SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Ac3H11_517 FitnessBrowser__acidovorax_3H11:Ac3H11_517 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5khaA Structure of glutamine-dependent NAD+ synthetase from acinetobacter baumannii in complex with adenosine diphosphate (adp)
43% identity, 100% coverage: 2:552/552 of query aligns to 2:524/526 of 5khaA

query
sites
5khaA
T
 
S
L
 
F
S
 
K
I
 
V
C
 
A
T
 
L
A
 
A
Q
 
Q
L
 
F
N
 
S
F
 
P
V
 
H
V
 
I
G
 
G
D
 
N
M
 
I
P
 
D
G
 
S
N
 
N
A
 
T
Q
 
Q
K
 
K
I
 
M
I
 
I
A
 
E
A
 
Q
A
 
A
R
 
N
E
 
Q
A
 
A
Y
 
K
A
 
K
Q
 
Q
G
 
D
A
 
A
R
 
D
L
 
L
L
 
I
L
 
I
T
 
F
P
 
P
E
 
E
L
 
L
A
 
S
I
 
V
C
 
I
G
 
G
Y
 
Y
A
 
P
A
 
A
E
 
E
D
 
D
L
 
L
F
 
L
L
 
L
R
 
R
P
 
P
A
 
N
F
 
L
I
 
N
A
 
K
A
 
R
C
 
M
D
 
Q
D
 
K
A
 
A
V
 
F
K
 
A
T
 
Q
V
 
L
A
 
S
R
 
E
E
 
-
T
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
V
K
 
K
G
 
D
L
 
I
A
 
V
I
 
M
V
 
V
L
 
F
G
 
G
H
 
F
P
 
V
Q
 
N
A
 
Q
L
 
T
A
 
E
P
 
D
D
 
-
A
 
-
P
 
-
A
 
-
F
 
-
S
 
G
A
 
Q
C
 
R
H
 
Y
N
 
N
A
 
S
A
 
A
S
 
A
V
 
V
L
 
M
R
 
K
D
 
D
G
 
G
R
 
Q
I
 
V
E
 
L
Q
 
G
T
 
V
Y
 
F
A
 
N
K
 
K
R
 
H
E
 
N
L
 
L
P
 
P
N
 
N
Y
 
Y
Q
 
G
V
 
V
F
 
F
D
 
D
E
 
E
R
 
K
R
 
R
Y
 
Y
F
 
F
V
 
Q
A
 
K
G
 
G
T
 
H
A
 
Q
P
 
H
C
 
L
V
 
V
F
 
F
E
 
E
V
 
Y
E
 
L
G
 
G
V
 
H
R
 
K
V
 
F
G
 
G
L
 
V
L
 
L
V
 
I
C
 
C
E
 
E
D
 
D
A
 
I
W
 
W
F
 
S
A
 
I
E
 
N
P
 
T
A
 
V
R
 
K
S
 
Q
T
 
L
A
 
S
A
 
Q
A
 
L
G
 
N
A
 
V
Q
 
D
L
 
T
L
 
V
A
 
L
V
 
V
I
 
L
N
 
N
A
 
S
S
 
S
P
 
P
F
 
Y
H
 
E
L
 
V
G
 
G
K
 
K
S
 
P
A
 
Q
E
 
H
R
 
R
E
 
K
A
 
Q
T
 
T
M
 
L
R
 
S
E
 
E
R
 
L
V
 
A
A
 
K
E
 
Q
T
 
L
G
 
H
L
 
L
P
 
N
L
 
I
V
 
V
Y
 
Y
A
 
V
H
 
N
L
 
Q
V
 
V
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
D
 
D
E
 
D
V
 
L
V
 
I
F
 
F
E
 
D
G
 
G
R
 
T
S
 
S
F
 
F
A
 
V
L
 
S
N
 
N
A
 
Q
D
 
N
G
 
G
S
 
E
V
 
I
A
 
A
G
 
L
R
 
Q
A
 
A
P
 
P
G
 
S
F
 
F
E
 
K
E
 
E
K
 
D
L
 
L
V
 
Y
F
 
I
A
 
A
R
 
E
V
 
F
H
 
D
H
 
R
A
 
D
Q
 
T
A
 
K
A
 
L
I
 
Y
K
 
K
I
 
V
E
 
-
A
 
V
D
 
E
I
 
S
A
 
A
P
 
P
E
 
A
K
 
L
S
 
E
L
 
T
E
 
F
A
 
A
D
 
E
L
 
I
W
 
Y
D
 
Q
A
 
G
L
 
L
V
 
V
L
 
M
G
 
A
V
 
T
R
 
R
D
 
D
Y
|
Y
V
 
V
G
 
E
K
 
R
N
 
S
G
 
G
F
|
F
P
 
P
G
 
G
A
 
V
L
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
I
 
I
D
|
D
S
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
T
L
 
L
A
 
A
V
 
I
A
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
I
G
 
G
A
 
A
D
 
E
K
 
R
V
 
V
R
 
Q
T
 
A
V
 
V
M
 
M
M
 
M
P
 
P
S
 
Y
P
 
T
Y
 
Y
T
 
T
A
 
S
D
 
Q
I
 
I
S
 
S
W
 
V
I
 
E
D
 
D
A
 
A
R
 
A
D
 
E
M
 
Q
A
 
A
E
 
R
R
 
R
L
 
M
G
 
G
V
 
V
R
 
T
Y
 
F
D
 
G
E
 
I
I
 
A
S
 
E
I
 
I
K
 
H
P
 
S
Q
 
I
F
 
V
E
 
N
A
 
S
F
 
F
K
 
M
A
 
Q
A
 
T
L
 
L
A
 
Y
S
 
P
D
 
F
F
 
F
A
 
G
G
 
N
L
 
S
A
 
P
E
 
A
D
 
D
T
 
A
T
 
T
E
 
E
E
 
E
N
|
N
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
R
|
R
I
 
A
R
 
R
G
 
G
T
 
T
L
 
L
L
 
L
M
|
M
A
 
G
L
 
L
S
|
S
N
|
N
K
 
K
F
 
F
G
 
G
A
 
N
I
x
L
V
 
V
L
 
L
T
 
S
T
 
T
G
 
G
N
 
N
K
 
K
S
 
S
E
|
E
M
 
L
S
 
S
T
 
V
G
 
G
Y
 
Y
C
|
C
T
|
T
L
|
L
Y
 
Y
G
 
G
D
 
D
M
 
M
A
 
V
G
 
G
G
|
G
F
 
F
A
 
A
V
 
V
I
 
L
K
 
K
D
 
D
V
 
V
A
 
Y
K
 
K
T
 
T
R
 
I
V
 
V
F
 
F
D
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
K
W
 
Y
R
 
R
N
 
N
A
 
S
N
 
-
D
 
-
P
 
-
Y
 
-
G
 
-
T
 
L
G
 
S
A
 
E
N
 
T
P
 
P
-
 
V
I
 
I
P
 
P
E
 
E
R
 
R
I
 
V
I
 
I
T
 
T
R
 
R
P
 
-
P
 
-
S
 
-
A
 
-
E
 
-
L
 
-
R
 
-
P
 
-
D
 
-
Q
 
-
K
 
-
D
 
-
Q
 
-
D
 
-
S
 
S
L
 
L
P
 
P
P
 
A
Y
 
Y
E
 
D
V
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
L
A
 
Y
R
 
A
Y
 
Y
M
 
I
E
 
E
N
 
E
D
 
D
E
 
L
P
 
G
I
 
Q
E
 
A
S
 
D
I
 
I
I
 
I
A
 
A
S
 
K
G
 
G
Y
 
F
A
 
D
R
 
K
A
 
E
D
 
V
V
 
V
E
 
E
R
 
K
V
 
V
T
 
I
R
 
R
L
 
L
I
 
V
K
 
D
L
 
R
N
 
N
E
 
E
Y
|
Y
K
|
K
R
 
R
R
 
R
Q
 
Q
A
 
G
P
 
A
V
 
I
G
 
G
I
 
P
R
 
R
V
 
I
T
 
T
R
 
S
R
 
R
S
 
A
F
 
F
G
 
S
K
 
R
D
 
E
W
 
R
R
 
R
Y
 
Y
P
 
P
I
 
I
T
 
V
N
 
N
K
 
G
F
 
W
R
 
T
A
 
A

2e18A Crystal structure of project ph0182 from pyrococcus horikoshii ot3
37% identity, 47% coverage: 273:530/552 of query aligns to 6:247/256 of 2e18A

query
sites
2e18A
W
 
Y
D
 
D
A
 
K
L
 
V
V
 
I
L
 
E
G
 
R
V
 
I
R
 
L
D
 
E
Y
 
F
V
 
I
G
 
R
K
 
E
N
 
K
G
 
G
F
 
N
P
 
N
G
 
G
A
 
V
L
 
V
L
 
I
G
 
G
L
 
I
S
 
S
G
 
G
G
 
G
I
 
V
D
|
D
S
 
S
A
 
A
L
 
T
V
 
V
L
 
A
A
 
Y
V
 
L
A
 
A
V
 
T
D
 
K
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
K
D
 
E
K
 
K
V
 
V
R
 
L
T
 
G
V
 
L
M
 
I
M
 
M
P
 
P
S
 
Y
P
 
F
Y
 
E
T
 
N
A
 
K
D
 
D
I
 
V
S
 
E
W
 
-
I
 
-
D
 
D
A
 
A
R
 
K
D
 
L
M
 
V
A
 
A
E
 
E
R
 
K
L
 
L
G
 
G
V
 
I
R
 
G
Y
 
Y
D
 
K
E
 
V
I
 
I
S
 
N
I
 
I
K
 
K
P
 
P
Q
 
I
F
 
V
E
 
D
A
 
S
F
 
F
-
 
V
-
 
E
K
 
N
A
 
L
A
 
E
L
 
L
A
 
N
S
 
L
D
 
D
F
 
R
A
 
K
G
 
G
L
 
L
A
 
G
E
 
-
D
 
-
T
 
-
T
 
-
E
 
-
E
 
-
N
 
N
L
 
I
Q
 
M
A
 
S
R
 
R
I
 
T
R
 
R
G
 
M
T
 
I
L
 
M
L
 
L
M
 
Y
A
 
A
L
 
H
S
 
A
N
 
N
K
 
S
F
 
L
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
V
L
 
L
T
 
G
T
 
T
G
 
S
N
 
N
K
 
R
S
 
S
E
|
E
M
 
F
S
 
L
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
C
 
F
T
 
T
L
 
K
Y
 
W
G
 
G
D
 
D
M
 
G
A
 
A
G
 
S
G
 
D
F
 
Y
A
 
A
V
 
P
I
 
I
K
 
I
D
 
N
V
 
L
A
 
Y
K
 
K
T
 
T
R
 
E
V
 
V
F
 
W
D
 
E
L
 
I
A
 
A
R
 
K
W
 
-
R
 
-
N
 
-
A
 
-
N
 
-
D
 
-
P
 
-
Y
 
-
G
 
-
T
 
-
G
 
-
A
 
R
N
 
I
P
 
G
I
 
V
P
 
P
E
 
E
R
 
R
I
 
I
I
 
V
T
 
K
R
 
K
P
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
A
E
 
G
L
 
L
R
 
W
P
 
E
D
 
G
Q
 
Q
K
 
T
D
 
D
Q
 
E
D
 
D
S
 
E
L
 
L
P
 
G
-
 
I
P
 
S
Y
 
Y
E
 
N
V
 
L
L
 
L
D
 
D
A
x
E
I
 
I
V
 
L
A
 
W
R
 
R
Y
 
M
M
 
I
E
 
D
N
 
L
D
 
K
E
 
I
P
 
G
I
 
K
E
 
E
S
 
E
I
 
I
I
 
A
A
 
K
S
 
D
-
 
L
G
 
G
Y
 
I
A
 
P
R
 
L
A
 
S
D
 
L
V
 
V
E
 
E
R
 
R
V
 
V
T
 
E
R
 
E
L
 
L
I
 
I
K
 
K
L
 
K
N
 
S
E
 
E
Y
 
H
K
 
K
R
 
R
R
 
R
Q
 
-
A
 
L
P
 
P
V
 
I
G
 
G

Sites not aligning to the query:

P9WJJ3 Glutamine-dependent NAD(+) synthetase; NAD(+) synthase [glutamine-hydrolyzing]; EC 6.3.5.1 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see 2 papers)
23% identity, 98% coverage: 6:545/552 of query aligns to 17:660/679 of P9WJJ3

query
sites
P9WJJ3
C
 
C
T
 
T
A
 
H
Q
 
H
L
 
T
N
 
T
F
 
-
V
 
-
V
 
I
G
 
G
D
 
D
M
 
P
P
 
A
G
 
A
N
 
N
A
 
A
Q
 
A
K
 
S
I
 
V
I
 
L
A
 
D
A
 
M
A
 
A
R
 
R
E
 
A
A
 
C
Y
 
H
A
 
D
Q
 
D
G
 
G
A
 
A
R
 
A
L
 
L
L
 
A
L
 
V
T
 
F
P
 
P
E
|
E
L
 
L
A
 
T
I
 
L
C
 
S
G
 
G
Y
 
Y
A
 
S
A
 
I
E
 
E
D
 
D
L
 
V
F
 
L
L
 
L
R
 
Q
P
 
D
A
 
S
F
 
L
I
 
L
A
 
D
A
 
A
C
 
V
D
 
E
D
 
D
A
 
A
V
 
L
K
 
L
T
 
D
V
 
L
A
 
V
R
 
T
E
 
E
T
 
S
A
 
A
G
 
D
L
 
L
K
 
L
G
 
P
L
 
V
A
 
L
I
 
V
V
 
V
-
 
G
-
 
A
-
 
P
L
 
L
G
 
R
H
 
H
P
 
R
Q
 
H
A
 
R
L
 
I
A
 
-
P
 
-
D
 
-
A
 
-
P
 
-
A
 
-
F
 
-
S
 
-
A
 
-
C
 
-
H
 
Y
N
 
N
A
 
T
A
 
A
S
 
V
V
 
V
L
 
I
R
 
H
D
 
R
G
 
G
R
 
A
I
 
V
E
 
L
Q
 
G
T
 
V
Y
 
V
A
 
P
K
|
K
R
 
S
E
 
Y
L
 
L
P
 
P
N
 
T
Y
 
Y
Q
 
R
V
 
E
F
 
F
D
 
Y
E
 
E
R
 
R
R
 
R
Y
 
Q
F
 
M
V
 
A
A
 
P
G
 
G
T
 
D
-
 
G
-
 
E
-
 
R
-
 
G
-
 
T
-
 
I
-
 
R
-
 
I
-
 
G
-
 
G
A
 
A
P
 
D
C
 
V
V
 
A
F
 
F
-
 
G
-
 
T
-
 
D
-
 
L
-
 
L
-
 
F
-
 
A
-
 
A
-
 
S
E
 
D
V
 
L
E
 
P
G
 
G
V
 
F
R
 
V
V
 
L
G
 
H
L
 
V
L
 
E
V
 
I
C
|
C
E
 
E
D
 
D
A
 
M
W
 
F
F
 
V
A
 
P
E
 
M
P
 
P
A
 
P
R
 
S
S
 
A
T
 
E
A
 
A
A
 
A
-
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
T
L
 
V
L
 
L
A
 
A
V
 
N
I
 
L
N
 
S
A
 
G
S
 
S
P
 
P
F
 
I
H
 
T
L
 
I
G
 
G
K
 
R
S
 
A
A
 
E
E
 
D
R
 
R
E
 
R
A
 
L
T
 
L
M
 
A
R
 
R
E
 
S
R
 
A
V
 
S
A
 
A
E
 
R
T
 
C
G
 
L
L
 
A
P
 
A
L
 
Y
V
 
V
Y
 
Y
A
 
A
H
 
A
L
 
A
V
 
G
G
 
E
G
 
G
Q
 
E
D
 
S
-
 
T
-
 
T
E
 
D
V
 
L
V
 
A
F
 
W
E
 
D
G
 
G
R
 
Q
S
 
T
F
 
M
A
 
-
L
 
I
N
 
W
A
 
E
D
 
N
G
 
G
S
 
A
V
 
L
A
 
L
G
 
A
R
 
E
A
 
S
P
 
E
G
 
R
F
 
F
-
 
P
-
 
K
-
 
G
-
 
V
-
 
R
-
 
R
-
 
S
-
 
V
-
 
A
-
 
D
-
 
V
-
 
D
-
 
T
-
 
E
-
 
L
-
 
L
-
 
R
E
 
S
E
 
E
K
 
R
L
 
L
V
 
R
F
 
M
A
 
G
-
 
T
-
 
F
-
 
D
-
 
D
-
 
N
R
 
R
V
 
R
H
 
H
H
 
H
-
 
R
-
 
E
-
 
L
A
 
T
Q
 
E
A
 
S
A
 
F
I
 
R
K
 
R
I
 
I
E
 
D
A
 
F
D
 
A
I
 
L
A
 
D
P
 
P
-
 
P
-
 
A
-
 
G
-
 
D
-
 
I
-
 
G
-
 
L
-
 
L
-
 
R
-
 
E
-
 
V
-
 
E
-
 
R
-
 
F
-
 
P
-
 
F
-
 
V
-
 
P
-
 
A
-
 
D
E
 
P
K
 
Q
S
 
R
L
 
L
E
 
Q
A
 
Q
D
 
D
L
 
C
W
 
Y
D
 
E
A
 
A
L
 
Y
-
 
N
-
 
I
-
 
Q
V
 
V
L
 
S
G
 
G
V
 
L
R
 
E
D
 
Q
Y
 
R
V
 
L
G
 
R
K
 
A
N
 
L
G
 
D
F
 
Y
P
 
P
G
 
K
A
 
V
L
 
V
L
 
I
G
 
G
L
 
V
S
 
S
G
 
G
G
 
G
I
 
L
D
 
D
S
 
S
A
 
T
L
 
H
V
 
A
L
 
L
A
 
I
V
 
V
A
 
A
V
 
T
D
 
H
A
 
A
L
 
M
G
 
D
A
 
R
D
 
E
-
 
G
-
 
R
-
 
P
-
 
R
-
 
S
K
 
D
V
 
I
R
 
L
T
 
A
V
 
F
M
 
A
M
 
L
P
 
P
S
 
G
P
 
F
Y
 
A
T
 
T
A
 
G
D
 
E
I
 
H
S
 
T
W
 
K
I
 
N
D
 
N
A
 
A
R
 
I
D
 
K
M
 
L
A
 
A
E
 
R
R
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
T
Y
 
F
D
 
S
E
 
E
I
 
I
S
 
D
I
 
I
K
 
G
P
 
D
Q
 
T
F
 
A
E
 
R
A
 
L
F
 
M
K
 
L
A
 
H
A
 
T
L
 
I
A
 
G
S
 
H
D
 
P
F
 
Y
A
 
S
G
 
-
L
 
V
A
 
G
E
 
E
-
 
K
-
 
V
-
 
Y
D
 
D
T
 
V
T
 
T
E
 
F
E
 
E
N
 
N
L
 
V
Q
 
Q
A
 
A
R
 
G
I
 
L
R
 
R
G
 
T
T
 
D
L
 
Y
L
 
L
M
 
F
A
 
R
L
 
I
S
 
A
N
 
N
K
 
Q
F
 
R
G
 
G
A
 
G
I
 
I
V
 
V
L
 
L
T
 
G
T
 
T
G
 
G
N
 
D
K
 
L
S
 
S
E
 
E
M
 
L
S
 
A
T
 
L
G
 
G
Y
 
W
C
 
S
T
 
T
L
 
Y
-
 
G
Y
 
V
G
 
G
D
 
D
M
 
Q
A
 
M
G
 
S
G
 
H
F
 
Y
A
 
N
V
 
V
I
 
N
K
 
A
D
 
G
V
 
V
A
 
P
K
 
K
T
 
T
R
 
L
V
 
I
F
 
Q
D
 
H
L
 
L
A
 
I
R
 
R
W
 
W
R
 
V
N
 
I
A
 
S
N
 
A
D
 
G
P
 
E
Y
 
F
G
 
G
T
 
E
G
 
K
A
 
V
N
 
G
P
 
E
I
 
V
P
 
L
E
 
Q
R
 
S
I
 
V
I
 
L
T
 
D
R
 
T
P
 
E
P
 
I
S
 
T
A
 
P
E
 
E
L
 
L
R
 
I
P
 
P
D
 
T
-
 
G
-
 
E
-
 
E
-
 
E
-
 
L
Q
 
Q
K
 
S
D
 
S
Q
 
E
D
 
A
S
 
K
L
 
V
P
 
G
P
 
P
Y
 
F
E
 
A
V
 
L
L
 
Q
D
 
D
A
 
F
I
 
S
V
 
L
A
 
F
R
 
Q
Y
 
V
M
 
L
E
 
R
N
 
Y
D
 
G
-
 
F
E
 
R
P
 
P
I
 
S
E
 
K
S
 
I
I
 
A
I
 
F
A
 
L
S
 
A
G
 
W
Y
 
H
A
 
A
R
 
W
A
 
N
D
 
D
V
 
A
E
 
E
R
 
R
-
 
G
-
 
N
-
 
W
-
 
P
-
 
P
-
 
G
-
 
F
-
 
P
-
 
K
-
 
S
-
 
E
-
 
R
-
 
P
-
 
S
-
 
Y
-
 
S
-
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
I
-
 
R
-
 
H
-
 
W
-
 
L
-
 
Q
-
 
I
-
 
F
V
 
V
T
 
Q
R
 
R
L
 
F
I
 
Y
K
 
S
L
 
F
N
 
S
E
 
Q
Y
 
F
K
 
K
R
 
R
R
 
S
Q
 
A
A
 
L
P
 
P
V
 
N
G
 
G
I
 
P
R
 
K
V
 
V
T
 
S
R
 
H
-
 
G
-
 
G
-
 
A
R
 
L
S
 
S
F
 
P
G
 
R
K
 
G
D
|
D
W
 
W
R
 
R
Y
 
A
P
 
P

3dlaA X-ray crystal structure of glutamine-dependent NAD+ synthetase from mycobacterium tuberculosis bound to naad+ and don (see paper)
24% identity, 98% coverage: 6:545/552 of query aligns to 18:632/651 of 3dlaA

query
sites
3dlaA
C
 
C
T
 
T
A
 
H
Q
 
H
L
 
T
N
 
T
F
 
-
V
 
-
V
 
I
G
 
G
D
 
D
M
 
P
P
 
A
G
 
A
N
 
N
A
 
A
Q
 
A
K
 
S
I
 
V
I
 
L
A
 
D
A
 
M
A
 
A
R
 
R
E
 
A
A
 
C
Y
 
H
A
 
D
Q
 
D
G
 
G
A
 
A
R
 
A
L
 
L
L
 
A
L
 
V
T
 
F
P
 
P
E
 
E
L
 
L
A
 
T
I
 
L
C
 
S
G
 
G
Y
 
Y
A
 
S
A
 
I
E
 
E
D
 
D
L
 
V
F
 
L
L
 
L
R
 
Q
P
 
D
A
 
S
F
 
L
I
 
L
A
 
D
A
 
A
C
 
V
D
 
E
D
 
D
A
 
A
V
 
L
K
 
L
T
 
D
V
 
L
A
 
V
R
 
T
E
 
E
T
 
S
A
 
A
G
 
D
L
 
L
K
 
L
G
 
P
L
 
V
A
 
L
I
 
V
V
 
V
-
 
G
-
 
A
-
 
P
L
 
L
G
 
R
H
 
H
P
 
R
Q
 
H
A
 
R
L
 
I
A
 
-
P
 
-
D
 
-
A
 
-
P
 
-
A
 
-
F
 
-
S
 
-
A
 
-
C
 
-
H
 
Y
N
 
N
A
 
T
A
 
A
S
 
V
V
 
V
L
 
I
R
 
H
D
 
R
G
 
G
R
 
A
I
 
V
E
 
L
Q
 
G
T
 
V
Y
 
V
A
 
P
K
 
K
R
 
S
E
 
Y
L
 
L
P
|
P
N
 
T
Y
|
Y
Q
 
R
V
 
E
F
|
F
D
 
Y
E
 
E
R
 
R
R
 
R
Y
 
Q
F
 
M
V
 
A
A
 
P
G
 
G
T
 
D
-
 
G
-
 
E
-
 
R
-
 
G
-
 
T
-
 
I
-
 
R
-
 
I
-
 
G
-
 
G
A
 
A
P
 
D
C
 
V
V
 
A
F
 
F
-
 
G
-
 
T
-
 
D
-
 
L
-
 
L
-
 
F
-
 
A
-
 
A
-
 
S
E
 
D
V
 
L
E
 
P
G
 
G
V
 
F
R
 
V
V
 
L
G
 
H
L
 
V
L
 
E
V
 
I
C
|
C
E
|
E
D
 
D
A
 
M
W
x
F
F
 
V
A
 
P
E
 
M
P
 
P
A
 
P
R
 
S
S
 
A
T
 
E
A
 
A
A
 
A
-
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
T
L
 
V
L
 
L
A
 
A
V
 
N
I
 
L
N
 
S
A
 
G
S
 
S
P
 
P
F
 
I
H
 
T
L
 
I
G
 
G
K
 
R
S
 
A
A
 
E
E
 
D
R
 
R
E
 
R
A
 
L
T
 
L
M
 
A
R
 
R
E
 
S
R
 
A
V
 
S
A
 
A
E
 
R
T
 
C
G
 
L
L
 
A
P
 
A
L
 
Y
V
 
V
Y
 
Y
A
 
A
H
 
A
L
 
A
V
 
G
G
 
E
G
 
G
Q
 
E
D
 
S
-
 
T
-
 
T
E
 
D
V
 
L
V
 
A
F
 
W
E
 
D
G
 
G
R
 
Q
S
 
T
F
 
M
A
 
-
L
 
I
N
 
W
A
 
E
D
 
N
G
 
G
S
 
A
V
 
L
A
 
L
G
 
A
R
 
E
A
 
S
P
 
E
G
 
R
F
 
F
-
 
P
-
 
K
-
 
G
-
 
V
-
 
R
-
 
R
-
 
S
-
 
V
-
 
A
-
 
D
-
 
V
-
 
D
-
 
T
-
 
E
-
 
L
-
 
L
-
 
R
E
 
S
E
 
E
K
 
R
L
 
L
V
 
R
F
 
M
A
 
G
-
 
T
-
 
F
-
 
D
-
 
D
-
 
N
R
 
R
V
 
R
H
 
H
H
 
H
-
 
R
-
 
E
-
 
L
A
 
T
Q
 
E
A
 
S
A
 
F
I
 
R
K
 
R
I
 
I
E
 
D
A
 
F
D
 
A
I
 
L
A
 
D
P
 
P
-
 
P
-
 
A
-
 
G
-
 
D
-
 
I
-
 
G
-
 
L
-
 
L
-
 
R
-
 
E
-
 
V
-
 
E
-
 
R
-
 
F
-
 
P
-
 
F
-
 
V
-
 
P
-
 
A
-
 
D
E
 
P
K
 
Q
S
 
R
L
 
L
E
 
Q
A
 
Q
D
 
D
L
 
C
W
 
Y
D
 
E
A
 
A
L
 
Y
-
 
N
-
 
I
-
 
Q
V
 
V
L
 
S
G
 
G
V
 
L
R
 
E
D
 
Q
Y
x
R
V
 
L
G
 
R
K
 
A
N
x
L
G
 
D
F
 
Y
P
 
P
G
 
K
A
 
V
L
 
V
L
 
I
G
 
G
L
 
V
S
 
S
G
 
G
G
 
G
I
 
L
D
 
D
S
 
S
A
 
T
L
 
H
V
 
A
L
 
L
A
 
I
V
 
V
A
 
A
V
 
T
D
 
H
A
 
A
L
 
M
-
 
D
-
 
R
-
 
E
G
 
G
A
 
R
D
 
P
K
 
R
V
 
S
R
 
D
T
 
I
V
 
L
M
 
A
M
 
F
P
 
A
S
 
L
P
 
P
-
 
G
Y
 
H
T
 
T
A
 
K
D
 
N
I
 
-
S
 
-
W
 
-
I
 
-
D
 
N
A
 
A
R
 
I
D
 
K
M
 
L
A
 
A
E
 
R
R
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
T
Y
 
F
D
 
S
E
 
E
I
 
I
S
 
D
I
 
I
K
 
G
P
 
-
Q
 
-
F
 
-
E
 
D
A
 
T
F
 
A
K
 
R
A
 
L
A
 
M
L
 
L
A
 
H
S
 
T
D
 
-
F
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
I
A
 
G
E
 
H
D
 
D
T
 
V
T
 
T
E
 
F
E
 
E
N
 
N
L
 
V
Q
 
Q
A
 
A
R
 
G
I
 
L
R
 
R
G
 
T
T
 
D
L
 
Y
L
 
L
M
 
F
A
 
R
L
 
I
S
x
A
N
|
N
K
 
Q
F
 
R
G
 
G
A
x
G
I
|
I
V
 
V
L
 
L
T
 
G
T
 
T
G
 
G
N
 
D
K
 
L
S
 
S
E
|
E
M
 
L
S
 
A
T
 
L
G
 
G
Y
x
W
C
x
S
T
|
T
L
x
Y
-
 
G
Y
 
V
G
 
G
D
|
D
M
 
Q
A
 
M
G
 
S
G
x
H
F
 
Y
A
 
N
V
 
V
I
 
N
K
 
A
D
 
G
V
 
V
A
 
P
K
 
K
T
 
T
R
 
L
V
 
I
F
 
Q
D
 
H
L
 
L
A
 
I
R
 
R
W
 
W
R
 
V
N
 
I
A
 
S
N
 
A
D
 
G
P
 
E
Y
 
F
G
 
G
T
 
E
G
 
K
A
 
V
N
 
G
P
 
E
I
 
V
P
 
L
E
 
Q
R
 
S
I
 
V
I
 
L
T
 
D
R
 
T
P
 
E
P
 
I
S
 
T
A
 
A
E
 
K
L
 
V
R
 
G
P
 
P
D
 
F
Q
 
A
K
 
L
D
 
Q
Q
 
D
D
 
F
S
 
S
L
 
L
P
 
-
P
 
-
Y
 
F
E
 
Q
V
 
V
L
 
L
D
 
R
-
 
Y
-
 
G
-
 
F
-
 
R
-
 
P
-
 
S
-
 
K
-
 
I
A
 
A
I
 
F
V
 
L
A
 
A
R
 
W
Y
 
H
M
 
A
E
 
W
N
 
N
D
 
D
E
 
A
P
 
E
-
 
R
-
 
G
-
 
N
-
 
W
-
 
P
-
 
P
-
 
G
I
 
F
E
 
P
S
 
K
I
 
S
I
 
E
A
 
R
S
 
P
G
 
S
Y
 
Y
A
 
S
R
 
L
A
 
A
D
 
E
V
 
I
E
 
R
R
 
H
-
 
W
-
 
L
-
 
Q
-
 
I
-
 
F
V
 
V
T
 
Q
R
 
R
L
 
F
I
 
Y
K
 
S
L
x
F
N
 
S
E
 
Q
Y
x
F
K
|
K
R
 
R
R
 
S
Q
 
A
A
 
L
P
 
P
V
 
N
G
 
G
I
 
P
R
 
K
V
 
V
T
 
S
R
 
H
-
 
G
-
 
G
-
 
A
R
 
L
S
 
S
F
 
P
G
 
R
K
 
G
D
 
D
W
 
W
R
 
R
Y
 
A
P
 
P

1xngB Crystal structure of nh3-dependent NAD+ synthetase from helicobacter pylori (see paper)
33% identity, 45% coverage: 273:523/552 of query aligns to 3:245/262 of 1xngB

query
sites
1xngB
W
 
Y
D
 
Q
A
 
K
L
 
L
V
 
I
L
 
V
G
 
Y
V
 
L
R
 
C
D
 
D
Y
 
F
-
 
L
-
 
E
-
 
K
-
 
E
V
 
V
G
 
Q
K
 
K
N
x
R
G
 
G
F
|
F
P
 
K
G
 
K
A
 
V
L
 
V
L
 
Y
G
|
G
L
|
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
I
x
L
D
|
D
S
|
S
A
 
A
L
 
V
V
 
V
L
 
-
A
 
G
V
 
V
A
 
L
V
 
C
D
 
Q
A
 
K
L
 
V
G
 
F
A
 
K
D
 
E
K
 
N
V
 
A
R
 
H
T
 
A
V
x
L
M
x
L
M
|
M
P
|
P
S
 
S
P
 
S
Y
 
V
T
 
S
A
 
M
D
 
P
I
 
E
S
 
N
W
 
K
I
 
T
D
 
D
A
 
A
R
 
L
D
 
N
M
 
L
A
 
C
E
 
E
R
 
K
L
 
F
G
 
S
V
 
I
R
 
P
Y
 
Y
D
 
T
E
 
E
I
 
Y
S
 
S
I
 
I
K
 
A
P
 
P
Q
 
-
F
 
-
E
 
-
A
 
-
F
 
Y
K
 
D
A
 
A
A
 
I
L
 
F
A
 
S
S
 
S
D
 
H
F
 
F
A
 
K
G
 
D
L
 
-
A
 
A
E
 
S
D
 
L
T
 
T
T
 
R
E
 
K
E
 
G
N
|
N
L
 
F
Q
 
C
A
 
A
R
|
R
I
 
L
R
|
R
G
 
M
T
 
A
L
 
F
L
 
L
M
x
Y
A
 
D
L
 
Y
S
|
S
N
x
L
K
 
K
F
 
S
G
 
D
A
x
S
I
x
L
V
 
V
L
 
I
T
 
G
T
|
T
G
 
S
N
 
N
K
 
K
S
 
S
E
|
E
M
 
R
S
 
M
T
 
L
G
 
G
Y
|
Y
C
x
G
T
|
T
L
|
L
Y
 
F
G
 
G
D
|
D
M
 
L
A
 
A
G
 
C
G
x
A
F
 
I
A
 
N
V
 
P
I
 
I
K
 
G
D
 
E
V
 
L
A
 
F
K
|
K
T
 
T
R
 
E
V
 
V
F
 
Y
D
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
R
W
 
R
R
 
L
N
 
N
A
 
-
N
 
-
D
 
-
P
 
-
Y
 
-
G
 
-
T
 
-
G
 
-
A
 
-
N
 
-
P
 
-
I
 
I
P
 
P
E
 
K
R
 
K
I
 
I
I
 
L
T
 
N
R
 
K
P
 
P
P
|
P
S
|
S
A
|
A
E
 
D
L
|
L
R
 
F
P
 
V
D
 
G
Q
 
Q
K
 
S
D
 
D
Q
 
E
D
 
K
S
 
D
L
 
L
-
 
G
P
 
Y
P
 
P
Y
 
Y
E
 
S
V
 
V
L
 
I
D
 
D
A
 
P
I
 
L
V
 
L
A
 
K
-
 
D
-
 
I
R
 
E
Y
 
A
M
 
L
E
 
F
N
 
Q
D
 
T
E
 
K
P
 
P
I
 
I
-
 
D
-
 
T
E
 
E
S
 
T
I
 
L
I
 
A
A
 
Q
S
 
L
G
 
G
Y
 
Y
A
 
D
R
 
E
A
 
I
D
 
L
V
 
V
E
 
K
R
 
N
V
 
I
T
 
T
R
 
S
L
 
R
I
 
I
K
 
Q
L
 
K
N
 
N
E
 
A
Y
x
F
K
|
K

O25096 NH(3)-dependent NAD(+) synthetase; EC 6.3.1.5 from Helicobacter pylori (strain ATCC 700392 / 26695) (Campylobacter pylori) (see paper)
33% identity, 45% coverage: 273:523/552 of query aligns to 5:247/260 of O25096

query
sites
O25096
W
 
Y
D
 
Q
A
 
K
L
 
L
V
 
I
L
 
V
G
 
Y
V
 
L
R
 
C
D
 
D
Y
 
F
-
 
L
-
 
E
-
 
K
-
 
E
V
 
V
G
 
Q
K
 
K
N
 
R
G
 
G
F
 
F
P
 
K
G
 
K
A
 
V
L
 
V
L
 
Y
G
|
G
L
|
L
S
|
S
G
|
G
G
|
G
I
x
L
D
|
D
S
|
S
A
 
A
L
 
V
V
 
V
L
 
-
A
 
G
V
 
V
A
 
L
V
 
C
D
 
Q
A
 
K
L
 
V
G
 
F
A
 
K
D
 
E
K
 
N
V
 
A
R
 
H
T
 
A
V
 
L
M
 
L
M
 
M
P
 
P
S
 
S
P
 
S
Y
 
V
T
 
S
A
 
M
D
 
P
I
 
E
S
 
N
W
 
K
I
 
T
D
 
D
A
 
A
R
 
L
D
 
N
M
 
L
A
 
C
E
 
E
R
 
K
L
 
F
G
 
S
V
 
I
R
 
P
Y
 
Y
D
 
T
E
 
E
I
 
Y
S
 
S
I
 
I
K
 
A
P
 
P
Q
 
-
F
 
-
E
 
-
A
 
-
F
 
Y
K
 
D
A
 
A
A
 
I
L
 
F
A
 
S
S
 
S
D
 
H
F
 
F
A
 
K
G
 
D
L
 
-
A
 
A
E
 
S
D
 
L
T
 
T
T
 
R
E
 
K
E
 
G
N
 
N
L
 
F
Q
 
C
A
 
A
R
 
R
I
 
L
R
 
R
G
 
M
T
 
A
L
 
F
L
 
L
M
 
Y
A
 
D
L
 
Y
S
 
S
N
 
L
K
 
K
F
 
S
G
 
D
A
 
S
I
 
L
V
 
V
L
 
I
T
 
G
T
|
T
G
 
S
N
 
N
K
 
K
S
 
S
E
 
E
M
 
R
S
 
M
T
 
L
G
 
G
Y
 
Y
C
 
G
T
 
T
L
 
L
Y
 
F
G
 
G
D
 
D
M
 
L
A
 
A
G
 
C
G
 
A
F
 
I
A
 
N
V
 
P
I
 
I
K
 
G
D
 
E
V
 
L
A
 
F
K
|
K
T
 
T
R
 
E
V
 
V
F
 
Y
D
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
R
W
 
R
R
 
L
N
 
N
A
 
-
N
 
-
D
 
-
P
 
-
Y
 
-
G
 
-
T
 
-
G
 
-
A
 
-
N
 
-
P
 
-
I
 
I
P
 
P
E
 
K
R
 
K
I
 
I
I
 
L
T
 
N
R
 
K
P
 
P
P
 
P
S
 
S
A
 
A
E
 
D
L
 
L
R
 
F
P
 
V
D
 
G
Q
 
Q
K
 
S
D
 
D
Q
 
E
D
 
K
S
 
D
L
 
L
P
 
G
-
 
Y
P
 
P
Y
 
Y
E
 
S
V
 
V
L
 
I
D
 
D
A
 
P
I
 
L
V
 
L
A
 
K
-
 
D
-
 
I
R
 
E
Y
 
A
M
 
L
E
 
F
N
 
Q
D
 
T
E
 
K
P
 
P
I
 
I
-
 
D
-
 
T
E
 
E
S
 
T
I
 
L
I
 
A
A
 
Q
S
 
L
G
 
G
Y
 
Y
A
 
D
R
 
E
A
 
I
D
 
L
V
 
V
E
 
K
R
 
N
V
 
I
T
 
T
R
 
S
L
 
R
I
 
I
K
 
Q
L
 
K
N
 
N
E
 
A
Y
 
F
K
 
K

6ofcB Crystal structure of m. Tuberculosis glutamine-dependent NAD+ synthetase complexed with sulfonamide derivative 1, pyrophosphate, and glutamine (see paper)
23% identity, 98% coverage: 6:545/552 of query aligns to 17:650/669 of 6ofcB

query
sites
6ofcB
C
 
C
T
 
T
A
 
H
Q
 
H
L
 
T
N
 
T
F
 
-
V
 
-
V
 
I
G
 
G
D
 
D
M
 
P
P
 
A
G
 
A
N
 
N
A
 
A
Q
 
A
K
 
S
I
 
V
I
 
L
A
 
D
A
 
M
A
 
A
R
 
R
E
 
A
A
 
C
Y
 
H
A
 
D
Q
 
D
G
 
G
A
 
A
R
 
A
L
 
L
L
 
A
L
 
V
T
 
F
P
 
P
E
 
E
L
 
L
A
 
T
I
 
L
C
 
S
G
 
G
Y
 
Y
A
 
S
A
 
I
E
 
E
D
 
D
L
 
V
F
 
L
L
 
L
R
 
Q
P
 
D
A
 
S
F
 
L
I
 
L
A
 
D
A
 
A
C
 
V
D
 
E
D
 
D
A
 
A
V
 
L
K
 
L
T
 
D
V
 
L
A
 
V
R
 
T
E
 
E
T
 
S
A
 
A
G
 
D
L
 
L
K
 
L
G
 
P
L
 
V
A
 
L
I
 
V
V
 
V
-
 
G
-
 
A
-
 
P
L
 
L
G
 
R
H
 
H
P
 
R
Q
 
H
A
 
R
L
 
I
A
 
-
P
 
-
D
 
-
A
 
-
P
 
-
A
 
-
F
 
-
S
 
-
A
 
-
C
 
-
H
 
Y
N
 
N
A
 
T
A
 
A
S
 
V
V
 
V
L
 
I
R
 
H
D
 
R
G
 
G
R
 
A
I
 
V
E
 
L
Q
 
G
T
 
V
Y
 
V
A
 
P
K
 
K
R
 
S
E
 
Y
L
 
L
P
 
P
N
 
T
Y
 
Y
Q
 
R
V
 
E
F
 
F
D
 
Y
E
 
E
R
 
R
R
 
R
Y
 
Q
F
 
M
V
 
A
A
 
P
G
 
G
T
 
D
-
 
G
-
 
E
-
 
R
-
 
G
-
 
T
-
 
I
-
 
R
-
 
I
-
 
G
-
 
G
A
 
A
P
 
D
C
 
V
V
 
A
F
 
F
-
 
G
-
 
T
-
 
D
-
 
L
-
 
L
-
 
F
-
 
A
-
 
A
-
 
S
E
 
D
V
 
L
E
 
P
G
 
G
V
 
F
R
 
V
V
 
L
G
 
H
L
 
V
L
 
E
V
 
I
C
 
A
E
 
E
D
 
D
A
 
M
W
 
F
F
 
V
A
 
P
E
 
M
P
 
P
A
 
P
R
 
S
S
 
A
T
 
E
A
 
A
A
 
A
-
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
T
L
 
V
L
 
L
A
 
A
V
 
N
I
 
L
N
 
S
A
 
G
S
 
S
P
 
P
F
 
I
H
 
T
L
 
I
G
 
G
K
 
R
S
 
A
A
 
E
E
 
D
R
 
R
E
 
R
A
x
L
T
 
L
M
 
A
R
|
R
E
 
S
R
 
A
V
 
S
A
 
A
E
 
R
T
 
C
G
 
L
L
 
A
P
 
A
L
 
Y
V
 
V
Y
 
Y
A
 
A
H
 
A
L
 
A
V
 
G
G
 
E
G
 
G
Q
 
E
D
 
S
-
 
T
-
 
T
E
 
D
V
 
L
V
 
A
F
 
W
E
 
D
G
 
G
R
 
Q
S
 
T
F
 
M
A
 
-
L
 
I
N
 
W
A
 
E
D
 
N
G
 
G
S
 
A
V
 
L
A
 
L
G
 
A
R
 
E
A
 
S
P
 
E
G
 
R
F
 
F
-
 
P
-
 
K
-
 
G
-
 
V
-
 
R
-
 
R
-
 
S
-
 
V
-
 
A
-
 
D
-
 
V
-
 
D
-
 
T
-
 
E
-
 
L
-
 
L
-
 
R
E
 
S
E
 
E
K
 
R
L
 
L
V
 
R
F
 
M
A
 
G
-
 
T
-
 
F
-
 
D
-
 
D
-
 
N
R
 
R
V
 
R
H
 
H
H
 
H
-
 
R
-
 
E
-
 
L
A
 
T
Q
 
E
A
 
S
A
 
F
I
 
R
K
 
R
I
 
I
E
 
D
A
 
F
D
 
A
I
 
L
A
 
D
P
 
P
-
 
P
-
 
A
-
 
G
-
 
D
-
 
I
-
 
G
-
 
L
-
 
L
-
 
R
-
 
E
-
 
V
-
 
E
-
 
R
-
 
F
-
 
P
-
 
F
-
 
V
-
 
P
-
 
A
-
 
D
E
 
P
K
 
Q
S
 
R
L
 
L
E
 
Q
A
 
Q
D
 
D
L
 
C
W
 
Y
D
 
E
A
 
A
L
 
Y
-
 
N
-
 
I
-
 
Q
V
 
V
L
 
S
G
 
G
V
 
L
R
 
E
D
 
Q
Y
x
R
V
 
L
G
 
R
K
 
A
N
x
L
G
 
D
F
 
Y
P
 
P
G
 
K
A
 
V
L
 
V
L
 
I
G
|
G
L
x
V
S
|
S
G
 
G
G
|
G
I
x
L
D
|
D
S
|
S
A
 
T
L
 
H
V
 
A
L
 
L
A
 
I
V
 
V
A
 
A
V
 
T
D
 
H
A
 
A
L
 
M
G
 
D
A
 
R
D
 
E
-
 
G
-
 
R
-
 
P
-
 
R
-
 
S
K
 
D
V
 
I
R
 
L
T
 
A
V
x
F
M
x
A
M
x
L
P
|
P
S
 
G
P
 
F
Y
 
A
T
 
T
A
 
G
D
 
E
I
 
H
S
 
T
W
 
K
I
 
N
D
 
N
A
 
A
R
 
I
D
 
K
M
 
L
A
 
A
E
 
R
R
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
T
Y
 
F
D
 
S
E
 
E
I
 
I
S
 
D
I
 
I
K
 
G
P
 
D
Q
 
T
F
 
A
E
 
R
A
 
L
F
 
M
K
 
L
A
 
H
A
 
T
L
 
I
A
 
G
S
 
H
D
 
-
F
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
A
 
-
E
 
-
D
 
-
T
 
V
T
 
T
E
 
F
E
 
E
N
 
N
L
 
V
Q
 
Q
A
 
A
R
 
G
I
 
L
R
|
R
G
 
T
T
 
D
L
 
Y
L
 
L
M
 
F
A
 
R
L
 
I
S
 
A
N
|
N
K
 
Q
F
 
R
G
 
G
A
x
G
I
|
I
V
 
V
L
 
L
T
 
G
T
|
T
G
 
G
N
 
D
K
 
L
S
 
S
E
 
E
M
 
L
S
 
A
T
 
L
G
 
G
Y
x
W
C
x
S
T
|
T
L
x
Y
-
 
G
Y
 
V
G
 
G
D
|
D
M
 
Q
A
 
M
G
 
S
G
x
H
F
 
Y
A
 
N
V
 
V
I
 
N
K
 
A
D
 
G
V
 
V
A
 
P
K
 
K
T
 
T
R
 
L
V
 
I
F
 
Q
D
 
H
L
 
L
A
 
I
R
 
R
W
 
W
R
 
V
N
 
I
A
 
S
N
 
A
D
 
G
P
 
E
Y
 
F
G
 
G
T
 
E
G
 
K
A
 
V
N
 
G
P
 
E
I
 
V
P
 
L
E
 
Q
R
 
S
I
 
V
I
 
L
T
 
D
R
 
T
P
x
E
P
 
I
S
 
T
A
 
P
E
 
E
L
 
L
R
 
I
P
 
P
D
 
T
-
 
G
-
 
E
-
x
E
-
x
E
-
x
L
Q
 
Q
K
 
S
D
 
S
Q
 
E
D
 
A
S
 
K
L
 
V
P
 
G
P
 
P
Y
 
F
E
 
A
V
 
L
L
 
Q
D
 
D
A
 
F
I
 
S
V
 
L
A
 
F
R
 
Q
Y
 
V
M
 
L
E
 
R
N
 
Y
D
 
G
-
 
F
E
 
R
P
 
P
I
 
S
E
 
K
S
 
I
I
 
A
I
 
F
A
 
L
S
 
A
G
 
W
Y
 
H
A
 
A
R
 
W
A
 
N
D
 
D
V
 
A
E
 
E
R
 
R
-
 
G
-
 
N
-
 
W
-
 
P
-
 
P
-
 
G
-
 
F
-
 
P
-
 
K
-
 
S
-
 
E
-
 
R
-
 
P
-
 
S
-
 
Y
-
 
S
-
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
I
-
 
R
-
 
H
-
 
W
-
 
L
-
 
Q
-
 
I
-
 
F
V
 
V
T
 
Q
R
 
R
L
 
F
I
 
Y
K
 
S
L
x
F
N
 
S
E
 
Q
Y
x
F
K
|
K
R
 
R
R
 
S
Q
 
A
A
 
L
P
 
P
V
 
N
G
 
G
I
 
P
R
 
K
V
 
V
T
 
S
R
 
H
-
 
G
-
 
G
-
 
A
R
 
L
S
 
S
F
 
P
G
 
R
K
 
G
D
 
D
W
 
W
R
 
R
Y
 
A
P
 
P

3sytA Crystal structure of glutamine-dependent NAD+ synthetase from m. Tuberculosis bound to amp/ppi, NAD+, and glutamate (see paper)
24% identity, 98% coverage: 6:545/552 of query aligns to 17:641/660 of 3sytA

query
sites
3sytA
C
 
C
T
 
T
A
 
H
Q
 
H
L
 
T
N
 
T
F
 
-
V
 
-
V
 
I
G
 
G
D
 
D
M
 
P
P
 
A
G
 
A
N
 
N
A
 
A
Q
 
A
K
 
S
I
 
V
I
 
L
A
 
D
A
 
M
A
 
A
R
 
R
E
 
A
A
 
C
Y
 
H
A
 
D
Q
 
D
G
 
G
A
 
A
R
 
A
L
 
L
L
 
A
L
 
V
T
 
F
P
 
P
E
 
E
L
 
L
A
 
T
I
 
L
C
 
S
G
 
G
Y
 
Y
A
 
S
A
 
I
E
 
E
D
 
D
L
 
V
F
 
L
L
 
L
R
 
Q
P
 
D
A
 
S
F
 
L
I
 
L
A
 
D
A
 
A
C
 
V
D
 
E
D
 
D
A
 
A
V
 
L
K
 
L
T
 
D
V
 
L
A
 
V
R
 
T
E
 
E
T
 
S
A
 
A
G
 
D
L
 
L
K
 
L
G
 
P
L
 
V
A
 
L
I
 
V
V
 
V
-
 
G
-
 
A
-
 
P
L
 
L
G
 
R
H
 
H
P
 
R
Q
 
H
A
 
R
L
 
I
A
 
-
P
 
-
D
 
-
A
 
-
P
 
-
A
 
-
F
 
-
S
 
-
A
 
-
C
 
-
H
 
Y
N
 
N
A
 
T
A
 
A
S
 
V
V
 
V
L
 
I
R
 
H
D
 
R
G
 
G
R
 
A
I
 
V
E
 
L
Q
 
G
T
 
V
Y
 
V
A
 
P
K
 
K
R
 
S
E
 
Y
L
 
L
P
 
P
N
 
T
Y
|
Y
Q
x
R
V
 
E
F
|
F
D
 
Y
E
 
E
R
 
R
R
 
R
Y
 
Q
F
 
M
V
 
A
A
 
P
G
 
G
T
 
D
-
 
G
-
 
E
-
 
R
-
 
G
-
 
T
-
 
I
-
 
R
-
 
I
-
 
G
-
 
G
A
 
A
P
 
D
C
 
V
V
 
A
F
 
F
-
 
G
-
 
T
-
 
D
-
 
L
-
 
L
-
 
F
-
 
A
-
 
A
-
 
S
E
 
D
V
 
L
E
 
P
G
 
G
V
 
F
R
 
V
V
 
L
G
 
H
L
 
V
L
 
E
V
 
I
C
|
C
E
|
E
D
 
D
A
 
M
W
x
F
F
 
V
A
 
P
E
 
M
P
 
P
A
 
P
R
 
S
S
 
A
T
 
E
A
 
A
A
 
A
-
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
T
L
 
V
L
 
L
A
 
A
V
 
N
I
 
L
N
 
S
A
 
G
S
|
S
P
 
P
F
 
I
H
 
T
L
 
I
G
 
G
K
x
R
S
 
A
A
 
E
E
 
D
R
 
R
E
 
R
A
 
L
T
 
L
M
 
A
R
 
R
E
 
S
R
 
A
V
 
S
A
 
A
E
 
R
T
 
C
G
 
L
L
 
A
P
 
A
L
 
Y
V
 
V
Y
 
Y
A
 
A
H
 
A
L
 
A
V
 
G
G
 
E
G
 
G
Q
 
E
D
 
S
-
 
T
-
 
T
E
 
D
V
 
L
V
 
A
F
 
W
E
 
D
G
 
G
R
 
Q
S
 
T
F
 
M
A
 
-
L
 
I
N
 
W
A
 
E
D
 
N
G
 
G
S
 
A
V
 
L
A
 
L
G
 
A
R
 
E
A
 
S
P
 
E
G
 
R
F
 
F
-
 
P
-
 
K
-
 
G
-
 
V
-
 
R
-
 
R
-
 
S
-
 
V
-
 
A
-
 
D
-
 
V
-
 
D
-
 
T
-
 
E
-
 
L
-
 
L
-
 
R
E
 
S
E
 
E
K
 
R
L
 
L
V
 
R
F
 
M
A
 
G
-
 
T
-
 
F
-
 
D
-
 
D
-
 
N
R
 
R
V
 
R
H
 
H
H
 
H
-
 
R
-
 
E
-
 
L
A
 
T
Q
 
E
A
 
S
A
 
F
I
 
R
K
 
R
I
 
I
E
 
D
A
 
F
D
 
A
I
 
L
A
 
D
P
 
P
-
 
P
-
 
A
-
 
G
-
 
D
-
 
I
-
 
G
-
 
L
-
 
L
-
 
R
-
 
E
-
 
V
-
 
E
-
 
R
-
 
F
-
 
P
-
 
F
-
 
V
-
 
P
-
 
A
-
 
D
E
 
P
K
 
Q
S
 
R
L
 
L
E
 
Q
A
 
Q
D
 
D
L
 
C
W
 
Y
D
 
E
A
 
A
L
 
Y
-
 
N
-
 
I
-
 
Q
V
 
V
L
 
S
G
 
G
V
 
L
R
 
E
D
 
Q
Y
x
R
V
 
L
G
 
R
K
 
A
N
x
L
G
 
D
F
 
Y
P
 
P
G
 
K
A
 
V
L
 
V
L
 
I
G
|
G
L
x
V
S
|
S
G
 
G
G
|
G
I
x
L
D
|
D
S
|
S
A
 
T
L
 
H
V
 
A
L
 
L
A
 
I
V
 
V
A
 
A
V
 
T
D
 
H
A
 
A
L
 
M
-
 
D
-
 
R
-
 
E
G
 
G
A
 
R
D
 
P
K
 
R
V
 
S
R
 
D
T
 
I
V
 
L
M
 
A
M
x
F
P
x
A
S
x
L
P
 
P
Y
 
G
T
 
F
A
 
K
D
 
N
I
 
-
S
 
-
W
 
-
I
 
-
D
 
N
A
 
A
R
 
I
D
 
K
M
 
L
A
 
A
E
 
R
R
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
T
Y
 
F
D
 
S
E
 
E
I
 
I
S
 
D
I
 
I
K
 
G
P
 
D
Q
 
T
F
 
A
E
 
R
A
 
L
F
 
M
K
 
L
A
 
H
A
 
T
L
 
I
A
 
G
S
 
H
D
 
P
F
 
Y
A
 
S
G
 
-
L
 
V
A
 
G
E
 
E
-
 
K
-
 
V
-
 
Y
D
 
D
T
x
V
T
 
T
E
 
F
E
 
E
N
|
N
L
 
V
Q
 
Q
A
 
A
R
 
G
I
 
L
R
|
R
G
 
T
T
 
D
L
 
Y
L
 
L
M
 
F
A
 
R
L
 
I
S
x
A
N
|
N
K
 
Q
F
 
R
G
 
G
A
x
G
I
|
I
V
 
V
L
 
L
T
 
G
T
|
T
G
 
G
N
 
D
K
 
L
S
 
S
E
|
E
M
 
L
S
 
A
T
 
L
G
 
G
Y
x
W
C
x
S
T
|
T
L
x
Y
-
 
G
Y
 
V
G
 
G
D
|
D
M
 
Q
A
 
M
G
 
S
G
x
H
F
 
Y
A
 
N
V
 
V
I
 
N
K
 
A
D
 
G
V
 
V
A
 
P
K
 
K
T
 
T
R
 
L
V
 
I
F
 
Q
D
 
H
L
 
L
A
 
I
R
 
R
W
 
W
R
 
V
N
 
I
A
 
S
N
 
A
D
 
G
P
 
E
Y
 
F
G
 
G
T
 
E
G
 
K
A
 
V
N
 
G
P
 
E
I
 
V
P
 
L
E
 
Q
R
 
S
I
 
V
I
 
L
T
 
D
R
 
T
P
 
E
P
 
I
S
 
T
A
 
S
E
 
E
L
 
A
R
 
K
P
 
V
D
 
G
Q
 
P
K
 
F
D
 
A
Q
 
L
D
 
Q
S
 
D
L
 
F
P
 
S
P
 
L
Y
 
F
E
 
Q
V
 
V
L
 
L
D
 
R
-
 
Y
-
 
G
-
 
F
-
 
R
-
 
P
-
 
S
-
 
K
-
 
I
A
 
A
I
 
F
V
 
L
A
 
A
R
 
W
Y
 
H
M
 
A
E
 
W
N
 
N
D
 
D
E
 
A
P
 
E
-
 
R
-
 
G
-
 
N
-
 
W
-
 
P
-
 
P
-
 
G
I
 
F
E
 
P
S
 
K
I
 
S
I
 
E
A
 
R
S
 
P
G
 
S
Y
 
Y
A
 
S
R
 
L
A
 
A
D
 
E
V
 
I
E
 
R
R
 
H
-
 
W
-
 
L
-
 
Q
-
 
I
-
 
F
V
 
V
T
 
Q
R
 
R
L
 
F
I
 
Y
K
 
S
L
x
F
N
 
S
E
 
Q
Y
x
F
K
|
K
R
 
R
R
 
S
Q
 
A
A
 
L
P
 
P
V
 
N
G
 
G
I
 
P
R
 
K
V
 
V
T
 
S
R
 
H
-
 
G
-
 
G
-
 
A
R
 
L
S
 
S
F
 
P
G
 
R
K
 
G
D
 
D
W
 
W
R
 
R
Y
 
A
P
 
P

3sezA Crystal structure of c176a mutant of glutamine-dependent NAD+ synthetase from m. Tuberculosis in complex with atp and naad+ (see paper)
24% identity, 98% coverage: 6:545/552 of query aligns to 17:639/658 of 3sezA

query
sites
3sezA
C
 
C
T
 
T
A
 
H
Q
 
H
L
 
T
N
 
T
F
 
-
V
 
-
V
 
I
G
 
G
D
 
D
M
 
P
P
 
A
G
 
A
N
 
N
A
 
A
Q
 
A
K
 
S
I
 
V
I
 
L
A
 
D
A
 
M
A
 
A
R
 
R
E
 
A
A
 
C
Y
 
H
A
 
D
Q
 
D
G
 
G
A
 
A
R
 
A
L
 
L
L
 
A
L
 
V
T
 
F
P
 
P
E
 
E
L
 
L
A
 
T
I
 
L
C
 
S
G
 
G
Y
 
Y
A
 
S
A
 
I
E
 
E
D
 
D
L
 
V
F
 
L
L
 
L
R
 
Q
P
 
D
A
 
S
F
 
L
I
 
L
A
 
D
A
 
A
C
 
V
D
 
E
D
 
D
A
 
A
V
 
L
K
 
L
T
 
D
V
 
L
A
 
V
R
 
T
E
 
E
T
 
S
A
 
A
G
 
D
L
 
L
K
 
L
G
 
P
L
 
V
A
 
L
I
 
V
V
 
V
-
 
G
-
 
A
-
 
P
L
 
L
G
 
R
H
 
H
P
 
R
Q
 
H
A
 
R
L
 
I
A
 
-
P
 
-
D
 
-
A
 
-
P
 
-
A
 
-
F
 
-
S
 
-
A
 
-
C
 
-
H
 
Y
N
 
N
A
 
T
A
 
A
S
 
V
V
 
V
L
 
I
R
 
H
D
 
R
G
 
G
R
 
A
I
 
V
E
 
L
Q
 
G
T
 
V
Y
 
V
A
 
P
K
 
K
R
 
S
E
 
Y
L
 
L
P
 
P
N
 
T
Y
 
Y
Q
 
R
V
 
E
F
 
F
D
 
Y
E
 
E
R
 
R
R
 
R
Y
 
Q
F
 
M
V
 
A
A
 
P
G
 
G
T
 
D
-
 
G
-
 
E
-
 
R
-
 
G
-
 
T
-
 
I
-
 
R
-
 
I
-
 
G
-
 
G
A
 
A
P
 
D
C
 
V
V
 
A
F
 
F
-
 
G
-
 
T
-
 
D
-
 
L
-
 
L
-
 
F
-
 
A
-
 
A
-
 
S
E
 
D
V
 
L
E
 
P
G
 
G
V
 
F
R
 
V
V
 
L
G
 
H
L
 
V
L
 
E
V
 
I
C
 
A
E
 
E
D
 
D
A
 
M
W
 
F
F
 
V
A
 
P
E
 
M
P
 
P
A
 
P
R
 
S
S
 
A
T
 
E
A
 
A
A
 
A
-
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
T
L
 
V
L
 
L
A
 
A
V
 
N
I
 
L
N
 
S
A
 
G
S
 
S
P
 
P
F
 
I
H
 
T
L
 
I
G
 
G
K
 
R
S
 
A
A
 
E
E
 
D
R
 
R
E
 
R
A
 
L
T
 
L
M
 
A
R
 
R
E
 
S
R
 
A
V
 
S
A
 
A
E
 
R
T
 
C
G
 
L
L
 
A
P
 
A
L
 
Y
V
 
V
Y
 
Y
A
 
A
H
 
A
L
 
A
V
 
G
G
 
E
G
 
G
Q
 
E
D
 
S
-
 
T
-
 
T
E
 
D
V
 
L
V
 
A
F
 
W
E
 
D
G
 
G
R
 
Q
S
 
T
F
 
M
A
 
-
L
 
I
N
 
W
A
 
E
D
 
N
G
 
G
S
 
A
V
 
L
A
 
L
G
 
A
R
 
E
A
 
S
P
 
E
G
 
R
F
 
F
-
 
P
-
 
K
-
 
G
-
 
V
-
 
R
-
 
R
-
 
S
-
 
V
-
 
A
-
 
D
-
 
V
-
 
D
-
 
T
-
 
E
-
 
L
-
 
L
-
 
R
E
 
S
E
 
E
K
 
R
L
 
L
V
 
R
F
 
M
A
 
G
-
 
T
-
 
F
-
 
D
-
 
D
-
 
N
R
 
R
V
 
R
H
 
H
H
 
H
-
 
R
-
 
E
-
 
L
A
 
T
Q
 
E
A
 
S
A
 
F
I
 
R
K
 
R
I
 
I
E
 
D
A
 
F
D
 
A
I
 
L
A
 
D
P
 
P
-
 
P
-
 
A
-
 
G
-
 
D
-
 
I
-
 
G
-
 
L
-
 
L
-
 
R
-
 
E
-
 
V
-
 
E
-
 
R
-
 
F
-
 
P
-
 
F
-
 
V
-
 
P
-
 
A
-
 
D
E
 
P
K
 
Q
S
 
R
L
 
L
E
 
Q
A
 
Q
D
 
D
L
 
C
W
 
Y
D
 
E
A
 
A
L
 
Y
-
 
N
-
 
I
-
 
Q
V
 
V
L
 
S
G
 
G
V
 
L
R
 
E
D
 
Q
Y
x
R
V
 
L
G
 
R
K
 
A
N
x
L
G
 
D
F
 
Y
P
 
P
G
 
K
A
 
V
L
 
V
L
 
I
G
|
G
L
x
V
S
|
S
G
 
G
G
|
G
I
 
L
D
 
D
S
|
S
A
 
T
L
 
H
V
 
A
L
 
L
A
 
I
V
 
V
A
 
A
V
 
T
D
 
H
A
 
A
L
 
M
-
 
D
-
 
R
-
 
E
G
 
G
A
 
R
D
 
P
K
 
R
V
 
S
R
 
D
T
 
I
V
 
L
M
 
A
M
x
F
P
x
A
S
x
L
P
 
P
Y
 
G
T
 
F
A
 
K
D
 
N
I
 
-
S
 
-
W
 
-
I
 
-
D
 
N
A
 
A
R
 
I
D
 
K
M
 
L
A
 
A
E
 
R
R
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
T
Y
 
F
D
 
S
E
 
E
I
 
I
S
 
D
I
 
I
K
 
G
P
 
D
Q
 
T
F
 
A
E
 
R
A
 
L
F
 
M
K
 
L
A
 
H
A
 
T
L
 
I
A
 
G
S
 
H
D
 
P
F
 
Y
A
 
S
G
 
-
L
 
V
A
 
G
E
 
E
-
 
K
-
 
V
-
 
Y
D
 
D
T
 
V
T
 
T
E
 
F
E
|
E
N
|
N
L
 
V
Q
 
Q
A
 
A
R
 
G
I
 
L
R
|
R
G
 
T
T
 
D
L
 
Y
L
 
L
M
 
F
A
 
R
L
 
I
S
x
A
N
|
N
K
 
Q
F
 
R
G
 
G
A
x
G
I
|
I
V
 
V
L
 
L
T
 
G
T
|
T
G
 
G
N
 
D
K
 
L
S
 
S
E
|
E
M
 
L
S
 
A
T
 
L
G
 
G
Y
x
W
C
x
S
T
|
T
L
x
Y
-
 
G
Y
 
V
G
 
G
D
|
D
M
 
Q
A
 
M
G
 
S
G
x
H
F
 
Y
A
 
N
V
 
V
I
 
N
K
 
A
D
 
G
V
 
V
A
 
P
K
 
K
T
 
T
R
 
L
V
 
I
F
 
Q
D
 
H
L
 
L
A
 
I
R
 
R
W
 
W
R
 
V
N
 
I
A
 
S
N
 
A
D
 
G
P
 
E
Y
 
F
G
 
G
T
 
E
G
 
K
A
 
V
N
 
G
P
 
E
I
 
V
P
 
L
E
 
Q
R
 
S
I
 
V
I
 
L
T
 
D
R
 
T
P
 
E
P
 
S
S
 
E
A
 
A
E
 
K
L
 
V
R
 
G
P
 
P
D
 
F
Q
 
A
K
 
L
D
 
Q
Q
 
D
D
 
F
S
 
S
L
 
L
P
 
-
P
 
-
Y
 
F
E
 
Q
V
 
V
L
 
L
D
 
R
-
 
Y
-
 
G
-
 
F
-
 
R
-
 
P
-
 
S
-
 
K
-
 
I
A
 
A
I
 
F
V
 
L
A
 
A
R
 
W
Y
 
H
M
 
A
E
 
W
N
 
N
D
 
D
E
 
A
P
 
E
-
 
R
-
 
G
-
 
N
-
 
W
-
 
P
-
 
P
-
 
G
I
 
F
E
 
P
S
 
K
I
 
S
I
 
E
A
 
R
S
 
P
G
 
S
Y
 
Y
A
 
S
R
 
L
A
 
A
D
 
E
V
 
I
E
 
R
R
 
H
-
 
W
-
 
L
-
 
Q
-
 
I
-
 
F
V
 
V
T
 
Q
R
 
R
L
 
F
I
 
Y
K
 
S
L
x
F
N
 
S
E
 
Q
Y
x
F
K
|
K
R
 
R
R
 
S
Q
 
A
A
 
L
P
 
P
V
 
N
G
 
G
I
 
P
R
 
K
V
 
V
T
 
S
R
 
H
-
 
G
-
 
G
-
 
A
R
 
L
S
 
S
F
 
P
G
 
R
K
 
G
D
 
D
W
 
W
R
 
R