SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Ac3H11_4989 Enoyl-CoA hydratase (EC 4.2.1.17) to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6slbAAA Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase (see paper)
40% identity, 95% coverage: 13:266/266 of query aligns to 5:257/257 of 6slbAAA

query
sites
6slbAAA
L
 
I
L
 
L
L
 
K
E
 
E
R
 
R
E
 
Q
G
 
D
A
 
G
I
 
V
A
 
L
T
 
V
L
 
L
R
 
T
F
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
E
 
E
A
 
K
L
 
L
N
 
N
A
 
A
I
 
I
D
 
T
V
 
G
P
 
E
M
 
L
A
 
L
N
 
D
A
 
A
F
 
L
L
 
Y
A
 
A
A
 
A
V
 
L
Q
 
K
T
 
E
V
 
G
A
 
E
A
 
E
D
 
D
P
 
R
A
 
E
V
 
V
R
 
R
A
 
A
V
 
L
V
 
L
L
 
L
C
 
T
G
 
G
N
 
A
G
 
G
R
|
R
G
 
A
F
 
F
M
 
S
A
|
A
G
 
G
G
x
Q
D
|
D
L
|
L
A
 
T
T
 
E
L
x
F
R
 
-
A
 
G
D
 
D
P
 
R
V
 
K
Q
 
P
S
 
D
A
x
Y
I
 
E
D
 
A
I
 
H
L
|
L
T
 
R
P
 
R
L
 
Y
N
|
N
A
 
R
A
 
V
L
 
V
L
 
E
L
 
A
L
 
L
A
 
S
Q
 
G
M
 
L
N
 
E
A
 
K
P
 
P
V
 
L
V
 
V
A
 
V
Q
 
A
V
 
V
H
 
N
G
 
G
V
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
|
A
G
 
G
L
 
M
S
|
S
L
 
L
L
 
A
L
 
L
M
 
W
A
 
G
D
 
D
Y
 
L
V
 
R
I
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
V
G
 
G
T
 
A
R
 
S
L
 
F
N
 
T
L
 
T
A
|
A
Y
x
F
I
 
V
N
 
R
L
 
I
G
 
G
T
x
L
S
 
V
C
x
P
D
|
D
V
 
S
G
 
G
A
 
L
S
 
S
W
 
F
A
 
L
L
 
L
P
 
P
R
 
R
I
 
L
V
 
V
G
 
G
V
 
L
R
 
A
Q
 
K
A
 
A
L
 
Q
E
 
E
I
 
L
A
 
L
L
 
L
L
 
L
G
 
S
D
 
P
A
 
R
F
 
L
T
 
S
A
 
A
D
 
E
D
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
H
R
 
R
V
 
V
V
 
V
P
 
P
A
 
A
A
 
E
E
 
K
L
 
L
D
 
M
S
 
E
A
 
E
T
 
A
A
 
L
A
 
S
L
 
L
A
 
A
Q
 
K
R
 
E
L
 
L
A
 
A
S
 
Q
G
 
G
P
 
P
T
 
T
L
 
R
A
 
A
Y
 
Y
G
 
A
A
 
L
M
 
T
K
 
K
R
 
K
L
 
L
M
 
L
R
 
L
A
 
E
S
 
T
M
 
Y
D
 
R
H
 
L
T
 
S
L
 
L
P
 
T
E
 
E
Q
 
A
L
 
L
A
|
A
A
 
L
E
 
E
K
 
A
D
 
V
A
 
L
F
 
Q
V
 
G
H
 
Q
C
 
A
A
x
G
G
 
Q
T
 
T
E
 
Q
D
 
D
F
 
H
R
 
E
A
 
E
G
 
G
V
 
V
E
 
R
A
 
A
F
 
F
H
 
R
L
 
E
R
 
K
Q
 
R
S
 
P
A
 
P
S
 
R
F
 
F
A
 
Q
G
 
G
R
 
R

6slaAAA Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase (see paper)
39% identity, 95% coverage: 13:266/266 of query aligns to 2:245/245 of 6slaAAA

query
sites
6slaAAA
L
 
I
L
 
L
L
 
K
E
 
E
R
 
R
E
 
Q
G
 
D
A
 
G
I
 
V
A
 
L
T
 
V
L
 
L
R
 
T
F
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
E
 
E
A
 
K
L
|
L
N
 
N
A
 
A
I
 
I
D
 
T
V
 
G
P
 
E
M
 
L
A
 
L
N
 
D
A
 
A
F
 
L
L
 
Y
A
 
A
A
 
A
V
 
L
Q
 
K
T
 
E
V
 
G
A
 
E
A
 
E
D
 
D
P
 
R
A
 
E
V
 
V
R
 
R
A
 
A
V
 
L
V
 
L
L
 
L
C
 
T
G
 
G
N
 
A
G
 
G
R
 
R
G
 
A
F
 
F
M
 
S
A
|
A
G
 
G
G
x
Q
D
|
D
L
|
L
A
 
T
T
 
E
L
 
A
R
 
H
A
x
L
D
 
R
P
 
R
V
x
Y
Q
x
N
S
 
R
A
 
V
I
 
V
D
 
E
I
 
A
L
 
L
T
 
S
P
 
G
L
 
L
N
 
E
A
 
K
A
 
-
L
 
-
L
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
M
 
-
N
 
-
A
 
-
P
 
P
V
 
L
V
 
V
A
 
V
Q
 
A
V
 
V
H
 
N
G
 
G
V
 
V
A
 
A
A
|
A
G
|
G
A
|
A
G
 
G
L
 
M
S
|
S
L
 
L
L
 
A
L
 
L
M
 
W
A
 
G
D
 
D
Y
 
L
V
 
R
I
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
V
G
 
G
T
 
A
R
 
S
L
 
F
N
 
T
L
 
T
A
|
A
Y
x
F
I
 
V
N
 
R
L
x
I
G
 
G
T
x
L
S
 
V
C
x
P
D
x
N
V
 
S
G
 
G
A
 
L
S
 
S
W
 
F
A
 
L
L
 
L
P
 
P
R
 
R
I
 
L
V
 
V
G
 
G
V
 
L
R
 
A
Q
 
K
A
 
A
L
 
Q
E
 
E
I
 
L
A
 
L
L
 
L
L
 
L
G
 
S
D
 
P
A
 
R
F
 
L
T
 
S
A
 
A
D
 
E
D
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
H
R
 
R
V
 
V
V
 
V
P
 
P
A
 
A
A
 
E
E
 
K
L
 
L
D
 
M
S
 
E
A
 
E
T
 
A
A
 
L
A
 
S
L
 
L
A
 
A
Q
 
K
R
 
E
L
 
L
A
 
A
S
 
Q
G
 
G
P
 
P
T
 
T
L
 
R
A
 
A
Y
 
Y
G
 
A
A
 
L
M
 
T
K
 
K
R
 
K
L
 
L
M
 
L
R
 
L
A
 
E
S
 
T
M
 
Y
D
 
R
H
 
L
T
 
S
L
 
L
P
 
T
E
 
E
Q
 
A
L
 
L
A
|
A
A
 
L
E
 
E
K
 
A
D
 
V
A
 
L
F
 
Q
V
 
G
H
 
Q
C
 
A
A
x
G
G
 
Q
T
 
T
E
 
Q
D
 
D
F
 
H
R
 
E
A
 
E
G
 
G
V
 
V
E
 
R
A
 
A
F
|
F
H
 
R
L
 
E
R
x
K
Q
 
R
S
 
P
A
 
P
S
 
R
F
 
F
A
 
Q
G
 
G
R
 
R

5zaiC Crystal structure of 3-hydroxypropionyl-coa dehydratase from metallosphaera sedula (see paper)
32% identity, 94% coverage: 16:266/266 of query aligns to 9:259/259 of 5zaiC

query
sites
5zaiC
E
 
K
R
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
N
I
 
L
A
 
F
T
 
W
L
 
I
R
 
T
F
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
E
 
D
A
x
K
L
|
L
N
 
N
A
 
A
I
 
L
D
 
N
V
 
A
P
 
K
M
 
L
A
 
L
N
 
E
A
 
E
F
 
L
L
 
D
A
 
R
A
 
A
V
 
V
Q
 
S
T
 
Q
V
 
A
A
 
E
A
 
S
D
 
D
P
 
P
A
 
E
V
 
I
R
 
R
A
 
V
V
 
I
V
 
I
L
 
I
C
 
T
G
 
G
N
 
K
G
 
G
R
 
K
G
 
A
F
 
F
M
 
C
A
|
A
G
|
G
G
x
A
D
|
D
L
x
I
A
 
T
T
 
Q
L
x
F
R
 
N
A
 
Q
D
 
L
P
 
T
V
 
P
Q
 
A
S
 
E
A
 
A
I
 
W
D
 
K
I
 
F
L
x
S
T
 
K
P
 
K
L
 
G
N
x
R
A
 
E
A
 
I
L
 
M
L
 
D
L
 
K
L
 
I
A
 
E
Q
 
A
M
 
L
N
 
S
A
 
K
P
 
P
V
 
T
V
 
I
A
 
A
Q
 
M
V
 
I
H
 
N
G
 
G
V
 
Y
A
 
A
A
 
L
G
 
G
A
x
G
G
 
G
L
 
L
S
x
E
L
 
L
L
 
A
L
 
L
M
 
A
A
 
C
D
 
D
Y
 
I
V
 
R
I
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
E
G
 
E
T
 
A
R
 
Q
L
 
L
N
 
G
L
 
L
A
x
P
Y
x
E
I
 
I
N
 
N
L
 
L
G
 
G
T
x
I
S
 
Y
C
x
P
D
x
G
V
 
Y
G
 
G
A
 
G
S
 
T
W
 
Q
A
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
I
 
V
V
 
I
G
 
G
V
 
K
R
 
G
Q
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
E
I
 
M
A
 
M
L
 
M
L
 
T
G
 
G
D
 
D
A
x
R
F
 
I
T
 
P
A
 
G
D
 
K
D
 
D
A
 
A
L
 
E
R
 
K
L
 
Y
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N
R
 
R
V
 
V
V
 
V
P
 
P
A
 
L
A
 
A
E
 
N
L
 
L
D
 
E
S
 
Q
A
 
E
T
 
T
A
 
R
A
 
K
L
 
L
A
 
A
Q
 
E
R
 
K
L
 
I
A
 
A
S
 
K
G
 
K
P
 
S
T
 
P
L
 
I
A
 
S
Y
 
L
G
 
A
A
 
L
M
 
I
K
 
K
R
 
E
L
 
V
M
 
V
R
 
N
A
 
R
S
 
G
M
 
L
D
 
D
H
 
S
T
 
P
L
 
L
P
 
L
E
 
S
Q
 
G
L
 
L
A
|
A
A
 
L
E
 
E
K
 
S
D
 
V
A
 
G
F
 
W
V
 
G
H
 
V
C
 
V
A
x
F
G
 
S
T
 
T
E
 
E
D
 
D
F
 
K
R
 
K
A
 
E
G
 
G
V
 
V
E
 
S
A
 
A
F
|
F
H
 
L
L
 
E
R
x
K
Q
 
R
S
 
E
A
 
P
S
 
T
F
 
F
A
 
K
G
 
G
R
 
K

1mj3A Crystal structure analysis of rat enoyl-coa hydratase in complex with hexadienoyl-coa (see paper)
31% identity, 94% coverage: 13:263/266 of query aligns to 6:255/258 of 1mj3A

query
sites
1mj3A
L
 
I
L
 
I
L
 
T
E
 
E
R
 
K
E
 
K
G
 
G
-
 
K
-
 
N
-
 
S
A
 
S
I
 
V
A
 
G
T
 
L
L
 
I
R
 
Q
F
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
E
x
K
A
|
A
L
|
L
N
 
N
A
|
A
I
 
L
D
 
C
V
 
N
P
 
G
M
 
L
A
 
I
N
 
E
A
 
E
F
 
L
L
 
N
A
 
Q
A
 
A
V
 
L
Q
 
E
T
 
T
V
 
F
A
 
E
A
 
E
D
 
D
P
 
P
A
 
A
V
 
V
R
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
V
L
 
L
C
 
T
G
 
G
N
 
G
G
 
E
R
 
K
G
 
A
F
 
F
M
 
A
A
|
A
G
|
G
G
x
A
D
|
D
L
x
I
A
 
K
T
 
E
L
x
M
R
 
Q
A
 
N
D
 
R
P
 
T
V
 
F
Q
 
Q
S
 
D
A
 
C
I
 
Y
D
x
S
I
 
G
L
|
L
T
 
S
P
 
H
L
 
W
N
 
D
A
 
H
A
 
-
L
 
-
L
 
-
L
 
-
L
 
I
A
 
T
Q
 
R
M
 
I
N
 
K
A
 
K
P
 
P
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Q
 
A
V
 
V
H
 
N
G
 
G
V
 
Y
A
 
A
A
 
L
G
 
G
A
x
G
G
 
G
L
 
C
S
x
E
L
 
L
L
 
A
L
 
M
M
 
M
A
 
C
D
 
D
Y
 
I
V
 
I
I
 
Y
A
 
A
A
 
G
E
 
E
G
 
K
T
 
A
R
 
Q
L
 
F
N
 
G
L
 
Q
A
x
P
Y
x
E
I
 
I
N
 
L
L
|
L
G
 
G
T
|
T
S
 
I
C
x
P
D
x
G
V
 
A
G
 
G
A
 
G
S
 
T
W
 
Q
A
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
I
 
A
V
 
V
G
 
G
V
 
K
R
 
S
Q
 
L
A
 
A
L
 
M
E
 
E
I
 
M
A
 
V
L
 
L
L
 
T
G
 
G
D
 
D
A
 
R
F
 
I
T
 
S
A
 
A
D
 
Q
D
 
D
A
 
A
L
 
K
R
 
Q
L
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
S
R
 
K
V
 
I
V
 
F
P
 
P
A
 
V
A
 
E
E
 
T
L
 
L
D
 
V
S
 
E
A
 
E
T
 
A
A
 
I
A
 
Q
L
 
C
A
 
A
Q
 
E
R
 
K
L
 
I
A
 
A
S
 
N
G
 
N
P
 
S
T
 
K
L
 
I
A
 
I
Y
 
V
G
 
A
A
 
M
M
 
A
K
 
K
R
 
E
L
 
S
M
 
V
R
 
N
A
 
A
S
 
A
M
 
F
D
 
E
H
 
M
T
 
T
L
 
L
P
 
T
E
 
E
Q
 
G
L
 
N
A
x
K
A
 
L
E
 
E
K
 
K
D
 
K
A
 
L
F
 
F
V
 
Y
H
 
S
C
 
T
A
x
F
G
 
A
T
 
T
E
 
D
D
 
D
F
 
R
R
 
R
A
 
E
G
 
G
V
 
M
E
 
S
A
 
A
F
 
F
H
 
V
L
 
E
R
 
K
Q
 
R
S
 
K
A
 
A
S
 
N
F
 
F

2dubA Enoyl-coa hydratase complexed with octanoyl-coa (see paper)
31% identity, 94% coverage: 13:263/266 of query aligns to 5:251/254 of 2dubA

query
sites
2dubA
L
 
I
L
 
I
L
 
T
E
 
E
R
 
K
E
 
K
G
 
G
-
 
K
-
 
N
-
 
S
A
 
S
I
 
V
A
 
G
T
 
L
L
 
I
R
 
Q
F
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
E
x
K
A
|
A
L
|
L
N
 
N
A
|
A
I
 
L
D
 
C
V
 
N
P
 
G
M
 
L
A
 
I
N
 
E
A
 
E
F
 
L
L
 
N
A
 
Q
A
 
A
V
 
L
Q
 
E
T
 
T
V
 
F
A
 
E
A
 
E
D
 
D
P
 
P
A
 
A
V
 
V
R
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
V
L
 
L
C
 
T
G
 
G
N
 
G
G
 
E
R
 
K
G
 
A
F
 
F
M
 
A
A
|
A
G
 
G
G
x
A
D
|
D
L
x
I
A
x
K
T
 
E
L
x
M
R
 
Q
A
 
N
D
 
R
P
 
T
V
 
F
Q
 
Q
S
 
-
A
 
-
I
 
-
D
 
D
I
 
C
L
 
Y
T
x
S
P
 
H
L
 
W
N
 
D
A
 
H
A
 
-
L
 
-
L
 
-
L
 
-
L
 
I
A
 
T
Q
 
R
M
 
I
N
 
K
A
 
K
P
 
P
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Q
 
A
V
 
V
H
 
N
G
 
G
V
 
Y
A
 
A
A
 
L
G
 
G
A
x
G
G
 
G
L
 
C
S
x
E
L
 
L
L
 
A
L
 
M
M
 
M
A
 
C
D
 
D
Y
 
I
V
 
I
I
 
Y
A
 
A
A
 
G
E
 
E
G
 
K
T
 
A
R
 
Q
L
 
F
N
 
G
L
 
Q
A
x
P
Y
x
E
I
 
I
N
 
L
L
 
L
G
 
G
T
|
T
S
 
I
C
x
P
D
x
G
V
x
A
G
 
G
A
 
G
S
 
T
W
 
Q
A
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
I
 
A
V
 
V
G
 
G
V
 
K
R
 
S
Q
 
L
A
 
A
L
 
M
E
 
E
I
 
M
A
 
V
L
 
L
L
 
T
G
 
G
D
 
D
A
 
R
F
 
I
T
 
S
A
 
A
D
 
Q
D
 
D
A
 
A
L
 
K
R
 
Q
L
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
S
R
 
K
V
 
I
V
 
F
P
 
P
A
 
V
A
 
E
E
 
T
L
 
L
D
 
V
S
 
E
A
 
E
T
 
A
A
 
I
A
 
Q
L
 
C
A
 
A
Q
 
E
R
 
K
L
 
I
A
 
A
S
 
N
G
 
N
P
 
S
T
 
K
L
 
I
A
 
I
Y
 
V
G
 
A
A
 
M
M
 
A
K
 
K
R
 
E
L
 
S
M
 
V
R
 
N
A
 
A
S
 
A
M
 
F
D
 
E
H
 
M
T
 
T
L
 
L
P
 
T
E
 
E
Q
 
G
L
 
N
A
x
K
A
 
L
E
 
E
K
 
K
D
 
K
A
 
L
F
 
F
V
 
Y
H
 
S
C
 
T
A
x
F
G
 
A
T
 
T
E
 
D
D
 
D
F
 
R
R
 
R
A
 
E
G
 
G
V
 
M
E
 
S
A
 
A
F
 
F
H
 
V
L
 
E
R
 
K
Q
 
R
S
 
K
A
 
A
S
 
N
F
 
F

1ey3A Structure of enoyl-coa hydratase complexed with the substrate dac-coa (see paper)
30% identity, 94% coverage: 13:263/266 of query aligns to 4:255/258 of 1ey3A

query
sites
1ey3A
L
 
I
L
 
I
L
 
T
E
 
E
R
 
K
E
 
K
G
 
G
-
 
K
-
 
N
-
 
S
A
 
S
I
 
V
A
 
G
T
 
L
L
 
I
R
 
Q
F
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
E
x
K
A
 
A
L
|
L
N
 
N
A
|
A
I
 
L
D
 
C
V
 
N
P
 
G
M
 
L
A
 
I
N
 
E
A
 
E
F
 
L
L
 
N
A
 
Q
A
 
A
V
 
L
Q
 
E
T
 
T
V
 
F
A
 
E
A
 
E
D
 
D
P
 
P
A
 
A
V
 
V
R
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
V
L
 
L
C
 
T
G
 
G
N
 
G
G
 
E
R
 
K
G
 
A
F
 
F
M
 
A
A
|
A
G
|
G
G
x
A
D
|
D
L
x
I
A
 
K
T
 
E
L
x
M
R
 
Q
A
 
N
D
 
R
P
 
T
V
 
F
Q
 
Q
S
 
D
A
 
C
I
 
Y
-
x
S
-
 
G
D
 
K
I
 
F
L
|
L
T
 
S
P
 
H
L
x
W
N
 
D
A
 
H
A
 
-
L
 
-
L
 
-
L
 
-
L
 
I
A
 
T
Q
 
R
M
 
I
N
 
K
A
 
K
P
 
P
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Q
 
A
V
 
V
H
 
N
G
 
G
V
 
Y
A
 
A
A
 
L
G
 
G
A
x
G
G
 
G
L
 
C
S
x
E
L
 
L
L
 
A
L
 
M
M
 
M
A
 
C
D
 
D
Y
 
I
V
 
I
I
 
Y
A
 
A
A
 
G
E
 
E
G
 
K
T
 
A
R
 
Q
L
 
F
N
 
G
L
 
Q
A
x
P
Y
x
E
I
 
I
N
 
L
L
|
L
G
 
G
T
|
T
S
 
I
C
x
P
D
x
G
V
 
A
G
 
G
A
 
G
S
 
T
W
 
Q
A
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
I
 
A
V
 
V
G
 
G
V
 
K
R
 
S
Q
 
L
A
 
A
L
 
M
E
 
E
I
 
M
A
 
V
L
 
L
L
 
T
G
 
G
D
 
D
A
 
R
F
 
I
T
 
S
A
 
A
D
 
Q
D
 
D
A
 
A
L
 
K
R
 
Q
L
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
S
R
 
K
V
 
I
V
 
F
P
 
P
A
 
V
A
 
E
E
 
T
L
 
L
D
 
V
S
 
E
A
 
E
T
 
A
A
 
I
A
 
Q
L
 
C
A
 
A
Q
 
E
R
 
K
L
 
I
A
 
A
S
 
N
G
 
N
P
 
S
T
 
K
L
 
I
A
 
I
Y
 
V
G
 
A
A
 
M
M
 
A
K
 
K
R
 
E
L
 
S
M
 
V
R
 
N
A
 
A
S
 
A
M
 
F
D
 
E
H
 
M
T
 
T
L
 
L
P
 
T
E
 
E
Q
 
G
L
 
N
A
x
K
A
 
L
E
 
E
K
 
K
D
 
K
A
 
L
F
 
F
V
 
Y
H
 
S
C
 
T
A
x
F
G
 
A
T
 
T
E
 
D
D
 
D
F
 
R
R
 
R
A
 
E
G
 
G
V
 
M
E
 
S
A
 
A
F
 
F
H
 
V
L
 
E
R
 
K
Q
 
R
S
 
K
A
 
A
S
 
N
F
 
F

P14604 Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial; mECH; mECH1; Enoyl-CoA hydratase 1; ECHS1; Short-chain enoyl-CoA hydratase; SCEH; EC 4.2.1.17; EC 5.3.3.8 from Rattus norvegicus (Rat) (see 3 papers)
30% identity, 94% coverage: 13:263/266 of query aligns to 36:287/290 of P14604

query
sites
P14604
L
 
I
L
 
I
L
 
T
E
 
E
R
 
K
E
 
K
G
 
G
-
 
K
-
 
N
-
 
S
A
 
S
I
 
V
A
 
G
T
 
L
L
 
I
R
 
Q
F
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
E
 
K
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
I
 
L
D
 
C
V
 
N
P
 
G
M
 
L
A
 
I
N
 
E
A
 
E
F
 
L
L
 
N
A
 
Q
A
 
A
V
 
L
Q
 
E
T
 
T
V
 
F
A
 
E
A
 
E
D
 
D
P
 
P
A
 
A
V
 
V
R
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
V
L
 
L
C
 
T
G
 
G
N
 
G
G
 
E
R
 
K
G
 
A
F
 
F
M
 
A
A
 
A
G
 
G
G
 
A
D
 
D
L
 
I
A
 
K
T
 
E
L
 
M
R
 
Q
A
 
N
D
 
R
P
 
T
V
 
F
Q
 
Q
S
 
D
A
 
C
I
 
Y
-
 
S
-
 
G
D
 
K
I
 
F
L
 
L
T
 
S
P
 
H
L
 
W
N
 
D
A
 
H
A
 
-
L
 
-
L
 
-
L
 
-
L
 
I
A
 
T
Q
 
R
M
 
I
N
 
K
A
 
K
P
 
P
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Q
 
A
V
 
V
H
 
N
G
 
G
V
 
Y
A
 
A
A
 
L
G
 
G
A
 
G
G
 
G
L
 
C
S
x
E
L
 
L
L
 
A
L
 
M
M
 
M
A
 
C
D
 
D
Y
 
I
V
 
I
I
 
Y
A
 
A
A
 
G
E
 
E
G
 
K
T
 
A
R
 
Q
L
 
F
N
 
G
L
 
Q
A
 
P
Y
x
E
I
 
I
N
 
L
L
 
L
G
 
G
T
 
T
S
 
I
C
 
P
D
 
G
V
 
A
G
 
G
A
 
G
S
 
T
W
 
Q
A
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
I
 
A
V
 
V
G
 
G
V
 
K
R
 
S
Q
 
L
A
 
A
L
 
M
E
 
E
I
 
M
A
 
V
L
 
L
L
 
T
G
 
G
D
 
D
A
 
R
F
 
I
T
 
S
A
 
A
D
 
Q
D
 
D
A
 
A
L
 
K
R
 
Q
L
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
S
R
 
K
V
 
I
V
 
F
P
 
P
A
 
V
A
 
E
E
 
T
L
 
L
D
 
V
S
 
E
A
 
E
T
 
A
A
 
I
A
 
Q
L
 
C
A
 
A
Q
 
E
R
 
K
L
 
I
A
 
A
S
 
N
G
 
N
P
 
S
T
 
K
L
 
I
A
 
I
Y
 
V
G
 
A
A
 
M
M
 
A
K
 
K
R
 
E
L
 
S
M
 
V
R
 
N
A
 
A
S
 
A
M
 
F
D
 
E
H
 
M
T
 
T
L
 
L
P
 
T
E
 
E
Q
 
G
L
 
N
A
 
K
A
 
L
E
 
E
K
 
K
D
 
K
A
 
L
F
 
F
V
 
Y
H
 
S
C
 
T
A
 
F
G
 
A
T
 
T
E
 
D
D
 
D
F
 
R
R
 
R
A
 
E
G
 
G
V
 
M
E
 
S
A
 
A
F
 
F
H
 
V
L
 
E
R
 
K
Q
 
R
S
 
K
A
 
A
S
 
N
F
 
F

Sites not aligning to the query:

1dubA 2-enoyl-coa hydratase, data collected at 100 k, ph 6.5 (see paper)
30% identity, 94% coverage: 13:263/266 of query aligns to 6:257/260 of 1dubA

query
sites
1dubA
L
 
I
L
 
I
L
 
T
E
 
E
R
 
K
E
 
K
G
 
G
-
 
K
-
 
N
-
 
S
A
 
S
I
 
V
A
 
G
T
 
L
L
 
I
R
 
Q
F
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
E
x
K
A
|
A
L
|
L
N
 
N
A
|
A
I
 
L
D
 
C
V
 
N
P
 
G
M
 
L
A
 
I
N
 
E
A
 
E
F
 
L
L
 
N
A
 
Q
A
 
A
V
 
L
Q
 
E
T
 
T
V
 
F
A
 
E
A
 
E
D
 
D
P
 
P
A
 
A
V
 
V
R
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
V
L
 
L
C
 
T
G
 
G
N
 
G
G
 
E
R
 
K
G
 
A
F
 
F
M
 
A
A
|
A
G
 
G
G
x
A
D
|
D
L
x
I
A
 
K
T
 
E
L
x
M
R
 
Q
A
 
N
D
 
R
P
 
T
V
 
F
Q
 
Q
S
 
D
A
 
C
I
 
Y
-
x
S
-
 
G
D
 
K
I
 
F
L
|
L
T
 
S
P
 
H
L
 
W
N
 
D
A
 
H
A
 
-
L
 
-
L
 
-
L
 
-
L
 
I
A
 
T
Q
 
R
M
 
I
N
 
K
A
 
K
P
 
P
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Q
 
A
V
 
V
H
 
N
G
 
G
V
x
Y
A
 
A
A
 
L
G
|
G
A
x
G
G
 
G
L
 
C
S
x
E
L
 
L
L
 
A
L
 
M
M
 
M
A
 
C
D
 
D
Y
 
I
V
 
I
I
 
Y
A
 
A
A
 
G
E
 
E
G
 
K
T
 
A
R
 
Q
L
 
F
N
 
G
L
 
Q
A
x
P
Y
x
E
I
 
I
N
 
L
L
|
L
G
 
G
T
|
T
S
 
I
C
x
P
D
x
G
V
 
A
G
 
G
A
 
G
S
 
T
W
 
Q
A
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
I
 
A
V
 
V
G
 
G
V
 
K
R
 
S
Q
 
L
A
 
A
L
 
M
E
 
E
I
 
M
A
 
V
L
 
L
L
 
T
G
 
G
D
 
D
A
 
R
F
 
I
T
 
S
A
 
A
D
 
Q
D
 
D
A
 
A
L
 
K
R
 
Q
L
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
S
R
 
K
V
 
I
V
 
F
P
 
P
A
 
V
A
 
E
E
 
T
L
 
L
D
 
V
S
 
E
A
 
E
T
 
A
A
 
I
A
 
Q
L
 
C
A
 
A
Q
 
E
R
 
K
L
 
I
A
 
A
S
 
N
G
 
N
P
 
S
T
 
K
L
 
I
A
 
I
Y
 
V
G
 
A
A
 
M
M
 
A
K
 
K
R
 
E
L
 
S
M
 
V
R
 
N
A
 
A
S
 
A
M
 
F
D
 
E
H
 
M
T
 
T
L
 
L
P
 
T
E
 
E
Q
 
G
L
 
N
A
x
K
A
 
L
E
 
E
K
 
K
D
 
K
A
 
L
F
|
F
V
 
Y
H
 
S
C
 
T
A
x
F
G
 
A
T
 
T
E
 
D
D
 
D
F
 
R
R
 
R
A
 
E
G
 
G
V
 
M
E
 
S
A
 
A
F
|
F
H
 
V
L
 
E
R
 
K
Q
 
R
S
 
K
A
 
A
S
 
N
F
 
F

2hw5C The crystal structure of human enoyl-coenzyme a (coa) hydratase short chain 1, echs1
30% identity, 93% coverage: 17:263/266 of query aligns to 13:257/260 of 2hw5C

query
sites
2hw5C
R
 
K
E
 
N
G
 
N
A
 
T
I
 
V
A
 
G
T
 
L
L
 
I
R
 
Q
F
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
E
x
K
A
|
A
L
|
L
N
 
N
A
|
A
I
 
L
D
 
C
V
 
D
P
 
G
M
 
L
A
 
I
N
 
D
A
 
E
F
 
L
L
 
N
A
 
Q
A
 
A
V
 
L
Q
 
K
T
 
I
V
 
F
A
 
E
A
 
E
D
 
D
P
 
P
A
 
A
V
 
V
R
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
V
L
 
L
C
 
T
G
 
G
N
 
G
G
 
D
R
x
K
G
 
A
F
 
F
M
 
A
A
 
A
G
 
G
G
x
A
D
 
D
L
x
I
A
 
K
T
 
E
L
x
M
R
 
Q
A
 
N
D
 
L
P
 
S
V
 
F
Q
 
Q
S
 
D
A
 
C
I
 
Y
D
x
S
I
 
-
L
 
-
T
 
S
P
 
K
L
 
F
N
x
L
A
 
K
A
 
H
L
 
W
L
 
D
L
 
H
L
 
L
A
 
T
Q
 
Q
M
 
V
N
 
K
A
 
K
P
 
P
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Q
 
A
V
 
V
H
 
N
G
 
G
V
 
Y
A
 
A
A
x
F
G
 
G
A
x
G
G
 
G
L
 
C
S
x
E
L
 
L
L
 
A
L
 
M
M
 
M
A
 
C
D
 
D
Y
 
I
V
 
I
I
 
Y
A
 
A
A
 
G
E
 
E
G
 
K
T
 
A
R
 
Q
L
 
F
N
 
A
L
 
Q
A
x
P
Y
x
E
I
 
I
N
 
L
L
 
I
G
 
G
T
|
T
S
 
I
C
x
P
D
x
G
V
 
A
G
 
G
A
 
G
S
 
T
W
 
Q
A
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
I
 
A
V
 
V
G
 
G
V
 
K
R
 
S
Q
 
L
A
 
A
L
 
M
E
 
E
I
 
M
A
 
V
L
 
L
L
 
T
G
 
G
D
 
D
A
 
R
F
 
I
T
 
S
A
 
A
D
 
Q
D
 
D
A
 
A
L
 
K
R
 
Q
L
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
S
R
 
K
V
 
I
V
 
C
P
 
P
A
 
V
A
 
E
E
 
T
L
 
L
D
 
V
S
 
E
A
 
E
T
 
A
A
 
I
A
 
Q
L
 
C
A
 
A
Q
 
E
R
 
K
L
 
I
A
 
A
S
 
S
G
 
N
P
 
S
T
 
K
L
 
I
A
 
V
Y
 
V
G
 
A
A
 
M
M
 
A
K
 
K
R
 
E
L
 
S
M
 
V
R
 
N
A
 
A
S
 
A
M
 
F
D
 
E
H
 
M
T
 
T
L
 
L
P
 
T
E
 
E
Q
 
G
L
 
S
A
x
K
A
 
L
E
 
E
K
 
K
D
 
K
A
 
L
F
 
F
V
 
Y
H
 
S
C
 
T
A
x
F
G
 
A
T
 
T
E
 
D
D
 
D
F
 
R
R
 
K
A
 
E
G
 
G
V
 
M
E
 
T
A
 
A
F
 
F
H
 
V
L
 
E
R
 
K
Q
 
R
S
 
K
A
 
A
S
 
N
F
 
F

3q0gD Crystal structure of the mycobacterium tuberculosis crotonase bound to a reaction intermediate derived from crotonyl coa
31% identity, 94% coverage: 13:263/266 of query aligns to 5:249/250 of 3q0gD

query
sites
3q0gD
L
 
I
L
 
L
L
 
V
E
 
E
R
 
R
E
 
D
G
 
Q
A
 
R
I
 
V
A
 
G
T
 
I
L
 
I
R
 
T
F
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
I
 
L
D
 
N
V
 
S
P
 
Q
M
 
V
A
 
M
N
 
N
A
 
E
F
 
V
L
 
T
A
 
S
A
 
A
V
 
A
Q
 
T
T
 
E
V
 
L
A
 
D
A
 
D
D
 
D
P
 
P
A
 
D
V
 
I
R
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
I
L
 
I
C
 
T
G
 
G
N
 
S
G
 
A
R
 
K
G
 
A
F
 
F
M
 
A
A
 
A
G
 
G
G
x
A
D
 
D
L
 
I
A
 
K
T
 
E
L
x
M
R
 
F
A
 
A
D
 
D
P
 
A
V
 
F
Q
x
T
S
 
A
A
 
-
I
 
-
D
 
-
I
 
-
L
 
-
T
 
-
P
 
D
L
 
F
N
x
F
A
 
A
A
 
T
L
 
W
L
 
G
L
 
K
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
M
 
V
N
 
R
A
 
T
P
 
P
V
 
T
V
 
I
A
 
A
Q
 
A
V
 
V
H
 
A
G
 
G
V
 
Y
A
 
A
A
 
L
G
 
G
A
x
G
G
 
G
L
 
C
S
x
E
L
 
L
L
 
A
L
 
M
M
 
M
A
 
C
D
 
D
Y
 
V
V
 
L
I
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
D
G
 
T
T
 
A
R
 
K
L
 
F
N
 
G
L
 
Q
A
x
P
Y
x
E
I
 
I
N
 
K
L
 
L
G
 
G
T
x
V
S
 
L
C
x
P
D
x
G
V
 
M
G
 
G
A
 
G
S
 
S
W
 
Q
A
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
I
 
A
V
 
I
G
 
G
V
 
K
R
 
A
Q
 
K
A
 
A
L
 
M
E
 
D
I
 
L
A
 
I
L
 
L
L
 
T
G
 
G
D
 
R
A
 
T
F
 
M
T
 
D
A
 
A
D
 
A
D
 
E
A
 
A
L
 
E
R
 
R
L
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
S
R
 
R
V
 
V
V
 
V
P
 
P
A
 
A
A
 
D
E
 
D
L
 
L
D
 
L
S
 
T
A
 
E
T
 
A
A
 
R
A
 
A
L
 
T
A
 
A
Q
 
T
R
 
T
L
 
I
A
 
S
S
 
Q
G
 
M
P
 
S
T
 
A
L
 
S
A
 
A
Y
 
A
G
 
R
A
 
M
M
 
A
K
 
K
R
 
E
L
 
A
M
 
V
R
 
N
A
 
R
S
 
A
M
 
F
D
 
E
H
 
S
T
 
S
L
 
L
P
 
S
E
 
E
Q
 
G
L
 
L
A
x
L
A
 
Y
E
 
E
K
 
R
D
 
R
A
 
L
F
|
F
V
 
H
H
 
S
C
 
A
A
x
F
G
 
A
T
 
T
E
 
E
D
 
D
F
 
Q
R
 
S
A
 
E
G
 
G
V
 
M
E
 
A
A
 
A
F
|
F
H
 
I
L
 
E
R
 
K
Q
 
R
S
 
A
A
 
P
S
 
Q
F
 
F

3h81A Crystal structure of enoyl-coa hydratase from mycobacterium tuberculosis (see paper)
31% identity, 95% coverage: 13:266/266 of query aligns to 5:256/256 of 3h81A

query
sites
3h81A
L
 
I
L
 
L
L
 
V
E
 
E
R
 
R
E
 
D
G
 
Q
A
 
R
I
 
V
A
 
G
T
 
I
L
 
I
R
 
T
F
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
I
 
L
D
 
N
V
 
S
P
 
Q
M
 
V
A
 
M
N
 
N
A
 
E
F
 
V
L
 
T
A
 
S
A
 
A
V
 
A
Q
 
T
T
 
E
V
 
L
A
 
D
A
 
D
D
 
D
P
 
P
A
 
D
V
 
I
R
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
I
L
 
I
C
 
T
G
 
G
N
 
S
G
 
A
R
 
K
G
 
A
F
 
F
M
 
A
A
 
A
G
 
G
G
x
A
D
 
D
L
 
I
A
 
K
T
 
E
L
x
M
R
 
-
A
 
A
D
 
D
P
 
-
V
 
L
Q
 
T
S
 
F
A
 
A
I
 
D
D
 
A
I
 
F
L
x
T
T
 
A
P
 
D
L
 
F
N
x
F
A
 
A
A
 
T
L
 
W
L
 
G
L
 
K
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
M
 
V
N
 
R
A
 
T
P
 
P
V
 
T
V
 
I
A
 
A
Q
 
A
V
 
V
H
 
A
G
 
G
V
 
Y
A
 
A
A
 
L
G
 
G
A
x
G
G
 
G
L
 
C
S
x
E
L
 
L
L
 
A
L
 
M
M
 
M
A
 
C
D
 
D
Y
 
V
V
 
L
I
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
D
G
 
T
T
 
A
R
 
K
L
 
F
N
 
G
L
 
Q
A
x
P
Y
x
E
I
 
I
N
 
K
L
 
L
G
 
G
T
x
V
S
 
L
C
x
P
D
x
G
V
 
M
G
 
G
A
 
G
S
 
S
W
 
Q
A
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
I
 
A
V
 
I
G
 
G
V
 
K
R
 
A
Q
 
K
A
 
A
L
 
M
E
 
D
I
 
L
A
 
I
L
 
L
L
 
T
G
 
G
D
 
R
A
 
T
F
 
M
T
 
D
A
 
A
D
 
A
D
 
E
A
 
A
L
 
E
R
 
R
L
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
S
R
 
R
V
 
V
V
 
V
P
 
P
A
 
A
A
 
D
E
 
D
L
 
L
D
 
L
S
 
T
A
 
E
T
 
A
A
 
R
A
 
A
L
 
T
A
 
A
Q
 
T
R
 
T
L
 
I
A
 
S
S
 
Q
G
 
M
P
 
S
T
 
A
L
 
S
A
 
A
Y
 
A
G
 
R
A
 
M
M
 
A
K
 
K
R
 
E
L
 
A
M
 
V
R
 
N
A
 
R
S
 
A
M
 
F
D
 
E
H
 
S
T
 
S
L
 
L
P
 
S
E
 
E
Q
 
G
L
 
L
A
x
L
A
 
Y
E
 
E
K
 
R
D
 
R
A
 
L
F
 
F
V
 
H
H
 
S
C
 
A
A
x
F
G
 
A
T
 
T
E
 
E
D
 
D
F
x
Q
R
 
S
A
 
E
G
 
G
V
 
M
E
 
A
A
 
A
F
 
F
H
 
I
L
 
E
R
 
K
Q
 
R
S
 
A
A
 
P
S
 
Q
F
 
F
A
 
T
G
 
H
R
 
R

3q0jC Crystal structure of the mycobacterium tuberculosis crotonase in complex with the inhibitor acetoacetylcoa
31% identity, 94% coverage: 13:263/266 of query aligns to 6:254/255 of 3q0jC

query
sites
3q0jC
L
 
I
L
 
L
L
 
V
E
 
E
R
 
R
E
 
D
G
 
Q
A
 
R
I
 
V
A
 
G
T
 
I
L
 
I
R
 
T
F
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
E
x
Q
A
|
A
L
|
L
N
 
N
A
|
A
I
 
L
D
 
N
V
 
S
P
 
Q
M
 
V
A
 
M
N
 
N
A
 
E
F
 
V
L
 
T
A
 
S
A
 
A
V
 
A
Q
 
T
T
 
E
V
 
L
A
 
D
A
 
D
D
 
D
P
 
P
A
 
D
V
 
I
R
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
I
L
 
I
C
 
T
G
 
G
N
 
S
G
 
A
R
 
K
G
 
A
F
 
F
M
 
A
A
|
A
G
|
G
G
x
A
D
|
D
L
x
I
A
x
K
T
 
E
L
x
M
R
 
-
A
 
A
D
 
D
P
 
-
V
 
L
Q
 
T
S
 
F
A
 
A
I
 
D
D
 
A
I
 
F
L
x
T
T
 
A
P
 
D
L
 
F
N
x
F
A
 
A
A
 
T
L
 
W
L
 
G
L
 
K
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
M
 
V
N
 
R
A
 
T
P
 
P
V
 
T
V
 
I
A
 
A
Q
 
A
V
 
V
H
 
A
G
 
G
V
 
Y
A
 
A
A
 
L
G
|
G
A
x
G
G
 
G
L
 
C
S
x
E
L
 
L
L
 
A
L
 
M
M
 
M
A
 
C
D
 
D
Y
 
V
V
 
L
I
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
D
G
 
T
T
 
A
R
 
K
L
 
F
N
 
G
L
 
Q
A
x
P
Y
x
E
I
 
I
N
 
K
L
 
L
G
 
G
T
x
V
S
 
L
C
x
P
D
x
G
V
x
M
G
 
G
A
 
G
S
 
S
W
 
Q
A
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
I
 
A
V
 
I
G
 
G
V
 
K
R
 
A
Q
 
K
A
 
A
L
 
M
E
 
D
I
 
L
A
 
I
L
 
L
L
 
T
G
 
G
D
 
R
A
 
T
F
 
M
T
 
D
A
 
A
D
 
A
D
 
E
A
 
A
L
 
E
R
 
R
L
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
S
R
 
R
V
 
V
V
 
V
P
 
P
A
 
A
A
 
D
E
 
D
L
 
L
D
 
L
S
 
T
A
 
E
T
 
A
A
 
R
A
 
A
L
 
T
A
 
A
Q
 
T
R
 
T
L
 
I
A
 
S
S
 
Q
G
 
M
P
 
S
T
 
A
L
 
S
A
 
A
Y
 
A
G
 
R
A
 
M
M
 
A
K
 
K
R
 
E
L
 
A
M
 
V
R
 
N
A
 
R
S
 
A
M
 
F
D
 
E
H
 
S
T
 
S
L
 
L
P
 
S
E
 
E
Q
 
G
L
 
L
A
x
L
A
 
Y
E
 
E
K
 
R
D
 
R
A
 
L
F
 
F
V
 
H
H
 
S
C
 
A
A
x
F
G
 
A
T
 
T
E
 
E
D
 
D
F
 
Q
R
 
S
A
 
E
G
 
G
V
 
M
E
 
A
A
 
A
F
 
F
H
 
I
L
 
E
R
 
K
Q
 
R
S
 
A
A
 
P
S
 
Q
F
 
F

3q0gC Crystal structure of the mycobacterium tuberculosis crotonase bound to a reaction intermediate derived from crotonyl coa
31% identity, 94% coverage: 13:263/266 of query aligns to 6:254/255 of 3q0gC

query
sites
3q0gC
L
 
I
L
 
L
L
 
V
E
 
E
R
 
R
E
 
D
G
 
Q
A
 
R
I
 
V
A
 
G
T
 
I
L
 
I
R
 
T
F
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
E
 
Q
A
 
A
L
|
L
N
 
N
A
 
A
I
 
L
D
 
N
V
 
S
P
 
Q
M
 
V
A
 
M
N
 
N
A
 
E
F
 
V
L
 
T
A
 
S
A
 
A
V
 
A
Q
 
T
T
 
E
V
 
L
A
 
D
A
 
D
D
 
D
P
 
P
A
 
D
V
 
I
R
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
I
L
 
I
C
 
T
G
 
G
N
 
S
G
 
A
R
 
K
G
 
A
F
 
F
M
 
A
A
|
A
G
 
G
G
x
A
D
 
D
L
x
I
A
x
K
T
 
E
L
x
M
R
 
-
A
 
A
D
 
D
P
 
-
V
 
L
Q
 
T
S
 
F
A
 
A
I
 
D
D
 
A
I
 
F
L
x
T
T
 
A
P
 
D
L
 
F
N
x
F
A
 
A
A
 
T
L
 
W
L
 
G
L
 
K
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
M
 
V
N
 
R
A
 
T
P
 
P
V
 
T
V
 
I
A
 
A
Q
 
A
V
 
V
H
 
A
G
 
G
V
x
Y
A
 
A
A
 
L
G
 
G
A
x
G
G
 
G
L
 
C
S
x
E
L
 
L
L
 
A
L
 
M
M
 
M
A
 
C
D
 
D
Y
 
V
V
 
L
I
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
D
G
 
T
T
 
A
R
 
K
L
 
F
N
 
G
L
 
Q
A
x
P
Y
x
E
I
 
I
N
 
K
L
|
L
G
 
G
T
x
V
S
 
L
C
x
P
D
x
G
V
 
M
G
 
G
A
 
G
S
 
S
W
 
Q
A
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
I
 
A
V
 
I
G
 
G
V
 
K
R
 
A
Q
 
K
A
 
A
L
 
M
E
 
D
I
 
L
A
 
I
L
 
L
L
 
T
G
 
G
D
 
R
A
 
T
F
 
M
T
 
D
A
 
A
D
 
A
D
 
E
A
 
A
L
 
E
R
 
R
L
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
S
R
 
R
V
 
V
V
 
V
P
 
P
A
 
A
A
 
D
E
 
D
L
 
L
D
 
L
S
 
T
A
 
E
T
 
A
A
 
R
A
 
A
L
 
T
A
 
A
Q
 
T
R
 
T
L
 
I
A
 
S
S
 
Q
G
 
M
P
 
S
T
 
A
L
 
S
A
 
A
Y
 
A
G
 
R
A
 
M
M
 
A
K
 
K
R
 
E
L
 
A
M
 
V
R
 
N
A
 
R
S
 
A
M
 
F
D
 
E
H
 
S
T
 
S
L
 
L
P
 
S
E
 
E
Q
 
G
L
 
L
A
x
L
A
 
Y
E
 
E
K
 
R
D
 
R
A
 
L
F
 
F
V
 
H
H
 
S
C
 
A
A
x
F
G
 
A
T
 
T
E
 
E
D
 
D
F
 
Q
R
 
S
A
 
E
G
 
G
V
 
M
E
 
A
A
 
A
F
 
F
H
 
I
L
 
E
R
 
K
Q
 
R
S
 
A
A
 
P
S
 
Q
F
 
F

3rrvB Crystal structure of an enoyl-coa hydratase/isomerase from mycobacterium paratuberculosis (see paper)
32% identity, 88% coverage: 18:252/266 of query aligns to 13:247/254 of 3rrvB

query
sites
3rrvB
E
 
D
G
 
G
A
 
A
I
 
L
A
 
R
T
 
I
L
 
I
R
 
T
F
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
E
 
D
A
 
S
L
 
L
N
 
N
A
 
S
I
 
V
D
 
N
V
 
D
P
 
D
M
 
L
A
 
H
N
 
V
A
 
G
F
 
L
L
 
A
A
 
R
A
 
L
V
 
W
Q
 
Q
T
 
R
V
 
L
A
 
T
A
 
D
D
 
D
P
 
P
A
 
T
V
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
A
V
 
V
L
 
I
C
 
T
G
 
G
N
 
A
G
 
G
R
 
R
G
 
A
F
 
F
M
 
S
A
 
A
G
 
G
G
|
G
D
 
D
L
 
F
-
 
G
-
 
Y
-
x
L
-
 
K
-
 
E
-
 
L
-
 
S
-
 
A
-
 
D
A
 
A
T
 
D
L
 
L
R
 
R
A
 
A
D
 
K
P
 
T
V
 
I
Q
 
R
S
 
D
A
x
G
I
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
-
T
 
-
P
 
-
L
 
-
N
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
V
L
 
L
L
 
G
L
 
M
A
 
A
Q
 
R
M
 
C
N
 
R
A
 
I
P
 
P
V
 
V
V
 
V
A
 
A
Q
 
A
V
 
V
H
 
N
G
 
G
V
 
P
A
 
A
A
 
V
G
 
G
A
x
L
G
 
G
L
 
C
S
|
S
L
 
L
L
 
V
L
 
A
M
 
L
A
 
S
D
 
D
Y
 
I
V
 
V
I
 
Y
A
 
I
A
 
A
E
 
E
G
 
N
T
 
A
R
 
Y
L
 
L
N
 
A
L
 
D
A
 
P
Y
x
H
I
 
V
N
 
Q
L
 
V
G
 
G
T
 
L
S
 
V
C
 
A
D
x
A
V
x
D
G
 
G
A
 
G
S
 
P
W
 
L
A
 
T
L
 
W
P
 
P
R
 
L
I
 
H
V
 
I
G
 
S
V
 
L
R
 
L
Q
 
L
A
 
A
L
 
K
E
 
E
I
 
Y
A
 
A
L
 
L
L
 
T
G
 
G
D
 
T
A
 
R
F
 
I
T
 
S
A
 
A
D
 
Q
D
 
R
A
 
A
L
 
V
R
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
L
V
 
A
N
 
N
R
 
H
V
 
V
V
 
A
-
 
D
-
 
D
P
 
P
A
 
V
A
 
A
E
 
E
L
 
-
D
 
-
S
 
-
A
 
-
T
 
A
A
 
I
A
 
A
L
 
C
A
 
A
Q
 
K
R
 
K
L
 
I
A
 
L
S
 
E
G
 
L
P
 
P
T
 
Q
L
 
Q
A
 
A
Y
 
V
G
 
E
A
 
S
M
 
T
K
 
K
R
 
R
L
 
V
M
 
L
R
 
N
A
 
I
S
 
H
M
 
L
D
 
E
H
 
R
-
 
A
-
 
V
-
 
L
-
 
A
T
 
S
L
 
L
P
x
D
E
 
Y
Q
 
A
L
 
L
A
 
S
A
 
A
E
|
E
K
 
S
D
 
Q
A
 
S
F
 
F
V
 
V
H
 
-
C
 
-
A
 
-
G
 
-
T
 
T
E
 
E
D
 
D
F
 
F
R
 
R
A
 
S
G
 
I
V
 
V

7borA Structure of pseudomonas aeruginosa coa-bound odaa (see paper)
33% identity, 85% coverage: 15:239/266 of query aligns to 6:228/247 of 7borA

query
sites
7borA
L
 
V
E
 
E
R
 
R
E
 
E
G
 
T
A
 
G
I
 
L
A
 
L
T
 
T
L
 
L
R
 
R
F
 
L
N
 
D
R
 
R
P
 
Q
E
x
D
A
x
K
L
 
K
N
 
N
A
|
A
I
 
L
D
 
T
V
 
R
P
 
A
M
 
M
A
 
Y
N
 
S
A
 
R
F
 
M
L
 
A
A
 
E
A
 
A
V
 
L
Q
 
L
T
 
E
V
 
A
A
 
Q
A
 
A
D
 
D
P
 
T
A
 
A
V
 
V
R
 
R
A
 
V
V
 
V
V
 
L
L
 
I
C
 
T
G
 
G
N
 
G
G
 
D
R
 
A
G
 
C
F
 
F
M
 
T
A
x
S
G
 
G
G
x
N
D
 
D
L
x
I
A
 
L
T
 
D
L
x
F
R
 
L
A
 
E
D
 
Q
P
 
P
V
 
-
Q
 
P
S
 
S
A
 
L
I
 
R
D
|
D
I
 
-
L
 
-
T
 
S
P
 
P
L
 
V
N
x
G
A
 
R
A
 
F
L
 
M
L
 
S
L
 
A
L
 
L
A
 
L
Q
 
E
M
 
F
N
 
P
A
 
K
P
 
P
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Q
 
A
V
 
V
H
 
N
G
 
G
V
 
P
A
 
A
A
x
V
G
 
G
A
x
I
G
 
G
L
 
T
S
x
T
L
 
L
L
 
L
L
 
L
M
 
H
A
 
C
D
 
D
Y
 
L
V
 
V
I
 
F
A
 
V
A
 
G
E
 
R
G
 
N
T
 
A
R
 
R
L
 
L
N
 
K
L
 
M
A
 
P
Y
x
F
I
 
V
N
 
N
L
|
L
G
 
G
T
x
L
S
 
T
C
x
P
D
x
E
V
 
F
G
 
G
A
 
S
S
 
S
W
 
L
A
 
I
L
 
L
P
 
P
R
 
R
I
 
M
V
 
L
G
 
G
V
 
H
R
 
A
Q
 
K
A
 
A
L
 
A
E
 
E
I
 
L
A
 
L
L
 
M
L
 
L
G
 
G
D
 
Q
A
 
D
F
 
F
T
 
S
A
 
G
D
 
E
D
 
Q
A
 
A
L
 
A
R
 
A
L
 
W
G
 
G
L
 
L
V
 
A
N
 
N
R
 
A
V
 
A
V
 
L
P
 
E
-
 
D
-
 
G
A
 
A
A
 
T
E
 
V
L
 
L
D
 
E
S
 
H
A
 
A
T
 
R
A
 
D
A
 
A
L
 
A
A
 
R
Q
 
R
R
 
F
L
 
L
A
 
H
S
 
L
G
 
A
P
 
P
T
 
S
L
 
-
A
 
A
Y
 
V
G
 
V
A
 
E
M
 
S
K
 
K
R
 
R
L
 
L
M
 
M
R
 
K
A
 
A
S
 
P
M
 
F
D
 
I
H
 
E
T
 
E
L
 
L
P
 
R
E
 
R
Q
 
V
L
 
I
A
|
A
A
 
E
E
 
E
K
 
G
D
 
D
A
 
I
F
 
F

Sites not aligning to the query:

3omeC Crystal structure of a probable enoyl-coa hydratase from mycobacterium smegmatis (see paper)
32% identity, 77% coverage: 20:225/266 of query aligns to 13:216/247 of 3omeC

query
sites
3omeC
A
 
S
I
 
I
A
 
A
T
 
T
L
 
I
R
 
T
F
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
E
 
E
A
 
A
L
 
A
N
 
N
A
 
A
I
 
Q
D
 
N
V
 
P
P
 
E
M
 
L
A
 
L
N
 
D
A
 
E
F
 
L
L
 
D
A
 
A
A
 
A
V
 
W
Q
 
T
T
 
R
V
 
A
A
 
A
A
 
E
D
 
D
P
 
N
A
 
E
V
 
V
R
 
K
A
 
V
V
 
I
V
 
I
L
 
L
C
 
R
G
 
A
N
 
N
G
 
G
R
 
K
G
 
H
F
 
F
M
 
S
A
 
A
G
 
G
G
x
H
D
 
D
L
 
L
A
 
R
T
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
D
 
-
P
 
P
V
x
E
Q
 
K
S
 
I
A
 
S
I
 
L
D
 
E
I
 
F
L
 
I
T
 
I
P
 
Q
L
 
H
N
x
E
A
|
A
A
 
R
L
 
R
L
 
Y
L
|
L
-
 
D
-
 
Y
-
 
T
-
 
L
-
 
R
L
 
W
A
 
R
Q
 
N
M
 
V
N
 
P
A
 
K
P
 
P
V
 
S
V
 
I
A
 
A
Q
 
A
V
 
V
H
 
Q
G
 
G
V
 
R
A
 
C
A
 
I
G
 
S
A
x
G
G
 
G
L
 
L
S
x
L
L
 
L
L
 
C
L
 
W
M
 
P
A
 
C
D
 
D
Y
 
L
V
 
I
I
 
L
A
 
A
A
 
S
E
 
D
G
 
D
T
 
A
R
 
L
L
 
F
N
 
S
-
 
D
-
 
P
L
x
V
A
 
A
Y
 
L
I
 
M
N
 
G
L
x
I
G
|
G
T
 
G
S
 
V
C
x
E
D
 
Y
V
 
H
G
 
G
A
 
H
S
 
T
W
 
W
A
 
E
L
 
L
P
 
-
R
 
-
I
 
-
V
 
-
G
 
G
V
 
P
R
 
R
Q
 
K
A
 
A
L
 
K
E
 
E
I
 
I
A
 
L
L
 
F
L
 
T
G
 
G
D
 
R
A
 
A
F
 
L
T
 
T
A
 
A
D
 
E
D
 
E
A
 
A
L
 
E
R
 
R
L
 
T
G
 
G
L
 
M
V
 
V
N
 
N
R
 
R
V
 
V
V
 
V
P
 
A
A
 
R
A
 
D
E
 
E
L
 
L
D
 
D
S
 
A
A
 
Q
T
 
T
A
 
R
A
 
E
L
 
L
A
 
A
Q
 
E
R
 
Q
L
 
I
A
 
A
S
 
T
G
 
M
P
 
P
T
 
P
L
 
F
A
 
A
Y
 
L
G
 
R
A
 
Q
M
 
A
K
 
K
R
 
R
L
 
A
M
 
V
R
 
N
A
 
Q
S
 
T
M
 
L
D
 
D

Sites not aligning to the query:

1wdmA Fatty acid beta-oxidation multienzyme complex from pseudomonas fragi, form i (native3) (see paper)
29% identity, 94% coverage: 18:266/266 of query aligns to 14:267/707 of 1wdmA

query
sites
1wdmA
E
 
E
G
 
S
A
 
G
I
 
I
A
 
V
T
 
E
L
 
L
R
 
K
F
 
F
N
 
D
-
 
L
R
 
K
P
 
G
E
 
E
A
 
S
L
 
V
N
 
N
A
 
K
I
 
F
D
 
N
V
 
R
P
 
L
M
 
T
A
 
L
N
 
N
A
 
E
F
 
L
L
 
R
A
 
Q
A
 
A
V
 
V
Q
 
D
T
 
A
V
 
I
A
 
K
A
 
A
D
 
D
P
 
A
A
 
S
V
 
V
R
 
K
A
 
G
V
 
V
V
 
I
L
 
V
C
 
S
G
 
S
N
 
G
G
 
K
R
 
D
G
 
V
F
 
F
M
 
I
A
 
V
G
 
G
G
x
A
D
 
D
L
 
I
A
 
T
T
 
E
L
 
F
R
 
V
A
 
E
D
 
N
-
 
F
-
 
K
-
 
L
P
 
P
V
 
D
Q
 
A
S
 
E
A
 
L
I
 
I
D
 
A
I
 
G
L
x
N
T
 
L
P
 
E
L
 
A
N
|
N
A
 
K
A
 
I
L
 
F
L
 
S
L
 
D
L
 
F
A
 
E
Q
 
D
M
 
L
N
 
N
A
 
V
P
 
P
V
 
T
V
 
V
A
 
A
Q
 
A
V
 
I
H
 
N
G
 
G
V
 
I
A
 
A
A
 
L
G
 
G
A
x
G
G
 
G
L
 
L
S
x
E
L
 
M
L
 
C
L
 
L
M
 
A
A
 
A
D
 
D
Y
 
F
V
 
R
I
 
V
A
 
M
A
 
A
E
 
D
G
 
S
T
 
A
R
 
K
L
 
I
N
 
G
L
 
L
A
x
P
Y
x
E
I
 
V
N
x
K
L
 
L
G
 
G
T
 
I
S
 
Y
C
x
P
D
x
G
V
 
F
G
 
G
A
 
G
S
 
T
W
 
V
A
 
R
L
 
L
P
 
P
R
 
R
I
 
L
V
 
I
G
 
G
V
 
V
R
 
D
Q
 
N
A
 
A
L
 
V
E
 
E
I
 
W
A
 
I
L
 
A
L
 
S
G
 
G
D
 
K
A
 
E
F
 
N
T
 
R
A
 
A
D
 
E
D
 
D
A
 
A
L
 
L
R
 
K
L
 
V
G
 
S
L
 
A
V
 
V
N
 
D
R
 
A
V
 
V
V
 
V
P
 
T
A
 
A
A
 
D
E
 
K
L
 
L
D
 
G
S
 
A
A
 
A
T
 
A
A
 
L
A
 
D
L
 
L
A
 
I
Q
 
K
R
 
R
L
 
A
A
 
I
S
 
S
G
 
G
P
 
-
T
 
E
L
 
L
A
 
D
Y
 
Y
G
 
K
A
 
A
M
 
K
K
 
R
R
 
Q
L
 
P
M
 
K
R
 
L
A
 
E
S
 
K
M
 
L
D
 
K
H
 
L
T
 
N
L
 
A
P
 
I
E
 
E
Q
 
Q
L
 
M
A
 
M
A
 
A
E
 
F
K
 
E
D
 
T
A
 
A
-
 
K
-
 
G
F
 
F
V
 
V
H
 
A
C
 
G
A
 
Q
G
 
A
T
 
G
E
 
P
D
 
N
F
 
Y
R
 
P
A
 
A
G
 
P
V
 
V
E
 
E
A
 
A
F
 
I
H
 
K
L
 
T
R
 
I
Q
 
Q
S
 
K
A
 
A
S
 
A
F
 
N
A
 
F
G
 
G
R
 
R

Sites not aligning to the query:

1wdlA Fatty acid beta-oxidation multienzyme complex from pseudomonas fragi, form ii (native4) (see paper)
29% identity, 94% coverage: 18:266/266 of query aligns to 14:267/715 of 1wdlA

query
sites
1wdlA
E
 
E
G
 
S
A
 
G
I
 
I
A
 
V
T
 
E
L
 
L
R
 
K
F
 
F
N
 
D
-
 
L
R
 
K
P
 
G
E
 
E
A
 
S
L
 
V
N
 
N
A
 
K
I
 
F
D
 
N
V
 
R
P
 
L
M
 
T
A
 
L
N
 
N
A
 
E
F
 
L
L
 
R
A
 
Q
A
 
A
V
 
V
Q
 
D
T
 
A
V
 
I
A
 
K
A
 
A
D
 
D
P
 
A
A
 
S
V
 
V
R
 
K
A
 
G
V
 
V
V
 
I
L
 
V
C
 
S
G
 
S
N
 
G
G
 
K
R
 
D
G
 
V
F
 
F
M
 
I
A
 
V
G
 
G
G
x
A
D
 
D
L
 
I
A
 
T
T
 
E
L
 
F
R
 
V
A
 
E
D
 
N
-
 
F
-
 
K
-
 
L
P
 
P
V
 
D
Q
 
A
S
 
E
A
 
L
I
 
I
D
 
A
I
 
G
L
x
N
T
 
L
P
 
E
L
 
A
N
|
N
A
 
K
A
 
I
L
 
F
L
 
S
L
 
D
L
 
F
A
 
E
Q
 
D
M
 
L
N
 
N
A
 
V
P
 
P
V
 
T
V
 
V
A
 
A
Q
 
A
V
 
I
H
 
N
G
 
G
V
 
I
A
 
A
A
 
L
G
 
G
A
x
G
G
 
G
L
 
L
S
x
E
L
 
M
L
 
C
L
 
L
M
 
A
A
 
A
D
 
D
Y
 
F
V
 
R
I
 
V
A
 
M
A
 
A
E
 
D
G
 
S
T
 
A
R
 
K
L
 
I
N
 
G
L
 
L
A
x
P
Y
x
E
I
 
V
N
 
K
L
 
L
G
 
G
T
 
I
S
 
Y
C
x
P
D
x
G
V
 
F
G
 
G
A
 
G
S
 
T
W
 
V
A
 
R
L
 
L
P
 
P
R
 
R
I
 
L
V
 
I
G
 
G
V
 
V
R
 
D
Q
 
N
A
 
A
L
 
V
E
 
E
I
 
W
A
 
I
L
 
A
L
 
S
G
 
G
D
 
K
A
 
E
F
 
N
T
 
R
A
 
A
D
 
E
D
 
D
A
 
A
L
 
L
R
 
K
L
 
V
G
 
S
L
 
A
V
 
V
N
 
D
R
 
A
V
 
V
V
 
V
P
 
T
A
 
A
A
 
D
E
 
K
L
 
L
D
 
G
S
 
A
A
 
A
T
 
A
A
 
L
A
 
D
L
 
L
A
 
I
Q
 
K
R
 
R
L
 
A
A
 
I
S
 
S
G
 
G
P
 
-
T
 
E
L
 
L
A
 
D
Y
 
Y
G
 
K
A
 
A
M
 
K
K
 
R
R
 
Q
L
 
P
M
 
K
R
 
L
A
 
E
S
 
K
M
 
L
D
 
K
H
 
L
T
 
N
L
 
A
P
 
I
E
 
E
Q
 
Q
L
 
M
A
 
M
A
 
A
E
 
F
K
 
E
D
 
T
A
 
A
-
 
K
-
 
G
F
 
F
V
 
V
H
 
A
C
 
G
A
 
Q
G
 
A
T
 
G
E
 
P
D
 
N
F
 
Y
R
 
P
A
 
A
G
 
P
V
 
V
E
 
E
A
 
A
F
 
I
H
 
K
L
 
T
R
 
I
Q
 
Q
S
 
K
A
 
A
S
 
A
F
 
N
A
 
F
G
 
G
R
 
R

Sites not aligning to the query:

P28793 Fatty acid oxidation complex subunit alpha; EC 4.2.1.17; EC 5.1.2.3; EC 5.3.3.8; EC 1.1.1.35 from Pseudomonas fragi (see paper)
29% identity, 94% coverage: 18:266/266 of query aligns to 14:267/715 of P28793

query
sites
P28793
E
 
E
G
 
S
A
 
G
I
 
I
A
 
V
T
 
E
L
 
L
R
 
K
F
 
F
N
 
D
-
 
L
R
 
K
P
 
G
E
 
E
A
 
S
L
 
V
N
 
N
A
 
K
I
 
F
D
 
N
V
 
R
P
 
L
M
 
T
A
 
L
N
 
N
A
 
E
F
 
L
L
 
R
A
 
Q
A
 
A
V
 
V
Q
 
D
T
 
A
V
 
I
A
 
K
A
 
A
D
 
D
P
 
A
A
 
S
V
 
V
R
 
K
A
 
G
V
 
V
V
 
I
L
 
V
C
 
S
G
 
S
N
 
G
G
 
K
R
 
D
G
 
V
F
 
F
M
 
I
A
 
V
G
 
G
G
 
A
D
 
D
L
 
I
A
 
T
T
 
E
L
 
F
R
 
V
A
 
E
D
 
N
-
 
F
-
 
K
-
 
L
P
 
P
V
 
D
Q
 
A
S
 
E
A
 
L
I
 
I
D
 
A
I
 
G
L
 
N
T
 
L
P
 
E
L
 
A
N
 
N
A
 
K
A
 
I
L
 
F
L
 
S
L
 
D
L
 
F
A
 
E
Q
 
D
M
 
L
N
 
N
A
 
V
P
 
P
V
 
T
V
 
V
A
 
A
Q
 
A
V
 
I
H
 
N
G
 
G
V
 
I
A
 
A
A
 
L
G
 
G
A
 
G
G
 
G
L
 
L
S
 
E
L
 
M
L
 
C
L
 
L
M
 
A
A
 
A
D
 
D
Y
 
F
V
 
R
I
 
V
A
 
M
A
 
A
E
 
D
G
 
S
T
 
A
R
 
K
L
 
I
N
 
G
L
 
L
A
 
P
Y
 
E
I
 
V
N
 
K
L
 
L
G
 
G
T
 
I
S
 
Y
C
 
P
D
 
G
V
 
F
G
 
G
A
 
G
S
 
T
W
 
V
A
 
R
L
 
L
P
 
P
R
 
R
I
 
L
V
 
I
G
 
G
V
 
V
R
 
D
Q
 
N
A
 
A
L
 
V
E
 
E
I
 
W
A
 
I
L
 
A
L
 
S
G
 
G
D
 
K
A
 
E
F
 
N
T
 
R
A
 
A
D
 
E
D
 
D
A
 
A
L
 
L
R
 
K
L
 
V
G
 
S
L
 
A
V
 
V
N
 
D
R
 
A
V
 
V
V
 
V
P
 
T
A
 
A
A
 
D
E
 
K
L
 
L
D
 
G
S
 
A
A
 
A
T
 
A
A
 
L
A
 
D
L
 
L
A
 
I
Q
 
K
R
 
R
L
 
A
A
 
I
S
 
S
G
 
G
P
 
-
T
 
E
L
 
L
A
 
D
Y
 
Y
G
 
K
A
 
A
M
 
K
K
 
R
R
 
Q
L
 
P
M
 
K
R
 
L
A
 
E
S
 
K
M
 
L
D
 
K
H
 
L
T
 
N
L
 
A
P
 
I
E
 
E
Q
 
Q
L
 
M
A
 
M
A
 
A
E
 
F
K
 
E
D
 
T
A
 
A
-
 
K
-
 
G
F
 
F
V
 
V
H
 
A
C
 
G
A
 
Q
G
 
A
T
 
G
E
 
P
D
 
N
F
 
Y
R
 
P
A
 
A
G
 
P
V
 
V
E
 
E
A
 
A
F
 
I
H
 
K
L
 
T
R
 
I
Q
 
Q
S
 
K
A
 
A
S
 
A
F
 
N
A
 
F
G
 
G
R
 
R

Sites not aligning to the query:

Q62651 Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial; EC 5.3.3.- from Rattus norvegicus (Rat) (see paper)
27% identity, 87% coverage: 24:254/266 of query aligns to 69:312/327 of Q62651

query
sites
Q62651
L
 
V
R
 
Q
F
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
E
 
E
A
 
K
L
 
R
N
 
N
A
 
A
I
 
M
D
 
N
V
 
R
P
 
A
M
 
F
A
 
W
N
 
R
A
 
E
F
 
L
L
 
V
A
 
E
A
 
C
V
 
F
Q
 
Q
T
 
K
V
 
I
A
 
S
A
 
K
D
 
D
P
 
S
A
 
D
V
 
C
R
 
R
A
 
A
V
 
V
V
 
V
L
 
V
C
 
S
G
 
G
N
 
A
G
 
G
R
 
K
G
 
M
F
 
F
M
 
T
A
 
S
G
 
G
G
 
I
D
 
D
L
 
L
A
 
M
T
 
D
L
 
M
R
 
A
A
 
S
D
 
D
P
 
I
V
 
L
Q
 
Q
-
 
P
-
 
P
-
 
G
-
 
D
-
 
D
-
 
V
-
 
A
-
 
R
-
 
I
-
 
A
-
 
W
S
 
Y
A
 
L
I
 
R
D
 
D
I
 
L
L
 
I
T
 
S
P
 
R
L
 
Y
N
 
Q
A
 
K
A
 
T
L
 
F
L
 
T
L
 
V
L
 
I
A
 
E
Q
 
K
M
 
C
N
 
P
A
 
K
P
 
P
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Q
 
A
V
 
I
H
 
H
G
 
G
V
 
G
A
 
C
A
 
I
G
 
G
A
 
G
G
 
G
L
 
V
S
x
D
L
 
L
L
 
I
L
 
S
M
 
A
A
 
C
D
 
D
Y
 
I
V
 
R
I
 
Y
A
 
C
A
 
T
E
 
Q
G
 
D
T
 
A
R
 
F
L
 
F
N
 
Q
L
 
V
A
 
K
Y
x
E
I
 
V
N
 
D
L
 
V
G
 
G
T
 
L
S
 
A
C
 
A
D
|
D
V
 
V
G
 
G
A
 
T
S
 
L
W
 
Q
A
 
R
L
 
L
P
 
P
R
 
K
I
 
V
V
 
I
G
 
G
V
 
N
R
 
R
Q
 
S
A
 
L
L
 
V
-
 
N
E
 
E
I
 
L
A
 
T
L
 
F
L
 
T
G
 
A
D
 
R
A
 
K
F
 
M
T
 
M
A
 
A
D
 
D
D
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
D
L
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
S
R
 
R
V
 
V
V
 
F
P
 
P
A
 
D
A
 
K
E
 
D
-
 
V
L
 
M
D
 
L
S
 
N
A
 
A
T
 
A
A
 
F
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
R
 
D
L
 
I
A
 
S
S
 
S
G
 
K
P
 
S
T
 
P
L
 
V
A
 
A
Y
 
V
G
 
Q
A
 
G
M
 
S
K
 
K
R
 
I
L
 
N
M
 
L
R
 
I
A
 
Y
S
 
S
M
 
R
D
 
D
H
 
H
T
 
S
L
 
V
P
 
D
E
 
E
Q
 
S
L
 
L
A
 
D
A
 
Y
E
 
M
K
 
A
D
 
T
A
 
W
F
 
N
V
 
M
H
 
S
C
 
M
A
 
L
G
 
Q
T
 
T
E
 
Q
D
 
D
F
 
I
R
 
I
A
 
K
G
 
S
V
 
V
E
 
Q
A
 
A

Query Sequence

>Ac3H11_4989 Enoyl-CoA hydratase (EC 4.2.1.17)
MKNTATTPATPPLLLEREGAIATLRFNRPEALNAIDVPMANAFLAAVQTVAADPAVRAVV
LCGNGRGFMAGGDLATLRADPVQSAIDILTPLNAALLLLAQMNAPVVAQVHGVAAGAGLS
LLLMADYVIAAEGTRLNLAYINLGTSCDVGASWALPRIVGVRQALEIALLGDAFTADDAL
RLGLVNRVVPAAELDSATAALAQRLASGPTLAYGAMKRLMRASMDHTLPEQLAAEKDAFV
HCAGTEDFRAGVEAFHLRQSASFAGR

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory