SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing BPHYT_RS18270 FitnessBrowser__BFirm:BPHYT_RS18270 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3ozwA The crystal structure of flavohemoglobin from r. Eutrophus in complex with ketoconazole (see paper)
30% identity, 67% coverage: 11:254/362 of query aligns to 159:400/403 of 3ozwA

query
sites
3ozwA
I
 
I
R
 
R
E
 
E
V
 
K
R
 
R
P
 
P
E
 
E
T
 
S
A
 
D
D
 
V
S
 
I
V
 
T
S
 
S
V
 
F
A
 
I
F
 
L
E
 
E
V
 
-
P
 
P
A
 
A
E
 
D
L
 
G
R
 
G
D
 
P
H
 
V
Y
 
V
R
 
N
F
 
F
T
 
E
Q
 
P
G
 
G
Q
 
Q
F
 
Y
V
 
T
T
 
S
L
 
V
K
 
A
T
 
I
H
 
D
I
 
V
D
 
P
-
 
A
-
 
L
G
 
G
E
 
L
E
 
Q
T
 
Q
R
 
I
R
|
R
S
x
Q
Y
|
Y
S
|
S
I
 
L
C
 
-
V
 
-
G
 
-
V
 
-
T
 
S
D
 
D
Y
 
M
D
 
P
R
 
N
D
 
G
G
 
R
E
 
S
L
 
Y
R
 
R
I
 
I
G
x
S
I
x
V
K
|
K
R
 
R
V
x
E
R
 
G
G
 
G
G
 
G
-
 
P
-
 
Q
-
x
P
-
 
P
-
x
G
R
x
Y
F
x
V
S
|
S
N
 
N
F
 
L
A
 
L
F
 
H
D
 
D
T
 
H
L
 
V
Q
 
N
P
 
V
G
 
G
H
 
D
T
 
Q
I
 
V
D
 
K
V
 
L
M
 
A
T
 
A
P
 
P
D
 
Y
G
 
G
R
 
S
F
 
F
F
 
-
T
 
-
H
 
H
L
 
I
N
 
D
A
 
V
D
 
D
Q
 
A
G
 
K
Q
 
T
Q
 
P
Y
 
I
L
 
V
A
 
L
F
 
I
S
 
S
G
 
G
G
 
G
S
x
V
G
 
G
I
 
L
T
|
T
P
 
P
V
 
M
L
 
V
A
 
S
I
 
M
I
 
L
K
 
K
T
 
V
T
 
A
L
 
L
E
 
Q
V
 
A
E
 
P
P
 
P
R
 
R
S
 
Q
T
 
V
F
 
-
T
 
V
L
 
F
V
 
V
Y
 
H
G
 
G
N
 
A
R
 
R
S
 
N
V
 
S
D
 
A
Q
 
V
I
 
H
M
 
A
F
 
M
A
 
R
E
 
D
E
 
R
L
 
L
E
 
R
D
 
E
L
 
A
K
 
A
N
 
K
R
 
T
F
 
Y
M
 
E
N
 
N
R
 
L
-
 
D
-
 
L
F
 
F
V
 
V
L
 
F
Y
 
Y
-
 
D
H
 
Q
V
 
P
L
 
L
S
 
P
D
 
E
D
 
D
L
 
V
Q
 
Q
D
 
G
V
 
R
E
 
D
L
 
Y
-
 
D
F
 
Y
N
 
P
G
 
G
V
 
L
L
 
V
D
 
D
Q
 
V
D
 
K
K
 
Q
C
 
I
A
 
E
A
 
K
F
 
S
I
 
I
E
 
-
N
 
-
L
 
L
L
 
L
P
 
P
A
 
-
D
 
D
A
 
A
I
 
-
D
 
-
E
 
D
A
 
Y
F
 
Y
I
 
I
C
 
C
G
 
G
P
 
P
A
 
I
P
 
P
M
 
F
M
 
M
D
 
R
A
 
M
A
 
Q
E
 
H
A
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
N
A
 
L
G
 
G
V
 
I
P
 
H
S
 
E
E
 
A
K
 
R
V
 
I
H
 
H
V
 
Y
E
 
E
R
x
V
F
|
F
G
 
G
S
x
P
P
 
D
L
 
L

Sites not aligning to the query:

3ozvA The crystal structure of flavohemoglobin from r. Eutrophus in complex with econazole (see paper)
30% identity, 67% coverage: 11:254/362 of query aligns to 159:400/403 of 3ozvA

query
sites
3ozvA
I
 
I
R
 
R
E
 
E
V
 
K
R
 
R
P
 
P
E
 
E
T
 
S
A
 
D
D
 
V
S
 
I
V
 
T
S
 
S
V
 
F
A
 
I
F
 
L
E
 
E
V
 
-
P
 
P
A
 
A
E
 
D
L
 
G
R
 
G
D
 
P
H
 
V
Y
 
V
R
 
N
F
 
F
T
 
E
Q
 
P
G
 
G
Q
 
Q
F
 
Y
V
 
T
T
 
S
L
 
V
K
 
A
T
 
I
H
 
D
I
 
V
D
 
P
-
 
A
-
 
L
G
 
G
E
 
L
E
 
Q
T
 
Q
R
 
I
R
|
R
S
x
Q
Y
|
Y
S
|
S
I
 
L
C
 
-
V
 
-
G
 
-
V
 
-
T
 
S
D
 
D
Y
 
M
D
 
P
R
 
N
D
 
G
G
 
R
E
 
S
L
 
Y
R
 
R
I
 
I
G
x
S
I
x
V
K
|
K
R
 
R
V
x
E
R
 
G
G
 
G
G
 
G
-
 
P
-
 
Q
-
x
P
-
 
P
-
x
G
R
x
Y
F
x
V
S
|
S
N
 
N
F
 
L
A
 
L
F
 
H
D
 
D
T
 
H
L
 
V
Q
 
N
P
 
V
G
 
G
H
 
D
T
 
Q
I
 
V
D
 
K
V
 
L
M
 
A
T
 
A
P
 
P
D
 
Y
G
 
G
R
 
S
F
 
F
F
 
-
T
 
-
H
 
H
L
 
I
N
 
D
A
 
V
D
 
D
Q
 
A
G
 
K
Q
 
T
Q
 
P
Y
 
I
L
 
V
A
 
L
F
 
I
S
 
S
G
 
G
G
 
G
S
x
V
G
 
G
I
 
L
T
|
T
P
 
P
V
 
M
L
 
V
A
 
S
I
 
M
I
 
L
K
 
K
T
 
V
T
 
A
L
 
L
E
 
Q
V
 
A
E
 
P
P
 
P
R
 
R
S
 
Q
T
 
V
F
 
-
T
 
V
L
 
F
V
 
V
Y
 
H
G
 
G
N
 
A
R
 
R
S
 
N
V
 
S
D
 
A
Q
 
V
I
 
H
M
 
A
F
 
M
A
 
R
E
 
D
E
 
R
L
 
L
E
 
R
D
 
E
L
 
A
K
 
A
N
 
K
R
 
T
F
 
Y
M
 
E
N
 
N
R
 
L
-
 
D
-
 
L
F
 
F
V
 
V
L
 
F
Y
 
Y
-
 
D
H
 
Q
V
 
P
L
 
L
S
 
P
D
 
E
D
 
D
L
 
V
Q
 
Q
D
 
G
V
 
R
E
 
D
L
 
Y
-
 
D
F
 
Y
N
 
P
G
 
G
V
 
L
L
 
V
D
 
D
Q
 
V
D
 
K
K
 
Q
C
 
I
A
 
E
A
 
K
F
 
S
I
 
I
E
 
-
N
 
-
L
 
L
L
 
L
P
 
P
A
 
-
D
 
D
A
 
A
I
 
-
D
 
-
E
 
D
A
 
Y
F
 
Y
I
 
I
C
 
C
G
 
G
P
 
P
A
 
I
P
 
P
M
 
F
M
 
M
D
 
R
A
 
M
A
 
Q
E
 
H
A
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
N
A
 
L
G
 
G
V
 
I
P
 
H
S
 
E
E
 
A
K
 
R
V
 
I
H
 
H
V
 
Y
E
 
E
R
 
V
F
|
F
G
 
G
S
 
P
P
 
D
L
 
L

Sites not aligning to the query:

3ozuA The crystal structure of flavohemoglobin from r. Eutrophus in complex with miconazole (see paper)
30% identity, 67% coverage: 11:254/362 of query aligns to 159:400/403 of 3ozuA

query
sites
3ozuA
I
 
I
R
 
R
E
 
E
V
 
K
R
 
R
P
 
P
E
 
E
T
 
S
A
 
D
D
 
V
S
 
I
V
 
T
S
 
S
V
 
F
A
 
I
F
 
L
E
 
E
V
 
-
P
 
P
A
 
A
E
 
D
L
 
G
R
 
G
D
 
P
H
 
V
Y
 
V
R
 
N
F
 
F
T
 
E
Q
 
P
G
 
G
Q
 
Q
F
 
Y
V
 
T
T
 
S
L
 
V
K
 
A
T
 
I
H
 
D
I
 
V
D
 
P
-
 
A
-
 
L
G
 
G
E
 
L
E
 
Q
T
 
Q
R
 
I
R
|
R
S
x
Q
Y
|
Y
S
|
S
I
 
L
C
 
-
V
 
-
G
 
-
V
 
-
T
 
S
D
 
D
Y
 
M
D
 
P
R
 
N
D
 
G
G
 
R
E
 
S
L
 
Y
R
 
R
I
 
I
G
x
S
I
x
V
K
|
K
R
 
R
V
x
E
R
 
G
G
 
G
G
 
G
-
 
P
-
 
Q
-
x
P
-
 
P
-
x
G
R
x
Y
F
x
V
S
|
S
N
 
N
F
 
L
A
 
L
F
 
H
D
 
D
T
 
H
L
 
V
Q
 
N
P
 
V
G
 
G
H
 
D
T
 
Q
I
 
V
D
 
K
V
 
L
M
 
A
T
 
A
P
 
P
D
 
Y
G
 
G
R
 
S
F
 
F
F
 
-
T
 
-
H
 
H
L
 
I
N
 
D
A
 
V
D
 
D
Q
 
A
G
 
K
Q
 
T
Q
 
P
Y
 
I
L
 
V
A
 
L
F
 
I
S
 
S
G
 
G
G
 
G
S
 
V
G
 
G
I
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
M
L
 
V
A
 
S
I
 
M
I
 
L
K
 
K
T
 
V
T
 
A
L
 
L
E
 
Q
V
 
A
E
 
P
P
 
P
R
 
R
S
 
Q
T
 
V
F
 
-
T
 
V
L
 
F
V
 
V
Y
 
H
G
 
G
N
 
A
R
 
R
S
 
N
V
 
S
D
 
A
Q
 
V
I
 
H
M
 
A
F
 
M
A
 
R
E
 
D
E
 
R
L
 
L
E
 
R
D
 
E
L
 
A
K
 
A
N
 
K
R
 
T
F
 
Y
M
 
E
N
 
N
R
 
L
-
 
D
-
 
L
F
 
F
V
 
V
L
 
F
Y
 
Y
-
 
D
H
 
Q
V
 
P
L
 
L
S
 
P
D
 
E
D
 
D
L
 
V
Q
 
Q
D
 
G
V
 
R
E
 
D
L
 
Y
-
 
D
F
 
Y
N
 
P
G
 
G
V
 
L
L
 
V
D
 
D
Q
 
V
D
 
K
K
 
Q
C
 
I
A
 
E
A
 
K
F
 
S
I
 
I
E
 
-
N
 
-
L
 
L
L
 
L
P
 
P
A
 
-
D
 
D
A
 
A
I
 
-
D
 
-
E
 
D
A
 
Y
F
 
Y
I
 
I
C
 
C
G
 
G
P
 
P
A
 
I
P
 
P
M
 
F
M
 
M
D
 
R
A
 
M
A
 
Q
E
 
H
A
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
N
A
 
L
G
 
G
V
 
I
P
 
H
S
 
E
E
 
A
K
 
R
V
 
I
H
 
H
V
 
Y
E
|
E
R
x
V
F
 
F
G
|
G
S
x
P
P
 
D
L
 
L

Sites not aligning to the query:

P39662 Flavohemoprotein; FHP; Flavohemoglobin; Hemoglobin-like protein; Nitric oxide dioxygenase; NO oxygenase; NOD; EC 1.14.12.17 from Cupriavidus necator (strain ATCC 17699 / DSM 428 / KCTC 22496 / NCIMB 10442 / H16 / Stanier 337) (Ralstonia eutropha) (see paper)
30% identity, 67% coverage: 11:254/362 of query aligns to 159:400/403 of P39662

query
sites
P39662
I
 
I
R
 
R
E
 
E
V
 
K
R
 
R
P
 
P
E
 
E
T
 
S
A
 
D
D
 
V
S
 
I
V
 
T
S
 
S
V
 
F
A
 
I
F
 
L
E
 
E
V
 
-
P
 
P
A
 
A
E
 
D
L
 
G
R
 
G
D
 
P
H
 
V
Y
 
V
R
 
N
F
 
F
T
 
E
Q
 
P
G
 
G
Q
 
Q
F
 
Y
V
 
T
T
 
S
L
 
V
K
 
A
T
 
I
H
 
D
I
 
V
D
 
P
-
 
A
-
 
L
G
 
G
E
 
L
E
 
Q
T
 
Q
R
 
I
R
 
R
S
 
Q
Y
 
Y
S
 
S
I
 
L
C
 
-
V
 
-
G
 
-
V
 
-
T
 
S
D
 
D
Y
 
M
D
 
P
R
 
N
D
 
G
G
 
R
E
 
S
L
 
Y
R
 
R
I
 
I
G
 
S
I
 
V
K
 
K
R
 
R
V
 
E
R
 
G
G
 
G
G
 
G
-
 
P
-
 
Q
-
 
P
-
 
P
-
 
G
R
 
Y
F
 
V
S
 
S
N
 
N
F
 
L
A
 
L
F
 
H
D
 
D
T
 
H
L
 
V
Q
 
N
P
 
V
G
 
G
H
 
D
T
 
Q
I
 
V
D
 
K
V
 
L
M
 
A
T
 
A
P
 
P
D
 
Y
G
 
G
R
 
S
F
 
F
F
 
-
T
 
-
H
 
H
L
 
I
N
 
D
A
 
V
D
 
D
Q
 
A
G
 
K
Q
 
T
Q
 
P
Y
 
I
L
 
V
A
 
L
F
 
I
S
 
S
G
 
G
G
 
G
S
 
V
G
 
G
I
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
M
L
 
V
A
 
S
I
 
M
I
 
L
K
 
K
T
 
V
T
 
A
L
 
L
E
 
Q
V
 
A
E
 
P
P
 
P
R
 
R
S
 
Q
T
 
V
F
 
-
T
 
V
L
 
F
V
 
V
Y
 
H
G
 
G
N
 
A
R
 
R
S
 
N
V
 
S
D
 
A
Q
 
V
I
 
H
M
 
A
F
 
M
A
 
R
E
 
D
E
 
R
L
 
L
E
 
R
D
 
E
L
 
A
K
 
A
N
 
K
R
 
T
F
 
Y
M
 
E
N
 
N
R
 
L
-
 
D
-
 
L
F
 
F
V
 
V
L
 
F
Y
 
Y
-
 
D
H
 
Q
V
 
P
L
 
L
S
 
P
D
 
E
D
 
D
L
 
V
Q
 
Q
D
 
G
V
 
R
E
 
D
L
 
Y
-
 
D
F
 
Y
N
 
P
G
 
G
V
 
L
L
 
V
D
 
D
Q
 
V
D
 
K
K
 
Q
C
 
I
A
 
E
A
 
K
F
 
S
I
 
I
E
 
-
N
 
-
L
 
L
L
 
L
P
 
P
A
 
-
D
 
D
A
 
A
I
 
-
D
 
-
E
 
D
A
 
Y
F
 
Y
I
 
I
C
 
C
G
 
G
P
 
P
A
 
I
P
 
P
M
 
F
M
 
M
D
 
R
A
 
M
A
 
Q
E
 
H
A
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
N
A
 
L
G
 
G
V
 
I
P
 
H
S
 
E
E
 
A
K
 
R
V
 
I
H
 
H
V
 
Y
E
 
E
R
 
V
F
 
F
G
 
G
S
 
P
P
 
D
L
 
L

Sites not aligning to the query:

1cqxA Crystal structure of the flavohemoglobin from alcaligenes eutrophus at 1.75 a resolution (see paper)
30% identity, 67% coverage: 11:254/362 of query aligns to 159:400/403 of 1cqxA

query
sites
1cqxA
I
 
I
R
 
R
E
 
E
V
 
K
R
 
R
P
 
P
E
 
E
T
 
S
A
 
D
D
 
V
S
 
I
V
 
T
S
 
S
V
 
F
A
 
I
F
 
L
E
 
E
V
 
-
P
 
P
A
 
A
E
 
D
L
 
G
R
 
G
D
 
P
H
 
V
Y
 
V
R
 
N
F
 
F
T
 
E
Q
 
P
G
 
G
Q
 
Q
F
x
Y
V
 
T
T
 
S
L
 
V
K
 
A
T
 
I
H
 
D
I
 
V
D
 
P
-
 
A
-
 
L
G
 
G
E
 
L
E
 
Q
T
 
Q
R
 
I
R
|
R
S
x
Q
Y
|
Y
S
|
S
I
 
L
C
 
-
V
 
-
G
 
-
V
 
-
T
 
S
D
 
D
Y
 
M
D
 
P
R
 
N
D
 
G
G
 
R
E
 
T
L
 
Y
R
 
R
I
 
I
G
x
S
I
 
V
K
 
K
R
 
R
V
x
E
R
 
G
G
 
G
G
 
G
-
 
P
-
x
Q
-
x
P
-
 
P
-
x
G
R
x
Y
F
x
V
S
|
S
N
 
N
F
 
L
A
 
L
F
 
H
D
 
D
T
 
H
L
 
V
Q
 
N
P
 
V
G
 
G
H
 
D
T
 
Q
I
 
V
D
 
K
V
 
L
M
 
A
T
 
A
P
 
P
D
 
Y
G
 
G
R
 
S
F
 
F
F
 
-
T
 
-
H
 
H
L
 
I
N
 
D
A
 
V
D
 
D
Q
 
A
G
 
K
Q
 
T
Q
 
P
Y
 
I
L
 
V
A
 
L
F
 
I
S
 
S
G
 
G
G
 
G
S
 
V
G
 
G
I
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
M
L
 
V
A
 
S
I
 
M
I
 
L
K
 
K
T
 
V
T
 
A
L
 
L
E
 
Q
V
 
A
E
 
P
P
 
P
R
 
R
S
 
Q
T
 
V
F
 
-
T
 
V
L
 
F
V
 
V
Y
 
H
G
 
G
N
 
A
R
 
R
S
 
N
V
 
S
D
 
A
Q
 
V
I
 
H
M
 
A
F
 
M
A
 
R
E
 
D
E
 
R
L
 
L
E
 
R
D
 
E
L
 
A
K
 
A
N
 
K
R
 
T
F
 
Y
M
 
E
N
 
N
R
 
L
-
 
D
-
 
L
F
 
F
V
 
V
L
 
F
Y
 
Y
-
 
D
H
 
Q
V
 
P
L
 
L
S
 
P
D
 
E
D
 
D
L
 
V
Q
 
Q
D
 
G
V
 
R
E
 
D
L
 
Y
-
 
D
F
 
Y
N
 
P
G
 
G
V
 
L
L
 
V
D
 
D
Q
 
V
D
 
K
K
 
Q
C
 
I
A
 
E
A
 
K
F
 
S
I
 
I
E
 
-
N
 
-
L
 
L
L
 
L
P
 
P
A
 
-
D
 
D
A
 
A
I
 
-
D
 
-
E
 
D
A
 
Y
F
 
Y
I
 
I
C
 
C
G
 
G
P
 
P
A
 
I
P
 
P
M
 
F
M
 
M
D
 
R
A
 
M
A
 
Q
E
 
H
A
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
N
A
 
L
G
 
G
V
 
I
P
 
H
S
 
E
E
 
A
K
 
R
V
 
I
H
 
H
V
 
Y
E
 
E
R
x
V
F
 
F
G
|
G
S
x
P
P
 
D
L
 
L

Sites not aligning to the query:

5ogxA Crystal structure of amycolatopsis cytochrome p450 reductase gcob. (see paper)
29% identity, 67% coverage: 7:250/362 of query aligns to 95:329/333 of 5ogxA

query
sites
5ogxA
H
 
H
P
 
P
L
 
L
R
 
R
-
 
D
I
 
L
R
 
T
E
 
A
V
 
T
R
 
V
P
 
L
E
 
E
T
 
V
A
 
A
D
 
D
S
 
I
V
 
A
S
 
R
V
 
D
A
 
T
F
 
R
E
 
R
V
 
V
P
 
L
A
 
L
E
 
G
L
 
L
R
 
A
D
 
E
H
 
P
Y
 
L
R
 
A
F
 
F
T
 
E
Q
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
x
Y
V
 
V
T
 
E
L
 
L
K
 
V
T
 
-
H
 
-
I
 
V
D
 
P
G
 
G
E
 
S
E
 
G
T
 
A
R
 
R
R
|
R
S
x
Q
Y
|
Y
S
|
S
I
 
L
C
 
A
V
 
-
G
 
-
V
 
-
T
 
N
D
 
T
Y
 
A
D
 
D
R
 
E
D
 
D
G
 
K
E
 
V
L
 
L
R
 
E
I
 
L
G
x
H
I
x
V
K
 
R
R
 
R
V
|
V
R
 
P
G
 
G
G
|
G
R
x
V
F
x
A
S
x
T
N
 
D
-
 
G
F
 
W
A
 
L
F
 
F
D
 
D
T
 
G
L
 
L
Q
 
A
P
 
A
G
 
G
H
 
D
T
 
R
I
 
V
D
 
E
V
 
A
M
 
T
T
 
G
P
 
P
D
 
L
G
 
G
R
 
D
F
 
F
F
 
-
T
 
-
H
 
H
L
 
L
-
 
P
-
 
P
-
 
P
N
 
D
A
 
E
D
 
D
Q
 
D
G
 
G
Q
 
G
Q
 
P
Y
 
M
L
 
V
A
 
L
F
 
I
S
 
G
G
 
G
G
 
G
S
x
T
G
 
G
I
 
L
T
 
A
P
 
P
V
 
L
L
 
V
A
 
G
I
 
I
I
 
A
K
 
R
T
 
T
T
 
A
L
 
L
E
 
A
V
 
R
E
 
H
P
 
P
R
 
S
S
 
R
T
 
E
F
 
V
T
 
L
L
 
L
V
 
Y
Y
 
H
G
 
G
N
 
V
R
 
R
S
 
G
V
 
A
-
 
A
-
 
D
-
 
L
-
 
Y
D
 
D
Q
 
L
I
 
G
M
 
R
F
 
F
A
 
A
E
 
E
E
 
I
L
 
A
E
 
E
D
 
E
L
 
H
K
 
P
N
 
G
R
 
-
F
 
-
M
 
-
N
 
-
R
 
-
F
 
F
V
 
R
L
 
F
Y
 
V
H
 
P
V
 
V
L
 
L
S
 
S
D
 
D
D
 
E
L
 
P
Q
 
D
D
 
P
V
 
A
E
 
-
L
 
-
F
 
Y
N
 
R
G
 
G
V
 
G
L
 
F
D
 
P
Q
 
T
D
 
D
K
 
-
C
 
-
A
 
-
A
 
A
F
 
F
I
 
V
E
 
E
N
 
D
L
 
-
L
 
V
P
 
P
A
 
S
D
 
G
A
 
R
I
 
G
D
 
W
E
 
S
A
 
G
F
 
W
I
 
L
C
 
C
G
 
G
P
 
P
A
 
P
P
 
A
M
 
M
M
 
V
D
 
E
A
 
A
A
 
G
E
 
V
A
 
K
A
 
A
L
 
F
K
 
K
A
 
R
A
 
R
G
 
R
V
 
M
P
 
S
S
 
P
E
 
R
K
 
R
V
 
I
H
 
H
V
 
R
E
 
E
R
 
K
F
|
F

Sites not aligning to the query:

P0DPQ8 Aromatic O-demethylase, reductase subunit; NADH--hemoprotein reductase; EC 1.6.2.- from Amycolatopsis sp. (strain ATCC 39116 / 75iv2) (see paper)
29% identity, 67% coverage: 7:250/362 of query aligns to 96:330/334 of P0DPQ8

query
sites
P0DPQ8
H
 
H
P
 
P
L
 
L
R
 
R
-
 
D
I
 
L
R
 
T
E
 
A
V
 
T
R
 
V
P
 
L
E
 
E
T
 
V
A
 
A
D
 
D
S
 
I
V
 
A
S
 
R
V
 
D
A
 
T
F
 
R
E
 
R
V
 
V
P
 
L
A
 
L
E
 
G
L
 
L
R
 
A
D
 
E
H
 
P
Y
 
L
R
 
A
F
 
F
T
 
E
Q
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
Y
V
 
V
T
 
E
L
 
L
K
 
V
T
 
-
H
 
-
I
 
V
D
 
P
G
 
G
E
 
S
E
 
G
T
 
A
R
 
R
R
|
R
S
x
Q
Y
|
Y
S
|
S
I
 
L
C
 
A
V
 
-
G
 
-
V
 
-
T
 
N
D
 
T
Y
 
A
D
 
D
R
 
E
D
 
D
G
 
K
E
 
V
L
 
L
R
 
E
I
 
L
G
x
H
I
x
V
K
x
R
R
 
R
V
 
V
R
 
P
G
 
G
G
 
G
R
x
V
F
x
A
S
x
T
N
 
D
-
 
G
F
 
W
A
 
L
F
 
F
D
 
D
T
 
G
L
 
L
Q
 
A
P
 
A
G
 
G
H
 
D
T
 
R
I
 
V
D
 
E
V
 
A
M
 
T
T
 
G
P
 
P
D
 
L
G
 
G
R
 
D
F
 
F
F
 
-
T
 
-
H
 
H
L
 
L
-
 
P
-
 
P
-
 
P
N
 
D
A
 
E
D
 
D
Q
 
D
G
 
G
Q
 
G
Q
 
P
Y
 
M
L
 
V
A
 
L
F
 
I
S
 
G
G
 
G
G
 
G
S
x
T
G
 
G
I
 
L
T
 
A
P
 
P
V
 
L
L
 
V
A
 
G
I
 
I
I
 
A
K
 
R
T
 
T
T
 
A
L
 
L
E
 
A
V
 
R
E
 
H
P
 
P
R
 
S
S
 
R
T
 
E
F
 
V
T
 
L
L
 
L
V
 
Y
Y
 
H
G
 
G
N
 
V
R
 
R
S
 
G
V
 
A
-
 
A
-
 
D
-
 
L
-
 
Y
D
 
D
Q
 
L
I
 
G
M
 
R
F
 
F
A
 
A
E
 
E
E
 
I
L
 
A
E
 
E
D
 
E
L
 
H
K
 
P
N
 
G
R
 
-
F
 
-
M
 
-
N
 
-
R
 
-
F
 
F
V
 
R
L
 
F
Y
 
V
H
 
P
V
 
V
L
 
L
S
 
S
D
 
D
D
 
E
L
 
P
Q
 
D
D
 
P
V
 
A
E
 
-
L
 
-
F
 
Y
N
 
R
G
 
G
V
 
G
L
 
F
D
 
P
Q
 
T
D
 
D
K
 
-
C
 
-
A
 
-
A
 
A
F
 
F
I
 
V
E
 
E
N
 
D
L
 
-
L
 
V
P
 
P
A
 
S
D
 
G
A
 
R
I
 
G
D
 
W
E
 
S
A
 
G
F
 
W
I
 
L
C
 
C
G
 
G
P
 
P
A
 
P
P
 
A
M
 
M
M
 
V
D
 
E
A
 
A
A
 
G
E
 
V
A
 
K
A
 
A
L
 
F
K
 
K
A
 
R
A
 
R
G
 
R
V
 
M
P
 
S
S
 
P
E
 
R
K
 
R
V
 
I
H
 
H
V
 
R
E
 
E
R
 
K
F
|
F

Sites not aligning to the query:

Q9ZNT1 NADH--cytochrome b5 reductase 1; EC 1.6.2.2 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see 2 papers)
31% identity, 53% coverage: 52:243/362 of query aligns to 93:276/281 of Q9ZNT1

query
sites
Q9ZNT1
G
 
G
E
 
E
E
 
D
T
 
V
R
 
I
R
 
K
S
 
P
Y
 
Y
S
 
T
I
 
-
C
 
-
V
 
-
G
 
-
V
 
P
T
 
T
D
 
T
Y
 
L
D
 
D
R
 
S
D
 
D
-
 
V
G
 
G
E
 
R
L
 
F
R
 
E
I
 
L
G
 
V
I
 
I
K
 
K
R
 
M
V
 
Y
R
 
P
G
 
Q
G
 
G
R
 
R
F
 
M
S
 
S
N
 
H
F
 
-
A
 
H
F
 
F
D
 
R
T
 
E
L
 
M
Q
 
R
P
 
V
G
 
G
H
 
D
T
 
H
I
 
L
D
 
A
V
 
V
M
 
K
T
 
G
P
 
P
D
 
K
G
 
G
R
 
R
F
 
F
F
 
-
T
 
-
H
 
K
L
 
Y
N
 
Q
A
 
P
D
 
G
Q
 
Q
G
 
F
Q
 
R
Q
 
A
Y
 
F
L
 
G
A
 
M
F
 
L
S
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
I
 
I
T
 
T
P
 
P
V
 
M
L
 
F
A
 
Q
I
 
V
I
 
A
K
 
R
T
 
A
T
 
I
L
 
L
E
 
E
V
 
N
E
 
P
P
 
T
-
 
D
R
 
K
S
 
T
T
 
K
F
 
V
T
 
H
L
 
L
V
 
I
Y
 
Y
G
 
A
N
 
N
R
 
V
S
 
T
V
 
Y
D
 
D
Q
 
D
I
 
I
M
 
L
F
 
L
A
 
K
E
 
E
E
 
E
L
 
L
E
 
E
D
 
G
L
 
L
K
 
T
N
 
T
R
 
N
F
 
Y
M
 
P
N
 
E
R
 
Q
F
 
F
V
 
K
L
 
I
Y
 
F
H
 
Y
V
 
V
L
 
L
S
 
N
D
 
-
D
 
-
L
 
-
Q
 
Q
D
 
P
V
 
P
E
 
E
L
 
V
F
 
W
N
 
D
G
 
G
V
 
G
L
 
V
D
 
G
Q
 
-
D
 
F
K
 
V
C
 
S
A
 
K
A
 
E
F
 
M
I
 
I
E
 
Q
N
 
T
L
 
H
L
 
C
P
 
P
A
 
A
D
 
P
A
 
A
I
 
S
D
 
D
-
 
I
E
 
Q
A
 
I
F
 
L
I
 
R
C
 
C
G
 
G
P
 
P
A
 
P
P
 
P
M
 
M
M
 
N
D
 
K
A
 
A
A
 
M
E
 
A
A
 
A
A
 
N
L
 
L
K
 
E
A
 
A
A
 
L
G
 
G
V
 
Y
P
 
S
S
 
P
E
 
E

Sites not aligning to the query:

1tvcA Fad and nadh binding domain of methane monooxygenase reductase from methylococcus capsulatus (bath) (see paper)
27% identity, 59% coverage: 37:250/362 of query aligns to 43:244/250 of 1tvcA

query
sites
1tvcA
R
 
K
F
 
F
T
 
E
Q
 
P
G
 
G
Q
 
Q
F
|
F
V
 
M
T
 
D
L
 
L
K
 
T
T
 
-
H
 
-
I
 
I
D
 
P
G
 
G
E
 
T
E
 
D
T
 
V
R
 
S
R
|
R
S
|
S
Y
|
Y
S
|
S
I
 
P
C
 
A
V
 
-
G
 
-
V
 
-
T
 
N
D
 
L
Y
 
P
D
 
N
R
 
P
D
 
E
G
 
G
E
 
R
L
 
L
R
 
E
I
 
F
G
x
L
I
|
I
K
x
R
R
 
V
V
x
L
R
 
P
G
 
E
G
 
G
R
 
R
F
|
F
S
 
S
N
 
D
F
 
Y
A
 
L
F
 
R
D
 
N
T
 
D
L
 
A
Q
 
R
P
 
V
G
 
G
H
 
Q
T
 
V
I
 
L
D
 
S
V
 
V
M
 
K
T
 
G
P
 
P
D
 
L
G
 
G
R
 
V
F
 
F
F
 
G
T
 
L
H
 
K
L
 
E
N
 
R
A
 
G
D
 
M
Q
 
A
G
 
P
Q
 
R
Q
 
Y
Y
 
F
L
 
V
A
 
A
F
 
-
S
 
-
G
 
G
G
 
G
S
 
T
G
|
G
I
 
L
T
 
A
P
 
P
V
 
V
L
 
V
A
 
S
I
 
M
I
 
V
K
 
R
T
 
Q
T
 
M
L
 
Q
E
 
E
V
 
W
E
 
T
P
 
A
R
 
P
S
 
N
T
 
E
F
 
T
T
 
R
L
 
I
V
 
Y
Y
 
F
G
 
G
N
 
V
R
x
N
S
 
T
V
 
E
D
 
P
Q
x
E
I
 
L
M
 
F
F
 
Y
A
 
I
E
 
D
E
 
E
L
 
L
E
 
K
D
 
S
L
 
L
K
 
E
N
 
-
R
 
R
F
 
S
M
 
M
N
 
R
R
 
N
F
 
L
V
 
T
L
 
V
Y
 
K
H
 
A
V
 
C
L
 
V
S
 
W
D
 
H
D
 
P
L
x
S
Q
x
G
D
 
D
V
 
W
E
 
E
L
 
G
F
 
E
N
 
Q
G
 
G
V
 
-
L
 
-
D
 
-
Q
 
-
D
 
S
K
 
P
C
 
I
A
 
D
A
 
A
F
 
L
I
 
R
E
 
E
N
 
D
L
 
L
L
 
E
P
 
S
A
 
S
D
 
D
A
 
A
I
 
N
D
 
P
E
 
D
A
 
I
F
 
Y
I
x
L
C
 
C
G
 
G
P
 
P
A
 
P
P
 
G
M
 
M
M
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
A
E
 
C
A
 
E
A
 
L
L
 
V
K
 
R
A
 
S
A
 
R
G
 
G
V
 
I
P
 
P
S
 
G
E
 
E
K
 
Q
V
 
V
H
 
F
V
 
F
E
|
E
R
 
K
F
|
F

Sites not aligning to the query:

7ylrA Structure of a bacteria protein
29% identity, 85% coverage: 38:344/362 of query aligns to 36:311/326 of 7ylrA

query
sites
7ylrA
F
 
F
T
 
A
Q
 
A
G
 
G
Q
 
A
F
 
H
V
 
I
T
 
R
L
 
V
K
 
Q
T
 
V
H
 
S
I
 
L
-
 
P
D
 
D
G
 
G
E
 
R
E
 
T
T
 
D
R
 
W
R
|
R
S
x
H
Y
|
Y
S
|
S
I
 
L
C
 
I
V
 
N
G
 
F
V
 
A
T
 
T
D
 
A
Y
 
R
D
 
N
R
 
A
D
 
T
G
 
N
-
 
A
-
 
P
-
 
T
E
 
E
L
 
Y
R
 
V
I
 
I
G
x
A
I
x
V
K
x
R
R
 
K
V
 
E
R
 
A
G
 
E
G
|
G
R
|
R
F
 
G
-
x
G
S
|
S
N
 
R
F
 
F
A
 
M
F
 
H
D
 
E
T
 
G
L
 
L
Q
 
N
P
 
E
G
 
G
H
 
D
T
 
T
I
 
L
D
 
A
V
 
I
M
 
E
T
 
A
P
 
P
D
 
K
G
 
N
R
 
D
F
 
F
F
 
P
T
 
L
H
 
H
L
 
T
N
 
G
A
 
P
D
 
-
Q
 
-
G
 
G
Q
 
G
Q
 
S
Y
 
V
L
 
L
A
 
-
F
 
V
S
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
I
G
 
G
I
 
V
T
|
T
P
 
P
V
 
-
L
 
L
A
 
A
I
 
T
I
 
M
K
 
A
T
 
A
T
 
R
L
 
R
E
 
R
V
 
A
E
 
E
P
 
G
R
 
-
S
 
A
T
 
P
F
 
V
T
 
R
L
 
M
V
 
H
Y
 
Y
G
 
A
N
 
G
R
 
R
S
 
S
V
 
R
D
 
E
Q
 
L
I
 
M
M
 
A
F
 
F
A
 
L
E
 
P
E
 
E
L
 
L
E
 
Q
D
 
A
L
 
L
K
 
-
N
 
-
R
 
-
F
 
-
M
 
-
N
 
-
R
 
-
F
 
-
V
 
-
L
 
-
Y
 
-
H
 
-
V
 
-
L
 
L
S
 
G
D
 
D
D
 
D
L
 
L
Q
 
R
-
 
V
-
 
H
-
 
A
D
 
D
V
 
A
E
 
E
L
 
A
F
 
-
N
 
G
G
 
A
V
 
P
L
 
L
D
 
D
Q
 
I
D
 
D
K
 
-
C
 
-
A
 
-
A
 
A
F
 
L
I
 
L
E
 
D
N
 
G
L
 
V
L
 
-
P
 
-
A
 
-
D
 
P
A
 
A
I
 
G
D
 
D
E
 
R
A
 
L
F
 
Y
I
 
V
C
 
C
G
 
G
P
 
P
A
 
K
P
 
V
M
 
M
M
 
L
D
 
D
A
 
A
A
 
V
E
 
L
A
 
A
A
 
R
L
 
T
K
 
Q
A
 
A
A
 
R
G
 
G
V
 
W
P
 
E
S
 
H
E
 
D
K
 
R
V
 
V
H
 
H
V
 
F
E
|
E
R
 
L
F
|
F
G
 
T
S
x
E
P
 
P
L
 
V
P
 
A
Q
 
E
A
 
-
G
 
G
V
 
D
P
 
Q
P
 
P
V
 
F
E
 
E
I
 
V
T
 
-
E
 
-
D
 
-
T
 
-
P
 
-
A
 
-
A
 
-
D
 
-
L
 
-
E
 
E
I
 
L
V
 
A
L
 
Q
D
 
S
G
 
G
K
 
Q
R
 
R
R
 
-
K
 
-
L
 
F
R
 
T
L
 
V
P
 
P
Y
 
-
Q
 
A
G
 
G
V
 
Q
S
 
S
V
 
I
L
 
L
D
 
D
V
 
C
G
 
L
L
 
I
R
 
E
A
 
H
G
 
G
L
 
C
A
 
D
L
 
P
P
 
M
Y
 
F
A
 
D
C
|
C
K
|
K
G
x
R
G
|
G
V
 
E
C
|
C
C
x
G
T
 
V
C
|
C
R
 
A
A
 
V
K
 
P
V
 
V
L
 
L
E
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
I
K
 
D
M
 
-
E
 
H
K
 
R
N
 
D
Y
 
Y
T
 
V
L
 
L
E
 
T
E
 
A
H
 
R
E
 
E
I
 
K
R
 
A
D
 
Q
G
 
G
F
 
N
V
 
V
L
 
M

Sites not aligning to the query:

Q8IED5 Ferredoxin, apicoplast from Plasmodium falciparum (isolate 3D7) (see paper)
42% identity, 19% coverage: 293:361/362 of query aligns to 120:188/194 of Q8IED5

query
sites
Q8IED5
V
 
I
L
 
L
D
 
D
V
 
A
G
 
S
L
 
E
R
 
R
A
 
Q
G
 
N
L
 
V
A
 
E
L
 
L
P
 
P
Y
 
Y
A
 
S
C
|
C
K
 
R
G
 
G
G
 
G
V
 
S
C
|
C
C
 
S
T
 
T
C
|
C
R
 
A
A
 
A
K
 
K
V
 
L
L
 
V
E
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
V
K
 
D
M
 
N
E
 
D
K
 
D
N
 
Q
Y
 
S
T
 
Y
L
 
L
E
 
D
E
 
E
H
 
E
E
 
Q
I
 
I
R
 
K
D
 
K
G
 
K
F
 
Y
V
 
I
L
 
L
T
 
L
C
|
C
Q
 
T
C
 
C
H
 
Y
P
 
P
I
 
K
S
 
S
D
 
D
R
 
C
V
 
V
V
 
I
V
 
E
S
 
T
Y
 
H
D
 
K
E
 
E

1iueA Crystal structure analysis of ferredoxin from plasmodium falciparum
42% identity, 19% coverage: 293:361/362 of query aligns to 24:92/98 of 1iueA

query
sites
1iueA
V
 
I
L
 
L
D
 
D
V
 
A
G
 
S
L
 
E
R
 
R
A
 
Q
G
 
N
L
 
V
A
 
E
L
 
L
P
 
P
Y
|
Y
A
 
S
C
|
C
K
x
R
G
 
G
G
|
G
V
 
S
C
|
C
C
 
S
T
 
T
C
|
C
R
 
A
A
 
A
K
 
K
V
 
L
L
 
V
E
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
V
K
 
D
M
 
N
E
 
D
K
 
D
N
 
Q
Y
 
S
T
 
Y
L
 
L
E
 
D
E
 
E
H
 
E
E
 
Q
I
 
I
R
 
K
D
 
K
G
 
K
F
 
Y
V
 
I
L
 
L
T
 
L
C
|
C
Q
 
T
C
 
C
H
 
Y
P
 
P
I
 
K
S
 
S
D
 
D
R
 
C
V
 
V
V
 
I
V
 
E
S
 
T
Y
 
H
D
 
K
E
 
E

6khi1 Supercomplex for cylic electron transport in cyanobacteria (see paper)
39% identity, 23% coverage: 278:362/362 of query aligns to 12:95/98 of 6khi1

query
sites
6khi1
D
 
D
G
 
G
K
 
S
R
 
E
R
 
T
K
 
T
L
 
I
R
 
D
L
 
V
P
 
P
Y
 
-
Q
 
E
G
 
D
V
 
E
S
 
Y
V
 
I
L
 
L
D
 
D
V
 
V
G
 
A
L
 
E
R
 
E
A
 
Q
G
 
G
L
 
L
A
 
D
L
 
L
P
 
P
Y
 
F
A
 
S
C
|
C
K
x
R
G
 
A
G
|
G
V
 
A
C
|
C
C
 
S
T
 
T
C
|
C
R
 
A
A
 
G
K
 
K
V
 
L
L
 
L
E
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
V
K
 
D
M
 
Q
E
 
S
K
 
D
N
 
Q
Y
 
S
T
 
F
L
 
L
E
 
D
E
 
D
H
 
D
E
 
Q
I
 
I
R
 
E
D
 
K
G
 
G
F
 
F
V
 
V
L
|
L
T
 
T
C
|
C
Q
 
V
C
 
A
H
 
Y
P
 
P
I
 
R
S
 
S
D
 
D
R
 
C
V
 
K
V
 
I
V
 
L
S
 
T
Y
 
N
D
 
Q
E
 
E
R
 
E

7romA Crystal structure of saccharomyces cerevisiae nadh-cytochrome b5 reductase 1 (cbr1) fragment (residues 28-284) bound to fad
29% identity, 52% coverage: 41:228/362 of query aligns to 45:227/255 of 7romA

query
sites
7romA
G
 
G
Q
 
Q
F
 
H
V
 
I
T
 
V
L
 
I
K
 
K
T
 
A
H
 
N
I
 
I
D
 
N
G
 
G
E
 
K
E
 
D
T
 
I
R
 
T
R
|
R
S
|
S
Y
|
Y
S
x
T
I
 
P
C
 
T
V
 
-
G
 
-
V
 
S
T
 
L
D
 
D
Y
 
G
D
 
D
R
 
T
D
 
K
G
 
G
E
 
N
L
 
F
R
 
E
I
 
L
G
x
L
I
x
V
K
 
K
R
 
S
V
x
Y
R
 
P
G
x
T
G
|
G
R
x
N
F
x
V
S
|
S
N
 
K
F
 
M
A
 
-
F
 
I
D
 
G
T
 
E
L
 
L
Q
 
K
P
 
I
G
 
G
H
 
D
T
 
S
I
 
I
D
 
Q
V
 
I
M
 
K
T
 
G
P
 
P
D
 
R
G
 
G
R
 
N
F
 
Y
F
 
H
T
 
Y
H
 
E
L
 
R
N
 
N
A
 
C
D
 
R
Q
 
S
G
 
H
Q
 
L
Q
 
G
Y
 
M
L
 
I
A
 
A
F
 
-
S
 
-
G
 
G
G
 
G
S
x
T
G
 
G
I
 
I
T
x
A
P
 
P
V
 
M
L
 
Y
A
 
Q
I
 
I
I
 
M
K
 
K
T
 
-
T
 
A
L
 
I
E
 
A
V
 
M
E
 
D
P
 
P
R
 
H
S
 
D
T
 
T
-
 
T
-
 
K
F
 
V
T
 
S
L
 
L
V
 
V
Y
 
F
G
 
G
N
 
N
R
 
V
S
 
H
V
 
E
D
 
E
Q
 
D
I
 
I
M
 
L
F
 
L
A
 
K
E
 
K
E
 
E
L
 
L
E
 
E
D
 
A
L
 
L
K
 
V
N
 
A
R
 
M
F
 
K
M
 
P
N
 
S
R
 
Q
F
 
F
-
 
K
V
 
I
L
 
V
Y
 
Y
H
 
Y
V
 
L
L
 
D
S
 
S
D
 
P
D
 
D
L
 
R
Q
 
E
D
 
D
V
 
W
E
 
T
L
 
G
F
 
G
N
 
V
G
 
G
V
 
Y
L
 
I
D
 
T
Q
 
K
D
 
D
K
 
-
C
 
-
A
 
-
A
 
-
F
 
V
I
 
I
E
 
K
N
 
E
L
 
H
L
 
L
P
 
P
A
 
A
D
 
A
A
 
T
I
 
M
D
 
D
-
 
N
-
 
V
E
 
Q
A
 
I
F
 
L
I
 
I
C
 
C
G
 
G
P
 
P
A
 
P
P
 
A
M
 
M
M
 
V

7fixR1 Photosystem I reaction center subunit PsaK (see paper)
39% identity, 23% coverage: 278:362/362 of query aligns to 11:94/97 of 7fixR1

query
sites
7fixR1
D
 
D
G
 
G
K
 
S
R
 
E
R
 
T
K
 
T
L
 
I
R
 
D
L
 
V
P
 
P
Y
 
-
Q
 
E
G
 
D
V
 
E
S
 
Y
V
 
I
L
 
L
D
 
D
V
 
V
G
 
A
L
 
E
R
 
E
A
 
Q
G
 
G
L
 
L
A
 
D
L
 
L
P
 
P
Y
x
F
A
x
S
C
|
C
K
x
R
G
 
A
G
|
G
V
 
A
C
|
C
C
 
S
T
 
T
C
|
C
R
 
A
A
 
G
K
 
K
V
 
L
L
 
L
E
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
V
K
 
D
M
 
Q
E
 
S
K
 
D
N
 
Q
Y
 
S
T
 
F
L
 
L
E
 
D
E
 
D
H
 
D
E
 
Q
I
 
I
R
 
E
D
 
K
G
 
G
F
 
F
V
 
V
L
|
L
T
 
T
C
|
C
Q
 
V
C
 
A
H
 
Y
P
 
P
I
 
R
S
 
S
D
 
D
R
 
C
V
 
K
V
 
I
V
 
L
S
 
T
Y
 
N
D
 
Q
E
 
E
R
 
E

7aktA Crpetf variant - a39g_a41v
42% identity, 19% coverage: 293:361/362 of query aligns to 35:103/107 of 7aktA

query
sites
7aktA
V
 
I
L
 
L
D
 
D
V
 
A
G
 
A
L
 
E
R
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
D
L
 
L
P
 
P
Y
|
Y
A
 
S
C
|
C
K
x
R
G
 
G
G
|
G
V
 
V
C
|
C
C
 
S
T
 
S
C
|
C
R
 
A
A
 
G
K
 
K
V
 
V
L
 
A
E
 
A
G
 
G
E
 
T
V
 
V
K
 
D
M
 
Q
E
 
S
K
 
D
N
 
Q
Y
 
S
T
 
F
L
 
L
E
 
D
E
 
D
H
 
A
E
 
Q
I
 
M
R
 
G
D
 
N
G
 
G
F
 
F
V
 
V
L
 
L
T
 
T
C
|
C
Q
 
V
C
 
A
H
 
Y
P
 
P
I
 
T
S
 
S
D
 
D
R
 
C
V
 
T
V
 
I
V
 
Q
S
 
T
Y
 
H
D
 
Q
E
 
E

4zhoA The crystal structure of arabidopsis ferredoxin 2 with 2fe-2s cluster (see paper)
36% identity, 26% coverage: 268:362/362 of query aligns to 9:93/97 of 4zhoA

query
sites
4zhoA
T
 
T
P
 
P
A
 
E
A
 
G
D
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
V
V
 
E
L
 
C
D
 
D
G
 
-
K
 
-
R
 
-
R
 
-
K
 
-
L
 
-
R
 
-
L
 
-
P
 
-
Y
 
-
Q
 
D
G
 
D
V
 
V
S
 
Y
V
 
V
L
 
L
D
 
D
V
 
A
G
 
A
L
 
E
R
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
I
A
 
D
L
 
L
P
 
P
Y
|
Y
A
 
S
C
|
C
K
x
R
G
 
A
G
|
G
V
 
S
C
|
C
C
 
S
T
 
S
C
|
C
R
 
A
A
 
G
K
 
K
V
 
V
L
 
V
E
 
S
G
 
G
E
 
S
V
 
V
K
 
D
M
 
Q
E
 
S
K
 
D
N
 
Q
Y
 
S
T
 
F
L
 
L
E
 
D
E
 
D
H
 
E
E
 
Q
I
 
I
R
 
G
D
 
E
G
 
G
F
 
F
V
 
V
L
 
L
T
 
T
C
|
C
Q
 
A
C
 
A
H
 
Y
P
 
P
I
 
T
S
 
S
D
 
D
R
 
V
V
 
T
V
 
I
V
 
E
S
 
T
Y
 
H
D
 
K
E
 
E
R
 
E

P27787 Ferredoxin-1, chloroplastic; Ferredoxin I; Fd I from Zea mays (Maize) (see 2 papers)
38% identity, 22% coverage: 283:362/362 of query aligns to 67:145/150 of P27787

query
sites
P27787
K
 
E
L
 
L
R
 
Q
L
 
V
P
 
P
Y
 
-
Q
 
D
G
 
D
V
 
V
S
 
Y
V
 
I
L
 
L
D
 
D
V
 
Q
G
 
A
L
 
E
R
 
E
A
 
D
G
 
G
L
 
I
A
 
D
L
 
L
P
 
P
Y
 
Y
A
 
S
C
 
C
K
 
R
G
 
A
G
 
G
V
 
S
C
 
C
C
 
S
T
 
S
C
 
C
R
 
A
A
 
G
K
 
K
V
 
V
L
 
V
E
 
S
G
 
G
E
 
S
V
 
V
K
 
D
M
 
Q
E
 
S
K
 
D
N
 
Q
Y
 
S
T
 
Y
L
 
L
E
x
D
E
 
D
H
 
G
E
 
Q
I
 
I
R
 
A
D
 
D
G
 
G
F
 
W
V
 
V
L
 
L
T
 
T
C
 
C
Q
 
H
C
 
A
H
 
Y
P
 
P
I
 
T
S
 
S
D
 
D
R
 
V
V
 
V
V
 
I
V
 
E
S
 
T
Y
 
H
D
 
K
E
 
E
R
 
E

Sites not aligning to the query:

3ab5A Crystal structure of the 2fe 2s ferredoxin from cyanidioschyzon merolae
39% identity, 19% coverage: 293:361/362 of query aligns to 25:93/97 of 3ab5A

query
sites
3ab5A
V
 
I
L
 
L
D
 
D
V
 
A
G
 
A
L
 
E
R
 
E
A
 
Q
G
 
G
L
 
V
A
 
D
L
 
L
P
 
P
Y
|
Y
A
 
S
C
|
C
K
x
R
G
 
A
G
|
G
V
 
A
C
|
C
C
 
S
T
 
T
C
|
C
R
 
A
A
 
G
K
 
K
V
 
L
L
 
V
E
 
K
G
 
G
E
 
S
V
 
V
K
 
D
M
 
Q
E
 
S
K
 
D
N
 
Q
Y
 
S
T
 
F
L
 
L
E
 
D
E
 
E
H
 
D
E
 
Q
I
 
I
R
 
S
D
 
K
G
 
G
F
 
F
V
 
I
L
 
L
T
 
T
C
|
C
Q
 
V
C
 
A
H
 
Y
P
 
P
I
 
T
S
 
S
D
 
D
R
 
C
V
 
V
V
 
I
V
 
Q
S
 
T
Y
 
H
D
 
Q
E
 
E

Q9DCN2 NADH-cytochrome b5 reductase 3; B5R; Cytochrome b5 reductase; Diaphorase-1; EC 1.6.2.2 from Mus musculus (Mouse) (see paper)
25% identity, 66% coverage: 7:244/362 of query aligns to 43:297/301 of Q9DCN2

query
sites
Q9DCN2
H
 
Y
P
 
P
L
 
L
R
 
R
I
 
L
R
 
I
E
 
D
V
 
K
R
 
E
P
 
V
E
 
I
T
 
S
A
 
P
D
 
D
S
 
T
V
 
R
S
 
R
V
 
F
A
 
R
F
 
F
E
 
A
V
 
L
P
 
P
A
 
S
E
 
P
L
 
-
R
 
Q
D
 
H
H
 
I
Y
 
L
R
 
G
F
 
L
T
 
P
Q
 
I
G
 
G
Q
 
Q
F
 
H
V
 
I
T
 
Y
L
 
L
K
 
S
T
 
T
H
 
R
I
 
I
D
 
D
G
 
G
E
 
N
E
 
L
T
 
V
R
 
I
R
 
R
S
 
P
Y
 
Y
S
 
T
I
 
-
C
 
-
V
 
-
G
 
P
V
 
V
T
 
S
D
 
S
Y
 
D
D
 
D
R
 
D
D
 
K
G
 
G
E
 
F
L
 
V
R
 
D
I
 
L
G
 
V
I
 
V
K
 
K
R
 
V
V
 
Y
-
 
F
-
 
K
-
 
D
-
 
T
-
 
H
-
 
P
-
 
K
-
 
F
-
 
P
R
 
A
G
 
G
G
 
G
R
 
K
F
 
M
S
 
S
N
 
Q
F
 
Y
A
 
-
F
 
L
D
 
E
T
 
N
L
 
M
Q
 
K
P
 
I
G
 
G
H
 
D
T
 
T
I
 
I
D
 
E
V
 
F
M
 
R
T
 
G
P
 
P
D
 
N
G
 
G
R
 
L
F
 
L
F
 
V
T
 
Y
H
 
Q
-
 
G
-
 
K
-
 
G
-
 
K
-
 
F
-
 
A
L
 
I
N
 
R
A
 
A
D
 
D
Q
 
K
G
 
K
Q
 
S
Q
 
N
Y
 
P
L
 
V
A
 
V
-
 
R
-
 
T
-
 
V
-
 
K
-
 
S
-
 
V
-
 
G
-
 
M
F
 
I
S
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
T
G
 
G
I
 
I
T
 
T
P
 
P
V
 
M
L
 
L
A
 
Q
I
 
V
I
 
I
K
 
R
T
 
A
T
 
V
L
 
L
E
 
K
V
 
D
E
 
P
P
 
N
R
 
D
S
 
H
T
 
T
F
 
V
T
 
C
-
 
Y
L
 
L
V
 
L
Y
 
F
G
 
A
N
 
N
R
 
Q
S
 
S
V
 
E
D
 
K
Q
 
D
I
 
I
M
 
L
F
 
L
A
 
R
E
 
P
E
 
E
L
 
L
E
 
E
D
 
E
L
 
L
K
 
R
N
 
N
R
 
E
F
 
H
M
 
S
N
 
A
R
 
R
F
 
F
V
 
K
L
 
L
Y
 
W
H
 
Y
V
 
T
L
 
V
S
 
D
D
 
K
D
 
A
L
 
P
Q
 
D
D
 
A
V
 
W
E
 
D
L
 
Y
F
 
S
N
 
Q
G
 
G
V
 
F
L
 
V
D
 
N
Q
 
E
D
 
E
K
 
-
C
 
-
A
 
-
A
 
-
F
 
M
I
 
I
E
 
R
N
 
D
L
 
H
L
 
L
P
 
P
A
 
T
D
 
P
A
 
G
I
 
-
D
 
E
E
 
E
A
 
P
F
 
L
I
 
I
-
 
L
-
 
M
C
 
C
G
 
G
P
 
P
A
 
P
P
 
P
M
 
M
M
 
I
D
 
Q
-
 
F
A
 
A
A
 
C
E
 
L
A
 
P
A
 
N
L
 
L
K
 
E
A
 
R
A
 
V
G
 
G
V
 
H
P
 
P
S
 
K
E
 
E
K
 
R

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>BPHYT_RS18270 FitnessBrowser__BFirm:BPHYT_RS18270
MATPQFHPLRIREVRPETADSVSVAFEVPAELRDHYRFTQGQFVTLKTHIDGEETRRSYS
ICVGVTDYDRDGELRIGIKRVRGGRFSNFAFDTLQPGHTIDVMTPDGRFFTHLNADQGQQ
YLAFSGGSGITPVLAIIKTTLEVEPRSTFTLVYGNRSVDQIMFAEELEDLKNRFMNRFVL
YHVLSDDLQDVELFNGVLDQDKCAAFIENLLPADAIDEAFICGPAPMMDAAEAALKAAGV
PSEKVHVERFGSPLPQAGVPPVEITEDTPAADLEIVLDGKRRKLRLPYQGVSVLDVGLRA
GLALPYACKGGVCCTCRAKVLEGEVKMEKNYTLEEHEIRDGFVLTCQCHPISDRVVVSYD
ER

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory