SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing BPHYT_RS31750 BPHYT_RS31750 ABC transporter to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1g6hA Crystal structure of the adp conformation of mj1267, an atp-binding cassette of an abc transporter (see paper)
33% identity, 96% coverage: 8:254/258 of query aligns to 5:253/254 of 1g6hA

query
sites
1g6hA
L
 
L
S
 
R
V
 
T
K
 
E
G
 
N
V
 
I
S
 
V
K
 
K
R
 
Y
F
|
F
G
 
G
G
 
E
L
x
F
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
S
 
D
D
 
G
V
 
V
G
 
S
L
 
I
Q
 
S
I
 
V
D
 
N
E
 
K
G
 
G
S
 
D
I
 
V
Y
 
T
G
 
L
L
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
F
 
L
F
 
I
N
 
N
V
 
V
I
 
I
T
 
T
G
 
G
L
 
F
Y
 
L
S
 
K
P
 
A
D
 
D
S
 
E
G
 
G
E
 
R
F
 
V
E
 
Y
L
 
F
D
 
E
N
 
N
K
 
K
P
 
D
Y
 
I
T
 
T
P
 
N
T
 
K
A
 
E
V
 
P
H
 
A
K
 
E
V
 
L
A
 
Y
K
 
H
T
 
Y
G
 
G
I
 
I
A
 
V
R
 
R
T
 
T
F
 
F
Q
 
Q
N
 
T
I
 
P
R
 
Q
L
 
P
F
 
L
G
 
K
G
 
E
M
 
M
T
 
T
A
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
L
M
 
L
V
 
I
G
 
G
Q
 
E
H
 
I
V
 
C
R
 
P
T
 
G
K
 
E
Q
 
S
G
 
P
L
 
L
I
 
N
G
 
S
A
 
L
V
 
F
L
 
Y
Q
 
K
T
 
K
L
 
W
S
 
I
E
 
P
R
 
K
R
 
E
E
 
E
E
 
E
R
 
M
A
 
V
I
 
-
R
 
-
E
 
E
R
 
K
A
 
A
I
 
F
E
 
K
L
 
I
L
 
L
D
 
E
Y
 
F
V
 
L
G
 
K
I
 
L
A
 
S
Q
 
H
Y
 
L
A
 
Y
D
 
D
Y
 
R
T
 
K
A
 
A
R
 
G
N
 
E
L
 
L
S
 
S
Y
 
G
G
 
G
H
 
Q
Q
 
M
R
 
K
R
 
L
L
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
M
T
 
T
D
 
N
P
 
P
K
 
K
L
 
M
L
 
I
A
 
V
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
I
A
 
A
G
 
G
M
 
V
N
 
A
A
 
P
T
 
G
E
 
L
K
 
A
L
 
H
E
 
D
L
 
I
T
 
F
G
 
N
L
 
H
L
 
V
K
 
L
Q
 
E
I
 
L
R
 
K
A
 
A
D
 
K
G
 
G
R
 
I
T
 
T
I
 
F
L
 
L
L
 
I
I
 
I
E
 
E
H
 
H
D
 
R
V
 
L
K
 
D
L
 
I
M
 
V
M
 
L
G
 
N
V
 
Y
C
 
I
N
 
D
G
 
H
M
 
L
T
 
Y
V
 
V
L
 
M
D
 
F
Y
 
N
G
 
G
K
 
Q
V
 
I
I
 
I
A
 
A
E
 
E
G
 
G
L
 
R
-
 
G
-
 
E
-
 
E
-
 
E
P
 
I
R
 
K
D
 
N
V
 
V
Q
 
L
R
 
S
D
 
D
P
 
P
K
 
K
V
 
V
I
 
V
E
 
E
A
 
I
Y
 
Y
L
 
I
G
 
G

1g9xB Characterization of the twinning structure of mj1267, an atp-binding cassette of an abc transporter (see paper)
33% identity, 96% coverage: 8:254/258 of query aligns to 5:253/253 of 1g9xB

query
sites
1g9xB
L
 
L
S
 
R
V
 
T
K
 
E
G
 
N
V
 
I
S
 
V
K
 
K
R
 
Y
F
|
F
G
 
G
G
 
E
L
x
F
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
S
 
D
D
 
G
V
 
V
G
 
S
L
 
I
Q
 
S
I
 
V
D
 
C
E
 
K
G
 
G
S
 
D
I
 
V
Y
 
T
G
 
L
L
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
F
 
L
F
 
I
N
 
N
V
 
V
I
 
I
T
 
T
G
 
G
L
 
F
Y
 
L
S
 
K
P
 
A
D
 
D
S
 
E
G
 
G
E
 
R
F
 
V
E
 
Y
L
 
F
D
 
E
N
 
N
K
 
K
P
 
D
Y
 
I
T
 
T
P
 
N
T
 
K
A
 
E
V
 
P
H
 
A
K
 
E
V
 
L
A
 
Y
K
 
H
T
 
Y
G
 
G
I
 
I
A
 
V
R
 
R
T
 
T
F
 
F
Q
 
Q
N
 
T
I
 
P
R
 
Q
L
 
P
F
 
L
G
 
K
G
 
E
M
 
M
T
 
T
A
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
L
M
 
L
V
 
I
G
 
G
Q
 
E
H
 
-
V
 
I
R
 
N
T
 
P
K
 
G
Q
 
E
G
 
S
L
 
P
I
 
L
G
 
N
A
 
S
V
 
L
L
 
F
Q
 
Y
T
 
K
L
 
K
S
 
W
E
 
I
R
 
P
R
 
K
E
 
E
E
 
E
R
 
E
A
 
M
I
 
V
R
 
-
E
 
E
R
 
K
A
 
A
I
 
F
E
 
K
L
 
I
L
 
L
D
 
E
Y
 
F
V
 
L
G
 
K
I
 
L
A
 
S
Q
 
H
Y
 
L
A
 
Y
D
 
D
Y
 
R
T
 
K
A
 
A
R
 
G
N
 
E
L
 
L
S
 
S
Y
 
G
G
 
G
H
 
Q
Q
 
M
R
 
K
R
 
L
L
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
M
T
 
T
D
 
N
P
 
P
K
 
K
L
 
M
L
 
I
A
 
V
L
 
M
D
 
D
E
|
E
P
 
P
A
 
I
A
 
A
G
 
G
M
 
V
N
 
A
A
 
P
T
 
G
E
 
L
K
 
A
L
 
H
E
 
D
L
 
I
T
 
F
G
 
N
L
 
H
L
 
V
K
 
L
Q
 
E
I
 
L
R
 
K
A
 
A
D
 
K
G
 
G
R
 
I
T
 
T
I
 
F
L
 
L
L
 
I
I
 
I
E
 
E
H
 
H
D
 
R
V
 
L
K
 
D
L
 
I
M
 
V
M
 
L
G
 
N
V
 
Y
C
 
I
N
 
D
G
 
H
M
 
L
T
 
Y
V
 
V
L
 
M
D
 
F
Y
 
N
G
 
G
K
 
Q
V
 
I
I
 
I
A
 
A
E
 
E
G
 
G
L
 
R
-
 
G
-
 
E
-
 
E
-
 
E
P
 
I
R
 
K
D
 
N
V
 
V
Q
 
L
R
 
S
D
 
D
P
 
P
K
 
K
V
 
V
I
 
V
E
 
E
A
 
I
Y
 
Y
L
 
I
G
 
G

6mjpA Lptb(e163q)fgc from vibrio cholerae (see paper)
33% identity, 96% coverage: 8:254/258 of query aligns to 3:235/240 of 6mjpA

query
sites
6mjpA
L
 
L
S
 
K
V
 
A
K
 
Q
G
 
H
V
 
L
S
 
A
K
 
K
R
 
S
F
 
Y
G
 
K
G
 
K
L
 
R
Q
 
K
A
 
V
L
 
V
S
 
S
D
 
D
V
 
V
G
 
S
L
 
L
Q
 
Q
I
 
V
D
 
E
E
 
S
G
 
G
S
 
Q
I
 
I
Y
 
V
G
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
T
F
 
S
F
 
F
N
 
Y
V
 
M
I
 
I
T
 
V
G
 
G
L
 
L
Y
 
V
S
 
A
P
 
R
D
 
D
S
 
E
G
 
G
E
 
T
F
 
I
E
 
T
L
 
I
D
 
D
N
 
D
K
 
N
P
 
D
Y
 
I
T
 
S
P
 
I
T
 
L
A
 
P
V
 
M
H
 
H
K
 
S
V
 
R
A
 
S
K
 
R
T
 
M
G
 
G
I
 
I
A
 
G
R
 
Y
T
 
L
F
 
P
Q
 
Q
N
 
E
I
 
A
R
 
S
L
 
I
F
 
F
G
 
R
G
 
K
M
 
L
T
 
S
A
 
V
L
 
E
E
 
D
N
 
N
V
 
I
M
 
M
V
 
-
G
 
-
Q
 
-
H
 
-
V
 
-
R
 
-
T
 
-
K
 
-
Q
 
-
G
 
-
L
 
-
I
 
-
G
 
-
A
 
A
V
 
V
L
 
L
Q
 
Q
T
 
T
L
 
R
S
 
E
E
 
E
-
 
L
R
 
T
R
 
H
E
|
E
E
 
E
R
 
R
A
 
-
I
 
-
R
 
Q
E
x
D
R
 
K
A
 
L
I
 
E
E
 
D
L
 
L
L
 
L
D
 
E
Y
 
E
V
 
F
G
 
H
I
 
I
A
 
Q
Q
 
H
Y
 
I
A
 
R
D
 
K
Y
 
S
T
 
A
A
 
G
R
 
M
N
 
A
L
 
L
S
 
S
Y
 
G
G
 
G
H
 
E
Q
 
R
R
 
R
R
 
R
L
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
A
D
 
N
P
 
P
K
 
Q
L
 
F
L
 
I
A
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
A
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
V
N
 
D
A
 
P
T
 
I
E
 
S
K
 
V
L
 
I
E
 
D
L
 
I
T
 
K
G
 
K
L
 
I
L
 
I
K
 
E
Q
 
H
I
 
L
R
 
R
A
 
D
D
 
R
G
 
G
R
 
L
T
 
G
I
 
V
L
 
L
L
 
I
I
 
T
E
 
D
H
 
H
D
 
N
V
 
V
K
 
R
L
 
E
M
 
T
M
 
L
G
 
D
V
 
V
C
 
C
N
 
E
G
 
K
M
 
A
T
 
Y
V
 
I
L
 
V
D
 
S
Y
 
Q
G
 
G
K
 
R
V
 
L
I
 
I
A
 
A
E
 
E
G
 
G
L
 
T
P
 
P
R
 
Q
D
 
D
V
 
V
Q
 
L
R
 
N
D
 
N
P
 
E
K
 
Q
V
 
V
I
 
K
E
 
Q
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G

6mhzA Vanadate trapped cryo-em structure of e.Coli lptb2fg transporter (see paper)
32% identity, 96% coverage: 8:254/258 of query aligns to 3:235/235 of 6mhzA

query
sites
6mhzA
L
 
L
S
 
T
V
 
A
K
 
K
G
 
N
V
 
L
S
 
A
K
 
K
R
 
A
F
x
Y
G
 
K
G
 
G
L
 
R
Q
 
R
A
 
V
L
 
V
S
 
E
D
 
D
V
 
V
G
 
S
L
 
L
Q
 
T
I
 
V
D
 
N
E
 
S
G
 
G
S
 
E
I
 
I
Y
 
V
G
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
F
 
T
F
 
F
N
 
Y
V
 
M
I
 
V
T
 
V
G
 
G
L
 
I
Y
 
V
S
 
P
P
 
R
D
 
D
S
 
A
G
 
G
E
 
N
F
 
I
E
 
I
L
 
I
D
 
D
N
 
D
K
 
D
P
 
D
Y
 
I
T
 
S
P
 
L
T
 
L
A
 
P
V
 
L
H
 
H
K
 
A
V
 
R
A
 
A
K
 
R
T
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
G
R
 
Y
T
 
L
F
 
P
Q
|
Q
N
 
E
I
 
A
R
 
S
L
 
I
F
 
F
G
 
R
G
 
R
M
 
L
T
 
S
A
 
V
L
 
Y
E
 
D
N
 
N
V
 
L
M
 
M
V
 
A
G
 
V
Q
 
L
H
 
Q
V
 
I
R
 
R
T
 
D
K
 
D
Q
 
L
G
 
S
L
 
-
I
 
-
G
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
-
Q
 
-
T
 
-
L
 
-
S
 
A
E
 
E
R
 
Q
R
 
R
E
 
E
E
 
D
R
 
R
A
 
A
I
 
N
R
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
-
I
 
-
E
 
E
L
 
L
L
 
M
D
 
E
Y
 
E
V
 
F
G
 
H
I
 
I
A
 
E
Q
 
H
Y
 
L
A
 
R
D
 
D
Y
 
S
T
 
M
A
 
G
R
 
Q
N
x
S
L
 
L
S
|
S
Y
x
G
G
|
G
H
 
E
Q
 
R
R
 
R
R
 
R
L
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
A
D
 
N
P
 
P
K
 
K
L
 
F
L
 
I
A
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
A
 
F
A
 
A
G
|
G
M
 
V
N
 
D
A
 
P
T
 
I
E
 
S
K
 
V
L
 
I
E
 
D
L
 
I
T
 
K
G
 
R
L
 
I
L
 
I
K
 
E
Q
 
H
I
 
L
R
 
R
A
 
D
D
 
S
G
 
G
R
 
L
T
 
G
I
 
V
L
 
L
L
 
I
I
 
T
E
 
D
H
|
H
D
 
N
V
 
V
K
 
R
L
 
E
M
 
T
M
 
L
G
 
A
V
 
V
C
 
C
N
 
E
G
 
R
M
 
A
T
 
Y
V
 
I
L
 
V
D
 
S
Y
 
Q
G
 
G
K
 
H
V
 
L
I
 
I
A
 
A
E
 
H
G
 
G
L
 
T
P
 
P
R
 
T
D
 
E
V
 
I
Q
 
L
R
 
Q
D
 
D
P
 
E
K
 
H
V
 
V
I
 
K
E
 
R
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G

6s8nB Cryo-em structure of lptb2fgc in complex with lipopolysaccharide (see paper)
32% identity, 96% coverage: 8:254/258 of query aligns to 3:235/238 of 6s8nB

query
sites
6s8nB
L
 
L
S
 
T
V
 
A
K
 
K
G
 
N
V
 
L
S
 
A
K
 
K
R
 
A
F
 
Y
G
 
K
G
 
G
L
 
R
Q
 
R
A
 
V
L
 
V
S
 
E
D
 
D
V
 
V
G
 
S
L
 
L
Q
 
T
I
 
V
D
 
N
E
 
S
G
 
G
S
 
E
I
 
I
Y
 
V
G
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
T
F
 
T
F
 
F
N
 
Y
V
 
M
I
 
V
T
 
V
G
 
G
L
 
I
Y
 
V
S
 
P
P
 
R
D
 
D
S
 
A
G
 
G
E
 
N
F
 
I
E
 
I
L
 
I
D
 
D
N
 
D
K
 
D
P
 
D
Y
 
I
T
 
S
P
 
L
T
 
L
A
 
P
V
 
L
H
 
H
K
 
A
V
 
R
A
 
A
K
 
R
T
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
G
R
 
Y
T
 
L
F
 
P
Q
 
Q
N
 
E
I
 
A
R
 
S
L
 
I
F
 
F
G
x
R
G
 
R
M
 
L
T
 
S
A
 
V
L
 
Y
E
 
D
N
 
N
V
 
L
M
 
M
V
 
A
G
 
V
Q
 
L
H
 
Q
V
 
I
R
 
R
T
 
D
K
 
D
Q
 
L
G
 
S
L
 
-
I
 
-
G
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
-
Q
 
-
T
 
-
L
 
-
S
 
A
E
 
E
R
 
Q
R
 
R
E
 
E
E
 
D
R
 
R
A
 
A
I
 
N
R
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
-
I
 
-
E
 
E
L
 
L
L
 
M
D
 
E
Y
 
E
V
 
F
G
 
H
I
 
I
A
 
E
Q
 
H
Y
 
L
A
 
R
D
 
D
Y
 
S
T
x
M
A
x
G
R
x
Q
N
 
S
L
 
L
S
 
S
Y
 
G
G
 
G
H
 
E
Q
 
R
R
 
R
R
 
R
L
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
A
D
 
N
P
 
P
K
 
K
L
 
F
L
 
I
A
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
V
N
 
D
A
 
P
T
 
I
E
 
S
K
 
V
L
 
I
E
 
D
L
 
I
T
 
K
G
 
R
L
 
I
L
 
I
K
 
E
Q
 
H
I
 
L
R
 
R
A
 
D
D
 
S
G
 
G
R
 
L
T
 
G
I
 
V
L
 
L
L
 
I
I
 
T
E
 
D
H
 
H
D
 
N
V
 
V
K
 
R
L
 
E
M
 
T
M
 
L
G
 
A
V
 
V
C
 
C
N
 
E
G
 
R
M
 
A
T
 
Y
V
 
I
L
 
V
D
 
S
Y
 
Q
G
 
G
K
 
H
V
 
L
I
 
I
A
 
A
E
 
H
G
 
G
L
 
T
P
 
P
R
 
T
D
 
E
V
 
I
Q
 
L
R
 
Q
D
 
D
P
 
E
K
 
H
V
 
V
I
 
K
E
 
R
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G

6s8gA Cryo-em structure of lptb2fgc in complex with amp-pnp (see paper)
32% identity, 96% coverage: 8:254/258 of query aligns to 3:235/238 of 6s8gA

query
sites
6s8gA
L
 
L
S
 
T
V
 
A
K
 
K
G
 
N
V
 
L
S
 
A
K
 
K
R
 
A
F
x
Y
G
 
K
G
 
G
L
x
R
Q
 
R
A
 
V
L
 
V
S
 
E
D
 
D
V
 
V
G
 
S
L
 
L
Q
 
T
I
 
V
D
 
N
E
 
S
G
 
G
S
 
E
I
 
I
Y
 
V
G
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
 
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
F
 
T
F
 
F
N
 
Y
V
 
M
I
 
V
T
 
V
G
 
G
L
 
I
Y
 
V
S
 
P
P
 
R
D
 
D
S
 
A
G
 
G
E
 
N
F
 
I
E
 
I
L
 
I
D
 
D
N
 
D
K
 
D
P
 
D
Y
 
I
T
 
S
P
 
L
T
 
L
A
 
P
V
 
L
H
 
H
K
 
A
V
 
R
A
 
A
K
 
R
T
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
G
R
 
Y
T
 
L
F
 
P
Q
|
Q
N
 
E
I
 
A
R
 
S
L
 
I
F
 
F
G
 
R
G
 
R
M
 
L
T
 
S
A
 
V
L
 
Y
E
 
D
N
 
N
V
 
L
M
 
M
V
 
A
G
 
V
Q
 
L
H
 
Q
V
 
I
R
 
R
T
 
D
K
 
D
Q
 
L
G
 
S
L
 
-
I
 
-
G
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
-
Q
 
-
T
 
-
L
 
-
S
 
A
E
 
E
R
 
Q
R
 
R
E
 
E
E
 
D
R
 
R
A
 
A
I
 
N
R
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
-
I
 
-
E
 
E
L
 
L
L
 
M
D
 
E
Y
 
E
V
 
F
G
 
H
I
 
I
A
 
E
Q
 
H
Y
 
L
A
 
R
D
 
D
Y
 
S
T
 
M
A
 
G
R
 
Q
N
x
S
L
 
L
S
|
S
Y
 
G
G
 
G
H
x
E
Q
 
R
R
 
R
R
 
R
L
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
A
D
 
N
P
 
P
K
 
K
L
 
F
L
 
I
A
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
V
N
 
D
A
 
P
T
 
I
E
 
S
K
 
V
L
 
I
E
 
D
L
 
I
T
 
K
G
 
R
L
 
I
L
 
I
K
 
E
Q
 
H
I
 
L
R
 
R
A
 
D
D
 
S
G
 
G
R
 
L
T
 
G
I
 
V
L
 
L
L
 
I
I
 
T
E
 
D
H
 
H
D
 
N
V
 
V
K
 
R
L
 
E
M
 
T
M
 
L
G
 
A
V
 
V
C
 
C
N
 
E
G
 
R
M
 
A
T
 
Y
V
 
I
L
 
V
D
 
S
Y
 
Q
G
 
G
K
 
H
V
 
L
I
 
I
A
 
A
E
 
H
G
 
G
L
 
T
P
 
P
R
 
T
D
 
E
V
 
I
Q
 
L
R
 
Q
D
 
D
P
 
E
K
 
H
V
 
V
I
 
K
E
 
R
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G

6mbnA Lptb e163q in complex with atp (see paper)
32% identity, 97% coverage: 5:254/258 of query aligns to 1:236/241 of 6mbnA

query
sites
6mbnA
S
 
S
I
 
A
R
 
T
L
 
L
S
 
T
V
 
A
K
 
K
G
 
N
V
 
L
S
 
A
K
 
K
R
 
A
F
x
Y
G
 
K
G
 
G
L
x
R
Q
 
R
A
x
V
L
 
V
S
 
E
D
 
D
V
 
V
G
 
S
L
 
L
Q
 
T
I
 
V
D
 
N
E
 
S
G
 
G
S
 
E
I
 
I
Y
 
V
G
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
F
 
T
F
 
F
N
 
Y
V
 
M
I
 
V
T
 
V
G
 
G
L
 
I
Y
 
V
S
 
P
P
 
R
D
 
D
S
 
A
G
 
G
E
 
N
F
 
I
E
 
I
L
 
I
D
 
D
N
 
D
K
 
D
P
 
D
Y
 
I
T
 
S
P
 
L
T
 
L
A
 
P
V
 
L
H
 
H
K
 
A
V
 
R
A
 
A
K
 
R
T
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
G
R
 
Y
T
 
L
F
 
P
Q
 
Q
N
 
E
I
 
A
R
 
S
L
 
I
F
 
F
G
 
R
G
 
R
M
 
L
T
 
S
A
 
V
L
 
Y
E
 
D
N
 
N
V
 
L
M
 
M
V
 
A
G
 
V
Q
 
L
H
 
Q
V
 
I
R
 
R
T
 
D
K
 
D
Q
 
L
G
 
S
L
 
-
I
 
-
G
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
-
Q
 
-
T
 
-
L
 
-
S
 
A
E
 
E
R
 
Q
R
 
R
E
 
E
E
 
D
R
 
R
A
 
A
I
 
N
R
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
-
I
 
-
E
 
E
L
 
L
L
 
M
D
 
E
Y
 
E
V
 
F
G
 
H
I
 
I
A
 
E
Q
 
H
Y
 
L
A
 
R
D
 
D
Y
 
S
T
 
M
A
 
G
R
 
Q
N
 
S
L
 
L
S
 
S
Y
 
G
G
 
G
H
 
E
Q
 
R
R
 
R
R
 
R
L
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
A
D
 
N
P
 
P
K
 
K
L
 
F
L
 
I
A
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
A
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
V
N
 
D
A
 
P
T
 
I
E
 
S
K
 
V
L
 
I
E
 
D
L
 
I
T
 
K
G
 
R
L
 
I
L
 
I
K
 
E
Q
 
H
I
 
L
R
 
R
A
 
D
D
 
S
G
 
G
R
 
L
T
 
G
I
 
V
L
 
L
L
 
I
I
 
T
E
 
D
H
|
H
D
 
N
V
 
V
K
 
R
L
 
E
M
 
T
M
 
L
G
 
A
V
 
V
C
 
C
N
 
E
G
 
R
M
 
A
T
 
Y
V
 
I
L
 
V
D
 
S
Y
 
Q
G
 
G
K
 
H
V
 
L
I
 
I
A
 
A
E
 
H
G
 
G
L
 
T
P
 
P
R
 
T
D
 
E
V
 
I
Q
 
L
R
 
Q
D
 
D
P
 
E
K
 
H
V
 
V
I
 
K
E
 
R
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G

6b89A E. Coli lptb in complex with adp and novobiocin (see paper)
32% identity, 95% coverage: 8:253/258 of query aligns to 3:234/234 of 6b89A

query
sites
6b89A
L
 
L
S
 
T
V
 
A
K
 
K
G
 
N
V
 
L
S
 
A
K
 
K
R
 
A
F
x
Y
G
 
K
G
 
G
L
x
R
Q
 
R
A
x
V
L
 
V
S
 
E
D
 
D
V
 
V
G
 
S
L
 
L
Q
 
T
I
 
V
D
 
N
E
 
S
G
 
G
S
 
E
I
 
I
Y
 
V
G
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
F
 
T
F
 
F
N
 
Y
V
 
M
I
 
V
T
 
V
G
 
G
L
 
I
Y
 
V
S
 
P
P
 
R
D
 
D
S
 
A
G
 
G
E
 
N
F
 
I
E
 
I
L
 
I
D
 
D
N
 
D
K
 
D
P
 
D
Y
 
I
T
 
S
P
 
L
T
 
L
A
 
P
V
x
L
H
|
H
K
 
A
V
 
R
A
 
A
K
 
R
T
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
G
R
 
Y
T
 
L
F
x
P
Q
|
Q
N
 
E
I
x
A
R
x
S
L
 
I
F
|
F
G
x
R
G
x
R
M
x
L
T
 
S
A
 
V
L
 
Y
E
 
D
N
 
N
V
 
L
M
 
M
V
 
A
G
x
V
Q
 
L
H
 
Q
V
 
I
R
 
R
T
 
D
K
 
D
Q
 
L
G
 
S
L
 
-
I
 
-
G
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
-
Q
 
-
T
 
-
L
 
-
S
 
A
E
 
E
R
 
Q
R
 
R
E
 
E
E
 
D
R
 
R
A
 
A
I
 
N
R
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
-
I
 
-
E
 
E
L
 
L
L
 
M
D
 
E
Y
 
E
V
 
F
G
 
H
I
 
I
A
 
E
Q
 
H
Y
 
L
A
 
R
D
 
D
Y
 
S
T
 
M
A
 
G
R
x
Q
N
 
S
L
 
L
S
 
S
Y
 
G
G
 
G
H
 
E
Q
 
R
R
 
R
R
 
R
L
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
|
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
A
D
 
N
P
 
P
K
 
K
L
 
F
L
 
I
A
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
V
N
 
D
A
 
P
T
 
I
E
 
S
K
 
V
L
 
I
E
 
D
L
 
I
T
 
K
G
 
R
L
 
I
L
 
I
K
 
E
Q
 
H
I
 
L
R
 
R
A
 
D
D
 
S
G
 
G
R
 
L
T
 
G
I
 
V
L
 
L
L
 
I
I
 
T
E
 
D
H
 
H
D
 
N
V
 
V
K
 
R
L
 
E
M
 
T
M
 
L
G
 
A
V
 
V
C
 
C
N
 
E
G
 
R
M
 
A
T
 
Y
V
 
I
L
 
V
D
 
S
Y
 
Q
G
 
G
K
 
H
V
 
L
I
 
I
A
 
A
E
 
H
G
 
G
L
 
T
P
 
P
R
 
T
D
 
E
V
 
I
Q
 
L
R
 
Q
D
 
D
P
 
E
K
 
H
V
 
V
I
 
K
E
 
R
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L

4p31A Crystal structure of a selenomethionine derivative of e. Coli lptb in complex with adp-magensium (see paper)
32% identity, 95% coverage: 8:253/258 of query aligns to 3:234/234 of 4p31A

query
sites
4p31A
L
 
L
S
 
T
V
 
A
K
 
K
G
 
N
V
 
L
S
 
A
K
 
K
R
 
A
F
x
Y
G
 
K
G
 
G
L
x
R
Q
 
R
A
x
V
L
 
V
S
 
E
D
 
D
V
 
V
G
 
S
L
 
L
Q
 
T
I
 
V
D
 
N
E
 
S
G
 
G
S
 
E
I
 
I
Y
 
V
G
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
F
 
T
F
 
F
N
 
Y
V
 
M
I
 
V
T
 
V
G
 
G
L
 
I
Y
 
V
S
 
P
P
 
R
D
 
D
S
 
A
G
 
G
E
 
N
F
 
I
E
 
I
L
 
I
D
 
D
N
 
D
K
 
D
P
 
D
Y
 
I
T
 
S
P
 
L
T
 
L
A
 
P
V
 
L
H
 
H
K
 
A
V
 
R
A
 
A
K
 
R
T
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
G
R
 
Y
T
 
L
F
 
P
Q
|
Q
N
 
E
I
 
A
R
 
S
L
 
I
F
 
F
G
 
R
G
 
R
M
 
L
T
 
S
A
 
V
L
 
Y
E
 
D
N
 
N
V
 
L
M
 
M
V
 
A
G
 
V
Q
 
L
H
 
Q
V
 
I
R
 
R
T
 
D
K
 
D
Q
 
L
G
 
S
L
 
-
I
 
-
G
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
-
Q
 
-
T
 
-
L
 
-
S
 
A
E
 
E
R
 
Q
R
 
R
E
 
E
E
 
D
R
 
R
A
 
A
I
 
N
R
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
-
I
 
-
E
 
E
L
 
L
L
 
M
D
 
E
Y
 
E
V
 
F
G
 
H
I
 
I
A
 
E
Q
 
H
Y
 
L
A
 
R
D
 
D
Y
 
S
T
 
M
A
 
G
R
 
Q
N
 
S
L
 
L
S
 
S
Y
 
G
G
 
G
H
 
E
Q
 
R
R
 
R
R
 
R
L
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
A
D
 
N
P
 
P
K
 
K
L
 
F
L
 
I
A
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
V
N
 
D
A
 
P
T
 
I
E
 
S
K
 
V
L
 
I
E
 
D
L
 
I
T
 
K
G
 
R
L
 
I
L
 
I
K
 
E
Q
 
H
I
 
L
R
 
R
A
 
D
D
 
S
G
 
G
R
 
L
T
 
G
I
 
V
L
 
L
L
 
I
I
 
T
E
 
D
H
 
H
D
 
N
V
 
V
K
 
R
L
 
E
M
 
T
M
 
L
G
 
A
V
 
V
C
 
C
N
 
E
G
 
R
M
 
A
T
 
Y
V
 
I
L
 
V
D
 
S
Y
 
Q
G
 
G
K
 
H
V
 
L
I
 
I
A
 
A
E
 
H
G
 
G
L
 
T
P
 
P
R
 
T
D
 
E
V
 
I
Q
 
L
R
 
Q
D
 
D
P
 
E
K
 
H
V
 
V
I
 
K
E
 
R
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L

6b8bA E. Coli lptb in complex with adp and a novobiocin derivative (see paper)
32% identity, 95% coverage: 8:252/258 of query aligns to 3:233/233 of 6b8bA

query
sites
6b8bA
L
 
L
S
 
T
V
 
A
K
 
K
G
 
N
V
 
L
S
 
A
K
 
K
R
 
A
F
x
Y
G
 
K
G
 
G
L
x
R
Q
 
R
A
x
V
L
 
V
S
 
E
D
 
D
V
 
V
G
 
S
L
 
L
Q
 
T
I
 
V
D
 
N
E
 
S
G
 
G
S
 
E
I
 
I
Y
 
V
G
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
F
 
T
F
 
F
N
 
Y
V
 
M
I
 
V
T
 
V
G
 
G
L
 
I
Y
 
V
S
 
P
P
 
R
D
 
D
S
 
A
G
 
G
E
 
N
F
 
I
E
 
I
L
 
I
D
 
D
N
 
D
K
 
D
P
 
D
Y
 
I
T
 
S
P
 
L
T
 
L
A
 
P
V
 
L
H
 
H
K
 
A
V
 
R
A
 
A
K
 
R
T
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
G
R
 
Y
T
 
L
F
 
P
Q
 
Q
N
 
E
I
 
A
R
 
S
L
 
I
F
|
F
G
x
R
G
x
R
M
 
L
T
 
S
A
 
V
L
 
Y
E
 
D
N
 
N
V
 
L
M
 
M
V
 
A
G
 
V
Q
 
L
H
 
Q
V
 
I
R
 
R
T
 
D
K
 
D
Q
 
L
G
 
S
L
 
-
I
 
-
G
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
-
Q
 
-
T
 
-
L
 
-
S
 
A
E
 
E
R
 
Q
R
 
R
E
 
E
E
 
D
R
 
R
A
 
A
I
 
N
R
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
-
I
 
-
E
 
E
L
 
L
L
 
M
D
 
E
Y
 
E
V
 
F
G
 
H
I
 
I
A
 
E
Q
 
H
Y
 
L
A
 
R
D
 
D
Y
 
S
T
 
M
A
 
G
R
 
Q
N
 
S
L
 
L
S
 
S
Y
 
G
G
 
G
H
 
E
Q
 
R
R
 
R
R
 
R
L
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
A
D
 
N
P
 
P
K
 
K
L
 
F
L
 
I
A
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
V
N
 
D
A
 
P
T
 
I
E
 
S
K
 
V
L
 
I
E
 
D
L
 
I
T
 
K
G
 
R
L
 
I
L
 
I
K
 
E
Q
 
H
I
 
L
R
 
R
A
 
D
D
 
S
G
 
G
R
 
L
T
 
G
I
 
V
L
 
L
L
 
I
I
 
T
E
 
D
H
 
H
D
 
N
V
 
V
K
 
R
L
 
E
M
 
T
M
 
L
G
 
A
V
 
V
C
 
C
N
 
E
G
 
R
M
 
A
T
 
Y
V
 
I
L
 
V
D
 
S
Y
 
Q
G
 
G
K
 
H
V
 
L
I
 
I
A
 
A
E
 
H
G
 
G
L
 
T
P
 
P
R
 
T
D
 
E
V
 
I
Q
 
L
R
 
Q
D
 
D
P
 
E
K
 
H
V
 
V
I
 
K
E
 
R
A
 
V
Y
 
Y

1oxvD Crystal structure of glcv, the abc-atpase of the glucose abc transporter from sulfolobus solfataricus (see paper)
33% identity, 95% coverage: 6:251/258 of query aligns to 2:237/353 of 1oxvD

query
sites
1oxvD
I
 
V
R
 
R
L
 
I
S
 
I
V
 
V
K
 
K
G
 
N
V
 
V
S
 
S
K
 
K
R
 
V
F
|
F
-
 
K
-
 
K
G
 
G
G
 
K
L
 
V
Q
 
V
A
 
A
L
 
L
S
 
D
D
 
N
V
 
V
G
 
N
L
 
I
Q
 
N
I
 
I
D
 
E
E
 
N
G
 
G
S
 
E
I
 
R
Y
 
F
G
 
G
L
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
F
 
F
F
 
M
N
 
R
V
 
I
I
 
I
T
 
A
G
 
G
L
 
L
Y
 
D
S
 
V
P
 
P
D
 
S
S
 
T
G
 
G
E
 
E
F
 
L
E
 
Y
L
 
F
D
 
D
N
 
D
K
 
R
P
 
L
Y
 
V
T
 
A
P
 
S
T
 
N
A
 
G
V
 
K
H
 
L
K
 
I
V
 
V
A
 
P
K
 
P
T
 
E
G
 
D
-
 
R
-
 
K
I
 
I
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
|
Q
N
 
T
I
 
W
R
 
A
L
 
L
F
 
Y
G
 
P
G
 
N
M
 
L
T
 
T
A
 
A
L
 
F
E
 
E
N
 
N
V
 
-
M
 
-
V
 
-
G
 
-
Q
 
-
H
 
-
V
 
-
R
 
-
T
 
-
K
 
-
Q
 
-
G
 
-
L
 
-
I
 
I
G
 
A
A
 
F
V
 
P
L
 
L
Q
 
T
T
 
N
L
 
M
S
 
K
E
 
M
R
 
S
R
 
K
E
 
E
E
 
E
R
 
-
A
 
-
I
 
I
R
 
R
E
 
K
R
 
R
A
 
V
I
 
E
E
 
E
L
 
V
L
 
A
D
 
K
Y
 
I
V
 
L
G
 
D
I
 
I
A
 
H
Q
 
H
Y
 
V
A
 
L
D
 
N
Y
 
H
T
 
F
A
 
P
R
 
R
N
 
E
L
 
L
S
 
S
Y
 
G
G
 
G
H
 
Q
Q
 
Q
R
 
Q
R
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
V
T
 
K
D
 
D
P
 
P
K
 
S
L
 
L
L
 
L
A
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
A
 
F
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
A
 
A
T
 
R
E
 
M
K
 
R
L
 
D
E
 
S
L
 
A
T
 
R
G
 
A
L
 
L
L
 
V
K
 
K
Q
 
E
I
 
V
R
 
Q
A
 
S
D
 
R
-
 
L
G
 
G
R
 
V
T
 
T
I
 
L
L
 
L
L
 
V
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
V
 
P
K
 
A
L
 
D
M
 
I
M
 
F
G
 
A
V
 
I
C
 
A
N
 
D
G
 
R
M
 
V
T
 
G
V
 
V
L
 
L
D
 
V
Y
 
K
G
 
G
K
 
K
V
 
L
I
 
V
A
 
Q
E
 
V
G
 
G
L
 
K
P
 
P
R
 
E
D
 
D
V
 
L
Q
 
Y
R
 
D
D
 
N
P
 
P
K
 
V
V
 
S
I
 
I
E
 
Q
A
 
V

1oxvA Crystal structure of glcv, the abc-atpase of the glucose abc transporter from sulfolobus solfataricus (see paper)
33% identity, 95% coverage: 6:251/258 of query aligns to 2:237/353 of 1oxvA

query
sites
1oxvA
I
 
V
R
 
R
L
 
I
S
 
I
V
 
V
K
 
K
G
 
N
V
 
V
S
 
S
K
 
K
R
 
V
F
|
F
-
 
K
-
 
K
G
 
G
G
 
K
L
 
V
Q
 
V
A
 
A
L
 
L
S
 
D
D
 
N
V
 
V
G
 
N
L
 
I
Q
 
N
I
 
I
D
 
E
E
 
N
G
 
G
S
 
E
I
 
R
Y
 
F
G
 
G
L
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
F
 
F
F
 
M
N
 
R
V
 
I
I
 
I
T
 
A
G
 
G
L
 
L
Y
 
D
S
 
V
P
 
P
D
 
S
S
 
T
G
 
G
E
 
E
F
 
L
E
 
Y
L
 
F
D
 
D
N
 
D
K
 
R
P
 
L
Y
 
V
T
 
A
P
 
S
T
 
N
A
 
G
V
 
K
H
 
L
K
 
I
V
 
V
A
 
P
K
 
P
T
 
E
G
 
D
-
 
R
-
 
K
I
 
I
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
T
I
 
W
R
 
A
L
 
L
F
 
Y
G
 
P
G
 
N
M
 
L
T
 
T
A
 
A
L
 
F
E
 
E
N
 
N
V
 
-
M
 
-
V
 
-
G
 
-
Q
 
-
H
 
-
V
 
-
R
 
-
T
 
-
K
 
-
Q
 
-
G
 
-
L
 
-
I
 
I
G
 
A
A
 
F
V
 
P
L
 
L
Q
 
T
T
 
N
L
 
M
S
 
K
E
 
M
R
 
S
R
 
K
E
 
E
E
 
E
R
 
-
A
 
-
I
 
I
R
 
R
E
 
K
R
 
R
A
 
V
I
 
E
E
 
E
L
 
V
L
 
A
D
 
K
Y
 
I
V
 
L
G
 
D
I
 
I
A
 
H
Q
 
H
Y
 
V
A
 
L
D
 
N
Y
 
H
T
 
F
A
 
P
R
 
R
N
 
E
L
 
L
S
 
S
Y
 
G
G
 
G
H
 
Q
Q
 
Q
R
 
Q
R
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
V
T
 
K
D
 
D
P
 
P
K
 
S
L
 
L
L
 
L
A
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
A
 
F
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
A
 
A
T
 
R
E
 
M
K
 
R
L
 
D
E
 
S
L
 
A
T
 
R
G
 
A
L
 
L
L
 
V
K
 
K
Q
 
E
I
 
V
R
 
Q
A
 
S
D
 
R
-
 
L
G
 
G
R
 
V
T
 
T
I
 
L
L
 
L
L
 
V
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
V
 
P
K
 
A
L
 
D
M
 
I
M
 
F
G
 
A
V
 
I
C
 
A
N
 
D
G
 
R
M
 
V
T
 
G
V
 
V
L
 
L
D
 
V
Y
 
K
G
 
G
K
 
K
V
 
L
I
 
V
A
 
Q
E
 
V
G
 
G
L
 
K
P
 
P
R
 
E
D
 
D
V
 
L
Q
 
Y
R
 
D
D
 
N
P
 
P
K
 
V
V
 
S
I
 
I
E
 
Q
A
 
V

1oxuA Crystal structure of glcv, the abc-atpase of the glucose abc transporter from sulfolobus solfataricus (see paper)
33% identity, 95% coverage: 6:251/258 of query aligns to 2:237/353 of 1oxuA

query
sites
1oxuA
I
 
V
R
 
R
L
 
I
S
 
I
V
 
V
K
 
K
G
 
N
V
 
V
S
 
S
K
 
K
R
 
V
F
|
F
-
 
K
-
 
K
G
 
G
G
 
K
L
 
V
Q
 
V
A
|
A
L
 
L
S
 
D
D
 
N
V
 
V
G
 
N
L
 
I
Q
 
N
I
 
I
D
 
E
E
 
N
G
 
G
S
 
E
I
 
R
Y
 
F
G
 
G
L
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
F
 
F
F
 
M
N
 
R
V
 
I
I
 
I
T
 
A
G
 
G
L
 
L
Y
 
D
S
 
V
P
 
P
D
 
S
S
 
T
G
 
G
E
 
E
F
 
L
E
 
Y
L
 
F
D
 
D
N
 
D
K
 
R
P
 
L
Y
 
V
T
 
A
P
 
S
T
 
N
A
 
G
V
 
K
H
 
L
K
 
I
V
 
V
A
 
P
K
 
P
T
 
E
G
 
D
-
 
R
-
 
K
I
 
I
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
T
I
 
W
R
 
A
L
 
L
F
 
Y
G
 
P
G
 
N
M
 
L
T
 
T
A
 
A
L
 
F
E
 
E
N
 
N
V
 
-
M
 
-
V
 
-
G
 
-
Q
 
-
H
 
-
V
 
-
R
 
-
T
 
-
K
 
-
Q
 
-
G
 
-
L
 
-
I
 
I
G
 
A
A
 
F
V
 
P
L
 
L
Q
 
T
T
 
N
L
 
M
S
 
K
E
 
M
R
 
S
R
 
K
E
 
E
E
 
E
R
 
-
A
 
-
I
 
I
R
 
R
E
 
K
R
 
R
A
 
V
I
 
E
E
 
E
L
 
V
L
 
A
D
 
K
Y
 
I
V
 
L
G
 
D
I
 
I
A
 
H
Q
 
H
Y
 
V
A
 
L
D
 
N
Y
 
H
T
 
F
A
 
P
R
 
R
N
 
E
L
 
L
S
 
S
Y
 
G
G
 
G
H
 
Q
Q
 
Q
R
 
Q
R
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
V
T
 
K
D
 
D
P
 
P
K
 
S
L
 
L
L
 
L
A
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
F
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
A
 
A
T
 
R
E
 
M
K
 
R
L
 
D
E
 
S
L
 
A
T
 
R
G
 
A
L
 
L
L
 
V
K
 
K
Q
 
E
I
 
V
R
 
Q
A
 
S
D
 
R
-
 
L
G
 
G
R
 
V
T
 
T
I
 
L
L
 
L
L
 
V
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
V
 
P
K
 
A
L
 
D
M
 
I
M
 
F
G
 
A
V
 
I
C
 
A
N
 
D
G
 
R
M
 
V
T
 
G
V
 
V
L
 
L
D
 
V
Y
 
K
G
 
G
K
 
K
V
 
L
I
 
V
A
 
Q
E
 
V
G
 
G
L
 
K
P
 
P
R
 
E
D
 
D
V
 
L
Q
 
Y
R
 
D
D
 
N
P
 
P
K
 
V
V
 
S
I
 
I
E
 
Q
A
 
V

Q97UY8 Glucose import ATP-binding protein GlcV; EC 7.5.2.- from Saccharolobus solfataricus (strain ATCC 35092 / DSM 1617 / JCM 11322 / P2) (Sulfolobus solfataricus) (see paper)
33% identity, 95% coverage: 6:251/258 of query aligns to 2:237/353 of Q97UY8

query
sites
Q97UY8
I
 
V
R
 
R
L
 
I
S
 
I
V
 
V
K
 
K
G
 
N
V
 
V
S
 
S
K
 
K
R
 
V
F
 
F
-
 
K
-
 
K
G
 
G
G
 
K
L
 
V
Q
 
V
A
 
A
L
 
L
S
 
D
D
 
N
V
 
V
G
 
N
L
 
I
Q
 
N
I
 
I
D
 
E
E
 
N
G
 
G
S
 
E
I
 
R
Y
 
F
G
 
G
L
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
T
F
 
F
F
 
M
N
 
R
V
 
I
I
 
I
T
 
A
G
 
G
L
 
L
Y
 
D
S
 
V
P
 
P
D
 
S
S
 
T
G
 
G
E
 
E
F
 
L
E
 
Y
L
 
F
D
 
D
N
 
D
K
 
R
P
 
L
Y
 
V
T
 
A
P
 
S
T
 
N
A
 
G
V
 
K
H
 
L
K
 
I
V
 
V
A
 
P
K
 
P
T
 
E
G
 
D
-
 
R
-
 
K
I
 
I
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
T
I
 
W
R
 
A
L
 
L
F
 
Y
G
 
P
G
 
N
M
 
L
T
 
T
A
 
A
L
 
F
E
 
E
N
 
N
V
 
-
M
 
-
V
 
-
G
 
-
Q
 
-
H
 
-
V
 
-
R
 
-
T
 
-
K
 
-
Q
 
-
G
 
-
L
 
-
I
 
I
G
 
A
A
 
F
V
 
P
L
 
L
Q
 
T
T
 
N
L
 
M
S
 
K
E
 
M
R
 
S
R
 
K
E
 
E
E
 
E
R
 
-
A
 
-
I
 
I
R
 
R
E
 
K
R
 
R
A
 
V
I
 
E
E
 
E
L
 
V
L
 
A
D
 
K
Y
 
I
V
 
L
G
 
D
I
 
I
A
 
H
Q
 
H
Y
 
V
A
 
L
D
 
N
Y
 
H
T
 
F
A
 
P
R
 
R
N
 
E
L
 
L
S
|
S
Y
 
G
G
|
G
H
 
Q
Q
 
Q
R
 
Q
R
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
V
T
 
K
D
 
D
P
 
P
K
 
S
L
 
L
L
 
L
A
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
A
 
F
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
A
 
A
T
 
R
E
 
M
K
 
R
L
 
D
E
 
S
L
 
A
T
 
R
G
 
A
L
 
L
L
 
V
K
 
K
Q
 
E
I
 
V
R
 
Q
A
 
S
D
 
R
-
 
L
G
 
G
R
 
V
T
 
T
I
 
L
L
 
L
L
 
V
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
V
 
P
K
 
A
L
 
D
M
 
I
M
 
F
G
 
A
V
 
I
C
 
A
N
 
D
G
 
R
M
 
V
T
 
G
V
 
V
L
 
L
D
 
V
Y
 
K
G
 
G
K
 
K
V
 
L
I
 
V
A
 
Q
E
 
V
G
 
G
L
 
K
P
 
P
R
 
E
D
 
D
V
 
L
Q
 
Y
R
 
D
D
 
N
P
 
P
K
 
V
V
 
S
I
 
I
E
 
Q
A
 
V

3c4jA Abc protein artp in complex with atp-gamma-s
31% identity, 93% coverage: 8:247/258 of query aligns to 4:230/242 of 3c4jA

query
sites
3c4jA
L
 
I
S
 
D
V
 
V
K
 
H
G
 
Q
V
 
L
S
 
K
K
 
K
R
 
S
F
|
F
G
 
G
G
 
S
L
 
L
Q
 
E
A
x
V
L
 
L
S
 
K
D
 
G
V
 
I
G
 
N
L
 
V
Q
 
H
I
 
I
D
 
R
E
 
E
G
 
G
S
 
E
I
 
V
Y
 
V
G
 
V
L
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
F
 
F
F
 
L
N
 
R
V
 
C
I
 
L
T
 
N
G
 
L
L
 
L
Y
 
E
S
 
D
P
 
F
D
 
D
S
 
E
G
 
G
E
 
E
F
 
I
E
 
I
L
 
I
D
 
D
-
 
G
-
 
I
N
 
N
K
 
L
P
 
K
Y
 
A
T
 
K
P
 
D
T
 
T
A
 
N
V
 
L
H
 
N
K
 
K
V
 
V
A
 
-
K
 
R
T
 
E
G
 
E
I
 
V
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
R
I
 
F
R
 
N
L
 
L
F
 
F
G
 
P
G
 
H
M
 
M
T
 
T
A
 
V
L
 
L
E
 
N
N
 
N
V
 
I
M
 
-
V
 
-
G
 
-
Q
 
-
H
 
-
V
 
-
R
 
-
T
 
-
K
 
-
Q
 
-
G
 
-
L
 
-
I
 
-
G
 
-
A
 
-
V
 
T
L
 
L
Q
 
A
T
 
P
L
 
M
S
 
K
E
 
V
R
 
R
R
 
K
E
 
W
E
 
P
R
 
R
A
 
E
I
 
K
R
 
A
E
 
E
-
 
A
R
 
K
A
 
A
I
 
M
E
 
E
L
 
L
L
 
L
D
 
D
Y
 
K
V
 
V
G
 
G
I
 
L
A
 
K
Q
 
D
Y
 
K
A
 
A
D
 
H
Y
 
A
T
 
Y
A
 
P
R
 
D
N
 
S
L
 
L
S
 
S
Y
 
G
G
 
G
H
 
Q
Q
 
A
R
 
Q
R
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
M
D
 
E
P
 
P
K
 
K
L
 
I
L
 
M
A
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
L
N
 
D
A
 
P
T
 
E
E
 
M
K
 
V
L
 
G
E
 
E
L
 
V
T
 
L
G
 
S
L
 
V
L
 
M
K
 
K
Q
 
Q
I
 
L
R
 
A
A
 
N
D
 
E
G
 
G
R
 
M
T
 
T
I
 
M
L
 
V
L
 
V
I
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
E
V
 
M
K
 
G
L
 
F
M
 
A
M
 
R
G
 
E
V
 
V
C
 
G
N
 
D
G
 
R
M
 
V
T
 
L
V
 
F
L
 
M
D
 
D
Y
 
G
G
 
G
K
 
Y
V
 
I
I
 
I
A
 
E
E
 
E
G
 
G
L
 
K
P
 
P
R
 
E
D
 
D
V
 
L
Q
 
F
R
 
D
D
 
R
P
 
P
K
 
Q

3c41J Abc protein artp in complex with amp-pnp/mg2+
31% identity, 93% coverage: 8:247/258 of query aligns to 4:230/242 of 3c41J

query
sites
3c41J
L
 
I
S
 
D
V
 
V
K
 
H
G
 
Q
V
 
L
S
 
K
K
 
K
R
 
S
F
|
F
G
 
G
G
 
S
L
 
L
Q
 
E
A
x
V
L
 
L
S
 
K
D
 
G
V
 
I
G
 
N
L
 
V
Q
 
H
I
 
I
D
 
R
E
 
E
G
 
G
S
 
E
I
 
V
Y
 
V
G
 
V
L
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
F
 
F
F
 
L
N
 
R
V
 
C
I
 
L
T
 
N
G
 
L
L
 
L
Y
 
E
S
 
D
P
 
F
D
 
D
S
 
E
G
 
G
E
 
E
F
 
I
E
 
I
L
 
I
D
 
D
-
 
G
-
 
I
N
 
N
K
 
L
P
 
K
Y
 
A
T
 
K
P
 
D
T
 
T
A
 
N
V
 
L
H
 
N
K
 
K
V
 
V
A
 
-
K
 
R
T
 
E
G
 
E
I
 
V
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
R
I
 
F
R
 
N
L
 
L
F
 
F
G
 
P
G
 
H
M
 
M
T
 
T
A
 
V
L
 
L
E
 
N
N
 
N
V
 
I
M
 
-
V
 
-
G
 
-
Q
 
-
H
 
-
V
 
-
R
 
-
T
 
-
K
 
-
Q
 
-
G
 
-
L
 
-
I
 
-
G
 
-
A
 
-
V
 
T
L
 
L
Q
 
A
T
 
P
L
 
M
S
 
K
E
 
V
R
 
R
R
 
K
E
 
W
E
 
P
R
 
R
A
 
E
I
 
K
R
 
A
E
 
E
-
 
A
R
 
K
A
 
A
I
 
M
E
 
E
L
 
L
L
 
L
D
 
D
Y
 
K
V
 
V
G
 
G
I
 
L
A
 
K
Q
 
D
Y
 
K
A
 
A
D
 
H
Y
 
A
T
 
Y
A
 
P
R
 
D
N
 
S
L
 
L
S
 
S
Y
 
G
G
 
G
H
 
Q
Q
 
A
R
 
Q
R
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
M
D
 
E
P
 
P
K
 
K
L
 
I
L
 
M
A
 
L
L
 
F
D
|
D
E
 
E
P
 
P
A
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
L
N
 
D
A
 
P
T
 
E
E
 
M
K
 
V
L
 
G
E
 
E
L
 
V
T
 
L
G
 
S
L
 
V
L
 
M
K
 
K
Q
 
Q
I
 
L
R
 
A
A
 
N
D
 
E
G
 
G
R
 
M
T
 
T
I
 
M
L
 
V
L
 
V
I
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
E
V
 
M
K
 
G
L
 
F
M
 
A
M
 
R
G
 
E
V
 
V
C
 
G
N
 
D
G
 
R
M
 
V
T
 
L
V
 
F
L
 
M
D
 
D
Y
 
G
G
 
G
K
 
Y
V
 
I
I
 
I
A
 
E
E
 
E
G
 
G
L
 
K
P
 
P
R
 
E
D
 
D
V
 
L
Q
 
F
R
 
D
D
 
R
P
 
P
K
 
Q

2olkA Abc protein artp in complex with adp-beta-s
31% identity, 93% coverage: 8:247/258 of query aligns to 4:230/242 of 2olkA

query
sites
2olkA
L
 
I
S
 
D
V
 
V
K
 
H
G
 
Q
V
 
L
S
 
K
K
 
K
R
 
S
F
|
F
G
 
G
G
 
S
L
 
L
Q
 
E
A
x
V
L
 
L
S
 
K
D
 
G
V
 
I
G
 
N
L
 
V
Q
 
H
I
 
I
D
 
R
E
 
E
G
 
G
S
 
E
I
 
V
Y
 
V
G
 
V
L
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
F
 
F
F
 
L
N
 
R
V
 
C
I
 
L
T
 
N
G
 
L
L
 
L
Y
 
E
S
 
D
P
 
F
D
 
D
S
 
E
G
 
G
E
 
E
F
 
I
E
 
I
L
 
I
D
 
D
-
 
G
-
 
I
N
 
N
K
 
L
P
 
K
Y
 
A
T
 
K
P
 
D
T
 
T
A
 
N
V
 
L
H
 
N
K
 
K
V
 
V
A
 
-
K
 
R
T
 
E
G
 
E
I
 
V
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
R
I
 
F
R
 
N
L
 
L
F
 
F
G
 
P
G
 
H
M
 
M
T
 
T
A
 
V
L
 
L
E
 
N
N
 
N
V
 
I
M
 
-
V
 
-
G
 
-
Q
 
-
H
 
-
V
 
-
R
 
-
T
 
-
K
 
-
Q
 
-
G
 
-
L
 
-
I
 
-
G
 
-
A
 
-
V
 
T
L
 
L
Q
 
A
T
 
P
L
 
M
S
 
K
E
 
V
R
 
R
R
 
K
E
 
W
E
 
P
R
 
R
A
 
E
I
 
K
R
 
A
E
 
E
-
 
A
R
 
K
A
 
A
I
 
M
E
 
E
L
 
L
L
 
L
D
 
D
Y
 
K
V
 
V
G
 
G
I
 
L
A
 
K
Q
 
D
Y
 
K
A
 
A
D
 
H
Y
 
A
T
 
Y
A
 
P
R
 
D
N
 
S
L
 
L
S
 
S
Y
 
G
G
 
G
H
 
Q
Q
 
A
R
 
Q
R
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
M
D
 
E
P
 
P
K
 
K
L
 
I
L
 
M
A
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
L
N
 
D
A
 
P
T
 
E
E
 
M
K
 
V
L
 
G
E
 
E
L
 
V
T
 
L
G
 
S
L
 
V
L
 
M
K
 
K
Q
 
Q
I
 
L
R
 
A
A
 
N
D
 
E
G
 
G
R
 
M
T
 
T
I
 
M
L
 
V
L
 
V
I
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
E
V
 
M
K
 
G
L
 
F
M
 
A
M
 
R
G
 
E
V
 
V
C
 
G
N
 
D
G
 
R
M
 
V
T
 
L
V
 
F
L
 
M
D
 
D
Y
 
G
G
 
G
K
 
Y
V
 
I
I
 
I
A
 
E
E
 
E
G
 
G
L
 
K
P
 
P
R
 
E
D
 
D
V
 
L
Q
 
F
R
 
D
D
 
R
P
 
P
K
 
Q

2oljA Abc protein artp in complex with adp/mg2+
31% identity, 93% coverage: 8:247/258 of query aligns to 4:230/242 of 2oljA

query
sites
2oljA
L
 
I
S
 
D
V
 
V
K
 
H
G
 
Q
V
 
L
S
 
K
K
 
K
R
 
S
F
|
F
G
 
G
G
 
S
L
 
L
Q
 
E
A
x
V
L
 
L
S
 
K
D
 
G
V
 
I
G
 
N
L
 
V
Q
 
H
I
 
I
D
 
R
E
 
E
G
 
G
S
 
E
I
 
V
Y
 
V
G
 
V
L
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
F
 
F
F
 
L
N
 
R
V
 
C
I
 
L
T
 
N
G
 
L
L
 
L
Y
 
E
S
 
D
P
 
F
D
 
D
S
 
E
G
 
G
E
 
E
F
 
I
E
 
I
L
 
I
D
 
D
-
 
G
-
 
I
N
 
N
K
 
L
P
 
K
Y
 
A
T
 
K
P
 
D
T
 
T
A
 
N
V
 
L
H
 
N
K
 
K
V
 
V
A
 
-
K
 
R
T
 
E
G
 
E
I
 
V
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
R
I
 
F
R
 
N
L
 
L
F
 
F
G
 
P
G
 
H
M
 
M
T
 
T
A
 
V
L
 
L
E
 
N
N
 
N
V
 
I
M
 
-
V
 
-
G
 
-
Q
 
-
H
 
-
V
 
-
R
 
-
T
 
-
K
 
-
Q
 
-
G
 
-
L
 
-
I
 
-
G
 
-
A
 
-
V
 
T
L
 
L
Q
 
A
T
 
P
L
 
M
S
 
K
E
 
V
R
 
R
R
 
K
E
 
W
E
 
P
R
 
R
A
 
E
I
 
K
R
 
A
E
 
E
-
 
A
R
 
K
A
 
A
I
 
M
E
 
E
L
 
L
L
 
L
D
 
D
Y
 
K
V
 
V
G
 
G
I
 
L
A
 
K
Q
 
D
Y
 
K
A
 
A
D
 
H
Y
 
A
T
 
Y
A
 
P
R
 
D
N
 
S
L
 
L
S
 
S
Y
 
G
G
 
G
H
 
Q
Q
 
A
R
 
Q
R
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
M
D
 
E
P
 
P
K
 
K
L
 
I
L
 
M
A
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
L
N
 
D
A
 
P
T
 
E
E
 
M
K
 
V
L
 
G
E
 
E
L
 
V
T
 
L
G
 
S
L
 
V
L
 
M
K
 
K
Q
 
Q
I
 
L
R
 
A
A
 
N
D
 
E
G
 
G
R
 
M
T
 
T
I
 
M
L
 
V
L
 
V
I
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
E
V
 
M
K
 
G
L
 
F
M
 
A
M
 
R
G
 
E
V
 
V
C
 
G
N
 
D
G
 
R
M
 
V
T
 
L
V
 
F
L
 
M
D
 
D
Y
 
G
G
 
G
K
 
Y
V
 
I
I
 
I
A
 
E
E
 
E
G
 
G
L
 
K
P
 
P
R
 
E
D
 
D
V
 
L
Q
 
F
R
 
D
D
 
R
P
 
P
K
 
Q

P04983 Ribose import ATP-binding protein RbsA; EC 7.5.2.7 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
31% identity, 89% coverage: 8:236/258 of query aligns to 5:222/501 of P04983

query
sites
P04983
L
 
L
S
 
Q
V
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
I
S
 
D
K
 
K
R
 
A
F
 
F
G
 
P
G
 
G
L
 
V
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
S
 
S
D
 
G
V
 
A
G
 
A
L
 
L
Q
 
N
I
 
V
D
 
Y
E
 
P
G
 
G
S
 
R
I
 
V
Y
 
M
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
 
G
P
 
E
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
|
K
T
 
S
T
 
T
F
 
M
F
 
M
N
 
K
V
 
V
I
 
L
T
 
T
G
 
G
L
 
I
Y
 
Y
S
 
T
P
 
R
D
 
D
S
 
A
G
 
G
E
 
T
F
 
L
E
 
L
L
 
W
D
 
L
N
 
G
K
 
K
P
 
E
Y
 
T
T
 
T
P
 
F
T
 
T
A
 
G
V
 
P
H
 
K
K
 
S
V
 
S
A
 
Q
K
 
E
T
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
G
R
 
I
T
 
I
F
 
H
Q
 
Q
N
 
E
I
 
L
R
 
N
L
 
L
F
 
I
G
 
P
G
 
Q
M
 
L
T
 
T
A
 
I
L
 
A
E
 
E
N
 
N
V
 
I
M
 
F
V
 
L
G
 
G
Q
 
R
H
 
E
V
 
F
R
 
V
T
 
N
K
 
R
Q
 
F
G
 
G
L
 
K
I
 
I
G
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
-
Q
 
-
T
 
-
L
 
-
S
 
-
E
 
-
R
 
-
R
 
-
E
 
D
E
 
W
R
 
K
A
 
T
I
 
M
R
 
Y
E
 
A
R
 
E
A
 
A
I
 
D
E
 
K
L
 
L
L
 
L
D
 
A
Y
 
K
V
 
L
G
 
N
I
 
L
A
 
R
Q
 
F
Y
 
K
A
 
S
D
 
D
Y
 
K
T
 
L
A
 
V
R
 
G
N
 
D
L
 
L
S
 
S
Y
 
I
G
 
G
H
 
D
Q
 
Q
R
 
Q
R
 
M
L
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
K
A
 
V
L
 
L
A
 
S
T
 
F
D
 
E
P
 
S
K
 
K
L
 
V
L
 
I
A
 
I
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
T
A
 
D
G
 
A
M
 
L
N
 
T
A
 
D
T
 
T
E
 
E
K
 
T
L
 
E
E
 
S
L
 
L
T
 
F
G
 
R
L
 
V
L
 
I
K
 
R
Q
 
E
I
 
L
R
 
K
A
 
S
D
 
Q
G
 
G
R
 
R
T
 
G
I
 
I
L
 
V
L
 
Y
I
 
I
E
 
S
H
 
H
D
 
R
V
 
M
K
 
K
L
 
E
M
 
I
M
 
F
G
 
E
V
 
I
C
 
C
N
 
D
G
 
D
M
 
V
T
 
T
V
 
V
L
 
F
D
 
R
Y
 
D
G
 
G
K
 
Q
V
 
F
I
 
I
A
 
A
E
 
E

4ymuJ Crystal structure of an amino acid abc transporter complex with arginines and atps (see paper)
29% identity, 90% coverage: 10:242/258 of query aligns to 4:223/240 of 4ymuJ

query
sites
4ymuJ
V
 
V
K
 
N
G
 
D
V
 
V
S
 
Y
K
 
K
R
 
N
F
|
F
G
 
G
G
 
S
L
 
L
Q
 
E
A
x
V
L
 
L
S
 
K
D
 
G
V
 
V
G
 
T
L
 
L
Q
 
K
I
 
V
D
 
N
E
 
K
G
 
G
S
 
E
I
 
V
Y
 
V
G
 
V
L
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
F
 
L
F
 
L
N
 
R
V
 
C
I
 
I
T
 
N
G
 
L
L
 
L
Y
 
E
S
 
E
P
 
P
D
 
T
S
 
K
G
 
G
E
 
E
F
 
V
E
 
F
L
 
I
D
 
D
N
 
G
K
 
V
P
 
K
Y
 
I
T
 
N
-
 
N
-
 
G
P
 
K
T
 
V
A
 
N
V
 
I
H
 
N
K
 
K
V
 
V
A
 
-
K
 
R
T
 
Q
G
 
K
I
 
V
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
H
I
 
F
R
 
N
L
 
L
F
 
F
G
 
P
G
 
H
M
 
L
T
 
T
A
 
A
L
 
I
E
 
E
N
 
N
V
 
I
M
 
T
V
 
L
G
 
A
Q
 
P
H
 
-
V
 
V
R
 
K
T
 
V
K
 
K
Q
 
-
G
 
-
L
 
-
I
 
-
G
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
-
Q
 
-
T
 
-
L
 
-
S
 
-
E
 
-
R
 
K
R
 
M
E
 
N
E
 
K
R
 
K
A
 
E
I
 
A
R
 
E
E
 
E
R
 
L
A
 
A
I
 
V
E
 
D
L
 
L
L
 
L
D
 
A
Y
 
K
V
 
V
G
 
G
I
 
L
A
 
L
Q
 
D
Y
 
K
A
 
K
D
 
D
Y
 
Q
T
 
Y
A
 
P
R
 
I
N
 
K
L
 
L
S
 
S
Y
 
G
G
 
G
H
 
Q
Q
 
K
R
 
Q
R
 
R
L
 
L
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
M
D
 
Q
P
 
P
K
 
E
L
 
V
L
 
M
A
 
L
L
 
F
D
 
D
E
|
E
P
 
P
A
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
L
N
 
D
A
 
P
T
 
E
E
 
M
K
 
V
L
 
K
E
 
E
L
 
V
T
 
L
G
 
N
L
 
V
L
 
M
K
 
K
Q
 
Q
I
 
L
R
 
A
A
 
N
D
 
E
G
 
G
R
 
M
T
 
T
I
 
M
L
 
V
L
 
V
I
 
V
E
 
T
H
|
H
D
 
E
V
 
M
K
 
G
L
 
F
M
 
A
M
 
R
G
 
E
V
 
V
C
 
G
N
 
D
G
 
R
M
 
V
T
 
I
V
 
F
L
 
M
D
 
D
Y
 
D
G
 
G
K
 
V
V
 
I
I
 
V
A
 
E
E
 
E
G
 
G
L
 
T
P
 
P
R
 
E
D
 
E
V
 
I

Query Sequence

>BPHYT_RS31750 BPHYT_RS31750 ABC transporter
MKKNSIRLSVKGVSKRFGGLQALSDVGLQIDEGSIYGLIGPNGAGKTTFFNVITGLYSPD
SGEFELDNKPYTPTAVHKVAKTGIARTFQNIRLFGGMTALENVMVGQHVRTKQGLIGAVL
QTLSERREERAIRERAIELLDYVGIAQYADYTARNLSYGHQRRLEIARALATDPKLLALD
EPAAGMNATEKLELTGLLKQIRADGRTILLIEHDVKLMMGVCNGMTVLDYGKVIAEGLPR
DVQRDPKVIEAYLGTGVQ

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory