SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing BPHYT_RS07275 FitnessBrowser__BFirm:BPHYT_RS07275 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P83788 Kynureninase; L-kynurenine hydrolase; EC 3.7.1.3 from Pseudomonas fluorescens (see paper)
51% identity, 100% coverage: 1:409/409 of query aligns to 1:416/416 of P83788

query
sites
P83788
M
 
M
I
 
T
T
 
T
R
 
R
E
 
N
H
 
D
C
 
C
A
 
L
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
A
A
 
Q
D
 
D
T
 
S
L
 
L
A
 
A
H
 
P
C
 
L
R
 
R
A
 
Q
R
 
Q
F
 
F
D
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
E
D
 
G
T
 
V
I
 
I
Y
 
Y
L
 
L
D
 
D
G
 
G
N
 
N
S
 
S
L
 
L
G
 
G
A
 
A
M
 
R
P
 
P
A
 
V
N
 
A
V
 
A
P
 
L
A
 
A
R
 
R
I
 
A
E
 
Q
Q
 
A
A
 
V
L
 
I
K
 
A
H
 
E
E
 
E
W
 
W
A
 
G
H
 
N
G
 
G
L
 
L
I
 
I
R
 
R
S
 
S
W
 
W
N
 
N
D
 
S
A
 
A
G
 
G
W
 
W
Y
 
R
P
 
D
A
 
L
P
 
S
Q
 
E
R
 
R
T
 
L
G
 
G
N
 
N
K
 
R
I
 
L
A
 
A
R
 
T
L
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
R
Q
 
D
D
 
G
E
 
E
V
 
V
I
 
V
V
 
V
A
 
T
D
 
D
S
 
T
T
|
T
S
|
S
V
 
I
N
 
N
L
 
L
F
 
F
K
 
K
V
 
V
L
 
L
V
 
S
A
 
A
A
 
A
T
 
L
R
 
R
M
 
V
R
 
Q
-
 
A
-
 
T
-
 
R
-
 
S
P
 
P
G
 
E
R
 
R
N
 
R
V
 
V
I
 
I
L
 
V
A
 
T
E
 
E
R
 
T
T
 
S
N
 
N
F
 
F
P
 
P
T
 
T
D
|
D
V
 
L
Y
 
Y
I
 
I
A
 
A
S
 
E
S
 
G
V
 
L
A
 
A
E
 
D
M
 
M
-
 
L
-
 
Q
T
 
Q
G
 
G
C
 
Y
D
 
T
L
 
L
R
 
R
C
 
L
V
 
V
D
 
D
-
 
S
P
 
P
D
 
E
E
 
E
I
 
L
V
 
P
S
 
Q
A
 
A
I
 
I
D
 
D
D
 
Q
T
 
D
V
 
T
A
 
A
I
 
V
V
 
V
S
 
M
L
 
L
T
|
T
H
 
H
V
 
V
N
 
N
Y
 
Y
K
 
K
T
 
T
G
 
G
K
 
Y
R
 
M
Y
 
H
D
 
D
M
 
M
E
 
Q
A
 
A
V
 
L
T
 
T
R
 
A
Q
 
L
A
 
S
Q
 
H
E
 
E
A
 
C
G
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
A
V
 
I
W
 
W
D
|
D
L
 
L
C
 
A
H
|
H
S
 
S
A
 
A
G
 
G
A
 
A
M
 
V
P
 
P
V
 
V
N
 
D
L
 
L
N
 
H
R
 
Q
C
 
A
D
 
G
A
 
A
D
 
D
F
 
Y
A
 
A
V
 
I
G
 
G
C
 
C
G
 
T
Y
 
Y
K
 
K
Y
 
Y
L
 
L
N
 
N
G
 
G
G
 
G
P
 
P
G
 
G
A
 
S
P
 
Q
A
 
A
F
 
F
V
 
V
F
 
W
V
 
V
A
 
S
S
 
P
R
 
Q
H
 
L
I
 
C
E
 
D
A
 
L
V
 
V
R
 
P
Q
 
Q
P
 
P
L
 
L
T
 
S
G
 
G
W
 
W
H
 
F
G
 
G
H
 
H
S
 
S
R
 
R
P
 
Q
F
 
F
E
 
A
F
 
M
A
 
E
H
 
P
D
 
R
Y
 
Y
A
 
E
P
 
P
H
 
S
P
 
N
G
 
G
I
 
I
D
 
A
R
 
R
M
 
Y
L
 
L
T
 
C
G
 
G
T
 
T
A
 
Q
P
 
P
Q
 
I
L
 
T
G
 
S
V
 
L
I
 
A
A
 
M
L
 
V
E
 
E
S
 
C
A
 
G
L
 
L
E
 
D
A
 
V
F
 
F
D
 
A
G
 
Q
V
 
T
D
 
D
L
 
M
D
 
A
V
 
S
L
 
L
R
 
R
D
 
R
K
 
K
S
 
S
V
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
T
N
 
D
L
 
L
F
 
F
I
 
I
E
 
E
L
 
L
T
 
V
D
 
E
Q
 
Q
E
 
R
L
 
C
T
 
A
G
 
A
L
 
H
G
 
E
C
 
L
T
 
T
L
 
L
A
 
V
S
 
T
P
 
P
R
 
R
D
 
E
A
 
H
E
 
A
M
 
K
R
 
R
G
 
G
S
 
S
Q
 
H
V
 
V
S
 
S
L
 
F
G
 
E
H
 
H
A
 
P
Q
 
E
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
I
 
V
M
 
I
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
I
 
I
A
 
D
R
 
R
N
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
D
 
D
F
 
Y
R
 
R
A
 
E
P
 
P
D
 
R
I
 
I
L
 
M
R
 
R
F
 
F
G
 
G
F
 
F
A
 
T
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
V
 
T
R
 
T
Y
 
F
V
 
T
D
 
E
I
 
V
W
 
W
D
 
D
T
 
A
I
 
V
A
 
Q
Q
 
I
L
 
L
K
 
G
D
 
E
I
 
I
I
 
L
A
 
D
T
 
R
D
 
K
A
 
T
W
 
W
N
 
A
T
 
Q
D
 
A
E
 
Q
F
 
F
K
 
Q
A
 
V
R
 
R
K
 
H
S
 
S
V
 
V
T
 
T

1qz9A The three dimensional structure of kynureninase from pseudomonas fluorescens (see paper)
52% identity, 97% coverage: 3:397/409 of query aligns to 2:403/404 of 1qz9A

query
sites
1qz9A
T
 
T
R
 
R
E
 
N
H
 
D
C
 
C
A
 
L
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
A
A
 
Q
D
 
D
T
 
S
L
 
L
A
 
A
H
 
P
C
 
L
R
 
R
A
 
Q
R
 
Q
F
 
F
D
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
E
D
 
G
T
 
V
I
 
I
Y
 
Y
L
 
L
D
 
D
G
 
G
N
 
N
S
 
S
L
 
L
G
 
G
A
 
A
M
 
R
P
 
P
A
 
V
N
 
A
V
 
A
P
 
L
A
 
A
R
 
R
I
 
A
E
 
Q
Q
 
A
A
 
V
L
 
I
K
 
A
H
 
E
E
 
E
W
 
W
A
 
G
H
 
N
G
 
G
L
 
L
I
 
I
R
 
R
S
 
S
W
 
W
N
 
N
D
 
S
A
 
A
G
 
G
W
 
W
Y
 
R
P
 
D
A
 
L
P
 
S
Q
 
E
R
 
R
T
 
L
G
 
G
N
 
N
K
 
R
I
 
L
A
 
A
R
 
T
L
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
R
Q
 
D
D
 
G
E
 
E
V
 
V
I
 
V
V
 
V
A
 
T
D
 
D
S
x
T
T
|
T
S
|
S
V
 
I
N
 
N
L
 
L
F
 
F
K
 
K
V
 
V
L
 
L
V
 
S
A
 
A
A
 
A
T
 
L
R
 
R
M
 
V
R
 
Q
-
 
A
-
 
T
-
 
R
-
 
S
P
 
P
G
 
E
R
 
R
N
 
R
V
 
V
I
 
I
L
 
V
A
 
T
E
 
E
R
 
T
T
 
S
N
 
N
F
|
F
P
 
P
T
 
T
D
|
D
V
 
L
Y
 
Y
I
 
I
A
 
A
S
 
E
S
 
G
V
 
L
A
 
A
E
 
D
M
 
M
-
 
L
-
 
Q
T
 
Q
G
 
G
C
 
Y
D
 
T
L
 
L
R
 
R
C
 
L
V
 
V
D
 
D
-
 
S
P
 
P
D
 
E
E
 
E
I
 
L
V
 
P
S
 
Q
A
 
A
I
 
I
D
 
D
D
 
Q
T
 
D
V
 
T
A
 
A
I
 
V
V
 
V
S
 
M
L
 
L
T
|
T
H
 
H
V
 
V
N
 
N
Y
 
Y
K
 
K
T
 
T
G
 
G
K
 
Y
R
 
M
Y
 
H
D
 
D
M
 
M
E
 
Q
A
 
A
V
 
L
T
 
T
R
 
A
Q
 
L
A
 
S
Q
 
H
E
 
E
A
 
C
G
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
A
V
 
I
W
 
W
D
|
D
L
 
L
C
x
A
H
|
H
S
 
S
A
 
A
G
 
G
A
 
A
M
 
V
P
 
P
V
 
V
N
 
D
L
 
L
N
 
H
R
 
Q
C
 
A
D
 
G
A
 
A
D
 
D
F
 
Y
A
 
A
V
 
I
G
 
G
C
|
C
G
 
T
Y
|
Y
K
|
K
Y
 
Y
L
 
L
N
 
N
G
 
G
G
 
G
P
 
P
G
 
G
A
 
S
P
 
Q
A
 
A
F
 
F
V
 
V
F
 
W
V
 
V
A
 
S
S
 
P
R
 
Q
H
 
L
I
 
C
E
 
D
A
 
L
V
 
V
R
 
P
Q
 
Q
P
 
P
L
 
L
T
 
S
G
 
G
W
 
W
H
 
F
G
 
G
H
 
H
S
 
S
R
 
R
P
 
Q
F
 
F
E
 
A
F
 
M
A
 
E
H
 
P
D
 
R
Y
 
Y
A
 
E
P
 
P
H
 
S
P
 
N
G
 
G
I
 
I
D
 
A
R
 
R
M
 
Y
L
 
L
T
 
C
G
 
G
T
 
T
A
 
Q
P
 
P
Q
 
I
L
 
T
G
 
S
V
 
L
I
 
A
A
 
M
L
 
V
E
 
E
S
 
C
A
 
G
L
 
L
E
 
D
A
 
V
F
 
F
D
 
A
G
 
Q
V
 
T
D
 
D
L
 
M
D
 
A
V
 
S
L
 
L
R
 
R
D
 
R
K
 
K
S
 
S
V
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
T
N
 
D
L
 
L
F
 
F
I
 
I
E
 
E
L
 
L
T
 
V
D
 
E
Q
 
Q
E
 
R
L
 
C
T
 
A
G
 
A
L
 
H
G
 
E
C
 
L
T
 
T
L
 
L
A
 
V
S
 
T
P
 
P
R
 
R
D
 
E
A
 
H
E
 
A
M
 
K
R
 
R
G
 
G
S
 
S
Q
 
H
V
 
V
S
 
S
L
 
F
G
 
E
H
 
H
A
 
P
Q
 
E
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
I
 
V
M
 
I
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
I
 
I
A
 
D
R
 
R
N
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
D
 
D
F
 
Y
R
 
R
A
 
E
P
 
P
D
 
R
I
 
I
L
 
M
R
|
R
F
 
F
G
 
G
F
 
F
A
 
T
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
V
 
T
R
 
T
Y
 
F
V
 
T
D
 
E
I
 
V
W
 
W
D
 
D
T
 
A
I
 
V
A
 
Q
Q
 
I
L
 
L
K
 
G
D
 
E
I
 
I
I
 
L
A
 
D
T
 
R
D
 
K
A
 
T
W
 
W

2hzpA Crystal structure of homo sapiens kynureninase (see paper)
27% identity, 94% coverage: 10:392/409 of query aligns to 28:445/447 of 2hzpA

query
sites
2hzpA
L
 
L
D
 
D
A
 
E
A
 
E
D
 
D
T
 
K
L
 
L
A
 
R
H
 
H
C
 
F
R
 
R
A
 
E
R
 
C
F
 
F
D
 
Y
L
 
I
P
 
P
A
 
K
-
 
I
-
 
Q
-
 
D
-
 
L
-
 
P
-
 
P
-
 
V
-
 
D
-
 
L
-
 
S
-
 
L
-
 
V
-
 
N
-
 
K
-
 
D
-
 
E
D
 
N
T
 
A
I
 
I
Y
 
Y
L
 
F
D
 
L
G
 
G
N
 
N
S
 
S
L
 
L
G
 
G
A
 
L
M
 
Q
P
 
P
A
 
K
N
 
M
V
 
V
P
 
K
A
 
T
R
 
Y
I
 
L
E
 
E
Q
 
E
A
 
E
L
 
L
K
 
D
H
 
-
E
 
K
W
 
W
A
 
A
H
 
-
G
 
K
L
 
I
I
 
A
R
 
A
S
 
Y
W
 
G
N
 
H
D
 
E
A
 
V
G
 
G
-
 
K
-
 
R
-
 
P
W
 
W
Y
 
I
P
 
T
A
 
G
P
 
D
Q
 
E
R
 
S
T
 
I
G
 
V
N
 
G
K
 
L
I
 
M
A
 
K
R
 
D
L
 
I
I
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
N
Q
 
E
D
 
K
E
 
E
V
 
I
I
 
A
V
 
L
A
 
M
D
 
N
S
 
A
T
x
L
S
x
T
V
 
V
N
 
N
L
 
L
F
 
H
K
 
L
V
 
L
L
 
M
V
 
L
A
 
S
A
 
F
T
 
F
R
 
K
M
 
P
R
 
T
P
 
P
G
 
K
R
 
R
N
 
Y
V
 
K
I
 
I
L
 
L
A
 
L
E
 
E
R
 
A
T
 
K
N
 
A
F
|
F
P
 
P
T
 
S
D
|
D
V
 
H
Y
 
Y
I
 
A
A
 
I
S
 
E
S
 
S
V
 
Q
A
 
L
E
 
Q
M
 
L
T
 
H
G
 
G
C
 
L
D
 
N
-
 
I
-
 
E
-
 
E
-
 
S
-
 
M
-
 
R
-
 
M
-
 
I
-
 
K
-
 
P
-
 
R
-
 
E
-
 
G
-
 
E
-
 
E
-
 
T
L
 
L
R
 
R
C
 
I
V
 
E
D
 
D
P
 
I
D
 
L
E
 
E
I
 
V
V
 
I
S
 
E
A
 
K
I
 
E
D
 
G
D
 
D
T
 
S
V
 
I
A
 
A
I
 
V
V
 
I
S
 
L
L
 
F
T
 
S
H
 
G
V
 
V
N
 
H
Y
 
F
K
 
Y
T
 
T
G
 
G
K
 
Q
R
 
H
Y
 
F
D
 
N
M
 
I
E
 
P
A
 
A
V
 
I
T
 
T
R
 
K
Q
 
A
A
 
G
Q
 
Q
E
 
A
A
 
K
G
 
G
A
 
C
L
 
Y
I
 
V
V
 
G
W
 
F
D
|
D
L
 
L
C
x
A
H
|
H
S
 
A
A
 
V
G
 
G
A
 
N
M
 
V
P
 
E
V
 
L
N
 
Y
L
 
L
N
 
H
R
 
D
C
 
W
D
 
G
A
 
V
D
 
D
F
 
F
A
 
A
V
 
C
G
 
W
C
 
C
G
 
S
Y
|
Y
K
|
K
Y
 
Y
L
 
L
N
 
N
G
 
A
G
 
G
P
 
A
G
 
G
A
 
G
P
 
I
A
 
A
F
 
G
V
 
A
F
 
F
V
 
I
A
 
H
S
 
E
R
 
K
H
 
H
I
 
A
E
 
H
A
 
T
V
 
I
R
 
K
Q
 
P
P
 
A
L
 
L
T
 
V
G
 
G
W
 
W
H
 
F
G
 
G
H
 
H
S
 
E
R
 
L
P
 
S
F
 
T
E
 
R
F
 
F
A
 
K
H
 
M
D
 
D
Y
 
N
A
 
K
P
 
L
H
 
Q
-
 
L
-
 
I
P
 
P
G
 
G
I
 
V
D
 
C
R
 
G
M
 
F
L
 
R
T
 
I
G
 
S
T
 
N
A
 
P
P
 
P
Q
 
I
L
 
L
G
 
L
V
 
V
I
 
C
A
 
S
L
 
L
E
 
H
S
 
A
A
 
S
L
 
L
E
 
E
A
 
I
F
 
F
D
 
K
G
 
Q
V
 
A
D
 
T
L
 
M
D
 
K
V
 
A
L
 
L
R
 
R
D
 
K
K
 
K
S
 
S
V
 
V
A
 
L
L
 
L
G
 
T
N
 
G
L
 
-
F
 
Y
I
 
L
E
 
E
L
 
Y
T
 
L
D
 
I
Q
 
K
E
 
H
L
 
N
T
 
Y
G
 
G
L
 
K
G
 
V
C
 
V
T
 
N
L
 
I
A
 
I
S
 
T
P
 
P
R
 
S
D
 
H
A
 
V
E
 
E
M
 
E
R
 
R
G
 
G
S
 
C
Q
 
Q
V
 
L
S
 
T
L
 
I
G
 
T
H
 
F
A
 
S
-
 
V
Q
 
P
G
 
N
Y
 
K
A
 
D
I
 
V
M
 
F
Q
 
Q
A
 
E
L
 
L
I
 
E
A
 
K
R
 
R
N
 
G
V
 
V
I
 
V
G
 
C
D
 
D
F
 
K
R
 
R
A
 
N
P
 
P
D
 
N
I
 
G
L
 
I
R
|
R
F
 
V
G
 
A
F
 
P
A
 
V
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
V
 
N
R
 
S
Y
 
F
V
 
H
D
 
D
I
 
V
W
 
Y
D
 
K
T
 
F
I
 
T
A
 
N
Q
 
L
L
 
L
K
 
T
D
 
S
I
 
I
I
 
L

P70712 Kynureninase; L-kynurenine hydrolase; EC 3.7.1.3 from Rattus norvegicus (Rat) (see paper)
28% identity, 95% coverage: 10:398/409 of query aligns to 33:464/464 of P70712

query
sites
P70712
L
 
L
D
 
D
A
 
E
A
 
E
D
 
D
T
 
K
L
 
L
A
 
K
H
 
R
C
 
F
R
 
K
A
 
D
R
 
C
F
 
F
-
 
Y
-
 
I
-
 
P
-
 
K
-
 
M
-
 
R
D
 
D
L
 
L
P
 
P
A
 
S
-
 
I
-
 
D
-
 
L
-
 
S
-
 
L
-
 
V
-
 
N
-
 
E
-
 
D
-
 
D
D
 
N
T
 
A
I
 
I
Y
 
Y
L
 
F
D
 
L
G
 
G
N
 
N
S
 
S
L
 
L
G
 
G
A
 
L
M
 
Q
P
 
P
A
 
K
N
 
M
V
 
V
P
 
K
A
 
T
R
 
Y
I
 
L
E
 
E
Q
 
E
A
 
E
L
 
L
K
 
D
H
 
-
E
 
K
W
 
W
A
 
A
H
 
K
G
 
-
L
 
-
I
 
I
R
 
G
S
 
A
W
 
Y
-
 
G
N
 
H
D
 
E
A
 
V
G
 
G
-
 
K
-
 
R
-
 
P
W
 
W
Y
 
I
P
 
I
A
 
G
P
 
D
Q
 
E
R
 
S
T
 
I
G
 
V
N
 
S
K
 
L
I
 
M
A
 
K
R
 
D
L
 
I
I
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
H
Q
 
E
D
 
K
E
 
E
V
 
I
I
 
A
V
 
L
A
 
M
D
 
N
S
 
A
T
 
L
S
 
T
V
 
V
N
 
N
L
 
L
F
 
H
K
 
L
V
 
L
L
 
L
V
 
L
A
 
S
A
 
F
T
 
F
R
 
K
M
 
P
R
 
T
P
 
P
G
 
K
R
 
R
N
 
H
V
 
K
I
 
I
L
 
L
A
 
L
E
 
E
R
 
A
T
 
K
N
 
A
F
 
F
P
 
P
T
 
S
D
 
D
V
 
H
Y
 
Y
I
 
A
A
 
I
S
 
E
S
 
S
V
 
Q
A
 
I
E
 
Q
M
 
L
T
 
H
G
 
G
C
 
L
D
 
D
-
 
V
-
 
E
-
 
K
-
 
S
-
 
M
-
 
R
-
 
M
-
 
I
-
 
K
-
 
P
-
 
R
-
 
E
-
 
G
-
 
E
-
 
E
-
 
T
L
 
L
R
 
R
C
 
M
V
 
E
D
 
D
P
 
I
D
 
L
E
 
E
I
 
V
V
 
I
S
 
E
A
 
K
I
 
E
D
 
G
D
 
D
T
 
S
V
 
I
A
 
A
I
 
V
V
 
V
S
 
L
L
 
F
T
 
S
H
 
G
V
 
L
N
 
H
Y
 
F
K
 
Y
T
 
T
G
 
G
K
 
Q
R
 
L
Y
 
F
D
 
N
M
 
I
E
 
P
A
 
A
V
 
I
T
 
T
R
 
Q
Q
 
A
A
 
G
Q
 
H
E
 
A
A
 
K
G
 
G
A
 
C
L
 
F
I
 
V
V
 
G
W
 
F
D
 
D
L
 
L
C
 
A
H
 
H
S
 
A
A
 
V
G
 
G
A
 
N
M
 
V
P
 
E
V
 
L
N
 
H
L
 
L
N
 
H
R
 
D
C
 
W
D
 
D
A
 
V
D
 
D
F
 
F
A
 
A
V
 
C
G
 
W
C
 
C
G
 
S
Y
 
Y
K
 
K
Y
 
Y
L
 
L
N
 
N
G
 
S
G
 
G
P
 
A
G
 
G
A
 
G
P
 
L
A
 
A
F
 
G
V
 
A
F
 
F
V
 
I
A
 
H
S
 
E
R
 
K
H
 
H
I
 
A
E
 
H
A
 
T
V
 
I
R
 
K
Q
 
P
P
 
A
L
 
L
T
 
V
G
 
G
W
 
W
H
 
F
G
 
G
H
 
H
S
 
E
R
 
L
P
 
S
F
 
T
E
 
R
F
 
F
A
 
N
H
 
M
D
 
D
Y
 
N
A
 
K
P
 
L
H
 
Q
-
 
L
-
 
I
P
 
P
G
 
G
I
 
V
D
 
N
R
 
G
M
 
F
L
 
R
T
 
I
G
 
S
T
 
N
A
 
P
P
 
P
Q
 
I
L
 
L
G
 
L
V
 
V
I
 
C
A
 
S
L
 
L
E
 
H
S
 
A
A
 
S
L
 
L
E
 
E
A
 
I
F
 
F
D
 
Q
G
 
Q
V
 
A
D
 
T
L
 
M
D
 
T
V
 
A
L
 
L
R
 
R
D
 
R
K
 
K
S
 
S
V
 
I
A
 
L
L
 
L
G
 
T
N
 
G
L
 
Y
F
 
L
I
 
E
E
 
Y
L
 
L
-
 
L
-
 
K
-
 
H
-
 
Y
-
 
H
-
 
G
-
 
G
T
 
N
D
 
D
Q
 
T
E
 
E
L
 
N
T
 
K
G
 
R
L
 
P
G
 
V
C
 
V
T
 
N
L
 
I
A
 
I
S
 
T
P
 
P
R
 
S
D
 
R
A
 
A
E
 
E
M
 
E
R
 
R
G
 
G
S
 
C
Q
 
Q
V
 
L
S
 
T
L
 
L
G
 
T
H
 
F
A
 
S
-
 
I
Q
 
S
G
 
K
Y
 
K
A
 
G
I
 
V
M
 
F
Q
 
K
A
 
E
L
 
L
I
 
E
A
 
K
R
 
R
N
 
G
V
 
V
I
 
V
G
 
C
D
 
D
F
 
K
R
 
R
A
 
E
P
 
P
D
 
E
I
 
G
L
 
I
R
 
R
F
 
V
G
 
A
F
 
P
A
 
V
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
V
 
N
R
 
S
Y
 
F
V
 
H
D
 
D
I
 
V
W
 
Y
D
 
K
T
 
F
I
 
I
A
 
R
Q
 
L
L
 
L
K
 
T
D
 
A
I
 
I
I
 
L
A
 
D
T
 
S
D
 
T
A
 
E
W
 
R
N
 
N

Sites not aligning to the query:

3e9kA Crystal structure of homo sapiens kynureninase-3-hydroxyhippuric acid inhibitor complex (see paper)
27% identity, 94% coverage: 10:392/409 of query aligns to 28:444/446 of 3e9kA

query
sites
3e9kA
L
 
L
D
 
D
A
 
E
A
 
E
D
 
D
T
 
K
L
 
L
A
 
R
H
 
H
C
 
F
R
 
R
A
 
E
R
 
C
F
 
F
D
 
Y
L
 
I
P
 
P
A
 
K
-
 
I
-
 
Q
-
 
D
-
 
L
-
 
P
-
 
P
-
 
V
-
 
D
-
 
L
-
 
S
-
 
L
-
 
V
-
 
N
-
 
K
-
 
D
-
 
E
D
 
N
T
 
A
I
 
I
Y
 
Y
L
 
F
D
 
L
G
 
G
N
 
N
S
|
S
L
 
L
G
 
G
A
 
L
M
 
Q
P
 
P
A
 
K
N
 
M
V
 
V
P
 
K
A
 
T
R
 
Y
I
 
L
E
 
E
Q
 
E
A
 
E
L
 
L
K
 
D
H
 
-
E
 
K
W
 
W
A
 
A
H
 
-
G
 
K
L
 
I
I
 
A
R
 
A
S
 
Y
W
 
G
N
 
H
D
 
E
A
 
V
G
 
G
-
 
K
-
 
R
-
 
P
W
 
W
Y
 
I
P
 
T
A
 
G
P
 
D
Q
 
E
R
 
S
T
 
I
G
 
V
N
 
G
K
 
L
I
 
M
A
 
K
R
 
D
L
 
I
I
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
N
Q
 
E
D
 
K
E
 
E
V
 
I
I
 
A
V
 
L
A
 
M
D
 
N
S
 
A
T
x
L
S
x
T
V
 
V
N
 
N
L
 
L
F
 
H
K
 
L
V
 
L
L
 
M
V
 
L
A
 
S
A
 
F
T
 
F
R
 
K
M
 
P
R
 
T
P
 
P
G
 
K
R
 
R
N
 
Y
V
 
K
I
 
I
L
 
L
A
 
L
E
 
E
R
 
A
T
 
K
N
 
A
F
|
F
P
 
P
T
 
S
D
|
D
V
 
H
Y
 
Y
I
 
A
A
 
I
S
 
E
S
 
S
V
 
Q
A
 
L
E
 
Q
M
 
L
T
 
H
G
 
G
C
 
L
D
 
N
-
 
I
-
 
E
-
 
E
-
 
S
-
 
M
-
 
R
-
 
M
-
 
I
-
 
K
-
 
P
-
 
R
-
 
E
-
 
G
-
 
E
-
 
E
-
 
T
L
 
L
R
 
R
C
 
I
V
 
E
D
 
D
P
 
I
D
 
L
E
 
E
I
 
V
V
 
I
S
 
E
A
 
K
I
 
E
D
 
G
D
 
D
T
 
S
V
 
I
A
 
A
I
 
V
V
 
I
S
 
L
L
 
F
T
 
S
H
 
G
V
 
V
N
 
H
Y
 
F
K
 
Y
T
 
T
G
 
G
K
 
Q
R
 
H
Y
 
F
D
 
N
M
 
I
E
 
P
A
 
A
V
 
I
T
 
T
R
 
K
Q
 
A
A
 
G
Q
 
Q
E
 
A
A
 
K
G
 
G
A
 
C
L
 
Y
I
 
V
V
 
G
W
 
F
D
|
D
L
 
L
C
x
A
H
|
H
S
 
A
A
 
V
G
 
G
A
 
N
M
 
V
P
 
E
V
 
L
N
 
Y
L
 
L
N
 
H
R
 
D
C
 
W
D
 
G
A
 
V
D
 
D
F
 
F
A
 
A
V
 
C
G
 
W
C
 
C
G
 
S
Y
|
Y
K
|
K
Y
 
Y
L
 
L
N
 
N
G
 
A
G
 
G
P
 
A
G
 
G
A
 
G
P
 
I
A
 
A
F
 
G
V
 
A
F
 
F
V
 
I
A
 
H
S
 
E
R
 
K
H
 
H
I
 
A
E
 
H
A
 
T
V
 
I
R
 
K
Q
 
P
P
 
A
L
 
L
T
 
V
G
 
G
W
 
W
H
 
F
G
 
G
H
 
H
S
 
E
R
 
L
P
 
S
F
 
T
E
 
R
F
 
F
A
 
K
H
 
M
D
 
D
Y
 
N
A
 
K
P
 
L
H
 
Q
-
 
L
-
 
I
P
 
P
G
 
G
I
 
V
D
 
C
R
 
G
M
 
F
L
 
R
T
 
I
G
 
S
T
 
N
A
 
P
P
 
P
Q
 
I
L
 
L
G
 
L
V
 
V
I
 
C
A
 
S
L
 
L
E
 
H
S
 
A
A
 
S
L
 
L
E
 
E
A
 
I
F
 
F
D
 
K
G
 
Q
V
 
A
D
 
T
L
 
M
D
 
K
V
 
A
L
 
L
R
 
R
D
 
K
K
 
K
S
 
S
V
 
V
A
 
L
L
 
L
G
 
T
N
 
G
L
 
-
F
 
Y
I
 
L
E
 
E
L
 
Y
T
 
L
D
 
I
Q
 
K
E
 
H
L
 
N
T
 
Y
G
 
G
L
 
V
G
 
-
C
 
V
T
 
N
L
 
I
A
 
I
S
 
T
P
 
P
R
 
S
D
 
H
A
 
V
E
 
E
M
 
E
R
 
R
G
 
G
S
 
C
Q
 
Q
V
 
L
S
 
T
L
 
I
G
 
T
H
 
F
A
 
S
-
 
V
Q
 
P
G
 
N
Y
 
K
A
 
D
I
 
V
M
 
F
Q
 
Q
A
 
E
L
 
L
I
 
E
A
 
K
R
 
R
N
 
G
V
 
V
I
 
V
G
 
C
D
 
D
F
 
K
R
 
R
A
 
N
P
 
P
D
 
N
I
 
G
L
 
I
R
|
R
F
 
V
G
 
A
F
 
P
A
 
V
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
V
 
N
R
 
S
Y
 
F
V
 
H
D
 
D
I
 
V
W
 
Y
D
 
K
T
 
F
I
 
T
A
 
N
Q
 
L
L
 
L
K
 
T
D
 
S
I
 
I
I
 
L

Q16719 Kynureninase; L-kynurenine hydrolase; EC 3.7.1.3 from Homo sapiens (Human) (see 4 papers)
27% identity, 94% coverage: 10:392/409 of query aligns to 33:458/465 of Q16719

query
sites
Q16719
L
 
L
D
 
D
A
 
E
A
 
E
D
 
D
T
 
K
L
 
L
A
 
R
H
 
H
C
 
F
R
 
R
A
 
E
R
 
C
F
 
F
D
 
Y
L
 
I
P
 
P
A
 
K
-
 
I
-
 
Q
-
 
D
-
 
L
-
 
P
-
 
P
-
 
V
-
 
D
-
 
L
-
 
S
-
 
L
-
 
V
-
 
N
-
 
K
-
 
D
-
 
E
D
 
N
T
 
A
I
 
I
Y
 
Y
L
 
F
D
 
L
G
 
G
N
 
N
S
 
S
L
 
L
G
 
G
A
 
L
M
 
Q
P
 
P
A
 
K
N
 
M
V
 
V
P
 
K
A
 
T
R
 
Y
I
 
L
E
 
E
Q
 
E
A
 
E
L
 
L
K
 
D
H
 
-
E
 
K
W
 
W
A
 
A
H
 
-
G
 
K
L
 
I
I
 
A
R
 
A
S
 
Y
W
 
G
N
 
H
D
 
E
A
 
V
G
 
G
-
 
K
-
 
R
-
 
P
W
 
W
Y
 
I
P
 
T
A
 
G
P
 
D
Q
 
E
R
 
S
T
 
I
G
 
V
N
 
G
K
 
L
I
 
M
A
 
K
R
 
D
L
 
I
I
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
N
Q
 
E
D
 
K
E
 
E
V
 
I
I
 
A
V
 
L
A
 
M
D
 
N
S
 
A
T
 
L
S
x
T
V
 
V
N
 
N
L
 
L
F
 
H
K
 
L
V
 
L
L
 
M
V
 
L
A
 
S
A
 
F
T
 
F
R
 
K
M
 
P
R
 
T
P
 
P
G
 
K
R
 
R
N
x
Y
V
x
K
I
|
I
L
|
L
A
x
L
E
|
E
R
x
A
T
x
K
N
x
A
F
|
F
P
|
P
T
x
S
D
|
D
V
x
H
Y
|
Y
I
x
A
A
x
I
S
x
E
S
|
S
V
x
Q
A
x
L
E
x
Q
M
x
L
T
x
H
G
|
G
C
x
L
D
x
N
-
x
I
-
x
E
-
x
E
-
x
S
-
x
M
-
x
R
-
x
M
-
x
I
-
x
K
-
x
P
-
x
R
-
x
E
-
x
G
-
x
E
-
x
E
-
x
T
L
|
L
R
|
R
C
x
I
V
x
E
D
|
D
P
x
I
D
x
L
E
|
E
I
x
V
V
x
I
S
x
E
A
x
K
I
x
E
D
x
G
D
|
D
T
x
S
V
x
I
A
|
A
I
x
V
V
x
I
S
x
L
L
x
F
T
x
S
H
x
G
V
|
V
N
x
H
Y
x
F
K
x
Y
T
|
T
G
|
G
K
x
Q
R
x
H
Y
x
F
D
x
N
M
x
I
E
x
P
A
|
A
V
x
I
T
|
T
R
x
K
Q
x
A
A
x
G
Q
|
Q
E
x
A
A
x
K
G
|
G
A
x
C
L
x
Y
I
x
V
V
x
G
W
x
F
D
|
D
L
|
L
C
x
A
H
|
H
S
x
A
A
x
V
G
|
G
A
x
N
M
x
V
P
x
E
V
x
L
N
x
Y
L
|
L
N
x
H
R
x
D
C
x
W
D
x
G
A
x
V
D
|
D
F
|
F
A
|
A
V
x
C
G
x
W
C
|
C
G
x
S
Y
|
Y
K
|
K
Y
|
Y
L
|
L
N
|
N
G
x
A
G
|
G
P
x
A
G
|
G
A
x
G
P
x
I
A
|
A
F
x
G
V
x
A
F
|
F
V
x
I
A
x
H
S
x
E
R
x
K
H
|
H
I
x
A
E
x
H
A
x
T
V
x
I
R
x
K
Q
x
P
P
x
A
L
|
L
T
x
V
G
|
G
W
|
W
H
x
F
G
|
G
H
|
H
S
x
E
R
x
L
P
x
S
F
x
T
E
x
R
F
|
F
A
x
K
H
x
M
D
|
D
Y
x
N
A
x
K
P
x
L
H
x
Q
-
x
L
-
x
I
P
|
P
G
|
G
I
x
V
D
x
C
R
x
G
M
x
F
L
x
R
T
x
I
G
x
S
T
x
N
A
x
P
P
|
P
Q
x
I
L
|
L
G
x
L
V
|
V
I
x
C
A
x
S
L
|
L
E
x
H
S
x
A
A
x
S
L
|
L
E
|
E
A
x
I
F
|
F
D
x
K
G
x
Q
V
x
A
D
x
T
L
x
M
D
x
K
V
x
A
L
|
L
R
|
R
D
x
K
K
|
K
S
|
S
V
|
V
A
x
L
L
|
L
G
x
T
N
x
G
L
 
-
F
x
Y
I
x
L
E
|
E
L
x
Y
T
x
L
D
x
I
Q
x
K
E
x
H
L
x
N
T
x
Y
G
|
G
L
x
K
G
x
D
-
x
K
-
x
A
-
x
A
-
x
T
-
x
K
-
x
K
-
x
P
-
x
V
C
x
V
T
x
N
L
x
I
A
x
I
S
x
T
P
|
P
R
x
S
D
x
H
A
x
V
E
|
E
M
x
E
R
|
R
G
|
G
S
x
C
Q
|
Q
V
x
L
S
x
T
L
x
I
G
x
T
H
x
F
A
x
S
-
x
V
Q
x
P
G
x
N
Y
x
K
A
x
D
I
x
V
M
x
F
Q
|
Q
A
x
E
L
|
L
I
x
E
A
x
K
R
|
R
N
x
G
V
|
V
I
x
V
G
x
C
D
|
D
F
x
K
R
|
R
A
x
N
P
|
P
D
x
N
I
x
G
L
x
I
R
|
R
F
x
V
G
x
A
F
x
P
A
x
V
P
|
P
L
|
L
Y
|
Y
V
x
N
R
x
S
Y
x
F
V
x
H
D
|
D
I
x
V
W
x
Y
D
x
K
T
x
F
I
x
T
A
x
N
Q
x
L
L
|
L
K
x
T
D
x
S
I
|
I
I
x
L

Sites not aligning to the query:

7tlmA Structure of atopobium parvulum sufs (see paper)
24% identity, 57% coverage: 80:312/409 of query aligns to 75:318/415 of 7tlmA

query
sites
7tlmA
I
 
I
A
 
A
R
 
K
L
 
F
I
 
I
G
 
G
A
 
A
-
 
V
-
 
D
-
 
N
-
 
D
-
 
K
-
 
P
G
 
E
Q
 
S
D
 
Q
E
 
Q
V
 
I
I
 
I
V
 
F
A
 
T
D
 
R
S
x
N
T
 
T
S
|
S
-
 
E
-
 
A
V
 
L
N
 
N
L
 
L
F
 
V
K
 
A
V
 
S
L
 
S
V
 
L
A
 
G
A
 
R
T
 
Y
R
 
A
M
 
L
R
 
K
P
 
P
G
 
G
R
 
D
N
 
D
V
 
V
I
 
V
L
 
I
A
 
S
E
 
I
R
 
M
T
 
E
N
x
H
F
 
H
P
 
-
T
 
S
D
 
N
V
 
I
Y
 
I
I
 
P
A
 
W
S
 
Q
S
 
Q
V
 
I
A
 
C
E
 
K
M
 
A
T
 
T
G
 
G
C
 
A
D
 
N
L
 
L
-
 
V
-
 
Y
-
 
L
-
 
R
-
 
M
-
 
N
-
 
S
-
 
Q
R
 
Y
C
 
Q
V
 
I
D
 
T
P
 
P
D
 
E
E
 
E
I
 
I
V
 
A
S
 
S
A
 
K
I
 
I
D
 
T
D
 
E
T
 
R
V
 
A
A
 
K
I
 
I
V
 
V
S
 
S
L
 
V
T
 
T
H
 
H
V
 
V
N
 
S
Y
 
N
K
 
V
T
 
L
G
 
G
K
 
T
R
 
R
Y
 
N
D
 
D
M
 
I
E
 
K
A
 
A
V
 
I
T
 
A
R
 
K
Q
 
R
A
 
T
Q
 
H
E
 
A
A
 
M
G
 
G
A
 
A
L
 
Y
I
 
M
V
 
V
W
 
V
D
|
D
L
 
A
C
x
A
H
 
Q
S
 
S
A
 
A
G
 
P
A
 
H
M
 
I
P
 
L
V
 
V
N
 
N
L
 
V
N
 
H
R
 
D
C
 
L
D
 
D
A
 
C
D
 
D
F
 
L
A
 
L
V
 
A
G
 
F
C
x
S
G
 
A
Y
x
H
K
|
K
Y
 
M
L
 
C
N
 
-
G
 
-
G
 
G
P
 
P
G
 
M
A
 
G
P
 
I
A
 
G
F
 
V
V
 
L
F
 
W
V
 
G
A
 
R
S
 
A
R
 
E
H
 
L
I
 
L
E
 
N
A
 
A
V
 
M
R
 
P
Q
 
P
P
 
F
L
 
L
T
 
T
G
 
G
W
 
G
H
 
E
G
 
M
H
 
I
S
 
D
R
 
S
P
 
V
F
 
T
E
 
E
F
 
T
A
 
G
H
 
A
D
 
V
Y
 
W
A
 
A
P
 
P
H
 
V
P
 
P
G
 
-
I
 
-
D
 
E
R
 
K
M
 
F
L
 
E
T
 
A
G
 
G
T
 
T
A
 
Q
P
 
D
Q
 
A
L
 
A
G
 
G
V
 
I
I
 
Y
A
 
A
L
 
T
E
 
G
S
 
A
A
 
A
L
 
I
E
 
K
A
 
Y
F
 
L
D
 
N
G
 
G
V
 
L
D
 
D
L
 
M
D
 
A
V
 
K
L
 
I
R
 
E
D
 
K
K
 
R
S
 
E
V
 
E
A
 
L
L
 
L
G
 
A
N
 
R
L
 
Y
F
 
L
I
 
V
E
 
Q

8odqD Sufs-sufu complex from mycobacterium tuberculosis (see paper)
25% identity, 83% coverage: 54:393/409 of query aligns to 54:398/410 of 8odqD

query
sites
8odqD
H
 
H
E
 
R
W
 
G
A
 
A
H
 
H
G
 
Q
L
 
L
I
 
M
R
 
E
S
 
E
W
 
A
N
 
T
D
 
D
A
 
A
G
 
-
W
 
-
Y
 
-
P
 
-
A
 
-
P
 
Y
Q
 
E
R
 
Q
T
 
G
G
 
R
N
 
A
K
 
D
I
 
I
A
 
A
R
 
L
L
 
F
I
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
D
Q
 
T
D
 
D
E
 
E
V
 
L
I
 
V
V
 
F
A
 
T
D
 
K
S
x
N
T
x
A
S
x
T
-
 
E
-
 
A
V
 
L
N
 
N
L
 
L
F
 
V
K
 
S
V
 
Y
L
 
V
V
 
L
A
 
G
A
 
D
T
 
S
R
 
R
M
 
F
R
 
E
-
 
R
-
 
A
-
 
V
-
 
G
P
 
P
G
 
G
R
 
-
N
 
D
V
 
V
I
 
I
L
 
V
A
 
T
E
 
T
R
 
E
T
 
L
N
 
E
F
x
H
P
 
H
T
 
A
D
 
N
V
 
L
Y
 
I
I
 
P
A
 
W
S
 
Q
S
 
E
V
 
L
A
 
A
E
 
R
M
 
R
T
 
T
G
 
G
C
 
A
D
 
T
L
 
L
R
 
R
C
 
W
-
 
Y
-
 
G
-
 
V
-
 
T
-
 
D
-
 
D
-
 
G
-
 
R
V
 
I
D
 
D
P
 
L
D
 
D
E
 
S
I
 
L
V
 
Y
S
 
-
A
 
-
I
 
L
D
 
D
D
 
D
T
 
R
V
 
V
A
 
K
I
 
V
V
 
V
S
 
A
L
 
F
T
 
T
H
 
H
V
 
H
N
 
S
Y
x
N
K
 
V
T
 
T
G
 
G
K
 
V
R
 
L
Y
 
T
D
 
P
M
 
V
E
 
S
A
 
E
V
 
L
T
 
V
R
 
S
Q
 
R
A
 
A
Q
 
H
E
 
Q
A
 
S
G
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
T
V
 
V
W
 
L
D
|
D
L
 
A
C
|
C
H
x
Q
S
 
S
A
 
V
G
 
P
A
 
H
M
 
Q
P
 
P
V
 
V
N
 
D
L
 
L
N
 
H
R
 
E
C
 
L
D
 
G
A
 
V
D
 
D
F
 
F
A
 
A
V
 
A
G
 
F
C
x
S
G
 
G
Y
x
H
K
|
K
Y
 
M
L
 
L
N
 
-
G
 
-
G
 
G
P
 
P
G
 
N
A
 
G
P
 
I
A
 
G
F
 
V
V
 
L
F
 
Y
V
 
-
A
 
G
S
 
R
R
 
R
H
 
E
I
 
L
E
 
L
A
 
A
V
 
Q
R
 
M
Q
 
P
P
 
P
-
 
F
L
 
L
T
 
T
G
 
G
W
 
G
H
 
S
G
 
M
H
 
I
S
 
E
R
 
T
P
 
V
F
 
T
E
 
M
F
 
E
A
 
G
H
 
A
D
 
T
Y
 
Y
A
 
A
P
 
P
H
 
A
P
 
P
G
 
-
I
 
-
D
 
Q
R
 
R
M
 
F
L
 
E
T
 
A
G
 
G
T
 
T
A
 
P
P
 
M
Q
 
T
L
 
S
G
 
Q
V
 
V
I
 
V
A
 
G
L
 
L
E
 
A
S
 
A
A
 
A
L
 
A
E
 
R
A
 
Y
F
 
L
D
 
G
G
 
A
V
 
I
D
 
G
L
 
M
D
 
A
V
 
A
L
 
V
R
 
E
D
 
A
K
 
H
S
 
E
V
 
R
A
 
E
L
 
L
G
 
V
N
 
A
L
 
A
F
 
A
I
 
I
E
 
E
L
 
-
T
 
-
D
 
-
Q
 
-
E
 
G
L
 
L
T
 
S
G
 
G
L
 
I
-
 
D
G
 
G
C
 
V
T
 
R
L
 
I
A
 
L
S
 
G
P
 
P
R
 
T
D
 
S
A
 
M
E
 
R
M
 
D
R
 
R
G
 
G
S
 
S
Q
 
P
V
 
V
S
 
A
L
 
F
-
 
V
-
 
V
-
 
E
-
 
G
-
 
V
-
 
H
G
 
A
H
 
H
A
 
D
Q
 
V
G
 
G
Y
 
Q
A
 
V
I
 
L
M
 
D
Q
 
D
A
 
G
L
 
G
I
 
V
A
 
A
R
 
V
N
 
R
V
 
V
I
 
G
G
 
H
D
 
H
F
 
C
R
 
A
A
 
L
P
 
P
D
 
L
I
 
H
L
 
R
R
 
R
F
 
F
G
 
G
F
 
L
A
 
A
P
 
A
L
 
T
Y
 
A
V
 
R
R
 
A
Y
 
S
V
 
F
D
 
A
I
 
V
W
 
Y
D
 
N
T
 
T
I
 
A
A
 
D
Q
 
E
L
 
V
K
 
D
D
 
R
I
 
L
I
 
V
A
 
A

7tlpA Structure of atopobium parvulum sufs k235r (see paper)
23% identity, 57% coverage: 80:312/409 of query aligns to 67:298/391 of 7tlpA

query
sites
7tlpA
I
 
I
A
 
A
R
 
K
L
 
F
I
 
I
G
 
G
A
 
A
-
 
V
-
 
D
-
 
A
-
 
K
-
 
P
G
 
E
Q
 
S
D
 
Q
E
 
Q
V
 
I
I
 
I
V
 
F
A
 
T
D
 
R
S
x
N
T
|
T
S
|
S
-
 
E
-
 
A
V
 
L
N
 
N
L
 
L
F
 
V
K
 
A
V
 
S
L
 
S
V
 
L
A
 
G
A
 
R
T
 
Y
R
 
A
M
 
L
R
 
K
P
 
P
G
 
G
R
 
D
N
 
D
V
 
V
I
 
V
L
 
I
A
 
S
E
 
I
R
 
M
T
 
E
N
x
H
F
 
H
P
 
-
T
 
S
D
 
N
V
 
I
Y
 
I
I
 
P
A
 
W
S
 
Q
S
 
Q
V
 
I
A
 
C
E
 
K
M
 
A
T
 
T
G
 
G
C
 
A
D
 
N
L
 
L
-
 
V
-
 
Y
-
 
L
-
 
R
-
 
M
-
 
N
-
 
S
-
 
Q
R
 
Y
C
 
Q
V
 
I
D
 
T
P
 
P
D
 
E
E
 
E
I
 
I
V
 
A
S
 
S
A
 
K
I
 
I
D
 
T
D
 
E
T
 
R
V
 
A
A
 
K
I
 
I
V
 
V
S
 
S
L
 
V
T
 
T
H
 
H
V
 
V
N
 
S
Y
x
N
K
 
V
T
 
L
G
 
G
K
 
T
R
 
R
Y
 
N
D
 
D
M
 
I
E
 
K
A
 
A
V
 
I
T
 
A
R
 
K
Q
 
R
A
 
T
Q
 
H
E
 
A
A
 
M
G
 
G
A
 
A
L
 
Y
I
 
M
V
 
V
W
 
V
D
|
D
L
 
A
C
 
A
H
 
Q
S
 
S
A
 
A
G
 
P
A
 
H
M
 
I
P
 
L
V
 
V
N
 
N
L
 
V
N
 
H
R
 
D
C
 
L
D
 
D
A
 
C
D
 
D
F
 
L
A
 
L
V
 
A
G
 
F
C
x
S
G
 
A
Y
 
H
K
x
R
Y
 
M
L
 
C
N
 
-
G
 
-
G
 
G
P
 
P
G
 
M
A
 
G
P
 
I
A
 
G
F
 
V
V
 
L
F
 
W
V
 
G
A
 
R
S
 
A
R
 
E
H
 
L
I
 
L
E
 
N
A
 
A
V
 
M
R
 
P
Q
 
P
P
 
F
L
 
L
T
 
T
G
 
G
W
 
G
H
 
-
G
 
-
H
 
-
S
 
-
R
 
-
P
 
-
F
 
-
E
 
-
F
 
-
A
 
-
H
 
-
D
 
E
Y
 
M
A
 
A
P
 
P
H
 
V
P
 
P
G
 
-
I
 
-
D
 
E
R
 
K
M
 
F
L
 
E
T
 
A
G
 
G
T
 
T
A
 
Q
P
 
D
Q
 
A
L
 
A
G
 
G
V
 
I
I
 
Y
A
 
A
L
 
T
E
 
G
S
 
A
A
 
A
L
 
I
E
 
K
A
 
Y
F
 
L
D
 
N
G
 
G
V
 
L
D
 
D
L
 
M
D
 
A
V
 
K
L
 
I
R
 
E
D
 
K
K
 
R
S
 
E
V
 
E
A
 
L
L
 
L
G
 
A
N
 
R
L
 
Y
F
 
L
I
 
V
E
 
Q

Sites not aligning to the query:

7tlpB Structure of atopobium parvulum sufs k235r (see paper)
23% identity, 57% coverage: 80:312/409 of query aligns to 69:300/393 of 7tlpB

query
sites
7tlpB
I
 
I
A
 
A
R
 
K
L
 
F
I
 
I
G
 
G
A
 
A
-
 
V
-
 
D
-
 
A
-
 
K
-
 
P
G
 
E
Q
 
S
D
 
Q
E
 
Q
V
 
I
I
 
I
V
 
F
A
 
T
D
 
R
S
x
N
T
|
T
S
|
S
-
 
E
-
 
A
V
 
L
N
 
N
L
 
L
F
 
V
K
 
A
V
 
S
L
 
S
V
 
L
A
 
G
A
 
R
T
 
Y
R
 
A
M
 
L
R
 
K
P
 
P
G
 
G
R
 
D
N
 
D
V
 
V
I
 
V
L
 
I
A
 
S
E
 
I
R
 
M
T
 
E
N
x
H
F
 
H
P
 
-
T
 
S
D
 
N
V
 
I
Y
 
I
I
 
P
A
 
W
S
 
Q
S
 
Q
V
 
I
A
 
C
E
 
K
M
 
A
T
 
T
G
 
G
C
 
A
D
 
N
L
 
L
-
 
V
-
 
Y
-
 
L
-
 
R
-
 
M
-
 
N
-
 
S
-
 
Q
R
 
Y
C
 
Q
V
 
I
D
 
T
P
 
P
D
 
E
E
 
E
I
 
I
V
 
A
S
 
S
A
 
K
I
 
I
D
 
T
D
 
E
T
 
R
V
 
A
A
 
K
I
 
I
V
 
V
S
 
S
L
 
V
T
 
T
H
 
H
V
 
V
N
 
S
Y
x
N
K
 
V
T
 
L
G
 
G
K
 
T
R
 
R
Y
 
N
D
 
D
M
 
I
E
 
K
A
 
A
V
 
I
T
 
A
R
 
K
Q
 
R
A
 
T
Q
 
H
E
 
A
A
 
M
G
 
G
A
 
A
L
 
Y
I
 
M
V
 
V
W
 
V
D
|
D
L
 
A
C
 
A
H
x
Q
S
 
S
A
 
A
G
 
P
A
 
H
M
 
I
P
 
L
V
 
V
N
 
N
L
 
V
N
 
H
R
 
D
C
 
L
D
 
D
A
 
C
D
 
D
F
 
L
A
 
L
V
 
A
G
 
F
C
x
S
G
 
A
Y
 
H
K
x
R
Y
 
M
L
 
C
N
 
-
G
 
-
G
 
G
P
 
P
G
 
M
A
 
G
P
 
I
A
 
G
F
 
V
V
 
L
F
 
W
V
 
G
A
 
R
S
 
A
R
 
E
H
 
L
I
 
L
E
 
N
A
 
A
V
 
M
R
 
P
Q
 
P
P
 
F
L
 
L
T
 
T
G
 
G
W
 
G
H
 
-
G
 
-
H
 
-
S
 
-
R
 
-
P
 
-
F
 
-
E
 
-
F
 
-
A
 
-
H
 
-
D
 
E
Y
 
M
A
 
A
P
 
P
H
 
V
P
 
P
G
 
-
I
 
-
D
 
E
R
 
K
M
 
F
L
 
E
T
 
A
G
 
G
T
 
T
A
 
Q
P
 
D
Q
 
A
L
 
A
G
 
G
V
 
I
I
 
Y
A
 
A
L
 
T
E
 
G
S
 
A
A
 
A
L
 
I
E
 
K
A
 
Y
F
 
L
D
 
N
G
 
G
V
 
L
D
 
D
L
 
M
D
 
A
V
 
K
L
 
I
R
 
E
D
 
K
K
 
R
S
 
E
V
 
E
A
 
L
L
 
L
G
 
A
N
 
R
L
 
Y
F
 
L
I
 
V
E
 
Q

Sites not aligning to the query:

Q93WX6 Cysteine desulfurase 1, chloroplastic; NIFS-like protein 1; CpNifS1; Plastid sufS-like protein; Protein AtCpNifS; Selenocysteine lyase; EC 2.8.1.7; EC 4.4.1.16 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see 2 papers)
26% identity, 64% coverage: 78:340/409 of query aligns to 123:390/463 of Q93WX6

query
sites
Q93WX6
N
 
K
K
 
K
I
 
V
A
 
A
R
 
R
L
 
F
I
 
I
G
 
N
A
 
A
G
 
S
Q
 
D
D
 
S
E
 
R
V
 
E
I
 
I
V
 
V
A
 
F
D
 
T
-
 
R
-
 
N
-
 
A
S
 
T
T
 
E
S
 
A
V
 
I
N
 
N
L
 
L
F
 
V
K
 
A
V
 
Y
L
 
S
V
 
W
A
 
G
A
 
L
T
 
S
R
 
N
M
 
L
R
 
K
P
 
P
G
 
G
R
 
D
N
 
E
V
 
V
I
 
I
L
 
L
-
 
T
-
 
V
A
 
A
E
 
E
R
 
H
T
 
H
N
 
S
F
 
C
P
 
I
T
 
V
D
 
P
V
 
W
Y
 
Q
I
 
I
A
 
-
S
 
-
S
 
-
V
 
V
A
 
S
E
 
Q
M
 
K
T
 
T
G
 
G
C
 
A
D
 
V
L
 
L
R
 
K
C
 
F
V
 
V
-
 
T
-
 
L
-
 
N
-
 
E
-
 
D
-
 
E
-
 
V
-
 
P
D
 
D
P
 
I
D
 
N
E
 
K
I
 
L
V
 
R
S
 
E
A
 
L
I
 
I
D
 
S
D
 
P
T
 
K
V
 
T
A
 
K
I
 
L
V
 
V
S
 
A
L
 
V
T
 
H
H
 
H
V
 
V
N
 
S
Y
 
N
K
 
V
T
 
L
G
 
A
K
 
S
R
 
S
Y
 
L
D
 
P
M
 
I
E
 
E
A
 
E
V
 
I
T
 
V
R
 
V
Q
 
W
A
 
A
Q
 
H
E
 
D
A
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
K
I
 
V
V
 
L
W
 
V
D
 
D
L
 
A
C
 
C
H
 
Q
S
 
S
A
 
V
G
 
P
A
 
H
M
 
M
P
 
V
V
 
V
N
 
D
L
 
V
N
 
Q
R
 
K
C
 
L
D
 
N
A
 
A
D
 
D
F
 
F
A
 
L
V
 
V
G
 
A
C
 
S
G
 
S
Y
 
H
K
 
K
Y
 
M
L
 
C
N
 
-
G
 
-
G
 
G
P
 
P
G
 
T
A
 
G
P
 
I
A
 
G
F
 
F
V
 
L
F
 
Y
V
 
G
A
 
K
S
 
S
R
 
D
H
 
L
I
 
L
E
 
H
A
 
S
V
 
M
R
 
P
Q
 
P
P
 
F
L
 
L
T
 
G
G
 
G
W
 
G
H
 
E
G
 
M
H
 
I
S
 
S
R
 
D
P
 
V
F
 
F
E
 
L
F
 
D
A
 
H
H
 
S
D
 
T
Y
 
Y
A
 
A
P
 
E
H
 
P
P
 
P
G
 
S
I
 
-
D
 
-
R
 
R
M
 
F
L
 
E
T
 
A
G
 
G
T
 
T
A
 
-
P
 
P
Q
 
A
L
 
I
G
 
G
-
 
E
V
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
L
E
 
G
S
 
A
A
 
A
L
 
V
E
 
D
A
 
Y
F
 
L
D
 
S
G
 
G
V
 
I
D
 
G
L
 
M
D
 
P
V
 
K
L
 
I
R
 
H
D
 
E
K
 
Y
S
 
E
V
 
V
A
 
E
L
 
I
G
 
G
N
 
K
L
 
Y
F
 
L
I
 
Y
E
 
E
-
 
K
-
 
L
-
 
S
-
 
S
L
 
L
T
 
P
D
 
D
Q
 
V
E
 
R
L
 
I
T
 
Y
G
 
G
L
 
-
G
 
-
C
 
-
T
 
-
L
 
-
A
 
P
S
 
R
P
 
P
R
 
S
D
 
E
A
 
S
E
 
V
M
 
H
R
 
R
G
 
G
S
 
A
Q
 
L
V
x
C
S
 
S
L
 
F

Sites not aligning to the query:

5ft8A Crystal structure of the complex between the cysteine desulfurase csda and the sulfur-acceptor csde in the persulfurated state at 2.50 angstroem resolution
26% identity, 57% coverage: 78:309/409 of query aligns to 70:307/401 of 5ft8A

query
sites
5ft8A
N
 
E
K
 
K
I
 
V
A
 
A
R
 
Q
L
 
L
I
 
L
G
 
N
A
 
A
G
 
P
Q
 
D
D
 
D
E
 
K
V
 
T
I
 
I
V
 
V
-
 
W
-
 
T
-
 
R
A
 
G
D
x
T
S
x
T
T
 
E
S
 
S
V
 
I
N
 
N
L
 
M
F
 
V
K
 
A
V
 
Q
L
 
C
V
 
Y
A
 
A
A
 
R
T
 
P
R
 
R
M
 
L
R
 
Q
P
 
P
G
 
G
R
 
D
N
 
E
V
 
I
I
 
I
L
 
V
A
 
S
E
 
V
R
 
A
T
 
E
N
x
H
F
 
H
P
 
-
T
 
A
D
 
N
V
 
L
Y
 
V
I
 
P
A
 
W
S
 
L
S
 
M
V
 
V
A
 
A
E
 
Q
M
 
Q
T
 
T
G
 
G
C
 
A
D
 
K
L
 
V
-
 
V
-
 
K
-
 
L
-
 
P
-
 
L
-
 
N
-
 
A
-
 
Q
R
 
R
C
 
L
V
 
P
D
 
D
P
 
V
D
 
D
E
 
L
I
 
L
V
 
P
S
 
E
A
 
L
I
 
I
D
 
T
D
 
P
T
 
R
V
 
S
A
 
R
I
 
I
V
 
L
S
 
A
L
 
L
T
 
G
H
 
Q
V
 
M
N
 
S
Y
 
N
K
 
V
T
 
T
G
 
G
K
 
G
R
 
C
Y
 
P
D
 
D
M
 
L
E
 
A
A
 
R
V
 
A
T
 
I
R
 
T
Q
 
F
A
 
A
Q
 
H
E
 
S
A
 
A
G
 
G
A
 
M
L
 
V
I
 
V
V
 
M
W
 
V
D
|
D
L
 
G
C
x
A
H
x
Q
S
 
G
A
 
A
G
 
V
A
 
H
M
 
F
P
 
P
V
 
A
N
 
D
L
 
V
N
 
Q
R
 
Q
C
 
L
D
 
D
A
 
I
D
 
D
F
 
F
A
 
Y
V
 
A
G
 
F
C
x
S
G
 
G
Y
x
H
K
|
K
Y
 
L
L
 
Y
N
 
-
G
 
-
G
 
G
P
 
P
G
 
T
A
 
G
P
 
I
A
 
G
F
 
V
V
 
L
F
 
Y
V
 
G
A
 
K
S
 
S
R
 
E
H
 
L
I
 
L
E
 
E
A
 
A
V
 
M
R
 
S
Q
 
P
P
 
W
L
 
L
T
 
G
G
 
G
W
 
G
H
 
K
G
 
M
-
 
V
H
 
H
S
 
E
R
 
V
P
 
S
F
 
F
E
 
D
-
 
G
F
 
F
A
 
T
H
 
T
D
 
Q
Y
 
S
A
 
A
P
 
P
H
 
W
P
 
-
G
 
-
I
 
-
D
 
-
R
 
K
M
 
L
L
 
E
T
 
A
G
 
G
T
 
T
A
 
P
P
 
N
Q
 
V
L
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
A
 
G
L
 
L
E
 
S
S
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
W
F
 
L
D
 
A
G
 
D
V
 
Y
D
 
D
L
 
I
D
 
N
V
 
Q
L
 
A
R
 
E
D
 
S
K
 
W
S
 
S
V
 
R
A
 
S
L
 
L
G
 
A
N
 
T
L
 
L

Sites not aligning to the query:

Q46925 Cysteine desulfurase CsdA; Cysteine sulfinate desulfinase; CSD; Selenocysteine lyase; EC 2.8.1.7; EC 3.13.1.-; EC 4.4.1.16 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
26% identity, 57% coverage: 78:309/409 of query aligns to 70:307/401 of Q46925

query
sites
Q46925
N
 
E
K
 
K
I
 
V
A
 
A
R
 
Q
L
 
L
I
 
L
G
 
N
A
 
A
G
 
P
Q
 
D
D
 
D
E
 
K
V
 
T
I
 
I
V
 
V
-
 
W
-
 
T
-
 
R
A
 
G
D
 
T
S
 
T
T
 
E
S
 
S
V
 
I
N
 
N
L
 
M
F
 
V
K
 
A
V
 
Q
L
x
C
V
 
Y
A
 
A
A
 
R
T
 
P
R
 
R
M
 
L
R
 
Q
P
 
P
G
 
G
R
 
D
N
 
E
V
 
I
I
 
I
L
 
V
A
 
S
E
 
V
R
 
A
T
 
E
N
 
H
F
 
H
P
 
-
T
 
A
D
 
N
V
 
L
Y
 
V
I
 
P
A
 
W
S
 
L
S
 
M
V
 
V
A
 
A
E
 
Q
M
 
Q
T
 
T
G
 
G
C
 
A
D
 
K
L
 
V
-
 
V
-
 
K
-
 
L
-
 
P
-
 
L
-
 
N
-
 
A
-
 
Q
R
 
R
C
 
L
V
 
P
D
 
D
P
 
V
D
 
D
E
 
L
I
 
L
V
 
P
S
 
E
A
 
L
I
 
I
D
 
T
D
 
P
T
 
R
V
 
S
A
 
R
I
 
I
V
 
L
S
 
A
L
 
L
T
 
G
H
 
Q
V
 
M
N
 
S
Y
 
N
K
 
V
T
 
T
G
 
G
K
 
G
R
x
C
Y
 
P
D
 
D
M
 
L
E
 
A
A
 
R
V
 
A
T
 
I
R
 
T
Q
 
F
A
 
A
Q
 
H
E
 
S
A
 
A
G
 
G
A
 
M
L
 
V
I
 
V
V
 
M
W
 
V
D
 
D
L
 
G
C
 
A
H
 
Q
S
 
G
A
 
A
G
 
V
A
 
H
M
 
F
P
 
P
V
 
A
N
 
D
L
 
V
N
 
Q
R
 
Q
C
 
L
D
 
D
A
 
I
D
 
D
F
 
F
A
 
Y
V
 
A
G
 
F
C
 
S
G
 
G
Y
 
H
K
 
K
Y
 
L
L
 
Y
N
 
-
G
 
-
G
 
G
P
 
P
G
 
T
A
 
G
P
 
I
A
 
G
F
 
V
V
 
L
F
 
Y
V
 
G
A
 
K
S
 
S
R
 
E
H
 
L
I
 
L
E
 
E
A
 
A
V
 
M
R
 
S
Q
 
P
P
 
W
L
 
L
T
 
G
G
 
G
W
 
G
H
 
K
G
 
M
-
 
V
H
 
H
S
 
E
R
 
V
P
 
S
F
 
F
E
 
D
-
 
G
F
 
F
A
 
T
H
 
T
D
 
Q
Y
 
S
A
 
A
P
 
P
H
 
W
P
 
-
G
 
-
I
 
-
D
 
-
R
 
K
M
 
L
L
 
E
T
 
A
G
 
G
T
 
T
A
 
P
P
 
N
Q
 
V
L
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
A
 
G
L
 
L
E
 
S
S
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
W
F
 
L
D
 
A
G
 
D
V
 
Y
D
 
D
L
 
I
D
 
N
V
 
Q
L
 
A
R
 
E
D
 
S
K
 
W
S
 
S
V
 
R
A
 
S
L
 
L
G
 
A
N
 
T
L
 
L

Sites not aligning to the query:

5b87A Crystal structure of a cysteine desulfurase from thermococcus onnurineus na1 in complex with alanine at 2.3 angstrom resolution (see paper)
24% identity, 56% coverage: 19:248/409 of query aligns to 6:242/397 of 5b87A

query
sites
5b87A
C
 
V
R
 
R
A
 
K
R
 
D
F
 
I
D
 
P
L
 
L
P
 
T
A
 
N
D
 
E
T
 
V
I
 
I
Y
 
Y
L
 
F
D
 
D
G
 
N
N
 
T
S
x
A
L
 
T
G
 
S
A
 
L
M
 
T
P
 
P
A
 
K
N
 
P
V
 
V
-
 
V
P
 
E
A
 
A
R
 
M
I
 
D
E
 
E
Q
 
Y
A
 
Y
L
 
L
K
 
K
-
 
Y
-
 
R
-
 
A
-
 
N
-
 
V
H
 
H
E
 
R
W
 
G
A
 
V
H
 
H
G
 
R
L
 
L
I
 
-
R
 
-
S
 
S
W
 
Q
N
 
M
D
 
A
A
 
T
G
 
H
W
 
K
Y
 
Y
P
 
E
A
 
E
P
 
S
Q
 
R
R
 
K
T
 
I
G
 
-
N
 
-
K
 
-
I
 
V
A
 
A
R
 
D
L
 
F
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
K
Q
 
F
D
 
E
E
 
E
V
 
I
I
 
V
V
 
F
A
 
T
D
 
K
S
x
N
T
|
T
S
|
S
V
 
E
N
 
S
L
 
L
F
 
N
K
 
L
V
 
V
L
 
A
V
 
L
A
 
G
A
 
L
T
 
G
R
 
H
M
 
I
R
 
F
P
 
K
G
 
R
R
 
G
N
 
D
V
 
K
I
 
I
L
 
V
A
 
T
E
 
T
R
 
P
T
 
Y
N
 
E
F
x
H
P
 
H
T
 
S
D
 
D
V
 
L
Y
 
L
I
 
P
A
 
W
S
 
Q
S
 
R
V
 
L
A
 
A
E
 
T
M
 
K
T
 
L
G
 
G
C
 
L
D
 
K
L
 
L
R
 
E
C
 
F
V
 
I
D
 
E
P
 
G
D
 
D
E
 
D
I
 
E
-
 
G
-
 
N
-
 
L
-
 
D
V
 
L
S
 
S
A
 
D
I
 
A
D
 
E
D
 
K
T
 
K
V
 
I
A
 
K
-
 
G
-
 
A
-
 
K
I
 
L
V
 
V
S
 
A
L
 
V
T
 
Q
H
 
H
V
 
V
N
 
S
Y
x
N
K
 
A
T
 
L
G
 
G
K
 
V
R
 
I
Y
 
H
D
 
E
M
 
V
E
 
E
A
 
E
V
 
L
T
 
G
R
 
K
Q
 
I
A
 
A
Q
 
K
E
 
D
A
 
E
G
 
G
A
 
A
L
 
I
I
 
F
V
 
V
W
 
V
D
|
D
L
 
A
C
x
A
H
x
Q
S
 
S
A
 
A
G
 
G
A
 
H
M
 
M
P
 
E
V
 
V
N
 
N
L
 
V
N
 
K
R
 
K
C
 
L
D
 
H
A
 
A
D
 
D
F
 
F
A
 
L
V
 
A
G
 
F
C
x
S
G
 
G
Y
x
H
K
|
K
Y
 
-
L
 
-
N
 
-
G
 
-
G
 
G
P
 
P
G
 
M
A
 
G
P
 
P
-
 
T
-
 
G
-
 
I
A
 
G
F
 
V
V
 
L
F
 
Y
V
 
I
A
 
R
S
 
E
R
 
E
H
 
F
I
 
F
E
 
D
A
 
T
V
 
F
R
 
E
Q
 
P
P
 
P
L
 
L
T
 
I
G
 
G

Sites not aligning to the query:

5b7uA Apo structure of cysteine desulfurase from thermococcus onnurineus na1 at 1.89a (see paper)
24% identity, 56% coverage: 19:248/409 of query aligns to 12:248/402 of 5b7uA

query
sites
5b7uA
C
 
V
R
 
R
A
 
K
R
 
D
F
 
I
D
 
P
L
 
L
P
 
T
A
 
N
D
 
E
T
 
V
I
 
I
Y
 
Y
L
 
F
D
 
D
G
 
N
N
 
T
S
 
A
L
 
T
G
 
S
A
 
L
M
 
T
P
 
P
A
 
K
N
 
P
V
 
V
-
 
V
P
 
E
A
 
A
R
 
M
I
 
D
E
 
E
Q
 
Y
A
x
Y
L
 
L
K
 
K
-
 
Y
-
 
R
-
 
A
-
 
N
-
 
V
H
 
H
E
 
R
W
 
G
A
 
V
H
 
H
G
 
R
L
 
L
I
 
-
R
 
-
S
 
S
W
 
Q
N
 
M
D
 
A
A
 
T
G
 
H
W
 
K
Y
 
Y
P
 
E
A
 
E
P
 
S
Q
 
R
R
 
K
T
 
I
G
 
-
N
 
-
K
 
-
I
 
V
A
 
A
R
 
D
L
 
F
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
K
Q
 
F
D
 
E
E
 
E
V
 
I
I
 
V
V
 
F
A
 
T
D
 
K
S
 
N
T
 
T
S
 
S
V
 
E
N
 
S
L
 
L
F
 
N
K
 
L
V
 
V
L
 
A
V
 
L
A
 
G
A
 
L
T
 
G
R
 
H
M
 
I
R
 
F
P
 
K
G
 
R
R
 
G
N
 
D
V
 
K
I
 
I
L
 
V
A
 
T
E
 
T
R
 
P
T
 
Y
N
 
E
F
x
H
P
 
H
T
 
S
D
 
D
V
 
L
Y
 
L
I
 
P
A
 
W
S
 
Q
S
 
R
V
 
L
A
 
A
E
 
T
M
 
K
T
 
L
G
 
G
C
 
L
D
 
K
L
 
L
R
 
E
C
 
F
V
 
I
D
 
E
P
 
G
D
 
D
E
 
D
I
 
E
-
 
G
-
 
N
-
 
L
-
 
D
V
 
L
S
 
S
A
 
D
I
 
A
D
 
E
D
 
K
T
 
K
V
 
I
A
 
K
-
 
G
-
 
A
-
 
K
I
 
L
V
 
V
S
 
A
L
 
V
T
 
Q
H
 
H
V
 
V
N
 
S
Y
 
N
K
 
A
T
 
L
G
 
G
K
 
V
R
 
I
Y
 
H
D
 
E
M
 
V
E
 
E
A
 
E
V
 
L
T
 
G
R
 
K
Q
 
I
A
 
A
Q
 
K
E
 
D
A
 
E
G
 
G
A
 
A
L
 
I
I
 
F
V
 
V
W
 
V
D
|
D
L
 
A
C
x
A
H
x
Q
S
 
S
A
 
A
G
 
G
A
 
H
M
 
M
P
 
E
V
 
V
N
 
N
L
 
V
N
 
K
R
 
K
C
 
L
D
 
H
A
 
A
D
 
D
F
 
F
A
 
L
V
 
A
G
 
F
C
 
S
G
 
G
Y
 
H
K
|
K
Y
 
-
L
 
-
N
 
-
G
 
-
G
 
G
P
 
P
G
 
M
A
 
G
P
 
P
-
 
T
-
 
G
-
 
I
A
 
G
F
 
V
V
 
L
F
 
Y
V
 
I
A
 
R
S
 
E
R
 
E
H
 
F
I
 
F
E
 
D
A
 
T
V
 
F
R
 
E
Q
 
P
P
 
P
L
 
L
T
 
I
G
 
G

Sites not aligning to the query:

1vjoA Crystal structure of alanine--glyoxylate aminotransferase (alr1004) from nostoc sp. At 1.70 a resolution (see paper)
29% identity, 30% coverage: 130:250/409 of query aligns to 103:237/377 of 1vjoA

query
sites
1vjoA
Y
 
Y
I
x
F
A
 
G
S
 
N
S
 
R
V
 
L
A
 
V
E
 
D
M
 
M
T
 
A
G
 
G
-
 
R
-
 
Y
-
 
G
C
 
A
D
 
D
L
 
V
R
 
R
C
 
T
V
 
I
D
 
S
P
 
K
-
 
P
-
 
W
-
 
G
-
 
E
-
 
V
-
 
F
-
 
S
-
 
L
D
 
E
E
 
E
I
 
L
V
 
R
S
 
T
A
 
A
I
 
L
D
 
E
D
 
T
-
 
H
T
 
R
V
 
P
A
 
A
I
 
I
V
 
L
S
 
A
L
 
L
T
 
V
H
 
H
V
 
A
N
 
E
Y
x
T
K
 
S
T
 
T
G
 
G
K
 
A
R
 
R
Y
 
Q
D
 
P
M
 
L
E
 
E
A
 
G
V
 
V
T
 
G
R
 
E
Q
 
L
A
 
C
Q
 
R
E
 
E
A
 
F
G
 
G
A
 
T
L
 
L
I
 
L
V
 
L
W
 
V
D
|
D
L
 
T
C
x
V
H
 
T
S
 
S
A
 
L
G
 
G
A
 
G
M
 
V
P
 
P
V
 
I
N
 
F
L
 
L
N
 
D
R
 
A
C
 
W
D
 
G
A
 
V
D
 
D
F
 
L
A
 
A
V
 
Y
G
 
S
C
 
C
G
 
S
Y
 
Q
K
|
K
Y
 
G
L
 
L
N
 
G
G
 
C
G
 
S
P
 
P
G
 
G
A
 
A
P
 
S
A
 
P
F
 
F
V
 
T
F
 
-
V
 
M
A
 
S
S
 
S
R
 
R
H
 
A
I
 
I
E
 
E
A
 
K
V
 
L
-
 
Q
-
 
R
-
 
R
R
 
R
Q
 
T
P
 
K
L
 
V
T
 
A
G
 
N
W
 
W
H
 
Y

Sites not aligning to the query:

1t3iA Structure of slr0077/sufs, the essential cysteine desulfurase from synechocystis pcc 6803 (see paper)
23% identity, 72% coverage: 30:322/409 of query aligns to 24:314/406 of 1t3iA

query
sites
1t3iA
I
 
V
Y
 
Y
L
 
L
D
 
D
G
 
N
N
 
A
S
 
A
L
 
T
G
 
S
A
 
Q
M
 
K
P
 
P
A
 
R
N
 
A
V
 
V
P
 
L
A
 
E
R
 
K
I
 
L
E
 
M
Q
 
H
A
 
Y
L
 
Y
K
 
E
H
 
N
E
 
D
-
 
N
-
 
A
-
 
N
-
 
V
W
 
G
A
 
A
H
 
H
G
 
Q
L
 
L
I
 
S
R
 
V
S
 
R
W
 
A
N
 
T
D
 
D
A
 
A
G
 
-
W
 
-
Y
 
Y
P
 
E
A
 
A
P
 
V
Q
 
R
R
 
-
T
 
-
G
 
-
N
 
N
K
 
K
I
 
V
A
 
A
R
 
K
L
 
F
I
 
I
G
 
N
A
 
A
G
 
R
Q
 
S
D
 
P
E
 
R
V
 
E
I
 
I
V
 
V
A
 
Y
D
 
T
-
 
R
-
x
N
-
 
A
S
x
T
T
 
E
S
 
A
V
 
I
N
 
N
L
 
L
F
 
V
K
 
A
V
 
Y
L
 
S
V
 
W
A
 
G
A
 
M
T
 
N
R
 
N
M
 
L
R
 
K
P
 
A
G
 
G
R
 
D
N
 
E
V
 
I
I
 
I
L
 
T
A
 
T
E
 
V
R
 
M
T
 
E
N
x
H
F
 
H
P
 
-
T
 
S
D
 
N
V
 
L
Y
 
V
I
 
P
A
 
W
S
 
Q
S
 
M
V
 
V
A
 
A
E
 
A
M
 
K
T
 
T
G
 
G
C
 
A
D
 
V
L
 
L
R
 
K
C
 
F
V
 
V
D
 
Q
P
x
L
D
|
D
E
|
E
-
 
Q
-
x
E
-
 
S
-
 
F
-
 
D
-
 
L
-
 
E
-
 
H
I
 
F
V
 
K
S
 
T
A
 
L
I
 
L
D
 
S
D
 
E
T
 
K
V
 
T
A
 
K
I
 
L
V
 
V
S
 
T
L
 
V
T
 
V
H
 
H
V
 
I
N
 
S
Y
x
N
K
 
T
T
 
L
G
 
G
K
 
C
R
 
V
Y
 
N
D
 
P
M
 
A
E
 
E
A
 
E
V
 
I
T
 
A
R
 
Q
Q
 
L
A
 
A
Q
 
H
E
 
Q
A
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
K
I
 
V
V
 
L
W
 
V
D
|
D
L
 
A
C
|
C
H
x
Q
S
 
S
A
 
A
G
 
P
A
 
H
M
 
Y
P
 
P
V
 
L
N
 
D
L
 
V
N
 
Q
R
 
L
C
 
I
D
 
D
A
 
C
D
 
D
F
 
W
A
 
L
V
 
V
G
 
A
C
x
S
G
 
G
Y
x
H
K
|
K
Y
 
M
L
 
C
N
 
-
G
 
-
G
 
A
P
 
P
G
 
T
A
 
G
P
 
I
A
 
G
F
 
F
V
 
L
F
 
Y
V
 
G
A
 
K
S
 
E
R
 
E
H
 
I
I
 
L
E
 
E
A
 
A
V
 
M
R
 
-
Q
 
-
P
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
W
 
-
H
 
-
G
 
-
H
 
-
S
 
-
R
 
P
P
 
P
F
 
F
E
 
F
F
 
G
A
 
G
H
 
G
D
 
E
Y
 
M
A
 
I
P
 
A
H
 
E
P
 
V
G
 
F
I
 
F
D
 
D
R
 
H
M
 
F
L
 
T
T
 
T
G
 
G
T
 
E
A
 
L
P
 
P
-
 
H
-
 
K
-
 
F
Q
 
E
L
 
A
G
|
G
V
x
T
I
 
P
A
 
A
L
 
I
E
 
A
S
 
E
A
 
A
L
 
I
E
 
A
A
 
L
F
 
-
D
 
-
G
 
G
V
 
A
D
 
A
L
 
V
D
 
D
V
 
Y
L
 
L
R
 
T
D
 
D
K
 
L
S
 
G
V
 
M
A
 
E
-
 
N
L
 
I
G
 
H
N
 
N
L
 
Y
F
 
E
I
 
V
E
 
E
L
 
L
T
 
T
D
 
H
Q
 
Y
E
 
L
L
 
W
T
 
Q
G
 
G
L
 
L
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Q9EXP2 Cysteine desulfurase; Selenocysteine beta-lyase; SCL; Selenocysteine lyase; Selenocysteine reductase; EC 2.8.1.7; EC 4.4.1.16 from Dickeya dadantii (strain 3937) (Erwinia chrysanthemi (strain 3937)) (see paper)
24% identity, 66% coverage: 31:300/409 of query aligns to 31:308/412 of Q9EXP2

query
sites
Q9EXP2
Y
 
Y
L
 
L
D
 
D
G
 
S
N
 
A
S
 
A
L
 
S
G
 
A
A
 
Q
M
 
K
P
 
P
A
 
L
N
 
A
V
 
V
P
 
I
A
 
D
R
 
R
I
 
E
E
 
R
Q
 
D
A
 
F
L
 
Y
K
 
L
H
 
H
E
 
E
W
 
Y
A
 
A
-
 
A
-
 
V
H
 
H
G
 
R
L
 
G
I
 
I
R
 
H
S
 
T
W
 
L
N
 
S
D
 
-
A
 
A
G
 
R
W
 
A
Y
 
T
P
 
S
A
 
A
P
 
M
Q
 
E
R
 
E
T
 
V
G
 
R
N
 
A
K
 
K
I
 
V
A
 
A
R
 
T
L
 
F
I
 
I
G
 
H
A
 
A
G
 
A
Q
 
S
D
 
A
E
 
E
V
 
D
I
 
I
V
 
V
-
 
F
-
 
V
-
 
R
A
 
G
D
 
T
S
 
T
T
 
E
S
 
A
V
 
I
N
 
N
L
 
L
F
 
V
K
 
A
V
 
N
L
 
S
V
 
Y
A
 
G
A
 
R
T
 
T
R
 
A
M
 
F
R
 
Q
P
 
P
G
 
G
R
 
D
N
 
N
V
 
L
I
 
V
L
 
I
A
 
S
E
 
E
R
 
M
T
 
E
N
 
H
F
 
H
P
 
-
T
 
A
D
 
N
V
 
I
Y
 
V
I
 
P
A
 
W
S
 
Q
S
 
M
V
 
L
A
 
A
E
 
Q
M
 
A
T
 
R
G
 
G
C
 
L
D
 
T
L
 
L
R
 
R
C
 
V
V
 
L
-
 
P
-
 
I
-
 
T
-
 
D
-
 
D
-
 
G
-
 
E
-
 
L
D
 
D
P
 
M
D
 
A
E
 
Q
I
 
L
V
 
P
S
 
A
A
 
L
I
 
L
D
 
D
D
 
E
T
 
R
V
 
T
A
 
R
I
 
L
V
 
V
S
 
A
L
 
V
T
 
T
H
 
Q
V
 
V
N
 
S
Y
 
N
K
 
V
T
 
L
G
 
G
K
 
T
R
 
V
Y
 
N
D
 
P
M
 
L
E
 
A
A
 
E
V
 
I
T
 
I
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
H
E
 
A
A
 
C
G
 
G
A
 
A
L
 
K
I
 
V
V
 
L
W
 
V
D
 
D
L
 
G
C
 
A
H
 
Q
S
 
A
A
 
V
G
 
M
A
 
H
M
 
Q
P
 
A
V
 
V
N
 
D
L
 
V
N
 
Q
R
 
A
C
 
L
D
 
D
A
 
C
D
 
D
F
 
F
A
 
Y
V
 
A
G
 
F
C
 
S
G
 
G
Y
 
H
K
 
K
Y
 
L
L
 
Y
N
 
-
G
 
-
G
 
G
P
 
P
G
 
S
A
 
G
P
 
I
A
 
G
F
 
V
V
 
L
F
 
Y
V
 
G
A
 
K
S
 
S
R
 
E
H
 
L
I
 
L
E
 
Q
A
 
A
V
 
M
R
 
-
Q
 
P
P
 
P
L
 
W
T
 
E
G
 
G
W
 
G
H
 
G
G
 
A
H
 
M
S
 
I
R
 
R
P
 
E
F
 
V
E
 
S
F
 
L
A
 
T
H
 
Q
-
 
G
-
 
T
D
 
T
Y
 
Y
A
 
A
P
 
D
H
 
P
P
 
P
G
 
W
I
 
-
D
 
-
R
 
R
M
 
F
L
 
E
T
 
A
G
 
G
T
 
S
A
 
P
P
 
H
Q
 
V
L
 
A
G
 
G
V
 
I
I
 
I
A
 
G
L
 
L
E
 
G
S
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
D
A
 
Y
F
 
V
D
 
S
G
 
A
V
 
L
D
 
G
L
 
V
D
 
D
V
 
A
L
 
I
R
 
Q

Sites not aligning to the query:

P05341 Cysteine desulfurase NifS; Nitrogenase metalloclusters biosynthesis protein NifS; EC 2.8.1.7 from Azotobacter vinelandii (see 2 papers)
23% identity, 47% coverage: 30:220/409 of query aligns to 4:202/402 of P05341

query
sites
P05341
I
 
V
Y
 
Y
L
 
L
D
 
D
G
 
N
N
 
N
S
 
A
L
 
T
G
 
T
-
 
R
-
 
V
-
 
D
-
 
D
-
 
E
A
 
I
M
 
V
P
 
Q
A
 
A
N
 
M
V
 
L
P
 
P
A
 
F
R
 
F
I
 
T
E
 
E
Q
 
Q
A
 
F
L
 
G
K
 
N
H
 
P
E
 
S
W
 
S
A
 
L
H
 
H
G
 
S
L
 
F
I
 
-
R
 
-
S
 
-
W
 
G
N
 
N
D
 
Q
A
 
V
G
 
G
W
 
M
Y
 
-
P
 
-
A
 
A
P
 
L
Q
 
K
R
 
K
T
 
A
G
 
R
N
 
Q
K
 
S
I
 
V
A
 
Q
R
 
K
L
 
L
I
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
E
Q
 
H
D
 
D
-
 
S
E
 
E
V
 
I
I
 
L
V
 
F
A
 
T
D
 
S
S
 
C
T
 
G
S
 
T
V
 
E
N
 
S
L
 
D
F
 
S
K
 
T
V
 
A
L
 
I
V
 
L
A
 
S
A
 
A
T
 
L
R
 
K
M
 
A
R
 
Q
P
 
P
G
 
E
R
 
R
N
 
K
V
 
T
I
 
V
L
 
I
A
 
T
E
 
T
R
 
V
T
 
V
N
 
E
F
 
H
P
 
P
T
 
A
D
 
V
V
 
L
-
 
S
-
 
L
-
 
C
-
 
D
Y
 
Y
I
 
L
A
 
A
S
 
S
-
 
E
-
 
G
-
 
Y
S
 
T
V
 
V
A
 
H
E
 
K
M
 
L
T
 
P
G
 
V
C
 
D
D
 
K
L
 
K
R
 
G
C
 
R
V
 
L
D
 
D
P
 
L
D
 
E
E
 
H
I
 
Y
V
 
A
S
 
S
A
 
L
I
 
L
D
 
T
D
 
D
T
 
D
V
 
V
A
 
A
I
 
V
V
 
V
S
 
S
L
 
V
T
 
M
H
 
W
V
 
A
N
 
N
Y
 
N
K
 
E
T
 
T
G
 
G
K
 
T
R
 
L
Y
 
F
D
 
P
M
 
I
E
 
E
A
 
E
V
 
M
T
 
A
R
 
R
Q
 
L
A
 
A
Q
 
D
E
 
D
A
 
A
G
 
G
A
 
I
L
 
M
I
 
F
V
 
H
W
 
T
D
 
D
L
 
A
C
 
V
H
 
Q
S
 
A
A
 
V
G
 
G
A
 
K
M
 
V
P
 
P
V
 
I
N
 
D
L
 
L
N
 
K
R
 
N
C
 
S
D
 
S
A
 
I
D
 
H
F
 
M
A
 
L
V
 
S
G
 
L
C
 
C
G
 
G
Y
 
H
K
 
K

Sites not aligning to the query:

3lvmB Crystal structure of e.Coli iscs (see paper)
24% identity, 43% coverage: 78:254/409 of query aligns to 62:243/394 of 3lvmB

query
sites
3lvmB
N
 
N
K
 
Q
I
 
I
A
 
A
R
 
D
L
 
L
I
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
D
Q
 
P
D
 
R
E
 
E
V
 
I
I
 
V
V
 
F
A
 
T
D
 
S
-
x
G
-
x
A
S
x
T
T
 
E
S
 
S
V
 
D
N
 
N
L
 
L
F
 
A
K
 
I
V
 
K
L
 
G
V
 
A
A
 
A
A
 
N
T
 
F
R
 
Y
M
 
Q
R
 
K
P
 
K
G
 
G
R
 
K
N
 
H
V
 
I
I
 
I
L
 
T
A
 
S
-
 
K
-
 
T
-
 
E
-
x
H
-
 
K
-
 
A
-
 
V
-
 
L
-
 
D
-
 
T
-
 
C
-
 
R
-
 
Q
-
 
L
E
 
E
R
 
R
T
 
E
N
 
G
F
 
F
P
 
E
T
 
V
D
 
-
V
 
T
Y
 
Y
I
 
L
A
 
A
S
 
-
S
 
-
V
 
-
A
 
P
E
 
Q
M
 
R
T
 
N
G
 
G
C
 
I
D
 
-
L
 
-
R
 
-
C
 
-
V
 
I
D
 
D
P
 
L
D
 
K
E
 
E
I
 
L
V
 
E
S
 
A
A
 
A
I
 
M
D
 
R
D
 
D
T
 
D
V
 
T
A
 
I
I
 
L
V
 
V
S
 
S
L
 
I
T
 
M
H
 
H
V
 
V
N
 
N
Y
 
N
K
 
E
T
 
I
G
 
G
K
 
V
R
 
V
Y
 
Q
D
 
D
M
 
I
E
 
A
A
 
A
V
 
I
T
 
G
R
 
E
Q
 
M
A
 
C
Q
 
R
E
 
A
A
 
R
G
 
G
A
 
I
L
 
I
I
 
Y
V
 
H
W
 
V
D
|
D
L
 
A
C
x
T
H
x
Q
S
 
S
A
 
V
G
 
G
A
 
K
M
 
L
P
 
P
V
 
I
N
 
D
L
 
L
N
 
S
R
 
Q
C
 
L
D
 
K
A
 
V
D
 
D
F
 
L
A
 
M
V
 
S
G
 
F
C
 
S
G
 
G
Y
x
H
K
|
K
Y
 
I
L
 
Y
N
 
-
G
 
-
G
 
G
P
 
P
G
 
K
A
 
G
P
 
I
A
 
G
F
 
A
V
 
L
F
 
Y
V
 
V
A
 
R
S
 
R
R
 
K
H
 
P
I
 
R
E
 
V
A
 
R
V
 
I
R
 
E
Q
 
A
P
 
Q
L
 
M
T
 
H
G
 
G
W
 
G
H
 
-
G
 
G
H
 
H
S
 
E
R
 
R

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>BPHYT_RS07275 FitnessBrowser__BFirm:BPHYT_RS07275
MITREHCAALDAADTLAHCRARFDLPADTIYLDGNSLGAMPANVPARIEQALKHEWAHGL
IRSWNDAGWYPAPQRTGNKIARLIGAGQDEVIVADSTSVNLFKVLVAATRMRPGRNVILA
ERTNFPTDVYIASSVAEMTGCDLRCVDPDEIVSAIDDTVAIVSLTHVNYKTGKRYDMEAV
TRQAQEAGALIVWDLCHSAGAMPVNLNRCDADFAVGCGYKYLNGGPGAPAFVFVASRHIE
AVRQPLTGWHGHSRPFEFAHDYAPHPGIDRMLTGTAPQLGVIALESALEAFDGVDLDVLR
DKSVALGNLFIELTDQELTGLGCTLASPRDAEMRGSQVSLGHAQGYAIMQALIARNVIGD
FRAPDILRFGFAPLYVRYVDIWDTIAQLKDIIATDAWNTDEFKARKSVT

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory