SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing BPHYT_RS20960 FitnessBrowser__BFirm:BPHYT_RS20960 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5aovA Ternary crystal structure of pyrococcus furiosus glyoxylate hydroxypyruvate reductase in presence of glyoxylate (see paper)
40% identity, 74% coverage: 73:309/320 of query aligns to 68:310/334 of 5aovA

query
sites
5aovA
V
 
L
K
 
R
I
 
I
I
 
V
A
 
A
N
 
N
A
x
Y
S
x
A
A
x
V
G
|
G
F
 
Y
D
 
D
H
 
N
M
 
I
D
 
D
V
 
V
A
 
E
A
 
E
A
 
A
R
 
T
E
 
R
R
 
R
G
 
G
I
 
I
V
 
Y
V
 
V
T
 
T
N
 
N
A
 
T
P
 
P
D
 
D
A
 
V
L
|
L
T
 
T
E
 
N
C
 
A
T
|
T
A
 
A
D
 
D
F
 
H
S
 
A
L
 
F
L
 
A
L
 
L
V
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
T
C
 
A
R
 
R
R
 
H
A
 
V
S
 
V
E
 
K
Y
 
G
E
 
D
R
 
K
I
 
F
M
 
V
R
 
R
N
 
S
G
 
G
W
 
E
G
 
W
K
 
K
S
 
R
F
 
K
G
 
G
M
 
I
-
 
A
-
 
W
-
 
H
-
 
P
T
 
K
E
 
W
M
 
F
L
 
L
G
 
G
T
 
Y
R
 
E
V
 
L
N
 
Y
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
V
 
V
G
 
G
F
|
F
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
R
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
A
K
 
R
R
 
R
A
 
A
Q
 
K
G
 
G
F
 
F
G
 
N
M
 
M
R
 
R
V
 
I
I
 
L
Y
 
Y
T
 
Y
D
x
S
I
x
R
N
 
T
R
 
R
A
 
K
A
 
S
A
 
Q
S
 
A
L
 
E
E
 
K
N
 
E
G
 
L
A
 
G
T
 
A
F
 
E
Y
 
Y
N
 
R
S
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
M
 
V
L
 
L
P
 
K
H
 
E
C
 
S
Q
 
D
V
 
F
L
 
V
T
 
I
L
 
L
H
x
A
V
|
V
P
|
P
-
 
L
-
 
T
G
 
K
G
 
E
G
x
T
V
 
M
P
 
Y
L
 
M
M
 
I
T
 
N
K
 
E
R
 
E
E
 
R
F
 
L
A
 
K
L
 
L
L
 
M
P
 
K
A
 
P
G
 
T
A
 
A
V
 
I
F
 
L
V
 
V
N
 
N
A
x
I
A
|
A
R
|
R
G
 
G
A
 
K
L
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
D
 
K
A
 
A
L
 
L
Y
 
I
E
 
K
A
 
A
L
 
L
T
 
K
S
 
E
G
 
G
H
 
W
L
 
I
F
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
R
 
E
N
 
E
E
|
E
P
 
P
N
 
Y
V
 
Y
D
 
N
K
 
E
R
 
E
F
 
L
A
 
F
G
 
S
L
 
L
D
 
D
N
 
N
V
 
V
F
 
V
L
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
M
 
I
A
x
G
S
 
S
A
 
A
T
 
T
M
 
F
E
 
E
T
 
A
R
 
R
D
 
E
Q
 
A
M
 
M
G
 
A
F
 
E
T
 
L
A
 
V
L
 
A
D
 
R
N
 
N
V
 
L
A
 
I
A
 
A

Sites not aligning to the query:

6biiA Crystal structure of pyrococcus yayanosii glyoxylate hydroxypyruvate reductase in complex with NADP and malonate (re-refinement of 5aow) (see paper)
43% identity, 75% coverage: 73:312/320 of query aligns to 67:312/332 of 6biiA

query
sites
6biiA
V
 
L
K
 
R
I
 
I
I
 
V
A
 
A
N
 
N
A
 
Y
S
 
A
A
x
V
G
 
G
F
 
Y
D
 
D
H
 
N
M
 
I
D
 
D
V
 
I
A
 
E
A
 
E
A
 
A
R
 
T
E
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
V
 
Y
V
 
V
T
 
T
N
 
N
A
 
T
P
 
P
D
 
D
A
 
V
L
|
L
T
 
T
E
 
D
C
 
A
T
|
T
A
 
A
D
 
D
F
 
L
S
 
A
L
 
W
L
 
A
L
 
L
V
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
A
C
 
A
R
 
R
R
 
H
A
 
V
S
 
V
E
 
K
Y
 
G
E
 
D
R
 
K
I
 
F
M
 
V
R
 
R
N
 
S
G
 
G
W
 
E
G
 
W
K
 
K
S
 
R
F
 
R
G
 
G
M
 
I
-
 
A
-
 
W
-
 
H
-
 
P
T
 
K
E
 
M
M
 
F
L
 
L
G
 
G
T
 
Y
R
 
D
V
 
V
N
 
Y
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
V
 
V
G
|
G
F
|
F
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
R
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
A
K
 
K
R
 
R
A
 
A
Q
 
K
G
 
G
F
 
F
G
 
G
M
 
M
R
 
R
V
 
I
I
 
L
Y
 
Y
T
 
T
D
x
A
I
x
R
N
x
S
R
 
R
A
x
K
A
 
P
-
 
E
A
 
A
S
 
E
L
 
K
E
 
E
N
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
E
F
 
F
Y
 
-
N
 
K
S
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
M
 
L
L
 
L
P
 
R
H
 
E
C
 
S
Q
 
D
V
 
F
L
 
V
T
 
V
L
 
L
H
 
A
V
|
V
P
|
P
-
 
L
-
 
T
G
 
K
G
x
E
G
x
T
V
 
Y
P
 
H
L
 
M
M
 
I
T
 
N
K
 
E
R
 
E
E
 
R
F
 
L
A
 
R
L
 
L
L
 
M
P
 
K
A
 
P
G
 
T
A
 
A
V
 
V
F
 
L
V
 
V
N
 
N
A
x
V
A
|
A
R
|
R
G
 
G
A
 
K
L
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
D
 
K
A
 
A
L
 
L
Y
 
I
E
 
R
A
 
A
L
 
L
T
 
K
S
 
E
G
 
G
H
 
W
L
 
I
F
 
A
G
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
R
 
E
N
 
E
E
|
E
P
 
P
N
 
Y
V
 
Y
D
 
D
K
 
E
R
 
E
F
 
L
A
 
F
G
 
A
L
 
L
D
 
D
N
 
N
V
 
V
F
 
V
L
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
M
 
I
A
x
G
S
 
S
A
 
A
T
 
T
M
 
F
E
 
G
T
 
A
R
 
R
D
 
E
Q
 
G
M
 
M
G
 
A
F
 
E
T
 
L
A
 
V
L
 
A
D
 
K
N
 
N
V
 
L
A
 
I
A
 
A
V
 
F
L
 
K
N
 
N

Q65CJ7 Hydroxyphenylpyruvate reductase; HPPR; EC 1.1.1.237 from Plectranthus scutellarioides (Coleus) (Solenostemon scutellarioides) (see paper)
40% identity, 84% coverage: 52:320/320 of query aligns to 48:312/313 of Q65CJ7

query
sites
Q65CJ7
A
 
A
V
 
V
L
 
V
I
 
G
G
 
N
K
 
S
K
 
N
S
 
A
G
 
G
L
 
A
Q
 
D
A
 
A
E
 
E
H
 
L
I
 
I
A
 
D
A
 
A
L
 
L
P
 
P
S
 
K
T
 
-
V
 
L
K
 
E
I
 
I
I
 
V
A
 
S
N
 
S
A
 
F
S
 
S
A
 
V
G
 
G
F
 
L
D
 
D
H
 
K
M
 
V
D
 
D
V
 
L
A
 
I
A
 
K
A
 
C
R
 
E
E
 
E
R
 
K
G
 
G
I
 
V
V
 
R
V
 
V
T
 
T
N
 
N
A
 
T
P
 
P
D
 
D
A
 
V
L
 
L
T
 
T
E
 
D
C
 
D
T
 
V
A
 
A
D
 
D
F
 
L
S
 
A
L
 
I
L
 
G
L
 
L
V
 
I
L
 
L
A
 
A
A
 
V
C
 
L
R
 
R
R
 
R
A
 
I
S
 
C
E
 
E
Y
 
C
E
 
D
R
 
K
I
 
Y
M
 
V
R
 
R
N
 
R
G
 
G
W
 
A
G
 
W
K
 
K
S
 
-
F
 
F
G
 
G
M
 
D
T
 
F
E
 
K
M
 
-
L
 
L
G
 
T
T
 
T
R
 
K
V
 
F
N
 
S
G
 
G
K
 
K
T
 
R
L
 
V
G
 
G
I
 
I
V
 
I
G
 
G
F
x
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
A
V
 
V
A
 
A
K
 
E
R
 
R
A
 
A
Q
 
E
G
 
A
F
 
F
G
 
D
M
 
C
R
 
P
V
 
I
I
 
S
Y
 
Y
T
 
-
D
 
-
I
 
F
N
x
S
R
|
R
A
x
S
A
 
K
A
 
K
S
 
P
L
 
N
E
 
T
N
 
N
G
 
-
A
 
Y
T
 
T
F
 
Y
Y
 
Y
N
 
G
S
 
S
L
 
V
D
 
V
E
 
E
M
 
L
L
 
A
P
 
S
H
 
N
C
 
S
Q
 
D
V
 
I
L
 
L
T
 
V
L
 
V
H
 
A
V
 
C
P
 
P
-
 
L
G
 
T
G
 
P
G
 
E
V
 
T
P
 
T
L
 
H
M
 
I
T
 
I
K
 
N
R
 
R
E
 
E
F
 
V
-
 
I
-
 
D
A
 
A
L
 
L
L
 
G
P
 
P
A
 
K
G
 
G
A
 
-
V
 
V
F
 
L
V
 
I
N
 
N
A
x
I
A
 
G
R
 
R
G
 
G
A
 
P
L
 
H
V
 
V
D
 
D
E
 
E
D
 
P
A
 
E
L
 
L
Y
 
V
E
 
S
A
 
A
L
 
L
T
 
V
S
 
E
G
 
G
H
 
R
L
 
L
F
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
R
 
E
N
 
R
E
 
E
P
 
P
N
 
E
V
 
V
D
 
P
K
 
E
R
 
K
F
 
L
A
 
F
G
 
G
L
 
L
D
 
E
N
 
N
V
 
V
F
 
V
L
 
L
T
 
L
P
 
P
H
 
H
M
 
V
A
 
G
S
 
S
A
 
G
T
 
T
M
 
V
E
 
E
T
 
T
R
 
R
D
 
K
Q
 
V
M
 
M
G
 
A
F
 
D
T
 
L
A
 
V
L
 
V
D
 
G
N
 
N
V
 
L
A
 
E
A
 
A
V
 
H
L
 
F
N
 
S
E
 
G
R
 
K
P
 
P
A
 
L
L
 
L
N
 
T
P
 
P
V
 
V

3bazA Structure of hydroxyphenylpyruvate reductase from coleus blumei in complex with NADP+ (see paper)
40% identity, 84% coverage: 52:320/320 of query aligns to 46:310/311 of 3bazA

query
sites
3bazA
A
 
A
V
 
V
L
 
V
I
 
G
G
 
N
K
 
S
K
 
N
S
 
A
G
 
G
L
 
A
Q
 
D
A
 
A
E
 
E
H
 
L
I
 
I
A
 
D
A
 
A
L
 
L
P
 
P
S
 
K
T
 
-
V
 
L
K
 
E
I
 
I
I
 
V
A
 
S
N
 
S
A
 
F
S
 
S
A
x
V
G
 
G
F
 
L
D
 
D
H
 
K
M
 
V
D
 
D
V
 
L
A
 
I
A
 
K
A
 
C
R
 
E
E
 
E
R
 
K
G
 
G
I
 
V
V
 
R
V
 
V
T
 
T
N
 
N
A
 
T
P
 
P
D
 
D
A
 
V
L
|
L
T
 
T
E
 
D
C
 
D
T
 
V
A
 
A
D
 
D
F
 
L
S
 
A
L
 
I
L
 
G
L
 
L
V
 
I
L
 
L
A
 
A
A
 
V
C
 
L
R
 
R
R
 
R
A
 
I
S
 
C
E
 
E
Y
 
C
E
 
D
R
 
K
I
 
Y
M
 
V
R
 
R
N
 
R
G
 
G
W
 
A
G
 
W
K
 
K
S
 
-
F
 
F
G
 
G
M
 
D
T
 
F
E
 
K
M
 
-
L
 
L
G
 
T
T
 
T
R
 
K
V
 
F
N
 
S
G
 
G
K
 
K
T
 
R
L
 
V
G
 
G
I
 
I
V
 
I
G
|
G
F
x
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
A
V
 
V
A
 
A
K
 
E
R
 
R
A
 
A
Q
 
E
G
 
A
F
 
F
G
 
D
M
 
C
R
 
P
V
 
I
I
 
S
Y
 
Y
T
 
-
D
 
-
I
 
F
N
x
S
R
|
R
A
x
S
A
 
K
A
 
K
S
 
P
L
 
N
E
 
T
N
 
N
G
 
-
A
 
Y
T
 
T
F
 
Y
Y
 
Y
N
 
G
S
 
S
L
 
V
D
 
V
E
 
E
M
 
L
L
 
A
P
 
S
H
 
N
C
 
S
Q
 
D
V
 
I
L
 
L
T
 
V
L
 
V
H
 
A
V
x
C
P
|
P
-
 
L
G
 
T
G
 
P
G
 
E
V
x
T
P
 
T
L
 
H
M
 
I
T
 
I
K
 
N
R
 
R
E
 
E
F
 
V
-
 
I
-
 
D
A
 
A
L
 
L
L
 
G
P
 
P
A
 
K
G
 
G
A
 
-
V
 
V
F
 
L
V
 
I
N
 
N
A
x
I
A
x
G
R
|
R
G
 
G
A
 
P
L
 
H
V
 
V
D
 
D
E
 
E
D
 
P
A
 
E
L
 
L
Y
 
V
E
 
S
A
 
A
L
 
L
T
 
V
S
 
E
G
 
G
H
 
R
L
 
L
F
 
G
G
 
G
A
|
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
R
 
E
N
 
R
E
|
E
P
 
P
N
 
E
V
 
V
D
 
P
K
 
E
R
 
K
F
 
L
A
 
F
G
 
G
L
 
L
D
 
E
N
 
N
V
 
V
F
 
V
L
 
L
T
 
L
P
 
P
H
|
H
M
 
V
A
x
G
S
 
S
A
 
G
T
 
T
M
 
V
E
 
E
T
 
T
R
 
R
D
 
K
Q
 
V
M
 
M
G
 
A
F
 
D
T
 
L
A
 
V
L
 
V
D
 
G
N
 
N
V
 
L
A
 
E
A
 
A
V
 
H
L
 
F
N
 
S
E
 
G
R
 
K
P
 
P
A
 
L
L
 
L
N
 
T
P
 
P
V
 
V

5v7nA Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc04462 (smghrb) from sinorhizobium meliloti in complex with NADP and 2-keto-d-gluconic acid (see paper)
36% identity, 99% coverage: 5:320/320 of query aligns to 1:309/319 of 5v7nA

query
sites
5v7nA
N
 
S
R
 
R
T
 
P
R
 
R
L
 
I
L
 
L
I
 
V
A
 
P
R
 
G
K
 
K
V
 
I
P
 
N
T
 
P
A
 
R
V
 
V
A
 
L
N
 
E
R
 
R
A
 
L
E
 
P
A
 
E
E
 
M
F
 
F
H
 
E
A
 
T
F
 
V
V
 
R
T
 
I
E
 
E
S
 
R
D
 
A
M
 
D
D
 
A
A
 
A
W
 
L
S
 
V
V
 
T
V
 
A
D
 
D
F
 
M
C
 
R
K
 
D
K
 
V
H
 
S
A
 
G
T
 
-
P
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
-
I
 
I
G
 
A
K
 
V
K
 
S
S
 
G
G
 
K
L
 
L
Q
 
P
A
 
V
E
 
P
H
 
L
I
 
M
A
 
D
A
 
A
L
 
F
P
 
P
S
 
S
T
 
-
V
 
L
K
 
E
I
 
I
I
 
V
A
 
A
N
 
N
A
 
F
S
x
G
A
x
V
G
|
G
F
 
Y
D
 
D
H
 
G
M
 
V
D
 
D
V
 
V
A
 
S
A
 
R
A
 
A
R
 
A
E
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
I
V
 
V
V
 
V
T
 
T
N
 
N
A
 
T
P
 
P
D
 
D
A
 
V
L
|
L
T
 
T
E
 
E
C
 
E
T
x
V
A
 
A
D
 
D
F
 
T
S
 
A
L
 
I
L
 
G
L
 
L
V
 
L
L
 
L
A
 
N
A
 
T
C
 
L
R
 
R
R
 
L
A
 
L
S
 
P
E
 
Q
Y
 
A
E
 
E
R
 
Q
I
 
W
M
 
L
R
 
R
N
 
Q
G
 
G
W
 
R
G
 
W
K
 
V
S
 
R
F
 
E
G
 
G
M
 
A
T
 
F
E
 
P
M
 
L
L
 
S
G
 
P
T
 
L
R
 
S
V
 
L
N
 
R
G
 
G
K
 
R
T
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
L
V
 
F
G
 
G
F
x
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
A
V
 
I
A
 
A
K
 
R
R
 
R
A
 
L
Q
 
E
G
 
A
F
 
F
G
 
G
M
 
V
R
 
S
V
 
I
I
 
A
Y
 
Y
-
 
H
T
|
T
D
x
R
I
 
T
N
 
P
R
 
R
A
 
E
A
 
G
A
 
L
S
 
-
L
 
-
E
 
-
N
 
-
G
 
G
A
 
F
T
 
T
F
 
Y
Y
 
H
N
 
P
S
 
T
L
 
L
D
 
V
E
 
G
M
 
M
L
 
A
P
 
E
H
 
A
C
 
V
Q
 
D
V
 
T
L
 
L
T
 
I
L
 
V
H
 
I
V
|
V
P
|
P
G
 
G
G
 
T
G
 
A
V
x
S
P
x
T
L
 
L
M
 
K
T
 
A
K
 
V
R
 
N
E
 
A
-
 
D
-
 
V
-
 
L
F
 
S
A
 
A
L
 
L
L
 
G
P
 
P
A
 
K
G
 
G
A
 
-
V
 
V
F
 
L
V
 
I
N
 
N
A
x
V
A
x
G
R
|
R
G
 
G
A
 
S
L
 
T
V
 
V
D
 
D
E
 
E
D
 
A
A
 
A
L
 
L
Y
 
V
E
 
T
A
 
A
L
 
L
T
 
Q
S
 
N
G
 
G
H
 
T
L
 
I
F
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
R
 
E
N
 
N
E
|
E
P
 
P
N
 
N
V
 
V
D
 
P
K
 
E
R
 
A
F
 
L
A
 
L
G
 
S
L
 
F
D
 
P
N
 
N
V
 
V
F
 
S
L
 
L
T
 
L
P
 
P
H
|
H
M
 
V
A
|
A
S
|
S
A
 
A
T
 
S
M
 
V
E
 
V
T
 
T
R
|
R
D
 
N
Q
 
A
M
 
M
G
 
S
F
 
D
T
 
L
A
 
V
L
 
V
D
 
D
N
 
N
V
 
L
A
 
K
A
 
A
V
 
W
L
 
F
N
 
S
E
 
T
R
 
G
P
 
E
A
 
A
L
 
L
N
 
T
P
 
P
V
 
V

5v6qB Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc04462 (smghrb) from sinorhizobium meliloti in complex with NADP and malonate (see paper)
36% identity, 99% coverage: 5:320/320 of query aligns to 2:310/319 of 5v6qB

query
sites
5v6qB
N
 
S
R
 
R
T
 
P
R
 
R
L
 
I
L
 
L
I
 
V
A
 
P
R
 
G
K
 
K
V
 
I
P
 
N
T
 
P
A
 
R
V
 
V
A
 
L
N
 
E
R
 
R
A
 
L
E
 
P
A
 
E
E
 
M
F
 
F
H
 
E
A
 
T
F
 
V
V
 
R
T
 
I
E
 
E
S
 
R
D
 
A
M
 
D
D
 
A
A
 
A
W
 
L
S
 
V
V
 
T
V
 
A
D
 
D
F
 
M
C
 
R
K
 
D
K
 
V
H
 
S
A
 
G
T
 
-
P
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
-
I
 
I
G
 
A
K
 
V
K
 
S
S
 
G
G
 
K
L
 
L
Q
 
P
A
 
V
E
 
P
H
 
L
I
 
M
A
 
D
A
 
A
L
 
F
P
 
P
S
 
S
T
 
-
V
 
L
K
 
E
I
 
I
I
 
V
A
 
A
N
 
N
A
 
F
S
 
G
A
x
V
G
 
G
F
 
Y
D
 
D
H
 
G
M
 
V
D
 
D
V
 
V
A
 
S
A
 
R
A
 
A
R
 
A
E
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
I
V
 
V
V
 
V
T
 
T
N
 
N
A
 
T
P
 
P
D
 
D
A
 
V
L
|
L
T
 
T
E
 
E
C
 
E
T
x
V
A
 
A
D
 
D
F
 
T
S
 
A
L
 
I
L
 
G
L
 
L
V
 
L
L
 
L
A
 
N
A
 
T
C
 
L
R
 
R
R
 
L
A
 
L
S
 
P
E
 
Q
Y
 
A
E
 
E
R
 
Q
I
 
W
M
 
L
R
 
R
N
 
Q
G
 
G
W
 
R
G
 
W
K
 
V
S
 
R
F
 
E
G
 
G
M
 
A
T
 
F
E
 
P
M
 
L
L
 
S
G
 
P
T
 
L
R
 
S
V
 
L
N
 
R
G
 
G
K
 
R
T
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
L
V
x
F
G
 
G
F
x
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
A
V
 
I
A
 
A
K
 
R
R
 
R
A
 
L
Q
 
E
G
 
A
F
 
F
G
 
G
M
 
V
R
 
S
V
 
I
I
 
A
Y
 
Y
-
 
H
T
|
T
D
x
R
I
 
T
N
 
P
R
 
R
A
 
E
A
 
G
A
 
L
S
 
-
L
 
-
E
 
-
N
 
-
G
 
G
A
 
F
T
 
T
F
 
Y
Y
 
H
N
 
P
S
 
T
L
 
L
D
 
V
E
 
G
M
 
M
L
 
A
P
 
E
H
 
A
C
 
V
Q
 
D
V
 
T
L
 
L
T
 
I
L
 
V
H
 
I
V
|
V
P
|
P
G
 
G
G
 
T
G
 
A
V
x
S
P
x
T
L
 
L
M
 
K
T
 
A
K
 
V
R
 
N
E
 
A
-
 
D
-
 
V
-
 
L
F
 
S
A
 
A
L
 
L
L
 
G
P
 
P
A
 
K
G
 
G
A
 
-
V
 
V
F
 
L
V
 
I
N
 
N
A
x
V
A
x
G
R
|
R
G
 
G
A
 
S
L
 
T
V
 
V
D
 
D
E
 
E
D
 
A
A
 
A
L
 
L
Y
 
V
E
 
T
A
 
A
L
 
L
T
 
Q
S
 
N
G
 
G
H
 
T
L
 
I
F
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
R
 
E
N
 
N
E
|
E
P
 
P
N
 
N
V
 
V
D
 
P
K
 
E
R
 
A
F
 
L
A
 
L
G
 
S
L
 
F
D
 
P
N
 
N
V
 
V
F
 
S
L
 
L
T
 
L
P
 
P
H
|
H
M
 
V
A
|
A
S
 
S
A
 
A
T
 
S
M
 
V
E
 
V
T
 
T
R
 
R
D
 
N
Q
 
A
M
 
M
G
 
S
F
 
D
T
 
L
A
 
V
L
 
V
D
 
D
N
 
N
V
 
L
A
 
K
A
 
A
V
 
W
L
 
F
N
 
S
E
 
T
R
 
G
P
 
E
A
 
A
L
 
L
N
 
T
P
 
P
V
 
V

5j23A Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc04462 (smghrb) from sinorhizobium meliloti in complex with 2'-phospho-adp-ribose (see paper)
36% identity, 98% coverage: 6:320/320 of query aligns to 1:308/318 of 5j23A

query
sites
5j23A
R
 
R
T
 
P
R
 
R
L
 
I
L
 
L
I
 
V
A
 
P
R
 
G
K
 
K
V
 
I
P
 
N
T
 
P
A
 
R
V
 
V
A
 
L
N
 
E
R
 
R
A
 
L
E
 
P
A
 
E
E
 
M
F
 
F
H
 
E
A
 
T
F
 
V
V
 
R
T
 
I
E
 
E
S
 
R
D
 
A
M
 
D
D
 
A
A
 
A
W
 
L
S
 
V
V
 
T
V
 
A
D
 
D
F
 
M
C
 
R
K
 
D
K
 
V
H
 
S
A
 
G
T
 
-
P
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
-
I
 
I
G
 
A
K
 
V
K
 
S
S
 
G
G
 
K
L
 
L
Q
 
P
A
 
V
E
 
P
H
 
L
I
 
M
A
 
D
A
 
A
L
 
F
P
 
P
S
 
S
T
 
-
V
 
L
K
 
E
I
 
I
I
 
V
A
 
A
N
 
N
A
 
F
S
 
G
A
x
V
G
 
G
F
 
Y
D
 
D
H
 
G
M
 
V
D
 
D
V
 
V
A
 
S
A
 
R
A
 
A
R
 
A
E
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
I
V
 
V
V
 
V
T
 
T
N
 
N
A
 
T
P
 
P
D
 
D
A
 
V
L
|
L
T
 
T
E
 
E
C
 
E
T
 
V
A
 
A
D
 
D
F
 
T
S
 
A
L
 
I
L
 
G
L
 
L
V
 
L
L
 
L
A
 
N
A
 
T
C
 
L
R
 
R
R
 
L
A
 
L
S
 
P
E
 
Q
Y
 
A
E
 
E
R
 
Q
I
 
W
M
 
L
R
 
R
N
 
Q
G
 
G
W
 
R
G
 
W
K
 
V
S
 
R
F
 
E
G
 
G
M
 
A
T
 
F
E
 
P
M
 
L
L
 
S
G
 
P
T
 
L
R
 
S
V
 
L
N
 
R
G
 
G
K
 
R
T
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
L
V
 
F
G
 
G
F
x
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
A
V
 
I
A
 
A
K
 
R
R
 
R
A
 
L
Q
 
E
G
 
A
F
 
F
G
 
G
M
 
V
R
 
S
V
 
I
I
 
A
Y
 
Y
-
 
H
T
|
T
D
x
R
I
 
T
N
 
P
R
 
R
A
 
E
A
 
G
A
 
L
S
 
-
L
 
-
E
 
-
N
 
-
G
 
G
A
 
F
T
 
T
F
 
Y
Y
 
H
N
 
P
S
 
T
L
 
L
D
 
V
E
 
G
M
 
M
L
 
A
P
 
E
H
 
A
C
 
V
Q
 
D
V
 
T
L
 
L
T
 
I
L
 
V
H
 
I
V
 
V
P
|
P
G
 
G
G
 
T
G
 
A
V
x
S
P
x
T
L
 
L
M
 
K
T
 
A
K
 
V
R
 
N
E
 
A
-
 
D
-
 
V
-
 
L
F
 
S
A
 
A
L
 
L
L
 
G
P
 
P
A
 
K
G
 
G
A
 
-
V
 
V
F
 
L
V
 
I
N
 
N
A
 
V
A
 
G
R
|
R
G
 
G
A
 
S
L
 
T
V
 
V
D
 
D
E
 
E
D
 
A
A
 
A
L
 
L
Y
 
V
E
 
T
A
 
A
L
 
L
T
 
Q
S
 
N
G
 
G
H
 
T
L
 
I
F
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
R
 
E
N
 
N
E
|
E
P
 
P
N
 
N
V
 
V
D
 
P
K
 
E
R
 
A
F
 
L
A
 
L
G
 
S
L
 
F
D
 
P
N
 
N
V
 
V
F
 
S
L
 
L
T
 
L
P
 
P
H
|
H
M
 
V
A
 
A
S
 
S
A
 
A
T
 
S
M
 
V
E
 
V
T
 
T
R
 
R
D
 
N
Q
 
A
M
 
M
G
 
S
F
 
D
T
 
L
A
 
V
L
 
V
D
 
D
N
 
N
V
 
L
A
 
K
A
 
A
V
 
W
L
 
F
N
 
S
E
 
T
R
 
G
P
 
E
A
 
A
L
 
L
N
 
T
P
 
P
V
 
V

5v7gA Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc04462 (smghrb) from sinorhizobium meliloti in complex with NADPH and oxalate (see paper)
36% identity, 98% coverage: 6:320/320 of query aligns to 1:308/317 of 5v7gA

query
sites
5v7gA
R
 
R
T
 
P
R
 
R
L
 
I
L
 
L
I
 
V
A
 
P
R
 
G
K
 
K
V
 
I
P
 
N
T
 
P
A
 
R
V
 
V
A
 
L
N
 
E
R
 
R
A
 
L
E
 
P
A
 
E
E
 
M
F
 
F
H
 
E
A
 
T
F
 
V
V
 
R
T
 
I
E
 
E
S
 
R
D
 
A
M
 
D
D
 
A
A
 
A
W
 
L
S
 
V
V
 
T
V
 
A
D
 
D
F
 
M
C
 
R
K
 
D
K
 
V
H
 
S
A
 
G
T
 
-
P
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
-
I
 
I
G
 
A
K
 
V
K
 
S
S
 
G
G
 
K
L
 
L
Q
 
P
A
 
V
E
 
P
H
 
L
I
 
M
A
 
D
A
 
A
L
 
F
P
 
P
S
 
S
T
 
-
V
 
L
K
 
E
I
 
I
I
 
V
A
 
A
N
 
N
A
 
F
S
x
G
A
x
V
G
|
G
F
 
Y
D
 
D
H
 
G
M
 
V
D
 
D
V
 
V
A
 
S
A
 
R
A
 
A
R
 
A
E
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
I
V
 
V
V
 
V
T
 
T
N
 
N
A
 
T
P
 
P
D
 
D
A
 
V
L
|
L
T
 
T
E
 
E
C
 
E
T
x
V
A
 
A
D
 
D
F
 
T
S
 
A
L
 
I
L
 
G
L
 
L
V
 
L
L
 
L
A
 
N
A
 
T
C
 
L
R
 
R
R
 
L
A
 
L
S
 
P
E
 
Q
Y
 
A
E
 
E
R
 
Q
I
 
W
M
 
L
R
 
R
N
 
Q
G
 
G
W
 
R
G
 
W
K
 
V
S
 
R
F
 
E
G
 
G
M
 
A
T
 
F
E
 
P
M
 
L
L
 
S
G
 
P
T
 
L
R
 
S
V
 
L
N
 
R
G
 
G
K
 
R
T
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
L
V
x
F
G
 
G
F
x
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
A
V
 
I
A
 
A
K
 
R
R
 
R
A
 
L
Q
 
E
G
 
A
F
 
F
G
 
G
M
 
V
R
 
S
V
 
I
I
 
A
Y
 
Y
-
 
H
T
|
T
D
x
R
I
 
T
N
 
P
R
 
R
A
 
E
A
 
G
A
 
L
S
 
-
L
 
-
E
 
-
N
 
-
G
 
G
A
 
F
T
 
T
F
 
Y
Y
 
H
N
 
P
S
 
T
L
 
L
D
 
V
E
 
G
M
 
M
L
 
A
P
 
E
H
 
A
C
 
V
Q
 
D
V
 
T
L
 
L
T
 
I
L
 
V
H
 
I
V
|
V
P
|
P
G
 
G
G
 
T
G
 
A
V
x
S
P
x
T
L
 
L
M
 
K
T
 
A
K
 
V
R
 
N
E
 
A
-
 
D
-
 
V
-
 
L
F
 
S
A
 
A
L
 
L
L
 
G
P
 
P
A
 
K
G
 
G
A
 
-
V
 
V
F
 
L
V
 
I
N
 
N
A
x
V
A
x
G
R
|
R
G
 
G
A
 
S
L
 
T
V
 
V
D
 
D
E
 
E
D
 
A
A
 
A
L
 
L
Y
 
V
E
 
T
A
 
A
L
 
L
T
 
Q
S
 
N
G
 
G
H
 
T
L
 
I
F
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
R
 
E
N
 
N
E
|
E
P
 
P
N
 
N
V
 
V
D
 
P
K
 
E
R
 
A
F
 
L
A
 
L
G
 
S
L
 
F
D
 
P
N
 
N
V
 
V
F
 
S
L
 
L
T
 
L
P
 
P
H
|
H
M
 
V
A
|
A
S
 
S
A
 
A
T
 
S
M
 
V
E
 
V
T
 
T
R
 
R
D
 
N
Q
 
A
M
 
M
G
 
S
F
 
D
T
 
L
A
 
V
L
 
V
D
 
D
N
 
N
V
 
L
A
 
K
A
 
A
V
 
W
L
 
F
N
 
S
E
 
T
R
 
G
P
 
E
A
 
A
L
 
L
N
 
T
P
 
P
V
 
V

6rj3A Crystal structure of phgdh in complex with compound 15 (see paper)
36% identity, 71% coverage: 73:300/320 of query aligns to 64:290/297 of 6rj3A

query
sites
6rj3A
V
 
L
K
 
Q
I
 
V
I
 
V
A
 
G
N
 
R
A
 
A
S
 
G
A
 
T
G
 
G
F
 
V
D
 
D
H
 
N
M
 
V
D
 
D
V
 
L
A
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
T
E
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
V
 
L
V
 
V
T
 
M
N
 
N
A
 
T
P
 
P
D
 
N
A
 
G
L
 
N
T
 
S
E
 
L
C
 
S
T
 
A
A
 
A
D
 
E
F
 
L
S
 
T
L
 
C
L
 
G
L
 
M
V
 
I
L
 
M
A
 
C
A
 
L
C
 
A
R
 
R
R
 
Q
A
 
I
S
 
P
E
 
Q
Y
 
A
E
 
T
R
 
A
I
 
S
M
 
M
R
 
K
N
 
D
G
 
G
-
 
K
W
 
W
G
 
E
K
 
R
S
 
K
F
 
-
G
 
-
M
 
-
T
 
-
E
 
K
M
 
F
L
 
M
G
 
G
T
 
T
R
 
E
V
 
L
N
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
V
x
L
G
 
G
F
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
E
V
 
V
A
 
A
K
 
T
R
 
R
A
 
M
Q
 
Q
G
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
R
 
K
V
 
T
I
 
I
Y
 
G
T
x
Y
D
|
D
I
 
-
N
 
-
R
 
-
A
x
P
A
x
I
A
x
I
S
 
S
L
 
P
E
 
E
N
 
V
G
 
S
A
 
A
T
 
S
F
 
F
-
 
G
-
 
V
-
 
Q
Y
 
Q
N
 
L
S
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
M
 
I
L
 
W
P
 
P
H
 
L
C
 
C
Q
 
D
V
 
F
L
 
I
T
 
T
L
 
V
H
|
H
V
x
T
P
|
P
-
 
L
-
 
L
G
 
P
G
 
S
G
 
T
V
 
T
P
 
G
L
|
L
M
 
L
T
 
N
K
 
D
R
 
N
E
 
T
F
 
F
A
 
A
L
 
Q
L
 
C
P
 
K
A
 
K
G
 
G
A
 
V
V
 
R
F
 
V
V
 
V
N
 
N
A
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
G
L
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
D
 
G
A
 
A
L
 
L
Y
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
T
 
Q
S
 
S
G
 
G
H
 
Q
L
 
C
F
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
Y
 
F
R
 
T
N
 
E
E
 
E
P
 
P
N
 
P
V
 
R
D
 
D
K
 
R
R
 
A
F
 
L
A
 
V
G
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
F
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
M
 
L
A
 
G
S
 
A
A
 
S
T
 
T
M
 
K
E
 
E
T
 
A
R
 
Q
D
 
S
Q
 
R
M
 
C
G
 
G

6cwaA Crystal structure phgdh in complex with nadh and 3-phosphoglycerate at 1.77 a resolution (see paper)
36% identity, 71% coverage: 73:300/320 of query aligns to 64:290/299 of 6cwaA

query
sites
6cwaA
V
 
L
K
 
Q
I
 
V
I
 
V
A
 
G
N
 
R
A
 
A
S
 
G
A
 
T
G
 
G
F
 
V
D
 
D
H
 
N
M
 
V
D
 
D
V
 
L
A
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
T
E
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
V
 
L
V
 
V
T
 
M
N
 
N
A
 
T
P
 
P
D
 
N
A
 
G
L
x
N
T
 
S
E
 
L
C
 
S
T
x
A
A
 
A
D
 
E
F
 
L
S
 
T
L
 
C
L
 
G
L
 
M
V
 
I
L
 
M
A
 
C
A
 
L
C
 
A
R
 
R
R
 
Q
A
 
I
S
 
P
E
 
Q
Y
 
A
E
 
T
R
 
A
I
 
S
M
 
M
R
 
K
N
 
D
G
 
G
-
 
K
W
 
W
G
 
E
K
 
R
S
 
K
F
 
-
G
 
-
M
 
-
T
 
-
E
 
K
M
 
F
L
 
M
G
 
G
T
 
T
R
 
E
V
 
L
N
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
V
 
L
G
 
G
F
 
L
G
 
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
E
V
 
V
A
 
A
K
 
T
R
 
R
A
 
M
Q
 
Q
G
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
R
 
K
V
 
T
I
 
I
Y
 
G
T
x
Y
D
|
D
I
 
-
N
 
-
R
 
-
A
x
P
A
x
I
A
 
I
S
 
S
L
 
P
E
 
E
N
 
V
G
 
S
A
 
A
T
 
S
F
 
F
-
 
G
-
 
V
-
 
Q
Y
 
Q
N
 
L
S
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
M
 
I
L
 
W
P
 
P
H
 
L
C
 
C
Q
 
D
V
 
F
L
 
I
T
 
T
L
 
V
H
|
H
V
x
T
P
|
P
-
 
L
-
 
L
G
 
P
G
 
S
G
x
T
V
 
T
P
 
G
L
 
L
M
 
L
T
 
N
K
 
D
R
 
N
E
 
T
F
 
F
A
 
A
L
 
Q
L
 
C
P
 
K
A
 
K
G
 
G
A
 
V
V
 
R
F
 
V
V
 
V
N
 
N
A
x
C
A
|
A
R
|
R
G
 
G
A
 
G
L
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
D
 
G
A
 
A
L
 
L
Y
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
T
 
Q
S
 
S
G
 
G
H
 
Q
L
 
C
F
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
Y
 
F
R
 
T
N
 
E
E
 
E
P
 
P
N
 
P
V
 
R
D
 
D
K
 
R
R
 
A
F
 
L
A
 
V
G
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
F
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
M
 
L
A
x
G
S
 
A
A
 
S
T
 
T
M
 
K
E
 
E
T
 
A
R
 
Q
D
 
S
Q
 
R
M
 
C
G
 
G

7dkmA Phgdh covalently linked to oridonin (see paper)
36% identity, 71% coverage: 73:300/320 of query aligns to 66:292/306 of 7dkmA

query
sites
7dkmA
V
 
L
K
 
Q
I
 
V
I
 
V
A
 
G
N
 
R
A
 
A
S
 
G
A
x
T
G
 
G
F
 
V
D
 
D
H
 
N
M
 
V
D
 
D
V
 
L
A
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
T
E
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
V
 
L
V
 
V
T
 
M
N
 
N
A
 
T
P
 
P
D
 
N
A
 
G
L
 
N
T
 
S
E
 
L
C
 
S
T
x
A
A
 
A
D
 
E
F
 
L
S
 
T
L
 
C
L
 
G
L
 
M
V
 
I
L
 
M
A
 
C
A
 
L
C
 
A
R
 
R
R
 
Q
A
 
I
S
 
P
E
 
Q
Y
 
A
E
 
T
R
 
A
I
 
S
M
 
M
R
 
K
N
 
D
G
 
G
-
 
K
W
 
W
G
 
E
K
 
R
S
 
K
F
 
-
G
 
-
M
 
-
T
 
-
E
 
K
M
 
F
L
 
M
G
 
G
T
 
T
R
 
E
V
 
L
N
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
V
 
L
G
|
G
F
 
L
G
 
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
E
V
 
V
A
 
A
K
 
T
R
 
R
A
 
M
Q
 
Q
G
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
R
 
K
V
 
T
I
 
I
Y
 
G
T
x
Y
D
|
D
I
 
-
N
 
-
R
 
-
A
x
P
A
x
I
A
 
I
S
 
S
L
 
P
E
 
E
N
 
V
G
 
S
A
 
A
T
 
S
F
 
F
-
 
G
-
 
V
-
 
Q
Y
 
Q
N
 
L
S
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
M
 
I
L
 
W
P
 
P
H
 
L
C
 
C
Q
 
D
V
 
F
L
 
I
T
 
T
L
 
V
H
|
H
V
x
T
P
|
P
-
 
L
-
 
L
G
 
P
G
 
S
G
x
T
V
 
T
P
 
G
L
 
L
M
 
L
T
 
N
K
 
D
R
 
N
E
 
T
F
 
F
A
 
A
L
 
Q
L
 
C
P
 
K
A
 
K
G
 
G
A
 
V
V
 
R
F
 
V
V
 
V
N
 
N
A
x
C
A
|
A
R
|
R
G
 
G
A
 
G
L
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
D
 
G
A
 
A
L
 
L
Y
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
T
 
Q
S
 
S
G
 
G
H
 
Q
L
 
C
F
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
Y
 
F
R
 
T
N
 
E
E
 
E
P
 
P
N
 
P
V
 
R
D
 
D
K
 
R
R
 
A
F
 
L
A
 
V
G
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
F
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
M
 
L
A
x
G
S
 
A
A
 
S
T
 
T
M
 
K
E
 
E
T
 
A
R
 
Q
D
 
S
Q
 
R
M
 
C
G
 
G

Sites not aligning to the query:

6rj2A Crystal structure of phgdh in complex with compound 40 (see paper)
36% identity, 71% coverage: 73:300/320 of query aligns to 62:288/299 of 6rj2A

query
sites
6rj2A
V
 
L
K
 
Q
I
 
V
I
 
V
A
 
G
N
 
R
A
 
A
S
 
G
A
 
T
G
 
G
F
 
V
D
 
D
H
 
N
M
 
V
D
 
D
V
 
L
A
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
T
E
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
V
 
L
V
 
V
T
 
M
N
 
N
A
 
T
P
 
P
D
 
N
A
 
G
L
 
N
T
 
S
E
 
L
C
 
S
T
 
A
A
 
A
D
 
E
F
 
L
S
 
T
L
 
C
L
 
G
L
 
M
V
 
I
L
 
M
A
 
C
A
 
L
C
 
A
R
 
R
R
 
Q
A
 
I
S
 
P
E
 
Q
Y
 
A
E
 
T
R
 
A
I
 
S
M
 
M
R
 
K
N
 
D
G
 
G
-
 
K
W
 
W
G
 
E
K
 
R
S
 
K
F
 
-
G
 
-
M
 
-
T
 
-
E
 
K
M
 
F
L
 
M
G
 
G
T
 
T
R
 
E
V
 
L
N
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
V
 
L
G
 
G
F
 
L
G
|
G
R
 
R
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
E
V
 
V
A
 
A
K
 
T
R
 
R
A
 
M
Q
 
Q
G
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
R
 
K
V
 
T
I
 
I
Y
 
G
T
x
Y
D
|
D
I
 
-
N
 
-
R
 
-
A
x
P
A
x
I
A
x
I
S
 
S
L
 
P
E
 
E
N
 
V
G
 
S
A
 
A
T
 
S
F
 
F
-
 
G
-
 
V
-
 
Q
Y
 
Q
N
 
L
S
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
M
 
I
L
 
W
P
 
P
H
 
L
C
 
C
Q
 
D
V
 
F
L
 
I
T
 
T
L
 
V
H
|
H
V
x
T
P
 
P
-
 
L
-
 
L
G
 
P
G
 
S
G
 
T
V
 
T
P
 
G
L
|
L
M
 
L
T
 
N
K
 
D
R
 
N
E
 
T
F
 
F
A
 
A
L
 
Q
L
 
C
P
 
K
A
 
K
G
 
G
A
 
V
V
 
R
F
 
V
V
 
V
N
 
N
A
 
C
A
 
A
R
|
R
G
 
G
A
 
G
L
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
D
 
G
A
 
A
L
 
L
Y
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
T
 
Q
S
 
S
G
 
G
H
 
Q
L
 
C
F
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
Y
 
F
R
 
T
N
 
E
E
 
E
P
 
P
N
 
P
V
 
R
D
 
D
K
 
R
R
 
A
F
 
L
A
 
V
G
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
F
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
M
 
L
A
 
G
S
 
A
A
 
S
T
 
T
M
 
K
E
 
E
T
 
A
R
 
Q
D
 
S
Q
 
R
M
 
C
G
 
G

O43175 D-3-phosphoglycerate dehydrogenase; 3-PGDH; 2-oxoglutarate reductase; Malate dehydrogenase; EC 1.1.1.95; EC 1.1.1.399; EC 1.1.1.37 from Homo sapiens (Human) (see 3 papers)
36% identity, 71% coverage: 73:300/320 of query aligns to 70:296/533 of O43175

query
sites
O43175
V
 
L
K
 
Q
I
 
V
I
 
V
A
 
G
N
 
R
A
 
A
S
 
G
A
x
T
G
 
G
F
 
V
D
 
D
H
 
N
M
 
V
D
 
D
V
 
L
A
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
T
E
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
V
 
L
V
 
V
T
 
M
N
 
N
A
 
T
P
 
P
D
 
N
A
 
G
L
 
N
T
 
S
E
 
L
C
 
S
T
 
A
A
 
A
D
 
E
F
 
L
S
 
T
L
 
C
L
 
G
L
 
M
V
 
I
L
 
M
A
 
C
A
 
L
C
 
A
R
 
R
R
 
Q
A
 
I
S
 
P
E
 
Q
Y
 
A
E
 
T
R
 
A
I
 
S
M
 
M
R
 
K
N
 
D
G
 
G
-
 
K
W
 
W
G
 
E
K
x
R
S
 
K
F
 
-
G
 
-
M
 
-
T
 
-
E
 
K
M
 
F
L
 
M
G
 
G
T
 
T
R
 
E
V
 
L
N
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
V
 
L
G
 
G
F
 
L
G
 
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
E
V
 
V
A
 
A
K
 
T
R
 
R
A
 
M
Q
 
Q
G
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
R
 
K
V
 
T
I
 
I
Y
 
G
T
 
Y
D
|
D
I
 
-
N
 
-
R
 
-
A
 
P
A
 
I
A
 
I
S
 
S
L
 
P
E
 
E
N
 
V
G
 
S
A
 
A
T
 
S
F
 
F
-
 
G
-
 
V
-
 
Q
Y
 
Q
N
 
L
S
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
M
 
I
L
 
W
P
 
P
H
 
L
C
 
C
Q
 
D
V
 
F
L
 
I
T
 
T
L
 
V
H
 
H
V
x
T
P
 
P
-
 
L
-
 
L
G
 
P
G
 
S
G
 
T
V
 
T
P
 
G
L
 
L
M
 
L
T
 
N
K
 
D
R
 
N
E
 
T
F
 
F
A
 
A
L
 
Q
L
 
C
P
 
K
A
 
K
G
 
G
A
 
V
V
 
R
F
 
V
V
 
V
N
 
N
A
x
C
A
|
A
R
|
R
G
 
G
A
 
G
L
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
D
 
G
A
 
A
L
 
L
Y
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
T
 
Q
S
 
S
G
 
G
H
 
Q
L
 
C
F
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
|
D
V
|
V
Y
 
F
R
 
T
N
 
E
E
 
E
P
 
P
N
 
P
V
 
R
D
 
D
K
 
R
R
 
A
F
 
L
A
 
V
G
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
F
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
M
x
L
A
x
G
S
x
A
A
 
S
T
 
T
M
 
K
E
 
E
T
 
A
R
 
Q
D
 
S
Q
 
R
M
 
C
G
 
G

Sites not aligning to the query:

7ewhA Crystal structure of human phgdh in complex with homoharringtonine (see paper)
36% identity, 71% coverage: 73:300/320 of query aligns to 65:291/302 of 7ewhA

query
sites
7ewhA
V
 
L
K
 
Q
I
 
V
I
 
V
A
 
G
N
 
R
A
 
A
S
 
G
A
 
T
G
 
G
F
 
V
D
 
D
H
 
N
M
 
V
D
 
D
V
 
L
A
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
T
E
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
V
 
L
V
 
V
T
 
M
N
 
N
A
 
T
P
 
P
D
 
N
A
 
G
L
 
N
T
 
S
E
 
L
C
 
S
T
 
A
A
 
A
D
 
E
F
 
L
S
 
T
L
 
C
L
 
G
L
 
M
V
 
I
L
 
M
A
 
C
A
 
L
C
 
A
R
 
R
R
 
Q
A
 
I
S
 
P
E
 
Q
Y
 
A
E
 
T
R
 
A
I
 
S
M
 
M
R
 
K
N
 
D
G
 
G
-
 
K
W
 
W
G
 
E
K
 
R
S
 
K
F
 
-
G
 
-
M
 
-
T
 
-
E
 
K
M
 
F
L
 
M
G
 
G
T
 
T
R
 
E
V
 
L
N
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
V
x
L
G
|
G
F
x
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
|
G
R
 
R
A
 
E
V
 
V
A
 
A
K
 
T
R
 
R
A
 
M
Q
 
Q
G
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
R
 
K
V
 
T
I
 
I
Y
 
G
T
 
Y
D
|
D
I
 
-
N
 
-
R
 
-
A
 
P
A
 
I
A
 
I
S
 
S
L
 
P
E
 
E
N
 
V
G
 
S
A
 
A
T
 
S
F
 
F
-
 
G
-
 
V
-
 
Q
Y
 
Q
N
 
L
S
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
M
 
I
L
 
W
P
 
P
H
 
L
C
 
C
Q
 
D
V
 
F
L
 
I
T
 
T
L
 
V
H
|
H
V
x
T
P
|
P
-
 
L
-
 
L
G
 
P
G
 
S
G
 
T
V
 
T
P
 
G
L
 
L
M
 
L
T
 
N
K
 
D
R
 
N
E
 
T
F
 
F
A
 
A
L
 
Q
L
 
C
P
 
K
A
 
K
G
 
G
A
 
V
V
 
R
F
 
V
V
 
V
N
 
N
A
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
G
L
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
D
 
G
A
 
A
L
 
L
Y
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
T
 
Q
S
 
S
G
 
G
H
 
Q
L
 
C
F
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
Y
 
F
R
 
T
N
 
E
E
 
E
P
 
P
N
 
P
V
 
R
D
 
D
K
 
R
R
 
A
F
 
L
A
 
V
G
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
F
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
M
 
L
A
 
G
S
 
A
A
 
S
T
 
T
M
 
K
E
 
E
T
 
A
R
 
Q
D
 
S
Q
 
R
M
 
C
G
 
G

6rihA Crystal structure of phgdh in complex with compound 9 (see paper)
36% identity, 71% coverage: 73:300/320 of query aligns to 65:291/302 of 6rihA

query
sites
6rihA
V
 
L
K
 
Q
I
 
V
I
 
V
A
 
G
N
 
R
A
 
A
S
 
G
A
 
T
G
 
G
F
 
V
D
 
D
H
 
N
M
 
V
D
 
D
V
 
L
A
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
T
E
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
V
 
L
V
 
V
T
 
M
N
 
N
A
 
T
P
 
P
D
 
N
A
 
G
L
 
N
T
 
S
E
 
L
C
 
S
T
 
A
A
 
A
D
 
E
F
 
L
S
 
T
L
 
C
L
 
G
L
 
M
V
 
I
L
 
M
A
 
C
A
 
L
C
 
A
R
 
R
R
 
Q
A
 
I
S
 
P
E
 
Q
Y
 
A
E
 
T
R
 
A
I
 
S
M
 
M
R
 
K
N
 
D
G
 
G
-
 
K
W
 
W
G
 
E
K
 
R
S
 
K
F
 
-
G
 
-
M
 
-
T
 
-
E
 
K
M
 
F
L
 
M
G
 
G
T
 
T
R
 
E
V
 
L
N
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
V
 
L
G
 
G
F
 
L
G
|
G
R
 
R
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
E
V
 
V
A
 
A
K
 
T
R
 
R
A
 
M
Q
 
Q
G
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
R
 
K
V
 
T
I
 
I
Y
 
G
T
x
Y
D
|
D
I
 
-
N
 
-
R
 
-
A
x
P
A
x
I
A
x
I
S
 
S
L
 
P
E
 
E
N
 
V
G
 
S
A
 
A
T
 
S
F
 
F
-
 
G
-
 
V
-
 
Q
Y
 
Q
N
 
L
S
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
M
 
I
L
 
W
P
 
P
H
 
L
C
 
C
Q
 
D
V
 
F
L
 
I
T
 
T
L
 
V
H
 
H
V
x
T
P
|
P
-
 
L
-
 
L
G
 
P
G
 
S
G
 
T
V
 
T
P
 
G
L
|
L
M
 
L
T
 
N
K
 
D
R
 
N
E
 
T
F
 
F
A
 
A
L
 
Q
L
 
C
P
 
K
A
 
K
G
 
G
A
 
V
V
 
R
F
 
V
V
 
V
N
 
N
A
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
G
L
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
D
 
G
A
 
A
L
 
L
Y
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
T
 
Q
S
 
S
G
 
G
H
 
Q
L
 
C
F
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
Y
 
F
R
 
T
N
 
E
E
 
E
P
 
P
N
 
P
V
 
R
D
 
D
K
 
R
R
 
A
F
 
L
A
 
V
G
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
F
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
M
 
L
A
 
G
S
 
A
A
 
S
T
 
T
M
 
K
E
 
E
T
 
A
R
 
Q
D
 
S
Q
 
R
M
 
C
G
 
G

6rj5A Crystal structure of phgdh in complex with compound 39 (see paper)
36% identity, 71% coverage: 73:300/320 of query aligns to 65:291/301 of 6rj5A

query
sites
6rj5A
V
 
L
K
 
Q
I
 
V
I
 
V
A
 
G
N
 
R
A
 
A
S
 
G
A
 
T
G
 
G
F
 
V
D
 
D
H
 
N
M
 
V
D
 
D
V
 
L
A
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
T
E
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
V
 
L
V
 
V
T
 
M
N
 
N
A
 
T
P
 
P
D
 
N
A
 
G
L
 
N
T
 
S
E
 
L
C
 
S
T
 
A
A
 
A
D
 
E
F
 
L
S
 
T
L
 
C
L
 
G
L
 
M
V
 
I
L
 
M
A
 
C
A
 
L
C
 
A
R
 
R
R
 
Q
A
 
I
S
 
P
E
 
Q
Y
 
A
E
 
T
R
 
A
I
 
S
M
 
M
R
 
K
N
 
D
G
 
G
-
 
K
W
 
W
G
 
E
K
 
R
S
 
K
F
 
-
G
 
-
M
 
-
T
 
-
E
 
K
M
 
F
L
 
M
G
 
G
T
 
T
R
 
E
V
 
L
N
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
V
x
L
G
 
G
F
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
E
V
 
V
A
 
A
K
 
T
R
 
R
A
 
M
Q
 
Q
G
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
R
 
K
V
 
T
I
 
I
Y
 
G
T
x
Y
D
|
D
I
 
-
N
 
-
R
 
-
A
x
P
A
 
I
A
x
I
S
 
S
L
 
P
E
 
E
N
 
V
G
 
S
A
 
A
T
 
S
F
 
F
-
 
G
-
 
V
-
 
Q
Y
 
Q
N
 
L
S
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
M
 
I
L
 
W
P
 
P
H
 
L
C
 
C
Q
 
D
V
 
F
L
 
I
T
 
T
L
 
V
H
|
H
V
x
T
P
|
P
-
 
L
-
 
L
G
 
P
G
 
S
G
 
T
V
 
T
P
 
G
L
|
L
M
 
L
T
 
N
K
 
D
R
 
N
E
 
T
F
 
F
A
 
A
L
 
Q
L
 
C
P
 
K
A
 
K
G
 
G
A
 
V
V
 
R
F
 
V
V
 
V
N
 
N
A
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
G
L
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
D
 
G
A
 
A
L
 
L
Y
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
T
 
Q
S
 
S
G
 
G
H
 
Q
L
 
C
F
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
Y
 
F
R
 
T
N
 
E
E
 
E
P
 
P
N
 
P
V
 
R
D
 
D
K
 
R
R
 
A
F
 
L
A
 
V
G
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
F
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
M
 
L
A
 
G
S
 
A
A
 
S
T
 
T
M
 
K
E
 
E
T
 
A
R
 
Q
D
 
S
Q
 
R
M
 
C
G
 
G

6plgA Crystal structure of human phgdh complexed with compound 15 (see paper)
36% identity, 71% coverage: 73:300/320 of query aligns to 65:291/303 of 6plgA

query
sites
6plgA
V
 
L
K
 
Q
I
 
V
I
 
V
A
 
G
N
 
R
A
 
A
S
 
G
A
 
T
G
 
G
F
 
V
D
 
D
H
 
N
M
 
V
D
 
D
V
 
L
A
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
T
E
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
V
 
L
V
 
V
T
 
M
N
 
N
A
 
T
P
 
P
D
 
N
A
 
G
L
 
N
T
 
S
E
 
L
C
 
S
T
 
A
A
 
A
D
 
E
F
 
L
S
 
T
L
 
C
L
 
G
L
 
M
V
 
I
L
 
M
A
 
C
A
 
L
C
 
A
R
 
R
R
 
Q
A
 
I
S
 
P
E
 
Q
Y
 
A
E
 
T
R
 
A
I
 
S
M
 
M
R
 
K
N
 
D
G
 
G
-
 
K
W
 
W
G
 
E
K
 
R
S
 
K
F
 
-
G
 
-
M
 
-
T
 
-
E
 
K
M
 
F
L
 
M
G
 
G
T
 
T
R
 
E
V
 
L
N
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
V
 
L
G
 
G
F
 
L
G
|
G
R
|
R
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
E
V
 
V
A
 
A
K
 
T
R
 
R
A
 
M
Q
 
Q
G
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
R
 
K
V
 
T
I
 
I
Y
 
G
T
 
Y
D
|
D
I
 
-
N
 
-
R
 
-
A
x
P
A
x
I
A
x
I
S
 
S
L
 
P
E
 
E
N
 
V
G
 
S
A
 
A
T
 
S
F
 
F
-
 
G
-
 
V
-
 
Q
Y
 
Q
N
 
L
S
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
M
 
I
L
 
W
P
 
P
H
 
L
C
 
C
Q
 
D
V
 
F
L
 
I
T
 
T
L
 
V
H
|
H
V
x
T
P
 
P
-
 
L
-
x
L
G
 
P
G
 
S
G
 
T
V
 
T
P
 
G
L
 
L
M
 
L
T
 
N
K
 
D
R
 
N
E
 
T
F
 
F
A
 
A
L
 
Q
L
 
C
P
 
K
A
 
K
G
 
G
A
 
V
V
 
R
F
 
V
V
 
V
N
 
N
A
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
G
L
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
D
 
G
A
 
A
L
 
L
Y
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
T
 
Q
S
 
S
G
 
G
H
 
Q
L
 
C
F
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
Y
 
F
R
 
T
N
 
E
E
 
E
P
 
P
N
 
P
V
 
R
D
 
D
K
 
R
R
 
A
F
 
L
A
 
V
G
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
F
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
M
 
L
A
 
G
S
 
A
A
 
S
T
 
T
M
 
K
E
 
E
T
 
A
R
 
Q
D
 
S
Q
 
R
M
 
C
G
 
G

6plfA Crystal structure of human phgdh complexed with compound 1 (see paper)
36% identity, 71% coverage: 73:300/320 of query aligns to 66:292/305 of 6plfA

query
sites
6plfA
V
 
L
K
 
Q
I
 
V
I
 
V
A
 
G
N
 
R
A
 
A
S
 
G
A
 
T
G
 
G
F
 
V
D
 
D
H
 
N
M
 
V
D
 
D
V
 
L
A
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
T
E
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
V
 
L
V
 
V
T
 
M
N
 
N
A
 
T
P
 
P
D
 
N
A
 
G
L
 
N
T
 
S
E
 
L
C
 
S
T
 
A
A
 
A
D
 
E
F
 
L
S
 
T
L
 
C
L
 
G
L
 
M
V
 
I
L
 
M
A
 
C
A
 
L
C
 
A
R
 
R
R
 
Q
A
 
I
S
 
P
E
 
Q
Y
 
A
E
 
T
R
 
A
I
 
S
M
 
M
R
 
K
N
 
D
G
 
G
-
 
K
W
 
W
G
 
E
K
 
R
S
 
K
F
 
-
G
 
-
M
 
-
T
 
-
E
 
K
M
 
F
L
 
M
G
 
G
T
 
T
R
 
E
V
 
L
N
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
V
 
L
G
 
G
F
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
E
V
 
V
A
 
A
K
 
T
R
 
R
A
 
M
Q
 
Q
G
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
R
 
K
V
 
T
I
 
I
Y
 
G
T
x
Y
D
|
D
I
 
-
N
 
-
R
 
-
A
x
P
A
 
I
A
 
I
S
 
S
L
 
P
E
 
E
N
 
V
G
 
S
A
 
A
T
 
S
F
 
F
-
 
G
-
 
V
-
 
Q
Y
 
Q
N
 
L
S
 
P
L
|
L
D
 
E
E
 
E
M
 
I
L
 
W
P
 
P
H
 
L
C
 
C
Q
 
D
V
 
F
L
 
I
T
 
T
L
 
V
H
|
H
V
x
T
P
|
P
-
 
L
-
 
L
G
 
P
G
 
S
G
 
T
V
 
T
P
 
G
L
|
L
M
 
L
T
 
N
K
 
D
R
 
N
E
 
T
F
 
F
A
 
A
L
 
Q
L
 
C
P
 
K
A
 
K
G
 
G
A
 
V
V
 
R
F
 
V
V
 
V
N
 
N
A
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
G
L
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
D
 
G
A
 
A
L
 
L
Y
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
T
 
Q
S
 
S
G
 
G
H
 
Q
L
 
C
F
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
Y
 
F
R
 
T
N
 
E
E
 
E
P
 
P
N
 
P
V
 
R
D
 
D
K
 
R
R
 
A
F
 
L
A
 
V
G
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
F
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
M
 
L
A
 
G
S
 
A
A
 
S
T
 
T
M
 
K
E
 
E
T
 
A
R
 
Q
D
 
S
Q
 
R
M
 
C
G
 
G

6plfB Crystal structure of human phgdh complexed with compound 1 (see paper)
36% identity, 71% coverage: 73:300/320 of query aligns to 56:282/292 of 6plfB

query
sites
6plfB
V
 
L
K
 
Q
I
 
V
I
 
V
A
 
G
N
 
R
A
 
A
S
 
G
A
 
T
G
 
G
F
 
V
D
 
D
H
 
N
M
 
V
D
 
D
V
 
L
A
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
T
E
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
V
 
L
V
 
V
T
 
M
N
 
N
A
 
T
P
 
P
D
 
N
A
 
G
L
 
N
T
 
S
E
 
L
C
 
S
T
 
A
A
 
A
D
 
E
F
 
L
S
 
T
L
 
C
L
 
G
L
 
M
V
 
I
L
 
M
A
 
C
A
 
L
C
 
A
R
 
R
R
 
Q
A
 
I
S
 
P
E
 
Q
Y
 
A
E
 
T
R
 
A
I
 
S
M
 
M
R
 
K
N
 
D
G
 
G
-
 
K
W
 
W
G
 
E
K
 
R
S
 
K
F
 
-
G
 
-
M
 
-
T
 
-
E
 
K
M
 
F
L
 
M
G
 
G
T
 
T
R
 
E
V
 
L
N
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
V
 
L
G
 
G
F
 
L
G
 
G
R
|
R
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
E
V
 
V
A
 
A
K
 
T
R
 
R
A
 
M
Q
 
Q
G
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
R
 
K
V
 
T
I
 
I
Y
 
G
T
x
Y
D
|
D
I
 
-
N
 
-
R
 
-
A
x
P
A
 
I
A
x
I
S
 
S
L
 
P
E
 
E
N
 
V
G
 
S
A
 
A
T
 
S
F
 
F
-
 
G
-
 
V
-
 
Q
Y
 
Q
N
 
L
S
 
P
L
|
L
D
 
E
E
 
E
M
 
I
L
 
W
P
 
P
H
 
L
C
 
C
Q
 
D
V
 
F
L
 
I
T
 
T
L
 
V
H
 
H
V
x
T
P
|
P
-
 
L
-
 
L
G
 
P
G
x
S
G
 
T
V
 
T
P
 
G
L
|
L
M
 
L
T
 
N
K
 
D
R
 
N
E
 
T
F
 
F
A
 
A
L
 
Q
L
 
C
P
 
K
A
 
K
G
 
G
A
 
V
V
 
R
F
 
V
V
 
V
N
 
N
A
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
G
L
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
D
 
G
A
 
A
L
 
L
Y
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
T
 
Q
S
 
S
G
 
G
H
 
Q
L
 
C
F
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
Y
 
F
R
 
T
N
 
E
E
 
E
P
 
P
N
 
P
V
 
R
D
 
D
K
 
R
R
 
A
F
 
L
A
 
V
G
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
F
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
M
 
L
A
 
G
S
 
A
A
 
S
T
 
T
M
 
K
E
 
E
T
 
A
R
 
Q
D
 
S
Q
 
R
M
 
C
G
 
G

2w2lA Crystal structure of the holo forms of rhodotorula graminis d- mandelate dehydrogenase at 2.5a.
35% identity, 80% coverage: 63:319/320 of query aligns to 71:337/346 of 2w2lA

query
sites
2w2lA
A
 
A
E
 
D
H
 
L
I
 
I
A
 
S
A
 
H
L
 
L
P
 
P
S
 
S
T
 
S
V
 
L
K
 
K
I
 
V
I
 
F
A
 
A
N
 
A
A
 
A
S
 
G
A
 
A
G
 
G
F
 
F
D
 
D
H
 
W
M
 
L
D
 
D
V
 
L
A
 
D
A
 
A
A
 
L
R
 
N
E
 
E
R
 
R
G
 
G
I
 
V
V
 
A
V
 
F
T
 
A
N
 
N
A
 
S
P
 
R
D
 
G
A
 
A
L
x
G
T
 
D
E
 
T
C
 
A
T
|
T
A
 
S
D
 
D
F
 
L
S
 
A
L
 
L
L
 
Y
L
 
L
V
 
I
L
 
L
A
 
S
A
 
V
C
 
F
R
 
R
R
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
Y
Y
 
S
E
 
E
R
 
R
I
 
A
M
 
A
R
 
R
N
 
T
G
 
G
W
 
D
G
 
P
K
 
E
S
 
T
F
 
F
G
 
N
M
 
R
T
 
V
E
 
H
M
 
L
-
 
E
L
 
I
G
 
G
T
 
K
R
 
S
V
 
A
N
 
H
-
 
N
-
 
P
-
 
R
G
 
G
K
 
H
T
 
V
L
 
L
G
 
G
I
 
A
V
 
V
G
 
G
F
 
L
G
|
G
R
x
A
I
|
I
G
 
Q
R
 
K
A
 
E
V
 
I
A
 
A
K
 
R
R
 
K
A
 
A
-
 
V
Q
 
H
G
 
G
F
 
L
G
 
G
M
 
M
R
 
K
V
 
L
I
 
V
Y
 
Y
T
 
Y
D
|
D
I
 
V
N
 
A
R
 
P
A
 
A
A
 
D
A
 
A
S
 
E
L
 
T
E
 
E
N
 
K
-
 
A
-
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
E
F
 
R
Y
 
V
N
 
D
S
 
S
L
 
L
D
 
E
E
 
E
M
 
L
L
 
A
P
 
R
H
 
R
C
 
S
Q
 
D
V
 
C
L
 
V
T
 
S
L
 
V
H
 
S
V
|
V
P
|
P
G
 
Y
G
 
M
G
 
K
V
 
L
P
x
T
-
 
H
-
 
H
L
 
L
M
 
I
T
 
D
K
 
E
R
 
A
E
 
F
F
 
F
A
 
A
L
 
A
L
 
M
P
 
K
A
 
P
G
 
G
A
 
S
V
 
R
F
 
I
V
 
V
N
 
N
A
x
T
A
|
A
R
|
R
G
 
G
A
 
P
L
 
V
V
 
I
D
 
S
E
 
Q
D
 
D
A
 
A
L
 
L
Y
 
I
E
 
A
A
 
A
L
 
L
T
 
K
S
 
S
G
 
G
H
 
K
L
 
L
F
 
L
G
 
S
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
H
R
 
E
N
 
F
E
|
E
P
 
P
N
 
Q
V
 
V
D
 
S
K
 
K
R
 
E
F
 
L
A
 
I
G
 
E
L
 
M
D
 
K
N
 
H
V
 
V
F
 
T
L
 
L
T
 
T
P
 
T
H
|
H
M
 
I
A
x
G
S
x
G
A
 
V
T
 
A
M
 
I
E
 
E
T
 
T
R
 
F
D
 
H
Q
 
E
M
 
F
G
 
E
F
 
R
T
 
L
A
 
T
L
 
M
D
 
T
N
 
N
V
 
I
A
 
D
A
 
R
-
 
F
V
 
L
L
 
L
N
 
Q
E
 
G
R
 
K
P
 
P
A
 
L
L
 
L
N
 
T
P
 
P

Query Sequence

>BPHYT_RS20960 FitnessBrowser__BFirm:BPHYT_RS20960
MSENNRTRLLIARKVPTAVANRAEAEFHAFVTESDMDAWSVVDFCKKHATPAVLIGKKSG
LQAEHIAALPSTVKIIANASAGFDHMDVAAARERGIVVTNAPDALTECTADFSLLLVLAA
CRRASEYERIMRNGWGKSFGMTEMLGTRVNGKTLGIVGFGRIGRAVAKRAQGFGMRVIYT
DINRAAASLENGATFYNSLDEMLPHCQVLTLHVPGGGVPLMTKREFALLPAGAVFVNAAR
GALVDEDALYEALTSGHLFGAGLDVYRNEPNVDKRFAGLDNVFLTPHMASATMETRDQMG
FTALDNVAAVLNERPALNPV

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory