SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing BPHYT_RS08325 FitnessBrowser__BFirm:BPHYT_RS08325 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

Q4W6G0 Quinohemoprotein alcohol dehydrogenase ADH-IIG; ADH IIG; Alcohol dehydrogenase (azurin); EC 1.1.9.1 from Pseudomonas putida (Arthrobacter siderocapsulatus) (see 2 papers)
25% identity, 85% coverage: 115:826/837 of query aligns to 2:577/718 of Q4W6G0

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1yiqA Molecular cloning and structural analysis of quinohemoprotein alcohol dehydrogenase adhiig from pseudomonas putida hk5. Compariison to the other quinohemoprotein alcohol dehydrogenase adhiib found in the same microorganism. (see paper)
25% identity, 79% coverage: 164:826/837 of query aligns to 18:548/684 of 1yiqA

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P12293 Methanol dehydrogenase [cytochrome c] subunit 1; MDH large subunit alpha; MEDH; EC 1.1.2.7 from Paracoccus denitrificans (see 2 papers)
23% identity, 78% coverage: 164:816/837 of query aligns to 42:567/631 of P12293

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6damA Crystal structure of lanthanide-dependent methanol dehydrogenase xoxf from methylomicrobium buryatense 5g (see paper)
27% identity, 47% coverage: 164:556/837 of query aligns to 10:344/563 of 6damA

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Q8GR64 Quinohemoprotein alcohol dehydrogenase ADH IIB; ADH IIB; Alcohol dehydrogenase (azurin); EC 1.1.9.1 from Pseudomonas putida (Arthrobacter siderocapsulatus) (see 3 papers)
24% identity, 78% coverage: 167:816/837 of query aligns to 39:543/690 of Q8GR64

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