SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing BPHYT_RS11215 FitnessBrowser__BFirm:BPHYT_RS11215 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P04983 Ribose import ATP-binding protein RbsA; EC 7.5.2.7 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
41% identity, 94% coverage: 11:508/532 of query aligns to 3:491/501 of P04983

query
sites
P04983
A
 
A
V
 
L
L
 
L
S
 
Q
V
 
L
S
 
K
G
 
G
I
 
I
G
 
D
K
 
K
T
 
A
Y
 
F
-
 
P
A
 
G
E
 
V
P
 
K
V
 
A
L
 
L
A
 
S
D
 
G
I
 
A
S
 
A
L
 
L
S
 
N
L
 
V
R
 
Y
A
 
P
G
 
G
E
 
R
V
 
V
L
 
M
A
 
A
L
 
L
T
 
V
G
 
G
E
 
E
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
|
K
S
 
S
T
 
T
L
 
M
S
 
M
K
 
K
I
 
V
I
 
L
G
 
T
G
 
G
L
 
I
V
 
Y
E
 
T
P
 
R
T
 
D
A
 
A
G
 
G
T
 
T
M
 
L
Q
 
L
L
 
W
G
 
L
G
 
G
V
 
K
P
 
E
Y
 
T
A
 
T
P
 
F
A
 
T
S
 
G
R
 
P
T
 
K
Q
 
S
A
 
S
E
 
Q
A
 
E
L
 
A
G
 
G
V
 
I
R
 
G
M
 
I
V
 
I
M
 
H
Q
 
Q
E
 
E
L
 
L
N
 
N
L
 
L
L
 
I
P
 
P
T
 
Q
L
 
L
S
 
T
V
 
I
A
 
A
E
 
E
N
 
N
L
 
I
F
 
F
L
 
L
N
 
G
R
 
R
L
 
-
P
 
-
R
 
-
A
 
E
G
 
F
A
 
V
F
 
N
S
 
R
F
 
F
G
 
G
W
 
K
I
 
I
D
 
D
R
 
W
R
 
K
K
 
T
L
 
M
R
 
Y
E
 
A
D
 
E
A
 
A
R
 
D
Q
 
K
A
 
L
M
 
L
A
 
A
Q
 
K
V
 
L
G
 
N
L
 
L
D
 
-
A
 
R
I
 
F
D
 
K
P
 
S
D
 
D
T
 
K
L
 
L
V
 
V
G
 
G
E
 
D
L
 
L
G
 
S
I
 
I
G
 
G
H
 
D
Q
 
Q
Q
 
Q
M
 
M
V
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
K
N
 
V
L
 
L
I
 
S
D
 
F
D
 
E
C
 
S
R
 
K
V
 
V
L
 
I
I
 
I
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
D
M
 
A
L
 
L
T
 
T
A
 
D
R
 
T
E
 
E
V
 
T
D
 
E
L
 
S
L
 
L
F
 
F
E
 
R
Q
 
V
I
 
I
D
 
R
R
 
E
L
 
L
K
 
K
A
 
S
R
 
Q
G
 
G
V
 
R
A
 
G
L
 
I
V
 
V
Y
 
Y
I
 
I
S
 
S
H
 
H
R
 
R
L
 
M
E
 
K
E
 
E
L
 
I
A
 
F
R
 
E
V
 
I
A
 
C
E
 
D
Q
 
D
I
 
V
A
 
T
V
 
V
L
 
F
R
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
Q
L
 
F
V
 
I
H
 
A
V
 
E
D
 
R
A
 
E
M
 
V
A
 
A
N
 
S
L
 
L
T
 
T
S
 
E
D
 
D
E
 
S
I
 
L
V
 
I
T
 
E
W
 
M
M
 
M
V
 
V
G
 
G
R
 
R
E
 
K
L
 
L
G
 
E
E
 
D
R
 
Q
I
 
Y
D
 
P
L
 
H
G
 
L
V
 
D
R
 
K
N
 
A
I
 
P
G
 
G
A
 
D
P
 
I
L
 
R
L
 
L
K
 
K
V
 
V
D
 
D
R
 
N
L
 
L
T
 
C
R
 
-
G
 
G
K
 
P
V
 
G
V
 
V
R
 
N
E
 
D
V
 
V
S
 
S
F
 
F
E
 
T
V
 
L
R
 
R
A
 
K
G
 
G
E
 
E
I
 
I
F
 
L
G
 
G
I
 
V
S
 
S
G
 
G
L
 
L
I
 
M
G
 
G
A
 
A
G
 
G
R
 
R
T
 
T
E
 
E
L
 
L
M
 
M
R
 
K
L
 
V
I
 
L
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
D
 
L
P
 
P
K
 
R
D
 
T
S
 
S
G
 
G
T
 
Y
V
 
V
S
 
T
L
 
L
A
 
D
A
 
G
T
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
P
 
-
P
 
-
T
 
H
P
 
E
V
 
V
Q
 
V
I
 
T
A
 
R
S
 
S
P
 
P
S
 
Q
D
 
D
A
 
G
V
 
L
R
 
A
A
 
N
G
 
G
I
 
I
A
 
V
L
 
Y
I
 
I
T
 
S
E
 
E
D
 
D
R
 
R
K
 
K
G
 
R
E
 
D
G
 
G
L
 
L
L
 
V
L
 
L
P
 
G
Q
 
M
P
 
S
I
 
V
A
 
K
A
 
E
N
 
N
V
 
M
S
 
S
L
 
L
G
 
T
N
 
A
I
 
L
G
 
R
S
 
Y
V
 
F
A
 
S
R
 
R
H
 
A
G
 
G
-
 
G
-
 
S
I
 
L
V
 
K
D
 
H
A
 
A
K
 
D
R
 
E
E
 
Q
N
 
Q
A
 
A
L
 
V
A
 
S
Q
 
D
T
 
F
Q
 
-
I
 
I
A
 
R
A
 
L
M
 
F
R
 
N
I
 
V
R
 
K
T
 
T
S
 
P
G
 
S
P
 
M
G
 
E
Q
 
Q
I
 
A
V
 
I
G
 
G
E
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
N
 
N
Q
 
Q
Q
 
Q
K
 
K
V
 
V
V
 
A
I
 
I
G
 
A
R
 
R
W
 
G
L
 
L
A
 
M
R
 
T
D
 
R
C
 
P
R
 
K
V
 
V
L
 
L
L
 
I
F
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
R
 
R
G
 
G
I
 
V
D
 
D
V
 
V
G
 
G
A
 
A
K
 
K
F
 
K
D
 
E
I
 
I
Y
 
Y
G
 
Q
L
 
L
M
 
I
G
 
N
A
 
Q
L
 
F
A
 
K
R
 
A
E
 
D
G
 
G
R
 
L
A
 
S
L
 
I
V
 
I
V
 
L
V
 
V
S
 
S
S
 
S
D
 
E
L
 
M
R
 
P
E
 
E
L
 
V
M
 
L
L
 
G
I
 
M
C
 
S
D
 
D
R
 
R
I
 
I
G
 
I
V
 
V
M
 
M
S
 
H
A
 
E
G
 
G
S
 
H
M
 
L
T
 
S
G
 
G
V
 
E
F
 
F
E
 
T
R
 
R
D
 
E
N
 
Q
W
 
A
S
 
T
Q
 
Q
D
 
E
A
 
V
L
 
L
L
 
M
A
 
A
A
 
A
A
 
A

7arlD Lolcde in complex with lipoprotein and adp (see paper)
33% identity, 41% coverage: 12:231/532 of query aligns to 2:221/222 of 7arlD

query
sites
7arlD
V
 
L
L
 
L
S
 
Q
V
 
C
S
 
D
G
 
N
I
 
L
G
 
C
K
 
K
T
 
R
Y
|
Y
A
 
Q
E
 
E
-
 
G
-
 
S
-
 
V
-
 
Q
-
 
T
P
 
D
V
 
V
L
 
L
A
 
H
D
 
N
I
 
V
S
 
S
L
 
F
S
 
S
L
 
V
R
 
G
A
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
M
L
 
M
A
 
A
L
 
I
T
 
V
G
 
G
E
 
S
N
 
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
S
 
L
K
 
H
I
 
L
I
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
L
V
 
D
E
 
T
P
 
P
T
 
T
A
 
S
G
 
G
T
 
D
M
 
V
Q
 
I
L
 
F
G
 
N
G
 
G
V
 
Q
P
 
P
Y
 
M
A
 
S
P
 
K
-
 
L
A
 
S
S
 
S
R
 
A
T
 
A
Q
 
K
A
 
A
E
 
E
A
 
L
L
 
R
G
 
N
V
 
Q
R
 
K
M
 
L
-
 
G
-
 
F
V
 
I
M
 
Y
Q
 
Q
E
 
F
L
 
H
N
 
H
L
 
L
L
 
L
P
 
P
T
 
D
L
 
F
S
 
T
V
 
A
A
 
L
E
 
E
N
 
N
L
 
V
F
 
A
L
 
M
N
 
P
R
 
L
L
 
L
P
 
-
R
 
-
A
 
I
G
 
G
A
 
K
F
 
K
S
 
K
F
 
P
G
 
A
W
 
E
I
 
I
D
 
N
R
 
S
R
 
R
K
 
A
L
 
L
R
 
-
E
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
-
Q
 
E
A
 
M
M
 
L
A
 
K
Q
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
D
A
 
H
I
 
-
D
 
R
P
 
A
D
 
N
T
 
H
L
 
R
V
 
P
G
 
S
E
 
E
L
 
L
G
 
S
I
 
G
G
 
G
H
 
E
Q
 
R
Q
 
Q
M
 
R
V
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
A
L
 
L
I
 
V
D
 
N
D
 
N
C
 
P
R
 
R
V
 
L
L
 
V
I
 
L
L
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
G
M
 
N
L
 
L
T
 
D
A
 
A
R
 
R
E
 
N
V
 
A
D
 
D
L
 
S
L
 
I
F
 
F
E
 
Q
Q
 
L
I
 
L
D
 
G
R
 
E
L
 
L
-
 
N
K
 
R
A
 
L
R
 
Q
G
 
G
V
 
T
A
 
A
L
 
F
V
 
L
Y
 
V
I
 
V
S
 
T
H
 
H
R
 
D
L
 
L
E
 
Q
E
 
L
L
 
A
A
 
K
R
 
R
V
 
M
A
 
S
E
 
R
Q
 
Q
I
 
L
A
 
E
V
 
-
L
 
M
R
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
R
L
 
L
V
 
T

P75957 Lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD; EC 7.6.2.- from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
33% identity, 41% coverage: 12:231/532 of query aligns to 5:224/233 of P75957

query
sites
P75957
V
 
L
L
 
L
S
 
Q
V
 
C
S
 
D
G
 
N
I
 
L
G
 
C
K
 
K
T
 
R
Y
 
Y
A
 
Q
E
 
E
-
 
G
-
 
S
-
 
V
-
 
Q
-
 
T
P
 
D
V
 
V
L
 
L
A
 
H
D
 
N
I
 
V
S
 
S
L
 
F
S
 
S
L
 
V
R
 
G
A
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
M
L
 
M
A
 
A
L
 
I
T
 
V
G
|
G
E
 
S
N
 
S
G
 
G
A
 
S
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
S
 
L
K
 
H
I
 
L
I
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
L
V
 
D
E
 
T
P
 
P
T
 
T
A
 
S
G
 
G
T
 
D
M
 
V
Q
 
I
L
 
F
G
 
N
G
 
G
V
 
Q
P
 
P
Y
 
M
A
 
S
P
 
K
-
 
L
A
 
S
S
 
S
R
 
A
T
 
A
Q
 
K
A
 
A
E
 
E
A
 
L
L
 
R
G
 
N
V
 
Q
R
 
K
M
 
L
-
 
G
-
 
F
V
 
I
M
 
Y
Q
 
Q
E
 
F
L
 
H
N
 
H
L
 
L
L
 
L
P
 
P
T
 
D
L
 
F
S
 
T
V
 
A
A
 
L
E
 
E
N
 
N
L
 
V
F
 
A
L
 
M
N
 
P
R
 
L
L
 
L
P
 
-
R
 
-
A
 
I
G
 
G
A
 
K
F
 
K
S
 
K
F
 
P
G
 
A
W
 
E
I
 
I
D
 
N
R
 
S
R
 
R
K
 
A
L
 
L
R
 
-
E
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
-
Q
 
E
A
 
M
M
 
L
A
 
K
Q
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
D
A
 
H
I
 
-
D
 
R
P
 
A
D
 
N
T
 
H
L
 
R
V
 
P
G
 
S
E
 
E
L
 
L
G
 
S
I
 
G
G
 
G
H
 
E
Q
 
R
Q
 
Q
M
 
R
V
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
A
L
 
L
I
 
V
D
 
N
D
 
N
C
 
P
R
 
R
V
 
L
L
 
V
I
 
L
L
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
G
M
 
N
L
 
L
T
 
D
A
 
A
R
 
R
E
 
N
V
 
A
D
 
D
L
 
S
L
 
I
F
 
F
E
 
Q
Q
 
L
I
 
L
D
 
G
R
 
E
L
 
L
-
 
N
K
 
R
A
 
L
R
 
Q
G
 
G
V
 
T
A
 
A
L
 
F
V
 
L
Y
 
V
I
 
V
S
 
T
H
 
H
R
 
D
L
 
L
E
 
Q
E
 
L
L
 
A
A
 
K
R
 
R
V
 
M
A
 
S
E
 
R
Q
 
Q
I
 
L
A
 
E
V
 
-
L
 
M
R
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
R
L
 
L
V
 
T

7mdyC Lolcde nucleotide-bound
33% identity, 41% coverage: 12:231/532 of query aligns to 2:221/226 of 7mdyC

query
sites
7mdyC
V
 
L
L
 
L
S
 
Q
V
 
C
S
 
D
G
 
N
I
 
L
G
 
C
K
 
K
T
 
R
Y
|
Y
A
 
Q
E
 
E
-
 
G
-
 
S
-
 
V
-
 
Q
-
x
T
P
 
D
V
|
V
L
 
L
A
 
H
D
 
N
I
 
V
S
 
S
L
 
F
S
 
S
L
 
V
R
 
G
A
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
M
L
 
M
A
 
A
L
 
I
T
 
V
G
 
G
E
x
S
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
S
 
L
K
 
H
I
 
L
I
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
L
V
 
D
E
 
T
P
 
P
T
 
T
A
 
S
G
 
G
T
 
D
M
 
V
Q
 
I
L
 
F
G
 
N
G
 
G
V
 
Q
P
 
P
Y
 
M
A
 
S
P
 
K
-
 
L
A
 
S
S
 
S
R
 
A
T
 
A
Q
 
K
A
 
A
E
 
E
A
 
L
L
 
R
G
 
N
V
 
Q
R
 
K
M
 
L
-
 
G
-
 
F
V
 
I
M
 
Y
Q
|
Q
E
 
F
L
 
H
N
 
H
L
 
L
L
 
L
P
 
P
T
 
D
L
 
F
S
 
T
V
 
A
A
 
L
E
 
E
N
 
N
L
 
V
F
 
A
L
 
M
N
 
P
R
 
L
L
 
L
P
 
-
R
 
-
A
 
I
G
 
G
A
 
K
F
 
K
S
 
K
F
 
P
G
 
A
W
 
E
I
 
I
D
 
N
R
 
S
R
 
R
K
 
A
L
 
L
R
 
-
E
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
-
Q
 
E
A
 
M
M
 
L
A
 
K
Q
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
D
A
 
H
I
 
-
D
x
R
P
 
A
D
 
N
T
x
H
L
 
R
V
 
P
G
 
S
E
|
E
L
 
L
G
x
S
I
x
G
G
|
G
H
x
E
Q
 
R
Q
 
Q
M
 
R
V
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
A
L
 
L
I
 
V
D
 
N
D
 
N
C
 
P
R
 
R
V
 
L
L
 
V
I
 
L
L
 
A
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
T
A
 
G
M
x
N
L
 
L
T
 
D
A
 
A
R
 
R
E
 
N
V
 
A
D
 
D
L
 
S
L
 
I
F
 
F
E
 
Q
Q
 
L
I
 
L
D
 
G
R
 
E
L
 
L
-
 
N
K
 
R
A
 
L
R
 
Q
G
 
G
V
 
T
A
 
A
L
 
F
V
 
L
Y
 
V
I
 
V
S
 
T
H
|
H
R
 
D
L
 
L
E
 
Q
E
 
L
L
 
A
A
 
K
R
 
R
V
 
M
A
 
S
E
 
R
Q
 
Q
I
 
L
A
 
E
V
 
-
L
 
M
R
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
R
L
 
L
V
 
T

7v8iD Lolcd(e171q)e with bound amppnp in nanodiscs
32% identity, 41% coverage: 12:231/532 of query aligns to 4:223/229 of 7v8iD

query
sites
7v8iD
V
 
L
L
 
L
S
 
Q
V
 
C
S
 
D
G
 
N
I
 
L
G
 
C
K
 
K
T
 
R
Y
 
Y
A
 
Q
E
 
E
-
 
G
-
 
S
-
 
V
-
 
Q
-
 
T
P
 
D
V
|
V
L
 
L
A
 
H
D
 
N
I
 
V
S
 
S
L
 
F
S
 
S
L
 
V
R
 
G
A
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
M
L
 
M
A
 
A
L
 
I
T
 
V
G
 
G
E
 
S
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
S
 
L
K
 
H
I
 
L
I
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
L
V
 
D
E
 
T
P
 
P
T
 
T
A
 
S
G
 
G
T
 
D
M
 
V
Q
 
I
L
 
F
G
 
N
G
 
G
V
 
Q
P
 
P
Y
 
M
A
 
S
P
 
K
-
 
L
A
 
S
S
 
S
R
 
A
T
 
A
Q
 
K
A
 
A
E
 
E
A
 
L
L
 
R
G
 
N
V
 
Q
R
 
K
M
 
L
-
 
G
-
 
F
V
 
I
M
 
Y
Q
|
Q
E
 
F
L
 
H
N
 
H
L
 
L
L
 
L
P
 
P
T
 
D
L
 
F
S
 
T
V
 
A
A
 
L
E
 
E
N
 
N
L
 
V
F
 
A
L
 
M
N
 
P
R
 
L
L
 
L
P
 
-
R
 
-
A
 
I
G
 
G
A
 
K
F
 
K
S
 
K
F
 
P
G
 
A
W
 
E
I
 
I
D
 
N
R
 
S
R
 
R
K
 
A
L
 
L
R
 
-
E
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
-
Q
 
E
A
 
M
M
 
L
A
 
K
Q
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
D
A
 
H
I
 
-
D
x
R
P
 
A
D
 
N
T
x
H
L
 
R
V
 
P
G
 
S
E
|
E
L
|
L
G
x
S
I
x
G
G
|
G
H
x
E
Q
 
R
Q
 
Q
M
 
R
V
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
A
L
 
L
I
 
V
D
 
N
D
 
N
C
 
P
R
 
R
V
 
L
L
 
V
I
 
L
L
 
A
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
T
A
 
G
M
x
N
L
 
L
T
 
D
A
 
A
R
 
R
E
 
N
V
 
A
D
 
D
L
 
S
L
 
I
F
 
F
E
 
Q
Q
 
L
I
 
L
D
 
G
R
 
E
L
 
L
-
 
N
K
 
R
A
 
L
R
 
Q
G
 
G
V
 
T
A
 
A
L
 
F
V
 
L
Y
 
V
I
 
V
S
 
T
H
|
H
R
 
D
L
 
L
E
 
Q
E
 
L
L
 
A
A
 
K
R
 
R
V
 
M
A
 
S
E
 
R
Q
 
Q
I
 
L
A
 
E
V
 
-
L
 
M
R
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
R
L
 
L
V
 
T

P07821 Iron(3+)-hydroxamate import ATP-binding protein FhuC; Ferric hydroxamate uptake protein C; Ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC; Iron(III)-hydroxamate import ATP-binding protein FhuC; EC 7.2.2.16 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
33% identity, 43% coverage: 26:254/532 of query aligns to 26:250/265 of P07821

query
sites
P07821
V
 
L
L
 
L
A
 
H
D
 
P
I
 
L
S
 
S
L
 
L
S
 
T
L
 
F
R
 
P
A
 
A
G
 
G
E
 
K
V
 
V
L
 
T
A
 
G
L
 
L
T
 
I
G
 
G
E
 
H
N
 
N
G
 
G
A
 
S
G
 
G
K
|
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
S
 
L
K
 
K
I
 
M
I
 
L
G
 
G
G
 
R
L
 
H
V
 
Q
E
 
P
P
 
P
T
 
S
A
 
E
G
 
G
T
 
E
M
 
I
Q
 
L
L
 
L
G
 
D
G
 
A
V
 
Q
P
 
P
Y
 
L
A
 
E
P
 
S
A
 
W
S
 
S
R
 
-
T
 
S
Q
 
K
A
 
A
E
 
F
A
 
A
L
 
R
G
 
K
V
 
V
R
 
A
M
 
Y
V
 
L
M
 
P
Q
 
Q
E
 
Q
L
 
L
N
 
P
L
 
P
L
 
A
P
 
E
T
 
G
L
 
M
S
 
T
V
 
V
A
 
R
E
 
E
N
 
L
L
 
V
F
 
A
L
 
I
N
 
G
R
 
R
L
 
Y
P
 
P
R
 
W
A
 
H
G
 
G
A
 
A
F
 
L
S
 
G
-
 
R
F
 
F
G
 
G
W
 
A
I
 
A
D
 
D
R
 
R
R
 
E
K
 
K
L
 
V
R
 
E
E
 
E
D
 
-
A
 
-
R
 
-
Q
 
-
A
 
A
M
 
I
A
 
S
Q
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
K
A
 
P
I
 
L
D
 
A
P
 
-
D
 
H
T
 
R
L
 
L
V
 
V
G
 
D
E
 
S
L
 
L
G
 
S
I
 
G
G
 
G
H
 
E
Q
 
R
Q
 
Q
M
 
R
V
 
A
E
 
W
I
 
I
A
 
A
R
 
M
N
 
L
L
 
V
I
 
A
D
 
Q
D
 
D
C
 
S
R
 
R
V
 
C
L
 
L
I
 
L
L
 
L
D
|
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
S
M
 
A
L
 
L
-
 
D
T
 
I
A
 
A
R
 
H
E
 
Q
V
 
V
D
 
D
L
 
V
L
 
L
F
 
-
E
 
S
Q
 
L
I
 
V
D
 
H
R
 
R
L
 
L
-
 
S
K
 
Q
A
 
E
R
 
R
G
 
G
V
 
L
A
 
T
L
 
V
V
 
I
Y
 
A
I
 
V
S
 
L
H
 
H
R
 
D
L
 
I
E
 
N
E
 
M
L
 
A
A
 
A
R
 
R
V
 
Y
A
 
C
E
 
D
Q
 
Y
I
 
L
A
 
V
V
 
A
L
 
L
R
 
R
D
 
G
G
 
G
R
 
E
L
 
M
V
 
I
H
 
A
V
 
Q
D
 
G
A
 
T
M
 
P
A
 
A
N
 
E
L
 
I
T
 
M
S
 
R
D
 
G
E
 
E
I
 
T
V
 
L
T
 
E
W
 
M
M
 
I
V
 
Y
G
 
G
R
 
I
E
 
P
L
 
M
G
 
G

7w78A Heme exporter hrtba in complex with mg-amppnp (see paper)
33% identity, 41% coverage: 12:229/532 of query aligns to 4:214/218 of 7w78A

query
sites
7w78A
V
 
V
L
 
L
S
 
S
V
 
I
S
 
T
G
 
N
I
 
A
G
 
S
K
 
V
T
 
V
Y
|
Y
A
 
P
E
 
D
P
 
G
V
 
I
-
 
S
-
 
T
-
x
V
-
 
T
-
x
A
L
 
L
A
 
D
D
 
S
I
 
A
S
 
N
L
 
V
S
 
E
L
 
I
R
 
F
A
 
P
G
 
G
E
 
E
V
 
L
L
 
V
A
 
A
L
 
I
T
 
V
G
 
G
E
|
E
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
S
 
L
K
 
S
I
 
I
I
 
A
G
 
G
G
 
F
L
 
L
V
 
Q
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
S
G
 
G
T
 
T
M
 
V
Q
 
T
L
 
L
G
 
H
G
 
G
V
 
A
P
 
E
Y
 
G
A
 
L
P
 
D
A
 
A
S
 
T
R
 
S
T
 
T
Q
 
R
A
 
R
E
 
E
A
 
H
L
 
I
G
 
G
V
 
-
R
 
-
M
 
F
V
 
V
M
 
F
Q
|
Q
E
 
Q
L
 
P
N
 
N
L
 
L
L
 
L
P
 
G
T
 
S
L
 
L
S
 
T
V
 
A
A
 
R
E
 
E
N
 
Q
L
 
L
F
 
L
L
 
I
N
 
T
R
 
D
L
 
H
P
 
L
R
 
R
A
 
G
G
 
-
A
 
-
F
 
-
S
 
-
F
 
-
G
 
-
W
 
-
I
 
I
D
 
K
R
 
P
R
 
R
K
 
K
L
 
D
R
 
R
E
 
A
D
 
D
A
 
-
R
 
-
Q
 
E
A
 
L
M
 
L
A
 
A
Q
 
R
V
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
K
A
 
G
I
 
L
D
 
G
P
 
-
D
 
G
T
 
R
L
 
R
V
 
V
G
 
A
E
 
Q
L
 
L
G
 
S
I
 
G
G
 
G
H
 
Q
Q
 
R
Q
 
Q
M
 
R
V
 
V
E
 
N
I
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
A
L
 
L
I
 
M
D
 
G
D
 
N
C
 
P
R
 
Q
V
 
L
L
 
L
I
 
L
L
 
A
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
T
A
 
S
M
 
A
L
 
L
T
 
D
A
 
A
R
 
R
E
 
L
V
 
S
D
 
K
L
 
E
L
 
I
F
 
V
E
 
E
Q
 
L
I
 
L
-
 
R
D
 
D
R
 
V
L
 
T
K
 
K
A
 
E
R
 
F
G
 
A
V
 
L
A
 
A
L
 
T
V
 
L
Y
 
M
I
 
V
S
 
T
H
|
H
R
 
D
L
 
R
E
 
S
E
 
Q
L
 
L
A
 
A
R
 
-
V
 
Y
A
 
A
E
 
D
Q
 
R
I
 
F
A
 
V
V
 
E
L
 
M
R
 
A
D
 
D
G
 
G
R
 
K

7w79A Heme exporter hrtba in complex with mn-amppnp (see paper)
33% identity, 41% coverage: 12:229/532 of query aligns to 4:214/216 of 7w79A

query
sites
7w79A
V
 
V
L
 
L
S
|
S
V
 
I
S
 
T
G
 
N
I
 
A
G
 
S
K
 
V
T
 
V
Y
|
Y
A
 
P
E
 
D
P
 
G
V
 
I
-
 
S
-
 
T
-
x
V
-
 
T
-
x
A
L
 
L
A
 
D
D
 
S
I
 
A
S
 
N
L
 
V
S
x
E
L
 
I
R
 
F
A
 
P
G
 
G
E
 
E
V
 
L
L
 
V
A
 
A
L
 
I
T
 
V
G
 
G
E
|
E
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
S
 
L
K
 
S
I
 
I
I
 
A
G
 
G
G
 
F
L
 
L
V
 
Q
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
S
G
 
G
T
 
T
M
 
V
Q
 
T
L
 
L
G
 
H
G
 
G
V
 
A
P
 
E
Y
 
G
A
 
L
P
 
D
A
 
A
S
 
T
R
 
S
T
 
T
Q
 
R
A
 
R
E
 
E
A
 
H
L
 
I
G
 
G
V
 
-
R
 
-
M
 
F
V
 
V
M
 
F
Q
|
Q
E
 
Q
L
 
P
N
 
N
L
 
L
L
 
L
P
 
G
T
 
S
L
 
L
S
 
T
V
 
A
A
 
R
E
 
E
N
 
Q
L
 
L
F
 
L
L
 
I
N
 
T
R
 
D
L
 
H
P
 
L
R
 
R
A
 
G
G
 
-
A
 
-
F
 
-
S
 
-
F
 
-
G
 
-
W
 
-
I
 
I
D
 
K
R
 
P
R
 
R
K
 
K
L
 
D
R
 
R
E
 
A
D
 
D
A
 
-
R
 
-
Q
 
E
A
 
L
M
 
L
A
 
A
Q
 
R
V
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
K
A
 
G
I
 
L
D
 
G
P
 
-
D
 
G
T
 
R
L
 
R
V
 
V
G
 
A
E
 
Q
L
 
L
G
 
S
I
 
G
G
 
G
H
 
Q
Q
 
R
Q
 
Q
M
 
R
V
 
V
E
 
N
I
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
A
L
 
L
I
 
M
D
 
G
D
 
N
C
 
P
R
 
Q
V
 
L
L
 
L
I
 
L
L
 
A
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
T
A
 
S
M
 
A
L
 
L
T
 
D
A
 
A
R
 
R
E
 
L
V
 
S
D
 
K
L
 
E
L
 
I
F
 
V
E
 
E
Q
 
L
I
 
L
-
 
R
D
 
D
R
 
V
L
 
T
K
 
K
A
 
E
R
 
F
G
 
A
V
 
L
A
 
A
L
 
T
V
 
L
Y
 
M
I
 
V
S
 
T
H
|
H
R
 
D
L
 
R
E
 
S
E
 
Q
L
 
L
A
 
A
R
 
-
V
 
Y
A
 
A
E
 
D
Q
 
R
I
 
F
A
 
V
V
 
E
L
 
M
R
 
A
D
 
D
G
 
G
R
 
K

5lilA Structure of aggregatibacter actinomycetemcomitans macb bound to atpys (p21) (see paper)
32% identity, 39% coverage: 26:231/532 of query aligns to 22:221/615 of 5lilA

query
sites
5lilA
V
|
V
L
 
L
A
 
K
D
 
D
I
 
I
S
 
S
L
 
L
S
 
S
L
 
I
R
 
E
A
 
R
G
 
G
E
 
D
V
 
F
L
 
V
A
 
A
L
 
I
T
 
M
G
 
G
E
 
Q
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
S
 
M
K
 
N
I
 
I
I
 
I
G
 
G
G
 
C
L
 
L
V
 
D
E
 
T
P
 
A
T
 
T
A
 
G
G
 
G
T
 
S
M
 
S
Q
 
K
L
 
I
G
 
D
G
 
G
V
 
K
P
 
E
Y
 
T
A
 
I
P
 
E
A
 
L
S
 
T
R
 
N
T
 
D
Q
 
Q
A
 
L
E
 
S
A
 
D
L
 
L
G
 
R
V
 
S
R
 
Q
-
 
K
-
 
F
-
 
G
M
 
F
V
 
I
M
 
F
Q
|
Q
E
 
R
L
 
Y
N
 
N
L
 
L
L
 
L
P
 
S
T
 
S
L
 
L
S
 
T
V
 
A
A
 
A
E
 
E
N
 
N
L
 
V
F
 
-
L
 
-
N
 
-
R
 
A
L
 
L
P
 
P
R
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
A
F
 
I
S
 
Y
F
 
A
G
 
G
W
 
M
I
 
P
D
 
Q
R
 
S
R
 
Q
K
 
R
L
 
L
R
 
-
E
 
E
D
 
R
A
 
A
R
 
K
Q
 
Q
A
 
L
M
 
L
A
 
E
Q
 
K
V
 
L
G
 
G
L
 
L
D
 
G
-
 
D
-
x
K
-
 
W
A
 
Q
I
x
N
D
 
K
P
 
P
D
 
N
T
x
Q
L
|
L
V
x
S
G
|
G
E
 
-
L
 
-
G
 
-
I
 
-
G
|
G
H
x
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
M
 
R
V
 
V
E
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
A
L
 
L
I
 
M
D
 
N
D
 
G
C
 
G
R
 
E
V
 
I
L
 
I
I
 
L
L
 
A
D
|
D
E
x
Q
P
 
P
T
 
T
A
 
G
M
x
A
L
 
L
T
 
D
A
 
S
R
 
H
E
 
S
V
 
G
D
 
E
L
 
N
L
 
V
F
 
M
E
 
E
Q
 
I
I
 
L
D
 
R
R
 
Q
L
 
L
K
 
H
A
 
E
R
 
E
G
 
G
V
 
H
A
 
T
L
 
I
V
 
I
Y
 
M
I
 
V
S
 
T
H
|
H
R
 
D
L
 
-
E
 
K
E
 
H
L
 
I
A
 
A
R
 
A
V
 
S
A
 
A
E
 
N
Q
 
R
I
 
I
A
 
I
V
 
E
L
 
I
R
 
K
D
 
D
G
 
G
R
 
E
L
 
I
V
 
I

Sites not aligning to the query:

5lj7A Structure of aggregatibacter actinomycetemcomitans macb bound to atp (p21) (see paper)
32% identity, 39% coverage: 26:231/532 of query aligns to 22:221/592 of 5lj7A

query
sites
5lj7A
V
|
V
L
 
L
A
 
K
D
 
D
I
 
I
S
 
S
L
 
L
S
 
S
L
 
I
R
 
E
A
 
R
G
 
G
E
 
D
V
 
F
L
 
V
A
 
A
L
 
I
T
 
M
G
 
G
E
 
Q
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
S
 
M
K
 
N
I
 
I
I
 
I
G
 
G
G
 
C
L
 
L
V
 
D
E
 
T
P
 
A
T
 
T
A
 
G
G
 
G
T
 
S
M
 
S
Q
 
K
L
 
I
G
 
D
G
 
G
V
 
K
P
 
E
Y
 
T
A
 
I
P
 
E
A
 
L
S
 
T
R
 
N
T
 
D
Q
 
Q
A
 
L
E
 
S
A
 
D
L
 
L
G
 
R
V
 
S
R
 
Q
-
 
K
-
 
F
-
 
G
M
 
F
V
 
I
M
 
F
Q
|
Q
E
 
R
L
 
Y
N
 
N
L
 
L
L
 
L
P
 
S
T
 
S
L
 
L
S
 
T
V
 
A
A
 
A
E
 
E
N
 
N
L
 
V
F
 
-
L
 
-
N
 
-
R
 
A
L
 
L
P
 
P
R
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
A
F
 
I
S
 
Y
F
 
A
G
 
G
W
 
M
I
 
P
D
 
Q
R
 
S
R
 
Q
K
 
R
L
 
L
R
 
-
E
 
E
D
 
R
A
 
A
R
 
K
Q
 
Q
A
 
L
M
 
L
A
 
E
Q
 
K
V
 
L
G
 
G
L
 
L
D
 
G
-
 
D
-
x
K
-
 
W
A
 
Q
I
 
N
D
 
K
P
 
P
D
x
N
T
x
Q
L
|
L
V
x
S
G
|
G
E
 
-
L
 
-
G
 
-
I
 
-
G
|
G
H
x
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
M
 
R
V
 
V
E
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
A
L
 
L
I
 
M
D
 
N
D
 
G
C
 
G
R
 
E
V
 
I
L
 
I
I
 
L
L
 
A
D
|
D
E
x
Q
P
 
P
T
 
T
A
 
G
M
x
A
L
 
L
T
 
D
A
 
S
R
 
H
E
 
S
V
 
G
D
 
E
L
 
N
L
 
V
F
 
M
E
 
E
Q
 
I
I
 
L
D
 
R
R
 
Q
L
 
L
K
 
H
A
 
E
R
 
E
G
 
G
V
 
H
A
 
T
L
 
I
V
 
I
Y
 
M
I
 
V
S
 
T
H
|
H
R
 
D
L
 
-
E
 
K
E
 
H
L
 
I
A
 
A
R
 
A
V
 
S
A
 
A
E
 
N
Q
 
R
I
 
I
A
 
I
V
 
E
L
 
I
R
 
K
D
 
D
G
 
G
R
 
E
L
 
I
V
 
I

Sites not aligning to the query:

1g6hA Crystal structure of the adp conformation of mj1267, an atp- binding cassette of an abc transporter (see paper)
26% identity, 41% coverage: 12:231/532 of query aligns to 4:229/254 of 1g6hA

query
sites
1g6hA
V
 
I
L
 
L
S
 
R
V
 
T
S
 
E
G
 
N
I
 
I
G
 
V
K
 
K
T
 
Y
Y
x
F
A
 
G
E
 
E
-
x
F
P
 
K
V
 
A
L
 
L
A
 
D
D
 
G
I
 
V
S
 
S
L
 
I
S
 
S
L
 
V
R
 
N
A
 
K
G
 
G
E
 
D
V
 
V
L
 
T
A
 
L
L
 
I
T
 
I
G
 
G
E
 
P
N
|
N
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
S
 
I
K
 
N
I
 
V
I
 
I
G
 
T
G
 
G
L
 
F
V
 
L
E
 
K
P
 
A
T
 
D
A
 
E
G
 
G
T
 
R
M
 
V
Q
 
Y
L
 
F
G
 
E
G
 
N
V
 
K
P
 
D
Y
 
I
A
 
T
P
 
N
A
 
K
S
 
E
R
 
P
T
 
A
Q
 
E
A
 
L
E
 
Y
A
 
H
L
 
Y
G
 
G
V
 
I
R
 
V
M
 
R
V
 
T
M
 
F
Q
 
Q
E
 
T
L
 
P
N
 
Q
L
 
P
L
 
L
P
 
K
T
 
E
L
 
M
S
 
T
V
 
V
A
 
L
E
 
E
N
 
N
L
 
L
F
 
L
L
 
I
N
 
G
R
 
E
L
 
I
-
 
C
-
 
P
-
 
G
-
 
E
-
 
S
P
 
P
R
 
L
A
 
N
G
 
S
A
 
L
F
 
F
S
 
Y
F
 
K
G
 
K
W
 
W
I
 
I
D
 
P
R
 
K
R
 
E
K
 
E
-
 
E
L
 
M
R
 
V
E
 
E
D
 
K
A
 
A
R
 
F
Q
 
K
A
 
I
M
 
L
A
 
E
Q
 
F
V
 
L
G
 
K
L
 
L
D
 
S
A
 
H
I
 
L
D
 
Y
P
 
-
D
 
D
T
 
R
L
 
K
V
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
L
G
 
S
I
 
G
G
 
G
H
 
Q
Q
 
M
Q
 
K
M
 
L
V
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
G
R
 
R
N
 
A
L
 
L
I
 
M
D
 
T
D
 
N
C
 
P
R
 
K
V
 
M
L
 
I
I
 
V
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
I
A
 
A
M
 
G
L
 
V
T
 
A
A
 
P
R
 
G
E
 
L
V
 
A
D
 
H
L
 
D
L
 
I
F
 
F
E
 
N
Q
 
H
I
 
V
D
 
L
R
 
E
L
 
L
K
 
K
A
 
A
R
 
K
G
 
G
V
 
I
A
 
T
L
 
F
V
 
L
Y
 
I
I
 
I
S
 
E
H
 
H
R
 
R
L
 
L
E
 
D
E
 
I
L
 
V
A
 
L
R
 
N
V
 
Y
A
 
I
E
 
D
Q
 
H
I
 
L
A
 
Y
V
 
V
L
 
M
R
 
F
D
 
N
G
 
G
R
 
Q
L
 
I
V
 
I

1g9xB Characterization of the twinning structure of mj1267, an atp-binding cassette of an abc transporter (see paper)
26% identity, 41% coverage: 12:231/532 of query aligns to 4:229/253 of 1g9xB

query
sites
1g9xB
V
 
I
L
 
L
S
 
R
V
 
T
S
 
E
G
 
N
I
 
I
G
 
V
K
 
K
T
 
Y
Y
x
F
A
 
G
E
 
E
-
x
F
P
 
K
V
 
A
L
 
L
A
 
D
D
 
G
I
 
V
S
 
S
L
 
I
S
 
S
L
 
V
R
 
C
A
 
K
G
 
G
E
 
D
V
 
V
L
 
T
A
 
L
L
 
I
T
 
I
G
 
G
E
 
P
N
|
N
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
S
 
I
K
 
N
I
 
V
I
 
I
G
 
T
G
 
G
L
 
F
V
 
L
E
 
K
P
 
A
T
 
D
A
 
E
G
 
G
T
 
R
M
 
V
Q
 
Y
L
 
F
G
 
E
G
 
N
V
 
K
P
 
D
Y
 
I
A
 
T
P
 
N
A
 
K
S
 
E
R
 
P
T
 
A
Q
 
E
A
 
L
E
 
Y
A
 
H
L
 
Y
G
 
G
V
 
I
R
 
V
M
 
R
V
 
T
M
 
F
Q
 
Q
E
 
T
L
 
P
N
 
Q
L
 
P
L
 
L
P
 
K
T
 
E
L
 
M
S
 
T
V
 
V
A
 
L
E
 
E
N
 
N
L
 
L
F
 
L
L
 
I
N
 
G
R
 
E
L
 
I
-
 
N
-
 
P
-
 
G
-
 
E
-
 
S
P
 
P
R
 
L
A
 
N
G
 
S
A
 
L
F
 
F
S
 
Y
F
 
K
G
 
K
W
 
W
I
 
I
D
 
P
R
 
K
R
 
E
K
 
E
-
 
E
L
 
M
R
 
V
E
 
E
D
 
K
A
 
A
R
 
F
Q
 
K
A
 
I
M
 
L
A
 
E
Q
 
F
V
 
L
G
 
K
L
 
L
D
 
S
A
 
H
I
 
L
D
 
Y
P
 
-
D
 
D
T
 
R
L
 
K
V
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
L
G
 
S
I
 
G
G
 
G
H
 
Q
Q
 
M
Q
 
K
M
 
L
V
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
G
R
 
R
N
 
A
L
 
L
I
 
M
D
 
T
D
 
N
C
 
P
R
 
K
V
 
M
L
 
I
I
 
V
L
 
M
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
I
A
 
A
M
 
G
L
 
V
T
 
A
A
 
P
R
 
G
E
 
L
V
 
A
D
 
H
L
 
D
L
 
I
F
 
F
E
 
N
Q
 
H
I
 
V
D
 
L
R
 
E
L
 
L
K
 
K
A
 
A
R
 
K
G
 
G
V
 
I
A
 
T
L
 
F
V
 
L
Y
 
I
I
 
I
S
 
E
H
 
H
R
 
R
L
 
L
E
 
D
E
 
I
L
 
V
A
 
L
R
 
N
V
 
Y
A
 
I
E
 
D
Q
 
H
I
 
L
A
 
Y
V
 
V
L
 
M
R
 
F
D
 
N
G
 
G
R
 
Q
L
 
I
V
 
I

P19566 Maltose/maltodextrin import ATP-binding protein MalK; EC 7.5.2.1 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
32% identity, 45% coverage: 11:250/532 of query aligns to 2:235/369 of P19566

query
sites
P19566
A
 
A
V
 
S
L
 
V
S
 
Q
V
 
L
S
 
R
G
 
N
I
 
V
G
 
T
K
 
K
T
 
A
Y
 
W
A
 
G
E
 
D
P
 
V
V
 
V
L
 
V
A
 
S
-
 
K
D
 
D
I
 
I
S
 
N
L
 
L
S
 
D
L
 
I
R
 
H
A
 
D
G
 
G
E
 
E
V
 
F
L
 
V
A
 
V
L
 
F
T
 
V
G
 
G
E
 
P
N
 
S
G
 
G
A
 
C
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
S
 
L
K
 
R
I
 
M
I
 
I
G
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
E
E
 
T
P
 
I
T
 
T
A
 
S
G
 
G
T
 
D
M
 
L
Q
 
F
L
 
I
G
 
G
-
 
E
-
 
T
-
 
R
-
 
M
-
 
N
G
 
D
V
 
I
P
 
P
Y
 
-
A
 
-
P
 
P
A
 
A
S
 
E
R
 
R
T
 
-
Q
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
G
V
 
V
R
 
G
M
 
M
V
 
V
M
 
F
Q
 
Q
E
 
S
L
 
Y
N
 
A
L
|
L
L
 
Y
P
 
P
T
 
H
L
 
L
S
 
S
V
 
V
A
 
A
E
 
E
N
 
N
L
 
M
F
 
-
L
 
-
N
 
-
R
 
-
L
 
-
P
 
-
R
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
F
 
-
S
 
S
F
 
F
G
 
G
W
 
L
I
 
K
D
 
L
R
 
A
R
 
G
K
 
A
L
 
K
R
 
K
E
 
E
D
 
V
A
 
M
R
 
N
Q
 
Q
A
 
R
M
 
V
A
 
N
Q
 
Q
V
 
V
G
 
A
-
 
E
-
 
V
-
 
L
-
 
Q
-
 
L
-
 
A
-
 
H
L
 
L
D
 
L
A
 
E
I
 
R
D
 
K
P
 
P
D
 
K
T
 
A
L
 
L
V
 
S
G
 
G
E
 
-
L
 
-
G
 
-
I
 
-
G
 
G
H
 
Q
Q
 
R
Q
 
Q
M
 
R
V
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
G
R
 
R
N
 
T
L
 
L
I
 
V
D
 
A
D
 
E
C
 
P
R
 
R
V
 
V
L
 
F
I
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
|
P
T
 
L
A
 
S
M
 
N
L
 
L
T
x
D
A
 
A
R
 
A
E
 
L
V
 
R
D
 
V
L
 
Q
L
 
M
F
 
R
E
 
I
Q
 
E
I
 
I
D
 
S
R
 
R
L
 
L
K
 
H
A
 
K
R
 
R
-
 
L
G
 
G
V
 
R
A
 
T
L
 
M
V
 
I
Y
 
Y
I
 
V
S
 
T
H
 
H
R
 
D
L
 
Q
E
 
V
E
 
E
L
 
A
A
 
M
R
 
T
V
 
L
A
 
A
E
 
D
Q
 
K
I
 
I
A
 
V
V
 
V
L
 
L
R
 
D
D
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
V
V
 
A
H
 
Q
V
 
V
D
 
G
A
 
K
-
 
P
-
 
L
-
 
E
M
 
L
A
 
Y
N
 
H
L
 
Y
T
 
P
S
 
A
D
 
D
E
 
R
I
 
F
V
 
V
T
 
A
W
 
G
M
 
F
V
 
I
G
 
G

Sites not aligning to the query:

2awnB Crystal structure of the adp-mg-bound e. Coli malk (crystallized with atp-mg) (see paper)
32% identity, 45% coverage: 11:250/532 of query aligns to 1:234/374 of 2awnB

query
sites
2awnB
A
 
A
V
 
S
L
 
V
S
 
Q
V
 
L
S
 
Q
G
 
N
I
 
V
G
 
T
K
 
K
T
 
A
Y
x
W
A
 
G
E
 
E
P
 
V
V
 
V
L
x
V
A
 
S
-
 
K
D
 
D
I
 
I
S
 
N
L
 
L
S
 
D
L
 
I
R
 
H
A
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
F
L
 
V
A
 
V
L
 
F
T
 
V
G
 
G
E
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
S
 
L
K
 
R
I
 
M
I
 
I
G
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
E
E
 
T
P
 
I
T
 
T
A
 
S
G
 
G
T
 
D
M
 
L
Q
 
F
L
 
I
G
 
G
G
 
E
V
 
K
-
 
R
-
 
M
-
 
N
P
 
D
Y
 
T
A
 
P
P
 
P
A
 
A
S
 
E
R
 
R
T
 
-
Q
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
G
V
 
V
R
 
G
M
 
M
V
 
V
M
 
F
Q
 
Q
E
 
S
L
 
Y
N
 
A
L
 
L
L
 
Y
P
 
P
T
 
H
L
 
L
S
 
S
V
 
V
A
 
A
E
 
E
N
 
N
L
 
M
F
 
-
L
 
-
N
 
-
R
 
-
L
 
-
P
 
-
R
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
F
 
-
S
 
S
F
 
F
G
 
G
W
 
L
I
 
K
D
 
L
R
 
A
R
 
G
K
 
A
L
 
K
R
 
K
E
 
E
D
 
V
A
 
I
R
 
N
Q
 
Q
A
 
R
M
 
V
A
 
N
Q
 
Q
V
 
V
G
 
A
-
 
E
-
 
V
-
 
L
-
 
Q
-
 
L
-
 
A
-
 
H
-
 
L
L
 
L
D
 
D
A
 
R
I
 
-
D
 
K
P
 
P
D
 
K
T
 
A
L
 
L
V
 
S
G
 
G
E
 
-
L
 
-
G
 
-
I
 
-
G
 
G
H
 
Q
Q
 
R
Q
 
Q
M
 
R
V
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
G
R
 
R
N
 
T
L
 
L
I
 
V
D
 
A
D
 
E
C
 
P
R
 
S
V
 
V
L
 
F
I
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
L
A
 
S
M
 
N
L
 
L
T
 
D
A
 
A
R
 
A
E
 
L
V
 
R
D
 
V
L
 
Q
L
 
M
F
 
R
E
 
I
Q
 
E
I
 
I
D
 
S
R
 
R
L
 
L
K
 
H
A
 
K
R
 
R
-
 
L
G
 
G
V
 
R
A
 
T
L
 
M
V
 
I
Y
 
Y
I
 
V
S
 
T
H
 
H
R
 
D
L
 
Q
E
 
V
E
 
E
L
 
A
A
 
M
R
 
T
V
 
L
A
 
A
E
 
D
Q
 
K
I
 
I
A
 
V
V
 
V
L
 
L
R
 
D
D
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
V
V
 
A
H
 
Q
V
 
V
D
 
G
A
 
K
-
 
P
-
 
L
-
 
E
M
 
L
A
 
Y
N
 
H
L
 
Y
T
 
P
S
 
A
D
 
D
E
 
R
I
 
F
V
 
V
T
 
A
W
 
G
M
 
F
V
 
I
G
 
G

3puyA Crystal structure of an outward-facing mbp-maltose transporter complex bound to amp-pnp after crystal soaking of the pretranslocation state (see paper)
32% identity, 45% coverage: 11:250/532 of query aligns to 1:234/371 of 3puyA

query
sites
3puyA
A
 
A
V
 
S
L
 
V
S
 
Q
V
 
L
S
 
Q
G
 
N
I
 
V
G
 
T
K
 
K
T
 
A
Y
x
W
A
 
G
E
 
E
P
 
V
V
 
V
L
x
V
A
 
S
-
 
K
D
 
D
I
 
I
S
 
N
L
 
L
S
 
D
L
 
I
R
 
H
A
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
F
L
 
V
A
 
V
L
 
F
T
 
V
G
 
G
E
x
P
N
x
S
G
|
G
A
x
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
S
 
L
K
 
R
I
 
M
I
 
I
G
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
E
E
 
T
P
 
I
T
 
T
A
 
S
G
 
G
T
 
D
M
 
L
Q
 
F
L
 
I
G
 
G
G
 
E
V
 
K
-
 
R
-
 
M
-
 
N
P
 
D
Y
 
T
A
 
P
P
 
P
A
 
A
S
 
E
R
 
R
T
 
-
Q
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
G
V
 
V
R
 
G
M
 
M
V
 
V
M
 
F
Q
|
Q
E
 
S
L
 
Y
N
 
A
L
 
L
L
 
Y
P
 
P
T
 
H
L
 
L
S
 
S
V
 
V
A
 
A
E
 
E
N
 
N
L
 
M
F
 
-
L
 
-
N
 
-
R
 
-
L
 
-
P
 
-
R
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
F
 
-
S
 
S
F
 
F
G
 
G
W
 
L
I
 
K
D
 
L
R
 
A
R
 
G
K
 
A
L
 
K
R
 
K
E
 
E
D
 
V
A
 
I
R
 
N
Q
 
Q
A
 
R
M
 
V
A
 
N
Q
 
Q
V
 
V
G
 
A
-
 
E
-
 
V
-
 
L
-
 
Q
-
 
L
-
 
A
-
 
H
-
 
L
L
 
L
D
 
D
A
x
R
I
 
-
D
 
K
P
 
P
D
 
K
T
x
A
L
 
L
V
x
S
G
|
G
E
 
-
L
 
-
G
 
-
I
 
-
G
|
G
H
x
Q
Q
 
R
Q
 
Q
M
 
R
V
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
G
R
 
R
N
 
T
L
 
L
I
 
V
D
 
A
D
 
E
C
 
P
R
 
S
V
 
V
L
 
F
I
 
L
L
 
L
D
|
D
E
|
E
P
 
P
T
 
L
A
 
S
M
 
N
L
 
L
T
 
D
A
 
A
R
 
A
E
 
L
V
 
R
D
 
V
L
 
Q
L
 
M
F
 
R
E
 
I
Q
 
E
I
 
I
D
 
S
R
 
R
L
 
L
K
 
H
A
 
K
R
 
R
-
 
L
G
 
G
V
 
R
A
 
T
L
 
M
V
 
I
Y
 
Y
I
 
V
S
 
T
H
|
H
R
 
D
L
 
Q
E
 
V
E
 
E
L
 
A
A
 
M
R
 
T
V
 
L
A
 
A
E
 
D
Q
 
K
I
 
I
A
 
V
V
 
V
L
 
L
R
 
D
D
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
V
V
 
A
H
 
Q
V
 
V
D
 
G
A
 
K
-
 
P
-
 
L
-
 
E
M
 
L
A
 
Y
N
 
H
L
 
Y
T
 
P
S
 
A
D
 
D
E
 
R
I
 
F
V
 
V
T
 
A
W
 
G
M
 
F
V
 
I
G
 
G

3puxA Crystal structure of an outward-facing mbp-maltose transporter complex bound to adp-bef3 (see paper)
32% identity, 45% coverage: 11:250/532 of query aligns to 1:234/371 of 3puxA

query
sites
3puxA
A
 
A
V
 
S
L
 
V
S
 
Q
V
 
L
S
 
Q
G
 
N
I
 
V
G
 
T
K
 
K
T
 
A
Y
x
W
A
 
G
E
 
E
P
 
V
V
 
V
L
x
V
A
 
S
-
 
K
D
 
D
I
 
I
S
 
N
L
 
L
S
 
D
L
 
I
R
 
H
A
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
F
L
 
V
A
 
V
L
 
F
T
 
V
G
 
G
E
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
S
 
L
K
 
R
I
 
M
I
 
I
G
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
E
E
 
T
P
 
I
T
 
T
A
 
S
G
 
G
T
 
D
M
 
L
Q
 
F
L
 
I
G
 
G
G
 
E
V
 
K
-
 
R
-
 
M
-
 
N
P
 
D
Y
 
T
A
 
P
P
 
P
A
 
A
S
 
E
R
 
R
T
 
-
Q
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
G
V
 
V
R
 
G
M
 
M
V
 
V
M
 
F
Q
|
Q
E
 
S
L
 
Y
N
 
A
L
 
L
L
 
Y
P
 
P
T
 
H
L
 
L
S
 
S
V
 
V
A
 
A
E
 
E
N
 
N
L
 
M
F
 
-
L
 
-
N
 
-
R
 
-
L
 
-
P
 
-
R
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
F
 
-
S
 
S
F
 
F
G
 
G
W
 
L
I
 
K
D
 
L
R
 
A
R
 
G
K
 
A
L
 
K
R
 
K
E
 
E
D
 
V
A
 
I
R
 
N
Q
 
Q
A
 
R
M
 
V
A
 
N
Q
 
Q
V
 
V
G
 
A
-
 
E
-
 
V
-
 
L
-
 
Q
-
 
L
-
 
A
-
 
H
-
 
L
L
 
L
D
 
D
A
x
R
I
 
-
D
 
K
P
 
P
D
 
K
T
x
A
L
|
L
V
x
S
G
|
G
E
 
-
L
 
-
G
 
-
I
 
-
G
|
G
H
x
Q
Q
 
R
Q
 
Q
M
 
R
V
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
G
R
 
R
N
 
T
L
 
L
I
 
V
D
 
A
D
 
E
C
 
P
R
 
S
V
 
V
L
 
F
I
 
L
L
 
L
D
|
D
E
|
E
P
 
P
T
 
L
A
 
S
M
 
N
L
 
L
T
 
D
A
 
A
R
 
A
E
 
L
V
 
R
D
 
V
L
 
Q
L
 
M
F
 
R
E
 
I
Q
 
E
I
 
I
D
 
S
R
 
R
L
 
L
K
 
H
A
 
K
R
 
R
-
 
L
G
 
G
V
 
R
A
 
T
L
 
M
V
 
I
Y
 
Y
I
 
V
S
 
T
H
|
H
R
 
D
L
 
Q
E
 
V
E
 
E
L
 
A
A
 
M
R
 
T
V
 
L
A
 
A
E
 
D
Q
 
K
I
 
I
A
 
V
V
 
V
L
 
L
R
 
D
D
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
V
V
 
A
H
 
Q
V
 
V
D
 
G
A
 
K
-
 
P
-
 
L
-
 
E
M
 
L
A
 
Y
N
 
H
L
 
Y
T
 
P
S
 
A
D
 
D
E
 
R
I
 
F
V
 
V
T
 
A
W
 
G
M
 
F
V
 
I
G
 
G

3puwA Crystal structure of an outward-facing mbp-maltose transporter complex bound to adp-alf4 (see paper)
32% identity, 45% coverage: 11:250/532 of query aligns to 1:234/371 of 3puwA

query
sites
3puwA
A
 
A
V
 
S
L
 
V
S
 
Q
V
 
L
S
 
Q
G
 
N
I
 
V
G
 
T
K
 
K
T
 
A
Y
x
W
A
 
G
E
 
E
P
 
V
V
 
V
L
x
V
A
 
S
-
 
K
D
 
D
I
 
I
S
 
N
L
 
L
S
 
D
L
 
I
R
 
H
A
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
F
L
 
V
A
 
V
L
 
F
T
 
V
G
 
G
E
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
S
 
L
K
 
R
I
 
M
I
 
I
G
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
E
E
 
T
P
 
I
T
 
T
A
 
S
G
 
G
T
 
D
M
 
L
Q
 
F
L
 
I
G
 
G
G
 
E
V
 
K
-
 
R
-
 
M
-
 
N
P
 
D
Y
 
T
A
 
P
P
 
P
A
 
A
S
 
E
R
 
R
T
 
-
Q
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
G
V
 
V
R
 
G
M
 
M
V
 
V
M
 
F
Q
|
Q
E
 
S
L
 
Y
N
 
A
L
 
L
L
 
Y
P
 
P
T
 
H
L
 
L
S
 
S
V
 
V
A
 
A
E
 
E
N
 
N
L
 
M
F
 
-
L
 
-
N
 
-
R
 
-
L
 
-
P
 
-
R
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
F
 
-
S
 
S
F
 
F
G
 
G
W
 
L
I
 
K
D
 
L
R
 
A
R
 
G
K
 
A
L
 
K
R
 
K
E
 
E
D
 
V
A
 
I
R
 
N
Q
 
Q
A
 
R
M
 
V
A
 
N
Q
 
Q
V
 
V
G
 
A
-
 
E
-
 
V
-
 
L
-
 
Q
-
 
L
-
 
A
-
 
H
-
 
L
L
 
L
D
 
D
A
x
R
I
 
-
D
 
K
P
 
P
D
 
K
T
x
A
L
 
L
V
x
S
G
|
G
E
 
-
L
 
-
G
 
-
I
 
-
G
|
G
H
x
Q
Q
 
R
Q
 
Q
M
 
R
V
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
G
R
 
R
N
 
T
L
 
L
I
 
V
D
 
A
D
 
E
C
 
P
R
 
S
V
 
V
L
 
F
I
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
L
A
 
S
M
x
N
L
 
L
T
 
D
A
 
A
R
 
A
E
 
L
V
 
R
D
 
V
L
 
Q
L
 
M
F
 
R
E
 
I
Q
 
E
I
 
I
D
 
S
R
 
R
L
 
L
K
 
H
A
 
K
R
 
R
-
 
L
G
 
G
V
 
R
A
 
T
L
 
M
V
 
I
Y
 
Y
I
 
V
S
 
T
H
|
H
R
 
D
L
 
Q
E
 
V
E
 
E
L
 
A
A
 
M
R
 
T
V
 
L
A
 
A
E
 
D
Q
 
K
I
 
I
A
 
V
V
 
V
L
 
L
R
 
D
D
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
V
V
 
A
H
 
Q
V
 
V
D
 
G
A
 
K
-
 
P
-
 
L
-
 
E
M
 
L
A
 
Y
N
 
H
L
 
Y
T
 
P
S
 
A
D
 
D
E
 
R
I
 
F
V
 
V
T
 
A
W
 
G
M
 
F
V
 
I
G
 
G

2awoA Crystal structure of the adp-mg-bound e. Coli malk (crystallized with adp-mg) (see paper)
32% identity, 45% coverage: 11:250/532 of query aligns to 1:234/372 of 2awoA

query
sites
2awoA
A
 
A
V
 
S
L
 
V
S
 
Q
V
 
L
S
 
Q
G
 
N
I
 
V
G
 
T
K
 
K
T
 
A
Y
x
W
A
 
G
E
 
E
P
 
V
V
 
V
L
x
V
A
 
S
-
 
K
D
 
D
I
 
I
S
 
N
L
 
L
S
 
D
L
 
I
R
 
H
A
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
F
L
 
V
A
 
V
L
 
F
T
 
V
G
 
G
E
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
S
 
L
K
 
R
I
 
M
I
 
I
G
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
E
E
 
T
P
 
I
T
 
T
A
 
S
G
 
G
T
 
D
M
 
L
Q
 
F
L
 
I
G