SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing BPHYT_RS07320 FitnessBrowser__BFirm:BPHYT_RS07320 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4dxvA Crystal structure of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii complexed with mg and cl ions at 1.80 a resolution
30% identity, 71% coverage: 5:217/302 of query aligns to 9:217/291 of 4dxvA

query
sites
4dxvA
V
 
I
I
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
T
 
L
K
 
K
D
 
D
L
 
G
R
 
G
I
 
V
D
 
D
A
 
W
P
 
K
R
 
S
F
 
L
V
 
E
A
 
K
F
 
L
C
 
V
R
 
E
W
 
W
L
 
H
V
 
I
G
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
T
G
 
N
-
 
S
L
 
I
A
 
V
L
 
A
F
 
V
G
 
G
T
|
T
N
 
T
S
 
G
E
 
E
A
 
A
N
 
S
S
 
T
L
 
L
G
 
S
L
 
M
T
 
E
E
 
E
R
 
H
H
 
T
A
 
Q
L
 
V
L
 
I
D
 
K
D
 
E
V
 
I
I
 
I
K
 
R
A
 
V
G
 
A
V
 
N
D
 
K
P
 
R
A
 
I
H
 
P
L
 
I
L
 
I
P
 
A
G
 
G
T
 
T
G
 
G
S
 
A
C
 
N
A
 
S
L
 
T
P
 
R
D
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
E
L
 
L
T
 
T
R
 
K
H
 
A
A
 
A
C
 
K
E
 
D
A
 
L
G
 
G
C
 
A
A
 
D
G
 
A
A
 
A
L
 
L
M
 
L
L
 
V
P
x
T
P
 
P
F
 
Y
F
x
Y
Y
 
N
K
 
K
G
 
P
V
 
-
S
 
T
D
 
Q
D
 
E
G
 
G
L
 
L
F
 
Y
A
 
Q
Y
 
H
Y
 
Y
S
 
K
D
 
A
V
 
I
I
 
A
Q
 
E
A
 
A
I
 
V
G
 
-
S
 
-
D
 
-
Q
 
E
L
 
L
R
 
P
V
 
L
L
 
I
L
 
L
Y
|
Y
H
x
N
I
x
V
P
|
P
Q
 
G
F
x
R
T
|
T
G
 
G
V
 
V
P
 
D
I
 
L
T
 
S
H
 
N
T
 
D
L
 
T
I
 
A
E
 
V
R
 
R
L
 
L
I
 
-
T
 
-
A
 
A
Y
 
E
P
 
I
R
 
P
T
 
N
V
 
I
V
 
V
G
 
G
I
 
I
K
|
K
D
 
D
S
 
A
S
 
T
G
 
G
D
 
D
W
 
V
A
 
P
N
 
R
T
 
G
E
 
K
A
 
A
M
 
L
L
 
I
R
 
D
K
 
A
F
 
L
P
 
N
G
 
G
-
 
K
F
 
M
A
 
A
V
 
V
F
 
Y
P
 
S
A
 
G
S
 
D
E
 
D
A
 
E
L
 
T
L
 
A
G
 
W
K
 
E
A
 
L
L
 
M
P
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
D
G
 
G
C
 
N
I
|
I
S
 
S
A
 
V
T
 
T
A
 
A
N
 
N
I
 
I
Q
 
A
P
 
P
Q
 
K
A
 
A
I
 
M
A
 
S
S
 
E
L
 
V

3u8gA Crystal structure of the complex of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with oxalic acid at 1.80 a resolution
30% identity, 71% coverage: 5:217/302 of query aligns to 9:217/291 of 3u8gA

query
sites
3u8gA
V
 
I
I
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
T
 
L
K
 
K
D
 
D
L
 
G
R
 
G
I
 
V
D
 
D
A
 
W
P
 
K
R
 
S
F
 
L
V
 
E
A
 
K
F
 
L
C
 
V
R
 
E
W
 
W
L
 
H
V
 
I
G
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
T
G
 
N
-
 
S
L
 
I
A
 
V
L
 
A
F
 
V
G
|
G
T
|
T
N
x
T
S
 
G
E
 
E
A
 
A
N
 
S
S
 
T
L
 
L
G
 
S
L
 
M
T
 
E
E
 
E
R
 
H
H
 
T
A
 
Q
L
 
V
L
 
I
D
 
K
D
 
E
V
 
I
I
 
I
K
 
R
A
 
V
G
 
A
V
 
N
D
 
K
P
 
R
A
 
I
H
 
P
L
 
I
L
 
I
P
 
A
G
 
G
T
 
T
G
 
G
S
 
A
C
 
N
A
 
S
L
 
T
P
 
R
D
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
E
L
 
L
T
 
T
R
 
K
H
 
A
A
 
A
C
 
K
E
 
D
A
 
L
G
 
G
C
 
A
A
 
D
G
 
A
A
 
A
L
|
L
M
 
L
L
 
V
P
 
T
P
 
P
F
 
Y
F
x
Y
Y
 
N
K
 
K
G
 
P
V
 
-
S
 
T
D
 
Q
D
 
E
G
 
G
L
 
L
F
 
Y
A
 
Q
Y
 
H
Y
 
Y
S
 
K
D
 
A
V
 
I
I
 
A
Q
 
E
A
 
A
I
 
V
G
 
-
S
 
-
D
 
-
Q
 
E
L
 
L
R
 
P
V
 
L
L
 
I
L
 
L
Y
|
Y
H
 
N
I
 
V
P
 
P
Q
 
G
F
x
R
T
 
T
G
 
G
V
 
V
P
 
D
I
 
L
T
 
S
H
 
N
T
 
D
L
 
T
I
 
A
E
 
V
R
 
R
L
 
L
I
 
-
T
 
-
A
 
A
Y
 
E
P
 
I
R
 
P
T
 
N
V
 
I
V
 
V
G
 
G
I
 
I
K
|
K
D
 
D
S
 
A
S
 
T
G
 
G
D
 
D
W
 
V
A
 
P
N
 
R
T
 
G
E
 
K
A
 
A
M
 
L
L
 
I
R
 
D
K
 
A
F
 
L
P
 
N
G
 
G
-
 
K
F
 
M
A
 
A
V
 
V
F
 
Y
P
 
S
A
 
G
S
 
D
E
 
D
A
 
E
L
 
T
L
 
A
G
 
W
K
 
E
A
 
L
L
 
M
P
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
D
G
 
G
C
 
N
I
|
I
S
 
S
A
 
V
T
 
T
A
 
A
N
 
N
I
 
I
Q
 
A
P
 
P
Q
 
K
A
 
A
I
 
M
A
 
S
S
 
E
L
 
V

Sites not aligning to the query:

3tdfA Crystal structure of the complex of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with 2-ketobutanoic acid at 1.99 a resolution
30% identity, 71% coverage: 5:217/302 of query aligns to 9:217/291 of 3tdfA

query
sites
3tdfA
V
 
I
I
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
T
 
L
K
 
K
D
 
D
L
 
G
R
 
G
I
 
V
D
 
D
A
 
W
P
 
K
R
 
S
F
 
L
V
 
E
A
 
K
F
 
L
C
 
V
R
 
E
W
 
W
L
 
H
V
 
I
G
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
T
G
 
N
-
 
S
L
 
I
A
 
V
L
 
A
F
 
V
G
 
G
T
|
T
N
x
T
S
 
G
E
 
E
A
 
A
N
 
S
S
 
T
L
 
L
G
 
S
L
 
M
T
 
E
E
 
E
R
 
H
H
 
T
A
 
Q
L
 
V
L
 
I
D
 
K
D
 
E
V
 
I
I
 
I
K
 
R
A
 
V
G
 
A
V
 
N
D
 
K
P
 
R
A
 
I
H
 
P
L
 
I
L
 
I
P
 
A
G
 
G
T
 
T
G
 
G
S
 
A
C
 
N
A
 
S
L
 
T
P
 
R
D
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
E
L
 
L
T
 
T
R
 
K
H
 
A
A
 
A
C
 
K
E
 
D
A
 
L
G
 
G
C
 
A
A
 
D
G
 
A
A
 
A
L
 
L
M
 
L
L
 
V
P
 
T
P
 
P
F
 
Y
F
x
Y
Y
 
N
K
 
K
G
 
P
V
 
-
S
 
T
D
 
Q
D
 
E
G
 
G
L
 
L
F
 
Y
A
 
Q
Y
 
H
Y
 
Y
S
 
K
D
 
A
V
 
I
I
 
A
Q
 
E
A
 
A
I
 
V
G
 
-
S
 
-
D
 
-
Q
 
E
L
 
L
R
 
P
V
 
L
L
 
I
L
 
L
Y
|
Y
H
 
N
I
 
V
P
 
P
Q
 
G
F
x
R
T
 
T
G
 
G
V
 
V
P
 
D
I
 
L
T
 
S
H
 
N
T
 
D
L
 
T
I
 
A
E
 
V
R
 
R
L
 
L
I
 
-
T
 
-
A
 
A
Y
 
E
P
 
I
R
 
P
T
 
N
V
 
I
V
 
V
G
 
G
I
 
I
K
|
K
D
 
D
S
 
A
S
 
T
G
 
G
D
 
D
W
 
V
A
 
P
N
 
R
T
 
G
E
 
K
A
 
A
M
 
L
L
 
I
R
 
D
K
 
A
F
 
L
P
 
N
G
 
G
-
 
K
F
 
M
A
 
A
V
 
V
F
 
Y
P
 
S
A
 
G
S
 
D
E
 
D
A
 
E
L
 
T
L
 
A
G
 
W
K
 
E
A
 
L
L
 
M
P
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
D
G
 
G
C
 
N
I
|
I
S
 
S
A
 
V
T
 
T
A
 
A
N
 
N
I
 
I
Q
 
A
P
 
P
Q
 
K
A
 
A
I
 
M
A
 
S
S
 
E
L
 
V

Sites not aligning to the query:

3tceA Crystal structure of the complex of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with 5-hydroxylysine at 2.6 a resolution
30% identity, 71% coverage: 5:217/302 of query aligns to 9:217/291 of 3tceA

query
sites
3tceA
V
 
I
I
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
T
 
L
K
 
K
D
 
D
L
 
G
R
 
G
I
 
V
D
 
D
A
 
W
P
 
K
R
 
S
F
 
L
V
 
E
A
 
K
F
 
L
C
 
V
R
 
E
W
 
W
L
 
H
V
 
I
G
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
T
G
 
N
-
 
S
L
 
I
A
 
V
L
 
A
F
 
V
G
 
G
T
|
T
N
 
T
S
 
G
E
 
E
A
 
A
N
x
S
S
 
T
L
|
L
G
 
S
L
 
M
T
 
E
E
 
E
R
x
H
H
 
T
A
 
Q
L
 
V
L
 
I
D
 
K
D
 
E
V
 
I
I
 
I
K
 
R
A
 
V
G
 
A
V
 
N
D
 
K
P
 
R
A
 
I
H
 
P
L
 
I
L
 
I
P
 
A
G
 
G
T
 
T
G
 
G
S
 
A
C
 
N
A
 
S
L
 
T
P
 
R
D
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
E
L
 
L
T
 
T
R
 
K
H
 
A
A
 
A
C
 
K
E
 
D
A
 
L
G
 
G
C
 
A
A
 
D
G
 
A
A
 
A
L
 
L
M
 
L
L
 
V
P
 
T
P
 
P
F
x
Y
F
x
Y
Y
 
N
K
 
K
G
 
P
V
 
-
S
 
T
D
 
Q
D
 
E
G
 
G
L
 
L
F
 
Y
A
 
Q
Y
 
H
Y
 
Y
S
 
K
D
 
A
V
 
I
I
 
A
Q
 
E
A
 
A
I
 
V
G
 
-
S
 
-
D
 
-
Q
 
E
L
 
L
R
 
P
V
 
L
L
 
I
L
 
L
Y
|
Y
H
 
N
I
 
V
P
 
P
Q
 
G
F
x
R
T
 
T
G
 
G
V
 
V
P
 
D
I
 
L
T
 
S
H
 
N
T
 
D
L
 
T
I
 
A
E
 
V
R
 
R
L
 
L
I
 
-
T
 
-
A
 
A
Y
 
E
P
 
I
R
 
P
T
 
N
V
 
I
V
 
V
G
 
G
I
 
I
K
|
K
D
 
D
S
 
A
S
 
T
G
 
G
D
 
D
W
 
V
A
 
P
N
 
R
T
 
G
E
 
K
A
 
A
M
 
L
L
 
I
R
 
D
K
 
A
F
 
L
P
 
N
G
 
G
-
 
K
F
 
M
A
 
A
V
 
V
F
 
Y
P
 
S
A
 
G
S
 
D
E
 
D
A
 
E
L
 
T
L
 
A
G
 
W
K
 
E
A
 
L
L
 
M
P
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
D
G
 
G
C
 
N
I
|
I
S
 
S
A
 
V
T
 
T
A
 
A
N
 
N
I
 
I
Q
 
A
P
 
P
Q
 
K
A
 
A
I
 
M
A
 
S
S
 
E
L
 
V

3rk8A Crystal structure of the chloride inhibited dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii complexed with pyruvate at 1.8 a resolution
30% identity, 71% coverage: 5:217/302 of query aligns to 9:217/291 of 3rk8A

query
sites
3rk8A
V
 
I
I
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
T
 
L
K
 
K
D
 
D
L
 
G
R
 
G
I
 
V
D
 
D
A
 
W
P
 
K
R
 
S
F
 
L
V
 
E
A
 
K
F
 
L
C
 
V
R
 
E
W
 
W
L
 
H
V
 
I
G
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
T
G
 
N
-
 
S
L
 
I
A
 
V
L
 
A
F
 
V
G
 
G
T
|
T
N
 
T
S
 
G
E
 
E
A
 
A
N
 
S
S
 
T
L
 
L
G
 
S
L
 
M
T
 
E
E
 
E
R
 
H
H
 
T
A
 
Q
L
 
V
L
 
I
D
 
K
D
 
E
V
 
I
I
 
I
K
 
R
A
 
V
G
 
A
V
 
N
D
 
K
P
 
R
A
 
I
H
 
P
L
 
I
L
 
I
P
 
A
G
 
G
T
 
T
G
 
G
S
 
A
C
 
N
A
 
S
L
 
T
P
 
R
D
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
E
L
 
L
T
 
T
R
 
K
H
 
A
A
 
A
C
 
K
E
 
D
A
 
L
G
 
G
C
 
A
A
 
D
G
 
A
A
 
A
L
 
L
M
 
L
L
 
V
P
 
T
P
 
P
F
 
Y
F
x
Y
Y
 
N
K
 
K
G
 
P
V
 
-
S
 
T
D
 
Q
D
 
E
G
 
G
L
 
L
F
 
Y
A
 
Q
Y
 
H
Y
 
Y
S
 
K
D
 
A
V
 
I
I
 
A
Q
 
E
A
 
A
I
 
V
G
 
-
S
 
-
D
 
-
Q
 
E
L
 
L
R
 
P
V
 
L
L
 
I
L
 
L
Y
|
Y
H
 
N
I
 
V
P
 
P
Q
 
G
F
x
R
T
 
T
G
 
G
V
 
V
P
 
D
I
 
L
T
 
S
H
 
N
T
 
D
L
 
T
I
 
A
E
 
V
R
 
R
L
 
L
I
 
-
T
 
-
A
 
A
Y
 
E
P
 
I
R
 
P
T
 
N
V
 
I
V
 
V
G
 
G
I
 
I
K
|
K
D
 
D
S
 
A
S
 
T
G
 
G
D
 
D
W
 
V
A
 
P
N
 
R
T
 
G
E
 
K
A
 
A
M
 
L
L
 
I
R
 
D
K
 
A
F
 
L
P
 
N
G
 
G
-
 
K
F
 
M
A
 
A
V
 
V
F
 
Y
P
 
S
A
x
G
S
 
D
E
 
D
A
 
E
L
 
T
L
 
A
G
 
W
K
 
E
A
 
L
L
 
M
P
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
D
G
 
G
C
 
N
I
|
I
S
 
S
A
 
V
T
 
T
A
 
A
N
 
N
I
 
I
Q
 
A
P
 
P
Q
 
K
A
 
A
I
 
M
A
 
S
S
 
E
L
 
V

Sites not aligning to the query:

3pueB Crystal structure of the complex of dhydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with lysine at 2.6a resolution
30% identity, 71% coverage: 5:217/302 of query aligns to 9:217/291 of 3pueB

query
sites
3pueB
V
 
I
I
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
T
 
L
K
 
K
D
 
D
L
 
G
R
 
G
I
 
V
D
 
D
A
 
W
P
 
K
R
 
S
F
 
L
V
 
E
A
 
K
F
 
L
C
 
V
R
 
E
W
 
W
L
 
H
V
 
I
G
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
T
G
 
N
-
 
S
L
 
I
A
 
V
L
 
A
F
 
V
G
 
G
T
|
T
N
 
T
S
 
G
E
 
E
A
 
A
N
 
S
S
 
T
L
 
L
G
 
S
L
 
M
T
 
E
E
 
E
R
 
H
H
 
T
A
 
Q
L
 
V
L
 
I
D
 
K
D
 
E
V
 
I
I
 
I
K
 
R
A
 
V
G
 
A
V
 
N
D
 
K
P
 
R
A
 
I
H
 
P
L
 
I
L
 
I
P
 
A
G
 
G
T
 
T
G
 
G
S
 
A
C
 
N
A
 
S
L
 
T
P
 
R
D
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
E
L
 
L
T
 
T
R
 
K
H
 
A
A
 
A
C
 
K
E
 
D
A
 
L
G
 
G
C
 
A
A
 
D
G
 
A
A
 
A
L
 
L
M
 
L
L
 
V
P
 
T
P
 
P
F
 
Y
F
x
Y
Y
 
N
K
 
K
G
 
P
V
 
-
S
 
T
D
 
Q
D
 
E
G
 
G
L
 
L
F
 
Y
A
 
Q
Y
 
H
Y
 
Y
S
 
K
D
 
A
V
 
I
I
 
A
Q
 
E
A
 
A
I
 
V
G
 
-
S
 
-
D
 
-
Q
 
E
L
 
L
R
 
P
V
 
L
L
 
I
L
 
L
Y
|
Y
H
 
N
I
 
V
P
 
P
Q
 
G
F
x
R
T
 
T
G
 
G
V
 
V
P
 
D
I
 
L
T
 
S
H
 
N
T
 
D
L
 
T
I
 
A
E
 
V
R
 
R
L
 
L
I
 
-
T
 
-
A
 
A
Y
 
E
P
 
I
R
 
P
T
 
N
V
 
I
V
 
V
G
 
G
I
 
I
K
|
K
D
 
D
S
 
A
S
 
T
G
 
G
D
 
D
W
 
V
A
 
P
N
 
R
T
 
G
E
 
K
A
 
A
M
 
L
L
 
I
R
 
D
K
 
A
F
 
L
P
 
N
G
 
G
-
 
K
F
 
M
A
 
A
V
 
V
F
 
Y
P
 
S
A
 
G
S
 
D
E
 
D
A
 
E
L
 
T
L
 
A
G
 
W
K
 
E
A
 
L
L
 
M
P
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
D
G
 
G
C
 
N
I
|
I
S
 
S
A
 
V
T
 
T
A
 
A
N
 
N
I
 
I
Q
 
A
P
 
P
Q
 
K
A
 
A
I
 
M
A
 
S
S
 
E
L
 
V

Sites not aligning to the query:

4ptnA Crystal structure of yage, a kdg aldolase protein in complex with magnesium cation coordinated l-glyceraldehyde (see paper)
30% identity, 89% coverage: 4:273/302 of query aligns to 9:281/298 of 4ptnA

query
sites
4ptnA
P
|
P
V
 
V
I
 
S
T
 
T
P
 
I
F
 
F
T
 
T
K
 
A
D
 
D
L
 
G
R
 
Q
I
 
L
D
 
D
A
 
K
P
 
P
R
 
G
F
 
T
V
 
A
A
 
A
F
 
L
C
 
I
R
 
D
W
 
D
L
 
L
V
 
I
G
 
K
Q
 
A
G
 
G
A
 
V
-
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
F
L
 
F
F
 
L
G
 
G
T
x
S
N
x
G
S
 
G
E
 
E
A
 
F
N
 
S
S
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
A
T
 
E
E
 
E
R
 
R
H
 
K
A
 
A
L
 
I
L
 
A
D
 
R
D
 
F
V
 
A
I
 
I
K
 
D
A
 
H
G
 
V
V
 
D
D
 
R
P
 
R
A
 
V
H
 
P
L
 
V
L
 
L
P
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
S
 
G
C
 
T
A
 
N
L
 
A
P
 
R
D
 
E
A
 
T
I
 
I
A
 
E
L
 
L
T
 
S
R
 
Q
H
 
H
A
 
A
C
 
Q
E
 
Q
A
 
A
G
 
G
C
 
A
A
 
D
G
 
G
A
 
I
L
 
V
M
 
V
L
 
I
P
 
N
P
 
P
F
 
Y
F
x
Y
Y
 
W
K
 
K
G
 
-
V
 
V
S
 
S
D
 
E
D
 
A
G
 
N
L
 
L
F
 
I
A
 
R
Y
 
Y
Y
 
F
S
 
E
D
 
Q
V
 
V
I
 
A
Q
 
D
A
 
S
I
 
V
G
 
-
S
 
-
D
 
-
Q
 
T
L
 
L
R
 
P
V
 
V
L
 
M
L
 
L
Y
|
Y
H
 
N
I
 
F
P
 
P
Q
 
A
F
x
L
T
 
T
G
 
G
V
 
Q
P
 
D
I
 
L
T
 
T
H
 
P
T
 
A
L
 
L
I
 
V
E
 
K
R
 
T
L
 
L
I
 
A
T
 
D
A
 
S
Y
 
R
P
 
-
R
 
S
T
 
N
V
 
I
V
 
I
G
 
G
I
 
I
K
|
K
D
 
D
S
 
T
S
 
I
G
 
D
D
 
S
W
 
V
A
 
A
N
 
H
T
 
L
E
 
R
A
 
S
M
 
M
L
 
I
R
 
H
K
 
T
F
 
V
P
 
K
G
 
G
-
 
A
-
 
H
-
 
P
-
 
H
F
 
F
A
 
T
V
 
V
F
 
L
P
 
C
A
x
G
S
x
Y
E
 
D
A
 
D
L
 
H
L
 
L
G
 
F
K
 
N
A
 
T
L
 
L
P
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
G
A
 
D
G
 
G
C
 
A
I
|
I
S
 
S
A
|
A
T
 
S
A
 
G
N
 
N
I
 
F
Q
 
A
P
 
P
Q
 
Q
A
 
V
I
 
S
A
 
V
S
 
N
L
 
L
L
 
L
N
 
K
A
 
A
T
 
-
T
 
-
L
 
-
E
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
-
W
 
W
-
 
R
E
 
D
G
 
G
K
 
D
V
 
V
A
 
A
T
 
K
V
 
A
R
 
A
L
 
G
A
 
Y
V
 
H
Q
 
Q
A
 
T
Q
 
L
P
 
L
M
 
Q
I
 
I
P
 
P
A
 
Q
L
 
M
K
 
Y
H
 
Q
I
 
L
V
 
D
A
 
T
H
 
P
F
 
F
A
 
V
N
 
N
-
 
V
-
 
I
D
 
K
E
 
E
S
 
A
W
 
I
-
 
V
-
 
L
-
 
C
-
 
G
-
 
R
-
 
P
-
 
V
-
 
S
T
 
T
R
 
H
V
 
V
R
 
L
P
 
P
P
 
P
L
 
A
T
 
S
P
 
P
M
 
L
N
 
D

4onvA Crystal structure of yage, a kdg aldolase protein in complex with 2- keto-3-deoxy gluconate
30% identity, 89% coverage: 4:273/302 of query aligns to 9:281/298 of 4onvA

query
sites
4onvA
P
|
P
V
 
V
I
 
S
T
 
T
P
 
I
F
 
F
T
 
T
K
 
A
D
 
D
L
 
G
R
 
Q
I
 
L
D
 
D
A
 
K
P
 
P
R
 
G
F
 
T
V
 
A
A
 
A
F
 
L
C
 
I
R
 
D
W
 
D
L
 
L
V
 
I
G
 
K
Q
 
A
G
 
G
A
 
V
-
 
D
G
 
G
L
 
L
A
x
F
L
 
F
F
 
L
G
|
G
T
x
S
N
 
G
S
 
G
E
 
E
A
 
F
N
 
S
S
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
A
T
 
E
E
 
E
R
 
R
H
 
K
A
 
A
L
 
I
L
 
A
D
 
R
D
 
F
V
 
A
I
 
I
K
 
D
A
 
H
G
 
V
V
 
D
D
 
R
P
 
R
A
 
V
H
 
P
L
 
V
L
 
L
P
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
S
 
G
C
 
T
A
 
N
L
 
A
P
 
R
D
 
E
A
 
T
I
 
I
A
 
E
L
 
L
T
 
S
R
 
Q
H
 
H
A
 
A
C
 
Q
E
 
Q
A
 
A
G
 
G
C
 
A
A
 
D
G
 
G
A
 
I
L
 
V
M
 
V
L
 
I
P
 
N
P
 
P
F
 
Y
F
x
Y
Y
 
W
K
 
K
G
 
-
V
 
V
S
 
S
D
 
E
D
 
A
G
 
N
L
 
L
F
 
I
A
 
R
Y
 
Y
Y
 
F
S
 
E
D
 
Q
V
 
V
I
 
A
Q
 
D
A
 
S
I
 
V
G
 
-
S
 
-
D
 
-
Q
 
T
L
 
L
R
 
P
V
 
V
L
 
M
L
 
L
Y
|
Y
H
 
N
I
 
F
P
 
P
Q
 
A
F
x
L
T
 
T
G
 
G
V
 
Q
P
 
D
I
 
L
T
 
T
H
 
P
T
 
A
L
 
L
I
 
V
E
 
K
R
 
T
L
 
L
I
 
A
T
 
D
A
 
S
Y
 
R
P
 
-
R
 
S
T
 
N
V
 
I
V
 
I
G
 
G
I
 
I
K
|
K
D
 
D
S
 
T
S
 
I
G
 
D
D
 
S
W
 
V
A
 
A
N
 
H
T
 
L
E
 
R
A
 
S
M
 
M
L
 
I
R
 
H
K
 
T
F
 
V
P
 
K
G
 
G
-
 
A
-
 
H
-
 
P
-
 
H
F
 
F
A
 
T
V
 
V
F
 
L
P
 
C
A
x
G
S
x
Y
E
 
D
A
 
D
L
 
H
L
 
L
G
 
F
K
 
N
A
 
T
L
 
L
P
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
G
A
 
D
G
 
G
C
 
A
I
|
I
S
|
S
A
 
A
T
 
S
A
 
G
N
 
N
I
 
F
Q
 
A
P
 
P
Q
 
Q
A
 
V
I
 
S
A
 
V
S
 
N
L
 
L
L
 
L
N
 
K
A
 
A
T
 
-
T
 
-
L
 
-
E
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
-
W
 
W
-
 
R
E
 
D
G
 
G
K
 
D
V
 
V
A
 
A
T
 
K
V
 
A
R
 
A
L
 
G
A
 
Y
V
 
H
Q
 
Q
A
 
T
Q
 
L
P
 
L
M
 
Q
I
 
I
P
 
P
A
 
Q
L
 
M
K
 
Y
H
 
Q
I
 
L
V
 
D
A
 
T
H
 
P
F
 
F
A
 
V
N
 
N
-
 
V
-
 
I
D
 
K
E
 
E
S
 
A
W
 
I
-
 
V
-
 
L
-
 
C
-
 
G
-
 
R
-
 
P
-
 
V
-
 
S
T
 
T
R
 
H
V
 
V
R
 
L
P
 
P
P
 
P
L
 
A
T
 
S
P
 
P
M
 
L
N
 
D

4oe7D Crystal structure of yage, a kdg aldolase protein, in complex with aldol condensed product of pyruvate and glyoxal
30% identity, 89% coverage: 4:273/302 of query aligns to 9:281/298 of 4oe7D

query
sites
4oe7D
P
|
P
V
 
V
I
 
S
T
 
T
P
 
I
F
 
F
T
 
T
K
 
A
D
 
D
L
 
G
R
 
Q
I
 
L
D
 
D
A
 
K
P
 
P
R
 
G
F
 
T
V
 
A
A
 
A
F
 
L
C
 
I
R
 
D
W
 
D
L
 
L
V
 
I
G
 
K
Q
 
A
G
 
G
A
 
V
-
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
F
L
 
F
F
 
L
G
|
G
T
x
S
N
x
G
S
 
G
E
 
E
A
 
F
N
 
S
S
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
A
T
 
E
E
 
E
R
 
R
H
 
K
A
 
A
L
 
I
L
 
A
D
 
R
D
 
F
V
 
A
I
 
I
K
 
D
A
 
H
G
 
V
V
 
D
D
 
R
P
 
R
A
 
V
H
 
P
L
 
V
L
 
L
P
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
S
 
G
C
 
T
A
 
N
L
 
A
P
 
R
D
 
E
A
 
T
I
 
I
A
 
E
L
 
L
T
 
S
R
 
Q
H
 
H
A
 
A
C
 
Q
E
 
Q
A
 
A
G
 
G
C
 
A
A
 
D
G
 
G
A
 
I
L
 
V
M
 
V
L
 
I
P
 
N
P
 
P
F
 
Y
F
x
Y
Y
 
W
K
 
K
G
 
-
V
 
V
S
 
S
D
 
E
D
 
A
G
 
N
L
 
L
F
 
I
A
 
R
Y
 
Y
Y
 
F
S
 
E
D
 
Q
V
 
V
I
 
A
Q
 
D
A
 
S
I
 
V
G
 
-
S
 
-
D
 
-
Q
 
T
L
 
L
R
 
P
V
 
V
L
 
M
L
 
L
Y
|
Y
H
 
N
I
x
F
P
 
P
Q
 
A
F
x
L
T
 
T
G
 
G
V
 
Q
P
 
D
I
 
L
T
 
T
H
 
P
T
 
A
L
 
L
I
 
V
E
 
K
R
 
T
L
 
L
I
 
A
T
 
D
A
 
S
Y
 
R
P
 
-
R
 
S
T
 
N
V
 
I
V
 
I
G
 
G
I
 
I
K
|
K
D
 
D
S
x
T
S
 
I
G
 
D
D
 
S
W
 
V
A
 
A
N
 
H
T
 
L
E
 
R
A
 
S
M
 
M
L
 
I
R
 
H
K
 
T
F
 
V
P
 
K
G
 
G
-
 
A
-
 
H
-
 
P
-
 
H
F
 
F
A
 
T
V
 
V
F
 
L
P
 
C
A
x
G
S
 
Y
E
 
D
A
 
D
L
 
H
L
 
L
G
 
F
K
 
N
A
 
T
L
 
L
P
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
G
A
 
D
G
 
G
C
 
A
I
|
I
S
 
S
A
 
A
T
 
S
A
 
G
N
 
N
I
 
F
Q
 
A
P
 
P
Q
 
Q
A
 
V
I
 
S
A
 
V
S
 
N
L
 
L
L
 
L
N
 
K
A
 
A
T
 
-
T
 
-
L
 
-
E
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
-
W
 
W
-
 
R
E
 
D
G
 
G
K
 
D
V
 
V
A
 
A
T
 
K
V
 
A
R
 
A
L
 
G
A
 
Y
V
 
H
Q
 
Q
A
 
T
Q
 
L
P
 
L
M
 
Q
I
 
I
P
 
P
A
 
Q
L
 
M
K
 
Y
H
 
Q
I
 
L
V
 
D
A
 
T
H
 
P
F
 
F
A
 
V
N
 
N
-
 
V
-
 
I
D
 
K
E
 
E
S
 
A
W
 
I
-
 
V
-
 
L
-
 
C
-
 
G
-
 
R
-
 
P
-
 
V
-
 
S
T
 
T
R
 
H
V
 
V
R
 
L
P
 
P
P
 
P
L
 
A
T
 
S
P
 
P
M
 
L
N
 
D

4oe7B Crystal structure of yage, a kdg aldolase protein, in complex with aldol condensed product of pyruvate and glyoxal
30% identity, 89% coverage: 4:273/302 of query aligns to 9:281/298 of 4oe7B

query
sites
4oe7B
P
|
P
V
 
V
I
 
S
T
 
T
P
 
I
F
 
F
T
 
T
K
 
A
D
 
D
L
 
G
R
 
Q
I
 
L
D
 
D
A
 
K
P
 
P
R
 
G
F
 
T
V
 
A
A
 
A
F
 
L
C
 
I
R
 
D
W
 
D
L
 
L
V
 
I
G
 
K
Q
 
A
G
 
G
A
 
V
-
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
F
L
 
F
F
 
L
G
|
G
T
x
S
N
x
G
S
 
G
E
 
E
A
 
F
N
 
S
S
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
A
T
 
E
E
 
E
R
 
R
H
 
K
A
 
A
L
 
I
L
 
A
D
 
R
D
 
F
V
 
A
I
 
I
K
 
D
A
 
H
G
 
V
V
 
D
D
 
R
P
 
R
A
 
V
H
 
P
L
 
V
L
 
L
P
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
S
 
G
C
 
T
A
 
N
L
 
A
P
 
R
D
 
E
A
 
T
I
 
I
A
 
E
L
 
L
T
 
S
R
 
Q
H
 
H
A
 
A
C
 
Q
E
 
Q
A
 
A
G
 
G
C
 
A
A
 
D
G
 
G
A
 
I
L
 
V
M
 
V
L
 
I
P
 
N
P
 
P
F
 
Y
F
x
Y
Y
 
W
K
 
K
G
 
-
V
 
V
S
 
S
D
 
E
D
 
A
G
 
N
L
 
L
F
 
I
A
 
R
Y
 
Y
Y
 
F
S
 
E
D
 
Q
V
 
V
I
 
A
Q
 
D
A
 
S
I
 
V
G
 
-
S
 
-
D
 
-
Q
 
T
L
 
L
R
 
P
V
 
V
L
 
M
L
 
L
Y
|
Y
H
 
N
I
x
F
P
 
P
Q
 
A
F
x
L
T
 
T
G
 
G
V
 
Q
P
 
D
I
 
L
T
 
T
H
 
P
T
 
A
L
 
L
I
 
V
E
 
K
R
 
T
L
 
L
I
 
A
T
 
D
A
 
S
Y
 
R
P
 
-
R
 
S
T
 
N
V
 
I
V
 
I
G
 
G
I
 
I
K
|
K
D
 
D
S
x
T
S
 
I
G
 
D
D
 
S
W
 
V
A
 
A
N
 
H
T
 
L
E
 
R
A
 
S
M
 
M
L
 
I
R
 
H
K
 
T
F
 
V
P
 
K
G
 
G
-
 
A
-
 
H
-
 
P
-
 
H
F
 
F
A
 
T
V
 
V
F
 
L
P
 
C
A
x
G
S
 
Y
E
 
D
A
 
D
L
 
H
L
 
L
G
 
F
K
 
N
A
 
T
L
 
L
P
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
G
A
 
D
G
 
G
C
 
A
I
|
I
S
 
S
A
 
A
T
 
S
A
 
G
N
 
N
I
 
F
Q
 
A
P
 
P
Q
 
Q
A
 
V
I
 
S
A
 
V
S
 
N
L
 
L
L
 
L
N
 
K
A
 
A
T
 
-
T
 
-
L
 
-
E
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
-
W
 
W
-
 
R
E
 
D
G
 
G
K
 
D
V
 
V
A
 
A
T
 
K
V
 
A
R
 
A
L
 
G
A
 
Y
V
 
H
Q
 
Q
A
 
T
Q
 
L
P
 
L
M
 
Q
I
 
I
P
 
P
A
 
Q
L
 
M
K
 
Y
H
 
Q
I
 
L
V
 
D
A
 
T
H
 
P
F
 
F
A
 
V
N
 
N
-
 
V
-
 
I
D
 
K
E
 
E
S
 
A
W
 
I
-
 
V
-
 
L
-
 
C
-
 
G
-
 
R
-
 
P
-
 
V
-
 
S
T
 
T
R
 
H
V
 
V
R
 
L
P
 
P
P
 
P
L
 
A
T
 
S
P
 
P
M
 
L
N
 
D

4oe7A Crystal structure of yage, a kdg aldolase protein, in complex with aldol condensed product of pyruvate and glyoxal
30% identity, 89% coverage: 4:273/302 of query aligns to 9:281/298 of 4oe7A

query
sites
4oe7A
P
|
P
V
 
V
I
 
S
T
 
T
P
 
I
F
 
F
T
 
T
K
 
A
D
 
D
L
 
G
R
 
Q
I
 
L
D
 
D
A
 
K
P
 
P
R
 
G
F
 
T
V
 
A
A
 
A
F
 
L
C
 
I
R
 
D
W
 
D
L
 
L
V
 
I
G
 
K
Q
 
A
G
 
G
A
 
V
-
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
F
L
 
F
F
 
L
G
|
G
T
x
S
N
x
G
S
 
G
E
 
E
A
 
F
N
 
S
S
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
A
T
 
E
E
 
E
R
 
R
H
 
K
A
 
A
L
 
I
L
 
A
D
 
R
D
 
F
V
 
A
I
 
I
K
 
D
A
 
H
G
 
V
V
 
D
D
 
R
P
 
R
A
 
V
H
 
P
L
 
V
L
 
L
P
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
S
 
G
C
 
T
A
 
N
L
 
A
P
 
R
D
 
E
A
 
T
I
 
I
A
 
E
L
 
L
T
 
S
R
 
Q
H
 
H
A
 
A
C
 
Q
E
 
Q
A
 
A
G
 
G
C
 
A
A
 
D
G
 
G
A
 
I
L
 
V
M
 
V
L
 
I
P
 
N
P
 
P
F
 
Y
F
x
Y
Y
 
W
K
 
K
G
 
-
V
 
V
S
 
S
D
 
E
D
 
A
G
 
N
L
 
L
F
 
I
A
 
R
Y
 
Y
Y
 
F
S
 
E
D
 
Q
V
 
V
I
 
A
Q
 
D
A
 
S
I
 
V
G
 
-
S
 
-
D
 
-
Q
 
T
L
 
L
R
 
P
V
 
V
L
 
M
L
 
L
Y
|
Y
H
 
N
I
 
F
P
 
P
Q
 
A
F
x
L
T
 
T
G
 
G
V
 
Q
P
 
D
I
 
L
T
 
T
H
 
P
T
 
A
L
 
L
I
 
V
E
 
K
R
 
T
L
 
L
I
 
A
T
 
D
A
 
S
Y
 
R
P
 
-
R
 
S
T
 
N
V
 
I
V
 
I
G
 
G
I
 
I
K
|
K
D
 
D
S
 
T
S
 
I
G
 
D
D
 
S
W
 
V
A
 
A
N
 
H
T
 
L
E
 
R
A
 
S
M
 
M
L
 
I
R
 
H
K
 
T
F
 
V
P
 
K
G
 
G
-
 
A
-
 
H
-
 
P
-
 
H
F
 
F
A
 
T
V
 
V
F
 
L
P
 
C
A
 
G
S
 
Y
E
 
D
A
 
D
L
 
H
L
 
L
G
 
F
K
 
N
A
 
T
L
 
L
P
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
G
A
 
D
G
 
G
C
 
A
I
|
I
S
 
S
A
 
A
T
 
S
A
 
G
N
 
N
I
 
F
Q
 
A
P
 
P
Q
 
Q
A
 
V
I
 
S
A
 
V
S
 
N
L
 
L
L
 
L
N
 
K
A
 
A
T
 
-
T
 
-
L
 
-
E
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
-
W
 
W
-
 
R
E
 
D
G
 
G
K
 
D
V
 
V
A
 
A
T
 
K
V
 
A
R
 
A
L
 
G
A
 
Y
V
 
H
Q
 
Q
A
 
T
Q
 
L
P
 
L
M
 
Q
I
 
I
P
 
P
A
 
Q
L
 
M
K
 
Y
H
 
Q
I
 
L
V
 
D
A
 
T
H
 
P
F
 
F
A
 
V
N
 
N
-
 
V
-
 
I
D
 
K
E
 
E
S
 
A
W
 
I
-
 
V
-
 
L
-
 
C
-
 
G
-
 
R
-
 
P
-
 
V
-
 
S
T
 
T
R
 
H
V
 
V
R
 
L
P
 
P
P
 
P
L
 
A
T
 
S
P
 
P
M
 
L
N
 
D

3nevA Crystal structure of yage, a prophage protein from e. Coli k12 in complex with kdgal (see paper)
30% identity, 89% coverage: 4:273/302 of query aligns to 9:281/298 of 3nevA

query
sites
3nevA
P
|
P
V
 
V
I
 
S
T
 
T
P
 
I
F
 
F
T
 
T
K
 
A
D
 
D
L
 
G
R
 
Q
I
 
L
D
 
D
A
 
K
P
 
P
R
 
G
F
 
T
V
 
A
A
 
A
F
 
L
C
 
I
R
 
D
W
 
D
L
 
L
V
 
I
G
 
K
Q
 
A
G
 
G
A
 
V
-
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
F
L
 
F
F
 
L
G
|
G
T
x
S
N
x
G
S
 
G
E
 
E
A
 
F
N
 
S
S
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
A
T
 
E
E
 
E
R
 
R
H
 
K
A
 
A
L
 
I
L
 
A
D
 
R
D
 
F
V
 
A
I
 
I
K
 
D
A
 
H
G
 
V
V
 
D
D
 
R
P
 
R
A
 
V
H
 
P
L
 
V
L
 
L
P
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
S
 
G
C
 
T
A
 
N
L
 
A
P
 
R
D
 
E
A
 
T
I
 
I
A
 
E
L
 
L
T
 
S
R
 
Q
H
 
H
A
 
A
C
 
Q
E
 
Q
A
 
A
G
 
G
C
 
A
A
 
D
G
 
G
A
 
I
L
 
V
M
 
V
L
 
I
P
 
N
P
 
P
F
 
Y
F
x
Y
Y
 
W
K
 
K
G
 
-
V
 
V
S
 
S
D
 
E
D
 
A
G
 
N
L
 
L
F
 
I
A
 
R
Y
 
Y
Y
 
F
S
 
E
D
 
Q
V
 
V
I
 
A
Q
 
D
A
 
S
I
 
V
G
 
-
S
 
-
D
 
-
Q
 
T
L
 
L
R
 
P
V
 
V
L
 
M
L
 
L
Y
|
Y
H
 
N
I
x
F
P
 
P
Q
 
A
F
x
L
T
 
T
G
 
G
V
 
Q
P
 
D
I
 
L
T
 
T
H
 
P
T
 
A
L
 
L
I
 
V
E
 
K
R
 
T
L
 
L
I
 
A
T
 
D
A
 
S
Y
 
R
P
 
-
R
 
S
T
 
N
V
 
I
V
 
I
G
 
G
I
 
I
K
|
K
D
 
D
S
x
T
S
 
I
G
 
D
D
 
S
W
 
V
A
 
A
N
 
H
T
 
L
E
 
R
A
 
S
M
 
M
L
 
I
R
 
H
K
 
T
F
 
V
P
 
K
G
 
G
-
 
A
-
 
H
-
 
P
-
 
H
F
 
F
A
 
T
V
 
V
F
 
L
P
 
C
A
x
G
S
 
Y
E
 
D
A
 
D
L
 
H
L
 
L
G
 
F
K
 
N
A
 
T
L
 
L
P
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
G
A
 
D
G
 
G
C
 
A
I
|
I
S
 
S
A
|
A
T
 
S
A
 
G
N
 
N
I
 
F
Q
 
A
P
 
P
Q
 
Q
A
 
V
I
 
S
A
 
V
S
 
N
L
 
L
L
 
L
N
 
K
A
 
A
T
 
-
T
 
-
L
 
-
E
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
-
W
 
W
-
 
R
E
 
D
G
 
G
K
 
D
V
 
V
A
 
A
T
 
K
V
 
A
R
 
A
L
 
G
A
 
Y
V
 
H
Q
 
Q
A
 
T
Q
 
L
P
 
L
M
 
Q
I
 
I
P
 
P
A
 
Q
L
 
M
K
 
Y
H
 
Q
I
 
L
V
 
D
A
 
T
H
 
P
F
 
F
A
 
V
N
 
N
-
 
V
-
 
I
D
 
K
E
 
E
S
 
A
W
 
I
-
 
V
-
 
L
-
 
C
-
 
G
-
 
R
-
 
P
-
 
V
-
 
S
T
 
T
R
 
H
V
 
V
R
 
L
P
 
P
P
 
P
L
 
A
T
 
S
P
 
P
M
 
L
N
 
D

Q8UGL3 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase; HTPA synthase; EC 4.3.3.7 from Agrobacterium fabrum (strain C58 / ATCC 33970) (Agrobacterium tumefaciens (strain C58)) (see paper)
27% identity, 93% coverage: 5:285/302 of query aligns to 9:288/294 of Q8UGL3

query
sites
Q8UGL3
V
 
L
I
 
I
T
 
T
P
 
P
F
 
F
T
 
T
K
 
D
D
 
N
L
 
G
R
 
S
I
 
V
D
 
D
A
 
E
P
 
K
R
 
A
F
 
F
V
 
A
A
 
A
F
 
H
C
 
V
R
 
E
W
 
W
L
 
Q
V
 
I
G
 
A
Q
 
E
G
 
G
A
 
S
-
 
N
G
 
G
L
 
L
A
 
V
L
 
P
F
 
V
G
 
G
T
 
T
N
x
T
S
 
G
E
 
E
A
 
S
N
x
P
S
 
T
L
 
L
G
 
S
L
 
H
T
 
D
E
 
E
R
x
H
H
 
K
A
 
R
L
 
V
L
 
V
D
 
E
D
 
L
V
 
C
I
 
I
K
 
E
A
 
V
G
 
A
V
 
A
D
 
K
P
 
R
A
 
V
H
 
P
L
 
V
L
 
I
P
 
A
G
 
G
T
 
A
G
 
G
S
 
S
C
x
N
A
 
N
L
 
T
P
 
D
D
x
E
A
 
A
I
 
I
A
 
E
L
 
L
T
 
A
R
 
L
H
 
H
A
 
A
C
 
Q
E
 
E
A
 
A
G
 
G
C
 
A
A
 
D
G
 
A
A
 
L
L
 
L
M
 
V
L
 
V
P
 
T
P
 
P
F
x
Y
F
 
Y
Y
 
N
K
 
K
G
 
-
V
 
P
S
 
T
D
 
Q
D
 
K
G
 
G
L
 
L
F
 
F
A
 
A
Y
 
H
Y
 
F
S
 
S
D
 
A
V
 
V
I
 
A
Q
 
E
A
 
A
I
 
V
G
 
-
S
 
-
D
 
-
Q
 
K
L
 
L
R
 
P
V
 
I
L
 
V
L
 
I
Y
 
Y
H
 
N
I
 
I
P
 
P
Q
 
P
F
 
R
T
 
S
G
 
V
V
 
V
P
 
D
I
 
M
T
 
S
H
 
P
T
 
E
L
 
T
I
 
M
E
 
G
R
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
K
A
 
A
Y
 
H
P
 
-
R
 
K
T
 
N
V
 
I
V
 
I
G
 
G
I
 
V
K
|
K
D
 
D
S
 
A
S
 
T
G
 
G
D
 
K
W
 
L
A
 
D
N
 
R
-
 
V
T
 
S
E
 
E
A
 
Q
M
 
R
L
 
I
R
 
S
K
 
C
F
 
G
P
 
K
G
 
D
F
 
F
A
 
V
V
 
Q
F
 
L
P
 
S
A
 
G
S
 
E
E
 
D
A
 
-
L
 
-
L
 
-
G
 
G
K
 
T
A
 
A
L
 
L
P
 
G
L
 
F
-
 
N
-
 
A
-
 
H
G
 
G
A
 
G
A
 
V
G
 
G
C
 
C
I
 
I
S
 
S
A
 
V
T
 
T
A
 
A
N
 
N
I
 
V
Q
 
A
P
 
P
Q
 
R
A
 
L
I
 
C
A
 
S
S
 
E
L
 
F
L
 
Q
N
 
A
A
 
A
T
 
M
T
 
L
L
 
A
E
 
G
E
 
D
R
 
Y
A
 
A
V
 
K
-
 
A
-
 
L
-
 
E
W
 
Y
E
 
Q
G
 
D
K
 
R
V
 
L
A
 
M
T
 
P
V
 
L
R
 
H
L
 
R
A
 
A
V
 
I
Q
 
F
A
 
M
Q
 
E
P
 
P
M
 
G
I
 
V
P
 
C
A
 
G
L
 
T
K
 
K
H
 
Y
I
 
A
V
 
L
A
 
S
H
 
K
F
 
T
A
 
R
N
 
G
D
 
G
E
 
N
S
 
R
W
 
-
T
 
-
R
 
R
V
 
V
R
 
R
P
 
S
P
 
P
L
 
L
-
 
M
T
 
S
P
 
T
M
 
L
N
 
E
P
 
P
A
 
A
Q
 
T
S
 
E
G
 
A
A
 
A
L
 
I
L
 
D
Q
 
A
Q
 
A
L
 
L
Q
 
K

4i7wA Agrobacterium tumefaciens dhdps with lysine and pyruvate
25% identity, 93% coverage: 5:285/302 of query aligns to 9:288/294 of 4i7wA

query
sites
4i7wA
V
 
L
I
 
I
T
 
T
P
 
P
F
 
F
T
 
T
K
 
D
D
 
N
L
 
G
R
 
A
I
 
V
D
 
D
A
 
E
P
 
Q
R
 
A
F
 
F
V
 
A
A
 
A
F
 
H
C
 
V
R
 
E
W
 
W
L
 
Q
V
 
I
G
 
A
Q
 
E
G
 
G
A
 
S
-
 
N
G
 
G
L
 
L
A
 
V
L
 
P
F
 
V
G
 
G
T
|
T
N
 
T
S
 
G
E
 
E
A
x
S
N
x
P
S
 
T
L
|
L
G
 
S
L
 
H
T
 
D
E
 
E
R
x
H
H
 
K
A
 
R
L
 
V
L
 
V
D
 
E
D
 
L
V
 
C
I
 
I
K
 
E
A
 
V
G
 
A
V
 
A
D
 
K
P
 
R
A
 
V
H
 
P
L
 
V
L
 
I
P
 
A
G
 
G
T
 
A
G
 
G
S
 
S
C
x
N
A
 
N
L
 
T
P
 
D
D
x
E
A
 
A
I
 
I
A
 
E
L
 
L
T
 
A
R
 
L
H
 
H
A
 
A
C
 
Q
E
 
D
A
 
A
G
 
G
C
 
A
A
 
D
G
 
A
A
 
L
L
 
L
M
 
V
L
 
V
P
 
T
P
 
P
F
x
Y
F
x
Y
Y
 
N
K
 
K
G
 
-
V
 
P
S
 
T
D
 
Q
D
 
K
G
 
G
L
 
L
F
 
F
A
 
A
Y
 
H
Y
 
F
S
 
S
D
 
A
V
 
V
I
 
A
Q
 
E
A
 
A
I
 
V
G
 
-
S
 
-
D
 
-
Q
 
K
L
 
L
R
 
P
V
 
I
L
 
V
L
 
I
Y
|
Y
H
 
N
I
 
I
P
 
P
Q
 
P
F
x
R
T
 
S
G
 
V
V
 
V
P
 
D
I
 
M
T
 
S
H
 
P
T
 
E
L
 
T
I
 
M
E
 
G
R
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
K
A
 
A
Y
 
H
P
 
-
R
 
K
T
 
N
V
 
I
V
 
V
G
 
G
I
 
V
K
|
K
D
 
D
S
 
A
S
 
T
G
 
G
D
 
K
W
 
L
A
 
D
N
 
R
-
 
V
T
 
S
E
 
E
A
 
Q
M
 
R
L
 
I
R
 
S
K
 
C
F
 
G
P
 
K
G
 
D
F
 
F
A
 
I
V
 
Q
F
 
L
P
 
S
A
 
G
S
 
E
E
 
D
A
 
S
L
 
T
L
 
A
G
 
L
K
 
G
A
 
F
L
 
N
P
 
A
L
 
H
G
 
G
A
 
G
A
 
V
G
 
G
C
 
C
I
|
I
S
 
S
A
 
V
T
 
S
A
 
A
N
 
N
I
 
V
Q
 
A
P
 
P
Q
 
R
A
 
L
I
 
C
A
 
S
S
 
E
L
 
F
L
 
Q
N
 
A
A
 
A
T
 
M
T
 
L
L
 
A
E
 
G
E
 
D
R
 
Y
A
 
A
V
 
K
-
 
A
-
 
L
-
 
E
W
 
Y
E
 
Q
G
 
D
K
 
R
V
 
L
A
 
M
T
 
P
V
 
L
R
 
H
L
 
R
A
 
A
V
 
I
Q
 
F
A
 
M
Q
 
E
P
 
P
M
 
G
I
 
V
P
 
C
A
 
G
L
 
T
K
 
K
H
 
Y
I
 
A
V
 
L
A
 
S
H
 
K
F
 
T
A
 
R
N
 
G
D
 
-
E
 
-
S
 
C
W
 
N
T
 
R
R
 
K
V
 
V
R
 
R
P
 
S
P
 
P
L
 
L
-
 
M
T
 
S
P
 
T
M
 
L
N
 
E
P
 
P
A
 
A
Q
 
T
S
 
E
G
 
A
A
 
A
L
 
I
L
 
D
Q
 
A
Q
 
A
L
 
L
Q
 
K

7mjfA Crystal structure of candidatus liberibacter solanacearum dihydrodipicolinate synthase with pyruvate and succinic semi-aldehyde bound in active site
25% identity, 94% coverage: 5:288/302 of query aligns to 9:289/296 of 7mjfA

query
sites
7mjfA
V
 
L
I
 
I
T
 
T
P
 
P
F
 
F
T
 
T
K
 
K
D
 
D
L
 
N
R
 
L
I
 
I
D
 
D
A
 
E
P
 
D
R
 
S
F
 
F
V
 
V
A
 
D
F
 
H
C
 
I
R
 
E
W
 
W
L
 
Q
V
 
I
G
 
S
Q
 
E
G
 
G
A
 
S
-
 
S
G
 
G
L
 
L
A
 
V
L
 
P
F
 
A
G
 
G
T
|
T
N
x
T
S
 
G
E
 
E
A
 
S
N
 
S
S
 
T
L
 
L
G
 
S
L
 
Y
T
 
E
E
 
E
R
 
H
H
 
C
A
 
R
L
 
V
L
 
V
D
 
E
D
 
L
V
 
C
I
 
V
K
 
K
A
 
T
G
 
A
V
 
A
D
 
G
P
 
R
A
 
V
H
 
P
L
 
V
L
 
M
P
 
A
G
 
G
T
 
A
G
 
G
S
 
S
C
 
N
A
 
N
L
 
T
P
 
K
D
 
E
A
 
S
I
 
I
A
 
E
L
 
L
T
 
A
R
 
Q
H
 
Y
A
 
A
C
 
Q
E
 
N
A
 
T
G
 
G
C
 
A
A
 
D
G
 
A
A
 
L
L
 
L
M
 
V
L
 
V
P
 
V
P
 
P
F
 
Y
F
 
Y
Y
 
N
K
 
K
G
 
P
V
 
-
S
 
N
D
 
K
D
 
K
G
 
G
L
 
L
F
 
L
A
 
A
Y
 
H
Y
 
F
S
 
G
D
 
S
V
 
I
I
 
A
Q
 
N
A
 
A
I
 
V
G
 
-
S
 
-
D
 
-
Q
 
S
L
 
L
R
 
P
V
 
I
L
 
Y
L
 
I
Y
|
Y
H
 
N
I
 
N
P
 
P
Q
 
S
F
x
R
T
 
T
G
 
V
V
 
I
P
 
E
I
 
M
T
 
D
H
 
V
T
 
D
L
 
T
I
 
M
E
 
A
R
 
E
L
 
L
I
 
V
T
 
K
A
 
T
Y
 
Y
P
 
S
R
 
-
T
 
N
V
 
I
V
 
V
G
 
G
I
 
V
K
|
K
D
 
D
S
 
A
S
 
T
G
 
G
-
 
R
-
 
I
D
 
E
W
 
L
A
 
A
N
 
S
T
 
G
E
 
Q
A
 
R
M
 
I
L
 
A
R
 
C
K
 
G
F
 
S
P
 
D
G
 
F
F
 
I
A
 
Q
V
 
L
F
 
S
P
x
G
A
 
D
S
 
D
E
 
S
A
 
S
L
 
A
L
 
L
G
 
G
K
 
F
A
 
N
L
 
V
P
 
H
L
 
-
G
 
G
A
 
G
A
 
V
G
 
G
C
 
C
I
 
I
S
 
S
A
 
V
T
 
T
A
 
A
N
 
N
I
 
V
Q
 
A
P
 
P
Q
 
R
A
 
I
I
 
C
A
 
A
S
 
E
L
 
F
L
 
Q
N
 
K
A
 
A
T
 
I
T
 
S
-
 
E
-
 
G
-
 
D
L
 
Y
E
 
R
E
 
Q
R
 
A
A
 
L
V
 
E
W
 
Y
E
 
Q
G
 
D
K
 
K
V
 
L
A
 
F
T
 
P
V
 
L
R
 
H
L
 
Q
A
 
A
V
 
L
Q
 
F
A
 
I
Q
 
E
P
 
P
M
 
S
I
 
I
P
 
S
A
 
S
L
 
V
K
 
K
H
 
Y
I
 
A
V
 
L
A
 
S
H
 
R
F
 
L
A
 
G
N
 
R
D
 
N
E
 
V
S
 
S
W
 
L
T
 
V
R
 
-
V
 
V
R
 
R
P
 
A
P
 
P
L
 
M
T
 
V
P
 
S
M
 
I
N
 
L
P
 
E
A
 
K
Q
 
E
S
 
T
G
 
-
A
 
-
L
 
M
L
 
F
Q
 
A
Q
 
I
L
 
D
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
D
 
D

Sites not aligning to the query:

7lvlA Dihydrodipicolinate synthase bound with allosteric inhibitor (s)- lysine from candidatus liberibacter solanacearum
25% identity, 94% coverage: 5:288/302 of query aligns to 9:289/296 of 7lvlA

query
sites
7lvlA
V
 
L
I
 
I
T
 
T
P
 
P
F
 
F
T
 
T
K
 
K
D
 
D
L
 
N
R
 
L
I
 
I
D
 
D
A
 
E
P
 
D
R
 
S
F
 
F
V
 
V
A
 
D
F
 
H
C
 
I
R
 
E
W
 
W
L
 
Q
V
 
I
G
 
S
Q
 
E
G
 
G
A
 
S
-
 
S
G
 
G
L
 
L
A
 
V
L
 
P
F
 
A
G
 
G
T
|
T
N
 
T
S
 
G
E
 
E
A
x
S
N
x
S
S
 
T
L
|
L
G
 
S
L
 
Y
T
 
E
E
 
E
R
 
H
H
 
C
A
 
R
L
 
V
L
 
V
D
 
E
D
 
L
V
 
C
I
 
V
K
 
K
A
 
T
G
 
A
V
 
A
D
 
G
P
 
R
A
 
V
H
 
P
L
 
V
L
 
M
P
 
A
G
 
G
T
 
A
G
 
G
S
 
S
C
 
N
A
 
N
L
 
T
P
 
K
D
 
E
A
 
S
I
 
I
A
 
E
L
 
L
T
 
A
R
 
Q
H
 
Y
A
 
A
C
 
Q
E
 
N
A
 
T
G
 
G
C
 
A
A
 
D
G
 
A
A
 
L
L
 
L
M
 
V
L
 
V
P
 
V
P
 
P
F
x
Y
F
x
Y
Y
 
N
K
 
K
G
 
P
V
 
-
S
 
N
D
 
K
D
 
K
G
 
G
L
 
L
F
 
L
A
 
A
Y
 
H
Y
 
F
S
 
G
D
 
S
V
 
I
I
 
A
Q
 
N
A
 
A
I
 
V
G
 
-
S
 
-
D
 
-
Q
 
S
L
 
L
R
 
P
V
 
I
L
 
Y
L
 
I
Y
|
Y
H
 
N
I
 
N
P
 
P
Q
 
S
F
x
R
T
 
T
G
 
V
V
 
I
P
 
E
I
 
M
T
 
D
H
 
V
T
 
D
L
 
T
I
 
M
E
 
A
R
 
E
L
 
L
I
 
V
T
 
K
A
 
T
Y
 
Y
P
 
S
R
 
-
T
 
N
V
 
I
V
 
V
G
 
G
I
 
V
K
|
K
D
 
D
S
 
A
S
 
T
G
 
G
-
 
R
-
 
I
D
 
E
W
 
L
A
 
A
N
 
S
T
 
G
E
 
Q
A
 
R
M
 
I
L
 
A
R
 
C
K
 
G
F
 
S
P
 
D
G
 
F
F
 
I
A
 
Q
V
 
L
F
 
S
P
 
G
A
 
D
S
 
D
E
 
S
A
 
S
L
 
A
L
 
L
G
 
G
K
 
F
A
 
N
L
 
V
P
 
H
L
 
-
G
 
G
A
 
G
A
 
V
G
 
G
C
 
C
I
|
I
S
 
S
A
 
V
T
 
T
A
 
A
N
 
N
I
 
V
Q
 
A
P
 
P
Q
 
R
A
 
I
I
 
C
A
 
A
S
 
E
L
 
F
L
 
Q
N
 
K
A
 
A
T
 
I
T
 
S
-
 
E
-
 
G
-
 
D
L
 
Y
E
 
R
E
 
Q
R
 
A
A
 
L
V
 
E
W
 
Y
E
 
Q
G
 
D
K
 
K
V
 
L
A
 
F
T
 
P
V
 
L
R
 
H
L
 
Q
A
 
A
V
 
L
Q
 
F
A
 
I
Q
 
E
P
 
P
M
 
S
I
 
I
P
 
S
A
 
S
L
 
V
K
 
K
H
 
Y
I
 
A
V
 
L
A
 
S
H
 
R
F
 
L
A
 
G
N
 
R
D
 
N
E
 
V
S
 
S
W
 
L
T
 
V
R
 
-
V
 
V
R
 
R
P
 
A
P
 
P
L
 
M
T
 
V
P
 
S
M
 
I
N
 
L
P
 
E
A
 
K
Q
 
E
S
 
T
G
 
-
A
 
-
L
 
M
L
 
F
Q
 
A
Q
 
I
L
 
D
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
D
 
D

Q07607 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase; HTPA synthase; Protein MosA; EC 4.3.3.7 from Rhizobium meliloti (Ensifer meliloti) (Sinorhizobium meliloti) (see paper)
27% identity, 72% coverage: 5:220/302 of query aligns to 9:220/292 of Q07607

query
sites
Q07607
V
 
L
I
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
F
T
 
A
K
 
D
D
 
D
L
 
-
R
 
R
I
 
I
D
 
D
A
 
E
P
 
V
R
 
A
F
 
L
V
 
H
A
 
D
F
 
L
C
 
V
R
 
E
W
 
W
L
 
Q
V
 
I
G
 
E
Q
 
E
G
 
G
A
 
S
-
 
F
G
 
G
L
 
L
A
 
V
L
 
P
F
 
C
G
 
G
T
 
T
N
 
T
S
 
G
E
 
E
A
 
S
N
 
P
S
 
T
L
 
L
G
 
S
L
 
K
T
 
S
E
 
E
R
 
H
H
 
E
A
 
Q
L
 
V
L
 
V
D
 
E
D
 
I
V
 
T
I
 
I
K
 
K
A
 
T
G
 
A
V
 
N
D
 
G
P
 
R
A
 
V
H
 
P
L
 
V
L
 
I
P
 
A
G
 
G
T
 
A
G
 
G
S
 
S
C
 
N
A
 
S
L
 
T
P
 
A
D
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
F
T
 
V
R
 
R
H
 
H
A
 
A
C
 
Q
E
 
N
A
 
A
G
 
G
C
 
A
A
 
D
G
 
G
A
 
V
L
 
L
M
 
I
L
 
V
P
 
S
P
 
P
F
 
Y
F
 
Y
Y
 
N
K
 
K
G
 
-
V
 
P
S
 
T
D
 
Q
D
 
E
G
 
G
L
 
I
F
 
Y
A
 
Q
Y
 
H
Y
 
F
S
 
K
D
 
A
V
 
I
I
 
D
Q
 
A
A
 
A
I
 
-
G
 
-
S
 
-
D
 
S
Q
 
T
L
 
I
R
 
P
V
 
I
L
 
I
L
 
V
Y
 
Y
H
 
N
I
 
I
P
 
P
Q
 
G
F
 
R
T
 
S
G
 
A
V
 
I
P
 
E
I
 
I
T
 
H
H
 
V
T
 
E
L
 
T
I
 
L
E
 
A
R
 
R
L
 
I
I
 
F
T
 
E
A
 
D
Y
 
C
P
 
P
R
 
-
T
 
N
V
 
V
V
 
K
G
 
G
I
 
V
K
|
K
D
 
D
S
 
A
S
 
T
G
 
G
D
 
N
W
 
L
A
 
L
N
 
R
T
 
P
E
 
-
A
 
S
M
 
L
L
 
E
R
 
R
K
 
M
F
 
A
P
 
C
G
 
G
-
 
E
-
 
D
F
 
F
A
 
N
V
 
L
F
 
L
P
 
T
A
 
G
S
 
E
E
 
D
A
 
G
L
 
T
L
 
A
G
 
L
K
 
G
A
 
Y
L
 
M
P
 
A
L
 
H
G
 
G
A
 
G
A
 
H
G
 
G
C
 
C
I
 
I
S
 
S
A
 
V
T
 
T
A
 
A
N
 
N
I
 
V
Q
 
A
P
 
P
Q
 
A
A
 
L
I
 
C
A
 
A
S
 
D
L
 
F
L
 
Q
N
 
Q
A
 
A

1xxxA Crystal structure of dihydrodipicolinate synthase (dapa, rv2753c) from mycobacterium tuberculosis (see paper)
29% identity, 83% coverage: 1:252/302 of query aligns to 11:250/296 of 1xxxA

query
sites
1xxxA
M
 
L
F
 
L
A
 
T
P
 
A
V
 
M
I
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
F
T
 
S
K
 
G
D
 
D
L
 
G
R
 
S
I
 
L
D
 
D
A
 
T
P
 
A
R
 
T
F
 
A
V
 
A
A
 
R
F
 
L
C
 
A
R
 
N
W
 
H
L
 
L
V
 
V
G
 
D
Q
 
Q
G
 
G
A
 
C
-
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
V
L
 
V
F
 
S
G
 
G
T
|
T
N
 
T
S
 
G
E
 
E
A
 
S
N
 
P
S
 
T
L
 
T
G
 
T
L
 
D
T
 
G
E
 
E
R
 
K
H
 
I
A
 
E
L
 
L
L
 
L
D
 
R
D
 
A
V
 
V
I
 
L
K
 
E
A
 
A
G
 
V
V
 
G
D
 
D
P
 
R
A
 
A
H
 
R
L
 
V
L
 
I
P
 
A
G
 
G
T
 
A
G
 
G
S
 
T
C
 
Y
A
 
D
L
 
T
P
 
A
D
 
H
A
 
S
I
 
I
A
 
R
L
 
L
T
 
A
R
 
K
H
 
A
A
 
C
C
 
A
E
 
A
A
 
E
G
 
G
C
 
A
A
 
H
G
 
G
A
 
L
L
 
L
M
 
V
L
 
V
P
 
T
P
 
P
F
 
Y
F
x
Y
Y
 
S
K
 
K
G
 
-
V
 
P
S
 
P
D
 
Q
D
 
R
G
 
G
L
 
L
F
 
Q
A
 
A
Y
 
H
Y
 
F
S
 
T
D
 
A
V
 
V
I
 
A
Q
 
D
A
 
A
I
 
T
G
 
-
S
 
-
D
 
-
Q
 
E
L
 
L
R
 
P
V
 
M
L
 
L
L
 
L
Y
|
Y
H
 
D
I
 
I
P
 
P
Q
 
G
F
x
R
T
 
S
G
 
A
V
 
V
P
 
P
I
 
I
T
 
E
H
 
P
T
 
D
L
 
T
I
 
I
E
 
-
R
 
R
L
 
A
I
 
L
T
x
A
A
 
S
Y
x
H
P
 
P
R
 
-
T
 
N
V
x
I
V
 
V
G
 
G
I
 
V
K
|
K
D
 
D
S
 
A
S
 
K
G
 
A
D
 
D
W
 
L
A
 
-
N
 
H
T
 
S
E
 
G
A
 
A
M
 
Q
L
 
I
R
 
M
K
 
A
F
 
D
P
 
T
G
 
G
F
 
L
A
 
A
V
 
Y
F
 
Y
P
 
S
A
 
G
S
 
D
E
 
D
A
 
A
L
 
L
L
 
N
G
 
L
K
 
P
A
 
W
L
 
L
P
 
A
L
 
M
G
 
G
A
 
A
A
 
T
G
 
G
C
 
F
I
|
I
S
 
S
A
 
V
T
 
I
A
 
A
N
 
H
I
 
L
Q
 
A
P
 
A
Q
 
G
A
 
Q
I
 
L
A
 
R
S
 
E
L
 
L
L
 
L
N
 
S
A
 
-
T
 
-
T
 
-
L
 
-
E
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
A
V
 
F
W
 
G
E
 
S
G
 
G
K
 
D
V
 
I
A
 
A
T
 
T
V
 
A
R
 
R
-
 
K
L
 
I
A
 
N
V
 
I
Q
 
A
A
 
V
Q
 
A
P
 
P
M
 
L
I
 
C
P
 
N
A
 
A
L
 
M
K
 
S
H
 
R
I
 
L

P9WP25 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase; HTPA synthase; EC 4.3.3.7 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
29% identity, 83% coverage: 1:252/302 of query aligns to 15:254/300 of P9WP25

query
sites
P9WP25
M
 
L
F
 
L
A
 
T
P
 
A
V
 
M
I
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
F
T
 
S
K
 
G
D
 
D
L
 
G
R
 
S
I
 
L
D
 
D
A
 
T
P
 
A
R
 
T
F
 
A
V
 
A
A
 
R
F
 
L
C
 
A
R
 
N
W
 
H
L
 
L
V
 
V
G
 
D
Q
 
Q
G
 
G
A
 
C
-
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
V
L
 
V
F
 
S
G
 
G
T
 
T
N
 
T
S
 
G
E
 
E
A
 
S
N
 
P
S
 
T
L
 
T
G
 
T
L
 
D
T
 
G
E
 
E
R
 
K
H
 
I
A
 
E
L
 
L
L
 
L
D
 
R
D
 
A
V
 
V
I
 
L
K
 
E
A
 
A
G
 
V
V
 
G
D
 
D
P
 
R
A
 
A
H
 
R
L
 
V
L
 
I
P
 
A
G
 
G
T
 
A
G
 
G
S
 
T
C
 
Y
A
 
D
L
 
T
P
 
A
D
 
H
A
 
S
I
 
I
A
 
R
L
 
L
T
 
A
R
 
K
H
 
A
A
 
C
C
 
A
E
 
A
A
 
E
G
 
G
C
 
A
A
 
H
G
 
G
A
 
L
L
 
L
M
 
V
L
 
V
P
 
T
P
 
P
F
 
Y
F
 
Y
Y
 
S
K
 
K
G
 
-
V
 
P
S
 
P
D
 
Q
D
 
R
G
 
G
L
 
L
F
 
Q
A
 
A
Y
 
H
Y
 
F
S
 
T
D
 
A
V
 
V
I
 
A
Q
 
D
A
 
A
I
 
T
G
 
-
S
 
-
D
 
-
Q
 
E
L
 
L
R
 
P
V
 
M
L
 
L
L
 
L
Y
 
Y
H
 
D
I
 
I
P
 
P
Q
 
G
F
 
R
T
 
S
G
 
A
V
 
V
P
 
P
I
 
I
T
 
E
H
 
P
T
 
D
L
 
T
I
 
I
E
 
-
R
 
R
L
 
A
I
 
L
T
 
A
A
 
S
Y
 
H
P
 
P
R
 
-
T
 
N
V
 
I
V
 
V
G
 
G
I
 
V
K
|
K
D
 
D
S
 
A
S
 
K
G
 
A
D
 
D
W
 
L
A
 
-
N
 
H
T
 
S
E
 
G
A
 
A
M
 
Q
L
 
I
R
 
M
K
 
A
F
 
D
P
 
T
G
 
G
F
 
L
A
 
A
V
 
Y
F
 
Y
P
 
S
A
 
G
S
 
D
E
 
D
A
 
A
L
 
L
L
 
N
G
 
L
K
 
P
A
 
W
L
 
L
P
x
A
L
 
M
G
 
G
A
 
A
A
 
T
G
 
G
C
 
F
I
 
I
S
 
S
A
 
V
T
 
I
A
 
A
N
 
H
I
 
L
Q
 
A
P
 
A
Q
 
G
A
 
Q
I
 
L
A
 
R
S
 
E
L
 
L
L
 
L
N
 
S
A
 
-
T
 
-
T
 
-
L
 
-
E
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
A
V
 
F
W
 
G
E
 
S
G
 
G
K
 
D
V
 
I
A
 
A
T
 
T
V
 
A
R
 
R
-
 
K
L
 
I
A
 
N
V
 
I
Q
 
A
A
 
V
Q
 
A
P
 
P
M
 
L
I
 
C
P
 
N
A
 
A
L
 
M
K
 
S
H
 
R
I
 
L

5j5dA Crystal structure of dihydrodipicolinate synthase from mycobacterium tuberculosis in complex with alpha-ketopimelic acid (see paper)
29% identity, 83% coverage: 1:252/302 of query aligns to 12:251/297 of 5j5dA

query
sites
5j5dA
M
 
L
F
 
L
A
 
T
P
x
A
V
 
M
I
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
F
T
 
S
K
 
G
D
 
D
L
 
G
R
 
S
I
 
L
D
 
D
A
 
T
P
 
A
R
 
T
F
 
A
V
 
A
A
 
R
F
 
L
C
 
A
R
 
N
W
 
H
L
 
L
V
 
V
G
 
D
Q
 
Q
G
 
G
A
 
C
-
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
V
L
 
V
F
 
S
G
 
G
T
|
T
N
x
T
S
 
G
E
 
E
A
 
S
N
 
P
S
 
T
L
 
T
G
 
T
L
 
D
T
 
G
E
 
E
R
 
K
H
 
I
A
 
E
L
 
L
L
 
L
D
 
R
D
 
A
V
 
V
I
 
L
K
 
E
A
 
A
G
 
V
V
 
G
D
 
D
P
 
R
A
 
A
H
 
R
L
 
V
L
 
I
P
 
A
G
 
G
T
 
A
G
 
G
S
 
T
C
 
Y
A
 
D
L
 
T
P
 
A
D
 
H
A
 
S
I
 
I
A
 
R
L
 
L
T
 
A
R
 
K
H
 
A
A
 
C
C
 
A
E
 
A
A
 
E
G
 
G
C
 
A
A
 
H
G
 
G
A
 
L
L
 
L
M
 
V
L
 
V
P
 
T
P
 
P
F
 
Y
F
x
Y
Y
 
S
K
 
K
G
 
-
V
 
P
S
 
P
D
 
Q
D
 
R
G
 
G
L
 
L
F
 
Q
A
 
A
Y
 
H
Y
 
F
S
 
T
D
 
A
V
 
V
I
 
A
Q
 
D
A
 
A
I
 
T
G
 
-
S
 
-
D
 
-
Q
 
E
L
 
L
R
 
P
V
 
M
L
 
L
L
 
L
Y
|
Y
H
 
D
I
 
I
P
 
P
Q
 
G
F
x
R
T
 
S
G
 
A
V
 
V
P
 
P
I
 
I
T
 
E
H
 
P
T
 
D
L
 
T
I
 
I
E
 
-
R
 
R
L
 
A
I
 
L
T
 
A
A
 
S
Y
 
H
P
 
P
R
 
-
T
 
N
V
 
I
V
 
V
G
 
G
I
 
V
K
|
K
D
 
D
S
 
A
S
 
K
G
 
A
D
 
D
W
 
L
A
 
-
N
 
H
T
 
S
E
 
G
A
 
A
M
 
Q
L
 
I
R
 
M
K
 
A
F
 
D
P
 
T
G
 
G
F
 
L
A
 
A
V
 
Y
F
 
Y
P
 
S
A
x
G
S
 
D
E
 
D
A
 
A
L
 
L
L
 
N
G
 
L
K
 
P
A
 
W
L
 
L
P
 
A
L
 
M
G
 
G
A
 
A
A
 
T
G
 
G
C
 
F
I
|
I
S
 
S
A
 
V
T
 
I
A
 
A
N
 
H
I
 
L
Q
 
A
P
 
A
Q
 
G
A
 
Q
I
 
L
A
 
R
S
 
E
L
 
L
L
 
L
N
 
S
A
 
-
T
 
-
T
 
-
L
 
-
E
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
A
V
 
F
W
 
G
E
 
S
G
 
G
K
 
D
V
 
I
A
 
A
T
 
T
V
 
A
R
 
R
-
 
K
L
 
I
A
 
N
V
 
I
Q
 
A
A
 
V
Q
 
A
P
 
P
M
 
L
I
 
C
P
 
N
A
 
A
L
 
M
K
 
S
H
 
R
I
 
L

Query Sequence

>BPHYT_RS07320 FitnessBrowser__BFirm:BPHYT_RS07320
MFAPVITPFTKDLRIDAPRFVAFCRWLVGQGAGLALFGTNSEANSLGLTERHALLDDVIK
AGVDPAHLLPGTGSCALPDAIALTRHACEAGCAGALMLPPFFYKGVSDDGLFAYYSDVIQ
AIGSDQLRVLLYHIPQFTGVPITHTLIERLITAYPRTVVGIKDSSGDWANTEAMLRKFPG
FAVFPASEALLGKALPLGAAGCISATANIQPQAIASLLNATTLEERAVWEGKVATVRLAV
QAQPMIPALKHIVAHFANDESWTRVRPPLTPMNPAQSGALLQQLQALDFSMPAMATLATV
AA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory