SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Ac3H11_4630 FitnessBrowser__acidovorax_3H11:Ac3H11_4630 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1g6hA Crystal structure of the adp conformation of mj1267, an atp-binding cassette of an abc transporter (see paper)
31% identity, 91% coverage: 23:271/274 of query aligns to 4:253/254 of 1g6hA

query
sites
1g6hA
I
 
I
L
 
L
D
 
R
V
 
T
K
 
E
N
 
N
I
 
I
S
 
V
L
 
K
R
 
Y
F
|
F
G
 
G
G
 
E
V
x
F
K
 
K
A
 
A
L
 
L
T
 
D
D
 
G
I
 
V
S
 
S
F
 
I
N
 
S
V
 
V
K
 
N
E
 
K
H
 
G
E
 
D
I
 
V
R
 
T
A
 
L
I
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
M
 
L
L
 
I
N
 
N
C
 
V
I
 
I
N
 
T
G
 
G
V
 
F
Y
 
L
T
 
K
P
 
A
Q
 
D
D
 
E
G
 
G
S
 
R
I
 
V
T
 
Y
F
 
F
R
 
E
G
 
N
K
 
K
T
 
D
F
 
I
S
 
T
H
 
N
M
 
K
N
 
E
S
 
P
R
 
A
Q
 
E
V
 
L
A
 
Y
E
 
H
M
 
Y
G
 
G
V
 
I
A
 
V
R
 
R
T
 
T
F
 
F
Q
 
Q
N
 
T
L
 
P
A
 
Q
L
 
P
F
 
L
K
 
K
G
 
E
M
 
M
S
 
T
V
 
V
I
 
L
D
 
E
N
 
N
I
 
L
M
 
L
T
 
I
G
 
G
R
 
E
N
 
I
L
 
C
K
 
P
I
 
G
K
 
E
S
 
S
N
 
P
L
 
L
F
 
N
L
 
S
Q
 
L
A
 
F
L
 
Y
R
 
K
L
 
K
G
 
W
P
 
I
A
 
P
E
 
K
R
 
E
E
 
E
E
 
E
M
 
M
A
 
V
H
 
-
R
 
-
E
 
E
K
 
K
V
 
A
E
 
F
H
 
K
I
 
I
I
 
L
D
 
E
F
 
F
L
 
L
E
 
K
I
 
L
Q
 
S
A
 
H
F
 
L
R
 
Y
K
 
D
T
 
R
P
 
K
V
 
A
G
 
G
Q
 
E
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
Q
Q
 
M
K
 
K
R
 
L
V
 
V
D
 
E
L
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
M
M
 
T
E
 
N
P
 
P
Q
 
K
V
 
M
L
 
I
L
 
V
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
I
A
 
A
G
 
G
M
 
V
N
 
A
V
 
P
E
 
G
E
 
L
K
 
A
Q
 
H
D
 
D
M
 
I
C
 
F
R
 
N
F
 
H
I
 
V
L
 
L
D
 
E
V
 
L
N
 
K
D
 
A
E
 
K
F
 
-
G
 
G
T
 
I
T
 
T
I
 
F
V
 
L
L
 
I
I
 
I
E
 
E
H
 
H
D
 
R
M
 
L
G
 
D
V
 
I
V
 
V
M
 
L
D
 
N
I
 
Y
S
 
I
D
 
D
R
 
H
V
 
L
V
 
Y
V
 
V
L
 
M
D
 
F
Y
 
N
G
 
G
K
 
Q
K
 
I
I
 
I
G
 
A
D
 
E
G
 
G
T
 
R
P
 
G
D
 
E
E
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
N
V
 
V
R
 
L
N
 
S
N
 
D
Q
 
P
D
 
K
V
 
V
I
 
V
S
 
E
A
 
I
Y
 
Y
L
 
I
G
 
G

1g9xB Characterization of the twinning structure of mj1267, an atp-binding cassette of an abc transporter (see paper)
31% identity, 91% coverage: 23:271/274 of query aligns to 4:253/253 of 1g9xB

query
sites
1g9xB
I
 
I
L
 
L
D
 
R
V
 
T
K
 
E
N
 
N
I
 
I
S
 
V
L
 
K
R
 
Y
F
|
F
G
 
G
G
 
E
V
x
F
K
 
K
A
 
A
L
 
L
T
 
D
D
 
G
I
 
V
S
 
S
F
 
I
N
 
S
V
 
V
K
 
C
E
 
K
H
 
G
E
 
D
I
 
V
R
 
T
A
 
L
I
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
M
 
L
L
 
I
N
 
N
C
 
V
I
 
I
N
 
T
G
 
G
V
 
F
Y
 
L
T
 
K
P
 
A
Q
 
D
D
 
E
G
 
G
S
 
R
I
 
V
T
 
Y
F
 
F
R
 
E
G
 
N
K
 
K
T
 
D
F
 
I
S
 
T
H
 
N
M
 
K
N
 
E
S
 
P
R
 
A
Q
 
E
V
 
L
A
 
Y
E
 
H
M
 
Y
G
 
G
V
 
I
A
 
V
R
 
R
T
 
T
F
 
F
Q
 
Q
N
 
T
L
 
P
A
 
Q
L
 
P
F
 
L
K
 
K
G
 
E
M
 
M
S
 
T
V
 
V
I
 
L
D
 
E
N
 
N
I
 
L
M
 
L
T
 
I
G
 
G
R
 
E
N
 
I
L
 
N
K
 
P
I
 
G
K
 
E
S
 
S
N
 
P
L
 
L
F
 
N
L
 
S
Q
 
L
A
 
F
L
 
Y
R
 
K
L
 
K
G
 
W
P
 
I
A
 
P
E
 
K
R
 
E
E
 
E
E
 
E
M
 
M
A
 
V
H
 
-
R
 
-
E
 
E
K
 
K
V
 
A
E
 
F
H
 
K
I
 
I
I
 
L
D
 
E
F
 
F
L
 
L
E
 
K
I
 
L
Q
 
S
A
 
H
F
 
L
R
 
Y
K
 
D
T
 
R
P
 
K
V
 
A
G
 
G
Q
 
E
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
Q
Q
 
M
K
 
K
R
 
L
V
 
V
D
 
E
L
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
M
M
 
T
E
 
N
P
 
P
Q
 
K
V
 
M
L
 
I
L
 
V
L
 
M
D
 
D
E
|
E
P
 
P
M
 
I
A
 
A
G
 
G
M
 
V
N
 
A
V
 
P
E
 
G
E
 
L
K
 
A
Q
 
H
D
 
D
M
 
I
C
 
F
R
 
N
F
 
H
I
 
V
L
 
L
D
 
E
V
 
L
N
 
K
D
 
A
E
 
K
F
 
-
G
 
G
T
 
I
T
 
T
I
 
F
V
 
L
L
 
I
I
 
I
E
 
E
H
 
H
D
 
R
M
 
L
G
 
D
V
 
I
V
 
V
M
 
L
D
 
N
I
 
Y
S
 
I
D
 
D
R
 
H
V
 
L
V
 
Y
V
 
V
L
 
M
D
 
F
Y
 
N
G
 
G
K
 
Q
K
 
I
I
 
I
G
 
A
D
 
E
G
 
G
T
 
R
P
 
G
D
 
E
E
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
N
V
 
V
R
 
L
N
 
S
N
 
D
Q
 
P
D
 
K
V
 
V
I
 
V
S
 
E
A
 
I
Y
 
Y
L
 
I
G
 
G

6mjpA Lptb(e163q)fgc from vibrio cholerae (see paper)
31% identity, 91% coverage: 23:271/274 of query aligns to 2:235/240 of 6mjpA

query
sites
6mjpA
I
 
I
L
 
L
D
 
K
V
 
A
K
 
Q
N
 
H
I
 
L
S
 
A
L
 
K
R
 
S
F
 
Y
G
 
K
G
 
K
V
 
R
K
 
K
A
 
V
L
 
V
T
 
S
D
 
D
I
 
V
S
 
S
F
 
L
N
 
Q
V
 
V
K
 
E
E
 
S
H
 
G
E
 
Q
I
 
I
R
 
V
A
 
G
I
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
T
S
 
T
M
 
S
L
 
F
N
 
Y
C
 
M
I
 
I
N
 
V
G
 
G
V
 
L
Y
 
V
T
 
A
P
 
R
Q
 
D
D
 
E
G
 
G
S
 
T
I
 
I
T
 
T
F
 
I
R
 
D
G
 
D
K
 
N
T
 
D
F
 
I
S
 
S
H
 
I
M
 
L
N
 
P
S
 
M
R
 
H
Q
 
S
V
 
R
A
 
S
E
 
R
M
 
M
G
 
G
V
 
I
A
 
G
R
 
Y
T
 
L
F
 
P
Q
 
Q
N
 
E
L
 
A
A
 
S
L
 
I
F
 
F
K
 
R
G
 
K
M
 
L
S
 
S
V
 
V
I
 
E
D
 
D
N
 
N
I
 
I
M
 
M
T
 
A
G
 
-
R
 
-
N
 
-
L
 
-
K
 
-
I
 
-
K
 
-
S
 
-
N
 
-
L
 
-
F
 
V
L
 
L
Q
 
Q
A
 
T
L
 
-
R
 
-
L
 
-
G
 
-
P
 
-
A
 
-
E
 
-
R
 
R
E
 
E
E
 
E
M
 
L
A
 
T
H
 
H
R
x
E
E
 
E
K
 
R
V
 
Q
E
x
D
H
 
K
I
 
L
I
 
E
D
 
D
F
 
L
L
 
L
E
 
E
-
 
E
-
 
F
-
 
H
I
 
I
Q
 
Q
A
 
H
F
 
I
R
 
R
K
 
K
T
 
S
P
 
A
V
 
G
G
 
M
Q
 
A
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
E
Q
 
R
K
 
R
R
 
R
V
 
V
D
 
E
L
 
I
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
A
E
 
N
P
 
P
Q
 
Q
V
 
F
L
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
M
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
V
N
 
D
V
 
P
E
 
I
E
 
S
K
 
V
Q
 
I
D
 
D
M
 
I
C
 
K
R
 
K
F
 
I
I
 
I
L
 
E
D
 
H
V
 
L
N
 
R
D
 
D
E
 
R
F
 
-
G
 
G
T
 
L
T
 
G
I
 
V
V
 
L
L
 
I
I
 
T
E
 
D
H
 
H
D
 
N
M
 
V
G
 
R
V
 
E
V
 
T
M
 
L
D
 
D
I
 
V
S
 
C
D
 
E
R
 
K
V
 
A
V
 
Y
V
 
I
L
 
V
D
 
S
Y
 
Q
G
 
G
K
 
R
K
 
L
I
 
I
G
 
A
D
 
E
G
 
G
T
 
T
P
 
P
D
 
Q
E
 
D
V
 
V
R
 
L
N
 
N
N
 
N
Q
 
E
D
 
Q
V
 
V
I
 
K
S
 
Q
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G

4u00A Crystal structure of ttha1159 in complex with adp (see paper)
32% identity, 91% coverage: 23:270/274 of query aligns to 2:236/241 of 4u00A

query
sites
4u00A
I
 
I
L
 
I
D
 
R
V
 
I
K
 
R
N
 
N
I
 
L
S
 
H
L
 
K
R
 
W
F
|
F
G
 
G
G
 
P
V
 
L
K
 
H
A
x
V
L
 
L
T
 
K
D
 
G
I
 
I
S
 
H
F
 
L
N
 
E
V
 
V
K
 
A
E
 
P
H
 
G
E
 
E
I
 
K
R
 
L
A
 
V
I
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
M
 
L
L
 
I
N
 
R
C
 
T
I
 
I
N
 
N
G
 
R
V
 
L
Y
 
E
T
 
D
P
 
F
Q
 
Q
D
 
E
G
 
G
S
 
E
I
 
V
T
 
V
F
 
V
R
 
D
G
 
G
K
 
L
T
 
S
F
 
V
S
 
K
H
 
D
M
 
D
N
 
R
S
 
A
R
 
L
Q
 
R
V
 
E
A
 
I
E
 
R
M
 
R
G
 
E
V
 
V
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
Q
L
 
F
A
 
N
L
 
L
F
 
F
K
 
P
G
 
H
M
 
M
S
 
T
V
 
V
I
 
L
D
 
E
N
 
N
I
 
V
M
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
-
N
 
-
L
 
-
K
 
-
I
 
-
K
 
-
S
 
-
N
 
T
L
 
L
F
 
A
L
 
P
Q
 
M
A
 
R
L
 
V
R
 
R
L
 
R
G
 
W
P
 
P
A
 
R
E
 
E
R
 
K
E
 
A
E
 
E
M
 
K
A
 
K
H
 
A
R
 
L
E
 
E
K
 
L
V
 
L
E
 
E
H
 
R
-
 
V
-
 
G
I
 
I
I
 
L
D
 
D
F
 
-
L
 
-
E
 
-
I
 
-
Q
 
Q
A
 
A
F
 
-
R
 
R
K
 
K
T
 
Y
P
 
P
V
 
-
G
 
A
Q
 
Q
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
Q
Q
 
Q
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
D
 
A
L
 
I
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
E
 
E
P
 
P
Q
 
K
V
 
I
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
L
N
 
D
V
 
P
E
 
E
E
 
-
K
 
-
Q
 
-
D
 
-
M
 
M
C
 
V
R
 
G
F
 
E
I
 
V
L
 
L
D
 
D
V
 
V
N
 
M
D
 
R
E
 
D
F
 
L
-
 
A
-
 
Q
-
 
G
G
 
G
T
 
M
T
 
T
I
 
M
V
 
V
L
 
V
I
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
E
M
 
M
G
 
G
V
 
F
V
 
A
M
 
R
D
 
E
I
 
V
S
 
A
D
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
V
V
 
F
L
 
M
D
 
D
Y
 
G
G
 
G
K
 
Q
K
 
I
I
 
V
G
 
E
D
 
E
G
 
G
T
 
R
P
 
P
D
 
E
E
 
E
V
 
I
-
 
F
-
 
T
R
 
R
N
 
P
N
 
K
Q
 
E
D
 
E
V
 
R
I
 
T
S
 
R
A
 
S
Y
 
F
L
 
L

7d0aB Acinetobacter mlafedb complex in adp-vanadate trapped vclose conformation (see paper)
30% identity, 87% coverage: 23:260/274 of query aligns to 4:229/263 of 7d0aB

query
sites
7d0aB
I
 
L
L
 
I
D
 
E
V
 
V
K
 
K
N
 
N
I
 
L
S
 
S
L
 
F
R
 
N
F
 
R
G
 
G
G
 
E
V
 
R
K
 
V
A
 
I
L
 
Y
T
 
D
D
 
N
I
 
I
S
 
S
F
 
L
N
 
N
V
 
I
K
 
R
E
 
R
H
 
G
E
 
Q
I
 
I
R
 
T
A
 
A
I
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
 
G
A
x
T
G
|
G
K
|
K
S
 
T
S
 
T
M
 
L
L
 
L
N
 
R
C
 
L
I
 
I
N
 
G
G
 
G
V
 
Q
Y
 
L
T
 
V
P
 
P
Q
 
D
D
 
Q
G
 
G
S
 
E
I
 
V
T
 
L
F
 
L
R
 
D
G
 
G
K
 
K
T
 
D
F
 
I
S
 
A
H
 
Q
M
 
M
N
 
S
S
 
R
R
 
Q
Q
 
E
V
 
L
-
 
F
-
 
A
-
 
A
-
 
R
A
 
A
E
 
R
M
 
M
G
 
G
V
 
M
A
 
-
R
 
-
T
 
L
F
 
F
Q
 
Q
N
 
S
L
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
F
K
 
T
G
 
D
M
 
M
S
 
S
V
 
V
I
 
Y
D
 
E
N
 
N
I
 
V
M
 
A
-
 
F
-
 
P
T
 
I
G
 
R
R
 
A
N
 
H
L
 
T
K
 
K
I
 
L
K
 
S
S
 
E
N
 
N
L
 
L
F
 
I
L
 
A
Q
 
E
A
 
L
L
 
V
R
 
A
L
 
L
G
 
-
P
 
-
A
 
-
E
 
-
R
 
-
E
 
-
E
 
-
M
 
-
A
 
-
H
 
-
R
 
-
E
 
-
K
 
K
V
 
L
E
 
E
H
 
S
I
 
V
I
 
-
D
 
-
F
 
-
L
 
-
E
 
G
I
 
L
Q
 
R
A
 
G
F
 
T
R
 
E
K
 
Q
T
 
L
P
 
M
V
 
P
G
 
T
Q
x
E
L
 
L
P
x
S
Y
 
G
G
 
G
L
x
M
Q
 
N
K
 
R
R
 
R
V
 
V
D
 
A
L
 
L
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
A
M
 
L
E
 
D
P
 
P
Q
 
D
V
 
L
L
 
I
L
 
M
L
 
Y
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
Q
N
 
D
V
 
P
E
 
I
E
 
V
K
 
K
Q
 
G
D
 
V
M
 
L
C
 
T
R
 
R
F
 
L
I
 
I
L
 
R
D
 
S
V
 
L
N
 
R
D
 
E
E
 
A
F
 
L
G
 
D
T
 
L
T
 
T
I
 
T
V
 
I
L
 
I
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
V
G
 
P
V
 
E
V
 
T
M
 
L
D
 
S
I
 
I
S
 
A
D
 
D
R
 
Y
V
 
I
V
 
Y
V
 
V
L
 
V
D
 
A
Y
 
E
G
 
G
K
 
K
K
 
I
I
 
Q
G
 
G
D
 
E
G
 
G
T
 
T
P
 
P
D
 
E
E
 
E
V
 
L
R
 
Q

7d08B Acinetobacter mlafedb complex in atp-bound vtrans1 conformation (see paper)
30% identity, 87% coverage: 23:260/274 of query aligns to 4:229/263 of 7d08B

query
sites
7d08B
I
 
L
L
 
I
D
 
E
V
 
V
K
 
K
N
 
N
I
 
L
S
 
S
L
 
F
R
 
N
F
x
R
G
 
G
G
 
E
V
x
R
K
 
V
A
 
I
L
 
Y
T
 
D
D
 
N
I
 
I
S
 
S
F
 
L
N
 
N
V
 
I
K
 
R
E
 
R
H
 
G
E
 
Q
I
 
I
R
 
T
A
 
A
I
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
|
G
A
x
T
G
 
G
K
|
K
S
x
T
S
x
T
M
 
L
L
 
L
N
 
R
C
 
L
I
 
I
N
 
G
G
 
G
V
 
Q
Y
 
L
T
 
V
P
 
P
Q
 
D
D
 
Q
G
 
G
S
 
E
I
 
V
T
 
L
F
 
L
R
 
D
G
 
G
K
 
K
T
 
D
F
 
I
S
 
A
H
 
Q
M
 
M
N
 
S
S
 
R
R
 
Q
Q
 
E
V
 
L
-
 
F
-
 
A
-
 
A
-
 
R
A
 
A
E
 
R
M
 
M
G
 
G
V
 
M
A
 
-
R
 
-
T
 
L
F
 
F
Q
 
Q
N
 
S
L
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
F
K
 
T
G
 
D
M
 
M
S
 
S
V
 
V
I
 
Y
D
 
E
N
 
N
I
 
V
M
 
A
-
 
F
-
 
P
T
 
I
G
 
R
R
 
A
N
 
H
L
 
T
K
 
K
I
 
L
K
 
S
S
 
E
N
 
N
L
 
L
F
 
I
L
 
A
Q
 
E
A
 
L
L
 
V
R
 
A
L
 
L
G
 
-
P
 
-
A
 
-
E
 
-
R
 
-
E
 
-
E
 
-
M
 
-
A
 
-
H
 
-
R
 
-
E
 
-
K
 
K
V
 
L
E
 
E
H
 
S
I
 
V
I
 
-
D
 
-
F
 
-
L
 
-
E
 
G
I
 
L
Q
 
R
A
 
G
F
 
T
R
 
E
K
 
Q
T
 
L
P
 
M
V
 
P
G
 
T
Q
 
E
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
M
Q
 
N
K
 
R
R
 
R
V
 
V
D
 
A
L
 
L
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
A
M
 
L
E
 
D
P
 
P
Q
 
D
V
 
L
L
 
I
L
 
M
L
 
Y
D
 
D
E
|
E
P
 
P
M
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
Q
N
 
D
V
 
P
E
 
I
E
 
V
K
 
K
Q
 
G
D
 
V
M
 
L
C
 
T
R
 
R
F
 
L
I
 
I
L
 
R
D
 
S
V
 
L
N
 
R
D
 
E
E
 
A
F
 
L
G
 
D
T
 
L
T
 
T
I
 
T
V
 
I
L
 
I
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
V
G
 
P
V
 
E
V
 
T
M
 
L
D
 
S
I
 
I
S
 
A
D
 
D
R
 
Y
V
 
I
V
 
Y
V
 
V
L
 
V
D
 
A
Y
 
E
G
 
G
K
 
K
K
 
I
I
 
Q
G
 
G
D
 
E
G
 
G
T
 
T
P
 
P
D
 
E
E
 
E
V
 
L
R
 
Q

6z5uK Cryo-em structure of the a. Baumannii mlabdef complex bound to appnhp (see paper)
30% identity, 87% coverage: 23:260/274 of query aligns to 2:227/253 of 6z5uK

query
sites
6z5uK
I
 
L
L
 
I
D
 
E
V
 
V
K
 
K
N
 
N
I
 
L
S
 
S
L
 
F
R
 
N
F
x
R
G
 
G
G
 
E
V
 
R
K
 
V
A
 
I
L
 
Y
T
 
D
D
 
N
I
 
I
S
 
S
F
 
L
N
 
N
V
 
I
K
 
R
E
 
R
H
 
G
E
 
Q
I
 
I
R
 
T
A
 
A
I
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
T
G
|
G
K
|
K
S
x
T
S
x
T
M
 
L
L
 
L
N
 
R
C
 
L
I
 
I
N
 
G
G
 
G
V
 
Q
Y
 
L
T
 
V
P
 
P
Q
 
D
D
 
Q
G
 
G
S
 
E
I
 
V
T
 
L
F
 
L
R
 
D
G
 
G
K
 
K
T
 
D
F
 
I
S
 
A
H
 
Q
M
 
M
N
 
S
S
 
R
R
 
Q
Q
 
E
V
 
L
-
 
F
-
 
A
-
 
A
-
 
R
A
 
A
E
 
R
M
 
M
G
 
G
V
 
M
A
 
-
R
 
-
T
 
L
F
 
F
Q
|
Q
N
 
S
L
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
F
K
 
T
G
 
D
M
 
M
S
 
S
V
 
V
I
 
Y
D
 
E
N
 
N
I
 
V
M
 
A
-
 
F
-
 
P
T
 
I
G
 
R
R
 
A
N
 
H
L
 
T
K
 
K
I
 
L
K
 
S
S
 
E
N
 
N
L
 
L
F
 
I
L
 
A
Q
 
E
A
 
L
L
 
V
R
 
A
L
 
L
G
 
-
P
 
-
A
 
-
E
 
-
R
 
-
E
 
-
E
 
-
M
 
-
A
 
-
H
 
-
R
 
-
E
 
-
K
 
K
V
 
L
E
 
E
H
 
S
I
 
V
I
 
-
D
 
-
F
 
-
L
 
-
E
 
G
I
 
L
Q
 
R
A
 
G
F
 
T
R
 
E
K
 
Q
T
 
L
P
 
M
V
 
P
G
 
T
Q
 
E
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
M
Q
 
N
K
 
R
R
 
R
V
 
V
D
 
A
L
 
L
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
A
M
 
L
E
 
D
P
 
P
Q
 
D
V
 
L
L
 
I
L
 
M
L
 
Y
D
 
D
E
|
E
P
 
P
M
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
Q
N
 
D
V
 
P
E
 
I
E
 
V
K
 
K
Q
 
G
D
 
V
M
 
L
C
 
T
R
 
R
F
 
L
I
 
I
L
 
R
D
 
S
V
 
L
N
 
R
D
 
E
E
 
A
F
 
L
G
 
D
T
 
L
T
 
T
I
 
T
V
 
I
L
 
I
I
 
V
E
 
S
H
|
H
D
 
D
M
 
V
G
 
P
V
 
E
V
 
T
M
 
L
D
 
S
I
 
I
S
 
A
D
 
D
R
 
Y
V
 
I
V
 
Y
V
 
V
L
 
V
D
 
A
Y
 
E
G
 
G
K
 
K
K
 
I
I
 
Q
G
 
G
D
 
E
G
 
G
T
 
T
P
 
P
D
 
E
E
 
E
V
 
L
R
 
Q

4ymuJ Crystal structure of an amino acid abc transporter complex with arginines and atps (see paper)
29% identity, 85% coverage: 26:259/274 of query aligns to 4:223/240 of 4ymuJ

query
sites
4ymuJ
V
 
V
K
 
N
N
 
D
I
 
V
S
 
Y
L
 
K
R
 
N
F
|
F
G
 
G
G
 
S
V
 
L
K
 
E
A
x
V
L
 
L
T
 
K
D
 
G
I
 
V
S
 
T
F
 
L
N
 
K
V
 
V
K
 
N
E
 
K
H
 
G
E
 
E
I
 
V
R
 
V
A
 
V
I
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
M
 
L
L
 
L
N
 
R
C
 
C
I
 
I
N
 
N
G
 
L
V
 
L
Y
 
E
T
 
E
P
 
P
Q
 
T
D
 
K
G
 
G
S
 
E
I
 
V
T
 
F
F
 
I
R
 
D
G
 
G
K
 
V
T
 
K
F
 
I
S
 
N
H
 
N
-
 
G
-
 
K
M
 
V
N
 
N
S
 
I
R
 
N
Q
 
K
V
 
V
A
 
R
E
 
Q
M
 
-
G
 
K
V
 
V
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
H
L
 
F
A
 
N
L
 
L
F
 
F
K
 
P
G
 
H
M
 
L
S
 
T
V
 
A
I
 
I
D
 
E
N
 
N
I
 
I
M
 
T
T
 
-
G
 
-
R
 
-
N
 
-
L
 
-
K
 
-
I
 
-
K
 
-
S
 
-
N
 
-
L
 
-
F
 
-
L
 
-
Q
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
L
 
L
G
 
A
P
 
P
A
 
V
E
 
K
R
 
V
E
 
K
E
 
K
M
 
M
A
 
N
H
 
K
R
 
K
E
 
E
K
 
A
V
 
E
E
 
E
H
 
L
I
 
A
I
 
V
D
 
D
F
 
L
L
 
L
E
 
A
-
 
K
-
 
V
-
 
G
-
 
L
I
 
L
Q
 
D
A
 
K
F
 
K
R
 
D
K
 
Q
T
 
Y
P
 
P
V
 
I
G
 
-
Q
 
K
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
Q
Q
 
K
K
 
Q
R
 
R
V
 
L
D
 
A
L
 
I
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
E
 
Q
P
 
P
Q
 
E
V
 
V
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
|
E
P
 
P
M
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
L
N
 
D
V
 
P
E
 
E
E
 
M
K
 
V
Q
 
K
D
 
E
M
 
V
C
 
L
R
 
N
F
 
V
I
 
M
L
 
K
D
 
Q
V
 
L
N
 
A
D
 
N
E
 
E
F
 
-
G
 
G
T
 
M
T
 
T
I
 
M
V
 
V
L
 
V
I
 
V
E
 
T
H
|
H
D
 
E
M
 
M
G
 
G
V
 
F
V
 
A
M
 
R
D
 
E
I
 
V
S
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
I
V
 
F
L
 
M
D
 
D
Y
 
D
G
 
G
K
 
V
K
 
I
I
 
V
G
 
E
D
 
E
G
 
G
T
 
T
P
 
P
D
 
E
E
 
E
V
 
I

P19566 Maltose/maltodextrin import ATP-binding protein MalK; EC 7.5.2.1 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
31% identity, 86% coverage: 24:259/274 of query aligns to 4:221/369 of P19566

query
sites
P19566
L
 
V
D
 
Q
V
 
L
K
 
R
N
 
N
I
 
V
S
 
T
L
 
K
R
 
A
F
 
W
G
 
G
G
 
D
V
 
V
K
 
V
A
 
V
L
 
S
T
 
K
D
 
D
I
 
I
S
 
N
F
 
L
N
 
D
V
 
I
K
 
H
E
 
D
H
 
G
E
 
E
I
 
F
R
 
V
A
 
V
I
 
F
I
 
V
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
 
G
A
 
C
G
 
G
K
 
K
S
 
S
S
 
T
M
 
L
L
 
L
N
 
R
C
 
M
I
 
I
N
 
A
G
 
G
V
 
L
Y
 
E
T
 
T
P
 
I
Q
 
T
D
 
S
G
 
G
S
 
D
I
 
L
T
 
-
F
 
F
R
 
I
G
 
G
K
 
E
T
 
T
F
 
-
S
 
-
H
 
R
M
 
M
N
 
N
S
 
D
R
 
I
Q
 
P
V
 
P
A
 
A
E
 
E
M
 
R
G
 
G
V
 
V
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
S
L
 
Y
A
 
A
L
|
L
F
 
Y
K
 
P
G
 
H
M
 
L
S
 
S
V
 
V
I
 
A
D
 
E
N
 
N
I
 
M
M
 
S
T
 
F
G
 
G
R
 
-
N
 
-
L
 
-
K
 
-
I
 
-
K
 
-
S
 
-
N
 
-
L
 
-
F
 
-
L
 
-
Q
 
-
A
 
-
L
 
L
R
 
K
L
 
L
G
 
A
P
 
G
A
 
A
E
 
K
R
 
K
E
 
E
E
 
V
M
 
M
A
 
N
H
 
Q
R
 
R
E
 
-
K
 
-
V
 
V
E
 
N
H
 
Q
I
 
V
I
 
A
D
 
E
F
 
V
L
 
L
E
 
Q
I
 
L
Q
 
A
A
 
H
F
 
L
R
 
L
K
 
E
T
 
R
P
 
K
V
 
P
G
 
K
Q
 
A
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
Q
Q
 
R
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
D
 
A
L
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
T
L
 
L
A
 
V
M
 
A
E
 
E
P
 
P
Q
 
R
V
 
V
L
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
|
P
M
 
L
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
x
D
V
 
A
E
 
A
E
 
L
K
 
R
Q
 
V
D
 
Q
M
 
M
C
 
R
R
 
I
F
 
E
I
 
I
L
 
S
D
 
R
V
 
L
N
 
H
D
 
K
E
 
R
F
 
L
G
 
G
T
 
R
T
 
T
I
 
M
V
 
I
L
 
Y
I
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
D
M
 
Q
G
 
V
V
 
E
V
 
A
M
 
M
D
 
T
I
 
L
S
 
A
D
 
D
R
 
K
V
 
I
V
 
V
V
 
V
L
 
L
D
 
D
Y
 
A
G
 
G
K
 
R
K
 
V
I
 
A
G
 
Q
D
 
V
G
 
G
T
 
K
P
 
P
D
 
L
E
 
E
V
 
L

Sites not aligning to the query:

3puyA Crystal structure of an outward-facing mbp-maltose transporter complex bound to amp-pnp after crystal soaking of the pretranslocation state (see paper)
31% identity, 86% coverage: 24:259/274 of query aligns to 3:220/371 of 3puyA

query
sites
3puyA
L
 
V
D
 
Q
V
 
L
K
 
Q
N
 
N
I
 
V
S
 
T
L
 
K
R
 
A
F
x
W
G
 
G
G
 
E
V
 
V
K
 
V
A
 
V
L
 
S
T
 
K
D
 
D
I
 
I
S
 
N
F
 
L
N
 
D
V
 
I
K
 
H
E
 
E
H
 
G
E
 
E
I
 
F
R
 
V
A
 
V
I
 
F
I
 
V
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
M
 
L
L
 
L
N
 
R
C
 
M
I
 
I
N
 
A
G
 
G
V
 
L
Y
 
E
T
 
T
P
 
I
Q
 
T
D
 
S
G
 
G
S
 
D
I
 
L
T
 
-
F
 
F
R
 
I
G
 
G
K
 
E
T
 
-
F
 
-
S
 
K
H
 
R
M
 
M
N
 
N
S
 
D
R
 
T
Q
 
P
V
 
P
A
 
A
E
 
E
M
 
R
G
 
G
V
 
V
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
|
Q
N
 
S
L
 
Y
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
K
 
P
G
 
H
M
 
L
S
 
S
V
 
V
I
 
A
D
 
E
N
 
N
I
 
M
M
 
S
T
 
F
G
 
G
R
 
-
N
 
-
L
 
-
K
 
-
I
 
-
K
 
-
S
 
-
N
 
-
L
 
-
F
 
-
L
 
-
Q
 
-
A
 
-
L
 
L
R
 
K
L
 
L
G
 
A
P
 
G
A
 
A
E
 
K
R
 
K
E
 
E
E
 
V
M
 
I
A
 
N
H
 
Q
R
 
R
E
 
-
K
 
-
V
 
V
E
 
N
H
 
Q
I
 
V
I
 
A
D
 
E
F
 
V
L
 
L
E
 
Q
I
 
L
Q
 
A
A
 
H
F
 
L
R
 
L
K
 
D
T
x
R
P
 
K
V
 
P
G
 
K
Q
x
A
L
 
L
P
x
S
Y
 
G
G
|
G
L
x
Q
Q
 
R
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
D
 
A
L
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
T
L
 
L
A
 
V
M
 
A
E
 
E
P
 
P
Q
 
S
V
 
V
L
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
M
 
L
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
V
 
A
E
 
A
E
 
L
K
 
R
Q
 
V
D
 
Q
M
 
M
C
 
R
R
 
I
F
 
E
I
 
I
L
 
S
D
 
R
V
 
L
N
 
H
D
 
K
E
 
R
F
 
L
G
 
G
T
 
R
T
 
T
I
 
M
V
 
I
L
 
Y
I
 
V
E
 
T
H
|
H
D
 
D
M
 
Q
G
 
V
V
 
E
V
 
A
M
 
M
D
 
T
I
 
L
S
 
A
D
 
D
R
 
K
V
 
I
V
 
V
V
 
V
L
 
L
D
 
D
Y
 
A
G
 
G
K
 
R
K
 
V
I
 
A
G
 
Q
D
 
V
G
 
G
T
 
K
P
 
P
D
 
L
E
 
E
V
 
L

3puxA Crystal structure of an outward-facing mbp-maltose transporter complex bound to adp-bef3 (see paper)
31% identity, 86% coverage: 24:259/274 of query aligns to 3:220/371 of 3puxA

query
sites
3puxA
L
 
V
D
 
Q
V
 
L
K
 
Q
N
 
N
I
 
V
S
 
T
L
 
K
R
 
A
F
x
W
G
 
G
G
 
E
V
 
V
K
 
V
A
 
V
L
 
S
T
 
K
D
 
D
I
 
I
S
 
N
F
 
L
N
 
D
V
 
I
K
 
H
E
 
E
H
 
G
E
 
E
I
 
F
R
 
V
A
 
V
I
 
F
I
 
V
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
M
 
L
L
 
L
N
 
R
C
 
M
I
 
I
N
 
A
G
 
G
V
 
L
Y
 
E
T
 
T
P
 
I
Q
 
T
D
 
S
G
 
G
S
 
D
I
 
L
T
 
-
F
 
F
R
 
I
G
 
G
K
 
E
T
 
-
F
 
-
S
 
K
H
 
R
M
 
M
N
 
N
S
 
D
R
 
T
Q
 
P
V
 
P
A
 
A
E
 
E
M
 
R
G
 
G
V
 
V
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
|
Q
N
 
S
L
 
Y
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
K
 
P
G
 
H
M
 
L
S
 
S
V
 
V
I
 
A
D
 
E
N
 
N
I
 
M
M
 
S
T
 
F
G
 
G
R
 
-
N
 
-
L
 
-
K
 
-
I
 
-
K
 
-
S
 
-
N
 
-
L
 
-
F
 
-
L
 
-
Q
 
-
A
 
-
L
 
L
R
 
K
L
 
L
G
 
A
P
 
G
A
 
A
E
 
K
R
 
K
E
 
E
E
 
V
M
 
I
A
 
N
H
 
Q
R
 
R
E
 
-
K
 
-
V
 
V
E
 
N
H
 
Q
I
 
V
I
 
A
D
 
E
F
 
V
L
 
L
E
 
Q
I
 
L
Q
 
A
A
 
H
F
 
L
R
 
L
K
 
D
T
x
R
P
 
K
V
 
P
G
 
K
Q
 
A
L
 
L
P
x
S
Y
 
G
G
|
G
L
x
Q
Q
 
R
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
D
 
A
L
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
T
L
 
L
A
 
V
M
 
A
E
 
E
P
 
P
Q
 
S
V
 
V
L
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
L
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
V
 
A
E
 
A
E
 
L
K
 
R
Q
 
V
D
 
Q
M
 
M
C
 
R
R
 
I
F
 
E
I
 
I
L
 
S
D
 
R
V
 
L
N
 
H
D
 
K
E
 
R
F
 
L
G
 
G
T
 
R
T
 
T
I
 
M
V
 
I
L
 
Y
I
 
V
E
 
T
H
|
H
D
 
D
M
 
Q
G
 
V
V
 
E
V
 
A
M
 
M
D
 
T
I
 
L
S
 
A
D
 
D
R
 
K
V
 
I
V
 
V
V
 
V
L
 
L
D
 
D
Y
 
A
G
 
G
K
 
R
K
 
V
I
 
A
G
 
Q
D
 
V
G
 
G
T
 
K
P
 
P
D
 
L
E
 
E
V
 
L

3puwA Crystal structure of an outward-facing mbp-maltose transporter complex bound to adp-alf4 (see paper)
31% identity, 86% coverage: 24:259/274 of query aligns to 3:220/371 of 3puwA

query
sites
3puwA
L
 
V
D
 
Q
V
 
L
K
 
Q
N
 
N
I
 
V
S
 
T
L
 
K
R
 
A
F
x
W
G
 
G
G
 
E
V
 
V
K
 
V
A
x
V
L
 
S
T
 
K
D
 
D
I
 
I
S
 
N
F
 
L
N
 
D
V
 
I
K
 
H
E
 
E
H
 
G
E
 
E
I
 
F
R
 
V
A
 
V
I
 
F
I
 
V
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
M
 
L
L
 
L
N
 
R
C
 
M
I
 
I
N
 
A
G
 
G
V
 
L
Y
 
E
T
 
T
P
 
I
Q
 
T
D
 
S
G
 
G
S
 
D
I
 
L
T
 
-
F
 
F
R
 
I
G
 
G
K
 
E
T
 
-
F
 
-
S
 
K
H
 
R
M
 
M
N
 
N
S
 
D
R
 
T
Q
 
P
V
 
P
A
 
A
E
 
E
M
 
R
G
 
G
V
 
V
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
|
Q
N
 
S
L
 
Y
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
K
 
P
G
 
H
M
 
L
S
 
S
V
 
V
I
 
A
D
 
E
N
 
N
I
 
M
M
 
S
T
 
F
G
 
G
R
 
-
N
 
-
L
 
-
K
 
-
I
 
-
K
 
-
S
 
-
N
 
-
L
 
-
F
 
-
L
 
-
Q
 
-
A
 
-
L
 
L
R
 
K
L
 
L
G
 
A
P
 
G
A
 
A
E
 
K
R
 
K
E
 
E
E
 
V
M
 
I
A
 
N
H
 
Q
R
 
R
E
 
-
K
 
-
V
 
V
E
 
N
H
 
Q
I
 
V
I
 
A
D
 
E
F
 
V
L
 
L
E
 
Q
I
 
L
Q
 
A
A
 
H
F
 
L
R
 
L
K
 
D
T
x
R
P
 
K
V
 
P
G
 
K
Q
x
A
L
 
L
P
x
S
Y
x
G
G
|
G
L
x
Q
Q
 
R
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
D
 
A
L
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
T
L
 
L
A
 
V
M
 
A
E
 
E
P
 
P
Q
 
S
V
 
V
L
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
M
 
L
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
V
 
A
E
 
A
E
 
L
K
 
R
Q
 
V
D
 
Q
M
 
M
C
 
R
R
 
I
F
 
E
I
 
I
L
 
S
D
 
R
V
 
L
N
 
H
D
 
K
E
 
R
F
 
L
G
 
G
T
 
R
T
 
T
I
 
M
V
 
I
L
 
Y
I
 
V
E
 
T
H
|
H
D
 
D
M
 
Q
G
 
V
V
 
E
V
 
A
M
 
M
D
 
T
I
 
L
S
 
A
D
 
D
R
 
K
V
 
I
V
 
V
V
 
V
L
 
L
D
 
D
Y
 
A
G
 
G
K
 
R
K
 
V
I
 
A
G
 
Q
D
 
V
G
 
G
T
 
K
P
 
P
D
 
L
E
 
E
V
 
L

3puvA Crystal structure of an outward-facing mbp-maltose transporter complex bound to adp-vo4 (see paper)
31% identity, 86% coverage: 24:259/274 of query aligns to 3:220/371 of 3puvA

query
sites
3puvA
L
 
V
D
 
Q
V
 
L
K
 
Q
N
 
N
I
 
V
S
 
T
L
 
K
R
 
A
F
x
W
G
 
G
G
 
E
V
 
V
K
 
V
A
x
V
L
 
S
T
 
K
D
 
D
I
 
I
S
 
N
F
 
L
N
 
D
V
 
I
K
 
H
E
 
E
H
 
G
E
 
E
I
 
F
R
 
V
A
 
V
I
 
F
I
 
V
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
|
G
A
x
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
M
 
L
L
 
L
N
 
R
C
 
M
I
 
I
N
 
A
G
 
G
V
 
L
Y
 
E
T
 
T
P
 
I
Q
 
T
D
 
S
G
 
G
S
 
D
I
 
L
T
 
-
F
 
F
R
 
I
G
 
G
K
 
E
T
 
-
F
 
-
S
 
K
H
 
R
M
 
M
N
 
N
S
 
D
R
 
T
Q
 
P
V
 
P
A
 
A
E
 
E
M
 
R
G
 
G
V
 
V
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
|
Q
N
 
S
L
 
Y
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
K
 
P
G
 
H
M
 
L
S
 
S
V
 
V
I
 
A
D
 
E
N
 
N
I
 
M
M
 
S
T
 
F
G
 
G
R
 
-
N
 
-
L
 
-
K
 
-
I
 
-
K
 
-
S
 
-
N
 
-
L
 
-
F
 
-
L
 
-
Q
 
-
A
 
-
L
 
L
R
 
K
L
 
L
G
 
A
P
 
G
A
 
A
E
 
K
R
 
K
E
 
E
E
 
V
M
 
I
A
 
N
H
 
Q
R
 
R
E
 
-
K
 
-
V
 
V
E
 
N
H
 
Q
I
 
V
I
 
A
D
 
E
F
 
V
L
 
L
E
 
Q
I
 
L
Q
 
A
A
 
H
F
 
L
R
 
L
K
 
D
T
x
R
P
 
K
V
 
P
G
 
K
Q
x
A
L
 
L
P
x
S
Y
 
G
G
 
G
L
x
Q
Q
 
R
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
D
 
A
L
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
T
L
 
L
A
 
V
M
 
A
E
 
E
P
 
P
Q
 
S
V
 
V
L
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
L
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
V
 
A
E
 
A
E
 
L
K
 
R
Q
 
V
D
 
Q
M
 
M
C
 
R
R
 
I
F
 
E
I
 
I
L
 
S
D
 
R
V
 
L
N
 
H
D
 
K
E
 
R
F
 
L
G
 
G
T
 
R
T
 
T
I
 
M
V
 
I
L
 
Y
I
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
D
M
 
Q
G
 
V
V
 
E
V
 
A
M
 
M
D
 
T
I
 
L
S
 
A
D
 
D
R
 
K
V
 
I
V
 
V
V
 
V
L
 
L
D
 
D
Y
 
A
G
 
G
K
 
R
K
 
V
I
 
A
G
 
Q
D
 
V
G
 
G
T
 
K
P
 
P
D
 
L
E
 
E
V
 
L

2awnB Crystal structure of the adp-mg-bound e. Coli malk (crystallized with atp-mg) (see paper)
31% identity, 86% coverage: 24:259/274 of query aligns to 3:220/374 of 2awnB

query
sites
2awnB
L
 
V
D
 
Q
V
 
L
K
 
Q
N
 
N
I
 
V
S
 
T
L
 
K
R
 
A
F
x
W
G
 
G
G
 
E
V
 
V
K
 
V
A
x
V
L
 
S
T
 
K
D
 
D
I
 
I
S
 
N
F
 
L
N
 
D
V
 
I
K
 
H
E
 
E
H
 
G
E
 
E
I
 
F
R
 
V
A
 
V
I
 
F
I
 
V
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
M
 
L
L
 
L
N
 
R
C
 
M
I
 
I
N
 
A
G
 
G
V
 
L
Y
 
E
T
 
T
P
 
I
Q
 
T
D
 
S
G
 
G
S
 
D
I
 
L
T
 
-
F
 
F
R
 
I
G
 
G
K
 
E
T
 
-
F
 
-
S
 
K
H
 
R
M
 
M
N
 
N
S
 
D
R
 
T
Q
 
P
V
 
P
A
 
A
E
 
E
M
 
R
G
 
G
V
 
V
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
S
L
 
Y
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
K
 
P
G
 
H
M
 
L
S
 
S
V
 
V
I
 
A
D
 
E
N
 
N
I
 
M
M
 
S
T
 
F
G
 
G
R
 
-
N
 
-
L
 
-
K
 
-
I
 
-
K
 
-
S
 
-
N
 
-
L
 
-
F
 
-
L
 
-
Q
 
-
A
 
-
L
 
L
R
 
K
L
 
L
G
 
A
P
 
G
A
 
A
E
 
K
R
 
K
E
 
E
E
 
V
M
 
I
A
 
N
H
 
Q
R
 
R
E
 
-
K
 
-
V
 
V
E
 
N
H
 
Q
I
 
V
I
 
A
D
 
E
F
 
V
L
 
L
E
 
Q
I
 
L
Q
 
A
A
 
H
F
 
L
R
 
L
K
 
D
T
 
R
P
 
K
V
 
P
G
 
K
Q
 
A
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
Q
Q
 
R
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
D
 
A
L
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
T
L
 
L
A
 
V
M
 
A
E
 
E
P
 
P
Q
 
S
V
 
V
L
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
L
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
V
 
A
E
 
A
E
 
L
K
 
R
Q
 
V
D
 
Q
M
 
M
C
 
R
R
 
I
F
 
E
I
 
I
L
 
S
D
 
R
V
 
L
N
 
H
D
 
K
E
 
R
F
 
L
G
 
G
T
 
R
T
 
T
I
 
M
V
 
I
L
 
Y
I
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
D
M
 
Q
G
 
V
V
 
E
V
 
A
M
 
M
D
 
T
I
 
L
S
 
A
D
 
D
R
 
K
V
 
I
V
 
V
V
 
V
L
 
L
D
 
D
Y
 
A
G
 
G
K
 
R
K
 
V
I
 
A
G
 
Q
D
 
V
G
 
G
T
 
K
P
 
P
D
 
L
E
 
E
V
 
L

P68187 Maltose/maltodextrin import ATP-binding protein MalK; EC 7.5.2.1 from Escherichia coli (strain K12) (see 5 papers)
31% identity, 86% coverage: 24:259/274 of query aligns to 4:221/371 of P68187

query
sites
P68187
L
 
V
D
 
Q
V
 
L
K
 
Q
N
 
N
I
 
V
S
 
T
L
 
K
R
 
A
F
 
W
G
 
G
G
 
E
V
 
V
K
 
V
A
 
V
L
 
S
T
 
K
D
 
D
I
 
I
S
 
N
F
 
L
N
 
D
V
 
I
K
 
H
E
 
E
H
 
G
E
 
E
I
 
F
R
 
V
A
 
V
I
 
F
I
 
V
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
 
G
A
 
C
G
 
G
K
 
K
S
 
S
S
 
T
M
 
L
L
 
L
N
 
R
C
 
M
I
 
I
N
 
A
G
 
G
V
 
L
Y
 
E
T
 
T
P
 
I
Q
 
T
D
 
S
G
 
G
S
 
D
I
 
L
T
 
-
F
 
F
R
 
I
G
 
G
K
 
E
T
 
-
F
 
-
S
 
K
H
 
R
M
 
M
N
 
N
S
 
D
R
 
T
Q
 
P
V
 
P
A
 
A
E
 
E
M
 
R
G
 
G
V
 
V
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
S
L
 
Y
A
|
A
L
 
L
F
 
Y
K
 
P
G
 
H
M
 
L
S
 
S
V
 
V
I
 
A
D
 
E
N
 
N
I
 
M
M
 
S
T
 
F
G
 
G
R
 
-
N
 
-
L
 
-
K
 
-
I
 
-
K
 
-
S
 
-
N
 
-
L
 
-
F
 
-
L
 
-
Q
 
-
A
 
-
L
 
L
R
 
K
L
 
L
G
 
A
P
 
G
A
 
A
E
x
K
R
 
K
E
 
E
E
 
V
M
 
I
A
 
N
H
 
Q
R
 
R
E
 
-
K
 
-
V
|
V
E
 
N
H
 
Q
I
x
V
I
 
A
D
x
E
F
 
V
L
 
L
E
 
Q
I
 
L
Q
x
A
A
 
H
F
 
L
R
 
L
K
 
D
T
 
R
P
 
K
V
 
P
G
 
K
Q
 
A
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
|
G
L
 
Q
Q
 
R
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
D
 
A
L
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
T
L
 
L
A
 
V
M
 
A
E
 
E
P
 
P
Q
 
S
V
 
V
L
 
F
L
 
L
L
 
L
D
|
D
E
 
E
P
 
P
M
 
L
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
V
 
A
E
 
A
E
 
L
K
 
R
Q
 
V
D
 
Q
M
 
M
C
 
R
R
 
I
F
 
E
I
 
I
L
 
S
D
 
R
V
 
L
N
 
H
D
 
K
E
 
R
F
 
L
G
 
G
T
 
R
T
 
T
I
 
M
V
 
I
L
 
Y
I
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
D
M
 
Q
G
 
V
V
 
E
V
 
A
M
 
M
D
 
T
I
 
L
S
 
A
D
 
D
R
 
K
V
 
I
V
 
V
V
 
V
L
 
L
D
 
D
Y
 
A
G
 
G
K
 
R
K
 
V
I
 
A
G
 
Q
D
 
V
G
 
G
T
 
K
P
 
P
D
 
L
E
 
E
V
 
L

Sites not aligning to the query:

1q12A Crystal structure of the atp-bound e. Coli malk (see paper)
31% identity, 86% coverage: 24:259/274 of query aligns to 1:218/367 of 1q12A

query
sites
1q12A
L
 
V
D
 
Q
V
 
L
K
 
Q
N
 
N
I
 
V
S
 
T
L
 
K
R
 
A
F
x
W
G
 
G
G
 
E
V
 
V
K
 
V
A
 
V
L
 
S
T
 
K
D
 
D
I
 
I
S
 
N
F
 
L
N
 
D
V
 
I
K
 
H
E
 
E
H
 
G
E
 
E
I
 
F
R
 
V
A
 
V
I
 
F
I
 
V
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
M
 
L
L
 
L
N
 
R
C
 
M
I
 
I
N
 
A
G
 
G
V
 
L
Y
 
E
T
 
T
P
 
I
Q
 
T
D
 
S
G
 
G
S
 
D
I
 
L
T
 
-
F
 
F
R
 
I
G
 
G
K
 
E
T
 
-
F
 
-
S
 
K
H
 
R
M
 
M
N
 
N
S
 
D
R
 
T
Q
 
P
V
 
P
A
 
A
E
 
E
M
 
R
G
 
G
V
 
V
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
S
L
 
Y
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
K
 
P
G
 
H
M
 
L
S
 
S
V
 
V
I
 
A
D
 
E
N
 
N
I
 
M
M
 
S
T
 
F
G
 
G
R
 
-
N
 
-
L
 
-
K
 
-
I
 
-
K
 
-
S
 
-
N
 
-
L
 
-
F
 
-
L
 
-
Q
 
-
A
 
-
L
 
L
R
 
K
L
 
L
G
 
A
P
 
G
A
 
A
E
 
K
R
 
K
E
 
E
E
 
V
M
 
I
A
 
N
H
 
Q
R
 
R
E
 
-
K
 
-
V
 
V
E
 
N
H
 
Q
I
 
V
I
 
A
D
 
E
F
 
V
L
 
L
E
 
Q
I
 
L
Q
 
A
A
 
H
F
 
L
R
 
L
K
 
D
T
x
R
P
 
K
V
 
P
G
 
K
Q
x
A
L
 
L
P
x
S
Y
 
G
G
|
G
L
x
Q
Q
 
R
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
D
 
A
L
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
T
L
 
L
A
 
V
M
 
A
E
 
E
P
 
P
Q
 
S
V
 
V
L
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
L
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
V
 
A
E
 
A
E
 
L
K
 
R
Q
 
V
D
 
Q
M
 
M
C
 
R
R
 
I
F
 
E
I
 
I
L
 
S
D
 
R
V
 
L
N
 
H
D
 
K
E
 
R
F
 
L
G
 
G
T
 
R
T
 
T
I
 
M
V
 
I
L
 
Y
I
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
D
M
 
Q
G
 
V
V
 
E
V
 
A
M
 
M
D
 
T
I
 
L
S
 
A
D
 
D
R
 
K
V
 
I
V
 
V
V
 
V
L
 
L
D
 
D
Y
 
A
G
 
G
K
 
R
K
 
V
I
 
A
G
 
Q
D
 
V
G
 
G
T
 
K
P
 
P
D
 
L
E
 
E
V
 
L

7ahhC Opua inhibited inward-facing, sbd docked (see paper)
28% identity, 84% coverage: 32:262/274 of query aligns to 35:253/382 of 7ahhC

query
sites
7ahhC
R
 
K
F
 
T
G
 
G
G
 
A
V
x
T
K
x
V
A
x
G
L
 
V
T
 
Y
D
 
D
I
 
T
S
 
N
F
 
F
N
 
E
V
 
I
K
 
N
E
 
E
H
 
G
E
 
E
I
 
I
R
 
F
A
 
V
I
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
L
N
 
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
 
S
S
 
T
M
 
L
L
 
L
N
 
R
C
 
L
I
 
L
N
 
N
G
 
R
V
 
L
Y
 
I
T
 
E
P
 
P
Q
 
T
D
 
S
G
 
G
S
 
K
I
 
I
T
 
F
F
 
I
R
 
D
G
 
N
K
 
Q
T
 
D
F
 
V
S
 
A
H
 
T
M
 
L
N
 
N
S
 
K
R
 
E
-
 
D
-
 
L
-
 
L
Q
 
Q
V
 
V
A
 
R
E
 
R
M
 
K
G
 
T
V
 
M
A
 
S
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
N
L
 
F
A
 
G
L
 
L
F
 
F
K
 
P
G
 
H
M
 
R
S
 
T
V
 
I
I
 
L
D
 
E
N
 
N
I
 
T
M
 
E
T
 
Y
G
 
G
R
 
-
N
 
-
L
 
-
K
 
-
I
 
-
K
 
-
S
 
-
N
 
-
L
 
-
F
 
-
L
 
-
Q
 
-
A
 
-
L
 
L
R
 
E
L
 
V
G
 
Q
P
 
N
A
 
V
E
 
P
R
 
K
E
 
E
E
 
E
M
 
-
A
 
-
H
 
R
R
 
R
E
 
K
K
 
R
V
 
A
E
 
E
H
 
K
I
 
A
I
 
L
D
 
D
F
 
N
L
 
A
E
 
N
I
 
L
Q
 
L
A
 
D
F
 
F
R
 
K
K
 
D
T
 
Q
P
 
Y
V
 
P
G
 
K
Q
 
Q
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
M
Q
 
Q
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
D
 
G
L
 
L
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
N
E
 
D
P
 
P
Q
 
E
V
 
I
L
 
L
L
 
L
L
 
M
D
|
D
E
|
E
P
 
A
M
 
F
A
 
S
G
 
A
M
 
L
N
 
D
V
 
P
E
 
L
E
 
I
K
 
R
Q
 
R
D
 
E
M
 
M
C
 
Q
R
 
D
F
 
E
I
 
L
L
 
L
D
 
E
V
 
L
N
 
Q
D
 
A
E
 
K
F
 
F
G
 
Q
T
 
K
T
 
T
I
 
I
V
 
I
L
 
F
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
L
G
 
N
V
 
E
V
 
A
M
 
L
D
 
R
I
 
I
S
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
I
V
 
A
V
 
I
L
 
M
D
 
K
Y
 
D
G
 
G
K
 
K
K
 
I
I
 
M
G
 
Q
D
 
I
G
 
G
T
 
T
P
 
G
D
 
E
E
 
E
V
 
I
R
 
L
N
 
T
N
 
N

Sites not aligning to the query:

7aheC Opua inhibited inward facing (see paper)
28% identity, 84% coverage: 32:262/274 of query aligns to 35:253/382 of 7aheC

query
sites
7aheC
R
 
K
F
 
T
G
 
G
G
 
A
V
 
T
K
 
V
A
 
G
L
 
V
T
 
Y
D
 
D
I
 
T
S
 
N
F
 
F
N
 
E
V
 
I
K
 
N
E
 
E
H
 
G
E
 
E
I
 
I
R
 
F
A
 
V
I
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
L
N
 
S
G
 
G
A
 
S
G
 
G
K
 
K
S
 
S
S
 
T
M
 
L
L
 
L
N
 
R
C
 
L
I
 
L
N
 
N
G
 
R
V
 
L
Y
 
I
T
 
E
P
 
P
Q
 
T
D
 
S
G
 
G
S
 
K
I
 
I
T
 
F
F
 
I
R
 
D
G
 
N
K
 
Q
T
 
D
F
 
V
S
 
A
H
 
T
M
 
L
N
 
N
S
 
K
R
 
E
-
 
D
-
 
L
-
 
L
Q
 
Q
V
 
V
A
 
R
E
 
R
M
 
K
G
 
T
V
 
M
A
 
S
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
N
L
 
F
A
 
G
L
 
L
F
 
F
K
 
P
G
 
H
M
 
R
S
 
T
V
 
I
I
 
L
D
 
E
N
 
N
I
 
T
M
 
E
T
 
Y
G
 
G
R
 
-
N
 
-
L
 
-
K
 
-
I
 
-
K
 
-
S
 
-
N
 
-
L
 
-
F
 
-
L
 
-
Q
 
-
A
 
-
L
 
L
R
 
E
L
 
V
G
 
Q
P
 
N
A
 
V
E
 
P
R
 
K
E
 
E
E
 
E
M
 
-
A
 
-
H
 
R
R
 
R
E
 
K
K
 
R
V
 
A
E
 
E
H
 
K
I
 
A
I
 
L
D
 
D
F
 
N
L
 
A
E
 
N
I
 
L
Q
 
L
A
 
D
F
 
F
R
 
K
K
 
D
T
 
Q
P
 
Y
V
 
P
G
 
K
Q
 
Q
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
M
Q
 
Q
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
D
 
G
L
 
L
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
N
E
 
D
P
 
P
Q
 
E
V
 
I
L
 
L
L
 
L
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
A
M
 
F
A
 
S
G
 
A
M
 
L
N
 
D
V
 
P
E
 
L
E
 
I
K
 
R
Q
 
R
D
 
E
M
 
M
C
 
Q
R
 
D
F
 
E
I
 
L
L
 
L
D
 
E
V
 
L
N
 
Q
D
 
A
E
 
K
F
 
F
G
 
Q
T
 
K
T
 
T
I
 
I
V
 
I
L
 
F
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
L
G
 
N
V
 
E
V
 
A
M
 
L
D
 
R
I
 
I
S
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
I
V
 
A
V
 
I
L
 
M
D
 
K
Y
 
D
G
 
G
K
 
K
K
 
I
I
 
M
G
 
Q
D
 
I
G
 
G
T
 
T
P
 
G
D
 
E
E
 
E
V
 
I
R
 
L
N
 
T
N
 
N

Sites not aligning to the query:

3c4jA Abc protein artp in complex with atp-gamma-s
29% identity, 91% coverage: 23:270/274 of query aligns to 3:238/242 of 3c4jA

query
sites
3c4jA
I
 
M
L
 
I
D
 
D
V
 
V
K
 
H
N
 
Q
I
 
L
S
 
K
L
 
K
R
 
S
F
|
F
G
 
G
G
 
S
V
 
L
K
 
E
A
x
V
L
 
L
T
 
K
D
 
G
I
 
I
S
 
N
F
 
V
N
 
H
V
 
I
K
 
R
E
 
E
H
 
G
E
 
E
I
 
V
R
 
V
A
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
M
 
F
L
 
L
N
 
R
C
 
C
I
 
L
N
 
N
G
 
L
V
 
L
Y
 
E
T
 
D
P
 
F
Q
 
D
D
 
E
G
 
G
S
 
E
I
 
I
T
 
I
F
 
I
R
 
D
G
 
G
K
 
I
T
 
N
F
 
L
-
 
K
-
 
A
S
 
K
H
 
D
M
 
T
N
 
N
S
 
L
R
 
N
Q
 
K
V
 
V
A
 
R
E
 
E
M
 
-
G
 
E
V
 
V
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
R
L
 
F
A
 
N
L
 
L
F
 
F
K
 
P
G
 
H
M
 
M
S
 
T
V
 
V
I
 
L
D
 
N
N
 
N
I
 
I
M
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
-
N
 
-
L
 
-
K
 
-
I
 
-
K
 
-
S
 
-
N
 
T
L
 
L
F
 
A
L
 
P
Q
 
M
A
 
K
L
 
V
R
 
R
L
 
K
G
 
W
P
 
P
A
 
R
E
 
E
R
 
K
E
 
A
E
 
E
M
 
-
A
 
-
H
 
-
R
 
-
E
 
A
K
 
K
V
 
A
E
 
M
H
 
E
I
 
L
I
 
L
D
 
D
F
 
K
L
 
V
E
 
G
I
 
L
Q
 
K
A
 
D
F
 
K
R
 
A
K
 
H
T
 
A
P
 
Y
V
 
P
G
 
D
Q
 
S
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
Q
Q
 
A
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
D
 
A
L
 
I
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
E
 
E
P
 
P
Q
 
K
V
 
I
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
L
N
 
D
V
 
P
E
 
E
E
 
M
K
 
V
Q
 
G
D
 
E
M
 
V
C
 
L
R
 
S
F
 
V
I
 
M
L
 
K
D
 
Q
V
 
L
N
 
A
D
 
N
E
 
E
F
 
-
G
 
G
T
 
M
T
 
T
I
 
M
V
 
V
L
 
V
I
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
E
M
 
M
G
 
G
V
 
F
V
 
A
M
 
R
D
 
E
I
 
V
S
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
L
V
 
F
L
 
M
D
 
D
Y
 
G
G
 
G
K
 
Y
K
 
I
I
 
I
G
 
E
D
 
E
G
 
G
T
 
K
P
 
P
D
 
E
E
 
D
V
 
L
-
 
F
-
 
D
R
 
R
N
 
P
N
 
Q
Q
 
H
D
 
E
V
 
R
I
 
T
S
 
K
A
 
A
Y
 
F
L
 
L

3c41J Abc protein artp in complex with amp-pnp/mg2+
29% identity, 91% coverage: 23:270/274 of query aligns to 3:238/242 of 3c41J

query
sites
3c41J
I
 
M
L
 
I
D
 
D
V
 
V
K
 
H
N
 
Q
I
 
L
S
 
K
L
 
K
R
 
S
F
|
F
G
 
G
G
 
S
V
 
L
K
 
E
A
x
V
L
 
L
T
 
K
D
 
G
I
 
I
S
 
N
F
 
V
N
 
H
V
 
I
K
 
R
E
 
E
H
 
G
E
 
E
I
 
V
R
 
V
A
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
M
 
F
L
 
L
N
 
R
C
 
C
I
 
L
N
 
N
G
 
L
V
 
L
Y
 
E
T
 
D
P
 
F
Q
 
D
D
 
E
G
 
G
S
 
E
I
 
I
T
 
I
F
 
I
R
 
D
G
 
G
K
 
I
T
 
N
F
 
L
-
 
K
-
 
A
S
 
K
H
 
D
M
 
T
N
 
N
S
 
L
R
 
N
Q
 
K
V
 
V
A
 
R
E
 
E
M
 
-
G
 
E
V
 
V
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
R
L
 
F
A
 
N
L
 
L
F
 
F
K
 
P
G
 
H
M
 
M
S
 
T
V
 
V
I
 
L
D
 
N
N
 
N
I
 
I
M
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
-
N
 
-
L
 
-
K
 
-
I
 
-
K
 
-
S
 
-
N
 
T
L
 
L
F
 
A
L
 
P
Q
 
M
A
 
K
L
 
V
R
 
R
L
 
K
G
 
W
P
 
P
A
 
R
E
 
E
R
 
K
E
 
A
E
 
E
M
 
-
A
 
-
H
 
-
R
 
-
E
 
A
K
 
K
V
 
A
E
 
M
H
 
E
I
 
L
I
 
L
D
 
D
F
 
K
L
 
V
E
 
G
I
 
L
Q
 
K
A
 
D
F
 
K
R
 
A
K
 
H
T
 
A
P
 
Y
V
 
P
G
 
D
Q
 
S
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
Q
Q
 
A
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
D
 
A
L
 
I
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
E
 
E
P
 
P
Q
 
K
V
 
I
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
|
D
E
 
E
P
 
P
M
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
L
N
 
D
V
 
P
E
 
E
E
 
M
K
 
V
Q
 
G
D
 
E
M
 
V
C
 
L
R
 
S
F
 
V
I
 
M
L
 
K
D
 
Q
V
 
L
N
 
A
D
 
N
E
 
E
F
 
-
G
 
G
T
 
M
T
 
T
I
 
M
V
 
V
L
 
V
I
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
E
M
 
M
G
 
G
V
 
F
V
 
A
M
 
R
D
 
E
I
 
V
S
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
L
V
 
F
L
 
M
D
 
D
Y
 
G
G
 
G
K
 
Y
K
 
I
I
 
I
G
 
E
D
 
E
G
 
G
T
 
K
P
 
P
D
 
E
E
 
D
V
 
L
-
 
F
-
 
D
R
 
R
N
 
P
N
 
Q
Q
 
H
D
 
E
V
 
R
I
 
T
S
 
K
A
 
A
Y
 
F
L
 
L

Query Sequence

>Ac3H11_4630 FitnessBrowser__acidovorax_3H11:Ac3H11_4630
MKPALYPLEKPPTMTTKKIGDVILDVKNISLRFGGVKALTDISFNVKEHEIRAIIGPNGA
GKSSMLNCINGVYTPQDGSITFRGKTFSHMNSRQVAEMGVARTFQNLALFKGMSVIDNIM
TGRNLKIKSNLFLQALRLGPAEREEMAHREKVEHIIDFLEIQAFRKTPVGQLPYGLQKRV
DLGRALAMEPQVLLLDEPMAGMNVEEKQDMCRFILDVNDEFGTTIVLIEHDMGVVMDISD
RVVVLDYGKKIGDGTPDEVRNNQDVISAYLGTSH

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory