SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing BPHYT_RS16940 FitnessBrowser__BFirm:BPHYT_RS16940 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6ixmC Crystal structure of the ketone reductase chkred20 from the genome of chryseobacterium sp. Ca49 complexed with NAD (see paper)
40% identity, 98% coverage: 4:255/258 of query aligns to 3:248/248 of 6ixmC

query
sites
6ixmC
L
 
L
A
 
D
G
 
N
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
G
R
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
S
 
L
A
 
A
I
 
V
A
 
A
H
 
H
A
 
S
F
 
Y
A
 
A
R
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
K
V
 
V
V
 
I
L
 
V
A
 
S
E
x
D
L
x
I
D
 
N
I
 
E
E
 
D
T
 
H
A
 
G
R
 
N
Q
 
K
T
 
A
A
 
V
E
 
E
H
 
D
I
 
I
K
 
K
A
 
A
Q
 
Q
T
 
G
G
 
G
A
 
E
R
 
A
V
 
S
L
 
F
A
 
-
V
 
V
H
 
K
T
x
A
D
|
D
V
x
T
T
 
S
Q
 
N
S
 
P
A
 
E
S
 
E
V
 
V
Q
 
E
H
 
A
A
 
L
V
 
V
S
 
K
E
 
R
A
 
T
E
 
V
R
 
E
A
 
I
F
 
Y
G
 
G
A
 
R
L
 
L
D
 
D
V
 
I
L
 
A
V
 
C
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
N
 
G
V
 
-
F
 
-
C
 
G
D
 
E
P
 
Q
L
 
A
T
 
L
M
 
A
T
 
G
D
 
D
-
 
Y
-
 
G
-
 
L
D
 
D
D
 
S
W
 
W
R
 
R
R
 
K
C
 
V
F
 
L
A
 
S
V
 
I
D
 
N
L
 
L
D
 
D
G
 
G
V
 
V
W
 
F
N
 
Y
G
 
G
C
 
C
R
 
K
A
 
Y
A
 
E
L
 
L
P
 
E
G
 
Q
M
 
M
V
 
E
E
 
K
R
 
N
G
 
G
A
 
G
G
 
G
S
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
M
A
 
A
S
|
S
T
 
I
H
 
H
S
 
G
F
 
I
K
 
V
I
 
A
I
 
A
P
 
P
G
 
L
C
 
S
F
 
S
P
 
A
Y
|
Y
P
 
T
V
 
S
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
A
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
A
 
N
L
 
I
G
 
G
I
 
A
E
 
E
Y
 
Y
A
 
G
P
 
Q
R
 
K
N
 
N
V
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
G
P
|
P
G
x
A
Y
|
Y
I
|
I
E
 
E
T
 
T
Q
 
P
L
|
L
T
 
L
H
 
E
D
 
S
W
 
L
W
 
T
N
 
K
E
 
E
Q
 
M
A
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
Q
 
K
Q
 
E
A
 
A
T
 
L
L
 
I
D
 
S
L
 
K
Q
 
H
P
 
P
M
 
M
K
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
G
R
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
M
 
E
T
 
L
A
 
V
V
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
S
S
 
S
D
 
E
E
 
K
A
 
S
P
 
S
F
 
F
I
 
M
N
 
T
A
 
G
T
 
G
C
 
Y
I
 
Y
T
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
Y
S
 
T
A
 
A
L
 
V

4urfB Molecular genetic and crystal structural analysis of 1-(4- hydroxyphenyl)-ethanol dehydrogenase from aromatoleum aromaticum ebn1 (see paper)
39% identity, 96% coverage: 4:251/258 of query aligns to 3:244/248 of 4urfB

query
sites
4urfB
L
 
L
A
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
T
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
|
G
R
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
S
 
R
A
 
T
I
 
I
A
 
A
H
 
L
A
 
T
F
 
Y
A
 
A
R
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
N
V
 
V
V
 
V
L
 
V
A
 
S
E
x
D
L
x
I
D
 
S
I
 
D
E
 
E
T
 
W
A
 
G
R
 
R
Q
 
E
T
 
T
A
 
L
E
 
A
H
 
L
I
 
I
K
 
E
A
 
G
Q
 
K
T
 
G
G
 
G
A
 
K
R
 
A
V
 
V
L
 
F
A
 
Q
V
 
-
H
 
H
T
 
A
D
|
D
V
x
T
T
 
A
Q
 
H
S
 
P
A
 
E
S
 
D
V
 
H
Q
 
D
H
 
E
A
 
L
V
 
I
S
 
A
E
 
A
A
 
A
E
 
K
R
 
R
A
 
A
F
 
F
G
 
G
A
 
R
L
 
L
D
 
D
V
 
I
L
 
A
V
 
C
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
N
 
S
-
x
G
V
 
E
F
 
F
C
 
T
D
 
P
P
 
T
L
 
A
T
 
E
M
 
T
T
 
T
D
 
D
D
 
A
D
 
Q
W
 
W
R
 
Q
R
|
R
C
 
V
F
 
I
A
 
G
V
 
I
D
 
N
L
 
L
D
 
S
G
 
G
V
 
V
W
 
F
N
 
Y
G
 
G
C
 
V
R
 
R
A
 
A
A
 
Q
L
 
I
P
 
R
G
 
A
M
 
M
V
 
L
E
 
E
R
 
T
G
 
G
A
 
G
G
 
G
S
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
|
I
A
 
S
S
|
S
T
 
I
H
 
A
S
 
G
F
 
Q
K
 
I
I
 
G
I
 
I
P
 
E
G
 
G
C
x
I
F
 
T
P
 
P
Y
|
Y
P
 
T
V
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
A
 
T
L
 
V
G
 
A
I
 
W
E
 
E
Y
 
Y
A
 
G
P
 
S
R
 
K
N
 
G
V
 
I
R
|
R
V
 
I
N
 
N
A
 
S
I
 
V
A
 
G
P
|
P
G
x
A
Y
 
F
I
|
I
E
 
N
T
|
T
Q
 
T
L
 
L
T
 
V
H
 
-
D
 
-
W
 
-
W
 
-
N
 
-
E
 
-
Q
 
Q
A
 
N
D
 
V
P
 
P
A
 
L
A
 
E
A
 
T
Q
 
R
Q
 
R
A
 
Q
T
 
L
L
 
E
D
 
Q
L
 
M
Q
 
H
P
 
A
M
x
L
K
x
R
R
|
R
I
 
L
G
 
G
R
 
E
P
 
T
E
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
M
 
N
T
 
L
A
 
V
V
 
A
F
 
W
L
 
L
A
 
S
S
|
S
D
 
D
E
 
K
A
 
A
P
 
S
F
 
F
I
 
V
N
 
T
A
 
G
T
 
S
C
 
Y
I
 
Y
T
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

4urfA Molecular genetic and crystal structural analysis of 1-(4- hydroxyphenyl)-ethanol dehydrogenase from aromatoleum aromaticum ebn1 (see paper)
39% identity, 96% coverage: 4:251/258 of query aligns to 3:244/248 of 4urfA

query
sites
4urfA
L
 
L
A
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
T
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
|
G
R
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
S
 
R
A
 
T
I
 
I
A
 
A
H
 
L
A
 
T
F
 
Y
A
 
A
R
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
N
V
 
V
V
 
V
L
 
V
A
 
S
E
x
D
L
x
I
D
 
S
I
 
D
E
 
E
T
x
W
A
 
G
R
 
R
Q
 
E
T
 
T
A
 
L
E
 
A
H
 
L
I
 
I
K
 
E
A
 
G
Q
 
K
T
 
G
G
 
G
A
 
K
R
 
A
V
 
V
L
 
F
A
 
Q
V
 
-
H
 
H
T
 
A
D
|
D
V
x
T
T
 
A
Q
 
H
S
 
P
A
 
E
S
 
D
V
 
H
Q
 
D
H
 
E
A
 
L
V
 
I
S
 
A
E
 
A
A
 
A
E
 
K
R
 
R
A
 
A
F
 
F
G
 
G
A
 
R
L
 
L
D
 
D
V
 
I
L
 
A
V
 
C
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
N
x
S
-
x
G
V
x
E
F
 
F
C
x
T
D
 
P
P
 
T
L
 
A
T
x
E
M
 
T
T
|
T
D
 
D
D
 
A
D
x
Q
W
 
W
R
 
Q
R
|
R
C
 
V
F
 
I
A
 
G
V
 
I
D
 
N
L
 
L
D
 
S
G
 
G
V
 
V
W
 
F
N
 
Y
G
 
G
C
 
V
R
 
R
A
 
A
A
 
Q
L
 
I
P
 
R
G
 
A
M
 
M
V
 
L
E
 
E
R
 
T
G
 
G
A
 
G
G
 
G
S
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
|
I
A
 
S
S
|
S
T
 
I
H
 
A
S
 
G
F
 
Q
K
 
I
I
 
G
I
 
I
P
 
E
G
 
G
C
x
I
F
 
T
P
 
P
Y
|
Y
P
 
T
V
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
A
 
T
L
 
V
G
 
A
I
 
W
E
 
E
Y
 
Y
A
 
G
P
x
S
R
 
K
N
x
G
V
 
I
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
S
I
 
V
A
 
G
P
|
P
G
 
A
Y
 
F
I
|
I
E
 
N
T
|
T
Q
 
T
L
 
L
T
 
V
H
 
-
D
 
-
W
 
-
W
 
-
N
 
-
E
 
-
Q
 
Q
A
 
N
D
 
V
P
 
P
A
 
L
A
 
E
A
 
T
Q
 
R
Q
 
R
A
 
Q
T
 
L
L
 
E
D
 
Q
L
 
M
Q
 
H
P
 
A
M
 
L
K
 
R
R
 
R
I
 
L
G
 
G
R
 
E
P
 
T
E
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
M
 
N
T
 
L
A
 
V
V
 
A
F
 
W
L
 
L
A
 
S
S
 
S
D
 
D
E
 
K
A
 
A
P
 
S
F
 
F
I
 
V
N
 
T
A
 
G
T
x
S
C
x
Y
I
 
Y
T
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

4ureB Molecular genetic and crystal structural analysis of 1-(4- hydroxyphenyl)-ethanol dehydrogenase from aromatoleum aromaticum ebn1 (see paper)
39% identity, 96% coverage: 4:251/258 of query aligns to 3:244/248 of 4ureB

query
sites
4ureB
L
 
L
A
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
T
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
R
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
S
 
R
A
 
T
I
 
I
A
 
A
H
 
L
A
 
T
F
 
Y
A
 
A
R
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
N
V
 
V
V
 
V
L
 
V
A
 
S
E
 
D
L
 
I
D
 
S
I
 
D
E
 
E
T
 
W
A
 
G
R
 
R
Q
 
E
T
 
T
A
 
L
E
 
A
H
 
L
I
 
I
K
 
E
A
 
G
Q
 
K
T
 
G
G
 
G
A
 
K
R
 
A
V
 
V
L
 
F
A
 
Q
V
 
-
H
 
H
T
 
A
D
 
D
V
 
T
T
 
A
Q
 
H
S
 
P
A
 
E
S
 
D
V
 
H
Q
 
D
H
 
E
A
 
L
V
 
I
S
 
A
E
 
A
A
 
A
E
 
K
R
 
R
A
 
A
F
 
F
G
 
G
A
 
R
L
 
L
D
 
D
V
 
I
L
 
A
V
 
C
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
I
N
 
S
-
 
G
V
 
E
F
 
F
C
 
T
D
 
P
P
 
T
L
 
A
T
 
E
M
 
T
T
 
T
D
 
D
D
 
A
D
 
Q
W
 
W
R
 
Q
R
 
R
C
 
V
F
 
I
A
 
G
V
 
I
D
 
N
L
 
L
D
 
S
G
 
G
V
 
V
W
 
F
N
 
Y
G
 
G
C
 
V
R
 
R
A
 
A
A
 
Q
L
 
I
P
 
R
G
 
A
M
 
M
V
 
L
E
 
E
R
 
T
G
 
G
A
 
G
G
 
G
S
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
I
A
 
S
S
|
S
T
 
I
H
 
A
S
 
G
F
 
Q
K
 
I
I
 
G
I
 
I
P
 
E
G
 
G
C
x
I
F
 
T
P
 
P
Y
|
Y
P
 
T
V
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
A
 
T
L
 
V
G
 
A
I
 
W
E
 
E
Y
 
Y
A
 
G
P
 
S
R
 
K
N
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
S
I
 
V
A
 
G
P
|
P
G
x
A
Y
 
F
I
 
I
E
 
N
T
 
T
Q
 
T
L
 
L
T
 
V
H
 
-
D
 
-
W
 
-
W
 
-
N
 
-
E
 
-
Q
 
Q
A
 
N
D
 
V
P
 
P
A
 
L
A
 
E
A
 
T
Q
 
R
Q
 
R
A
 
Q
T
 
L
L
 
E
D
 
Q
L
 
M
Q
 
H
P
 
A
M
 
L
K
 
R
R
 
R
I
 
L
G
 
G
R
 
E
P
 
T
E
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
M
 
N
T
 
L
A
 
V
V
 
A
F
 
W
L
 
L
A
 
S
S
 
S
D
 
D
E
 
K
A
 
A
P
 
S
F
 
F
I
 
V
N
 
T
A
 
G
T
 
S
C
 
Y
I
 
Y
T
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

5itvA Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
35% identity, 98% coverage: 3:254/258 of query aligns to 4:254/255 of 5itvA

query
sites
5itvA
R
 
N
L
 
L
A
 
T
G
 
D
K
 
K
V
 
T
A
 
V
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
G
 
A
R
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
S
 
Y
A
 
A
I
 
A
A
 
V
H
 
Q
A
 
A
F
 
F
A
 
L
R
 
G
E
 
Q
G
 
Q
A
 
A
A
 
N
V
 
V
V
 
V
L
 
V
A
 
A
E
x
D
L
x
I
D
 
D
I
 
-
E
 
-
T
 
-
A
 
E
R
 
A
Q
 
Q
T
 
G
A
 
E
E
 
A
H
 
M
I
 
V
K
 
R
A
 
K
Q
 
E
T
 
N
G
 
N
A
 
D
R
 
R
V
 
L
L
 
H
A
 
F
V
 
V
H
 
Q
T
|
T
D
 
D
V
x
I
T
 
T
Q
 
D
S
 
E
A
 
A
S
 
A
V
 
C
Q
 
Q
H
 
H
A
 
A
V
 
V
S
 
E
E
 
S
A
 
A
E
 
V
R
 
H
A
 
T
F
 
F
G
 
G
A
 
G
L
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
I
N
 
E
V
 
I
F
 
V
C
 
A
D
 
P
P
 
I
L
 
H
T
 
E
M
 
M
T
 
E
D
 
L
D
 
S
D
 
D
W
 
W
R
 
N
R
 
K
C
 
V
F
 
L
A
 
Q
V
 
V
D
 
N
L
 
L
D
 
T
G
 
G
V
 
M
W
 
F
N
 
L
G
 
M
C
 
S
R
 
K
A
 
H
A
 
A
L
 
L
P
 
K
G
 
H
M
 
M
V
 
L
E
 
A
R
 
A
G
 
G
A
 
K
G
 
G
S
 
N
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
T
A
 
C
S
|
S
T
 
V
H
 
G
S
 
G
F
 
L
K
 
V
I
 
A
I
 
W
P
 
P
G
 
D
C
 
I
F
 
P
P
 
A
Y
|
Y
P
 
N
V
 
A
A
 
S
K
|
K
H
 
G
G
 
G
V
 
V
I
 
L
G
 
Q
L
 
L
T
 
T
R
 
K
A
 
S
L
 
M
G
 
A
I
 
V
E
 
D
Y
 
Y
A
 
A
P
 
K
R
 
H
N
 
Q
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
I
 
V
A
 
C
P
|
P
G
|
G
Y
x
I
I
|
I
E
 
D
T
 
T
Q
 
P
L
 
L
T
 
N
H
 
E
D
 
K
W
 
S
W
 
F
-
 
L
-
 
E
N
 
N
E
 
N
Q
 
E
A
 
G
D
 
T
P
 
L
A
 
E
A
 
E
A
 
I
Q
 
K
Q
 
K
A
 
E
T
 
K
L
 
A
D
 
K
L
 
V
Q
 
N
P
 
P
M
 
L
K
 
L
R
 
R
I
 
L
G
 
G
R
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
M
 
N
T
 
V
A
 
M
V
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
L
A
 
S
P
 
S
F
 
Y
I
 
M
N
 
T
A
 
G
T
 
S
C
 
A
I
 
I
T
 
T
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
Y
S
 
T
A
 
A

H9XP47 Meso-2,3-butanediol dehydrogenase; BDH; meso-2,3-BDH; (R,S)-butane-2,3-diol dehydrogenase; NAD(H)-dependent meso-2,3-BDH; SmBdh; EC 1.1.1.- from Serratia marcescens (see paper)
39% identity, 98% coverage: 3:254/258 of query aligns to 2:243/251 of H9XP47

query
sites
H9XP47
R
 
R
L
 
F
A
 
D
G
 
N
K
 
K
V
 
V
A
 
V
L
 
V
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
R
x
N
G
 
G
I
x
M
G
 
G
S
 
E
A
 
A
I
 
A
A
 
A
H
 
R
A
 
R
F
 
F
A
 
S
R
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
I
V
 
V
V
 
V
L
 
L
A
 
A
E
x
D
L
 
W
D
 
A
I
 
K
E
 
E
T
 
A
A
 
V
R
 
D
Q
 
K
T
 
V
A
 
A
E
 
A
H
 
S
I
 
L
K
 
P
A
 
K
Q
 
-
T
 
-
G
 
-
A
 
G
R
 
R
V
 
A
L
 
M
A
 
A
V
 
V
H
 
H
T
 
I
D
|
D
V
|
V
T
 
S
Q
 
D
S
 
H
A
 
V
S
 
A
V
 
V
Q
 
E
H
 
K
A
 
M
V
 
M
S
 
N
E
 
E
A
 
V
E
 
A
R
 
E
A
 
K
F
 
L
G
 
G
A
 
R
L
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
L
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
V
N
 
H
V
 
V
F
 
A
C
 
G
D
 
S
P
 
V
L
 
L
T
 
E
M
 
T
T
 
S
D
 
I
D
 
D
D
 
D
W
 
W
R
 
R
R
 
R
C
 
I
F
 
A
A
 
G
V
 
V
D
 
D
L
 
I
D
 
D
G
 
G
V
 
V
W
 
V
N
 
F
G
 
C
C
 
S
R
 
K
A
 
F
A
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
H
M
 
L
V
 
L
E
 
-
R
 
K
G
 
T
A
 
K
G
 
G
S
 
C
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
T
A
 
A
S
|
S
T
x
V
H
x
S
S
 
G
F
 
L
K
 
G
I
 
G
I
 
D
P
 
W
G
 
G
C
 
A
F
 
A
P
 
Y
Y
|
Y
P
 
C
V
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
G
G
 
A
V
 
V
I
 
V
G
 
N
L
 
L
T
 
T
R
 
R
A
 
A
L
 
M
G
 
A
I
 
L
E
 
D
Y
 
H
A
 
G
P
 
G
R
 
D
N
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
S
I
 
V
A
 
C
P
 
P
G
 
S
Y
 
L
I
x
V
E
 
K
T
|
T
Q
 
N
L
 
M
T
 
T
H
 
N
D
 
G
W
 
W
W
 
P
N
 
Q
E
 
E
Q
 
I
A
x
R
D
|
D
P
x
K
A
 
F
A
 
N
A
 
E
Q
 
R
Q
 
I
A
 
A
T
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
-
Q
 
-
P
 
-
M
 
L
K
 
G
R
 
R
I
 
A
G
 
A
R
 
E
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
M
 
A
T
 
V
A
 
M
V
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
D
A
 
A
P
 
S
F
 
F
I
 
I
N
 
N
A
 
G
T
 
A
C
 
N
I
 
I
T
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
A
S
 
T
A
 
A

Sites not aligning to the query:

6xewA Structure of serratia marcescens 2,3-butanediol dehydrogenase (see paper)
39% identity, 98% coverage: 3:254/258 of query aligns to 2:243/251 of 6xewA

query
sites
6xewA
R
 
R
L
 
F
A
 
D
G
 
N
K
 
K
V
 
V
A
 
V
L
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
G
R
x
N
G
|
G
I
x
M
G
 
G
S
 
E
A
 
A
I
 
A
A
 
A
H
 
R
A
 
R
F
 
F
A
 
S
R
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
I
V
 
V
V
 
V
L
 
L
A
 
A
E
x
D
L
x
W
D
x
A
I
 
K
E
 
E
T
 
A
A
 
V
R
 
D
Q
 
K
T
 
V
A
 
A
E
 
A
H
 
S
I
 
L
K
 
P
A
 
K
Q
 
-
T
 
-
G
 
-
A
 
G
R
 
R
V
 
A
L
 
M
A
 
A
V
 
V
H
 
H
T
x
I
D
|
D
V
|
V
T
 
S
Q
 
D
S
 
H
A
 
V
S
 
A
V
 
V
Q
 
E
H
 
K
A
 
M
V
 
M
S
 
N
E
 
E
A
 
V
E
 
A
R
 
E
A
 
K
F
 
L
G
 
G
A
 
R
L
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
L
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
V
N
 
H
V
 
V
F
 
A
C
 
G
D
 
S
P
 
V
L
 
L
T
 
E
M
 
T
T
 
S
D
 
I
D
 
D
D
 
D
W
 
W
R
 
R
R
 
R
C
 
I
F
 
A
A
 
G
V
|
V
D
 
D
L
 
I
D
 
D
G
 
G
V
 
V
W
 
V
N
 
F
G
 
C
C
 
S
R
 
K
A
 
F
A
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
H
M
 
L
V
 
L
E
 
-
R
 
K
G
 
T
A
 
K
G
 
G
S
 
C
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
T
A
 
A
S
|
S
T
 
V
H
x
S
S
 
G
F
 
L
K
 
G
I
 
G
I
 
D
P
 
W
G
 
G
C
 
A
F
 
A
P
 
Y
Y
|
Y
P
 
C
V
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
G
G
 
A
V
 
V
I
 
V
G
 
N
L
 
L
T
 
T
R
 
R
A
 
A
L
 
M
G
 
A
I
 
L
E
 
D
Y
 
H
A
 
G
P
 
G
R
 
D
N
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
S
I
 
V
A
 
C
P
 
P
G
x
S
Y
x
L
I
x
V
E
 
K
T
|
T
Q
x
N
L
x
M
T
|
T
H
 
N
D
 
G
W
 
W
W
 
P
N
 
Q
E
 
E
Q
 
I
A
 
R
D
 
D
P
 
K
A
 
F
A
 
N
A
 
E
Q
 
R
Q
 
I
A
 
A
T
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
-
Q
 
-
P
 
-
M
 
L
K
 
G
R
 
R
I
 
A
G
 
A
R
 
E
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
M
 
A
T
 
V
A
 
M
V
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
D
A
 
A
P
 
S
F
 
F
I
 
I
N
 
N
A
 
G
T
 
A
C
 
N
I
 
I
T
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
A
S
 
T
A
 
A

6vspB Structure of serratia marcescens 2,3-butanediol dehydrogenase mutant q247a (see paper)
39% identity, 98% coverage: 3:254/258 of query aligns to 4:245/252 of 6vspB

query
sites
6vspB
R
 
R
L
 
F
A
 
D
G
 
N
K
 
K
V
 
V
A
 
V
L
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
G
R
x
N
G
|
G
I
 
M
G
 
G
S
 
E
A
 
A
I
 
A
A
 
A
H
 
R
A
 
R
F
 
F
A
 
S
R
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
I
V
 
V
V
 
V
L
 
L
A
 
A
E
x
D
L
x
W
D
 
A
I
 
K
E
 
E
T
 
A
A
 
V
R
 
D
Q
 
K
T
 
V
A
 
A
E
 
A
H
 
S
I
 
L
K
 
P
A
 
K
Q
 
-
T
 
-
G
 
-
A
 
G
R
 
R
V
 
A
L
 
M
A
 
A
V
 
V
H
 
H
T
x
I
D
|
D
V
|
V
T
 
S
Q
 
D
S
 
H
A
 
V
S
 
A
V
 
V
Q
 
E
H
 
K
A
 
M
V
 
M
S
 
N
E
 
E
A
 
V
E
 
A
R
 
E
A
 
K
F
 
L
G
 
G
A
 
R
L
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
L
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
|
G
I
 
V
N
 
H
V
 
V
F
 
A
C
 
G
D
 
S
P
 
V
L
 
L
T
 
E
M
 
T
T
 
S
D
 
I
D
 
D
D
 
D
W
 
W
R
 
R
R
 
R
C
 
I
F
 
A
A
 
G
V
 
V
D
 
D
L
 
I
D
 
D
G
 
G
V
 
V
W
 
V
N
 
F
G
 
C
C
 
S
R
 
K
A
 
F
A
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
H
M
 
L
V
 
L
E
 
-
R
 
K
G
 
T
A
 
K
G
 
G
S
 
C
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
T
A
 
A
S
|
S
T
 
V
H
 
S
S
 
G
F
 
L
K
 
G
I
 
G
I
 
D
P
 
W
G
 
G
C
 
A
F
 
A
P
 
Y
Y
|
Y
P
 
C
V
 
A
A
 
A
K
 
K
H
 
G
G
 
A
V
 
V
I
 
V
G
 
N
L
 
L
T
 
T
R
 
R
A
 
A
L
 
M
G
 
A
I
 
L
E
 
D
Y
 
H
A
 
G
P
 
G
R
 
D
N
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
S
I
 
V
A
 
C
P
 
P
G
 
S
Y
 
L
I
 
V
E
 
K
T
 
T
Q
 
N
L
 
M
T
 
T
H
 
N
D
 
G
W
 
W
W
 
P
N
 
Q
E
 
E
Q
 
I
A
 
R
D
 
D
P
 
K
A
 
F
A
 
N
A
 
E
Q
 
R
Q
 
I
A
 
A
T
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
-
Q
 
-
P
 
-
M
 
L
K
 
G
R
 
R
I
 
A
G
 
A
R
 
E
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
M
 
A
T
 
V
A
 
M
V
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
D
A
 
A
P
 
S
F
 
F
I
 
I
N
 
N
A
 
G
T
 
A
C
 
N
I
 
I
T
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
A
S
 
T
A
 
A

6vspA Structure of serratia marcescens 2,3-butanediol dehydrogenase mutant q247a (see paper)
39% identity, 98% coverage: 3:254/258 of query aligns to 2:243/251 of 6vspA

query
sites
6vspA
R
 
R
L
 
F
A
 
D
G
 
N
K
 
K
V
 
V
A
 
V
L
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
G
R
x
N
G
|
G
I
x
M
G
 
G
S
 
E
A
 
A
I
 
A
A
 
A
H
 
R
A
 
R
F
 
F
A
 
S
R
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
I
V
 
V
V
 
V
L
 
L
A
 
A
E
x
D
L
x
W
D
x
A
I
 
K
E
 
E
T
 
A
A
 
V
R
 
D
Q
 
K
T
 
V
A
 
A
E
 
A
H
 
S
I
 
L
K
 
P
A
 
K
Q
 
-
T
 
-
G
 
-
A
 
G
R
 
R
V
 
A
L
 
M
A
 
A
V
 
V
H
 
H
T
x
I
D
|
D
V
|
V
T
 
S
Q
 
D
S
 
H
A
 
V
S
 
A
V
 
V
Q
 
E
H
 
K
A
 
M
V
 
M
S
 
N
E
 
E
A
 
V
E
 
A
R
 
E
A
 
K
F
 
L
G
 
G
A
 
R
L
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
L
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
x
V
N
 
H
V
 
V
F
 
A
C
 
G
D
 
S
P
 
V
L
 
L
T
 
E
M
 
T
T
 
S
D
 
I
D
 
D
D
 
D
W
 
W
R
 
R
R
 
R
C
 
I
F
 
A
A
 
G
V
|
V
D
 
D
L
 
I
D
 
D
G
 
G
V
 
V
W
 
V
N
 
F
G
 
C
C
 
S
R
 
K
A
 
F
A
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
H
M
 
L
V
 
L
E
 
-
R
 
K
G
 
T
A
 
K
G
 
G
S
 
C
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
T
A
 
A
S
|
S
T
 
V
H
 
S
S
 
G
F
 
L
K
 
G
I
 
G
I
 
D
P
 
W
G
 
G
C
 
A
F
 
A
P
 
Y
Y
|
Y
P
 
C
V
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
G
G
 
A
V
 
V
I
 
V
G
 
N
L
 
L
T
 
T
R
 
R
A
 
A
L
 
M
G
 
A
I
 
L
E
 
D
Y
 
H
A
 
G
P
 
G
R
 
D
N
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
S
I
 
V
A
 
C
P
|
P
G
x
S
Y
x
L
I
x
V
E
 
K
T
|
T
Q
x
N
L
x
M
T
|
T
H
 
N
D
 
G
W
 
W
W
 
P
N
 
Q
E
 
E
Q
 
I
A
 
R
D
 
D
P
 
K
A
 
F
A
 
N
A
 
E
Q
 
R
Q
 
I
A
 
A
T
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
-
Q
 
-
P
 
-
M
 
L
K
 
G
R
 
R
I
 
A
G
 
A
R
 
E
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
M
 
A
T
 
V
A
 
M
V
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
D
A
 
A
P
 
S
F
 
F
I
 
I
N
 
N
A
 
G
T
 
A
C
 
N
I
 
I
T
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
A
S
 
T
A
 
A

4fn4A Short-chain NAD(h)-dependent dehydrogenase/reductase from sulfolobus acidocaldarius (see paper)
37% identity, 98% coverage: 2:255/258 of query aligns to 3:254/254 of 4fn4A

query
sites
4fn4A
K
 
Q
R
 
S
L
 
L
A
 
K
G
 
N
K
 
K
V
 
V
A
 
V
L
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
G
R
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
S
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
H
 
K
A
 
K
F
 
F
A
 
A
R
 
L
E
 
N
G
 
D
A
 
S
A
 
I
V
 
V
V
 
V
L
 
A
A
 
V
E
|
E
L
|
L
D
 
L
I
 
E
E
 
D
T
x
R
A
 
L
R
 
N
Q
 
Q
T
 
I
A
 
V
E
 
Q
H
 
E
I
 
L
K
 
R
A
 
G
Q
 
M
T
 
-
G
 
G
A
 
K
R
 
E
V
 
V
L
 
L
A
 
G
V
 
V
H
 
K
T
x
A
D
|
D
V
|
V
T
 
S
Q
 
K
S
 
K
A
 
K
S
 
D
V
 
V
Q
 
E
H
 
E
A
 
F
V
 
V
S
 
R
E
 
R
A
 
T
E
 
F
R
 
E
A
 
T
F
 
Y
G
 
S
A
 
R
L
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
C
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
|
I
N
 
M
V
 
D
F
 
G
C
 
V
D
 
T
P
 
P
L
 
V
T
 
A
-
 
E
M
 
V
T
 
S
D
 
D
D
 
E
D
 
L
W
 
W
R
 
E
R
 
R
C
 
V
F
 
L
A
 
A
V
 
V
D
 
N
L
 
L
D
 
Y
G
 
S
V
 
A
W
 
F
N
 
Y
G
 
S
C
 
S
R
 
R
A
 
A
A
 
V
L
 
I
P
 
P
G
 
I
M
 
M
V
 
L
E
 
K
R
 
Q
G
 
G
A
 
K
G
 
G
S
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
T
A
 
A
S
|
S
T
 
I
H
 
A
S
 
G
F
 
I
K
 
R
I
 
-
I
 
-
P
 
-
G
 
G
C
 
G
F
 
F
-
 
A
-
 
G
-
 
A
P
 
P
Y
|
Y
P
 
T
V
 
V
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
V
 
L
I
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
R
A
 
S
L
 
I
G
 
A
I
 
A
E
 
H
Y
 
Y
A
 
G
P
 
D
R
 
Q
N
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
A
N
 
V
A
 
A
I
 
V
A
 
L
P
|
P
G
 
G
Y
 
T
I
x
V
E
 
K
T
|
T
Q
x
N
L
x
I
T
 
-
H
 
-
D
 
G
W
 
L
W
 
G
N
 
S
E
 
S
Q
 
K
A
 
P
D
x
S
P
 
E
A
 
L
A
 
G
A
 
M
Q
 
R
Q
 
T
A
 
L
T
 
T
L
 
K
D
 
L
L
 
M
Q
 
S
P
 
L
M
 
S
K
 
S
R
 
R
I
 
L
G
 
A
R
 
E
P
 
P
E
 
E
E
 
D
V
 
I
A
 
A
M
 
N
T
 
V
A
 
I
V
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
E
A
 
A
P
 
S
F
 
F
I
 
V
N
 
N
A
 
G
T
 
D
C
 
A
I
 
V
T
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
L
S
 
T
A
 
V
L
 
L

4wecA Crystal structure of a short chain dehydrogenase from mycobacterium smegmatis
38% identity, 99% coverage: 2:256/258 of query aligns to 6:254/258 of 4wecA

query
sites
4wecA
K
 
Q
R
 
R
L
 
L
A
 
A
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
G
x
A
R
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
S
 
L
A
 
A
I
 
T
A
 
G
H
 
R
A
 
R
F
 
L
A
 
R
R
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
T
V
 
V
V
 
V
L
 
V
A
 
G
E
x
D
L
x
I
D
 
D
I
 
P
E
 
T
T
 
T
A
 
G
R
 
K
Q
 
A
T
 
A
A
 
A
E
 
D
H
 
E
I
 
L
K
 
E
A
 
G
Q
 
-
T
 
-
G
 
-
A
 
-
R
 
-
V
 
-
L
 
L
A
 
F
V
 
V
H
 
P
T
x
V
D
|
D
V
|
V
T
 
S
Q
 
E
S
 
Q
A
 
E
S
 
A
V
 
V
Q
 
D
H
 
N
A
 
L
V
 
F
S
 
D
E
 
T
A
 
A
E
 
A
R
 
S
A
 
T
F
 
F
G
 
G
A
 
R
L
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
A
V
 
F
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
N
 
S
V
 
P
F
 
P
C
 
E
D
 
D
P
 
D
L
 
L
T
 
I
M
 
E
T
 
N
D
 
T
D
 
D
-
 
L
-
 
P
D
 
A
W
 
W
R
 
Q
R
 
R
C
 
V
F
 
Q
A
 
D
V
 
I
D
 
N
L
 
L
D
 
K
G
 
S
V
 
V
W
 
Y
N
 
L
G
 
S
C
 
C
R
 
R
A
 
A
A
 
A
L
 
L
P
 
R
G
 
H
M
 
M
V
 
V
E
 
P
R
 
A
G
 
G
A
 
K
G
 
G
S
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
-
A
 
-
S
 
-
T
|
T
H
 
A
S
|
S
F
 
F
K
 
V
I
 
A
I
 
V
P
 
M
G
 
G
C
 
S
-
 
A
-
 
T
-
 
S
-
x
Q
F
 
I
P
 
S
Y
|
Y
P
 
T
V
 
A
A
 
S
K
|
K
H
 
G
G
 
G
V
 
V
I
 
L
G
 
A
L
 
M
T
 
S
R
 
R
A
 
E
L
 
L
G
 
G
I
 
V
E
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
P
 
R
R
 
Q
N
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
L
A
 
C
P
|
P
G
 
G
Y
x
P
I
x
V
E
 
N
T
 
T
Q
 
P
L
 
L
T
 
L
H
 
Q
D
 
E
W
 
L
W
 
F
N
 
A
E
 
K
Q
 
-
A
 
-
D
 
D
P
 
P
A
 
E
A
 
R
A
 
A
Q
 
A
Q
 
R
A
 
R
T
 
L
L
 
V
D
 
H
L
 
I
Q
 
-
P
 
P
M
 
L
K
 
G
R
 
R
I
 
F
G
 
A
R
 
E
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
L
A
 
A
M
 
A
T
 
A
A
 
V
V
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
D
A
 
A
P
 
S
F
 
F
I
 
I
N
 
T
A
 
G
T
 
S
C
 
T
I
 
F
T
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
I
S
 
S
A
 
S
L
 
A
Y
 
Y

7pcsB Structure of the heterotetrameric sdr family member bbscd (see paper)
39% identity, 96% coverage: 7:253/258 of query aligns to 5:243/247 of 7pcsB

query
sites
7pcsB
K
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
S
G
 
A
R
 
S
G
 
G
I
x
M
G
 
G
S
 
K
A
 
Q
I
 
T
A
 
A
H
 
L
A
 
R
F
 
F
A
 
A
R
 
E
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
V
V
 
V
L
 
I
A
 
N
E
x
D
L
x
I
D
 
D
I
 
A
E
 
E
T
 
K
A
 
V
R
 
R
Q
 
A
T
 
T
A
 
V
E
 
D
H
 
E
I
 
F
K
 
S
A
 
A
Q
 
R
T
 
-
G
 
G
A
 
H
R
 
R
V
 
V
L
 
L
A
 
G
V
 
A
H
 
V
T
 
A
D
 
D
V
x
I
T
 
G
Q
 
N
S
 
K
A
 
A
S
 
A
V
 
V
Q
 
D
H
 
G
A
 
M
V
 
V
S
 
K
E
 
Q
A
 
T
E
 
I
R
 
D
A
 
A
F
 
F
G
 
G
A
 
R
L
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
M
N
 
E
V
 
R
F
 
A
C
 
G
D
 
A
P
 
L
L
 
R
T
 
K
M
 
L
T
 
S
D
 
E
D
 
A
D
 
D
W
 
W
R
 
D
R
 
V
C
 
T
F
 
I
A
 
N
V
 
V
D
 
N
L
 
L
D
 
K
G
 
G
V
 
T
W
 
F
N
 
L
G
 
C
C
 
T
R
 
Q
A
 
A
A
 
V
L
 
H
P
 
G
G
 
H
M
 
M
V
 
V
E
 
E
R
 
N
G
 
K
A
 
H
G
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
|
I
A
 
A
S
|
S
T
 
-
H
 
R
S
 
A
F
 
W
K
 
L
I
 
G
I
 
G
P
 
A
G
 
G
C
 
Q
F
 
T
P
 
P
Y
|
Y
P
 
S
V
 
S
A
 
A
K
|
K
H
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
M
T
 
T
R
 
R
A
 
A
L
 
L
G
 
A
I
 
I
E
 
E
Y
 
L
A
 
G
P
 
R
R
 
A
N
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
C
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
L
I
|
I
E
 
H
T
 
T
Q
 
P
L
 
M
T
 
-
H
 
-
D
 
-
W
 
-
W
 
W
N
 
D
E
 
E
Q
 
L
A
 
-
D
 
-
P
 
P
A
 
E
A
 
K
A
 
D
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
F
T
 
L
L
 
L
D
 
S
L
 
R
Q
 
Q
P
 
P
M
 
T
K
 
G
R
 
K
I
 
L
G
 
G
R
 
E
P
 
P
E
 
D
E
 
D
V
 
I
A
 
A
M
 
N
T
 
T
A
 
L
V
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
D
D
 
D
E
 
D
A
 
S
P
 
G
F
 
F
I
 
V
N
 
T
A
 
G
T
 
Q
C
 
V
I
 
L
T
 
Y
V
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G
R
 
R
S
 
S

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
37% identity, 97% coverage: 1:251/258 of query aligns to 2:241/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
M
 
M
K
 
S
R
 
R
L
 
L
A
 
Q
G
 
D
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
A
R
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
S
 
L
A
 
E
I
 
A
A
 
A
H
 
R
A
 
V
F
 
F
A
 
M
R
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
K
V
 
V
V
 
V
L
 
I
A
 
A
E
x
D
L
x
F
D
 
N
I
 
E
E
 
A
T
 
A
A
 
G
R
 
K
Q
 
-
T
 
-
A
 
-
E
 
E
H
 
A
I
 
V
K
 
E
A
 
A
Q
 
N
T
 
P
G
 
G
A
 
-
R
 
-
V
 
V
L
 
V
A
 
F
V
 
I
H
 
R
T
x
V
D
|
D
V
|
V
T
 
S
Q
 
D
S
 
R
A
 
E
S
 
S
V
 
V
Q
 
H
H
 
R
A
 
L
V
 
V
S
 
E
E
 
N
A
 
V
E
 
A
R
 
E
A
 
R
F
 
F
G
 
G
A
 
K
L
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
N
 
T
V
 
R
F
x
D
C
 
S
D
 
M
P
 
L
L
 
S
T
x
K
M
 
M
T
 
T
D
 
V
D
 
D
D
 
Q
W
 
F
R
 
Q
R
 
Q
C
 
V
F
 
I
A
 
N
V
 
V
D
x
N
L
 
L
D
 
T
G
 
G
V
 
V
W
 
F
N
 
H
G
 
C
C
 
T
R
 
Q
A
 
A
A
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
Y
M
 
M
V
 
A
E
 
E
R
 
Q
G
 
G
A
 
K
G
 
G
S
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
T
A
 
S
S
|
S
T
 
V
H
 
T
S
 
G
F
 
T
K
 
Y
I
 
G
I
x
N
P
x
V
G
 
G
C
x
Q
F
 
T
P
 
N
Y
|
Y
P
 
A
V
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
M
T
 
T
R
 
K
A
 
T
L
 
W
G
 
A
I
 
K
E
 
E
Y
 
L
A
 
A
P
 
R
R
 
K
N
 
G
V
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
Y
x
F
I
x
T
E
 
E
T
|
T
Q
 
A
L
x
M
T
 
V
H
 
A
D
 
E
W
 
V
W
 
P
N
 
E
E
 
K
Q
 
V
A
 
I
D
 
E
P
x
K
A
 
M
A
 
K
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
-
A
 
-
T
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
-
Q
 
V
P
 
P
M
 
M
K
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
G
R
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
D
V
 
I
A
 
A
M
 
N
T
 
A
A
 
Y
V
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
H
E
 
E
A
 
S
P
 
D
F
 
Y
I
 
V
N
 
N
A
 
G
T
 
H
C
 
V
I
 
L
T
 
H
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Q9KJF1 (2S)-[(R)-hydroxy(phenyl)methyl]succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; (S,R)-2-(alpha-hydroxybenzyl)succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; EC 1.1.1.429 from Thauera aromatica (see 2 papers)
39% identity, 96% coverage: 7:253/258 of query aligns to 6:244/248 of Q9KJF1

query
sites
Q9KJF1
K
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
S
G
 
A
R
x
S
G
 
G
I
 
M
G
 
G
S
 
K
A
 
Q
I
 
T
A
 
A
H
 
L
A
 
R
F
 
F
A
 
A
R
 
E
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
V
V
 
V
L
 
I
A
 
N
E
x
D
L
 
I
D
 
D
I
 
A
E
 
E
T
 
K
A
 
V
R
 
R
Q
 
A
T
 
T
A
 
V
E
 
D
H
 
E
I
 
F
K
 
S
A
 
A
Q
 
R
T
 
-
G
 
G
A
 
H
R
 
R
V
 
V
L
 
L
A
 
G
V
 
A
H
 
V
T
 
A
D
|
D
V
x
I
T
 
G
Q
 
N
S
 
K
A
 
A
S
 
A
V
 
V
Q
 
D
H
 
G
A
 
M
V
 
V
S
 
K
E
 
Q
A
 
T
E
 
I
R
 
D
A
 
A
F
 
F
G
 
G
A
 
R
L
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
M
N
 
E
V
 
R
F
 
A
C
 
G
D
 
A
P
 
L
L
 
R
T
 
K
M
 
L
T
 
S
D
 
E
D
 
A
D
 
D
W
 
W
R
 
D
R
 
V
C
 
T
F
 
I
A
 
N
V
 
V
D
 
N
L
 
L
D
 
K
G
 
G
V
 
T
W
 
F
N
 
L
G
 
C
C
 
T
R
 
Q
A
 
A
A
 
V
L
 
H
P
 
G
G
 
H
M
 
M
V
 
V
E
 
E
R
 
N
G
 
K
A
 
H
G
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
I
A
 
A
S
 
S
T
 
-
H
 
R
S
 
A
F
 
W
K
 
L
I
 
G
I
 
G
P
 
A
G
 
G
C
 
Q
F
 
T
P
 
P
Y
|
Y
P
 
S
V
 
S
A
 
A
K
|
K
H
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
M
T
 
T
R
 
R
A
 
A
L
 
L
G
 
A
I
 
I
E
 
E
Y
 
L
A
 
G
P
 
R
R
 
A
N
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
C
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
L
I
 
I
E
 
H
T
 
T
Q
 
P
L
 
M
T
 
-
H
 
-
D
 
-
W
 
-
W
 
W
N
 
D
E
 
E
Q
 
L
A
 
-
D
 
-
P
 
P
A
 
E
A
 
K
A
 
D
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
F
T
 
L
L
 
L
D
 
S
L
 
R
Q
 
Q
P
 
P
M
 
T
K
 
G
R
 
K
I
 
L
G
 
G
R
 
E
P
 
P
E
 
D
E
 
D
V
 
I
A
 
A
M
 
N
T
 
T
A
 
L
V
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
D
D
 
D
E
 
D
A
 
S
P
 
G
F
 
F
I
 
V
N
 
T
A
 
G
T
 
Q
C
 
V
I
 
L
T
 
Y
V
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G
R
 
R
S
 
S

Sites not aligning to the query:

7v0hG Crystal structure of putative glucose 1-dehydrogenase from burkholderia cenocepacia in complex with NADP and a potential reaction product
39% identity, 97% coverage: 1:251/258 of query aligns to 6:251/253 of 7v0hG

query
sites
7v0hG
M
 
M
K
 
S
R
 
K
L
 
L
A
 
A
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
x
S
R
x
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
S
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
A
H
 
K
A
 
A
F
 
L
A
 
A
R
 
D
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
V
V
 
V
L
 
V
A
 
N
E
 
Y
L
x
A
D
x
S
I
x
S
E
 
K
T
 
A
A
 
G
R
 
A
Q
 
D
T
 
A
A
 
V
E
 
V
H
 
S
I
 
A
K
 
I
A
 
T
Q
 
E
T
 
A
G
 
G
A
 
G
R
 
R
V
 
A
L
 
V
A
 
A
V
 
V
H
 
G
T
x
G
D
|
D
V
|
V
T
 
S
Q
 
K
S
 
A
A
 
A
S
 
D
V
 
A
Q
 
Q
H
 
R
A
 
I
V
 
V
S
 
D
E
 
T
A
 
A
E
 
I
R
 
E
A
 
T
F
 
Y
G
 
G
A
 
R
L
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
x
S
G
|
G
I
 
V
N
x
Y
V
 
E
F
 
F
C
 
A
D
 
P
P
 
I
L
 
E
T
 
A
M
 
I
T
 
T
D
 
E
D
 
E
D
 
H
W
 
Y
R
 
R
R
 
R
C
 
Q
F
 
F
A
 
D
V
 
T
D
 
N
L
 
V
D
 
F
G
 
G
V
 
V
W
 
L
N
 
L
G
 
T
C
 
T
R
 
Q
A
 
A
A
 
A
L
 
V
P
 
K
G
 
H
M
 
L
V
 
G
E
 
E
R
 
-
G
 
-
A
 
G
G
 
A
S
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
|
I
A
 
S
S
|
S
T
 
V
H
 
V
S
 
T
F
 
S
K
 
I
I
 
T
I
 
P
P
 
P
G
 
A
C
 
S
F
 
A
P
 
V
Y
|
Y
P
 
S
V
 
G
A
 
T
K
|
K
H
 
G
G
 
A
V
 
V
I
 
D
G
 
A
L
 
I
T
 
T
R
 
G
A
 
V
L
 
L
G
 
A
I
 
L
E
 
E
Y
 
L
A
 
G
P
 
P
R
 
R
N
 
K
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
N
P
|
P
G
|
G
Y
x
M
I
|
I
E
 
V
T
|
T
Q
 
E
L
x
G
T
|
T
H
 
H
D
 
S
W
 
A
W
 
G
N
x
I
E
 
I
Q
 
G
A
 
S
D
 
D
P
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
L
Q
 
E
Q
 
A
A
 
Q
T
 
V
L
 
L
D
 
G
L
 
Q
Q
 
T
P
 
P
M
 
L
K
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
G
R
 
E
P
 
P
E
 
N
E
 
D
V
 
I
A
 
A
M
 
S
T
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
D
A
 
A
P
 
R
F
 
W
I
 
M
N
 
T
A
 
G
T
 
E
C
 
H
I
 
L
T
 
V
V
 
V
D
 
S
G
 
G
G
 
G

Q9LBG2 Levodione reductase; (6R)-2,2,6-trimethyl-1,4-cyclohexanedione reductase; EC 1.1.1.- from Leifsonia aquatica (Corynebacterium aquaticum) (see paper)
36% identity, 98% coverage: 3:256/258 of query aligns to 10:267/267 of Q9LBG2

query
sites
Q9LBG2
R
 
R
L
 
F
A
 
T
G
 
D
K
 
R
V
 
V
A
 
V
L
|
L
V
x
I
T
|
T
G
|
G
A
x
G
G
|
G
R
x
S
G
|
G
I
x
L
G
|
G
S
x
R
A
|
A
I
x
T
A
|
A
H
x
V
A
x
R
F
x
L
A
|
A
R
x
A
E
|
E
G
|
G
A
|
A
A
x
K
V
x
L
V
x
S
L
|
L
A
 
V
E
 
D
L
 
V
D
 
S
I
 
S
E
 
E
T
 
G
A
 
L
R
 
E
Q
 
A
T
 
S
-
 
K
A
 
A
E
 
A
H
 
V
I
 
L
K
 
E
A
 
T
Q
 
A
T
 
P
G
 
D
A
 
A
R
 
E
V
 
V
L
 
L
A
 
T
V
 
T
H
 
V
T
 
A
D
 
D
V
 
V
T
 
S
Q
 
D
S
 
E
A
 
A
S
 
Q
V
 
V
Q
 
E
H
 
A
A
 
Y
V
 
V
S
 
T
E
 
A
A
 
T
E
 
T
R
 
E
A
 
R
F
 
F
G
 
G
A
 
R
L
 
I
D
 
D
V
 
G
L
 
F
V
 
F
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
N
x
E
V
 
G
F
 
K
C
 
Q
D
 
N
P
 
P
L
 
T
-
 
E
T
 
S
M
 
F
T
 
T
D
 
A
D
 
A
D
 
E
W
 
F
R
 
D
R
 
K
C
 
V
F
 
V
A
 
S
V
 
I
D
 
N
L
 
L
D
 
R
G
 
G
V
 
V
W
 
F
N
 
L
G
 
G
C
 
L
R
 
E
A
 
K
A
 
V
L
 
L
P
 
K
G
 
I
M
 
M
V
 
R
E
 
E
R
 
Q
G
 
G
A
 
S
G
 
G
S
 
M
I
 
V
V
 
V
N
 
N
I
 
T
A
 
A
S
 
S
T
 
V
H
 
G
S
 
G
F
 
I
K
 
R
I
 
G
I
 
I
P
 
G
G
 
N
C
 
Q
F
 
S
P
 
G
Y
 
Y
P
 
A
V
 
A
A
 
A
K
 
K
H
 
H
G
 
G
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
R
A
 
N
L
 
S
G
 
A
I
 
V
E
 
E
Y
 
Y
A
 
G
P
 
R
R
 
Y
N
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
A
I
 
I
E
 
W
T
 
T
Q
 
P
L
 
M
T
 
V
H
 
E
D
 
N
W
 
S
W
 
M
N
 
-
E
 
K
Q
 
Q
A
 
L
D
 
D
P