SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing BPHYT_RS23125 FitnessBrowser__BFirm:BPHYT_RS23125 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

7cyxA Crystal strcuture of glycine oxidase from bacillus cereus atcc 14579 (see paper)
24% identity, 83% coverage: 34:391/430 of query aligns to 3:347/363 of 7cyxA

query
sites
7cyxA
D
 
D
V
 
V
C
 
A
V
 
I
I
|
I
G
|
G
A
 
G
G
|
G
L
x
V
T
x
I
G
 
G
I
 
S
S
 
S
T
 
V
A
 
A
L
 
H
N
 
F
L
 
L
A
 
A
E
 
E
R
 
R
G
 
G
H
 
H
S
 
K
V
 
V
A
 
A
V
 
I
L
x
V
E
|
E
A
x
K
S
 
Q
K
 
S
V
 
I
G
 
A
W
 
S
A
x
E
A
|
A
S
|
S
G
 
K
R
 
A
N
x
A
G
 
A
G
|
G
Q
x
L
L
 
L
I
 
-
G
 
-
G
 
G
F
 
V
A
 
A
C
 
-
D
 
-
I
 
-
D
 
-
T
 
-
F
 
-
A
 
-
K
 
-
Y
 
Y
L
 
N
P
 
P
A
 
-
D
 
-
D
 
-
V
 
-
K
 
-
R
 
-
V
 
L
W
 
F
D
 
E
M
 
L
G
 
A
I
 
R
E
 
E
T
 
S
L
 
R
D
 
A
I
 
I
V
 
F
K
 
P
E
 
Q
R
 
L
V
 
A
A
 
A
K
 
V
H
 
L
Q
 
R
I
 
E
D
 
K
C
 
T
D
 
G
L
 
V
T
 
D
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
-
 
E
-
 
E
-
 
K
-
 
G
-
 
I
-
 
Y
L
 
R
T
 
I
A
 
A
A
 
Q
N
 
N
K
 
E
P
 
D
R
 
E
D
 
K
T
 
E
D
 
R
A
 
I
L
 
L
Q
 
H
-
 
I
-
 
M
K
 
D
W
 
W
R
 
-
D
 
-
E
 
-
A
 
-
Q
 
Q
R
 
Q
R
 
K
F
 
T
G
 
G
Y
 
E
D
 
D
R
 
S
L
 
Y
S
 
-
Y
 
F
V
 
L
D
 
T
A
 
G
D
 
D
G
 
H
V
 
V
G
 
R
N
 
E
-
 
K
-
 
E
-
 
P
Y
 
Y
V
 
L
Q
 
-
S
 
S
Q
 
E
R
 
S
Y
 
I
L
 
I
G
 
G
G
 
A
L
 
V
F
 
Y
D
 
Y
A
 
P
D
 
K
S
 
D
G
 
G
H
 
H
L
 
V
H
 
I
P
 
A
L
 
P
N
 
E
Y
 
L
T
 
T
L
 
K
G
 
A
L
 
F
A
 
A
R
 
H
A
 
S
A
 
A
R
 
A
E
 
I
A
 
S
G
 
G
V
 
A
Q
 
D
I
 
I
F
 
Y
E
 
E
D
 
Q
S
 
T
C
 
E
V
|
V
T
 
F
A
 
D
L
 
I
R
 
R
E
 
I
E
 
E
D
 
N
G
 
N
R
 
K
H
 
V
V
 
T
A
 
G
E
 
V
-
 
I
T
 
T
A
 
S
R
 
E
G
 
G
R
 
I
V
 
V
Q
 
T
A
 
C
R
 
E
F
 
K
V
 
V
V
 
V
L
 
I
A
 
A
C
x
G
N
x
G
T
 
S
Y
x
W
L
 
S
G
 
T
Q
 
K
L
 
L
A
 
L
P
 
S
D
 
Y
V
 
F
A
 
H
N
 
R
K
 
D
I
 
W
M
 
-
P
 
-
V
 
-
G
 
G
T
 
T
Y
 
Y
V
 
P
I
 
V
A
 
K
T
 
G
E
 
E
P
 
V
L
 
V
D
 
A
P
 
V
D
 
R
R
 
S
A
 
R
E
 
K
A
 
Q
L
 
L
M
 
L
P
 
-
A
 
-
K
 
K
A
 
A
A
 
P
V
 
I
C
 
F
D
 
Q
S
 
E
R
 
R
F
 
F
V
 
-
L
 
-
D
 
-
Y
 
Y
F
 
I
R
 
T
P
 
P
A
 
K
P
 
R
D
 
G
H
 
G
R
 
R
L
 
Y
L
 
V
W
 
I
G
 
G
G
 
A
K
 
T
V
 
M
-
 
K
-
 
P
-
 
H
S
 
T
Y
 
F
S
 
N
K
 
K
-
 
T
L
 
V
A
 
Q
P
 
P
R
 
E
N
 
S
L
 
I
G
 
T
E
 
S
A
 
I
M
 
L
R
 
E
R
 
R
D
 
-
M
 
A
L
 
Y
K
 
T
T
 
I
F
 
L
P
 
P
Q
 
A
L
 
L
D
 
K
D
 
E
V
 
A
K
 
E
I
 
W
D
 
E
Y
 
S
A
 
T
W
 
W
G
 
A
G
|
G
F
 
L
V
x
R
D
x
P
I
 
Q
T
 
S
M
 
N
N
 
H
R
 
E
A
 
A
P
 
P
H
 
Y
F
 
M
G
 
G
R
 
E
L
 
H
S
 
E
P
 
E
T
 
I
-
 
K
-
 
G
V
 
L
Y
 
Y
F
 
A
A
 
C
Q
 
T
G
 
G
F
 
H
S
x
Y
G
x
R
H
x
N
G
|
G
V
x
I
N
 
L
T
 
L
T
 
S
G
 
P
L
 
I
A
 
S
G
 
G
K
 
Q
L
 
Y
I
 
M
A
 
A
E
 
D
A
 
L
I
 
I
D
 
E
G
 
G
Q
 
K

2gagB Heteroteterameric sarcosine: structure of a diflavin metaloenzyme at 1.85 a resolution (see paper)
25% identity, 83% coverage: 32:388/430 of query aligns to 19:370/403 of 2gagB

query
sites
2gagB
S
 
S
V
 
Y
D
 
D
V
 
A
C
 
I
V
 
I
I
 
V
G
|
G
A
 
G
G
|
G
L
x
G
T
x
H
G
 
G
I
 
L
S
 
A
T
 
T
A
 
A
L
 
Y
N
 
F
L
 
L
A
 
A
E
 
-
R
 
K
G
 
N
H
 
H
S
 
G
V
 
I
A
 
T
V
 
N
L
 
V
E
 
A
A
 
V
S
 
L
K
x
E
V
x
K
G
 
G
W
 
W
A
 
L
A
 
A
S
 
G
G
|
G
-
x
N
-
x
M
-
x
A
R
|
R
N
|
N
G
x
T
G
x
T
Q
x
I
L
 
I
I
x
R
G
 
S
G
 
N
F
 
Y
A
 
L
C
 
W
D
 
D
I
 
-
D
 
E
T
 
S
F
 
A
A
 
G
K
 
I
Y
 
Y
L
 
-
P
 
-
A
 
-
D
 
E
D
 
K
V
 
S
K
 
L
R
 
K
V
 
L
W
 
W
D
 
E
M
 
Q
G
 
L
I
 
P
E
 
E
T
 
D
L
 
L
D
 
E
I
 
Y
V
 
D
K
 
F
E
 
L
R
 
F
V
 
S
A
 
Q
K
 
R
H
 
G
Q
 
V
I
 
L
D
 
N
C
 
L
D
 
A
L
 
H
T
 
T
I
 
L
G
 
G
Y
 
D
L
 
V
-
 
R
-
 
E
-
 
S
-
 
V
-
 
R
-
 
R
T
 
V
A
 
E
A
 
A
N
 
N
K
 
K
P
 
L
R
 
N
D
 
G
T
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
-
Q
 
-
K
 
E
W
 
W
R
 
L
D
 
D
E
 
P
A
 
S
Q
 
Q
R
 
V
R
 
K
F
 
-
G
 
-
Y
 
-
D
 
-
R
 
-
L
 
-
S
 
-
Y
 
-
V
 
-
D
 
E
A
 
A
D
 
C
G
 
P
V
 
I
G
 
I
N
 
N
Y
 
T
V
 
S
Q
 
D
S
 
D
Q
 
I
R
 
R
Y
 
Y
-
 
P
-
 
V
L
 
M
G
 
G
G
 
A
L
 
T
F
 
W
D
 
Q
A
 
P
D
 
R
S
 
A
G
 
G
H
 
I
L
 
A
H
x
K
P
x
H
L
 
D
N
 
H
Y
 
V
T
 
A
L
 
W
G
 
A
L
 
F
A
 
A
R
 
R
A
 
K
A
 
A
R
 
N
E
 
E
A
 
M
G
 
G
V
 
V
Q
 
D
I
 
I
F
 
I
E
 
Q
D
 
N
S
 
C
C
 
E
V
|
V
T
 
T
A
 
G
L
 
F
R
 
I
E
 
K
E
 
-
D
 
D
G
 
G
R
 
E
H
 
K
V
 
V
A
 
T
-
 
G
-
 
V
E
 
K
T
 
T
A
 
T
R
 
R
G
 
G
R
 
T
V
 
I
Q
 
H
A
 
A
R
 
G
F
 
K
V
 
V
V
 
A
L
 
L
A
 
A
C
x
G
N
x
A
T
 
G
Y
x
H
L
 
S
G
 
S
Q
 
V
L
|
L
A
 
A
P
 
-
D
 
E
V
 
M
A
 
A
N
 
G
K
 
F
I
 
E
M
 
L
P
 
P
V
 
-
G
 
-
T
 
-
Y
 
-
V
 
-
I
 
I
A
 
Q
T
 
S
E
 
H
P
 
P
L
|
L
D
 
Q
P
 
A
D
 
L
R
x
V
A
 
S
E
 
E
A
 
L
L
 
F
M
 
E
P
 
P
A
 
V
K
 
H
A
 
P
A
 
T
V
 
V
C
 
V
D
x
M
S
 
S
R
 
N
F
 
H
V
 
I
L
 
H
D
 
V
Y
|
Y
F
 
V
R
 
S
P
 
Q
A
 
A
P
 
H
D
x
K
H
 
G
R
x
E
L
 
L
L
 
V
W
 
M
G
 
G
G
 
A
K
 
G
V
 
I
-
 
D
S
 
S
Y
 
Y
S
 
N
K
 
G
L
 
Y
A
 
G
P
 
Q
R
 
R
N
 
G
L
 
A
G
 
F
E
 
H
A
 
V
M
 
I
R
 
Q
R
 
E
D
 
Q
M
 
M
-
 
A
-
 
A
-
 
A
L
 
V
K
 
E
T
 
L
F
 
F
P
 
P
Q
 
I
L
 
F
D
 
A
D
 
R
V
 
A
K
 
H
I
 
V
D
 
L
Y
x
R
A
 
T
W
|
W
G
 
G
G
 
G
F
 
I
V
 
V
D
 
D
I
 
T
T
 
T
M
 
M
N
 
D
R
 
A
A
 
S
P
 
P
H
 
I
F
 
I
G
 
S
R
 
K
L
 
T
S
 
P
-
 
I
P
 
Q
T
 
N
V
 
L
Y
 
Y
F
 
V
A
 
N
Q
 
C
G
 
G
F
 
W
S
x
G
G
x
T
H
x
G
G
|
G
V
x
F
N
x
K
T
 
G
T
 
T
G
 
P
L
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
F
L
 
T
I
 
L
A
 
A
E
 
H
A
 
T
I
 
I

Sites not aligning to the query:

S5FMM4 Glycine oxidase; GO; BliGO; EC 1.4.3.19 from Bacillus licheniformis (see paper)
24% identity, 80% coverage: 46:391/430 of query aligns to 18:349/369 of S5FMM4

query
sites
S5FMM4
S
 
S
T
 
I
A
 
A
L
 
Y
N
 
H
L
 
L
A
 
A
E
 
K
R
 
A
G
 
G
H
 
K
S
 
K
V
 
T
A
 
A
V
 
V
L
 
F
E
 
E
A
 
S
S
 
G
K
 
E
V
 
V
G
 
G
W
 
K
A
 
K
A
 
A
S
 
T
G
 
S
R
 
A
N
 
A
G
 
A
G
 
G
Q
 
M
L
 
L
I
x
G
G
 
A
G
 
H
F
x
A
A
 
E
C
 
C
D
 
D
I
 
K
-
 
P
D
 
G
T
 
T
F
 
F
A
 
F
K
 
E
Y
 
F
L
 
A
P
 
R
A
 
A
D
 
S
D
 
Q
V
 
-
K
 
K
R
 
A
V
 
Y
W
 
K
D
 
R
M
 
L
G
 
T
I
 
G
E
 
E
T
 
L
L
x
K
D
 
D
I
 
I
V
 
S
K
 
G
E
 
I
R
 
D
V
 
I
A
 
R
K
 
R
H
 
H
Q
 
D
I
 
-
D
 
-
C
 
-
D
 
-
L
 
-
T
 
-
I
 
G
G
 
G
Y
 
I
L
 
L
T
 
K
A
 
L
A
 
A
N
 
F
K
 
S
P
 
E
R
 
S
D
 
D
T
 
-
D
 
-
A
 
-
L
 
-
Q
 
-
K
 
-
W
 
-
R
 
R
D
 
E
E
 
H
A
 
L
Q
 
M
R
 
Q
R
 
M
F
 
G
G
 
A
Y
 
L
D
 
D
R
 
S
L
 
V
S
 
E
Y
 
W
V
 
L
D
 
E
A
 
A
D
 
D
G
 
E
V
 
V
G
 
Y
N
 
K
Y
 
L
V
 
E
Q
 
P
S
 
N
-
 
A
-
 
G
Q
 
K
R
 
G
Y
 
I
L
 
L
G
 
G
G
 
A
L
 
N
F
 
F
D
 
I
A
 
R
D
 
D
S
 
D
G
 
V
H
 
H
L
 
V
H
 
E
P
 
P
L
 
A
N
 
A
Y
 
V
T
 
C
L
 
R
G
 
A
L
 
F
A
 
A
R
 
R
A
 
G
A
 
A
R
 
R
E
 
M
A
 
L
G
 
G
V
 
A
Q
 
D
I
 
V
F
 
F
E
 
E
D
 
Y
S
 
T
C
 
P
V
 
V
T
 
L
A
 
S
L
 
I
R
 
E
E
 
S
E
 
E
D
 
A
G
 
G
R
 
A
H
 
V
V
 
R
A
 
V
E
 
T
T
 
S
A
 
A
R
 
S
G
 
G
R
 
T
V
 
A
Q
 
E
A
 
A
R
 
E
F
 
H
V
 
A
V
 
V
L
 
I
A
 
A
C
x
S
N
 
G
T
 
V
Y
 
W
L
 
S
G
 
G
Q
 
A
L
 
L
A
 
F
P
 
K
D
 
Q
V
 
I
A
 
G
-
 
L
-
 
D
N
 
K
K
 
R
I
 
F
M
 
Y
P
 
P
V
 
V
G
 
-
T
 
-
Y
 
-
V
 
-
I
 
-
A
 
-
T
 
-
E
 
-
P
 
-
L
 
-
D
 
-
P
 
-
D
 
-
R
 
K
A
 
G
E
 
E
A
 
C
L
 
L
M
 
S
P
 
V
A
 
W
K
 
N
A
 
D
A
 
G
V
 
I
C
 
S
D
 
L
S
 
T
R
 
R
F
 
T
V
 
L
L
 
Y
D
 
H
-
 
D
-
 
H
-
 
C
Y
 
Y
F
 
I
R
 
V
P
 
P
A
 
R
P
 
H
D
 
S
H
 
G
R
 
R
L
 
L
L
 
V
W
 
V
G
 
G
G
 
A
K
 
T
V
 
M
S
 
K
Y
 
P
S
 
G
K
 
D
L
 
W
A
 
N
P
 
E
R
 
Q
-
 
P
N
 
E
L
 
L
G
 
G
-
 
G
-
 
I
E
 
E
A
 
E
M
 
L
R
 
I
R
 
R
D
 
K
M
 
A
L
 
K
K
 
S
T
 
M
F
 
L
P
 
P
Q
 
G
L
 
I
D
 
E
D
 
S
V
 
M
K
 
K
I
 
I
D
 
D
Y
 
Q
A
 
C
W
 
W
G
 
A
G
 
G
F
 
L
V
 
R
D
 
P
I
 
E
T
 
T
M
 
G
N
 
D
R
 
G
A
 
N
P
 
P
H
 
Y
F
 
I
G
 
G
R
 
R
L
 
H
S
 
P
P
 
E
T
 
N
-
 
D
-
 
R
V
 
I
Y
 
L
F
 
F
A
 
A
Q
 
A
G
 
G
F
 
H
S
 
F
G
 
R
H
 
N
G
 
G
V
x
I
N
 
L
T
 
L
T
 
A
G
 
P
L
 
A
A
 
T
G
 
G
K
 
E
L
 
M
I
x
M
A
 
A
E
 
D
A
 
M
I
 
I
D
 
L
G
 
G
Q
 
N

5hxwA L-amino acid deaminase from proteus vulgaris (see paper)
28% identity, 49% coverage: 34:244/430 of query aligns to 18:221/433 of 5hxwA

query
sites
5hxwA
D
 
D
V
 
V
C
 
V
V
 
V
I
x
V
G
|
G
A
 
A
G
|
G
L
x
I
T
x
L
G
 
G
I
 
I
S
 
M
T
 
T
A
 
A
L
 
I
N
 
N
L
 
L
A
 
V
E
 
E
R
 
R
G
 
G
H
 
L
S
 
S
V
 
V
A
 
V
V
 
I
L
 
V
E
|
E
A
x
K
S
 
G
K
 
N
V
 
I
G
 
A
W
 
G
A
x
E
A
x
Q
S
|
S
G
 
S
R
|
R
N
x
F
G
x
Y
G
|
G
Q
|
Q
L
x
A
I
 
I
G
 
S
G
 
Y
F
 
K
A
 
M
C
 
P
D
 
D
I
 
E
D
 
T
T
 
F
F
 
L
A
 
L
K
 
H
Y
 
H
L
 
L
P
 
G
A
 
-
D
 
-
D
 
-
V
 
-
K
 
K
R
 
H
V
 
R
W
 
W
D
 
-
M
 
-
G
 
-
I
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
-
D
 
-
I
 
-
V
 
-
K
 
R
E
 
E
R
 
M
V
 
N
A
 
A
K
 
K
H
 
V
Q
 
G
I
 
I
D
 
D
C
 
T
D
 
T
L
 
Y
-
 
R
T
 
T
I
 
Q
G
 
G
Y
 
R
L
 
V
T
 
E
A
 
V
A
 
P
N
 
L
K
 
D
P
 
E
R
 
E
D
 
D
T
 
L
D
 
V
A
 
N
L
 
V
Q
 
R
K
 
K
W
 
W
R
 
I
D
 
D
E
 
E
A
 
R
Q
 
S
R
 
K
R
 
N
F
 
V
G
 
G
Y
 
S
D
 
D
-
 
I
-
 
P
-
 
F
R
 
K
L
 
T
S
 
R
Y
 
I
V
 
I
D
 
E
A
 
G
D
 
A
G
 
E
V
 
L
G
 
-
N
 
-
Y
 
-
V
 
-
Q
 
-
S
 
N
Q
 
Q
R
 
R
Y
 
L
L
 
R
G
 
G
G
 
A
L
 
T
-
 
T
-
 
D
-
 
W
-
 
K
-
 
I
-
 
A
-
 
G
F
 
F
D
 
E
A
 
E
D
 
D
S
 
S
G
 
G
H
 
S
L
 
F
H
 
D
P
 
P
L
 
E
N
 
V
Y
 
A
T
 
T
L
 
F
G
 
V
L
 
M
A
 
A
R
 
E
A
 
Y
A
 
A
R
 
K
E
 
K
A
 
M
G
 
G
V
 
V
Q
 
R
I
 
I
F
 
Y
E
 
T
D
 
Q
S
 
C
C
x
A
V
x
A
T
 
R
A
 
G
L
 
L
R
 
E
E
 
T
E
 
Q
D
 
A
G
 
G
R
 
V
-
 
I
H
 
S
V
 
D
A
 
V
E
 
V
T
 
T
A
 
E
R
 
K
G
 
G
R
 
A
V
 
I
Q
 
K
A
 
T
R
 
S
F
 
Q
V
 
V
V
 
V
L
 
V
A
 
A
C
x
G
N
x
G
T
 
V
Y
x
W

Sites not aligning to the query:

5i39A High resolution structure of l-amino acid deaminase from proteus vulgaris with the deletion of the specific insertion sequence (see paper)
28% identity, 49% coverage: 34:244/430 of query aligns to 26:229/383 of 5i39A

query
sites
5i39A
D
 
D
V
 
V
C
 
V
V
 
V
I
x
V
G
|
G
A
 
A
G
|
G
L
x
I
T
x
L
G
 
G
I
 
I
S
 
M
T
 
T
A
 
A
L
 
I
N
 
N
L
 
L
A
 
V
E
 
E
R
 
R
G
 
G
H
 
L
S
 
S
V
 
V
A
 
V
V
 
I
L
x
V
E
|
E
A
x
K
S
 
G
K
 
N
V
 
I
G
 
A
W
 
G
A
 
E
A
x
Q
S
|
S
G
 
S
R
 
R
N
x
F
G
x
Y
G
 
G
Q
|
Q
L
x
A
I
 
I
G
 
S
G
 
Y
F
 
K
A
 
M
C
 
P
D
 
D
I
 
E
D
 
T
T
 
F
F
 
L
A
 
L
K
 
H
Y
 
H
L
 
L
P
 
G
A
 
-
D
 
-
D
 
-
V
 
-
K
 
K
R
 
H
V
 
R
W
 
W
D
 
-
M
 
-
G
 
-
I
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
-
D
 
-
I
 
-
V
 
-
K
 
R
E
 
E
R
 
M
V
 
N
A
 
A
K
 
K
H
 
V
Q
 
G
I
 
I
D
 
D
C
 
T
D
 
T
L
 
Y
-
 
R
T
 
T
I
 
Q
G
 
G
Y
 
R
L
 
V
T
 
E
A
 
V
A
 
P
N
 
L
K
 
D
P
 
E
R
 
E
D
 
D
T
 
L
D
 
V
A
 
N
L
 
V
Q
 
R
K
 
K
W
 
W
R
 
I
D
 
D
E
 
E
A
 
R
Q
 
S
R
 
K
R
 
N
F
 
V
G
 
G
Y
 
S
D
 
D
-
 
I
-
 
P
-
 
F
R
 
K
L
 
T
S
 
R
Y
 
I
V
 
I
D
 
E
A
 
G
D
 
A
G
 
E
V
 
L
G
 
-
N
 
-
Y
 
-
V
 
-
Q
 
-
S
 
N
Q
 
Q
R
 
R
Y
 
L
L
 
R
G
 
G
G
 
A
L
 
T
-
 
T
-
 
D
-
 
W
-
 
K
-
 
I
-
 
A
-
 
G
F
 
F
D
 
E
A
 
E
D
 
D
S
 
S
G
 
G
H
 
S
L
 
F
H
 
D
P
 
P
L
 
E
N
 
V
Y
 
A
T
 
T
L
 
F
G
 
V
L
 
M
A
 
A
R
 
E
A
 
Y
A
 
A
R
 
K
E
 
K
A
 
M
G
 
G
V
 
V
Q
 
R
I
 
I
F
 
Y
E
 
T
D
 
Q
S
 
C
C
x
A
V
x
A
T
 
R
A
 
G
L
 
L
R
 
E
E
 
T
E
 
Q
D
 
A
G
 
G
R
 
V
-
 
I
H
 
S
V
 
D
A
 
V
E
 
V
T
 
T
A
 
E
R
 
K
G
 
G
R
 
A
V
 
I
Q
 
K
A
 
T
R
 
S
F
 
Q
V
 
V
V
 
V
L
 
V
A
 
A
C
x
G
N
x
G
T
 
V
Y
x
W

Sites not aligning to the query:

5fjnA Structure of l-amino acid deaminase from proteus myxofaciens in complex with anthranilate (see paper)
26% identity, 48% coverage: 47:252/430 of query aligns to 43:245/447 of 5fjnA

query
sites
5fjnA
T
 
T
A
 
A
L
 
I
N
 
N
L
 
L
A
 
A
E
 
E
R
 
R
G
 
G
H
 
M
S
 
S
V
 
V
A
 
T
V
 
I
L
|
L
E
|
E
A
x
K
S
 
G
K
 
E
V
 
V
G
 
A
W
 
G
A
x
E
A
x
Q
S
|
S
G
 
G
R
 
R
N
x
A
G
x
Y
G
x
S
Q
|
Q
L
 
I
I
 
I
G
 
-
G
 
-
F
 
-
A
 
-
C
 
-
D
 
S
I
 
Y
D
 
Q
T
 
T
F
 
S
A
 
P
K
 
E
Y
 
I
L
 
F
P
 
P
A
 
L
D
 
H
D
 
H
V
 
Y
K
 
G
R
 
K
V
 
I
W
 
L
D
 
W
M
 
R
G
 
G
I
 
M
E
 
-
T
 
-
L
 
-
D
 
-
I
 
-
V
 
-
K
 
-
E
 
-
R
 
-
V
 
-
A
 
-
K
 
N
H
 
E
Q
 
K
I
 
I
D
 
G
C
 
A
D
 
D
L
 
T
-
 
S
-
 
Y
-
 
R
T
 
T
I
 
Q
G
 
G
Y
 
R
L
 
V
T
 
E
A
 
A
A
 
L
N
 
A
K
 
D
P
 
E
R
 
K
D
 
A
T
 
L
D
 
D
A
 
R
L
 
A
Q
 
Q
K
 
E
W
 
W
R
 
I
D
 
K
E
 
T
A
 
A
Q
 
K
R
 
E
R
 
T
F
 
A
G
 
G
Y
 
F
D
 
D
-
 
V
-
 
P
-
 
L
R
 
N
L
 
T
S
 
R
Y
 
I
V
 
I
D
 
K
A
 
G
D
 
E
G
 
E
V
 
L
G
 
S
N
 
N
Y
 
R
V
 
L
Q
 
V
S
 
G
Q
 
A
R
 
Q
-
 
T
-
 
P
Y
 
W
L
 
T
G
 
V
G
 
A
L
 
A
F
 
F
D
 
E
A
 
E
D
 
D
S
 
S
G
 
G
H
 
S
L
 
V
H
 
D
P
 
P
L
 
E
N
 
T
Y
 
G
T
 
T
L
 
P
G
 
T
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
Y
A
 
A
R
 
K
E
 
Q
A
 
I
G
 
G
V
 
V
Q
 
K
I
 
I
F
 
Y
E
 
T
D
 
H
S
 
C
C
 
A
V
|
V
T
 
R
A
 
G
L
 
I
R
 
E
E
 
T
E
 
A
D
 
G
G
 
G
R
 
K
-
 
I
H
 
S
V
 
D
A
 
V
E
 
V
T
 
T
A
 
E
R
 
K
G
 
G
R
 
A
V
 
I
Q
 
R
A
 
T
R
 
S
F
 
N
V
 
V
V
 
V
L
 
L
A
 
A
-
x
G
-
x
G
-
 
I
-
x
W
C
 
S
N
 
R
T
 
L
Y
 
F
L
 
M
G
 
G
Q
 
N
L
 
M
A
 
G
P
 
V
D
 
D
V
 
L

Sites not aligning to the query:

5fjmA Structure of l-amino acid deaminase from proteus myxofaciens (see paper)
26% identity, 48% coverage: 47:252/430 of query aligns to 43:245/447 of 5fjmA

query
sites
5fjmA
T
 
T
A
 
A
L
 
I
N
 
N
L
 
L
A
 
A
E
 
E
R
 
R
G
 
G
H
 
M
S
 
S
V
 
V
A
 
T
V
 
I
L
|
L
E
|
E
A
x
K
S
 
G
K
 
E
V
 
V
G
 
A
W
 
G
A
x
E
A
x
Q
S
|
S
G
 
G
R
 
R
N
x
A
G
x
Y
G
x
S
Q
|
Q
L
 
I
I
 
I
G
 
-
G
 
-
F
 
-
A
 
-
C
 
-
D
 
S
I
 
Y
D
 
Q
T
 
T
F
 
S
A
 
P
K
 
E
Y
 
I
L
 
F
P
 
P
A
 
L
D
 
H
D
 
H
V
 
Y
K
 
G
R
 
K
V
 
I
W
 
L
D
 
W
M
 
R
G
 
G
I
 
M
E
 
-
T
 
-
L
 
-
D
 
-
I
 
-
V
 
-
K
 
-
E
 
-
R
 
-
V
 
-
A
 
-
K
 
N
H
 
E
Q
 
K
I
 
I
D
 
G
C
 
A
D
 
D
L
 
T
-
 
S
-
 
Y
-
 
R
T
 
T
I
 
Q
G
 
G
Y
 
R
L
 
V
T
 
E
A
 
A
A
 
L
N
 
A
K
 
D
P
 
E
R
 
K
D
 
A
T
 
L
D
 
D
A
 
R
L
 
A
Q
 
Q
K
 
E
W
 
W
R
 
I
D
 
K
E
 
T
A
 
A
Q
 
K
R
 
E
R
 
T
F
 
A
G
 
G
Y
 
F
D
 
D
-
 
V
-
 
P
-
 
L
R
 
N
L
 
T
S
 
R
Y
 
I
V
 
I
D
 
K
A
 
G
D
 
E
G
 
E
V
 
L
G
 
S
N
 
N
Y
 
R
V
 
L
Q
 
V
S
 
G
Q
 
A
R
 
Q
-
 
T
-
 
P
Y
 
W
L
 
T
G
 
V
G
 
A
L
 
A
F
 
F
D
 
E
A
 
E
D
 
D
S
 
S
G
 
G
H
 
S
L
 
V
H
 
D
P
 
P
L
 
E
N
 
T
Y
 
G
T
 
T
L
 
P
G
 
T
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
Y
A
 
A
R
 
K
E
 
Q
A
 
I
G
 
G
V
 
V
Q
 
K
I
 
I
F
 
Y
E
 
T
D
 
H
S
 
C
C
 
A
V
|
V
T
 
R
A
 
G
L
 
I
R
 
E
E
 
T
E
 
A
D
 
G
G
 
G
R
 
K
-
 
I
H
 
S
V
 
D
A
 
V
E
 
V
T
 
T
A
 
E
R
 
K
G
 
G
R
 
A
V
 
I
Q
 
R
A
 
T
R
 
S
F
 
N
V
 
V
V
 
V
L
 
L
A
 
A
-
x
G
-
x
G
-
 
I
-
x
W
C
 
S
N
 
R
T
 
L
Y
 
F
L
 
M
G
 
G
Q
 
N
L
 
M
A
 
G
P
 
V
D
 
D
V
 
L

Sites not aligning to the query:

P40875 Sarcosine oxidase subunit beta; Sarcosine oxidase subunit B; Sarcosine oxidase (5,10-methylenetetrahydrofolate-forming) subunit beta; Tetrameric sarcosine oxidase subunit beta; TSOX subunit beta; EC 1.5.3.24 from Corynebacterium sp. (strain P-1) (see 3 papers)
28% identity, 45% coverage: 196:388/430 of query aligns to 180:372/405 of P40875

query
sites
P40875
L
 
F
A
 
A
R
 
R
A
 
K
A
 
A
R
 
N
E
 
E
A
 
M
G
 
G
V
 
V
Q
 
D
I
 
I
F
 
I
E
 
Q
D
 
N
S
x
C
C
 
E
V
 
V
T
 
T
A
 
G
L
 
F
R
 
L
E
 
K
E
 
-
D
 
D
G
 
G
R
 
E
H
 
K
V
 
V
A
 
T
-
 
G
-
 
V
E
 
K
T
 
T
A
 
T
R
 
R
G
 
G
R
 
T
V
 
I
Q
 
H
A
 
A
R
 
G
F
 
K
V
 
V
V
 
A
L
 
L
A
 
A
C
 
G
N
 
A
T
 
G
Y
 
H
L
 
S
G
 
S
Q
 
V
L
 
L
A
 
A
P
 
-
D
 
E
V
 
L
A
 
A
N
 
G
K
 
F
I
 
E
M
 
L
P
 
P
V
 
-
G
 
-
T
 
-
Y
 
-
V
 
-
I
 
I
A
 
Q
T
 
S
E
 
H
P
 
P
L
 
L
D
 
Q
P
 
A
D
 
L
R
 
V
A
 
S
E
 
E
A
 
L
L
 
F
M
 
E
P
 
P
A
 
V
K
 
H
A
 
P
A
 
T
V
 
V
C
 
V
D
 
M
S
 
S
R
 
N
F
 
H
V
 
I
L
 
H
D
 
V
Y
 
Y
F
 
V
R
 
S
P
 
Q
A
 
A
P
 
H
D
 
K
H
 
G
R
 
E
L
 
L
L
 
V
W
 
M
G
 
G
G
 
A
K
 
G
V
 
I
-
 
D
S
 
S
Y
 
Y
S
 
N
K
 
G
L
 
Y
A
 
G
P
 
Q
R
 
R
N
 
G
L
 
A
G
 
F
E
 
H
A
 
V
M
 
I
R
 
E
R
 
E
D
 
Q
M
 
M
-
 
A
-
 
A
-
 
A
L
 
V
K
 
E
T
 
L
F
 
F
P
 
P
Q
 
I
L
 
F
D
 
A
D
 
R
V
 
A
K
 
H
I
 
V
D
 
L
Y
 
R
A
 
T
W
 
W
G
 
G
G
 
G
F
 
I
V
 
V
D
 
D
I
 
T
T
 
T
M
 
M
N
 
D
R
 
A
A
 
S
P
 
P
H
 
I
F
 
I
G
 
S
R
 
K
L
 
T
S
 
P
-
 
I
P
 
Q
T
 
N
V
 
L
Y
 
Y
F
 
V
A
 
N
Q
x
C
G
 
G
F
 
W
S
 
G
G
 
T
H
 
G
G
 
G
V
 
F
N
 
K
T
 
G
T
 
T
G
 
P
L
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
F
L
 
T
I
 
L
A
 
A
E
 
H
A
 
T
I
 
I

Sites not aligning to the query:

Q50LF2 Sarcosine oxidase subunit beta; Sarcosine oxidase subunit B; Sarcosine oxidase (5,10-methylenetetrahydrofolate-forming) subunit beta; Tetrameric sarcosine oxidase subunit beta; TSOX subunit beta; EC 1.5.3.24 from Corynebacterium sp. (strain U-96) (see 4 papers)
28% identity, 45% coverage: 196:388/430 of query aligns to 180:372/405 of Q50LF2

query
sites
Q50LF2
L
 
F
A
 
A
R
 
R
A
 
K
A
 
A
R
 
N
E
 
E
A
 
M
G
 
G
V
 
V
Q
 
D
I
 
I
F
 
I
E
 
Q
D
 
N
S
 
C
C
 
E
V
|
V
T
 
T
A
 
G
L
 
F
R
 
L
E
 
K
E
 
-
D
 
D
G
 
G
R
 
E
H
 
K
V
 
V
A
 
T
-
 
G
-
 
V
E
 
K
T
 
T
A
 
T
R
 
R
G
 
G
R
 
T
V
 
I
Q
 
L
A
 
A
R
 
G
F
 
K
V
 
V
V
 
A
L
 
L
A
 
A
C
 
G
N
 
A
T
 
G
Y
 
H
L
 
S
G
 
S
Q
 
V
L
 
L
A
 
A
P
 
-
D
 
E
V
 
L
A
 
A
N
 
G
K
 
F
I
 
E
M
 
L
P
 
P
V
 
-
G
 
-
T
 
-
Y
 
-
V
 
-
I
 
I
A
 
Q
T
 
S
E
 
H
P
 
P
L
 
L
D
 
Q
P
 
A
D
 
L
R
 
V
A
 
S
E
 
E
A
 
L
L
 
F
M
 
E
P
 
P
A
 
V
K
 
H
A
 
P
A
 
T
V
 
V
C
 
V
D
 
M
S
 
S
R
 
N
F
 
H
V
 
I
L
x
H
D
 
V
Y
|
Y
F
 
V
R
 
S
P
 
Q
A
 
A
P
 
H
D
 
K
H
 
G
R
 
E
L
 
L
L
 
V
W
 
M
G
 
G
G
 
A
K
 
G
V
 
I
-
 
D
S
 
S
Y
 
Y
S
 
N
K
 
G
L
 
Y
A
 
G
P
 
Q
R
 
R
N
 
G
L
 
A
G
 
F
E
 
H
A
 
V
M
 
I
R
 
E
R
 
E
D
 
Q
M
 
M
-
 
A
-
 
A
-
 
A
L
 
V
K
 
E
T
 
L
F
 
F
P
 
P
Q
 
I
L
 
F
D
 
A
D
 
R
V
 
A
K
 
H
I
 
V
D
 
L
Y
 
R
A
 
T
W
 
W
G
 
G
G
 
G
F
 
I
V
 
V
D
 
D
I
 
T
T
 
T
M
 
M
N
 
D
R
 
A
A
 
S
P
 
P
H
 
I
F
 
I
G
 
S
R
 
K
L
 
T
S
 
P
-
 
I
P
 
Q
T
 
N
V
 
L
Y
 
Y
F
 
V
A
 
N
Q
 
C
G
 
G
F
 
W
S
x
G
G
 
T
H
 
G
G
|
G
V
 
F
N
x
K
T
 
G
T
 
T
G
 
P
L
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
Y
L
 
T
I
 
L
A
 
A
E
 
H
A
 
T
I
 
I

Sites not aligning to the query:

1vrqB Crystal structure of heterotetrameric sarcosine oxidase from corynebacterium sp. U-96 in complex with folinic acid (see paper)
28% identity, 45% coverage: 196:388/430 of query aligns to 179:371/402 of 1vrqB

query
sites
1vrqB
L
 
F
A
 
A
R
 
R
A
 
K
A
 
A
R
 
N
E
 
E
A
 
M
G
 
G
V
 
V
Q
 
D
I
 
I
F
 
I
E
 
Q
D
 
N
S
 
C
C
 
E
V
|
V
T
 
T
A
 
G
L
 
F
R
 
L
E
 
K
E
 
-
D
 
D
G
 
G
R
 
E
H
 
K
V
 
V
A
 
T
-
 
G
-
 
V
E
 
K
T
 
T
A
 
T
R
 
R
G
 
G
R
 
T
V
 
I
Q
 
L
A
 
A
R
 
G
F
 
K
V
 
V
V
 
A
L
 
L
A
|
A
C
x
G
N
 
A
T
 
G
Y
x
H
L
 
S
G
 
S
Q
 
V
L
 
L
A
 
A
P
 
-
D
 
E
V
 
L
A
 
A
N
 
G
K
 
F
I
 
E
M
 
L
P
 
P
V
 
-
G
 
-
T
 
-
Y
 
-
V
 
-
I
 
I
A
 
Q
T
 
S
E
 
H
P
 
P
L
|
L
D
 
Q
P
 
A
D
 
L
R
x
V
A
 
S
E
 
E
A
 
L
L
 
F
M
 
E
P
 
P
A
 
V
K
 
H
A
 
P
A
 
T
V
 
V
C
 
V
D
 
M
S
 
S
R
 
N
F
 
H
V
 
I
L
 
H
D
 
V
Y
 
Y
F
 
V
R
 
S
P
 
Q
A
 
A
P
 
H
D
 
K
H
 
G
R
x
E
L
 
L
L
 
V
W
 
M
G
 
G
G
 
A
K
 
G
V
 
I
-
 
D
S
 
S
Y
 
Y
S
 
N
K
 
G
L
 
Y
A
 
G
P
 
Q
R
 
R
N
 
G
L
 
A
G
 
F
E
 
H
A
 
V
M
 
I
R
 
E
R
 
E
D
 
Q
M
 
M
-
 
A
-
 
A
-
 
A
L
 
V
K
 
E
T
 
L
F
 
F
P
 
P
Q
 
I
L
 
F
D
 
A
D
 
R
V
 
A
K
 
H
I
 
V
D
 
L
Y
x
R
A
 
T
W
|
W
G
 
G
G
|
G
F
 
I
V
 
V
D
 
D
I
 
T
T
 
T
M
 
M
N
 
D
R
 
A
A
 
S
P
 
P
H
 
I
F
 
I
G
 
S
R
 
K
L
 
T
S
 
P
-
 
I
P
 
Q
T
 
N
V
 
L
Y
 
Y
F
 
V
A
 
N
Q
 
C
G
 
G
F
 
W
S
x
G
G
x
T
H
x
G
G
|
G
V
x
F
N
x
K
T
 
G
T
 
T
G
 
P
L
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
Y
L
 
T
I
 
L
A
 
A
E
 
H
A
 
T
I
 
I

Sites not aligning to the query:

3ad8B Heterotetrameric sarcosine oxidase from corynebacterium sp. U-96 in complex with pyrrole 2-carboxylate (see paper)
28% identity, 45% coverage: 196:388/430 of query aligns to 179:371/404 of 3ad8B

query
sites
3ad8B
L
 
F
A
 
A
R
 
R
A
 
K
A
 
A
R
 
N
E
 
E
A
 
M
G
 
G
V
 
V
Q
 
D
I
 
I
F
 
I
E
 
Q
D
 
N
S
 
C
C
 
E
V
|
V
T
 
T
A
 
G
L
 
F
R
 
L
E
 
K
E
 
-
D
 
D
G
 
G
R
 
E
H
 
K
V
 
V
A
 
T
-
 
G
-
 
V
E
 
K
T
 
T
A
 
T
R
 
R
G
 
G
R
 
T
V
 
I
Q
 
L
A
 
A
R
 
G
F
 
K
V
 
V
V
 
A
L
 
L
A
 
A
C
x
G
N
x
A
T
 
G
Y
x
H
L
 
S
G
 
S
Q
 
V
L
 
L
A
 
A
P
 
-
D
 
E
V
 
L
A
 
A
N
 
G
K
 
F
I
 
E
M
 
L
P
 
P
V
 
-
G
 
-
T
 
-
Y
 
-
V
 
-
I
 
I
A
 
Q
T
 
S
E
 
H
P
 
P
L
|
L
D
 
Q
P
 
A
D
 
L
R
x
V
A
 
S
E
 
E
A
 
L
L
 
F
M
 
E
P
 
P
A
 
V
K
 
H
A
 
P
A
 
T
V
 
V
C
 
V
D
x
M
S
 
S
R
 
N
F
 
H
V
 
I
L
 
H
D
 
V
Y
|
Y
F
 
V
R
 
S
P
 
Q
A
 
A
P
 
H
D
 
K
H
 
G
R
x
E
L
 
L
L
 
V
W
 
M
G
 
G
G
 
A
K
 
G
V
 
I
-
 
D
S
 
S
Y
 
Y
S
 
N
K
 
G
L
 
Y
A
 
G
P
 
Q
R
 
R
N
 
G
L
 
A
G
 
F
E
 
H
A
 
V
M
 
I
R
 
E
R
 
E
D
 
Q
M
 
M
-
 
A
-
 
A
-
 
A
L
 
V
K
 
E
T
 
L
F
 
F
P
 
P
Q
 
I
L
 
F
D
 
A
D
 
R
V
 
A
K
 
H
I
 
V
D
 
L
Y
x
R
A
 
T
W
|
W
G
 
G
G
|
G
F
 
I
V
 
V
D
 
D
I
 
T
T
 
T
M
 
M
N
 
D
R
 
A
A
 
S
P
 
P
H
 
I
F
 
I
G
 
S
R
 
K
L
 
T
S
 
P
-
 
I
P
 
Q
T
 
N
V
 
L
Y
 
Y
F
 
V
A
 
N
Q
 
C
G
 
G
F
 
W
S
x
G
G
x
T
H
x
G
G
|
G
V
x
F
N
x
K
T
 
G
T
 
T
G
 
P
L
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
Y
L
 
T
I
 
L
A
 
A
E
 
H
A
 
T
I
 
I

Sites not aligning to the query:

3ad7B Heterotetrameric sarcosine oxidase from corynebacterium sp. U-96 in complex with methylthio acetate (see paper)
28% identity, 45% coverage: 196:388/430 of query aligns to 179:371/404 of 3ad7B

query
sites
3ad7B
L
 
F
A
 
A
R
 
R
A
 
K
A
 
A
R
 
N
E
 
E
A
 
M
G
 
G
V
 
V
Q
 
D
I
 
I
F
 
I
E
 
Q
D
 
N
S
 
C
C
 
E
V
|
V
T
 
T
A
 
G
L
 
F
R
 
L
E
 
K
E
 
-
D
 
D
G
 
G
R
 
E
H
 
K
V
 
V
A
 
T
-
 
G
-
 
V
E
 
K
T
 
T
A
 
T
R
 
R
G
 
G
R
 
T
V
 
I
Q
 
L
A
 
A
R
 
G
F
 
K
V
 
V
V
 
A
L
 
L
A
 
A
C
x
G
N
x
A
T
 
G
Y
x
H
L
 
S
G
 
S
Q
 
V
L
 
L
A
 
A
P
 
-
D
 
E
V
 
L
A
 
A
N
 
G
K
 
F
I
 
E
M
 
L
P
 
P
V
 
-
G
 
-
T
 
-
Y
 
-
V
 
-
I
 
I
A
 
Q
T
 
S
E
 
H
P
 
P
L
|
L
D
 
Q
P
 
A
D
 
L
R
x
V
A
 
S
E
 
E
A
 
L
L
 
F
M
 
E
P
 
P
A
 
V
K
 
H
A
 
P
A
 
T
V
 
V
C
 
V
D
x
M
S
 
S
R
 
N
F
 
H
V
 
I
L
 
H
D
 
V
Y
|
Y
F
 
V
R
 
S
P
 
Q
A
 
A
P
 
H
D
x
K
H
 
G
R
x
E
L
 
L
L
 
V
W
 
M
G
 
G
G
 
A
K
 
G
V
 
I
-
 
D
S
 
S
Y
 
Y
S
 
N
K
 
G
L
 
Y
A
 
G
P
 
Q
R
 
R
N
 
G
L
 
A
G
 
F
E
 
H
A
 
V
M
 
I
R
 
E
R
 
E
D
 
Q
M
 
M
-
 
A
-
 
A
-
 
A
L
 
V
K
 
E
T
 
L
F
 
F
P
 
P
Q
 
I
L
 
F
D
 
A
D
 
R
V
 
A
K
 
H
I
 
V
D
 
L
Y
x
R
A
 
T
W
|
W
G
 
G
G
|
G
F
 
I
V
 
V
D
 
D
I
 
T
T
 
T
M
 
M
N
 
D
R
 
A
A
 
S
P
 
P
H
 
I
F
 
I
G
 
S
R
 
K
L
 
T
S
 
P
-
 
I
P
 
Q
T
 
N
V
 
L
Y
 
Y
F
 
V
A
 
N
Q
 
C
G
 
G
F
 
W
S
x
G
G
x
T
H
x
G
G
|
G
V
x
F
N
x
K
T
 
G
T
 
T
G
 
P
L
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
Y
L
 
T
I
 
L
A
 
A
E
 
H
A
 
T
I
 
I

Sites not aligning to the query:

Q63342 Dimethylglycine dehydrogenase, mitochondrial; ME2GLYDH; EC 1.5.8.4 from Rattus norvegicus (Rat) (see 2 papers)
22% identity, 56% coverage: 34:274/430 of query aligns to 44:276/857 of Q63342

query
sites
Q63342
D
 
E
V
 
T
C
 
V
V
 
I
I
 
I
G
 
G
A
 
G
G
 
G
L
x
C
T
x
V
G
 
G
I
 
V
S
 
S
T
 
L
A
 
A
L
 
Y
N
 
H
L
 
L
A
 
A
E
 
K
R
 
A
G
 
G
-
 
M
H
 
R
S
 
D
V
 
V
A
 
V
V
 
L
L
 
L
E
|
E
A
x
K
S
 
S
K
 
E
V
 
L
G
 
T
-
 
A
-
x
G
-
x
S
-
x
T
W
|
W
A
x
H
A
|
A
S
x
A
G
|
G
R
 
-
N
 
-
G
 
-
G
 
-
Q
 
-
L
 
-
I
 
-
G
 
-
G
 
-
F
 
-
A
 
-
C
 
-
D
 
-
I
x
L
D
 
T
T
 
T
F
 
Y
A
 
-
K
 
-
Y
 
F
L
 
H
P
 
P
A
 
G
D
 
I
D
 
N
V
 
L
K
 
K
R
 
K
V
 
I
W
 
H
D
 
Y
M
 
D
G
 
S
I
 
I
E
 
K
T
 
L
L
 
Y
D
 
E
I
 
R
V
 
L
K
 
E
E
 
E
R
 
E
V
 
T
A
 
G
K
 
-
H
 
-
Q
 
Q
I
 
V
D
 
V
C
 
G
D
 
F
L
 
H
T
 
Q
I
 
P
G
 
G
Y
 
S
L
 
I
T
 
R
A
 
L
A
 
A
N
 
T
K
 
T
P
 
P
R
 
E
D
 
R
T
 
V
D
 
D
A
 
E
L
 
F
Q
 
K
-
 
Y
-
 
Q
-
 
M
-
 
T
-
 
R
-
 
T
K
 
N
W
 
W
R
 
H
D
 
A
E
 
T
A
 
E
Q
 
Q
R
 
Y
R
 
I
F
 
I
G
 
E
Y
 
P
D
 
E
R
 
K
L
 
I
S
 
H
Y
 
E
V
 
L
D
 
F
A
 
P
D
 
-
G
 
-
V
 
-
G
 
-
N
 
-
Y
 
L
V
 
L
Q
 
N
S
 
M
Q
 
D
R
 
K
Y
 
I
L
 
L
G
 
A
G
 
G
L
 
L
F
 
Y
D
 
N
A
 
P
D
 
G
S
 
D
G
 
G
H
 
H
L
 
I
H
 
D
P
 
P
L
 
Y
N
 
S
Y
 
L
T
 
T
L
 
M
G
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
T
A
 
G
A
 
A
R
 
R
E
 
K
A
 
Y
G
 
G
V
 
V
Q
 
L
I
 
L
F
 
K
E
 
Y
D
 
P
S
 
A
C
 
P
V
|
V
T
 
T
A
 
S
L
 
L
R
 
K
-
 
P
E
 
R
E
 
P
D
 
D
G
 
G
R
 
T
H
 
W
V
 
D
A
 
V
E
 
E
T
 
T
A
 
P
R
 
Q
G
 
G
R
 
S
V
 
V
Q
 
R
A
 
A
R
 
N
F
 
R
V
 
I
V
 
V
L
 
N
A
 
A
C
 
A
N
 
G
T
 
F
Y
x
W
L
 
A
G
 
R
Q
 
E
L
 
V
A
 
G
P
 
K
D
 
M
V
 
I
A
 
G
-
 
L
-
 
D
N
 
H
K
 
P
I
 
L
M
 
I
P
 
P
V
 
V
G
 
Q
T
 
H
Y
 
Q
V
 
Y
I
 
V
A
 
V
T
 
T
E
 
S
P
 
T
L
 
I
D
 
P
P
 
E
D
 
V
R
 
K
A
 
A

Sites not aligning to the query:

4pabB Crystal structure of the precursor form of rat dmgdh complexed with tetrahydrofolate (see paper)
22% identity, 56% coverage: 34:274/430 of query aligns to 7:239/824 of 4pabB

query
sites
4pabB
D
 
E
V
 
T
C
 
V
V
 
I
I
|
I
G
|
G
A
 
G
G
|
G
L
x
C
T
x
V
G
 
G
I
 
V
S
 
S
T
 
L
A
 
A
L
 
Y
N
 
H
L
 
L
A
 
A
E
 
K
R
 
A
G
 
G
-
 
M
H
 
R
S
 
D
V
 
V
A
 
V
V
 
L
L
|
L
E
|
E
A
x
K
S
 
S
K
 
E
V
 
L
G
 
T
-
 
A
-
x
G
-
x
S
-
x
T
W
 
W
A
x
H
A
|
A
S
x
A
G
|
G
R
 
-
N
 
-
G
 
-
G
 
-
Q
 
-
L
 
-
I
 
-
G
 
-
G
 
-
F
 
-
A
 
-
C
 
-
D
 
-
I
x
L
D
 
T
T
|
T
F
 
Y
A
 
-
K
 
-
Y
 
F
L
 
H
P
 
P
A
 
G
D
 
I
D
 
N
V
 
L
K
 
K
R
 
K
V
 
I
W
 
H
D
 
Y
M
 
D
G
 
S
I
 
I
E
 
K
T
 
L
L
 
Y
D
 
E
I
 
R
V
 
L
K
 
E
E
 
E
R
 
E
V
 
T
A
 
G
K
 
-
H
 
-
Q
 
Q
I
 
V
D
 
V
C
 
G
D
 
F
L
 
H
T
 
Q
I
 
P
G
 
G
Y
 
S
L
 
I
T
 
R
A
 
L
A
 
A
N
 
T
K
 
T
P
 
P
R
 
E
D
 
R
T
 
V
D
 
D
A
x
E
L
 
F
Q
 
K
-
 
Y
-
 
Q
-
 
M
-
 
T
-
 
R
-
 
T
K
 
N
W
 
W
R
 
H
D
 
A
E
 
T
A
 
E
Q
 
Q
R
 
Y
R
 
I
F
 
I
G
 
E
Y
 
P
D
 
E
R
 
K
L
 
I
S
 
H
Y
 
E
V
 
L
D
 
F
A
 
P
D
 
-
G
 
-
V
 
-
G
 
-
N
 
-
Y
 
L
V
 
L
Q
 
N
S
 
M
Q
 
D
R
 
K
Y
 
I
L
 
L
G
 
A
G
 
G
L
 
L
F
 
Y
D
 
N
A
 
P
D
 
G
S
 
D
G
 
G
H
 
H
L
 
I
H
 
D
P
 
P
L
 
Y
N
 
S
Y
 
L
T
 
T
L
 
M
G
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
T
A
 
G
A
 
A
R
 
R
E
 
K
A
 
Y
G
 
G
V
 
V
Q
 
L
I
 
L
F
 
K
E
 
Y
D
 
P
S
 
A
C
 
P
V
|
V
T
 
T
A
 
S
L
 
L
R
 
K
-
 
P
E
 
R
E
 
P
D
 
D
G
 
G
R
 
T
H
 
W
V
 
D
A
 
V
E
 
E
T
 
T
A
 
P
R
 
Q
G
 
G
R
 
S
V
 
V
Q
 
R
A
 
A
R
 
N
F
 
R
V
 
I
V
 
V
L
 
N
A
 
A
C
x
A
N
x
G
T
 
F
Y
x
W
L
 
A
G
 
R
Q
 
E
L
 
V
A
 
G
P
 
K
D
 
M
V
 
I
A
 
G
-
 
L
-
 
D
N
 
H
K
 
P
I
 
L
M
 
I
P
 
P
V
 
V
G
 
Q
T
x
H
Y
 
Q
V
x
Y
I
 
V
A
 
V
T
 
T
E
 
S
P
 
T
L
 
I
D
 
P
P
 
E
D
 
V
R
 
K
A
 
A

Sites not aligning to the query:

1y56B Crystal structure of l-proline dehydrogenase from p.Horikoshii (see paper)
20% identity, 79% coverage: 48:388/430 of query aligns to 20:351/374 of 1y56B

query
sites
1y56B
A
 
A
L
 
H
N
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
K
R
 
R
G
 
G
H
 
E
S
 
E
V
 
V
A
 
T
V
 
V
L
x
I
E
|
E
A
x
K
S
 
R
K
 
F
V
 
I
G
 
G
W
 
S
A
 
G
A
x
S
S
x
T
G
x
F
R
|
R
N
x
C
G
|
G
G
x
T
Q
x
G
L
 
I
I
 
R
G
 
Q
G
 
Q
F
 
F
A
 
N
C
 
D
D
 
E
I
 
A
D
 
N
T
 
V
F
 
-
A
 
-
K
 
-
Y
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
-
D
 
-
D
 
-
V
 
-
K
 
-
R
 
R
V
 
V
W
 
M
D
 
K
M
 
R
G
 
S
I
 
V
E
 
E
T
 
-
L
 
-
D
 
-
I
 
L
V
 
W
K
 
K
E
 
K
R
 
Y
V
 
S
A
 
E
K
 
E
H
 
Y
Q
 
G
I
 
F
D
 
S
C
 
F
D
 
K
L
 
Q
T
 
T
I
 
-
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
T
 
F
A
 
L
A
 
L
N
 
Y
K
 
D
P
 
D
R
 
E
D
 
E
T
 
V
D
 
K
A
 
T
L
 
F
Q
 
K
K
 
R
W
 
-
R
 
N
D
 
I
E
 
E
A
 
I
Q
 
Q
R
 
N
R
 
K
F
 
F
G
 
G
Y
 
V
D
 
P
R
 
T
-
 
K
-
 
L
L
 
I
S
 
T
Y
 
P
V
 
E
D
 
E
A
 
A
D
 
K
G
 
E
V
 
I
G
 
V
N
 
P
Y
 
L
V
 
L
Q
 
D
S
 
I
Q
 
S
R
 
E
Y
 
V
L
 
I
G
 
A
G
 
A
L
 
S
F
 
W
D
 
N
A
 
P
D
 
T
S
 
D
G
 
G
H
 
K
L
 
A
H
 
D
P
 
P
L
 
F
N
 
E
Y
 
A
T
 
T
L
 
T
G
 
A
L
 
F
A
 
A
R
 
V
A
 
K
A
 
A
R
 
K
E
 
E
A
 
Y
G
 
G
V
 
A
Q
 
K
I
 
L
F
 
L
E
 
E
D
 
Y
S
 
T
C
x
E
V
|
V
T
 
K
A
 
G
-
 
F
L
 
L
R
 
I
E
 
E
E
 
N
D
 
N
G
 
E
R
 
I
H
 
K
V
 
G
A
 
V
E
 
K
T
 
T
A
 
N
R
 
K
G
 
G
R
 
I
V
 
I
Q
 
K
A
 
T
R
 
G
F
 
I
V
 
V
V
 
V
L
 
N
A
 
A
C
x
T
N
|
N
T
 
A
Y
x
W
L
 
A
G
 
-
Q
 
-
L
 
-
A
 
-
P
 
-
D
 
N
V
 
L
A
 
I
N
 
N
K
 
A
I
 
M
M
 
A
P
 
G
V
 
I
G
 
K
T
 
T
Y
 
K
V
 
I
I
 
-
A
 
-
T
 
-
E
 
-
P
 
P
L
 
I
D
 
E
P
 
P
D
 
Y
R
 
K
A
x
H
E
 
Q
A
 
A
L
 
V
M
 
I
-
 
T
-
 
Q
P
 
P
A
 
I
K
 
K
A
 
R
A
 
G
V
 
T
C
 
I
D
 
N
S
x
P
R
 
M
-
 
V
-
 
I
-
 
S
-
 
F
-
 
K
-
 
Y
-
 
G
-
 
H
-
 
A
F
 
Y
V
 
L
L
 
T
D
 
Q
Y
 
T
F
 
F
R
 
H
P
 
G
A
 
G
P
 
I
D
x
I
H
 
G
R
 
G
L
 
I
L
 
G
W
 
Y
G
 
E
G
 
I
K
 
G
V
 
P
S
 
T
Y
 
Y
S
 
D
K
 
L
L
 
T
A
 
P
P
 
T
R
 
Y
N
 
E
L
 
F
G
 
L
E
 
R
A
 
E
M
 
V
R
 
S
R
 
Y
D
 
Y
M
 
F
L
 
T
K
 
K
T
 
I
F
 
I
P
 
P
Q
 
A
L
 
L
D
 
K
D
 
N
V
 
L
K
 
L
I
 
I
D
 
L
Y
x
R
A
 
T
W
|
W
G
 
A
G
|
G
F
x
Y
V
x
Y
D
 
A
I
 
K
T
 
T
M
 
P
N
 
D
R
 
S
A
 
N
P
 
P
H
 
A
F
 
I
G
 
G
R
 
R
L
 
I
S
 
E
P
 
E
T
 
L
-
 
N
-
 
D
V
 
Y
Y
 
Y
F
 
I
A
 
A
Q
 
A
G
 
G
F
 
F
S
 
S
G
|
G
H
|
H
G
|
G
V
x
F
N
x
M
T
 
M
T
 
A
G
 
P
L
 
A
A
 
V
G
 
G
K
 
E
L
 
M
I
 
V
A
 
A
E
 
E
A
 
L
I
 
I

Sites not aligning to the query:

Q8GAI3 4-methylaminobutanoate oxidase (formaldehyde-forming); MABO; Demethylating gamma-N-methylaminobutyrate oxidase; Gamma-N-methylaminobutyrate oxidase 1; EC 1.5.3.19 from Paenarthrobacter nicotinovorans (Arthrobacter nicotinovorans) (see paper)
27% identity, 60% coverage: 1:256/430 of query aligns to 1:239/824 of Q8GAI3

query
sites
Q8GAI3
M
 
M
L
 
D
R
 
R
F
 
L
S
 
V
N
 
D
Q
 
R
P
 
D
H
 
I
V
 
S
A
 
A
S
 
S
Y
 
M
Y
 
F
A
 
T
A
 
A
T
 
T
A
 
S
N
 
H
D
 
D
S
 
P
T
 
L
R
 
-
H
 
-
P
 
-
A
 
-
L
 
-
D
 
-
E
 
-
T
 
P
I
 
T
S
 
H
V
 
V
D
 
R
V
 
T
C
 
V
V
 
V
I
 
V
G
 
G
A
 
G
G
 
G
L
 
I
T
 
I
G
 
G
I
 
A
S
 
S
T
 
I
A
 
A
L
 
Y
N
 
H
L
 
L
A
 
S
E
 
A
R
 
A
G
 
G
H
 
E
S
 
N
-
 
D
V
 
T
A
 
L
V
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
S
S
 
N
K
 
V
V
 
L
G
 
G
W
 
S
A
 
G
A
 
T
S
 
S
G
x
W
R
x
H
N
 
A
G
 
A
G
 
G
Q
 
L
L
 
V
I
 
T
G
 
G
G
 
A
F
 
R
A
 
G
C
 
T
D
 
T
I
 
T
D
 
M
T
 
T
-
 
K
F
 
L
A
 
A
K
 
K
Y
 
Y
L
 
-
P
 
G
A
 
L
D
 
D
D
 
F
V
 
Y
K
 
S
R
 
R
V
 
L
W
 
E
D
 
Q
M
 
M
G
 
-
I
 
-
E
 
S
T
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
V
V
 
S
K
 
F
E
 
Q
R
 
R
V
 
C
A
 
-
K
 
-
H
 
-
Q
 
-
I
 
-
D
 
-
C
 
-
D
 
-
L
 
-
T
 
-
I
 
-
G
 
G
Y
 
S
L
 
L
T
 
S
A
 
V
A
 
A
N
 
R
K
 
T
P
 
A
R
 
G
D
 
R
T
 
V
D
 
D
A
 
E
L
 
L
Q
 
L
K
 
Y
W
 
A
R
 
K
D
 
D
E
 
V
A
 
A
Q
 
D
R
 
Q
R
 
Q
F
 
G
G
 
-
Y
 
-
D
 
V
R
 
R
L
 
T
S
 
E
Y
 
W
V
 
L
D
 
T
A
 
E
D
 
D
G
 
R
V
 
Y
G
 
K
N
 
E
Y
 
L
V
 
W
Q
 
P
S
 
L
Q
 
A
R
 
T
Y
 
Y
-
 
S
-
 
G
-
 
V
L
 
A
G
 
G
G
 
A
L
 
L
F
 
L
D
 
L
A
 
P
D
 
D
S
 
D
G
 
G
H
 
H
L
 
I
H
 
N
P
 
P
L
 
G
N
 
H
Y
 
A
T
 
T
L
 
V
G
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
K
A
 
L
A
 
A
R
 
H
E
 
S
A
 
L
G
 
G
V
 
T
Q
 
Q
I
 
I
F
 
R
E
 
E
D
 
N
S
 
V
C
 
A
V
 
V
-
 
H
T
 
K
A
 
V
L
 
L
R
 
R
E
 
Q
E
 
G
D
 
D
G
 
L
R
 
V
H
 
V
V
 
G
A
 
V
E
 
L
T
 
T
A
 
D
R
 
Q
G
 
G
R
 
I
V
 
V
Q
 
H
A
 
C
R
 
D
F
 
R
V
 
V
V
 
I
L
 
L
A
 
A
C
 
C
N
 
G
T
 
L
Y
 
W
L
 
T
G
 
R
Q
 
D
L
 
L
A
 
A
P
 
A
D
 
T
V
 
A
A
 
G
N
 
V
K
 
K
I
 
V

Q9UI17 Dimethylglycine dehydrogenase, mitochondrial; ME2GLYDH; EC 1.5.8.4 from Homo sapiens (Human) (see 4 papers)
22% identity, 56% coverage: 34:274/430 of query aligns to 51:283/866 of Q9UI17

query
sites
Q9UI17
D
 
E
V
 
T
C
 
V
V
 
I
I
 
I
G
 
G
A
 
G
G
 
G
L
x
C
T
x
V
G
 
G
I
 
V
S
 
S
T
 
L
A
 
A
L
 
Y
N
 
H
L
 
L
A
 
A
E
 
K
R
 
A
G
 
G
-
 
M
H
 
K
S
 
D
V
 
V
A
 
V
V
 
L
L
 
L
E
|
E
A
x
K
S
 
S
K
 
E
V
 
L
G
 
T
-
 
A
-
x
G
-
x
S
-
x
T
W
|
W
A
x
H
A
|
A
S
x
A
G
|
G
R
 
-
N
 
-
G
 
-
G
 
-
Q
 
-
L
 
-
I
 
-
G
 
-
G
 
-
F
 
-
A
 
-
C
 
-
D
 
-
I
x
L
D
 
T
T
 
T
F
 
Y
A
 
-
K
 
-
Y
 
F
L
 
H
P
 
P
A
 
G
D
 
I
D
 
N
V
 
L
K
 
K
R
 
K
V
 
I
W
x
H
D
 
Y
M
 
D
G
 
S
I
 
I
E
 
K
T
 
L
L
 
Y
D
 
E
I
 
K
V
 
L
K
 
E
E
 
E
R
 
E
V
 
T
A
 
G
K
 
-
H
 
-
Q
 
Q
I
 
V
D
 
V
C
 
G
D
 
F
L
 
H
T
 
Q
I
 
P
G
 
G
Y
 
S
L
 
I
T
 
R
A
 
L
A
 
A
N
 
T
K
 
T
P
 
P
R
 
V
D
 
R
T
 
V
D
 
D
A
 
E
L
 
F
Q
 
K
-
 
Y
-
 
Q
-
 
M
-
 
T
-
 
R
-
 
T
K
 
G
W
 
W
R
 
H
D
 
A
E
 
T
A
 
E
Q
 
Q
R
 
Y
R
 
L
F
 
I
G
 
E
Y
 
P
D
 
E
R
 
K
L
 
I
S
 
Q
Y
 
E
V
 
M
D
 
F
A
 
P
D
 
-
G
 
-
V
 
-
G
 
-
N
 
-
Y
 
L
V
 
L
Q
 
N
S
 
M
Q
 
N
R
 
K
Y
 
V
L
 
L
G
 
A
G
 
G
L
 
L
F
 
Y
D
 
N
A
 
P
D
 
G
S
 
D
G
 
G
H
 
H
L
 
I
H
 
D
P
 
P
L
 
Y
N
 
S
Y
 
L
T
 
T
L
 
M
G
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
A
A
 
G
A
 
A
R
 
R
E
 
K
A
 
C
G
 
G
V
 
A
Q
 
L
I
 
L
F
 
K
E
 
Y
D
 
P
S
 
A
C
 
P
V
|
V
T
 
T
A
 
S
L
 
L
R
 
K
-
 
A
E
 
R
E
 
S
D
 
D
G
 
G
R
 
T
H
 
W
V
 
D
A
 
V
E
 
E
T
 
T
A
 
P
R
 
Q
G
 
G
R
 
S
V
 
M
Q
 
R
A
 
A
R
 
N
F
 
R
V
 
I
V
 
V
L
 
N
A
 
A
C
 
A
N
 
G
T
 
F
Y
 
W
L
 
A
G
 
R
Q
 
E
L
 
V
A
 
G
P
 
K
D
 
M
V
 
I
A
 
G
-
 
L
-
 
E
N
 
H
K
 
P
I
 
L
M
 
I
P
 
P
V
 
V
G
 
Q
T
 
H
Y
 
Q
V
 
Y
I
 
V
A
 
V
T
 
T
E
 
S
P
 
T
L
 
I
D
x
S
P
 
E
D
 
V
R
 
K
A
 
A

Sites not aligning to the query:

3if9A Crystal structure of glycine oxidase g51s/a54r/h244a mutant in complex with inhibitor glycolate (see paper)
22% identity, 53% coverage: 176:402/430 of query aligns to 137:360/364 of 3if9A

query
sites
3if9A
L
 
F
G
 
G
G
 
A
L
 
S
F
 
F
D
 
I
A
 
Q
D
 
D
S
 
D
G
 
V
H
 
H
L
 
V
H
 
E
P
 
P
L
 
Y
N
 
F
Y
 
V
T
 
C
L
 
K
G
 
A
L
 
Y
A
 
V
R
 
K
A
 
A
A
 
A
R
 
K
E
 
M
A
 
L
G
 
G
V
 
A
Q
 
E
I
 
I
F
 
F
E
 
E
D
 
H
S
 
T
C
x
P
V
|
V
T
 
L
A
 
H
L
 
V
R
 
E
E
 
R
E
 
D
D
 
G
G
 
E
R
 
A
H
 
L
V
 
F
A
 
I
E
 
K
T
 
T
A
 
P
R
 
S
G
 
G
R
 
D
V
 
V
Q
 
W
A
 
A
R
 
N
F
 
H
V
 
V
V
 
V
L
 
V
A
 
A
C
x
S
N
x
G
T
 
V
Y
x
W
L
 
S
G
 
G
Q
 
M
L
x
F
A
 
F
P
 
K
D
 
Q
V
 
L
A
 
G
-
 
L
-
 
N
N
 
N
K
 
A
I
 
F
M
 
L
P
 
P
V
 
V
G
 
K
T
 
G
Y
 
E
V
 
C
I
 
L
A
 
S
T
 
V
E
 
W
P
 
N
L
 
D
D
 
D
P
 
I
D
 
P
R
 
L
A
 
T
E
 
K
A
 
T
L
 
L
M
 
Y
P
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
H
A
 
D
V
 
A
C
 
C
D
 
-
S
 
-
R
 
-
F
 
-
V
 
-
L
 
-
D
 
-
Y
|
Y
F
 
I
R
 
V
P
 
P
A
 
R
P
 
K
D
 
S
H
 
G
R
 
R
L
 
L
L
 
V
W
 
V
G
 
G
G
 
A
K
 
T
V
 
M
S
 
K
-
 
P
-
 
G
-
 
D
Y
 
W
S
 
S
K
 
E
L
 
T
A
 
P
P
 
D
R
 
L
N
 
G
L
 
G
G
 
L
E
 
E
A
 
S
M
 
V
R
 
M
R
 
K
D
 
K
M
 
A
L
 
K
K
 
T
T
 
M
F
 
L
P
 
P
Q
 
A
L
 
I
D
 
Q
D
 
N
V
 
M
K
 
K
I
 
V
D
 
D
Y
 
R
A
 
F
W
 
W
G
 
A
G
|
G
F
 
L
V
x
R
D
 
P
I
 
G
T
 
T
M
 
K
N
 
D
R
 
G
A
 
K
P
 
P
H
 
Y
F
 
I
G
 
G
R
 
R
-
 
H
-
 
P
L
 
E
S
 
D
P
 
S
T
 
R
V
 
I
Y
 
L
F
 
F
A
 
A
Q
 
A
G
 
G
F
x
H
S
x
F
G
x
R
H
x
N
G
|
G
V
x
I
N
 
L
T
 
L
T
 
A
G
 
P
L
 
A
A
 
T
G
 
G
K
 
A
L
 
L
I
 
I
A
 
S
E
 
D
A
 
L
I
 
I
D
 
M
G
 
N
Q
 
K
A
 
E
S
 
V
R
 
N
F
 
Q
D
 
D
L
 
W
F
 
L
G
 
H
K
 
A
I
 
F
R
 
R

Sites not aligning to the query:

1ng3A Complex of thio (glycine oxidase) with acetyl-glycine (see paper)
22% identity, 53% coverage: 176:402/430 of query aligns to 137:360/364 of 1ng3A

query
sites
1ng3A
L
 
F
G
 
G
G
 
A
L
 
S
F
 
F
D
 
I
A
 
Q
D
 
D
S
 
D
G
 
V
H
 
H
L
 
V
H
 
E
P
 
P
L
 
Y
N
 
F
Y
 
V
T
 
C
L
 
K
G
 
A
L
 
Y
A
 
V
R
 
K
A
 
A
A
 
A
R
 
K
E
 
M
A
 
L
G
 
G
V
 
A
Q
 
E
I
 
I
F
 
F
E
 
E
D
 
H
S
 
T
C
 
P
V
|
V
T
 
L
A
 
H
L
 
V
R
 
E
E
 
R
E
 
D
D
 
G
G
 
E
R
 
A
H
 
L
V
 
F
A
 
I
E
 
K
T
 
T
A
 
P
R
 
S
G
 
G
R
 
D
V
 
V
Q
 
W
A
 
A
R
 
N
F
 
H
V
 
V
V
 
V
L
 
V
A
 
A
C
x
S
N
x
G
T
 
V
Y
x
W
L
 
S
G
 
G
Q
 
M
L
x
F
A
 
F
P
 
K
D
 
Q
V
 
L
A
 
G
-
 
L
-
 
N
N
 
N
K
 
A
I
 
F
M
 
L
P
 
P
V
 
V
G
 
K
T
 
G
Y
 
E
V
 
C
I
 
L
A
 
S
T
 
V
E
 
W
P
 
N
L
 
D
D
 
D
P
 
I
D
 
P
R
 
L
A
 
T
E
 
K
A
 
T
L
 
L
M
 
Y
P
 
H
A
 
D
K
 
H
A
 
C
A
 
-
V
 
-
C
 
-
D
 
-
S
 
-
R
 
-
F
 
-
V
 
-
L
 
-
D
 
-
Y
|
Y
F
 
I
R
 
V
P
 
P
A
 
R
P
 
K
D
 
S
H
 
G
R
|
R
L
 
L
L
 
V
W
 
V
G
 
G
G
 
A
K
 
T
V
 
M
S
 
K
-
 
P
-
 
G
-
 
D
Y
 
W
S
 
S
K
 
E
L
 
T
A
 
P
P
 
D
R
 
L
N
 
G
L
 
G
G
 
L
E
 
E
A
 
S
M
 
V
R
 
M
R
 
K
D
 
K
M
 
A
L
 
K
K
 
T
T
 
M
F
 
L
P
 
P
Q
 
P
L
 
I
D
 
Q
D
 
N
V
 
M
K
 
K
I
 
V
D
 
D
Y
 
R
A
 
F
W
 
W
G
 
A
G
|
G
F
 
L
V
x
R
D
 
P
I
 
G
T
 
T
M
 
K
N
 
D
R
 
G
A
 
K
P
 
P
H
 
Y
F
 
I
G
 
G
R
 
R
L
 
H
-
 
P
-
 
E
S
 
D
P
 
S
T
 
R
V
 
I
Y
 
L
F
 
F
A
 
A
Q
 
A
G
 
G
F
x
H
S
 
F
G
x
R
H
x
N
G
|
G
V
x
I
N
 
L
T
 
L
T
 
A
G
 
P
L
 
A
A
 
T
G
 
G
K
 
A
L
 
L
I
 
I
A
 
S
E
 
D
A
 
L
I
 
I
D
 
M
G
 
N
Q
 
K
A
 
E
S
 
V
R
 
N
F
 
Q
D
 
D
L
 
W
F
 
L
G
 
H
K
 
A
I
 
F
R
 
R

Sites not aligning to the query:

O31616 Glycine oxidase; GO; EC 1.4.3.19 from Bacillus subtilis (strain 168) (see 3 papers)
22% identity, 53% coverage: 176:402/430 of query aligns to 137:360/369 of O31616

query
sites
O31616
L
 
F
G
 
G
G
 
A
L
 
S
F
 
F
D
 
I
A
 
Q
D
 
D
S
 
D
G
 
V
H
 
H
L
 
V
H
 
E
P
 
P
L
 
Y
N
 
F
Y
 
V
T
 
C
L
 
K
G
 
A
L
 
Y
A
 
V
R
 
K
A
 
A
A
 
A
R
 
K
E
 
M
A
 
L
G
 
G
V
 
A
Q
 
E
I
 
I
F
 
F
E
 
E
D
 
H
S
 
T
C
 
P
V
|
V
T
 
L
A
 
H
L
 
V
R
 
E
E
 
R
E
 
D
D
 
G
G
 
E
R
 
A
H
 
L
V
 
F
A
 
I
E
 
K
T
 
T
A
 
P
R
 
S
G
 
G
R
 
D
V
 
V
Q
 
W
A
 
A
R
 
N
F
 
H
V
 
V
V
 
V
L
 
V
A
 
A
C
 
S
N
 
G
T
 
V
Y
 
W
L
 
S
G
 
G
Q
 
M
L
 
F
A
 
F
P
 
K
D
 
Q
V
 
L
A
 
G
-
 
L
-
 
N
N
 
N
K
 
A
I
 
F
M
 
L
P
 
P
V
 
V
G
 
K
T
 
G
Y
 
E
V
 
C
I
 
L
A
 
S
T
 
V
E
 
W
P
 
N
L
 
D
D
 
D
P
 
I
D
 
P
R
 
L
A
 
T
E
 
K
A
 
T
L
 
L
M
 
Y
P
 
H
A
 
D
K
x
H
A
 
C
A
 
-
V
 
-
C
 
-
D
 
-
S
 
-
R
 
-
F
 
-
V
 
-
L
 
-
D
 
-
Y
 
Y
F
 
I
R
 
V
P
 
P
A
 
R
P
 
K
D
 
S
H
 
G
R
 
R
L
 
L
L
 
V
W
 
V
G
 
G
G
 
A
K
 
T
V
 
M
S
 
K
-
 
P
-
 
G
-
 
D
Y
 
W
S
 
S
K
 
E
L
 
T
A
 
P
P
 
D
R
 
L
N
 
G
L
 
G
G
 
L
E
 
E
A
 
S
M
 
V
R
 
M
R
 
K
D
 
K
M
 
A
L
 
K
K
 
T
T
 
M
F
 
L
P
 
P
Q
 
A
L
 
I
D
 
Q
D
 
N
V
 
M
K
 
K
I
 
V
D
 
D
Y
 
R
A
 
F
W
 
W
G
 
A
G
 
G
F
 
L
V
x
R
D
 
P
I
 
G
T
 
T
M
 
K
N
 
D
R
 
G
A
 
K
P
 
P
H
 
Y
F
 
I
G
 
G
R
 
R
L
 
H
-
 
P
-
 
E
S
 
D
P
 
S
T
 
R
V
 
I
Y
 
L
F
 
F
A
 
A
Q
 
A
G
 
G
F
x
H
S
x
F
G
x
R
H
x
N
G
|
G
V
x
I
N
x
L
T
 
L
T
 
A
G
 
P
L
 
A
A
 
T
G
 
G
K
 
A
L
 
L
I
 
I
A
 
S
E
 
D
A
 
L
I
 
I
D
 
M
G
 
N
Q
 
K
A
 
E
S
 
V
R
 
N
F
 
Q
D
 
D
L
 
W
F
 
L
G
 
H
K
 
A
I
 
F
R
 
R

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>BPHYT_RS23125 FitnessBrowser__BFirm:BPHYT_RS23125
MLRFSNQPHVASYYAATANDSTRHPALDETISVDVCVIGAGLTGISTALNLAERGHSVAV
LEASKVGWAASGRNGGQLIGGFACDIDTFAKYLPADDVKRVWDMGIETLDIVKERVAKHQ
IDCDLTIGYLTAANKPRDTDALQKWRDEAQRRFGYDRLSYVDADGVGNYVQSQRYLGGLF
DADSGHLHPLNYTLGLARAAREAGVQIFEDSCVTALREEDGRHVAETARGRVQARFVVLA
CNTYLGQLAPDVANKIMPVGTYVIATEPLDPDRAEALMPAKAAVCDSRFVLDYFRPAPDH
RLLWGGKVSYSKLAPRNLGEAMRRDMLKTFPQLDDVKIDYAWGGFVDITMNRAPHFGRLS
PTVYFAQGFSGHGVNTTGLAGKLIAEAIDGQASRFDLFGKIRHRDFPGGATLRTPALVLA
MAWYRMKDLI

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory