SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Ac3H11_360 D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase (EC 1.1.1.30) to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5yssB Crystal structure of aminocaproic acid cyclase in complex with NAD (+) (see paper)
64% identity, 100% coverage: 2:260/260 of query aligns to 2:255/255 of 5yssB

query
sites
5yssB
L
 
L
K
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
T
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
S
T
|
T
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
G
 
G
I
 
I
A
 
A
K
 
Q
A
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
Q
Q
 
A
G
 
G
A
 
A
N
 
T
I
 
L
V
 
I
L
 
L
N
 
N
G
|
G
F
|
F
G
 
G
D
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
A
P
 
A
R
 
K
A
 
D
E
 
A
V
 
V
L
 
A
A
 
Q
A
 
Y
G
 
G
A
 
K
A
 
T
A
 
P
E
 
-
V
 
-
Q
 
-
V
 
-
A
 
G
Y
 
Y
H
 
H
G
 
G
A
 
A
D
 
D
M
x
L
S
 
S
R
 
D
A
 
E
A
 
A
D
 
Q
I
 
I
E
 
A
D
 
D
M
 
M
M
 
M
K
 
R
S
 
Y
S
 
A
A
 
E
A
 
S
Q
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
|
I
Q
 
Q
H
 
H
V
 
V
A
 
S
N
 
P
V
 
I
E
 
E
D
 
T
F
 
F
P
 
P
V
 
V
E
 
D
R
 
K
W
 
W
D
 
N
S
 
A
V
 
I
I
 
I
A
 
A
I
 
I
N
 
N
L
 
L
T
 
S
S
 
S
A
 
V
F
 
F
H
 
H
T
 
T
S
 
T
R
 
R
L
 
L
A
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
G
M
 
M
K
 
R
S
 
A
A
 
R
N
 
N
W
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
V
 
I
A
|
A
S
 
S
V
 
V
H
 
H
G
 
G
L
 
L
V
 
V
G
 
A
S
 
S
A
 
K
Q
 
E
K
 
K
A
 
S
A
 
A
Y
|
Y
V
 
V
A
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
V
 
T
T
 
I
A
 
A
L
 
L
E
 
E
N
 
T
A
 
A
T
 
Q
T
 
T
G
 
E
V
 
I
T
 
T
C
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
L
C
 
C
P
|
P
G
|
G
W
 
W
V
|
V
L
 
L
T
|
T
P
 
P
L
 
L
V
 
V
Q
 
Q
K
 
Q
Q
 
Q
V
 
I
D
 
D
A
 
K
K
 
R
A
 
I
A
 
A
E
 
E
H
 
-
G
 
G
L
 
A
S
 
E
N
 
P
E
 
E
D
 
A
A
 
A
K
 
R
K
 
D
L
 
A
L
 
L
L
 
L
G
 
A
E
 
E
K
 
K
E
 
Q
P
 
P
S
 
S
M
 
R
Q
 
E
F
 
F
T
 
V
T
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
E
 
N
L
 
L
A
 
A
V
 
L
F
 
F
F
 
L
C
 
C
S
 
S
P
 
D
A
 
G
A
 
A
N
 
A
N
 
Q
V
 
V
R
 
R
G
 
G
V
 
V
A
 
A
W
 
W
N
 
N
M
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
W
A
 
V
A
 
A
Q
 
Q

2q2qD Structure of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from pseudomonas putida (see paper)
66% identity, 100% coverage: 2:260/260 of query aligns to 2:255/255 of 2q2qD

query
sites
2q2qD
L
 
L
K
 
K
G
 
G
K
 
K
T
 
T
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
S
T
|
T
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
G
 
G
I
 
I
A
 
A
K
 
Q
A
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
R
Q
 
A
G
 
G
A
 
A
N
 
N
I
 
I
V
 
V
L
 
L
N
 
N
G
 
G
F
|
F
G
 
G
D
 
D
V
 
P
D
 
A
G
 
P
P
 
A
R
 
L
A
 
A
E
 
E
V
 
I
L
 
A
A
 
R
A
 
H
G
 
G
A
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
-
V
 
V
Q
 
K
V
 
A
A
 
V
Y
 
H
H
 
H
G
 
P
A
 
A
D
|
D
M
x
L
S
 
S
R
 
D
A
 
V
A
 
A
D
 
Q
I
 
I
E
 
E
D
 
A
M
 
L
M
 
F
K
 
A
S
 
L
S
 
A
A
 
E
A
 
R
Q
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
I
Q
 
Q
H
 
H
V
 
V
A
 
A
N
 
P
V
 
V
E
 
E
D
 
Q
F
 
F
P
 
P
V
 
L
E
 
E
R
 
S
W
 
W
D
 
D
S
 
K
V
 
I
I
 
I
A
 
A
I
x
L
N
 
N
L
 
L
T
 
S
S
 
A
A
 
V
F
 
F
H
 
H
T
 
G
S
 
T
R
 
R
L
 
L
A
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
G
M
 
M
K
 
R
S
 
A
A
 
R
N
 
N
W
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
V
x
I
A
 
A
S
|
S
V
 
V
H
 
H
G
 
G
L
 
L
V
 
V
G
 
G
S
 
S
A
 
T
Q
 
G
K
 
K
A
 
A
A
 
A
Y
|
Y
V
 
V
A
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
V
 
V
T
 
V
A
 
G
L
 
L
E
 
E
N
 
T
A
 
A
T
 
T
T
 
S
G
 
N
V
 
V
T
 
T
C
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
I
C
 
C
P
|
P
G
|
G
W
|
W
V
|
V
L
 
L
T
|
T
P
 
P
L
|
L
V
|
V
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
V
 
I
D
 
D
A
 
D
K
x
R
A
 
A
A
 
A
E
 
N
H
 
G
G
 
G
L
 
-
S
 
D
N
 
P
E
 
L
D
 
Q
A
 
A
K
 
Q
K
 
H
L
 
D
L
 
L
L
 
L
G
 
A
E
 
E
K
 
K
E
 
Q
P
 
P
S
 
S
M
 
L
Q
 
A
F
 
F
T
 
V
T
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
H
L
 
L
G
 
G
E
 
E
L
 
L
A
 
V
V
 
L
F
 
F
F
 
L
C
 
C
S
 
S
P
 
E
A
 
A
A
 
G
N
 
S
N
 
Q
V
 
V
R
 
R
G
 
G
V
 
A
A
 
A
W
 
W
N
 
N
M
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
W
A
 
L
A
 
A
Q
 
Q

2ztlA Closed conformation of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase complexed with NAD+ and l-3-hydroxybutyrate (see paper)
60% identity, 100% coverage: 1:260/260 of query aligns to 1:260/260 of 2ztlA

query
sites
2ztlA
M
 
M
L
 
L
K
 
K
G
 
G
K
 
K
T
 
V
A
 
A
L
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
S
T
 
T
S
 
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
G
 
G
I
 
I
A
 
A
K
 
T
A
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
A
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
N
 
D
I
 
I
V
 
V
L
 
L
N
 
N
G
 
G
F
|
F
G
 
G
D
 
D
V
 
A
D
 
-
G
 
-
P
 
A
R
 
E
A
 
I
E
 
E
V
 
K
L
 
V
A
 
R
A
 
A
G
 
G
A
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
Q
-
 
H
-
 
G
V
 
V
Q
 
K
V
 
V
A
 
L
Y
 
Y
H
 
D
G
 
G
A
 
A
D
 
D
M
x
L
S
 
S
R
 
K
A
 
G
A
 
E
D
 
A
I
 
V
E
 
R
D
 
G
M
 
L
M
 
V
K
 
D
S
 
N
S
 
A
A
 
V
A
 
R
Q
 
Q
F
 
M
G
 
G
R
 
R
V
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
Q
|
Q
H
 
H
V
 
T
A
 
A
N
 
L
V
 
I
E
 
E
D
 
D
F
 
F
P
 
P
V
 
T
E
 
E
R
 
K
W
 
W
D
 
D
S
 
A
V
 
I
I
 
L
A
 
A
I
x
L
N
|
N
L
 
L
T
 
S
S
 
A
A
 
V
F
 
F
H
 
H
T
 
G
S
 
T
R
 
A
L
 
A
A
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
H
M
 
M
K
 
K
S
 
K
A
 
Q
N
 
G
W
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
V
 
I
A
 
A
S
|
S
V
 
A
H
|
H
G
 
G
L
 
L
V
 
V
G
 
A
S
 
S
A
 
A
Q
 
N
K
|
K
A
 
S
A
 
A
Y
|
Y
V
 
V
A
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
F
T
 
T
K
 
K
V
 
V
T
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
E
N
 
T
A
 
A
T
 
G
T
 
Q
G
 
G
V
 
I
T
 
T
C
 
A
N
 
N
A
 
A
I
 
I
C
 
C
P
|
P
G
 
G
W
|
W
V
|
V
L
 
R
T
|
T
P
 
P
L
 
L
V
|
V
Q
 
E
K
 
K
Q
|
Q
V
 
I
D
 
S
A
 
A
K
x
L
A
 
A
A
 
E
E
 
K
H
 
N
G
 
G
L
 
V
S
 
D
N
 
Q
E
 
E
D
 
T
A
 
A
K
 
A
K
 
R
L
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
S
E
 
E
K
 
K
E
 
Q
P
 
P
S
 
S
M
 
L
Q
 
Q
F
 
F
T
 
V
T
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
E
 
G
L
 
T
A
 
A
V
 
V
F
 
F
F
 
L
C
 
A
S
 
S
P
 
D
A
 
A
A
 
A
N
 
A
N
 
Q
V
 
I
R
 
T
G
 
G
V
 
T
A
 
T
W
 
V
N
 
S
M
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
W
A
 
T
A
 
A
Q
 
R

1wmbA Crystal structure of NAD dependent d-3-hydroxybutylate dehydrogenase (see paper)
60% identity, 100% coverage: 1:260/260 of query aligns to 1:260/260 of 1wmbA

query
sites
1wmbA
M
 
M
L
 
L
K
 
K
G
 
G
K
 
K
T
 
V
A
 
A
L
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
S
 
S
T
 
T
S
 
S
G
|
G
I
 
I
G
 
G
L
 
L
G
 
G
I
 
I
A
 
A
K
 
T
A
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
A
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
N
 
D
I
 
I
V
 
V
L
 
L
N
 
N
G
 
G
F
 
F
G
 
G
D
 
D
V
 
A
D
 
-
G
 
-
P
 
A
R
 
E
A
 
I
E
 
E
V
 
K
L
 
V
A
 
R
A
 
A
G
 
G
A
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
Q
-
 
H
-
 
G
V
 
V
Q
 
K
V
 
V
A
 
L
Y
 
Y
H
 
D
G
 
G
A
 
A
D
 
D
M
 
L
S
 
S
R
 
K
A
 
G
A
 
E
D
 
A
I
 
V
E
 
R
D
 
G
M
 
L
M
 
V
K
 
D
S
 
N
S
 
A
A
 
V
A
 
R
Q
 
Q
F
 
M
G
 
G
R
 
R
V
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
Q
 
Q
H
 
H
V
 
T
A
 
A
N
 
L
V
 
I
E
 
E
D
 
D
F
 
F
P
 
P
V
 
T
E
 
E
R
 
K
W
 
W
D
 
D
S
 
A
V
 
I
I
 
L
A
 
A
I
 
L
N
|
N
L
 
L
T
 
S
S
 
A
A
 
V
F
 
F
H
 
H
T
 
G
S
 
T
R
 
A
L
 
A
A
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
H
M
 
M
K
 
K
S
 
K
A
 
Q
N
 
G
W
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
V
 
I
A
 
A
S
|
S
V
 
A
H
 
H
G
 
G
L
 
L
V
 
V
G
 
A
S
 
S
A
 
A
Q
 
N
K
 
K
A
 
S
A
 
A
Y
|
Y
V
 
V
A
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
F
T
 
T
K
 
K
V
 
V
T
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
E
N
 
T
A
 
A
T
 
G
T
 
Q
G
 
G
V
 
I
T
 
T
C
 
A
N
 
N
A
 
A
I
 
I
C
 
C
P
 
P
G
 
G
W
 
W
V
 
V
L
 
R
T
 
T
P
 
P
L
 
L
V
 
V
Q
 
E
K
 
K
Q
 
Q
V
 
I
D
 
S
A
 
A
K
x
L
A
 
A
A
 
E
E
 
K
H
 
N
G
 
G
L
 
V
S
 
D
N
 
Q
E
 
E
D
 
T
A
 
A
K
 
A
K
 
R
L
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
S
E
 
E
K
 
K
E
 
Q
P
 
P
S
 
S
M
 
L
Q
 
Q
F
 
F
T
 
V
T
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
E
 
G
L
 
T
A
 
A
V
 
V
F
 
F
F
 
L
C
 
A
S
 
S
P
 
D
A
 
A
A
 
A
N
 
A
N
 
Q
V
 
I
R
 
T
G
 
G
V
 
T
A
 
T
W
 
V
N
 
S
M
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
|
W
A
 
T
A
 
A
Q
 
R

5b4tA Crystal structure of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from alcaligenes faecalis complexed with NAD+ and a substrate d-3- hydroxybutyrate (see paper)
55% identity, 100% coverage: 1:260/260 of query aligns to 1:260/260 of 5b4tA

query
sites
5b4tA
M
 
M
L
 
L
K
 
K
G
 
G
K
 
K
T
 
K
A
 
A
L
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
S
T
|
T
S
 
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
G
 
A
I
 
M
A
 
A
K
 
T
A
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
K
Q
 
A
G
 
G
A
 
A
N
 
D
I
 
V
V
 
V
L
 
I
N
 
N
G
 
G
F
|
F
G
 
G
D
 
Q
V
 
P
D
 
E
G
 
D
P
 
I
R
 
E
A
 
R
E
 
E
V
 
R
L
 
S
A
 
T
A
 
L
G
 
E
A
 
S
A
 
K
A
 
F
E
 
G
V
 
V
Q
 
K
V
 
A
A
 
Y
Y
 
Y
H
 
L
G
 
N
A
 
A
D
|
D
M
x
L
S
 
S
R
 
D
A
 
A
A
 
Q
D
 
A
I
 
T
E
 
R
D
 
D
M
 
F
M
 
I
K
 
A
S
 
K
S
 
A
A
 
A
A
 
E
Q
 
A
F
 
L
G
 
G
R
 
G
V
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
I
Q
|
Q
H
 
H
V
 
T
A
 
A
N
 
P
V
 
I
E
 
E
D
 
E
F
 
F
P
 
P
V
 
V
E
 
D
R
 
K
W
 
W
D
 
N
S
 
A
V
 
I
I
 
I
A
 
A
I
x
L
N
|
N
L
 
L
T
 
S
S
 
A
A
 
V
F
 
F
H
 
H
T
 
G
S
 
T
R
 
A
L
 
A
A
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
I
M
 
M
K
 
Q
S
 
K
A
 
Q
N
 
G
W
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
V
x
I
A
 
A
S
|
S
V
 
A
H
|
H
G
 
G
L
 
L
V
 
V
G
 
A
S
 
S
A
 
V
Q
 
N
K
|
K
A
 
S
A
 
A
Y
|
Y
V
 
V
A
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
V
 
V
T
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
E
N
 
N
A
 
A
T
 
G
T
 
K
G
 
G
V
 
I
T
 
T
C
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
I
C
 
C
P
|
P
G
|
G
W
|
W
V
|
V
L
 
R
T
|
T
P
 
P
L
|
L
V
|
V
Q
 
E
K
 
K
Q
|
Q
V
 
I
D
 
E
A
 
A
K
x
I
A
 
S
A
 
Q
E
 
Q
H
 
K
G
 
G
L
 
I
S
 
D
N
 
I
E
 
E
D
 
A
A
 
A
K
 
A
K
 
R
L
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
A
E
 
E
K
 
K
E
 
Q
P
 
P
S
 
S
M
 
L
Q
 
Q
F
 
F
T
 
V
T
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
E
 
G
L
 
A
A
 
A
V
 
V
F
 
F
F
 
L
C
 
S
S
 
S
P
 
A
A
 
A
A
 
A
N
 
D
N
 
Q
V
 
M
R
 
T
G
 
G
V
 
T
A
 
T
W
 
L
N
 
S
M
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
W
A
 
T
A
 
A
Q
 
R

3w8dA Crystal structure of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from alcaligenes faecalis complexed with NAD+ and an inhibitor methylmalonate
55% identity, 100% coverage: 1:260/260 of query aligns to 1:260/260 of 3w8dA

query
sites
3w8dA
M
 
M
L
 
L
K
 
K
G
 
G
K
 
K
T
 
K
A
 
A
L
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
S
T
|
T
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
G
 
A
I
 
M
A
 
A
K
 
T
A
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
K
Q
 
A
G
 
G
A
 
A
N
 
D
I
 
V
V
 
V
L
 
I
N
 
N
G
 
G
F
|
F
G
 
G
D
 
Q
V
 
P
D
 
E
G
 
D
P
 
I
R
 
E
A
 
R
E
 
E
V
 
R
L
 
S
A
 
T
A
 
L
G
 
E
A
 
S
A
 
K
A
 
F
E
 
G
V
 
V
Q
 
K
V
 
A
A
 
Y
Y
 
Y
H
 
L
G
 
N
A
|
A
D
|
D
M
x
L
S
 
S
R
 
D
A
 
A
A
 
Q
D
 
A
I
 
T
E
 
R
D
 
D
M
 
F
M
 
I
K
 
A
S
 
K
S
 
A
A
 
A
A
 
E
Q
 
A
F
 
L
G
 
G
R
 
G
V
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
Q
|
Q
H
 
H
V
 
T
A
 
A
N
 
P
V
 
I
E
 
E
D
 
E
F
 
F
P
 
P
V
 
V
E
 
D
R
 
K
W
 
W
D
 
N
S
 
A
V
 
I
I
 
I
A
 
A
I
x
L
N
|
N
L
 
L
T
 
S
S
 
A
A
 
V
F
 
F
H
 
H
T
 
G
S
 
T
R
 
A
L
 
A
A
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
I
M
 
M
K
 
Q
S
 
K
A
 
Q
N
 
G
W
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
V
 
I
A
 
A
S
|
S
V
 
A
H
|
H
G
 
G
L
 
L
V
 
V
G
 
A
S
 
S
A
 
V
Q
 
N
K
|
K
A
 
S
A
 
A
Y
|
Y
V
 
V
A
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
V
 
V
T
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
E
N
 
N
A
 
A
T
 
G
T
 
K
G
 
G
V
 
I
T
 
T
C
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
I
C
 
C
P
|
P
G
|
G
W
|
W
V
|
V
L
 
R
T
|
T
P
 
P
L
|
L
V
|
V
Q
 
E
K
 
K
Q
|
Q
V
 
I
D
 
E
A
 
A
K
x
I
A
 
S
A
 
Q
E
 
Q
H
 
K
G
 
G
L
 
I
S
 
D
N
 
I
E
 
E
D
 
A
A
 
A
K
 
A
K
 
R
L
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
A
E
 
E
K
 
K
E
 
Q
P
 
P
S
 
S
M
 
L
Q
 
Q
F
 
F
T
 
V
T
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
E
 
G
L
 
A
A
 
A
V
 
V
F
 
F
F
 
L
C
 
S
S
 
S
P
 
A
A
 
A
A
 
A
N
 
D
N
 
Q
V
 
M
R
 
T
G
 
G
V
 
T
A
 
T
W
 
L
N
 
S
M
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
|
W
A
 
T
A
 
A
Q
 
R

3vdrA Crystal structure of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase, prepared in the presence of the substrate d-3-hydroxybutyrate and NAD(+) (see paper)
55% identity, 100% coverage: 1:260/260 of query aligns to 1:260/260 of 3vdrA

query
sites
3vdrA
M
 
M
L
 
L
K
 
K
G
 
G
K
 
K
T
 
K
A
 
A
L
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
S
T
|
T
S
 
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
G
 
A
I
 
M
A
 
A
K
 
T
A
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
K
Q
 
A
G
 
G
A
 
A
N
 
D
I
 
V
V
 
V
L
 
I
N
 
N
G
 
G
F
|
F
G
 
G
D
 
Q
V
 
P
D
 
E
G
 
D
P
 
I
R
 
E
A
 
R
E
 
E
V
 
R
L
 
S
A
 
T
A
 
L
G
 
E
A
 
S
A
 
K
A
 
F
E
 
G
V
 
V
Q
 
K
V
 
A
A
 
Y
Y
 
Y
H
 
L
G
 
N
A
 
A
D
|
D
M
x
L
S
 
S
R
 
D
A
 
A
A
 
Q
D
 
A
I
 
T
E
 
R
D
 
D
M
 
F
M
 
I
K
 
A
S
 
K
S
 
A
A
 
A
A
 
E
Q
 
A
F
 
L
G
 
G
R
 
G
V
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
Q
|
Q
H
 
H
V
 
T
A
 
A
N
 
P
V
 
I
E
 
E
D
 
E
F
 
F
P
 
P
V
 
V
E
 
D
R
 
K
W
 
W
D
 
N
S
 
A
V
 
I
I
 
I
A
 
A
I
x
L
N
|
N
L
 
L
T
 
S
S
 
A
A
 
V
F
 
F
H
 
H
T
 
G
S
 
T
R
 
A
L
 
A
A
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
I
M
 
M
K
 
Q
S
 
K
A
 
Q
N
 
G
W
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
V
 
I
A
 
A
S
|
S
V
 
A
H
|
H
G
 
G
L
 
L
V
 
V
G
 
A
S
 
S
A
 
V
Q
 
N
K
|
K
A
 
S
A
 
A
Y
|
Y
V
 
V
A
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
V
 
V
T
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
E
N
 
N
A
 
A
T
 
G
T
 
K
G
 
G
V
 
I
T
 
T
C
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
I
C
 
C
P
 
P
G
|
G
W
|
W
V
|
V
L
 
R
T
|
T
P
 
P
L
|
L
V
|
V
Q
 
E
K
 
K
Q
|
Q
V
 
I
D
 
E
A
 
A
K
x
I
A
 
S
A
 
Q
E
 
Q
H
 
K
G
 
G
L
 
I
S
 
D
N
 
I
E
 
E
D
 
A
A
 
A
K
 
A
K
 
R
L
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
A
E
 
E
K
 
K
E
 
Q
P
 
P
S
 
S
M
 
L
Q
 
Q
F
 
F
T
 
V
T
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
E
 
G
L
 
A
A
 
A
V
 
V
F
 
F
F
 
L
C
 
S
S
 
S
P
 
A
A
 
A
A
 
A
N
 
D
N
 
Q
V
 
M
R
 
T
G
 
G
V
 
T
A
 
T
W
 
L
N
 
S
M
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
|
W
A
 
T
A
 
A
Q
 
R

3vdqA Crystal structure of alcaligenes faecalis d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase in complex with NAD(+) and acetate (see paper)
55% identity, 100% coverage: 1:260/260 of query aligns to 1:260/260 of 3vdqA

query
sites
3vdqA
M
 
M
L
 
L
K
 
K
G
 
G
K
 
K
T
 
K
A
 
A
L
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
S
T
 
T
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
G
 
A
I
 
M
A
 
A
K
 
T
A
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
K
Q
 
A
G
 
G
A
 
A
N
 
D
I
 
V
V
 
V
L
 
I
N
 
N
G
 
G
F
|
F
G
 
G
D
 
Q
V
 
P
D
 
E
G
 
D
P
 
I
R
 
E
A
 
R
E
 
E
V
 
R
L
 
S
A
 
T
A
 
L
G
 
E
A
 
S
A
 
K
A
 
F
E
 
G
V
 
V
Q
 
K
V
 
A
A
 
Y
Y
 
Y
H
 
L
G
 
N
A
 
A
D
|
D
M
x
L
S
 
S
R
 
D
A
 
A
A
 
Q
D
 
A
I
 
T
E
 
R
D
 
D
M
 
F
M
 
I
K
 
A
S
 
K
S
 
A
A
 
A
A
 
E
Q
 
A
F
 
L
G
 
G
R
 
G
V
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
Q
|
Q
H
 
H
V
 
T
A
 
A
N
 
P
V
 
I
E
 
E
D
 
E
F
 
F
P
 
P
V
 
V
E
 
D
R
 
K
W
 
W
D
 
N
S
 
A
V
 
I
I
 
I
A
 
A
I
x
L
N
|
N
L
 
L
T
 
S
S
 
A
A
 
V
F
 
F
H
 
H
T
 
G
S
 
T
R
 
A
L
 
A
A
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
I
M
 
M
K
 
Q
S
 
K
A
 
Q
N
 
G
W
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
V
x
I
A
 
A
S
|
S
V
 
A
H
|
H
G
 
G
L
 
L
V
 
V
G
 
A
S
 
S
A
 
V
Q
 
N
K
|
K
A
 
S
A
 
A
Y
|
Y
V
 
V
A
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
V
 
V
T
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
E
N
 
N
A
 
A
T
 
G
T
 
K
G
 
G
V
 
I
T
 
T
C
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
I
C
 
C
P
|
P
G
|
G
W
|
W
V
|
V
L
 
R
T
|
T
P
 
P
L
|
L
V
|
V
Q
 
E
K
 
K
Q
|
Q
V
 
I
D
 
E
A
 
A
K
x
I
A
 
S
A
 
Q
E
 
Q
H
 
K
G
 
G
L
 
I
S
 
D
N
 
I
E
 
E
D
 
A
A
 
A
K
 
A
K
 
R
L
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
A
E
 
E
K
 
K
E
 
Q
P
 
P
S
 
S
M
 
L
Q
 
Q
F
 
F
T
 
V
T
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
E
 
G
L
 
A
A
 
A
V
 
V
F
 
F
F
 
L
C
 
S
S
 
S
P
 
A
A
 
A
A
 
A
N
 
D
N
 
Q
V
 
M
R
 
T
G
 
G
V
 
T
A
 
T
W
 
L
N
 
S
M
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
W
A
 
T
A
 
A
Q
 
R

1x1tA Crystal structure of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from pseudomonas fragi complexed with NAD+ (see paper)
56% identity, 100% coverage: 1:260/260 of query aligns to 1:236/236 of 1x1tA

query
sites
1x1tA
M
 
M
L
 
L
K
 
K
G
 
G
K
 
K
T
 
V
A
 
A
L
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
S
T
|
T
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
G
 
G
I
 
I
A
 
A
K
 
T
A
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
A
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
N
 
D
I
 
I
V
 
V
L
 
L
N
 
N
G
|
G
F
|
F
G
 
G
D
 
D
V
 
A
D
 
-
G
 
-
P
 
A
R
 
E
A
 
I
E
 
E
V
 
K
L
 
V
A
 
R
A
 
A
G
 
G
A
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
Q
-
 
H
-
 
G
V
 
V
Q
 
K
V
 
V
A
 
L
Y
 
Y
H
 
D
G
 
G
A
 
A
D
|
D
M
x
L
S
 
S
R
 
K
A
 
G
A
 
E
D
 
A
I
 
V
E
 
R
D
 
G
M
 
L
M
 
V
K
 
D
S
 
N
S
 
A
A
 
V
A
 
R
Q
 
Q
F
 
M
G
 
G
R
 
R
V
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
I
Q
 
Q
H
 
H
V
 
T
A
 
A
N
 
L
V
 
I
E
 
E
D
 
D
F
 
F
P
 
P
V
 
T
E
 
E
R
 
K
W
 
W
D
 
D
S
 
A
V
 
I
I
 
L
A
 
A
I
x
L
N
|
N
L
 
L
T
 
S
S
 
A
A
 
V
F
 
F
H
 
H
T
 
G
S
 
T
R
 
A
L
 
A
A
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
H
M
 
M
K
 
K
S
 
K
A
 
Q
N
 
G
W
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
V
 
I
A
 
A
S
|
S
V
 
A
H
|
H
G
 
G
L
 
L
V
 
V
G
 
A
S
 
S
A
 
A
Q
 
N
K
 
K
A
 
S
A
 
A
Y
|
Y
V
 
V
A
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
F
T
 
T
K
 
K
V
 
V
T
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
E
N
 
T
A
 
A
T
 
G
T
 
Q
G
 
G
V
 
I
T
 
T
C
 
A
N
 
N
A
 
A
I
 
I
C
 
C
P
|
P
G
 
G
W
|
W
V
|
V
L
 
R
T
|
T
P
 
-
L
 
-
V
 
-
Q
 
-
K
 
-
Q
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
-
H
 
-
G
 
-
L
 
-
S
 
-
N
 
-
E
 
-
D
 
-
A
 
-
K
 
-
K
 
-
L
 
-
L
 
L
L
 
L
G
 
S
E
 
E
K
 
K
E
 
Q
P
 
P
S
 
S
M
 
L
Q
 
Q
F
 
F
T
 
V
T
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
E
 
G
L
 
T
A
 
A
V
 
V
F
 
F
F
 
L
C
 
A
S
 
S
P
 
D
A
 
A
A
 
A
N
 
A
N
 
Q
V
 
I
R
 
T
G
 
G
V
 
T
A
 
T
W
 
V
N
 
S
M
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
|
W
A
 
T
A
 
A
Q
 
R

6zzqA Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from acinetobacter baumannii complexed with NAD+ and acetoacetate (see paper)
42% identity, 100% coverage: 1:260/260 of query aligns to 3:260/260 of 6zzqA

query
sites
6zzqA
M
 
L
L
 
L
K
 
D
G
 
G
K
 
K
T
 
V
A
 
A
L
 
F
V
 
I
T
 
T
G
|
G
S
 
S
T
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
G
 
E
I
 
I
A
 
A
K
 
K
A
 
K
L
 
F
A
 
A
R
 
Q
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
N
 
K
I
 
V
V
 
V
L
 
I
N
 
S
G
 
-
F
 
-
G
 
-
D
|
D
V
x
M
D
 
N
G
 
A
P
 
E
R
 
K
A
 
C
E
 
Q
V
 
E
L
 
T
A
 
A
A
 
N
G
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
-
V
 
-
Q
 
S
V
 
L
A
 
K
Y
 
E
H
 
Q
G
 
G
A
 
F
D
 
D
-
 
A
M
 
L
S
 
S
R
 
A
A
 
P
A
 
C
D
|
D
I
x
V
-
 
T
-
 
D
E
 
E
D
 
D
M
 
A
M
 
Y
K
 
K
S
 
Q
-
 
A
-
 
I
-
 
E
-
 
L
S
 
T
A
 
Q
A
 
K
Q
 
T
F
 
F
G
 
G
R
 
T
V
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
F
Q
|
Q
H
 
H
V
 
V
A
 
A
N
 
P
V
 
I
E
 
E
D
 
E
F
 
F
P
 
P
V
 
T
E
 
A
R
 
V
W
 
F
D
 
Q
S
 
K
V
 
L
I
 
V
A
 
Q
I
 
V
N
 
M
L
 
L
T
 
T
S
 
G
A
 
A
F
 
F
H
 
I
T
 
G
S
 
I
R
 
K
L
 
H
A
 
V
L
 
L
P
 
P
A
 
I
M
 
M
K
 
K
S
 
A
A
 
Q
N
 
K
W
 
Y
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
V
x
M
A
|
A
S
|
S
V
 
I
H
 
N
G
 
G
L
 
L
V
 
I
G
 
G
S
 
F
A
 
A
Q
 
G
K
|
K
A
 
A
A
 
G
Y
|
Y
V
 
N
A
 
S
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
V
 
V
V
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
V
 
V
T
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
N
 
C
A
 
A
T
 
R
T
 
D
G
 
G
V
 
I
T
 
T
C
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
L
C
 
C
P
 
P
G
 
G
W
x
Y
V
|
V
L
 
D
T
|
T
P
 
P
L
 
L
V
 
V
Q
 
R
K
 
G
Q
|
Q
V
 
I
D
 
A
A
 
D
K
 
L
A
 
A
A
 
K
E
 
T
H
 
R
G
 
N
L
 
V
S
 
S
N
 
L
E
 
D
D
 
S
A
 
A
K
 
L
K
 
E
L
 
D
L
 
V
L
 
I
G
 
L
E
 
A
K
 
M
E
 
V
P
 
P
S
 
Q
M
 
K
Q
 
R
F
 
L
T
 
L
T
 
S
P
 
V
E
 
E
E
 
E
L
 
I
G
 
A
E
 
D
L
 
Y
A
 
A
V
 
I
F
 
F
F
 
L
C
 
A
S
 
S
P
 
S
A
 
K
A
 
A
N
 
G
N
 
G
V
 
V
R
 
T
G
 
G
V
 
Q
A
 
A
W
 
V
N
 
V
M
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
Y
A
 
T
A
 
A
Q
 
Q

6zzsD Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from acinetobacter baumannii complexed with NAD+ and 3-oxovalerate (see paper)
42% identity, 100% coverage: 1:260/260 of query aligns to 4:261/261 of 6zzsD

query
sites
6zzsD
M
 
L
L
 
L
K
 
D
G
 
G
K
 
K
T
 
V
A
 
A
L
 
F
V
 
I
T
 
T
G
|
G
S
 
S
T
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
G
 
E
I
 
I
A
 
A
K
 
K
A
 
K
L
 
F
A
 
A
R
 
Q
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
N
 
K
I
 
V
V
 
V
L
 
I
N
 
S
G
 
-
F
 
-
G
 
-
D
|
D
V
x
M
D
 
N
G
 
A
P
 
E
R
 
K
A
 
C
E
 
Q
V
 
E
L
 
T
A
 
A
A
 
N
G
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
-
V
 
-
Q
 
S
V
 
L
A
 
K
Y
 
E
H
 
Q
G
 
G
A
 
F
D
 
D
-
 
A
M
 
L
S
 
S
R
 
A
A
 
P
A
 
C
D
|
D
I
x
V
-
 
T
-
 
D
E
 
E
D
 
D
M
 
A
M
 
Y
K
 
K
S
 
Q
-
 
A
-
 
I
-
 
E
-
 
L
S
 
T
A
 
Q
A
 
K
Q
 
T
F
 
F
G
 
G
R
 
T
V
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
F
Q
|
Q
H
 
H
V
 
V
A
 
A
N
 
P
V
 
I
E
 
E
D
 
E
F
 
F
P
 
P
V
 
T
E
 
A
R
 
V
W
 
F
D
 
Q
S
 
K
V
 
L
I
 
V
A
 
Q
I
 
V
N
 
M
L
 
L
T
 
T
S
 
G
A
 
A
F
 
F
H
 
I
T
 
G
S
 
I
R
 
K
L
 
H
A
 
V
L
 
L
P
 
P
A
 
I
M
 
M
K
 
K
S
 
A
A
 
Q
N
 
K
W
 
Y
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
V
x
M
A
|
A
S
|
S
V
 
I
H
x
N
G
 
G
L
 
L
V
 
I
G
 
G
S
 
F
A
 
A
Q
 
G
K
|
K
A
 
A
A
 
G
Y
|
Y
V
 
N
A
 
S
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
V
 
V
V
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
V
 
V
T
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
N
 
C
A
 
A
T
 
R
T
 
D
G
 
G
V
 
I
T
 
T
C
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
L
C
 
C
P
|
P
G
|
G
W
 
Y
V
|
V
L
 
D
T
|
T
P
 
P
L
|
L
V
 
V
Q
 
R
K
 
G
Q
|
Q
V
 
I
D
 
A
A
 
D
K
 
L
A
 
A
A
 
K
E
 
T
H
 
R
G
 
N
L
 
V
S
 
S
N
 
L
E
 
D
D
 
S
A
 
A
K
 
L
K
 
E
L
 
D
L
 
V
L
 
I
G
 
L
E
 
A
K
 
M
E
 
V
P
 
P
S
 
Q
M
 
K
Q
 
R
F
 
L
T
 
L
T
 
S
P
 
V
E
 
E
E
 
E
L
 
I
G
 
A
E
 
D
L
 
Y
A
 
A
V
 
I
F
 
F
F
 
L
C
 
A
S
 
S
P
 
S
A
 
K
A
 
A
N
 
G
N
 
G
V
 
V
R
 
T
G
 
G
V
 
Q
A
 
A
W
 
V
N
 
V
M
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
Y
A
 
T
A
 
A
Q
 
Q

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
39% identity, 98% coverage: 2:257/260 of query aligns to 3:245/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
L
 
L
K
 
Q
G
 
G
K
 
K
T
 
V
A
 
A
L
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
G
T
x
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
G
 
D
I
 
I
A
 
A
K
 
I
A
 
N
L
 
L
A
 
A
R
 
K
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
N
 
N
I
 
I
V
 
F
L
 
F
N
|
N
G
x
Y
F
x
N
G
|
G
D
 
-
V
 
-
D
 
-
G
x
S
P
 
P
R
 
E
A
 
A
E
 
A
V
 
E
L
 
E
A
 
T
A
 
A
G
 
K
A
 
L
A
 
V
A
 
A
E
 
E
-
 
H
-
 
G
V
 
V
Q
 
E
V
 
V
A
 
E
Y
 
A
H
 
M
G
 
K
A
 
A
D
x
N
M
x
V
S
 
A
R
 
I
A
 
A
A
 
E
D
 
D
I
 
V
E
 
D
D
 
A
M
 
F
M
 
F
K
 
K
S
 
Q
S
 
A
A
 
I
A
 
E
Q
 
R
F
 
F
G
 
G
R
 
R
V
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
|
I
Q
 
T
H
 
R
V
 
D
A
 
N
N
 
L
V
 
L
E
 
M
D
 
R
F
 
M
P
 
K
V
 
E
E
 
D
R
 
E
W
 
W
D
 
D
S
 
D
V
 
V
I
 
I
A
 
N
I
|
I
N
 
N
L
 
L
T
 
K
S
 
G
A
 
T
F
 
F
H
 
L
T
 
C
S
 
T
R
 
K
L
 
A
A
 
V
L
 
S
P
 
R
A
 
T
M
 
M
K
 
M
S
 
K
A
 
Q
N
 
R
W
 
A
G
 
G
R
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
V
 
M
A
 
A
S
|
S
V
 
V
H
 
V
G
 
G
L
 
L
V
 
I
G
 
G
S
 
N
A
 
A
Q
 
G
K
x
Q
A
 
A
A
 
N
Y
|
Y
V
 
V
A
 
A
A
 
S
K
|
K
H
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
V
 
T
T
 
T
A
 
A
L
 
R
E
 
E
N
 
L
A
 
A
T
 
P
T
 
R
G
 
G
V
 
I
T
 
N
C
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
C
 
A
P
|
P
G
 
G
W
 
F
V
x
I
L
 
T
T
|
T
P
 
D
L
 
M
V
 
T
Q
 
D
K
 
K
Q
 
-
V
 
L
D
 
D
A
 
E
K
 
K
A
 
T
A
 
K
E
 
E
H
 
A
G
 
M
L
 
L
S
 
A
N
 
-
E
 
-
D
 
-
A
 
-
K
 
-
K
 
-
L
 
-
L
 
-
L
 
-
G
 
-
E
 
-
K
 
Q
E
 
I
P
 
P
S
 
L
M
 
G
Q
 
A
F
 
Y
T
 
G
T
 
T
P
 
T
E
 
E
E
 
D
L
 
I
G
 
A
E
 
N
L
 
A
A
 
V
V
 
L
F
 
F
F
 
L
C
 
A
S
 
S
P
 
D
A
 
A
A
 
S
N
 
K
N
 
Y
V
 
I
R
 
T
G
 
G
V
 
Q
A
 
T
W
 
L
N
 
S
M
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
M

6ixmC Crystal structure of the ketone reductase chkred20 from the genome of chryseobacterium sp. Ca49 complexed with NAD (see paper)
34% identity, 100% coverage: 1:259/260 of query aligns to 2:247/248 of 6ixmC

query
sites
6ixmC
M
 
I
L
 
L
K
 
D
G
 
N
K
 
K
T
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
T
 
G
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
G
 
A
I
 
V
A
 
A
K
 
H
A
 
S
L
 
Y
A
 
A
R
 
K
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
N
 
K
I
 
V
V
 
I
L
 
V
N
 
S
G
x
D
F
x
I
G
 
N
D
 
E
V
 
D
D
 
H
G
 
G
P
 
N
R
 
K
A
 
A
-
 
V
-
 
E
E
 
D
V
 
I
L
 
K
A
 
A
A
 
Q
G
 
G
A
 
G
A
 
E
A
 
A
E
 
-
V
 
-
Q
 
-
V
 
-
A
 
S
Y
 
F
H
 
V
G
 
K
A
|
A
D
|
D
M
x
T
S
 
S
R
 
N
A
 
P
A
 
E
D
 
E
I
 
V
E
 
E
D
 
A
M
 
L
M
 
V
K
 
K
S
 
R
S
 
T
A
 
V
A
 
E
Q
 
I
F
 
Y
G
 
G
R
 
R
V
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
A
V
 
C
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
-
 
G
-
 
G
-
 
E
Q
 
Q
H
 
A
V
 
L
A
 
A
N
 
G
V
 
-
E
 
-
D
 
D
F
 
Y
P
 
G
V
 
L
E
 
D
R
 
S
W
 
W
D
 
R
S
 
K
V
 
V
I
 
L
A
 
S
I
 
I
N
 
N
L
 
L
T
 
D
S
 
G
A
 
V
F
 
F
H
 
Y
T
 
G
S
 
C
R
 
K
L
 
Y
A
 
E
L
 
L
P
 
E
A
 
Q
M
 
M
K
 
E
S
 
K
A
 
N
N
 
G
W
 
G
G
 
G
R
 
V
I
 
I
I
 
V
N
 
N
V
x
M
A
 
A
S
|
S
V
 
I
H
 
H
G
 
G
L
 
I
V
 
V
G
 
A
S
 
A
A
 
P
Q
 
L
K
 
S
A
 
S
A
 
A
Y
|
Y
V
 
T
A
 
S
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
A
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
V
 
N
T
 
I
A
 
G
L
 
A
E
 
E
N
 
Y
A
 
G
T
 
Q
T
 
K
G
 
N
V
 
I
T
 
R
C
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
V
C
 
G
P
|
P
G
x
A
W
x
Y
V
x
I
L
 
E
T
 
T
P
 
P
L
|
L
V
 
L
Q
 
E
K
 
S
Q
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
-
H
 
-
G
 
-
L
 
L
S
 
T
N
 
K
E
 
E
D
 
M
A
 
K
K
 
E
K
 
A
L
 
L
L
 
I
L
 
-
G
 
-
E
 
S
K
 
K
E
 
H
P
 
P
S
 
M
M
 
G
Q
 
R
F
 
L
T
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
E
L
 
V
G
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
V
V
 
L
F
 
F
F
 
L
C
 
S
S
 
S
P
 
E
A
 
K
A
 
S
N
 
S
N
 
F
V
 
M
R
 
T
G
 
G
V
 
G
A
 
Y
W
 
Y
N
 
L
M
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
Y
A
 
T
A
 
A

6zzpA Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from psychrobacter arcticus complexed with NAD+ and 3-oxovalerate (see paper)
37% identity, 98% coverage: 2:257/260 of query aligns to 8:262/265 of 6zzpA

query
sites
6zzpA
L
 
L
K
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
T
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
G
 
D
I
 
I
A
 
A
K
 
E
A
 
T
L
 
Y
A
 
A
R
 
K
Q
 
A
G
 
G
A
 
A
N
 
A
I
 
V
V
 
-
L
 
-
N
 
-
G
 
G
F
 
I
G
 
A
D
|
D
V
x
I
D
 
N
G
 
L
P
 
E
R
 
A
A
 
A
E
 
Q
-
 
K
-
 
T
-
 
V
-
 
D
-
 
A
V
 
I
L
 
E
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
G
A
 
R
A
 
A
E
 
-
V
 
L
Q
 
A
V
 
I
A
 
A
Y
x
M
H
 
-
G
 
-
A
 
-
D
|
D
M
x
V
S
 
T
R
 
S
A
 
E
A
 
A
D
 
A
I
 
V
E
 
N
D
 
D
M
 
G
M
 
V
K
 
Q
S
 
R
S
 
L
A
 
V
A
 
D
Q
 
T
F
 
F
G
 
G
R
 
G
V
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
S
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
Q
|
Q
H
 
I
V
 
I
A
 
D
N
 
P
V
 
I
E
 
H
D
 
K
F
 
M
P
 
A
V
 
F
E
 
E
R
 
D
W
 
W
D
 
K
S
 
K
V
 
M
I
 
L
A
 
A
I
 
I
N
 
H
L
 
L
T
 
D
S
 
G
A
 
A
F
 
F
H
 
L
T
 
T
S
 
T
R
 
K
L
 
A
A
 
A
L
 
I
P
 
Q
A
 
H
M
 
M
-
 
Y
K
 
K
S
 
D
A
 
D
N
 
K
W
 
G
G
 
G
R
 
T
I
 
V
I
 
I
N
 
Y
V
x
M
A
 
G
S
|
S
V
 
V
H
|
H
G
 
S
L
 
H
V
 
E
G
 
A
S
 
S
A
 
L
Q
 
F
K
|
K
A
 
A
A
 
P
Y
|
Y
V
 
V
A
 
T
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
V
 
L
V
 
L
G
 
G
L
 
L
T
 
C
K
 
R
V
 
V
T
 
L
A
 
A
L
 
K
E
 
E
N
 
G
A
 
A
T
 
V
T
 
H
G
 
N
V
 
V
T
 
R
C
 
S
N
 
H
A
 
V
I
 
I
C
 
C
P
|
P
G
 
G
W
x
F
V
|
V
L
 
K
T
|
T
P
 
P
L
|
L
V
|
V
Q
 
E
K
 
K
Q
|
Q
V
 
I
D
 
P
A
 
Q
K
 
Q
A
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
K
G
 
G
L
 
I
S
 
S
N
 
E
E
 
E
D
 
S
A
 
V
K
 
V
K
 
N
L
 
D
L
 
I
L
 
M
G
 
L
E
 
V
K
 
N
E
 
T
P
 
V
S
 
D
M
 
K
Q
 
E
F
 
F
T
 
T
T
 
T
P
 
V
E
 
D
E
 
D
L
 
I
G
 
A
E
 
Q
L
 
L
A
 
A
V
 
L
F
 
F
F
 
L
C
 
A
S
 
A
P
 
F
A
 
P
A
 
T
N
 
N
N
 
V
V
 
F
R
 
T
G
 
G
V
 
Q
A
 
S
W
 
I
N
 
V
M
 
A
D
 
S
G
 
H
G
 
G
W
 
W

6zzoC Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from psychrobacter arcticus complexed with NAD+ and acetoacetate (see paper)
37% identity, 98% coverage: 2:257/260 of query aligns to 8:262/265 of 6zzoC

query
sites
6zzoC
L
 
L
K
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
T
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
G
 
D
I
 
I
A
 
A
K
 
E
A
 
T
L
 
Y
A
 
A
R
 
K
Q
 
A
G
 
G
A
 
A
N
 
A
I
 
V
V
 
-
L
 
-
N
 
-
G
 
G
F
 
I
G
 
A
D
|
D
V
x
I
D
 
N
G
 
L
P
 
E
R
 
A
A
 
A
E
 
Q
-
 
K
-
 
T
-
 
V
-
 
D
-
 
A
V
 
I
L
 
E
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
G
A
 
R
A
 
A
E
 
-
V
 
L
Q
 
A
V
 
I
A
 
A
Y
x
M
H
 
-
G
 
-
A
 
-
D
|
D
M
x
V
S
 
T
R
 
S
A
 
E
A
 
A
D
 
A
I
 
V
E
 
N
D
 
D
M
 
G
M
 
V
K
 
Q
S
 
R
S
 
L
A
 
V
A
 
D
Q
 
T
F
 
F
G
 
G
R
 
G
V
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
S
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
Q
|
Q
H
 
I
V
 
I
A
 
D
N
 
P
V
 
I
E
 
H
D
 
K
F
 
M
P
 
A
V
 
F
E
 
E
R
 
D
W
 
W
D
 
K
S
 
K
V
 
M
I
 
L
A
 
A
I
 
I
N
 
H
L
 
L
T
 
D
S
 
G
A
 
A
F
 
F
H
 
L
T
 
T
S
 
T
R
 
K
L
 
A
A
 
A
L
 
I
P
 
Q
A
 
H
M
 
M
-
 
Y
K
 
K
S
 
D
A
 
D
N
 
K
W
 
G
G
 
G
R
 
T
I
 
V
I
 
I
N
 
Y
V
x
M
A
 
G
S
 
S
V
 
V
H
|
H
G
 
S
L
 
H
V
 
E
G
 
A
S
 
S
A
 
L
Q
 
F
K
|
K
A
 
A
A
 
P
Y
|
Y
V
 
V
A
 
T
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
V
 
L
V
 
L
G
 
G
L
 
L
T
 
C
K
 
R
V
 
V
T
 
L
A
 
A
L
 
K
E
 
E
N
 
G
A
 
A
T
 
V
T
 
H
G
 
N
V
 
V
T
 
R
C
 
S
N
 
H
A
 
V
I
 
I
C
 
C
P
|
P
G
 
G
W
x
F
V
|
V
L
 
K
T
|
T
P
 
P
L
|
L
V
|
V
Q
 
E
K
 
K
Q
|
Q
V
 
I
D
 
P
A
 
Q
K
 
Q
A
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
K
G
 
G
L
 
I
S
 
S
N
 
E
E
 
E
D
 
S
A
 
V
K
 
V
K
 
N
L
 
D
L
 
I
L
 
M
G
 
L
E
 
V
K
 
N
E
 
T
P
 
V
S
 
D
M
 
K
Q
 
E
F
 
F
T
 
T
T
 
T
P
 
V
E
 
D
E
 
D
L
 
I
G
 
A
E
 
Q
L
 
L
A
 
A
V
 
L
F
 
F
F
 
L
C
 
A
S
 
A
P
 
F
A
 
P
A
 
T
N
 
N
N
 
V
V
 
F
R
 
T
G
 
G
V
 
Q
A
 
S
W
 
I
N
 
V
M
 
A
D
 
S
G
 
H
G
 
G
W
 
W

1edoA The x-ray structure of beta-keto acyl carrier protein reductase from brassica napus complexed with NADP+ (see paper)
36% identity, 97% coverage: 8:258/260 of query aligns to 5:243/244 of 1edoA

query
sites
1edoA
L
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
T
x
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
K
G
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
L
A
 
S
L
 
L
A
 
G
R
 
K
Q
 
A
G
 
G
A
 
C
N
 
K
I
 
V
V
 
L
L
 
V
N
|
N
G
 
-
F
x
Y
G
x
A
D
x
R
V
x
S
D
 
A
G
 
K
P
 
A
R
 
A
A
 
E
E
 
E
V
 
V
L
 
S
A
 
K
A
 
Q
G
 
I
A
 
E
A
 
A
A
 
Y
E
 
G
V
 
G
Q
 
Q
V
 
A
A
 
I
Y
 
T
H
 
F
G
 
G
A
 
G
D
|
D
M
x
V
S
 
S
R
 
K
A
 
E
A
 
A
D
 
D
I
 
V
E
 
E
D
 
A
M
 
M
M
 
M
K
 
K
S
 
T
S
 
A
A
 
I
A
 
D
Q
 
A
F
 
W
G
 
G
R
 
T
V
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
V
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
Q
 
T
H
 
R
V
 
D
A
 
T
N
 
L
V
 
L
E
 
I
D
 
R
F
 
M
P
 
K
V
 
K
E
 
S
R
 
Q
W
 
W
D
 
D
S
 
E
V
 
V
I
 
I
A
 
D
I
 
L
N
 
N
L
 
L
T
 
T
S
 
G
A
 
V
F
 
F
H
 
L
T
 
C
S
 
T
R
 
Q
L
 
A
A
 
A
L
 
T
P
 
K
A
 
I
M
 
M
K
 
M
S
 
K
A
 
K
N
 
R
W
 
K
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
V
 
I
A
 
A
S
|
S
V
 
V
H
 
V
G
 
G
L
 
L
V
 
I
G
 
G
S
 
N
A
 
I
Q
 
G
K
 
Q
A
 
A
A
 
N
Y
|
Y
V
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
I
G
 
G
L
 
F
T
 
S
K
 
K
V
 
T
T
 
A
A
 
A
L
 
R
E
 
E
N
 
G
A
 
A
T
 
S
T
 
R
G
 
N
V
 
I
T
 
N
C
 
V
N
 
N
A
 
V
I
 
V
C
 
C
P
|
P
G
|
G
W
 
F
V
x
I
L
 
A
T
x
S
P
 
D
L
x
M
V
 
T
Q
 
A
K
 
K
Q
 
L
V
 
-
D
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
-
H
 
-
G
 
-
L
 
-
S
 
-
N
 
G
E
 
E
D
 
D
A
 
M
K
 
E
K
 
K
L
 
K
L
 
I
L
 
L
G
 
G
E
 
T
K
 
I
E
 
-
P
 
P
S
 
L
M
 
G
Q
 
R
F
 
T
T
 
G
T
 
Q
P
 
P
E
 
E
E
 
N
L
 
V
G
 
A
E
 
G
L
 
L
A
 
V
V
 
E
F
 
F
F
 
L
C
 
A
-
 
L
S
 
S
P
 
P
A
 
A
A
 
A
N
 
S
N
 
Y
V
 
I
R
 
T
G
 
G
V
 
Q
A
 
A
W
 
F
N
 
T
M
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
I
A
 
A

3sjuA Hedamycin polyketide ketoreductase bound to NADPH (see paper)
35% identity, 97% coverage: 5:256/260 of query aligns to 1:251/255 of 3sjuA

query
sites
3sjuA
K
 
Q
T
 
T
A
 
A
L
 
F
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
V
T
 
S
S
|
S
G
|
G
I
 
I
G
 
G
L
 
L
G
 
A
I
 
V
A
 
A
K
 
R
A
 
T
L
 
L
A
 
A
R
 
A
Q
 
R
G
 
G
-
 
I
-
 
A
-
 
V
-
 
Y
-
 
G
-
 
C
A
|
A
N
x
R
I
x
D
V
 
A
L
 
K
N
 
N
G
 
V
F
 
S
G
 
A
D
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
P
 
L
R
 
R
A
 
A
E
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
A
E
 
G
V
 
H
Q
 
D
V
 
V
A
 
D
Y
 
G
H
 
S
G
 
S
A
x
C
D
|
D
M
x
V
S
 
T
R
 
S
A
 
T
A
 
D
D
 
E
I
 
V
E
 
H
D
 
A
M
 
A
M
 
V
K
 
A
S
 
A
S
 
A
A
 
V
A
 
E
Q
 
R
F
 
F
G
 
G
R
 
P
V
 
I
D
 
G
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
x
S
A
|
A
G
|
G
I
 
R
Q
 
N
H
 
G
V
 
G
A
 
G
N
 
E
V
 
T
E
 
A
D
 
D
F
 
L
P
 
D
V
 
D
E
 
A
R
 
L
W
 
W
D
 
A
S
 
D
V
 
V
I
 
L
A
 
D
I
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
T
S
 
G
A
 
V
F
 
F
H
 
R
T
 
V
S
 
T
R
 
R
L
 
E
A
 
V
L
 
L
P
 
R
A
 
A
-
 
G
-
 
G
M
 
M
K
 
R
S
 
E
A
 
A
N
 
G
W
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
V
N
 
N
V
x
I
A
 
A
S
|
S
V
 
T
H
 
G
G
 
G
L
 
K
V
 
Q
G
 
G
S
 
V
A
 
M
Q
 
Y
K
 
A
A
 
A
A
 
P
Y
|
Y
V
 
T
A
 
A
A
 
S
K
|
K
H
 
H
G
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
F
T
 
T
K
 
K
V
 
S
T
 
V
A
 
G
L
 
F
E
 
E
N
 
L
A
 
A
T
 
K
T
 
T
G
 
G
V
 
I
T
 
T
C
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
C
 
C
P
|
P
G
|
G
W
x
Y
V
|
V
L
 
E
T
|
T
P
 
P
L
x
M
V
 
A
Q
 
E
K
 
R
Q
 
V
V
 
R
D
 
E
A
 
G
K
x
Y
A
 
A
A
 
R
E
 
H
H
 
W
G
 
G
L
 
V
S
 
T
N
 
E
E
 
Q
D
 
E
A
 
V
K
 
H
K
 
E
L
 
-
L
 
R
L
 
F
G
 
N
E
 
A
K
 
K
E
 
I
P
 
P
S
 
L
M
 
G
Q
 
R
F
 
Y
T
 
S
T
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
E
L
 
V
G
 
A
E
 
G
L
 
L
A
 
V
V
 
G
F
 
Y
F
 
L
C
 
V
S
 
T
P
 
D
A
 
A
A
 
A
N
 
A
N
 
S
V
 
I
R
 
T
G
 
A
V
 
Q
A
 
A
W
 
L
N
 
N
M
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G

3uf0A Crystal structure of a putative NAD(p) dependent gluconate 5- dehydrogenase from beutenbergia cavernae(efi target efi-502044) with bound NADP (low occupancy)
38% identity, 100% coverage: 2:260/260 of query aligns to 5:249/249 of 3uf0A

query
sites
3uf0A
L
 
L
K
 
A
G
 
G
K
 
R
T
 
T
A
 
A
L
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
T
 
G
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
G
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
H
A
 
G
L
 
Y
A
 
A
R
 
R
Q
 
A
G
 
G
A
 
A
N
 
H
I
 
V
V
 
L
L
 
-
N
 
-
G
 
A
F
 
W
G
 
G
D
x
R
V
 
T
D
 
D
G
 
G
P
 
V
R
 
K
A
 
E
-
 
V
-
 
A
-
 
D
E
 
E
V
 
I
L
 
A
A
 
D
A
 
G
G
 
G
A
 
G
A
 
S
A
 
A
E
 
E
V
 
A
Q
 
V
V
 
V
A
 
A
Y
x
D
H
x
L
G
 
-
A
 
A
D
 
D
M
 
L
S
 
E
R
 
G
A
 
A
A
 
A
D
 
N
I
 
V
E
 
A
D
 
E
M
 
E
M
 
L
K
 
A
S
 
A
S
 
T
A
 
R
A
 
-
Q
 
-
F
 
-
G
 
-
R
 
R
V
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
|
I
Q
 
I
H
 
A
V
 
R
A
 
A
N
 
P
V
 
A
E
 
E
D
 
E
F
 
V
P
 
S
V
 
L
E
 
G
R
 
R
W
 
W
D
 
R
S
 
E
V
 
V
I
 
L
A
 
T
I
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
D
S
 
A
A
 
A
F
 
W
H
 
V
T
 
L
S
 
S
R
 
R
L
 
S
A
 
F
L
 
G
P
 
T
A
 
A
M
 
M
K
 
L
S
 
A
A
 
H
N
 
G
W
 
S
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
V
N
 
T
V
x
I
A
|
A
S
|
S
V
 
M
H
 
L
G
 
S
L
 
F
V
 
Q
G
 
G
S
 
G
A
 
R
Q
 
N
K
x
V
A
 
A
A
 
A
Y
|
Y
V
 
A
A
 
A
A
 
S
K
|
K
H
 
H
G
 
A
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
R
V
 
A
T
 
L
A
 
A
L
 
S
E
 
E
N
 
W
A
 
A
T
 
G
T
 
R
G
 
G
V
 
V
T
 
G
C
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
L
C
 
A
P
|
P
G
|
G
W
 
Y
V
|
V
L
 
V
T
|
T
P
 
-
L
 
-
V
 
-
Q
 
-
K
 
-
Q
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
A
A
x
N
E
x
T
H
 
A
G
 
A
L
 
L
S
 
R
N
 
A
E
 
D
D
 
D
A
 
E
K
 
R
K
 
A
L
 
A
L
 
E
L
 
I
G
 
T
E
 
A
K
 
R
E
 
I
P
 
P
S
 
A
M
 
G
Q
 
R
F
 
W
T
 
A
T
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
D
L
 
M
G
 
V
E
 
G
L
 
P
A
 
A
V
 
V
F
 
F
F
 
L
C
 
A
S
 
S
P
 
D
A
 
A
A
 
A
N
 
S
N
 
Y
V
 
V
R
 
H
G
 
G
V
 
Q
A
 
V
W
 
L
N
 
A
M
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
W
A
 
L
A
 
A
Q
 
S

2rh4A Actinorhodin ketoreductase, actkr, with NADPH and inhibitor emodin (see paper)
35% identity, 97% coverage: 5:256/260 of query aligns to 3:253/257 of 2rh4A

query
sites
2rh4A
K
 
E
T
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
T
|
T
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
G
 
E
I
 
I
A
 
A
K
 
R
A
 
R
L
 
L
A
 
G
R
 
K
Q
 
E
G
 
G
A
 
L
N
 
R
I
 
V
V
 
F
L
 
V
N
 
C
G
x
A
F
x
R
G
|
G
D
 
E
V
 
-
D
 
E
G
 
G
P
 
L
R
 
R
A
 
T
-
 
T
-
 
L
-
 
K
E
 
E
V
 
L
L
 
R
A
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
V
A
 
E
A
 
A
E
 
D
V
 
G
Q
 
R
V
 
T
A
x
C
Y
 
-
H
 
-
G
 
-
A
 
-
D
|
D
M
x
V
S
 
R
R
 
S
A
 
V
A
 
P
D
 
E
I
 
I
E
 
E
D
 
A
M
 
L
M
 
V
K
 
A
S
 
A
S
 
V
A
 
V
A
 
E
Q
 
R
F
 
Y
G
 
G
R
 
P
V
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
R
Q
 
P
H
 
G
V
 
G
A
 
G
N
 
A
V
 
T
E
 
A
D
 
E
F
 
L
P
 
A
V
 
D
E
 
E
R
 
L
W
 
W
D
 
L
S
 
D
V
 
V
I
 
V
A
 
E
I
 
T
N
|
N
L
 
L
T
 
T
S
 
G
A
 
V
F
 
F
H
 
R
T
 
V
S
 
T
R
 
K
L
 
Q
A
 
V
L
 
L
P
 
K
A
 
A
-
 
G
-
 
G
M
 
M
K
 
L
S
 
E
A
 
R
N
 
G
W
 
T
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
V
N
 
N
V
 
I
A
 
A
S
|
S
V
x
T
H
 
G
G
 
G
L
 
K
V
x
Q
G
 
G
S
x
V
A
 
V
Q
 
H
K
 
A
A
 
A
A
 
P
Y
|
Y
V
 
S
A
 
A
A
 
S
K
|
K
H
 
H
G
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
F
T
 
T
K
 
K
V
 
A
T
 
L
A
 
G
L
 
L
E
 
E
N
 
L
A
 
A
T
 
R
T
 
T
G
 
G
V
 
I
T
 
T
C
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
C
 
C
P
|
P
G
|
G
W
x
F
V
|
V
L
 
E
T
|
T
P
 
P
L
x
M
V
 
A
Q
 
A
K
 
S
Q
 
V
V
 
R
D
 
E
A
 
H
K
x
Y
A
 
S
A
 
D
E
 
I
H
 
W
G
 
E
L
 
V
S
 
S
N
 
T
E
 
E
D
 
E
A
 
A
K
 
F
K
 
D
L
 
R
L
 
I
L
 
T
G
 
A
E
 
-
K
 
R
E
 
V
P
 
P
S
 
I
M
 
G
Q
 
R
F
 
Y
T
 
V
T
 
Q
P
 
P
E
 
S
E
 
E
L
 
V
G
 
A
E
 
E
L
 
M
A
 
V
V
 
A
F
 
Y
F
 
L
C
 
I
S
 
G
P
 
P
A
 
G
A
 
A
N
 
A
N
 
A
V
 
V
R
 
T
G
 
A
V
 
Q
A
 
A
W
 
L
N
 
N
M
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

P16544 Putative ketoacyl reductase; EC 1.3.1.- from Streptomyces coelicolor (strain ATCC BAA-471 / A3(2) / M145) (see 2 papers)
35% identity, 97% coverage: 5:256/260 of query aligns to 7:257/261 of P16544

query
sites
P16544
K
 
E
T
 
V
A
 
A
L
 
L
V
|
V
T
|
T
G
|
G
S
x
A
T
|
T
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
|
G
L
|
L
G
x
E
I
|
I
A
|
A
K
x
R
A
x
R
L
|
L
A
x
G
R
x
K
Q
x
E
G
|
G
A
x
L
N
x
R
I
x
V
V
x
F
L
x
V
N
x
C
G
x
A
F
x
R
G
|
G
D
 
E
V
 
-
D
 
E
G
 
G
P
 
L
R
 
R
A
 
T
-
 
T
-
 
L
-
 
K
E
 
E
V
 
L
L
 
R
A
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
V
A
 
E
A
 
A
E
 
D
V
 
G
Q
 
R
V
 
T
A
 
C
Y
 
-
H
 
-
G
 
-
A
 
-
D
|
D
M
 
V
S
 
R
R
 
S
A
 
V
A
 
P
D
 
E
I
 
I
E
 
E
D
 
A
M
 
L
M
 
V
K
 
A
S
 
A
S
 
V
A
 
V
A
 
E
Q
 
R
F
 
Y
G
 
G
R
 
P
V
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
R
Q
 
P
H
 
G
V
 
G
A
 
G
N
 
A
V
 
T
E
 
A
D
 
E
F
 
L
P
 
A
V
 
D
E
 
E
R
 
L
W
 
W
D
 
L
S
 
D
V
 
V
I
 
V
A
 
E
I
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
T
S
 
G
A
 
V
F
 
F
H
 
R
T
 
V
S
 
T
R
 
K
L
 
Q
A
 
V
L
 
L
P
 
K
A
 
A
-
 
G
-
 
G
M
 
M
K
 
L
S
 
E
A
 
R
N
 
G
W
 
T
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
V
N
 
N
V
 
I
A
 
A
S
 
S
V
 
T
H
 
G
G
 
G
L
 
K
V
 
Q
G
 
G
S
 
V
A
 
V
Q
 
H
K
 
A
A
 
A
A
 
P
Y
 
Y
V
 
S
A
 
A
A
 
S
K
|
K
H
 
H
G
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
F
T
 
T
K
 
K
V
 
A
T
 
L
A
 
G
L
 
L
E
 
E
N
 
L
A
 
A
T
 
R
T
 
T
G
 
G
V
 
I
T
 
T
C
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
C
 
C
P
 
P
G
 
G
W
 
F
V
 
V
L
 
E
T
 
T
P
 
P
L
 
M
V
 
A
Q
 
A
K
 
S
Q
 
V
V
 
R
D
 
E
A
 
H
K
 
Y
A
 
S
A
 
D
E
 
I
H
 
W
G
 
E
L
 
V
S
 
S
N
 
T
E
 
E
D
 
E
A
 
A
K
 
F
K
 
D
L
 
R
L
 
I
L
 
T
G
 
A
E
 
-
K
 
R
E
 
V
P
 
P
S
 
I
M
 
G
Q
 
R
F
 
Y
T
 
V
T
 
Q
P
 
P
E
 
S
E
 
E
L
 
V
G
 
A
E
 
E
L
 
M
A
 
V
V
 
A
F
 
Y
F
 
L
C
 
I
S
 
G
P
 
P
A
 
G
A
 
A
N
 
A
N
 
A
V
 
V
R
 
T
G
 
A
V
 
Q
A
 
A
W
 
L
N
 
N
M
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G

Query Sequence

>Ac3H11_360 D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase (EC 1.1.1.30)
MLKGKTALVTGSTSGIGLGIAKALARQGANIVLNGFGDVDGPRAEVLAAGAAAEVQVAYH
GADMSRAADIEDMMKSSAAQFGRVDILVNNAGIQHVANVEDFPVERWDSVIAINLTSAFH
TSRLALPAMKSANWGRIINVASVHGLVGSAQKAAYVAAKHGVVGLTKVTALENATTGVTC
NAICPGWVLTPLVQKQVDAKAAEHGLSNEDAKKLLLGEKEPSMQFTTPEELGELAVFFCS
PAANNVRGVAWNMDGGWAAQ

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory