SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing BPHYT_RS05425 FitnessBrowser__BFirm:BPHYT_RS05425 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1cqxA Crystal structure of the flavohemoglobin from alcaligenes eutrophus at 1.75 a resolution (see paper)
42% identity, 35% coverage: 343:587/700 of query aligns to 154:398/403 of 1cqxA

query
sites
1cqxA
W
 
W
R
 
R
P
 
T
F
 
F
K
 
V
V
 
I
L
 
R
E
 
E
T
 
K
I
 
R
D
 
P
E
 
E
S
 
S
A
 
D
T
 
V
I
 
I
R
 
T
S
 
S
F
 
F
I
 
I
L
 
L
E
 
E
P
 
P
A
 
A
D
 
D
G
 
G
S
 
G
G
 
P
L
 
V
V
 
V
G
 
N
Y
 
F
Q
 
E
A
 
P
G
 
G
Q
 
Q
Y
|
Y
L
 
T
P
 
S
I
 
V
R
 
A
L
 
I
Q
 
D
P
 
V
P
 
P
G
 
A
W
 
L
A
 
G
E
 
L
P
 
Q
T
 
Q
I
 
I
R
|
R
T
x
Q
Y
|
Y
T
x
S
L
 
L
S
 
S
D
 
D
A
 
M
S
 
P
N
 
N
G
 
G
R
 
R
T
 
T
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
S
|
S
V
 
V
K
 
K
R
 
R
E
|
E
G
 
G
-
 
G
-
 
G
-
 
P
-
x
Q
-
x
P
K
 
P
G
|
G
G
x
Y
C
x
V
S
|
S
D
 
N
F
 
L
L
 
L
H
 
H
D
 
D
H
 
H
I
 
V
V
 
N
V
 
V
G
 
G
D
 
D
T
 
Q
I
 
V
E
 
K
T
 
L
L
 
A
A
 
A
P
 
P
R
 
Y
G
 
G
A
 
S
F
 
F
V
 
H
F
 
I
D
 
D
E
 
V
A
 
D
A
 
A
G
 
K
R
 
T
P
 
P
L
 
I
A
 
V
L
 
L
I
 
I
S
 
S
A
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
G
I
 
L
T
 
T
P
 
P
L
 
M
I
 
V
A
 
S
M
 
M
L
 
L
N
 
K
S
 
V
Q
 
A
L
 
L
V
 
Q
N
 
A
D
 
P
G
 
P
R
 
R
T
 
Q
L
 
V
L
 
V
H
 
-
K
 
-
P
 
-
I
 
-
Y
 
-
C
 
F
I
 
V
H
 
H
S
 
G
A
 
A
T
 
R
N
 
N
S
 
S
K
 
A
H
 
V
R
 
H
A
 
A
F
 
M
A
 
R
A
 
D
H
 
R
L
 
L
A
 
R
K
 
E
K
 
A
G
 
A
E
 
K
L
 
T
H
 
Y
A
 
E
N
 
N
L
 
L
T
 
D
L
 
L
H
 
F
V
 
V
A
 
F
F
 
Y
S
 
D
R
 
Q
P
 
P
S
 
L
E
 
P
D
 
E
D
 
D
V
 
V
L
 
Q
G
 
G
K
 
R
T
 
D
H
 
Y
Q
 
D
S
 
Y
E
 
P
G
 
G
Y
 
L
I
 
V
D
 
D
R
 
V
A
 
K
L
 
Q
L
 
I
R
 
E
R
 
K
V
 
S
L
 
I
P
 
L
L
 
L
D
 
P
D
 
D
Y
 
A
E
 
D
V
 
Y
Y
 
Y
L
 
I
C
 
C
G
 
G
P
 
P
P
 
I
G
 
P
F
 
F
M
 
M
Q
 
R
S
 
M
V
 
Q
Y
 
H
D
 
D
A
 
A
L
 
L
L
 
K
S
 
N
L
 
L
G
 
G
V
 
I
R
 
H
D
 
E
S
 
A
R
 
R
I
 
I
H
 
H
L
 
Y
E
 
E
S
x
V
F
 
F
G
|
G
P
|
P

Sites not aligning to the query:

3ozwA The crystal structure of flavohemoglobin from r. Eutrophus in complex with ketoconazole (see paper)
41% identity, 35% coverage: 343:587/700 of query aligns to 154:398/403 of 3ozwA

query
sites
3ozwA
W
 
W
R
 
R
P
 
T
F
 
F
K
 
V
V
 
I
L
 
R
E
 
E
T
 
K
I
 
R
D
 
P
E
 
E
S
 
S
A
 
D
T
 
V
I
 
I
R
 
T
S
 
S
F
 
F
I
 
I
L
 
L
E
 
E
P
 
P
A
 
A
D
 
D
G
 
G
S
 
G
G
 
P
L
 
V
V
 
V
G
 
N
Y
 
F
Q
 
E
A
 
P
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
T
P
 
S
I
 
V
R
 
A
L
 
I
Q
 
D
P
 
V
P
 
P
G
 
A
W
 
L
A
 
G
E
 
L
P
 
Q
T
 
Q
I
 
I
R
|
R
T
x
Q
Y
|
Y
T
x
S
L
 
L
S
 
S
D
 
D
A
 
M
S
 
P
N
 
N
G
 
G
R
 
R
T
 
S
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
S
|
S
V
|
V
K
|
K
R
 
R
E
|
E
G
 
G
-
 
G
-
 
G
-
 
P
-
 
Q
-
x
P
K
 
P
G
|
G
G
x
Y
C
x
V
S
|
S
D
 
N
F
 
L
L
 
L
H
 
H
D
 
D
H
 
H
I
 
V
V
 
N
V
 
V
G
 
G
D
 
D
T
 
Q
I
 
V
E
 
K
T
 
L
L
 
A
A
 
A
P
 
P
R
 
Y
G
 
G
A
 
S
F
 
F
V
 
H
F
 
I
D
 
D
E
 
V
A
 
D
A
 
A
G
 
K
R
 
T
P
 
P
L
 
I
A
 
V
L
 
L
I
 
I
S
 
S
A
 
G
G
 
G
V
|
V
G
 
G
I
 
L
T
|
T
P
 
P
L
 
M
I
 
V
A
 
S
M
 
M
L
 
L
N
 
K
S
 
V
Q
 
A
L
 
L
V
 
Q
N
 
A
D
 
P
G
 
P
R
 
R
T
 
Q
L
 
V
L
 
V
H
 
-
K
 
-
P
 
-
I
 
-
Y
 
-
C
 
F
I
 
V
H
 
H
S
 
G
A
 
A
T
 
R
N
 
N
S
 
S
K
 
A
H
 
V
R
 
H
A
 
A
F
 
M
A
 
R
A
 
D
H
 
R
L
 
L
A
 
R
K
 
E
K
 
A
G
 
A
E
 
K
L
 
T
H
 
Y
A
 
E
N
 
N
L
 
L
T
 
D
L
 
L
H
 
F
V
 
V
A
 
F
F
 
Y
S
 
D
R
 
Q
P
 
P
S
 
L
E
 
P
D
 
E
D
 
D
V
 
V
L
 
Q
G
 
G
K
 
R
T
 
D
H
 
Y
Q
 
D
S
 
Y
E
 
P
G
 
G
Y
 
L
I
 
V
D
 
D
R
 
V
A
 
K
L
 
Q
L
 
I
R
 
E
R
 
K
V
 
S
L
 
I
P
 
L
L
 
L
D
 
P
D
 
D
Y
 
A
E
 
D
V
 
Y
Y
 
Y
L
 
I
C
 
C
G
 
G
P
 
P
P
 
I
G
 
P
F
 
F
M
 
M
Q
 
R
S
 
M
V
 
Q
Y
 
H
D
 
D
A
 
A
L
 
L
L
 
K
S
 
N
L
 
L
G
 
G
V
 
I
R
 
H
D
 
E
S
 
A
R
 
R
I
 
I
H
 
H
L
 
Y
E
 
E
S
x
V
F
|
F
G
 
G
P
|
P

Sites not aligning to the query:

3ozvA The crystal structure of flavohemoglobin from r. Eutrophus in complex with econazole (see paper)
41% identity, 35% coverage: 343:587/700 of query aligns to 154:398/403 of 3ozvA

query
sites
3ozvA
W
 
W
R
 
R
P
 
T
F
 
F
K
 
V
V
 
I
L
 
R
E
 
E
T
 
K
I
 
R
D
 
P
E
 
E
S
 
S
A
 
D
T
 
V
I
 
I
R
 
T
S
 
S
F
 
F
I
 
I
L
 
L
E
 
E
P
 
P
A
 
A
D
 
D
G
 
G
S
 
G
G
 
P
L
 
V
V
 
V
G
 
N
Y
 
F
Q
 
E
A
 
P
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
T
P
 
S
I
 
V
R
 
A
L
 
I
Q
 
D
P
 
V
P
 
P
G
 
A
W
 
L
A
 
G
E
 
L
P
 
Q
T
 
Q
I
 
I
R
|
R
T
x
Q
Y
|
Y
T
x
S
L
 
L
S
 
S
D
 
D
A
 
M
S
 
P
N
 
N
G
 
G
R
 
R
T
 
S
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
S
|
S
V
|
V
K
|
K
R
 
R
E
|
E
G
 
G
-
 
G
-
 
G
-
 
P
-
 
Q
-
x
P
K
 
P
G
|
G
G
x
Y
C
x
V
S
|
S
D
 
N
F
 
L
L
 
L
H
 
H
D
 
D
H
 
H
I
 
V
V
 
N
V
 
V
G
 
G
D
 
D
T
 
Q
I
 
V
E
 
K
T
 
L
L
 
A
A
 
A
P
 
P
R
 
Y
G
 
G
A
 
S
F
 
F
V
 
H
F
 
I
D
 
D
E
 
V
A
 
D
A
 
A
G
 
K
R
 
T
P
 
P
L
 
I
A
 
V
L
 
L
I
 
I
S
 
S
A
 
G
G
 
G
V
|
V
G
 
G
I
 
L
T
|
T
P
 
P
L
 
M
I
 
V
A
 
S
M
 
M
L
 
L
N
 
K
S
 
V
Q
 
A
L
 
L
V
 
Q
N
 
A
D
 
P
G
 
P
R
 
R
T
 
Q
L
 
V
L
 
V
H
 
-
K
 
-
P
 
-
I
 
-
Y
 
-
C
 
F
I
 
V
H
 
H
S
 
G
A
 
A
T
 
R
N
 
N
S
 
S
K
 
A
H
 
V
R
 
H
A
 
A
F
 
M
A
 
R
A
 
D
H
 
R
L
 
L
A
 
R
K
 
E
K
 
A
G
 
A
E
 
K
L
 
T
H
 
Y
A
 
E
N
 
N
L
 
L
T
 
D
L
 
L
H
 
F
V
 
V
A
 
F
F
 
Y
S
 
D
R
 
Q
P
 
P
S
 
L
E
 
P
D
 
E
D
 
D
V
 
V
L
 
Q
G
 
G
K
 
R
T
 
D
H
 
Y
Q
 
D
S
 
Y
E
 
P
G
 
G
Y
 
L
I
 
V
D
 
D
R
 
V
A
 
K
L
 
Q
L
 
I
R
 
E
R
 
K
V
 
S
L
 
I
P
 
L
L
 
L
D
 
P
D
 
D
Y
 
A
E
 
D
V
 
Y
Y
 
Y
L
 
I
C
 
C
G
 
G
P
 
P
P
 
I
G
 
P
F
 
F
M
 
M
Q
 
R
S
 
M
V
 
Q
Y
 
H
D
 
D
A
 
A
L
 
L
L
 
K
S
 
N
L
 
L
G
 
G
V
 
I
R
 
H
D
 
E
S
 
A
R
 
R
I
 
I
H
 
H
L
 
Y
E
 
E
S
 
V
F
|
F
G
 
G
P
 
P

Sites not aligning to the query:

3ozuA The crystal structure of flavohemoglobin from r. Eutrophus in complex with miconazole (see paper)
41% identity, 35% coverage: 343:587/700 of query aligns to 154:398/403 of 3ozuA

query
sites
3ozuA
W
 
W
R
 
R
P
 
T
F
 
F
K
 
V
V
 
I
L
 
R
E
 
E
T
 
K
I
 
R
D
 
P
E
 
E
S
 
S
A
 
D
T
 
V
I
 
I
R
 
T
S
 
S
F
 
F
I
 
I
L
 
L
E
 
E
P
 
P
A
 
A
D
 
D
G
 
G
S
 
G
G
 
P
L
 
V
V
 
V
G
 
N
Y
 
F
Q
 
E
A
 
P
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
T
P
 
S
I
 
V
R
 
A
L
 
I
Q
 
D
P
 
V
P
 
P
G
 
A
W
 
L
A
 
G
E
 
L
P
 
Q
T
 
Q
I
 
I
R
|
R
T
x
Q
Y
|
Y
T
x
S
L
 
L
S
 
S
D
 
D
A
 
M
S
 
P
N
 
N
G
 
G
R
 
R
T
 
S
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
S
|
S
V
|
V
K
|
K
R
 
R
E
|
E
G
 
G
-
 
G
-
 
G
-
 
P
-
 
Q
-
x
P
K
 
P
G
|
G
G
x
Y
C
x
V
S
|
S
D
 
N
F
 
L
L
 
L
H
 
H
D
 
D
H
 
H
I
 
V
V
 
N
V
 
V
G
 
G
D
 
D
T
 
Q
I
 
V
E
 
K
T
 
L
L
 
A
A
 
A
P
 
P
R
 
Y
G
 
G
A
 
S
F
 
F
V
 
H
F
 
I
D
 
D
E
 
V
A
 
D
A
 
A
G
 
K
R
 
T
P
 
P
L
 
I
A
 
V
L
 
L
I
 
I
S
 
S
A
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
G
I
 
L
T
 
T
P
 
P
L
 
M
I
 
V
A
 
S
M
 
M
L
 
L
N
 
K
S
 
V
Q
 
A
L
 
L
V
 
Q
N
 
A
D
 
P
G
 
P
R
 
R
T
 
Q
L
 
V
L
 
V
H
 
-
K
 
-
P
 
-
I
 
-
Y
 
-
C
 
F
I
 
V
H
 
H
S
 
G
A
 
A
T
 
R
N
 
N
S
 
S
K
 
A
H
 
V
R
 
H
A
 
A
F
 
M
A
 
R
A
 
D
H
 
R
L
 
L
A
 
R
K
 
E
K
 
A
G
 
A
E
 
K
L
 
T
H
 
Y
A
 
E
N
 
N
L
 
L
T
 
D
L
 
L
H
 
F
V
 
V
A
 
F
F
 
Y
S
 
D
R
 
Q
P
 
P
S
 
L
E
 
P
D
 
E
D
 
D
V
 
V
L
 
Q
G
 
G
K
 
R
T
 
D
H
 
Y
Q
 
D
S
 
Y
E
 
P
G
 
G
Y
 
L
I
 
V
D
 
D
R
 
V
A
 
K
L
 
Q
L
 
I
R
 
E
R
 
K
V
 
S
L
 
I
P
 
L
L
 
L
D
 
P
D
 
D
Y
 
A
E
 
D
V
 
Y
Y
 
Y
L
 
I
C
 
C
G
 
G
P
 
P
P
 
I
G
 
P
F
 
F
M
 
M
Q
 
R
S
 
M
V
 
Q
Y
 
H
D
 
D
A
 
A
L
 
L
L
 
K
S
 
N
L
 
L
G
 
G
V
 
I
R
 
H
D
 
E
S
 
A
R
 
R
I
 
I
H
 
H
L
 
Y
E
|
E
S
x
V
F
 
F
G
|
G
P
|
P

Sites not aligning to the query:

P39662 Flavohemoprotein; FHP; Flavohemoglobin; Hemoglobin-like protein; Nitric oxide dioxygenase; NO oxygenase; NOD; EC 1.14.12.17 from Cupriavidus necator (strain ATCC 17699 / DSM 428 / KCTC 22496 / NCIMB 10442 / H16 / Stanier 337) (Ralstonia eutropha) (see paper)
41% identity, 35% coverage: 343:587/700 of query aligns to 154:398/403 of P39662

query
sites
P39662
W
 
W
R
 
R
P
 
T
F
 
F
K
 
V
V
 
I
L
 
R
E
 
E
T
 
K
I
 
R
D
 
P
E
 
E
S
 
S
A
 
D
T
 
V
I
 
I
R
 
T
S
 
S
F
 
F
I
 
I
L
 
L
E
 
E
P
 
P
A
 
A
D
 
D
G
 
G
S
 
G
G
 
P
L
 
V
V
 
V
G
 
N
Y
 
F
Q
 
E
A
 
P
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
T
P
 
S
I
 
V
R
 
A
L
 
I
Q
 
D
P
 
V
P
 
P
G
 
A
W
 
L
A
 
G
E
 
L
P
 
Q
T
 
Q
I
 
I
R
 
R
T
 
Q
Y
 
Y
T
 
S
L
 
L
S
 
S
D
 
D
A
 
M
S
 
P
N
 
N
G
 
G
R
 
R
T
 
S
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
S
 
S
V
 
V
K
 
K
R
 
R
E
 
E
G
 
G
-
 
G
-
 
G
-
 
P
-
 
Q
-
 
P
K
 
P
G
 
G
G
 
Y
C
 
V
S
 
S
D
 
N
F
 
L
L
 
L
H
 
H
D
 
D
H
 
H
I
 
V
V
 
N
V
 
V
G
 
G
D
 
D
T
 
Q
I
 
V
E
 
K
T
 
L
L
 
A
A
 
A
P
 
P
R
 
Y
G
 
G
A
 
S
F
 
F
V
 
H
F
 
I
D
 
D
E
 
V
A
 
D
A
 
A
G
 
K
R
 
T
P
 
P
L
 
I
A
 
V
L
 
L
I
 
I
S
 
S
A
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
G
I
 
L
T
 
T
P
 
P
L
 
M
I
 
V
A
 
S
M
 
M
L
 
L
N
 
K
S
 
V
Q
 
A
L
 
L
V
 
Q
N
 
A
D
 
P
G
 
P
R
 
R
T
 
Q
L
 
V
L
 
V
H
 
-
K
 
-
P
 
-
I
 
-
Y
 
-
C
 
F
I
 
V
H
 
H
S
 
G
A
 
A
T
 
R
N
 
N
S
 
S
K
 
A
H
 
V
R
 
H
A
 
A
F
 
M
A
 
R
A
 
D
H
 
R
L
 
L
A
 
R
K
 
E
K
 
A
G
 
A
E
 
K
L
 
T
H
 
Y
A
 
E
N
 
N
L
 
L
T
 
D
L
 
L
H
 
F
V
 
V
A
 
F
F
 
Y
S
 
D
R
 
Q
P
 
P
S
 
L
E
 
P
D
 
E
D
 
D
V
 
V
L
 
Q
G
 
G
K
 
R
T
 
D
H
 
Y
Q
 
D
S
 
Y
E
 
P
G
 
G
Y
 
L
I
 
V
D
 
D
R
 
V
A
 
K
L
 
Q
L
 
I
R
 
E
R
 
K
V
 
S
L
 
I
P
 
L
L
 
L
D
 
P
D
 
D
Y
 
A
E
 
D
V
 
Y
Y
 
Y
L
 
I
C
 
C
G
 
G
P
 
P
P
 
I
G
 
P
F
 
F
M
 
M
Q
 
R
S
 
M
V
 
Q
Y
 
H
D
 
D
A
 
A
L
 
L
L
 
K
S
 
N
L
 
L
G
 
G
V
 
I
R
 
H
D
 
E
S
 
A
R
 
R
I
 
I
H
 
H
L
 
Y
E
 
E
S
 
V
F
 
F
G
 
G
P
 
P

Sites not aligning to the query:

1gvhA The x-ray structure of ferric escherichia coli flavohemoglobin reveals an unespected geometry of the distal heme pocket (see paper)
40% identity, 35% coverage: 344:590/700 of query aligns to 153:395/396 of 1gvhA

query
sites
1gvhA
R
 
R
P
 
D
F
 
F
K
 
R
V
 
I
L
 
V
E
 
A
T
 
K
I
 
T
D
 
P
E
 
R
S
 
S
A
 
A
T
 
L
I
 
I
R
 
T
S
 
S
F
 
F
I
 
E
L
 
L
E
 
E
P
 
P
A
 
V
D
 
D
G
 
G
S
 
G
G
 
A
L
 
V
V
 
A
G
 
E
Y
 
Y
Q
 
R
A
 
P
G
 
G
Q
 
Q
Y
|
Y
L
 
L
P
 
G
I
 
V
R
 
W
L
 
L
Q
 
K
P
 
P
P
 
E
G
 
G
W
 
F
A
 
P
E
 
H
P
 
Q
T
 
E
I
 
I
R
|
R
T
x
Q
Y
|
Y
T
x
S
L
 
L
S
 
T
D
 
R
A
 
K
S
 
P
N
 
D
G
 
G
R
 
K
T
 
G
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
S
x
A
V
|
V
K
 
K
R
 
R
E
|
E
G
 
E
K
 
G
G
|
G
G
x
Q
C
x
V
S
|
S
D
 
N
F
 
W
L
 
L
H
 
H
D
 
N
H
 
H
I
 
A
V
 
N
V
 
V
G
 
G
D
 
D
T
 
V
I
 
V
E
 
K
T
 
L
L
 
V
A
 
A
P
 
P
R
 
A
G
 
G
A
 
D
F
 
F
V
 
F
F
 
M
D
 
A
E
 
V
A
 
A
A
 
D
G
 
D
R
 
T
P
 
P
L
 
V
A
 
T
L
 
L
I
 
I
S
 
S
A
 
A
G
 
G
V
|
V
G
 
G
I
 
Q
T
|
T
P
 
P
L
 
M
I
 
L
A
 
A
M
 
M
L
 
L
N
 
D
S
 
T
Q
 
-
L
 
L
V
 
A
N
 
K
D
 
A
G
 
G
R
 
H
T
 
T
L
 
-
L
 
-
H
 
-
K
 
A
P
 
Q
I
 
V
Y
 
N
C
 
W
I
 
F
H
 
H
S
 
A
A
 
A
T
 
E
N
 
N
S
 
G
K
 
D
H
 
V
R
 
H
A
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
D
H
 
E
L
 
V
A
 
K
K
 
E
K
 
L
G
 
G
E
 
Q
L
 
S
H
 
L
A
 
P
N
 
R
L
 
F
T
 
T
L
 
A
H
 
H
V
 
T
A
 
W
F
 
Y
S
 
R
R
 
Q
P
 
P
S
 
S
E
 
E
D
 
A
D
 
D
V
 
R
L
 
A
G
 
K
K
 
G
T
 
Q
H
 
F
Q
 
D
S
 
S
E
 
E
G
 
G
Y
 
L
I
 
M
D
 
D
R
 
L
A
 
S
L
 
K
L
 
L
R
 
E
R
 
G
V
 
A
L
 
F
P
 
S
L
 
D
D
 
P
D
 
T
Y
 
M
E
 
Q
V
 
F
Y
 
Y
L
 
L
C
 
C
G
 
G
P
 
P
P
 
V
G
 
G
F
 
F
M
 
M
Q
 
Q
S
 
F
V
 
T
Y
 
A
D
 
K
A
 
Q
L
 
L
L
 
V
S
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
K
D
 
Q
S
 
E
R
 
N
I
 
I
H
 
H
L
 
Y
E
|
E
S
 
C
F
|
F
G
 
G
P
 
P
A
x
H
S
 
K
V
 
V

Sites not aligning to the query:

P24232 Flavohemoprotein; Flavohemoglobin; HMP; Hemoglobin-like protein; Nitric oxide dioxygenase; NO oxygenase; NOD; EC 1.14.12.17 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
40% identity, 35% coverage: 344:590/700 of query aligns to 153:395/396 of P24232

query
sites
P24232
R
 
R
P
 
D
F
 
F
K
 
R
V
 
I
L
 
V
E
 
A
T
 
K
I
 
T
D
 
P
E
 
R
S
 
S
A
 
A
T
 
L
I
 
I
R
 
T
S
 
S
F
 
F
I
 
E
L
 
L
E
 
E
P
 
P
A
 
V
D
 
D
G
 
G
S
 
G
G
 
A
L
 
V
V
 
A
G
 
E
Y
 
Y
Q
 
R
A
 
P
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
P
 
G
I
 
V
R
 
W
L
 
L
Q
 
K
P
 
P
P
 
E
G
 
G
W
 
F
A
 
P
E
 
H
P
 
Q
T
 
E
I
 
I
R
 
R
T
 
Q
Y
 
Y
T
 
S
L
 
L
S
 
T
D
 
R
A
 
K
S
 
P
N
 
D
G
 
G
R
 
K
T
 
G
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
S
 
A
V
 
V
K
 
K
R
 
R
E
 
E
G
 
E
K
 
G
G
 
G
G
 
Q
C
 
V
S
 
S
D
 
N
F
 
W
L
 
L
H
 
H
D
 
N
H
 
H
I
 
A
V
 
N
V
 
V
G
 
G
D
 
D
T
 
V
I
 
V
E
 
K
T
 
L
L
 
V
A
 
A
P
 
P
R
 
A
G
 
G
A
 
D
F
 
F
V
 
F
F
 
M
D
 
A
E
 
V
A
 
A
A
 
D
G
 
D
R
 
T
P
 
P
L
 
V
A
 
T
L
 
L
I
 
I
S
 
S
A
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
G
I
 
Q
T
 
T
P
 
P
L
 
M
I
 
L
A
 
A
M
 
M
L
 
L
N
 
D
S
 
T
Q
 
-
L
 
L
V
 
A
N
 
K
D
 
A
G
 
G
R
 
H
T
 
T
L
 
-
L
 
-
H
 
-
K
 
A
P
 
Q
I
 
V
Y
 
N
C
 
W
I
 
F
H
 
H
S
 
A
A
 
A
T
 
E
N
 
N
S
 
G
K
 
D
H
 
V
R
 
H
A
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
D
H
 
E
L
 
V
A
 
K
K
 
E
K
 
L
G
 
G
E
 
Q
L
 
S
H
 
L
A
 
P
N
 
R
L
 
F
T
 
T
L
 
A
H
 
H
V
 
T
A
 
W
F
 
Y
S
 
R
R
 
Q
P
 
P
S
 
S
E
 
E
D
 
A
D
 
D
V
 
R
L
 
A
G
 
K
K
 
G
T
 
Q
H
 
F
Q
 
D
S
 
S
E
 
E
G
 
G
Y
 
L
I
 
M
D
 
D
R
 
L
A
 
S
L
 
K
L
 
L
R
 
E
R
 
G
V
 
A
L
 
F
P
 
S
L
 
D
D
 
P
D
 
T
Y
 
M
E
 
Q
V
 
F
Y
 
Y
L
 
L
C
 
C
G
 
G
P
 
P
P
 
V
G
 
G
F
 
F
M
 
M
Q
 
Q
S
 
F
V
 
T
Y
 
A
D
 
K
A
 
Q
L
 
L
L
 
V
S
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
K
D
 
Q
S
 
E
R
 
N
I
 
I
H
 
H
L
 
Y
E
 
E
S
 
C
F
 
F
G
 
G
P
 
P
A
 
H
S
 
K
V
 
V

Sites not aligning to the query:

4eh1A Crystal structure of the flavohem-like-fad/NAD binding domain of nitric oxide dioxygenase from vibrio cholerae o1 biovar el tor
42% identity, 35% coverage: 344:587/700 of query aligns to 4:237/237 of 4eh1A

query
sites
4eh1A
R
 
R
P
 
T
F
 
F
K
 
V
V
 
V
L
 
R
E
 
E
T
 
K
I
 
Q
D
 
V
E
 
E
S
 
S
A
 
A
T
 
Y
I
 
V
R
 
T
S
 
S
F
 
F
I
 
V
L
 
L
E
 
V
P
 
P
A
 
A
D
 
D
G
 
G
S
 
G
G
 
A
L
 
V
V
 
L
G
 
D
Y
 
Y
Q
 
Q
A
 
P
G
 
G
Q
 
Q
Y
|
Y
L
 
I
P
 
G
I
 
I
R
 
E
L
 
V
Q
 
T
P
 
P
P
 
E
G
 
G
W
 
S
A
 
D
E
 
Y
P
 
R
T
 
E
I
 
I
R
|
R
T
x
Q
Y
|
Y
T
x
S
L
 
L
S
 
S
D
 
H
A
 
A
S
 
S
N
 
N
G
 
G
R
 
R
T
 
E
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
S
|
S
V
|
V
K
 
K
R
 
R
E
|
E
G
 
G
K
 
V
G
 
G
G
 
S
-
 
D
-
x
N
-
 
P
-
x
G
-
x
L
C
x
V
S
|
S
D
 
H
F
 
Y
L
 
L
H
 
H
D
 
N
H
 
N
I
 
V
V
 
K
V
 
V
G
 
G
D
 
D
T
 
S
I
 
V
E
 
K
T
 
L
L
 
Y
A
 
A
P
 
P
R
 
A
G
 
G
A
 
D
F
 
F
V
 
F
F
 
Y
D
 
V
E
 
E
A
 
R
A
 
E
G
 
-
R
 
R
P
 
P
L
 
V
A
 
V
L
 
L
I
 
I
S
 
S
A
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
G
I
 
A
T
|
T
P
 
P
L
 
M
I
 
Q
A
 
A
M
 
I
L
 
L
N
 
H
S
 
T
Q
 
-
L
 
L
V
 
A
N
 
K
D
 
Q
G
 
N
R
 
K
T
 
S
L
 
G
L
 
V
H
 
T
K
 
Y
P
 
L
I
 
Y
Y
 
A
C
 
C
I
 
N
H
 
S
S
 
A
A
 
K
T
 
E
N
 
H
S
 
T
K
 
F
H
 
A
R
 
Q
A
 
E
F
 
T
A
 
A
A
 
Q
H
 
L
L
 
I
A
 
A
K
 
Q
K
 
Q
G
 
G
E
 
W
L
 
M
H
 
Q
A
 
-
N
 
-
L
 
-
T
 
-
L
 
-
H
 
Q
V
 
V
A
 
W
F
 
Y
S
 
R
R
 
D
P
 
E
S
 
S
E
 
A
D
 
D
D
 
D
V
 
V
L
 
L
G
 
Q
K
 
G
T
 
E
H
 
M
Q
 
Q
S
 
-
E
 
-
G
 
-
Y
 
-
I
 
-
D
 
-
R
 
-
A
 
-
L
 
L
L
 
A
R
 
E
R
 
L
V
 
I
L
 
L
P
 
P
L
 
I
D
 
E
D
 
D
Y
 
G
E
 
D
V
 
F
Y
 
Y
L
 
L
C
 
C
G
 
G
P
 
P
P
 
I
G
 
G
F
 
F
M
 
M
Q
 
Q
S
 
Y
V
 
V
Y
 
V
D
 
K
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
S
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
D
D
 
K
S
 
A
R
 
R
I
 
I
H
 
H
L
 
Y
E
|
E
S
 
V
F
|
F
G
 
G
P
 
P

4g1bA X-ray structure of yeast flavohemoglobin in complex with econazole (see paper)
32% identity, 37% coverage: 330:587/700 of query aligns to 136:392/398 of 4g1bA

query
sites
4g1bA
V
 
V
A
 
E
K
 
K
T
 
K
L
 
M
E
 
Y
A
 
E
E
 
E
R
 
A
L
 
L
R
 
W
T
 
P
V
 
G
W
 
W
R
 
K
P
 
P
F
 
F
K
 
E
V
 
I
L
 
T
E
 
A
T
 
K
I
 
E
D
 
Y
E
 
V
S
 
A
A
 
S
T
 
D
I
 
I
R
 
V
S
 
E
F
 
F
I
 
T
L
 
V
E
 
K
P
 
P
A
 
K
D
 
F
G
 
G
S
 
S
G
 
G
L
 
I
-
 
E
-
 
L
-
 
E
-
 
S
V
 
L
G
 
P
Y
 
I
Q
 
T
A
 
P
G
 
G
Q
 
Q
Y
|
Y
L
 
I
P
 
T
I
 
V
R
 
N
L
 
T
Q
 
H
P
 
P
P
 
I
G
 
R
W
 
Q
A
 
E
E
 
N
P
 
Q
-
 
Y
-
 
D
T
 
A
I
 
L
R
|
R
T
x
H
Y
|
Y
T
x
S
L
 
L
S
 
C
D
 
S
A
 
A
S
 
S
N
 
T
G
 
K
R
 
N
T
 
G
Y
 
L
R
 
R
I
 
F
S
x
A
V
 
V
K
|
K
R
 
M
E
|
E
G
 
A
K
 
A
-
 
R
-
 
E
-
 
N
-
x
F
-
x
P
-
 
A
G
|
G
G
x
L
C
x
V
S
|
S
D
 
E
F
 
Y
L
 
L
H
 
H
D
 
K
H
 
D
I
 
A
V
 
K
V
 
V
G
 
G
D
 
D
T
 
E
I
 
I
E
 
K
T
 
L
L
 
S
A
 
A
P
 
P
R
 
A
G
 
G
A
 
D
F
 
F
V
 
A
F
 
I
D
 
N
E
 
K
A
 
E
A
 
L
G
 
I
R
 
H
-
 
Q
-
 
N
-
 
E
-
 
V
P
 
P
L
 
L
A
 
V
L
 
L
I
 
L
S
 
S
A
 
S
G
 
G
V
|
V
G
 
G
I
 
V
T
 
T
P
 
P
L
 
L
I
 
L
A
 
A
M
 
M
L
 
L
N
 
E
S
 
E
Q
 
Q
L
 
V
V
 
-
N
 
-
D
 
-
G
 
-
R
 
K
T
 
C
L
 
N
L
 
P
H
 
N
K
 
R
P
 
P
I
 
I
Y
 
Y
C
 
W
I
 
I
H
 
Q
S
 
S
A
 
S
T
 
Y
N
 
D
S
 
E
K
 
K
H
 
T
R
 
Q
A
 
A
F
 
F
A
 
K
A
 
K
H
 
H
L
 
V
A
 
D
K
 
E
K
 
L
G
 
L
E
 
A
L
 
E
H
 
C
A
 
A
N
 
N
L
 
V
T
 
-
L
 
-
H
 
-
V
 
-
A
 
-
F
 
-
S
 
-
R
 
-
P
 
-
S
 
-
E
 
-
D
 
D
D
 
K
V
 
I
L
 
I
G
 
V
K
 
H
T
 
T
H
 
-
Q
 
D
S
 
T
E
 
E
G
 
P
Y
 
L
I
 
I
D
 
N
R
 
A
A
 
A
L
 
F
L
 
L
R
 
K
R
 
E
V
 
K
L
 
S
P
 
P
L
 
A
D
 
H
D
 
A
Y
 
-
E
 
D
V
 
V
Y
 
Y
L
 
T
C
 
C
G
 
G
P
 
S
P
 
L
G
 
A
F
 
F
M
 
M
Q
 
Q
S
 
A
V
 
M
Y
 
I
D
 
G
A
 
H
L
 
L
L
 
K
S
 
E
L
 
L
G
 
E
V
 
H
R
 
R
D
 
D
S
 
D
R
 
M
I
 
I
H
 
H
L
 
Y
E
 
E
S
 
P
F
|
F
G
 
G
P
|
P

Sites not aligning to the query:

2piaA Phthalate dioxygenase reductase: a modular structure for electron transfer from pyridine nucleotides to [2fe-2s] (see paper)
27% identity, 46% coverage: 358:679/700 of query aligns to 23:311/321 of 2piaA

query
sites
2piaA
I
 
I
R
 
W
S
 
S
F
 
F
I
 
E
L
 
L
E
 
T
P
 
D
A
 
P
D
 
Q
G
 
G
S
 
A
G
 
P
L
 
L
V
 
P
G
 
P
Y
 
F
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
A
Y
x
N
L
 
L
P
 
T
I
 
V
R
 
A
L
 
V
Q
 
-
P
 
P
P
 
N
G
 
G
W
 
-
A
 
-
E
 
-
P
 
-
T
 
S
I
 
R
R
|
R
T
|
T
Y
|
Y
T
x
S
L
 
L
S
 
C
D
 
N
A
 
D
S
 
S
N
 
Q
G
 
E
R
 
R
T
 
N
-
 
R
Y
 
Y
R
 
V
I
 
I
S
x
A
V
|
V
K
 
K
R
 
R
E
 
D
-
 
S
-
 
N
G
|
G
K
x
R
G
 
G
G
|
G
C
x
S
S
 
I
D
 
S
F
 
F
L
 
I
H
 
D
D
 
D
H
 
-
I
 
T
V
 
S
V
 
E
G
 
G
D
 
D
T
 
A
I
 
V
E
 
E
T
 
V
L
 
S
A
 
L
P
 
P
R
 
R
G
 
N
A
 
E
F
 
F
V
 
P
F
 
L
D
 
D
E
 
K
A
 
R
A
 
A
G
 
-
R
 
K
P
 
S
L
 
F
A
 
I
L
 
L
I
 
V
S
 
A
A
 
G
G
 
G
V
x
I
G
 
G
I
 
I
T
|
T
P
 
P
L
 
M
I
 
L
A
 
S
M
 
M
L
 
A
N
 
R
S
 
-
Q
 
Q
L
 
L
V
 
R
N
 
A
D
 
E
G
 
G
R
 
L
T
 
-
L
 
-
L
 
-
H
 
-
K
 
R
P
 
S
I
 
F
Y
 
R
C
 
L
I
 
Y
H
 
Y
S
 
L
A
 
T
T
 
R
N
 
D
S
 
P
K
 
E
H
 
G
R
 
T
A
 
A
F
 
F
A
 
F
A
 
D
H
 
E
L
 
L
A
 
T
K
 
S
K
 
D
G
 
-
E
 
E
L
 
W
H
 
R
A
 
S
N
 
D
L
 
V
T
 
K
L
 
I
H
 
H
V
 
H
A
 
D
F
 
H
S
 
G
R
 
D
P
 
P
S
 
-
E
 
-
D
 
-
D
 
-
V
 
-
L
 
-
G
 
-
K
 
-
T
 
-
H
 
-
Q
 
-
S
 
T
E
 
K
G
 
A
Y
 
F
I
 
D
D
 
F
R
 
W
A
 
S
L
 
V
L
 
F
R
 
E
R
 
K
V
 
S
L
 
K
P
 
P
L
 
A
D
 
Q
D
 
-
Y
 
-
E
 
H
V
 
V
Y
 
Y
L
 
C
C
 
C
G
 
G
P
 
P
P
 
Q
G
 
A
F
 
L
M
 
M
Q
 
D
S
 
T
V
 
V
Y
 
R
D
 
D
A
 
-
L
 
-
L
 
M
S
 
T
L
 
G
G
 
H
V
 
W
R
 
P
D
 
S
S
 
G
R
 
T
I
 
V
H
 
H
L
 
F
E
|
E
S
 
S
F
|
F
G
 
G
P
 
A
A
 
T
S
 
N
V
 
T
S
 
N
R
 
A
R
 
R
I
 
-
E
 
-
R
 
-
T
 
-
V
 
-
E
 
-
V
 
-
D
 
-
N
 
E
S
 
N
E
 
T
G
 
P
V
 
F
V
 
T
V
 
V
T
 
R
F
 
L
A
 
S
K
 
R
S
 
S
G
 
G
R
 
-
N
 
T
A
 
S
I
 
F
W
 
E
R
 
I
P
 
P
K
 
A
V
 
N
G
 
R
S
 
S
L
 
I
L
 
L
E
 
E
L
 
V
A
 
L
E
 
R
A
 
D
N
 
A
G
 
N
L
 
V
K
 
R
P
 
V
L
 
P
Y
x
S
A
 
S
C
|
C
R
x
E
S
 
S
G
|
G
S
 
T
C
|
C
G
|
G
T
 
S
C
|
C
V
 
K
T
 
T
R
 
A
V
 
L
V
 
C
K
 
S
G
 
G
E
 
E
V
 
A
D
 
D
Y
 
H
T
 
R
E
 
D
P
 
M
P
 
V
A
 
L
H
 
R
D
 
D
V
 
D
E
 
E
P
 
K
G
 
G
-
 
T
E
 
Q
A
 
I
L
 
M
I
 
V
C
|
C
I
 
V
A
 
S
R
 
R

P33164 Phthalate dioxygenase reductase; PDR; EC 1.-.-.- from Burkholderia cepacia (Pseudomonas cepacia) (see paper)
27% identity, 46% coverage: 358:679/700 of query aligns to 24:312/322 of P33164

query
sites
P33164
I
 
I
R
 
W
S
 
S
F
 
F
I
 
E
L
 
L
E
 
T
P
 
D
A
 
P
D
 
Q
G
 
G
S
 
A
G
 
P
L
 
L
V
 
P
G
 
P
Y
 
F
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
A
Y
 
N
L
 
L
P
 
T
I
 
V
R
 
A
L
 
V
Q
 
-
P
 
P
P
 
N
G
 
G
W
 
-
A
 
-
E
 
-
P
 
-
T
 
S
I
 
R
R
|
R
T
|
T
Y
 
Y
T
 
S
L
 
L
S
 
C
D
 
N
A
 
D
S
 
S
N
 
Q
G
 
E
R
 
R
T
 
N
-
 
R
Y
 
Y
R
 
V
I
 
I
S
x
A
V
|
V
K
|
K
R
 
R
E
 
D
-
 
S
-
 
N
G
 
G
K
x
R
G
|
G
G
|
G
C
x
S
S
 
I
D
 
S
F
 
F
L
 
I
H
 
D
D
 
D
H
 
-
I
 
T
V
 
S
V
 
E
G
 
G
D
 
D
T
 
A
I
 
V
E
 
E
T
 
V
L
 
S
A
 
L
P
 
P
R
 
R
G
 
N
A
 
E
F
 
F
V
 
P
F
 
L
D
 
D
E
 
K
A
 
R
A
 
A
G
 
-
R
 
K
P
 
S
L
 
F
A
 
I
L
 
L
I
 
V
S
 
A
A
 
G
G
 
G
V
 
I
G
 
G
I
 
I
T
|
T
P
 
P
L
 
M
I
 
L
A
 
S
M
 
M
L
 
A
N
 
R
S
 
-
Q
 
Q
L
 
L
V
 
R
N
 
A
D
 
E
G
 
G
R
 
L
T
 
-
L
 
-
L
 
-
H
 
-
K
 
R
P
 
S
I
 
F
Y
 
R
C
 
L
I
 
Y
H
 
Y
S
 
L
A
 
T
T
 
R
N
 
D
S
 
P
K
 
E
H
 
G
R
 
T
A
 
A
F
 
F
A
 
F
A
 
D
H
 
E
L
 
L
A
 
T
K
 
S
K
 
D
G
 
-
E
 
E
L
 
W
H
 
R
A
 
S
N
 
D
L
 
V
T
 
K
L
 
I
H
 
H
V
 
H
A
 
D
F
 
H
S
 
G
R
 
D
P
 
P
S
 
-
E
 
-
D
 
-
D
 
-
V
 
-
L
 
-
G
 
-
K
 
-
T
 
-
H
 
-
Q
 
-
S
 
T
E
 
K
G
 
A
Y
 
F
I
 
D
D
 
F
R
 
W
A
 
S
L
 
V
L
 
F
R
 
E
R
 
K
V
 
S
L
 
K
P
 
P
L
 
A
D
 
Q
D
 
-
Y
 
-
E
 
H
V
 
V
Y
 
Y
L
 
C
C
 
C
G
 
G
P
 
P
P
 
Q
G
 
A
F
 
L
M
 
M
Q
 
D
S
 
T
V
 
V
Y
 
R
D
 
D
A
 
-
L
 
-
L
 
M
S
 
T
L
 
G
G
 
H
V
 
W
R
 
P
D
 
S
S
 
G
R
 
T
I
 
V
H
 
H
L
 
F
E
 
E
S
 
S
F
|
F
G
 
G
P
 
A
A
 
T
S
 
N
V
 
T
S
 
N
R
 
A
R
 
R
I
 
-
E
 
-
R
 
-
T
 
-
V
 
-
E
 
-
V
 
-
D
 
-
N
 
E
S
 
N
E
 
T
G
 
P
V
 
F
V
 
T
V
 
V
T
 
R
F
 
L
A
 
S
K
 
R
S
 
S
G
 
G
R
 
-
N
 
T
A
 
S
I
 
F
W
 
E
R
 
I
P
 
P
K
 
A
V
 
N
G
 
R
S
 
S
L
 
I
L
 
L
E
 
E
L
 
V
A
 
L
E
 
R
A
 
D
N
 
A
G
 
N
L
 
V
K
 
R
P
 
V
L
 
P
Y
 
S
A
 
S
C
|
C
R
 
E
S
|
S
G
 
G
S
 
T
C
|
C
G
 
G
T
 
S
C
|
C
V
 
K
T
 
T
R
 
A
V
 
L
V
 
C
K
 
S
G
 
G
E
 
E
V
 
A
D
 
D
Y
 
H
T
 
R
E
 
D
P
 
M
P
 
V
A
 
L
H
 
R
D
 
D
V
 
D
E
 
E
P
 
K
G
 
G
-
 
T
E
 
Q
A
 
I
L
 
M
I
 
V
C
|
C
I
 
V
A
 
S
R
 
R

Q03331 Flavohemoprotein; Flavohemoglobin; Hemoglobin-like protein; Nitric oxide dioxygenase; NO oxygenase; NOD; EC 1.14.12.17 from Candida norvegensis (Yeast) (Candida mycoderma) (see paper)
28% identity, 37% coverage: 330:588/700 of query aligns to 151:386/390 of Q03331

query
sites
Q03331
V
 
V
A
 
Y
K
 
K
T
 
T
L
 
L
E
 
A
A
 
W
E
 
E
R
 
E
L
 
-
R
 
-
T
 
-
V
 
-
W
 
F
R
 
K
P
 
D
F
 
F
K
 
R
V
 
V
L
 
T
E
 
K
T
 
L
I
 
V
D
 
K
E
 
E
S
 
A
A
 
E
T
 
D
I
 
V
R
 
T
S
 
S
F
 
V
I
 
Y
L
 
L
E
 
T
P
 
P
A
 
V
D
 
D
G
 
G
S
 
F
G
 
K
L
 
L
V
 
K
G
 
P
Y
 
I
Q
 
I
A
 
P
G
 
G
Q
 
E
Y
 
Y
L
 
I
P
 
S
I
 
F
R
 
R
-
 
W
-
 
D
L
 
I
Q
 
H
P
 
N
P
 
P
G
 
D
W
 
I
A
 
T
E
 
D
P
 
I
T
 
Q
I
 
P
R
 
R
T
 
E
Y
 
Y
T
 
S
L
 
I
S
 
S
D
 
Q
A
 
D
S
 
V
N
 
K
G
 
E
R
 
N
T
 
E
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
S
 
S
V
 
V
K
 
R
R
 
-
E
 
-
G
 
D
K
 
I
G
 
G
G
 
I
C
 
V
S
 
S
D
 
D
F
 
Y
L
 
I
H
 
N
D
 
K
H
 
K
I
 
L
V
 
Q
V
 
V
G
 
G
D
 
D
T
 
I
I
 
V
E
 
P
T
 
V
L
 
H
A
 
A
P
 
P
R
 
V
G
 
G
A
 
T
F
 
M
V
 
K
F
 
Y
D
 
D
E
 
S
A
 
I
A
 
S
G
 
K
R
 
K
-
 
G
P
 
K
L
 
V
A
 
A
L
 
V
I
 
L
S
 
A
A
 
G
G
 
G
V
 
I
G
 
G
I
 
I
T
 
T
P
 
P
L
 
M
I
 
I
A
 
P
M
 
I
L
 
I
N
 
E
S
 
H
Q
 
A
L
 
L
V
 
-
N
 
K
D
 
D
G
 
G
R
 
K
T
 
D
L
 
V
L
 
-
H
 
-
K
 
E
P
 
L
I
 
Y
Y
 
Y
C
 
S
I
 
N
H
 
R
S
 
S
A
 
Y
T
 
Q
N
 
S
S
 
E
K
 
P
H
 
F
R
 
R
A
 
E
F
 
F
A
 
F
A
 
S
H
 
N
L
 
L
A
 
E
K
 
K
K
 
E
G
 
N
E
 
N
L
 
G
H
 
K
A
 
F
N
 
K
L
 
L
T
 
N
L
 
N
H
 
Y
V
 
I
A
 
S
F
 
-
S
 
-
R
 
-
P
 
-
S
 
A
E
 
E
D
 
N
D
 
Q
V
 
K
L
 
L
G
 
Q
K
 
V
T
 
K
H
 
D
Q
 
-
S
 
-
E
 
-
G
 
-
Y
 
-
I
 
-
D
 
-
R
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
L
R
 
E
R
 
H
V
 
I
L
 
N
P
 
P
L
 
-
D
 
D
D
 
E
Y
 
Y
E
 
D
V
 
V
Y
 
Y
L
 
L
C
 
L
G
 
G
P
 
P
P
 
V
G
 
A
F
 
Y
M
 
M
Q
 
H
S
 
E
V
 
F
Y
 
K
D
 
T
A
 
Y
L
 
L
L
 
V
S
 
G
L
 
K
G
 
G
V
 
V
R
 
S
D
 
D
S
 
-
R
 
-
I
 
L
H
 
K
L
 
M
E
 
E
S
 
F
F
 
F
G
 
G
P
 
P
A
 
T

Sites not aligning to the query:

7ylrA Structure of a bacteria protein
26% identity, 48% coverage: 346:679/700 of query aligns to 8:317/326 of 7ylrA

query
sites
7ylrA
F
 
L
K
 
R
V
 
V
L
 
A
E
 
E
T
 
A
I
 
R
D
 
Q
E
 
L
S
 
N
A
 
P
T
 
L
I
 
I
R
 
R
S
 
M
F
 
L
I
 
R
L
 
L
E
 
C
P
 
A
A
 
E
D
 
D
G
 
G
S
 
R
G
 
A
L
 
L
V
 
P
G
 
G
Y
 
F
Q
 
A
A
 
A
G
 
G
Q
 
A
Y
 
H
L
 
I
P
 
R
I
 
V
R
 
Q
L
 
V
Q
 
S
P
 
L
P
 
P
G
 
D
-
 
G
-
 
R
-
 
T
-
 
D
W
 
W
A
x
R
E
x
H
P
x
Y
T
x
S
I
 
L
R
 
I
T
 
N
Y
 
F
-
 
A
T
 
T
L
 
A
S
 
R
D
 
N
A
 
A
S
 
T
N
 
N
G
 
A
R
 
P
T
 
T
-
 
E
Y
 
Y
R
 
V
I
 
I
S
x
A
V
|
V
K
x
R
R
 
K
E
 
E
G
 
A
K
 
E
G
|
G
-
x
R
G
 
G
C
x
G
S
|
S
D
 
R
F
 
F
L
 
M
H
 
H
D
 
E
H
 
G
I
 
L
V
 
N
V
 
E
G
 
G
D
 
D
T
 
T
I
 
L
E
 
A
T
 
I
L
 
E
A
 
A
P
 
P
R
 
K
G
 
N
A
 
D
F
 
F
V
 
P
F
 
L
D
 
H
E
 
T
A
 
G
A
 
P
G
 
G
R
 
G
P
 
S
L
 
V
A
 
-
L
 
L
I
 
V
S
 
A
A
 
G
G
 
G
V
 
I
G
 
G
I
 
V
T
|
T
P
 
P
L
 
L
I
 
A
A
 
T
M
 
M
L
 
A
N
 
A
S
 
R
Q
 
R
L
 
R
V
 
A
N
 
E
D
 
G
G
 
A
R
 
P
T
 
V
L
 
R
L
 
M
H
 
H
K
 
-
P
 
-
I
 
-
Y
 
-
C
 
-
I
 
-
H
 
Y
S
 
A
A
 
G
T
 
R
N
 
S
S
 
R
K
 
E
H
 
L
R
 
M
A
 
A
F
 
F
A
 
L
A
 
P
H
 
E
L
 
L
A
 
-
K
 
-
K
 
Q
G
 
A
E
 
L
L
 
L
H
 
G
A
 
D
N
 
D
L
 
L
T
 
R
L
 
V
H
 
H
V
 
A
A
 
D
F
 
A
S
 
E
R
 
A
P
 
G
S
 
A
E
 
P
D
 
L
D
 
D
V
 
I
L
 
-
G
 
-
K
 
-
T
 
-
H
 
-
Q
 
-
S
 
-
E
 
-
G
 
-
Y
 
-
I
 
-
D
 
-
R
 
D
A
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
D
R
 
G
V
 
V
L
 
-
P
 
P
L
 
A
D
 
G
D
 
D
Y
 
-
E
 
R
V
 
L
Y
 
Y
L
 
V
C
 
C
G
 
G
P
 
P
P
 
K
G
 
V
F
 
M
M
 
L
Q
 
D
S
 
A
V
 
V
Y
 
L
D
 
A
A
 
R
L
 
T
L
 
Q
S
 
A
L
 
R
G
 
G
V
 
W
R
 
E
D
 
H
S
 
D
R
 
R
I
 
V
H
 
H
L
 
F
E
|
E
S
 
L
F
|
F
G
 
-
P
 
-
A
 
-
S
 
-
V
 
-
S
 
-
R
 
-
R
 
-
I
 
T
E
|
E
R
 
P
T
 
V
V
 
A
E
 
E
V
 
G
D
 
D
N
 
Q
S
 
P
E
 
-
G
 
-
V
 
F
V
 
E
V
 
V
T
 
E
F
 
L
A
 
A
K
 
Q
S
 
S
G
 
G
R
 
Q
N
 
R
A
 
-
I
 
F
W
 
T
R
 
V
P
 
P
K
 
A
V
 
G
G
 
Q
S
 
S
L
 
I
L
 
L
E
 
D
L
 
C
A
 
L
E
 
I
A
 
E
N
 
H
G
 
G
L
 
C
K
 
D
P
 
P
L
 
M
Y
 
F
A
 
D
C
|
C
R
x
K
S
x
R
G
|
G
S
 
E
C
|
C
G
|
G
T
 
V
C
|
C
V
 
A
T
 
V
R
 
P
V
 
V
V
 
L
K
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
I
D
 
D
Y
 
H
T
 
R
E
 
D
-
 
Y
-
 
V
P
 
L
P
 
T
A
 
A
H
 
R
D
 
E
V
 
K
E
 
A
P
 
Q
G
 
G
E
 
N
A
 
V
L
 
M
-
 
Q
I
 
I
C
|
C
I
 
I
A
 
S
R
 
R

6laaA Crystal structure of full-length cyp116b46 from tepidiphilus thermophilus (see paper)
27% identity, 46% coverage: 338:662/700 of query aligns to 434:723/753 of 6laaA

query
sites
6laaA
R
 
R
L
 
A
R
 
K
T
 
D
V
 
V
W
 
V
R
 
R
P
 
T
F
 
M
K
 
E
V
 
V
L
 
A
E
 
A
T
 
V
I
 
E
D
 
R
E
 
P
S
 
S
A
 
E
T
 
D
I
 
I
R
 
V
S
 
V
F
 
L
I
 
H
L
 
L
E
 
T
P
 
R
A
 
P
D
 
D
G
 
R
S
 
R
G
 
P
L
 
L
V
 
P
G
 
R
Y
 
W
Q
 
S
A
 
P
G
 
G
Q
 
A
Y
 
H
L
 
I
P
 
D
I
 
I
R
 
E
L
 
C
Q
 
G
P
 
E
P
 
P
G
 
D
W
 
R
A
 
S
E
 
-
P
 
-
T
 
-
I
 
-
R
|
R
T
x
Q
Y
|
Y
T
x
S
L
 
L
-
 
C
S
 
S
D
 
D
A
 
P
S
 
E
N
 
N
G
 
R
R
 
D
T
 
A
Y
 
W
R
 
R
I
 
V
S
 
A
V
 
V
K
x
Q
R
 
R
E
 
D
-
 
P
G
 
A
K
x
S
G
x
R
G
 
G
C
x
G
S
|
S
D
 
R
F
 
W
L
 
I
H
 
H
D
 
E
H
 
E
I
 
V
V
 
R
V
 
P
G
 
G
D
 
M
T
 
L
I
 
L
E
 
R
T
 
V
L
 
R
A
 
G
P
 
P
R
 
R
G
 
N
A
 
S
F
 
F
V
 
R
F
 
L
D
 
D
E
 
E
A
 
H
A
 
A
G
 
P
R
 
R
P
 
Y
L
 
L
A
 
-
L
 
F
I
 
L
S
 
A
A
 
G
G
 
G
V
x
I
G
 
G
I
 
I
T
 
T
P
 
P
L
 
I
I
 
M
A
 
T
M
 
M
L
 
A
N
 
A
-
 
R
-
 
A
S
 
K
Q
 
E
L
 
L
V
 
G
N
 
T
D
 
D
G
 
-
R
 
-
T
 
-
L
 
-
L
 
-
H
 
-
K
 
-
P
 
-
I
 
-
Y
 
Y
C
 
E
I
 
L
H
 
H
S
 
Y
A
 
S
T
 
V
N
 
R
S
 
S
K
 
-
H
 
-
R
 
R
A
 
T
F
 
S
A
 
L
A
 
I
H
 
F
L
 
V
A
 
D
K
 
E
K
 
L
G
 
R
E
 
Q
L
 
I
H
 
H
A
 
G
N
 
D
L
 
-
T
 
R
L
 
L
H
 
H
V
 
V
A
 
Y
F
 
V
S
 
S
R
 
E
P
 
E
S
 
G
E
 
V
D
 
R
D
 
N
V
 
D
L
 
L
G
 
A
K
 
-
T
 
-
H
 
-
Q
 
-
S
 
-
E
 
-
G
 
-
Y
 
-
I
 
-
D
 
-
R
 
-
A
 
A
L
 
L
L
 
I
R
 
R
R
 
R
V
 
A
L
 
S
P
 
A
L
 
-
D
 
-
D
 
G
Y
 
T
E
 
Q
V
 
I
Y
 
Y
L
 
A
C
 
C
G
 
G
P
 
P
P
 
-
G
 
-
F
 
-
M
 
-
Q
 
Q
S
 
R
V
 
M
Y
 
L
D
 
D
A
 
T
L
 
L
L
 
E
S
 
R
L
 
L
G
 
I
V
 
E
R
 
N
D
 
R
S
 
P
R
 
E
I
 
V
H
 
T
L
 
L
E
 
R
S
 
V
-
x
E
-
 
H
-
x
F
F
 
F
G
 
G
-
 
E
P
 
P
A
 
S
S
 
H
V
 
L
S
 
D
R
 
P
R
 
A
I
 
K
E
 
E
R
 
R
T
 
P
V
 
F
E
 
Q
V
 
V
D
 
V
-
 
L
N
 
R
S
 
N
E
 
S
G
 
G
V
 
L
V
 
T
V
 
V
T
 
E
F
 
V
A
 
-
K
 
-
S
 
-
G
 
-
R
 
-
N
 
-
A
 
-
I
 
-
W
 
-
R
 
-
P
 
P
K
 
A
V
 
D
G
 
K
S
 
T
L
 
L
L
 
L
E
 
E
L
 
V
A
 
L
E
 
R
A
 
A
N
 
Y
G
 
N
L
 
I
K
 
E
P
 
V
L
 
Q
Y
x
S
A
 
D
C
|
C
R
x
E
S
 
E
G
|
G
S
 
L
C
|
C
G
|
G
T
 
T
C
|
C
V
 
E
T
 
V
R
 
S
V
 
V
V
 
V
K
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
V
D
 
D
Y
 
H
T
 
R
E
 
D

Sites not aligning to the query:

6kbhA Crystal structure of an intact type iv self-sufficient cytochrome p450 monooxygenase
28% identity, 38% coverage: 395:660/700 of query aligns to 499:733/765 of 6kbhA

query
sites
6kbhA
R
|
R
T
x
Q
Y
|
Y
T
x
S
L
 
L
S
 
C
-
 
G
D
 
D
A
 
P
S
 
H
N
 
D
G
 
R
R
 
T
T
 
T
Y
 
F
R
 
Q
I
 
V
S
x
A
V
 
V
-
x
L
-
 
H
K
 
D
R
 
R
E
 
E
G
x
S
K
x
R
G
 
G
G
|
G
C
 
-
S
|
S
D
 
R
F
 
W
L
 
I
H
 
H
D
 
T
H
 
E
I
 
L
V
 
A
V
 
V
G
 
G
D
 
A
T
 
T
I
 
L
E
 
R
T
 
V
L
 
R
A
 
G
P
 
P
R
 
R
G
 
N
A
 
H
F
 
F
V
 
K
F
 
L
D
 
D
E
 
P
A
 
D
A
 
A
G
 
K
R
 
R
P
 
-
L
 
Y
A
 
V
L
 
F
I
 
V
S
 
A
A
 
G
G
 
G
V
x
I
G
 
G
I
 
I
T
|
T
P
 
P
L
 
V
I
 
I
A
 
A
M
 
M
L
 
A
N
 
D
S
 
Q
Q
 
V
L
 
K
V
 
A
N
 
A
D
 
G
G
 
G
R
 
D
T
 
-
L
 
-
L
 
-
H
 
-
K
 
-
P
 
-
I
 
-
Y
 
Y
C
 
E
I
 
I
H
 
H
S
 
Y
A
 
A
T
 
G
N
 
R
S
 
S
K
 
R
-
 
T
H
 
S
R
 
M
A
 
A
F
 
F
A
 
L
A
 
D
H
 
R
L
 
L
A
 
A
K
 
R
K
 
D
G
 
-
E
 
-
L
 
-
H
 
-
A
 
-
N
 
-
L
 
-
T
 
-
L
 
-
H
 
H
V
 
G
A
 
E
F
 
S
S
 
V
R
 
R
P
 
V
S
 
Y
E
 
P
D
 
G
D
 
D
V
 
E
L
 
G
G
 
V
K
 
R
T
 
M
H
 
D
Q
 
L
S
 
P
E
 
S
G
 
L
Y
 
F
I
 
A
D
 
D
R
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
-
R
 
-
R
 
-
V
 
-
L
 
-
P
 
P
L
 
E
D
 
D
D
 
G
Y
 
T
E
 
Q
V
 
V
Y
 
Y
L
 
S
C
 
C
G
 
G
P
 
P
P
 
E
G
 
R
F
 
L
M
 
L
Q
 
S
S
 
A
V
 
L
Y
 
S
D
 
E
A
 
A
L
 
T
L
 
A
S
 
H
L
 
W
G
 
P
V
 
-
R
 
-
D
 
D
S
 
D
R
 
T
I
 
L
H
 
H
L
 
V
E
|
E
S
 
H
F
|
F
G
 
-
P
 
-
A
 
-
S
 
-
V
 
-
S
 
S
R
 
S
R
 
T
I
 
L
E
 
E
R
 
-
T
 
-
V
 
-
E
 
E
V
 
L
D
 
D
N
 
P
S
 
S
E
 
K
-
 
E
-
 
H
G
 
G
V
 
F
V
 
D
V
 
V
T
 
V
F
 
L
A
 
K
K
 
D
S
 
S
G
 
G
R
 
-
N
 
-
A
 
-
I
 
I
W
 
T
R
 
V
P
 
P
K
 
V
V
 
A
G
 
A
-
 
D
-
 
Q
S
 
T
L
 
V
L
 
L
E
 
Q
L
 
A
A
 
L
E
 
R
A
 
A
N
 
A
G
 
N
L
 
I
K
 
D
P
 
A
L
 
Q
Y
 
S
A
 
D
C
|
C
R
x
E
S
 
E
G
|
G
S
x
I
C
|
C
G
|
G
T
 
A
C
|
C
V
 
E
T
 
V
R
 
P
V
 
V
V
 
L
K
 
D
G
 
G
E
 
E
V
 
V
D
 
D
Y
 
H

Sites not aligning to the query:

6o0aA Crystal structure of flavohemoglobin from malassezia yamatoensis with bound fad and heme determined by iron sad phasing (see paper)
24% identity, 36% coverage: 332:586/700 of query aligns to 142:383/383 of 6o0aA

query
sites
6o0aA
K
 
R
T
 
K
L
 
L
E
 
Y
A
 
A
E
 
Q
R
 
Q
L
 
A
R
 
N
T
 
N
V
 
I
W
 
V
R
 
R
-
 
A
P
 
K
F
 
F
K
 
K
V
 
L
L
 
V
E
 
K
T
 
R
I
 
T
D
 
Q
E
 
V
S
 
T
A
 
K
T
 
D
I
 
V
R
 
V
S
 
D
F
 
M
I
 
V
L
 
F
E
 
E
P
 
P
A
 
A
D
 
D
G
 
N
S
 
T
G
 
A
L
 
M
V
 
T
G
 
P
Y
 
G
Q
 
K
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
Y
|
Y
L
 
I
P
 
S
I
 
I
R
 
Y
L
 
A
Q
 
R
P
 
T
P
 
S
-
 
D
G
 
G
W
 
L
A
 
L
E
 
Q
P
 
P
T
 
-
I
 
-
R
|
R
T
x
Q
Y
x
F
T
|
T
L
 
L
S
 
L
D
 
P
A
 
S
S
 
E
N
 
E
G
 
T
R
 
Q
T
 
R
Y
 
-
R
 
R
I
 
I
S
 
A
V
 
I
K
|
K
R
 
L
E
x
D
G
 
P
K
x
H
G
|
G
G
x
E
C
x
M
S
x
T
D
 
T
F
 
I
L
 
F
H
 
Q
D
 
N
H
 
Q
I
 
-
V
 
E
V
 
V
G
 
G
D
 
A
T
 
L
I
 
L
E
 
D
T
 
I
L
 
S
A
 
N
P
 
P
R
 
Y
G
 
G
A
 
D
F
 
M
V
 
T
F
 
L
D
 
E
E
 
T
A
 
L
A
 
E
-
 
T
-
 
D
-
 
P
G
 
N
R
 
S
P
 
P
L
 
L
A
 
V
L
 
L
I
 
I
S
 
C
A
 
A
G
 
G
V
 
I
G
 
G
I
 
V
T
|
T
P
 
P
L
 
V
I
 
L
A
 
A
M
 
F
L
 
V
N
 
E
S
 
K
Q
 
L
L
 
A
V
 
A
N
 
Q
D
 
K
G
 
S
R
 
-
T
 
-
L
 
-
L
 
-
H
 
E
K
 
R
P
 
E
I
 
V
Y
 
M
C
 
I
I
 
I
H
 
A
S
 
S
A
 
S
T
 
R
N
 
S
S
 
-
K
 
-
H
 
-
R
 
-
A
 
-
F
 
-
A
 
L
A
 
A
H
 
E
L
 
A
A
 
P
K
 
L
K
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
H
 
-
A
 
-
N
 
-
L
 
-
T
 
-
L
 
L
H
 
E
V
 
R
A
 
A
F
 
K
S
 
E
R
 
L
P
 
K
S
 
K
E
 
A
D
 
K
D
 
V
V
 
L
L
 
Y
G
 
G
K
 
T
T
 
T
H
 
Q
Q
 
E
S
 
K
E
 
D
G
 
G
-
 
D
Y
 
F
I
 
V
D
 
G
R
 
R
A
 
I
L
 
D
L
 
V
R
 
S
R
 
T
V
 
L
L
 
D
P
 
I
L
 
P
D
 
A
D
 
N
Y
 
A
E
 
S
V
 
V
Y
 
F
L
 
L
C
 
C
G
 
G
P
 
P
P
 
L
G
 
K
F
 
F
M
 
M
Q
 
Q
S
 
E
V
 
M
Y
 
R
D
 
S
A
 
H
L
 
L
L
 
V
S
 
E
L
 
A
G
 
G
V
 
I
R
 
A
D
 
K
S
 
H
R
 
K
I
 
I
H
 
F
L
 
Y
E
|
E
S
 
I
F
|
F
G
|
G

Sites not aligning to the query:

5ogxA Crystal structure of amycolatopsis cytochrome p450 reductase gcob. (see paper)
26% identity, 35% coverage: 348:589/700 of query aligns to 104:333/333 of 5ogxA

query
sites
5ogxA
V
 
V
L
 
L
E
 
E
T
 
V
I
 
A
D
 
D
E
 
I
S
 
A
A
 
R
T
 
D
I
 
T
R
 
R
S
 
R
F
 
V
I
 
L
L
 
L
E
 
G
P
 
L
A
 
A
D
 
E
G
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
P
V
 
L
G
 
A
Y
 
F
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
Y
|
Y
L
 
-
P
 
-
I
 
V
R
 
E
L
 
L
Q
 
V
P
 
V
P
 
P
G
 
G
W
 
S
A
 
G
E
 
-
P
 
-
T
 
A
I
 
R
R
|
R
T
x
Q
Y
|
Y
T
x
S
L
 
L
S
 
A
D
 
N
-
 
T
A
 
A
S
 
D
N
 
E
G
 
D
R
 
K
T
 
V
Y
 
L
R
 
E
I
 
L
S
x
H
V
|
V
K
 
R
R
 
R
E
x
V
G
 
P
K
 
G
G
|
G
G
x
V
C
x
A
S
x
T
D
 
D
-
 
G
F
 
W
L
 
L
H
 
F
D
 
D
H
 
G
I
 
L
V
 
A
V
 
A
G
 
G
D
 
D
T
 
R
I
 
V
E
 
E
T
 
A
L
 
T
A
 
G
P
 
P
R
 
L
G
 
G
A
 
D
F
 
F
V
 
H
F
 
L
-
 
P
-
 
P
-
 
P
D
 
D
E
 
E
A
 
D
A
 
D
G
 
G
R
 
G
P
 
P
L
 
M
A
 
V
L
 
L
I
 
I
S
 
G
A
 
G
G
 
G
V
x
T
G
 
G
I
 
L
T
 
A
P
 
P
L
 
L
I
 
V
A
 
G
M
 
I
L
 
A
N
 
R
S
 
T
Q
 
A
L
 
L
V
 
A
N
 
R
D
 
H
G
 
-
R
 
-
T
 
-
L
 
-
L
 
P
H
 
S
K
 
R
P
 
E
I
 
V
Y
 
L
C
 
L
I
 
Y
H
 
H
S
 
G
A
 
V
T
 
R
N
 
G
S
 
A
K
 
A
H
 
D
R
 
L
A
 
Y
F
 
D
A
 
L
A
 
G
H
 
R
L
 
F
A
 
A
K
 
E
K
 
I
G
 
A
E
 
E
L
 
E
H
 
H
A
 
P
N
 
G
L
 
F
T
 
R
L
 
F
H
 
V
V
 
P
A
 
V
F
 
L
S
 
S
R
 
D
P
 
E
S
 
P
E
 
D
D
 
P
D
 
A
V
 
Y
L
 
R
G
 
G
K
 
-
T
 
-
H
 
-
Q
 
-
S
 
-
E
 
-
G
 
G
Y
 
F
I
 
P
D
 
T
R
 
D
A
 
A
L
 
F
L
 
V
R
 
E
R
 
D
V
 
V
L
 
P
P
 
S
L
 
G
D
 
R
D
 
G
Y
 
W
E
 
S
V
 
G
Y
 
W
L
 
L
C
 
C
G
 
G
P
 
P
P
 
P
G
 
A
F
 
M
M
 
V
Q
 
E
S
 
A
V
 
G
Y
 
V
D
 
K
A
 
A
L
 
F
L
 
K
S
 
R
L
 
R
G
 
R
V
 
M
R
 
S
D
 
P
S
 
R
R
 
R
I
 
I
H
 
H
L
 
R
E
 
E
S
 
K
F
|
F
G
 
T
P
|
P
A
 
A
S
|
S

Sites not aligning to the query:

P0DPQ8 Aromatic O-demethylase, reductase subunit; NADH--hemoprotein reductase; EC 1.6.2.- from Amycolatopsis sp. (strain ATCC 39116 / 75iv2) (see paper)
26% identity, 35% coverage: 348:589/700 of query aligns to 105:334/334 of P0DPQ8

query
sites
P0DPQ8
V
 
V
L
 
L
E
 
E
T
 
V
I
 
A
D
 
D
E
 
I
S
 
A
A
 
R
T
 
D
I
 
T
R
 
R
S
 
R
F
 
V
I
 
L
L
 
L
E
 
G
P
 
L
A
 
A
D
 
E
G
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
P
V
 
L
G
 
A
Y
 
F
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
-
P
 
-
I
 
V
R
 
E
L
 
L
Q
 
V
P
 
V
P
 
P
G
 
G
W
 
S
A
 
G
E
 
-
P
 
-
T
 
A
I
 
R
R
|
R
T
x
Q
Y
|
Y
T
x
S
L
 
L
S
 
A
D
 
N
-
 
T
A
 
A
S
 
D
N
 
E
G
 
D
R
 
K
T
 
V
Y
 
L
R
 
E
I
 
L
S
x
H
V
|
V
K
x
R
R
 
R
E
 
V
G
 
P
K
 
G
G
 
G
G
x
V
C
x
A
S
x
T
D
 
D
-
 
G
F
 
W
L
 
L
H
 
F
D
 
D
H
 
G
I
 
L
V
 
A
V
 
A
G
 
G
D
 
D
T
 
R
I
 
V
E
 
E
T
 
A
L
 
T
A
 
G
P
 
P
R
 
L
G
 
G
A
 
D
F
 
F
V
 
H
F
 
L
-
 
P
-
 
P
-
 
P
D
 
D
E
 
E
A
 
D
A
 
D
G
 
G
R
 
G
P
 
P
L
 
M
A
 
V
L
 
L
I
 
I
S
 
G
A
 
G
G
 
G
V
x
T
G
 
G
I
 
L
T
 
A
P
 
P
L
 
L
I
 
V
A
 
G
M
 
I
L
 
A
N
 
R
S
 
T
Q
 
A
L
 
L
V
 
A
N
 
R
D
 
H
G
 
-
R
 
-
T
 
-
L
 
-
L
 
P
H
 
S
K
 
R
P
 
E
I
 
V
Y
 
L
C
 
L
I
 
Y
H
 
H
S
 
G
A
 
V
T
 
R
N
 
G
S
 
A
K
 
A
H
 
D
R
 
L
A
 
Y
F
 
D
A
 
L
A
 
G
H
 
R
L
 
F
A
 
A
K
 
E
K
 
I
G
 
A
E
 
E
L
 
E
H
 
H
A
 
P
N
 
G
L
 
F
T
 
R
L
 
F
H
 
V
V
 
P
A
 
V
F
 
L
S
 
S
R
 
D
P
 
E
S
 
P
E
 
D
D
 
P
D
 
A
V
 
Y
L
 
R
G
 
G
K
 
-
T
 
-
H
 
-
Q
 
-
S
 
-
E
 
-
G
 
G
Y
 
F
I
 
P
D
 
T
R
 
D
A
 
A
L
 
F
L
 
V
R
 
E
R
 
D
V
 
V
L
 
P
P
 
S
L
 
G
D
 
R
D
 
G
Y
 
W
E
 
S
V
 
G
Y
 
W
L
 
L
C
 
C
G
 
G
P
 
P
P
 
P
G
 
A
F
 
M
M
 
V
Q
 
E
S
 
A
V
 
G
Y
 
V
D
 
K
A
 
A
L
 
F
L
 
K
S
 
R
L
 
R
G
 
R
V
 
M
R
 
S
D
 
P
S
 
R
R
 
R
I
 
I
H
 
H
L
 
R
E
 
E
S
 
K
F
|
F
G
 
T
P
 
P
A
 
A
S
|
S

Sites not aligning to the query:

7romA Crystal structure of saccharomyces cerevisiae nadh-cytochrome b5 reductase 1 (cbr1) fragment (residues 28-284) bound to fad
23% identity, 34% coverage: 340:579/700 of query aligns to 8:243/255 of 7romA

query
sites
7romA
R
 
R
T
 
N
V
 
D
W
 
F
R
 
Q
P
 
S
F
 
F
K
 
P
V
 
L
L
 
V
E
 
E
T
 
K
-
 
T
-
 
I
I
 
L
D
 
T
E
 
H
S
 
N
A
 
T
T
 
S
I
 
M
R
 
Y
S
 
K
F
 
F
I
 
G
L
 
L
E
 
P
P
 
H
A
 
A
D
 
D
G
 
D
S
 
-
G
 
-
L
 
V
V
 
L
G
 
G
Y
 
L
Q
 
P
A
 
I
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
H
L
 
I
P
 
V
I
 
I
R
 
K
L
 
A
Q
 
N
P
 
I
P
 
N
G
 
G
W
 
-
A
 
-
E
 
K
P
 
D
T
 
I
I
 
T
R
|
R
T
x
S
Y
|
Y
T
|
T
L
 
P
S
 
T
-
 
S
-
 
L
D
 
D
A
 
G
S
 
D
N
 
T
G
 
K
R
 
G
T
 
N
Y
 
F
R
 
E
I
 
L
S
x
L
V
|
V
K
 
K
R
 
S
E
x
Y
G
 
P
K
x
T
G
|
G
G
x
N
C
x
V
S
|
S
D
 
K
F
 
M
L
 
I
H
 
G
D
 
E
H
 
-
I
 
L
V
 
K
V
 
I
G
 
G
D
 
D
T
 
S
I
 
I
E
 
Q
T
 
I
L
 
K
A
 
G
P
 
P
R
 
R
G
 
G
A
 
N
F
 
Y
V
 
H
F
 
Y
D
 
E
E
 
R
A
 
N
A
 
C
G
 
R
R
 
S
P
 
H
L
 
L
A
 
G
L
 
M
I
 
I
S
 
A
A
 
G
G
 
G
V
x
T
G
 
G
I
 
I
T
x
A
P
 
P
L
 
M
I
 
Y
A
 
Q
M
 
I
L
 
M
N
 
K
S
 
A
Q
 
I
L
 
A
V
 
M
N
 
D
D
 
P
G
 
H
R
 
D
T
 
T
L
 
T
L
 
K
H
 
V
K
 
S
P
 
L
I
 
V
Y
 
F
-
 
G
C
 
N
I
 
V
H
 
H
S
 
E
A
 
E
T
 
D
N
 
I
S
 
L
K
 
L
H
 
K
R
 
K
A
 
E
F
 
L
A
 
E
A
 
A
H
 
L
L
 
V
A
 
A
K
 
M
K
 
K
G
 
P
E
 
-
L
 
-
H
 
-
A
 
S
N
 
Q
L
 
F
T
 
K
L
 
I
H
 
V
V
 
Y
A
 
Y
F
 
L
S
 
D
R
 
S
P
 
P
S
 
D
E
 
R
D
 
E
D
 
D
V
 
W
L
 
T
G
 
G
K
 
G
T
 
V
H
 
-
Q
 
-
S
 
-
E
 
-
G
 
G
Y
 
Y
I
 
I
D
 
T
R
 
K
A
 
D
L
 
V
L
 
I
R
 
K
R
 
E
V
 
H
L
 
L
P
 
P
-
 
A
-
 
A
-
 
T
L
 
M
D
 
D
D
 
N
Y
 
V
E
 
Q
V
 
I
Y
 
L
L
 
I
C
 
C
G
 
G
P
 
P
P
 
P
G
 
A
F
 
M
M
 
V
Q
 
A
S
 
S
V
 
V
Y
 
R
D
 
R
A
 
S
L
 
T
L
 
V
S
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
F
R
 
R
D
 
R
S
 
S
R
 
K

7qu0A X-ray structure of fad domain of nqrf of klebsiella pneumoniae (see paper)
25% identity, 28% coverage: 391:585/700 of query aligns to 79:279/279 of 7qu0A

query
sites
7qu0A
E
 
E
P
 
P
T
 
T
I
 
L
R
|
R
T
x
A
Y
|
Y
T
x
S
L
 
M
S
 
A
D
 
N
A
 
Y
S
 
P
N
 
E
G
 
E
R
 
K
-
 
G
-
 
I
-
 
I
-
 
M
-
 
L
-
 
N
-
 
V
-
 
R
-
 
I
-
x
A
T
|
T
Y
x
P
R
x
P
I
 
P
S
 
K
V
 
I
K
 
P
R
 
D
E
x
A
G
x
P
K
x
P
G
|
G
G
x
I
C
x
M
S
|
S
D
 
S
F
 
Y
L
 
I
H
 
W
D
 
S
H
 
-
I
 
L
V
 
K
V
 
P
G
 
G
D
 
D
T
 
K
I
 
V
E
 
T
T
 
I
L
 
S
A
 
G
P
 
P
R
 
F
G
 
G
A
 
E
F
 
F
V
 
-
F
 
F
D
 
A
E
 
K
A
 
E
A
 
T
G
 
D
R
 
A
P
 
E
L
 
M
A
 
V
L
 
F
I
 
I
S
 
G
A
 
G
G
 
G
V
 
A
G
 
G
I
 
M
T
 
A
P
 
P
L
 
M
I
 
R
A
 
S
M
 
H
L
 
I
N
 
F
S
 
D
Q
 
Q
L
 
L
V
 
-
N
 
-
D
 
-
G
 
K
R
 
R
T
 
L
L
 
H
L
 
S
H
 
T
K
 
R
P
 
K
I
 
I
Y
 
S
C
 
F
I
 
W
H
 
Y
S
 
G
A
 
A
T
 
R
N
 
S
S
 
L
K
 
R
H
 
E
R
 
M
A
 
F
F
 
Y
A
 
D
A
 
E
H
 
E
L
 
F
A
 
E
K
 
Q
K
 
L
G
 
A
E
 
R
L
 
D
H
 
N
A
 
P
N
 
N
L
 
F
T
 
T
L
 
F
H
 
H
V
 
V
A
 
A
F
 
L
S
|
S
R
 
D
P
 
P
-
 
L
S
 
P
E
 
E
D
 
D
D
 
N
V
 
W
L
 
T
G
 
G
K
 
H
T
 
T
H
 
G
Q
x
F
S
 
I
E
 
H
G
 
N
Y
 
V
I
 
L
D
 
Y
R
 
E
A
 
N
L
 
Y
L
 
L
R
 
R
R
 
D
V
 
H
L
 
P
P
 
A
L
 
P
D
 
E
D
 
D
Y
 
C
E
 
E
V
 
F
Y
 
Y
L
 
M
C
 
C
G
 
G
P
 
P
P
 
P
G
 
V
F
x
M
M
 
N
Q
 
A
S
 
A
V
 
V
Y
 
I
D
 
K
A
 
M
L
 
L
L
 
K
S
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
E
D
 
D
S
 
E
R
 
N
I
 
I
H
 
L
L
 
L
E
 
D
S
 
D
F
|
F

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>BPHYT_RS05425 FitnessBrowser__BFirm:BPHYT_RS05425
MSSSTVPSSPGWDLERSPFHEGELAVQERVGVREKIDAQGRRAVRRYLTAQQREFFLMLP
YVFMASVDSSGRPWASFLVGEPGFVNPTGDVTLTVRARALYGDPLNDTLVPGAEIALLGV
QFHTRRRNRVIGTVGALLPDGFTIDVRQTLGICPQYIQGRELSFNRDPLLPEPRPVHRNS
RLDASASAIISKADTYFVASVLLQEGDPVATGADVSHRGGRPGFVRIDDDHTLTAPDFVG
NFIFNTIGNWQFDNHAGLMFIDFDSGAMLYIAAHAEVLWDGPELHAFNGAQRLFRYHIDE
VCRVEASLPCTFTAPDYSPLLERTGHWDIVAKTLEAERLRTVWRPFKVLETIDESATIRS
FILEPADGSGLVGYQAGQYLPIRLQPPGWAEPTIRTYTLSDASNGRTYRISVKREGKGGC
SDFLHDHIVVGDTIETLAPRGAFVFDEAAGRPLALISAGVGITPLIAMLNSQLVNDGRTL
LHKPIYCIHSATNSKHRAFAAHLAKKGELHANLTLHVAFSRPSEDDVLGKTHQSEGYIDR
ALLRRVLPLDDYEVYLCGPPGFMQSVYDALLSLGVRDSRIHLESFGPASVSRRIERTVEV
DNSEGVVVTFAKSGRNAIWRPKVGSLLELAEANGLKPLYACRSGSCGTCVTRVVKGEVDY
TEPPAHDVEPGEALICIARPHPGPHLEDGTQNREGVTLDI

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory