SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing BPHYT_RS06610 FitnessBrowser__BFirm:BPHYT_RS06610 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4y96A Crystal structure of triosephosphate isomerase from gemmata obscuriglobus (see paper)
50% identity, 96% coverage: 5:252/259 of query aligns to 2:249/250 of 4y96A

query
sites
4y96A
R
 
R
A
 
K
K
 
K
L
 
F
V
 
V
V
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
H
 
N
G
 
T
R
 
T
L
 
L
A
 
A
E
 
E
N
 
A
A
 
K
T
 
A
L
 
L
L
 
G
Q
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
A
H
 
K
G
 
G
A
 
V
G
 
-
E
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
T
D
 
D
V
 
D
R
 
R
V
 
V
G
 
T
V
 
V
C
 
A
V
 
V
-
 
F
-
 
P
P
 
P
S
 
Y
P
 
P
Y
 
W
L
 
L
A
 
T
Q
 
A
S
 
V
Q
 
G
S
 
E
L
 
V
L
 
L
E
 
K
G
 
G
S
 
S
R
 
P
V
 
V
V
 
A
W
 
L
G
 
G
V
 
A
Q
 
Q
D
 
D
V
 
V
S
 
S
A
 
S
F
 
E
T
 
K
H
 
K
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
V
A
 
S
A
 
P
P
 
A
M
 
M
V
 
L
V
 
L
D
 
E
F
 
T
G
 
G
A
 
C
T
 
K
L
 
Y
A
 
A
I
 
L
V
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
A
 
H
Y
 
I
H
 
I
R
 
G
E
 
E
S
 
S
A
 
E
E
 
T
L
 
F
V
 
I
A
 
N
V
 
H
K
 
K
T
 
V
Q
 
H
R
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
E
G
 
G
L
 
L
T
 
S
P
 
V
I
 
V
V
 
L
C
 
C
V
 
M
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
E
 
A
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
R
G
 
G
L
 
L
T
 
Q
E
 
E
Q
 
R
V
 
V
V
 
F
G
 
Q
T
 
R
Q
 
Q
L
 
V
D
 
Y
E
 
A
V
 
A
L
 
C
A
 
A
K
 
G
L
 
L
S
 
T
V
 
D
Q
 
E
E
 
Q
A
 
F
A
 
G
R
 
R
L
 
I
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
V
A
 
A
S
 
T
S
 
P
E
 
E
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
A
 
E
V
 
A
H
 
H
A
 
A
F
 
F
L
 
V
R
 
R
A
 
S
R
 
K
L
 
L
-
 
R
A
 
L
A
 
L
K
 
Y
G
|
G
A
 
D
A
x
K
V
 
I
A
 
A
D
 
D
-
 
S
V
 
T
P
 
P
L
 
I
L
 
V
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
T
P
 
P
E
 
D
N
 
N
A
 
T
E
 
V
E
 
G
L
 
L
F
 
M
R
 
S
Q
 
Q
P
 
P
D
 
D
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
D
 
A
Q
 
D
D
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
A
I
 
I
C
 
V
K
 
K
A
 
A
A
 
A

4mvaA 1.43 angstrom resolution crystal structure of triosephosphate isomerase (tpia) from escherichia coli in complex with acetyl phosphate. (see paper)
47% identity, 97% coverage: 5:254/259 of query aligns to 2:251/255 of 4mvaA

query
sites
4mvaA
R
 
R
A
 
H
K
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
M
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
M
 
L
H
 
N
G
 
G
R
 
S
L
 
R
A
 
-
E
 
-
N
 
-
A
 
-
T
 
-
L
 
-
L
 
-
Q
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
-
H
 
H
G
 
M
A
 
V
G
 
H
E
 
E
L
 
L
P
 
V
A
 
S
D
 
N
V
 
L
R
 
R
-
 
K
-
 
E
-
 
L
-
 
A
-
 
G
-
 
V
-
 
A
-
 
G
-
 
C
-
 
A
V
 
V
G
 
A
V
 
I
C
 
A
V
 
P
P
 
P
S
 
E
P
 
M
Y
 
Y
L
 
I
A
 
D
Q
 
M
S
 
A
Q
 
K
S
 
R
L
 
E
L
 
A
E
 
E
G
 
G
S
 
S
R
 
H
V
 
I
V
 
M
W
 
L
G
 
G
V
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
V
S
 
D
A
 
L
F
 
N
T
 
L
H
 
S
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
T
A
 
S
A
 
A
P
 
A
M
 
M
V
 
L
V
 
K
D
 
D
F
 
I
G
 
G
A
 
A
T
 
Q
L
 
Y
A
 
I
I
 
I
V
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
A
 
T
Y
 
Y
H
 
H
R
 
K
E
 
E
S
 
S
A
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
I
A
 
A
V
 
K
K
 
K
T
 
F
Q
 
A
R
 
V
A
 
L
L
 
K
E
 
E
A
 
Q
G
 
G
L
 
L
T
 
T
P
 
P
I
 
V
V
 
L
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
E
E
 
A
E
 
E
R
 
N
E
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
K
T
 
T
E
 
E
Q
 
E
V
 
V
V
 
C
G
 
A
T
 
R
Q
 
Q
L
 
I
D
 
D
E
 
A
V
 
V
L
 
L
A
 
K
K
 
T
L
 
Q
S
 
G
V
 
A
Q
 
A
E
 
A
A
 
F
A
 
E
R
 
G
L
 
A
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
S
A
 
A
S
 
T
S
 
P
E
 
A
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
H
 
H
A
 
K
F
 
F
L
 
I
R
 
R
A
 
D
R
 
H
L
 
I
A
 
A
A
 
K
K
 
V
G
 
D
A
 
A
A
 
N
V
 
I
A
 
A
D
 
E
-
 
Q
V
 
V
P
 
I
L
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
N
P
 
A
E
 
S
N
 
N
A
 
A
E
 
A
E
 
E
L
 
L
F
 
F
R
 
A
Q
 
Q
P
 
P
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
D
 
A
Q
 
D
D
 
A
F
 
F
L
 
A
A
 
V
I
 
I
C
 
V
K
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
E
A
 
A

B1XB85 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Escherichia coli (strain K12 / DH10B) (see paper)
47% identity, 97% coverage: 5:254/259 of query aligns to 2:251/255 of B1XB85

query
sites
B1XB85
R
 
R
A
 
H
K
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
M
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
M
 
L
H
 
N
G
 
G
R
 
S
L
 
R
A
 
-
E
 
-
N
 
-
A
 
-
T
 
-
L
 
-
L
 
-
Q
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
-
H
 
H
G
 
M
A
 
V
G
 
H
E
 
E
L
 
L
P
 
V
A
 
S
D
 
N
V
 
L
R
 
R
-
 
K
-
 
E
-
 
L
-
 
A
-
 
G
-
 
V
-
 
A
-
 
G
-
 
C
-
 
A
V
 
V
G
 
A
V
 
I
C
 
A
V
 
P
P
 
P
S
 
E
P
 
M
Y
 
Y
L
 
I
A
 
D
Q
 
M
S
 
A
Q
 
K
S
 
R
L
 
E
L
 
A
E
 
E
G
 
G
S
 
S
R
 
H
V
 
I
V
 
M
W
 
L
G
 
G
V
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
V
S
 
D
A
 
L
F
 
N
T
 
L
H
 
S
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
T
A
 
S
A
 
A
P
 
A
M
 
M
V
 
L
V
 
K
D
 
D
F
 
I
G
 
G
A
 
A
T
 
Q
L
 
Y
A
 
I
I
 
I
V
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
A
 
T
Y
 
Y
H
 
H
R
 
K
E
 
E
S
 
S
A
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
I
A
 
A
V
 
K
K
 
K
T
 
F
Q
 
A
R
 
V
A
 
L
L
 
K
E
 
E
A
 
Q
G
 
G
L
 
L
T
 
T
P
 
P
I
 
V
V
 
L
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
E
E
 
A
E
 
E
R
 
N
E
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
K
T
 
T
E
 
E
Q
 
E
V
 
V
V
 
C
G
 
A
T
 
R
Q
 
Q
L
 
I
D
 
D
E
 
A
V
 
V
L
 
L
A
 
K
K
 
T
L
 
Q
S
 
G
V
 
A
Q
 
A
E
 
A
A
 
F
A
 
E
R
 
G
L
 
A
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
S
A
 
A
S
 
T
S
 
P
E
 
A
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
H
 
H
A
 
K
F
 
F
L
 
I
R
 
R
A
 
D
R
 
H
L
 
I
A
 
A
A
 
K
K
 
V
G
 
D
A
 
A
A
 
N
V
 
I
A
 
A
D
 
E
-
 
Q
V
 
V
P
 
I
L
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
N
P
 
A
E
 
S
N
 
N
A
 
A
E
 
A
E
 
E
L
 
L
F
 
F
R
 
A
Q
 
Q
P
 
P
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
D
 
A
Q
 
D
D
 
A
F
 
F
L
 
A
A
 
V
I
 
I
C
 
V
K
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
E
A
 
A

P36204 Bifunctional PGK/TIM; EC 2.7.2.3; EC 5.3.1.1 from Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / DSM 3109 / JCM 10099 / NBRC 100826 / MSB8) (see paper)
44% identity, 92% coverage: 5:242/259 of query aligns to 402:640/654 of P36204

query
sites
P36204
R
 
R
A
 
K
K
 
L
L
 
I
V
 
L
V
 
A
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
M
 
M
H
 
H
G
 
K
R
 
T
L
 
I
A
 
S
E
 
E
N
 
A
A
 
K
T
 
K
L
 
F
L
 
V
Q
 
S
A
 
L
V
 
L
A
 
V
H
 
N
G
 
E
A
 
L
G
 
H
E
 
D
L
 
V
P
 
-
A
 
K
D
 
E
V
 
F
R
 
E
V
 
I
G
 
V
V
 
V
C
 
C
V
 
P
P
 
P
S
 
F
P
 
T
Y
 
A
L
 
L
A
 
S
Q
 
E
S
 
V
Q
 
G
S
 
E
L
 
I
L
 
L
E
 
S
G
 
G
S
 
R
R
 
N
V
 
I
V
 
K
W
 
L
G
 
G
V
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
V
S
 
F
A
 
Y
F
 
E
T
 
D
H
 
Q
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
A
 
S
A
 
P
P
 
L
M
 
M
V
 
L
V
 
Q
D
 
E
F
 
I
G
 
G
A
 
V
T
 
E
L
 
Y
A
 
V
I
 
I
V
 
V
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
A
 
R
Y
 
I
H
 
F
R
 
K
E
 
E
S
 
D
A
 
D
E
 
E
L
 
F
V
 
I
A
 
N
V
 
R
K
 
K
T
 
V
Q
 
K
R
 
A
A
 
V
L
 
L
E
 
E
A
 
K
G
 
G
L
 
M
T
 
T
P
 
P
I
 
I
V
 
L
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
E
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
K
G
 
G
L
 
L
T
 
T
E
 
F
Q
 
C
V
 
V
V
 
V
G
 
E
T
 
K
Q
 
Q
L
 
V
D
 
R
E
 
E
V
 
G
L
 
F
A
 
Y
K
 
G
L
 
L
S
 
D
V
 
K
Q
 
E
E
 
E
A
 
A
A
 
K
R
 
R
L
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
K
 
R
S
 
V
A
 
A
S
 
T
S
 
P
E
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
A
 
E
V
 
V
H
 
H
A
 
A
F
 
F
L
 
I
R
 
R
A
 
K
R
 
L
L
 
L
A
 
S
A
 
E
-
 
M
-
 
Y
K
 
D
G
 
E
A
 
E
A
 
T
V
 
A
A
 
G
D
 
S
V
 
I
P
 
R
L
 
I
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
I
K
 
K
P
 
P
E
 
D
N
 
N
A
 
F
E
 
L
E
 
G
L
 
L
F
 
I
R
 
V
Q
 
Q
P
 
K
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
L
I
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
D
 
E

Sites not aligning to the query:

P50921 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Moritella marina (Vibrio marinus) (see paper)
46% identity, 91% coverage: 5:240/259 of query aligns to 2:239/256 of P50921

query
sites
P50921
R
 
R
A
 
H
K
 
P
L
 
V
V
 
V
V
 
M
G
 
G
N
|
N
W
|
W
K
|
K
M
 
L
H
 
N
G
 
G
R
 
S
L
 
K
A
 
E
E
 
M
N
 
V
A
 
V
T
 
D
L
 
L
L
 
L
Q
 
N
A
 
G
V
 
L
A
 
N
H
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
A
E
 
E
L
 
L
P
 
E
A
 
G
D
 
V
V
 
T
R
 
G
V
 
V
G
 
D
V
 
V
C
 
A
V
 
V
P
 
A
S
 
P
P
 
P
Y
 
A
L
 
L
-
 
F
-
 
V
-
 
D
A
 
L
Q
 
A
S
 
E
Q
 
R
S
 
T
L
 
L
L
 
T
E
 
E
-
 
A
G
 
G
S
 
S
R
 
A
V
 
I
V
 
I
W
 
L
G
 
G
V
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
T
S
 
D
A
 
L
F
 
N
T
 
N
H
 
S
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
D
V
 
M
A
 
S
A
 
P
P
 
A
M
 
M
V
 
L
V
 
K
D
 
E
F
 
F
G
 
G
A
 
A
T
 
T
L
 
H
A
 
I
I
 
I
V
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
A
 
E
Y
 
Y
H
 
H
R
 
A
E
 
E
S
 
S
A
 
D
E
 
E
L
 
F
V
 
V
A
 
A
V
 
K
K
 
K
T
 
F
Q
 
A
R
 
F
A
 
L
L
 
K
E
 
E
A
 
N
G
 
G
L
 
L
T
 
T
P
 
P
I
 
V
V
 
L
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
S
L
 
D
E
 
A
E
 
Q
R
 
N
E
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
E
T
 
T
E
 
M
Q
 
A
V
 
V
V
 
C
G
 
A
T
 
R
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
E
 
A
V
 
V
L
 
I
A
 
N
K
 
T
L
 
Q
S
 
G
V
 
V
Q
 
E
E
 
A
A
 
L
A
 
E
R
 
G
L
 
A
V
 
I
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
A
A
 
A
S
 
T
S
 
A
E
 
E
Q
 
D
A
 
A
Q
 
Q
A
 
R
V
 
I
H
 
H
A
 
A
F
 
Q
L
 
I
R
 
R
A
 
A
R
 
H
L
 
I
A
 
A
A
 
E
K
 
K
G
 
S
A
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
A
-
 
K
D
 
N
V
 
V
P
 
V
L
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
E
 
E
N
 
N
A
 
A
E
 
A
E
 
A
L
 
Y
F
 
F
R
 
A
Q
 
Q
P
 
P
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
x
A
L
 
L

1aw2A Triosephosphate isomerase of vibrio marinus (see paper)
46% identity, 91% coverage: 5:240/259 of query aligns to 1:238/255 of 1aw2A

query
sites
1aw2A
R
 
R
A
 
H
K
 
P
L
 
V
V
 
V
V
 
M
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
L
H
 
N
G
 
G
R
 
S
L
 
K
A
 
E
E
 
M
N
 
V
A
 
V
T
 
D
L
 
L
L
 
L
Q
 
N
A
 
G
V
 
L
A
 
N
H
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
A
E
 
E
L
 
L
P
 
E
A
 
G
D
 
V
V
 
T
R
 
G
V
 
V
G
 
D
V
 
V
C
 
A
V
 
V
P
 
A
S
 
P
P
 
P
Y
 
A
L
 
L
-
 
F
-
 
V
-
 
D
A
 
L
Q
 
A
S
 
E
Q
 
R
S
 
T
L
 
L
L
 
T
E
 
E
-
 
A
G
 
G
S
 
S
R
 
A
V
 
I
V
 
I
W
 
L
G
 
G
V
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
T
S
 
D
A
 
L
F
 
N
T
 
N
H
 
S
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
D
V
 
M
A
 
S
A
 
P
P
 
A
M
 
M
V
 
L
V
 
K
D
 
E
F
 
F
G
 
G
A
 
A
T
 
T
L
 
H
A
 
I
I
 
I
V
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
A
 
E
Y
 
Y
H
 
H
R
 
A
E
 
E
S
 
S
A
 
D
E
 
E
L
 
F
V
 
V
A
 
A
V
 
K
K
 
K
T
 
F
Q
 
A
R
 
F
A
 
L
L
 
K
E
 
E
A
 
N
G
 
G
L
 
L
T
 
T
P
 
P
I
 
V
V
 
L
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
S
L
 
D
E
 
A
E
 
Q
R
 
N
E
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
E
T
 
T
E
 
M
Q
 
A
V
 
V
V
 
C
G
 
A
T
 
R
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
E
 
A
V
 
V
L
 
I
A
 
N
K
 
T
L
 
Q
S
 
G
V
 
V
Q
 
E
E
 
A
A
 
L
A
 
E
R
 
G
L
 
A
V
 
I
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
A
A
 
A
S
 
T
S
 
A
E
 
E
Q
 
D
A
 
A
Q
 
Q
A
 
R
V
 
I
H
 
H
A
 
A
F
 
Q
L
 
I
R
 
R
A
 
A
R
 
H
L
 
I
A
 
A
A
 
E
K
 
K
G
 
S
A
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
A
-
 
K
D
 
N
V
 
V
P
 
V
L
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
|
V
K
 
K
P
 
P
E
 
E
N
 
N
A
 
A
E
 
A
E
 
A
L
 
Y
F
 
F
R
 
A
Q
 
Q
P
 
P
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
A
L
 
L

1aw1A Triosephosphate isomerase of vibrio marinus complexed with 2-phosphoglycolate (see paper)
46% identity, 91% coverage: 5:240/259 of query aligns to 1:238/255 of 1aw1A

query
sites
1aw1A
R
 
R
A
 
H
K
 
P
L
 
V
V
 
V
V
 
M
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
L
H
 
N
G
 
G
R
 
S
L
 
K
A
 
E
E
 
M
N
 
V
A
 
V
T
 
D
L
 
L
L
 
L
Q
 
N
A
 
G
V
 
L
A
 
N
H
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
A
E
 
E
L
 
L
P
 
E
A
 
G
D
 
V
V
 
T
R
 
G
V
 
V
G
 
D
V
 
V
C
 
A
V
 
V
P
 
A
S
 
P
P
 
P
Y
 
A
L
 
L
-
 
F
-
 
V
-
 
D
A
 
L
Q
 
A
S
 
E
Q
 
R
S
 
T
L
 
L
L
 
T
E
 
E
-
 
A
G
 
G
S
 
S
R
 
A
V
 
I
V
 
I
W
 
L
G
 
G
V
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
T
S
 
D
A
 
L
F
 
N
T
 
N
H
 
S
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
D
V
 
M
A
 
S
A
 
P
P
 
A
M
 
M
V
 
L
V
 
K
D
 
E
F
 
F
G
 
G
A
 
A
T
 
T
L
 
H
A
 
I
I
 
I
V
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
A
 
E
Y
 
Y
H
 
H
R
 
A
E
 
E
S
 
S
A
 
D
E
 
E
L
 
F
V
 
V
A
 
A
V
 
K
K
 
K
T
 
F
Q
 
A
R
 
F
A
 
L
L
 
K
E
 
E
A
 
N
G
 
G
L
 
L
T
 
T
P
 
P
I
 
V
V
 
L
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
S
L
 
D
E
 
A
E
 
Q
R
 
N
E
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
E
T
 
T
E
 
M
Q
 
A
V
 
V
V
 
C
G
 
A
T
 
R
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
E
 
A
V
 
V
L
 
I
A
 
N
K
 
T
L
 
Q
S
 
G
V
 
V
Q
 
E
E
 
A
A
 
L
A
 
E
R
 
G
L
 
A
V
 
I
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
A
A
 
A
S
 
T
S
 
A
E
 
E
Q
 
D
A
 
A
Q
 
Q
A
 
R
V
 
I
H
 
H
A
 
A
F
 
Q
L
 
I
R
 
R
A
 
A
R
 
H
L
 
I
A
 
A
A
 
E
K
 
K
G
 
S
A
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
A
-
 
K
D
 
N
V
 
V
P
 
V
L
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
|
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
E
 
E
N
 
N
A
 
A
E
 
A
E
 
A
L
 
Y
F
 
F
R
 
A
Q
 
Q
P
 
P
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
|
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
A
L
 
L

6ooiC Crystal structure of triosephosphate isomerase from schistosoma mansoni in complex with 2pg (see paper)
44% identity, 97% coverage: 1:251/259 of query aligns to 4:253/255 of 6ooiC

query
sites
6ooiC
M
 
M
S
 
S
K
 
G
Q
 
S
R
 
R
A
 
K
K
 
F
L
 
F
V
 
V
V
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
H
 
N
G
 
G
R
 
S
L
 
R
A
 
D
E
 
D
N
 
N
A
 
D
T
 
K
L
 
L
L
 
L
Q
 
K
A
 
L
V
 
L
A
 
S
H
 
E
G
 
A
A
 
-
G
 
-
E
 
H
L
 
F
P
 
D
A
 
D
D
 
N
V
 
T
R
 
E
V
 
V
G
 
L
V
 
I
C
 
A
V
 
P
P
 
P
S
 
S
P
 
V
Y
 
F
L
 
L
A
 
H
Q
 
E
S
 
I
Q
 
R
S
 
K
L
 
S
L
 
L
E
 
K
G
 
K
S
 
E
R
 
I
V
 
H
V
 
V
W
 
-
G
 
A
V
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
C
S
 
Y
A
 
K
F
 
V
T
 
S
H
 
K
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
A
 
S
A
 
P
P
 
A
M
 
M
V
 
I
V
 
R
D
 
D
F
 
I
G
 
G
A
 
C
T
 
D
L
 
W
A
 
V
I
 
I
V
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
A
 
N
Y
 
I
H
 
F
R
 
G
E
 
E
S
 
S
A
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
I
A
 
A
V
 
E
K
 
K
T
 
V
Q
 
Q
R
 
H
A
 
A
L
 
L
E
 
A
A
 
E
G
 
G
L
 
L
T
 
S
P
 
V
I
 
I
V
 
A
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
E
 
S
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
S
G
 
N
L
 
K
T
 
T
E
 
E
Q
 
E
V
 
V
V
 
C
G
 
V
T
 
R
Q
 
Q
L
 
L
D
 
K
E
 
A
V
 
I
L
 
A
A
 
N
K
 
K
L
 
I
-
 
K
S
 
S
V
 
A
Q
 
D
E
 
E
A
 
W
A
 
K
R
 
R
L
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
V
A
 
A
S
 
T
S
 
P
E
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
A
 
E
V
 
V
H
 
H
A
 
N
F
 
F
L
 
L
R
 
R
A
 
K
R
 
W
L
 
F
A
 
K
A
 
T
K
 
N
G
 
A
A
 
P
A
 
N
V
 
G
A
 
V
D
 
D
-
 
E
-
 
K
V
 
I
P
 
R
L
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
K
 
T
P
 
A
E
 
A
N
 
N
A
 
C
E
 
K
E
 
E
L
 
L
F
 
A
R
 
Q
Q
 
Q
P
 
H
D
 
D
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
F
L
|
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
D
 
P
Q
 
E
D
 
-
F
 
F
L
 
T
A
 
E
I
 
I
C
 
C
K
 
K
A
 
A

6neeB Crystal structure of a reconstructed ancestor of triosephosphate isomerase from eukaryotes (see paper)
45% identity, 95% coverage: 5:251/259 of query aligns to 4:250/252 of 6neeB

query
sites
6neeB
R
 
R
A
 
K
K
 
F
L
 
F
V
 
V
V
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
H
 
N
G
 
G
R
 
T
L
 
L
A
 
E
E
 
S
N
 
I
A
 
K
T
 
A
L
 
L
L
 
V
Q
 
E
A
 
T
V
 
L
A
 
-
H
 
-
G
 
N
A
 
S
G
 
A
E
 
Q
L
 
L
P
 
D
A
 
P
D
 
N
V
 
T
R
 
E
V
 
V
G
 
V
V
 
V
C
 
A
V
 
P
P
 
P
S
 
A
P
 
I
Y
 
Y
L
 
L
A
 
P
Q
 
F
S
 
A
Q
 
R
S
 
S
L
 
K
L
 
L
E
 
K
G
 
K
S
 
P
R
 
K
V
 
E
V
 
I
W
 
Q
-
 
V
G
 
A
V
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
C
S
 
Y
A
 
T
F
 
K
T
 
P
H
 
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
A
 
S
A
 
A
P
 
E
M
 
M
V
 
L
V
 
K
D
 
D
F
 
L
G
 
G
A
 
V
T
 
P
L
 
W
A
 
V
I
 
I
V
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
A
 
T
Y
 
I
H
 
F
R
 
G
E
 
E
S
 
S
A
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
I
A
 
A
V
 
E
K
 
K
T
 
V
Q
 
K
R
 
Y
A
 
A
L
 
L
E
 
D
A
 
Q
G
 
G
L
 
L
T
 
K
P
 
V
I
 
I
V
 
A
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
E
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
K
T
 
T
E
 
M
Q
 
E
V
 
V
V
 
V
G
 
A
T
 
R
Q
 
Q
L
 
I
D
 
L
E
 
K
V
 
A
L
 
I
A
 
A
K
 
D
L
 
-
S
 
K
V
 
I
Q
 
K
E
 
D
A
 
W
A
 
S
R
 
N
L
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
V
A
 
A
S
 
T
S
 
P
E
 
E
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
A
 
E
V
 
V
H
 
H
A
 
A
F
 
A
L
 
L
R
 
R
A
 
K
R
 
W
L
 
L
A
 
K
A
 
E
K
 
N
-
 
V
G
 
S
A
 
P
A
 
E
V
 
V
A
 
A
D
 
E
-
 
S
V
 
T
P
 
R
L
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
K
 
N
P
 
A
E
 
A
N
 
N
A
 
C
E
 
K
E
 
E
L
 
L
F
 
A
R
 
K
Q
 
Q
P
 
P
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
F
L
|
L
I
x
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
D
 
A
Q
 
P
D
 
E
F
 
F
L
 
V
A
 
D
I
 
I
C
 
I
K
 
N
A
 
A

5zfxB Crystal structure of triosephosphate isomerase from opisthorchis viverrini (see paper)
43% identity, 96% coverage: 5:253/259 of query aligns to 1:248/248 of 5zfxB

query
sites
5zfxB
R
 
R
A
 
K
K
 
F
L
 
F
V
 
V
V
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
H
 
N
G
 
G
R
 
S
L
 
K
A
 
K
E
 
E
N
 
N
A
 
D
T
 
K
L
 
L
L
 
I
Q
x
E
A
 
M
V
 
L
A
 
T
H
|
H
G
 
A
A
 
-
G
 
-
E
 
K
L
 
I
P
 
D
A
 
P
D
 
N
V
 
T
R
 
E
V
 
V
G
 
L
V
 
V
C
 
A
V
 
P
P
 
P
S
 
A
P
 
L
Y
 
Y
L
 
L
A
 
P
Q
 
S
S
 
V
Q
 
R
S
 
E
L
 
K
L
 
L
E
 
D
G
 
-
S
 
K
R
 
R
V
 
F
V
 
H
W
 
V
G
 
A
V
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
C
S
 
Y
A
 
K
F
 
V
T
 
P
H
 
S
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
V
A
 
S
A
 
P
P
 
A
M
 
M
V
 
L
V
 
K
D
 
D
F
 
V
G
 
G
A
 
C
T
 
D
L
 
W
A
 
V
I
 
I
V
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
A
 
H
Y
 
I
H
 
L
R
 
L
E
 
E
S
 
T
A
 
D
E
 
Q
L
 
L
V
 
V
A
 
G
V
 
E
K
 
K
T
 
T
Q
 
N
R
 
H
A
 
A
L
 
I
E
 
S
A
 
A
G
 
G
L
 
V
T
 
N
P
 
V
I
 
I
V
 
A
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
K
L
 
L
E
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
K
T
 
T
E
 
E
Q
 
E
V
 
V
V
 
C
G
 
F
T
 
R
Q
 
Q
L
 
M
D
 
E
E
 
A
V
 
I
L
 
R
A
 
K
K
 
N
L
 
L
S
 
S
V
 
S
Q
 
A
E
 
D
A
 
M
-
 
W
A
 
N
R
 
H
L
 
I
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
|
A
I
 
I
G
|
G
T
|
T
G
 
G
K
|
K
S
 
T
A
 
A
S
 
T
S
 
E
E
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
A
 
E
V
 
V
H
 
H
A
 
L
F
 
A
L
 
V
R
 
R
A
 
R
R
 
W
L
 
M
A
 
E
A
 
E
K
 
K
-
 
V
-
 
S
G
 
P
A
 
A
A
 
V
V
 
A
A
 
K
D
 
S
V
 
I
P
 
R
L
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
T
P
 
A
E
 
A
N
 
N
A
 
C
E
 
R
E
 
T
L
 
L
F
 
A
R
 
K
Q
 
Q
P
 
P
D
 
D
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
F
L
 
L
I
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
D
 
-
Q
 
P
D
 
D
F
 
F
L
 
I
A
 
E
I
 
I
C
 
C
K
 
N
A
 
A
A
 
N
A
 
A

P00943 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Geobacillus stearothermophilus (Bacillus stearothermophilus) (see 2 papers)
43% identity, 95% coverage: 5:251/259 of query aligns to 2:249/253 of P00943

query
sites
P00943
R
 
R
A
 
K
K
 
P
L
 
I
V
 
I
V
 
A
G
 
G
N
|
N
W
|
W
K
|
K
M
 
M
H
|
H
G
x
K
R
 
T
L
 
L
A
 
A
E
 
E
N
 
A
A
 
V
T
 
Q
L
 
F
L
 
V
Q
 
E
A
 
D
V
 
V
A
 
K
H
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
G
E
 
H
L
 
V
P
 
P
A
 
P
-
 
A
-
 
D
D
 
E
V
 
V
R
 
I
V
 
S
G
 
V
V
 
V
C
 
C
V
 
A
P
 
P
S
 
F
P
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
D
Q
 
R
S
 
L
Q
 
V
S
 
Q
L
 
A
L
 
A
E
 
D
G
 
G
S
 
T
R
 
D
V
 
L
V
 
K
W
 
I
G
 
G
V
 
A
Q
 
Q
D
 
T
V
 
M
S
 
H
A
 
F
F
 
A
T
 
D
H
 
Q
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
V
A
 
S
A
 
P
P
 
V
M
 
M
V
 
L
V
 
K
D
 
D
F
 
L
G
 
G
A
 
V
T
 
T
L
 
Y
A
 
V
I
 
I
V
 
L
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
A
 
Q
Y
 
M
H
 
F
R
 
A
E
 
E
S
 
T
A
 
D
E
 
E
L
 
T
V
 
V
A
 
N
V
 
K
K
 
K
T
 
V
Q
 
L
R
 
A
A
 
A
L
 
F
E
 
T
A
 
R
G
 
G
L
 
L
T
 
I
P
 
P
I
 
I
V
 
I
C
 
C
V
 
C
G
 
G
E
 
E
T
 
S
L
 
L
E
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
Q
T
 
T
E
 
N
Q
 
A
V
 
V
V
 
V
G
 
A
T
 
S
Q
 
Q
L
 
V
D
 
E
E
 
K
V
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
G
L
 
L
S
 
T
V
 
P
Q
 
E
E
 
Q
A
 
V
A
 
K
R
 
Q
L
 
A
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
S
A
 
S
S
 
T
S
 
P
E
 
E
Q
 
D
A
 
A
Q
 
N
A
 
S
V
 
V
H
 
C
A
 
G
F
 
H
L
 
I
R
 
R
-
 
S
-
 
V
-
 
V
A
 
S
R
 
R
L
 
L
A
 
F
A
 
G
K
 
P
G
 
E
A
 
A
A
 
A
V
 
E
A
 
A
D
 
-
V
 
I
P
 
R
L
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
E
 
D
N
 
N
A
 
I
E
 
R
E
 
D
L
 
F
F
 
L
R
 
A
Q
 
Q
P
 
Q
D
 
Q
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
P
L
 
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
E
D
 
P
Q
 
A
D
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
Q
I
 
L
C
 
V
K
 
E
A
 
A

1btmA Triosephosphate isomerase (tim) complexed with 2-phosphoglycolic acid (see paper)
43% identity, 95% coverage: 5:251/259 of query aligns to 1:248/251 of 1btmA

query
sites
1btmA
R
 
R
A
 
K
K
 
P
L
 
I
V
 
I
V
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
H
 
H
G
 
K
R
 
T
L
 
L
A
 
A
E
 
E
N
 
A
A
 
V
T
 
Q
L
 
F
L
 
V
Q
 
E
A
 
D
V
 
V
A
 
K
H
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
G
E
 
H
L
 
V
P
 
P
A
 
P
-
 
A
-
 
D
D
 
E
V
 
V
R
 
I
V
 
S
G
 
V
V
 
V
C
 
C
V
 
A
P
 
P
S
 
F
P
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
D
Q
 
R
S
 
L
Q
 
V
S
 
Q
L
 
A
L
 
A
E
 
D
G
 
G
S
 
T
R
 
D
V
 
L
V
 
K
W
 
I
G
 
G
V
 
A
Q
 
Q
D
 
T
V
 
M
S
 
H
A
 
F
F
 
A
T
 
D
H
 
Q
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
V
A
 
S
A
 
P
P
 
V
M
 
M
V
 
L
V
 
K
D
 
D
F
 
L
G
 
G
A
 
V
T
 
T
L
 
Y
A
 
V
I
 
I
V
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
A
 
Q
Y
 
M
H
 
F
R
 
A
E
 
E
S
 
T
A
 
D
E
 
E
L
 
T
V
 
V
A
 
N
V
 
K
K
 
K
T
 
V
Q
 
L
R
 
A
A
 
A
L
 
F
E
 
T
A
 
R
G
 
G
L
 
L
T
 
I
P
 
P
I
 
I
V
 
I
C
 
C
V
 
C
G
 
G
E
 
E
T
 
S
L
 
L
E
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
Q
T
 
T
E
 
N
Q
 
A
V
 
V
V
 
V
G
 
A
T
 
S
Q
 
Q
L
 
V
D
 
E
E
 
K
V
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
G
L
 
L
S
 
T
V
 
P
Q
 
E
E
 
Q
A
 
V
A
 
K
R
 
Q
L
 
A
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
S
A
 
S
S
 
T
S
 
P
E
 
E
Q
 
D
A
 
A
Q
 
N
A
 
S
V
 
V
H
 
C
A
 
G
F
 
H
L
 
I
R
 
R
-
 
S
-
 
V
-
 
V
A
 
S
R
 
R
L
 
L
A
 
F
A
 
G
K
 
P
G
 
E
A
 
A
A
 
A
V
 
E
A
 
A
D
 
-
V
 
I
P
 
R
L
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
E
 
D
N
 
N
A
 
I
E
 
R
E
 
D
L
 
F
F
 
L
R
 
A
Q
 
Q
P
 
Q
D
 
Q
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
P
L
|
L
I
x
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
E
D
 
P
Q
 
A
D
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
Q
I
 
L
C
 
V
K
 
E
A
 
A

P00939 Triosephosphate isomerase; TIM; Methylglyoxal synthase; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1; EC 4.2.3.3 from Oryctolagus cuniculus (Rabbit) (see 2 papers)
43% identity, 97% coverage: 1:251/259 of query aligns to 1:247/249 of P00939

query
sites
P00939
M
 
M
S
 
A
K
 
P
Q
 
S
R
 
R
A
 
K
K
 
F
L
 
F
V
 
V
V
 
G
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
M
 
M
H
x
N
G
 
G
R
 
R
L
 
K
A
 
K
E
 
N
N
 
L
A
 
G
T
 
E
L
 
L
L
 
I
Q
 
T
A
 
T
V
 
L
A
 
-
H
 
-
G
 
N
A
 
A
G
 
A
E
 
K
L
 
V
P
 
P
A
 
A
D
 
D
V
 
T
R
 
E
V
 
V
G
 
V
V
 
C
C
 
A
V
 
P
P
 
P
S
 
T
P
 
A
Y
 
Y
L
 
I
A
 
D
Q
 
F
S
 
A
Q
 
R
S
 
Q
L
 
K
L
 
L
E
 
D
G
 
-
S
 
P
R
 
K
V
 
I
V
 
A
W
 
V
G
 
A
V
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
C
S
 
Y
A
 
K
F
 
V
T
 
T
H
x
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
A
 
S
A
 
P
P
 
G
M
 
M
V
 
I
V
 
K
D
 
D
F
 
C
G
 
G
A
 
A
T
 
T
L
 
W
A
 
V
I
 
V
V
 
L
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
A
 
H
Y
 
V
H
 
F
R
 
G
E
 
E
S
 
S
A
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
I
A
 
G
V
 
Q
K
 
K
T
 
V
Q
 
A
R
 
H
A
 
A
L
 
L
E
 
S
A
 
E
G
 
G
L
 
L
T
 
G
P
 
V
I
 
I
V
 
A
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
K
L
 
L
E
 
D
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
I
T
 
T
E
 
E
Q
 
K
V
 
V
V
 
V
G
 
F
T
 
E
Q
 
Q
L
 
T
D
 
-
E
 
K
V
 
V
L
 
I
A
 
A
K
 
D
L
 
-
S
 
N
V
 
V
Q
 
K
E
 
D
A
 
W
A
 
S
R
 
K
L
 
V
V
 
V
V
 
L
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
T
A
 
A
S
 
T
S
 
P
E
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
A
 
E
V
 
V
H
 
H
A
 
E
F
 
K
L
 
L
R
 
R
A
 
G
R
 
W
L
 
L
A
 
K
A
 
S
K
 
N
-
 
V
-
 
S
G
 
D
A
 
A
A
 
V
V
 
A
A
 
Q
D
 
S
V
 
T
P
 
R
L
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
V
K
 
T
P
 
G
E
 
A
N
 
T
A
 
C
E
 
K
E
 
E
L
 
L
F
 
A
R
 
S
Q
 
Q
P
 
P
D
 
D
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
F
L
 
L
I
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
D
 
P
Q
 
E
D
 
-
F
 
F
L
 
V
A
 
D
I
 
I
C
 
I
K
 
N
A
 
A

P60174 Triosephosphate isomerase; TIM; Methylglyoxal synthase; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1; EC 4.2.3.3 from Homo sapiens (Human) (see 7 papers)
43% identity, 97% coverage: 1:251/259 of query aligns to 1:247/249 of P60174

query
sites
P60174
M
 
M
S
 
A
K
 
P
Q
 
S
R
 
R
A
 
K
K
 
F
L
 
F
V
 
V
V
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
H
 
N
G
 
G
R
 
R
L
 
K
A
 
Q
E
 
S
N
 
L
A
 
G
T
 
E
L
 
L
L
 
I
Q
 
G
A
 
T
V
 
L
A
 
-
H
 
-
G
 
N
A
 
A
G
 
A
E
 
K
L
 
V
P
 
P
A
 
A
D
 
D
V
 
T
R
 
E
V
 
V
G
 
V
V
 
C
C
 
A
V
 
P
P
 
P
S
 
T
P
 
A
Y
 
Y
L
 
I
A
 
D
Q
 
F
S
 
A
Q
 
R
S
 
Q
L
 
K
L
 
L
E
 
D
G
 
-
S
 
P
R
 
K
V
 
I
V
 
A
W
 
V
G
 
A
V
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
C
S
 
Y
A
 
K
F
 
V
T
 
T
H
 
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
A
 
S
A
 
P
P
 
G
M
 
M
V
 
I
V
 
K
D
 
D
F
 
C
G
 
G
A
 
A
T
 
T
L
 
W
A
 
V
I
 
V
V
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
A
 
H
Y
 
V
H
 
F
R
 
G
E
|
E
S
 
S
A
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
I
A
 
G
V
 
Q
K
 
K
T
 
V
Q
 
A
R
 
H
A
 
A
L
 
L
E
 
A
A
 
E
G
 
G
L
 
L
T
x
G
P
 
V
I
 
I
V
 
A
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
K
L
 
L
E
 
D
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
I
T
 
T
E
 
E
Q
 
K
V
 
V
V
 
V
G
 
F
T
 
E
Q
 
Q
L
 
T
D
 
-
E
 
K
V
 
V
L
 
I
A
 
A
K
 
D
L
 
-
S
 
N
V
 
V
Q
 
K
E
 
D
A
 
W
A
 
S
R
 
K
L
 
V
V
 
V
V
 
L
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
T
A
 
A
S
 
T
S
 
P
E
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
A
 
E
V
 
V
H
 
H
A
 
E
F
 
K
L
 
L
R
 
R
A
 
G
R
 
W
L
 
L
A
 
K
A
 
S
K
 
N
-
 
V
-
 
S
G
 
D
A
 
A
A
 
V
V
 
A
A
 
Q
D
 
S
V
 
T
P
 
R
L
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
V
K
 
T
P
 
G
E
 
A
N
 
T
A
 
C
E
 
K
E
 
E
L
 
L
F
 
A
R
 
S
Q
 
Q
P
 
P
D
 
D
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
F
L
 
L
I
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
D
 
P
Q
 
E
D
 
-
F
|
F
L
 
V
A
 
D
I
 
I
C
 
I
K
 
N
A
 
A

4owgA Crystal structure of rabbit muscle triosephosphate isomerase-pep complex
43% identity, 95% coverage: 5:251/259 of query aligns to 2:244/246 of 4owgA

query
sites
4owgA
R
 
R
A
 
K
K
 
F
L
 
F
V
 
V
V
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
H
 
N
G
 
G
R
 
R
L
 
K
A
 
K
E
 
N
N
 
L
A
 
G
T
 
E
L
 
L
L
 
I
Q
 
T
A
 
T
V
 
L
A
 
-
H
 
-
G
 
N
A
 
A
G
 
A
E
 
K
L
 
V
P
 
P
A
 
A
D
 
D
V
 
T
R
 
E
V
 
V
G
 
V
V
 
C
C
 
A
V
 
P
P
 
P
S
 
T
P
 
A
Y
 
Y
L
 
I
A
 
D
Q
 
F
S
 
A
Q
 
R
S
 
Q
L
 
K
L
 
L
E
 
D
G
 
-
S
 
P
R
 
K
V
 
I
V
 
A
W
 
V
G
 
A
V
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
C
S
 
Y
A
 
K
F
 
V
T
 
T
H
 
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
A
 
S
A
 
P
P
 
G
M
 
M
V
 
I
V
 
K
D
 
D
F
 
C
G
 
G
A
 
A
T
 
T
L
 
W
A
 
V
I
 
V
V
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
A
 
H
Y
 
V
H
 
F
R
 
G
E
 
E
S
 
S
A
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
I
A
 
G
V
 
Q
K
 
K
T
 
V
Q
 
A
R
 
H
A
 
A
L
 
L
E
 
S
A
 
E
G
 
G
L
 
L
T
 
G
P
 
V
I
 
I
V
 
A
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
K
L
 
L
E
 
D
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
I
T
 
T
E
 
E
Q
 
K
V
 
V
V
 
V
G
 
F
T
 
E
Q
 
Q
L
 
T
D
 
-
E
 
K
V
 
V
L
 
I
A
 
A
K
 
D
L
 
-
S
 
N
V
 
V
Q
 
K
E
 
D
A
 
W
A
 
S
R
 
K
L
 
V
V
 
V
V
 
L
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
T
A
 
A
S
 
T
S
 
P
E
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
A
 
E
V
 
V
H
 
H
A
 
E
F
 
K
L
 
L
R
 
R
A
 
G
R
 
W
L
 
L
A
 
K
A
 
S
K
 
N
-
 
V
-
 
S
G
 
D
A
 
A
A
 
V
V
 
A
A
 
Q
D
 
S
V
 
T
P
 
R
L
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
|
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
K
 
T
P
 
G
E
 
A
N
 
T
A
 
C
E
 
K
E
 
E
L
 
L
F
 
A
R
 
S
Q
 
Q
P
 
P
D
 
D
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
F
L
|
L
I
x
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
D
 
P
Q
 
E
D
 
-
F
 
F
L
 
V
A
 
D
I
 
I
C
 
I
K
 
N
A
 
A

1r2rB Crystal structure of rabbit muscle triosephosphate isomerase (see paper)
43% identity, 95% coverage: 5:251/259 of query aligns to 3:245/247 of 1r2rB

query
sites
1r2rB
R
 
R
A
 
K
K
 
F
L
 
F
V
 
V
V
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
H
 
N
G
 
G
R
 
R
L
 
K
A
 
K
E
 
N
N
 
L
A
 
G
T
 
E
L
 
L
L
 
I
Q
 
T
A
 
T
V
 
L
A
 
-
H
 
-
G
 
N
A
 
A
G
 
A
E
 
K
L
 
V
P
 
P
A
 
A
D
 
D
V
 
T
R
 
E
V
 
V
G
 
V
V
 
C
C
 
A
V
 
P
P
 
P
S
 
T
P
 
A
Y
 
Y
L
 
I
A
 
D
Q
 
F
S
 
A
Q
 
R
S
 
Q
L
 
K
L
 
L
E
 
D
G
 
-
S
 
P
R
 
K
V
 
I
V
 
A
W
 
V
G
 
A
V
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
C
S
 
Y
A
 
K
F
 
V
T
 
T
H
 
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
A
 
S
A
 
P
P
 
G
M
 
M
V
 
I
V
 
K
D
 
D
F
 
C
G
 
G
A
 
A
T
 
T
L
 
W
A
 
V
I
 
V
V
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
A
 
H
Y
 
V
H
 
F
R
 
G
E
 
E
S
 
S
A
x
D
E
 
E
L
 
L
V
 
I
A
 
G
V
 
Q
K
 
K
T
 
V
Q
 
A
R
 
H
A
 
A
L
 
L
E
 
S
A
 
E
G
 
G
L
 
L
T
 
G
P
 
V
I
 
I
V
 
A
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
K
L
 
L
E
 
D
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
I
T
 
T
E
 
E
Q
 
K
V
 
V
V
 
V
G
 
F
T
 
E
Q
|
Q
L
 
T
D
 
-
E
 
K
V
 
V
L
 
I
A
 
A
K
 
D
L
 
-
S
 
N
V
 
V
Q
 
K
E
 
D
A
 
W
A
 
S
R
 
K
L
 
V
V
 
V
V
 
L
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
T
A
 
A
S
 
T
S
 
P
E
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
A
 
E
V
 
V
H
 
H
A
 
E
F
 
K
L
 
L
R
 
R
A
 
G
R
 
W
L
 
L
A
 
K
A
 
S
K
 
N
-
 
V
-
 
S
G
 
D
A
 
A
A
 
V
V
 
A
A
 
Q
D
 
S
V
 
T
P
 
R
L
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
T
P
 
G
E
 
A
N
 
T
A
 
C
E
 
K
E
 
E
L
 
L
F
 
A
R
 
S
Q
 
Q
P
 
P
D
 
D
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
F
L
 
L
I
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
D
 
P
Q
 
E
D
 
-
F
 
F
L
 
V
A
 
D
I
 
I
C
 
I
K
 
N
A
 
A

P27876 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Bacillus subtilis (strain 168) (see paper)
40% identity, 94% coverage: 5:248/259 of query aligns to 2:246/253 of P27876

query
sites
P27876
R
 
R
A
 
K
K
 
P
L
 
I
V
 
I
V
 
A
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
M
 
M
H
 
N
G
 
K
R
 
T
L
 
L
A
 
G
E
 
E
N
 
A
A
 
V
T
 
S
L
 
F
L
 
V
Q
 
E
A
 
E
V
 
V
A
 
K
H
 
S
G
 
S
A
 
-
G
 
-
E
 
-
L
 
I
P
 
P
A
 
A
D
 
A
V
 
D
R
 
K
V
 
A
G
 
E
-
 
A
-
 
V
V
 
V
C
 
C
V
 
A
P
 
P
S
 
A
P
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
E
Q
 
K
S
 
L
Q
 
A
S
 
S
L
 
A
L
 
V
E
 
K
G
 
G
S
 
T
R
 
D
V
 
L
V
 
K
W
 
V
G
 
G
V
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
M
S
 
H
A
 
F
F
 
E
T
 
E
H
 
S
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
A
 
S
A
 
P
P
 
V
M
 
A
V
 
L
V
 
K
D
 
D
F
 
L
G
 
G
A
 
V
T
 
D
L
 
Y
A
 
C
I
 
V
V
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
A
 
E
Y
 
M
H
 
F
R
 
A
E
 
E
S
 
T
A
 
D
E
 
E
L
 
T
V
 
V
A
 
N
V
 
K
K
 
K
T
 
A
Q
 
H
R
 
A
A
 
A
L
 
F
E
 
K
A
 
H
G
 
G
L
 
I
T
 
V
P
 
P
I
 
I
V
 
I
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
E
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
K
T
 
T
E
 
N
Q
 
D
V
 
L
V
 
V
G
 
A
T
 
D
Q
 
Q
L
 
V
D
 
K
E
 
K
V
 
G
L
 
L
A
 
A
K
 
G
L
 
L
S
 
S
V
 
E
Q
 
E
E
 
Q
A
 
V
A
 
A
R
 
A
L
 
S
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
S
A
 
S
S
 
T
S
 
A
E
 
K
Q
 
D
A
 
A
Q
 
N
A
 
D
V
 
V
H
 
C
A
 
A
F
 
H
L
 
I
R
 
R
A
 
K
R
 
T
L
 
V
A
 
A
A
 
E
K
 
S
G
 
F
A
 
S
-
 
Q
-
 
E
A
 
A
V
 
A
A
 
D
D
 
K
V
 
L
P
 
R
L
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
E
 
A
N
 
N
A
 
I
E
 
K
E
 
E
L
 
Y
F
 
M
R
 
A
Q
 
E
P
 
S
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
E
D
 
P
Q
 
Q
D
 
S
F
 
F
L
 
V
A
 
Q
I
 
L

1htiB Crystal structure of recombinant human triosephosphate isomerase at 2.8 angstroms resolution. Triosephosphate isomerase related human genetic disorders and comparison with the trypanosomal enzyme (see paper)
43% identity, 95% coverage: 5:251/259 of query aligns to 4:246/248 of 1htiB

query
sites
1htiB
R
 
R
A
 
K
K
 
F
L
 
F
V
 
V
V
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
H
 
N
G
 
G
R
 
R
L
 
K
A
 
Q
E
 
S
N
 
L
A
 
G
T
 
E
L
 
L
L
 
I
Q
 
G
A
 
T
V
 
L
A
 
-
H
 
-
G
 
N
A
 
A
G
 
A
E
 
K
L
 
V
P
 
P
A
 
A
D
 
D
V
 
T
R
 
E
V
 
V
G
 
V
V
 
C
C
 
A
V
 
P
P
 
P
S
 
T
P
 
A
Y
 
Y
L
 
I
A
 
D
Q
 
F
S
 
A
Q
 
R
S
 
Q
L
 
K
L
 
L
E
 
D
G
 
-
S
 
P
R
 
K
V
 
I
V
 
A
W
 
V
G
 
A
V
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
C
S
 
Y
A
 
K
F
 
V
T
 
T
H
 
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
A
 
S
A
 
P
P
 
G
M
 
M
V
 
I
V
 
K
D
 
D
F
 
C
G
 
G
A
 
A
T
 
T
L
 
W
A
 
V
I
 
V
V
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
A
 
H
Y
 
V
H
 
F
R
 
G
E
 
E
S
 
S
A
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
I
A
 
G
V
 
Q
K
 
K
T
 
V
Q
 
A
R
 
H
A
 
A
L
 
L
E
 
A
A
 
E
G
 
G
L
 
L
T
 
G
P
 
V
I
 
I
V
 
A
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
K
L
 
L
E
 
D
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
I
T
 
T
E
 
E
Q
 
K
V
 
V
V
 
V
G
 
F
T
 
E
Q
 
Q
L
 
T
D
 
-
E
 
K
V
 
V
L
 
I
A
 
A
K
 
D
L
 
-
S
 
N
V
 
V
Q
 
K
E
 
D
A
 
W
A
 
S
R
 
K
L
 
V
V
 
V
V
 
L
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
|
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
T
A
 
A
S
 
T
S
 
P
E
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
A
 
E
V
 
V
H
 
H
A
 
E
F
 
K
L
 
L
R
 
R
A
 
G
R
 
W
L
 
L
A
 
K
A
 
S
K
 
N
-
 
V
-
 
S
G
 
D
A
 
A
A
 
V
V
 
A
A
 
Q
D
 
S
V
 
T
P
 
R
L
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G