SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing BPHYT_RS20325 FitnessBrowser__BFirm:BPHYT_RS20325 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5ol2F The electron transferring flavoprotein/butyryl-coa dehydrogenase complex from clostridium difficile (see paper)
41% identity, 94% coverage: 8:370/388 of query aligns to 18:378/378 of 5ol2F

query
sites
5ol2F
F
 
F
V
 
A
R
 
E
D
 
N
E
 
E
A
 
V
I
 
K
P
 
P
R
 
L
E
 
A
N
 
T
E
|
E
I
 
L
E
 
D
Q
 
E
A
x
E
D
 
E
A
x
R
V
 
F
P
 
P
A
 
Y
D
 
E
L
 
T
V
 
V
Q
 
E
R
 
K
M
 
M
R
 
A
E
 
K
L
 
A
G
 
G
Y
 
M
F
 
M
G
 
G
W
 
I
S
 
P
I
 
Y
P
 
P
R
 
K
D
 
E
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
 
E
G
 
G
L
 
G
S
 
D
T
 
T
E
 
V
Q
 
G
L
 
Y
V
 
I
R
 
M
G
 
A
A
 
V
F
 
E
E
 
E
L
 
L
S
 
S
Q
 
R
A
 
V
S
 
C
V
 
G
A
 
T
F
 
T
R
 
G
A
 
V
R
 
I
V
 
L
G
 
S
T
 
A
N
 
H
T
 
T
G
 
S
I
 
L
G
 
G
S
 
S
E
 
W
A
 
P
L
 
I
V
 
Y
A
 
Q
D
 
Y
G
 
G
T
 
N
D
 
E
T
 
E
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
R
 
K
Y
 
F
L
 
L
P
 
R
R
 
P
L
 
L
A
 
A
S
 
S
G
 
G
E
 
E
F
 
K
T
 
L
G
 
G
A
 
A
F
|
F
A
 
G
L
|
L
T
|
T
E
 
E
P
|
P
D
 
N
A
 
A
G
 
G
S
x
T
D
 
D
A
 
A
T
 
S
A
 
G
L
 
Q
R
 
Q
T
 
T
T
 
T
A
 
A
R
 
V
R
 
L
D
 
D
G
 
G
D
 
D
H
 
E
Y
 
Y
I
 
I
L
 
L
D
 
N
G
 
G
S
 
S
K
 
K
C
 
I
F
|
F
I
|
I
T
|
T
N
 
N
A
 
A
P
 
I
I
 
A
A
 
G
D
 
D
L
 
I
F
 
Y
T
 
V
V
 
V
M
 
M
A
 
A
R
 
M
T
 
T
E
 
D
L
 
K
A
 
S
K
 
K
P
 
-
G
 
G
A
 
N
G
 
K
G
 
G
I
 
I
S
 
S
A
 
A
F
 
F
L
 
I
V
 
V
E
 
E
R
 
K
G
 
G
T
 
T
P
 
P
G
 
G
L
 
F
S
 
S
T
 
F
S
 
G
A
 
V
P
 
K
Y
x
E
D
 
K
K
 
K
M
 
M
G
 
G
Q
 
I
A
 
R
G
 
G
S
 
S
P
 
A
V
 
T
G
 
S
D
 
E
V
 
L
V
 
I
F
 
F
E
 
E
G
 
D
C
 
C
R
 
R
V
 
I
P
 
P
A
 
K
A
 
E
N
 
N
L
 
L
I
 
L
G
 
-
G
 
G
K
 
K
E
 
E
G
 
G
M
 
Q
G
 
G
F
 
F
R
 
K
T
 
I
A
 
A
M
 
M
K
 
S
V
 
T
L
|
L
N
 
D
K
 
G
Q
x
G
R
|
R
I
 
I
H
 
G
L
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
Q
C
 
A
T
 
L
G
 
G
P
 
L
A
 
A
M
 
Q
R
 
G
M
 
A
L
 
L
E
 
D
E
 
E
A
 
T
V
 
V
A
 
K
Y
 
Y
T
 
V
S
 
K
R
 
E
R
|
R
E
 
V
Q
 
Q
F
|
F
G
 
G
K
 
R
P
 
P
V
x
L
A
 
S
E
 
K
F
|
F
Q
 
Q
L
 
N
V
 
T
Q
 
Q
A
 
F
L
 
Q
I
 
L
A
 
A
E
 
D
C
 
M
Q
 
E
T
 
V
E
 
K
I
 
V
Y
 
Q
A
 
A
A
 
A
R
 
R
S
 
H
M
 
L
I
 
V
L
 
Y
E
 
Q
T
 
A
A
 
A
R
 
I
K
 
N
R
 
K
D
 
D
A
 
L
G
 
G
E
 
K
D
 
P
V
 
Y
A
 
G
L
 
V
E
 
E
A
 
A
S
 
A
M
 
M
C
 
A
K
 
K
M
 
L
F
 
F
A
 
A
S
 
A
E
 
E
M
 
T
C
 
A
G
 
M
R
 
E
V
 
V
A
 
T
D
 
T
R
 
K
A
 
A
V
 
V
Q
|
Q
M
x
L
L
 
H
G
|
G
G
|
G
R
 
Y
G
 
G
Y
 
Y
L
 
T
A
 
R
G
 
D
N
 
Y
A
 
P
V
 
V
E
 
E
R
 
R
F
 
M
Y
 
M
R
 
R
D
 
D
V
 
A
R
 
K
A
 
I
F
 
T
R
 
E
I
 
I
Y
|
Y
E
|
E
G
|
G
T
|
T
T
 
S
Q
x
E
I
 
V
H
 
Q
Q
 
R
L
 
M
N
 
V
I
 
I
A
 
S
K
x
G
I
 
K
T
 
L
L
 
L
R
 
K

4iv6B X-ray crystal structure of an isovaleryl-coa dehydrogenase from mycobacterium smegmatis (see paper)
41% identity, 95% coverage: 5:371/388 of query aligns to 13:378/383 of 4iv6B

query
sites
4iv6B
V
 
V
A
 
H
K
 
D
F
 
F
V
 
V
R
 
E
D
 
K
E
 
Q
A
 
V
I
 
K
P
 
P
R
 
V
E
 
V
N
 
R
E
 
E
I
 
L
E
 
E
Q
 
H
A
 
A
D
 
N
A
 
T
V
 
Y
P
 
P
A
 
E
D
 
E
L
 
L
V
 
I
Q
 
E
R
 
T
M
 
M
R
 
K
E
 
E
L
 
I
G
 
G
Y
 
I
F
 
F
G
 
G
W
 
L
S
 
A
I
 
I
P
 
P
R
 
E
D
 
P
F
 
Y
G
 
G
G
 
F
A
 
G
G
 
A
L
 
V
S
 
S
T
 
M
E
 
P
Q
 
C
L
 
Y
V
 
V
R
 
Q
G
 
V
A
 
A
F
 
E
E
 
E
L
 
L
S
 
A
Q
 
R
A
 
G
S
 
W
V
 
M
A
 
S
F
 
L
R
 
A
A
 
G
R
 
A
V
 
M
G
 
G
T
 
G
N
 
H
T
 
T
G
 
V
I
 
V
G
 
-
S
 
S
E
 
K
A
 
L
L
 
L
V
 
L
A
 
L
D
 
F
G
 
G
T
 
T
D
 
E
T
 
E
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
R
 
K
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
R
 
R
L
 
M
A
 
A
S
 
T
G
 
G
E
 
E
F
 
L
T
 
R
G
 
A
A
 
T
F
 
M
A
 
A
L
|
L
T
|
T
E
 
E
P
 
P
D
 
G
A
x
G
G
|
G
S
|
S
D
 
D
A
 
L
T
 
Q
A
 
A
L
 
M
R
 
R
T
 
T
T
 
V
A
 
A
R
 
R
R
 
R
D
 
D
G
 
G
D
 
D
H
 
D
Y
 
Y
I
 
V
L
 
I
D
 
N
G
 
G
S
 
S
K
 
K
C
 
T
F
x
W
I
|
I
T
x
S
N
 
N
A
 
A
P
 
R
I
 
R
A
 
S
D
 
D
L
 
L
F
 
V
T
 
A
V
 
L
M
 
M
A
 
C
R
 
K
T
 
T
E
 
D
L
 
P
-
 
D
A
 
A
K
 
Q
P
 
P
G
 
A
A
 
H
G
 
K
G
 
G
I
 
V
S
 
S
A
 
I
F
 
L
L
 
L
V
 
V
E
 
E
R
 
K
G
 
-
T
 
V
P
 
P
G
 
G
L
 
F
S
 
D
T
 
V
S
 
S
A
 
R
P
 
D
Y
 
L
D
 
P
K
 
K
M
 
L
G
 
G
Q
 
Y
A
 
K
G
 
G
S
 
V
P
 
E
V
 
S
G
 
C
D
 
E
V
 
L
V
 
N
F
 
F
E
 
T
G
 
D
C
 
A
R
 
R
V
 
V
P
 
P
A
 
V
A
 
S
N
 
S
L
 
L
I
 
L
G
 
G
G
 
D
K
 
D
E
 
E
G
 
G
M
 
R
G
 
G
F
 
F
R
 
A
T
 
Q
A
 
M
M
 
M
K
 
K
V
 
G
L
 
L
N
 
E
K
 
V
Q
x
G
R
 
R
I
 
L
H
 
Q
L
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
R
C
 
A
T
 
T
G
 
G
P
 
V
A
 
A
M
 
R
R
 
A
M
 
A
L
 
F
E
 
E
E
 
D
A
 
A
V
 
L
A
 
R
Y
 
Y
T
 
S
S
 
Q
R
 
E
R
|
R
E
 
E
Q
x
S
F
|
F
G
 
G
K
 
K
P
 
P
V
x
I
A
 
W
E
 
Q
F
x
H
Q
 
Q
L
 
S
V
|
V
Q
 
G
A
 
N
L
 
M
I
 
L
A
 
A
E
 
D
C
 
M
Q
 
G
T
 
T
E
 
K
I
 
L
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
R
 
R
S
 
S
M
 
L
I
 
L
L
 
L
E
 
S
T
 
A
A
 
A
R
 
E
K
 
K
R
 
F
D
 
D
A
 
A
G
 
G
E
 
Q
D
 
R
V
 
C
A
 
D
L
 
M
E
 
E
A
 
A
S
 
G
M
 
M
C
 
A
K
 
K
M
 
L
F
 
F
A
 
A
S
 
S
E
 
E
M
 
T
C
 
A
G
 
M
R
 
Q
V
 
I
A
 
A
D
 
L
R
 
D
A
 
A
V
 
V
Q
x
R
M
x
V
L
 
H
G
 
G
G
|
G
R
 
Y
G
 
G
Y
 
Y
L
 
S
A
 
T
G
 
E
N
 
Y
A
 
D
V
 
V
E
 
E
R
 
R
F
 
Y
Y
 
F
R
 
R
D
 
D
V
 
A
R
 
P
A
x
L
F
 
M
R
 
I
I
 
V
Y
x
G
E
|
E
G
 
G
T
|
T
T
 
N
Q
x
E
I
|
I
H
 
Q
Q
 
R
L
 
N
N
 
V
I
 
I
A
 
A
K
|
K
I
 
Q
T
 
L
L
 
V
R
 
A
R
 
R

5lnxD Crystal structure of mmgc, an acyl-coa dehydrogenase from bacillus subtilis.
41% identity, 94% coverage: 5:369/388 of query aligns to 13:373/374 of 5lnxD

query
sites
5lnxD
V
 
V
A
 
R
K
 
D
F
 
F
V
 
A
R
 
R
D
 
K
E
 
E
A
 
I
I
 
A
P
 
P
R
 
A
E
 
A
N
 
E
E
 
I
I
 
M
E
 
E
Q
 
K
A
 
T
D
 
D
A
 
E
V
 
F
P
 
P
A
 
F
D
 
Q
L
 
L
V
 
I
Q
 
K
R
 
K
M
 
M
R
 
G
E
 
K
L
 
H
G
 
G
Y
 
L
F
 
M
G
 
G
W
 
I
S
 
P
I
 
V
P
 
P
R
 
E
D
 
Q
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
A
S
 
D
T
 
V
E
 
V
Q
 
S
L
 
Y
V
 
I
R
 
L
G
 
A
A
 
I
F
 
H
E
 
E
L
 
I
S
 
S
Q
 
R
A
 
I
S
 
S
V
 
A
A
 
A
F
 
V
R
 
G
A
 
V
R
 
I
V
 
L
G
 
S
T
 
V
N
 
H
T
 
T
G
 
S
I
 
V
G
 
G
S
 
T
E
 
N
A
 
P
L
 
I
V
 
L
A
 
Y
D
 
F
G
 
G
T
 
N
D
 
E
T
 
E
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
M
R
 
K
Y
 
Y
L
 
I
P
 
P
R
 
N
L
 
L
A
 
A
S
 
S
G
 
G
E
 
D
F
 
H
T
 
L
G
 
G
A
 
A
F
 
F
A
 
A
L
|
L
T
|
T
E
 
E
P
 
P
D
 
H
A
 
S
G
|
G
S
|
S
D
 
D
A
 
A
T
 
G
A
 
S
L
 
L
R
 
R
T
 
T
T
 
T
A
 
A
R
 
I
R
 
K
D
 
K
G
 
N
D
 
G
H
 
K
Y
 
Y
I
 
L
L
 
L
D
 
N
G
 
G
S
 
S
K
 
K
C
 
I
F
|
F
I
 
I
T
|
T
N
 
N
A
 
G
P
 
G
I
 
A
A
 
A
D
 
D
L
 
I
F
 
Y
T
 
I
V
 
T
M
 
F
A
 
A
R
 
L
T
 
T
E
 
A
L
 
-
A
 
P
K
 
D
P
 
Q
G
 
G
A
 
R
G
 
H
G
 
G
I
 
I
S
 
S
A
 
A
F
 
F
L
 
I
V
 
V
E
 
E
R
 
K
G
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
G
L
 
F
S
 
T
T
 
V
S
 
G
A
 
K
P
 
K
Y
 
E
D
 
R
K
 
K
M
 
L
G
 
G
Q
 
L
A
 
Y
G
 
G
S
 
S
P
 
N
V
 
T
G
 
T
D
 
E
V
 
L
V
 
I
F
 
F
E
 
D
G
 
N
C
 
A
R
 
E
V
 
V
P
 
P
A
 
E
A
 
A
N
 
N
L
 
L
I
 
L
G
 
-
G
 
G
K
 
K
E
 
E
G
 
G
M
 
D
G
 
G
F
 
F
R
 
H
T
 
I
A
 
A
M
 
M
K
 
A
V
 
N
L
 
L
N
 
N
K
 
V
Q
x
G
R
 
R
I
 
I
H
 
G
L
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
Q
C
 
A
T
 
L
G
 
G
P
 
I
A
 
A
M
 
E
R
 
A
M
 
A
L
 
L
E
 
E
E
 
H
A
 
A
V
 
V
A
 
D
Y
 
Y
T
 
A
S
 
K
R
 
Q
R
|
R
E
 
V
Q
|
Q
F
|
F
G
 
G
K
 
R
P
 
P
V
x
I
A
 
A
E
 
A
F
x
N
Q
 
Q
L
 
G
V
x
I
Q
 
S
A
 
F
L
 
K
I
 
L
A
 
A
E
 
D
C
 
M
Q
 
A
T
 
T
E
 
R
I
 
A
Y
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
R
S
 
H
M
 
L
I
 
V
L
 
Y
E
 
H
T
 
A
A
 
A
R
 
D
K
 
L
R
 
H
D
 
N
A
 
R
G
 
-
E
 
L
D
 
N
V
 
C
A
 
G
L
 
K
E
 
E
A
 
A
S
 
S
M
 
M
C
 
A
K
 
K
M
 
Q
F
 
F
A
 
A
S
 
S
E
 
D
M
 
A
C
 
A
G
 
V
R
 
K
V
 
A
A
 
L
D
 
D
R
 
-
A
 
A
V
 
V
Q
|
Q
M
x
I
L
 
Y
G
 
G
G
|
G
R
 
Y
G
 
G
Y
 
Y
L
 
M
A
 
K
G
 
D
N
 
Y
A
 
P
V
 
V
E
 
E
R
 
R
F
 
L
Y
 
L
R
 
R
D
 
D
V
 
A
R
 
K
A
 
V
F
 
T
R
 
Q
I
 
I
Y
|
Y
E
|
E
G
 
G
T
|
T
T
 
N
Q
x
E
I
 
I
H
 
Q
Q
 
R
L
 
L
N
 
I
I
 
I
A
 
S
K
|
K
I
 
Y
T
 
L
L
 
L

6fahD Molecular basis of the flavin-based electron-bifurcating caffeyl-coa reductase reaction (see paper)
38% identity, 91% coverage: 18:371/388 of query aligns to 28:379/379 of 6fahD

query
sites
6fahD
N
 
D
E
 
E
I
 
V
E
 
E
Q
 
E
A
 
S
D
 
G
A
 
E
V
 
F
P
 
P
A
 
Q
D
 
E
L
 
I
V
 
L
Q
 
D
R
 
K
M
 
M
R
 
A
E
 
K
L
 
F
G
 
G
Y
 
F
F
 
F
G
 
G
W
 
I
S
 
K
I
 
I
P
 
P
R
 
K
D
 
S
F
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
S
G
 
G
L
 
G
S
 
D
T
 
H
E
 
M
Q
 
S
L
 
Y
V
 
V
R
 
I
G
 
C
A
 
M
F
 
E
E
 
E
L
 
F
S
 
A
Q
 
R
A
 
V
S
 
S
V
 
G
A
 
V
F
 
A
R
 
S
A
 
V
R
 
Y
V
 
L
G
 
S
T
 
S
N
 
P
T
 
N
G
 
S
I
 
L
G
 
A
S
 
G
E
 
G
A
 
P
L
 
L
V
 
L
A
 
L
D
 
S
G
 
G
T
 
T
D
 
E
T
 
E
Q
 
Q
K
 
I
Q
 
E
R
 
K
Y
 
Y
L
 
L
P
 
K
R
 
P
L
 
I
A
 
I
S
 
T
G
 
G
E
 
K
F
 
K
T
 
K
G
 
L
A
 
A
F
|
F
A
 
A
L
|
L
T
|
T
E
 
E
P
 
P
D
 
G
A
 
A
G
 
G
S
 
S
D
 
D
A
 
A
T
 
G
A
 
G
L
 
M
R
 
S
T
 
T
T
 
T
A
 
A
R
 
V
R
 
D
D
 
M
G
 
G
D
 
D
H
 
Y
Y
 
Y
I
 
L
L
 
L
D
 
N
G
 
G
S
x
R
K
 
K
C
 
T
F
|
F
I
 
I
T
|
T
N
 
M
A
 
A
P
 
P
I
 
L
A
 
C
D
 
D
L
 
D
F
 
A
T
 
V
V
 
I
M
 
Y
A
 
A
R
 
K
T
 
T
E
 
D
L
 
M
A
 
S
K
 
K
P
 
-
G
 
G
A
 
T
G
 
R
G
 
G
I
 
I
S
 
S
A
 
A
F
 
F
L
 
I
V
 
V
E
 
D
R
 
L
G
 
K
T
 
S
P
 
E
G
 
G
L
 
V
S
 
S
T
 
M
S
 
G
A
 
K
P
 
N
Y
x
E
D
 
H
K
 
K
M
 
M
G
 
G
Q
 
L
A
 
I
G
 
G
S
 
C
P
 
A
V
 
T
G
 
S
D
 
D
V
 
I
V
 
I
F
 
M
E
 
E
G
 
D
C
 
V
R
 
K
V
 
V
P
 
P
A
 
K
A
 
E
N
 
N
L
 
R
I
 
L
G
 
G
G
 
-
K
 
E
E
 
V
G
 
N
M
 
K
G
 
G
F
 
F
R
 
S
T
 
N
A
 
A
M
 
M
K
 
K
V
 
T
L
 
L
N
 
D
K
 
V
Q
x
G
R
 
R
I
 
L
H
 
G
L
 
V
A
 
A
A
 
S
L
 
Q
C
 
S
T
 
I
G
 
G
P
 
V
A
 
A
M
 
Q
R
 
G
M
 
A
L
 
L
E
 
D
E
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
K
Y
 
Y
T
 
A
S
 
K
R
 
E
R
|
R
E
 
K
Q
|
Q
F
|
F
G
 
G
K
 
K
P
 
R
V
x
I
A
 
A
E
 
D
F
|
F
Q
 
Q
L
 
A
V
 
I
Q
 
A
A
 
F
L
 
M
I
 
I
A
 
A
E
 
D
C
 
M
Q
 
A
T
 
T
E
 
K
I
 
L
Y
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
K
S
 
L
M
 
L
I
 
V
L
 
Y
E
 
N
T
 
A
A
 
A
R
 
S
K
 
L
R
 
M
D
 
D
A
 
N
G
 
K
E
 
K
D
 
N
V
 
A
A
 
T
L
 
K
E
 
E
A
 
A
S
 
S
M
 
M
C
 
A
K
 
K
M
 
F
F
 
Y
A
 
A
S
 
S
E
 
E
M
 
I
C
 
C
G
 
N
R
 
E
V
 
I
A
 
C
D
 
A
R
 
K
A
 
A
V
 
V
Q
|
Q
M
x
I
L
 
H
G
 
G
G
|
G
R
 
Y
G
 
G
Y
 
Y
L
 
I
A
 
K
G
 
E
N
 
Y
A
 
K
V
 
V
E
 
E
R
 
R
F
 
M
Y
 
Y
R
 
R
D
 
D
V
 
C
R
 
R
A
 
V
F
 
F
R
 
T
I
 
I
Y
|
Y
E
 
E
G
 
G
T
|
T
T
 
S
Q
|
Q
I
 
V
H
 
Q
Q
 
Q
L
 
M
N
 
V
I
 
I
A
 
S
K
x
G
I
 
M
T
 
L
L
 
L
R
 
K
R
 
K

4l1fA Electron transferring flavoprotein of acidaminococcus fermentans: towards a mechanism of flavin-based electron bifurcation (see paper)
39% identity, 94% coverage: 6:370/388 of query aligns to 17:379/380 of 4l1fA

query
sites
4l1fA
A
 
A
K
 
E
F
 
F
V
 
A
R
 
E
D
 
K
E
 
F
A
 
L
I
 
A
P
 
P
R
 
T
E
 
V
N
 
E
E
 
E
I
 
R
E
 
D
Q
 
K
A
 
A
D
 
H
A
 
I
V
 
W
P
 
D
A
 
R
D
 
K
L
 
L
V
 
I
Q
 
D
R
 
K
M
 
M
R
 
G
E
 
E
L
 
A
G
 
G
Y
 
F
F
 
C
G
 
G
W
 
I
S
 
C
I
 
F
P
 
P
R
 
E
D
 
E
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
 
M
G
 
G
L
 
L
S
 
D
T
 
V
E
 
L
Q
 
S
L
 
Y
V
 
I
R
 
L
G
 
A
A
 
V
F
 
E
E
 
E
L
 
L
S
 
S
Q
 
K
A
 
V
S
 
D
V
 
D
A
 
G
F
 
T
R
 
G
A
 
I
R
 
T
V
 
L
G
 
S
T
 
A
N
 
N
T
 
V
G
 
S
I
 
L
G
 
C
S
 
A
E
 
T
A
 
P
L
 
I
V
 
Y
A
 
M
D
 
F
G
 
G
T
 
T
D
 
E
T
 
E
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
R
 
K
Y
 
Y
L
 
L
P
 
A
R
 
P
L
 
I
A
 
A
S
 
E
G
 
G
E
 
T
F
 
H
T
 
V
G
 
G
A
 
A
F
|
F
A
 
G
L
|
L
T
|
T
E
 
E
P
 
P
D
 
S
A
 
A
G
|
G
S
x
T
D
 
D
A
 
A
T
 
S
A
 
A
L
 
Q
R
 
Q
T
 
T
T
 
T
A
 
A
R
 
V
R
 
L
D
 
K
G
 
G
D
 
D
H
 
K
Y
 
Y
I
 
I
L
 
L
D
 
N
G
 
G
S
 
S
K
 
K
C
 
I
F
|
F
I
|
I
T
|
T
N
 
N
A
 
G
P
 
K
I
 
E
A
 
A
D
 
D
L
 
T
F
 
Y
T
 
V
V
 
V
M
 
F
A
 
A
R
 
M
T
 
T
E
 
D
L
 
K
A
 
S
K
 
Q
P
 
-
G
 
G
A
 
V
G
x
H
G
 
G
I
 
I
S
 
S
A
 
A
F
 
F
L
 
I
V
 
L
E
 
E
R
 
K
G
 
G
T
 
M
P
 
P
G
 
G
L
 
F
S
 
R
T
 
F
S
 
G
A
 
K
P
 
I
Y
 
E
D
 
D
K
 
K
M
 
M
G
 
G
Q
 
G
A
 
H
G
 
T
S
 
S
P
 
I
V
 
T
G
 
A
D
 
E
V
 
L
V
 
I
F
 
F
E
 
E
G
 
D
C
 
C
R
 
E
V
 
V
P
 
P
A
 
K
A
 
E
N
 
N
L
 
L
I
 
L
G
 
G
G
 
-
K
 
K
E
 
E
G
 
G
M
 
E
G
 
G
F
|
F
R
 
K
T
 
I
A
 
A
M
|
M
K
x
E
V
 
T
L
|
L
N
x
D
K
 
G
Q
x
G
R
|
R
I
 
I
H
 
G
L
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
Q
C
 
A
T
 
L
G
 
G
P
 
I
A
 
A
M
 
E
R
 
G
M
 
A
L
 
L
E
 
A
E
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
K
Y
 
Y
T
 
S
S
 
K
R
 
E
R
|
R
E
 
E
Q
|
Q
F
|
F
G
 
G
K
 
R
P
 
S
V
x
I
A
 
S
E
 
K
F
|
F
Q
 
Q
L
 
A
V
x
L
Q
 
Q
A
 
F
L
 
M
I
 
M
A
 
A
E
 
D
C
 
M
Q
 
A
T
 
T
E
 
K
I
 
I
Y
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
R
S
 
Y
M
 
L
I
 
V
L
 
Y
E
 
H
T
 
A
A
 
A
R
 
M
K
 
L
R
 
K
D
 
N
A
 
E
G
 
G
E
 
K
D
 
P
V
 
Y
A
 
S
L
 
E
E
 
A
A
 
A
S
 
A
M
 
M
C
 
A
K
 
K
M
 
C
F
 
F
A
 
A
S
 
S
E
 
D
M
 
V
C
 
A
G
 
M
R
 
E
V
 
V
A
 
T
D
 
T
R
 
D
A
 
A
V
 
V
Q
|
Q
M
x
I
L
 
F
G
 
G
G
|
G
R
 
Y
G
 
G
Y
 
Y
L
 
T
A
 
V
G
 
D
N
 
Y
A
 
P
V
 
A
E
 
E
R
 
R
F
 
Y
Y
 
M
R
 
R
D
 
N
V
 
A
R
 
K
A
x
I
F
 
T
R
 
Q
I
 
I
Y
|
Y
E
|
E
G
|
G
T
|
T
T
 
N
Q
|
Q
I
 
V
H
 
M
Q
 
R
L
 
I
N
 
V
I
 
T
A
 
S
K
x
R
I
 
A
T
 
L
L
 
L
R
 
R

Sites not aligning to the query:

1ivhA Structure of human isovaleryl-coa dehydrogenase at 2.6 angstroms resolution: structural basis for substrate specificity (see paper)
36% identity, 93% coverage: 5:366/388 of query aligns to 19:382/387 of 1ivhA

query
sites
1ivhA
V
 
M
A
 
A
K
 
K
F
 
F
V
 
L
R
 
Q
D
 
E
E
 
H
A
 
L
I
 
A
P
 
P
R
 
K
E
 
A
N
 
Q
E
 
E
I
 
I
E
 
D
Q
 
R
A
 
S
D
 
N
A
 
E
V
 
F
P
 
K
A
 
N
-
 
L
-
 
R
D
 
E
L
 
F
V
 
W
Q
 
K
R
 
Q
M
 
L
R
 
G
E
 
N
L
 
L
G
 
G
Y
 
V
F
 
L
G
 
G
W
 
I
S
 
T
I
 
A
P
 
P
R
 
V
D
 
Q
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
 
S
G
 
G
L
 
L
S
 
G
T
 
Y
E
 
L
Q
 
E
L
 
H
V
 
V
R
 
L
G
 
V
A
 
M
F
 
E
E
 
E
L
 
I
S
 
S
Q
 
R
A
 
A
S
 
S
V
 
G
A
 
A
F
 
V
R
 
G
A
 
L
R
 
S
V
 
Y
G
 
G
T
 
A
N
 
H
T
 
S
G
 
N
I
 
L
G
 
C
S
 
I
E
 
N
A
 
Q
L
 
L
V
 
V
A
 
R
D
 
N
G
 
G
T
 
N
D
 
E
T
 
A
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
E
R
 
K
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
R
 
K
L
 
L
A
 
I
S
 
S
G
 
G
E
 
E
F
 
Y
T
 
I
G
 
G
A
 
A
F
x
L
A
 
A
L
x
M
T
x
S
E
 
E
P
 
P
D
 
N
A
 
A
G
|
G
S
|
S
D
 
D
A
 
V
T
 
V
A
 
S
L
 
M
R
 
K
T
 
L
T
 
K
A
 
A
R
 
E
R
 
K
D
 
K
G
 
G
D
 
N
H
 
H
Y
 
Y
I
 
I
L
 
L
D
 
N
G
 
G
S
 
N
K
 
K
C
 
F
F
x
W
I
 
I
T
|
T
N
 
N
A
 
G
P
 
P
I
 
D
A
 
A
D
 
D
L
 
V
F
 
L
T
 
I
V
 
V
M
 
Y
A
 
A
R
 
K
T
 
T
E
 
D
L
 
L
A
 
A
K
 
A
-
 
V
P
 
P
G
 
A
A
x
S
G
x
R
G
 
G
I
 
I
S
 
T
A
 
A
F
 
F
L
 
I
V
 
V
E
 
E
R
 
K
G
 
G
T
 
M
P
 
P
G
 
G
L
 
F
S
 
S
T
 
T
S
 
S
A
 
K
P
 
K
Y
 
L
D
 
D
K
 
K
M
 
L
G
 
G
Q
 
M
A
 
R
G
 
G
S
 
S
P
 
N
V
 
T
G
 
C
D
 
E
V
 
L
V
 
I
F
 
F
E
 
E
G
 
D
C
 
C
R
 
K
V
 
I
P
 
P
A
 
A
A
 
A
N
 
N
L
 
I
I
 
L
G
 
-
G
 
G
K
 
H
E
 
E
G
 
N
M
 
K
G
 
G
F
x
V
R
x
Y
T
 
V
A
 
L
M
|
M
K
 
S
V
 
G
L
 
L
N
 
D
K
 
L
Q
x
E
R
|
R
I
 
L
H
 
V
L
 
L
A
 
A
A
 
G
L
 
G
C
 
P
T
 
L
G
 
G
P
 
L
A
 
M
M
 
Q
R
 
A
M
 
V
L
 
L
E
 
D
E
 
H
A
 
T
V
 
I
A
 
P
Y
 
Y
T
 
L
S
 
H
R
 
V
R
|
R
E
 
E
Q
 
A
F
|
F
G
 
G
K
 
Q
P
 
K
V
 
I
A
 
G
E
 
H
F
|
F
Q
 
Q
L
 
L
V
x
M
Q
 
Q
A
 
G
L
 
K
I
 
M
A
 
A
E
 
D
C
 
M
Q
 
Y
T
 
T
E
 
R
I
 
L
Y
 
M
A
 
A
A
 
C
R
 
R
S
 
Q
M
 
Y
I
 
V
L
 
Y
E
 
N
T
 
V
A
 
A
R
 
K
K
 
A
R
 
C
D
 
D
A
 
E
G
 
G
E
 
H
D
 
C
V
 
T
A
 
A
L
 
K
E
 
D
A
 
C
S
 
A
M
 
G
C
 
V
K
 
I
M
 
L
F
 
Y
A
 
S
S
 
A
E
 
E
M
 
C
C
 
A
G
 
T
R
 
Q
V
 
V
A
 
A
D
 
L
R
 
D
A
 
G
V
 
I
Q
|
Q
M
x
C
L
 
F
G
 
G
G
|
G
R
 
N
G
 
G
Y
 
Y
L
 
I
A
 
N
G
 
D
N
 
F
A
 
P
V
 
M
E
 
G
R
 
R
F
 
F
Y
 
L
R
 
R
D
 
D
V
 
A
R
 
K
A
 
L
F
 
Y
R
 
E
I
 
I
Y
x
G
E
x
A
G
|
G
T
|
T
T
 
S
Q
x
E
I
x
V
H
 
R
Q
 
R
L
 
L
N
 
V
I
 
I
A
 
G
K
x
R

8sgrA Human liver mitochondrial isovaleryl-coa dehydrogenase (see paper)
36% identity, 93% coverage: 5:366/388 of query aligns to 23:386/393 of 8sgrA

query
sites
8sgrA
V
 
M
A
 
A
K
 
K
F
 
F
V
 
L
R
 
Q
D
 
E
E
 
H
A
 
L
I
 
A
P
 
P
R
 
K
E
 
A
N
 
Q
E
 
E
I
 
I
E
 
D
Q
 
R
A
 
S
D
 
N
A
 
E
V
 
F
P
 
K
A
 
N
-
 
L
-
 
R
D
 
E
L
 
F
V
 
W
Q
 
K
R
 
Q
M
 
L
R
 
G
E
 
N
L
 
L
G
 
G
Y
 
V
F
 
L
G
 
G
W
 
I
S
 
T
I
 
A
P
 
P
R
 
V
D
 
Q
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
 
S
G
 
G
L
 
L
S
 
G
T
 
Y
E
 
L
Q
 
E
L
 
H
V
 
V
R
 
L
G
 
V
A
 
M
F
 
E
E
 
E
L
 
I
S
 
S
Q
 
R
A
 
A
S
 
S
V
 
G
A
 
A
F
 
V
R
 
G
A
 
L
R
 
S
V
 
Y
G
 
G
T
 
A
N
 
H
T
 
S
G
 
N
I
 
L
G
 
C
S
 
I
E
 
N
A
 
Q
L
 
L
V
 
V
A
 
R
D
 
N
G
 
G
T
 
N
D
 
E
T
 
A
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
E
R
 
K
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
R
 
K
L
 
L
A
 
I
S
 
S
G
 
G
E
 
E
F
 
Y
T
 
I
G
 
G
A
 
A
F
 
L
A
 
A
L
 
M
T
x
S
E
 
E
P
 
P
D
 
N
A
 
A
G
|
G
S
|
S
D
 
D
A
 
V
T
 
V
A
 
S
L
 
M
R
 
K
T
 
L
T
 
K
A
 
A
R
 
E
R
 
K
D
 
K
G
 
G
D
 
N
H
 
H
Y
 
Y
I
 
I
L
 
L
D
 
N
G
 
G
S
 
N
K
 
K
C
 
F
F
x
W
I
 
I
T
|
T
N
 
N
A
 
G
P
 
P
I
 
D
A
 
A
D
 
D
L
 
V
F
 
L
T
 
I
V
 
V
M
 
Y
A
 
A
R
 
K
T
 
T
E
 
D
L
 
L
A
 
A
K
 
A
-
 
V
P
 
P
G
 
A
A
 
S
G
 
R
G
 
G
I
 
I
S
 
T
A
 
A
F
 
F
L
 
I
V
 
V
E
 
E
R
 
K
G
 
G
T
 
M
P
 
P
G
 
G
L
 
F
S
 
S
T
 
T
S
 
S
A
 
K
P
 
K
Y
 
L
D
 
D
K
 
K
M
 
L
G
 
G
Q
 
M
A
 
R
G
 
G
S
 
S
P
 
N
V
 
T
G
 
C
D
 
E
V
 
L
V
 
I
F
 
F
E
 
E
G
 
D
C
 
C
R
 
K
V
 
I
P
 
P
A
 
A
A
 
A
N
 
N
L
 
I
I
 
L
G
 
-
G
 
G
K
 
H
E
 
E
G
 
N
M
 
K
G
 
G
F
 
V
R
 
Y
T
 
V
A
 
L
M
 
M
K
 
S
V
 
G
L
 
L
N
 
D
K
 
L
Q
 
E
R
 
R
I
 
L
H
 
V
L
 
L
A
 
A
A
 
G
L
 
G
C
 
P
T
 
L
G
 
G
P
 
L
A
 
M
M
 
Q
R
 
A
M
 
V
L
 
L
E
 
D
E
 
H
A
 
T
V
 
I
A
 
P
Y
 
Y
T
 
L
S
 
H
R
 
V
R
|
R
E
 
E
Q
 
A
F
|
F
G
 
G
K
 
Q
P
 
K
V
x
I
A
 
G
E
 
H
F
|
F
Q
 
Q
L
 
L
V
 
M
Q
 
Q
A
 
G
L
 
K
I
 
M
A
 
A
E
 
D
C
 
M
Q
 
Y
T
 
T
E
 
R
I
 
L
Y
 
M
A
 
A
A
 
C
R
 
R
S
 
Q
M
 
Y
I
 
V
L
 
Y
E
 
N
T
 
V
A
 
A
R
 
K
K
 
A
R
 
C
D
 
D
A
 
E
G
 
G
E
 
H
D
 
C
V
 
T
A
 
A
L
 
K
E
 
D
A
 
C
S
 
A
M
 
G
C
 
V
K
 
I
M
 
L
F
 
Y
A
 
S
S
 
A
E
 
E
M
 
C
C
 
A
G
 
T
R
 
Q
V
 
V
A
 
A
D
 
L
R
 
D
A
 
G
V
 
I
Q
|
Q
M
x
C
L
 
F
G
 
G
G
|
G
R
 
N
G
 
G
Y
 
Y
L
 
I
A
 
N
G
 
D
N
 
F
A
 
P
V
 
M
E
 
G
R
 
R
F
 
F
Y
 
L
R
 
R
D
 
D
V
 
A
R
 
K
A
x
L
F
 
Y
R
 
E
I
 
I
Y
 
G
E
 
A
G
|
G
T
|
T
T
 
S
Q
 
E
I
 
V
H
 
R
Q
 
R
L
|
L
N
 
V
I
 
I
A
 
G
K
 
R

P26440 Isovaleryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial; IVD; Butyryl-CoA dehydrogenase; EC 1.3.8.4; EC 1.3.8.1 from Homo sapiens (Human) (see 5 papers)
36% identity, 93% coverage: 5:366/388 of query aligns to 56:419/426 of P26440

query
sites
P26440
V
 
M
A
 
A
K
 
K
F
 
F
V
 
L
R
 
Q
D
 
E
E
 
H
A
 
L
I
 
A
P
 
P
R
 
K
E
 
A
N
 
Q
E
 
E
I
 
I
E
 
D
Q
 
R
A
 
S
D
 
N
A
 
E
V
 
F
P
 
K
A
 
N
-
 
L
-
 
R
D
 
E
L
 
F
V
 
W
Q
 
K
R
 
Q
M
 
L
R
 
G
E
 
N
L
 
L
G
 
G
Y
 
V
F
 
L
G
 
G
W
 
I
S
 
T
I
 
A
P
 
P
R
 
V
D
 
Q
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
 
S
G
 
G
L
 
L
S
 
G
T
 
Y
E
 
L
Q
 
E
L
 
H
V
 
V
R
 
L
G
 
V
A
 
M
F
 
E
E
 
E
L
 
I
S
 
S
Q
 
R
A
 
A
S
 
S
V
 
G
A
 
A
F
 
V
R
 
G
A
 
L
R
 
S
V
 
Y
G
 
G
T
 
A
N
 
H
T
 
S
G
 
N
I
 
L
G
 
C
S
 
I
E
 
N
A
 
Q
L
 
L
V
 
V
A
 
R
D
 
N
G
 
G
T
 
N
D
 
E
T
 
A
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
E
R
 
K
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
R
 
K
L
 
L
A
 
I
S
 
S
G
 
G
E
 
E
F
 
Y
T
 
I
G
 
G
A
 
A
F
x
L
A
|
A
L
x
M
T
x
S
E
|
E
P
|
P
D
x
N
A
|
A
G
|
G
S
|
S
D
 
D
A
 
V
T
 
V
A
 
S
L
 
M
R
 
K
T
 
L
T
 
K
A
 
A
R
 
E
R
 
K
D
 
K
G
 
G
D
 
N
H
 
H
Y
 
Y
I
 
I
L
 
L
D
 
N
G
 
G
S
 
N
K
 
K
C
 
F
F
x
W
I
|
I
T
|
T
N
 
N
A
 
G
P
 
P
I
 
D
A
 
A
D
 
D
L
 
V
F
 
L
T
 
I
V
 
V
M
 
Y
A
 
A
R
 
K
T
 
T
E
 
D
L
 
L
A
 
A
K
 
A
-
 
V
P
 
P
G
 
A
A
x
S
G
x
R
G
 
G
I
 
I
S
 
T
A
 
A
F
 
F
L
 
I
V
 
V
E
 
E
R
 
K
G
 
G
T
 
M
P
 
P
G
 
G
L
 
F
S
 
S
T
 
T
S
 
S
A
 
K
P
 
K
Y
 
L
D
 
D
K
 
K
M
 
L
G
 
G
Q
 
M
A
 
R
G
|
G
S
 
S
P
 
N
V
 
T
G
 
C
D
 
E
V
 
L
V
 
I
F
 
F
E
 
E
G
 
D
C
 
C
R
 
K
V
 
I
P
 
P
A
 
A
A
 
A
N
 
N
L
 
I
I
 
L
G
 
-
G
 
G
K
 
H
E
 
E
G
 
N
M
 
K
G
 
G
F
 
V
R
x
Y
T
 
V
A
 
L
M
 
M
K
 
S
V
 
G
L
 
L
N
x
D
K
x
L
Q
x
E
R
|
R
I
 
L
H
 
V
L
 
L
A
|
A
A
 
G
L
 
G
C
 
P
T
 
L
G
 
G
P
 
L
A
 
M
M
 
Q
R
 
A
M
 
V
L
 
L
E
 
D
E
 
H
A
 
T
V
 
I
A
 
P
Y
 
Y
T
 
L
S
 
H
R
 
V
R
|
R
E
 
E
Q
 
A
F
 
F
G
 
G
K
 
Q
P
 
K
V
 
I
A
 
G
E
 
H
F
 
F
Q
|
Q
L
 
L
V
 
M
Q
 
Q
A
 
G
L
 
K
I
 
M
A
 
A
E
 
D
C
 
M
Q
 
Y
T
 
T
E
 
R
I
 
L
Y
 
M
A
 
A
A
 
C
R
 
R
S
 
Q
M
 
Y
I
 
V
L
 
Y
E
 
N
T
 
V
A
 
A
R
 
K
K
 
A
R
 
C
D
 
D
A
 
E
G
 
G
E
 
H
D
 
C
V
 
T
A
 
A
L
 
K
E
 
D
A
 
C
S
 
A
M
 
G
C
 
V
K
 
I
M
 
L
F
 
Y
A
 
S
S
 
A
E
 
E
M
 
C
C
 
A
G
 
T
R
 
Q
V
 
V
A
 
A
D
 
L
R
 
D
A
 
G
V
x
I
Q
|
Q
M
x
C
L
x
F
G
|
G
G
|
G
R
 
N
G
 
G
Y
 
Y
L
 
I
A
 
N
G
 
D
N
 
F
A
 
P
V
 
M
E
 
G
R
 
R
F
 
F
Y
 
L
R
|
R
D
 
D
V
 
A
R
 
K
A
 
L
F
x
Y
R
 
E
I
 
I
Y
 
G
E
x
A
G
|
G
T
|
T
T
x
S
Q
x
E
I
 
V
H
 
R
Q
 
R
L
 
L
N
 
V
I
 
I
A
 
G
K
 
R

Sites not aligning to the query:

2uxwA Crystal structure of human very long chain acyl-coa dehydrogenase (acadvl)
38% identity, 93% coverage: 5:365/388 of query aligns to 41:405/567 of 2uxwA

query
sites
2uxwA
V
 
V
A
 
S
K
 
R
F
 
F
V
 
F
R
 
E
D
 
E
E
 
V
A
 
N
I
 
D
P
 
P
R
 
A
E
 
K
N
 
N
E
 
D
I
 
-
E
 
-
Q
 
A
A
 
L
D
 
E
A
 
M
V
 
V
P
 
E
A
 
E
D
 
T
L
 
T
V
 
W
Q
 
Q
R
 
G
M
 
L
R
 
K
E
 
E
L
 
L
G
 
G
Y
 
A
F
 
F
G
 
G
W
 
L
S
 
Q
I
 
V
P
 
P
R
 
S
D
 
E
F
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
C
T
 
N
E
 
T
Q
 
Q
L
 
Y
V
 
A
R
 
R
G
 
L
A
x
V
F
 
E
E
 
I
L
 
V
S
 
G
Q
 
M
A
 
H
S
 
D
V
 
L
A
 
G
F
 
V
R
x
G
A
 
I
R
 
T
V
x
L
G
 
G
T
 
A
N
 
H
T
 
Q
G
 
S
I
 
I
G
 
G
S
 
F
E
 
K
A
 
G
L
 
I
V
 
L
A
 
L
D
 
F
G
 
G
T
 
T
D
 
K
T
 
A
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
E
R
 
K
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
R
 
K
L
 
L
A
 
A
S
 
S
G
 
G
E
 
E
F
 
T
T
 
V
G
 
A
A
 
A
F
|
F
A
 
C
L
|
L
T
|
T
E
 
E
P
 
P
D
 
S
A
 
S
G
|
G
S
|
S
D
 
D
A
 
A
T
 
A
A
 
S
L
 
I
R
 
R
T
 
T
T
 
S
A
 
A
R
 
V
R
 
P
D
 
S
-
 
P
-
 
C
G
 
G
D
 
K
H
 
Y
Y
 
Y
I
 
T
L
 
L
D
 
N
G
 
G
S
 
S
K
 
K
C
 
L
F
x
W
I
|
I
T
x
S
N
 
N
A
 
G
P
 
G
I
 
L
A
 
A
D
 
D
L
 
I
F
 
F
T
 
T
V
 
V
M
 
F
A
 
A
R
 
K
T
 
T
E
 
P
L
 
V
A
 
T
K
 
D
P
 
P
G
 
A
A
 
T
G
 
G
G
 
A
-
 
V
-
 
K
-
 
E
-
 
K
I
 
I
S
 
T
A
 
A
F
 
F
L
 
V
V
 
V
E
 
E
R
 
R
G
 
G
T
 
F
P
 
G
G
 
G
L
 
I
S
 
T
T
 
H
S
 
G
A
 
P
P
 
P
Y
 
E
D
 
K
K
 
K
M
 
M
G
 
G
Q
 
I
A
 
K
G
 
A
S
 
S
P
 
N
V
 
T
G
 
A
D
 
E
V
 
V
V
 
F
F
 
F
E
 
D
G
 
G
C
 
V
R
 
R
V
 
V
P
 
P
A
 
S
A
 
E
N
 
N
L
 
V
I
 
L
G
 
-
G
 
G
K
 
E
E
 
V
G
 
G
M
 
S
G
 
G
F
 
F
R
 
K
T
 
V
A
 
A
M
 
M
K
 
H
V
 
I
L
|
L
N
 
N
K
 
N
Q
x
G
R
 
R
I
 
F
H
 
G
L
 
M
A
 
A
A
 
A
L
 
A
C
 
L
T
 
A
G
 
G
P
 
T
A
 
M
M
 
R
R
 
G
M
 
I
L
 
I
E
 
A
E
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
D
Y
 
H
T
 
A
S
 
T
R
 
N
R
 
R
E
 
T
Q
 
Q
F
 
F
G
 
G
K
 
E
P
 
K
V
 
I
A
 
H
E
 
N
F
 
F
Q
 
G
L
 
L
V
 
I
Q
 
Q
A
 
E
L
 
K
I
 
L
A
 
A
E
 
R
C
 
M
Q
 
V
T
 
M
E
 
L
I
 
Q
Y
 
Y
A
 
V
A
 
T
R
 
E
S
 
S
M
 
M
I
 
A
L
 
Y
E
 
M
T
 
V
A
 
S
R
 
A
K
 
N
R
 
M
D
 
D
A
 
Q
G
 
G
-
 
A
E
 
T
D
 
D
V
 
F
A
 
Q
L
 
I
E
 
E
A
 
A
S
 
A
M
 
I
C
 
S
K
 
K
M
 
I
F
 
F
A
 
G
S
 
S
E
 
E
M
 
A
C
 
A
G
 
W
R
 
K
V
 
V
A
 
T
D
 
D
R
 
E
A
 
C
V
 
I
Q
 
Q
M
 
I
L
 
M
G
 
G
G
 
G
R
 
M
G
 
G
Y
 
F
L
 
M
A
 
K
G
 
E
N
 
P
A
 
G
V
 
V
E
 
E
R
 
R
F
 
V
Y
 
L
R
 
R
D
 
D
V
 
L
R
 
R
A
 
I
F
 
F
R
 
R
I
 
I
Y
x
F
E
|
E
G
|
G
T
|
T
T
 
N
Q
x
D
I
|
I
H
 
L
Q
 
R
L
 
L
N
 
F
I
 
V
A
 
A

Sites not aligning to the query:

3b96A Structural basis for substrate fatty-acyl chain specificity: crystal structure of human very-long-chain acyl-coa dehydrogenase (see paper)
38% identity, 93% coverage: 5:365/388 of query aligns to 41:405/554 of 3b96A

query
sites
3b96A
V
 
V
A
 
S
K
 
R
F
 
F
V
 
F
R
 
E
D
 
E
E
 
V
A
 
N
I
 
D
P
 
P
R
 
A
E
 
K
N
 
N
E
 
D
I
 
-
E
 
-
Q
 
A
A
 
L
D
 
E
A
 
M
V
 
V
P
 
E
A
 
E
D
 
T
L
 
T
V
 
W
Q
 
Q
R
 
G
M
 
L
R
 
K
E
 
E
L
 
L
G
 
G
Y
 
A
F
 
F
G
 
G
W
 
L
S
 
Q
I
 
V
P
 
P
R
 
S
D
 
E
F
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
C
T
 
N
E
 
T
Q
 
Q
L
 
Y
V
 
A
R
 
R
G
 
L
A
x
V
F
 
E
E
 
I
L
 
V
S
 
G
Q
 
M
A
 
H
S
 
D
V
 
L
A
 
G
F
 
V
R
x
G
A
 
I
R
 
T
V
 
L
G
 
G
T
 
A
N
 
H
T
 
Q
G
 
S
I
 
I
G
 
G
S
 
F
E
 
K
A
 
G
L
 
I
V
 
L
A
 
L
D
 
F
G
 
G
T
 
T
D
 
K
T
 
A
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
E
R
 
K
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
R
 
K
L
 
L
A
 
A
S
 
S
G
 
G
E
 
E
F
 
T
T
 
V
G
 
A
A
 
A
F
|
F
A
 
C
L
|
L
T
|
T
E
 
E
P
 
P
D
 
S
A
 
S
G
|
G
S
|
S
D
 
D
A
 
A
T
 
A
A
 
S
L
 
I
R
 
R
T
 
T
T
 
S
A
 
A
R
 
V
R
 
P
D
 
S
-
 
P
-
 
C
G
 
G
D
 
K
H
 
Y
Y
 
Y
I
 
T
L
 
L
D
 
N
G
 
G
S
 
S
K
 
K
C
 
L
F
x
W
I
|
I
T
x
S
N
 
N
A
 
G
P
 
G
I
 
L
A
 
A
D
 
D
L
 
I
F
 
F
T
 
T
V
 
V
M
 
F
A
 
A
R
 
K
T
 
T
E
 
P
L
 
V
A
 
T
K
 
D
P
 
P
G
 
A
A
 
T
G
 
G
G
 
A
-
 
V
-
 
K
-
 
E
-
 
K
I
 
I
S
 
T
A
 
A
F
 
F
L
 
V
V
 
V
E
 
E
R
 
R
G
 
G
T
 
F
P
 
G
G
 
G
L
 
I
S
 
T
T
 
H
S
 
G
A
 
P
P
 
P
Y
 
E
D
 
K
K
 
K
M
 
M
G
 
G
Q
 
I
A
 
K
G
 
A
S
 
S
P
 
N
V
 
T
G
 
A
D
 
E
V
 
V
V
 
F
F
 
F
E
 
D
G
 
G
C
 
V
R
 
R
V
 
V
P
 
P
A
 
S
A
 
E
N
 
N
L
 
V
I
 
L
G
 
-
G
 
G
K
 
E
E
 
V
G
 
G
M
 
S
G
 
G
F
 
F
R
 
K
T
 
V
A
 
A
M
 
M
K
 
H
V
 
I
L
|
L
N
 
N
K
 
N
Q
x
G
R
 
R
I
 
F
H
 
G
L
 
M
A
 
A
A
 
A
L
 
A
C
 
L
T
 
A
G
 
G
P
 
T
A
 
M
M
 
R
R
 
G
M
 
I
L
 
I
E
 
A
E
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
D
Y
 
H
T
 
A
S
 
T
R
 
N
R
 
R
E
 
T
Q
 
Q
F
 
F
G
 
G
K
 
E
P
 
K
V
 
I
A
 
H
E
 
N
F
 
F
Q
 
G
L
 
L
V
 
I
Q
 
Q
A
 
E
L
 
K
I
 
L
A
 
A
E
 
R
C
 
M
Q
 
V
T
 
M
E
 
L
I
 
Q
Y
 
Y
A
 
V
A
 
T
R
 
E
S
 
S
M
 
M
I
 
A
L
 
Y
E
 
M
T
 
V
A
 
S
R
 
A
K
 
N
R
 
M
D
 
D
A
 
Q
G
 
G
-
 
A
E
 
T
D
 
D
V
 
F
A
 
Q
L
 
I
E
 
E
A
 
A
S
 
A
M
 
I
C
 
S
K
 
K
M
 
I
F
 
F
A
 
G
S
 
S
E
 
E
M
 
A
C
 
A
G
 
W
R
 
K
V
 
V
A
 
T
D
 
D
R
 
E
A
 
C
V
 
I
Q
 
Q
M
 
I
L
 
M
G
 
G
G
 
G
R
 
M
G
 
G
Y
 
F
L
 
M
A
 
K
G
 
E
N
 
P
A
 
G
V
 
V
E
 
E
R
 
R
F
 
V
Y
 
L
R
 
R
D
 
D
V
 
L
R
 
R
A
x
I
F
 
F
R
 
R
I
 
I
Y
x
F
E
|
E
G
 
G
T
|
T
T
 
N
Q
x
D
I
|
I
H
 
L
Q
 
R
L
 
L
N
 
F
I
 
V
A
 
A

Sites not aligning to the query:

7s7gA Crystal structure analysis of human vlcad
38% identity, 93% coverage: 5:365/388 of query aligns to 41:405/571 of 7s7gA

query
sites
7s7gA
V
 
V
A
 
S
K
 
R
F
 
F
V
 
F
R
 
E
D
 
E
E
 
V
A
 
N
I
 
D
P
 
P
R
 
A
E
 
K
N
 
N
E
 
D
I
 
-
E
 
-
Q
 
A
A
 
L
D
 
E
A
 
M
V
 
V
P
 
E
A
 
E
D
 
T
L
 
T
V
 
W
Q
 
Q
R
 
G
M
 
L
R
 
K
E
 
E
L
 
L
G
 
G
Y
 
A
F
 
F
G
 
G
W
 
L
S
 
Q
I
 
V
P
 
P
R
 
S
D
 
E
F
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
C
T
 
N
E
 
T
Q
 
Q
L
 
Y
V
 
A
R
 
R
G
 
L
A
 
V
F
 
E
E
 
I
L
 
V
S
 
G
Q
 
M
A
 
H
S
 
D
V
 
L
A
 
G
F
 
V
R
 
G
A
 
I
R
 
T
V
 
L
G
 
G
T
 
A
N
 
H
T
 
Q
G
 
S
I
 
I
G
 
G
S
 
F
E
 
K
A
 
G
L
 
I
V
 
L
A
 
L
D
 
F
G
 
G
T
 
T
D
 
K
T
 
A
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
E
R
 
K
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
R
 
K
L
 
L
A
 
A
S
 
S
G
 
G
E
 
E
F
 
T
T
 
V
G
 
A
A
 
A
F
|
F
A
 
C
L
|
L
T
|
T
E
 
E
P
 
P
D
 
S
A
 
S
G
|
G
S
|
S
D
 
D
A
 
A
T
 
A
A
 
S
L
 
I
R
 
R
T
 
T
T
 
S
A
 
A
R
 
V
R
 
P
D
 
S
-
 
P
-
 
C
G
 
G
D
 
K
H
 
Y
Y
 
Y
I
 
T
L
 
L
D
 
N
G
 
G
S
 
S
K
 
K
C
 
L
F
x
W
I
|
I
T
x
S
N
 
N
A
 
G
P
 
G
I
 
L
A
 
A
D
 
D
L
 
I
F
 
F
T
 
T
V
 
V
M
 
F
A
 
A
R
 
K
T
 
T
E
 
P
L
 
V
A
 
T
K
 
D
P
 
P
G
 
A
A
 
T
G
 
G
G
 
A
-
 
V
-
 
K
-
 
E
-
 
K
I
 
I
S
 
T
A
 
A
F
 
F
L
 
V
V
 
V
E
 
E
R
 
R
G
 
G
T
 
F
P
 
G
G
 
G
L
 
I
S
 
T
T
 
H
S
 
G
A
 
P
P
 
P
Y
 
E
D
 
K
K
 
K
M
 
M
G
 
G
Q
 
I
A
 
K
G
 
A
S
 
S
P
 
N
V
 
T
G
 
A
D
 
E
V
 
V
V
 
F
F
 
F
E
 
D
G
 
G
C
 
V
R
 
R
V
 
V
P
 
P
A
 
S
A
 
E
N
 
N
L
 
V
I
 
L
G
 
-
G
 
G
K
 
E
E
 
V
G
 
G
M
 
S
G
 
G
F
 
F
R
 
K
T
 
V
A
 
A
M
 
M
K
 
H
V
 
I
L
 
L
N
 
N
K
 
N
Q
 
G
R
 
R
I
 
F
H
 
G
L
 
M
A
 
A
A
 
A
L
 
A
C
 
L
T
 
A
G
 
G
P
 
T
A
 
M
M
 
R
R
 
G
M
 
I
L
 
I
E
 
A
E
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
D
Y
 
H
T
 
A
S
 
T
R
 
N
R
 
R
E
 
T
Q
 
Q
F
 
F
G
 
G
K
 
E
P
 
K
V
 
I
A
 
H
E
 
N
F
 
F
Q
 
G
L
 
L
V
 
I
Q
 
Q
A
 
E
L
 
K
I
 
L
A
 
A
E
 
R
C
 
M
Q
 
V
T
 
M
E
 
L
I
 
Q
Y
 
Y
A
 
V
A
 
T
R
 
E
S
 
S
M
 
M
I
 
A
L
 
Y
E
 
M
T
 
V
A
 
S
R
 
A
K
 
N
R
 
M
D
 
D
A
 
Q
G
 
G
-
 
A
E
 
T
D
 
D
V
 
F
A
 
Q
L
 
I
E
 
E
A
 
A
S
 
A
M
 
I
C
 
S
K
 
K
M
 
I
F
 
F
A
 
G
S
 
S
E
 
E
M
 
A
C
 
A
G
 
W
R
 
K
V
 
V
A
 
T
D
 
D
R
 
E
A
 
C
V
 
I
Q
 
Q
M
 
I
L
 
M
G
 
G
G
 
G
R
 
M
G
 
G
Y
 
F
L
 
M
A
 
K
G
 
E
N
 
P
A
 
G
V
 
V
E
 
E
R
 
R
F
 
V
Y
 
L
R
 
R
D
 
D
V
 
L
R
 
R
A
x
I
F
 
F
R
 
R
I
 
I
Y
 
F
E
 
E
G
 
G
T
|
T
T
 
N
Q
x
D
I
|
I
H
 
L
Q
 
R
L
 
L
N
 
F
I
 
V
A
 
A

Sites not aligning to the query:

P49748 Very long-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial; VLCAD; EC 1.3.8.9 from Homo sapiens (Human) (see 8 papers)
38% identity, 93% coverage: 5:365/388 of query aligns to 109:473/655 of P49748

query
sites
P49748
V
 
V
A
 
S
K
 
R
F
 
F
V
 
F
R
 
E
D
 
E
E
 
V
A
 
N
I
 
D
P
 
P
R
 
A
E
 
K
N
 
N
E
 
D
I
 
-
E
 
-
Q
 
A
A
 
L
D
 
E
A
 
M
V
 
V
P
 
E
A
 
E
D
 
T
L
 
T
V
 
W
Q
 
Q
R
 
G
M
 
L
R
 
K
E
 
E
L
 
L
G
 
G
Y
 
A
F
 
F
G
 
G
W
 
L
S
 
Q
I
 
V
P
 
P
R
 
S
D
 
E
F
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
C
T
 
N
E
 
T
Q
 
Q
L
 
Y
V
 
A
R
 
R
G
 
L
A
 
V
F
 
E
E
 
I
L
 
V
S
 
G
Q
 
M
A
 
H
S
 
D
V
 
L
A
 
G
F
 
V
R
 
G
A
 
I
R
 
T
V
 
L
G
 
G
T
 
A
N
 
H
T
 
Q
G
 
S
I
 
I
G
 
G
S
 
F
E
 
K
A
 
G
L
 
I
V
 
L
A
 
L
D
 
F
G
 
G
T
 
T
D
 
K
T
 
A
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
E
R
 
K
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
R
 
K
L
 
L
A
 
A
S
 
S
G
 
G
E
 
E
F
 
T
T
 
V
G
 
A
A
 
A
F
|
F
A
x
C
L
|
L
T
|
T
E
|
E
P
|
P
D
x
S
A
x
S
G
|
G
S
|
S
D
 
D
A
 
A
T
 
A
A
 
S
L
 
I
R
 
R
T
 
T
T
 
S
A
 
A
R
 
V
R
 
P
D
 
S
-
 
P
-
 
C
G
 
G
D
 
K
H
 
Y
Y
 
Y
I
 
T
L
 
L
D
 
N
G
 
G
S
 
S
K
 
K
C
 
L
F
x
W
I
|
I