SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing BPHYT_RS21925 FitnessBrowser__BFirm:BPHYT_RS21925 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4mynA Crystal structure of trypanosoma cruzi formiminoglutamase n114h variant with mn2+2 (see paper)
28% identity, 87% coverage: 44:320/320 of query aligns to 21:291/298 of 4mynA

query
sites
4mynA
V
 
V
V
 
I
V
 
I
G
 
G
F
 
F
G
 
P
S
 
Y
D
 
D
E
 
E
G
 
G
V
 
C
R
 
V
R
 
R
N
 
N
Q
 
G
G
 
G
R
 
R
T
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
K
H
 
K
A
 
G
P
 
P
K
 
A
E
 
A
L
 
F
R
 
R
R
 
F
A
 
F
L
 
L
A
 
Q
G
 
R
L
 
L
P
 
G
A
 
S
K
 
V
N
 
N
S
 
N
M
 
L
A
 
E
M
 
L
-
 
N
-
 
V
-
 
D
-
 
A
-
 
S
-
 
H
-
 
L
-
 
K
L
 
L
A
 
Y
D
 
D
A
 
A
G
 
G
D
 
D
V
 
I
A
 
T
C
 
A
D
 
S
D
 
-
G
 
-
D
 
T
L
 
L
E
 
E
G
 
E
A
 
A
Q
 
H
A
 
E
E
 
K
L
 
L
A
 
E
N
 
S
V
 
K
I
 
V
S
 
F
E
 
T
V
 
V
L
 
L
A
 
A
S
 
R
G
 
G
G
 
A
R
 
F
P
 
P
L
 
F
V
 
V
F
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
H
|
H
E
 
D
V
 
Q
A
 
S
W
 
A
A
 
P
T
 
N
Y
 
G
C
 
R
G
 
A
L
 
M
V
 
L
L
 
-
H
 
-
Q
 
-
H
 
-
R
 
-
R
 
-
E
 
-
A
 
-
D
 
-
E
 
-
S
 
R
A
 
A
T
 
F
P
 
P
R
 
G
K
 
D
L
 
V
L
 
G
I
 
V
I
 
I
N
 
N
F
 
V
D
|
D
A
 
S
H
|
H
F
 
L
D
|
D
L
 
V
R
 
R
Q
 
P
K
 
P
R
 
L
P
 
S
-
 
D
-
 
G
-
 
R
A
 
V
N
 
H
S
|
S
G
 
G
T
 
T
P
 
P
F
 
F
D
 
R
Q
 
Q
I
 
L
A
 
L
N
 
E
D
 
E
C
 
S
A
 
S
E
 
F
R
 
S
R
 
G
V
 
K
P
 
R
F
 
F
-
 
V
N
 
E
Y
 
F
V
 
A
C
 
C
F
 
Q
G
 
G
I
 
-
S
 
S
D
 
Q
L
 
C
G
 
G
N
 
A
T
 
L
A
 
H
S
 
A
L
 
Q
F
 
Y
V
 
V
H
 
R
A
 
D
Q
 
H
R
 
Q
L
 
G
G
 
H
V
 
L
R
 
M
Y
 
W
A
 
L
L
 
S
D
 
E
V
 
V
D
 
R
M
 
K
Q
 
K
E
 
G
T
 
A
Q
 
V
L
 
A
P
 
A
L
 
L
R
 
E
L
 
-
Q
 
-
E
 
-
L
 
-
D
 
D
L
 
A
M
 
F
L
 
G
D
 
L
E
 
T
A
 
G
D
 
K
D
 
N
V
 
T
Y
 
F
L
 
F
T
 
S
I
 
F
D
|
D
L
 
V
D
|
D
V
 
S
L
 
L
P
 
K
A
 
S
A
 
S
T
 
D
A
 
M
P
 
P
G
 
G
V
 
V
S
 
S
A
 
C
P
 
P
A
 
A
A
 
A
L
 
V
G
 
G
V
 
L
P
 
S
L
 
A
F
 
Q
V
 
E
V
 
A
E
 
F
E
 
D
M
 
M
V
 
C
R
 
F
R
 
L
V
 
A
R
 
G
G
 
K
S
 
T
G
 
P
K
 
T
L
 
V
R
 
M
A
 
M
A
 
M
D
 
D
I
 
M
A
 
S
E
|
E
Y
 
L
N
 
N
P
 
P
S
 
-
L
 
L
D
 
V
Q
 
E
D
 
E
R
 
Y
R
 
R
T
 
S
A
 
P
R
 
R
A
 
V
A
 
A
A
 
V
R
 
Y
L
 
M
A
 
F
Y
 
Y
R
 
H
L
 
F
L
 
V

3m1rD The crystal structure of formimidoylglutamase from bacillus subtilis subsp. Subtilis str. 168
24% identity, 83% coverage: 55:320/320 of query aligns to 49:313/321 of 3m1rD

query
sites
3m1rD
R
 
K
R
 
S
N
 
S
Q
 
I
G
 
S
R
 
H
T
 
S
G
 
G
A
 
A
A
 
S
H
 
F
A
 
A
P
 
P
K
 
G
E
 
T
L
 
I
R
 
R
R
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
K
G
 
H
L
 
S
P
 
S
A
 
A
K
 
Y
N
 
S
S
 
A
-
 
E
-
 
L
-
 
G
-
 
E
-
 
H
-
 
V
-
 
V
M
 
S
A
 
E
M
 
L
L
 
L
A
 
Y
D
 
D
A
 
L
G
 
G
D
 
D
V
 
I
A
 
D
C
 
I
D
 
H
D
 
V
G
 
T
D
 
D
L
 
I
E
 
V
G
 
K
A
 
S
Q
 
H
A
 
H
E
 
H
L
 
I
A
 
F
N
 
Q
V
 
T
I
 
M
S
 
H
E
 
A
V
 
L
L
 
L
A
 
S
S
 
D
G
 
H
-
 
P
-
 
D
G
 
W
R
 
V
P
 
P
L
 
L
V
 
I
F
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
D
H
x
N
E
 
S
V
 
I
A
 
S
W
 
Y
A
 
S
T
 
T
Y
 
I
C
 
K
G
 
A
L
 
I
V
 
-
L
 
-
H
 
-
Q
 
-
H
 
-
R
 
-
R
 
-
E
 
-
A
 
-
D
 
-
E
 
-
S
 
A
A
 
Q
T
 
T
P
 
K
R
 
G
K
 
T
L
 
T
L
 
A
I
 
V
I
 
I
N
 
Q
F
 
F
D
|
D
A
 
A
H
|
H
F
 
H
D
|
D
L
 
V
R
 
R
Q
 
N
K
 
T
R
 
E
-
 
D
-
 
G
-
 
G
P
 
P
A
 
T
N
|
N
S
 
-
G
 
G
T
 
T
P
 
P
F
 
F
D
 
R
Q
 
R
I
 
L
A
 
L
N
 
D
D
 
E
C
 
-
A
 
-
E
 
E
R
 
I
R
 
I
V
 
E
P
 
G
F
 
Q
N
 
H
Y
 
L
V
 
I
C
 
Q
F
 
L
G
 
G
I
 
I
S
 
R
D
 
E
L
 
F
G
 
S
N
 
N
T
 
S
A
 
Q
S
 
A
L
 
Y
F
 
E
V
 
A
H
 
Y
A
 
A
Q
 
K
R
 
K
L
 
H
G
 
N
V
 
V
R
 
N
-
 
I
Y
 
H
A
 
T
L
 
M
D
 
D
V
 
M
D
 
I
M
 
R
Q
 
E
E
 
K
T
 
G
Q
 
L
L
 
I
P
 
P
L
 
T
R
 
I
L
 
K
Q
 
E
E
 
I
L
 
L
D
 
P
L
 
V
M
 
V
L
 
Q
D
 
D
E
 
K
A
 
T
D
 
D
D
 
F
V
 
I
Y
 
F
L
 
I
T
 
S
I
 
V
D
|
D
L
 
M
D
|
D
V
 
V
L
 
L
P
 
D
A
 
Q
A
 
S
T
 
H
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
C
S
 
P
A
 
A
P
 
I
A
 
G
A
 
P
L
 
G
G
 
G
V
 
L
P
 
Y
L
 
T
F
 
D
V
 
E
V
 
L
E
 
L
E
 
E
M
 
A
V
 
V
R
 
K
R
 
Y
V
 
I
R
 
A
G
 
Q
S
 
Q
G
 
P
K
 
N
L
 
V
R
 
A
A
 
G
A
 
I
D
 
E
I
 
I
A
 
V
E
|
E
Y
 
V
N
 
D
P
 
P
S
 
T
L
 
L
D
 
D
Q
 
F
D
 
R
R
 
D
R
 
M
T
 
T
A
 
S
R
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
H
L
 
V
A
 
L
Y
 
L
R
 
H
L
 
A
L
 
L

6dktE Crystal structure of arginase from bacillus subtilis
26% identity, 87% coverage: 42:320/320 of query aligns to 2:263/268 of 6dktE

query
sites
6dktE
T
 
T
T
 
I
V
 
S
V
 
V
V
 
I
G
 
G
F
 
M
G
 
P
S
 
M
D
 
D
E
 
L
G
 
G
V
 
-
R
 
-
R
 
-
N
 
-
Q
 
Q
G
 
A
R
 
R
T
 
R
G
 
G
A
 
V
A
 
D
H
 
M
A
 
G
P
 
P
K
 
S
E
 
A
L
 
I
R
 
R
R
 
Y
A
 
A
L
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
-
K
 
-
N
 
H
S
 
L
M
 
I
A
 
E
M
 
R
L
 
L
A
 
S
D
 
D
A
 
M
G
 
G
D
 
Y
V
 
T
A
 
V
C
 
E
D
 
D
D
 
L
G
 
G
D
 
D
L
 
I
E
 
P
-
 
I
-
 
N
-
 
S
-
 
V
-
 
L
G
 
A
A
 
G
Q
 
N
A
 
E
E
 
K
L
 
L
A
 
A
N
 
Q
V
 
K
I
 
V
S
 
N
E
 
K
V
 
V
L
 
I
A
 
E
S
 
E
G
 
K
G
 
K
R
 
F
P
 
P
L
 
L
V
 
V
F
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
D
H
|
H
E
 
S
V
 
I
A
 
A
W
 
I
A
 
G
T
 
T
Y
 
L
C
 
A
G
 
G
L
 
T
V
 
A
L
 
K
H
 
H
Q
 
Y
H
 
-
R
 
-
R
 
-
E
 
-
A
 
-
D
 
-
E
 
-
S
 
-
A
 
-
T
 
-
P
 
-
R
 
D
K
 
N
L
 
L
L
 
G
I
 
V
I
 
I
N
x
W
F
 
Y
D
|
D
A
 
A
H
|
H
F
 
G
D
|
D
L
 
L
R
 
N
Q
 
M
K
 
P
R
 
L
P
 
A
A
 
V
N
 
S
S
 
L
G
 
G
T
 
I
P
 
G
F
 
H
D
 
E
Q
 
S
I
 
L
A
 
V
N
 
N
-
 
L
-
 
E
D
 
G
C
 
Y
A
 
A
E
 
P
R
 
K
R
 
I
V
 
K
P
 
P
F
 
E
N
 
N
Y
 
V
V
 
V
C
 
I
F
 
I
G
 
G
I
 
A
S
 
R
D
 
S
L
 
L
G
 
D
N
 
E
T
 
G
A
 
E
S
 
R
L
 
K
F
 
Y
V
 
I
H
 
K
A
 
E
Q
 
S
R
 
G
L
 
M
G
 
K
V
 
V
R
 
Y
Y
 
T
A
 
M
L
 
H
D
 
E
V
 
I
D
 
D
-
 
R
M
 
L
Q
 
G
E
 
M
T
 
T
Q
 
K
L
 
V
P
 
-
L
 
-
R
 
-
L
 
I
Q
 
E
E
 
E
L
 
T
D
 
L
L
 
D
M
 
Y
L
 
L
D
 
S
E
 
A
A
 
C
D
 
D
D
 
G
V
 
V
Y
 
H
L
 
L
T
 
S
I
 
L
D
|
D
L
 
L
D
|
D
V
 
G
L
 
L
P
 
D
A
 
P
A
 
N
T
 
D
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
V
S
 
G
A
 
T
P
 
P
A
 
V
A
 
V
L
 
G
G
 
G
V
 
I
P
 
S
L
 
Y
F
 
R
V
 
E
V
 
S
E
 
H
E
 
L
M
 
A
V
 
M
R
 
E
R
 
M
V
 
L
R
 
Y
G
 
D
S
 
A
G
 
G
K
 
I
L
 
I
R
 
T
A
 
S
A
 
A
D
 
E
I
 
F
A
 
V
E
 
E
Y
 
V
N
 
N
P
 
P
S
 
I
L
 
L
D
 
D
Q
 
H
D
 
K
R
 
N
R
 
K
T
 
T
A
 
G
R
 
K
A
 
T
A
 
A
A
 
V
R
 
E
L
 
L
A
 
V
Y
 
E
R
 
S
L
 
L
L
 
L

3lhlA Crystal structure of a putative agmatinase from clostridium difficile
25% identity, 86% coverage: 44:319/320 of query aligns to 8:267/276 of 3lhlA

query
sites
3lhlA
V
 
I
V
 
V
V
 
F
G
 
G
F
 
V
G
 
G
S
 
F
D
 
D
E
 
-
G
 
G
V
 
T
R
 
T
R
 
S
N
 
N
Q
 
-
G
 
-
R
 
R
T
 
P
G
 
G
A
 
A
A
 
R
H
 
F
A
 
A
P
 
S
K
 
S
E
 
S
L
 
M
R
 
R
R
 
K
A
 
E
L
 
F
A
 
Y
G
 
G
L
 
L
P
 
E
A
 
T
K
 
Y
N
 
S
S
 
P
M
 
F
A
 
L
M
 
D
L
 
L
A
 
D
D
 
L
A
 
E
G
 
D
D
 
Y
V
 
N
A
 
I
C
 
C
D
 
D
D
 
Y
G
 
G
D
 
D
L
 
L
E
 
E
G
 
I
A
 
S
Q
 
V
A
 
G
E
 
S
L
 
T
A
 
E
N
 
Q
V
 
V
I
 
L
S
 
K
E
 
E
V
 
I
L
 
Y
A
 
Q
S
 
E
G
 
T
G
 
Y
R
 
K
-
 
I
-
 
V
-
 
R
-
 
D
-
 
S
-
 
K
-
 
V
P
 
P
L
 
F
V
 
M
F
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
E
H
|
H
E
 
L
V
 
V
A
 
T
W
 
L
A
 
P
T
 
A
Y
 
F
C
 
K
G
 
A
L
 
V
V
 
-
L
 
-
H
 
-
Q
 
-
H
 
H
R
 
E
R
 
K
E
 
Y
A
 
N
D
 
D
E
 
-
S
 
-
A
 
-
T
 
-
P
 
-
R
 
-
K
 
-
L
 
I
L
 
Y
I
 
V
I
 
I
N
 
H
F
 
F
D
|
D
A
 
A
H
|
H
F
 
T
D
|
D
L
 
L
R
 
R
Q
 
E
K
 
E
R
 
-
P
 
-
A
 
-
N
 
-
S
 
-
G
 
-
T
 
-
P
 
-
F
 
Y
D
 
N
Q
 
N
I
 
S
A
 
K
N
 
N
D
 
S
C
x
H
A
 
A
E
 
T
R
 
-
R
 
-
V
 
-
P
 
-
F
 
-
N
 
-
Y
 
-
V
 
V
C
 
I
F
 
K
G
 
R
I
 
I
S
 
W
D
 
D
L
 
I
G
 
V
N
 
G
T
 
D
A
 
N
S
 
K
L
 
I
F
 
F
V
 
Q
H
 
F
A
 
G
Q
 
I
R
 
R
L
 
S
G
 
G
V
 
T
R
 
K
Y
 
E
A
 
E
L
 
F
D
 
K
V
 
F
D
 
A
M
 
T
Q
 
E
E
 
E
T
 
K
Q
 
H
L
 
T
P
 
Y
L
 
M
R
 
E
L
 
I
Q
 
G
E
 
G
L
 
I
D
 
D
L
 
T
-
 
F
-
 
E
-
 
N
-
 
I
-
 
V
-
 
N
M
 
M
L
 
L
D
 
N
E
 
-
A
 
G
D
 
K
D
 
N
V
 
I
Y
 
Y
L
 
L
T
 
T
I
 
I
D
|
D
L
 
L
D
|
D
V
 
V
L
 
L
P
 
D
A
 
A
A
 
S
T
 
V
A
 
F
P
 
P
G
 
G
V
 
T
S
 
G
A
 
T
P
 
P
A
 
E
A
 
P
L
 
G
G
 
G
V
 
V
P
 
N
L
 
Y
F
 
R
V
 
E
V
 
F
E
 
Q
E
 
E
M
 
I
V
 
F
R
 
K
R
 
I
V
 
I
R
 
K
G
 
N
S
 
S
G
 
N
-
 
I
K
 
N
L
 
I
R
 
V
A
 
G
A
 
C
D
 
D
I
 
I
A
 
V
E
|
E
Y
 
L
N
 
S
P
 
P
S
 
D
L
 
Y
D
 
D
Q
 
T
D
 
T
R
 
G
R
 
V
T
 
S
A
 
T
R
 
V
A
 
I
A
 
A
A
 
C
R
 
K
L
 
I
A
 
L
Y
 
R
R
 
E
L
 
L

Q9I6K2 Guanidinopropionase; EC 3.5.3.17 from Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1) (see paper)
27% identity, 82% coverage: 60:320/320 of query aligns to 51:307/318 of Q9I6K2

query
sites
Q9I6K2
R
 
R
T
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
R
H
 
H
A
 
G
P
 
P
K
 
R
E
 
E
L
 
V
R
 
R
R
 
N
A
 
L
L
 
S
A
 
S
G
 
L
L
 
M
P
 
R
A
 
K
K
 
V
N
 
H
S
 
H
M
 
V
A
 
S
M
 
R
L
 
I
A
 
A
-
 
P
-
 
Y
-
 
D
-
 
L
-
 
V
-
 
R
-
 
V
-
 
G
D
 
D
A
 
L
G
 
G
D
 
D
V
 
A
A
 
P
C
 
V
D
 
N
D
 
P
G
 
I
D
 
D
L
 
L
E
 
L
G
 
D
A
 
S
Q
 
L
A
 
R
E
 
R
L
 
I
A
 
E
N
 
G
V
 
F
I
 
Y
S
 
R
E
 
Q
V
 
V
L
 
H
A
 
A
S
 
A
G
 
G
G
 
T
R
 
L
P
 
P
L
 
L
V
 
S
F
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
D
H
|
H
E
 
L
V
 
V
A
 
T
W
 
L
A
 
P
T
 
I
Y
 
F
C
 
R
G
 
A
L
 
L
V
 
-
L
 
-
H
 
-
Q
 
-
H
 
-
R
 
G
R
 
R
E
 
E
A
 
-
D
 
-
E
 
-
S
 
-
A
 
-
T
 
-
P
 
-
R
 
R
K
 
P
L
 
L
L
 
G
I
 
M
I
 
V
N
 
H
F
 
F
D
|
D
A
 
A
H
|
H
F
 
S
D
|
D
L
 
T
R
 
N
Q
 
D
K
 
R
-
x
Y
-
 
F
-
 
G
-
 
D
R
 
N
P
 
P
A
 
Y
N
 
T
S
 
H
G
 
G
T
 
T
P
 
P
F
 
F
D
 
R
Q
 
R
I
 
A
A
 
I
N
 
E
D
 
E
C
 
G
A
 
L
E
 
L
R
 
D
R
 
-
V
 
-
P
 
P
F
 
L
N
 
R
Y
 
T
V
 
V
C
 
Q
F
 
I
G
 
G
I
 
I
S
 
R
D
 
G
L
 
S
G
 
V
N
 
Y
T
 
S
A
 
P
S
 
D
L
 
D
F
 
D
V
 
A
H
 
F
A
 
A
Q
 
R
R
 
E
L
 
C
G
 
G
V
 
I
R
 
R
Y
 
V
A
 
I
L
 
H
D
 
M
V
 
E
D
 
E
M
 
F
Q
 
V
E
 
E
T
 
L
Q
 
G
L
 
V
P
 
E
L
 
A
R
 
T
L
 
L
Q
 
A
E
 
E
L
 
A
D
 
R
L
 
R
M
 
V
L
 
V
D
 
G
E
 
-
A
 
A
D
 
G
D
 
P
V
 
T
Y
 
Y
L
 
V
T
 
S
I
 
F
D
|
D
L
 
V
D
|
D
V
 
V
L
 
L
P
 
D
A
 
P
A
 
A
T
 
F
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
T
S
 
G
A
 
T
P
 
P
A
 
E
A
 
I
L
 
G
G
 
G
V
 
M
P
 
T
L
 
S
F
 
L
V
 
Q
V
 
A
E
 
Q
E
 
Q
M
 
L
V
 
V
R
 
R
R
 
G
V
 
L
R
 
R
G
 
G
S
 
L
G
 
-
K
 
D
L
 
L
R
 
V
A
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
V
A
 
V
E
 
E
Y
 
V
N
 
S
P
 
P
S
 
P
L
 
F
D
 
D
Q
 
V
D
 
G
R
 
G
R
 
A
T
 
T
A
 
A
R
 
L
A
 
V
A
 
G
A
 
A
R
 
T
L
 
M
A
 
M
Y
 
F
R
 
E
L
 
L
L
 
L

3niqA Crystal structure of pseudomonas aeruginosa guanidinopropionase (see paper)
27% identity, 82% coverage: 60:320/320 of query aligns to 48:304/315 of 3niqA

query
sites
3niqA
R
 
R
T
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
R
H
 
H
A
 
G
P
 
P
K
 
R
E
 
E
L
 
V
R
 
R
R
 
N
A
 
L
L
 
S
A
 
S
G
 
L
L
 
M
P
 
R
A
 
K
K
 
V
N
 
H
S
 
H
M
 
V
A
 
S
M
 
R
L
 
I
A
 
A
-
 
P
-
 
Y
-
 
D
-
 
L
-
 
V
-
 
R
-
 
V
-
 
G
D
 
D
A
 
L
G
 
G
D
 
D
V
 
A
A
 
P
C
 
V
D
 
N
D
 
P
G
 
I
D
 
D
L
 
L
E
 
L
G
 
D
A
 
S
Q
 
L
A
 
R
E
 
R
L
 
I
A
 
E
N
 
G
V
 
F
I
 
Y
S
 
R
E
 
Q
V
 
V
L
 
H
A
 
A
S
 
A
G
 
G
G
 
T
R
 
L
P
 
P
L
 
L
V
 
S
F
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
D
H
|
H
E
 
L
V
 
V
A
 
T
W
 
L
A
 
P
T
 
I
Y
 
F
C
 
R
G
 
A
L
 
L
V
 
-
L
 
-
H
 
-
Q
 
-
H
 
-
R
 
G
R
 
R
E
 
E
A
 
-
D
 
-
E
 
-
S
 
-
A
 
-
T
 
-
P
 
-
R
 
R
K
 
P
L
 
L
L
 
G
I
 
M
I
 
V
N
 
H
F
 
F
D
|
D
A
 
A
H
|
H
F
 
S
D
|
D
L
 
T
R
 
N
Q
 
D
K
 
R
-
 
Y
-
 
F
-
 
G
-
 
D
R
 
N
P
 
P
A
 
Y
N
 
T
S
x
H
G
 
G
T
 
T
P
 
P
F
 
F
D
 
R
Q
 
R
I
 
A
A
 
I
N
 
E
D
 
E
C
 
G
A
 
L
E
 
L
R
 
D
R
 
-
V
 
-
P
 
P
F
 
L
N
 
R
Y
 
T
V
 
V
C
 
Q
F
 
I
G
 
G
I
 
I
S
 
R
D
 
G
L
 
S
G
 
V
N
 
Y
T
 
S
A
 
P
S
 
D
L
 
D
F
 
D
V
 
A
H
 
F
A
 
A
Q
 
R
R
 
E
L
 
C
G
 
G
V
 
I
R
 
R
Y
 
V
A
 
I
L
 
H
D
 
M
V
 
E
D
 
E
M
 
F
Q
 
V
E
 
E
T
 
L
Q
 
G
L
 
V
P
 
E
L
 
A
R
 
T
L
 
L
Q
 
A
E
 
E
L
 
A
D
 
R
L
 
R
M
 
V
L
 
V
D
 
G
E
 
-
A
 
A
D
 
G
D
 
P
V
 
T
Y
 
Y
L
 
V
T
 
S
I
 
F
D
|
D
L
 
V
D
|
D
V
 
V
L
 
L
P
 
D
A
 
P
A
 
A
T
 
F
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
T
S
 
G
A
 
T
P
 
P
A
 
E
A
 
I
L
 
G
G
 
G
V
 
M
P
 
T
L
 
S
F
 
L
V
 
Q
V
 
A
E
 
Q
E
 
Q
M
 
L
V
 
V
R
 
R
R
 
G
V
 
L
R
 
R
G
 
G
S
 
L
G
 
-
K
 
D
L
 
L
R
 
V
A
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
V
A
 
V
E
|
E
Y
 
V
N
 
S
P
 
P
S
 
P
L
 
F
D
 
D
Q
 
V
D
 
G
R
 
G
R
 
A
T
 
T
A
 
A
R
 
L
A
 
V
A
 
G
A
 
A
R
 
T
L
 
M
A
 
M
Y
 
F
R
 
E
L
 
L
L
 
L

6dktA Crystal structure of arginase from bacillus subtilis
25% identity, 87% coverage: 42:320/320 of query aligns to 2:278/283 of 6dktA

query
sites
6dktA
T
 
T
T
 
I
V
 
S
V
 
V
V
 
I
G
 
G
F
 
M
G
 
P
S
 
M
D
 
D
E
 
L
G
 
G
V
 
-
R
 
-
R
 
-
N
 
-
Q
 
Q
G
 
A
R
 
R
T
 
R
G
 
G
A
 
V
A
 
D
H
 
M
A
 
G
P
 
P
K
 
S
E
 
A
L
 
I
R
 
R
R
 
Y
A
 
A
L
 
H
A
 
L
G
 
I
L
 
E
P
 
R
A
 
L
K
 
S
N
 
D
S
 
M
M
 
G
A
 
Y
M
 
T
L
 
V
A
 
E
D
 
D
A
 
L
G
 
G
D
 
D
V
 
I
A
 
P
C
 
I
D
 
N
D
 
N
-
 
L
G
 
N
D
 
S
L
 
V
E
 
L
G
 
A
A
 
G
Q
 
N
A
 
E
E
 
K
L
 
L
A
 
A
N
 
Q
V
 
K
I
 
V
S
 
N
E
 
K
V
 
V
L
 
I
A
 
E
S
 
E
G
 
K
G
 
K
R
 
F
P
 
P
L
 
L
V
 
V
F
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
D
H
|
H
E
 
S
V
 
I
A
 
A
W
 
I
A
 
G
T
 
T
Y
 
L
C
 
A
G
 
G
L
 
T
V
 
A
L
 
K
H
 
H
Q
 
Y
H
 
-
R
 
-
R
 
-
E
 
-
A
 
-
D
 
-
E
 
-
S
 
-
A
 
-
T
 
-
P
 
-
R
 
D
K
 
N
L
 
L
L
 
G
I
 
V
I
 
I
N
x
W
F
 
Y
D
|
D
A
 
A
H
|
H
F
 
G
D
|
D
L
 
L
R
 
N
Q
 
T
K
 
L
R
 
E
P
 
T
A
 
S
N
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
N
-
 
I
-
 
H
-
 
G
-
 
M
P
 
P
F
 
L
-
 
A
-
 
V
-
 
S
-
 
L
-
 
G
-
 
I
-
 
G
-
 
H
D
 
E
Q
 
S
I
 
L
A
 
V
N
 
N
-
 
L
-
 
E
D
 
G
C
 
Y
A
 
A
E
 
P
R
 
K
R
 
I
V
 
K
P
 
P
F
 
E
N
 
N
Y
 
V
V
 
V
C
 
I
F
 
I
G
 
G
I
 
A
S
 
R
D
 
S
L
 
L
G
 
D
N
 
E
T
 
G
A
 
E
S
 
R
L
 
K
F
 
Y
V
 
I
H
 
K
A
 
E
Q
 
S
R
 
G
L
 
M
G
 
K
V
 
V
R
 
Y
Y
 
T
A
 
M
L
 
H
D
 
E
V
 
I
D
 
D
-
 
R
M
 
L
Q
 
G
E
 
M
T
 
T
Q
 
K
L
 
V
P
 
-
L
 
-
R
 
-
L
 
I
Q
 
E
E
 
E
L
 
T
D
 
L
L
 
D
M
 
Y
L
 
L
D
 
S
E
 
A
A
 
C
D
 
D
D
 
G
V
 
V
Y
 
H
L
 
L
T
 
S
I
 
L
D
|
D
L
 
L
D
|
D
V
 
G
L
 
L
P
 
D
A
 
P
A
 
N
T
 
D
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
V
S
 
G
A
 
T
P
 
P
A
 
V
A
 
V
L
 
G
G
 
G
V
 
I
P
 
S
L
 
Y
F
 
R
V
 
E
V
 
S
E
 
H
E
 
L
M
 
A
V
 
M
R
 
E
R
 
M
V
 
L
R
 
Y
G
 
D
S
 
A
G
 
G
K
 
I
L
 
I
R
 
T
A
 
S
A
 
A
D
 
E
I
 
F
A
 
V
E
 
E
Y
 
V
N
 
N
P
 
P
S
 
I
L
 
L
D
 
D
Q
 
H
D
 
K
R
 
N
R
 
K
T
 
T
A
 
G
R
 
K
A
 
T
A
 
A
A
 
V
R
 
E
L
 
L
A
 
V
Y
 
E
R
 
S
L
 
L
L
 
L

3nipB Crystal structure of pseudomonas aeruginosa guanidinopropionase complexed with 1,6-diaminohexane (see paper)
27% identity, 82% coverage: 60:320/320 of query aligns to 49:305/316 of 3nipB

query
sites
3nipB
R
|
R
T
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
R
H
 
H
A
 
G
P
 
P
K
 
R
E
 
E
L
 
V
R
 
R
R
 
N
A
 
L
L
 
S
A
 
S
G
 
L
L
 
M
P
 
R
A
 
K
K
 
V
N
 
H
S
 
H
M
 
V
A
 
S
M
 
R
L
 
I
A
 
A
-
 
P
-
 
Y
-
 
D
-
 
L
-
 
V
-
 
R
-
 
V
-
 
G
D
 
D
A
 
L
G
 
G
D
 
D
V
 
A
A
 
P
C
 
V
D
 
N
D
 
P
G
 
I
D
 
D
L
 
L
E
 
L
G
 
D
A
 
S
Q
 
L
A
 
R
E
 
R
L
 
I
A
 
E
N
 
G
V
 
F
I
 
Y
S
 
R
E
 
Q
V
 
V
L
 
H
A
 
A
S
 
A
G
 
G
G
 
T
R
 
L
P
 
P
L
 
L
V
 
S
F
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
D
H
|
H
E
 
L
V
 
V
A
 
T
W
 
L
A
 
P
T
 
I
Y
 
F
C
 
R
G
 
A
L
 
L
V
 
-
L
 
-
H
 
-
Q
 
-
H
 
-
R
 
G
R
 
R
E
 
E
A
 
-
D
 
-
E
 
-
S
 
-
A
 
-
T
 
-
P
 
-
R
 
R
K
 
P
L
 
L
L
 
G
I
 
M
I
 
V
N
 
H
F
 
F
D
|
D
A
 
A
H
|
H
F
 
S
D
|
D
L
 
T
R
 
N
Q
 
D
K
 
R
-
 
Y
-
 
F
-
 
G
-
 
D
R
 
N
P
 
P
A
 
Y
N
 
T
S
x
H
G
 
G
T
 
T
P
 
P
F
 
F
D
 
R
Q
 
R
I
 
A
A
 
I
N
 
E
D
 
E
C
 
G
A
 
L
E
 
L
R
 
D
R
 
-
V
 
-
P
 
P
F
 
L
N
 
R
Y
 
T
V
 
V
C
 
Q
F
 
I
G
 
G
I
 
I
S
 
R
D
 
G
L
 
S
G
 
V
N
 
Y
T
 
S
A
 
P
S
 
D
L
 
D
F
 
D
V
 
A
H
 
F
A
 
A
Q
 
R
R
 
E
L
 
C
G
 
G
V
 
I
R
 
R
Y
 
V
A
 
I
L
 
H
D
 
M
V
 
E
D
 
E
M
 
F
Q
 
V
E
 
E
T
 
L
Q
 
G
L
 
V
P
 
E
L
 
A
R
 
T
L
 
L
Q
 
A
E
 
E
L
 
A
D
 
R
L
 
R
M
 
V
L
 
V
D
 
G
E
 
-
A
 
A
D
 
G
D
 
P
V
 
T
Y
 
Y
L
 
V
T
 
S
I
 
F
D
|
D
L
 
V
D
|
D
V
 
V
L
 
L
P
 
D
A
x
P
A
 
A
T
x
F
A
 
A
P
|
P
G
 
G
V
 
T
S
 
G
A
 
T
P
 
P
A
 
E
A
 
I
L
 
G
G
 
G
V
 
M
P
 
T
L
 
S
F
 
L
V
 
Q
V
 
A
E
 
Q
E
 
Q
M
 
L
V
 
V
R
 
R
R
 
G
V
 
L
R
 
R
G
 
G
S
 
L
G
 
-
K
 
D
L
 
L
R
 
V
A
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
V
A
 
V
E
|
E
Y
 
V
N
 
S
P
 
P
S
 
P
L
 
F
D
 
D
Q
 
V
D
 
G
R
 
G
R
x
A
T
 
T
A
 
A
R
 
L
A
x
V
A
 
G
A
 
A
R
 
T
L
 
M
A
 
M
Y
 
F
R
 
E
L
 
L
L
 
L

Q57757 Agmatinase; EC 3.5.3.11 from Methanocaldococcus jannaschii (strain ATCC 43067 / DSM 2661 / JAL-1 / JCM 10045 / NBRC 100440) (Methanococcus jannaschii) (see paper)
26% identity, 82% coverage: 60:320/320 of query aligns to 37:280/284 of Q57757

query
sites
Q57757
R
 
K
T
 
P
G
 
G
A
 
A
A
 
R
H
 
E
A
 
G
P
 
G
K
 
N
E
 
A
L
 
I
R
 
R
R
 
T
A
 
A
L
 
S
A
 
W
G
 
G
L
 
L
P
 
E
A
 
T
K
 
Y
N
 
S
S
 
P
M
 
I
A
 
L
M
 
D
L
 
R
A
 
D
D
 
L
A
 
A
G
 
E
D
 
L
V
 
K
A
 
Y
C
|
C
D
 
D
-
 
L
-
 
K
D
 
D
G
 
L
D
 
D
L
 
L
E
 
Y
G
 
G
A
 
S
Q
 
Q
A
 
E
E
 
E
L
 
I
A
 
F
N
 
G
V
 
T
I
 
I
S
 
H
-
 
S
-
 
V
-
 
S
-
 
R
E
 
E
V
 
I
L
 
L
A
 
K
S
 
E
G
 
N
G
 
K
R
 
K
P
 
I
L
 
I
V
 
V
F
 
F
G
 
G
G
 
G
G
 
E
H
 
H
E
 
S
V
 
I
A
 
T
W
 
Y
A
 
P
T
 
-
Y
 
-
C
 
-
G
 
-
L
 
-
V
 
I
L
 
I
H
 
K
Q
 
A
H
 
V
R
 
K
R
 
D
E
 
I
A
 
Y
D
 
D
E
 
D
S
 
-
A
 
-
T
 
-
P
 
-
R
 
-
K
 
-
L
 
F
L
 
I
I
 
V
I
 
I
N
 
Q
F
 
F
D
 
D
A
 
A
H
 
H
F
x
C
D
 
D
L
 
L
R
 
R
Q
 
D
K
 
E
R
 
Y
P
 
L
A
 
G
N
 
N
S
 
-
G
 
-
T
 
-
P
 
-
F
 
-
D
 
-
Q
 
K
I
 
L
A
 
S
N
 
H
D
 
A
C
|
C
A
 
V
E
 
M
R
 
R
R
 
R
V
 
V
P
 
-
F
 
-
N
 
-
Y
 
-
V
 
-
C
 
-
F
 
-
G
 
-
I
 
-
S
 
-
D
 
-
L
 
Y
G
 
E
N
 
L
T
 
T
A
 
K
S
 
N
L
 
I
F
 
F
V
 
Q
H
 
F
A
 
G
Q
 
I
R
 
R
L
 
S
G
 
G
V
 
D
R
 
K
Y
 
E
A
 
E
L
 
W
D
 
D
V
 
L
D
 
-
M
 
A
Q
 
R
E
 
K
T
 
N
Q
 
N
L
 
L
P
 
Y
L
 
L
R
 
K
L
 
M
Q
 
D
-
 
L
-
 
M
-
 
N
-
 
K
-
 
D
E
 
D
L
 
L
D
 
E
L
 
Y
M
 
I
L
 
K
D
 
S
E
 
L
A
 
D
D
 
K
D
 
P
V
 
I
Y
 
Y
L
 
V
T
 
T
I
 
I
D
 
D
L
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
P
 
D
A
 
P
A
 
A
T
 
Y
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
T
S
 
G
A
 
T
P
 
P
A
 
E
A
 
P
L
x
C
G
 
G
V
 
F
-
 
S
-
 
T
-
 
R
-
 
E
-
 
L
-
 
F
-
 
N
P
 
S
L
 
L
F
 
Y
V
 
L
V
 
L
E
 
E
E
 
E
M
 
V
V
 
K
R
 
D
R
 
K
V
 
I
R
 
I
G
 
G
S
 
-
G
 
-
K
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
A
 
F
D
 
D
I
 
I
A
 
V
E
 
E
Y
 
V
N
 
S
P
 
P
S
 
I
L
 
Y
D
 
D
Q
 
I
D
 
A
R
 
N
R
 
I
T
 
T
A
 
A
R
 
I
A
 
T
A
 
A
A
 
A
R
 
K
L
 
I
A
 
A
Y
 
R
R
 
E
L
 
L
L
 
M

6nfpD 1.7 angstrom resolution crystal structure of arginase from bacillus subtilis subsp. Subtilis str. 168
25% identity, 87% coverage: 42:320/320 of query aligns to 5:284/289 of 6nfpD

query
sites
6nfpD
T
 
T
T
 
I
V
 
S
V
 
V
V
 
I
G
 
G
F
 
M
G
 
P
S
 
M
D
 
D
E
 
L
G
 
G
V
 
-
R
 
-
R
 
-
N
 
-
Q
 
Q
G
 
A
R
 
R
T
 
R
G
 
G
A
 
V
A
 
D
H
 
M
A
 
G
P
 
P
K
 
S
E
 
A
L
 
I
R
 
R
R
 
Y
A
 
A
L
 
H
A
 
L
G
 
I
L
 
E
P
 
R
A
 
L
K
 
S
N
 
D
S
 
M
M
 
G
A
 
Y
M
 
T
L
 
V
A
 
E
D
 
D
A
 
L
G
 
G
D
 
D
V
 
I
A
 
P
C
 
I
D
 
N
D
 
E
-
 
L
-
 
K
-
 
N
-
 
L
G
 
N
D
 
S
L
 
V
E
 
L
G
 
A
A
 
G
Q
 
N
A
 
E
E
 
K
L
 
L
A
 
A
N
 
Q
V
 
K
I
 
V
S
 
N
E
 
K
V
 
V
L
 
I
A
 
E
S
 
E
G
 
K
G
 
K
R
 
F
P
 
P
L
 
L
V
 
V
F
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
D
H
|
H
E
 
S
V
 
I
A
 
A
W
 
I
A
 
G
T
 
T
Y
 
L
C
 
A
G
 
G
L
 
T
V
 
A
L
 
K
H
 
H
Q
 
Y
H
 
-
R
 
-
R
 
-
E
 
-
A
 
-
D
 
-
E
 
-
S
 
-
A
 
-
T
 
-
P
 
-
R
 
D
K
 
N
L
 
L
L
 
G
I
 
V
I
 
I
N
 
W
F
 
Y
D
|
D
A
 
A
H
|
H
F
 
G
D
|
D
L
 
L
R
 
N
Q
 
T
K
 
L
R
 
E
P
 
T
A
 
S
N
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
N
-
 
I
-
 
H
-
 
G
-
 
M
P
 
P
F
 
L
-
 
A
-
 
V
-
 
S
-
 
L
-
 
G
-
 
I
-
 
G
-
 
H
D
 
E
Q
 
S
I
 
L
A
 
V
N
 
N
-
 
L
-
 
E
D
 
G
C
 
Y
A
 
A
E
 
P
R
 
K
R
 
I
V
 
K
P
 
P
F
 
E
N
 
N
Y
 
V
V
 
V
C
 
I
F
 
I
G
 
G
I
 
A
S
 
R
D
 
S
L
 
L
G
 
D
N
 
E
T
 
G
A
 
E
S
 
R
L
 
K
F
 
Y
V
 
I
H
 
K
A
 
E
Q
 
S
R
 
G
L
 
M
G
 
K
V
 
V
R
 
Y
Y
 
T
A
 
M
L
 
H
D
 
E
V
 
I
D
 
D
-
 
R
M
 
L
Q
 
G
E
 
M
T
 
T
Q
 
K
L
 
V
P
 
-
L
 
-
R
 
-
L
 
I
Q
 
E
E
 
E
L
 
T
D
 
L
L
 
D
M
 
Y
L
 
L
D
 
S
E
 
A
A
 
C
D
 
D
D
 
G
V
 
V
Y
 
H
L
 
L
T
 
S
I
 
L
D
|
D
L
 
L
D
|
D
V
 
G
L
 
L
P
 
D
A
 
P
A
 
N
T
 
D
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
V
S
 
G
A
 
T
P
 
P
A
 
V
A
 
V
L
 
G
G
 
G
V
 
I
P
 
S
L
x
Y
F
 
R
V
 
E
V
 
S
E
 
H
E
 
L
M
 
A
V
 
M
R
 
E
R
 
M
V
 
L
R
 
Y
G
 
D
S
 
A
G
 
G
K
 
I
L
 
I
R
 
T
A
 
S
A
 
A
D
 
E
I
 
F
A
 
V
E
 
E
Y
 
V
N
 
N
P
 
P
S
 
I
L
 
L
D
 
D
Q
 
H
D
 
K
R
 
N
R
 
K
T
 
T
A
 
G
R
 
K
A
 
T
A
 
A
A
 
V
R
x
E
L
 
L
A
 
V
Y
 
E
R
 
S
L
 
L
L
 
L

6nfpA 1.7 angstrom resolution crystal structure of arginase from bacillus subtilis subsp. Subtilis str. 168
25% identity, 87% coverage: 42:320/320 of query aligns to 2:287/292 of 6nfpA

query
sites
6nfpA
T
 
T
T
 
I
V
 
S
V
 
V
V
 
I
G
 
G
F
 
M
G
 
P
S
 
M
D
 
D
E
 
L
G
 
G
V
 
-
R
 
-
R
 
-
N
 
-
Q
 
Q
G
 
A
R
 
R
T
 
R
G
 
G
A
 
V
A
 
D
H
 
M
A
 
G
P
 
P
K
 
S
E
 
A
L
 
I
R
 
R
R
 
Y
A
 
A
L
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
-
K
 
-
N
 
H
S
 
L
M
 
I
A
 
E
M
 
R
L
 
L
A
 
S
D
 
D
A
 
M
G
 
G
D
 
Y
V
 
T
A
 
V
C
 
E
D
 
D
D
 
L
G
 
G
D
 
D
L
 
I
-
 
P
-
 
I
-
 
N
-
 
R
E
 
E
G
 
K
A
 
I
Q
 
D
A
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
K
N
 
N
V
 
L
-
 
N
-
 
S
-
 
V
-
 
L
-
 
A
-
 
G
-
 
N
-
 
E
-
 
K
-
 
L
-
 
A
-
 
Q
-
 
K
I
 
V
S
 
N
E
 
K
V
 
V
L
 
I
A
 
E
S
 
E
G
 
K
G
 
K
R
 
F
P
 
P
L
 
L
V
 
V
F
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
D
H
|
H
E
 
S
V
 
I
A
 
A
W
 
I
A
 
G
T
 
T
Y
 
L
C
 
A
G
 
G
L
 
T
V
 
A
L
 
K
H
 
H
Q
 
Y
H
 
-
R
 
-
R
 
-
E
 
-
A
 
-
D
 
-
E
 
-
S
 
-
A
 
-
T
 
-
P
 
-
R
 
D
K
 
N
L
 
L
L
 
G
I
 
V
I
 
I
N
 
W
F
 
Y
D
|
D
A
 
A
H
|
H
F
 
G
D
|
D
L
 
L
R
 
N
Q
 
T
K
 
L
R
 
E
P
 
T
A
 
S
N
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
N
-
 
I
-
 
H
-
 
G
-
 
M
P
 
P
F
 
L
-
 
A
-
 
V
-
 
S
-
 
L
-
 
G
-
 
I
-
 
G
-
 
H
D
 
E
Q
 
S
I
 
L
A
 
V
N
 
N
-
 
L
-
 
E
D
 
G
C
 
Y
A
 
A
E
 
P
R
 
K
R
 
I
V
 
K
P
 
P
F
 
E
N
 
N
Y
 
V
V
 
V
C
 
I
F
 
I
G
 
G
I
 
A
S
 
R
D
 
S
L
 
L
G
 
D
N
 
E
T
 
G
A
 
E
S
 
R
L
 
K
F
 
Y
V
 
I
H
 
K
A
 
E
Q
 
S
R
 
G
L
 
M
G
 
K
V
 
V
R
 
Y
Y
 
T
A
 
M
L
 
H
D
 
E
V
 
I
D
 
D
-
 
R
M
 
L
Q
 
G
E
 
M
T
 
T
Q
 
K
L
 
V
P
 
-
L
 
-
R
 
-
L
 
I
Q
 
E
E
 
E
L
 
T
D
 
L
L
 
D
M
 
Y
L
 
L
D
 
S
E
 
A
A
 
C
D
 
D
D
 
G
V
 
V
Y
 
H
L
 
L
T
 
S
I
 
L
D
|
D
L
 
L
D
|
D
V
 
G
L
 
L
P
 
D
A
 
P
A
 
N
T
 
D
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
V
S
 
G
A
 
T
P
 
P
A
 
V
A
 
V
L
 
G
G
 
G
V
 
I
P
 
S
L
 
Y
F
 
R
V
 
E
V
 
S
E
 
H
E
 
L
M
 
A
V
 
M
R
 
E
R
 
M
V
 
L
R
 
Y
G
 
D
S
 
A
G
 
G
K
 
I
L
 
I
R
 
T
A
 
S
A
 
A
D
 
E
I
 
F
A
 
V
E
 
E
Y
 
V
N
 
N
P
 
P
S
 
I
L
 
L
D
 
D
Q
 
H
D
 
K
R
 
N
R
 
K
T
 
T
A
 
G
R
 
K
A
 
T
A
 
A
A
 
V
R
 
E
L
 
L
A
 
V
Y
 
E
R
 
S
L
 
L
L
 
L

5cevA Arginase from bacillus caldevelox, l-lysine complex (see paper)
25% identity, 68% coverage: 102:320/320 of query aligns to 73:293/298 of 5cevA

query
sites
5cevA
A
 
A
Q
 
N
A
 
E
E
 
K
L
 
L
A
 
A
N
 
A
V
 
A
I
 
V
S
 
D
E
 
Q
V
 
V
L
 
V
A
 
Q
S
 
R
G
 
G
G
 
R
R
 
F
P
 
P
L
 
L
V
 
V
F
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
D
H
|
H
E
 
S
V
 
I
A
 
A
W
 
I
A
 
G
T
 
T
Y
 
L
C
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
A
L
 
K
H
 
H
Q
 
Y
H
 
E
R
 
R
R
 
-
E
 
-
A
 
-
D
 
-
E
 
-
S
 
-
A
 
-
T
 
-
P
 
-
R
 
-
K
 
-
L
 
L
L
 
G
I
 
V
I
 
I
N
 
W
F
 
Y
D
|
D
A
 
A
H
|
H
F
 
G
D
|
D
L
 
V
R
 
N
Q
 
T
K
 
A
R
 
E
P
 
T
A
 
S
N
 
P
S
|
S
G
 
G
T
 
N
-
 
I
-
x
H
-
 
G
-
 
M
-
 
P
-
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
S
-
 
L
-
 
G
-
 
F
-
 
G
-
 
H
-
 
P
P
 
A
F
 
L
D
 
T
Q
 
Q
I
 
I
A
 
G
N
 
G
D
 
Y
C
 
S
A
 
P
E
 
K
R
 
I
R
 
K
V
 
-
P
 
P
F
 
E
N
 
H
Y
 
V
V
 
V
C
 
L
F
 
I
G
 
G
I
 
V
S
 
R
D
 
S
L
 
L
G
 
D
N
 
E
T
 
G
A
 
E
S
 
K
L
 
K
F
 
F
V
 
I
H
 
R
A
 
E
Q
 
K
R
 
G
L
 
I
G
 
K
V
 
I
R
 
Y
Y
 
T
A
 
M
L
 
H
D
 
E
V
 
V
D
 
D
-
 
R
-
 
L
-
 
G
-
 
M
-
 
T
-
 
R
-
 
V
M
 
M
Q
 
E
E
 
E
T
 
T
Q
 
I
L
 
A
P
 
Y
L
 
L
R
 
K
L
 
-
Q
 
-
E
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
-
M
 
-
L
 
-
D
 
E
E
 
R
A
 
T
D
 
D
D
 
G
V
 
V
Y
 
H
L
 
L
T
 
S
I
 
L
D
|
D
L
 
L
D
|
D
V
 
G
L
 
L
P
 
D
A
 
P
A
 
S
T
 
D
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
V
S
 
G
A
 
T
P
 
P
A
 
V
A
 
I
L
 
G
G
 
G
V
 
L
P
 
T
L
 
Y
F
 
R
V
 
E
V
 
S
E
x
H
E
 
L
M
 
A
V
 
M
R
x
E
R
 
M
V
 
L
R
 
A
G
 
E
S
 
A
G
 
Q
K
 
I
L
 
I
R
 
T
A
 
S
A
 
A
D
 
E
I
 
F
A
 
V
E
|
E
Y
 
V
N
 
N
P
 
P
S
 
I
L
 
L
D
 
D
Q
 
E
D
 
R
R
 
N
R
 
K
T
 
T
A
 
A
R
 
S
A
 
V
A
 
A
A
 
V
R
 
A
L
 
L
A
 
M
Y
 
G
R
 
S
L
 
L
L
 
F

4cevA Arginase from bacillus caldevelox, l-ornithine complex (see paper)
25% identity, 68% coverage: 102:320/320 of query aligns to 73:293/298 of 4cevA

query
sites
4cevA
A
 
A
Q
 
N
A
 
E
E
 
K
L
 
L
A
 
A
N
 
A
V
 
A
I
 
V
S
 
D
E
 
Q
V
 
V
L
 
V
A
 
Q
S
 
R
G
 
G
G
 
R
R
 
F
P
 
P
L
 
L
V
 
V
F
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
D
H
|
H
E
 
S
V
 
I
A
 
A
W
 
I
A
 
G
T
 
T
Y
 
L
C
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
A
L
 
K
H
 
H
Q
 
Y
H
 
E
R
 
R
R
 
-
E
 
-
A
 
-
D
 
-
E
 
-
S
 
-
A
 
-
T
 
-
P
 
-
R
 
-
K
 
-
L
 
L
L
 
G
I
 
V
I
 
I
N
 
W
F
 
Y
D
|
D
A
 
A
H
|
H
F
 
G
D
|
D
L
 
V
R
 
N
Q
 
T
K
 
A
R
 
E
P
 
T
A
 
S
N
 
P
S
|
S
G
 
G
T
 
N
-
 
I
-
x
H
-
 
G
-
 
M
-
 
P
-
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
S
-
 
L
-
 
G
-
 
F
-
 
G
-
 
H
-
 
P
P
 
A
F
 
L
D
 
T
Q
 
Q
I
 
I
A
 
G
N
 
G
D
 
Y
C
 
S
A
 
P
E
 
K
R
 
I
R
 
K
V
 
-
P
 
P
F
 
E
N
 
H
Y
 
V
V
 
V
C
 
L
F
 
I
G
 
G
I
 
V
S
 
R
D
 
S
L
 
L
G
x
D
N
 
E
T
 
G
A
 
E
S
 
K
L
 
K
F
 
F
V
 
I
H
 
R
A
 
E
Q
 
K
R
 
G
L
 
I
G
 
K
V
 
I
R
 
Y
Y
 
T
A
 
M
L
 
H
D
 
E
V
 
V
D
 
D
-
 
R
-
 
L
-
 
G
-
 
M
-
 
T
-
 
R
-
 
V
M
 
M
Q
 
E
E
 
E
T
 
T
Q
 
I
L
 
A
P
 
Y
L
 
L
R
 
K
L
 
-
Q
 
-
E
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
-
M
 
-
L
 
-
D
 
E
E
 
R
A
 
T
D
 
D
D
 
G
V
 
V
Y
 
H
L
 
L
T
 
S
I
 
L
D
|
D
L
 
L
D
|
D
V
 
G
L
 
L
P
 
D
A
 
P
A
 
S
T
 
D
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
V
S
 
G
A
 
T
P
 
P
A
 
V
A
 
I
L
 
G
G
 
G
V
 
L
P
 
T
L
 
Y
F
 
R
V
 
E
V
 
S
E
x
H
E
 
L
M
 
A
V
 
M
R
x
E
R
 
M
V
 
L
R
 
A
G
 
E
S
 
A
G
 
Q
K
 
I
L
 
I
R
 
T
A
 
S
A
 
A
D
 
E
I
 
F
A
 
V
E
|
E
Y
 
V
N
 
N
P
 
P
S
 
I
L
 
L
D
 
D
Q
 
E
D
 
R
R
 
N
R
 
K
T
 
T
A
 
A
R
 
S
A
 
V
A
 
A
A
 
V
R
 
A
L
 
L
A
 
M
Y
 
G
R
 
S
L
 
L
L
 
F

3cevA Arginase from bacillus caldevelox, complexed with l-arginine (see paper)
25% identity, 68% coverage: 102:320/320 of query aligns to 73:293/298 of 3cevA

query
sites
3cevA
A
 
A
Q
 
N
A
 
E
E
 
K
L
 
L
A
 
A
N
 
A
V
 
A
I
 
V
S
 
D
E
 
Q
V
 
V
L
 
V
A
 
Q
S
 
R
G
 
G
G
 
R
R
 
F
P
 
P
L
 
L
V
 
V
F
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
D
H
|
H
E
 
S
V
 
I
A
 
A
W
 
I
A
 
G
T
 
T
Y
 
L
C
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
A
L
 
K
H
 
H
Q
 
Y
H
 
E
R
 
R
R
 
-
E
 
-
A
 
-
D
 
-
E
 
-
S
 
-
A
 
-
T
 
-
P
 
-
R
 
-
K
 
-
L
 
L
L
 
G
I
 
V
I
 
I
N
 
W
F
 
Y
D
|
D
A
 
A
H
|
H
F
 
G
D
|
D
L
 
V
R
 
N
Q
 
T
K
 
A
R
 
E
P
 
T
A
 
S
N
 
P
S
|
S
G
 
G
T
 
N
-
 
I
-
x
H
-
 
G
-
 
M
-
 
P
-
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
S
-
 
L
-
 
G
-
 
F
-
 
G
-
 
H
-
 
P
P
 
A
F
 
L
D
 
T
Q
 
Q
I
 
I
A
 
G
N
 
G
D
 
Y
C
 
S
A
 
P
E
 
K
R
 
I
R
 
K
V
 
-
P
 
P
F
 
E
N
 
H
Y
 
V
V
 
V
C
 
L
F
 
I
G
 
G
I
 
V
S
 
R
D
 
S
L
 
L
G
 
D
N
 
E
T
 
G
A
 
E
S
 
K
L
 
K
F
 
F
V
 
I
H
 
R
A
 
E
Q
 
K
R
 
G
L
 
I
G
 
K
V
 
I
R
 
Y
Y
 
T
A
 
M
L
 
H
D
 
E
V
 
V
D
 
D
-
 
R
-
 
L
-
 
G
-
 
M
-
 
T
-
 
R
-
 
V
M
 
M
Q
 
E
E
 
E
T
 
T
Q
 
I
L
 
A
P
 
Y
L
 
L
R
 
K
L
 
-
Q
 
-
E
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
-
M
 
-
L
 
-
D
 
E
E
 
R
A
 
T
D
 
D
D
 
G
V
 
V
Y
 
H
L
 
L
T
 
S
I
 
L
D
|
D
L
 
L
D
|
D
V
 
G
L
 
L
P
 
D
A
 
P
A
 
S
T
 
D
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
V
S
 
G
A
 
T
P
 
P
A
 
V
A
 
I
L
 
G
G
 
G
V
 
L
P
 
T
L
 
Y
F
 
R
V
 
E
V
 
S
E
x
H
E
 
L
M
 
A
V
 
M
R
x
E
R
 
M
V
 
L
R
 
A
G
 
E
S
 
A
G
 
Q
K
 
I
L
 
I
R
 
T
A
 
S
A
 
A
D
 
E
I
 
F
A
 
V
E
|
E
Y
 
V
N
 
N
P
 
P
S
 
I
L
 
L
D
 
D
Q
 
E
D
 
R
R
 
N
R
 
K
T
 
T
A
 
A
R
 
S
A
 
V
A
 
A
A
 
V
R
 
A
L
 
L
A
 
M
Y
 
G
R
 
S
L
 
L
L
 
F

Sites not aligning to the query:

2cevB Arginase from bacillus caldevelox, native structure at ph 8.5 (see paper)
25% identity, 68% coverage: 102:320/320 of query aligns to 73:293/298 of 2cevB

query
sites
2cevB
A
 
A
Q
 
N
A
 
E
E
 
K
L
 
L
A
 
A
N
 
A
V
 
A
I
 
V
S
 
D
E
 
Q
V
 
V
L
 
V
A
 
Q
S
 
R
G
 
G
G
 
R
R
 
F
P
 
P
L
 
L
V
 
V
F
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
D
H
|
H
E
 
S
V
 
I
A
 
A
W
 
I
A
 
G
T
 
T
Y
 
L
C
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
A
L
 
K
H
 
H
Q
 
Y
H
 
E
R
 
R
R
 
-
E
 
-
A
 
-
D
 
-
E
 
-
S
 
-
A
 
-
T
 
-
P
 
-
R
 
-
K
 
-
L
 
L
L
 
G
I
 
V
I
 
I
N
 
W
F
 
Y
D
|
D
A
 
A
H
|
H
F
 
G
D
|
D
L
 
V
R
 
N
Q
 
T
K
 
A
R
 
E
P
 
T
A
 
S
N
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
N
-
 
I
-
x
H
-
 
G
-
 
M
-
 
P
-
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
S
-
 
L
-
 
G
-
 
F
-
 
G
-
 
H
-
 
P
P
 
A
F
 
L
D
 
T
Q
 
Q
I
 
I
A
 
G
N
 
G
D
 
Y
C
 
S
A
 
P
E
 
K
R
 
I
R
 
K
V
 
-
P
 
P
F
 
E
N
 
H
Y
 
V
V
 
V
C
 
L
F
 
I
G
 
G
I
 
V
S
 
R
D
 
S
L
 
L
G
 
D
N
 
E
T
 
G
A
 
E
S
 
K
L
 
K
F
 
F
V
 
I
H
 
R
A
 
E
Q
 
K
R
 
G
L
 
I
G
 
K
V
 
I
R
 
Y
Y
 
T
A
 
M
L
 
H
D
 
E
V
 
V
D
 
D
-
 
R
-
 
L
-
 
G
-
 
M
-
 
T
-
 
R
-
 
V
M
 
M
Q
 
E
E
 
E
T
 
T
Q
 
I
L
 
A
P
 
Y
L
 
L
R
 
K
L
 
-
Q
 
-
E
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
-
M
 
-
L
 
-
D
 
E
E
 
R
A
 
T
D
 
D
D
 
G
V
 
V
Y
 
H
L
 
L
T
 
S
I
 
L
D
|
D
L
 
L
D
|
D
V
 
G
L
 
L
P
 
D
A
 
P
A
 
S
T
 
D
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
V
S
 
G
A
 
T
P
 
P
A
 
V
A
 
I
L
 
G
G
 
G
V
 
L
P
 
T
L
 
Y
F
 
R
V
 
E
V
 
S
E
x
H
E
 
L
M
 
A
V
 
M
R
x
E
R
 
M
V
 
L
R
 
A
G
 
E
S
 
A
G
 
Q
K
 
I
L
 
I
R
 
T
A
 
S
A
 
A
D
 
E
I
 
F
A
 
V
E
|
E
Y
 
V
N
 
N
P
 
P
S
 
I
L
 
L
D
 
D
Q
 
E
D
 
R
R
 
N
R
 
K
T
 
T
A
 
A
R
 
S
A
 
V
A
 
A
A
 
V
R
 
A
L
 
L
A
 
M
Y
 
G
R
 
S
L
 
L
L
 
F

1cevA Arginase from bacillus caldovelox, native structure at ph 5.6 (see paper)
25% identity, 68% coverage: 102:320/320 of query aligns to 74:294/299 of 1cevA

query
sites
1cevA
A
 
A
Q
 
N
A
 
E
E
 
K
L
 
L
A
 
A
N
 
A
V
 
A
I
 
V
S
 
D
E
 
Q
V
 
V
L
 
V
A
 
Q
S
 
R
G
 
G
G
 
R
R
 
F
P
 
P
L
 
L
V
 
V
F
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
D
H
|
H
E
 
S
V
 
I
A
 
A
W
 
I
A
 
G
T
 
T
Y
 
L
C
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
A
L
 
K
H
 
H
Q
 
Y
H
 
E
R
 
R
R
 
-
E
 
-
A
 
-
D
 
-
E
 
-
S
 
-
A
 
-
T
 
-
P
 
-
R
 
-
K
 
-
L
 
L
L
 
G
I
 
V
I
 
I
N
 
W
F
 
Y
D
|
D
A
 
A
H
|
H
F
 
G
D
|
D
L
 
V
R
 
N
Q
 
T
K
 
A
R
 
E
P
 
T
A
 
S
N
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
N
-
 
I
-
x
H
-
 
G
-
 
M
-
 
P
-
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
S
-
 
L
-
 
G
-
 
F
-
 
G
-
 
H
-
 
P
P
 
A
F
 
L
D
 
T
Q
 
Q
I
 
I
A
 
G
N
 
G
D
 
Y
C
 
S
A
 
P
E
 
K
R
 
I
R
 
K
V
 
-
P
 
P
F
 
E
N
 
H
Y
 
V
V
 
V
C
 
L
F
 
I
G
 
G
I
 
V
S
 
R
D
 
S
L
 
L
G
 
D
N
 
E
T
 
G
A
 
E
S
 
K
L
 
K
F
 
F
V
 
I
H
 
R
A
 
E
Q
 
K
R
 
G
L
 
I
G
 
K
V
 
I
R
 
Y
Y
 
T
A
 
M
L
 
H
D
 
E
V
 
V
D
 
D
-
 
R
-
 
L
-
 
G
-
 
M
-
 
T
-
 
R
-
 
V
M
 
M
Q
 
E
E
 
E
T
 
T
Q
 
I
L
 
A
P
 
Y
L
 
L
R
 
K
L
 
-
Q
 
-
E
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
-
M
 
-
L
 
-
D
 
E
E
 
R
A
 
T
D
 
D
D
 
G
V
 
V
Y
 
H
L
 
L
T
 
S
I
 
L
D
|
D
L
 
L
D
|
D
V
 
G
L
 
L
P
 
D
A
 
P
A
 
S
T
 
D
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
V
S
 
G
A
 
T
P
 
P
A
 
V
A
 
I
L
 
G
G
 
G
V
 
L
P
 
T
L
 
Y
F
 
R
V
 
E
V
 
S
E
 
H
E
 
L
M
 
A
V
 
M
R
 
E
R
 
M
V
 
L
R
 
A
G
 
E
S
 
A
G
 
Q
K
 
I
L
 
I
R
 
T
A
 
S
A
 
A
D
 
E
I
 
F
A
 
V
E
|
E
Y
 
V
N
 
N
P
 
P
S
 
I
L
 
L
D
 
D
Q
 
E
D
 
R
R
 
N
R
 
K
T
 
T
A
 
A
R
 
S
A
 
V
A
 
A
A
 
V
R
 
A
L
 
L
A
 
M
Y
 
G
R
 
S
L
 
L
L
 
F

P53608 Arginase; EC 3.5.3.1 from Bacillus caldovelox (see paper)
25% identity, 68% coverage: 102:320/320 of query aligns to 74:294/299 of P53608

query
sites
P53608
A
 
A
Q
 
N
A
 
E
E
 
K
L
 
L
A
 
A
N
 
A
V
 
A
I
 
V
S
 
D
E
 
Q
V
 
V
L
 
V
A
 
Q
S
 
R
G
 
G
G
 
R
R
 
F
P
 
P
L
 
L
V
 
V
F
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
D
H
|
H
E
 
S
V
 
I
A
 
A
W
 
I
A
 
G
T
 
T
Y
 
L
C
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
A
L
 
K
H
 
H
Q
 
Y
H
 
E
R
 
R
R
 
-
E
 
-
A
 
-
D
 
-
E
 
-
S
 
-
A
 
-
T
 
-
P
 
-
R
 
-
K
 
-
L
 
L
L
 
G
I
 
V
I
 
I
N
 
W
F
 
Y
D
|
D
A
 
A
H
|
H
F
x
G
D
|
D
L
x
V
R
x
N
Q
 
T
K
 
A
R
 
E
P
 
T
A
 
S
N
 
P
S
|
S
G
|
G
T
x
N
-
 
I
-
 
H
-
 
G
-
 
M
-
 
P
-
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
S
-
 
L
-
 
G
-
 
F
-
 
G
-
 
H
-
 
P
P
 
A
F
 
L
D
 
T
Q
 
Q
I
 
I
A
 
G
N
 
G
D
 
Y
C
 
S
A
 
P
E
 
K
R
 
I
R
 
K
V
 
-
P
 
P
F
 
E
N
 
H
Y
 
V
V
 
V
C
 
L
F
 
I
G
 
G
I
 
V
S
 
R
D
 
S
L
 
L
G
x
D
N
 
E
T
 
G
A
 
E
S
 
K
L
 
K
F
 
F
V
 
I
H
 
R
A
 
E
Q
 
K
R
 
G
L
 
I
G
 
K
V
 
I
R
 
Y
Y
 
T
A
 
M
L
 
H
D
 
E
V
 
V
D
 
D
-
 
R
-
 
L
-
 
G
-
 
M
-
 
T
-
 
R
-
 
V
M
 
M
Q
 
E
E
 
E
T
 
T
Q
 
I
L
 
A
P
 
Y
L
 
L
R
 
K
L
 
-
Q
 
-
E
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
-
M
 
-
L
 
-
D
 
E
E
 
R
A
 
T
D
 
D
D
 
G
V
 
V
Y
 
H
L
 
L
T
 
S
I
 
L
D
|
D
L
 
L
D
|
D
V
 
G
L
 
L
P
 
D
A
 
P
A
 
S
T
 
D
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
V
S
 
G
A
x
T
P
 
P
A
 
V
A
 
I
L
 
G
G
 
G
V
 
L
P
 
T
L
 
Y
F
 
R
V
 
E
V
 
S
E
 
H
E
 
L
M
 
A
V
 
M
R
 
E
R
 
M
V
 
L
R
 
A
G
 
E
S
 
A
G
 
Q
K
 
I
L
 
I
R
 
T
A
 
S
A
 
A
D
 
E
I
 
F
A
 
V
E
|
E
Y
 
V
N
 
N
P
 
P
S
 
I
L
 
L
D
 
D
Q
 
E
D
 
R
R
 
N
R
 
K
T
 
T
A
 
A
R
 
S
A
 
V
A
 
A
A
 
V
R
 
A
L
 
L
A
 
M
Y
 
G
R
 
S
L
 
L
L
 
F

6vstD Arginase from medicago truncatula in complex with ornithine (see paper)
28% identity, 81% coverage: 62:319/320 of query aligns to 59:314/320 of 6vstD

query
sites
6vstD
G
 
G
A
 
S
A
 
A
H
 
F
A
 
A
P
 
P
K
 
P
E
 
R
L
 
I
R
 
R
R
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
W
G
 
-
L
 
C
P
 
D
A
 
S
K
 
T
N
 
N
S
 
S
M
 
T
A
 
T
-
 
E
-
 
E
-
 
G
-
 
K
-
 
N
-
 
L
-
 
R
-
 
D
-
 
P
-
 
R
M
 
V
L
 
I
A
 
T
D
 
N
A
 
V
G
 
G
D
 
D
V
 
V
A
 
P
C
 
I
D
 
E
D
 
E
-
 
I
G
 
R
D
 
D
L
 
C
E
 
G
G
 
V
A
 
D
Q
 
D
A
 
K
E
 
R
L
 
L
A
 
A
N
 
N
V
 
V
I
 
I
S
 
S
E
 
E
V
 
S
L
 
V
A
 
K
-
 
L
-
 
V
-
 
M
-
 
D
-
 
E
S
 
D
G
 
P
G
 
L
R
 
R
P
 
P
L
 
L
V
 
V
F
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
D
H
|
H
E
 
S
V
 
I
A
 
S
W
 
F
A
 
P
T
 
V
Y
 
V
C
 
-
G
 
-
L
 
-
V
 
-
L
 
-
H
 
-
Q
 
-
H
 
-
R
 
-
R
 
-
E
 
R
A
 
A
D
 
V
E
 
S
S
 
E
A
 
K
T
 
L
P
 
G
R
 
G
K
 
A
L
 
V
L
 
D
I
 
I
I
 
L
N
 
H
F
 
F
D
|
D
A
 
A
H
|
H
F
 
P
D
|
D
L
 
L
R
 
Y
Q
 
H
K
 
D
R
 
F
P
 
E
A
 
G
N
 
N
-
 
Y
-
 
Y
-
 
S
S
 
H
G
 
A
T
 
S
P
 
P
F
 
F
D
 
A
Q
 
R
I
 
I
A
 
M
N
 
E
D
 
G
C
 
G
A
 
Y
E
 
A
R
 
R
R
 
R
V
 
L
P
 
-
F
 
-
N
 
-
Y
 
-
V
 
V
C
 
Q
F
 
V
G
 
G
I
 
I
S
 
R
D
 
S
L
 
I
G
 
T
N
 
N
T
 
D
A
 
V
S
 
R
L
 
E
F
 
Q
V
 
V
H
 
K
A
 
-
Q
 
-
R
 
-
L
 
-
G
 
-
V
 
-
R
 
K
Y
 
Y
A
 
G
L
 
V
D
 
E
V
 
T
D
 
H
M
 
E
Q
 
M
E
 
R
T
 
T
Q
 
L
L
 
S
P
 
R
L
 
D
R
 
R
L
 
P
Q
 
I
E
 
L
L
 
E
D
 
N
L
 
L
M
 
K
L
 
L
D
 
G
E
 
E
-
 
G
A
 
V
D
 
K
D
 
G
V
 
V
Y
 
Y
L
 
V
T
 
S
I
 
I
D
|
D
L
 
V
D
|
D
V
 
S
L
 
L
P
 
D
A
 
P
A
 
S
T
 
I
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
V
S
 
S
A
 
H
P
 
H
A
 
E
A
 
P
L
 
G
G
 
G
V
 
L
P
 
L
L
 
F
F
 
R
V
 
D
V
 
I
E
 
L
E
 
N
M
 
I
V
 
L
R
 
Q
R
 
N
V
 
L
R
 
Q
G
 
G
S
 
D
G
 
-
K
 
-
L
 
I
R
 
V
A
 
G
A
 
G
D
 
D
I
 
V
A
 
V
E
 
E
Y
 
Y
N
 
N
P
 
P
S
 
Q
L
 
R
D
 
D
Q
 
T
-
 
Y
D
 
D
R
 
G
R
 
I
T
 
T
A
 
A
R
 
L
A
 
V
A
 
A
A
 
A
R
 
K
L
 
L
A
 
V
Y
 
R
R
 
E
L
 
L

6vstA Arginase from medicago truncatula in complex with ornithine (see paper)
28% identity, 81% coverage: 62:319/320 of query aligns to 56:311/317 of 6vstA

query
sites
6vstA
G
 
G
A
 
S
A
 
A
H
 
F
A
 
A
P
 
P
K
 
P
E
 
R
L
 
I
R
 
R
R
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
W
G
 
-
L
 
C
P
 
D
A
 
S
K
 
T
N
 
N
S
 
S
M
 
T
A
 
T
-
 
E
-
 
E
-
 
G
-
 
K
-
 
N
-
 
L
-
 
R
-
 
D
-
 
P
-
 
R
M
 
V
L
 
I
A
 
T
D
 
N
A
 
V
G
 
G
D
 
D
V
 
V
A
 
P
C
 
I
D
 
E
D
 
E
-
 
I
G
 
R
D
 
D
L
 
C
E
 
G
G
 
V
A
 
D
Q
 
D
A
 
K
E
 
R
L
 
L
A
 
A
N
 
N
V
 
V
I
 
I
S
 
S
E
 
E
V
 
S
L
 
V
A
 
K
-
 
L
-
 
V
-
 
M
-
 
D
-
 
E
S
 
D
G
 
P
G
 
L
R
 
R
P
 
P
L
 
L
V
 
V
F
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
D
H
|
H
E
 
S
V
 
I
A
 
S
W
 
F
A
 
P
T
 
V
Y
 
V
C
 
-
G
 
-
L
 
-
V
 
-
L
 
-
H
 
-
Q
 
-
H
 
-
R
 
-
R
 
-
E
 
R
A
 
A
D
 
V
E
 
S
S
 
E
A
 
K
T
 
L
P
 
G
R
 
G
K
 
A
L
 
V
L
 
D
I
 
I
I
 
L
N
 
H
F
 
F
D
|
D
A
 
A
H
|
H
F
 
P
D
|
D
L
 
L
R
x
Y
Q
 
H
K
 
D
R
 
F
P
 
E
A
 
G
N
 
N
-
 
Y
-
 
Y
-
 
S
S
x
H
G
 
A
T
 
S
P
 
P
F
 
F
D
 
A
Q
 
R
I
 
I
A
 
M
N
 
E
D
 
G
C
 
G
A
 
Y
E
 
A
R
 
R
R
 
R
V
 
L
P
 
-
F
 
-
N
 
-
Y
 
-
V
 
V
C
 
Q
F
 
V
G
 
G
I
 
I
S
 
R
D
 
S
L
 
I
G
 
T
N
 
N
T
 
D
A
 
V
S
 
R
L
 
E
F
 
Q
V
 
V
H
 
K
A
 
-
Q
 
-
R
 
-
L
 
-
G
 
-
V
 
-
R
 
K
Y
 
Y
A
 
G
L
 
V
D
 
E
V
 
T
D
 
H
M
 
E
Q
 
M
E
 
R
T
 
T
Q
 
L
L
 
S
P
 
R
L
 
D
R
 
R
L
 
P
Q
 
I
E
 
L
L
 
E
D
 
N
L
 
L
M
 
K
L
 
L
D
 
G
E
 
E
-
 
G
A
 
V
D
 
K
D
 
G
V
 
V
Y
 
Y
L
 
V
T
 
S
I
 
I
D
|
D
L
 
V
D
|
D
V
 
S
L
 
L
P
 
D
A
 
P
A
 
S
T
 
I
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
V
S
 
S
A
x
H
P
 
H
A
 
E
A
 
P
L
 
G
G
 
G
V
 
L
P
 
L
L
 
F
F
 
R
V
 
D
V
 
I
E
 
L
E
 
N
M
 
I
V
 
L
R
 
Q
R
 
N
V
 
L
R
 
Q
G
 
G
S
 
D
G
 
-
K
 
-
L
 
I
R
 
V
A
 
G
A
 
G
D
 
D
I
 
V
A
 
V
E
 
E
Y
 
Y
N
 
N
P
 
P
S
 
Q
L
 
R
D
 
D
Q
 
T
-
 
Y
D
 
D
R
 
G
R
 
I
T
 
T
A
 
A
R
 
L
A
 
V
A
 
A
A
 
A
R
 
K
L
 
L
A
 
V
Y
 
R
R
 
E
L
 
L

3pzlB The crystal structure of agmatine ureohydrolase of thermoplasma volcanium
24% identity, 80% coverage: 60:315/320 of query aligns to 39:278/293 of 3pzlB

query
sites
3pzlB
R
 
R
T
 
R
G
 
G
A
 
S
A
 
K
H
 
Y
A
 
A
P
 
P
K
 
D
E
 
S
L
 
I
R
 
R
R
 
G
A
 
A
L
 
Y
A
 
V
G
 
N
L
 
L
P
 
E
A
 
S
K
 
Y
N
 
E
S
 
Y
-
 
S
-
 
Y
-
 
G
-
 
I
-
 
D
-
 
L
-
 
L
M
 
A
A
 
S
M
 
G
L
 
M
A
 
A
D
 
D
A
 
L
G
 
G
D
 
D
V
 
M
A
 
E
C
 
-
D
 
E
D
 
S
G
 
E
D
 
D
L
 
V
E
 
E
G
 
Y
A
 
V
Q
 
I
A
 
D
E
 
T
L
 
V
A
 
E
N
 
S
V
 
V
I
 
V
S
 
S
E
 
A
V
 
V
L
 
M
A
 
S
S
 
D
G
 
G
G
 
K
R
 
I
P
 
P
L
 
I
V
 
M
F
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
E
H
|
H
E
 
S
V
 
I
A
 
T
W
 
-
A
 
-
T
 
-
Y
 
-
C
 
V
G
 
G
L
 
A
V
 
V
L
 
-
H
 
-
Q
 
-
H
 
-
R
 
-
R
 
-
E
 
-
A
 
-
D
 
-
E
 
-
S
 
R
A
 
A
T
 
L
P
 
P
R
 
K
K
 
D
L
 
V
L
 
D
I
 
L
I
 
V
N
 
I
F
 
V
D
|
D
A
 
A
H
|
H
F
 
S
D
|
D
L
 
F
R
 
R
Q
 
S
K
 
S
R
 
Y
P
 
M
A
 
G
N
 
N
S
 
-
G
 
-
T
 
-
P
 
-
F
 
-
D
 
-
Q
 
K
I
 
Y
A
 
N
N
x
H
D
 
A
C
 
C
A
 
V
E
 
T
R
 
R
R
 
R
V
 
A
-
 
L
-
 
D
-
 
L
-
 
L
-
 
G
P
 
E
F
 
G
N
 
R
Y
 
I
V
 
T
C
 
S
F
 
I
G
 
G
I
 
I
S
 
R
D
 
S
L
 
V
G
 
S
N
 
R
T
 
E
A
 
E
S
 
-
L
 
-
F
 
F
V
 
E
H
 
D
A
 
P
Q
 
D
R
 
F
L
 
R
G
 
K
V
 
V
R
 
S
Y
 
F
A
 
I
L
 
S
D
 
S
V
 
F
D
 
D
M
 
V
Q
 
K
E
 
K
T
 
N
Q
 
G
L
 
I
P
 
D
L
 
K
R
 
Y
L
 
I
Q
 
E
E
 
E
L
 
V
D
 
D
L
 
R
M
 
-
L
 
-
D
 
-
E
 
K
A
 
S
D
 
R
D
 
R
V
 
V
Y
 
Y
L
 
I
T
 
S
I
 
V
D
|
D
L
 
M
D
|
D
V
 
G
L
 
I
P
 
D
A
 
P
A
 
A
T
 
Y
A
 
A
P
 
P
G
 
A
V
 
V
S
 
G
A
 
T
P
 
P
A
 
E
A
 
P
L
 
F
G
 
G
V
 
L
P
 
A
L
 
D
F
 
T
V
 
D
V
 
V
E
 
R
E
 
R
M
 
L
V
 
I
R
 
E
R
 
R
V
 
L
R
 
-
G
 
-
S
 
S
G
 
Y
K
 
K
L
 
A
R
 
V
A
 
G
A
 
F
D
 
D
I
 
I
A
 
V
E
|
E
Y
 
F
N
 
S
P
 
P
S
 
L
L
 
Y
D
 
D
Q
 
N
D
 
G
R
 
N
R
 
T
T
 
S
A
 
M
R
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
K
R
 
L
L
 
L

Query Sequence

>BPHYT_RS21925 FitnessBrowser__BFirm:BPHYT_RS21925
MRVPFDDKMWAGRSDDGEPGDTRRVFNQIVPFDGSLRAHGDTTVVVGFGSDEGVRRNQGR
TGAAHAPKELRRALAGLPAKNSMAMLADAGDVACDDGDLEGAQAELANVISEVLASGGRP
LVFGGGHEVAWATYCGLVLHQHRREADESATPRKLLIINFDAHFDLRQKRPANSGTPFDQ
IANDCAERRVPFNYVCFGISDLGNTASLFVHAQRLGVRYALDVDMQETQLPLRLQELDLM
LDEADDVYLTIDLDVLPAATAPGVSAPAALGVPLFVVEEMVRRVRGSGKLRAADIAEYNP
SLDQDRRTARAAARLAYRLL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory