SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing BPHYT_RS03235 FitnessBrowser__BFirm:BPHYT_RS03235 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

7borA Structure of pseudomonas aeruginosa coa-bound odaa (see paper)
46% identity, 95% coverage: 5:247/256 of query aligns to 4:247/247 of 7borA

query
sites
7borA
I
 
I
L
 
R
V
 
V
E
 
E
R
 
R
A
 
E
D
 
T
G
 
G
V
 
L
L
 
L
T
 
T
I
 
L
A
 
R
F
 
L
N
 
D
R
 
R
P
 
Q
D
|
D
K
|
K
K
 
K
N
 
N
A
|
A
I
 
L
T
 
T
A
 
R
A
 
A
M
 
M
Y
 
Y
Q
 
S
T
 
R
M
 
M
A
 
A
D
 
E
A
 
A
L
 
L
V
 
L
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q
G
 
A
D
 
D
A
 
T
A
 
A
V
 
V
R
 
R
A
 
V
I
 
V
L
 
L
I
 
I
R
 
T
G
 
G
S
 
G
A
 
D
G
 
A
I
 
C
F
 
F
S
 
T
A
x
S
G
 
G
N
|
N
D
 
D
L
x
I
E
 
L
D
 
D
F
|
F
M
 
L
K
 
E
T
 
Q
P
 
P
P
 
P
M
 
S
G
 
L
E
 
R
H
x
D
A
 
S
P
 
P
V
 
V
F
x
G
Q
 
R
F
 
F
L
 
M
R
 
S
A
 
A
I
 
L
S
 
L
S
 
E
A
 
F
E
 
P
K
 
K
P
 
P
V
 
V
V
 
I
A
 
A
S
 
A
V
 
V
A
 
N
G
 
G
A
 
P
A
 
A
V
|
V
G
 
G
I
|
I
G
 
G
T
 
T
T
|
T
L
 
L
L
 
L
L
 
L
H
 
H
C
 
C
D
 
D
L
 
L
V
 
V
Y
 
F
A
 
V
A
 
G
D
 
R
T
 
N
A
 
A
S
 
R
F
 
L
S
 
K
L
 
M
P
 
P
F
|
F
T
 
V
Q
 
N
L
|
L
G
 
G
L
|
L
C
 
T
P
|
P
E
|
E
A
 
F
A
 
G
S
 
S
S
 
S
L
 
L
L
 
I
L
 
L
P
 
P
R
 
R
A
 
M
A
 
L
G
 
G
Y
 
H
Q
 
A
A
 
K
A
 
A
A
 
A
E
 
E
K
 
L
L
 
L
L
 
M
L
 
L
G
 
G
E
 
Q
A
 
D
F
 
F
D
 
S
A
 
G
A
 
E
E
 
Q
A
 
A
Q
 
A
R
 
A
M
 
W
G
 
G
F
 
L
V
 
A
N
 
N
R
 
A
V
 
A
L
 
L
P
 
E
-
 
D
A
 
G
S
 
A
E
 
T
V
 
V
D
 
L
A
 
E
F
 
H
A
 
A
A
 
R
S
 
D
Q
 
A
A
 
A
A
 
R
K
 
R
L
 
F
A
 
L
A
 
H
L
 
L
P
 
A
A
 
P
S
 
S
S
 
A
L
 
V
R
 
V
V
 
E
T
 
S
K
 
K
S
 
R
L
 
L
M
 
M
K
 
K
R
 
A
A
 
P
S
 
F
H
 
I
Q
 
E
E
 
E
L
 
L
Q
 
R
T
 
R
Q
 
V
M
 
I
S
x
A
E
 
E
E
 
E
A
 
G
V
 
D
H
 
I
F
 
F
G
 
S
K
 
T
M
 
R
L
|
L
L
 
R
A
 
S
P
 
P
E
 
E
A
 
A
R
 
I
E
 
E
A
 
A
F
 
L
K
 
S
A
 
A
F
|
F
F
 
M
E
 
H
K
x
R

6slbAAA Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase (see paper)
40% identity, 97% coverage: 5:253/256 of query aligns to 5:255/257 of 6slbAAA

query
sites
6slbAAA
I
 
I
L
 
L
V
 
K
E
 
E
R
 
R
A
 
Q
D
 
D
G
 
G
V
 
V
L
 
L
T
 
V
I
 
L
A
 
T
F
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
D
 
E
K
 
K
K
 
L
N
 
N
A
 
A
I
 
I
T
 
T
A
 
G
A
 
E
M
 
L
Y
 
L
Q
 
D
T
 
A
M
 
L
A
 
Y
D
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
K
E
 
E
A
 
G
Q
 
E
G
 
E
D
 
D
A
 
R
A
 
E
V
 
V
R
 
R
A
 
A
I
 
L
L
 
L
I
 
L
R
 
T
G
 
G
S
 
A
A
 
G
G
x
R
I
 
A
F
 
F
S
 
S
A
|
A
G
 
G
N
x
Q
D
|
D
L
|
L
E
 
T
D
 
E
F
|
F
M
 
G
K
 
D
T
 
R
P
 
K
P
 
P
M
 
D
G
x
Y
E
 
E
-
 
A
H
 
H
A
x
L
P
 
R
V
 
R
F
 
Y
-
x
N
Q
 
R
F
 
V
L
 
V
R
 
E
A
 
A
I
 
L
S
 
S
S
 
G
A
 
L
E
 
E
K
 
K
P
 
P
V
 
L
V
 
V
A
 
V
S
 
A
V
 
V
A
 
N
G
 
G
A
 
V
A
 
A
V
 
A
G
 
G
I
x
A
G
 
G
T
 
M
T
x
S
L
 
L
L
 
A
L
 
L
H
 
W
C
 
G
D
 
D
L
 
L
V
 
R
Y
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
V
T
 
G
A
 
A
S
 
S
F
 
F
S
 
T
L
 
T
P
x
A
F
|
F
T
 
V
Q
 
R
L
 
I
G
 
G
L
|
L
C
 
V
P
|
P
E
x
D
A
 
S
A
 
G
S
 
L
S
 
S
L
 
F
L
 
L
L
 
L
P
 
P
R
 
R
A
 
L
A
 
V
G
 
G
Y
 
L
Q
 
A
A
 
K
A
 
A
A
 
Q
E
 
E
K
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
L
G
 
S
E
 
P
A
 
R
F
 
L
D
 
S
A
 
A
A
 
E
E
 
E
A
 
A
Q
 
L
R
 
A
M
 
L
G
 
G
F
 
L
V
 
V
N
 
H
R
 
R
V
 
V
L
 
V
P
 
P
A
 
A
S
 
E
E
 
K
V
 
L
D
 
M
A
 
E
F
 
E
A
 
A
A
 
L
S
 
S
Q
 
L
A
 
A
A
 
K
K
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
Q
L
 
G
P
 
P
A
 
T
S
 
R
S
 
A
L
 
Y
R
 
A
V
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
K
L
 
L
M
 
L
K
 
L
R
 
E
A
 
T
S
 
Y
H
 
R
Q
 
L
E
 
S
L
 
L
Q
 
T
T
 
E
Q
 
A
M
 
L
S
x
A
E
 
L
E
 
E
A
 
A
V
 
V
H
 
L
F
 
Q
G
 
G
K
 
Q
M
 
A
L
x
G
L
 
Q
A
 
T
P
 
Q
E
 
D
A
 
H
R
 
E
E
 
E
A
 
G
F
 
V
K
 
R
A
 
A
F
 
F
F
 
R
E
 
E
K
 
K
R
 
R
K
 
P
P
 
P
D
 
R
F
 
F
R
 
Q

6slaAAA Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase (see paper)
39% identity, 97% coverage: 5:253/256 of query aligns to 2:243/245 of 6slaAAA

query
sites
6slaAAA
I
 
I
L
 
L
V
 
K
E
 
E
R
 
R
A
 
Q
D
 
D
G
 
G
V
 
V
L
 
L
T
 
V
I
 
L
A
 
T
F
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
D
 
E
K
 
K
K
x
L
N
 
N
A
 
A
I
 
I
T
 
T
A
 
G
A
 
E
M
 
L
Y
 
L
Q
 
D
T
 
A
M
 
L
A
 
Y
D
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
K
E
 
E
A
 
G
Q
 
E
G
 
E
D
 
D
A
 
R
A
 
E
V
 
V
R
 
R
A
 
A
I
 
L
L
 
L
I
 
L
R
 
T
G
 
G
S
 
A
A
 
G
G
 
R
I
 
A
F
 
F
S
 
S
A
|
A
G
 
G
N
x
Q
D
|
D
L
|
L
E
 
T
D
 
E
F
 
-
M
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
-
P
 
-
M
 
-
G
 
-
E
 
A
H
 
H
A
x
L
P
 
R
V
 
R
F
x
Y
-
x
N
Q
 
R
F
 
V
L
 
V
R
 
E
A
 
A
I
 
L
S
 
S
S
 
G
A
 
L
E
 
E
K
 
K
P
 
P
V
 
L
V
 
V
A
 
V
S
 
A
V
 
V
A
 
N
G
 
G
A
 
V
A
 
A
V
x
A
G
|
G
I
x
A
G
 
G
T
 
M
T
x
S
L
 
L
L
 
A
L
 
L
H
 
W
C
 
G
D
 
D
L
 
L
V
 
R
Y
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
V
T
 
G
A
 
A
S
 
S
F
 
F
S
 
T
L
 
T
P
x
A
F
|
F
T
 
V
Q
 
R
L
x
I
G
 
G
L
|
L
C
 
V
P
|
P
E
x
N
A
 
S
A
 
G
S
 
L
S
 
S
L
 
F
L
 
L
L
 
L
P
 
P
R
 
R
A
 
L
A
 
V
G
 
G
Y
 
L
Q
 
A
A
 
K
A
 
A
A
 
Q
E
 
E
K
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
L
G
 
S
E
 
P
A
 
R
F
 
L
D
 
S
A
 
A
A
 
E
E
 
E
A
 
A
Q
 
L
R
 
A
M
 
L
G
 
G
F
 
L
V
 
V
N
 
H
R
 
R
V
 
V
L
 
V
P
 
P
A
 
A
S
 
E
E
 
K
V
 
L
D
 
M
A
 
E
F
 
E
A
 
A
A
 
L
S
 
S
Q
 
L
A
 
A
A
 
K
K
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
Q
L
 
G
P
 
P
A
 
T
S
 
R
S
 
A
L
 
Y
R
 
A
V
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
K
L
 
L
M
 
L
K
 
L
R
 
E
A
 
T
S
 
Y
H
 
R
Q
 
L
E
 
S
L
 
L
Q
 
T
T
 
E
Q
 
A
M
 
L
S
x
A
E
 
L
E
 
E
A
 
A
V
 
V
H
 
L
F
 
Q
G
 
G
K
 
Q
M
 
A
L
x
G
L
 
Q
A
 
T
P
 
Q
E
 
D
A
 
H
R
 
E
E
 
E
A
 
G
F
 
V
K
 
R
A
 
A
F
|
F
F
 
R
E
 
E
K
|
K
R
 
R
K
 
P
P
 
P
D
 
R
F
 
F
R
 
Q

3q0gD Crystal structure of the mycobacterium tuberculosis crotonase bound to a reaction intermediate derived from crotonyl coa
35% identity, 97% coverage: 5:252/256 of query aligns to 5:249/250 of 3q0gD

query
sites
3q0gD
I
 
I
L
 
L
V
 
V
E
 
E
R
 
R
A
 
D
D
 
Q
G
 
R
V
 
V
L
 
G
T
 
I
I
 
I
A
 
T
F
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
D
 
Q
K
 
A
K
 
L
N
 
N
A
 
A
I
 
L
T
 
N
A
 
S
A
 
Q
M
 
V
Y
 
M
Q
 
N
T
 
E
M
 
V
A
 
T
D
 
S
A
 
A
L
 
A
V
 
T
E
 
E
A
 
L
Q
 
D
G
 
D
D
 
D
A
 
P
A
 
D
V
 
I
R
 
G
A
 
A
I
 
I
L
 
I
I
 
I
R
 
T
G
 
G
S
 
S
A
 
A
G
 
K
I
 
A
F
 
F
S
 
A
A
 
A
G
 
G
N
x
A
D
 
D
L
 
I
E
 
K
D
 
E
F
x
M
M
 
F
K
 
A
T
 
D
P
 
A
P
 
F
M
x
T
G
 
A
E
 
D
H
 
F
A
x
F
P
 
A
V
 
T
F
 
W
Q
 
G
F
 
K
L
 
L
R
 
A
A
 
A
I
 
V
S
 
R
S
 
T
A
 
-
E
 
-
K
 
-
P
 
P
V
 
T
V
 
I
A
 
A
S
 
A
V
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
V
 
L
G
 
G
I
x
G
G
 
G
T
 
C
T
x
E
L
 
L
L
 
A
L
 
M
H
 
M
C
 
C
D
 
D
L
 
V
V
 
L
Y
 
I
A
 
A
A
 
A
D
 
D
T
 
T
A
 
A
S
 
K
F
 
F
S
 
G
L
 
Q
P
|
P
F
x
E
T
 
I
Q
 
K
L
 
L
G
 
G
L
x
V
C
 
L
P
|
P
E
x
G
A
 
M
A
 
G
S
 
G
S
 
S
L
 
Q
L
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
A
 
A
A
 
I
G
 
G
Y
 
K
Q
 
A
A
 
K
A
 
A
A
 
M
E
 
D
K
 
L
L
 
I
L
 
L
L
 
T
G
 
G
E
 
R
A
 
T
F
 
M
D
 
D
A
 
A
A
 
A
E
 
E
A
 
A
Q
 
E
R
 
R
M
 
S
G
 
G
F
 
L
V
 
V
N
 
S
R
 
R
V
 
V
L
 
V
P
 
P
A
 
A
S
 
D
E
 
D
V
 
L
D
 
L
A
 
T
F
 
E
A
 
A
A
 
R
S
 
A
Q
 
T
A
 
A
A
 
T
K
 
T
L
 
I
A
 
S
A
 
Q
L
 
M
P
 
S
A
 
A
S
 
S
S
 
A
L
 
A
R
 
R
V
 
M
T
 
A
K
 
K
S
 
E
L
 
A
M
 
V
K
 
N
R
 
R
A
 
A
S
 
F
H
 
E
Q
 
S
E
 
S
L
 
L
Q
 
S
T
 
E
Q
 
G
M
 
L
S
x
L
E
 
Y
E
 
E
A
 
R
V
 
R
H
 
L
F
|
F
G
 
H
K
 
S
M
 
A
L
x
F
L
 
A
A
 
T
P
 
E
E
 
D
A
 
Q
R
 
S
E
 
E
A
 
G
F
 
M
K
 
A
A
 
A
F
|
F
F
 
I
E
 
E
K
 
K
R
 
R
K
 
A
P
 
P
D
 
Q
F
 
F

3q0jC Crystal structure of the mycobacterium tuberculosis crotonase in complex with the inhibitor acetoacetylcoa
35% identity, 97% coverage: 5:252/256 of query aligns to 6:254/255 of 3q0jC

query
sites
3q0jC
I
 
I
L
 
L
V
 
V
E
 
E
R
 
R
A
 
D
D
 
Q
G
 
R
V
 
V
L
 
G
T
 
I
I
 
I
A
 
T
F
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
D
x
Q
K
x
A
K
x
L
N
 
N
A
|
A
I
 
L
T
 
N
A
 
S
A
 
Q
M
 
V
Y
 
M
Q
 
N
T
 
E
M
 
V
A
 
T
D
 
S
A
 
A
L
 
A
V
 
T
E
 
E
A
 
L
Q
 
D
G
 
D
D
 
D
A
 
P
A
 
D
V
 
I
R
 
G
A
 
A
I
 
I
L
 
I
I
 
I
R
 
T
G
 
G
S
 
S
A
 
A
G
 
K
I
 
A
F
 
F
S
 
A
A
|
A
G
|
G
N
x
A
D
|
D
L
x
I
E
x
K
D
 
E
F
x
M
M
 
A
K
 
D
-
 
L
T
 
T
P
 
F
P
 
A
M
 
D
G
 
A
E
 
F
H
x
T
A
 
A
P
 
D
V
 
F
F
|
F
Q
 
A
F
 
T
L
 
W
R
 
G
A
 
K
I
 
L
S
 
A
S
 
A
A
 
V
E
 
R
K
 
T
P
 
P
V
 
T
V
 
I
A
 
A
S
 
A
V
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
V
 
L
G
|
G
I
x
G
G
 
G
T
 
C
T
x
E
L
 
L
L
 
A
L
 
M
H
 
M
C
 
C
D
 
D
L
 
V
V
 
L
Y
 
I
A
 
A
A
 
A
D
 
D
T
 
T
A
 
A
S
 
K
F
 
F
S
 
G
L
 
Q
P
|
P
F
x
E
T
 
I
Q
 
K
L
 
L
G
 
G
L
x
V
C
 
L
P
|
P
E
x
G
A
x
M
A
 
G
S
 
G
S
 
S
L
 
Q
L
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
A
 
A
A
 
I
G
 
G
Y
 
K
Q
 
A
A
 
K
A
 
A
A
 
M
E
 
D
K
 
L
L
 
I
L
 
L
L
 
T
G
 
G
E
 
R
A
 
T
F
 
M
D
 
D
A
 
A
A
 
A
E
 
E
A
 
A
Q
 
E
R
 
R
M
 
S
G
 
G
F
 
L
V
 
V
N
 
S
R
 
R
V
 
V
L
 
V
P
 
P
A
 
A
S
 
D
E
 
D
V
 
L
D
 
L
A
 
T
F
 
E
A
 
A
A
 
R
S
 
A
Q
 
T
A
 
A
A
 
T
K
 
T
L
 
I
A
 
S
A
 
Q
L
 
M
P
 
S
A
 
A
S
 
S
S
 
A
L
 
A
R
 
R
V
 
M
T
 
A
K
 
K
S
 
E
L
 
A
M
 
V
K
 
N
R
 
R
A
 
A
S
 
F
H
 
E
Q
 
S
E
 
S
L
 
L
Q
 
S
T
 
E
Q
 
G
M
 
L
S
x
L
E
 
Y
E
 
E
A
 
R
V
 
R
H
 
L
F
 
F
G
 
H
K
 
S
M
 
A
L
x
F
L
 
A
A
 
T
P
 
E
E
 
D
A
 
Q
R
 
S
E
 
E
A
 
G
F
 
M
K
 
A
A
 
A
F
 
F
F
 
I
E
 
E
K
 
K
R
 
R
K
 
A
P
 
P
D
 
Q
F
 
F

3q0gC Crystal structure of the mycobacterium tuberculosis crotonase bound to a reaction intermediate derived from crotonyl coa
35% identity, 97% coverage: 5:252/256 of query aligns to 6:254/255 of 3q0gC

query
sites
3q0gC
I
 
I
L
 
L
V
 
V
E
 
E
R
 
R
A
 
D
D
 
Q
G
 
R
V
 
V
L
 
G
T
 
I
I
 
I
A
 
T
F
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
D
 
Q
K
 
A
K
x
L
N
 
N
A
 
A
I
 
L
T
 
N
A
 
S
A
 
Q
M
 
V
Y
 
M
Q
 
N
T
 
E
M
 
V
A
 
T
D
 
S
A
 
A
L
 
A
V
 
T
E
 
E
A
 
L
Q
 
D
G
 
D
D
 
D
A
 
P
A
 
D
V
 
I
R
 
G
A
 
A
I
 
I
L
 
I
I
 
I
R
 
T
G
 
G
S
 
S
A
 
A
G
 
K
I
 
A
F
 
F
S
 
A
A
|
A
G
 
G
N
x
A
D
 
D
L
x
I
E
x
K
D
 
E
F
x
M
M
 
A
K
 
D
-
 
L
T
 
T
P
 
F
P
 
A
M
 
D
G
 
A
E
 
F
H
x
T
A
 
A
P
 
D
V
 
F
F
|
F
Q
 
A
F
 
T
L
 
W
R
 
G
A
 
K
I
 
L
S
 
A
S
 
A
A
 
V
E
 
R
K
 
T
P
 
P
V
 
T
V
 
I
A
 
A
S
 
A
V
 
V
A
 
A
G
 
G
A
x
Y
A
 
A
V
 
L
G
 
G
I
x
G
G
 
G
T
 
C
T
x
E
L
 
L
L
 
A
L
 
M
H
 
M
C
 
C
D
 
D
L
 
V
V
 
L
Y
 
I
A
 
A
A
 
A
D
 
D
T
 
T
A
 
A
S
 
K
F
 
F
S
 
G
L
 
Q
P
|
P
F
x
E
T
 
I
Q
 
K
L
|
L
G
 
G
L
x
V
C
 
L
P
|
P
E
x
G
A
 
M
A
 
G
S
 
G
S
 
S
L
 
Q
L
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
A
 
A
A
 
I
G
 
G
Y
 
K
Q
 
A
A
 
K
A
 
A
A
 
M
E
 
D
K
 
L
L
 
I
L
 
L
L
 
T
G
 
G
E
 
R
A
 
T
F
 
M
D
 
D
A
 
A
A
 
A
E
 
E
A
 
A
Q
 
E
R
 
R
M
 
S
G
 
G
F
 
L
V
 
V
N
 
S
R
 
R
V
 
V
L
 
V
P
 
P
A
 
A
S
 
D
E
 
D
V
 
L
D
 
L
A
 
T
F
 
E
A
 
A
A
 
R
S
 
A
Q
 
T
A
 
A
A
 
T
K
 
T
L
 
I
A
 
S
A
 
Q
L
 
M
P
 
S
A
 
A
S
 
S
S
 
A
L
 
A
R
 
R
V
 
M
T
 
A
K
 
K
S
 
E
L
 
A
M
 
V
K
 
N
R
 
R
A
 
A
S
 
F
H
 
E
Q
 
S
E
 
S
L
 
L
Q
 
S
T
 
E
Q
 
G
M
 
L
S
x
L
E
 
Y
E
 
E
A
 
R
V
 
R
H
 
L
F
 
F
G
 
H
K
 
S
M
 
A
L
x
F
L
 
A
A
 
T
P
 
E
E
 
D
A
 
Q
R
 
S
E
 
E
A
 
G
F
 
M
K
 
A
A
 
A
F
 
F
F
 
I
E
 
E
K
 
K
R
 
R
K
 
A
P
 
P
D
 
Q
F
 
F

3h81A Crystal structure of enoyl-coa hydratase from mycobacterium tuberculosis (see paper)
35% identity, 97% coverage: 5:252/256 of query aligns to 5:253/256 of 3h81A

query
sites
3h81A
I
 
I
L
 
L
V
 
V
E
 
E
R
 
R
A
 
D
D
 
Q
G
 
R
V
 
V
L
 
G
T
 
I
I
 
I
A
 
T
F
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
D
 
Q
K
 
A
K
 
L
N
 
N
A
 
A
I
 
L
T
 
N
A
 
S
A
 
Q
M
 
V
Y
 
M
Q
 
N
T
 
E
M
 
V
A
 
T
D
 
S
A
 
A
L
 
A
V
 
T
E
 
E
A
 
L
Q
 
D
G
 
D
D
 
D
A
 
P
A
 
D
V
 
I
R
 
G
A
 
A
I
 
I
L
 
I
I
 
I
R
 
T
G
 
G
S
 
S
A
 
A
G
 
K
I
 
A
F
 
F
S
 
A
A
 
A
G
 
G
N
x
A
D
 
D
L
 
I
E
 
K
D
 
E
F
x
M
M
 
A
K
 
D
-
 
L
T
 
T
P
 
F
P
 
A
M
 
D
G
 
A
E
 
F
H
x
T
A
 
A
P
 
D
V
 
F
F
|
F
Q
 
A
F
 
T
L
 
W
R
 
G
A
 
K
I
 
L
S
 
A
S
 
A
A
 
V
E
 
R
K
 
T
P
 
P
V
 
T
V
 
I
A
 
A
S
 
A
V
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
V
 
L
G
 
G
I
x
G
G
 
G
T
 
C
T
x
E
L
 
L
L
 
A
L
 
M
H
 
M
C
 
C
D
 
D
L
 
V
V
 
L
Y
 
I
A
 
A
A
 
A
D
 
D
T
 
T
A
 
A
S
 
K
F
 
F
S
 
G
L
 
Q
P
|
P
F
x
E
T
 
I
Q
 
K
L
 
L
G
 
G
L
x
V
C
 
L
P
|
P
E
x
G
A
 
M
A
 
G
S
 
G
S
 
S
L
 
Q
L
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
A
 
A
A
 
I
G
 
G
Y
 
K
Q
 
A
A
 
K
A
 
A
A
 
M
E
 
D
K
 
L
L
 
I
L
 
L
L
 
T
G
 
G
E
 
R
A
 
T
F
 
M
D
 
D
A
 
A
A
 
A
E
 
E
A
 
A
Q
 
E
R
 
R
M
 
S
G
 
G
F
 
L
V
 
V
N
 
S
R
 
R
V
 
V
L
 
V
P
 
P
A
 
A
S
 
D
E
 
D
V
 
L
D
 
L
A
 
T
F
 
E
A
 
A
A
 
R
S
 
A
Q
 
T
A
 
A
A
 
T
K
 
T
L
 
I
A
 
S
A
 
Q
L
 
M
P
 
S
A
 
A
S
 
S
S
 
A
L
 
A
R
 
R
V
 
M
T
 
A
K
 
K
S
 
E
L
 
A
M
 
V
K
 
N
R
 
R
A
 
A
S
 
F
H
 
E
Q
 
S
E
 
S
L
 
L
Q
 
S
T
 
E
Q
 
G
M
 
L
S
x
L
E
 
Y
E
 
E
A
 
R
V
 
R
H
 
L
F
 
F
G
 
H
K
 
S
M
 
A
L
x
F
L
 
A
A
 
T
P
 
E
E
 
D
A
x
Q
R
 
S
E
 
E
A
 
G
F
 
M
K
 
A
A
 
A
F
 
F
F
 
I
E
 
E
K
 
K
R
 
R
K
 
A
P
 
P
D
 
Q
F
 
F

5zaiC Crystal structure of 3-hydroxypropionyl-coa dehydratase from metallosphaera sedula (see paper)
30% identity, 97% coverage: 5:253/256 of query aligns to 6:257/259 of 5zaiC

query
sites
5zaiC
I
 
I
L
 
E
V
 
T
E
 
K
R
 
K
A
 
E
D
 
G
G
 
N
V
 
L
L
 
F
T
 
W
I
 
I
A
 
T
F
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
D
 
D
K
|
K
K
x
L
N
 
N
A
 
A
I
 
L
T
 
N
A
 
A
A
 
K
M
 
L
Y
 
L
Q
 
E
T
 
E
M
 
L
A
 
D
D
 
R
A
 
A
L
 
V
V
 
S
E
 
Q
A
 
A
Q
 
E
G
 
S
D
 
D
A
 
P
A
 
E
V
 
I
R
 
R
A
 
V
I
 
I
L
 
I
I
 
I
R
 
T
G
 
G
S
 
K
A
 
G
G
 
K
I
 
A
F
 
F
S
 
C
A
|
A
G
|
G
N
x
A
D
|
D
L
x
I
E
 
T
D
 
Q
F
|
F
M
 
N
K
 
Q
T
 
L
P
 
T
P
 
P
M
 
-
G
 
-
E
 
-
H
 
-
A
 
A
P
 
E
V
 
A
F
 
W
Q
 
K
F
 
F
-
x
S
-
 
K
-
 
K
-
 
G
-
x
R
-
 
E
-
 
I
L
 
M
R
 
D
A
 
K
I
 
I
S
 
E
S
 
A
A
 
L
E
 
S
K
 
K
P
 
P
V
 
T
V
 
I
A
 
A
S
 
M
V
 
I
A
 
N
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
V
 
L
G
 
G
I
x
G
G
 
G
T
 
L
T
x
E
L
 
L
L
 
A
L
 
L
H
 
A
C
 
C
D
 
D
L
 
I
V
 
R
Y
 
I
A
 
A
A
 
A
D
 
E
T
 
E
A
 
A
S
 
Q
F
 
L
S
 
G
L
 
L
P
|
P
F
x
E
T
 
I
Q
 
N
L
 
L
G
 
G
L
x
I
C
 
Y
P
|
P
E
x
G
A
 
Y
A
 
G
S
 
G
S
 
T
L
 
Q
L
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
A
 
V
A
 
I
G
 
G
Y
 
K
Q
 
G
A
 
R
A
 
A
A
 
L
E
 
E
K
 
M
L
 
M
L
 
M
L
 
T
G
 
G
E
 
D
A
x
R
F
 
I
D
 
P
A
 
G
A
 
K
E
 
D
A
 
A
Q
 
E
R
 
K
M
 
Y
G
 
G
F
 
L
V
 
V
N
 
N
R
 
R
V
 
V
L
 
V
P
 
P
A
 
L
S
 
A
E
 
N
V
 
L
D
 
E
A
 
Q
F
 
E
A
 
T
A
 
R
S
 
K
Q
 
L
A
 
A
A
 
E
K
 
K
L
 
I
A
 
A
A
 
K
L
 
K
P
 
S
A
 
P
S
 
I
S
 
S
L
 
L
R
 
A
V
 
L
T
 
I
K
 
K
S
 
E
L
 
V
M
 
V
K
 
N
R
 
R
A
 
G
S
 
L
H
 
D
Q
 
S
E
 
P
L
 
L
Q
 
L
T
 
S
Q
 
G
M
 
L
S
x
A
E
 
L
E
 
E
A
 
S
V
 
V
H
 
G
F
 
W
G
 
G
K
 
V
M
 
V
L
x
F
L
 
S
A
 
T
P
 
E
E
 
D
A
 
K
R
 
K
E
 
E
A
 
G
F
 
V
K
 
S
A
 
A
F
|
F
F
 
L
E
 
E
K
|
K
R
 
R
K
 
E
P
 
P
D
 
T
F
 
F
R
 
K

O53561 Enoyl-CoA hydratase EchA19; EC 4.2.1.- from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see 2 papers)
31% identity, 98% coverage: 4:254/256 of query aligns to 9:265/266 of O53561

query
sites
O53561
D
 
D
I
 
A
L
 
L
V
 
V
E
 
E
R
 
R
A
 
R
D
 
G
G
 
H
V
 
T
L
 
L
T
 
I
I
 
V
A
 
T
F
 
M
N
 
N
R
 
R
P
 
P
D
 
A
K
 
A
K
 
R
N
 
N
A
 
A
I
 
L
T
 
S
A
 
T
A
 
E
M
 
M
Y
 
M
Q
 
R
T
 
I
M
 
M
A
 
V
D
 
Q
A
 
A
L
 
W
V
 
D
E
 
R
A
 
V
Q
 
D
G
 
N
D
 
D
A
 
P
A
 
D
V
 
I
R
 
R
A
 
C
I
 
C
L
 
I
I
 
L
R
 
T
G
 
G
S
 
A
A
 
G
G
 
G
I
 
Y
F
 
F
S
 
C
A
 
A
G
 
G
N
 
M
D
 
D
L
 
L
E
 
K
D
 
A
F
 
A
M
 
T
K
 
Q
T
 
K
P
 
P
P
 
P
M
 
G
-
 
D
-
 
S
-
 
F
-
 
K
-
 
D
G
 
G
E
 
S
H
 
Y
A
 
G
P
 
P
-
 
S
-
 
R
V
 
I
F
 
D
Q
 
A
F
 
L
L
 
L
R
 
K
A
 
G
I
 
-
S
 
R
S
 
R
A
 
L
E
 
T
K
 
K
P
 
P
V
 
L
V
 
I
A
 
A
S
 
A
V
 
V
A
 
E
G
 
G
A
 
P
A
 
A
V
 
I
G
 
A
I
 
G
G
 
G
T
 
T
T
 
E
L
 
I
L
 
L
L
 
Q
H
 
G
C
 
T
D
 
D
L
 
I
V
 
R
Y
 
V
A
 
A
A
 
G
D
 
E
T
 
S
A
 
A
S
x
K
F
|
F
S
x
G
L
x
I
P
x
S
F
x
E
T
x
A
Q
x
K
L
 
W
G
 
S
L
 
L
C
 
Y
P
 
P
E
 
M
A
 
G
A
 
G
S
 
S
S
 
A
L
 
V
L
 
R
L
 
L
P
 
V
R
 
R
A
 
Q
A
 
I
G
 
P
Y
 
Y
Q
 
T
A
 
L
A
 
A
A
 
C
E
 
D
K
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
T
G
 
G
E
 
R
A
 
H
F
 
I
D
 
T
A
 
A
A
 
A
E
 
E
A
 
A
Q
 
K
R
 
E
M
 
M
G
 
G
F
 
L
V
 
I
N
 
G
R
 
H
V
 
V
L
 
V
P
 
P
A
 
-
S
 
-
E
 
-
V
 
-
D
 
D
A
 
G
F
 
Q
A
 
A
A
 
L
S
 
T
Q
 
K
A
 
A
A
 
L
K
 
E
L
 
L
A
 
A
-
 
D
A
 
A
L
 
I
P
 
S
A
 
A
S
 
N
S
 
G
L
 
P
R
 
L
V
 
A
T
 
V
K
 
Q
S
 
A
L
 
I
M
 
L
K
 
R
R
 
-
A
 
-
S
 
S
H
 
I
Q
 
R
E
 
E
L
 
T
Q
 
E
T
 
C
Q
 
M
M
 
P
S
 
E
E
 
N
E
 
E
A
 
A
V
 
F
H
 
K
F
 
I
G
 
D
-
 
T
-
 
Q
-
 
I
-
 
G
-
 
I
K
 
K
M
 
V
L
 
F
L
 
L
A
 
S
P
 
D
E
 
D
A
 
A
R
 
K
E
 
E
A
 
G
F
 
P
K
 
R
A
 
A
F
 
F
F
 
A
E
 
E
K
 
K
R
 
R
K
 
A
P
 
P
D
 
N
F
 
F
R
 
Q
Q
 
N

2uzfA Crystal structure of staphylococcus aureus 1,4-dihydroxy-2-naphthoyl coa synthase (menb) in complex with acetoacetyl coa (see paper)
33% identity, 98% coverage: 4:255/256 of query aligns to 9:256/260 of 2uzfA

query
sites
2uzfA
D
 
E
I
 
I
L
 
K
V
 
Y
E
 
E
R
 
F
A
 
Y
D
 
E
G
 
G
V
 
I
L
 
A
T
 
K
I
 
V
A
 
T
F
 
I
N
 
N
R
 
R
P
 
P
D
 
E
K
x
V
K
x
R
N
 
N
A
 
A
I
 
F
T
 
T
A
 
P
A
 
K
M
 
T
Y
 
V
Q
 
A
T
 
E
M
 
M
A
 
I
D
 
D
A
 
A
L
 
F
V
 
S
E
 
R
A
 
A
Q
 
R
G
 
D
D
 
D
A
 
Q
A
 
N
V
 
V
R
 
S
A
 
V
I
 
I
L
 
V
I
 
L
R
 
T
G
 
G
S
 
E
A
 
G
G
 
D
I
 
L
-
 
A
F
 
F
S
 
C
A
x
S
G
|
G
N
x
G
D
|
D
L
 
Q
E
 
K
D
 
G
F
 
E
M
 
D
K
 
Q
T
 
I
P
 
P
P
x
R
M
 
L
G
 
N
E
 
-
H
 
-
A
 
-
P
 
-
V
 
V
F
x
L
Q
 
D
F
 
L
L
 
Q
R
 
R
A
 
L
I
 
I
S
 
R
S
 
I
A
 
I
E
 
P
K
 
K
P
 
P
V
 
V
V
 
I
A
 
A
S
 
M
V
 
V
A
 
K
G
 
G
A
x
Y
A
 
A
V
 
V
G
 
G
I
x
G
G
 
G
T
 
N
T
x
V
L
 
L
L
 
N
L
 
V
H
 
V
C
 
C
D
 
D
L
 
L
V
 
T
Y
 
I
A
 
A
A
 
A
D
 
D
T
 
N
A
 
A
S
 
I
F
 
F
S
 
G
L
 
Q
P
x
T
F
x
G
T
 
P
Q
 
K
L
 
V
G
 
G
L
x
S
C
 
F
P
x
D
E
x
A
A
 
G
A
 
Y
S
 
G
S
 
S
L
 
G
L
 
Y
L
 
L
P
 
A
R
 
R
A
 
I
A
 
V
G
 
G
Y
 
H
Q
 
K
A
 
K
A
 
A
A
 
R
E
 
E
K
 
I
L
 
W
L
 
Y
L
 
L
G
 
C
E
 
R
A
 
Q
F
 
Y
D
 
N
A
 
A
A
 
Q
E
 
E
A
 
A
Q
 
L
R
 
D
M
 
M
G
 
G
F
 
L
V
 
V
N
 
N
R
 
T
V
 
V
L
 
V
P
 
P
A
 
L
S
 
E
E
 
K
V
 
V
D
 
E
A
 
D
F
 
E
A
 
T
A
 
V
S
 
Q
Q
 
W
A
 
C
A
 
K
K
 
E
L
 
I
A
 
M
A
 
K
L
 
H
P
 
S
A
 
P
S
 
T
S
 
A
L
 
L
R
 
R
V
 
F
T
 
L
K
 
K
S
 
A
L
 
A
M
 
M
K
 
N
R
 
A
A
 
D
S
 
T
H
 
D
Q
 
G
-
 
L
-
 
A
E
 
G
L
 
L
Q
 
Q
T
 
-
Q
 
Q
M
 
M
S
x
A
E
 
G
E
 
D
A
 
A
V
 
T
H
 
L
F
 
L
G
 
-
K
 
-
M
 
Y
L
x
Y
L
 
T
A
 
T
P
 
D
E
 
E
A
 
A
R
 
K
E
 
E
A
 
G
F
 
R
K
 
D
A
 
A
F
 
F
F
 
K
E
 
E
K
 
K
R
 
R
K
 
D
P
 
P
D
 
D
F
 
F
R
 
D
Q
 
Q
F
 
F

Q5HH38 1,4-dihydroxy-2-naphthoyl-CoA synthase; DHNA-CoA synthase; EC 4.1.3.36 from Staphylococcus aureus (strain COL) (see paper)
32% identity, 98% coverage: 4:255/256 of query aligns to 14:269/273 of Q5HH38

query
sites
Q5HH38
D
 
E
I
 
I
L
 
K
V
 
Y
E
 
E
R
 
F
A
 
Y
D
 
E
G
 
G
V
 
I
L
 
A
T
 
K
I
 
V
A
 
T
F
 
I
N
 
N
R
 
R
P
 
P
D
 
E
K
 
V
K
x
R
N
 
N
A
 
A
I
 
F
T
 
T
A
 
P
A
 
K
M
 
T
Y
 
V
Q
 
A
T
 
E
M
 
M
A
 
I
D
 
D
A
 
A
L
 
F
V
 
S
E
 
R
A
 
A
Q
 
R
G
 
D
D
 
D
A
 
Q
A
 
N
V
 
V
R
 
S
A
 
V
I
 
I
L
 
V
I
 
L
R
 
T
G
 
G
S
 
E
A
 
G
G
 
D
I
 
L
-
 
A
F
 
F
S
 
C
A
x
S
G
|
G
N
x
G
D
|
D
L
x
Q
E
 
K
D
 
K
F
 
R
M
 
G
K
 
H
T
 
G
P
 
G
P
 
Y
M
 
V
G
 
G
E
 
E
H
 
D
A
 
Q
-
 
I
-
 
P
-
 
R
-
 
L
P
 
N
V
 
V
F
 
L
Q
 
D
F
 
L
L
 
Q
R
 
R
A
 
L
I
 
I
S
 
R
S
 
I
A
 
I
E
 
P
K
 
K
P
 
P
V
 
V
V
 
I
A
 
A
S
 
M
V
 
V
A
 
K
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
V
 
V
G
 
G
I
 
G
G
 
G
T
 
N
T
 
V
L
 
L
L
 
N
L
 
V
H
 
V
C
 
C
D
 
D
L
 
L
V
 
T
Y
 
I
A
 
A
A
 
A
D
 
D
T
 
N
A
 
A
S
 
I
F
 
F
S
 
G
L
 
Q
P
 
T
F
 
G
T
 
P
Q
 
K
L
 
V
G
 
G
L
x
S
C
 
F
P
 
D
E
 
A
A
 
G
A
 
Y
S
 
G
S
 
S
L
 
G
L
 
Y
L
 
L
P
 
A
R
 
R
A
 
I
A
 
V
G
 
G
Y
 
H
Q
 
K
A
 
K
A
 
A
A
 
R
E
 
E
K
 
I
L
 
W
L
 
Y
L
 
L
G
 
C
E
 
R
A
 
Q
F
 
Y
D
 
N
A
 
A
A
 
Q
E
 
E
A
 
A
Q
 
L
R
 
D
M
 
M
G
 
G
F
 
L
V
 
V
N
 
N
R
 
T
V
 
V
L
 
V
P
 
P
A
 
L
S
 
E
E
 
K
V
 
V
D
 
E
A
 
D
F
 
E
A
 
T
A
 
V
S
 
Q
Q
 
W
A
 
C
A
 
K
K
 
E
L
 
I
A
 
M
A
 
K
L
 
H
P
 
S
A
 
P
S
 
T
S
 
A
L
 
L
R
 
R
V
 
F
T
 
L
K
 
K
S
 
A
L
 
A
M
 
M
K
 
N
R
 
A
A
 
D
S
 
T
H
 
D
Q
 
G
-
 
L
-
 
A
E
 
G
L
 
L
Q
 
Q
T
 
-
Q
 
Q
M
 
M
S
 
A
E
 
G
E
 
D
A
 
A
V
 
T
H
 
L
F
 
L
G
 
-
K
 
-
M
 
Y
L
 
Y
L
 
T
A
 
T
P
 
D
E
 
E
A
 
A
R
 
K
E
 
E
A
 
G
F
 
R
K
 
D
A
 
A
F
 
F
F
 
K
E
 
E
K
 
K
R
 
R
K
 
D
P
 
P
D
 
D
F
 
F
R
 
D
Q
 
Q
F
 
F

4elxA Structure of apo e.Coli. 1,4-dihydroxy-2- naphthoyl coa synthases with cl (see paper)
30% identity, 98% coverage: 4:255/256 of query aligns to 21:264/268 of 4elxA

query
sites
4elxA
D
 
D
I
 
I
L
 
R
V
 
Y
E
 
E
R
 
K
A
 
S
-
 
T
D
 
D
G
 
G
V
 
I
L
 
A
T
 
K
I
 
I
A
 
T
F
 
I
N
 
N
R
 
R
P
 
P
D
 
Q
K
 
V
K
 
R
N
 
N
A
 
A
I
 
F
T
 
R
A
 
P
A
 
L
M
 
T
Y
 
V
Q
 
K
T
 
E
M
 
M
A
 
I
D
 
Q
A
 
A
L
 
L
V
 
A
E
 
D
A
 
A
Q
 
R
G
 
Y
D
 
D
A
 
D
A
 
N
V
 
I
R
 
G
A
 
V
I
 
I
L
 
I
I
 
L
R
 
T
G
 
G
S
 
A
A
 
G
G
 
D
-
 
K
I
 
A
F
 
F
S
 
C
A
 
S
G
 
G
N
x
G
D
 
D
L
 
Q
E
 
K
D
 
-
F
 
-
M
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
-
P
 
-
M
 
-
G
 
-
E
 
H
H
|
H
A
 
L
P
 
N
V
 
V
F
x
L
Q
 
D
F
 
F
L
 
Q
R
 
R
A
 
Q
I
 
I
S
 
R
S
 
T
A
 
C
E
 
P
K
 
K
P
 
P
V
 
V
V
 
V
A
 
A
S
 
M
V
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
Y
A
 
S
V
 
I
G
|
G
I
x
G
G
 
G
T
 
H
T
x
V
L
 
L
L
 
H
L
 
M
H
 
M
C
 
C
D
 
D
L
 
L
V
 
T
Y
 
I
A
 
A
A
 
A
D
 
D
T
 
N
A
 
A
S
 
I
F
 
F
S
 
G
L
 
Q
P
 
T
F
x
G
T
 
P
Q
 
K
L
 
V
G
 
G
L
x
S
C
 
F
P
x
D
E
x
G
A
 
G
A
 
W
S
 
G
S
 
A
L
 
S
L
 
Y
L
 
M
P
 
A
R
 
R
A
 
I
A
 
V
G
 
G
Y
 
Q
Q
 
K
A
 
K
A
 
A
A
 
R
E
 
E
K
 
I
L
x
W
L
 
F
L
 
L
G
 
C
E
 
R
A
 
Q
F
 
Y
D
 
D
A
 
A
A
 
K
E
 
Q
A
 
A
Q
 
L
R
 
D
M
 
M
G
 
G
F
 
L
V
 
V
N
 
N
R
 
T
V
 
V
L
 
V
P
 
P
A
 
L
S
 
A
E
 
D
V
 
L
D
 
E
A
 
K
F
 
E
A
 
T
A
 
V
S
 
R
Q
 
W
A
 
C
A
 
R
K
 
E
L
 
M
A
 
L
A
 
Q
L
 
N
P
 
S
A
 
P
S
 
M
S
 
A
L
 
L
R
 
R
V
 
C
T
 
L
K
 
K
S
 
A
L
 
A
M
 
L
K
 
N
-
 
A
-
 
D
-
 
C
-
 
D
-
 
G
R
 
Q
A
 
A
S
 
G
H
 
L
Q
 
Q
E
 
E
L
 
L
Q
x
A
T
 
G
Q
 
N
M
 
A
S
 
T
E
 
-
E
 
-
A
 
-
V
 
-
H
 
-
F
 
-
G
 
-
K
 
-
M
 
M
L
 
L
-
 
F
-
x
Y
L
 
M
A
 
T
P
 
E
E
 
E
A
 
G
R
 
Q
E
 
E
A
 
G
F
 
R
K
 
N
A
 
A
F
 
F
F
 
N
E
 
Q
K
 
K
R
 
R
K
 
Q
P
 
P
D
 
D
F
 
F
R
 
S
Q
 
K
F
 
F

4elwA Structure of e. Coli. 1,4-dihydroxy-2- naphthoyl coenzyme a synthases (menb) in complex with nitrate (see paper)
30% identity, 98% coverage: 4:255/256 of query aligns to 21:263/267 of 4elwA

query
sites
4elwA
D
 
D
I
 
I
L
 
R
V
 
Y
E
 
E
R
 
K
A
 
S
-
 
T
D
 
D
G
 
G
V
 
I
L
 
A
T
 
K
I
 
I
A
 
T
F
 
I
N
 
N
R
 
R
P
 
P
D
 
Q
K
 
V
K
 
R
N
 
N
A
 
A
I
 
F
T
 
R
A
 
P
A
 
L
M
 
T
Y
 
V
Q
 
K
T
 
E
M
 
M
A
 
I
D
 
Q
A
 
A
L
 
L
V
 
A
E
 
D
A
 
A
Q
 
R
G
 
Y
D
 
D
A
 
D
A
 
N
V
 
I
R
 
G
A
 
V
I
 
I
L
 
I
I
 
L
R
 
T
G
 
G
S
 
A
A
 
G
G
 
D
-
 
K
I
 
A
F
 
F
S
 
C
A
 
S
G
 
G
N
x
G
D
 
D
L
 
Q
E
 
K
D
 
-
F
 
-
M
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
-
P
 
-
M
 
-
G
 
-
E
 
-
H
 
H
A
 
L
P
 
N
V
 
V
F
x
L
Q
 
D
F
 
F
L
 
Q
R
 
R
A
 
Q
I
 
I
S
 
R
S
 
T
A
 
C
E
 
P
K
 
K
P
 
P
V
 
V
V
 
V
A
 
A
S
 
M
V
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
Y
A
 
S
V
 
I
G
|
G
I
x
G
G
 
G
T
 
H
T
x
V
L
 
L
L
 
H
L
 
M
H
 
M
C
 
C
D
 
D
L
 
L
V
 
T
Y
 
I
A
 
A
A
 
A
D
 
D
T
 
N
A
 
A
S
 
I
F
 
F
S
 
G
L
 
Q
P
x
T
F
x
G
T
 
P
Q
 
K
L
 
V
G
 
G
L
x
S
C
x
F
P
x
D
E
x
G
A
 
G
A
 
W
S
 
G
S
 
A
L
 
S
L
 
Y
L
 
M
P
 
A
R
 
R
A
 
I
A
 
V
G
 
G
Y
 
Q
Q
 
K
A
 
K
A
 
A
A
 
R
E
 
E
K
 
I
L
x
W
L
 
F
L
 
L
G
 
C
E
 
R
A
 
Q
F
 
Y
D
 
D
A
 
A
A
 
K
E
 
Q
A
 
A
Q
 
L
R
 
D
M
 
M
G
 
G
F
 
L
V
 
V
N
 
N
R
 
T
V
 
V
L
 
V
P
 
P
A
 
L
S
 
A
E
 
D
V
 
L
D
 
E
A
 
K
F
 
E
A
 
T
A
 
V
S
 
R
Q
 
W
A
 
C
A
 
R
K
 
E
L
 
M
A
 
L
A
 
Q
L
 
N
P
 
S
A
 
P
S
 
M
S
 
A
L
 
L
R
 
R
V
 
C
T
 
L
K
 
K
S
 
A
L
 
A
M
 
L
K
 
N
-
 
A
-
 
D
-
 
C
-
 
D
-
 
G
R
 
Q
A
 
A
S
 
G
H
 
L
Q
 
Q
E
 
E
L
 
L
Q
x
A
T
 
G
Q
 
N
M
 
A
S
 
T
E
 
-
E
 
-
A
 
-
V
 
-
H
 
-
F
 
-
G
 
-
K
 
-
M
 
M
L
 
L
-
 
F
-
x
Y
L
 
M
A
 
T
P
 
E
E
 
E
A
 
G
R
 
Q
E
 
E
A
 
G
F
 
R
K
 
N
A
 
A
F
 
F
F
 
N
E
 
Q
K
 
K
R
 
R
K
 
Q
P
 
P
D
 
D
F
 
F
R
 
S
Q
 
K
F
 
F

1mj3A Crystal structure analysis of rat enoyl-coa hydratase in complex with hexadienoyl-coa (see paper)
29% identity, 93% coverage: 16:253/256 of query aligns to 20:256/258 of 1mj3A

query
sites
1mj3A
I
 
I
A
 
Q
F
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
D
x
K
K
x
A
K
x
L
N
 
N
A
|
A
I
 
L
T
 
C
A
 
N
A
 
G
M
 
L
Y
 
I
Q
 
E
T
 
E
M
 
L
A
 
N
D
 
Q
A
 
A
L
 
L
V
 
E
E
 
T
A
 
F
Q
 
E
G
 
E
D
 
D
A
 
P
A
 
A
V
 
V
R
 
G
A
 
A
I
 
I
L
 
V
I
 
L
R
 
T
G
 
G
S
 
G
A
 
E
G
 
K
I
 
A
F
 
F
S
 
A
A
|
A
G
|
G
N
x
A
D
|
D
L
x
I
E
 
K
D
 
E
F
 
-
M
|
M
K
 
Q
T
 
N
P
 
R
P
 
T
M
 
F
G
 
Q
E
 
D
H
 
C
A
 
Y
P
x
S
V
 
G
F
x
L
Q
 
S
F
 
H
L
 
W
R
 
D
A
 
H
I
 
I
S
 
T
S
 
R
A
 
I
E
 
K
K
 
K
P
 
P
V
 
V
V
 
I
A
 
A
S
 
A
V
 
V
A
 
N
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
V
 
L
G
 
G
I
x
G
G
 
G
T
 
C
T
x
E
L
 
L
L
 
A
L
 
M
H
 
M
C
 
C
D
 
D
L
 
I
V
 
I
Y
 
Y
A
 
A
A
 
G
D
 
E
T
 
K
A
 
A
S
 
Q
F
 
F
S
 
G
L
 
Q
P
|
P
F
x
E
T
 
I
Q
 
L
L
|
L
G
 
G
L
x
T
C
 
I
P
|
P
E
x
G
A
 
A
A
 
G
S
 
G
S
 
T
L
 
Q
L
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
A
 
A
A
 
V
G
 
G
Y
 
K
Q
 
S
A
 
L
A
 
A
A
 
M
E
 
E
K
 
M
L
 
V
L
 
L
L
 
T
G
 
G
E
 
D
A
 
R
F
 
I
D
 
S
A
 
A
A
 
Q
E
 
D
A
 
A
Q
 
K
R
 
Q
M
 
A
G
 
G
F
 
L
V
 
V
N
 
S
R
 
K
V
 
I
L
 
F
P
 
P
A
 
V
S
 
E
E
 
T
V
 
L
D
 
-
A
 
-
F
 
-
A
 
-
A
 
V
S
 
E
Q
 
E
A
 
A
A
 
I
K
 
Q
L
 
C
A
 
A
A
 
E
L
 
K
P
 
I
A
 
A
S
 
N
S
 
N
L
 
S
R
 
K
V
 
I
T
 
I
K
 
V
S
 
A
L
 
M
M
 
A
K
 
K
R
 
E
A
 
S
S
 
V
H
 
N
Q
 
A
E
 
A
L
 
F
Q
 
E
T
 
M
Q
 
T
M
 
L
S
 
T
E
 
E
-
 
G
-
 
N
-
x
K
-
 
L
E
 
E
A
 
K
V
 
K
H
 
L
F
 
F
G
 
Y
K
 
S
M
 
T
L
x
F
L
 
A
A
 
T
P
 
D
E
 
D
A
 
R
R
 
R
E
 
E
A
 
G
F
 
M
K
 
S
A
 
A
F
 
F
F
 
V
E
 
E
K
 
K
R
 
R
K
 
K
P
 
A
D
 
N
F
 
F
R
 
K

4i42A E.Coli. 1,4-dihydroxy-2-naphthoyl coenzyme a synthase (ecmenb) in complex with 1-hydroxy-2-naphthoyl-coa (see paper)
30% identity, 98% coverage: 4:255/256 of query aligns to 24:281/285 of 4i42A

query
sites
4i42A
D
 
D
I
 
I
L
 
R
V
 
Y
E
 
E
R
 
K
A
 
S
-
 
T
D
 
D
G
 
G
V
 
I
L
 
A
T
 
K
I
 
I
A
 
T
F
 
I
N
 
N
R
 
R
P
 
P
D
 
Q
K
x
V
K
x
R
N
 
N
A
 
A
I
 
F
T
 
R
A
 
P
A
 
L
M
 
T
Y
 
V
Q
 
K
T
 
E
M
 
M
A
 
I
D
 
Q
A
 
A
L
 
L
V
 
A
E
 
D
A
 
A
Q
 
R
G
 
Y
D
 
D
A
 
D
A
 
N
V
 
I
R
 
G
A
 
V
I
 
I
L
 
I
I
 
L
R
 
T
G
 
G
S
 
A
A
 
G
G
 
D
-
 
K
I
 
A
F
 
F
S
 
C
A
x
S
G
|
G
N
x
G
D
|
D
L
x
Q
E
x
K
-
 
V
-
x
R
-
 
G
D
 
D
F
 
Y
-
 
G
-
 
G
M
x
Y
K
 
K
T
 
D
P
 
D
P
 
S
M
 
G
G
 
V
E
 
H
H
|
H
A
 
L
P
 
N
V
|
V
F
x
L
Q
 
D
F
 
F
L
 
Q
R
 
R
A
 
Q
I
 
I
S
 
R
S
 
T
A
 
C
E
 
P
K
 
K
P
 
P
V
 
V
V
 
V
A
 
A
S
 
M
V
 
V
A
 
A
G
 
G
A
x
Y
A
 
S
V
 
I
G
 
G
I
x
G
G
 
G
T
 
H
T
x
V
L
 
L
L
 
H
L
 
M
H
 
M
C
 
C
D
 
D
L
 
L
V
 
T
Y
 
I
A
 
A
A
 
A
D
 
D
T
 
N
A
 
A
S
 
I
F
 
F
S
 
G
L
 
Q
P
x
T
F
x
G
T
 
P
Q
 
K
L
 
V
G
 
G
L
x
S
C
 
F
P
x
D
E
x
G
A
 
G
A
 
W
S
 
G
S
 
A
L
 
S
L
 
Y
L
 
M
P
 
A
R
 
R
A
 
I
A
 
V
G
 
G
Y
 
Q
Q
 
K
A
 
K
A
 
A
A
 
R
E
 
E
K
 
I
L
 
W
L
 
F
L
 
L
G
 
C
E
 
R
A
 
Q
F
 
Y
D
 
D
A
 
A
A
 
K
E
 
Q
A
 
A
Q
 
L
R
 
D
M
 
M
G
 
G
F
 
L
V
 
V
N
 
N
R
 
T
V
 
V
L
 
V
P
 
P
A
 
L
S
 
A
E
 
D
V
 
L
D
 
E
A
 
K
F
 
E
A
 
T
A
 
V
S
 
R
Q
 
W
A
 
C
A
 
R
K
 
E
L
 
M
A
 
L
A
 
Q
L
 
N
P
 
S
A
 
P
S
 
M
S
 
A
L
 
L
R
 
R
V
 
C
T
 
L
K
 
K
S
 
A
L
 
A
M
 
L
K
 
N
-
 
A
-
 
D
-
 
C
-
 
D
-
 
G
R
 
Q
A
 
A
S
 
G
H
 
L
Q
 
Q
E
 
E
L
 
L
Q
x
A
T
 
G
Q
 
N
M
 
A
S
x
T
E
 
-
E
 
-
A
 
-
V
 
-
H
 
-
F
 
-
G
 
-
K
 
-
M
 
M
L
 
L
-
 
F
-
x
Y
L
 
M
A
 
T
P
 
E
E
 
E
A
 
G
R
 
Q
E
 
E
A
 
G
F
 
R
K
 
N
A
 
A
F
|
F
F
 
N
E
 
Q
K
|
K
R
 
R
K
 
Q
P
 
P
D
 
D
F
 
F
R
 
S
Q
 
K
F
 
F

P0ABU0 1,4-dihydroxy-2-naphthoyl-CoA synthase; DHNA-CoA synthase; EC 4.1.3.36 from Escherichia coli (strain K12) (see 4 papers)
30% identity, 98% coverage: 4:255/256 of query aligns to 24:281/285 of P0ABU0

query
sites
P0ABU0
D
 
D
I
 
I
L
 
R
V
 
Y
E
 
E
R
 
K
A
 
S
-
 
T
D
 
D
G
 
G
V
 
I
L
 
A
T
 
K
I
 
I
A
 
T
F
 
I
N
 
N
R
 
R
P
 
P
D
 
Q
K
 
V
K
x
R
N
 
N
A
 
A
I
 
F
T
 
R
A
 
P
A
 
L
M
 
T
Y
 
V
Q
 
K
T
 
E
M
 
M
A
 
I
D
 
Q
A
 
A
L
 
L
V
 
A
E
 
D
A
 
A
Q
 
R
G
 
Y
D
 
D
A
 
D
A
 
N
V
 
I
R
 
G
A
 
V
I
 
I
L
 
I
I
 
L
R
 
T
G
 
G
S
 
A
A
 
G
G
 
D
-
 
K
I
 
A
F
 
F
S
 
C
A
x
S
G
|
G
N
x
G
D
|
D
L
x
Q
E
x
K
-
 
V
-
x
R
-
 
G
D
 
D
F
 
Y
-
 
G
-
 
G
M
x
Y
K
 
K
T
 
D
P
 
D
P
 
S
M
 
G
G
 
V
E
 
H
H
 
H
A
 
L
P
 
N
V
 
V
F
 
L
Q
 
D
F
 
F
L
 
Q
R
 
R
A
 
Q
I
 
I
S
 
R
S
 
T
A
 
C
E
 
P
K
 
K
P
 
P
V
 
V
V
 
V
A
 
A
S
 
M
V
 
V
A
 
A
G
 
G
A
x
Y
A
x
S
V
x
I
G
|
G
I
x
G
G
 
G
T
 
H
T
 
V
L
 
L
L
 
H
L
 
M
H
 
M
C
 
C
D
 
D
L
 
L
V
 
T
Y
 
I
A
 
A
A
 
A
D
 
D
T
 
N
A
 
A
S
 
I
F
 
F
S
 
G
L
x
Q
P
x
T
F
x
G
T
 
P
Q
 
K
L
 
V
G
 
G
L
x
S
C
 
F
P
 
D
E
 
G
A
 
G
A
 
W
S
 
G
S
 
A
L
 
S
L
 
Y
L
 
M
P
 
A
R
 
R
A
 
I
A
 
V
G
 
G
Y
 
Q
Q
 
K
A
 
K
A
 
A
A
 
R
E
 
E
K
 
I
L
x
W
L
 
F
L
 
L
G
 
C
E
 
R
A
 
Q
F
 
Y
D
 
D
A
 
A
A
 
K
E
 
Q
A
 
A
Q
 
L
R
 
D
M
 
M
G
 
G
F
 
L
V
 
V
N
 
N
R
 
T
V
 
V
L
 
V
P
 
P
A
 
L
S
 
A
E
 
D
V
 
L
D
 
E
A
 
K
F
 
E
A
 
T
A
 
V
S
 
R
Q
 
W
A
 
C
A
 
R
K
 
E
L
 
M
A
 
L
A
 
Q
L
 
N
P
 
S
A
 
P
S
 
M
S
 
A
L
 
L
R
 
R
V
 
C
T
 
L
K
 
K
S
 
A
L
 
A
M
 
L
K
 
N
-
 
A
-
 
D
-
 
C
-
 
D
-
 
G
R
 
Q
A
 
A
S
 
G
H
 
L
Q
 
Q
E
 
E
L
 
L
Q
 
A
T
 
G
Q
 
N
M
 
A
S
 
T
E
 
-
E
 
-
A
 
-
V
 
-
H
 
-
F
 
-
G
 
-
K
 
-
M
 
M
L
 
L
-
 
F
-
x
Y
L
 
M
A
 
T
P
 
E
E
 
E
A
 
G
R
 
Q
E
 
E
A
 
G
F
x
R
K
 
N
A
 
A
F
|
F
F
 
N
E
 
Q
K
|
K
R
 
R
K
 
Q
P
 
P
D
 
D
F
 
F
R
 
S
Q
 
K
F
 
F

3t88A Crystal structure of escherichia coli menb in complex with substrate analogue, osb-ncoa (see paper)
30% identity, 98% coverage: 4:255/256 of query aligns to 20:277/281 of 3t88A

query
sites
3t88A
D
 
D
I
 
I
L
 
R
V
 
Y
E
 
E
R
 
K
A
 
S
-
 
T
D
 
D
G
 
G
V
 
I
L
 
A
T
 
K
I
 
I
A
 
T
F
 
I
N
 
N
R
 
R
P
 
P
D
x
Q
K
x
V
K
x
R
N
 
N
A
|
A
I
 
F
T
 
R
A
 
P
A
 
L
M
 
T
Y
 
V
Q
 
K
T
 
E
M
 
M
A
 
I
D
 
Q
A
 
A
L
 
L
V
 
A
E
 
D
A
 
A
Q
 
R
G
 
Y
D
 
D
A
 
D
A
 
N
V
 
I
R
 
G
A
 
V
I
 
I
L
 
I
I
 
L
R
 
T
G
 
G
S
 
A
A
 
G
G
 
D
-
 
K
I
 
A
F
 
F
S
 
C
A
x
S
G
|
G
N
x
G
D
|
D
L
x
Q
E
x
K
-
 
V
-
x
R
-
 
G
D
 
D
F
 
Y
-
 
G
-
 
G
M
x
Y
K
 
K
T
 
D
P
 
D
P
 
S
M
 
G
G
 
V
E
 
H
H
|
H
A
 
L
P
 
N
V
|
V
F
x
L
Q
 
D
F
 
F
L
 
Q
R
 
R
A
 
Q
I
 
I
S
 
R
S
 
T
A
 
C
E
 
P
K
 
K
P
 
P
V
 
V
V
 
V
A
 
A
S
 
M
V
 
V
A
 
A
G
 
G
A
x
Y
A
 
S
V
 
I
G
 
G
I
x
G
G
 
G
T
 
H
T
x
V
L
 
L
L
 
H
L
 
M
H
 
M
C
 
C
D
 
D
L
 
L
V
 
T
Y
 
I
A
 
A
A
 
A
D
 
D
T
 
N
A
 
A
S
 
I
F
 
F
S
 
G
L
 
Q
P
x
T
F
x
G
T
 
P
Q
 
K
L
x
V
G
 
G
L
x
S
C
x
F
P
x
D
E
x
G
A
 
G
A
 
W
S
 
G
S
 
A
L
 
S
L
 
Y
L
 
M
P
 
A
R
 
R
A
 
I
A
 
V
G
 
G
Y
 
Q
Q
 
K
A
 
K
A
 
A
A
 
R
E
 
E
K
 
I
L
 
W
L
 
F
L
 
L
G
 
C
E
 
R
A
 
Q
F
 
Y
D
 
D
A
 
A
A
 
K
E
 
Q
A
 
A
Q
 
L
R
 
D
M
 
M
G
 
G
F
 
L
V
 
V
N
 
N
R
 
T
V
 
V
L
 
V
P
 
P
A
 
L
S
 
A
E
 
D
V
 
L
D
 
E
A
 
K
F
 
E
A
 
T
A
 
V
S
 
R
Q
 
W
A
 
C
A
 
R
K
 
E
L
 
M
A
 
L
A
 
Q
L
 
N
P
 
S
A
 
P
S
 
M
S
 
A
L
 
L
R
 
R
V
 
C
T
 
L
K
 
K
S
 
A
L
 
A
M
 
L
K
 
N
-
 
A
-
 
D
-
 
C
-
 
D
-
 
G
R
 
Q
A
 
A
S
 
G
H
 
L
Q
 
Q
E
 
E
L
 
L
Q
x
A
T
 
G
Q
 
N
M
 
A
S
x
T
E
 
-
E
 
-
A
 
-
V
 
-
H
 
-
F
 
-
G
 
-
K
 
-
M
 
M
L
 
L
-
 
F
-
x
Y
L
 
M
A
 
T
P
 
E
E
 
E
A
 
G
R
 
Q
E
 
E
A
 
G
F
 
R
K
 
N
A
 
A
F
|
F
F
 
N
E
 
Q
K
|
K
R
 
R
K
 
Q
P
 
P
D
 
D
F
 
F
R
 
S
Q
 
K
F
 
F

2dubA Enoyl-coa hydratase complexed with octanoyl-coa (see paper)
29% identity, 93% coverage: 16:253/256 of query aligns to 19:252/254 of 2dubA

query
sites
2dubA
I
 
I
A
 
Q
F
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
D
x
K
K
x
A
K
x
L
N
 
N
A
|
A
I
 
L
T
 
C
A
 
N
A
 
G
M
 
L
Y
 
I
Q
 
E
T
 
E
M
 
L
A
 
N
D
 
Q
A
 
A
L
 
L
V
 
E
E
 
T
A
 
F
Q
 
E
G
 
E
D
 
D
A
 
P
A
 
A
V
 
V
R
 
G
A
 
A
I
 
I
L
 
V
I
 
L
R
 
T
G
 
G
S
 
G
A
 
E
G
 
K
I
 
A
F
 
F
S
 
A
A
|
A
G
 
G
N
x
A
D
|
D
L
x
I
E
x
K
D
 
E
F
x
M
M
 
Q
K
 
N
T
 
R
P
 
T
P
 
-
M
 
-
G
 
-
E
 
-
H
 
F
A
 
Q
P
 
D
V
 
C
F
 
Y
Q
x
S
F
 
H
L
 
W
R
 
D
A
 
H
I
 
I
S
 
T
S
 
R
A
 
I
E
 
K
K
 
K
P
 
P
V
 
V
V
 
I
A
 
A
S
 
A
V
 
V
A
 
N
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
V
 
L
G
 
G
I
x
G
G
 
G
T
 
C
T
x
E
L
 
L
L
 
A
L
 
M
H
 
M
C
 
C
D
 
D
L
 
I
V
 
I
Y
 
Y
A
 
A
A
 
G
D
 
E
T
 
K
A
 
A
S
 
Q
F
 
F
S
 
G
L
 
Q
P
|
P
F
x
E
T
 
I
Q
 
L
L
 
L
G
 
G
L
x
T
C
 
I
P
|
P
E
x
G
A
|
A
A
 
G
S
 
G
S
 
T
L
 
Q
L
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
A
 
A
A
 
V
G
 
G
Y
 
K
Q
 
S
A
 
L
A
 
A
A
 
M
E
 
E
K
 
M
L
 
V
L
 
L
L
 
T
G
 
G
E
 
D
A
 
R
F
 
I
D
 
S
A
 
A
A
 
Q
E
 
D
A
 
A
Q
 
K
R
 
Q
M
 
A
G
 
G
F
 
L
V
 
V
N
 
S
R
 
K
V
 
I
L
 
F
P
 
P
A
 
V
S
 
E
E
 
T
V
 
L
D
 
-
A
 
-
F
 
-
A
 
-
A
 
V
S
 
E
Q
 
E
A
 
A
A
 
I
K
 
Q
L
 
C
A
 
A
A
 
E
L
 
K
P
 
I
A
 
A
S
 
N
S
 
N
L
 
S
R
 
K
V
 
I
T
 
I
K
 
V
S
 
A
L
 
M
M
 
A
K
 
K
R
 
E
A
 
S
S
 
V
H
 
N
Q
 
A
E
 
A
L
 
F
Q
 
E
T
 
M
Q
 
T
M
 
L
S
 
T
E
 
E
-
 
G
-
 
N
-
x
K
-
 
L
E
 
E
A
 
K
V
 
K
H
 
L
F
 
F
G
 
Y
K
 
S
M
 
T
L
x
F
L
 
A
A
 
T
P
 
D
E
 
D
A
 
R
R
 
R
E
 
E
A
 
G
F
 
M
K
 
S
A
 
A
F
 
F
F
 
V
E
 
E
K
 
K
R
 
R
K
 
K
P
 
A
D
 
N
F
 
F
R
 
K

3h02A 2.15 angstrom resolution crystal structure of naphthoate synthase from salmonella typhimurium.
31% identity, 98% coverage: 4:255/256 of query aligns to 20:262/266 of 3h02A

query
sites
3h02A
D
 
D
I
 
I
L
 
R
V
 
Y
E
 
E
R
 
K
A
 
S
-
 
T
D
 
D
G
 
G
V
 
I
L
 
A
T
 
K
I
 
I
A
 
T
F
 
I
N
 
N
R
 
R
P
 
P
D
 
Q
K
 
V
K
 
R
N
 
N
A
 
A
I
 
F
T
 
R
A
 
P
A
 
L
M
 
T
Y
 
V
Q
 
K
T
 
E
M
 
M
A
 
I
D
 
Q
A
 
A
L
 
L
V
 
A
E
 
D
A
 
A
Q
 
R
G
 
Y
D
 
D
A
 
D
A
 
N
V
 
V
R
 
G
A
 
V
I
 
I
L
 
I
I
 
L
R
 
T
G
 
G
S
 
E
A
 
G
G
 
D
-
 
K
I
 
A
F
 
F
S
 
C
A
 
A
G
 
G
N
x
G
D
 
D
L
 
Q
E
 
H
D
 
-
F
 
-
M
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
-
P
 
-
M
 
-
G
 
-
E
 
-
H
|
H
A
 
L
P
 
N
V
 
V
F
x
L
Q
 
D
F
 
F
L
 
Q
R
 
R
A
 
Q
I
 
I
S
 
R
S
 
T
A
 
C
E
 
P
K
 
K
P
 
P
V
 
V
V
 
V
A
 
A
S
 
M
V
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
Y
A
 
S
V
 
I
G
|
G
I
x
G
G
 
G
T
 
H
T
x
V
L
 
L
L
 
H
L
 
M
H
 
M
C
 
C
D
 
D
L
 
L
V
 
T
Y
 
I
A
 
A
A
 
A
D
 
E
T
 
N
A
 
A
S
 
I
F
 
F
S
 
G
L
x
Q
P
 
T
F
x
G
T
 
P
Q
 
K
L
 
V
G
 
G
L
x
S
C
 
F
P
x
D
E
x
G
A
 
G
A
 
W
S
 
G
S
 
A
L
 
S
L
 
Y
L
 
M
P
 
A
R
 
R
A
 
I
A
 
V
G
 
G
Y
 
Q
Q
 
K
A
 
K
A
 
A
A
 
R
E
 
E
K
 
I
L
x
W
L
 
F
L
 
L
G
 
C
E
 
R
A
 
Q
F
 
Y
D
 
D
A
 
A
A
 
Q
E
 
Q
A
 
A
Q
 
L
R
 
D
M
 
M
G
 
G
F
 
L
V
 
V
N
 
N
R
 
T
V
 
V
L
 
V
P
 
P
A
 
L
S
 
A
E
 
D
V
 
L
D
 
E
A
 
K
F
 
E
A
 
T
A
 
V
S
 
R
Q
 
W
A
 
C
A
 
R
K
 
E
L
 
M
A
 
L
A
 
Q
L
 
N
P
 
S
A
 
P
S
 
M
S
 
A
L
 
L
R
 
R
V
 
C
T
 
L
K
 
K
S
 
A
L
 
A
M
 
L
K
 
N
-
 
A
-
 
D
-
 
C
-
 
D
-
 
G
R
 
Q
A
 
A
S
 
G
H
 
L
Q
 
Q
E
 
E
L
 
L
Q
x
A
T
 
G
Q
 
N
M
 
A
S
 
T
E
 
-
E
 
-
A
 
-
V
 
-
H
 
-
F
 
-
G
 
-
K
 
-
M
 
M
L
 
L
-
 
F
-
x
Y
L
 
M
A
 
T
P
 
E
E
 
E
A
 
G
R
 
Q
E
 
E
A
 
G
F
 
R
K
 
N
A
 
A
F
 
F
F
 
N
E
 
Q
K
 
K
R
 
R
K
 
Q
P
 
P
D
 
D
F
 
F
R
 
S
Q
 
K
F
 
F

1ey3A Structure of enoyl-coa hydratase complexed with the substrate dac-coa (see paper)
29% identity, 93% coverage: 16:253/256 of query aligns to 18:256/258 of 1ey3A

query
sites
1ey3A
I
 
I
A
 
Q
F
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
D
x
K
K
 
A
K
x
L
N
 
N
A
|
A
I
 
L
T
 
C
A
 
N
A
 
G
M
 
L
Y
 
I
Q
 
E
T
 
E
M
 
L
A
 
N
D
 
Q
A
 
A
L
 
L
V
 
E
E
 
T
A
 
F
Q
 
E
G
 
E
D
 
D
A
 
P
A
 
A
V
 
V
R
 
G
A
 
A
I
 
I
L
 
V
I
 
L
R
 
T
G
 
G
S
 
G
A
 
E
G
 
K
I
 
A
F
 
F
S
 
A
A
|
A
G
|
G
N
x
A
D
|
D
L
x
I
E
 
K
D
 
E
F
x
M
M
 
Q
K
 
N
T
 
R
P
 
T
P
 
F
M
 
Q
G
 
D
E
 
C
H
 
Y
A
x
S
P
 
G
V
 
K
F
 
F
-
x
L
Q
 
S
F
 
H
L
x
W
R
 
D
A
 
H
I
 
I
S
 
T
S
 
R
A
 
I
E
 
K
K
 
K
P
 
P
V
 
V
V
 
I
A
 
A
S
 
A
V
 
V
A
 
N
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
V
 
L
G
 
G
I
x
G
G
 
G
T
 
C
T
x
E
L
 
L
L
 
A
L
 
M
H
 
M
C
 
C
D
 
D
L
 
I
V
 
I
Y
 
Y
A
 
A
A
 
G
D
 
E
T
 
K
A
 
A
S
 
Q
F
 
F
S
 
G
L
 
Q
P
|
P
F
x
E
T
 
I
Q
 
L
L
|
L
G
 
G
L
x
T
C
 
I
P
|
P
E
x
G
A
 
A
A
 
G
S
 
G
S
 
T
L
 
Q
L
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
A
 
A
A
 
V
G
 
G
Y
 
K
Q
 
S
A
 
L
A
 
A
A
 
M
E
 
E
K
 
M
L
 
V
L
 
L
L
 
T
G
 
G
E
 
D
A
 
R
F
 
I
D
 
S
A
 
A
A
 
Q
E
 
D
A
 
A
Q
 
K
R
 
Q
M
 
A
G
 
G
F
 
L
V
 
V
N
 
S
R
 
K
V
 
I
L
 
F
P
 
P
A
 
V
S
 
E
E
 
T
V
 
L
D
 
-
A
 
-
F
 
-
A
 
-
A
 
V
S
 
E
Q
 
E
A
 
A
A
 
I
K
 
Q
L
 
C
A
 
A
A
 
E
L
 
K
P
 
I
A
 
A
S
 
N
S
 
N
L
 
S
R
 
K
V
 
I
T
 
I
K
 
V
S
 
A
L
 
M
M
 
A
K
 
K
R
 
E
A
 
S
S
 
V
H
 
N
Q
 
A
E
 
A
L
 
F
Q
 
E
T
 
M
Q
 
T
M
 
L
S
 
T
E
 
E
-
 
G
-
 
N
-
x
K
-
 
L
E
 
E
A
 
K
V
 
K
H
 
L
F
 
F
G
 
Y
K
 
S
M
 
T
L
x
F
L
 
A
A
 
T
P
 
D
E
 
D
A
 
R
R
 
R
E
 
E
A
 
G
F
 
M
K
 
S
A
 
A
F
 
F
F
 
V
E
 
E
K
 
K
R
 
R
K
 
K
P
 
A
D
 
N
F
 
F
R
 
K

Query Sequence

>BPHYT_RS03235 FitnessBrowser__BFirm:BPHYT_RS03235
MTMDILVERADGVLTIAFNRPDKKNAITAAMYQTMADALVEAQGDAAVRAILIRGSAGIF
SAGNDLEDFMKTPPMGEHAPVFQFLRAISSAEKPVVASVAGAAVGIGTTLLLHCDLVYAA
DTASFSLPFTQLGLCPEAASSLLLPRAAGYQAAAEKLLLGEAFDAAEAQRMGFVNRVLPA
SEVDAFAASQAAKLAALPASSLRVTKSLMKRASHQELQTQMSEEAVHFGKMLLAPEAREA
FKAFFEKRKPDFRQFD

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory