SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Ac3H11_704 FitnessBrowser__acidovorax_3H11:Ac3H11_704 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 16 hits to proteins with known functional sites (download)

7wxiA Gpr domain of drosophila p5cs filament with glutamate and atpgammas (see paper)
39% identity, 95% coverage: 16:421/426 of query aligns to 8:407/430 of 7wxiA

query
sites
7wxiA
Q
 
N
A
 
A
K
 
R
T
 
T
A
 
G
S
 
S
A
 
R
L
 
Q
M
 
M
A
 
Q
K
 
A
A
 
L
P
 
T
A
 
P
A
 
A
I
 
Q
K
 
R
N
 
A
K
 
S
A
 
A
L
 
V
K
 
N
A
 
T
L
 
L
A
 
A
R
 
D
L
 
L
L
 
L
R
 
V
E
 
S
N
 
R
V
 
E
D
 
K
A
 
F
L
 
I
Q
 
L
I
 
D
D
 
A
N
 
N
A
 
A
R
 
K
D
 
D
L
 
L
E
 
A
R
 
E
A
 
A
R
 
Q
A
 
K
A
 
S
G
 
G
L
 
L
A
 
A
E
 
K
P
 
P
M
 
L
V
 
L
D
 
S
R
 
R
L
 
L
K
 
S
L
 
L
S
 
N
P
 
P
K
 
A
V
 
K
L
 
L
E
 
K
T
 
N
C
 
L
A
 
S
E
 
V
G
 
G
C
 
L
E
 
K
Q
 
Q
L
 
I
A
 
A
A
 
E
-
 
D
M
 
S
P
 
H
D
 
K
I
 
N
I
 
V
G
 
G
E
 
R
I
 
V
L
 
L
G
 
R
M
 
R
K
 
T
Q
 
R
Q
 
L
P
 
A
S
 
D
G
 
Q
I
 
L
R
 
E
V
 
L
G
 
K
Q
 
Q
M
 
V
R
 
T
V
 
V
P
 
P
I
 
I
G
 
G
V
 
V
F
 
L
G
 
L
M
 
V
I
 
I
Y
 
F
E
 
E
S
 
S
R
 
R
P
 
P
N
 
D
V
 
S
T
 
L
I
 
P
E
 
Q
A
 
V
A
 
A
S
 
A
L
 
L
S
 
A
I
 
M
K
 
A
S
 
S
G
 
A
N
 
N
A
 
G
C
 
L
I
 
L
L
 
L
R
 
K
G
 
G
G
 
G
S
 
K
E
 
E
A
 
A
I
 
A
D
 
H
S
 
S
N
 
N
K
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
M
K
 
E
L
 
L
V
 
V
Q
 
K
Q
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
T
A
 
V
G
 
G
L
 
-
P
 
A
Q
 
E
D
 
H
A
 
A
V
 
V
Q
 
S
L
 
L
V
 
V
Q
 
S
T
 
T
T
 
-
D
 
-
R
 
R
E
 
E
A
 
E
V
 
I
G
 
S
Q
 
D
L
 
L
I
 
L
A
 
S
M
 
M
P
 
E
Q
 
N
F
 
H
V
 
I
D
 
D
V
 
L
I
 
I
I
 
I
P
 
P
R
 
R
G
 
G
G
 
S
K
 
S
G
 
D
L
 
L
I
 
V
E
 
R
R
 
S
I
 
I
S
 
Q
R
 
Q
D
 
Q
A
 
S
-
 
L
K
 
H
V
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
L
K
 
G
H
 
H
L
 
A
D
 
E
G
 
G
N
 
V
C
 
C
H
 
H
T
 
V
Y
 
Y
V
 
I
D
 
D
D
 
R
P
 
D
C
 
A
D
 
D
V
 
L
P
 
E
M
 
K
A
 
A
V
 
L
K
 
R
V
 
I
A
 
A
D
 
R
N
 
D
A
 
A
K
 
K
T
 
C
N
 
D
K
 
Y
Y
 
P
S
 
A
P
 
A
C
 
C
N
 
N
A
 
A
S
 
M
E
 
E
G
 
T
L
 
L
L
 
L
V
 
I
A
 
H
R
 
E
G
 
D
V
 
L
-
 
M
A
 
S
A
 
G
E
 
A
F
 
I
L
 
F
P
 
G
K
 
D
I
 
V
G
 
C
A
 
N
V
 
M
Y
 
L
A
 
K
A
 
R
K
 
E
G
 
G
V
 
V
E
 
K
M
 
I
R
 
Y
G
 
A
C
 
G
P
 
P
E
 
R
S
 
-
L
 
-
A
 
-
I
 
-
L
 
-
Q
 
-
S
 
-
V
 
-
A
 
L
G
 
N
A
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
V
 
T
-
 
F
-
 
G
P
 
P
A
 
P
T
 
A
E
 
A
Q
 
K
D
 
S
W
 
L
S
 
K
E
 
H
E
 
E
Y
 
Y
L
 
G
A
 
A
P
 
L
I
 
E
I
 
C
S
 
C
V
 
I
K
 
E
I
 
V
V
 
V
A
 
P
G
 
S
L
 
L
D
 
D
E
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
N
H
 
H
I
 
I
N
 
H
H
 
T
Y
 
Y
S
 
G
S
 
S
H
 
S
H
 
H
T
 
T
D
 
D
A
 
V
I
 
I
L
 
V
T
 
T
T
 
E
N
 
N
H
 
D
V
 
A
H
 
A
A
 
A
Q
 
R
R
 
Q
F
 
F
L
 
L
R
 
G
E
 
S
V
 
V
D
 
D
S
 
S
A
 
A
S
 
C
V
 
V
M
 
F
V
 
H
N
 
N
A
 
A
S
 
S
T
 
S
R
|
R
F
 
F
A
 
A
D
|
D
G
 
G
F
 
F
E
 
R
Y
 
F
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
E
I
 
V
G
 
G
I
 
I
S
 
S
T
 
T
D
 
A
K
 
R
F
 
I
H
 
H
A
 
A
R
 
R
G
 
G
P
 
P
V
 
V
G
 
G
I
 
V
E
 
E
G
 
G
L
 
L
T
 
L
S
 
T
L
 
T
K
 
K
Y
 
W
V
 
I
V
 
L
L
 
E
G
 
G
E
 
Q

7wxgA Gpr domain closed form of drosophila p5cs filament with glutamate, atp, and NADPH (see paper)
39% identity, 95% coverage: 16:421/426 of query aligns to 8:407/430 of 7wxgA

query
sites
7wxgA
Q
 
N
A
 
A
K
 
R
T
 
T
A
 
G
S
 
S
A
 
R
L
 
Q
M
 
M
A
 
Q
K
 
A
A
 
L
P
 
T
A
 
P
A
 
A
I
 
Q
K
 
R
N
 
A
K
 
S
A
 
A
L
 
V
K
 
N
A
 
T
L
 
L
A
 
A
R
 
D
L
 
L
L
 
L
R
 
V
E
 
S
N
 
R
V
 
E
D
 
K
A
 
F
L
 
I
Q
 
L
I
 
D
D
 
A
N
 
N
A
 
A
R
 
K
D
 
D
L
 
L
E
 
A
R
 
E
A
 
A
R
 
Q
A
 
K
A
 
S
G
 
G
L
 
L
A
 
A
E
 
K
P
 
P
M
 
L
V
 
L
D
 
S
R
 
R
L
 
L
K
 
S
L
 
L
S
 
N
P
 
P
K
 
A
V
 
K
L
 
L
E
 
K
T
 
N
C
 
L
A
 
S
E
 
V
G
 
G
C
 
L
E
 
K
Q
 
Q
L
 
I
A
 
A
A
 
E
-
 
D
M
 
S
P
 
H
D
 
K
I
 
N
I
 
V
G
 
G
E
 
R
I
 
V
L
 
L
G
 
R
M
 
R
K
 
T
Q
 
R
Q
 
L
P
 
A
S
 
D
G
 
Q
I
 
L
R
 
E
V
 
L
G
 
K
Q
 
Q
M
 
V
R
 
T
V
 
V
P
 
P
I
 
I
G
 
G
V
 
V
F
 
L
G
 
L
M
 
V
I
 
I
Y
 
F
E
|
E
S
 
S
R
 
R
P
 
P
N
 
D
V
 
S
T
 
L
I
 
P
E
 
Q
A
 
V
A
 
A
S
 
A
L
 
L
S
 
A
I
 
M
K
 
A
S
 
S
G
 
A
N
 
N
A
 
G
C
 
L
I
 
L
L
 
L
R
 
K
G
 
G
G
 
G
S
 
K
E
 
E
A
 
A
I
 
A
D
 
H
S
 
S
N
 
N
K
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
M
K
 
E
L
 
L
V
 
V
Q
 
K
Q
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
T
A
 
V
G
 
G
L
 
-
P
 
A
Q
 
E
D
 
H
A
 
A
V
 
V
Q
 
S
L
 
L
V
 
V
Q
 
S
T
 
T
T
 
-
D
 
-
R
|
R
E
 
E
A
 
E
V
 
I
G
 
S
Q
 
D
L
 
L
I
 
L
A
 
S
M
 
M
P
 
E
Q
 
N
F
 
H
V
 
I
D
 
D
V
 
L
I
 
I
I
 
I
P
 
P
R
 
R
G
|
G
G
x
S
K
x
S
G
 
D
L
|
L
I
 
V
E
 
R
R
 
S
I
 
I
S
 
Q
R
 
Q
D
 
Q
A
 
S
-
 
L
K
 
H
V
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
L
K
 
G
H
 
H
L
 
A
D
 
E
G
|
G
N
 
V
C
 
C
H
 
H
T
 
V
Y
 
Y
V
 
I
D
 
D
D
 
R
P
 
D
C
 
A
D
 
D
V
 
L
P
 
E
M
 
K
A
 
A
V
 
L
K
 
R
V
 
I
A
 
A
D
 
R
N
 
D
A
 
A
K
 
K
T
 
C
N
 
D
K
 
Y
Y
 
P
S
 
A
P
 
A
C
 
C
N
 
N
A
 
A
S
 
M
E
 
E
G
 
T
L
 
L
L
 
L
V
 
I
A
 
H
R
 
E
G
 
D
V
 
L
-
 
M
A
 
S
A
 
G
E
 
A
F
 
I
L
 
F
P
 
G
K
 
D
I
 
V
G
 
C
A
 
N
V
 
M
Y
 
L
A
 
K
A
 
R
K
 
E
G
 
G
V
 
V
E
 
K
M
 
I
R
 
Y
G
 
A
C
 
G
P
 
P
E
 
R
S
 
-
L
 
-
A
 
-
I
 
-
L
 
-
Q
 
-
S
 
-
V
 
-
A
 
L
G
 
N
A
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
V
 
T
-
 
F
-
 
G
P
 
P
A
 
P
T
 
A
E
 
A
Q
 
K
D
 
S
W
 
L
S
 
K
E
 
H
E
|
E
Y
 
Y
L
 
G
A
 
A
P
 
L
I
 
E
I
 
C
S
 
C
V
 
I
K
 
E
I
 
V
V
 
V
A
 
P
G
 
S
L
 
L
D
 
D
E
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
N
H
 
H
I
 
I
N
 
H
H
 
T
Y
 
Y
S
 
G
S
 
S
H
 
S
H
 
H
T
 
T
D
 
D
A
 
V
I
 
I
L
 
V
T
 
T
T
 
E
N
 
N
H
 
D
V
 
A
H
 
A
A
 
A
Q
 
R
R
 
Q
F
 
F
L
 
L
R
 
G
E
 
S
V
 
V
D
 
D
S
 
S
A
 
A
S
 
C
V
 
V
M
 
F
V
 
H
N
 
N
A
 
A
S
 
S
T
 
S
R
 
R
F
 
F
A
 
A
D
 
D
G
 
G
F
 
F
E
 
R
Y
 
F
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
E
I
 
V
G
 
G
I
 
I
S
 
S
T
 
T
D
 
A
K
 
R
F
 
I
H
 
H
A
 
A
R
 
R
G
 
G
P
 
P
V
 
V
G
 
G
I
 
V
E
 
E
G
 
G
L
 
L
T
 
L
S
 
T
L
 
T
K
 
K
Y
 
W
V
 
I
V
 
L
L
 
E
G
 
G
E
 
Q

4jbeB 1.95 angstrom crystal structure of gamma-glutamyl phosphate reductase from saccharomonospora viridis.
31% identity, 97% coverage: 5:419/426 of query aligns to 3:408/412 of 4jbeB

query
sites
4jbeB
H
 
E
V
 
V
A
 
A
E
 
K
Y
 
A
T
 
V
H
 
E
S
 
E
L
 
C
G
 
A
L
 
R
Q
 
A
A
 
A
K
 
K
T
 
S
A
 
A
S
 
A
A
 
P
L
 
S
M
 
L
A
 
S
K
 
G
A
 
A
P
 
P
A
 
D
A
 
T
I
 
A
K
 
I
N
 
D
K
 
A
A
 
A
L
 
L
K
 
E
A
 
S
L
 
M
A
 
A
R
 
D
L
 
R
L
 
L
R
 
L
E
 
A
N
 
H
V
 
R
D
 
D
A
 
A
L
 
V
Q
 
L
I
 
A
D
 
A
N
 
N
A
 
A
R
 
E
D
 
D
L
 
I
E
 
A
R
 
K
A
 
A
R
 
E
A
 
A
A
 
G
G
 
G
L
 
M
A
 
S
E
 
A
P
 
G
M
 
L
V
 
L
D
 
D
R
 
R
L
 
L
K
 
T
L
 
I
S
 
T
P
 
E
K
 
S
V
 
R
L
 
L
E
 
T
T
 
D
C
 
M
A
 
A
E
 
D
G
 
Q
C
 
L
E
 
R
Q
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
G
M
 
A
P
 
P
D
 
H
I
 
P
I
 
-
G
 
Q
E
 
R
I
 
T
L
 
V
G
 
E
M
 
L
K
 
S
Q
 
T
Q
 
L
P
 
D
S
 
G
G
 
G
I
 
L
R
 
R
V
 
L
G
 
V
Q
 
E
M
 
R
R
 
R
V
 
R
P
 
P
I
 
V
G
 
G
V
 
V
F
 
I
G
 
G
M
 
A
I
 
N
Y
 
Y
E
 
E
S
 
A
R
 
R
P
 
P
N
 
N
V
 
V
T
 
T
I
 
V
E
 
D
A
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
Q
S
 
L
I
 
V
K
 
K
S
 
S
G
 
R
N
 
N
A
 
A
C
 
G
I
 
V
L
 
L
R
 
R
G
 
T
G
 
G
S
 
S
E
 
A
A
 
A
I
 
L
D
 
K
S
 
S
N
 
A
K
 
Q
A
 
R
L
 
L
A
 
L
K
 
E
L
 
V
V
 
V
-
 
I
Q
 
R
Q
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
T
E
 
D
A
 
S
G
 
G
L
 
I
P
 
D
Q
 
A
D
 
N
A
 
V
V
 
V
Q
 
Q
L
 
L
V
 
V
Q
 
P
T
 
R
T
 
P
D
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
V
 
A
G
 
G
Q
 
A
L
 
L
I
 
V
A
 
R
M
 
L
P
 
P
Q
 
D
F
 
L
V
 
V
D
 
P
V
 
L
I
 
V
I
 
I
P
 
L
R
 
R
G
 
G
G
 
S
K
 
G
G
 
E
L
 
S
I
 
T
E
 
R
R
 
A
I
 
L
S
 
A
R
 
L
D
 
E
A
 
A
K
 
A
-
 
Q
-
 
H
-
 
G
V
 
V
P
 
R
V
 
T
I
 
L
K
 
A
H
 
H
L
 
A
D
 
D
G
 
G
N
 
G
C
 
G
H
 
V
T
 
L
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
D
 
E
P
 
K
C
 
A
D
|
D
V
 
R
P
x
D
M
 
T
A
 
V
V
 
R
K
 
S
V
 
L
A
 
V
D
 
V
N
 
N
A
 
S
K
 
-
T
 
L
N
 
D
K
 
R
Y
 
L
S
 
G
P
 
V
C
 
C
N
 
N
A
 
R
S
 
L
E
 
N
G
 
L
L
 
L
L
 
L
V
 
I
A
 
H
R
 
D
G
x
A
V
 
V
A
 
Y
A
 
E
E
|
E
F
 
F
L
 
W
P
 
P
K
 
V
I
 
V
G
 
S
A
x
E
V
 
A
Y
 
L
A
 
A
A
x
E
K
 
R
G
 
G
V
 
V
E
 
S
M
 
-
R
 
-
G
 
-
C
 
-
P
 
-
E
 
P
S
 
S
L
 
L
A
 
P
I
 
P
L
 
Y
Q
 
D
S
 
H
V
 
P
A
 
I
G
 
G
A
 
Y
Q
 
E
L
 
W
V
 
A
P
 
L
A
 
D
T
 
S
E
 
E
Q
 
R
D
 
E
W
 
A
S
 
T
E
 
-
E
 
-
Y
 
-
L
 
-
A
 
-
P
 
-
I
 
-
I
 
V
S
 
T
V
 
V
K
 
A
I
 
R
V
 
V
A
 
D
G
 
G
L
 
V
D
 
A
E
 
E
A
 
A
I
 
V
A
 
R
H
 
I
I
 
A
N
 
N
H
 
E
Y
 
E
S
 
T
S
 
S
H
 
G
H
 
L
T
 
A
D
 
A
A
 
G
I
 
I
L
 
A
T
 
T
T
 
E
N
 
D
H
 
A
V
 
R
H
 
A
A
 
A
Q
 
E
R
 
E
F
 
F
L
 
F
R
 
D
E
 
G
V
 
Y
D
 
Q
S
 
G
A
 
T
S
 
G
V
 
V
M
 
F
V
 
W
N
 
N
A
 
A
S
 
P
T
 
T
R
 
R
F
 
L
A
 
L
D
 
D
G
 
G
F
 
F
E
 
K
Y
 
L
G
 
L
L
 
G
G
 
V
A
 
P
E
 
E
I
 
T
G
 
G
I
 
I
S
 
N
T
 
L
D
 
D
K
 
K
F
 
V
H
 
P
A
 
G
-
 
P
R
 
R
G
 
G
P
 
P
V
 
V
G
 
T
I
 
Y
E
 
P
G
 
D
L
 
L
T
 
Y
S
 
V
L
 
R
K
 
Q
Y
 
Y
V
 
A
V
 
V
L
 
L

5j7iB Crystal structure of a geobacillus thermoglucosidasius acetylating aldehyde dehydrogenase in complex with adp (see paper)
22% identity, 88% coverage: 35:407/426 of query aligns to 25:426/456 of 5j7iB

query
sites
5j7iB
A
 
A
L
 
Q
K
 
K
A
 
I
L
 
L
A
 
E
R
 
K
L
 
M
L
 
T
R
 
Q
E
 
S
N
 
E
V
 
I
D
 
D
A
 
K
L
 
I
-
 
V
-
 
E
Q
 
S
I
 
M
D
 
A
N
 
N
A
 
A
R
 
A
D
 
R
L
 
E
E
 
E
R
 
A
A
 
G
R
 
R
A
 
L
A
 
A
G
 
A
L
 
M
A
 
A
E
 
V
P
 
E
M
 
E
V
 
T
D
 
G
R
 
F
L
 
G
K
 
N
L
 
V
S
 
E
P
 
D
K
 
K
V
 
T
L
 
L
E
 
K
T
 
N
C
 
L
A
 
F
E
 
A
G
 
A
C
 
N
E
 
D
Q
 
V
L
 
Y
A
 
N
A
 
S
M
 
I
P
 
K
D
 
D
I
 
V
I
 
-
G
 
-
E
 
K
I
 
T
L
 
V
G
 
G
M
 
I
K
 
I
Q
 
R
Q
 
R
P
 
D
S
 
E
G
 
E
I
 
N
R
 
R
V
 
V
G
 
W
Q
 
E
M
 
I
R
 
A
V
 
Q
P
 
P
I
 
V
G
 
G
V
 
I
F
 
V
-
 
A
G
 
G
M
 
I
I
 
I
Y
 
P
E
 
S
S
 
T
R
 
N
P
 
P
N
 
T
V
 
S
T
 
T
-
 
V
I
 
I
E
 
F
A
 
K
A
 
A
S
 
L
L
 
I
S
 
A
I
 
V
K
 
K
S
 
A
G
 
R
N
 
N
A
 
A
C
 
I
I
 
V
L
 
F
R
 
S
G
 
P
G
 
H
S
 
P
E
 
S
A
 
A
I
 
A
D
 
K
S
 
C
N
 
T
K
 
A
A
 
E
L
 
A
A
 
A
K
 
R
L
 
I
V
 
M
Q
 
Q
Q
 
E
A
 
A
L
 
A
A
 
E
E
 
R
A
 
A
G
 
G
L
 
A
P
 
P
Q
 
K
D
 
G
A
 
L
V
 
I
Q
 
S
L
 
C
V
 
I
Q
 
T
T
 
Q
T
 
P
D
 
T
R
 
M
E
 
A
A
 
A
V
 
T
G
 
N
Q
 
E
L
 
L
I
 
M
A
 
K
M
 
H
P
 
-
Q
 
K
F
 
L
V
 
T
D
 
D
V
 
V
I
 
I
I
 
L
P
 
A
R
 
T
G
 
G
G
 
G
K
 
P
G
 
G
L
|
L
I
 
V
E
 
K
R
 
A
I
 
A
S
 
Y
R
 
S
D
 
S
A
 
G
K
 
K
V
 
-
P
 
P
V
 
A
I
 
Y
K
 
G
H
 
V
L
 
G
D
 
P
G
 
G
N
 
N
C
 
V
H
 
P
T
 
V
Y
 
Y
V
 
I
D
 
H
D
 
E
P
 
S
C
 
A
D
 
N
V
 
I
P
 
A
M
 
K
A
 
A
V
 
V
K
 
Q
V
 
L
A
 
I
D
 
I
N
 
Q
A
 
S
K
 
K
T
 
T
N
 
F
K
 
D
Y
 
Y
-
 
G
S
 
T
P
 
I
C
 
C
N
 
A
A
 
S
S
 
E
E
 
Q
G
 
A
L
 
L
L
 
L
V
 
V
A
 
D
R
 
E
G
 
S
V
 
I
-
 
K
-
 
E
-
 
K
-
 
V
-
 
V
-
 
A
-
 
E
-
 
L
-
 
K
-
 
Q
-
 
Q
A
 
G
A
 
A
E
 
Y
F
 
F
L
 
L
-
 
N
-
 
E
-
 
E
-
 
E
-
 
K
P
 
Q
K
 
K
I
 
V
G
 
A
A
 
S
V
 
I
Y
 
I
A
 
M
A
 
V
K
 
N
G
 
G
-
 
S
-
 
L
-
 
N
V
x
A
E
 
K
M
 
I
R
 
V
G
 
G
-
 
K
C
 
A
P
 
P
E
 
Q
S
 
V
L
 
I
A
 
A
I
 
E
L
 
M
Q
 
A
S
 
G
V
 
I
-
 
E
-
 
I
-
 
P
A
 
S
G
 
D
A
 
V
Q
 
K
L
 
L
V
 
L
P
 
V
A
 
A
T
 
E
E
 
E
Q
 
T
D
 
E
W
 
V
S
 
G
E
 
K
E
 
E
Y
 
Y
-
 
P
-
 
F
-
 
S
-
 
I
-
 
E
-
 
K
L
 
L
A
 
S
P
 
P
I
 
I
I
 
L
S
 
A
V
 
F
K
 
Y
I
 
I
V
 
V
A
 
K
G
 
G
L
 
M
D
 
E
E
 
E
A
 
A
I
 
S
A
 
E
H
 
L
I
 
A
N
 
Q
H
 
K
Y
 
L
S
 
L
S
 
E
-
 
V
-
 
G
-
 
G
-
 
L
H
 
G
H
 
H
T
 
T
D
 
V
A
 
G
I
 
I
L
 
H
T
 
A
T
 
E
N
 
D
H
 
E
V
 
K
H
 
V
A
 
I
Q
 
E
R
 
A
F
 
Y
L
 
T
R
 
I
E
 
D
V
 
K
D
 
P
S
 
A
A
 
G
S
 
R
V
 
I
M
 
V
V
 
V
N
 
N
A
 
A
S
 
G
T
 
T
R
 
T
F
 
F
A
 
G
D
 
-
G
 
-
F
 
-
E
 
-
Y
 
-
G
 
G
L
 
I
G
 
G
A
 
A
E
 
T
I
 
V
G
 
N
I
 
V
S
 
K
T
 
P
D
 
S
K
 
L
F
 
T
H
 
L
A
 
G
R
 
C
G
 
G
P
 
A
V
 
I
G
 
G

5j7iC Crystal structure of a geobacillus thermoglucosidasius acetylating aldehyde dehydrogenase in complex with adp (see paper)
22% identity, 88% coverage: 35:407/426 of query aligns to 24:425/455 of 5j7iC

query
sites
5j7iC
A
 
A
L
 
Q
K
 
K
A
 
I
L
 
L
A
 
E
R
 
K
L
 
M
L
 
T
R
 
Q
E
 
S
N
 
E
V
 
I
D
 
D
A
 
K
L
 
I
-
 
V
-
 
E
Q
 
S
I
 
M
D
 
A
N
 
N
A
 
A
R
 
A
D
 
R
L
 
E
E
 
E
R
 
A
A
 
G
R
 
R
A
 
L
A
 
A
G
 
A
L
 
M
A
 
A
E
 
V
P
 
E
M
 
E
V
 
T
D
 
G
R
 
F
L
 
G
K
 
N
L
 
V
S
 
E
P
 
D
K
 
K
V
 
T
L
 
L
E
 
K
T
 
N
C
 
L
A
 
F
E
 
A
G
 
A
C
 
N
E
 
D
Q
 
V
L
 
Y
A
 
N
A
 
S
M
 
I
P
 
K
D
 
D
I
 
V
I
 
-
G
 
-
E
 
K
I
 
T
L
 
V
G
 
G
M
 
I
K
 
I
Q
 
R
Q
 
R
P
 
D
S
 
E
G
 
E
I
 
N
R
 
R
V
 
V
G
 
W
Q
 
E
M
 
I
R
 
A
V
 
Q
P
 
P
I
 
V
G
 
G
V
 
I
F
 
V
-
 
A
G
 
G
M
 
I
I
 
I
Y
 
P
E
 
S
S
 
T
R
 
N
P
 
P
N
 
T
V
 
S
T
 
T
-
 
V
I
 
I
E
 
F
A
 
K
A
 
A
S
 
L
L
 
I
S
 
A
I
 
V
K
 
K
S
 
A
G
 
R
N
 
N
A
 
A
C
 
I
I
 
V
L
 
F
R
 
S
G
 
P
G
x
H
S
x
P
E
 
S
A
 
A
I
 
A
D
 
K
S
 
C
N
 
T
K
 
A
A
 
E
L
 
A
A
 
A
K
 
R
L
 
I
V
 
M
Q
 
Q
Q
 
E
A
 
A
L
 
A
A
 
E
E
 
R
A
 
A
G
 
G
L
 
A
P
 
P
Q
 
K
D
 
G
A
 
L
V
 
I
Q
 
S
L
 
C
V
 
I
Q
 
T
T
 
Q
T
 
P
D
 
T
R
 
M
E
 
A
A
 
A
V
 
T
G
 
N
Q
 
E
L
 
L
I
 
M
A
 
K
M
 
H
P
 
-
Q
 
K
F
 
L
V
 
T
D
 
D
V
 
V
I
 
I
I
 
L
P
 
A
R
 
T
G
 
G
G
 
G
K
 
P
G
 
G
L
|
L
I
 
V
E
 
K
R
 
A
I
 
A
S
 
Y
R
 
S
D
 
S
A
 
G
K
 
K
V
 
-
P
 
P
V
 
A
I
 
Y
K
 
G
H
 
V
L
 
G
D
 
P
G
 
G
N
 
N
C
 
V
H
 
P
T
 
V
Y
 
Y
V
 
I
D
 
H
D
 
E
P
 
S
C
 
A
D
 
N
V
 
I
P
 
A
M
 
K
A
 
A
V
 
V
K
 
Q
V
 
L
A
 
I
D
 
I
N
 
Q
A
 
S
K
 
K
T
 
T
N
 
F
K
 
D
Y
 
Y
-
 
G
S
 
T
P
 
I
C
 
C
N
 
A
A
 
S
S
 
E
E
 
Q
G
 
A
L
 
L
L
 
L
V
 
V
A
 
D
R
 
E
G
 
S
V
 
I
-
 
K
-
 
E
-
 
K
-
 
V
-
 
V
-
 
A
-
 
E
-
 
L
-
 
K
-
 
Q
-
 
Q
A
 
G
A
 
A
E
 
Y
F
 
F
L
 
L
-
 
N
-
 
E
-
 
E
-
 
E
-
 
K
P
 
Q
K
 
K
I
 
V
G
 
A
A
 
S
V
 
I
Y
 
I
A
 
M
A
 
V
K
 
N
G
 
G
-
 
S
-
 
L
-
 
N
V
 
A
E
 
K
M
 
I
R
 
V
G
 
G
-
 
K
C
 
A
P
 
P
E
 
Q
S
 
V
L
 
I
A
 
A
I
 
E
L
 
M
Q
 
A
S
 
G
V
 
I
-
 
E
-
 
I
-
 
P
A
 
S
G
 
D
A
 
V
Q
 
K
L
 
L
V
 
L
P
 
V
A
 
A
T
 
E
E
 
E
Q
 
T
D
 
E
W
 
V
S
 
G
E
 
K
E
 
E
Y
 
Y
-
 
P
-
 
F
-
 
S
-
 
I
-
 
E
-
 
K
L
 
L
A
 
S
P
 
P
I
 
I
I
 
L
S
 
A
V
 
F
K
 
Y
I
 
I
V
 
V
A
 
K
G
 
G
L
 
M
D
 
E
E
 
E
A
 
A
I
 
S
A
 
E
H
 
L
I
 
A
N
 
Q
H
 
K
Y
 
L
S
 
L
S
 
E
-
 
V
-
 
G
-
 
G
-
 
L
H
 
G
H
 
H
T
 
T
D
 
V
A
 
G
I
 
I
L
 
H
T
 
A
T
 
E
N
 
D
H
 
E
V
 
K
H
 
V
A
 
I
Q
 
E
R
 
A
F
 
Y
L
 
T
R
 
I
E
 
D
V
 
K
D
 
P
S
 
A
A
 
G
S
 
R
V
 
I
M
 
V
V
 
V
N
 
N
A
 
A
S
 
G
T
 
T
R
 
T
F
 
F
A
 
G
D
 
-
G
 
-
F
 
-
E
 
-
Y
 
-
G
 
G
L
 
I
G
 
G
A
 
A
E
 
T
I
 
V
G
 
N
I
 
V
S
 
K
T
 
P
D
 
S
K
 
L
F
 
T
H
 
L
A
 
G
R
 
C
G
 
G
P
 
A
V
 
I
G
 
G

4itbA Structure of bacterial enzyme in complex with cofactor and substrate (see paper)
25% identity, 61% coverage: 138:396/426 of query aligns to 140:439/453 of 4itbA

query
sites
4itbA
A
 
A
S
 
A
L
 
P
S
 
A
I
 
L
K
 
M
S
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
V
C
 
A
I
 
V
L
 
L
R
x
K
G
 
H
G
x
A
S
|
S
E
 
N
A
 
V
I
 
-
D
 
-
S
 
P
N
 
Q
K
 
C
A
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
-
L
 
-
V
 
V
Q
 
E
Q
 
A
A
 
I
L
 
L
A
 
E
E
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
F
P
 
P
Q
 
E
D
 
G
A
 
V
V
 
F
Q
 
Q
L
 
T
V
 
L
Q
 
L
T
 
I
T
 
G
D
x
A
R
 
S
E
 
Q
A
 
-
V
|
V
G
 
E
Q
 
Q
L
 
V
I
 
I
A
 
K
M
 
D
P
 
P
Q
 
R
F
 
V
V
 
K
D
 
A
V
 
A
I
 
T
I
 
L
P
 
T
-
x
G
-
x
S
-
 
E
R
 
P
G
x
A
G
 
G
K
 
A
G
x
S
L
 
L
I
 
A
E
 
S
R
 
L
I
 
A
S
 
G
R
 
Q
D
 
E
A
 
I
K
 
K
V
 
-
P
 
P
V
 
T
I
 
L
K
 
L
H
x
E
L
|
L
D
 
G
G
 
G
N
 
S
C
 
D
H
 
P
T
 
F
Y
 
V
V
 
V
D
 
F
D
 
P
P
 
S
C
 
A
D
 
D
V
 
L
P
 
D
M
 
E
A
 
A
V
 
V
K
 
E
V
 
V
A
 
G
D
 
T
N
 
V
A
 
A
K
 
R
T
 
T
-
 
M
N
 
N
K
 
N
Y
 
G
S
 
Q
P
 
S
C
|
C
N
 
I
A
 
A
S
 
A
E
 
K
G
 
R
L
 
F
L
 
I
V
 
L
A
 
H
R
 
E
G
 
A
V
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
E
F
 
F
L
 
L
P
 
E
K
 
K
I
 
L
G
 
H
A
 
L
V
 
K
Y
 
F
A
 
A
A
 
S
K
 
L
G
 
K
V
 
I
E
 
G
M
 
D
R
 
P
G
 
M
C
 
A
P
 
P
E
 
E
S
 
T
-
 
D
-
 
I
-
 
G
-
 
P
L
 
L
A
 
A
-
 
T
-
 
E
-
 
G
I
 
I
L
 
L
Q
 
Q
S
 
D
V
 
I
-
 
S
-
 
R
-
 
Q
-
 
V
-
 
D
-
 
Q
-
 
A
-
 
V
-
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
L
 
I
-
 
L
-
 
L
-
 
G
-
 
G
-
 
R
-
 
P
-
 
L
-
 
D
-
 
R
-
 
A
-
 
G
-
 
Y
-
 
F
-
 
Y
-
 
P
-
 
P
-
 
T
-
 
I
-
 
L
-
 
T
-
 
E
V
 
I
P
 
P
A
 
P
T
 
G
E
 
A
Q
 
K
D
 
I
W
 
L
S
 
Q
E
 
E
E
|
E
Y
 
L
L
x
F
A
 
A
P
 
P
I
 
V
I
 
A
S
 
M
V
 
V
K
 
F
I
 
T
V
 
V
A
 
K
G
 
D
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
H
 
L
I
 
A
N
 
N
H
 
D
Y
 
I
S
 
P
S
 
F
H
 
G
H
 
L
T
 
G
D
 
A
A
 
S
I
 
A
L
 
W
T
 
T
T
 
N
N
 
D
H
 
P
V
 
A
H
 
E
A
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
F
 
F
L
 
I
R
 
Q
E
 
E
V
 
L
D
 
D
S
 
A
A
 
G
S
 
A
V
 
V
M
 
F
V
 
I
N
 
N
A
 
G
S
 
M
T
 
V
R
 
K
-
x
S
-
 
D
-
 
P
-
 
R
-
 
L
-
 
P
F
 
F
A
 
G
D
 
G
G
 
T
F
 
K
E
 
R
Y
 
S
G
 
G
L
 
Y
G
 
G
A
 
R
E
|
E
I
 
L
G
 
G
I
 
L
S
 
A

Sites not aligning to the query:

6gvsA Engineered glycolyl-coa reductase comprising 8 mutations with bound NADP+ (see paper)
26% identity, 70% coverage: 119:415/426 of query aligns to 104:424/441 of 6gvsA

query
sites
6gvsA
P
 
P
I
 
F
G
 
G
V
 
V
F
 
I
G
 
G
M
 
A
I
 
I
Y
 
T
-
x
P
E
x
T
S
 
T
R
 
N
P
 
P
N
 
T
V
 
E
T
 
T
I
 
I
E
 
V
A
 
C
A
 
N
S
 
S
L
 
I
S
 
G
-
 
M
I
 
L
K
 
A
S
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
S
C
 
V
I
 
V
L
 
F
R
 
S
G
 
P
G
x
H
S
 
G
E
 
R
A
 
A
I
 
R
D
 
Q
S
 
V
N
 
S
K
 
L
A
 
L
L
 
L
A
 
V
K
 
R
L
 
L
V
 
I
Q
 
N
Q
 
Q
A
 
K
L
 
L
A
 
A
E
 
A
A
 
L
G
 
G
L
 
A
P
 
P
Q
 
E
D
 
N
A
 
L
V
 
V
Q
 
V
L
 
T
V
 
V
Q
 
E
T
 
K
T
 
P
D
 
S
R
|
R
E
 
E
A
 
N
V
 
T
G
 
L
Q
 
A
L
 
M
I
 
M
A
 
A
M
 
H
P
 
P
Q
 
K
F
 
-
V
 
V
D
 
R
V
 
M
I
 
L
I
 
V
P
 
A
R
x
T
G
|
G
G
|
G
K
 
P
G
 
A
L
|
L
I
 
V
E
 
K
R
 
A
I
 
V
S
 
L
R
 
S
D
 
T
A
 
G
K
 
K
V
 
-
P
 
K
V
 
A
I
 
I
K
 
G
H
x
A
L
x
G
D
x
A
G
 
G
N
 
N
C
 
P
H
 
P
T
 
V
Y
 
V
V
 
V
D
 
D
D
 
E
P
 
T
C
 
A
D
 
N
V
 
I
-
 
E
P
 
K
M
 
A
A
 
A
V
 
C
K
 
D
V
 
I
A
 
V
D
 
N
N
 
G
A
 
C
K
 
S
T
 
F
N
 
D
K
 
N
Y
 
N
S
 
I
P
 
T
C
|
C
N
 
T
A
 
A
S
 
E
E
 
K
G
 
E
L
 
I
L
 
I
V
 
A
A
 
V
R
 
A
G
 
Q
V
 
I
A
 
A
A
 
D
E
 
Y
F
 
L
-
 
I
-
 
F
-
 
N
L
 
L
P
 
K
K
 
K
I
 
N
G
 
G
A
 
A
-
 
Y
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
D
-
 
P
-
 
A
-
 
V
-
 
L
-
 
Q
-
 
Q
-
 
L
-
 
Q
-
 
D
-
 
L
V
 
V
Y
 
L
A
 
T
A
 
A
K
 
K
G
 
G
V
 
G
E
 
P
M
 
Q
R
 
T
G
 
K
C
 
C
-
 
V
P
 
G
E
 
K
S
 
S
L
 
A
A
 
V
I
 
W
L
 
L
Q
 
L
S
 
S
V
 
Q
A
 
I
G
 
G
A
 
I
Q
 
S
L
 
V
-
 
D
-
 
A
-
 
S
-
 
I
-
 
K
-
 
I
-
 
I
-
 
L
-
 
M
-
 
E
V
 
V
P
 
P
A
 
R
T
 
E
E
 
H
Q
 
P
D
 
F
W
 
V
S
 
Q
E
 
E
E
|
E
Y
 
L
L
 
M
A
 
M
P
 
P
I
 
I
I
 
L
S
 
P
V
 
L
K
 
V
I
 
R
V
 
V
A
 
E
G
 
T
L
 
V
D
 
D
E
 
D
A
 
A
I
 
I
-
 
D
-
 
L
-
 
A
A
 
I
H
 
E
I
 
V
N
 
E
H
 
H
Y
 
D
S
 
N
S
 
R
H
|
H
H
 
-
T
 
-
D
 
T
A
 
A
I
 
I
L
 
M
T
 
H
T
 
S
N
 
T
H
 
D
V
 
V
H
 
R
A
 
K
Q
 
L
R
 
T
F
 
K
L
 
M
R
 
A
E
 
K
V
 
L
D
 
I
S
 
Q
A
 
T
S
 
T
V
 
I
M
 
F
V
 
V
N
 
K
A
 
N
S
 
G
T
 
P
R
 
S
F
 
Y
A
 
A
D
 
G
G
 
-
F
 
-
E
 
-
Y
 
H
G
 
G
L
 
A
G
 
G
A
 
G
E
 
E
I
 
-
G
 
G
I
 
Y
S
 
S
T
 
T
D
 
-
K
 
-
F
 
F
H
 
T
A
x
I
R
 
A
G
 
G
P
 
P
V
 
T
G
 
G
I
 
-
E
 
E
G
 
G
L
 
L
T
 
T
S
 
S
L
 
A
K
 
K

4yweA Crystal structure of a putative aldehyde dehydrogenase from burkholderia cenocepacia
23% identity, 74% coverage: 109:422/426 of query aligns to 126:476/476 of 4yweA

query
sites
4yweA
S
 
A
G
 
G
I
 
Y
R
 
T
V
 
V
G
 
L
Q
 
T
M
 
V
R
 
R
V
 
E
P
 
P
I
 
H
G
 
G
V
 
V
F
 
T
G
 
G
M
 
H
I
 
I
Y
 
V
E
 
P
S
 
W
R
x
N
P
 
Y
N
 
P
V
 
M
T
 
Q
I
 
I
E
 
F
A
 
G
A
 
R
S
 
S
L
 
V
-
 
G
-
 
A
S
 
A
I
 
L
K
 
A
S
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
C
 
C
I
 
V
L
 
V
R
x
K
G
 
P
G
 
A
S
 
E
E
x
D
A
 
A
I
 
C
D
 
L
S
 
S
N
 
V
K
 
L
A
 
R
L
 
V
A
 
A
K
 
E
L
 
L
V
 
A
Q
 
-
Q
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
A
E
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
Q
 
A
D
 
G
A
 
A
V
 
L
Q
 
N
L
 
I
V
 
V
Q
 
T
T
 
G
T
 
Y
D
 
G
R
 
H
E
 
E
A
 
A
V
 
G
G
 
A
Q
 
A
L
 
L
I
 
A
A
 
R
M
 
H
P
 
P
Q
 
G
F
 
I
V
 
D
D
 
H
V
 
I
I
 
S
I
 
F
-
 
T
-
 
G
-
 
S
P
 
P
R
 
A
G
 
T
G
 
G
K
 
K
G
 
-
L
 
L
I
 
V
E
 
T
R
 
Q
I
 
M
S
 
A
R
 
A
D
 
E
A
 
N
K
 
H
V
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
T
K
 
L
H
x
E
L
 
L
D
 
G
G
 
G
N
 
K
C
 
S
H
 
P
T
 
Q
Y
 
I
V
 
V
D
 
F
D
 
A
P
 
D
C
 
A
D
 
D
V
 
L
P
 
D
M
 
A
A
 
A
V
 
L
K
 
P
V
 
V
A
 
L
D
 
V
N
 
S
A
 
A
K
 
I
T
 
V
-
 
Q
N
 
N
K
 
G
Y
 
G
S
 
Q
P
 
T
C
|
C
N
 
S
A
 
A
S
 
G
E
 
S
G
 
R
L
 
V
L
 
L
V
 
I
A
 
E
R
 
R
G
 
A
V
 
V
A
 
Y
A
 
E
E
 
P
F
 
L
L
 
V
P
 
E
K
 
R
I
 
L
G
 
A
A
 
T
V
 
A
Y
 
F
-
 
N
-
 
G
-
 
L
-
 
R
-
 
V
-
 
G
-
 
P
-
 
S
-
 
R
-
 
A
-
 
D
-
 
L
-
 
D
-
 
C
-
 
G
-
 
P
-
 
L
-
 
I
-
 
N
-
 
A
-
 
K
-
 
Q
-
 
Q
-
 
Q
-
 
R
-
 
V
-
 
W
-
 
D
-
 
F
-
 
L
-
 
S
-
 
D
-
 
A
-
 
Q
-
 
H
-
 
D
-
 
G
-
 
I
-
 
P
-
 
M
A
 
A
A
 
A
K
 
H
G
 
G
V
 
Q
E
 
V
M
 
V
R
 
A
G
 
D
C
 
A
P
 
P
E
 
E
S
 
S
L
 
-
A
 
G
I
 
F
L
 
Y
Q
 
Q
S
 
A
V
 
P
A
 
A
G
 
L
A
 
L
Q
 
R
L
 
D
V
 
V
P
 
P
A
 
P
T
 
S
E
 
H
Q
 
R
D
 
L
W
 
A
S
 
Q
E
 
E
E
|
E
Y
 
V
L
 
F
A
 
G
P
 
P
I
 
V
I
 
L
S
 
A
V
 
A
K
 
M
I
 
R
V
 
F
A
 
V
G
 
D
L
 
E
D
 
D
E
 
E
A
 
A
I
 
V
A
 
A
H
 
L
I
 
A
N
 
N
H
 
G
Y
 
T
S
 
P
S
 
Y
H
 
G
H
 
L
T
 
V
D
 
A
A
 
G
I
 
I
L
 
W
T
 
T
T
 
R
N
 
D
H
 
G
V
 
A
H
 
R
A
 
Q
Q
 
M
R
 
R
F
 
L
L
 
A
R
 
R
E
 
R
V
 
L
D
 
R
S
 
A
A
 
G
S
 
Q
V
 
V
M
 
F
V
 
I
N
 
N
A
 
-
S
 
-
T
 
-
R
 
-
F
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
F
 
-
E
 
N
Y
 
Y
G
 
G
L
 
A
G
 
G
A
 
G
E
 
G
I
 
V
-
 
E
-
 
L
-
 
P
-
 
F
G
 
G
I
 
G
S
 
V
T
x
G
D
 
H
K
 
S
F
x
G
H
 
H
A
 
G
R
 
R
-
x
E
-
 
K
G
 
G
P
 
F
V
 
E
G
 
A
I
 
L
E
 
Y
G
 
G
L
 
F
T
 
T
S
 
A
L
 
L
K
 
K
Y
 
T
V
 
I
V
 
A
L
 
I
G
 
R
E
 
H
G
 
G

Sites not aligning to the query:

5jfmA Crystal structure of rhodopseudomonas palustris propionaldehyde dehydrogenase with bound propionyl-coa (see paper)
25% identity, 70% coverage: 119:415/426 of query aligns to 102:422/439 of 5jfmA

query
sites
5jfmA
P
 
P
I
 
F
G
 
G
V
 
V
F
 
I
G
 
G
M
 
A
I
|
I
Y
x
T
-
 
P
E
 
T
S
x
T
R
x
N
P
 
P
N
 
T
V
 
E
T
 
T
I
 
I
E
 
V
A
 
C
A
 
N
S
 
S
L
 
I
S
 
G
-
 
M
I
 
L
K
 
A
S
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
S
C
 
V
I
 
V
L
 
F
R
x
S
G
x
P
G
x
H
S
 
P
E
 
R
A
 
A
I
 
R
D
 
Q
S
 
V
N
 
S
K
 
L
A
 
L
L
 
L
A
 
V
K
 
R
L
 
L
V
 
I
Q
 
N
Q
 
Q
A
 
K
L
 
L
A
 
A
E
 
A
A
 
L
G
 
G
L
 
A
P
 
P
Q
 
E
D
 
N
A
 
L
V
 
V
Q
 
V
L
 
T
V
 
V
Q
 
E
T
 
K
T
 
P
D
 
S
R
x
I
E
 
E
A
 
N
V
 
T
G
 
N
Q
 
A
L
 
M
I
 
M
A
 
A
M
 
H
P
 
P
Q
 
K
F
 
-
V
 
V
D
 
R
V
 
M
I
 
L
I
 
V
P
 
A
R
x
T
G
|
G
G
|
G
K
 
P
G
 
A
L
 
I
I
 
V
E
 
K
R
 
A
I
 
V
S
 
L
R
 
S
D
 
T
A
 
G
K
 
K
V
 
-
P
 
K
V
 
A
I
 
I
K
 
G
H
x
A
L
 
G
D
 
A
G
 
G
N
 
N
C
 
P
H
 
P
T
 
V
Y
 
V
V
 
V
D
 
D
D
 
E
P
 
T
C
 
A
D
 
N
V
 
I
-
 
E
P
 
K
M
 
A
A
 
A
V
 
C
K
 
D
V
 
I
A
 
V
D
 
N
N
 
G
A
 
C
K
 
S
T
 
F
N
 
D
K
 
N
Y
 
N
S
 
L
P
|
P
C
|
C
N
 
V
A
 
A
S
 
E
E
 
K
G
 
E
L
 
I
L
 
I
V
 
A
A
 
V
R
 
A
G
 
Q
V
 
I
A
 
A
A
 
D
E
 
Y
F
 
L
-
 
I
-
 
F
-
 
N
L
 
L
P
 
K
K
 
K
I
 
N
G
 
G
A
 
A
-
 
Y
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
D
-
 
P
-
 
A
-
 
V
-
 
L
-
 
Q
-
 
Q
-
 
L
-
 
Q
-
 
D
-
 
L
V
 
V
Y
 
L
A
 
T
A
 
A
K
 
K
G
 
G
V
 
G
E
 
P
M
 
Q
R
 
T
G
 
K
C
 
C
-
 
V
P
 
G
E
 
K
S
 
S
L
 
A
A
 
V
I
 
W
L
 
L
Q
 
L
S
 
S
V
 
Q
A
 
I
G
 
G
A
 
I
Q
 
S
L
 
V
-
 
D
-
 
A
-
 
S
-
 
I
-
 
K
-
 
I
-
 
I
-
 
L
-
 
M
-
 
E
V
 
V
P
 
P
A
 
R
T
 
E
E
 
H
Q
 
P
D
 
F
W
 
V
S
 
Q
E
 
E
E
 
E
Y
 
L
L
 
M
A
 
M
P
 
P
I
 
I
I
 
L
S
 
P
V
 
L
K
 
V
I
 
R
V
 
V
A
 
E
G
 
T
L
 
V
D
 
D
E
 
D
A
 
A
I
 
I
-
 
D
-
 
L
-
 
A
A
 
I
H
 
E
I
 
V
N
 
E
H
 
H
Y
 
D
S
 
N
S
 
R
H
 
H
H
 
-
T
 
-
D
 
T
A
 
A
I
 
I
L
 
M
T
 
H
T
 
S
N
 
T
H
 
D
V
 
V
H
 
-
A
 
-
Q
 
-
R
 
-
F
 
-
L
 
-
R
 
R
E
 
K
V
 
L
D
 
T
S
 
K
A
 
M
S
 
A
V
 
K
M
 
L
V
 
I
N
 
Q
A
 
T
S
 
T
T
 
I
R
 
F
F
 
V
A
 
K
D
 
N
G
 
G
F
 
P
E
 
S
Y
 
Y
-
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
G
I
 
-
G
 
G
I
 
E
S
 
G
T
 
Y
D
 
S
K
 
T
F
 
F
H
 
T
A
 
I
R
 
A
G
 
G
P
 
P
V
 
T
G
 
G
I
 
-
E
 
E
G
 
G
L
 
L
T
 
T
S
 
S
L
 
A
K
 
K

5jflA Crystal structure of rhodopseudomonas palustris propionaldehyde dehydrogenase with bound NAD+ (see paper)
25% identity, 70% coverage: 119:415/426 of query aligns to 103:423/440 of 5jflA

query
sites
5jflA
P
 
P
I
 
F
G
 
G
V
 
V
F
 
I
G
 
G
M
 
A
I
|
I
Y
x
T
-
x
P
E
x
T
S
x
T
R
 
N
P
 
P
N
 
T
V
 
E
T
 
T
I
 
I
E
 
V
A
 
C
A
 
N
S
 
S
L
 
I
S
 
G
-
 
M
I
 
L
K
 
A
S
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
S
C
 
V
I
 
V
L
 
F
R
 
S
G
 
P
G
x
H
S
 
P
E
 
R
A
 
A
I
 
R
D
 
Q
S
 
V
N
 
S
K
 
L
A
 
L
L
 
L
A
 
V
K
 
R
L
 
L
V
 
I
Q
 
N
Q
 
Q
A
 
K
L
 
L
A
 
A
E
 
A
A
 
L
G
 
G
L
 
A
P
 
P
Q
 
E
D
 
N
A
 
L
V
 
V
Q
 
V
L
 
T
V
 
V
Q
 
E
T
 
K
T
 
P
D
 
S
R
x
I
E
 
E
A
 
N
V
 
T
G
 
N
Q
 
A
L
 
M
I
 
M
A
 
A
M
 
H
P
 
P
Q
 
K
F
 
-
V
 
V
D
 
R
V
 
M
I
 
L
I
 
V
P
 
A
R
x
T
G
|
G
G
 
G
K
 
P
G
 
A
L
x
I
I
 
V
E
 
K
R
 
A
I
 
V
S
 
L
R
 
S
D
 
T
A
 
G
K
 
K
V
 
-
P
 
K
V
 
A
I
 
I
K
 
G
H
x
A
L
x
G
D
x
A
G
 
G
N
 
N
C
 
P
H
 
P
T
 
V
Y
 
V
V
 
V
D
 
D
D
 
E
P
 
T
C
 
A
D
 
N
V
 
I
-
 
E
P
 
K
M
 
A
A
 
A
V
 
C
K
 
D
V
 
I
A
 
V
D
 
N
N
 
G
A
 
C
K
 
S
T
 
F
N
 
D
K
 
N
Y
 
N
S
 
L
P
 
P
C
|
C
N
 
V
A
 
A
S
 
E
E
 
K
G
 
E
L
 
I
L
 
I
V
 
A
A
 
V
R
 
A
G
 
Q
V
 
I
A
 
A
A
 
D
E
 
Y
F
 
L
-
 
I
-
 
F
-
 
N
L
 
L
P
 
K
K
 
K
I
 
N
G
 
G
A
 
A
-
 
Y
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
D
-
 
P
-
 
A
-
 
V
-
 
L
-
 
Q
-
 
Q
-
 
L
-
 
Q
-
 
D
-
 
L
V
 
V
Y
 
L
A
 
T
A
 
A
K
 
K
G
 
G
V
 
G
E
 
P
M
 
Q
R
 
T
G
 
K
C
 
C
-
 
V
P
 
G
E
 
K
S
 
S
L
 
A
A
 
V
I
 
W
L
 
L
Q
 
L
S
 
S
V
 
Q
A
 
I
G
 
G
A
 
I
Q
 
S
L
 
V
-
 
D
-
 
A
-
 
S
-
 
I
-
 
K
-
 
I
-
 
I
-
 
L
-
 
M
-
 
E
V
 
V
P
 
P
A
 
R
T
 
E
E
 
H
Q
 
P
D
 
F
W
 
V
S
 
Q
E
 
E
E
|
E
Y
 
L
L
 
M
A
 
M
P
 
P
I
 
I
I
 
L
S
 
P
V
 
L
K
 
V
I
 
R
V
 
V
A
 
E
G
 
T
L
 
V
D
 
D
E
 
D
A
 
A
I
 
I
-
 
D
-
 
L
-
 
A
A
 
I
H
 
E
I
 
V
N
 
E
H
 
H
Y
 
D
S
 
N
S
 
R
H
|
H
H
 
-
T
 
-
D
 
T
A
 
A
I
 
I
L
 
M
T
 
H
T
 
S
N
 
T
H
 
D
V
 
V
H
 
-
A
 
-
Q
 
-
R
 
-
F
 
-
L
 
-
R
 
R
E
 
K
V
 
L
D
 
T
S
 
K
A
 
M
S
 
A
V
 
K
M
 
L
V
 
I
N
 
Q
A
 
T
S
 
T
T
 
I
R
 
F
F
 
V
A
 
K
D
 
N
G
 
G
F
 
P
E
 
S
Y
 
Y
-
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
G
I
 
-
G
 
G
I
 
E
S
 
G
T
 
Y
D
 
S
K
 
T
F
|
F
H
x
T
A
x
I
R
 
A
G
 
G
P
 
P
V
 
T
G
 
G
I
 
-
E
 
E
G
 
G
L
 
L
T
 
T
S
 
S
L
 
A
K
 
K

5jfmB Crystal structure of rhodopseudomonas palustris propionaldehyde dehydrogenase with bound propionyl-coa (see paper)
25% identity, 70% coverage: 119:415/426 of query aligns to 115:435/452 of 5jfmB

query
sites
5jfmB
P
 
P
I
 
F
G
 
G
V
 
V
F
 
I
G
 
G
M
 
A
I
|
I
Y
 
T
-
x
P
E
x
T
S
x
T
R
x
N
P
 
P
N
 
T
V
 
E
T
 
T
I
 
I
E
 
V
A
 
C
A
 
N
S
 
S
L
 
I
S
 
G
-
 
M
I
 
L
K
 
A
S
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
S
C
 
V
I
 
V
L
 
F
R
 
S
G
x
P
G
x
H
S
 
P
E
 
R
A
 
A
I
 
R
D
 
Q
S
 
V
N
 
S
K
 
L
A
 
L
L
 
L
A
 
V
K
 
R
L
 
L
V
 
I
Q
 
N
Q
 
Q
A
 
K
L
 
L
A
 
A
E
 
A
A
 
L
G
 
G
L
 
A
P
 
P
Q
 
E
D
 
N
A
 
L
V
 
V
Q
 
V
L
 
T
V
 
V
Q
 
E
T
 
K
T
 
P
D
x
S
R
x
I
E
 
E
A
 
N
V
x
T
G
 
N
Q
 
A
L
 
M
I
 
M
A
 
A
M
 
H
P
 
P
Q
 
K
F
 
-
V
 
V
D
 
R
V
 
M
I
 
L
I
 
V
P
 
A
R
x
T
G
|
G
G
|
G
K
 
P
G
 
A
L
 
I
I
 
V
E
 
K
R
 
A
I
 
V
S
 
L
R
 
S
D
 
T
A
 
G
K
 
K
V
 
-
P
 
K
V
 
A
I
 
I
K
 
G
H
x
A
L
 
G
D
 
A
G
 
G
N
 
N
C
 
P
H
 
P
T
 
V
Y
 
V
V
 
V
D
 
D
D
 
E
P
 
T
C
 
A
D
 
N
V
 
I
-
 
E
P
 
K
M
 
A
A
 
A
V
 
C
K
 
D
V
 
I
A
 
V
D
 
N
N
 
G
A
 
C
K
 
S
T
 
F
N
 
D
K
 
N
Y
 
N
S
 
L
P
 
P
C
|
C
N
 
V
A
 
A
S
 
E
E
 
K
G
 
E
L
 
I
L
 
I
V
 
A
A
 
V
R
 
A
G
 
Q
V
 
I
A
 
A
A
 
D
E
 
Y
F
 
L
-
 
I
-
 
F
-
 
N
L
 
L
P
 
K
K
 
K
I
 
N
G
 
G
A
 
A
-
 
Y
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
D
-
 
P
-
 
A
-
 
V
-
 
L
-
 
Q
-
 
Q
-
 
L
-
 
Q
-
 
D
-
 
L
V
 
V
Y
 
L
A
 
T
A
 
A
K
 
K
G
 
G
V
 
G
E
 
P
M
 
Q
R
x
T
G
 
K
C
 
C
-
 
V
P
 
G
E
 
K
S
 
S
L
 
A
A
 
V
I
 
W
L
 
L
Q
 
L
S
 
S
V
 
Q
A
 
I
G
 
G
A
 
I
Q
 
S
L
 
V
-
 
D
-
 
A
-
 
S
-
 
I
-
 
K
-
 
I
-
 
I
-
 
L
-
 
M
-
 
E
V
 
V
P
 
P
A
 
R
T
 
E
E
 
H
Q
 
P
D
 
F
W
 
V
S
 
Q
E
 
E
E
 
E
Y
 
L
L
 
M
A
 
M
P
 
P
I
 
I
I
 
L
S
 
P
V
 
L
K
 
V
I
 
R
V
 
V
A
 
E
G
 
T
L
 
V
D
 
D
E
 
D
A
 
A
I
 
I
-
 
D
-
 
L
-
 
A
A
 
I
H
 
E
I
 
V
N
 
E
H
 
H
Y
 
D
S
 
N
S
 
R
H
 
H
H
 
-
T
 
-
D
 
T
A
 
A
I
 
I
L
 
M
T
 
H
T
 
S
N
 
T
H
 
D
V
 
V
H
 
-
A
 
-
Q
 
-
R
 
-
F
 
-
L
 
-
R
 
R
E
 
K
V
 
L
D
 
T
S
 
K
A
 
M
S
 
A
V
 
K
M
 
L
V
 
I
N
 
Q
A
 
T
S
 
T
T
 
I
R
 
F
F
 
V
A
 
K
D
 
N
G
 
G
F
 
P
E
 
S
Y
 
Y
-
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
G
I
 
-
G
 
G
I
 
E
S
 
G
T
 
Y
D
 
S
K
 
T
F
 
F
H
 
T
A
 
I
R
 
A
G
 
G
P
 
P
V
 
T
G
 
G
I
 
-
E
 
E
G
 
G
L
 
L
T
 
T
S
 
S
L
 
A
K
 
K

7bvpA Adhe spirosome in extended conformation (see paper)
29% identity, 35% coverage: 119:265/426 of query aligns to 103:249/869 of 7bvpA

query
sites
7bvpA
P
 
P
I
 
I
G
 
G
V
 
I
F
 
I
-
 
C
G
 
G
M
 
I
I
 
V
Y
x
P
E
x
T
S
 
T
R
 
N
P
 
P
N
 
T
V
 
S
T
 
T
-
 
A
I
 
I
E
 
F
A
 
K
A
 
S
S
 
L
L
 
I
S
 
S
I
 
L
K
 
K
S
 
T
G
 
R
N
 
N
A
 
A
C
 
I
I
 
I
L
 
F
R
 
S
G
 
P
G
x
H
S
 
P
E
 
R
A
 
A
I
 
K
D
 
D
S
 
A
N
 
T
K
 
N
A
 
K
L
 
A
A
 
A
K
 
D
L
 
I
V
 
V
Q
 
L
Q
 
Q
A
 
A
L
 
A
A
 
I
E
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
A
P
 
P
Q
 
K
D
 
D
A
 
L
V
 
I
Q
 
G
L
 
W
V
 
I
Q
 
D
T
 
Q
T
 
P
D
 
S
R
 
V
E
 
E
A
 
L
V
 
S
G
 
N
Q
 
A
L
 
L
I
 
M
A
 
H
M
 
H
P
 
P
Q
 
D
F
 
-
V
 
I
D
 
N
V
 
L
I
 
I
I
 
L
P
 
A
R
 
T
G
|
G
G
|
G
K
 
P
G
 
G
L
x
M
I
 
V
E
 
K
R
 
A
I
 
A
S
 
Y
R
 
S
D
 
S
A
 
G
K
 
K
V
 
-
P
 
P
V
 
A
I
 
I
K
 
G
H
x
V
L
x
G
D
x
A
G
 
G
N
 
N
C
 
T
H
 
P
T
 
V
Y
 
V
V
 
I
D
 
D
D
 
E
P
 
T
C
 
A
D
 
D
V
 
I
P
 
K
M
 
R
A
 
A
V
 
V
K
 
A
V
 
S
A
 
V
D
 
L
N
 
M
A
 
S
K
 
K
T
 
T
N
 
F
K
 
D
Y
 
N
S
 
G
P
 
V
C
 
I
N
x
C
A
 
A
S
 
S
E
 
E

Sites not aligning to the query:

6tqmA Escherichia coli adhe structure in its compact conformation (see paper)
29% identity, 35% coverage: 119:265/426 of query aligns to 103:249/869 of 6tqmA

query
sites
6tqmA
P
 
P
I
 
I
G
 
G
V
 
I
F
 
I
-
 
C
G
 
G
M
 
I
I
 
V
Y
 
P
E
 
T
S
 
T
R
 
N
P
 
P
N
 
T
V
 
S
T
 
T
-
 
A
I
 
I
E
 
F
A
 
K
A
 
S
S
 
L
L
 
I
S
 
S
I
 
L
K
 
K
S
 
T
G
 
R
N
 
N
A
 
A
C
 
I
I
 
I
L
 
F
R
 
S
G
 
P
G
 
H
S
 
P
E
 
R
A
 
A
I
 
K
D
 
D
S
 
A
N
 
T
K
 
N
A
 
K
L
 
A
A
 
A
K
 
D
L
 
I
V
 
V
Q
 
L
Q
 
Q
A
 
A
L
 
A
A
 
I
E
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
A
P
 
P
Q
 
K
D
 
D
A
 
L
V
 
I
Q
 
G
L
 
W
V
 
I
Q
 
D
T
 
Q
T
 
P
D
 
S
R
 
V
E
 
E
A
 
L
V
 
S
G
 
N
Q
 
A
L
 
L
I
 
M
A
 
H
M
 
H
P
 
P
Q
 
D
F
 
-
V
 
I
D
 
N
V
 
L
I
 
I
I
 
L
P
 
A
R
 
T
G
 
G
G
 
G
K
 
P
G
 
G
L
 
M
I
 
V
E
 
K
R
 
A
I
 
A
S
 
Y
R
 
S
D
 
S
A
 
G
K
 
K
V
 
-
P
 
P
V
 
A
I
 
I
K
 
G
H
 
V
L
 
G
D
 
A
G
 
G
N
 
N
C
 
T
H
 
P
T
 
V
Y
 
V
V
 
I
D
 
D
D
 
E
P
 
T
C
 
A
D
 
D
V
 
I
P
 
K
M
 
R
A
 
A
V
 
V
K
 
A
V
 
S
A
 
V
D
 
L
N
 
M
A
 
S
K
 
K
T
 
T
N
 
F
K
 
D
Y
 
N
S
 
G
P
 
V
C
 
I
N
 
C
A
 
A
S
 
S
E
 
E

Sites not aligning to the query:

P0A9Q7 Bifunctional aldehyde-alcohol dehydrogenase AdhE; Alcohol dehydrogenase E; EC 1.2.1.10; EC 1.1.1.1 from Escherichia coli (strain K12) (see 8 papers)
29% identity, 35% coverage: 119:265/426 of query aligns to 103:249/891 of P0A9Q7

query
sites
P0A9Q7
P
 
P
I
 
I
G
 
G
V
 
I
F
 
I
-
 
C
G
 
G
M
x
I
I
x
V
Y
x
P
E
x
T
S
x
T
R
x
N
P
 
P
N
 
T
V
 
S
T
 
T
-
 
A
I
 
I
E
 
F
A
 
K
A
 
S
S
 
L
L
 
I
S
 
S
I
 
L
K
 
K
S
 
T
G
 
R
N
 
N
A
 
A
C
 
I
I
 
I
L
 
F
R
 
S
G
 
P
G
 
H
S
 
P
E
 
R
A
 
A
I
 
K
D
 
D
S
 
A
N
 
T
K
 
N
A
 
K
L
 
A
A
 
A
K
 
D
L
 
I
V
 
V
Q
 
L
Q
 
Q
A
 
A
L
 
A
A
 
I
E
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
A
P
 
P
Q
 
K
D
 
D
A
 
L
V
 
I
Q
 
G
L
 
W
V
 
I
Q
 
D
T
 
Q
T
 
P
D
 
S
R
 
V
E
 
E
A
 
L
V
 
S
G
 
N
Q
 
A
L
 
L
I
 
M
A
 
H
M
 
H
P
 
P
Q
 
D
F
 
-
V
 
I
D
 
N
V
 
L
I
 
I
I
 
L
P
 
A
R
 
T
G
 
G
G
|
G
K
 
P
G
 
G
L
 
M
I
 
V
E
 
K
R
 
A
I
 
A
S
 
Y
R
 
S
D
 
S
A
 
G
K
 
K
V
 
-
P
 
P
V
 
A
I
 
I
K
 
G
H
 
V
L
x
G
D
 
A
G
 
G
N
 
N
C
 
T
H
 
P
T
 
V
Y
 
V
V
 
I
D
 
D
D
 
E
P
 
T
C
 
A
D
 
D
V
 
I
P
 
K
M
 
R
A
 
A
V
 
V
K
 
A
V
 
S
A
 
V
D
 
L
N
 
M
A
 
S
K
 
K
T
 
T
N
 
F
K
 
D
Y
 
N
S
 
G
P
 
V
C
 
I
N
 
C
A
 
A
S
 
S
E
 
E

Sites not aligning to the query:

P0A9Q8 Bifunctional aldehyde-alcohol dehydrogenase AdhE; Alcohol dehydrogenase E; EC 1.2.1.10; EC 1.1.1.1 from Escherichia coli O157:H7 (see paper)
29% identity, 35% coverage: 119:265/426 of query aligns to 103:249/891 of P0A9Q8

query
sites
P0A9Q8
P
 
P
I
 
I
G
 
G
V
 
I
F
 
I
-
 
C
G
 
G
M
 
I
I
 
V
Y
 
P
E
 
T
S
 
T
R
 
N
P
 
P
N
 
T
V
 
S
T
 
T
-
 
A
I
 
I
E
 
F
A
 
K
A
 
S
S
 
L
L
 
I
S
 
S
I
 
L
K
 
K
S
 
T
G
 
R
N
 
N
A
 
A
C
 
I
I
 
I
L
 
F
R
 
S
G
 
P
G
 
H
S
 
P
E
 
R
A
 
A
I
 
K
D
 
D
S
 
A
N
 
T
K
 
N
A
 
K
L
 
A
A
 
A
K
 
D
L
 
I
V
 
V
Q
 
L
Q
 
Q
A
 
A
L
 
A
A
 
I
E
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
A
P
 
P
Q
 
K
D
 
D
A
 
L
V
 
I
Q
 
G
L
 
W
V
 
I
Q
 
D
T
 
Q
T
 
P
D
 
S
R
 
V
E
 
E
A
 
L
V
 
S
G
 
N
Q
 
A
L
 
L
I
 
M
A
 
H
M
 
H
P
 
P
Q
 
D
F
 
-
V
 
I
D
 
N
V
 
L
I
 
I
I
 
L
P
 
A
R
 
T
G
 
G
G
 
G
K
 
P
G
 
G
L
 
M
I
 
V
E
 
K
R
 
A
I
 
A
S
 
Y
R
 
S
D
 
S
A
 
G
K
 
K
V
 
-
P
 
P
V
 
A
I
 
I
K
 
G
H
 
V
L
 
G
D
 
A
G
 
G
N
 
N
C
 
T
H
 
P
T
 
V
Y
 
V
V
 
I
D
 
D
D
 
E
P
 
T
C
 
A
D
 
D
V
 
I
P
 
K
M
 
R
A
 
A
V
 
V
K
 
A
V
 
S
A
 
V
D
 
L
N
 
M
A
 
S
K
 
K
T
 
T
N
 
F
K
 
D
Y
 
N
S
 
G
P
 
V
C
 
I
N
 
C
A
 
A
S
 
S
E
 
E

Sites not aligning to the query:

3vz3A Structural insights into substrate and cofactor selection by sp2771 (see paper)
25% identity, 61% coverage: 138:396/426 of query aligns to 140:439/453 of 3vz3A

query
sites
3vz3A
A
 
A
S
 
A
L
 
P
S
 
A
I
 
L
K
 
M
S
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
V
C
 
A
I
 
V
L
 
L
R
x
K
G
 
H
G
x
A
S
|
S
E
 
N
A
 
V
I
 
-
D
 
-
S
 
P
N
 
Q
K
 
C
A
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
-
L
 
-
V
 
V
Q
 
E
Q
 
A
A
 
I
L
 
L
A
 
E
E
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
F
P
 
P
Q
 
E
D
 
G
A
 
V
V
 
F
Q
 
Q
L
 
T
V
 
L
Q
 
L
T
 
I
T
 
G
D
x
A
R
 
S
E
 
Q
A
 
-
V
|
V
G
 
E
Q
 
Q
L
 
V
I
 
I
A
 
K
M
 
D
P
 
P
Q
 
R
F
 
V
V
 
K
D
 
A
V
 
A
I
 
T
I
 
L
P
x
T
-
x
G
-
x
S
-
 
E
R
 
P
G
x
A
G
 
G
K
 
A
G
 
S
L
 
L
I
 
A
E
 
S
R
 
L
I
 
A
S
 
G
R
 
Q
D
 
E
A
 
I
K
 
K
V
 
-
P
 
P
V
 
T
I
 
L
K
 
L
H
x
E
L
|
L
D
x
G
G
 
G
N
 
S
C
 
D
H
 
P
T
 
F
Y
 
V
V
 
V
D
 
F
D
 
P
P
 
S
C
 
A
D
 
D
V
 
L
P
 
D
M
 
E
A
 
A
V
 
V
K
 
E
V
 
V
A
 
G
D
 
T
N
 
V
A
 
A
K
 
R
T
 
T
-
 
M
N
 
N
K
 
N
Y
 
G
S
 
Q
P
x
S
C
x
A
N
x
I
A
 
A
S
 
A
E
 
K
G
 
R
L
 
F
L
 
I
V
 
L
A
 
H
R
 
E
G
 
A
V
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
E
F
 
F
L
 
L
P
 
E
K
 
K
I
 
L
G
 
H
A
 
L
V
 
K
Y
 
F
A
 
A
A
 
S
K
 
L
G
 
K
V
 
I
E
 
G
M
 
D
R
 
P
G
 
M
C
 
A
P
 
P
E
 
E
S
 
T
-
 
D
-
 
I
-
 
G
-
 
P
L
 
L
A
 
A
-
 
T
-
 
E
-
 
G
I
 
I
L
 
L
Q
 
Q
S
 
D
V
 
I
-
 
S
-
 
R
-
 
Q
-
 
V
-
 
D
-
 
Q
-
 
A
-
 
V
-
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
L
 
I
-
 
L
-
 
L
-
 
G
-
 
G
-
 
R
-
 
P
-
 
L
-
 
D
-
 
R
-
 
A
-
 
G
-
 
Y
-
 
F
-
 
Y
-
 
P
-
 
P
-
 
T
-
 
I
-
 
L
-
 
T
-
 
E
V
 
I
P
 
P
A
 
P
T
 
G
E
 
A
Q
 
K
D
 
I
W
 
L
S
 
Q
E
 
E
E
|
E
Y
 
L
L
x
F
A
 
A
P
 
P
I
 
V
I
 
A
S
 
M
V
 
V
K
 
F
I
 
T
V
 
V
A
 
K
G
 
D
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
H
 
L
I
 
A
N
 
N
H
 
D
Y
 
I
S
 
P
S
 
F
H
 
G
H
 
L
T
 
G
D
 
A
A
 
S
I
 
A
L
 
W
T
 
T
T
 
N
N
 
D
H
 
P
V
 
A
H
 
E
A
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
F
 
F
L
 
I
R
 
Q
E
 
E
V
 
L
D
 
D
S
 
A
A
 
G
S
 
A
V
 
V
M
 
F
V
 
I
N
 
N
A
 
G
S
 
M
T
 
V
R
 
K
-
x
S
-
 
D
-
 
P
-
 
R
-
 
L
-
 
P
F
 
F
A
 
G
D
 
G
G
 
T
F
 
K
E
 
R
Y
 
S
G
 
G
L
 
Y
G
 
G
A
 
R
E
|
E
I
 
L
G
 
G
I
 
L
S
 
A

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>Ac3H11_704 FitnessBrowser__acidovorax_3H11:Ac3H11_704
MNALHVAEYTHSLGLQAKTASALMAKAPAAIKNKALKALARLLRENVDALQIDNARDLER
ARAAGLAEPMVDRLKLSPKVLETCAEGCEQLAAMPDIIGEILGMKQQPSGIRVGQMRVPI
GVFGMIYESRPNVTIEAASLSIKSGNACILRGGSEAIDSNKALAKLVQQALAEAGLPQDA
VQLVQTTDREAVGQLIAMPQFVDVIIPRGGKGLIERISRDAKVPVIKHLDGNCHTYVDDP
CDVPMAVKVADNAKTNKYSPCNASEGLLVARGVAAEFLPKIGAVYAAKGVEMRGCPESLA
ILQSVAGAQLVPATEQDWSEEYLAPIISVKIVAGLDEAIAHINHYSSHHTDAILTTNHVH
AQRFLREVDSASVMVNASTRFADGFEYGLGAEIGISTDKFHARGPVGIEGLTSLKYVVLG
EGEVRG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory