SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing BPHYT_RS14005 FitnessBrowser__BFirm:BPHYT_RS14005 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

2ia4B Crystal structure of novel amino acid binding protein from shigella flexneri
49% identity, 92% coverage: 23:292/292 of query aligns to 8:278/278 of 2ia4B

query
sites
2ia4B
T
 
T
L
 
L
R
 
D
K
 
K
I
 
I
H
 
A
D
 
K
D
 
N
G
 
G
V
 
V
V
 
I
V
 
V
L
 
V
G
 
G
V
 
H
R
|
R
E
 
E
A
 
S
S
 
S
I
 
V
P
 
P
F
 
F
S
 
S
Y
 
Y
F
 
Y
D
 
D
G
 
N
K
 
Q
-
 
Q
G
 
K
T
 
V
V
 
V
G
 
G
Y
 
Y
S
 
S
Q
 
Q
T
 
D
I
 
Y
A
 
S
L
 
N
Q
 
A
I
 
I
V
 
V
E
 
E
E
 
A
I
 
V
K
 
K
K
 
K
T
 
K
L
 
L
G
 
N
M
 
K
P
 
P
Q
 
D
L
 
L
K
 
Q
V
 
V
H
 
K
E
 
L
I
 
I
T
 
P
V
 
I
T
 
T
S
|
S
S
 
Q
N
 
N
R
|
R
T
 
I
P
 
P
M
 
L
L
 
L
L
 
Q
N
 
N
N
 
G
Q
 
T
I
 
F
D
 
D
L
 
F
E
 
E
C
 
C
G
 
G
S
|
S
T
|
T
T
|
T
H
 
N
T
 
N
V
 
V
E
 
E
R
|
R
E
 
Q
N
 
K
L
 
Q
A
 
A
A
 
A
F
 
F
S
 
S
N
 
D
S
 
T
F
 
I
F
 
F
Q
 
V
Y
 
V
A
 
G
V
 
T
R
 
R
M
 
L
I
 
L
A
 
T
R
 
K
K
 
K
N
 
G
A
 
G
G
 
D
I
 
I
T
 
K
D
 
D
F
 
F
Q
 
A
D
 
D
L
 
L
A
 
K
G
 
G
K
 
K
A
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
V
T
 
T
A
 
S
G
 
G
T
|
T
S
x
T
D
 
S
E
 
E
R
 
V
L
 
L
L
 
L
R
 
N
R
 
K
L
 
L
N
 
N
T
 
E
D
 
E
K
 
Q
L
 
K
L
 
M
N
 
N
M
 
M
R
 
R
I
 
I
T
 
I
S
 
S
A
 
A
R
 
K
D
 
D
H
|
H
S
 
G
E
 
D
A
 
S
F
 
F
N
 
R
T
 
T
L
 
L
K
 
E
D
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
V
 
M
M
|
M
D
|
D
E
 
D
P
 
A
I
 
L
V
 
L
Y
 
A
G
 
G
F
 
E
K
 
R
S
 
A
T
 
K
D
 
A
P
 
K
R
 
K
P
 
P
D
 
D
D
 
N
F
 
W
V
 
D
V
 
I
T
 
V
G
 
G
T
 
K
P
 
P
L
 
Q
G
 
S
Y
 
Q
E
 
E
V
 
A
Y
 
Y
A
 
G
C
 
C
M
 
M
F
 
L
R
 
R
K
 
K
G
 
D
D
 
D
E
 
P
P
 
Q
F
 
F
R
 
K
T
 
K
L
 
L
V
 
M
N
 
D
G
 
D
V
 
T
I
 
I
A
 
A
R
 
Q
G
 
V
Q
 
Q
T
 
T
S
 
S
G
 
G
E
 
E
A
 
A
E
 
E
R
 
K
L
 
W
Y
 
F
R
 
D
Q
 
K
W
 
W
F
 
F
T
 
K
Q
 
N
P
 
P
I
 
I
P
 
P
P
 
P
H
 
K
G
 
N
I
 
L
N
 
N
L
 
M
N
 
N
F
 
F
P
 
E
L
 
L
S
 
S
E
 
D
Q
 
E
N
 
M
R
 
K
A
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
K
H
 
E
P
 
P
N
 
N
D
 
D
R
 
K
A
 
A
L
 
L
D
 
N

2vhaA Debp (see paper)
50% identity, 92% coverage: 23:291/292 of query aligns to 7:276/276 of 2vhaA

query
sites
2vhaA
T
 
T
L
 
L
R
 
D
K
 
K
I
 
I
H
 
A
D
 
K
D
 
N
G
 
G
V
 
V
V
 
I
V
 
V
L
 
V
G
 
G
V
 
H
R
|
R
E
 
E
A
 
S
S
 
S
I
 
V
P
 
P
F
 
F
S
 
S
Y
 
Y
F
 
Y
D
 
D
G
 
N
K
 
Q
-
 
Q
G
 
K
T
 
V
V
 
V
G
 
G
Y
 
Y
S
 
S
Q
 
Q
T
 
D
I
 
Y
A
 
S
L
 
N
Q
 
A
I
 
I
V
 
V
E
 
E
E
 
A
I
 
V
K
 
K
K
 
K
T
 
K
L
 
L
G
 
N
M
 
K
P
 
P
Q
 
D
L
 
L
K
 
Q
V
 
V
H
 
K
E
 
L
I
 
I
T
 
P
V
 
I
T
 
T
S
|
S
S
 
Q
N
 
N
R
|
R
T
 
I
P
 
P
M
 
L
L
 
L
L
 
Q
N
 
N
N
 
G
Q
 
T
I
 
F
D
 
D
L
 
F
E
 
E
C
 
C
G
 
G
S
|
S
T
|
T
T
|
T
H
 
N
T
 
N
V
 
V
E
 
E
R
|
R
E
 
Q
N
 
K
L
 
Q
A
 
A
A
 
A
F
 
F
S
 
S
N
 
D
S
 
T
F
 
I
F
 
F
Q
 
V
Y
 
V
A
 
G
V
 
T
R
 
R
M
 
L
I
 
L
A
 
T
R
 
K
K
 
K
N
 
G
A
 
G
G
 
D
I
 
I
T
 
K
D
 
D
F
 
F
Q
 
A
D
 
D
L
 
L
A
 
K
G
 
G
K
 
K
A
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
V
T
 
T
A
 
S
G
 
G
T
|
T
S
x
T
D
 
S
E
 
E
R
 
V
L
 
L
L
 
L
R
 
N
R
 
K
L
 
L
N
 
N
T
 
E
D
 
E
K
 
Q
L
 
K
L
 
M
N
 
N
M
 
M
R
 
R
I
 
I
T
 
I
S
 
S
A
 
A
R
 
K
D
 
D
H
|
H
S
 
G
E
 
D
A
 
S
F
 
F
N
 
R
T
 
T
L
 
L
K
 
E
D
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
V
 
M
M
|
M
D
|
D
E
 
D
P
 
A
I
 
L
V
 
L
Y
 
A
G
 
G
F
 
E
K
 
R
S
 
A
T
 
K
D
 
A
P
 
K
R
 
K
P
 
P
D
 
D
D
 
N
F
 
W
V
 
D
V
 
I
T
 
V
G
 
G
T
 
K
P
 
P
L
 
Q
G
 
S
Y
 
Q
E
 
E
V
 
A
Y
 
Y
A
 
G
C
 
C
M
 
M
F
 
L
R
 
R
K
 
K
G
 
D
D
 
D
E
 
P
P
 
Q
F
 
F
R
 
K
T
 
K
L
 
L
V
 
M
N
 
D
G
 
D
V
 
T
I
 
I
A
 
A
R
 
Q
G
 
V
Q
 
Q
T
 
T
S
 
S
G
 
G
E
 
E
A
 
A
E
 
E
R
 
K
L
 
W
Y
 
F
R
 
D
Q
 
K
W
 
W
F
 
F
T
 
K
Q
 
N
P
 
P
I
 
I
P
 
P
P
 
P
H
 
K
G
 
N
I
 
L
N
 
N
L
 
M
N
 
N
F
 
F
P
 
E
L
 
L
S
 
S
E
 
D
Q
 
E
N
 
M
R
 
K
A
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
K
H
 
E
P
 
P
N
 
N
D
 
D
R
 
K
A
 
A
L
 
L

8ovoA X-ray structure of the sf-iglusnfr-s72a in complex with l-aspartate
48% identity, 83% coverage: 23:264/292 of query aligns to 5:247/503 of 8ovoA

query
sites
8ovoA
T
 
T
L
 
L
R
 
D
K
 
K
I
 
I
H
 
A
D
 
K
D
 
N
G
 
G
V
 
V
V
 
I
V
 
V
L
 
V
G
 
G
V
 
H
R
|
R
E
 
E
A
 
S
S
 
S
I
 
V
P
 
P
F
 
F
S
 
S
Y
 
Y
F
 
Y
D
 
D
G
 
N
K
 
Q
-
 
Q
G
 
K
T
 
V
V
 
V
G
 
G
Y
 
Y
S
 
S
Q
 
Q
T
 
D
I
 
Y
A
 
S
L
 
N
Q
 
A
I
 
I
V
 
V
E
 
E
E
 
A
I
 
V
K
 
K
K
 
K
T
 
K
L
 
L
G
 
N
M
 
K
P
 
P
Q
 
D
L
 
L
K
 
Q
V
 
V
H
 
K
E
 
L
I
 
I
T
 
P
V
 
I
T
 
T
S
 
A
S
 
Q
N
 
N
R
|
R
T
 
I
P
 
P
M
 
L
L
 
L
L
 
Q
N
 
N
N
 
G
Q
 
T
I
 
F
D
 
D
L
 
F
E
 
E
C
 
C
G
 
G
S
|
S
T
 
T
T
|
T
H
 
N
T
 
N
V
 
V
E
 
E
R
|
R
E
 
Q
N
 
K
L
 
Q
A
 
A
A
 
A
F
 
F
S
 
S
N
 
D
S
 
T
F
 
I
F
 
F
Q
 
V
Y
 
V
A
 
G
V
 
T
R
 
R
M
 
L
I
 
L
A
 
T
R
 
K
K
 
K
N
 
G
A
 
G
G
 
D
I
 
I
T
 
K
D
 
D
F
 
F
Q
 
A
D
 
N
L
 
L
A
 
K
G
 
D
K
 
K
A
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
V
T
 
T
A
 
S
G
 
G
T
|
T
S
x
T
D
 
S
E
 
E
R
 
V
L
 
L
L
 
L
R
 
N
R
 
K
L
 
L
N
 
N
T
 
E
D
 
E
K
 
Q
L
 
K
L
 
M
N
 
N
M
 
M
R
 
R
I
 
I
T
 
I
S
 
S
A
 
A
R
 
K
D
 
D
H
|
H
S
 
G
E
 
D
A
 
S
F
 
F
N
 
R
T
 
T
L
 
L
K
 
E
D
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
V
 
M
M
 
M
D
|
D
E
 
D
P
 
V
I
 
L
V
 
L
Y
 
A
G
 
G
F
 
E
K
 
R
S
 
A
T
 
K
D
 
A
P
 
K
R
 
K
P
 
P
D
 
D
D
 
N
F
 
W
V
 
E
V
 
I
T
 
V
G
 
G
T
 
K
P
 
P
L
 
Q
G
 
S
Y
 
Q
E
 
E
V
 
A
Y
 
Y
A
 
G
C
 
C
M
 
M
F
 
L
R
 
R
K
 
K
G
 
D
D
 
D
E
 
P
P
 
Q
F
 
F
R
 
K
T
 
K
L
 
L
V
 
M
N
 
D
G
 
D
V
 
T
I
 
I
A
 
A
R
 
Q
G
 
V
Q
 
Q
T
 
T
S
 
S
G
 
G
E
 
E
A
 
A
E
 
E
R
 
K
L
 
W
Y
 
F
R
 
D
Q
 
K
W
 
W
F
 
F
T
 
K
Q
 
N
P
 
P
I
 
I

6svfA Crystal structure of the p235gk mutant of argbp from t. Maritima (see paper)
28% identity, 82% coverage: 24:262/292 of query aligns to 3:229/229 of 6svfA

query
sites
6svfA
L
 
I
R
 
D
K
 
E
I
 
I
H
 
K
D
 
S
D
 
R
G
 
G
V
 
Y
V
 
L
V
 
L
L
 
V
G
 
G
V
 
L
R
 
S
E
 
A
A
 
D
S
x
F
I
 
P
P
 
P
F
 
F
S
 
E
Y
 
F
F
 
V
D
 
D
G
 
E
K
 
N
G
 
G
T
 
N
-
 
I
V
 
V
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
Q
 
V
T
 
D
I
 
L
A
 
A
L
 
-
Q
 
-
I
 
-
V
 
-
E
 
K
E
 
E
I
 
I
K
 
A
K
 
R
T
 
R
L
 
L
G
 
G
M
 
V
P
 
-
Q
 
E
L
 
L
K
 
K
V
 
I
H
 
-
E
 
-
I
 
V
T
 
D
V
 
M
T
 
T
S
x
F
S
 
D
N
 
G
R
 
L
T
 
I
P
 
P
M
 
S
L
 
L
L
 
L
N
 
T
N
 
K
Q
 
K
I
 
I
D
 
D
L
 
V
E
 
I
C
 
I
G
x
S
S
x
G
T
x
M
T
|
T
H
 
I
T
 
T
V
 
E
E
 
E
R
|
R
E
 
K
N
 
K
L
 
V
A
 
V
A
 
A
F
 
F
S
 
S
N
 
D
S
 
P
F
 
Y
F
 
F
Q
 
D
Y
 
A
A
 
G
V
 
Q
R
 
V
M
 
I
I
 
V
A
 
V
R
 
R
K
 
K
N
 
D
A
 
S
G
 
D
I
 
F
-
 
R
-
 
P
T
 
K
D
 
T
F
 
Y
Q
 
E
D
 
D
L
 
L
A
 
V
G
 
G
K
 
K
A
 
T
V
 
V
V
 
A
T
 
V
T
x
Q
A
 
I
G
 
G
T
|
T
S
x
T
D
 
G
E
 
D
R
 
-
L
 
-
L
 
-
R
 
-
R
 
-
L
 
I
N
 
E
T
 
V
D
 
S
K
 
K
L
 
Y
L
 
D
N
 
G
M
 
I
R
 
K
I
 
V
T
 
V
S
 
R
A
 
F
R
 
D
D
 
K
H
 
F
S
 
T
E
 
D
A
 
A
F
 
F
N
 
L
T
 
E
L
 
L
K
 
K
D
 
R
G
 
G
R
 
R
A
 
A
V
 
D
A
 
A
F
 
V
V
 
V
M
 
L
D
|
D
E
 
S
P
 
A
I
 
T
V
 
A
Y
 
R
G
 
A
F
 
F
K
 
V
S
 
A
T
 
K
D
 
N
P
 
P
R
 
-
P
 
-
D
 
-
D
 
D
F
 
L
V
 
V
V
 
I
T
 
S
G
 
S
T
 
G
P
 
V
L
 
L
G
 
S
Y
 
S
E
 
E
V
 
Q
Y
 
Y
A
 
G
C
 
I
M
 
A
F
 
V
R
 
R
K
 
K
G
 
E
D
 
D
E
 
T
P
 
D
F
 
L
R
 
L
T
 
E
L
 
F
V
 
I
N
 
N
G
 
S
V
 
V
I
 
L
A
 
R
R
 
E
G
 
L
Q
 
K
T
 
K
S
 
S
G
 
G
E
 
K
A
 
Y
E
 
D
R
 
V
L
 
L
Y
 
I
R
 
E
Q
 
K
W
 
W
F
 
F
T
 
S
Q
 
E

2yjpA Crystal structure of the solute receptors for l-cysteine of neisseria gonorrhoeae (see paper)
26% identity, 82% coverage: 21:258/292 of query aligns to 1:229/247 of 2yjpA

query
sites
2yjpA
T
 
A
G
 
A
T
 
T
L
 
V
R
 
A
K
 
A
I
 
I
H
 
K
D
 
E
D
 
K
G
 
G
V
 
V
V
 
I
V
 
R
L
 
I
G
 
G
V
 
V
R
x
F
E
 
G
A
 
D
S
x
K
I
 
P
P
 
P
F
 
F
S
 
G
Y
 
Y
F
 
V
D
 
D
G
 
A
K
 
N
G
 
G
T
 
K
V
 
-
G
 
-
Y
 
-
S
 
N
Q
 
Q
T
 
G
I
 
F
A
 
D
L
 
V
Q
 
E
I
 
I
V
 
A
E
 
K
E
 
D
I
 
L
K
 
A
K
 
K
T
 
D
L
 
L
-
 
L
G
 
G
M
 
S
P
 
P
Q
 
D
L
 
-
K
 
K
V
 
V
H
 
E
E
 
F
I
 
V
T
 
L
V
 
T
T
x
E
S
 
A
S
 
A
N
 
N
R
|
R
T
 
V
P
 
E
M
 
Y
L
 
V
L
 
R
N
 
S
N
 
G
Q
 
K
I
 
V
D
 
D
L
 
L
E
 
I
C
 
L
G
 
A
S
x
N
T
x
F
T
|
T
H
 
Q
T
 
T
V
 
P
E
 
E
R
|
R
E
 
A
N
 
E
L
 
A
A
 
V
A
 
D
F
 
F
S
 
A
N
 
D
S
 
P
F
 
Y
F
 
M
Q
 
K
Y
 
V
A
 
A
V
 
L
R
 
G
M
 
V
I
 
V
A
 
S
R
 
P
K
 
K
N
 
N
A
 
K
G
 
P
I
 
I
T
 
T
D
 
D
F
 
M
Q
 
A
D
 
Q
L
 
L
A
 
K
G
 
D
K
 
Q
A
 
T
V
 
L
V
 
L
T
 
V
T
 
N
A
 
K
G
 
G
T
|
T
S
x
T
D
 
A
E
 
D
R
 
A
L
 
F
L
 
F
R
 
T
R
 
K
L
 
S
N
x
H
T
 
P
D
x
E
K
 
-
L
 
-
L
 
-
N
 
-
M
 
V
R
 
K
I
 
L
T
 
L
S
 
K
A
 
F
R
x
D
D
 
Q
H
 
N
S
 
T
E
 
E
A
 
T
F
 
F
N
 
D
T
 
A
L
 
L
K
 
K
D
 
D
G
 
G
R
 
R
A
 
G
V
 
V
A
 
A
F
 
L
V
 
A
M
x
H
D
|
D
E
 
N
P
 
A
I
 
L
V
 
L
Y
 
W
G
 
A
F
 
W
K
 
A
S
 
K
T
 
E
D
 
N
P
 
P
R
 
-
P
 
-
D
 
-
D
 
N
F
 
F
V
 
E
V
 
V
T
 
A
G
 
I
T
 
G
P
 
N
L
 
L
G
 
G
-
 
P
Y
 
A
E
 
E
V
 
F
Y
 
I
A
 
A
C
 
P
M
 
A
F
 
V
R
 
Q
K
 
K
G
 
G
D
 
N
E
 
A
P
 
D
F
 
L
R
 
L
T
 
N
L
 
W
V
 
V
N
 
N
G
 
G
V
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
A
G
 
M
Q
 
K
T
 
K
S
 
D
G
 
G
E
 
R
A
 
L
E
 
K
R
 
A
L
 
A
Y
 
Y
R
 
E
Q
 
K

4zv1A An ancestral arginine-binding protein bound to arginine (see paper)
26% identity, 80% coverage: 28:260/292 of query aligns to 1:225/226 of 4zv1A

query
sites
4zv1A
H
 
H
D
 
M
D
 
R
G
 
G
V
 
T
V
 
L
V
 
R
L
 
V
G
 
G
V
 
T
R
x
E
E
 
A
A
 
T
S
x
F
I
 
P
P
 
P
F
 
F
S
 
G
Y
 
F
F
 
K
D
 
D
G
 
E
K
 
N
G
 
G
T
 
K
-
 
L
V
 
V
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
Q
 
-
T
 
-
I
 
-
A
 
-
L
 
I
Q
 
D
I
 
L
V
 
A
E
 
K
E
 
A
I
 
I
K
 
A
K
 
K
T
 
K
L
 
L
G
 
G
M
 
-
P
 
-
Q
 
-
L
 
V
K
 
K
V
 
V
H
 
E
E
 
F
I
 
K
T
 
P
V
 
M
T
 
D
S
x
F
S
 
D
N
 
G
R
 
I
T
 
I
P
 
P
M
 
A
L
 
L
L
 
Q
N
 
S
N
 
G
Q
 
K
I
 
I
D
 
D
L
 
V
E
 
V
C
 
I
G
x
A
S
x
G
T
x
M
T
|
T
H
 
I
T
 
T
V
 
E
E
 
E
R
|
R
E
 
K
N
 
K
L
 
Q
A
 
V
A
 
D
F
 
F
S
 
S
N
 
D
S
 
P
F
 
Y
F
 
F
Q
 
E
Y
 
A
A
 
G
V
 
Q
R
 
A
M
 
I
I
 
V
A
 
V
R
 
K
K
 
K
-
 
G
N
 
N
A
 
D
G
 
S
I
 
I
T
 
K
D
 
S
F
 
L
Q
 
E
D
 
D
L
 
L
A
 
K
G
 
G
K
 
K
A
 
K
V
 
V
V
 
G
T
 
V
T
x
Q
A
 
L
G
 
G
T
x
S
S
x
T
D
 
S
E
 
E
R
 
Q
L
 
H
L
 
V
R
 
K
R
 
K
L
 
V
N
 
A
T
 
K
D
 
D
K
 
-
L
 
-
L
 
A
N
 
G
M
 
V
R
 
K
I
 
V
T
 
K
S
 
K
A
 
F
R
 
D
D
 
N
H
 
F
S
 
S
E
 
E
A
 
A
F
 
F
N
 
Q
T
 
E
L
 
L
K
 
K
D
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
V
V
 
D
A
 
A
F
 
V
V
 
V
M
 
T
D
|
D
E
 
N
P
 
A
I
 
V
V
 
A
Y
 
L
G
 
A
F
 
Y
K
 
V
S
 
K
T
 
Q
D
 
N
P
 
P
R
 
N
P
 
A
D
 
G
D
 
V
F
 
K
V
 
I
V
 
V
T
 
-
G
 
G
T
 
E
P
 
T
L
 
F
G
 
S
Y
 
G
E
 
E
V
 
P
Y
 
Y
A
 
G
C
 
I
M
 
A
F
 
V
R
 
R
K
 
K
G
 
G
D
 
N
E
 
S
P
 
E
F
 
L
R
 
L
T
 
E
L
 
K
V
 
I
N
 
N
G
 
K
V
 
A
I
 
L
A
 
E
R
 
E
G
 
M
Q
 
K
T
 
K
S
 
D
G
 
G
E
 
T
A
 
Y
E
 
D
R
 
K
L
 
I
Y
 
Y
R
 
E
Q
 
K
W
 
W
F
 
F

1xt8B Crystal structure of cysteine-binding protein from campylobacter jejuni at 2.0 a resolution (see paper)
26% identity, 84% coverage: 23:267/292 of query aligns to 6:237/251 of 1xt8B

query
sites
1xt8B
T
 
S
L
 
L
R
 
D
K
 
K
I
 
I
H
 
K
D
 
Q
D
 
N
G
 
G
V
 
V
V
 
V
V
 
R
L
 
I
G
 
G
V
 
V
R
x
F
E
 
G
A
 
D
S
x
K
I
 
P
P
 
P
F
 
F
S
 
G
Y
 
Y
F
 
V
D
 
D
G
 
E
K
 
K
G
 
G
T
 
N
V
 
-
G
 
-
Y
 
-
S
 
N
Q
 
Q
T
 
G
I
 
Y
A
 
D
L
 
I
Q
 
A
I
 
L
V
 
A
E
 
K
E
 
R
I
 
I
K
 
A
K
 
K
T
 
E
L
 
L
G
 
F
M
 
G
P
 
D
Q
 
E
L
 
N
K
 
K
V
 
V
H
 
Q
E
 
F
I
 
V
T
 
L
V
 
V
T
 
E
S
 
A
S
 
A
N
 
N
R
|
R
T
 
V
P
 
E
M
 
F
L
 
L
L
 
K
N
 
S
N
 
N
Q
 
K
I
 
V
D
 
D
L
 
I
E
 
I
C
 
L
G
 
A
S
x
N
T
 
F
T
|
T
H
 
Q
T
 
T
V
 
P
E
 
Q
R
|
R
E
 
A
N
 
E
L
 
Q
A
 
V
A
 
D
F
 
F
S
 
C
N
 
S
S
 
P
F
 
Y
F
 
M
Q
 
K
Y
 
V
A
 
A
V
 
L
R
 
G
M
 
V
I
 
A
A
 
V
R
 
P
K
 
K
N
 
D
A
 
S
G
 
N
I
 
I
T
 
T
D
 
S
F
 
V
Q
 
E
D
 
D
L
 
L
A
 
K
G
 
D
K
 
K
A
 
T
V
 
L
V
 
L
T
 
L
T
 
N
A
 
K
G
 
G
T
|
T
S
x
T
D
 
A
E
 
D
R
 
A
L
 
Y
L
 
F
R
 
-
R
 
-
L
 
-
N
 
-
T
 
T
D
 
Q
K
 
N
L
 
Y
L
 
P
N
 
N
M
 
I
R
 
K
I
 
T
T
 
L
S
 
K
A
 
Y
R
 
D
D
 
Q
H
 
N
S
 
T
E
 
E
A
 
T
F
 
F
N
 
A
T
 
A
L
 
L
K
 
M
D
 
D
G
 
K
R
 
R
A
 
G
V
 
D
A
 
A
F
 
L
V
 
S
M
x
H
D
|
D
E
 
N
P
 
T
I
 
L
V
 
L
Y
 
F
G
 
A
F
 
W
K
 
V
S
 
K
T
 
D
D
 
H
P
 
P
R
 
-
P
 
-
D
 
-
D
 
D
F
 
F
V
 
K
V
 
M
T
 
G
G
 
I
T
 
K
P
 
E
L
 
L
G
 
G
-
 
N
Y
 
K
E
 
D
V
 
V
Y
 
I
A
 
A
C
 
P
M
 
A
F
 
V
R
 
K
K
 
K
G
 
G
D
 
D
E
 
K
P
 
E
F
 
L
R
 
K
T
 
E
L
 
F
V
 
I
N
 
D
G
 
N
V
 
L
I
 
I
A
 
I
R
 
K
-
 
L
G
 
G
Q
 
Q
T
 
-
S
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
-
E
 
E
R
 
Q
L
 
F
Y
 
F
R
 
H
Q
 
K
W
 
A
F
 
Y
T
 
D
Q
 
E
P
 
T
I
 
L
P
 
K
P
 
A
H
 
H

5eyfB Crystal structure of solute-binding protein from enterococcus faecium with bound glutamate
27% identity, 78% coverage: 33:260/292 of query aligns to 15:234/243 of 5eyfB

query
sites
5eyfB
V
 
I
V
 
I
L
 
W
G
 
G
V
 
V
R
 
K
E
 
Y
A
 
D
S
 
T
I
 
R
P
 
L
F
 
F
S
 
G
Y
 
M
F
 
M
D
 
D
-
 
I
-
 
E
G
 
S
K
 
R
G
 
T
T
 
V
V
 
Q
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
Q
 
V
T
 
D
I
 
I
A
 
A
L
 
K
Q
 
A
I
 
I
V
 
T
E
 
-
E
 
-
I
 
-
K
 
K
K
 
K
T
 
I
L
 
L
G
 
G
M
 
-
P
 
D
Q
 
N
L
 
G
K
 
K
V
 
T
H
 
E
E
 
F
I
 
V
T
 
E
V
 
V
T
 
T
S
|
S
S
 
K
N
 
T
R
|
R
T
 
I
P
 
P
M
 
L
L
 
L
L
 
K
N
 
N
N
 
G
Q
 
N
I
 
I
D
 
D
L
 
A
E
 
I
C
 
I
G
 
A
S
x
T
T
x
M
T
|
T
H
 
I
T
 
T
V
 
D
E
 
E
R
|
R
E
 
K
N
 
K
L
 
Q
A
 
V
A
 
D
F
 
F
S
 
S
N
 
D
S
 
V
F
 
Y
F
 
F
Q
 
D
Y
 
A
A
 
G
V
 
Q
R
 
A
M
 
L
I
 
L
A
 
V
R
 
K
K
 
K
N
 
G
A
 
S
G
 
Q
I
 
I
T
 
K
D
 
S
F
 
V
Q
 
D
D
 
D
L
 
L
-
 
N
A
 
A
G
 
S
K
 
T
A
 
T
V
 
V
V
 
L
T
 
A
T
 
V
A
 
K
G
 
G
T
x
S
S
x
T
D
 
S
E
 
A
R
 
A
L
 
N
L
 
I
R
 
R
R
 
Q
L
 
H
N
 
A
T
 
P
D
 
D
K
 
-
L
 
-
L
 
-
N
 
-
M
 
A
R
 
K
I
 
I
T
 
L
S
 
E
A
 
L
R
 
E
D
 
N
H
x
Y
S
 
A
E
 
E
A
 
A
F
 
F
N
 
T
T
 
A
L
 
L
K
 
Q
D
 
S
G
 
G
R
 
Q
A
 
G
V
 
D
A
 
A
F
 
M
V
 
T
M
 
T
D
|
D
E
 
N
P
 
A
I
 
I
V
 
L
Y
 
L
G
 
G
F
 
I
K
 
A
S
 
D
T
 
E
D
 
N
P
 
P
R
 
-
P
 
-
D
 
-
D
 
E
F
 
Y
V
 
E
V
 
L
T
 
V
G
 
G
T
 
G
P
 
T
L
 
F
G
 
T
Y
 
N
E
 
E
V
 
P
Y
 
Y
A
 
G
C
 
I
M
 
A
F
 
I
R
 
N
K
 
K
G
 
G
D
 
Q
E
 
E
P
 
N
F
 
F
R
 
L
T
 
K
L
 
A
V
 
V
N
 
N
G
 
Q
V
 
A
I
 
L
A
 
E
R
 
E
G
 
M
Q
 
H
T
 
A
S
 
D
G
 
G
E
 
T
A
 
Y
E
 
D
R
 
K
L
 
I
Y
 
Y
R
 
Q
Q
 
K
W
 
W
F
 
F

4zv2A An ancestral arginine-binding protein bound to glutamine (see paper)
25% identity, 80% coverage: 28:262/292 of query aligns to 1:225/225 of 4zv2A

query
sites
4zv2A
H
 
H
D
 
M
D
 
R
G
 
G
V
 
T
V
 
L
V
 
R
L
 
V
G
 
G
V
 
T
R
x
E
E
 
A
A
 
T
S
x
F
I
 
P
P
 
P
F
 
F
S
 
G
Y
 
F
F
 
K
D
 
D
G
 
E
K
 
N
G
 
G
T
 
K
-
 
L
V
 
V
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
Q
 
-
T
 
-
I
 
-
A
 
-
L
 
I
Q
 
D
I
 
L
V
 
A
E
 
K
E
 
A
I
 
I
K
 
A
K
 
K
T
 
K
L
 
L
G
 
G
M
 
-
P
 
-
Q
 
-
L
 
V
K
 
K
V
 
V
H
 
E
E
 
F
I
 
K
T
 
P
V
 
M
T
 
D
S
x
F
S
 
D
N
 
G
R
 
I
T
 
I
P
 
P
M
 
A
L
 
L
L
 
Q
N
 
S
N
 
G
Q
 
K
I
 
I
D
 
D
L
 
V
E
 
V
C
 
I
G
 
A
S
x
G
T
x
M
T
|
T
H
 
I
T
 
T
V
 
E
E
 
E
R
|
R
E
 
K
N
 
K
L
 
Q
A
 
V
A
 
D
F
 
F
S
 
S
N
 
D
S
 
P
F
 
Y
F
 
F
Q
 
E
Y
 
A
A
 
G
V
 
Q
R
 
A
M
 
I
I
 
V
A
 
V
R
 
K
K
 
K
-
 
G
N
 
N
A
 
D
G
 
S
I
 
I
T
 
K
D
 
S
F
 
L
Q
 
E
D
 
D
L
 
L
A
 
K
G
 
G
K
 
K
A
 
K
V
 
V
V
 
G
T
 
V
T
 
Q
A
 
L
G
 
G
T
x
S
S
x
T
D
 
S
E
 
E
R
 
Q
L
 
H
L
 
V
R
 
K
R
 
K
L
 
V
N
 
A
T
 
A
D
 
-
K
 
-
L
 
-
L
 
-
N
 
G
M
 
V
R
 
K
I
 
V
T
 
K
S
 
K
A
 
F
R
 
D
D
 
N
H
 
F
S
 
S
E
 
E
A
 
A
F
 
F
N
 
Q
T
 
E
L
 
L
K
 
K
D
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
V
V
 
D
A
 
A
F
 
V
V
 
V
M
 
T
D
|
D
E
 
N
P
 
A
I
 
V
V
 
A
Y
 
L
G
 
A
F
 
Y
K
 
V
S
 
K
T
 
Q
D
 
N
P
 
P
R
 
N
P
 
A
D
 
G
D
 
V
F
 
K
V
 
I
V
 
V
T
 
-
G
 
G
T
 
E
P
 
T
L
 
F
G
 
S
Y
 
G
E
 
E
V
 
P
Y
 
Y
A
 
G
C
 
I
M
 
A
F
 
V
R
 
R
K
 
K
G
 
G
D
 
N
E
 
S
P
 
E
F
 
L
R
 
L
T
 
E
L
 
K
V
 
I
N
 
N
G
 
K
V
 
A
I
 
L
A
 
E
R
 
E
G
 
M
Q
 
K
T
 
K
S
 
D
G
 
G
E
 
T
A
 
Y
E
 
D
R
 
K
L
 
I
Y
 
Y
R
 
E
Q
 
K
W
 
W
F
 
F
T
 
G
Q
 
E

6h20A Glnh bound to asn, mycobacterium tuberculosis (see paper)
26% identity, 88% coverage: 9:266/292 of query aligns to 29:281/287 of 6h20A

query
sites
6h20A
A
 
A
S
 
S
L
 
L
A
 
R
C
 
P
S
 
F
A
 
A
Q
 
T
T
 
K
D
 
A
E
 
E
L
 
A
T
 
D
G
 
A
T
 
A
L
 
V
R
 
A
K
 
D
I
 
I
H
 
R
D
 
A
D
 
R
G
 
G
V
 
R
V
 
L
V
 
I
L
 
V
G
 
G
V
 
L
R
 
D
E
 
I
A
 
G
S
 
S
I
 
N
P
 
L
F
 
F
S
 
S
Y
 
F
F
 
R
D
 
D
-
 
P
-
 
I
-
 
T
G
 
G
K
 
E
G
 
I
T
 
T
V
 
-
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
Q
 
V
T
 
D
I
 
I
A
 
A
L
 
G
Q
 
E
I
 
V
V
 
A
E
 
R
E
 
D
I
 
I
K
 
-
K
 
-
T
 
-
L
 
F
G
 
G
M
 
V
P
 
P
Q
 
S
L
 
H
K
 
V
V
 
E
H
 
Y
E
 
R
I
 
I
T
 
-
V
 
L
T
 
S
S
 
A
S
 
A
N
 
E
R
|
R
T
 
V
P
 
T
M
 
A
L
 
L
L
 
Q
N
 
K
N
 
S
Q
 
Q
I
 
V
D
 
D
L
 
I
E
 
V
C
 
V
G
 
K
S
x
T
T
 
M
T
x
S
H
 
I
T
 
T
V
 
C
E
 
E
R
|
R
E
 
R
N
 
K
L
 
L
A
 
V
A
 
N
F
 
F
S
 
S
N
 
T
S
 
V
F
 
Y
F
 
L
Q
 
D
Y
 
A
A
 
N
V
 
Q
R
 
R
M
 
I
I
 
L
A
 
A
R
 
P
K
 
R
N
 
D
A
 
S
G
 
P
I
 
I
T
 
T
D
 
K
F
 
V
Q
 
S
D
 
D
L
 
L
A
 
S
G
 
G
K
 
K
A
 
R
V
 
V
V
 
C
T
 
V
T
 
A
A
 
R
G
 
G
T
|
T
S
x
T
D
 
S
E
 
L
R
 
R
L
 
R
L
 
I
R
 
R
R
 
E
L
 
I
N
 
A
T
 
P
D
 
P
K
 
P
L
 
V
L
 
-
N
 
-
M
 
-
R
 
-
I
 
I
T
 
V
S
 
S
A
 
V
R
 
V
D
 
N
H
x
W
S
 
A
E
 
D
A
 
C
F
 
L
N
 
V
T
 
A
L
 
L
K
 
Q
D
 
Q
G
 
R
R
 
E
A
 
I
V
 
D
A
 
A
F
 
V
V
 
S
M
 
T
D
|
D
E
 
D
P
 
T
I
 
I
V
 
L
Y
 
A
G
 
G
F
 
L
K
 
V
S
 
E
T
 
E
D
 
D
P
 
P
R
 
Y
P
 
-
D
 
-
D
 
-
F
 
L
V
 
H
V
 
I
T
 
V
G
 
G
T
 
P
P
 
D
L
 
M
G
 
A
Y
 
D
E
 
Q
V
 
P
Y
 
Y
A
 
G
C
 
V
M
 
G
F
 
I
R
 
N
K
 
L
G
 
D
D
 
N
E
 
T
P
 
G
F
 
L
R
 
V
T
 
R
L
 
F
V
 
V
N
 
N
G
 
G
V
 
T
I
 
L
A
 
E
R
 
R
G
 
I
Q
 
R
T
 
N
S
 
D
G
 
G
E
 
T
A
 
W
E
 
N
R
 
T
L
 
L
Y
 
Y
R
 
R
Q
 
K
W
 
W
F
 
L
T
 
T
-
 
V
-
 
L
-
 
G
-
 
P
Q
 
A
P
 
P
I
 
A
P
 
P
P
 
P

6h1uA Glnh bound to asp, mycobacterium tuberculosis (see paper)
26% identity, 88% coverage: 9:266/292 of query aligns to 29:281/287 of 6h1uA

query
sites
6h1uA
A
 
A
S
 
S
L
 
L
A
 
R
C
 
P
S
 
F
A
 
A
Q
 
T
T
 
K
D
 
A
E
 
E
L
 
A
T
 
D
G
 
A
T
 
A
L
 
V
R
 
A
K
 
D
I
 
I
H
 
R
D
 
A
D
 
R
G
 
G
V
 
R
V
 
L
V
 
I
L
 
V
G
 
G
V
 
L
R
 
D
E
 
I
A
 
G
S
 
S
I
 
N
P
 
L
F
 
F
S
 
S
Y
 
F
F
 
R
D
 
D
-
 
P
-
 
I
-
 
T
G
 
G
K
 
E
G
 
I
T
 
T
V
 
-
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
Q
 
V
T
 
D
I
 
I
A
 
A
L
 
G
Q
 
E
I
 
V
V
 
A
E
 
R
E
 
D
I
 
I
K
 
-
K
 
-
T
 
-
L
 
F
G
 
G
M
 
V
P
 
P
Q
 
S
L
 
H
K
 
V
V
 
E
H
 
Y
E
 
R
I
 
I
T
 
-
V
 
L
T
 
S
S
 
A
S
 
A
N
 
E
R
|
R
T
 
V
P
 
T
M
 
A
L
 
L
L
 
Q
N
 
K
N
 
S
Q
 
Q
I
 
V
D
 
D
L
 
I
E
 
V
C
 
V
G
 
K
S
x
T
T
 
M
T
x
S
H
 
I
T
 
T
V
 
C
E
 
E
R
|
R
E
 
R
N
 
K
L
 
L
A
 
V
A
 
N
F
 
F
S
 
S
N
 
T
S
 
V
F
 
Y
F
 
L
Q
 
D
Y
 
A
A
 
N
V
 
Q
R
 
R
M
 
I
I
 
L
A
 
A
R
 
P
K
 
R
N
 
D
A
 
S
G
 
P
I
 
I
T
 
T
D
 
K
F
 
V
Q
 
S
D
 
D
L
 
L
A
 
S
G
 
G
K
 
K
A
 
R
V
 
V
V
 
C
T
 
V
T
 
A
A
 
R
G
 
G
T
|
T
S
x
T
D
 
S
E
 
L
R
 
R
L
 
R
L
 
I
R
 
R
R
 
E
L
 
I
N
 
A
T
 
P
D
 
P
K
 
P
L
 
V
L
 
-
N
 
-
M
 
-
R
 
-
I
 
I
T
 
V
S
 
S
A
 
V
R
 
V
D
 
N
H
x
W
S
 
A
E
 
D
A
 
C
F
 
L
N
 
V
T
 
A
L
 
L
K
 
Q
D
 
Q
G
 
R
R
 
E
A
 
I
V
 
D
A
 
A
F
 
V
V
 
S
M
 
T
D
|
D
E
 
D
P
 
T
I
|
I
V
 
L
Y
 
A
G
 
G
F
 
L
K
 
V
S
 
E
T
 
E
D
 
D
P
 
P
R
 
Y
P
 
-
D
 
-
D
 
-
F
 
L
V
 
H
V
 
I
T
 
V
G
 
G
T
 
P
P
 
D
L
 
M
G
 
A
Y
 
D
E
 
Q
V
 
P
Y
 
Y
A
 
G
C
 
V
M
 
G
F
 
I
R
 
N
K
 
L
G
 
D
D
 
N
E
 
T
P
 
G
F
 
L
R
 
V
T
 
R
L
 
F
V
 
V
N
 
N
G
 
G
V
 
T
I
 
L
A
 
E
R
 
R
G
 
I
Q
 
R
T
 
N
S
 
D
G
 
G
E
 
T
A
 
W
E
 
N
R
 
T
L
 
L
Y
 
Y
R
 
R
Q
 
K
W
 
W
F
 
L
T
 
T
-
 
V
-
 
L
-
 
G
-
 
P
Q
 
A
P
 
P
I
 
A
P
 
P
P
 
P

6h2tA Glnh bound to glu, mycobacterium tuberculosis (see paper)
26% identity, 88% coverage: 9:266/292 of query aligns to 30:282/288 of 6h2tA

query
sites
6h2tA
A
 
A
S
 
S
L
 
L
A
 
R
C
 
P
S
 
F
A
 
A
Q
 
T
T
 
K
D
 
A
E
 
E
L
 
A
T
 
D
G
 
A
T
 
A
L
 
V
R
 
A
K
 
D
I
 
I
H
 
R
D
 
A
D
 
R
G
 
G
V
 
R
V
 
L
V
 
I
L
 
V
G
 
G
V
 
L
R
 
D
E
 
I
A
 
G
S
 
S
I
 
N
P
 
L
F
 
F
S
 
S
Y
 
F
F
 
R
D
 
D
-
 
P
-
 
I
-
 
T
G
 
G
K
 
E
G
 
I
T
 
T
V
 
-
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
Q
 
V
T
 
D
I
 
I
A
 
A
L
 
G
Q
 
E
I
 
V
V
 
A
E
 
R
E
 
D
I
 
I
K
 
-
K
 
-
T
 
-
L
 
F
G
 
G
M
 
V
P
 
P
Q
 
S
L
 
H
K
 
V
V
 
E
H
 
Y
E
 
R
I
 
I
T
 
-
V
 
L
T
 
S
S
 
A
S
 
A
N
 
E
R
|
R
T
 
V
P
 
T
M
 
A
L
 
L
L
 
Q
N
 
K
N
 
S
Q
 
Q
I
 
V
D
 
D
L
 
I
E
 
V
C
 
V
G
 
K
S
x
T
T
 
M
T
x
S
H
 
I
T
 
T
V
 
C
E
 
E
R
|
R
E
 
R
N
 
K
L
 
L
A
 
V
A
 
N
F
 
F
S
 
S
N
 
T
S
 
V
F
 
Y
F
 
L
Q
 
D
Y
 
A
A
 
N
V
 
Q
R
 
R
M
 
I
I
 
L
A
 
A
R
 
P
K
 
R
N
 
D
A
 
S
G
 
P
I
 
I
T
 
T
D
 
K
F
 
V
Q
 
S
D
 
D
L
 
L
A
 
S
G
 
G
K
 
K
A
 
R
V
 
V
V
 
C
T
 
V
T
 
A
A
 
R
G
 
G
T
|
T
S
x
T
D
 
S
E
 
L
R
 
R
L
 
R
L
 
I
R
 
R
R
 
E
L
 
I
N
 
A
T
 
P
D
 
P
K
 
P
L
 
V
L
 
-
N
 
-
M
 
-
R
 
-
I
 
I
T
 
V
S
 
S
A
 
V
R
 
V
D
 
N
H
x
W
S
 
A
E
 
D
A
 
C
F
 
L
N
 
V
T
 
A
L
 
L
K
 
Q
D
 
Q
G
 
R
R
 
E
A
 
I
V
 
D
A
 
A
F
 
V
V
 
S
M
 
T
D
|
D
E
 
D
P
 
T
I
 
I
V
 
L
Y
 
A
G
 
G
F
 
L
K
 
V
S
 
E
T
 
E
D
 
D
P
 
P
R
 
Y
P
 
-
D
 
-
D
 
-
F
 
L
V
 
H
V
 
I
T
 
V
G
 
G
T
 
P
P
 
D
L
 
M
G
 
A
Y
 
D
E
 
Q
V
 
P
Y
 
Y
A
 
G
C
 
V
M
 
G
F
 
I
R
 
N
K
 
L
G
 
D
D
 
N
E
 
T
P
 
G
F
 
L
R
 
V
T
 
R
L
 
F
V
 
V
N
 
N
G
 
G
V
 
T
I
 
L
A
 
E
R
 
R
G
 
I
Q
 
R
T
 
N
S
 
D
G
 
G
E
 
T
A
 
W
E
 
N
R
 
T
L
 
L
Y
 
Y
R
 
R
Q
 
K
W
 
W
F
 
L
T
 
T
-
 
V
-
 
L
-
 
G
-
 
P
Q
 
A
P
 
P
I
 
A
P
 
P
P
 
P

5t0wA Crystal structure of the ancestral amino acid-binding protein anccdt- 1, a precursor of cyclohexadienyl dehydratase
26% identity, 82% coverage: 23:260/292 of query aligns to 2:228/229 of 5t0wA

query
sites
5t0wA
T
 
T
L
 
L
R
 
D
K
 
E
I
 
I
H
 
M
D
 
K
D
 
R
G
 
G
V
 
T
V
 
L
V
 
R
L
 
V
G
 
G
V
 
T
R
x
D
E
 
A
A
 
D
S
x
Y
I
 
K
P
 
P
F
 
F
S
 
S
Y
 
F
F
 
K
D
 
D
G
 
K
K
 
N
G
 
G
T
 
Q
-
 
Y
V
 
T
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
Q
 
-
T
 
-
I
 
-
A
 
-
L
 
I
Q
 
D
I
 
L
V
 
A
E
 
K
E
 
A
I
 
L
K
 
A
K
 
K
T
 
E
L
 
L
G
 
G
M
 
-
P
 
-
Q
 
-
L
 
V
K
 
K
V
 
V
H
 
E
E
 
F
I
 
V
T
 
P
V
 
T
T
 
T
S
x
W
S
 
D
N
 
G
R
 
I
T
 
I
P
 
P
M
 
A
L
 
L
L
 
Q
N
 
T
N
 
G
Q
 
K
I
 
F
D
 
D
L
 
I
E
 
V
C
 
M
G
x
S
S
x
G
T
x
M
T
|
T
H
 
I
T
 
T
V
 
P
E
 
E
R
|
R
E
 
K
N
 
K
L
 
K
A
 
V
A
 
D
F
 
F
S
 
S
N
 
D
S
 
P
F
 
Y
F
 
M
Q
 
T
Y
 
A
A
 
G
V
 
Q
R
 
T
M
 
I
I
 
L
A
 
V
R
 
K
K
 
K
N
 
D
A
 
N
G
 
A
-
 
D
-
 
K
I
 
I
T
 
K
D
 
S
F
 
F
Q
 
E
D
 
D
L
 
L
A
 
N
G
 
K
K
 
P
-
 
D
-
 
V
A
 
K
V
 
V
V
 
A
T
 
V
T
x
Q
A
 
L
G
 
G
T
|
T
S
x
T
D
 
S
E
 
E
R
 
Q
L
 
A
L
 
A
R
 
K
R
 
E
L
 
F
N
 
-
T
 
-
D
 
-
K
 
-
L
 
L
L
 
P
N
 
K
M
 
A
R
 
K
I
 
I
T
 
R
S
 
T
A
 
F
R
 
E
D
 
N
H
 
N
S
 
A
E
 
E
A
 
A
F
 
F
N
 
Q
T
 
E
L
 
V
K
 
V
D
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
A
V
 
D
A
 
A
F
 
M
V
 
V
M
 
T
D
|
D
E
 
S
P
 
P
I
 
V
V
 
A
Y
 
A
G
 
Y
F
 
Y
K
 
A
S
 
K
T
 
L
D
 
A
P
 
-
R
 
-
P
 
-
D
 
-
D
 
-
F
 
V
V
 
V
V
 
V
T
 
V
G
 
D
T
 
E
P
 
P
L
 
F
G
 
T
Y
 
H
E
 
E
V
 
P
Y
 
L
A
 
G
C
 
F
M
 
A
F
 
I
R
 
R
K
 
K
G
 
G
D
 
D
E
 
P
P
 
E
F
 
L
R
 
L
T
 
N
L
 
W
V
 
V
N
 
N
G
 
N
V
 
W
I
 
L
A
 
K
R
 
Q
G
 
M
Q
 
K
T
 
K
S
 
D
G
 
G
E
 
T
A
 
Y
E
 
D
R
 
K
L
 
L
Y
 
Y
R
 
E
Q
 
K
W
 
W
F
 
F

8eyzA Engineered glutamine binding protein bound to gln and a cobaloxime ligand (see paper)
24% identity, 80% coverage: 30:263/292 of query aligns to 2:225/226 of 8eyzA

query
sites
8eyzA
D
 
D
G
 
K
V
 
K
V
 
L
V
 
V
L
 
V
G
 
A
V
 
T
R
x
D
E
 
T
A
 
A
S
x
F
I
 
V
P
 
P
F
 
F
S
 
E
Y
 
F
F
 
K
D
 
Q
G
 
G
K
 
D
G
 
I
T
 
Y
V
 
V
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
Q
 
V
T
 
D
I
 
L
A
 
W
L
 
A
Q
 
A
I
 
I
V
 
A
E
 
K
E
 
E
I
 
L
K
 
K
K
 
L
T
 
D
L
 
Y
G
 
E
M
 
L
P
 
K
Q
 
P
L
 
M
K
 
D
V
x
F
H
 
S
E
 
G
I
 
I
T
 
I
V
 
-
T
 
-
S
 
-
S
 
-
N
 
-
R
 
-
T
 
-
P
 
P
M
 
A
L
 
L
L
 
Q
N
 
T
N
 
K
Q
 
N
I
 
V
D
 
D
L
 
L
E
 
A
C
 
L
G
x
A
S
x
G
T
 
I
T
|
T
H
 
I
T
x
C
V
 
D
E
 
E
R
|
R
E
 
K
N
 
K
L
 
A
A
 
I
A
 
D
F
 
F
S
 
S
N
 
D
S
 
G
F
 
Y
F
 
Y
Q
 
K
Y
 
S
A
 
G
V
 
L
R
 
L
-
 
V
M
 
M
I
 
V
A
 
K
R
 
A
K
 
N
N
 
N
A
 
N
G
 
D
I
 
V
T
 
K
D
 
S
F
 
V
Q
 
K
D
 
D
L
 
L
A
 
D
G
 
G
K
 
K
A
 
V
V
 
V
V
 
A
T
 
V
T
 
K
A
 
S
G
 
G
T
 
T
S
x
G
D
 
S
E
 
V
R
x
D
L
 
Y
L
 
A
R
 
K
R
 
A
L
 
-
N
 
-
T
 
-
D
 
-
K
 
-
L
 
-
L
 
-
N
 
N
M
 
I
R
 
K
I
 
T
T
 
K
S
 
D
A
 
L
R
 
R
D
 
Q
H
 
F
-
 
P
-
 
N
-
 
I
S
 
D
E
 
N
A
 
A
F
 
Y
N
 
M
T
 
E
L
 
L
K
 
G
D
 
T
G
 
N
R
 
R
A
 
A
V
 
D
A
 
A
F
 
V
V
 
L
M
 
H
D
|
D
E
 
T
P
 
P
I
 
N
V
 
I
Y
 
L
G
 
Y
F
 
F
K
 
I
S
 
K
T
 
T
D
 
-
P
 
A
R
 
G
P
 
N
D
 
G
D
 
Q
F
 
F
V
 
K
V
 
A
T
 
V
G
 
G
T
 
D
P
 
S
L
 
L
G
 
E
Y
 
A
E
 
Q
V
 
Q
Y
 
Y
A
 
G
C
 
I
M
 
A
F
 
F
R
 
P
K
 
K
G
 
G
D
 
S
E
 
D
P
 
E
F
 
L
R
 
R
T
 
D
L
 
K
V
 
V
N
 
N
G
 
G
V
 
A
I
 
L
A
 
K
R
 
T
G
 
L
Q
 
R
T
 
E
S
 
N
G
 
G
E
 
T
A
 
Y
E
 
N
R
 
E
L
 
I
Y
 
Y
R
 
K
Q
 
K
W
 
W
F
 
F
-
 
G
T
 
T
Q
 
E
P
 
P

4ymxA Crystal structure of the substrate binding protein of an amino acid abc transporter (see paper)
23% identity, 79% coverage: 31:262/292 of query aligns to 1:224/224 of 4ymxA

query
sites
4ymxA
G
 
G
V
 
V
V
 
I
V
 
V
L
 
M
G
 
G
V
 
T
R
x
S
E
 
A
A
x
D
S
x
F
I
 
P
P
 
P
F
 
F
S
 
E
Y
 
F
F
 
H
D
 
K
G
 
V
K
 
E
G
 
G
T
 
G
V
 
K
G
 
D
Y
 
E
S
 
I
Q
 
V
T
 
G
I
 
F
A
 
D
L
 
I
Q
 
D
I
 
I
V
 
A
E
 
N
E
 
A
I
 
I
K
 
A
K
 
K
T
 
K
L
 
L
G
 
G
M
 
V
P
 
-
Q
 
K
L
 
L
K
 
E
V
 
I
H
 
K
E
 
D
I
 
M
T
 
D
V
x
F
T
 
-
S
 
-
S
 
K
N
 
G
R
 
L
T
 
I
P
 
P
M
 
A
L
 
L
L
 
Q
N
 
A
N
 
G
Q
 
R
I
 
V
D
 
D
L
 
M
E
 
V
C
 
I
G
x
A
S
x
G
T
x
M
T
|
T
H
 
P
T
 
T
V
 
A
E
 
E
R
|
R
E
 
K
N
 
K
L
 
S
A
 
V
A
 
D
F
 
F
S
 
S
N
 
D
S
 
L
F
 
Y
F
 
Y
Q
 
D
Y
 
S
A
 
R
V
 
Q
R
 
V
M
 
V
I
 
V
A
 
V
R
 
K
K
 
N
N
 
D
A
 
S
G
 
P
I
 
I
T
 
S
D
 
K
F
 
F
Q
 
D
D
 
D
L
 
L
A
 
K
G
 
V
K
 
K
A
 
T
V
 
I
V
 
A
T
 
V
T
x
Q
A
 
I
G
 
G
T
|
T
S
x
T
D
 
S
E
 
E
R
 
E
L
 
A
L
 
A
R
 
K
R
 
-
L
 
-
N
 
-
T
 
-
D
 
-
K
 
K
L
 
I
L
 
P
N
 
N
M
 
V
R
 
K
I
 
L
T
 
K
S
 
Q
A
 
L
R
 
N
D
 
R
H
 
V
S
 
S
E
 
D
A
 
E
F
 
F
N
 
M
T
 
D
L
 
L
K
 
Q
D
 
N
G
 
G
R
 
R
A
 
C
V
 
D
A
 
A
F
 
I
V
 
V
M
 
V
D
x
E
E
 
D
P
 
T
I
 
V
V
 
A
Y
 
K
G
 
A
F
 
Y
K
 
L
S
 
K
T
 
E
D
 
Y
P
 
K
R
 
D
P
 
M
D
 
K
D
 
I
F
 
L
V
 
Y
V
 
M
T
 
D
G
 
E
T
 
I
P
 
N
L
 
N
G
 
V
Y
 
E
E
 
N
V
 
G
Y
 
S
A
 
A
C
 
V
M
 
A
F
 
V
R
 
A
K
 
K
G
 
G
D
 
N
E
 
K
P
 
S
F
 
L
R
 
L
T
 
D
L
 
V
V
 
V
N
 
N
G
 
E
V
 
V
I
 
I
A
 
K
R
 
E
G
 
L
Q
 
K
T
 
Q
S
 
S
G
 
G
E
 
E
A
 
Y
E
 
D
R
 
K
L
 
L
Y
 
V
R
 
D
Q
 
K
W
 
W
F
 
F
T
 
K
Q
 
Q

3k4uE Crystal structure of putative binding component of abc transporter from wolinella succinogenes dsm 1740 complexed with lysine
24% identity, 79% coverage: 31:261/292 of query aligns to 4:227/234 of 3k4uE

query
sites
3k4uE
G
 
G
V
 
E
V
 
L
V
 
R
L
 
V
G
 
G
V
 
L
R
x
E
E
 
P
A
 
G
S
x
Y
I
 
L
P
 
P
F
 
F
S
 
E
Y
 
M
F
 
K
D
 
D
G
 
K
K
 
K
G
 
G
T
 
N
V
 
V
-
 
I
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
Q
 
V
T
 
D
I
 
L
A
 
A
L
 
-
Q
 
-
I
 
-
V
 
-
E
 
R
E
 
E
I
 
M
K
 
A
K
 
K
T
 
A
L
 
M
G
 
G
M
 
V
P
 
-
Q
 
-
L
 
-
K
 
K
V
 
L
H
 
K
E
 
L
I
 
V
T
 
P
V
 
T
T
 
S
S
x
W
S
 
D
N
 
G
R
 
L
T
 
I
P
 
P
M
 
G
L
 
L
L
 
V
N
 
T
N
 
E
Q
 
K
I
 
F
D
 
D
L
 
I
E
 
I
C
 
I
G
 
S
S
x
G
T
 
M
T
|
T
H
 
I
T
 
S
V
 
Q
E
 
E
R
|
R
E
 
N
N
 
L
L
 
R
A
 
V
A
 
N
F
 
F
S
 
V
N
 
E
S
 
P
F
 
Y
F
 
I
Q
 
V
Y
 
V
A
 
G
V
 
Q
R
 
S
M
 
L
I
 
L
A
 
V
R
 
K
K
 
K
-
 
G
-
 
L
N
 
E
A
 
K
G
 
G
I
 
V
T
 
K
D
 
S
F
 
Y
Q
 
K
D
 
D
L
 
L
A
 
D
G
 
K
K
 
P
-
 
E
-
 
L
A
 
T
V
 
L
V
 
V
T
 
T
T
x
K
A
 
F
G
 
G
T
x
V
S
|
S
D
 
A
E
 
E
R
 
Y
L
 
A
L
 
A
R
 
K
R
 
R
L
 
L
N
 
-
T
 
-
D
 
-
K
 
-
L
 
F
L
 
K
N
 
N
M
 
A
R
 
K
I
 
L
T
 
K
S
 
T
A
 
Y
R
 
D
D
 
T
H
x
E
S
 
A
E
 
E
A
 
A
F
 
V
N
 
Q
T
 
E
L
 
V
K
 
L
D
 
N
G
 
G
R
 
K
A
 
A
V
 
D
A
 
M
F
 
F
V
 
I
M
 
F
D
|
D
E
 
L
P
 
P
I
 
F
V
 
N
Y
 
V
G
 
A
F
 
F
K
 
M
S
 
A
T
 
Q
D
 
K
P
 
G
R
 
Q
P
 
-
D
 
G
D
 
Y
F
 
L
V
 
V
V
 
H
T
 
L
G
 
D
T
 
T
P
 
S
L
 
L
G
 
T
Y
 
Y
E
 
E
V
 
P
Y
 
L
A
 
G
C
 
W
M
 
A
F
 
I
R
 
K
K
 
K
G
 
G
D
 
D
E
 
P
P
 
D
F
 
F
R
 
L
T
 
N
L
 
W
V
 
L
N
 
N
G
 
H
V
 
F
I
 
L
A
 
A
R
 
Q
G
 
I
Q
 
K
T
 
H
S
 
D
G
 
G
E
 
S
A
 
Y
E
 
D
R
 
E
L
 
L
Y
 
Y
R
 
E
Q
 
R
W
 
W
F
 
F
T
 
V

4i62A 1.05 angstrom crystal structure of an amino acid abc transporter substrate-binding protein abpa from streptococcus pneumoniae canada mdr_19a bound to l-arginine
24% identity, 83% coverage: 24:264/292 of query aligns to 1:235/237 of 4i62A

query
sites
4i62A
L
 
I
R
 
E
K
 
A
I
 
I
H
 
K
D
 
S
D
 
K
G
 
G
V
 
K
V
 
L
V
 
V
L
 
V
G
 
A
V
 
L
R
x
N
E
 
P
A
 
D
S
x
F
I
 
A
P
 
P
F
 
F
S
 
E
Y
 
Y
-
 
Q
-
 
K
-
 
V
F
 
V
D
 
D
G
 
G
K
 
K
G
 
N
T
 
Q
V
 
I
G
 
V
Y
 
G
S
 
S
Q
 
D
T
 
-
I
 
-
A
 
-
L
 
I
Q
 
E
I
 
L
V
 
A
E
 
K
E
 
A
I
 
I
K
 
A
K
 
T
T
 
E
L
 
L
G
 
G
M
 
V
P
 
-
Q
 
E
L
 
L
K
 
E
V
 
L
H
 
S
E
 
P
I
 
M
T
 
S
V
x
F
T
 
-
S
 
-
S
 
D
N
 
N
R
 
V
T
 
L
P
 
A
M
 
S
L
 
V
L
 
Q
N
 
S
N
 
G
Q
 
K
I
 
A
D
 
D
L
 
L
E
 
A
C
 
I
G
x
S
S
x
G
T
x
V
T
x
S
H
 
K
T
 
T
V
 
D
E
 
E
R
|
R
E
 
S
N
 
K
L
 
V
A
 
F
A
 
D
F
 
F
S
 
S
N
 
T
S
 
P
F
 
Y
F
 
Y
Q
 
T
Y
 
A
A
 
K
V
 
N
R
 
K
M
 
L
I
 
I
A
 
V
R
 
K
K
 
K
N
 
S
-
 
D
-
 
L
A
 
A
G
 
T
I
 
Y
T
 
Q
D
 
S
F
 
V
Q
 
N
D
 
D
L
 
L
A
 
A
G
 
Q
K
 
K
A
 
K
V
 
V
V
 
G
T
 
A
T
x
Q
A
 
K
G
 
G
T
x
S
S
x
I
D
x
Q
E
 
E
R
 
T
L
 
M
L
 
A
R
 
K
R
 
D
L
 
L
N
 
-
T
 
-
D
 
-
K
 
-
L
 
L
L
 
Q
N
 
N
M
 
S
R
 
S
I
 
L
T
 
V
S
 
S
A
 
L
R
 
P
D
 
K
H
 
N
S
 
G
E
 
N
A
 
L
F
 
I
N
 
T
T
 
D
L
 
L
K
 
K
D
 
S
G
 
G
R
 
Q
A
 
V
V
 
D
A
 
A
F
 
V
V
 
I
M
 
F
D
x
E
E
 
E
P
 
P
I
 
V
V
 
A
Y
 
K
G
 
G
F
 
F
K
 
V
S
 
E
T
 
N
D
 
N
P
 
P
R
 
-
P
 
-
D
 
-
D
 
D
F
 
L
V
 
A
V
 
I
T
 
A
G
 
D
T
 
-
P
 
-
L
 
L
G
 
N
Y
 
F
E
 
E
-
 
K
-
 
Q
-
 
D
-
 
D
V
 
S
Y
 
Y
A
 
A
C
 
V
M
 
A
F
 
M
R
 
K
K
 
K
G
 
D
D
 
S
E
 
K
P
 
E
F
 
L
R
 
K
T
 
E
L
 
A
V
 
V
N
 
D
G
 
K
V
 
T
I
 
I
A
 
Q
R
 
K
G
 
L
Q
 
K
T
 
E
S
 
S
G
 
G
E
 
E
A
 
L
E
 
D
R
 
K
L
 
L
Y
 
I
R
 
E
Q
 
D
W
 
A
F
 
F
T
 
K
Q
 
A
P
 
S
I
 
I

2v25A Structure of the campylobacter jejuni antigen peb1a, an aspartate and glutamate receptor with bound aspartate (see paper)
20% identity, 82% coverage: 22:259/292 of query aligns to 1:229/231 of 2v25A

query
sites
2v25A
G
 
G
T
 
K
L
 
L
R
 
E
K
 
S
I
 
I
H
 
K
D
 
S
D
 
K
G
 
G
V
 
Q
V
 
L
V
 
I
L
 
V
G
 
G
V
 
V
R
x
K
E
 
N
A
 
D
S
 
V
I
 
P
P
 
H
F
 
Y
S
 
A
Y
 
L
F
 
L
D
 
D
G
 
Q
K
 
-
G
 
-
T
 
A
V
 
T
G
 
G
Y
 
E
S
 
I
Q
 
K
T
 
G
I
 
F
A
 
E
L
 
V
Q
 
D
I
 
V
V
 
A
E
 
K
E
 
L
I
 
L
K
 
A
K
 
K
T
 
S
L
 
I
G
 
L
M
 
G
P
 
D
Q
 
D
L
 
K
K
 
K
V
 
I
H
 
K
E
 
L
I
 
V
T
 
A
V
 
V
T
 
N
S
 
A
S
 
K
N
 
T
R
|
R
T
 
G
P
 
P
M
 
L
L
 
L
L
 
D
N
 
N
N
 
G
Q
 
S
I
 
V
D
 
D
L
 
A
E
 
V
C
 
I
G
 
A
S
x
T
T
 
F
T
|
T
H
 
I
T
 
T
V
 
P
E
 
E
R
|
R
E
 
K
N
 
R
L
 
I
A
 
Y
A
 
N
F
 
F
S
 
S
N
 
E
S
 
P
F
 
Y
F
 
Y
Q
 
Q
Y
 
D
A
 
A
V
 
I
R
 
G
M
 
L
I
 
L
A
 
V
R
 
L
K
 
K
N
 
E
A
 
K
G
 
K
I
 
Y
T
 
K
D
 
S
F
 
L
Q
 
A
D
 
D
L
 
M
A
 
K
G
 
G
K
 
A
A
 
N
V
 
I
V
 
G
T
 
V
T
 
A
A
 
Q
G
 
A
T
x
A
S
x
T
D
 
T
E
 
K
R
 
K
L
 
A
L
 
I
R
 
G
R
 
E
L
 
A
N
 
A
T
 
K
D
 
K
K
 
I
L
 
G
L
 
I
N
 
D
M
 
V
R
 
K
I
 
F
T
 
S
S
 
E
A
 
F
R
 
P
D
 
D
H
x
Y
S
 
P
E
 
S
A
 
I
F
 
K
N
 
A
T
 
A
L
 
L
K
 
D
D
 
A
G
 
K
R
 
R
A
 
V
V
 
D
A
 
A
F
 
F
V
 
S
M
 
V
D
|
D
E
 
K
P
 
S
I
|
I
V
 
L
Y
 
L
G
 
G
F
 
Y
-
 
V
-
 
D
K
 
D
S
 
K
T
 
S
D
 
E
P
 
I
R
 
L
P
 
P
D
 
D
D
 
S
F
 
F
V
 
-
V
 
-
T
 
-
G
 
-
T
 
E
P
 
P
L
 
-
G
 
-
Y
 
-
E
 
Q
V
 
S
Y
 
Y
A
 
G
C
 
I
M
 
V
F
 
T
R
 
K
K
 
K
G
 
D
D
 
D
E
 
P
P
 
A
F
 
F
R
 
A
T
 
K
L
 
Y
V
 
V
N
 
D
G
 
D
V
 
F
I
 
V
A
 
K
R
 
-
G
 
-
Q
 
E
T
 
H
S
 
K
G
 
N
E
 
E
A
 
I
E
 
D
R
 
A
L
 
L
Y
 
A
R
 
K
Q
 
K
W
 
W

2pyyB Crystal structure of the glur0 ligand-binding core from nostoc punctiforme in complex with (l)-glutamate (see paper)
27% identity, 57% coverage: 94:260/292 of query aligns to 53:210/217 of 2pyyB

query
sites
2pyyB
N
 
D
N
 
N
Q
 
K
I
 
V
D
 
N
L
 
L
E
 
G
C
 
I
G
 
A
S
x
A
T
x
I
T
x
S
H
 
I
T
 
T
V
 
A
E
 
E
R
|
R
E
 
E
N
 
Q
L
 
N
A
 
F
A
 
D
F
 
F
S
 
S
N
 
L
S
 
P
F
 
I
F
 
F
Q
 
A
Y
 
S
A
 
G
V
 
L
R
 
Q
M
 
I
I
 
M
A
 
V
R
 
R
K
 
-
N
 
N
A
 
G
G
 
D
I
 
I
T
 
R
D
 
S
F
 
I
Q
 
D
D
 
D
L
 
L
A
 
P
G
 
G
K
 
K
A
 
V
V
 
V
V
 
A
T
 
T
T
|
T
A
 
A
G
 
G
T
x
S
S
x
T
D
 
A
E
 
A
R
 
T
L
 
Y
L
 
L
R
 
R
R
 
E
L
 
H
N
 
H
T
 
I
D
 
S
K
 
V
L
 
L
L
 
E
N
 
V
M
 
P
R
 
K
I
 
I
T
 
-
S
 
-
A
 
-
R
 
-
D
 
-
H
 
-
S
 
E
E
 
E
A
 
A
F
 
Y
N
 
K
T
 
A
L
 
L
K
 
Q
D
 
T
G
 
K
R
 
K
A
 
A
V
 
D
A
 
A
F
 
V
V
 
V
M
 
F
D
|
D
E
 
A
P
 
P
I
 
V
V
 
L
Y
 
L
G
 
F
F
 
Y
K
 
A
S
 
A
T
 
N
D
 
E
P
 
G
R
 
K
P
 
-
D
 
G
D
 
K
F
 
V
V
 
E
V
 
I
T
 
V
G
 
G
T
 
S
P
 
I
L
 
L
G
 
R
Y
 
E
E
 
E
V
 
S
Y
 
Y
A
 
G
C
 
I
M
 
I
F
 
L
R
 
-
K
 
P
G
 
N
D
 
N
E
 
S
P
 
P
F
 
Y
R
 
R
T
 
K
L
 
P
V
 
I
N
 
N
G
 
Q
V
 
A
I
 
L
A
 
L
R
 
N
G
 
L
Q
 
K
T
 
E
S
 
N
G
 
G
E
 
T
A
 
Y
E
 
Q
R
 
S
L
 
L
Y
 
Y
R
 
D
Q
 
K
W
 
W
F
 
F

Sites not aligning to the query:

4ohnA Crystal structure of an abc uptake transporter substrate binding protein from streptococcus pneumoniae with bound histidine
24% identity, 61% coverage: 88:265/292 of query aligns to 64:244/246 of 4ohnA

query
sites
4ohnA
R
 
K
T
 
E
P
 
A
M
 
E
L
 
L
L
 
T
N
 
K
N
 
G
Q
 
T
I
 
I
D
 
D
L
 
L
E
 
I
C
 
W
G
x
N
S
x
G
T
 
Y
T
x
S
H
 
A
T
 
T
V
 
D
E
 
E
R
|
R
E
 
R
N
 
E
L
 
K
A
 
V
A
 
A
F
 
F
S
 
S
N
 
N
S
 
S
F
 
Y
F
 
M
Q
 
K
Y
 
N
A
 
E
V
 
Q
R
 
V
M
 
L
I
 
V
A
 
T
R
 
K
K
 
K
N
 
S
A
 
S
G
 
G
I
 
I
T
 
T
D
 
T
F
 
A
Q
 
K
D
 
D
L
 
M
A
 
T
G
 
G
K
 
K
A
 
T
V
 
L
V
 
G
T
 
A
T
x
Q
A
 
A
G
 
G
T
x
S
S
|
S
-
 
G
-
 
Y
-
 
A
-
 
D
-
 
F
-
 
E
-
 
A
D
 
N
E
 
P
R
 
E
L
 
I
L
 
L
R
 
K
R
 
N
L
 
I
N
 
V
T
 
A
D
 
N
K
 
K
L
 
E
L
 
A
N
 
N
M
 
Q
R
 
Y
I
 
Q
T
 
T
S
 
-
A
 
-
R
 
-
D
 
-
H
 
F
S
 
N
E
 
E
A
 
A
F
 
L
N
 
I
T
 
D
L
 
L
K
 
K
D
 
N
G
 
D
R
 
R
A
 
I
V
 
D
A
 
G
F
 
L
V
 
L
M
 
I
D
|
D
E
 
R
P
 
V
I
 
Y
V
 
A
Y
 
N
G
 
Y
F
 
Y
K
 
L
S
 
E
T
 
A
D
 
E
P
 
G
R
 
V
P
 
L
D
 
N
D
 
D
F
 
Y
V
 
N
V
 
V
T
 
F
G
 
T
T
 
V
P
 
G
L
 
L
G
 
E
Y
 
T
E
 
E
V
 
A
Y
 
F
A
 
A
C
 
V
M
 
G
F
 
S
R
 
R
K
 
K
G
 
E
D
 
D
E
 
T
P
 
T
F
 
L
R
 
V
T
 
K
L
 
K
V
 
I
N
 
N
G
 
E
V
 
A
I
 
F
A
 
S
R
 
S
G
 
L
Q
 
Y
T
 
K
S
 
D
G
 
G
E
 
K
A
 
F
E
 
Q
R
 
E
L
 
I
Y
 
S
R
 
Q
Q
 
K
W
 
W
F
 
F
T
 
G
Q
 
E
P
 
D
I
 
V
P
 
A

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>BPHYT_RS14005 FitnessBrowser__BFirm:BPHYT_RS14005
MALTTFGAASLACSAQTDELTGTLRKIHDDGVVVLGVREASIPFSYFDGKGTVGYSQTIA
LQIVEEIKKTLGMPQLKVHEITVTSSNRTPMLLNNQIDLECGSTTHTVERENLAAFSNSF
FQYAVRMIARKNAGITDFQDLAGKAVVTTAGTSDERLLRRLNTDKLLNMRITSARDHSEA
FNTLKDGRAVAFVMDEPIVYGFKSTDPRPDDFVVTGTPLGYEVYACMFRKGDEPFRTLVN
GVIARGQTSGEAERLYRQWFTQPIPPHGINLNFPLSEQNRALFAHPNDRALD

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory