SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing BPHYT_RS16040 FitnessBrowser__BFirm:BPHYT_RS16040 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3d3wA Structure of l-xylulose reductase with bound coenzyme, phosphate and hydroxide. (see paper)
48% identity, 97% coverage: 7:244/245 of query aligns to 5:243/244 of 3d3wA

query
sites
3d3wA
F
 
L
S
 
A
G
 
G
R
 
R
S
 
R
I
 
V
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
x
G
S
x
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
G
T
 
T
V
 
V
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
C
 
H
A
 
A
S
 
T
G
 
G
A
 
A
N
 
R
V
 
V
V
 
V
A
 
A
A
 
V
A
x
S
R
|
R
N
x
T
V
 
Q
S
 
A
E
 
D
L
 
L
A
 
D
R
 
S
L
 
L
A
 
V
E
 
R
E
 
E
-
 
C
T
 
P
G
 
G
C
 
I
E
 
E
P
 
P
L
 
V
V
 
C
L
x
V
D
 
D
V
x
L
S
 
G
D
 
D
E
 
W
A
 
E
A
 
A
I
 
T
D
 
E
D
 
R
A
 
A
L
 
L
G
 
G
S
 
S
L
 
V
D
 
G
V
 
P
F
 
V
D
 
D
G
 
L
L
 
L
V
 
V
N
 
N
C
x
N
A
|
A
G
x
A
I
 
V
A
 
A
L
 
L
L
 
L
E
 
Q
R
 
P
A
 
F
V
 
L
D
 
E
T
 
V
T
 
T
G
 
K
A
 
E
S
 
A
F
 
F
D
 
D
R
 
R
V
 
S
M
 
F
A
 
E
V
|
V
N
 
N
A
 
L
R
 
R
G
 
A
A
 
V
V
 
I
L
 
Q
V
 
V
A
 
S
K
 
Q
H
 
I
V
 
V
A
 
A
R
 
R
G
 
G
M
 
L
I
 
I
D
 
A
A
 
R
Q
 
G
R
 
V
G
 
P
G
 
G
S
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
V
|
V
S
|
S
S
|
S
Q
 
Q
A
 
C
A
 
S
L
 
Q
V
 
R
A
 
A
L
 
V
D
 
T
D
 
N
H
|
H
L
 
S
S
 
V
Y
|
Y
S
 
C
A
 
S
S
 
T
K
|
K
A
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
M
V
 
L
T
 
T
R
 
K
A
 
V
L
 
M
C
 
A
V
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
P
F
 
H
G
 
K
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
A
V
 
V
N
 
N
P
|
P
T
|
T
V
 
V
T
x
V
L
 
M
T
|
T
P
x
S
M
|
M
A
x
G
V
 
Q
L
 
A
A
 
T
W
 
W
S
 
S
D
 
D
P
 
P
V
 
H
K
 
K
R
 
A
D
 
K
P
 
T
A
 
M
L
 
L
K
 
N
A
 
R
I
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
K
F
 
F
A
 
A
E
 
E
S
 
V
A
 
E
E
 
H
V
 
V
A
 
V
A
 
N
P
 
A
I
 
I
L
 
L
F
 
F
L
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
D
G
 
R
A
 
S
S
 
G
M
 
M
I
 
T
S
 
T
G
 
G
V
 
S
C
 
T
L
 
L
A
 
P
V
 
V
D
 
E
G
 
G
G
 
G
Y
 
F
T
 
W
A
 
A

1pr9A Human l-xylulose reductase holoenzyme (see paper)
48% identity, 97% coverage: 7:244/245 of query aligns to 5:243/244 of 1pr9A

query
sites
1pr9A
F
 
L
S
 
A
G
 
G
R
 
R
S
 
R
I
 
V
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
x
G
S
x
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
G
T
 
T
V
 
V
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
C
 
H
A
 
A
S
 
T
G
 
G
A
 
A
N
 
R
V
 
V
V
 
V
A
 
A
A
 
V
A
x
S
R
|
R
N
x
T
V
 
Q
S
 
A
E
 
D
L
 
L
A
 
D
R
 
S
L
 
L
A
 
V
E
 
R
E
 
E
-
 
C
T
 
P
G
 
G
C
 
I
E
 
E
P
 
P
L
 
V
V
 
C
L
 
V
D
 
D
V
x
L
S
 
G
D
 
D
E
 
W
A
 
E
A
 
A
I
 
T
D
 
E
D
 
R
A
 
A
L
 
L
G
 
G
S
 
S
L
 
V
D
 
G
V
 
P
F
 
V
D
 
D
G
 
L
L
 
L
V
 
V
N
 
N
C
x
N
A
 
A
G
x
A
I
 
V
A
 
A
L
 
L
L
 
L
E
 
Q
R
 
P
A
 
F
V
 
L
D
 
E
T
 
V
T
 
T
G
 
K
A
 
E
S
 
A
F
 
F
D
 
D
R
 
R
V
 
S
M
 
F
A
 
E
V
|
V
N
 
N
A
 
L
R
 
R
G
 
A
A
 
V
V
 
I
L
 
Q
V
 
V
A
 
S
K
 
Q
H
 
I
V
 
V
A
 
A
R
 
R
G
 
G
M
 
L
I
 
I
D
 
A
A
 
R
Q
 
G
R
 
V
G
 
P
G
 
G
S
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
V
|
V
S
 
S
S
|
S
Q
 
Q
A
x
C
A
 
S
L
 
Q
V
 
R
A
 
A
L
 
V
D
 
T
D
 
N
H
|
H
L
 
S
S
 
V
Y
|
Y
S
 
C
A
 
S
S
 
T
K
|
K
A
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
M
V
 
L
T
 
T
R
 
K
A
 
V
L
 
M
C
 
A
V
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
P
F
 
H
G
 
K
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
A
V
 
V
N
 
N
P
 
P
T
|
T
V
 
V
T
x
V
L
 
M
T
|
T
P
 
S
M
|
M
A
 
G
V
 
Q
L
 
A
A
 
T
W
 
W
S
 
S
D
 
D
P
 
P
V
 
H
K
 
K
R
 
A
D
 
K
P
 
T
A
 
M
L
 
L
K
 
N
A
 
R
I
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
K
F
 
F
A
 
A
E
 
E
S
 
V
A
 
E
E
 
H
V
 
V
A
 
V
A
 
N
P
 
A
I
 
I
L
 
L
F
 
F
L
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
D
G
 
R
A
 
S
S
 
G
M
 
M
I
 
T
S
 
T
G
 
G
V
 
S
C
 
T
L
 
L
A
 
P
V
 
V
D
 
E
G
 
G
G
 
G
Y
 
F
T
 
W
A
 
A

Q7Z4W1 L-xylulose reductase; XR; Carbonyl reductase II; Dicarbonyl/L-xylulose reductase; Kidney dicarbonyl reductase; kiDCR; Short chain dehydrogenase/reductase family 20C member 1; Sperm surface protein P34H; EC 1.1.1.10 from Homo sapiens (Human) (see 2 papers)
48% identity, 97% coverage: 7:244/245 of query aligns to 5:243/244 of Q7Z4W1

query
sites
Q7Z4W1
F
 
L
S
 
A
G
 
G
R
 
R
S
 
R
I
 
V
L
|
L
V
|
V
T
|
T
G
|
G
A
|
A
S
x
G
S
x
K
G
|
G
I
|
I
G
|
G
R
|
R
A
x
G
T
|
T
V
|
V
E
x
Q
A
|
A
L
|
L
C
x
H
A
|
A
S
x
T
G
|
G
A
|
A
N
x
R
V
|
V
V
|
V
A
|
A
A
x
V
A
x
S
R
|
R
N
x
T
V
 
Q
S
 
A
E
 
D
L
 
L
A
 
D
R
 
S
L
 
L
A
 
V
E
 
R
E
 
E
-
 
C
T
 
P
G
 
G
C
 
I
E
 
E
P
 
P
L
 
V
V
 
C
L
 
V
D
 
D
V
 
L
S
 
G
D
 
D
E
 
W
A
 
E
A
 
A
I
 
T
D
 
E
D
 
R
A
 
A
L
 
L
G
 
G
S
 
S
L
 
V
D
 
G
V
 
P
F
 
V
D
 
D
G
 
L
L
 
L
V
 
V
N
 
N
C
 
N
A
 
A
G
 
A
I
 
V
A
 
A
L
 
L
L
 
L
E
 
Q
R
 
P
A
 
F
V
 
L
D
 
E
T
 
V
T
 
T
G
 
K
A
 
E
S
 
A
F
 
F
D
 
D
R
 
R
V
 
S
M
 
F
A
 
E
V
 
V
N
|
N
A
 
L
R
 
R
G
 
A
A
 
V
V
 
I
L
 
Q
V
 
V
A
 
S
K
 
Q
H
 
I
V
 
V
A
 
A
R
 
R
G
 
G
M
 
L
I
 
I
D
 
A
A
 
R
Q
 
G
R
 
V
G
 
P
G
 
G
S
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
V
 
V
S
 
S
S
|
S
Q
 
Q
A
 
C
A
 
S
L
 
Q
V
 
R
A
 
A
L
 
V
D
 
T
D
 
N
H
 
H
L
 
S
S
 
V
Y
 
Y
S
 
C
A
 
S
S
 
T
K
|
K
A
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
M
V
 
L
T
 
T
R
 
K
A
 
V
L
 
M
C
 
A
V
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
P
F
 
H
G
 
K
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
A
V
 
V
N
 
N
P
 
P
T
 
T
V
 
V
T
 
V
L
 
M
T
 
T
P
 
S
M
 
M
A
 
G
V
 
Q
L
 
A
A
 
T
W
 
W
S
 
S
D
 
D
P
 
P
V
 
H
K
 
K
R
 
A
D
 
K
P
 
T
A
 
M
L
 
L
K
 
N
A
 
R
I
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
K
F
 
F
A
 
A
E
 
E
S
 
V
A
 
E
E
 
H
V
 
V
A
 
V
A
 
N
P
 
A
I
 
I
L
 
L
F
 
F
L
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
D
G
 
R
A
 
S
S
 
G
M
 
M
I
 
T
S
 
T
G
 
G
V
 
S
C
 
T
L
 
L
A
 
P
V
 
V
D
 
E
G
 
G
G
 
G
Y
 
F
T
 
W
A
 
A

Sites not aligning to the query:

Q920P0 L-xylulose reductase; XR; Dicarbonyl/L-xylulose reductase; EC 1.1.1.10 from Rattus norvegicus (Rat) (see paper)
49% identity, 97% coverage: 7:244/245 of query aligns to 5:243/244 of Q920P0

query
sites
Q920P0
F
 
L
S
 
A
G
 
G
R
 
R
S
 
R
I
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
G
S
 
K
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
S
T
 
T
V
 
V
E
 
L
A
 
A
L
 
L
C
 
Q
A
 
A
S
 
A
G
 
G
A
 
A
N
 
Q
V
 
V
V
 
V
A
 
A
A
 
V
A
 
S
R
 
R
N
 
T
V
 
R
S
 
E
E
 
D
L
 
L
A
 
D
R
 
S
L
 
L
A
 
V
E
 
R
E
 
E
-
 
C
T
 
P
G
 
G
C
 
V
E
 
E
P
 
P
L
 
V
V
 
C
L
 
V
D
 
D
V
 
L
S
 
A
D
 
D
E
 
W
A
 
E
A
 
A
I
 
T
D
 
E
D
 
Q
A
 
A
L
 
L
G
 
S
S
 
N
L
 
V
D
 
G
V
 
P
F
 
V
D
 
D
G
 
L
L
 
L
V
 
V
N
 
N
C
 
N
A
 
A
G
 
A
I
 
V
A
 
A
L
 
T
L
 
L
E
 
Q
R
 
P
A
 
F
V
 
L
D
 
E
T
 
V
T
 
T
G
 
K
A
 
E
S
 
A
F
 
C
D
 
D
R
 
T
V
 
S
M
 
F
A
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
F
R
 
R
G
 
A
A
 
V
V
 
V
L
 
Q
V
 
V
A
 
S
K
 
Q
H
 
I
V
 
V
A
 
A
R
 
R
G
 
G
M
 
M
I
 
I
D
 
A
A
 
R
Q
 
G
R
 
V
G
 
P
G
 
G
S
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
V
 
V
S
 
S
S
|
S
Q
|
Q
A
 
A
A
 
S
L
 
Q
V
 
R
A
 
A
L
|
L
D
 
T
D
 
N
H
|
H
L
 
T
S
 
V
Y
|
Y
S
 
C
A
 
S
S
 
T
K
|
K
A
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
M
V
 
L
T
 
T
R
 
K
A
 
V
L
 
M
C
 
A
V
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
P
F
 
H
G
 
K
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
A
V
 
V
N
 
N
P
 
P
T
 
T
V
 
V
T
 
V
L
 
M
T
 
T
P
 
P
M
 
M
A
 
G
V
 
R
L
 
A
A
x
N
W
|
W
S
 
S
D
 
D
P
 
P
V
 
H
K
 
K
R
 
A
D
 
K
P
 
V
A
 
M
L
 
L
K
 
D
A
 
R
I
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
K
F
 
F
A
 
A
E
 
E
S
 
V
A
 
E
E
 
N
V
 
V
A
 
V
A
 
D
P
 
T
I
 
I
L
 
L
F
 
F
L
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
N
G
 
R
A
 
S
S
 
S
M
 
M
I
 
T
S
 
T
G
 
G
V
 
S
C
 
A
L
 
L
A
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
F
T
 
L
A
 
A

P08074 Carbonyl reductase [NADPH] 2; Adipocyte protein P27; AP27; Lung carbonyl reductase; LCR; NADPH-dependent carbonyl reductase 2; EC 1.1.1.184 from Mus musculus (Mouse) (see 2 papers)
46% identity, 98% coverage: 5:244/245 of query aligns to 3:243/244 of P08074

query
sites
P08074
F
 
L
D
 
N
F
 
F
S
 
S
G
 
G
R
 
L
S
 
R
I
 
A
L
|
L
V
|
V
T
|
T
G
|
G
A
|
A
S
x
G
S
x
K
G
|
G
I
|
I
G
|
G
R
|
R
A
x
D
T
|
T
V
|
V
E
x
K
A
|
A
L
|
L
C
x
H
A
|
A
S
|
S
G
|
G
A
|
A
N
x
K
V
|
V
V
|
V
A
|
A
A
x
V
A
x
T
R
|
R
N
 
T
V
 
N
S
 
S
E
 
D
L
 
L
A
 
V
R
 
S
L
 
L
A
 
A
E
 
K
E
 
E
-
 
C
T
 
P
G
 
G
C
 
I
E
 
E
P
 
P
L
 
V
V
 
C
L
 
V
D
 
D
V
 
L
S
 
G
D
 
D
E
 
W
A
 
D
A
 
A
I
 
T
D
 
E
D
 
K
A
 
A
L
 
L
G
 
G
S
 
G
L
 
I
D
 
G
V
 
P
F
 
V
D
 
D
G
 
L
L
 
L
V
 
V
N
 
N
C
 
N
A
 
A
G
 
A
I
 
L
A
 
V
L
 
I
L
 
M
E
 
Q
R
 
P
A
 
F
V
 
L
D
 
E
T
 
V
T
 
T
G
 
K
A
 
E
S
 
A
F
 
F
D
 
D
R
 
R
V
 
S
M
 
F
A
 
S
V
 
V
N
 
N
A
 
L
R
 
R
G
 
S
A
 
V
V
 
F
L
 
Q
V
 
V
A
 
S
K
 
Q
H
 
M
V
 
V
A
 
A
R
 
R
G
 
D
M
 
M
I
 
I
D
 
N
A
 
R
Q
 
G
R
 
V
G
 
P
G
 
G
S
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
N
V
 
V
S
 
S
S
 
S
Q
 
M
A
 
V
A
 
A
L
 
H
V
 
V
A
 
T
L
 
F
D
 
P
D
 
N
H
 
L
L
 
I
S
 
T
Y
 
Y
S
 
S
A
 
S
S
 
T
K
 
K
A
 
G
A
 
A
L
 
M
D
 
T
A
 
M
V
 
L
T
 
T
R
 
K
A
 
A
L
 
M
C
 
A
V
 
M
E
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
P
F
 
H
G
 
K
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
S
V
 
V
N
 
N
P
 
P
T
 
T
V
 
V
T
 
V
L
 
L
T
 
T
P
 
D
M
 
M
A
 
G
V
 
K
L
 
K
A
 
V
W
 
S
S
 
A
D
 
D
P
 
P
V
 
E
K
 
F
R
 
A
D
 
R
P
 
K
A
 
L
L
 
K
K
 
E
A
 
R
I
 
H
P
 
P
L
 
L
G
 
R
R
 
K
F
 
F
A
 
A
E
 
E
S
 
V
A
 
E
E
 
D
V
 
V
A
 
V
A
 
N
P
 
S
I
 
I
L
 
L
F
 
F
L
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
D
G
 
R
A
 
S
S
 
A
M
 
S
I
 
T
S
 
S
G
 
G
V
 
G
C
 
G
L
 
I
A
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
A
G
 
G
Y
 
Y
T
 
L
A
 
A

1cydA Carbonyl reductase complexed with NADPH and 2-propanol (see paper)
46% identity, 98% coverage: 5:244/245 of query aligns to 1:241/242 of 1cydA

query
sites
1cydA
F
 
L
D
 
N
F
 
F
S
 
S
G
 
G
R
 
L
S
 
R
I
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
x
G
S
x
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
D
T
 
T
V
 
V
E
 
K
A
 
A
L
 
L
C
 
H
A
 
A
S
 
S
G
 
G
A
 
A
N
 
K
V
 
V
V
 
V
A
 
A
A
 
V
A
 
T
R
|
R
N
x
T
V
 
N
S
 
S
E
 
D
L
 
L
A
 
V
R
 
S
L
 
L
A
 
A
E
 
K
E
 
E
-
 
C
T
 
P
G
 
G
C
 
I
E
 
E
P
 
P
L
 
V
V
 
C
L
 
V
D
|
D
V
x
L
S
 
G
D
 
D
E
 
W
A
 
D
A
 
A
I
 
T
D
 
E
D
 
K
A
 
A
L
 
L
G
 
G
S
 
G
L
 
I
D
 
G
V
 
P
F
 
V
D
 
D
G
 
L
L
 
L
V
 
V
N
 
N
C
x
N
A
 
A
G
x
A
I
 
L
A
 
V
L
 
I
L
 
M
E
 
Q
R
 
P
A
 
F
V
 
L
D
 
E
T
 
V
T
 
T
G
 
K
A
 
E
S
 
A
F
 
F
D
 
D
R
 
R
V
 
S
M
 
F
A
 
S
V
|
V
N
 
N
A
 
L
R
 
R
G
 
S
A
 
V
V
 
F
L
 
Q
V
 
V
A
 
S
K
 
Q
H
 
M
V
 
V
A
 
A
R
 
R
G
 
D
M
 
M
I
 
I
D
 
N
A
 
R
Q
 
G
R
 
V
G
 
P
G
 
G
S
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
N
V
|
V
S
 
S
S
|
S
Q
 
M
A
 
V
A
 
A
L
 
H
V
 
V
A
 
T
L
 
F
D
 
P
D
 
N
H
x
L
L
 
I
S
 
T
Y
|
Y
S
 
S
A
 
S
S
 
T
K
|
K
A
 
G
A
 
A
L
 
M
D
 
T
A
 
M
V
 
L
T
 
T
R
 
K
A
 
A
L
 
M
C
 
A
V
 
M
E
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
P
F
 
H
G
 
K
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
S
V
 
V
N
 
N
P
|
P
T
|
T
V
|
V
T
x
V
L
 
L
T
|
T
P
 
D
M
|
M
A
x
G
V
 
K
L
 
K
A
x
V
W
 
S
S
 
A
D
 
D
P
 
P
V
 
E
K
 
F
R
 
A
D
 
R
P
 
K
A
 
L
L
 
K
K
 
E
A
 
R
I
 
H
P
 
P
L
 
L
G
 
R
R
 
K
F
 
F
A
 
A
E
 
E
S
 
V
A
 
E
E
 
D
V
 
V
A
 
V
A
 
N
P
 
S
I
 
I
L
 
L
F
 
F
L
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
D
G
 
R
A
 
S
S
 
A
M
 
S
I
 
T
S
 
S
G
 
G
V
 
G
C
 
G
L
 
I
A
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
A
G
 
G
Y
 
Y
T
 
L
A
 
A

5jlaD Crystal structure of ribose-5-phosphate isomerase from brucella melitensis 16m
38% identity, 98% coverage: 3:242/245 of query aligns to 1:244/259 of 5jlaD

query
sites
5jlaD
A
 
A
T
 
S
F
 
A
D
 
E
F
 
F
S
 
N
G
 
G
R
 
A
S
 
I
I
 
A
L
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
 
G
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
T
 
C
V
 
A
E
 
E
A
 
L
L
 
L
C
 
S
A
 
R
S
 
S
G
 
G
A
 
A
N
 
N
V
 
V
V
 
I
A
 
V
A
 
A
A
x
D
R
|
R
N
 
D
V
 
I
S
 
E
E
 
A
L
 
A
A
 
T
R
 
R
L
 
V
A
 
A
E
 
R
E
 
A
T
 
T
G
 
G
C
 
G
E
 
K
P
 
T
L
 
L
V
 
V
L
|
L
D
|
D
V
|
V
S
 
G
D
 
E
E
 
D
A
 
A
A
 
S
I
 
V
-
 
T
-
 
A
-
 
A
-
 
A
D
 
N
D
 
E
A
 
V
L
 
R
G
 
A
S
 
R
L
 
Y
D
 
G
V
 
V
F
 
A
D
 
D
G
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
C
|
C
A
|
A
G
 
G
I
 
V
A
 
-
L
 
-
L
 
L
E
 
Q
R
 
R
A
 
T
V
 
L
-
 
P
-
 
P
-
 
G
D
 
E
T
 
L
T
 
A
G
 
Q
A
 
R
S
 
E
F
 
W
D
 
D
R
 
V
V
 
V
M
 
S
A
 
R
V
 
I
N
 
D
A
 
L
R
 
R
G
 
G
A
 
T
V
 
Y
L
 
L
V
 
C
A
 
C
K
 
A
H
 
A
V
 
F
A
 
G
R
 
A
G
 
P
M
 
M
I
 
A
D
 
D
A
 
R
Q
 
R
R
 
R
G
 
-
G
 
G
S
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
N
V
x
I
S
 
A
S
|
S
Q
 
V
A
 
A
A
 
G
L
 
M
V
 
R
A
 
S
L
 
G
D
 
P
D
x
L
H
 
H
L
 
-
S
 
A
Y
|
Y
S
 
G
A
 
P
S
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
L
 
V
D
 
I
A
 
S
V
 
L
T
 
T
R
 
E
A
 
T
L
 
L
C
 
A
V
 
G
E
 
E
L
 
W
G
 
G
P
 
P
F
 
K
G
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
C
V
 
V
N
 
S
P
|
P
T
x
G
V
x
F
T
|
T
L
 
Q
T
|
T
P
 
P
M
x
A
A
 
L
V
 
E
L
 
R
A
 
G
W
 
F
-
 
T
S
 
T
D
x
H
P
 
T
V
 
L
K
 
K
R
 
A
D
 
D
P
 
V
A
 
L
L
 
R
K
 
D
A
 
A
I
 
A
P
 
A
L
 
L
G
 
G
R
 
H
F
 
I
A
 
V
E
 
S
S
 
A
A
 
N
E
 
E
V
 
I
A
 
A
A
 
E
P
 
A
I
 
V
L
 
V
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
G
 
E
G
 
R
A
 
A
S
 
S
M
 
A
I
 
I
S
 
T
G
 
G
V
 
V
C
 
N
L
 
L
A
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
A
G
 
G
Y
 
Y

3lqfA Crystal structure of the short-chain dehydrogenase galactitol- dehydrogenase (gatdh) of rhodobacter sphaeroides in complex with NAD and erythritol (see paper)
38% identity, 98% coverage: 5:243/245 of query aligns to 7:252/254 of 3lqfA

query
sites
3lqfA
F
 
F
D
 
R
F
 
L
S
 
D
G
 
G
R
 
A
S
 
C
I
 
A
L
 
A
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
 
G
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
E
T
 
I
V
 
C
E
 
R
A
 
A
L
 
F
C
 
A
A
 
A
S
 
S
G
 
G
A
 
A
N
 
R
V
 
L
V
 
I
A
 
L
A
 
I
A
x
D
R
|
R
N
 
E
V
 
A
S
 
A
E
 
A
L
 
L
A
 
D
R
 
R
L
 
A
A
 
A
E
 
Q
E
 
E
T
 
L
G
 
G
C
 
A
E
 
A
-
 
V
-
 
A
-
 
A
P
 
R
L
 
I
V
 
V
L
 
A
D
|
D
V
|
V
S
 
T
D
 
D
E
 
A
A
 
E
A
 
A
I
 
M
D
 
T
D
 
A
A
 
A
L
 
A
G
 
A
S
 
E
L
 
A
D
 
E
V
 
A
F
 
V
D
 
A
G
 
P
-
 
V
-
 
S
-
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
C
x
S
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
A
L
 
R
L
 
L
E
 
H
R
 
D
A
 
A
V
 
L
D
 
E
T
 
T
T
 
D
G
 
D
A
 
A
S
 
T
F
 
W
D
 
R
R
 
Q
V
 
V
M
 
M
A
 
A
V
 
V
N
 
N
A
 
V
R
 
D
G
 
G
A
 
M
V
 
F
L
 
W
V
 
A
A
 
S
K
 
R
H
 
A
V
 
F
A
 
G
R
 
R
G
 
A
M
 
M
I
 
V
D
 
-
A
 
A
Q
 
R
R
 
G
G
 
A
G
 
G
S
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
V
x
L
S
 
G
S
|
S
Q
 
M
A
 
S
A
 
G
L
 
T
V
 
I
A
 
V
L
x
N
D
 
R
D
 
P
H
 
Q
L
 
F
-
 
A
-
 
S
S
 
S
Y
|
Y
S
 
M
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
A
L
 
V
D
 
H
A
 
Q
V
 
L
T
 
T
R
 
R
A
 
A
L
 
L
C
 
A
V
 
A
E
 
E
L
 
W
G
 
A
P
 
G
F
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
A
V
 
L
N
 
A
P
|
P
T
 
G
V
x
Y
T
x
V
L
 
A
T
|
T
P
 
E
M
|
M
A
x
T
V
 
L
L
 
K
A
x
M
W
 
R
S
 
E
D
 
R
P
 
P
V
 
E
K
 
L
R
 
F
D
 
E
P
 
T
A
 
W
L
 
L
K
 
D
A
 
M
I
 
T
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
R
F
 
C
A
 
G
E
 
E
S
 
P
A
 
S
E
 
E
V
 
I
A
 
A
A
 
A
P
 
A
I
 
A
L
 
L
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
G
 
P
G
 
A
A
 
A
S
 
S
M
 
Y
I
 
V
S
 
T
G
 
G
V
 
A
C
 
I
L
 
L
A
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T

2wsbA Crystal structure of the short-chain dehydrogenase galactitol-dehydrogenase (gatdh) of rhodobacter sphaeroides in complex with NAD (see paper)
38% identity, 98% coverage: 5:243/245 of query aligns to 7:252/254 of 2wsbA

query
sites
2wsbA
F
 
F
D
 
R
F
 
L
S
 
D
G
 
G
R
 
A
S
 
C
I
 
A
L
 
A
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
 
G
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
E
T
 
I
V
 
C
E
 
R
A
 
A
L
 
F
C
 
A
A
 
A
S
 
S
G
 
G
A
 
A
N
 
R
V
 
L
V
 
I
A
 
L
A
 
I
A
x
D
R
|
R
N
 
E
V
 
A
S
 
A
E
 
A
L
 
L
A
 
D
R
 
R
L
 
A
A
 
A
E
 
Q
E
 
E
T
 
L
G
 
G
C
 
A
E
 
A
-
 
V
-
 
A
-
 
A
P
 
R
L
 
I
V
 
V
L
 
A
D
|
D
V
|
V
S
 
T
D
 
D
E
 
A
A
 
E
A
 
A
I
 
M
D
 
T
D
 
A
A
 
A
L
 
A
G
 
A
S
 
E
L
 
A
D
 
E
V
 
A
F
 
V
D
 
A
G
 
P
-
 
V
-
 
S
-
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
C
x
S
A
|
A
G
 
G
I
 
I
A
 
A
L
 
R
L
 
L
E
 
H
R
 
D
A
 
A
V
 
L
D
 
E
T
 
T
T
 
D
G
 
D
A
 
A
S
 
T
F
 
W
D
 
R
R
 
Q
V
 
V
M
 
M
A
 
A
V
 
V
N
 
N
A
 
V
R
 
D
G
 
G
A
 
M
V
 
F
L
 
W
V
 
A
A
 
S
K
 
R
H
 
A
V
 
F
A
 
G
R
 
R
G
 
A
M
 
M
I
 
V
D
 
-
A
 
A
Q
 
R
R
 
G
G
 
A
G
 
G
S
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
V
x
L
S
 
G
S
|
S
Q
x
M
A
 
S
A
 
G
L
 
T
V
 
I
A
 
V
L
x
N
D
 
R
D
 
P
H
 
Q
L
 
F
-
 
A
-
 
S
S
 
S
Y
|
Y
S
 
M
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
A
L
 
V
D
 
H
A
 
Q
V
 
L
T
 
T
R
 
R
A
 
A
L
 
L
C
 
A
V
 
A
E
 
E
L
 
W
G
 
A
P
 
G
F
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
A
V
 
L
N
 
A
P
|
P
T
 
G
V
x
Y
T
x
V
L
 
A
T
|
T
P
 
E
M
|
M
A
x
T
V
 
L
L
 
K
A
 
M
W
 
R
S
 
E
D
 
R
P
 
P
V
 
E
K
 
L
R
 
F
D
 
E
P
 
T
A
 
W
L
 
L
K
 
D
A
 
M
I
 
T
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
R
F
 
C
A
 
G
E
 
E
S
 
P
A
 
S
E
 
E
V
 
I
A
 
A
A
 
A
P
 
A
I
 
A
L
 
L
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
G
 
P
G
 
A
A
 
A
S
 
S
M
 
Y
I
 
V
S
 
T
G
 
G
V
 
A
C
 
I
L
 
L
A
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T

2wdzA Crystal structure of the short chain dehydrogenase galactitol-dehydrogenase (gatdh) of rhodobacter sphaeroides in complex with NAD+ and 1,2-pentandiol (see paper)
38% identity, 98% coverage: 5:243/245 of query aligns to 7:252/254 of 2wdzA

query
sites
2wdzA
F
 
F
D
 
R
F
 
L
S
 
D
G
 
G
R
 
A
S
 
C
I
 
A
L
 
A
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
 
G
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
E
T
 
I
V
 
C
E
 
R
A
 
A
L
 
F
C
 
A
A
 
A
S
 
S
G
 
G
A
 
A
N
 
R
V
 
L
V
 
I
A
 
L
A
 
I
A
x
D
R
|
R
N
 
E
V
x
A
S
 
A
E
 
A
L
 
L
A
x
D
R
 
R
L
 
A
A
 
A
E
 
Q
E
 
E
T
 
L
G
 
G
C
 
A
E
 
A
-
 
V
-
 
A
-
 
A
P
x
R
L
 
I
V
 
V
L
x
A
D
|
D
V
|
V
S
 
T
D
 
D
E
 
A
A
 
E
A
 
A
I
 
M
D
 
T
D
 
A
A
 
A
L
 
A
G
 
A
S
 
E
L
 
A
D
 
E
V
 
A
F
 
V
D
 
A
G
 
P
-
 
V
-
 
S
-
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
C
x
S
A
|
A
G
 
G
I
 
I
A
 
A
L
 
R
L
 
L
E
 
H
R
 
D
A
 
A
V
 
L
D
 
E
T
 
T
T
 
D
G
 
D
A
 
A
S
 
T
F
 
W
D
 
R
R
 
Q
V
 
V
M
 
M
A
 
A
V
 
V
N
 
N
A
 
V
R
 
D
G
 
G
A
 
M
V
 
F
L
 
W
V
 
A
A
 
S
K
 
R
H
 
A
V
 
F
A
 
G
R
 
R
G
 
A
M
 
M
I
 
V
D
 
-
A
 
A
Q
 
R
R
 
G
G
 
A
G
 
G
S
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
V
x
L
S
 
G
S
|
S
Q
 
M
A
x
S
A
 
G
L
 
T
V
 
I
A
 
V
L
 
N
D
 
R
D
 
P
H
 
Q
L
 
F
-
 
A
-
 
S
S
 
S
Y
|
Y
S
 
M
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
A
L
 
V
D
 
H
A
 
Q
V
 
L
T
 
T
R
 
R
A
 
A
L
 
L
C
 
A
V
 
A
E
 
E
L
 
W
G
 
A
P
 
G
F
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
A
V
 
L
N
 
A
P
|
P
T
 
G
V
 
Y
T
x
V
L
 
A
T
|
T
P
 
E
M
|
M
A
x
T
V
 
L
L
 
K
A
 
M
W
 
R
S
 
E
D
 
R
P
 
P
V
 
E
K
 
L
R
 
F
D
 
E
P
 
T
A
 
W
L
 
L
K
 
D
A
 
M
I
 
T
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
R
F
 
C
A
 
G
E
 
E
S
 
P
A
 
S
E
 
E
V
 
I
A
 
A
A
 
A
P
 
A
I
 
A
L
 
L
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
G
 
P
G
 
A
A
 
A
S
 
S
M
 
Y
I
 
V
S
 
T
G
 
G
V
 
A
C
 
I
L
 
L
A
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T

C0KTJ6 Galactitol 2-dehydrogenase (L-tagatose-forming); Galactitol dehydrogenase; GDH; GatDH; Galactitol:NAD(+) 5-oxidoreductase; EC 1.1.1.406 from Cereibacter sphaeroides (Rhodobacter sphaeroides) (see paper)
38% identity, 98% coverage: 5:243/245 of query aligns to 7:252/254 of C0KTJ6

query
sites
C0KTJ6
F
 
F
D
 
R
F
 
L
S
 
D
G
 
G
R
 
A
S
 
C
I
 
A
L
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
G
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
E
T
 
I
V
 
C
E
 
R
A
 
A
L
 
F
C
 
A
A
 
A
S
 
S
G
 
G
A
 
A
N
 
R
V
 
L
V
 
I
A
 
L
A
 
I
A
x
D
R
 
R
N
 
E
V
 
A
S
 
A
E
 
A
L
 
L
A
 
D
R
 
R
L
 
A
A
 
A
E
 
Q
E
 
E
T
 
L
G
 
G
C
 
A
E
 
A
-
 
V
-
 
A
-
 
A
P
 
R
L
 
I
V
 
V
L
 
A
D
|
D
V
|
V
S
 
T
D
 
D
E
 
A
A
 
E
A
 
A
I
 
M
D
 
T
D
 
A
A
 
A
L
 
A
G
 
A
S
 
E
L
 
A
D
 
E
V
 
A
F
 
V
D
 
A
G
 
P
-
 
V
-
 
S
-
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
C
 
S
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
A
L
 
R
L
 
L
E
 
H
R
 
D
A
 
A
V
 
L
D
 
E
T
 
T
T
 
D
G
 
D
A
 
A
S
 
T
F
 
W
D
 
R
R
 
Q
V
 
V
M
 
M
A
 
A
V
 
V
N
 
N
A
 
V
R
 
D
G
 
G
A
 
M
V
 
F
L
 
W
V
 
A
A
 
S
K
 
R
H
 
A
V
 
F
A
 
G
R
 
R
G
 
A
M
 
M
I
 
V
D
 
-
A
 
A
Q
 
R
R
 
G
G
 
A
G
 
G
S
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
V
 
L
S
 
G
S
 
S
Q
 
M
A
 
S
A
 
G
L
 
T
V
 
I
A
 
V
L
 
N
D
 
R
D
 
P
H
 
Q
L
 
F
-
 
A
-
 
S
S
 
S
Y
|
Y
S
 
M
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
A
L
 
V
D
 
H
A
 
Q
V
 
L
T
 
T
R
 
R
A
 
A
L
 
L
C
 
A
V
 
A
E
 
E
L
 
W
G
 
A
P
 
G
F
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
A
V
 
L
N
 
A
P
 
P
T
 
G
V
 
Y
T
x
V
L
x
A
T
|
T
P
 
E
M
 
M
A
 
T
V
 
L
L
 
K
A
 
M
W
 
R
S
 
E
D
 
R
P
 
P
V
 
E
K
 
L
R
 
F
D
 
E
P
 
T
A
 
W
L
 
L
K
 
D
A
 
M
I
 
T
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
R
F
 
C
A
 
G
E
 
E
S
 
P
A
 
S
E
 
E
V
 
I
A
 
A
A
 
A
P
 
A
I
 
A
L
 
L
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
G
 
P
G
 
A
A
 
A
S
 
S
M
 
Y
I
 
V
S
 
T
G
 
G
V
 
A
C
 
I
L
 
L
A
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T

Sites not aligning to the query:

1ae1B Tropinone reductase-i complex with NADP (see paper)
36% identity, 98% coverage: 5:244/245 of query aligns to 2:254/258 of 1ae1B

query
sites
1ae1B
F
 
W
D
 
S
F
 
L
S
 
K
G
 
G
R
 
T
S
 
T
I
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
S
|
S
S
x
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
Y
A
 
A
T
 
I
V
 
V
E
 
E
A
 
E
L
 
L
C
 
A
A
 
G
S
 
L
G
 
G
A
 
A
N
 
R
V
 
V
V
 
Y
A
 
T
A
 
C
A
x
S
R
|
R
N
 
N
V
 
E
S
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
D
R
 
E
L
 
C
A
 
L
E
 
E
-
 
I
-
 
W
-
 
R
E
 
E
T
 
K
G
 
G
-
 
L
-
 
N
C
 
V
E
 
E
P
 
G
L
 
S
V
 
V
L
x
C
D
|
D
V
x
L
S
 
L
D
 
S
E
 
R
A
 
T
A
 
E
I
 
R
D
 
D
D
 
K
A
 
L
L
 
M
G
 
Q
S
 
T
L
 
V
-
 
A
D
 
H
V
 
V
F
 
F
D
 
D
G
 
G
-
 
K
-
 
L
-
 
N
-
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
C
x
N
A
|
A
G
 
G
I
 
V
A
 
V
L
 
I
L
 
H
E
 
K
R
 
E
A
 
A
V
 
K
D
 
D
T
 
F
T
 
T
G
 
E
A
 
K
S
 
D
F
 
Y
D
 
N
R
 
I
V
 
I
M
 
M
A
 
G
V
 
T
N
 
N
A
 
F
R
 
E
G
 
A
A
 
A
V
 
Y
L
 
H
V
 
L
A
 
S
K
 
Q
H
 
-
V
 
I
A
 
A
R
 
Y
G
 
P
M
 
L
I
 
L
D
 
K
A
 
A
Q
 
S
R
 
Q
G
 
N
G
 
G
S
 
N
I
 
V
V
 
I
N
 
F
V
 
L
S
 
S
S
|
S
Q
 
I
A
 
A
A
 
G
L
 
F
V
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
P
D
 
S
H
x
V
L
 
S
S
 
L
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
A
L
 
I
D
 
N
A
 
Q
V
 
M
T
 
T
R
 
K
A
 
S
L
 
L
C
 
A
V
 
C
E
 
E
L
 
W
G
 
A
P
 
K
F
 
D
G
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
S
V
 
V
N
 
A
P
|
P
T
 
G
V
 
V
T
x
I
L
 
L
T
|
T
P
 
P
M
x
L
A
x
V
V
 
E
L
 
T
A
 
A
W
 
-
S
 
-
D
 
-
P
 
-
V
 
I
K
 
K
R
 
K
D
 
N
P
 
P
A
 
H
L
 
Q
K
 
K
-
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
D
-
 
N
-
 
F
-
 
I
-
 
V
A
 
K
I
 
T
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
R
F
 
A
A
 
G
E
 
K
S
 
P
A
 
Q
E
 
E
V
 
V
A
 
S
A
 
A
P
 
L
I
 
I
L
 
A
F
 
F
L
 
L
L
 
C
S
 
F
G
 
P
G
 
A
A
 
A
S
 
S
M
 
Y
I
 
I
S
 
T
G
 
G
V
 
Q
C
 
I
L
 
I
A
 
W
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
F
T
 
T
A
 
A

P50162 Tropinone reductase 1; Tropine dehydrogenase; Tropinone reductase I; TR-I; EC 1.1.1.206 from Datura stramonium (Jimsonweed) (Common thornapple) (see paper)
36% identity, 98% coverage: 5:245/245 of query aligns to 17:270/273 of P50162

query
sites
P50162
F
 
W
D
 
S
F
 
L
S
 
K
G
 
G
R
 
T
S
 
T
I
 
A
L
|
L
V
|
V
T
|
T
G
|
G
A
x
G
S
|
S
S
x
K
G
|
G
I
|
I
G
|
G
R
x
Y
A
|
A
T
x
I
V
|
V
E
|
E
A
x
E
L
|
L
C
x
A
A
x
G
S
x
L
G
|
G
A
|
A
N
x
R
V
|
V
V
x
Y
A
 
T
A
 
C
A
 
S
R
 
R
N
 
N
V
 
E
S
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
D
R
 
E
L
 
C
A
 
L
E
 
E
-
 
I
-
 
W
-
 
R
E
 
E
T
 
K
G
 
G
-
 
L
-
 
N
C
 
V
E
 
E
P
 
G
L
 
S
V
 
V
L
 
C
D
 
D
V
 
L
S
 
L
D
 
S
E
 
R
A
 
T
A
 
E
I
 
R
D
 
D
D
 
K
A
 
L
L
 
M
G
 
Q
S
 
T
L
 
V
-
 
A
D
 
H
V
 
V
F
 
F
D
 
D
G
 
G
-
 
K
-
 
L
-
 
N
-
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
C
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
V
A
 
V
L
 
I
L
 
H
E
 
K
R
 
E
A
 
A
V
 
K
D
 
D
T
 
F
T
 
T
G
 
E
A
 
K
S
 
D
F
 
Y
D
 
N
R
 
I
V
 
I
M
 
M
A
 
G
V
 
T
N
 
N
A
 
F
R
 
E
G
 
A
A
 
A
V
 
Y
L
 
H
V
 
L
A
 
S
K
 
Q
H
 
-
V
 
I
A
 
A
R
 
Y
G
 
P
M
 
L
I
 
L
D
 
K
A
 
A
Q
 
S
R
 
Q
G
 
N
G
 
G
S
 
N
I
 
V
V
 
I
N
 
F
V
 
L
S
 
S
S
|
S
Q
 
I
A
 
A
A
 
G
L
 
F
V
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
P
D
 
S
H
 
V
L
 
S
S
 
L
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
S
 
S
K
 
K
A
 
G
A
 
A
L
 
I
D
 
N
A
 
Q
V
 
M
T
 
T
R
 
K
A
 
S
L
 
L
C
 
A
V
 
C
E
 
E
L
 
W
G
 
A
P
 
K
F
 
D
G
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
S
V
 
V
N
 
A
P
 
P
T
 
G
V
 
V
T
 
I
L
 
L
T
 
T
P
 
P
M
 
L
A
 
V
V
 
E
L
 
T
A
 
A
W
 
-
S
 
-
D
 
-
P
 
-
V
 
I
K
 
K
R
 
K
D
 
N
P
 
P
A
 
H
L
 
Q
K
 
K
-
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
D
-
 
N
-
 
F
-
 
I
-
 
V
A
 
K
I
 
T
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
R
F
 
A
A
 
G
E
 
K
S
 
P
A
 
Q
E
 
E
V
 
V
A
 
S
A
 
A
P
 
L
I
 
I
L
 
A
F
 
F
L
 
L
L
 
C
S
 
F
G
 
P
G
 
A
A
 
A
S
 
S
M
 
Y
I
 
I
S
 
T
G
 
G
V
 
Q
C
 
I
L
 
I
A
 
W
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
F
T
 
T
A
 
A
R
 
N

1vl8B Crystal structure of gluconate 5-dehydrogenase (tm0441) from thermotoga maritima at 2.07 a resolution
35% identity, 98% coverage: 5:244/245 of query aligns to 2:251/252 of 1vl8B

query
sites
1vl8B
F
 
F
D
 
D
F
 
L
S
 
R
G
 
G
R
 
R
S
 
V
I
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
S
 
S
S
x
R
G
|
G
I
x
L
G
 
G
R
 
F
A
 
G
T
 
I
V
 
A
E
 
Q
A
 
G
L
 
L
C
 
A
A
 
E
S
 
A
G
 
G
A
 
C
N
 
S
V
 
V
V
 
V
A
 
V
A
 
A
A
x
S
R
|
R
N
 
N
V
 
L
S
 
E
E
 
E
L
 
A
A
 
S
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
Q
R
 
K
L
 
L
A
 
T
E
 
E
E
 
K
T
 
Y
G
 
G
C
 
V
E
 
E
P
 
T
L
 
M
V
 
A
L
 
F
-
 
R
-
x
C
D
|
D
V
|
V
S
 
S
D
 
N
E
 
Y
A
 
E
-
 
E
-
 
V
-
 
K
-
 
K
-
 
L
-
 
L
-
 
E
A
 
A
I
 
V
D
 
K
D
 
E
A
 
K
L
 
F
G
 
G
S
 
K
L
 
L
D
 
D
V
 
T
F
 
-
D
 
-
G
 
-
L
 
V
V
 
V
N
 
N
C
x
A
A
|
A
G
|
G
I
|
I
A
 
N
L
 
R
L
 
R
E
 
H
R
 
P
A
 
A
V
 
E
D
 
E
T
 
F
T
 
P
G
 
L
A
 
D
S
 
E
F
 
F
D
 
R
R
 
Q
V
 
V
M
 
I
A
 
E
V
|
V
N
 
N
A
 
L
R
 
F
G
 
G
A
 
T
V
 
Y
L
 
Y
V
 
V
A
 
C
K
 
R
H
 
E
V
 
-
A
 
A
R
 
F
G
 
S
M
 
L
I
 
L
D
 
R
A
 
E
Q
 
S
R
 
D
G
 
N
G
 
P
S
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
x
I
S
 
G
S
|
S
-
 
L
Q
 
T
A
 
V
A
 
E
L
 
E
V
 
V
A
 
T
L
 
M
D
 
P
D
 
N
H
x
I
L
 
S
S
 
A
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
G
L
 
V
D
 
A
A
 
S
V
 
L
T
 
T
R
 
K
A
 
A
L
 
L
C
 
A
V
 
K
E
 
E
L
 
W
G
 
G
P
 
R
F
 
Y
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
V
V
 
I
N
 
A
P
|
P
T
x
G
V
 
W
T
x
Y
L
 
R
T
|
T
P
 
K
M
|
M
A
x
T
V
 
E
L
 
A
A
 
V
W
 
F
S
 
S
D
 
D
P
 
P
V
 
E
K
 
K
R
 
L
D
 
D
P
 
Y
A
 
M
L
 
L
K
 
K
A
 
R
I
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
R
F
 
T
A
 
G
E
 
V
S
 
P
A
 
E
E
 
D
V
 
L
A
 
K
A
 
G
P
 
V
I
 
A
L
 
V
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
G
 
E
G
 
E
A
 
A
S
 
K
M
 
Y
I
 
V
S
 
T
G
 
G
V
 
Q
C
 
I
L
 
I
A
 
F
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
W
T
 
T
A
 
A

4b79A The aeropath project and pseudomonas aeruginosa high-throughput crystallographic studies for assessment of potential targets in early stage drug discovery. (see paper)
37% identity, 96% coverage: 7:242/245 of query aligns to 8:233/236 of 4b79A

query
sites
4b79A
F
 
Y
S
 
A
G
 
G
R
 
Q
S
 
Q
I
 
V
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
S
|
S
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
A
A
 
A
T
 
I
V
 
A
E
 
M
A
 
Q
L
 
F
C
 
A
A
 
E
S
 
L
G
 
G
A
 
A
N
 
E
V
 
V
V
 
V
A
 
A
A
 
L
A
 
G
R
x
L
-
 
D
-
 
A
-
 
D
-
 
G
-
 
V
N
 
H
V
 
A
S
 
P
E
 
R
L
 
H
A
 
P
R
 
R
L
 
I
A
 
R
E
 
R
E
 
E
T
 
E
G
 
-
C
 
-
E
 
-
P
 
-
L
 
-
V
 
-
L
|
L
D
|
D
V
x
I
S
 
T
D
 
D
E
 
S
A
 
Q
A
 
R
I
 
L
D
 
Q
D
 
R
A
 
L
L
 
F
G
 
E
S
 
A
L
 
L
D
 
P
V
 
R
F
 
L
D
 
D
G
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
C
x
N
A
 
A
G
|
G
I
 
I
A
 
S
L
 
R
L
 
D
E
 
R
R
 
E
A
 
E
V
 
Y
D
 
D
T
 
L
T
 
-
G
 
-
A
 
A
S
 
T
F
 
F
D
 
E
R
 
R
V
 
V
M
 
L
A
 
R
V
x
L
N
 
N
A
 
L
R
 
S
G
 
A
A
 
A
V
 
M
L
 
L
V
 
-
A
 
A
K
 
S
H
 
Q
V
 
L
A
 
A
R
 
R
G
 
P
M
 
L
I
 
L
D
 
-
A
 
A
Q
 
Q
R
 
R
G
 
G
G
 
G
S
 
S
I
 
I
V
 
L
N
 
N
V
x
I
S
 
A
S
|
S
Q
 
M
A
 
Y
A
 
S
L
 
T
V
 
F
A
 
G
L
 
S
D
 
A
D
 
D
H
x
R
L
 
P
S
 
A
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
A
L
 
I
D
 
V
A
 
Q
V
 
L
T
 
T
R
 
R
A
 
S
L
 
L
C
 
A
V
 
C
E
 
E
L
 
Y
G
 
A
P
 
A
F
 
E
G
 
R
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
A
V
 
I
N
 
A
P
|
P
T
x
G
V
 
W
T
x
I
L
 
D
T
|
T
P
 
P
M
 
K
A
 
A
V
 
D
L
 
V
A
 
E
W
 
A
S
 
T
D
 
R
P
 
R
V
 
I
K
 
-
R
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
-
L
 
M
K
 
Q
A
 
R
I
 
T
P
 
P
L
 
L
G
 
A
R
 
R
F
 
W
A
 
G
E
 
E
S
 
A
A
 
P
E
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
S
P
 
A
I
 
A
L
 
A
F
 
F
L
 
L
L
 
C
S
 
G
G
 
P
G
 
G
A
 
A
S
 
S
M
 
F
I
 
V
S
 
T
G
 
G
V
 
A
C
 
V
L
 
L
A
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y

5itvA Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
31% identity, 98% coverage: 5:245/245 of query aligns to 3:255/255 of 5itvA

query
sites
5itvA
F
 
M
D
 
N
F
 
L
S
 
T
G
 
D
R
 
K
S
 
T
I
 
V
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
S
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
Y
A
 
A
T
 
A
V
 
V
E
 
Q
A
 
A
L
 
F
C
 
L
A
 
G
S
 
Q
G
 
Q
A
 
A
N
 
N
V
 
V
V
 
V
A
 
V
A
 
A
A
x
D
R
x
I
N
 
D
V
 
E
S
 
A
E
 
Q
-
 
G
-
 
E
-
 
A
L
 
M
A
 
V
R
 
R
L
 
K
A
 
E
E
 
N
E
 
N
T
 
D
G
 
R
C
 
L
E
 
H
P
 
F
L
 
V
V
 
Q
L
x
T
D
 
D
V
x
I
S
 
T
D
 
D
E
 
E
A
 
A
A
 
A
-
 
C
-
 
Q
-
 
H
-
 
A
I
 
V
D
 
E
D
 
S
A
 
A
L
 
V
G
 
H
S
 
T
L
 
F
D
 
G
V
 
G
F
 
L
D
 
D
G
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
C
x
N
A
 
A
G
|
G
I
 
I
A
 
E
L
 
I
L
 
V
E
 
A
R
 
P
A
 
I
V
 
H
D
 
E
T
 
M
T
 
E
G
 
L
A
 
S
S
 
D
F
 
W
D
 
N
R
 
K
V
 
V
M
 
L
A
 
Q
V
 
V
N
 
N
A
 
L
R
 
T
G
 
G
A
 
M
V
 
F
L
 
L
V
 
M
A
 
S
K
 
K
H
 
H
V
 
A
A
 
L
R
 
K
G
 
H
M
 
M
I
 
L
D
 
A
A
 
A
Q
 
G
R
 
K
G
 
G
G
 
-
S
 
N
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
x
T
S
 
C
S
|
S
Q
 
V
A
 
G
A
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
A
L
 
W
D
 
P
D
 
D
H
 
I
L
 
P
S
 
A
Y
|
Y
S
 
N
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
G
L
 
V
D
 
L
A
 
Q
V
 
L
T
 
T
R
 
K
A
 
S
L
 
M
C
 
A
V
 
V
E
 
D
L
 
Y
G
 
A
P
 
K
F
 
H
G
 
Q
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
C
V
 
V
N
 
C
P
|
P
T
x
G
V
x
I
T
x
I
L
 
D
T
 
T
P
 
P
M
 
L
A
 
N
V
 
E
L
 
K
A
 
S
W
 
F
-
 
L
-
 
E
-
 
N
-
 
N
-
 
E
-
 
G
-
 
T
S
 
L
D
 
E
P
 
E
V
 
I
K
 
K
R
 
K
D
 
E
P
 
K
A
 
A
L
 
-
K
 
K
A
 
V
I
 
N
P
 
P
L
 
L
G
 
L
R
 
R
F
 
L
A
 
G
E
 
K
S
 
P
A
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
A
 
N
P
 
V
I
 
M
L
 
L
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
G
 
D
G
 
L
A
 
S
S
 
S
M
 
Y
I
 
M
S
 
T
G
 
G
V
 
S
C
 
A
L
 
I
A
 
T
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
A
 
A
R
 
Q

7do7A Crystal structure of azotobacter vinelandii l-rhamnose 1- dehydrogenase(NAD and l-rhamnose bound-form) (see paper)
35% identity, 95% coverage: 10:241/245 of query aligns to 6:250/256 of 7do7A

query
sites
7do7A
R
 
K
S
 
T
I
 
V
L
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
 
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
T
 
A
V
 
A
E
 
R
A
 
E
L
 
C
C
 
A
A
 
R
S
 
Q
G
 
G
A
 
A
N
 
R
V
 
V
V
 
V
A
 
I
A
 
G
A
 
H
R
x
S
N
 
G
V
 
S
S
 
D
E
 
E
-
 
G
-
 
R
-
 
A
-
 
G
L
 
A
A
 
L
R
 
S
L
 
L
A
 
A
E
 
E
E
 
E
-
 
I
-
 
A
-
 
A
-
 
F
-
 
G
-
 
G
-
 
T
-
 
A
-
 
I
-
 
A
T
 
V
G
 
G
C
 
A
E
x
D
P
x
A
L
 
A
V
 
D
L
 
L
D
 
D
V
 
S
S
 
G
D
 
E
E
 
K
-
 
L
-
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
A
D
 
V
D
 
E
A
 
A
L
 
F
G
 
G
S
 
S
L
 
V
D
 
D
V
 
V
F
 
-
D
 
-
G
 
-
L
 
L
V
 
V
N
 
N
C
x
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
A
 
C
L
 
P
L
x
F
E
 
H
R
 
S
A
 
F
V
 
L
D
 
D
T
 
M
T
 
P
G
 
R
A
 
E
S
 
L
F
 
Y
D
 
L
R
 
K
V
 
T
M
 
V
A
 
G
V
 
T
N
 
N
A
 
L
R
 
N
G
 
G
A
 
A
V
 
Y
L
 
F
V
 
T
A
 
V
K
 
Q
H
 
A
V
 
A
A
 
A
R
 
R
G
 
R
M
 
M
I
 
K
D
 
E
A
 
Q
Q
 
G
R
 
R
G
 
G
G
 
G
S
 
A
I
 
I
V
 
I
N
 
A
V
|
V
S
|
S
S
|
S
Q
 
I
A
x
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
G
L
 
G
D
 
A
D
 
M
H
x
Q
L
 
T
S
 
H
Y
|
Y
S
 
T
A
 
P
S
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
 
L
A
 
S
V
 
L
T
 
M
R
 
Q
A
 
S
L
 
C
C
 
A
V
 
I
E
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
F
 
Y
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
S
 
A
V
 
V
N
 
L
P
|
P
T
x
G
V
 
T
T
x
I
L
 
A
T
|
T
P
 
D
M
x
I
A
x
N
V
 
K
L
 
E
A
 
D
W
 
L
S
 
S
D
 
D
P
 
L
V
 
E
K
 
K
R
 
R
D
 
E
P
 
R
A
 
M
L
 
T
K
 
S
A
 
R
I
 
V
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
R
F
 
L
A
 
G
E
 
E
S
 
P
A
 
D
E
 
D
V
 
L
A
 
A
A
 
G
P
 
P
I
 
I
L
 
V
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
G
x
D
G
x
M
A
 
A
S
x
R
M
 
Y
I
 
V
S
 
T
G
 
G
V
 
A
C
 
S
L
 
L
A
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

7b81A Crystal structure of azotobacter vinelandii l-rhamnose 1-dehydrogenase (NAD bound-form) (see paper)
35% identity, 95% coverage: 10:241/245 of query aligns to 6:250/256 of 7b81A

query
sites
7b81A
R
 
K
S
 
T
I
 
V
L
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
|
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
T
 
A
V
 
A
E
 
R
A
 
E
L
 
C
C
 
A
A
 
R
S
 
Q
G
 
G
A
 
A
N
 
R
V
 
V
V
 
V
A
 
I
A
 
G
A
 
H
R
 
S
N
 
G
V
 
S
S
 
D
E
 
E
-
 
G
-
 
R
-
 
A
-
 
G
L
 
A
A
 
L
R
 
S
L
 
L
A
 
A
E
 
E
E
 
E
-
 
I
-
 
A
-
 
A
-
 
F
-
 
G
-
 
G
-
 
T
-
 
A
-
 
I
-
 
A
T
 
V
G
 
G
C
 
A
E
x
D
P
x
A
L
 
A
V
 
D
L
 
L
D
 
D
V
 
S
S
 
G
D
 
E
E
 
K
-
 
L
-
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
A
D
 
V
D
 
E
A
 
A
L
 
F
G
 
G
S
 
S
L
 
V
D
 
D
V
 
V
F
 
-
D
 
-
G
 
-
L
 
L
V
 
V
N
 
N
C
x
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
A
 
C
L
 
P
L
 
F
E
 
H
R
 
S
A
 
F
V
 
L
D
 
D
T
 
M
T
 
P
G
 
R
A
 
E
S
 
L
F
 
Y
D
 
L
R
 
K
V
 
T
M
 
V
A
 
G
V
x
T
N
 
N
A
 
L
R
 
N
G
 
G
A
 
A
V
 
Y
L
 
F
V
 
T
A
 
V
K
 
Q
H
 
A
V
 
A
A
 
A
R
 
R
G
 
R
M
 
M
I
 
K
D
 
E
A
 
Q
Q
 
G
R
 
R
G
 
G
G
 
G
S
 
A
I
 
I
V
 
I
N
 
A
V
|
V
S
 
S
S
|
S
Q
 
I
A
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
G
L
 
G
D
 
A
D
 
M
H
 
Q
L
 
T
S
 
H
Y
|
Y
S
 
T
A
 
P
S
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
 
L
A
 
S
V
 
L
T
 
M
R
 
Q
A
 
S
L
 
C
C
 
A
V
 
I
E
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
F
 
Y
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
S
 
A
V
 
V
N
 
L
P
|
P
T
x
G
V
 
T
T
x
I
L
 
A
T
|
T
P
 
D
M
x
I
A
 
N
V
 
K
L
 
E
A
 
D
W
 
L
S
 
S
D
 
D
P
 
L
V
 
E
K
 
K
R
 
R
D
 
E
P
 
R
A
 
M
L
 
T
K
 
S
A
 
R
I
 
V
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
R
F
 
L
A
 
G
E
 
E
S
 
P
A
 
D
E
 
D
V
 
L
A
 
A
A
 
G
P
 
P
I
 
I
L
 
V
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
G
 
D
G
 
M
A
 
A
S
 
R
M
 
Y
I
 
V
S
 
T
G
 
G
V
 
A
C
 
S
L
 
L
A
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

5t2uA Short chain dehydrogenase/reductase family protein (see paper)
35% identity, 96% coverage: 6:241/245 of query aligns to 3:237/241 of 5t2uA

query
sites
5t2uA
D
 
E
F
 
L
S
 
E
G
 
G
R
 
L
S
 
T
I
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
S
 
T
S
 
S
G
|
G
I
 
I
G
 
G
R
 
L
A
 
E
T
 
S
V
 
A
E
 
R
A
 
L
L
 
M
C
 
A
A
 
A
S
 
E
G
 
G
A
 
A
N
 
D
V
 
V
V
 
V
A
 
I
A
 
T
A
 
G
R
|
R
N
x
D
V
 
A
S
 
Q
E
x
R
L
 
G
A
 
E
R
 
Q
L
 
A
A
 
A
E
 
A
E
 
D
-
 
I
-
 
G
T
 
H
G
 
G
C
 
A
E
 
R
P
 
F
L
 
V
V
 
Q
L
 
A
D
|
D
V
x
L
S
 
G
D
 
D
E
 
L
A
 
D
A
 
S
I
 
V
D
 
A
D
 
D
A
 
L
L
 
A
G
 
A
S
 
Q
L
 
A
D
 
P
V
 
D
F
 
V
D
 
D
G
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
C
x
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
A
x
Y
L
 
P
L
 
Q
E
 
A
R
 
S
A
 
T
V
 
F
D
 
D
T
 
Q
T
 
D
G
 
V
A
 
A
S
 
G
F
 
F
D
 
Q
R
 
Q
V
 
L
M
 
F
A
 
D
V
 
T
N
 
N
A
 
V
R
 
R
G
 
G
A
 
T
V
 
Y
L
 
F
V
 
L
A
 
V
K
 
A
H
 
A
V
 
A
A
 
A
R
 
K
G
 
G
M
 
M
I
 
V
D
 
-
A
 
A
Q
 
R
R
 
G
G
 
H
G
 
G
S
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
N
V
x
I
S
 
T
S
x
T
Q
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
H
V
 
K
A
 
G
L
 
F
D
 
P
D
 
G
H
x
T
L
 
S
S
 
V
Y
|
Y
S
 
G
A
 
A
S
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
E
A
 
S
V
 
L
T
 
T
R
 
R
A
 
T
L
 
W
C
 
A
V
 
A
E
 
E
L
 
F
G
 
G
P
 
A
F
 
N
G
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
S
V
 
V
N
 
S
P
|
P
T
 
G
V
x
P
T
|
T
L
 
R
T
|
T
P
 
P
M
x
T
A
x
T
V
 
L
L
 
E
A
 
Q
W
 
L
S
 
G
D
 
D
P
 
F
V
 
I
K
 
-
R
 
-
D
 
D
P
 
D
A
 
V
L
 
A
K
 
A
A
 
G
I
 
L
P
 
P
L
 
L
G
 
R
R
 
R
F
 
T
A
 
A
E
 
A
S
 
P
A
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
A
 
Q
P
 
A
I
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
G
 
P
G
 
R
A
 
A
S
 
S
M
 
F
I
 
V
S
 
T
G
 
G
V
 
S
C
 
T
L
 
L
A
 
Y
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Q9LBG2 Levodione reductase; (6R)-2,2,6-trimethyl-1,4-cyclohexanedione reductase; EC 1.1.1.- from Leifsonia aquatica (Corynebacterium aquaticum) (see paper)
34% identity, 98% coverage: 4:244/245 of query aligns to 8:265/267 of Q9LBG2

query
sites
Q9LBG2
T
 
T
F
 
T
D
 
R
F
 
F
S
 
T
G
 
D
R
 
R
S
 
V
I
 
V
L
|
L
V
x
I
T
|
T
G
|
G
A
x
G
S
x
G
S
|
S
G
|
G
I
x
L
G
|
G
R
|
R
A
|
A
T
|
T
V
x
A
E
x
V
A
x
R
L
|
L
C
x
A
A
|
A
S
x
E
G
|
G
A
|
A
-
x
K
-
x
L
-
x
S
-
x
L
-
 
V
N
 
D
V
 
V
V
 
S
A
 
S
A
 
E
A
 
G
R
 
L
N
 
E
V
 
A
S
 
S
E
 
K
L
 
A
A
 
A
R
 
V
L
 
L
A
 
E
E
 
T
E
 
A
T
 
P
G
 
D
C
 
A
E
 
E
P
 
V
L
 
L
-
 
T
-
 
T
V
 
V
L
 
A
D
 
D
V
 
V
S
 
S
D
 
D
E
 
E
A
 
A
A
 
Q
I
 
V
D
 
E
D
 
A
A
 
Y
L
 
V
-
 
T
G
 
A
S
 
T
L
 
T
D
 
E
V
 
R
F
 
F
-
 
G
-
 
R
-
 
I
D
 
D
G
 
G
L
 
F
V
 
F
N
 
N
C
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
x
E
L
 
G
L
 
K
E
 
Q
R
 
N
A
 
P
V
 
T
D
 
E
T
 
S
-
 
F
T
 
T
G
 
A
A
 
A
S
 
E
F
 
F
D
 
D
R
 
K
V
 
V
M
 
V
A
 
S
V
 
I
N
 
N
A
 
L
R
 
R
G
 
G
A
 
V
V
 
F
L
 
L
V
 
G
A
 
L
K
 
E
H
 
K
V
 
V
A
 
L
R
 
K
G
 
I
M
 
M
I
 
R
D
 
E
A
 
-
Q
 
Q
R
 
G
G
 
S
G
 
G
S
 
M
I
 
V
V
 
V
N
 
N
V
 
T
S
 
A
S
 
S
Q
 
V
A
 
G
A
 
G
L
 
I
V
 
R
A
 
G
L
 
I
D
 
G
D
 
N
H
 
Q
L
 
S
S
 
G
Y
 
Y
S
 
A
A
 
A
S
 
A
K
 
K
A
 
H
A
 
G
L
 
V
D
 
V
A
 
G
V
 
L
T
 
T
R
 
R
A
 
N
L
 
S
C
 
A
V
 
V
E
 
E
L
 
Y
G
 
G
P
 
R
F
 
Y
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
I
N
 
N
S
 
A
V
 
I
N
 
A
P
 
P
T
 
G
V
 
A
T
 
I
L
 
W
T
 
T
P
 
P
M
 
M
A
 
V
-
 
E
-
 
N
V
 
S
L
 
M
A
 
K
W
 
Q
S
 
L
D
 
D
P
 
P
V
 
E
K
 
N
R
 
P
D
 
R
P
 
K
A
 
A
-
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
F
L
 
I
K
 
Q
A
 
V
I
 
N
P
 
P
L
 
S
G
 
K
R
 
R
F
 
Y
A
 
G
E
 
E
S
 
A
A
 
P
E
 
E
V
 
I
A
 
A
A
 
A
P
 
V
I
 
V
L
 
A
F
 
F
L
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
D
G
 
D
A
 
A
S
 
S
M
 
Y
I
 
V
S
 
N
G
 
A
V
 
T
C
 
V
L
 
V
A
 
P
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
Q
T
 
S
A
 
A

Query Sequence

>BPHYT_RS16040 FitnessBrowser__BFirm:BPHYT_RS16040
MNATFDFSGRSILVTGASSGIGRATVEALCASGANVVAAARNVSELARLAEETGCEPLVL
DVSDEAAIDDALGSLDVFDGLVNCAGIALLERAVDTTGASFDRVMAVNARGAVLVAKHVA
RGMIDAQRGGSIVNVSSQAALVALDDHLSYSASKAALDAVTRALCVELGPFGIRVNSVNP
TVTLTPMAVLAWSDPVKRDPALKAIPLGRFAESAEVAAPILFLLSGGASMISGVCLAVDG
GYTAR

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory