SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Ac3H11_416 FitnessBrowser__acidovorax_3H11:Ac3H11_416 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 4 hits to proteins with known functional sites (download)

1pj7A Structure of dimethylglycine oxidase of arthrobacter globiformis in complex with folinic acid (see paper)
23% identity, 98% coverage: 2:402/410 of query aligns to 3:382/827 of 1pj7A

query
sites
1pj7A
K
 
R
I
 
I
A
 
V
I
 
I
V
 
I
G
|
G
A
 
A
G
|
G
I
|
I
V
|
V
G
 
G
V
 
T
T
 
N
T
 
L
A
 
A
Y
 
D
E
 
E
L
 
L
A
 
V
S
 
T
D
 
R
G
 
G
-
 
W
H
 
N
E
 
N
V
 
I
T
 
T
V
 
V
F
 
L
E
x
D
Q
|
Q
R
 
-
S
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
-
E
 
-
A
 
-
S
 
-
F
 
-
A
 
-
T
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
P
 
-
H
 
-
L
 
-
L
 
-
T
 
-
P
 
-
W
 
-
A
 
-
V
 
-
P
 
-
G
 
-
F
 
-
G
 
-
H
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
L
 
-
M
 
-
G
 
G
P
 
P
H
 
-
A
 
-
T
 
-
L
 
L
R
 
N
L
 
M
S
 
P
G
 
G
G
|
G
L
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
N
 
-
W
 
-
A
 
-
W
 
-
L
 
-
S
 
-
R
 
-
W
 
-
R
 
-
S
|
S
A
x
T
T
 
S
H
|
H
A
 
A
-
x
P
-
 
G
-
x
L
-
 
V
-
 
F
S
 
Q
S
 
T
A
 
N
P
 
P
A
 
S
A
 
K
A
 
T
L
 
M
E
 
A
R
 
S
L
 
F
A
 
A
Q
 
K
Y
 
Y
S
 
T
Q
 
V
S
 
E
R
 
K
L
 
L
Q
 
L
A
 
S
L
 
L
A
 
T
Q
 
E
R
 
D
H
 
G
E
 
V
L
 
S
D
 
C
F
 
F
E
 
N
A
 
Q
S
 
V
Q
 
G
G
 
G
R
 
-
L
 
L
V
 
E
L
 
V
L
 
A
R
 
T
T
 
T
E
 
E
Q
 
T
E
 
R
R
 
L
A
 
A
Q
 
D
L
 
L
Q
 
K
P
 
R
A
 
K
L
 
L
Q
 
G
V
 
Y
L
 
A
R
 
A
D
 
A
S
 
W
G
 
G
V
 
I
A
 
E
L
 
G
R
 
R
E
 
L
V
 
L
D
 
S
A
 
P
D
 
A
I
 
E
A
 
C
R
 
Q
Q
 
E
I
 
L
E
 
Y
P
 
P
G
 
L
L
 
L
S
 
D
P
 
G
E
 
E
A
 
N
P
 
I
L
 
L
A
 
G
G
 
G
A
 
-
I
 
L
H
 
H
L
 
V
P
 
P
D
 
S
A
 
D
R
 
G
A
 
L
G
 
A
N
 
S
C
 
A
R
 
A
L
 
R
F
 
A
A
 
V
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
R
 
I
Q
 
K
G
 
R
T
 
T
Q
 
E
G
 
S
S
 
A
G
 
G
V
 
V
H
 
T
F
 
Y
A
 
R
F
 
G
N
 
S
T
 
T
R
x
T
I
x
V
D
 
T
R
 
G
I
 
I
G
 
E
T
 
Q
T
 
S
P
 
G
V
 
G
G
 
R
V
 
V
V
 
T
-
 
G
V
 
V
Q
 
Q
G
 
T
E
 
A
S
 
D
D
 
G
L
 
V
R
 
I
R
 
P
F
 
A
D
 
D
A
 
I
V
 
V
V
 
V
L
 
S
C
 
C
A
|
A
G
|
G
T
 
F
A
x
W
S
 
G
A
 
A
A
 
K
L
 
I
L
 
G
P
 
A
A
 
M
L
 
I
G
 
G
M
 
M
R
 
A
-
 
V
-
 
P
-
 
L
L
 
L
P
 
P
M
 
L
A
 
A
A
x
H
V
 
Q
Y
 
Y
G
 
V
Y
 
K
S
 
T
V
 
T
S
 
P
A
 
V
P
 
P
L
 
A
R
 
Q
E
 
Q
S
 
G
-
 
R
T
 
N
H
 
D
A
 
Q
P
 
P
Q
 
N
A
 
G
S
 
A
-
 
R
-
 
L
-
 
P
-
 
I
V
 
L
V
 
R
D
 
H
A
 
Q
A
 
D
Q
 
Q
Q
 
D
I
 
L
S
x
Y
I
 
Y
T
 
R
R
 
E
L
 
H
G
 
G
Q
 
D
R
 
R
V
 
Y
R
 
G
I
 
I
A
 
G
G
 
S
-
 
Y
-
 
A
-
 
H
-
 
R
-
 
P
-
 
M
-
 
P
-
 
V
-
 
D
-
 
V
-
 
D
-
 
T
-
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
Y
L
 
A
A
 
P
G
 
E
A
 
T
D
 
V
A
 
S
E
 
E
H
 
H
H
 
H
A
 
M
A
 
P
T
 
S
L
 
-
Q
 
-
R
 
R
L
 
L
Y
 
D
R
 
F
T
 
T
L
 
L
N
 
E
D
 
D
W
 
F
F
 
L
P
 
P
-
 
A
-
 
W
-
 
E
-
 
A
-
 
T
-
 
K
-
 
Q
-
 
L
-
 
L
-
 
P
-
 
A
-
 
L
G
 
A
G
 
D
A
 
S
Q
 
E
L
 
I
S
 
E
S
 
D
G
 
G
V
 
-
Q
 
-
V
 
-
W
 
F
R
 
N
G
 
G
A
x
I
R
 
F
P
 
S
L
 
F
L
 
T
P
 
P
D
 
D
G
 
G
A
 
G
P
 
P
V
 
L
V
 
L
G
 
G
A
 
E
S
 
S
G
 
K
-
 
E
V
 
L
P
 
D
G
 
G
L
 
F
W
 
Y
L
 
V
N
 
-
T
 
-
G
 
-
H
 
-
G
 
A
A
 
E
G
 
A
G
x
V
W
|
W
A
x
V
L
x
T
-
 
H
A
 
S
C
 
A
G
 
G
S
 
V
A
 
A
R
 
K
A
 
A
L
 
M
A
 
A
D
 
E
L
 
L
M
 
L
A
 
T
Q
 
T
R
 
G
V
 
R
P
 
S
E
 
E
V
 
T
P
 
D
L
 
L

Sites not aligning to the query:

1pj6A Crystal structure of dimethylglycine oxidase of arthrobacter globiformis in complex with folic acid (see paper)
23% identity, 98% coverage: 2:402/410 of query aligns to 4:383/828 of 1pj6A

query
sites
1pj6A
K
 
R
I
 
I
A
 
V
I
 
I
V
 
I
G
|
G
A
 
A
G
|
G
I
|
I
V
|
V
G
 
G
V
 
T
T
 
N
T
 
L
A
 
A
Y
 
D
E
 
E
L
 
L
A
 
V
S
 
T
D
 
R
G
 
G
-
 
W
H
 
N
E
 
N
V
 
I
T
 
T
V
 
V
F
 
L
E
x
D
Q
|
Q
R
 
-
S
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
-
E
 
-
A
 
-
S
 
-
F
 
-
A
 
-
T
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
P
 
-
H
 
-
L
 
-
L
 
-
T
 
-
P
 
-
W
 
-
A
 
-
V
 
-
P
 
-
G
 
-
F
 
-
G
 
-
H
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
L
 
-
M
 
-
G
 
G
P
 
P
H
 
-
A
 
-
T
 
-
L
 
L
R
 
N
L
 
M
S
 
P
G
 
G
G
|
G
L
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
N
 
-
W
 
-
A
 
-
W
 
-
L
 
-
S
 
-
R
 
-
W
 
-
R
 
-
S
|
S
A
x
T
T
 
S
H
|
H
A
 
A
-
x
P
-
 
G
-
x
L
-
 
V
-
 
F
S
 
Q
S
 
T
A
 
N
P
 
P
A
 
S
A
 
K
A
 
T
L
 
M
E
 
A
R
 
S
L
 
F
A
 
A
Q
 
K
Y
 
Y
S
 
T
Q
 
V
S
 
E
R
 
K
L
 
L
Q
 
L
A
 
S
L
 
L
A
 
T
Q
 
E
R
 
D
H
 
G
E
 
V
L
 
S
D
 
C
F
 
F
E
 
N
A
 
Q
S
 
V
Q
 
G
G
 
G
R
 
-
L
 
L
V
 
E
L
 
V
L
 
A
R
 
T
T
 
T
E
 
E
Q
 
T
E
 
R
R
 
L
A
 
A
Q
 
D
L
 
L
Q
 
K
P
 
R
A
 
K
L
 
L
Q
 
G
V
 
Y
L
 
A
R
 
A
D
 
A
S
 
W
G
 
G
V
 
I
A
 
E
L
 
G
R
 
R
E
 
L
V
 
L
D
 
S
A
 
P
D
 
A
I
 
E
A
 
C
R
 
Q
Q
 
E
I
 
L
E
 
Y
P
 
P
G
 
L
L
 
L
S
 
D
P
 
G
E
 
E
A
 
N
P
 
I
L
 
L
A
 
G
G
 
G
A
 
-
I
 
L
H
 
H
L
 
V
P
 
P
D
 
S
A
 
D
R
 
G
A
 
L
G
 
A
N
 
S
C
 
A
R
 
A
L
 
R
F
 
A
A
 
V
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
R
 
I
Q
 
K
G
 
R
T
 
T
Q
 
E
G
 
S
S
 
A
G
 
G
V
 
V
H
 
T
F
 
Y
A
 
R
F
 
G
N
 
S
T
 
T
R
 
T
I
x
V
D
 
T
R
 
G
I
 
I
G
 
E
T
 
Q
T
 
S
P
 
G
V
 
G
G
 
R
V
 
V
V
 
T
-
 
G
V
 
V
Q
 
Q
G
 
T
E
 
A
S
 
D
D
 
G
L
 
V
R
 
I
R
 
P
F
 
A
D
 
D
A
 
I
V
 
V
V
 
V
L
 
S
C
 
C
A
|
A
G
|
G
T
 
F
A
x
W
S
 
G
A
 
A
A
 
K
L
 
I
L
 
G
P
 
A
A
 
M
L
 
I
G
 
G
M
 
M
R
 
A
-
 
V
-
 
P
-
 
L
L
 
L
P
 
P
M
 
L
A
 
A
A
x
H
V
 
Q
Y
 
Y
G
 
V
Y
 
K
S
 
T
V
 
T
S
 
P
A
 
V
P
 
P
L
 
A
R
 
Q
E
 
Q
S
 
G
-
 
R
T
 
N
H
 
D
A
 
Q
P
 
P
Q
 
N
A
 
G
S
 
A
-
 
R
-
 
L
-
 
P
-
 
I
V
 
L
V
 
R
D
 
H
A
 
Q
A
 
D
Q
 
Q
Q
 
D
I
 
L
S
x
Y
I
 
Y
T
 
R
R
 
E
L
 
H
G
 
G
Q
 
D
R
 
R
V
 
Y
R
 
G
I
 
I
A
 
G
G
 
S
-
 
Y
-
 
A
-
 
H
-
 
R
-
 
P
-
 
M
-
 
P
-
 
V
-
 
D
-
 
V
-
 
D
-
 
T
-
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
Y
L
 
A
A
 
P
G
 
E
A
 
T
D
 
V
A
 
S
E
 
E
H
 
H
H
 
H
A
 
M
A
 
P
T
 
S
L
 
-
Q
 
-
R
 
R
L
 
L
Y
 
D
R
 
F
T
 
T
L
 
L
N
 
E
D
 
D
W
 
F
F
 
L
P
 
P
-
 
A
-
 
W
-
 
E
-
 
A
-
 
T
-
 
K
-
 
Q
-
 
L
-
 
L
-
 
P
-
 
A
-
 
L
G
 
A
G
 
D
A
 
S
Q
 
E
L
 
I
S
 
E
S
 
D
G
 
G
V
 
-
Q
 
-
V
 
-
W
 
F
R
 
N
G
|
G
A
x
I
R
 
F
P
 
S
L
 
F
L
 
T
P
 
P
D
 
D
G
 
G
A
 
G
P
 
P
V
 
L
V
 
L
G
 
G
A
 
E
S
 
S
G
 
K
-
 
E
V
 
L
P
 
D
G
 
G
L
 
F
W
 
Y
L
 
V
N
 
-
T
 
-
G
 
-
H
 
-
G
 
A
A
 
E
G
 
A
G
x
V
W
|
W
A
x
V
L
x
T
-
 
H
A
 
S
C
 
A
G
 
G
S
 
V
A
 
A
R
 
K
A
 
A
L
 
M
A
 
A
D
 
E
L
 
L
M
 
L
A
 
T
Q
 
T
R
 
G
V
 
R
P
 
S
E
 
E
V
 
T
P
 
D
L
 
L

Sites not aligning to the query:

Q9AGP8 Dimethylglycine oxidase; DMGO; EC 1.5.3.10 from Arthrobacter globiformis (see 2 papers)
23% identity, 98% coverage: 2:402/410 of query aligns to 6:385/830 of Q9AGP8

query
sites
Q9AGP8
K
 
R
I
 
I
A
 
V
I
 
I
V
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
I
|
I
V
|
V
G
 
G
V
 
T
T
 
N
T
 
L
A
 
A
Y
 
D
E
 
E
L
 
L
A
 
V
S
 
T
D
 
R
G
 
G
-
 
W
H
 
N
E
 
N
V
 
I
T
 
T
V
 
V
F
 
L
E
x
D
Q
|
Q
R
 
-
S
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
-
E
 
-
A
 
-
S
 
-
F
 
-
A
 
-
T
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
P
 
-
H
 
-
L
 
-
L
 
-
T
 
-
P
 
-
W
 
-
A
 
-
V
 
-
P
 
-
G
 
-
F
 
-
G
 
-
H
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
L
 
-
M
 
-
G
 
G
P
 
P
H
 
-
A
 
-
T
 
-
L
 
L
R
 
N
L
 
M
S
 
P
G
 
G
G
 
G
L
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
N
 
-
W
 
-
A
 
-
W
 
-
L
 
-
S
 
-
R
 
-
W
 
-
R
 
-
S
|
S
A
x
T
T
x
S
H
|
H
A
 
A
-
 
P
-
 
G
-
x
L
-
 
V
-
 
F
S
 
Q
S
 
T
A
 
N
P
 
P
A
 
S
A
 
K
A
 
T
L
 
M
E
 
A
R
 
S
L
 
F
A
 
A
Q
 
K
Y
 
Y
S
 
T
Q
 
V
S
 
E
R
 
K
L
 
L
Q
 
L
A
 
S
L
 
L
A
 
T
Q
 
E
R
 
D
H
 
G
E
 
V
L
 
S
D
 
C
F
 
F
E
 
N
A
 
Q
S
 
V
Q
 
G
G
 
G
R
 
-
L
 
L
V
 
E
L
 
V
L
 
A
R
 
T
T
 
T
E
 
E
Q
 
T
E
 
R
R
 
L
A
 
A
Q
 
D
L
 
L
Q
 
K
P
 
R
A
 
K
L
 
L
Q
 
G
V
 
Y
L
 
A
R
 
A
D
 
A
S
 
W
G
 
G
V
 
I
A
 
E
L
 
G
R
 
R
E
 
L
V
 
L
D
 
S
A
 
P
D
 
A
I
 
E
A
 
C
R
 
Q
Q
 
E
I
 
L
E
 
Y
P
 
P
G
 
L
L
 
L
S
 
D
P
 
G
E
 
E
A
 
N
P
 
I
L
 
L
A
 
G
G
 
G
A
 
-
I
 
L
H
 
H
L
 
V
P
 
P
D
 
S
A
 
D
R
 
G
A
 
L
G
 
A
N
 
S
C
 
A
R
 
A
L
 
R
F
 
A
A
 
V
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
R
 
I
Q
 
K
G
 
R
T
 
T
Q
 
E
G
 
S
S
 
A
G
 
G
V
 
V
H
 
T
F
 
Y
A
 
R
F
 
G
N
 
S
T
 
T
R
 
T
I
x
V
D
 
T
R
 
G
I
 
I
G
 
E
T
 
Q
T
 
S
P
 
G
V
 
G
G
 
R
V
 
V
V
 
T
-
 
G
V
 
V
Q
 
Q
G
 
T
E
 
A
S
 
D
D
 
G
L
 
V
R
 
I
R
 
P
F
 
A
D
 
D
A
 
I
V
 
V
V
 
V
L
 
S
C
 
C
A
 
A
G
 
G
T
 
F
A
 
W
S
 
G
A
 
A
A
 
K
L
 
I
L
 
G
P
 
A
A
 
M
L
 
I
G
 
G
M
 
M
R
 
A
-
 
V
-
 
P
-
 
L
L
 
L
P
 
P
M
 
L
A
 
A
A
x
H
V
 
Q
Y
 
Y
G
 
V
Y
 
K
S
 
T
V
 
T
S
 
P
A
 
V
P
 
P
L
 
A
R
 
Q
E
 
Q
S
 
G
-
 
R
T
 
N
H
 
D
A
 
Q
P
 
P
Q
 
N
A
 
G
S
 
A
-
 
R
-
 
L
-
 
P
-
 
I
V
 
L
V
 
R
D
 
H
A
 
Q
A
 
D
Q
 
Q
Q
 
D
I
 
L
S
x
Y
I
 
Y
T
 
R
R
 
E
L
 
H
G
 
G
Q
 
D
R
 
R
V
 
Y
R
 
G
I
 
I
A
 
G
G
 
S
-
 
Y
-
 
A
-
 
H
-
 
R
-
 
P
-
 
M
-
 
P
-
 
V
-
 
D
-
 
V
-
 
D
-
 
T
-
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
Y
L
 
A
A
 
P
G
 
E
A
 
T
D
 
V
A
 
S
E
 
E
H
 
H
H
 
H
A
 
M
A
 
P
T
 
S
L
 
-
Q
 
-
R
 
R
L
 
L
Y
 
D
R
 
F
T
 
T
L
 
L
N
 
E
D
 
D
W
 
F
F
 
L
P
 
P
-
 
A
-
 
W
-
 
E
-
 
A
-
 
T
-
 
K
-
 
Q
-
 
L
-
 
L
-
 
P
-
 
A
-
 
L
G
 
A
G
 
D
A
 
S
Q
 
E
L
 
I
S
 
E
S
 
D
G
 
G
V
 
-
Q
 
-
V
 
-
W
 
F
R
 
N
G
 
G
A
 
I
R
 
F
P
 
S
L
 
F
L
 
T
P
 
P
D
 
D
G
 
G
A
 
G
P
 
P
V
 
L
V
 
L
G
 
G
A
 
E
S
 
S
G
 
K
-
 
E
V
 
L
P
 
D
G
 
G
L
 
F
W
 
Y
L
 
V
N
 
-
T
 
-
G
 
-
H
 
-
G
 
A
A
 
E
G
 
A
G
x
V
W
|
W
A
x
V
L
x
T
-
 
H
A
 
S
C
 
A
G
 
G
S
 
V
A
 
A
R
 
K
A
 
A
L
 
M
A
 
A
D
 
E
L
 
L
M
 
L
A
 
T
Q
 
T
R
 
G
V
 
R
P
 
S
E
 
E
V
 
T
P
 
D
L
 
L

Sites not aligning to the query:

3gsiA Crystal structure of d552a dimethylglycine oxidase mutant of arthrobacter globiformis in complex with tetrahydrofolate (see paper)
23% identity, 98% coverage: 2:402/410 of query aligns to 3:382/827 of 3gsiA

query
sites
3gsiA
K
 
R
I
 
I
A
 
V
I
 
I
V
 
I
G
 
G
A
 
A
G
|
G
I
|
I
V
|
V
G
 
G
V
 
T
T
 
N
T
 
L
A
 
A
Y
 
D
E
 
E
L
 
L
A
 
V
S
 
T
D
 
R
G
 
G
-
 
W
H
 
N
E
 
N
V
 
I
T
 
T
V
 
V
F
 
L
E
x
D
Q
|
Q
R
 
-
S
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
-
E
 
-
A
 
-
S
 
-
F
 
-
A
 
-
T
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
P
 
-
H
 
-
L
 
-
L
 
-
T
 
-
P
 
-
W
 
-
A
 
-
V
 
-
P
 
-
G
 
-
F
 
-
G
 
-
H
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
L
 
-
M
 
-
G
 
G
P
 
P
H
 
-
A
 
-
T
 
-
L
 
L
R
 
N
L
 
M
S
 
P
G
 
G
G
|
G
L
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
N
 
-
W
 
-
A
 
-
W
 
-
L
 
-
S
 
-
R
 
-
W
 
-
R
 
-
S
|
S
A
x
T
T
 
S
H
|
H
A
 
A
-
x
P
-
 
G
-
x
L
-
 
V
-
 
F
S
 
Q
S
 
T
A
 
N
P
 
P
A
 
S
A
 
K
A
 
T
L
 
M
E
 
A
R
 
S
L
 
F
A
 
A
Q
 
K
Y
 
Y
S
 
T
Q
 
V
S
 
E
R
 
K
L
 
L
Q
 
L
A
 
S
L
 
L
A
 
T
Q
 
E
R
 
D
H
 
G
E
 
V
L
 
S
D
 
C
F
 
F
E
 
N
A
 
Q
S
 
V
Q
 
G
G
 
G
R
 
-
L
 
L
V
 
E
L
 
V
L
 
A
R
 
T
T
 
T
E
 
E
Q
 
T
E
 
R
R
 
L
A
 
A
Q
 
D
L
 
L
Q
 
K
P
 
R
A
 
K
L
 
L
Q
 
G
V
 
Y
L
 
A
R
 
A
D
 
A
S
 
W
G
 
G
V
 
I
A
 
E
L
 
G
R
 
R
E
 
L
V
 
L
D
 
S
A
 
P
D
 
A
I
 
E
A
 
C
R
 
Q
Q
 
E
I
 
L
E
 
Y
P
 
P
G
 
L
L
 
L
S
 
D
P
 
G
E
 
E
A
 
N
P
 
I
L
 
L
A
 
G
G
 
G
A
 
-
I
 
L
H
 
H
L
 
V
P
 
P
D
 
S
A
 
D
R
 
G
A
 
L
G
 
A
N
 
S
C
 
A
R
 
A
L
 
R
F
 
A
A
 
V
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
R
 
I
Q
 
K
G
 
R
T
 
T
Q
 
E
G
 
S
S
 
A
G
 
G
V
 
V
H
 
T
F
 
Y
A
 
R
F
 
G
N
 
S
T
 
T
R
x
T
I
x
V
D
 
T
R
 
G
I
 
I
G
 
E
T
 
Q
T
 
S
P
 
G
V
 
G
G
 
R
V
 
V
V
 
T
-
 
G
V
 
V
Q
 
Q
G
 
T
E
 
A
S
 
D
D
 
G
L
 
V
R
 
I
R
 
P
F
 
A
D
 
D
A
 
I
V
 
V
V
 
V
L
 
S
C
 
C
A
|
A
G
|
G
T
 
F
A
x
W
S
 
G
A
 
A
A
 
K
L
 
I
L
 
G
P
 
A
A
 
M
L
 
I
G
 
G
M
 
M
R
 
A
-
 
V
-
 
P
-
 
L
L
 
L
P
 
P
M
 
L
A
 
A
A
x
H
V
 
Q
Y
 
Y
G
 
V
Y
 
K
S
 
T
V
 
T
S
 
P
A
 
V
P
 
P
L
 
A
R
 
Q
E
 
Q
S
 
G
-
 
R
T
 
N
H
 
D
A
 
Q
P
 
P
Q
 
N
A
 
G
S
 
A
-
 
R
-
 
L
-
 
P
-
 
I
V
 
L
V
 
R
D
 
H
A
 
Q
A
 
D
Q
 
Q
Q
x
D
I
 
L
S
x
Y
I
 
Y
T
 
R
R
 
E
L
 
H
G
 
G
Q
 
D
R
 
R
V
 
Y
R
 
G
I
 
I
A
 
G
G
 
S
-
 
Y
-
 
A
-
 
H
-
 
R
-
 
P
-
 
M
-
 
P
-
 
V
-
 
D
-
 
V
-
 
D
-
 
T
-
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
Y
L
 
A
A
 
P
G
 
E
A
 
T
D
 
V
A
 
S
E
 
E
H
 
H
H
 
H
A
 
M
A
 
P
T
 
S
L
 
-
Q
 
-
R
 
R
L
 
L
Y
 
D
R
 
F
T
 
T
L
 
L
N
 
E
D
 
D
W
 
F
F
 
L
P
 
P
-
 
A
-
 
W
-
 
E
-
 
A
-
 
T
-
 
K
-
 
Q
-
 
L
-
 
L
-
 
P
-
 
A
-
 
L
G
 
A
G
 
D
A
 
S
Q
 
E
L
 
I
S
 
E
S
 
D
G
 
G
V
 
-
Q
 
-
V
 
-
W
 
F
R
 
N
G
|
G
A
x
I
R
x
F
P
 
S
L
 
F
L
 
T
P
 
P
D
 
D
G
 
G
A
 
G
P
 
P
V
 
L
V
 
L
G
 
G
A
 
E
S
 
S
G
 
K
-
 
E
V
 
L
P
 
D
G
 
G
L
 
F
W
 
Y
L
 
V
N
 
-
T
 
-
G
 
-
H
 
-
G
 
A
A
 
E
G
 
A
G
x
V
W
|
W
A
x
V
L
x
T
-
 
H
A
 
S
C
 
A
G
 
G
S
 
V
A
 
A
R
 
K
A
 
A
L
 
M
A
 
A
D
 
E
L
 
L
M
 
L
A
 
T
Q
 
T
R
 
G
V
 
R
P
 
S
E
 
E
V
 
T
P
 
D
L
 
L

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>Ac3H11_416 FitnessBrowser__acidovorax_3H11:Ac3H11_416
MKIAIVGAGIVGVTTAYELASDGHEVTVFEQRSAAAEEASFATAGLLAPHLLTPWAVPGF
GHALRLMGPHATLRLSGGLSRANWAWLSRWRSATHASSAPAAALERLAQYSQSRLQALAQ
RHELDFEASQGRLVLLRTEQERAQLQPALQVLRDSGVALREVDADIARQIEPGLSPEAPL
AGAIHLPDARAGNCRLFAQLLRQGTQGSGVHFAFNTRIDRIGTTPVGVVVQGESDLRRFD
AVVLCAGTASAALLPALGMRLPMAAVYGYSVSAPLRESTHAPQASVVDAAQQISITRLGQ
RVRIAGGAELAGADAEHHAATLQRLYRTLNDWFPGGAQLSSGVQVWRGARPLLPDGAPVV
GASGVPGLWLNTGHGAGGWALACGSARALADLMAQRVPEVPLDGLGMRPF

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory