SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing BPHYT_RS30200 FitnessBrowser__BFirm:BPHYT_RS30200 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 16 hits to proteins with known functional sites (download)

7cyxA Crystal strcuture of glycine oxidase from bacillus cereus atcc 14579 (see paper)
25% identity, 86% coverage: 27:390/424 of query aligns to 3:351/363 of 7cyxA

query
sites
7cyxA
D
 
D
V
 
V
V
 
A
V
 
I
I
|
I
G
|
G
G
 
G
G
|
G
F
x
V
T
x
I
G
 
G
L
 
S
S
 
S
A
 
V
A
 
A
Q
 
H
A
 
F
L
 
L
G
 
A
K
 
E
R
 
R
G
 
G
A
 
H
A
 
K
V
 
V
T
 
A
V
 
I
L
x
V
D
x
E
A
x
K
G
 
Q
R
 
S
I
 
I
G
 
A
G
 
S
G
x
E
A
|
A
S
|
S
G
 
K
R
 
A
N
x
A
G
 
A
G
|
G
Q
x
L
V
 
L
N
 
-
T
 
-
G
 
G
V
 
V
A
 
A
Q
 
Y
D
 
N
F
 
P
V
 
L
A
 
F
L
 
E
V
 
L
A
 
A
Q
 
-
L
 
-
G
 
-
V
 
-
E
 
-
R
 
R
A
 
E
S
 
S
A
 
-
C
 
-
Y
 
-
R
 
R
A
 
A
F
 
I
S
 
F
D
 
P
A
 
Q
V
 
L
D
 
A
T
 
A
V
 
V
E
 
L
R
 
R
L
 
-
I
 
-
R
 
E
E
 
K
E
 
T
N
 
G
I
 
V
D
 
D
C
 
I
N
 
G
Y
 
Y
I
 
E
A
 
E
T
 
K
G
 
G
K
 
I
L
 
Y
K
 
R
L
 
I
A
 
A
S
 
Q
K
 
N
P
 
E
-
 
D
-
 
E
-
 
K
-
 
E
-
 
R
-
 
I
-
 
L
H
 
H
H
 
I
L
 
M
A
 
D
H
 
W
L
 
Q
E
 
Q
K
 
K
T
 
T
A
 
G
E
 
E
A
 
-
I
 
-
R
 
-
R
 
-
E
 
-
V
 
-
D
 
D
T
 
S
D
 
Y
I
 
F
E
 
L
L
 
T
I
 
G
D
 
D
R
 
H
S
 
V
R
 
R
I
 
E
R
 
K
S
 
E
E
 
P
I
 
Y
Q
 
L
S
 
S
D
 
E
S
 
S
F
 
I
H
 
I
G
 
G
G
 
A
L
 
V
L
 
Y
Q
 
Y
R
 
P
H
 
K
G
 
D
G
 
G
Q
 
H
M
 
V
H
 
I
M
 
A
G
 
P
K
 
E
F
 
L
T
 
T
V
 
K
G
 
A
L
 
F
A
 
A
E
 
H
A
 
S
A
 
A
V
 
A
R
 
I
R
 
S
G
 
G
A
 
A
K
 
D
L
 
I
Y
 
Y
E
 
E
N
 
Q
A
 
T
A
 
E
V
|
V
T
 
F
A
 
D
I
 
I
A
 
R
K
 
I
D
 
E
G
 
N
N
 
N
G
 
K
Y
 
V
R
 
T
-
 
G
I
 
V
T
 
I
T
 
T
A
 
S
R
 
E
G
 
G
E
 
I
V
 
V
R
 
T
A
 
C
K
 
E
Q
 
K
V
 
V
L
 
V
I
 
I
A
 
A
T
x
G
G
|
G
P
 
S
S
x
W
R
 
S
H
 
T
G
 
K
P
 
L
F
 
L
G
 
S
W
 
Y
Y
 
F
R
 
H
R
 
R
R
 
D
L
 
W
A
 
G
P
 
-
V
 
-
G
 
-
S
 
-
F
 
-
I
 
-
V
 
-
V
 
-
T
 
T
E
 
Y
P
 
P
L
 
V
S
 
K
P
 
G
E
 
E
L
 
V
L
 
V
A
 
A
Q
 
-
V
 
-
F
 
V
P
 
R
N
 
S
R
 
R
R
 
K
A
 
Q
Y
 
L
T
 
L
T
 
K
T
 
A
R
 
P
L
 
I
M
 
F
H
 
Q
N
 
E
Y
 
R
F
 
F
R
 
Y
V
 
I
T
 
T
P
 
P
D
 
K
-
 
R
-
 
G
S
 
G
R
 
R
L
 
Y
L
 
V
F
 
I
G
 
G
G
 
A
R
 
T
A
 
M
R
 
K
-
 
P
-
 
H
-
 
T
F
 
F
T
 
N
A
 
K
S
 
T
E
 
V
R
 
Q
P
 
P
S
 
E
D
 
S
A
 
I
K
 
T
S
 
S
G
 
-
R
 
-
I
 
-
L
 
I
Q
 
L
E
 
E
G
 
R
L
 
A
A
 
Y
A
 
T
M
 
I
F
 
L
P
 
P
T
 
A
L
 
L
A
 
K
S
 
E
A
 
A
R
 
E
I
 
W
D
 
E
Y
 
S
C
 
T
W
 
W
G
 
A
G
|
G
L
 
L
V
x
R
D
x
P
M
 
Q
S
 
S
A
 
N
D
 
H
R
 
E
L
 
A
P
 
P
H
 
Y
A
 
M
G
 
G
Q
 
E
H
 
H
D
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
K
G
 
G
I
 
L
Y
 
Y
F
 
A
S
 
C
M
 
T
G
 
G
Y
 
H
S
x
Y
G
x
R
H
x
N
G
|
G
T
x
I
Q
 
L
M
 
L
S
 
S
T
 
P
H
 
I
M
 
S
G
 
G
Q
 
Q
V
 
Y
M
 
M
A
 
A
D
 
D
V
 
L
M
 
I
D
 
E
G
 
G
H
 
K
E
 
Q
D
 
E
K
 
N
N
 
H

5i39A High resolution structure of l-amino acid deaminase from proteus vulgaris with the deletion of the specific insertion sequence (see paper)
22% identity, 88% coverage: 14:387/424 of query aligns to 13:370/383 of 5i39A

query
sites
5i39A
L
 
F
L
 
V
S
 
E
A
 
G
S
 
T
E
 
E
G
 
G
P
 
A
L
 
L
D
 
P
G
 
K
Q
 
Q
T
 
A
D
 
D
V
 
V
V
 
V
V
 
V
I
x
V
G
|
G
G
 
A
G
|
G
F
x
I
T
x
L
G
 
G
L
 
I
S
 
M
A
 
T
A
 
A
Q
 
I
A
 
N
L
 
L
G
 
V
K
 
E
R
 
R
G
 
G
A
 
L
A
 
S
V
 
V
T
 
V
V
 
I
L
x
V
D
x
E
A
x
K
G
 
G
R
 
N
I
 
I
G
 
A
G
 
G
G
 
E
A
x
Q
S
|
S
G
 
S
R
 
R
N
x
F
G
x
Y
G
 
G
Q
|
Q
V
x
A
N
 
I
T
 
S
G
 
Y
V
 
K
A
 
M
Q
 
P
D
 
D
F
 
E
V
 
T
A
 
F
L
 
L
V
 
L
A
 
H
Q
 
H
L
 
L
G
 
G
V
 
K
E
 
H
R
 
R
A
 
-
S
 
-
A
 
-
C
 
-
Y
 
W
R
 
R
A
 
E
F
 
M
S
 
N
D
 
A
A
 
K
V
 
V
D
 
-
T
 
-
V
 
-
E
 
-
R
 
-
L
 
-
I
 
-
R
 
-
E
 
-
E
 
-
N
 
G
I
 
I
D
 
D
C
 
T
N
 
T
Y
 
Y
I
 
R
A
 
T
T
 
Q
G
 
G
K
 
R
L
 
V
K
 
E
L
 
V
A
 
P
S
 
L
K
 
D
P
 
E
H
 
E
H
 
D
L
 
L
A
 
V
H
 
N
L
 
V
E
 
R
K
 
K
T
 
W
A
 
I
E
 
D
A
 
E
I
 
R
R
 
S
R
 
K
E
 
N
V
 
V
D
 
G
T
 
S
D
 
D
I
 
I
E
 
P
L
 
F
I
 
K
D
 
T
R
 
R
-
 
I
-
 
I
-
 
E
-
 
G
-
 
A
-
 
E
-
 
L
-
 
N
S
 
Q
R
 
R
I
 
L
R
 
R
S
 
G
E
 
A
I
 
T
Q
 
T
S
 
D
D
 
W
S
 
K
F
 
I
H
 
A
G
 
G
G
 
-
L
 
-
L
 
F
Q
 
E
R
 
E
H
 
D
G
 
S
G
 
G
Q
 
S
M
 
F
H
 
D
M
 
P
G
 
E
K
 
V
F
 
A
T
 
T
V
 
F
G
 
V
L
 
M
A
 
A
E
 
E
A
 
Y
A
 
A
V
 
K
R
 
K
R
 
M
G
 
G
A
 
V
K
 
R
L
 
I
Y
 
Y
E
 
T
N
 
Q
A
 
C
A
|
A
V
x
A
T
 
R
A
 
G
I
 
L
-
 
E
A
 
T
K
 
Q
D
 
A
G
 
G
N
 
V
G
 
I
Y
 
S
R
 
D
I
 
V
T
 
V
T
 
T
A
 
E
R
 
K
G
 
G
E
 
A
V
 
I
R
 
K
A
 
T
K
 
S
Q
 
Q
V
 
V
L
 
V
I
 
V
A
 
A
T
x
G
G
|
G
P
 
V
S
 
-
R
 
-
H
 
-
G
 
-
P
 
-
F
 
-
G
 
-
W
|
W
Y
 
S
R
 
R
R
 
L
R
 
F
L
 
M
A
 
Q
P
 
N
V
 
L
G
 
N
S
 
V
F
 
D
I
 
V
V
 
P
V
 
T
T
 
L
E
 
P
P
 
A
L
 
Y
S
x
Q
P
 
S
E
x
Q
L
 
Q
L
 
L
A
 
I
Q
 
S
V
 
G
F
 
S
P
 
P
N
 
T
R
 
A
R
 
P
A
 
G
Y
 
G
T
 
N
T
 
V
T
 
A
R
 
L
L
x
P
M
 
G
H
 
G
N
 
I
Y
 
F
F
 
F
R
 
R
V
 
E
T
 
Q
P
 
A
D
 
D
S
 
G
R
 
T
L
 
Y
L
 
A
F
 
T
G
 
S
G
 
P
R
 
R
A
 
V
R
 
I
F
 
V
T
 
A
A
 
L
S
 
P
E
 
D
R
 
L
P
 
P
S
 
E
D
 
L
A
 
N
K
 
A
S
 
S
G
 
-
R
 
-
I
 
-
L
 
-
Q
 
L
E
 
E
G
 
K
L
 
L
A
 
K
A
 
A
M
 
E
F
 
F
P
 
P
T
 
A
L
 
F
A
 
K
S
 
E
A
 
S
R
 
K
I
 
L
D
 
I
Y
 
D
C
 
Q
W
 
W
G
 
S
G
|
G
L
 
A
V
x
M
D
 
A
M
 
I
S
 
A
A
 
P
D
 
D
R
 
E
L
 
N
P
 
P
-
 
I
-
 
I
-
 
S
H
 
E
A
 
V
G
 
K
Q
 
E
H
 
Y
D
 
P
G
 
G
I
 
L
Y
 
V
F
 
I
S
 
N
M
 
T
G
 
A
Y
 
-
S
x
T
G
|
G
H
x
W
G
|
G
T
x
M
Q
x
T
M
 
E
S
 
S
T
 
P
H
 
V
M
 
S
G
 
A
Q
 
E
V
 
L
M
 
T
A
 
A
D
 
D
V
 
L
M
 
L
D
 
L
G
 
G
H
 
K
E
 
K

S5FMM4 Glycine oxidase; GO; BliGO; EC 1.4.3.19 from Bacillus licheniformis (see paper)
27% identity, 49% coverage: 189:395/424 of query aligns to 157:358/369 of S5FMM4

query
sites
S5FMM4
L
 
F
A
 
A
E
 
R
A
 
G
A
 
A
V
 
R
R
 
M
R
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
D
L
 
V
Y
 
F
E
 
E
N
 
Y
A
 
T
A
 
P
V
 
V
T
 
L
A
 
S
I
 
I
A
 
E
K
 
S
D
 
E
G
 
A
N
 
G
G
 
A
Y
 
V
R
 
R
I
 
V
T
 
T
T
 
S
A
 
A
R
 
S
G
 
G
E
 
T
V
 
A
R
 
E
A
 
A
K
 
E
Q
 
H
V
 
A
L
 
V
I
 
I
A
 
A
T
x
S
G
 
G
P
 
V
S
 
W
R
 
S
H
 
G
G
 
A
P
 
L
F
 
F
G
 
-
W
 
-
Y
 
-
R
 
-
R
 
K
R
 
Q
L
 
I
A
 
G
P
 
L
V
 
D
G
 
K
S
 
R
F
 
F
I
 
Y
V
 
-
V
 
-
T
 
-
E
 
-
P
 
P
L
 
V
S
 
K
P
 
G
E
 
E
L
 
C
L
 
L
A
 
S
Q
 
-
V
 
V
F
 
W
P
 
N
N
 
D
R
 
G
R
 
I
A
 
S
Y
 
L
T
 
T
T
 
R
T
 
T
R
 
-
L
 
L
M
 
Y
H
 
H
N
 
D
Y
 
H
F
 
C
R
 
Y
V
 
I
T
 
V
P
 
P
-
 
R
-
 
H
D
 
S
S
 
G
R
 
R
L
 
L
L
 
V
F
 
V
G
 
G
G
 
A
R
 
T
A
 
M
R
 
K
-
 
P
F
 
G
T
 
D
A
 
W
S
 
N
E
 
E
R
 
Q
P
 
P
S
 
E
D
 
L
A
 
G
K
 
G
S
 
I
G
 
E
R
 
E
I
 
L
L
 
I
Q
 
R
E
 
K
G
 
A
L
 
-
A
 
K
A
 
S
M
 
M
F
 
L
P
 
P
T
 
G
L
 
I
A
 
E
S
 
S
A
 
M
R
 
K
I
 
I
D
 
D
Y
 
Q
C
 
C
W
 
W
G
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
R
D
 
P
M
 
E
S
 
T
A
 
G
D
 
D
R
 
G
L
 
N
P
 
P
H
 
Y
A
 
I
G
 
G
Q
 
R
H
 
H
-
 
P
-
 
E
-
 
N
D
 
D
G
 
R
I
 
I
Y
 
L
F
 
F
S
 
A
M
 
A
G
 
G
Y
 
H
S
 
F
G
 
R
H
 
N
G
 
G
T
x
I
Q
 
L
M
 
L
S
 
A
T
 
P
H
 
A
M
 
T
G
 
G
Q
 
E
V
 
M
M
|
M
A
 
A
D
 
D
V
 
M
M
 
I
D
 
L
G
 
G
H
 
N
E
 
P
D
 
V
K
 
K
N
 
T
P
 
E
W
 
W
R
 
I
E
 
E
S
 
A

Sites not aligning to the query:

5hxwA L-amino acid deaminase from proteus vulgaris (see paper)
25% identity, 52% coverage: 14:235/424 of query aligns to 5:219/433 of 5hxwA

query
sites
5hxwA
L
 
F
L
 
V
S
 
E
A
 
G
S
 
T
E
 
E
G
 
G
P
 
A
L
 
L
D
 
P
G
 
K
Q
 
Q
T
 
A
D
 
D
V
 
V
V
 
V
V
 
V
I
x
V
G
|
G
G
 
A
G
|
G
F
x
I
T
x
L
G
 
G
L
 
I
S
 
M
A
 
T
A
 
A
Q
 
I
A
 
N
L
 
L
G
 
V
K
 
E
R
 
R
G
 
G
A
 
L
A
 
S
V
 
V
T
 
V
V
 
I
L
 
V
D
x
E
A
x
K
G
 
G
R
 
N
I
 
I
G
 
A
G
 
G
G
x
E
A
x
Q
S
|
S
G
 
S
R
|
R
N
x
F
G
x
Y
G
|
G
Q
|
Q
V
x
A
N
 
I
T
 
S
G
 
Y
V
 
K
A
 
M
Q
 
P
D
 
D
F
 
E
V
 
T
A
 
F
L
 
L
V
 
L
A
 
H
Q
 
H
L
 
L
G
 
G
V
 
K
E
 
H
R
 
R
A
 
-
S
 
-
A
 
-
C
 
-
Y
 
W
R
 
R
A
 
E
F
 
M
S
 
N
D
 
A
A
 
K
V
 
V
D
 
-
T
 
-
V
 
-
E
 
-
R
 
-
L
 
-
I
 
-
R
 
-
E
 
-
E
 
-
N
 
G
I
 
I
D
 
D
C
 
T
N
 
T
Y
 
Y
I
 
R
A
 
T
T
 
Q
G
 
G
K
 
R
L
 
V
K
 
E
L
 
V
A
 
P
S
 
L
K
 
D
P
 
E
H
 
E
H
 
D
L
 
L
A
 
V
H
 
N
L
 
V
E
 
R
K
 
K
T
 
W
A
 
I
E
 
D
A
 
E
I
 
R
R
 
S
R
 
K
E
 
N
V
 
V
D
 
G
T
 
S
D
 
D
I
 
I
E
 
P
L
 
F
I
 
K
D
 
T
R
 
R
-
 
I
-
 
I
-
 
E
-
 
G
-
 
A
-
 
E
-
 
L
-
 
N
S
 
Q
R
 
R
I
 
L
R
 
R
S
 
G
E
 
A
I
 
T
Q
 
T
S
 
D
D
 
W
S
 
K
F
 
I
H
 
A
G
 
G
G
 
-
L
 
-
L
 
F
Q
 
E
R
 
E
H
 
D
G
 
S
G
 
G
Q
 
S
M
 
F
H
 
D
M
 
P
G
 
E
K
 
V
F
 
A
T
 
T
V
 
F
G
 
V
L
 
M
A
 
A
E
 
E
A
 
Y
A
 
A
V
 
K
R
 
K
R
 
M
G
 
G
A
 
V
K
 
R
L
 
I
Y
 
Y
E
 
T
N
 
Q
A
 
C
A
|
A
V
x
A
T
 
R
A
 
G
I
 
L
-
 
E
A
 
T
K
 
Q
D
 
A
G
 
G
N
 
V
G
 
I
Y
 
S
R
 
D
I
 
V
T
 
V
T
 
T
A
 
E
R
 
K
G
 
G
E
 
A
V
 
I
R
 
K
A
 
T
K
 
S
Q
 
Q
V
 
V
L
 
V
I
 
V
A
 
A
T
x
G
G
|
G

Sites not aligning to the query:

O31616 Glycine oxidase; GO; EC 1.4.3.19 from Bacillus subtilis (strain 168) (see 3 papers)
24% identity, 48% coverage: 191:392/424 of query aligns to 159:355/369 of O31616

query
sites
O31616
E
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
K
R
 
M
R
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
E
L
 
I
Y
 
F
E
 
E
N
 
H
A
 
T
A
 
P
V
|
V
T
 
L
A
 
H
I
 
V
A
 
E
K
 
R
D
 
D
G
 
G
N
 
E
G
 
A
Y
 
L
R
 
F
I
 
I
T
 
K
T
 
T
A
 
P
R
 
S
G
 
G
E
 
D
V
 
V
R
 
W
A
 
A
K
 
N
Q
 
H
V
 
V
L
 
V
I
 
V
A
 
A
T
 
S
G
 
G
P
 
V
S
 
W
R
 
S
H
 
-
G
 
-
P
 
-
F
 
-
G
 
G
W
 
M
Y
 
F
R
 
F
R
 
K
R
 
Q
L
 
L
A
 
G
P
 
L
V
 
N
G
 
N
S
 
A
F
 
F
I
 
L
V
 
-
V
 
-
T
 
-
E
 
-
P
 
P
L
 
V
S
 
K
P
 
G
E
 
E
L
 
C
L
 
L
A
 
S
Q
 
-
V
 
V
F
 
W
P
 
N
N
 
D
R
 
D
R
 
I
A
 
P
Y
 
L
T
 
T
T
 
K
T
 
T
R
 
-
L
 
L
M
 
Y
H
 
H
N
 
D
Y
x
H
F
 
C
R
 
Y
V
 
I
T
 
V
P
 
P
-
 
R
-
 
K
D
 
S
S
 
G
R
 
R
L
 
L
L
 
V
F
 
V
G
 
G
G
 
A
R
 
T
A
 
M
R
 
K
F
 
P
T
 
G
A
 
D
S
 
W
E
 
S
R
 
E
P
 
T
S
 
P
D
 
D
A
 
L
K
 
G
S
 
G
G
 
L
R
 
E
I
 
S
L
 
V
Q
 
M
E
 
K
G
 
K
L
 
A
A
 
K
A
 
T
M
 
M
F
 
L
P
 
P
T
 
A
L
 
I
A
 
Q
S
 
N
A
 
M
R
 
K
I
 
V
D
 
D
Y
 
R
C
 
F
W
 
W
G
 
A
G
 
G
L
 
L
V
x
R
D
 
P
M
 
G
S
 
T
A
 
K
D
 
D
R
 
G
L
 
K
P
 
P
H
 
Y
A
 
I
G
 
G
Q
 
R
H
 
H
-
 
P
-
 
E
-
 
D
D
 
S
G
 
R
I
 
I
Y
 
L
F
 
F
S
 
A
M
 
A
G
 
G
Y
x
H
S
x
F
G
x
R
H
x
N
G
|
G
T
x
I
Q
x
L
M
 
L
S
 
A
T
 
P
H
 
A
M
 
T
G
 
G
Q
 
A
V
 
L
M
 
I
A
 
S
D
 
D
V
 
L
M
 
I
D
 
M
G
 
N
H
 
K
E
 
E
D
 
V
K
 
N
N
 
Q
P
 
D
W
 
W

Sites not aligning to the query:

1ng3A Complex of thio (glycine oxidase) with acetyl-glycine (see paper)
24% identity, 48% coverage: 190:392/424 of query aligns to 158:355/364 of 1ng3A

query
sites
1ng3A
A
 
V
E
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
K
R
 
M
R
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
E
L
 
I
Y
 
F
E
 
E
N
 
H
A
 
T
A
 
P
V
|
V
T
 
L
A
 
H
I
 
V
A
 
E
K
 
R
D
 
D
G
 
G
N
 
E
G
 
A
Y
 
L
R
 
F
I
 
I
T
 
K
T
 
T
A
 
P
R
 
S
G
 
G
E
 
D
V
 
V
R
 
W
A
 
A
K
 
N
Q
 
H
V
 
V
L
 
V
I
 
V
A
 
A
T
x
S
G
|
G
P
 
V
S
x
W
R
 
S
H
 
-
G
 
-
P
 
-
F
 
-
G
 
G
W
 
M
Y
x
F
R
 
F
R
 
K
R
 
Q
L
 
L
A
 
G
P
 
L
V
 
N
G
 
N
S
 
A
F
 
F
I
 
L
V
 
-
V
 
-
T
 
-
E
 
-
P
 
P
L
 
V
S
 
K
P
 
G
E
 
E
L
 
C
L
 
L
A
 
S
Q
 
-
V
 
V
F
 
W
P
 
N
N
 
D
R
 
D
R
 
I
A
 
P
Y
 
L
T
 
T
T
 
K
T
 
T
R
 
-
L
 
L
M
 
Y
H
 
H
N
 
D
Y
 
H
F
 
C
R
x
Y
V
 
I
T
 
V
P
 
P
-
 
R
-
 
K
D
 
S
S
 
G
R
|
R
L
 
L
L
 
V
F
 
V
G
 
G
G
 
A
R
 
T
A
 
M
R
 
K
F
 
P
T
 
G
A
 
D
S
 
W
E
 
S
R
 
E
P
 
T
S
 
P
D
 
D
A
 
L
K
 
G
S
 
G
G
 
L
R
 
E
I
 
S
L
 
V
Q
 
M
E
 
K
G
 
K
L
 
A
A
 
K
A
 
T
M
 
M
F
 
L
P
 
P
T
 
P
L
 
I
A
 
Q
S
 
N
A
 
M
R
 
K
I
 
V
D
 
D
Y
 
R
C
 
F
W
 
W
G
 
A
G
|
G
L
 
L
V
x
R
D
 
P
M
 
G
S
 
T
A
 
K
D
 
D
R
 
G
L
 
K
P
 
P
H
 
Y
A
 
I
G
 
G
Q
 
R
H
 
H
-
 
P
-
 
E
-
 
D
D
 
S
G
 
R
I
 
I
Y
 
L
F
 
F
S
 
A
M
 
A
G
 
G
Y
x
H
S
 
F
G
x
R
H
x
N
G
|
G
T
x
I
Q
 
L
M
 
L
S
 
A
T
 
P
H
 
A
M
 
T
G
 
G
Q
 
A
V
 
L
M
 
I
A
 
S
D
 
D
V
 
L
M
 
I
D
 
M
G
 
N
H
 
K
E
 
E
D
 
V
K
 
N
N
 
Q
P
 
D
W
 
W

Sites not aligning to the query:

3if9A Crystal structure of glycine oxidase g51s/a54r/h244a mutant in complex with inhibitor glycolate (see paper)
24% identity, 48% coverage: 191:392/424 of query aligns to 159:355/364 of 3if9A

query
sites
3if9A
E
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
K
R
 
M
R
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
E
L
 
I
Y
 
F
E
 
E
N
 
H
A
 
T
A
x
P
V
|
V
T
 
L
A
 
H
I
 
V
A
 
E
K
 
R
D
 
D
G
 
G
N
 
E
G
 
A
Y
 
L
R
 
F
I
 
I
T
 
K
T
 
T
A
 
P
R
 
S
G
 
G
E
 
D
V
 
V
R
 
W
A
 
A
K
 
N
Q
 
H
V
 
V
L
 
V
I
 
V
A
 
A
T
x
S
G
|
G
P
 
V
S
x
W
R
 
S
H
 
-
G
 
-
P
 
-
F
 
-
G
 
G
W
 
M
Y
x
F
R
 
F
R
 
K
R
 
Q
L
 
L
A
 
G
P
 
L
V
 
N
G
 
N
S
 
A
F
 
F
I
 
L
V
 
-
V
 
-
T
 
-
E
 
-
P
 
P
L
 
V
S
 
K
P
 
G
E
 
E
L
 
C
L
 
L
A
 
S
Q
 
-
V
 
V
F
 
W
P
 
N
N
 
D
R
 
D
R
 
I
A
 
P
Y
 
L
T
 
T
T
 
K
T
 
T
R
 
-
L
 
L
M
 
Y
H
 
H
N
 
D
Y
 
A
F
 
C
R
x
Y
V
 
I
T
 
V
P
 
P
-
 
R
-
 
K
D
 
S
S
 
G
R
 
R
L
 
L
L
 
V
F
 
V
G
 
G
G
 
A
R
 
T
A
 
M
R
 
K
F
 
P
T
 
G
A
 
D
S
 
W
E
 
S
R
 
E
P
 
T
S
 
P
D
 
D
A
 
L
K
 
G
S
 
G
G
 
L
R
 
E
I
 
S
L
 
V
Q
 
M
E
 
K
G
 
K
L
 
A
A
 
K
A
 
T
M
 
M
F
 
L
P
 
P
T
 
A
L
 
I
A
 
Q
S
 
N
A
 
M
R
 
K
I
 
V
D
 
D
Y
 
R
C
 
F
W
 
W
G
 
A
G
|
G
L
 
L
V
x
R
D
 
P
M
 
G
S
 
T
A
 
K
D
 
D
R
 
G
L
 
K
P
 
P
H
 
Y
A
 
I
G
 
G
Q
 
R
H
 
H
-
 
P
-
 
E
-
 
D
D
 
S
G
 
R
I
 
I
Y
 
L
F
 
F
S
 
A
M
 
A
G
 
G
Y
x
H
S
x
F
G
x
R
H
x
N
G
|
G
T
x
I
Q
 
L
M
 
L
S
 
A
T
 
P
H
 
A
M
 
T
G
 
G
Q
 
A
V
 
L
M
 
I
A
 
S
D
 
D
V
 
L
M
 
I
D
 
M
G
 
N
H
 
K
E
 
E
D
 
V
K
 
N
N
 
Q
P
 
D
W
 
W

Sites not aligning to the query:

8p84B X-ray structure of thermoanaerobacterales bacterium monoamine oxidase (see paper)
28% identity, 51% coverage: 25:240/424 of query aligns to 3:268/450 of 8p84B

query
sites
8p84B
Q
 
Q
T
 
V
D
 
D
V
 
V
V
 
V
V
 
V
I
x
V
G
|
G
G
 
A
G
|
G
F
 
F
T
x
A
G
 
G
L
 
L
S
 
T
A
 
A
A
 
A
Q
 
R
A
 
A
L
 
V
G
 
H
K
 
E
R
 
A
G
 
G
A
 
R
A
 
S
V
 
V
T
 
L
V
 
V
L
 
L
D
x
E
A
|
A
-
x
R
G
 
D
R
 
R
I
 
V
G
 
G
G
|
G
G
x
R
A
x
T
S
 
C
G
 
T
R
 
E
N
 
E
-
 
H
-
 
H
-
 
G
-
 
T
-
 
W
-
 
I
-
 
D
-
 
L
G
 
G
G
|
G
Q
|
Q
V
 
-
N
x
W
T
 
I
G
 
G
V
 
P
A
 
G
Q
 
Q
D
 
D
F
 
R
V
 
V
-
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
A
A
 
A
Q
 
E
L
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
E
-
 
T
-
 
Y
-
 
P
-
 
Q
-
 
P
-
 
T
-
 
E
-
 
G
-
 
D
-
 
D
-
 
V
-
 
V
-
 
L
-
 
F
-
 
G
-
 
D
-
 
G
-
 
E
-
 
P
-
 
Q
R
 
R
A
 
A
S
 
P
A
 
D
C
 
V
Y
 
A
R
 
L
A
 
A
F
 
F
S
 
S
D
 
D
A
 
E
V
 
E
D
 
L
T
 
T
-
 
A
-
 
Y
-
 
L
-
 
E
-
 
L
-
 
A
-
 
G
-
 
A
V
 
L
E
 
E
R
 
A
L
 
I
I
 
A
R
x
E
E
 
K
E
 
V
N
 
P
I
 
L
D
 
D
C
 
A
N
 
P
Y
 
W
I
 
L
A
 
A
T
 
P
G
 
E
K
 
A
L
 
A
K
 
A
L
 
W
A
 
D
S
 
A
K
 
T
-
 
T
-
 
L
-
 
R
-
 
E
-
 
W
-
 
V
-
 
A
-
 
G
-
 
T
-
 
G
-
 
V
P
 
P
H
 
D
H
 
R
L
 
V
A
 
A
H
 
G
L
 
L
-
 
F
E
 
E
K
 
V
T
 
A
A
 
V
E
 
Q
A
 
A
I
 
V
R
 
F
R
 
A
E
 
A
V
 
T
D
 
S
T
 
A
D
 
Q
I
 
L
E
 
S
L
 
L
I
 
L
D
 
H
R
 
A
S
 
A
R
 
H
I
 
Y
R
 
-
S
 
-
E
 
-
I
 
V
Q
x
H
S
 
S
D
 
A
S
 
G
F
 
G
H
 
W
G
 
S
G
 
K
L
 
L
L
 
T
Q
 
D
R
 
T
H
 
E
G
 
G
G
 
G
Q
 
-
M
 
A
H
 
Q
M
 
Q
G
 
D
K
 
R
F
 
L
T
 
V
V
 
G
G
 
G
L
 
V
A
 
Q
E
 
P
A
 
L
A
 
A
V
 
E
R
 
R
R
 
L
G
 
A
A
 
A
K
 
R
L
 
L
Y
 
P
E
 
D
N
 
G
A
 
A
-
 
L
-
 
R
-
 
L
-
 
S
-
 
T
A
 
P
V
|
V
T
 
R
A
 
G
I
 
L
A
 
A
K
 
Q
D
 
D
G
 
G
N
 
D
G
 
G
Y
 
V
R
 
T
I
 
V
T
 
R
T
 
T
A
 
A
R
 
G
G
 
G
E
 
E
V
 
V
R
 
R
A
 
A
K
 
R
Q
 
R
V
 
A
L
 
I
I
 
V
A
 
A
T
x
V
G
 
P
P
 
P
S
 
T
R
 
L
H
 
A
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Q5L2C2 Glycine oxidase; GO; GOX; GOXK; EC 1.4.3.19 from Geobacillus kaustophilus (strain HTA426)
25% identity, 67% coverage: 106:387/424 of query aligns to 78:357/377 of Q5L2C2

query
sites
Q5L2C2
E
 
E
R
 
E
L
 
L
I
 
R
R
 
E
E
 
R
E
 
T
N
 
G
I
 
I
D
 
D
C
 
I
N
 
G
Y
 
L
I
 
V
A
 
E
T
 
K
G
 
G
K
 
L
L
 
I
K
 
K
L
 
L
A
 
A
S
 
T
K
 
T
P
 
E
H
 
E
H
 
E
L
 
A
A
 
D
H
 
D
L
 
L
E
 
Y
K
 
R
T
 
H
A
 
Y
E
 
-
A
 
T
I
 
F
R
 
W
R
 
R
E
 
G
V
 
I
D
 
G
T
 
E
D
 
P
I
 
V
E
 
Q
L
 
W
I
 
L
D
 
T
R
 
K
S
 
G
R
 
E
-
 
A
-
 
L
-
 
E
I
 
M
R
 
E
S
 
P
E
 
R
I
 
L
Q
 
A
S
 
A
D
 
E
S
 
A
F
 
L
H
 
A
G
 
G
G
 
A
L
 
M
L
 
Y
Q
 
I
R
 
P
H
 
G
G
 
D
G
 
G
Q
 
Q
M
 
V
H
 
S
M
 
A
G
 
P
K
 
D
F
 
L
T
 
A
V
 
A
G
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
Y
A
 
A
A
 
A
V
 
A
R
 
S
R
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
C
L
 
L
Y
 
Y
E
 
E
N
 
Y
A
 
T
A
 
E
V
|
V
T
 
F
A
 
D
I
 
I
A
 
R
K
 
S
D
 
D
G
 
S
N
 
S
G
 
G
Y
 
H
R
 
V
I
 
L
T
 
D
T
 
T
A
 
T
R
 
G
G
 
G
E
 
T
V
 
F
R
 
A
A
 
A
K
 
E
Q
 
A
V
 
V
L
 
V
I
 
I
A
 
A
T
 
S
G
 
G
P
 
-
S
 
-
R
 
-
H
 
-
G
 
-
P
 
-
F
 
-
G
 
A
W
 
W
Y
 
A
R
 
A
R
 
R
R
 
L
L
 
G
A
 
A
P
 
R
V
 
V
G
 
G
S
 
L
F
 
S
I
 
L
V
 
S
V
 
V
T
 
Y
E
 
-
P
 
P
L
 
V
S
 
K
P
 
G
E
 
E
L
 
C
L
 
V
A
 
M
Q
 
V
V
 
R
F
 
A
P
 
P
N
 
V
R
 
P
R
 
L
A
 
L
Y
 
Q
T
 
T
T
 
T
T
 
V
R
 
-
L
 
F
M
 
A
H
 
K
N
 
N
Y
 
G
F
 
C
R
 
Y
V
 
I
T
 
V
P
 
P
D
 
K
S
 
S
-
 
G
-
 
N
R
 
R
L
 
L
L
 
L
F
 
I
G
 
G
G
 
A
R
 
T
A
 
S
R
 
T
F
 
P
T
 
G
A
 
T
S
 
F
E
 
D
R
 
R
P
 
R
S
 
V
D
 
S
A
 
A
K
 
G
S
 
G
G
 
V
R
 
M
I
 
N
L
 
L
Q
 
L
E
 
H
G
 
R
L
 
A
A
 
A
A
 
H
M
 
L
F
 
V
P
 
P
T
 
D
L
 
I
A
 
E
S
 
Q
A
 
A
R
 
E
I
 
W
D
 
V
Y
 
A
C
 
S
W
 
W
G
 
S
G
 
G
L
 
I
V
x
R
D
 
P
M
 
Q
S
 
T
A
 
E
D
 
D
R
 
G
L
 
L
P
 
P
H
 
Y
A
 
L
G
 
G
Q
 
E
H
 
H
D
 
P
-
 
E
-
 
R
-
 
R
G
 
G
I
 
L
Y
 
F
F
 
V
S
 
A
M
 
A
G
 
G
Y
x
H
S
x
Y
G
x
R
H
x
N
G
|
G
T
x
I
Q
x
L
M
 
L
S
 
S
T
 
P
H
 
L
M
 
T
G
 
G
Q
 
L
V
 
L
M
 
V
A
 
A
D
 
D
V
 
L
M
 
V
D
 
E
G
 
R
H
 
K
E
 
E

Sites not aligning to the query:

4yshA Crystal structure of glycine oxidase from geobacillus kaustophilus
27% identity, 45% coverage: 198:387/424 of query aligns to 170:355/370 of 4yshA

query
sites
4yshA
A
 
A
K
 
C
L
 
L
Y
 
Y
E
 
E
N
 
Y
A
 
T
A
 
E
V
|
V
T
 
F
A
 
D
I
 
I
A
 
R
K
 
S
D
 
D
G
 
S
N
 
S
G
 
G
Y
 
H
R
 
V
I
 
L
T
 
D
T
 
T
A
 
T
R
 
G
G
 
G
E
 
T
V
 
F
R
 
A
A
 
A
K
 
E
Q
 
A
V
 
V
L
 
V
I
 
I
A
 
A
T
x
S
G
|
G
-
 
A
-
x
W
P
 
A
S
 
A
R
 
R
H
 
L
G
 
G
P
 
A
F
 
R
G
 
V
W
 
G
Y
 
L
R
 
S
R
 
L
R
 
S
L
 
V
A
 
Y
P
 
P
V
 
V
-
 
K
G
 
G
S
 
E
F
 
C
I
 
V
V
 
M
V
 
V
T
 
R
E
 
A
P
 
P
L
 
V
S
 
-
P
 
P
E
 
L
L
 
L
L
 
Q
A
 
T
Q
 
T
V
 
V
F
 
F
P
 
A
N
 
K
R
 
N
R
 
G
A
 
C
Y
 
Y
T
 
-
T
 
-
T
 
-
R
 
-
L
 
-
M
 
-
H
 
-
N
 
-
Y
 
-
F
 
-
R
 
-
V
 
I
T
 
V
P
 
P
D
 
K
S
 
S
-
 
G
-
 
N
R
 
R
L
 
L
L
 
L
F
x
I
G
 
G
G
 
A
R
 
T
A
 
S
R
 
T
F
 
P
T
 
G
A
 
T
S
 
F
E
 
D
R
 
R
P
 
R
S
 
V
D
 
S
A
 
A
K
 
G
S
 
G
G
 
V
R
 
M
I
 
N
L
|
L
Q
 
L
E
 
H
G
 
R
L
 
A
A
 
A
A
 
H
M
 
L
F
 
V
P
 
P
T
 
D
L
 
I
A
 
E
S
 
Q
A
 
A
R
 
E
I
 
W
D
 
V
Y
 
A
C
 
S
W
 
W
G
 
S
G
|
G
L
 
I
V
x
R
D
 
P
M
 
Q
S
 
T
A
 
E
D
 
D
R
 
G
L
 
L
P
 
P
H
 
Y
A
 
L
G
 
G
Q
 
E
H
 
H
D
 
P
-
 
E
-
 
R
-
 
R
G
 
G
I
 
L
Y
 
F
F
 
V
S
 
A
M
 
A
G
 
G
Y
x
H
S
 
Y
G
x
R
H
x
N
G
|
G
T
x
I
Q
x
L
M
 
L
S
 
S
T
 
P
H
 
L
M
 
T
G
 
G
Q
 
L
V
 
L
M
 
V
A
 
A
D
 
D
V
 
L
M
 
V
D
 
E
G
 
R
H
 
K
E
 
E

Sites not aligning to the query:

4yshB Crystal structure of glycine oxidase from geobacillus kaustophilus
28% identity, 45% coverage: 198:387/424 of query aligns to 170:355/368 of 4yshB

query
sites
4yshB
A
 
A
K
 
C
L
 
L
Y
 
Y
E
 
E
N
 
Y
A
 
T
A
 
E
V
|
V
T
 
F
A
 
D
I
 
I
A
 
R
K
 
S
D
 
D
G
 
S
N
 
S
G
 
G
Y
 
H
R
 
V
I
 
L
T
 
D
T
 
T
A
 
T
R
 
G
G
 
G
E
 
T
V
 
F
R
 
A
A
 
A
K
 
E
Q
 
A
V
 
V
L
 
V
I
 
I
A
 
A
T
x
S
G
 
G
P
 
-
S
 
-
R
 
-
H
 
-
G
 
-
P
 
-
F
 
-
G
 
A
W
|
W
Y
 
A
R
 
A
R
 
R
R
 
L
L
 
G
A
 
A
P
 
R
V
 
V
G
 
G
S
 
L
F
 
S
I
 
L
V
 
S
V
 
V
T
 
Y
E
 
-
P
 
P
L
 
V
S
 
K
P
 
G
E
 
E
L
 
C
L
 
V
A
 
M
Q
 
V
V
 
R
F
 
A
P
 
P
N
 
V
R
 
P
R
 
L
A
 
L
Y
 
Q
T
 
T
T
 
T
T
 
V
R
 
-
L
 
F
M
 
A
H
 
K
N
 
N
Y
x
G
F
 
C
R
x
Y
V
 
I
T
 
V
P
 
P
D
 
K
S
 
S
-
 
G
-
 
N
R
 
R
L
 
L
L
 
L
F
x
I
G
 
G
G
x
A
R
 
T
A
 
S
R
 
T
F
 
P
T
 
G
A
 
T
S
 
F
E
 
D
R
 
R
P
 
R
S
 
V
D
 
S
A
 
A
K
 
G
S
 
G
G
 
V
R
 
M
I
 
N
L
|
L
Q
 
L
E
 
H
G
 
R
L
 
A
A
 
A
A
 
H
M
 
L
F
 
V
P
 
P
T
 
D
L
 
I
A
 
E
S
 
Q
A
 
A
R
 
E
I
 
W
D
 
V
Y
 
A
C
 
S
W
 
W
G
 
S
G
|
G
L
 
I
V
x
R
D
 
P
M
 
Q
S
 
T
A
 
E
D
 
D
R
 
G
L
 
L
P
 
P
H
 
Y
A
 
L
G
 
G
Q
 
E
H
 
H
D
 
P
-
 
E
-
 
R
-
 
R
G
 
G
I
 
L
Y
 
F
F
 
V
S
 
A
M
 
A
G
 
G
Y
x
H
S
 
Y
G
x
R
H
x
N
G
|
G
T
x
I
Q
x
L
M
 
L
S
 
S
T
 
P
H
 
L
M
 
T
G
 
G
Q
 
L
V
 
L
M
 
V
A
 
A
D
 
D
V
 
L
M
 
V
D
 
E
G
 
R
H
 
K
E
 
E

Sites not aligning to the query:

Q8GAI3 4-methylaminobutanoate oxidase (formaldehyde-forming); MABO; Demethylating gamma-N-methylaminobutyrate oxidase; Gamma-N-methylaminobutyrate oxidase 1; EC 1.5.3.19 from Paenarthrobacter nicotinovorans (Arthrobacter nicotinovorans) (see paper)
26% identity, 53% coverage: 10:235/424 of query aligns to 10:225/824 of Q8GAI3

query
sites
Q8GAI3
T
 
S
A
 
A
P
 
S
P
 
M
L
 
F
L
 
T
S
 
A
A
 
T
S
 
S
E
 
H
G
 
D
P
 
P
L
 
L
D
 
P
G
 
T
Q
 
H
T
 
V
D
 
R
V
 
T
V
 
V
V
 
V
I
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
F
 
I
T
 
I
G
 
G
L
 
A
S
 
S
A
 
I
A
 
A
Q
 
Y
A
 
H
L
 
L
G
 
S
K
 
A
R
 
A
G
 
G
A
 
E
A
 
N
V
 
D
T
 
T
-
 
L
V
 
L
L
 
L
D
 
E
A
 
S
G
 
N
R
 
V
I
 
L
G
 
G
G
 
S
G
 
G
A
 
T
S
 
S
G
x
W
R
x
H
N
 
A
G
 
A
G
 
G
Q
 
L
V
 
V
N
 
T
T
 
G
G
 
A
V
 
R
A
 
G
Q
 
T
D
 
T
F
 
T
V
 
M
A
 
T
L
 
K
V
 
L
A
 
A
Q
 
K
L
 
Y
G
 
G
V
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
-
S
 
-
A
 
-
C
 
-
Y
 
-
R
 
-
A
 
-
F
 
-
S
 
-
D
 
-
A
 
-
V
 
L
D
 
D
T
 
F
V
 
Y
E
 
S
R
 
R
L
 
L
I
 
E
R
 
Q
E
 
M
E
 
S
N
 
G
I
 
L
D
 
D
C
 
V
N
 
S
Y
 
F
I
 
Q
A
 
R
T
 
C
G
 
G
K
 
S
L
 
L
K
 
S
L
 
V
A
 
A
S
 
R
K
 
T
P
 
A
H
 
G
H
 
R
L
 
V
A
 
D
H
 
E
L
 
L
E
 
L
K
 
Y
T
 
A
A
 
K
E
 
D
-
 
V
A
 
A
I
 
D
R
 
Q
R
 
Q
E
 
G
V
 
V
D
 
R
T
 
T
D
 
E
I
 
W
E
 
L
L
 
T
I
 
E
D
 
D
R
 
R
S
 
Y
R
 
K
I
 
E
R
 
L
S
 
W
E
 
P
I
 
L
Q
 
A
S
 
T
D
 
Y
S
 
S
-
 
G
F
 
V
H
 
A
G
 
G
G
 
A
L
 
L
L
 
L
Q
 
L
R
 
P
H
 
D
G
 
D
G
 
G
Q
 
H
M
 
I
H
 
N
M
 
P
G
 
G
K
 
H
F
 
A
T
 
T
V
 
V
G
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
K
A
 
L
A
 
A
V
 
H
R
 
S
R
 
L
G
 
G
A
 
T
K
 
Q
L
 
I
Y
 
R
E
 
E
N
 
N
A
 
V
A
 
A
V
 
V
T
 
H
A
 
K
I
 
V
A
 
L
K
 
R
D
 
Q
G
 
G
N
 
D
G
 
L
Y
 
V
R
 
V
-
 
G
I
 
V
T
 
L
T
 
T
A
 
D
R
 
Q
G
 
G
E
 
I
V
 
V
R
 
H
A
 
C
K
 
D
Q
 
R
V
 
V
L
 
I
I
 
L
A
 
A
T
 
C
G
 
G

1y56B Crystal structure of l-proline dehydrogenase from p.Horikoshii (see paper)
21% identity, 84% coverage: 41:397/424 of query aligns to 20:362/374 of 1y56B

query
sites
1y56B
A
 
A
Q
 
H
A
 
E
L
 
L
G
 
A
K
 
K
R
 
R
G
 
G
A
 
E
A
 
E
V
 
V
T
 
T
V
 
V
L
x
I
D
x
E
A
x
K
G
 
R
R
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
S
G
 
G
A
x
S
S
x
T
G
x
F
R
|
R
N
x
C
G
|
G
G
 
-
Q
 
-
V
 
-
N
 
-
T
|
T
G
|
G
V
 
I
A
 
R
Q
 
Q
D
 
Q
F
 
F
V
 
N
A
 
D
L
 
E
V
 
A
A
 
N
Q
 
V
L
 
R
G
 
V
V
 
M
E
 
K
R
 
R
A
 
S
S
 
V
A
 
E
C
 
L
Y
 
W
R
 
K
A
 
K
F
 
Y
S
 
S
D
 
-
A
 
-
V
 
-
D
 
-
T
 
-
V
 
-
E
 
-
R
 
-
L
 
-
I
 
-
R
 
-
E
 
-
E
 
E
N
 
E
I
 
Y
D
 
G
C
 
F
N
 
S
Y
 
F
I
 
K
A
 
Q
T
 
T
G
 
G
K
 
Y
L
 
L
K
 
F
L
 
L
A
 
L
S
 
Y
K
 
D
P
 
D
H
 
E
H
 
E
L
 
V
A
 
K
H
 
T
L
 
F
E
 
K
K
 
R
T
 
N
A
 
I
E
 
E
A
 
-
I
 
I
R
 
Q
R
 
N
E
 
K
V
 
F
D
 
G
T
 
V
D
 
P
I
 
T
E
 
K
L
 
L
I
 
I
D
 
T
R
 
P
S
 
E
R
 
E
I
 
A
R
 
K
-
 
E
-
 
I
-
 
V
-
 
P
-
 
L
-
 
L
-
 
D
-
 
I
S
 
S
E
 
E
I
 
V
Q
 
I
S
 
A
D
 
A
S
 
S
F
 
W
H
 
N
G
 
P
G
 
T
L
 
-
L
 
-
Q
 
-
R
 
-
H
 
-
G
 
D
G
 
G
Q
 
K
M
 
A
H
 
D
M
 
P
G
 
F
K
 
E
F
 
A
T
 
T
V
 
T
G
 
A
L
 
F
A
 
A
E
 
V
A
 
K
A
 
A
V
 
K
R
 
E
R
 
Y
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
L
Y
 
L
E
 
E
N
 
Y
A
 
T
A
x
E
V
|
V
T
 
K
A
 
G
I
 
F
A
 
L
K
 
I
D
 
E
G
 
N
N
 
N
G
 
E
Y
 
I
R
 
K
-
 
G
I
 
V
T
 
K
T
 
T
A
 
N
R
 
K
G
 
G
E
 
I
V
 
I
R
 
K
A
 
T
K
 
G
Q
 
I
V
 
V
L
 
V
I
 
N
A
 
A
T
|
T
-
x
N
-
 
A
-
x
W
-
 
A
-
 
N
-
 
L
-
 
I
-
 
N
-
 
A
-
 
M
-
 
A
G
 
G
P
 
I
S
 
K
R
 
T
H
 
K
G
 
I
P
 
P
F
 
I
G
 
E
W
 
P
Y
 
Y
R
 
K
R
x
H
R
 
Q
L
 
A
A
 
-
P
 
-
V
 
-
G
 
-
S
 
-
F
 
-
I
 
-
V
 
V
V
 
I
T
 
T
E
 
Q
P
 
P
-
 
I
-
 
K
-
 
R
-
 
G
-
 
T
L
 
I
S
 
N
P
|
P
E
 
M
L
 
V
-
 
I
-
 
S
-
 
F
-
 
K
-
 
Y
-
 
G
-
 
H
-
 
A
-
 
Y
L
 
L
A
 
T
Q
 
Q
V
 
T
F
 
F
P
 
H
N
 
G
R
 
G
R
 
I
A
x
I
Y
 
G
T
 
G
T
 
I
T
 
G
R
 
Y
L
 
E
M
 
I
H
 
G
N
 
P
Y
 
T
F
 
Y
R
 
D
V
 
L
T
 
T
P
 
P
D
 
T
S
 
Y
R
 
E
L
 
F
L
 
L
F
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
-
F
 
-
T
 
-
A
 
-
S
 
-
E
 
-
R
 
-
P
 
-
S
 
-
D
 
-
A
 
-
K
 
-
S
 
-
G
 
-
R
 
R
I
 
E
L
 
V
Q
 
S
E
 
Y
G
 
Y
L
 
F
A
 
T
A
 
K
M
 
I
F
 
I
P
 
P
T
 
A
L
 
L
A
 
K
S
 
N
A
 
L
R
 
L
I
 
I
D
 
L
Y
x
R
C
 
T
W
|
W
G
 
A
G
|
G
L
x
Y
V
x
Y
D
 
A
M
 
K
S
 
T
A
 
P
D
 
D
R
 
S
L
 
N
P
 
P
H
 
A
A
 
I
G
 
G
Q
 
R
H
 
I
D
 
E
G
 
E
I
 
L
-
 
N
-
 
D
-
 
Y
Y
 
Y
F
 
I
S
 
A
M
 
A
G
 
G
Y
 
F
S
 
S
G
|
G
H
|
H
G
|
G
T
x
F
Q
x
M
M
 
M
S
 
A
T
 
P
H
 
A
M
 
V
G
 
G
Q
 
E
V
 
M
M
 
V
A
 
A
D
 
E
V
 
L
M
 
I
D
 
T
G
 
K
H
 
G
E
 
K
D
 
T
K
 
K
N
 
L
P
 
P
W
 
-
R
 
-
E
 
-
S
 
V
E
 
E
W
 
W

Sites not aligning to the query:

5fjnA Structure of l-amino acid deaminase from proteus myxofaciens in complex with anthranilate (see paper)
24% identity, 52% coverage: 14:235/424 of query aligns to 17:231/447 of 5fjnA

query
sites
5fjnA
L
 
F
L
 
V
S
 
E
A
 
S
S
 
T
E
 
E
G
 
G
P
 
A
L
 
L
D
 
P
G
 
S
Q
 
E
T
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
V
V
 
I
I
|
I
G
|
G
G
 
G
G
|
G
F
x
I
T
x
Q
G
 
G
L
 
I
S
 
M
A
 
T
A
 
A
Q
 
I
A
 
N
L
 
L
G
 
A
K
 
E
R
 
R
G
 
G
A
 
M
A
 
S
V
 
V
T
 
T
V
 
I
L
|
L
D
x
E
A
x
K
G
 
G
R
 
E
I
 
V
G
 
A
G
 
G
G
x
E
A
x
Q
S
|
S
G
 
G
R
 
R
N
x
A
G
x
Y
G
x
S
Q
|
Q
V
 
I
N
 
I
T
 
S
G
 
Y
V
 
Q
A
 
T
Q
 
S
D
 
P
F
 
E
V
 
I
A
 
F
L
 
P
V
 
L
A
 
H
Q
 
H
L
 
Y
G
 
G
V
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
-
S
 
K
A
 
I
C
 
L
Y
 
W
R
 
R
A
 
G
F
 
M
S
 
N
D
 
E
A
 
K
V
 
I
D
 
-
T
 
-
V
 
-
E
 
-
R
 
-
L
 
-
I
 
-
R
 
-
E
 
-
E
 
-
N
 
G
I
 
A
D
 
D
C
 
T
N
 
S
Y
 
Y
I
 
R
A
 
T
T
 
Q
G
 
G
K
 
R
L
 
V
K
 
E
L
 
A
A
 
L
S
 
A
K
 
D
P
 
E
H
 
K
H
 
A
L
 
L
A
 
D
H
 
R
L
 
A
E
 
Q
K
 
E
T
 
W
A
 
I
E
 
K
A
 
T
I
 
A
R
 
K
R
 
E
E
 
T
V
 
A
D
 
G
T
 
F
D
 
D
I
 
V
E
 
P
L
 
L
I
 
N
D
 
T
R
 
R
S
 
I
R
 
-
I
 
I
R
 
K
S
 
G
E
 
E
I
 
E
Q
 
L
S
 
S
D
 
N
S
 
R
F
 
L
H
 
V
G
 
G
-
 
A
-
 
Q
-
 
T
-
 
P
-
 
W
-
 
T
-
 
V
G
 
A
L
 
A
L
 
F
Q
 
E
R
 
E
H
 
D
G
 
S
G
 
G
Q
 
S
M
 
V
H
 
D
M
 
P
G
 
E
K
 
T
F
 
G
T
 
T
V
 
P
G
 
T
L
 
L
A
 
A
E
 
R
A
 
Y
A
 
A
V
 
K
R
 
Q
R
 
I
G
 
G
A
 
V
K
 
K
L
 
I
Y
 
Y
E
 
T
N
 
H
A
 
C
A
 
A
V
|
V
T
 
R
A
 
G
I
 
I
A
 
E
K
 
T
D
 
A
G
 
G
N
 
G
G
 
K
Y
 
I
R
 
S
-
 
D
I
 
V
T
 
V
T
 
T
A
 
E
R
 
K
G
 
G
E
 
A
V
 
I
R
 
R
A
 
T
K
 
S
Q
 
N
V
 
V
L
 
V
I
 
L
A
 
A
T
x
G
G
|
G

Sites not aligning to the query:

5fjmA Structure of l-amino acid deaminase from proteus myxofaciens (see paper)
24% identity, 52% coverage: 14:235/424 of query aligns to 17:231/447 of 5fjmA

query
sites
5fjmA
L
 
F
L
 
V
S
 
E
A
 
S
S
 
T
E
 
E
G
 
G
P
 
A
L
 
L
D
 
P
G
 
S
Q
 
E
T
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
V
V
 
I
I
|
I
G
|
G
G
 
G
G
|
G
F
x
I
T
x
Q
G
 
G
L
 
I
S
 
M
A
 
T
A
 
A
Q
 
I
A
 
N
L
 
L
G
 
A
K
 
E
R
 
R
G
 
G
A
 
M
A
 
S
V
 
V
T
 
T
V
 
I
L
|
L
D
x
E
A
x
K
G
 
G
R
 
E
I
 
V
G
 
A
G
 
G
G
x
E
A
x
Q
S
|
S
G
 
G
R
 
R
N
x
A
G
x
Y
G
x
S
Q
|
Q
V
 
I
N
 
I
T
 
S
G
 
Y
V
 
Q
A
 
T
Q
 
S
D
 
P
F
 
E
V
 
I
A
 
F
L
 
P
V
 
L
A
 
H
Q
 
H
L
 
Y
G
 
G
V
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
-
S
 
K
A
 
I
C
 
L
Y
 
W
R
 
R
A
 
G
F
 
M
S
 
N
D
 
E
A
 
K
V
 
I
D
 
-
T
 
-
V
 
-
E
 
-
R
 
-
L
 
-
I
 
-
R
 
-
E
 
-
E
 
-
N
 
G
I
 
A
D
 
D
C
 
T
N
 
S
Y
 
Y
I
 
R
A
 
T
T
 
Q
G
 
G
K
 
R
L
 
V
K
 
E
L
 
A
A
 
L
S
 
A
K
 
D
P
 
E
H
 
K
H
 
A
L
 
L
A
 
D
H
 
R
L
 
A
E
 
Q
K
 
E
T
 
W
A
 
I
E
 
K
A
 
T
I
 
A
R
 
K
R
 
E
E
 
T
V
 
A
D
 
G
T
 
F
D
 
D
I
 
V
E
 
P
L
 
L
I
 
N
D
 
T
R
 
R
S
 
I
R
 
-
I
 
I
R
 
K
S
 
G
E
 
E
I
 
E
Q
 
L
S
 
S
D
 
N
S
 
R
F
 
L
H
 
V
G
 
G
-
 
A
-
 
Q
-
 
T
-
 
P
-
 
W
-
 
T
-
 
V
G
 
A
L
 
A
L
 
F
Q
 
E
R
 
E
H
 
D
G
 
S
G
 
G
Q
 
S
M
 
V
H
 
D
M
 
P
G
 
E
K
 
T
F
 
G
T
 
T
V
 
P
G
 
T
L
 
L
A
 
A
E
 
R
A
 
Y
A
 
A
V
 
K
R
 
Q
R
 
I
G
 
G
A
 
V
K
 
K
L
 
I
Y
 
Y
E
 
T
N
 
H
A
 
C
A
 
A
V
|
V
T
 
R
A
 
G
I
 
I
A
 
E
K
 
T
D
 
A
G
 
G
N
 
G
G
 
K
Y
 
I
R
 
S
-
 
D
I
 
V
T
 
V
T
 
T
A
 
E
R
 
K
G
 
G
E
 
A
V
 
I
R
 
R
A
 
T
K
 
S
Q
 
N
V
 
V
L
 
V
I
 
L
A
 
A
T
x
G
G
|
G

Sites not aligning to the query:

P40875 Sarcosine oxidase subunit beta; Sarcosine oxidase subunit B; Sarcosine oxidase (5,10-methylenetetrahydrofolate-forming) subunit beta; Tetrameric sarcosine oxidase subunit beta; TSOX subunit beta; EC 1.5.3.24 from Corynebacterium sp. (strain P-1) (see 3 papers)
22% identity, 71% coverage: 51:350/424 of query aligns to 49:337/405 of P40875

query
sites
P40875
V
 
V
T
 
A
V
 
V
L
 
L
D
 
E
A
 
K
G
 
G
R
 
W
I
 
L
G
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
N
S
 
M
G
 
A
R
 
R
N
 
N
G
 
T
G
 
T
Q
 
I
V
 
I
N
 
R
T
 
S
G
 
N
V
 
Y
A
 
L
Q
 
W
D
 
D
F
 
E
V
 
S
A
 
A
L
 
G
V
 
I
A
 
-
Q
 
-
L
 
-
G
 
-
V
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
-
S
 
-
A
 
-
C
 
-
Y
 
-
R
 
-
A
 
-
F
 
Y
S
 
E
D
 
K
A
 
S
V
 
L
D
 
K
T
 
L
V
 
W
E
 
E
R
 
Q
L
 
L
I
 
P
R
 
E
E
 
E
E
 
L
N
 
D
I
 
Y
D
 
D
C
 
F
N
 
L
Y
 
F
I
 
S
A
 
Q
T
 
R
G
 
G
K
 
V
L
 
L
K
 
N
L
 
L
A
 
A
S
 
H
K
 
T
P
 
-
H
 
-
H
 
-
L
 
-
A
 
-
H
 
-
L
 
L
E
 
G
K
 
D
T
 
V
A
 
R
E
 
E
A
 
S
I
 
V
R
 
R
R
 
R
E
 
V
V
 
E
D
 
A
T
 
N
D
 
K
I
 
F
E
 
N
L
 
G
I
 
V
D
 
D
R
 
A
S
 
E
R
 
W
I
 
L
R
 
T
S
 
P
E
 
E
-
 
Q
-
 
V
-
 
K
-
 
E
-
 
V
-
x
C
-
 
P
-
 
I
-
 
I
-
 
N
I
 
I
Q
 
G
S
 
D
D
 
D
-
 
I
-
 
R
-
 
Y
S
 
P
F
 
V
H
 
M
G
 
G
G
 
A
L
 
T
L
 
Y
Q
 
Q
R
 
P
H
 
R
G
 
A
G
 
G
Q
 
I
M
 
A
H
 
K
M
x
H
G
 
D
K
x
H
F
 
V
T
 
A
V
 
W
G
 
A
L
 
F
A
 
A
E
 
R
A
 
K
A
 
A
V
 
N
R
 
E
R
 
M
G
 
G
A
 
V
K
 
D
L
 
I
Y
 
I
E
 
Q
N
 
N
A
x
C
A
 
E
V
 
V
T
 
T
A
 
G
I
 
F
A
 
L
K
 
K
D
 
D
G
 
G
N
 
E
G
 
K
Y
 
V
R
 
T
-
 
G
I
 
V
T
 
K
T
 
T
A
 
T
R
 
R
G
 
G
E
 
T
V
 
I
R
 
H
A
 
A
K
 
G
Q
 
K
V
 
V
L
 
A
I
 
L
A
 
A
T
 
G
G
 
A
P
 
G
S
 
-
R
 
-
H
 
-
G
 
-
P
 
-
F
 
-
G
 
-
W
 
-
Y
 
H
R
 
S
R
 
S
R
 
V
L
 
L
A
 
A
P
 
E
V
 
L
G
 
A
S
 
G
F
 
F
-
 
E
-
 
L
I
 
P
V
 
I
V
 
Q
T
 
S
E
 
H
P
 
P
L
 
L
S
 
Q
P
 
A
E
 
-
L
 
L
L
 
V
A
 
S
Q
 
E
V
 
L
F
 
F
-
 
E
P
 
P
N
 
V
R
 
H
R
 
P
A
 
T
Y
 
V
T
 
V
T
 
M
T
 
S
R
 
N
L
 
H
M
 
I
H
 
H
N
 
V
Y
 
Y
F
 
V
R
 
S
V
 
Q
T
 
A
P
 
H
D
 
K
S
 
G
R
 
E
L
 
L
L
 
V
F
 
M
G
 
G
G
 
-
R
 
-
A
 
A
R
 
G
F
 
I
T
 
D
A
 
S
S
 
Y
E
 
N
R
 
G
P
 
Y
S
 
G
D
 
Q
A
 
R
K
 
G
S
 
A
G
 
F
R
 
H
I
 
V
L
 
I
Q
 
E
E
 
E
G
 
Q
L
 
M
A
 
A
A
 
A
-
 
A
-
 
V
-
 
E
M
 
L
F
 
F
P
 
P
T
 
I
L
 
F
A
 
A
S
 
R
A
 
A
R
 
H
I
 
V
D
 
L
Y
 
R
C
 
T
W
 
W
G
 
G
G
 
G
L
 
I
V
 
V
D
 
D
M
 
T
S
 
T
A
 
M
D
 
D
R
 
A
L
 
S
P
 
P

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>BPHYT_RS30200 FitnessBrowser__BFirm:BPHYT_RS30200
MKLDSYWLDTAPPLLSASEGPLDGQTDVVVIGGGFTGLSAAQALGKRGAAVTVLDAGRIG
GGASGRNGGQVNTGVAQDFVALVAQLGVERASACYRAFSDAVDTVERLIREENIDCNYIA
TGKLKLASKPHHLAHLEKTAEAIRREVDTDIELIDRSRIRSEIQSDSFHGGLLQRHGGQM
HMGKFTVGLAEAAVRRGAKLYENAAVTAIAKDGNGYRITTARGEVRAKQVLIATGPSRHG
PFGWYRRRLAPVGSFIVVTEPLSPELLAQVFPNRRAYTTTRLMHNYFRVTPDSRLLFGGR
ARFTASERPSDAKSGRILQEGLAAMFPTLASARIDYCWGGLVDMSADRLPHAGQHDGIYF
SMGYSGHGTQMSTHMGQVMADVMDGHEDKNPWRESEWPAIPGHTGKPWFLPLVGTYYRIK
DIFY

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory