SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing BPHYT_RS16120 FitnessBrowser__BFirm:BPHYT_RS16120 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6pejA Structure of sorbitol dehydrogenase from sinorhizobium meliloti 1021 bound to sorbitol
60% identity, 99% coverage: 4:260/260 of query aligns to 3:257/257 of 6pejA

query
sites
6pejA
R
 
R
L
 
L
Q
 
E
D
 
G
K
 
K
V
 
S
A
 
A
I
 
L
L
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
S
A
 
A
S
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
E
 
R
A
 
A
V
 
F
A
 
A
R
 
E
R
 
A
Y
 
Y
L
 
V
D
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
T
C
 
V
V
 
A
L
 
I
V
 
A
D
 
D
V
 
I
K
 
D
P
 
I
A
 
E
D
 
R
S
 
A
F
 
-
G
 
-
D
 
R
S
 
Q
L
 
A
R
 
A
A
 
A
T
 
E
Y
 
I
G
 
G
D
 
P
R
 
A
V
 
A
L
 
Y
T
 
A
V
 
V
S
 
Q
A
 
M
D
 
D
V
 
V
T
 
T
R
 
R
R
 
Q
D
 
D
D
 
S
I
 
I
Q
 
D
R
 
A
I
 
A
V
 
I
A
 
A
S
 
A
T
 
T
L
 
V
E
 
E
R
 
H
F
 
A
G
 
G
Q
 
G
I
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
L
F
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
A
 
A
L
 
L
F
 
F
D
 
D
M
 
L
R
 
A
P
 
P
I
 
I
L
 
V
E
 
E
E
 
I
S
 
T
W
 
R
D
 
E
V
 
S
F
 
Y
D
 
E
R
 
K
L
 
L
F
 
F
A
 
A
V
 
I
N
 
N
V
 
V
K
 
A
G
 
G
M
 
T
F
 
L
F
 
F
L
 
T
M
 
L
Q
 
Q
A
 
A
V
 
A
A
 
A
Q
 
R
K
 
Q
M
 
M
V
 
I
E
 
A
Q
 
Q
G
 
G
C
 
R
G
 
G
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
M
S
 
A
S
|
S
Q
|
Q
A
 
A
G
 
G
R
 
R
R
 
R
G
 
G
E
|
E
A
 
A
L
 
L
V
 
V
S
 
A
H
 
I
Y
|
Y
C
 
C
A
 
A
T
 
T
K
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
V
L
 
I
S
 
S
Y
 
L
T
 
T
Q
 
Q
S
 
S
A
 
A
A
 
G
L
 
L
A
 
D
L
 
L
A
 
I
P
 
K
H
 
H
K
 
R
I
 
I
N
 
N
V
 
V
N
 
N
G
 
A
I
 
I
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
G
P
 
E
M
x
H
W
|
W
N
 
D
E
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
L
F
|
F
A
 
A
R
 
R
Y
 
Y
E
 
E
N
 
N
R
 
R
P
 
P
L
 
R
G
 
G
E
 
E
K
 
K
K
 
K
R
 
R
L
 
L
V
 
V
G
 
G
E
 
E
A
 
A
V
 
V
P
 
P
L
 
F
G
 
G
R
 
R
M
 
M
G
 
G
V
 
T
P
 
A
D
 
E
D
 
D
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
M
A
 
A
L
 
I
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
A
D
 
E
A
 
S
D
 
D
Y
 
Y
I
 
I
T
 
V
A
 
S
Q
 
Q
T
 
T
L
 
Y
N
 
N
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
N
W
 
W
M
 
M
S
 
S

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
42% identity, 99% coverage: 3:259/260 of query aligns to 3:244/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
A
 
S
R
 
R
L
 
L
Q
 
Q
D
 
D
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
I
L
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
S
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
L
A
 
E
V
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
V
Y
 
F
L
 
M
D
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
C
 
V
V
 
V
L
 
I
V
 
A
D
|
D
V
x
F
K
 
N
P
 
E
A
 
A
D
 
-
S
 
A
F
 
G
G
 
K
D
 
E
S
 
A
L
 
V
R
 
E
A
 
A
T
 
N
Y
 
P
G
 
G
D
 
-
R
 
-
V
 
V
L
 
V
T
 
F
V
 
I
S
 
R
A
x
V
D
|
D
V
|
V
T
 
S
R
 
D
R
 
R
D
 
E
D
 
S
I
 
V
Q
 
H
R
 
R
I
 
L
V
 
V
A
 
E
S
 
N
T
 
V
L
 
A
E
 
E
R
 
R
F
 
F
G
 
G
Q
 
K
I
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
F
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
G
L
x
I
F
 
T
D
 
R
M
x
D
R
 
S
P
 
M
I
 
L
L
 
S
E
x
K
E
 
M
S
 
T
W
 
V
D
 
D
V
 
Q
F
 
F
D
 
Q
R
 
Q
L
 
V
F
 
I
A
 
N
V
 
V
N
|
N
V
 
L
K
 
T
G
 
G
M
 
V
F
 
F
F
 
H
L
 
C
M
 
T
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
L
Q
 
P
K
 
Y
M
 
M
V
 
A
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
C
 
K
G
 
-
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
x
T
S
 
S
S
|
S
Q
 
V
A
 
T
G
 
G
R
 
T
R
 
Y
G
 
G
E
x
N
A
x
V
L
 
G
V
x
Q
S
 
T
H
 
N
Y
|
Y
C
 
A
A
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
V
L
 
I
S
 
G
Y
 
M
T
 
T
Q
 
K
S
 
T
A
 
W
A
 
A
L
 
K
A
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
R
H
 
K
K
 
G
I
 
I
N
 
N
V
 
V
N
 
N
G
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
V
x
F
V
x
T
D
 
E
T
|
T
P
 
A
M
|
M
W
 
V
N
 
A
E
 
E
V
 
V
D
 
P
A
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
-
R
 
-
Y
 
-
E
 
-
N
 
-
R
 
E
P
 
K
L
 
V
G
 
I
E
 
E
K
|
K
K
 
M
R
 
K
L
 
-
V
 
-
G
 
-
E
 
A
A
 
Q
V
 
V
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
G
V
 
K
P
 
P
D
 
E
D
 
D
L
 
I
T
 
A
G
 
N
A
 
A
A
 
Y
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
H
D
 
E
A
 
S
D
 
D
Y
 
Y
I
 
V
T
 
N
A
 
G
Q
 
H
T
 
V
L
 
L
N
 
H
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
I
W
 
M
M
 
M

Q48436 Diacetyl reductase [(S)-acetoin forming]; Acetoin(diacetyl) reductase; AR; Meso-2,3-butanediol dehydrogenase; EC 1.1.1.304 from Klebsiella pneumoniae (see paper)
37% identity, 96% coverage: 8:256/260 of query aligns to 3:252/256 of Q48436

query
sites
Q48436
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
x
L
L
x
V
T
|
T
G
|
G
A
|
A
A
x
G
S
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
|
G
E
x
K
A
|
A
V
x
I
A
|
A
R
x
L
R
|
R
Y
x
L
L
x
V
D
x
K
E
x
D
G
|
G
A
x
F
R
x
A
C
x
V
V
x
A
L
x
I
V
x
A
D
|
D
V
 
Y
K
 
N
P
 
D
A
 
A
D
 
T
S
 
A
F
 
K
G
 
A
D
 
V
S
 
A
L
 
S
R
 
E
A
 
I
T
 
N
Y
 
Q
-
 
A
G
 
G
D
 
G
R
 
R
V
 
A
L
 
M
T
 
A
V
 
V
S
 
K
A
 
V
D
|
D
V
 
V
T
 
S
R
 
D
R
 
R
D
 
D
D
 
Q
I
 
V
Q
 
F
R
 
A
I
 
A
V
 
V
A
 
E
S
 
Q
T
 
A
L
 
R
E
 
K
R
 
T
F
 
L
G
 
G
Q
 
G
I
 
F
D
 
D
I
 
V
L
 
I
F
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
A
 
G
L
 
V
F
 
A
D
 
P
M
 
S
R
 
T
P
 
P
I
 
I
L
 
E
E
 
S
E
 
I
S
 
T
W
 
P
D
 
E
V
 
I
F
 
V
D
 
D
R
 
K
L
 
V
F
 
Y
A
 
N
V
 
I
N
 
N
V
 
V
K
 
K
G
 
G
M
 
V
F
 
I
F
 
W
L
 
G
M
 
I
Q
 
Q
A
 
A
V
 
A
A
 
V
Q
 
E
K
 
A
M
 
F
V
 
K
E
 
K
Q
 
E
G
 
G
C
 
H
G
 
G
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
A
S
 
C
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
R
 
H
R
 
V
G
 
G
E
 
N
A
 
P
L
 
E
V
 
L
S
 
A
H
 
V
Y
 
Y
C
 
S
A
 
S
T
 
S
K
|
K
A
 
F
A
 
A
V
 
V
L
 
R
S
 
G
Y
 
L
T
 
T
Q
 
Q
S
 
T
A
 
A
A
 
A
L
 
R
A
 
D
L
 
L
A
 
A
P
 
P
H
 
L
K
 
G
I
 
I
N
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
G
I
 
Y
A
 
C
P
 
P
G
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
K
T
 
T
P
 
P
M
 
M
W
 
W
N
 
A
E
 
E
V
 
I
D
 
D
A
 
R
L
 
Q
F
 
V
A
 
S
R
 
E
Y
 
A
E
 
A
N
 
G
R
 
K
P
 
P
L
 
L
G
 
G
E
 
Y
K
 
G
K
 
T
R
 
A
L
 
E
V
 
F
G
 
A
E
 
K
A
 
R
V
 
I
P
 
T
L
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
S
V
 
E
P
 
P
D
 
E
D
 
D
L
 
V
T
 
A
G
 
A
A
 
C
A
 
V
L
 
S
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
P
D
 
D
A
 
S
D
 
D
Y
 
Y
I
 
M
T
 
T
A
 
G
Q
 
Q
T
 
S
L
 
L
N
 
L
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G

1gegE Cryatal structure analysis of meso-2,3-butanediol dehydrogenase (see paper)
37% identity, 96% coverage: 8:256/260 of query aligns to 3:252/256 of 1gegE

query
sites
1gegE
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
L
L
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
G
S
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
K
A
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
L
R
 
R
Y
 
L
L
 
V
D
 
K
E
 
D
G
 
G
A
 
F
R
 
A
C
 
V
V
 
A
L
 
I
V
 
A
D
|
D
V
x
Y
K
 
N
P
 
D
A
 
A
D
 
T
S
 
A
F
 
K
G
 
A
D
 
V
S
 
A
L
 
S
R
 
E
A
 
I
T
 
N
Y
 
Q
-
 
A
G
 
G
D
 
G
R
 
H
V
 
A
L
 
V
T
 
A
V
 
V
S
 
K
A
x
V
D
|
D
V
|
V
T
 
S
R
 
D
R
|
R
D
|
D
D
 
Q
I
 
V
Q
x
F
R
 
A
I
 
A
V
 
V
A
 
E
S
 
Q
T
 
A
L
 
R
E
 
K
R
 
T
F
 
L
G
 
G
Q
 
G
I
 
F
D
 
D
I
 
V
L
 
I
F
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
 
G
L
 
V
F
 
A
D
 
P
M
 
S
R
 
T
P
 
P
I
 
I
L
 
E
E
 
S
E
 
I
S
 
T
W
 
P
D
 
E
V
 
I
F
 
V
D
 
D
R
 
K
L
 
V
F
 
Y
A
 
N
V
x
I
N
 
N
V
 
V
K
 
K
G
 
G
M
 
V
F
 
I
F
 
W
L
 
G
M
 
I
Q
 
Q
A
 
A
V
 
A
A
 
V
Q
x
E
K
 
A
M
 
F
V
 
K
E
 
K
Q
 
E
G
 
G
C
 
H
G
 
G
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
A
S
 
C
S
|
S
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
R
 
H
R
 
V
G
 
G
E
 
N
A
 
P
L
 
E
V
 
L
S
 
A
H
 
V
Y
|
Y
C
 
S
A
 
S
T
 
S
K
|
K
A
 
F
A
 
A
V
 
V
L
 
R
S
 
G
Y
 
L
T
 
T
Q
 
Q
S
 
T
A
 
A
A
 
A
L
 
R
A
 
D
L
 
L
A
 
A
P
 
P
H
 
L
K
 
G
I
 
I
N
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
G
I
 
Y
A
 
C
P
|
P
G
 
G
V
 
I
V
|
V
D
 
K
T
|
T
P
 
P
M
|
M
W
 
W
N
 
A
E
 
E
V
 
I
D
 
D
A
 
R
L
 
Q
F
x
V
A
 
S
R
 
E
Y
 
A
E
 
A
N
 
G
R
 
K
P
 
P
L
 
L
G
 
G
E
 
Y
K
 
G
K
 
T
R
 
A
L
 
E
V
 
F
G
 
A
E
 
K
A
 
R
V
 
I
P
 
T
L
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
S
V
 
E
P
 
P
D
 
E
D
 
D
L
 
V
T
 
A
G
 
A
A
 
C
A
 
V
L
 
S
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
P
D
 
D
A
 
S
D
 
D
Y
 
Y
I
 
M
T
 
T
A
 
G
Q
 
Q
T
 
S
L
 
L
N
 
L
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G

3wyeA Crystal structure of chimeric engineered (2s,3s)-butanediol dehydrogenase complexed with NAD+
38% identity, 96% coverage: 8:256/260 of query aligns to 2:251/255 of 3wyeA

query
sites
3wyeA
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
L
L
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
G
S
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
K
A
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
L
R
 
R
Y
 
L
L
 
V
D
 
K
E
 
D
G
 
G
A
 
F
R
 
A
C
 
V
V
 
A
L
 
I
V
 
A
D
|
D
V
x
Y
K
 
N
P
 
D
A
 
A
D
 
T
S
 
A
F
 
K
G
 
A
D
 
V
S
 
A
L
 
S
R
 
E
A
 
I
T
 
N
Y
 
Q
-
 
A
G
 
G
D
 
G
R
 
H
V
 
A
L
 
V
T
 
A
V
 
V
S
 
K
A
x
V
D
|
D
V
|
V
T
 
S
R
 
D
R
 
R
D
 
D
D
 
Q
I
 
V
Q
 
F
R
 
A
I
 
A
V
 
V
A
 
E
S
 
Q
T
 
A
L
 
R
E
 
K
R
 
T
F
 
L
G
 
G
Q
 
G
I
 
F
D
 
D
I
 
V
L
 
I
F
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
 
G
L
 
I
F
 
A
D
 
Q
M
 
I
R
 
K
P
 
P
I
 
L
L
 
L
E
 
E
E
 
V
S
 
T
W
 
E
D
 
E
V
 
D
F
 
L
D
 
K
R
 
Q
L
 
I
F
 
Y
A
 
S
V
 
V
N
 
N
V
 
V
K
 
F
G
 
S
M
 
V
F
 
F
F
 
F
L
 
G
M
 
I
Q
 
Q
A
 
A
V
 
A
A
 
V
Q
 
E
K
 
A
M
 
F
V
 
K
E
 
K
Q
 
E
G
 
G
C
 
H
G
 
G
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
A
S
 
A
S
|
S
Q
 
I
A
 
A
G
 
A
R
 
I
R
 
Q
G
 
G
E
 
F
A
 
P
L
 
I
V
 
L
S
 
S
H
 
A
Y
|
Y
C
 
S
A
 
T
T
 
T
K
|
K
A
 
F
A
 
A
V
 
V
L
 
R
S
 
G
Y
 
L
T
 
T
Q
 
Q
S
 
T
A
 
A
A
 
A
L
 
R
A
 
D
L
 
L
A
 
A
P
 
P
H
 
L
K
 
G
I
 
I
N
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
G
I
 
Y
A
 
C
P
|
P
G
|
G
V
 
I
V
|
V
D
 
G
T
|
T
P
 
G
M
|
M
W
|
W
N
 
E
E
 
Q
V
 
I
D
 
D
A
 
A
L
 
E
F
x
L
A
 
S
R
 
K
Y
 
I
E
 
N
N
 
G
R
 
K
P
 
P
L
 
I
G
 
G
E
 
E
K
 
N
K
 
F
R
 
K
L
 
E
V
 
Y
G
 
S
E
 
S
A
 
S
V
 
I
P
 
A
L
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
P
G
 
S
V
 
V
P
 
P
D
 
E
D
 
D
L
 
V
T
 
A
G
 
G
A
 
L
A
 
V
L
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
P
D
 
D
A
 
S
D
 
D
Y
 
Y
I
 
M
T
 
T
A
 
G
Q
 
Q
T
 
S
L
 
L
N
 
L
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G

7do7A Crystal structure of azotobacter vinelandii l-rhamnose 1- dehydrogenase(NAD and l-rhamnose bound-form) (see paper)
37% identity, 98% coverage: 5:260/260 of query aligns to 3:254/256 of 7do7A

query
sites
7do7A
L
 
L
Q
 
I
D
 
D
K
 
K
V
 
T
A
 
V
I
 
I
L
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
R
A
 
A
V
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
E
Y
 
C
L
 
A
D
 
R
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
R
 
R
C
 
V
V
 
V
L
 
I
V
 
G
D
 
H
V
x
S
K
 
G
P
 
S
A
 
D
D
 
E
S
 
G
F
 
R
G
 
A
D
 
G
S
 
A
L
 
L
R
 
S
-
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
I
A
 
A
T
 
A
Y
 
F
G
 
G
D
 
G
R
 
T
V
 
A
L
 
I
T
 
A
V
 
V
S
 
G
A
 
A
D
|
D
V
x
A
T
 
A
R
 
D
R
 
L
D
 
D
D
 
S
I
 
G
Q
 
E
R
 
K
I
 
L
V
 
V
A
 
A
S
 
A
T
 
A
L
 
V
E
 
E
R
 
A
F
 
F
G
 
G
Q
 
S
I
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
L
F
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
G
L
x
I
F
 
C
D
 
P
M
x
F
R
 
H
P
 
S
I
 
F
L
 
L
E
 
D
E
 
M
S
 
P
W
 
R
D
 
E
V
 
L
F
 
Y
D
 
L
R
 
K
L
 
T
F
 
V
A
 
G
V
 
T
N
 
N
V
 
L
K
 
N
G
 
G
M
 
A
F
 
Y
F
 
F
L
 
T
M
 
V
Q
 
Q
A
 
A
V
 
A
A
 
A
Q
 
R
K
 
R
M
 
M
V
 
K
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
C
 
R
G
 
G
G
 
G
K
 
A
I
 
I
I
 
I
N
 
A
M
x
V
S
|
S
S
|
S
Q
 
I
A
x
S
G
 
A
R
 
L
R
 
V
G
 
G
E
 
G
A
 
A
L
 
M
V
x
Q
S
 
T
H
 
H
Y
|
Y
C
 
T
A
 
P
T
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
L
L
 
L
S
 
S
Y
 
L
T
 
M
Q
 
Q
S
 
S
A
 
C
A
 
A
L
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
G
P
 
P
H
 
Y
K
 
G
I
 
I
N
 
R
V
 
C
N
 
N
G
 
A
I
 
V
A
 
L
P
|
P
G
|
G
V
 
T
V
x
I
D
 
A
T
|
T
P
 
D
M
x
I
W
x
N
N
 
K
E
 
E
V
 
-
D
 
-
A
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
-
R
 
-
Y
 
-
E
 
D
N
 
L
R
 
S
P
 
D
L
 
L
G
 
E
E
 
K
K
 
R
K
 
E
R
 
R
L
 
M
V
 
T
G
 
S
E
 
R
A
 
-
V
 
V
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
G
V
 
E
P
 
P
D
 
D
D
 
D
L
 
L
T
 
A
G
 
G
A
 
P
A
 
I
L
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
x
D
D
x
M
A
 
A
D
x
R
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
A
 
G
Q
 
A
T
 
S
L
 
L
N
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
L
W
 
F
M
 
V
S
 
N

7b81A Crystal structure of azotobacter vinelandii l-rhamnose 1-dehydrogenase (NAD bound-form) (see paper)
37% identity, 98% coverage: 5:260/260 of query aligns to 3:254/256 of 7b81A

query
sites
7b81A
L
 
L
Q
 
I
D
 
D
K
 
K
V
 
T
A
 
V
I
 
I
L
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
R
A
 
A
V
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
E
Y
 
C
L
 
A
D
 
R
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
R
 
R
C
 
V
V
 
V
L
 
I
V
 
G
D
 
H
V
 
S
K
 
G
P
 
S
A
 
D
D
 
E
S
 
G
F
 
R
G
 
A
D
 
G
S
 
A
L
 
L
R
 
S
-
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
I
A
 
A
T
 
A
Y
 
F
G
 
G
D
 
G
R
 
T
V
 
A
L
 
I
T
 
A
V
 
V
S
 
G
A
 
A
D
|
D
V
x
A
T
 
A
R
 
D
R
 
L
D
 
D
D
 
S
I
 
G
Q
 
E
R
 
K
I
 
L
V
 
V
A
 
A
S
 
A
T
 
A
L
 
V
E
 
E
R
 
A
F
 
F
G
 
G
Q
 
S
I
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
L
F
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
G
L
x
I
F
 
C
D
 
P
M
 
F
R
 
H
P
 
S
I
 
F
L
 
L
E
 
D
E
 
M
S
 
P
W
 
R
D
 
E
V
 
L
F
 
Y
D
 
L
R
 
K
L
 
T
F
 
V
A
 
G
V
x
T
N
 
N
V
 
L
K
 
N
G
 
G
M
 
A
F
 
Y
F
 
F
L
 
T
M
 
V
Q
 
Q
A
 
A
V
 
A
A
 
A
Q
 
R
K
 
R
M
 
M
V
 
K
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
C
 
R
G
 
G
G
 
G
K
 
A
I
 
I
I
 
I
N
 
A
M
x
V
S
 
S
S
|
S
Q
 
I
A
 
S
G
 
A
R
 
L
R
 
V
G
 
G
E
 
G
A
 
A
L
 
M
V
 
Q
S
 
T
H
 
H
Y
|
Y
C
 
T
A
 
P
T
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
L
L
 
L
S
 
S
Y
 
L
T
 
M
Q
 
Q
S
 
S
A
 
C
A
 
A
L
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
G
P
 
P
H
 
Y
K
 
G
I
 
I
N
 
R
V
 
C
N
 
N
G
 
A
I
 
V
A
 
L
P
|
P
G
|
G
V
 
T
V
x
I
D
 
A
T
|
T
P
 
D
M
x
I
W
 
N
N
 
K
E
 
E
V
 
-
D
 
-
A
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
-
R
 
-
Y
 
-
E
 
D
N
 
L
R
 
S
P
 
D
L
 
L
G
 
E
E
 
K
K
 
R
K
 
E
R
 
R
L
 
M
V
 
T
G
 
S
E
 
R
A
 
-
V
 
V
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
G
V
 
E
P
 
P
D
 
D
D
 
D
L
 
L
T
 
A
G
 
G
A
 
P
A
 
I
L
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
D
D
 
M
A
 
A
D
 
R
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
A
 
G
Q
 
A
T
 
S
L
 
L
N
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
L
W
 
F
M
 
V
S
 
N

Q5P5I4 (S)-1-Phenylethanol dehydrogenase; EC 1.1.1.311 from Aromatoleum aromaticum (strain EbN1) (Azoarcus sp. (strain EbN1)) (see 2 papers)
39% identity, 98% coverage: 1:256/260 of query aligns to 1:245/249 of Q5P5I4

query
sites
Q5P5I4
M
|
M
A
 
T
A
 
Q
R
 
R
L
 
L
Q
 
K
D
 
D
K
 
K
V
 
L
A
 
A
I
 
V
L
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
G
A
 
A
S
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
R
A
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
E
R
 
R
Y
 
F
L
 
A
D
 
V
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
D
C
 
I
V
 
A
L
 
I
V
 
A
D
|
D
V
 
L
K
 
V
P
 
P
A
 
A
D
 
P
S
 
E
F
 
A
G
 
E
D
 
A
S
 
A
L
 
I
R
 
R
A
 
-
T
 
N
Y
 
L
G
 
G
D
 
R
R
 
R
V
 
V
L
 
L
T
 
T
V
 
V
S
 
K
A
x
C
D
|
D
V
|
V
T
 
S
R
 
Q
R
 
P
D
 
G
D
 
D
I
 
V
Q
 
E
R
 
A
I
 
F
V
 
G
A
 
K
S
 
Q
T
 
V
L
 
I
E
 
S
R
 
T
F
 
F
G
 
G
Q
 
R
I
 
C
D
 
D
I
 
I
L
 
L
F
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
 
G
L
 
I
F
x
Y
D
 
P
M
 
L
R
 
I
P
 
P
I
 
F
L
 
D
E
 
E
E
 
L
S
 
T
W
 
F
D
 
E
V
 
Q
F
 
W
D
 
K
R
 
K
L
 
T
F
 
F
A
 
E
V
 
I
N
 
N
V
 
V
K
 
D
G
 
S
M
 
G
F
 
F
F
 
L
L
 
M
M
 
A
Q
 
K
A
 
A
V
 
F
A
 
V
Q
 
P
K
 
G
M
 
M
V
 
K
E
 
R
Q
 
N
G
 
G
C
 
W
G
 
-
G
 
G
K
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
L
S
 
T
S
 
S
Q
 
T
A
 
T
G
 
Y
R
 
W
R
 
L
G
 
K
E
 
I
A
 
E
L
 
A
V
 
Y
S
 
T
H
 
H
Y
 
Y
C
 
I
A
 
S
T
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
A
V
 
N
L
 
I
S
 
G
Y
 
F
T
 
T
Q
 
R
S
 
A
A
 
L
A
 
A
L
 
S
A
 
D
L
 
L
A
 
G
P
 
K
H
 
D
K
 
G
I
 
I
N
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
A
I
 
I
A
 
A
P
|
P
G
x
S
V
x
L
V
|
V
D
 
R
T
 
T
P
 
A
M
x
T
W
 
-
N
 
T
E
 
E
V
 
A
D
 
S
A
 
A
L
 
L
F
 
S
A
 
A
R
 
M
Y
 
F
E
 
D
N
 
V
R
 
L
P
 
P
L
 
-
G
 
-
E
 
-
K
 
-
K
 
-
R
 
-
L
 
N
V
 
M
G
 
L
E
 
Q
A
 
A
V
 
I
P
 
P
L
 
-
G
 
-
R
 
R
M
 
L
G
 
Q
V
 
V
P
 
P
D
 
L
D
 
D
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
D
D
 
D
A
 
A
D
 
S
Y
 
F
I
 
I
T
 
T
A
 
G
Q
 
Q
T
 
T
L
 
L
N
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

2ewmB Crystal structure of the (s)-specific 1-phenylethanol dehydrogenase of the denitrifying bacterium strain ebn1 (see paper)
40% identity, 97% coverage: 4:256/260 of query aligns to 2:243/247 of 2ewmB

query
sites
2ewmB
R
 
R
L
 
L
Q
 
K
D
 
D
K
 
K
V
 
L
A
 
A
I
 
V
L
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
A
S
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
R
A
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
E
R
 
R
Y
 
F
L
 
A
D
 
V
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
D
C
 
I
V
 
A
L
 
I
V
 
A
D
|
D
V
x
L
K
 
V
P
 
P
A
 
A
D
 
P
S
 
E
F
 
A
G
 
E
D
 
A
S
 
A
L
 
I
R
 
R
A
 
-
T
 
N
Y
 
L
G
 
G
D
 
R
R
 
R
V
 
V
L
 
L
T
 
T
V
 
V
S
 
K
A
x
C
D
|
D
V
|
V
T
 
S
R
 
Q
R
 
P
D
 
G
D
 
D
I
 
V
Q
 
E
R
 
A
I
 
F
V
 
G
A
 
K
S
 
Q
T
 
V
L
 
I
E
 
S
R
 
T
F
 
F
G
 
G
Q
 
R
I
 
C
D
 
D
I
 
I
L
 
L
F
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
 
G
L
 
I
F
 
Y
D
 
P
M
 
L
R
 
I
P
 
P
I
 
F
L
 
D
E
 
E
E
 
L
S
 
T
W
 
F
D
 
E
V
 
Q
F
 
W
D
 
K
R
 
K
L
 
T
F
 
F
A
 
E
V
 
I
N
 
N
V
 
V
K
 
D
G
 
S
M
 
G
F
 
F
F
 
L
L
 
M
M
 
A
Q
 
K
A
 
A
V
 
F
A
 
V
Q
 
P
K
 
G
M
 
M
V
 
K
E
 
R
Q
 
N
G
 
G
C
 
W
G
 
-
G
 
G
K
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
L
S
 
T
S
|
S
Q
 
T
A
 
T
G
 
Y
R
 
W
R
 
L
G
 
K
E
 
I
A
 
E
L
 
A
V
x
Y
S
 
T
H
 
H
Y
|
Y
C
 
I
A
 
S
T
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
A
V
 
N
L
 
I
S
 
G
Y
 
F
T
 
T
Q
 
R
S
 
A
A
 
L
A
 
A
L
 
S
A
 
D
L
 
L
A
 
G
P
 
K
H
 
D
K
 
G
I
 
I
N
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
A
I
 
I
A
 
A
P
|
P
G
x
S
V
x
L
V
|
V
D
 
R
T
 
T
P
 
A
M
x
T
W
 
-
N
 
T
E
 
E
V
 
A
D
 
S
A
 
A
L
 
L
F
 
S
A
 
A
R
 
M
Y
 
F
E
 
D
N
 
V
R
 
L
P
 
P
L
 
-
G
 
-
E
 
-
K
 
-
K
 
-
R
 
-
L
 
N
V
 
M
G
 
L
E
 
Q
A
 
A
V
 
I
P
 
P
L
 
-
G
 
-
R
 
R
M
 
L
G
 
Q
V
 
V
P
 
P
D
 
L
D
 
D
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
D
D
 
D
A
 
A
D
 
S
Y
 
F
I
 
I
T
 
T
A
 
G
Q
 
Q
T
 
T
L
 
L
N
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

7do6A Crystal structure of azotobacter vinelandii l-rhamnose 1- dehydrogenase(NADP bound-form) (see paper)
36% identity, 98% coverage: 5:260/260 of query aligns to 3:245/247 of 7do6A

query
sites
7do6A
L
 
L
Q
 
I
D
 
D
K
 
K
V
 
T
A
 
V
I
 
I
L
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
R
A
 
A
V
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
E
Y
 
C
L
 
A
D
 
R
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
R
 
R
C
 
V
V
 
V
L
 
I
V
 
G
D
x
H
V
x
S
K
 
G
P
 
S
A
 
D
D
 
E
S
x
G
F
 
R
G
 
A
D
 
G
S
 
A
L
 
L
R
 
S
-
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
I
A
 
A
T
 
A
Y
 
F
G
 
G
D
 
G
R
 
T
V
 
A
L
 
I
T
 
A
V
 
V
S
 
G
A
 
A
D
|
D
V
x
A
T
 
A
R
 
D
R
 
L
D
 
D
D
 
S
I
 
G
Q
 
E
R
 
K
I
 
L
V
 
V
A
 
A
S
 
A
T
 
A
L
 
V
E
 
E
R
 
A
F
 
F
G
 
G
Q
 
S
I
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
L
F
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
G
L
x
I
F
 
C
D
 
P
M
 
F
R
 
H
P
 
S
I
 
F
L
 
L
E
 
D
E
 
M
S
 
P
W
 
R
D
 
E
V
 
L
F
 
Y
D
 
L
R
 
K
L
 
T
F
 
V
A
 
G
V
x
T
N
 
N
V
 
L
K
 
N
G
 
G
M
 
A
F
 
Y
F
 
F
L
 
T
M
 
V
Q
 
Q
A
 
A
V
 
A
A
 
A
Q
 
R
K
 
R
M
 
M
V
 
K
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
C
 
R
G
 
G
G
 
G
K
 
A
I
 
I
I
 
I
N
 
A
M
 
V
S
 
S
S
|
S
Q
 
I
A
 
S
G
 
A
R
 
L
R
 
V
G
 
G
E
 
G
A
 
A
L
 
M
V
 
Q
S
 
T
H
 
H
Y
|
Y
C
 
T
A
 
P
T
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
L
L
 
L
S
 
S
Y
 
L
T
 
M
Q
 
Q
S
 
S
A
 
C
A
 
A
L
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
G
P
 
P
H
 
Y
K
 
G
I
 
I
N
 
R
V
 
C
N
 
N
G
 
A
I
 
V
A
 
L
P
 
P
G
 
G
V
 
T
V
x
I
D
 
A
T
 
D
P
 
L
M
 
-
W
 
-
N
 
-
E
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
-
R
 
-
Y
 
-
E
 
-
N
 
-
R
 
-
P
 
-
L
 
-
G
 
-
E
 
E
K
 
K
K
 
R
R
 
E
L
 
R
V
 
M
G
 
T
E
 
S
A
 
R
V
 
V
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
G
V
 
E
P
 
P
D
 
D
D
 
D
L
 
L
T
 
A
G
 
G
A
 
P
A
 
I
L
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
D
D
 
M
A
 
A
D
 
R
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
A
 
G
Q
 
A
T
 
S
L
 
L
N
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
L
W
 
F
M
 
V
S
 
N

Q9ZNN8 L-2,3-butanediol dehydrogenase; L-BDH; (S,S)-butanediol dehydrogenase; Diacetyl reductase [(S)-acetoin forming]; EC 1.1.1.76; EC 1.1.1.304 from Corynebacterium glutamicum (Brevibacterium saccharolyticum) (see paper)
35% identity, 96% coverage: 8:256/260 of query aligns to 3:254/258 of Q9ZNN8

query
sites
Q9ZNN8
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
M
L
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
G
A
 
A
S
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
R
A
 
G
V
 
I
A
 
S
R
 
E
R
 
K
Y
 
L
L
 
A
D
 
A
E
 
D
G
 
G
A
 
F
R
 
D
C
 
I
V
 
A
L
 
V
V
 
A
D
|
D
V
 
L
-
 
P
K
 
Q
P
x
Q
A
 
E
D
 
E
S
 
Q
F
 
A
G
 
A
D
 
E
S
 
T
L
 
I
R
 
K
A
 
L
T
 
I
Y
 
E
G
 
A
-
 
A
-
 
D
D
 
Q
R
 
K
V
 
A
L
 
V
T
 
F
V
 
V
S
 
G
A
 
L
D
|
D
V
|
V
T
 
T
R
 
D
R
 
K
D
 
A
D
 
N
I
 
F
Q
 
D
R
 
S
I
 
A
V
 
I
A
 
D
S
 
E
T
 
A
L
 
A
E
 
E
R
 
K
F
 
L
G
 
G
Q
 
G
I
 
F
D
 
D
I
 
V
L
 
L
F
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
 
G
L
 
I
F
 
A
D
 
Q
M
 
I
R
 
K
P
 
P
I
 
L
L
 
L
E
 
E
E
 
V
S
 
T
W
 
E
D
 
E
V
 
D
F
 
L
D
 
K
R
 
Q
L
 
I
F
 
Y
A
 
S
V
 
V
N
 
N
V
 
V
K
 
F
G
 
S
M
 
V
F
 
F
F
 
F
L
 
G
M
 
I
Q
 
Q
A
 
A
V
 
A
A
 
S
Q
 
R
K
 
K
M
 
F
V
 
D
E
 
E
Q
 
L
G
 
G
C
 
V
G
 
K
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
A
S
 
A
S
 
S
Q
x
I
A
 
A
G
 
A
R
 
I
R
 
Q
G
 
G
E
x
F
A
 
P
L
 
I
V
 
L
S
 
S
H
 
A
Y
|
Y
C
 
S
A
 
T
T
 
T
K
|
K
A
 
F
A
 
A
V
 
V
L
 
R
S
 
G
Y
 
L
T
 
T
Q
 
Q
S
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
Q
A
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
H
 
K
K
 
G
I
 
H
N
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
A
I
 
Y
A
 
A
P
|
P
G
|
G
V
x
I
V
|
V
D
x
G
T
|
T
P
 
G
M
 
M
W
 
W
N
 
E
E
 
Q
V
 
I
D
 
D
A
 
A
L
 
E
F
 
L
A
 
S
R
 
K
Y
 
I
E
 
N
N
 
G
R
 
K
P
 
P
L
 
I
G
 
G
E
 
E
K
 
N
K
 
F
R
 
K
L
 
E
V
 
Y
G
 
S
E
 
S
A
 
S
V
 
I
P
 
A
L
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
P
G
 
S
V
 
V
P
 
P
D
 
E
D
 
D
L
 
V
T
 
A
G
 
G
A
 
L
A
 
V
L
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
E
D
 
N
A
 
S
D
 
N
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
A
 
G
Q
 
Q
T
 
V
L
 
M
N
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

3a28C Crystal structure of l-2,3-butanediol dehydrogenase (see paper)
35% identity, 96% coverage: 8:256/260 of query aligns to 2:253/257 of 3a28C

query
sites
3a28C
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
M
L
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
A
S
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
R
A
 
G
V
 
I
A
 
S
R
 
E
R
 
K
Y
 
L
L
 
A
D
 
A
E
 
D
G
 
G
A
 
F
R
 
D
C
 
I
V
 
A
L
 
V
V
 
A
D
|
D
V
x
L
-
 
P
K
 
Q
P
x
Q
A
 
E
D
 
E
S
 
Q
F
 
A
G
 
A
D
 
E
S
 
T
L
 
I
R
 
K
A
 
L
T
 
I
Y
 
E
G
 
A
-
 
A
-
 
D
D
 
Q
R
 
K
V
 
A
L
 
V
T
 
F
V
 
V
S
 
G
A
x
L
D
|
D
V
|
V
T
 
T
R
 
D
R
 
K
D
 
A
D
 
N
I
 
F
Q
 
D
R
 
S
I
 
A
V
 
I
A
 
D
S
 
E
T
 
A
L
 
A
E
 
E
R
 
K
F
 
L
G
 
G
Q
 
G
I
 
F
D
 
D
I
 
V
L
 
L
F
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
 
G
L
 
I
F
 
A
D
 
Q
M
 
I
R
 
K
P
 
P
I
 
L
L
 
L
E
 
E
E
 
V
S
 
T
W
 
E
D
 
E
V
 
D
F
 
L
D
 
K
R
 
Q
L
 
I
F
 
Y
A
 
S
V
 
V
N
 
N
V
 
V
K
 
F
G
 
S
M
 
V
F
 
F
F
 
F
L
 
G
M
 
I
Q
 
Q
A
 
A
V
 
A
A
 
S
Q
 
R
K
 
K
M
 
F
V
 
D
E
 
E
Q
 
L
G
 
G
C
 
V
G
 
K
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
A
S
 
A
S
|
S
Q
 
I
A
 
A
G
 
A
R
 
I
R
 
Q
G
 
G
E
 
F
A
 
P
L
 
I
V
 
L
S
 
S
H
 
A
Y
|
Y
C
 
S
A
 
T
T
 
T
K
|
K
A
 
F
A
 
A
V
 
V
L
 
R
S
 
G
Y
 
L
T
 
T
Q
 
Q
S
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
Q
A
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
H
 
K
K
 
G
I
 
H
N
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
A
I
 
Y
A
 
A
P
|
P
G
 
G
V
 
I
V
|
V
D
 
G
T
|
T
P
 
G
M
|
M
W
|
W
N
 
E
E
 
Q
V
 
I
D
 
D
A
 
A
L
 
E
F
x
L
A
 
S
R
 
K
Y
 
I
E
 
N
N
 
G
R
 
K
P
 
P
L
 
I
G
 
G
E
 
E
K
 
N
K
 
F
R
 
K
L
 
E
V
 
Y
G
 
S
E
 
S
A
 
S
V
 
I
P
 
A
L
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
P
G
 
S
V
 
V
P
 
P
D
 
E
D
 
D
L
 
V
T
 
A
G
 
G
A
 
L
A
 
V
L
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
E
D
 
N
A
 
S
D
 
N
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
A
 
G
Q
 
Q
T
 
V
L
 
M
N
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
37% identity, 98% coverage: 5:259/260 of query aligns to 3:247/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
L
 
L
Q
 
Q
D
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
V
L
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
x
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
R
A
 
D
V
 
I
A
 
A
R
 
I
R
 
N
Y
 
L
L
 
A
D
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
N
C
 
I
V
 
F
L
 
F
V
x
N
D
x
Y
V
x
N
K
x
G
P
x
S
A
 
P
D
 
E
S
 
A
F
 
A
G
 
E
D
 
E
S
 
T
-
 
A
-
 
K
L
 
L
R
 
V
A
 
A
T
 
E
Y
 
H
G
 
G
D
 
V
R
 
E
V
 
V
L
 
E
T
 
A
V
 
M
S
 
K
A
 
A
D
x
N
V
|
V
T
 
A
R
 
I
R
 
A
D
 
E
D
 
D
I
 
V
Q
 
D
R
 
A
I
 
F
V
 
F
A
 
K
S
 
Q
T
 
A
L
 
I
E
 
E
R
 
R
F
 
F
G
 
G
Q
 
R
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
F
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
 
G
L
x
I
F
 
T
D
 
R
M
 
D
R
 
N
P
 
L
I
 
L
L
 
M
E
 
R
E
 
M
S
 
K
W
 
E
D
 
D
V
 
E
F
 
W
D
 
D
R
 
D
L
 
V
F
 
I
A
 
N
V
x
I
N
 
N
V
 
L
K
 
K
G
 
G
M
 
T
F
 
F
F
 
L
L
 
C
M
 
T
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
S
Q
 
R
K
 
T
M
 
M
V
 
M
E
 
K
Q
 
Q
G
 
R
C
 
A
G
 
G
G
 
-
K
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
M
S
 
A
S
|
S
Q
 
V
A
 
V
G
 
G
R
 
L
R
 
I
G
 
G
E
 
N
A
 
A
L
 
G
V
x
Q
S
 
A
H
 
N
Y
|
Y
C
 
V
A
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
V
L
 
I
S
 
G
Y
 
L
T
 
T
Q
 
K
S
 
T
A
 
T
A
 
A
L
 
R
A
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
H
 
R
K
 
G
I
 
I
N
 
N
V
 
V
N
 
N
G
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
V
 
F
V
x
I
D
 
T
T
|
T
P
 
D
M
 
M
W
 
T
N
 
D
E
 
K
V
 
L
D
 
D
A
 
E
L
 
-
F
 
-
A
 
-
R
 
-
Y
 
-
E
 
-
N
 
-
R
 
-
P
 
-
L
 
-
G
 
-
E
 
K
K
 
T
K
 
K
R
 
E
L
 
A
V
 
M
G
 
L
E
 
A
A
 
Q
V
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
A
M
 
Y
G
 
G
V
 
T
P
 
T
D
 
E
D
 
D
L
 
I
T
 
A
G
 
N
A
 
A
A
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
D
D
 
A
A
 
S
D
 
K
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
A
 
G
Q
 
Q
T
 
T
L
 
L
N
 
S
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
M
W
 
V
M
 
M

4za2D Crystal structure of pectobacterium carotovorum 2-keto-3-deoxy-d- gluconate dehydrogenase complexed with NAD+ (see paper)
36% identity, 98% coverage: 5:260/260 of query aligns to 8:246/247 of 4za2D

query
sites
4za2D
L
 
L
Q
 
Q
D
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
L
L
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
C
A
x
D
S
 
T
G
 
G
I
x
L
G
 
G
E
 
Q
A
 
G
V
 
M
A
 
A
R
 
I
R
 
G
Y
 
L
L
 
A
D
 
Q
E
 
A
G
 
G
A
 
C
R
 
D
C
 
I
V
 
V
L
 
G
V
 
V
D
 
N
-
x
I
V
 
V
K
 
E
P
 
P
A
 
K
D
 
D
S
 
T
F
 
I
G
 
-
D
 
E
S
 
K
L
 
V
R
 
T
A
 
A
T
 
-
Y
 
L
G
 
G
D
 
R
R
 
R
V
 
F
L
 
L
T
 
S
V
 
L
S
 
T
A
 
A
D
|
D
V
x
M
T
 
S
R
 
N
R
 
V
D
 
S
D
 
G
I
 
H
Q
 
A
R
 
E
I
 
L
V
 
V
A
 
E
S
 
K
T
 
A
L
 
V
E
 
A
R
 
E
F
 
F
G
 
G
Q
 
H
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
F
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
G
L
 
I
F
 
I
D
 
R
M
 
R
R
 
E
P
 
D
I
 
A
L
 
I
E
 
E
E
 
F
S
 
S
W
 
E
D
 
K
V
 
N
F
 
W
D
 
D
R
 
D
L
 
V
F
 
M
A
 
N
V
x
L
N
 
N
V
 
I
K
 
K
G
 
S
M
 
V
F
 
F
F
 
F
L
 
M
M
 
S
Q
 
Q
A
 
T
V
 
V
A
 
A
Q
 
R
K
 
Q
M
 
F
V
 
I
E
 
K
Q
 
Q
G
 
G
C
 
K
G
 
G
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
x
I
S
 
A
S
|
S
Q
 
M
A
 
L
G
 
S
R
 
F
R
 
Q
G
 
G
E
 
G
A
 
I
L
 
R
V
 
V
S
 
P
H
 
S
Y
|
Y
C
 
T
A
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
S
A
 
A
V
 
V
L
 
M
S
 
G
Y
 
V
T
 
T
Q
 
R
S
 
L
A
 
M
A
 
A
L
 
N
A
 
E
L
 
W
A
 
A
P
 
K
H
 
H
K
 
G
I
 
I
N
 
N
V
 
V
N
 
N
G
 
A
I
 
I
A
 
A
P
 
P
G
|
G
V
 
Y
V
x
M
D
 
A
T
|
T
P
 
-
M
 
-
W
 
-
N
 
-
E
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
-
R
 
-
Y
 
-
E
 
-
N
 
-
R
 
N
P
x
N
L
 
T
G
 
Q
E
 
E
K
 
R
K
 
S
R
 
K
L
 
E
V
 
I
G
 
L
E
 
D
A
 
R
V
 
I
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
M
 
W
G
 
G
V
 
L
P
 
P
D
 
Q
D
 
D
L
 
L
T
 
M
G
 
G
A
 
P
A
 
S
L
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
S
D
 
A
A
 
S
D
 
D
Y
 
Y
I
 
I
T
 
N
A
 
G
Q
 
Y
T
 
T
L
 
I
N
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
-
W
 
W
M
 
L
S
 
A

Q9KJF1 (2S)-[(R)-hydroxy(phenyl)methyl]succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; (S,R)-2-(alpha-hydroxybenzyl)succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; EC 1.1.1.429 from Thauera aromatica (see 2 papers)
36% identity, 97% coverage: 5:256/260 of query aligns to 3:242/248 of Q9KJF1

query
sites
Q9KJF1
L
 
I
Q
 
Q
D
 
N
K
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
L
L
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
S
A
 
A
S
|
S
G
 
G
I
 
M
G
 
G
E
 
K
A
 
Q
V
 
T
A
 
A
R
 
L
R
 
R
Y
 
F
L
 
A
D
 
E
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
R
 
A
C
 
V
V
 
V
L
 
I
V
 
N
D
|
D
V
 
I
K
 
D
P
 
A
A
 
-
D
 
-
S
 
-
F
 
-
G
 
-
D
 
E
S
 
K
L
 
V
R
 
R
A
 
A
T
 
T
Y
 
V
-
 
D
-
 
E
-
 
F
-
 
S
-
 
A
-
 
R
G
 
G
D
 
H
R
 
R
V
 
V
L
 
L
T
 
G
V
 
A
S
 
V
A
 
A
D
|
D
V
x
I
T
 
G
R
 
N
R
 
K
D
 
A
D
 
A
I
 
V
Q
 
D
R
 
G
I
 
M
V
 
V
A
 
K
S
 
Q
T
 
T
L
 
I
E
 
D
R
 
A
F
 
F
G
 
G
Q
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
F
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
 
G
L
 
M
F
 
E
D
 
R
-
 
A
-
 
G
-
 
A
M
 
L
R
 
R
P
 
K
I
 
L
L
 
S
E
 
E
E
 
A
S
 
D
W
 
W
D
 
D
V
 
V
F
 
-
D
 
-
R
 
-
L
 
T
F
 
I
A
 
N
V
 
V
N
 
N
V
 
L
K
 
K
G
 
G
M
 
T
F
 
F
F
 
L
L
 
C
M
 
T
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
H
Q
 
G
K
 
H
M
 
M
V
 
V
E
 
E
Q
 
N
G
 
K
C
 
H
G
 
-
G
 
G
K
 
R
I
 
I
I
 
V
N
 
N
M
 
I
S
 
A
S
 
S
Q
 
R
A
 
A
G
 
-
R
 
W
R
 
L
G
 
G
E
 
G
A
 
A
L
 
G
V
 
Q
S
 
T
H
 
P
Y
|
Y
C
 
S
A
 
S
T
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
V
L
 
V
S
 
G
Y
 
M
T
 
T
Q
 
R
S
 
A
A
 
L
A
 
A
L
 
I
A
 
E
L
 
L
A
 
G
P
 
R
H
 
A
K
 
G
I
 
I
N
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
C
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
L
V
 
I
D
 
H
T
 
T
P
 
P
M
 
M
W
 
W
N
 
D
E
 
E
V
 
L
D
 
-
A
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
-
R
 
-
Y
 
-
E
 
-
N
 
-
R
 
-
P
 
P
L
 
E
G
 
K
E
 
D
K
 
Q
K
 
Q
R
 
F
L
 
L
V
 
L
G
 
S
E
 
R
A
 
Q
V
 
-
P
 
P
L
 
T
G
 
G
R
 
K
M
 
L
G
 
G
V
 
E
P
 
P
D
 
D
D
 
D
L
 
I
T
 
A
G
 
N
A
 
T
A
 
L
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
D
A
 
D
D
 
D
A
 
S
D
 
G
Y
 
F
I
 
V
T
 
T
A
 
G
Q
 
Q
T
 
V
L
 
L
N
 
Y
V
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

8cxaA Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase from mycobacterium smegmatis with bound NAD
37% identity, 97% coverage: 4:256/260 of query aligns to 2:247/251 of 8cxaA

query
sites
8cxaA
R
 
R
L
 
L
Q
 
A
D
 
N
K
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
L
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
S
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
R
A
 
I
V
 
Y
A
 
A
R
 
E
R
 
R
Y
 
F
L
 
A
D
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
A
C
 
V
V
 
V
L
 
V
V
 
A
D
|
D
V
 
I
-
 
N
K
 
E
P
 
P
A
 
K
D
 
A
S
 
T
F
 
E
G
 
V
D
 
A
S
 
S
L
 
S
R
 
I
A
 
T
T
 
S
Y
 
L
G
 
G
D
 
G
R
 
R
V
 
A
L
 
I
T
 
A
V
 
A
S
 
A
A
 
V
D
 
D
V
|
V
T
 
S
R
 
D
R
 
V
D
 
E
D
 
S
I
 
V
Q
 
N
R
 
R
I
 
M
V
 
V
A
 
D
S
 
S
T
 
A
L
 
V
E
 
E
R
 
A
F
 
F
G
 
G
Q
 
T
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
F
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
|
A
L
 
I
F
 
F
D
x
S
-
 
T
-
 
L
-
 
K
M
 
M
R
 
K
P
 
P
I
 
F
L
 
E
E
 
E
E
 
I
S
 
S
W
 
G
D
 
D
V
 
E
F
 
W
D
 
D
R
 
K
L
 
L
F
 
F
A
 
A
V
 
V
N
 
N
V
 
A
K
 
K
G
 
G
M
 
T
F
 
F
F
 
L
L
 
C
M
 
C
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
S
Q
 
P
K
 
V
M
 
M
V
 
-
E
 
R
Q
 
K
G
 
N
C
 
Q
G
 
Y
G
 
G
K
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
x
I
S
|
S
S
|
S
Q
 
S
A
 
V
G
 
V
R
 
V
R
 
T
G
 
G
E
 
R
A
 
P
L
 
N
V
 
Y
S
 
A
H
 
H
Y
|
Y
C
 
I
A
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
W
S
 
A
Y
 
L
T
 
T
Q
 
H
S
 
A
A
 
L
A
 
A
L
 
T
A
 
E
L
 
M
A
 
G
P
 
T
H
 
D
K
 
G
I
 
I
N
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
T
I
 
V
A
 
S
P
|
P
G
x
H
V
 
G
V
x
I
D
 
I
T
 
T
P
 
E
M
x
I
W
 
P
N
 
R
E
 
E
V
 
T
D
 
I
A
 
S
L
 
-
F
 
-
A
 
-
R
 
-
Y
 
-
E
 
-
N
 
-
R
 
-
P
 
E
L
 
E
G
 
G
E
 
W
K
 
R
K
 
R
R
 
N
L
 
L
V
 
-
G
 
-
E
 
E
A
 
E
V
 
Q
P
 
A
L
 
L
G
 
K
R
 
R
M
 
K
G
 
G
V
 
D
P
 
A
D
 
S
D
 
D
L
 
L
T
 
V
G
 
G
A
 
I
A
 
L
L
 
L
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
D
D
 
E
A
 
S
D
 
K
Y
 
F
I
 
M
T
 
T
A
 
G
Q
 
Q
T
 
T
L
 
V
N
 
A
V
 
L
D
 
D
G
 
A
G
 
G

7pcsB Structure of the heterotetrameric sdr family member bbscd (see paper)
36% identity, 97% coverage: 5:256/260 of query aligns to 2:241/247 of 7pcsB

query
sites
7pcsB
L
 
I
Q
 
Q
D
 
N
K
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
L
L
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
S
A
 
A
S
 
S
G
 
G
I
x
M
G
 
G
E
 
K
A
 
Q
V
 
T
A
 
A
R
 
L
R
 
R
Y
 
F
L
 
A
D
 
E
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
R
 
A
C
 
V
V
 
V
L
 
I
V
 
N
D
|
D
V
x
I
K
 
D
P
 
A
A
 
-
D
 
-
S
 
-
F
 
-
G
 
-
D
 
E
S
 
K
L
 
V
R
 
R
A
 
A
T
 
T
Y
 
V
-
 
D
-
 
E
-
 
F
-
 
S
-
 
A
-
 
R
G
 
G
D
 
H
R
 
R
V
 
V
L
 
L
T
 
G
V
 
A
S
 
V
A
 
A
D
 
D
V
x
I
T
 
G
R
 
N
R
 
K
D
 
A
D
 
A
I
 
V
Q
 
D
R
 
G
I
 
M
V
 
V
A
 
K
S
 
Q
T
 
T
L
 
I
E
 
D
R
 
A
F
 
F
G
 
G
Q
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
F
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
x
G
L
 
M
F
 
E
D
 
R
-
 
A
-
 
G
-
 
A
M
 
L
R
 
R
P
 
K
I
 
L
L
 
S
E
 
E
E
 
A
S
 
D
W
 
W
D
 
D
V
 
V
F
 
-
D
 
-
R
 
-
L
 
T
F
 
I
A
 
N
V
 
V
N
 
N
V
 
L
K
 
K
G
 
G
M
 
T
F
 
F
F
 
L
L
 
C
M
 
T
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
H
Q
 
G
K
 
H
M
 
M
V
 
V
E
 
E
Q
 
N
G
 
K
C
 
H
G
 
-
G
 
G
K
 
R
I
 
I
I
 
V
N
 
N
M
x
I
S
 
A
S
|
S
Q
 
R
A
 
A
G
 
-
R
 
W
R
 
L
G
 
G
E
 
G
A
 
A
L
 
G
V
 
Q
S
 
T
H
 
P
Y
|
Y
C
 
S
A
 
S
T
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
V
L
 
V
S
 
G
Y
 
M
T
 
T
Q
 
R
S
 
A
A
 
L
A
 
A
L
 
I
A
 
E
L
 
L
A
 
G
P
 
R
H
 
A
K
 
G
I
 
I
N
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
C
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
L
V
x
I
D
 
H
T
 
T
P
 
P
M
 
M
W
 
W
N
 
D
E
 
E
V
 
L
D
 
-
A
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
-
R
 
-
Y
 
-
E
 
-
N
 
-
R
 
-
P
 
P
L
 
E
G
 
K
E
 
D
K
 
Q
K
 
Q
R
 
F
L
 
L
V
 
L
G
 
S
E
 
R
A
 
Q
V
 
-
P
 
P
L
 
T
G
 
G
R
 
K
M
 
L
G
 
G
V
 
E
P
 
P
D
 
D
D
 
D
L
 
I
T
 
A
G
 
N
A
 
T
A
 
L
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
D
A
 
D
D
 
D
A
 
S
D
 
G
Y
 
F
I
 
V
T
 
T
A
 
G
Q
 
Q
T
 
V
L
 
L
N
 
Y
V
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G

5t5qC Crystal structure of short-chain dehydrogenase/reductase sdr:glucose/ribitol dehydrogenase from brucella melitensis
33% identity, 100% coverage: 1:260/260 of query aligns to 1:245/245 of 5t5qC

query
sites
5t5qC
M
 
M
A
 
K
A
 
F
R
 
E
L
 
F
Q
 
E
D
 
N
K
 
R
V
 
T
A
 
L
I
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
x
N
S
x
G
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
R
A
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
E
R
 
L
Y
 
F
L
 
H
D
 
A
E
 
S
G
 
G
A
 
A
R
 
N
C
 
L
V
 
V
L
 
L
V
 
T
D
|
D
V
x
L
-
 
D
-
 
R
K
 
E
P
 
G
A
 
L
D
 
D
S
 
A
F
 
F
G
 
A
D
 
A
S
 
S
L
 
L
R
 
G
A
 
S
T
 
P
Y
 
-
G
 
-
D
 
E
R
 
R
V
 
I
L
 
A
T
 
T
V
 
I
S
 
K
A
 
A
D
|
D
V
x
A
T
 
S
R
 
S
R
 
A
D
 
D
D
 
D
I
 
A
Q
 
E
R
 
K
I
 
T
V
 
V
A
 
A
S
 
L
T
 
A
L
 
M
E
 
E
R
 
R
F
 
F
G
 
G
Q
 
G
I
 
I
D
 
D
I
 
F
L
 
L
F
 
V
N
 
P
N
x
S
A
 
A
A
 
G
L
 
I
F
 
Y
D
 
Q
M
 
A
R
 
K
P
 
P
I
 
F
L
 
A
E
 
E
E
 
M
S
 
S
W
 
D
D
 
A
V
 
D
F
 
W
D
 
H
R
 
R
L
 
T
F
 
I
A
 
S
V
x
I
N
 
N
V
 
L
K
 
D
G
 
G
M
 
V
F
 
F
F
 
Y
L
 
L
M
 
C
Q
 
K
A
 
R
V
 
A
A
 
L
Q
 
P
K
 
A
M
 
L
V
 
K
E
 
E
Q
 
D
G
 
-
C
 
-
G
 
-
G
 
S
K
 
S
I
 
I
I
 
V
N
 
T
M
 
L
S
 
A
S
|
S
Q
 
L
A
 
A
G
 
A
R
 
Y
R
 
R
G
 
G
E
 
A
A
 
Y
L
 
V
V
x
N
S
 
A
H
 
H
Y
|
Y
C
 
G
A
 
A
T
 
T
K
|
K
A
 
G
A
 
A
V
 
M
L
 
V
S
 
S
Y
 
M
T
 
T
Q
 
R
S
 
A
A
 
L
A
 
S
L
 
R
A
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
H
 
-
K
 
K
I
 
T
N
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
G
I
 
V
A
 
S
P
|
P
G
 
G
V
 
I
V
x
I
D
 
E
T
|
T
P
 
P
M
|
M
W
 
T
N
 
S
E
 
E
V
 
L
D
 
-
A
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
-
R
 
-
Y
 
-
E
 
-
N
 
-
R
 
-
P
 
-
L
 
L
G
 
K
E
 
T
K
 
R
K
 
M
R
 
D
L
 
E
V
 
T
G
 
M
E
 
T
A
 
Q
V
 
T
P
 
P
L
 
L
G
 
K
R
 
R
M
 
L
G
 
G
V
 
K
P
 
P
D
 
S
D
 
E
L
 
I
T
 
A
G
 
S
A
 
V
A
 
I
L
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
C
S
 
S
A
 
P
D
 
A
A
 
A
D
 
S
Y
 
F
I
 
V
T
 
T
A
 
G
Q
 
E
T
 
T
L
 
I
N
 
Q
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
N
 
I
W
 
Y
M
 
M
S
 
A

7v0hG Crystal structure of putative glucose 1-dehydrogenase from burkholderia cenocepacia in complex with NADP and a potential reaction product
36% identity, 98% coverage: 3:256/260 of query aligns to 7:251/253 of 7v0hG

query
sites
7v0hG
A
 
S
R
 
K
L
 
L
Q
 
A
D
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
I
L
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
S
x
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
A
A
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
K
R
 
A
Y
 
L
L
 
A
D
 
D
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
-
C
 
A
V
 
V
L
 
V
V
 
V
D
 
N
V
 
Y
K
x
A
P
x
S
A
x
S
D
 
K
S
 
A
F
 
G
G
 
A
D
 
D
S
 
A
L
 
V
R
 
V
A
 
S
T
 
A
Y
 
I
-
 
T
-
 
E
-
 
A
G
 
G
D
 
G
R
 
R
V
 
A
L
 
V
T
 
A
V
 
V
S
 
G
A
x
G
D
|
D
V
|
V
T
 
S
R
 
K
R
 
A
D
 
A
D
 
D
I
 
A
Q
 
Q
R
 
R
I
 
I
V
 
V
A
 
D
S
 
T
T
 
A
L
 
I
E
 
E
R
 
T
F
 
Y
G
 
G
Q
 
R
I
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
F
 
V
N
 
N
N
|
N
A
x
S
A
x
G
L
 
V
F
x
Y
D
 
E
M
 
F
R
 
A
P
 
P
I
 
I
L
 
E
E
 
A
E
 
I
S
 
T
W
 
E
D
 
E
V
 
H
F
 
Y
D
 
R
R
 
R
L
 
Q
F
 
F
A
 
D
V
 
T
N
 
N
V
 
V
K
 
F
G
 
G
M
 
V
F
 
L
F
 
L
L
 
T
M
 
T
Q
 
Q
A
 
A
V
 
A
A
 
V
Q
 
K
K
 
H
M
 
L
V
 
-
E
 
-
Q
 
-
G
 
G
C
 
E
G
 
G
G
 
A
K
 
S
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
x
I
S
 
S
S
|
S
Q
 
V
A
 
V
G
 
T
R
 
S
R
 
I
G
 
T
E
 
P
A
 
P
L
 
A
V
 
S
S
 
A
H
 
V
Y
|
Y
C
 
S
A
 
G
T
 
T
K
|
K
A
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
D
S
 
A
Y
 
I
T
 
T
Q
 
G
S
 
V
A
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
E
L
 
L
A
 
G
P
 
P
H
 
R
K
 
K
I
 
I
N
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
A
I
 
I
A
 
N
P
|
P
G
|
G
V
x
M
V
x
I
D
 
V
T
|
T
P
 
E
M
x
G
W
x
T
N
 
H
E
 
S
V
 
A
D
 
G
A
x
I
L
 
I
F
 
G
A
 
S
R
 
D
Y
 
L
E
 
E
N
 
A
R
 
Q
P
 
V
L
 
L
G
 
G
E
 
Q
K
 
T
K
 
-
R
 
-
L
 
-
V
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
-
V
 
-
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
G
V
 
E
P
 
P
D
 
N
D
 
D
L
 
I
T
 
A
G
 
S
A
 
V
A
 
A
L
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
D
D
 
D
A
 
A
D
 
R
Y
 
W
I
 
M
T
 
T
A
 
G
Q
 
E
T
 
H
L
 
L
N
 
V
V
 
V
D
 
S
G
 
G
G
 
G

5ojiA Crystal structure of the dehydrogenase/reductase sdr family member 4 (dhrs4) from caenorhabditis elegans (see paper)
36% identity, 97% coverage: 4:256/260 of query aligns to 7:255/260 of 5ojiA

query
sites
5ojiA
R
 
R
L
 
F
Q
 
E
D
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
I
L
 
V
T
 
T
G
x
A
A
 
A
A
x
T
S
 
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
L
A
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
E
R
 
R
Y
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
S
C
 
V
V
 
V
L
 
I
-
 
G
-
x
S
V
x
R
D
x
N
V
 
Q
K
 
K
P
x
N
A
 
V
D
 
D
S
 
E
F
 
A
G
 
I
D
 
E
S
 
Y
L
 
L
R
 
K
A
 
N
T
 
K
Y
 
G
G
 
L
D
 
T
R
 
K
V
 
V
L
 
A
T
 
G
V
 
I
S
 
A
A
 
G
D
 
H
V
x
I
T
 
A
R
 
S
R
 
T
D
 
D
D
 
D
I
 
Q
Q
 
K
R
 
K
I
 
L
V
 
V
A
 
D
S
 
F
T
 
T
L
 
L
E
 
Q
R
 
K
F
 
F
G
 
G
Q
 
K
I
 
I
D
 
N
I
 
I
L
 
L
F
 
V
N
 
N
N
|
N
A
x
H
A
x
G
L
 
I
F
 
N
D
 
P
-
 
A
M
 
F
R
 
G
P
 
H
I
 
I
L
 
L
E
 
E
E
 
V
S
 
S
W
 
D
D
 
Q
V
 
V
F
 
W
D
 
D
R
 
K
L
 
L
F
 
F
A
 
E
V
 
V
N
 
N
V
 
V
K
 
K
G
 
A
M
 
G
F
 
F
F
 
Q
L
 
M
M
 
T
Q
 
K
A
 
L
V
 
V
A
 
H
Q
 
P
K
 
H
M
 
I
V
 
A
E
 
K
Q
 
E
G
 
G
C
 
-
G
 
G
G
 
G
K
 
A
I
 
I
I
 
I
N
 
F
M
x
N
S
 
A
S
|
S
Q
 
Y
A
x
S
G
 
A
R
 
Y
R
 
K
G
 
S
E
 
P
A
 
P
L
 
G
V
 
I
S
 
A
H
 
A
Y
|
Y
C
 
G
A
 
V
T
 
T
K
|
K
A
 
T
A
 
T
V
 
L
L
 
V
S
 
G
Y
 
L
T
 
T
Q
 
R
S
 
A
A
 
L
A
 
A
L
 
M
A
 
G
L
 
L
A
 
A
P
 
K
H
 
D
K
 
N
I
 
I
N
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
G
I
 
I
A
 
A
P
 
P
G
|
G
V
|
V
V
x
I
D
 
K
T
|
T
P
 
K
M
|
M
W
x
S
N
 
Q
E
 
V
V
x
L
D
 
-
A
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
-
R
 
-
Y
 
W
E
 
D
N
 
G
R
 
G
P
 
E
L
 
D
G
 
A
E
 
E
K
 
K
K
 
E
R
 
L
L
 
T
V
 
D
G
 
I
E
 
Q
A
 
E
V
 
I
P
 
A
L
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
G
V
 
V
P
 
P
D
 
D
D
 
D
L
 
C
T
 
A
G
 
G
A
 
T
A
 
V
L
 
A
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
D
D
 
D
A
 
S
D
 
S
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
A
 
G
Q
 
E
T
 
M
L
 
I
N
 
I
V
 
I
D
 
A
G
 
G
G
 
G

Query Sequence

>BPHYT_RS16120 FitnessBrowser__BFirm:BPHYT_RS16120
MAARLQDKVAILTGAASGIGEAVARRYLDEGARCVLVDVKPADSFGDSLRATYGDRVLTV
SADVTRRDDIQRIVASTLERFGQIDILFNNAALFDMRPILEESWDVFDRLFAVNVKGMFF
LMQAVAQKMVEQGCGGKIINMSSQAGRRGEALVSHYCATKAAVLSYTQSAALALAPHKIN
VNGIAPGVVDTPMWNEVDALFARYENRPLGEKKRLVGEAVPLGRMGVPDDLTGAALFLAS
ADADYITAQTLNVDGGNWMS

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory