SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing BPHYT_RS34945 FitnessBrowser__BFirm:BPHYT_RS34945 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1nfqA Rv2002 gene product from mycobacterium tuberculosis (see paper)
39% identity, 97% coverage: 6:253/255 of query aligns to 1:238/244 of 1nfqA

query
sites
1nfqA
S
 
S
A
 
G
A
 
R
L
 
L
N
 
T
G
 
G
R
 
K
R
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
S
G
|
G
G
 
G
A
 
A
R
|
R
G
|
G
L
x
M
G
 
G
A
 
A
A
 
S
F
 
H
V
 
V
R
 
R
S
 
A
L
 
M
V
 
V
Q
 
A
A
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
V
 
V
F
 
F
G
 
G
D
|
D
V
x
I
L
|
L
H
 
D
E
 
E
E
 
E
G
 
G
R
 
K
A
 
A
L
 
M
A
 
A
A
 
A
S
 
E
L
 
L
V
 
A
E
 
D
Q
 
A
G
 
A
H
 
R
A
 
-
V
 
-
T
 
-
Y
 
Y
V
 
V
P
 
H
L
|
L
D
|
D
L
x
V
A
 
T
D
 
Q
P
 
P
T
 
A
S
 
Q
I
 
W
K
 
K
Q
 
A
F
 
A
A
 
V
E
 
D
Q
 
T
G
 
A
A
 
V
A
 
T
Q
 
A
L
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
 
H
A
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
G
I
|
I
T
x
L
N
 
N
S
x
I
G
 
G
G
 
-
K
 
-
F
 
T
A
 
I
D
 
E
E
 
D
L
 
Y
S
 
A
V
 
L
D
 
T
T
 
E
W
 
W
D
 
Q
A
 
R
V
 
I
M
 
L
N
 
D
V
|
V
N
 
N
V
 
L
R
 
T
G
 
G
T
 
V
W
 
F
L
 
L
M
 
G
S
 
I
T
 
R
A
 
A
A
 
V
L
 
V
P
 
K
Y
 
P
L
 
M
R
 
K
D
 
E
S
 
A
G
 
G
R
 
R
G
 
G
S
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
|
I
A
x
S
S
|
S
D
 
I
T
x
E
A
 
G
M
 
L
W
 
A
G
 
G
A
 
T
P
x
V
K
 
A
L
x
C
L
 
H
A
 
G
Y
|
Y
V
 
T
A
 
A
S
 
T
K
|
K
G
 
F
A
 
A
V
 
V
I
 
R
S
 
G
M
 
L
T
 
T
R
 
K
S
 
S
L
 
T
A
 
A
R
 
L
E
 
E
F
 
L
G
 
G
A
 
P
H
 
S
Q
 
G
V
 
I
T
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
S
I
 
I
A
 
H
P
|
P
G
|
G
L
|
L
T
x
V
E
 
K
V
x
T
E
x
P
A
x
M
T
|
T
A
 
D
Y
 
W
V
|
V
P
 
P
A
 
E
E
 
D
R
x
I
H
x
F
E
 
Q
Y
 
-
Y
 
-
L
 
-
Q
 
-
G
 
-
R
 
T
A
 
A
L
 
L
T
 
G
R
 
R
A
 
A
Q
 
A
V
 
E
P
 
P
D
 
V
D
 
E
V
 
V
T
 
S
G
 
N
P
 
L
V
 
V
L
 
V
F
 
Y
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
E
A
 
S
R
 
S
F
 
Y
V
 
S
T
 
T
G
 
G
Q
 
A
L
 
E
L
 
F
P
 
V
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
T
V
 
V

1nffA Crystal structure of rv2002 gene product from mycobacterium tuberculosis (see paper)
39% identity, 97% coverage: 6:253/255 of query aligns to 1:238/244 of 1nffA

query
sites
1nffA
S
 
S
A
 
G
A
 
R
L
 
L
N
 
T
G
 
G
R
 
K
R
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
S
G
|
G
G
 
G
A
 
A
R
|
R
G
|
G
L
x
M
G
 
G
A
 
A
A
 
S
F
 
H
V
 
V
R
 
R
S
 
A
L
 
M
V
 
V
Q
 
A
A
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
V
 
V
F
 
F
G
 
G
D
|
D
V
x
I
L
|
L
H
 
D
E
 
E
E
 
E
G
 
G
R
 
K
A
 
A
L
 
M
A
 
A
A
 
A
S
 
E
L
 
L
V
 
A
E
 
D
Q
 
A
G
 
A
H
 
R
A
 
-
V
 
-
T
 
-
Y
 
Y
V
 
V
P
 
H
L
|
L
D
|
D
L
x
V
A
 
T
D
 
Q
P
 
P
T
 
A
S
 
Q
I
 
W
K
 
K
Q
 
A
F
 
A
A
 
V
E
 
D
Q
 
T
G
 
A
A
 
V
A
 
T
Q
 
A
L
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
 
H
A
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
G
I
|
I
T
 
L
N
 
N
S
 
I
G
 
G
G
 
-
K
 
-
F
 
T
A
 
I
D
 
E
E
 
D
L
 
Y
S
 
A
V
 
L
D
 
T
T
 
E
W
 
W
D
 
Q
A
 
R
V
 
I
M
 
L
N
 
D
V
|
V
N
 
N
V
 
L
R
 
T
G
 
G
T
 
V
W
 
F
L
 
L
M
 
G
S
 
I
T
 
R
A
 
A
A
 
V
L
 
V
P
 
K
Y
 
P
L
 
M
R
 
K
D
 
E
S
 
A
G
 
G
R
 
R
G
 
G
S
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
|
I
A
x
S
S
|
S
D
 
I
T
 
E
A
 
G
M
 
L
W
 
A
G
 
G
A
 
T
P
 
V
K
 
A
L
 
C
L
 
H
A
 
G
Y
|
Y
V
 
T
A
 
A
S
 
T
K
|
K
G
 
F
A
 
A
V
 
V
I
 
R
S
 
G
M
 
L
T
 
T
R
 
K
S
 
S
L
 
T
A
 
A
R
 
L
E
 
E
F
 
L
G
 
G
A
 
P
H
 
S
Q
 
G
V
 
I
T
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
S
I
 
I
A
 
H
P
|
P
G
|
G
L
|
L
T
x
V
E
 
K
V
x
T
E
x
P
A
x
M
T
|
T
A
 
D
Y
 
W
V
 
V
P
 
P
A
 
E
E
 
D
R
 
I
H
 
F
E
 
Q
Y
 
-
Y
 
-
L
 
-
Q
 
-
G
 
-
R
 
T
A
 
A
L
 
L
T
 
G
R
 
R
A
 
A
Q
 
A
V
 
E
P
 
P
D
 
V
D
 
E
V
 
V
T
 
S
G
 
N
P
 
L
V
 
V
L
 
V
F
 
Y
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
E
A
 
S
R
 
S
F
 
Y
V
 
S
T
 
T
G
 
G
Q
 
A
L
 
E
L
 
F
P
 
V
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
T
V
 
V

P9WGT1 3-alpha-(or 20-beta)-hydroxysteroid dehydrogenase; NADH-dependent 3alpha, 20beta-hydroxysteroid dehydrogenase; EC 1.1.1.53 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
38% identity, 97% coverage: 6:253/255 of query aligns to 2:239/260 of P9WGT1

query
sites
P9WGT1
S
 
S
A
 
G
A
 
R
L
 
L
N
x
I
G
 
G
R
 
K
R
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
S
G
 
G
G
 
G
A
 
A
R
|
R
G
|
G
L
x
M
G
 
G
A
 
A
A
 
S
F
 
H
V
 
V
R
 
R
S
 
A
L
 
M
V
 
V
Q
 
A
A
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
V
 
V
F
 
F
G
 
G
D
|
D
V
 
I
L
 
L
H
 
D
E
 
E
E
 
E
G
 
G
R
 
K
A
 
A
L
x
V
A
 
A
A
 
A
S
 
E
L
 
L
V
 
A
E
 
D
Q
 
A
G
 
A
H
 
R
A
 
-
V
 
-
T
 
-
Y
 
Y
V
 
V
P
 
H
L
 
L
D
|
D
L
x
V
A
 
T
D
 
Q
P
 
P
T
 
A
S
 
Q
I
 
W
K
x
T
Q
 
A
F
 
A
A
 
V
E
 
D
Q
 
T
G
 
A
A
 
V
A
 
T
Q
 
A
L
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
 
H
A
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
 
G
I
 
I
T
 
L
N
 
N
S
 
I
G
 
G
G
 
-
K
 
-
F
 
T
A
 
I
D
 
E
E
 
D
L
 
Y
S
 
A
V
 
L
D
 
T
T
 
E
W
 
W
D
 
Q
A
 
R
V
 
I
M
 
L
N
 
D
V
 
V
N
 
N
V
 
L
R
 
T
G
 
G
T
 
V
W
 
F
L
 
L
M
 
G
S
 
I
T
 
R
A
 
A
A
 
V
L
 
V
P
 
K
Y
 
P
L
 
M
R
 
K
D
 
E
S
 
A
G
 
G
R
 
R
G
 
G
S
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
I
A
 
S
S
|
S
D
 
I
T
 
E
A
 
G
M
 
L
W
 
A
G
 
G
A
 
T
P
 
V
K
 
A
L
 
C
L
 
H
A
 
G
Y
|
Y
V
 
T
A
 
A
S
 
T
K
|
K
G
 
F
A
 
A
V
 
V
I
 
R
S
 
G
M
 
L
T
 
T
R
 
K
S
 
S
L
 
T
A
 
A
R
 
L
E
 
E
F
 
L
G
 
G
A
 
P
H
 
S
Q
 
G
V
 
I
T
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
S
I
 
I
A
 
H
P
|
P
G
|
G
L
|
L
T
x
V
E
x
K
V
x
T
E
x
P
A
x
M
T
|
T
A
 
D
Y
 
W
V
 
V
P
 
P
A
 
E
E
 
D
R
 
I
H
 
F
E
 
Q
Y
 
-
Y
 
-
L
 
-
Q
 
-
G
 
-
R
 
T
A
 
A
L
 
L
T
 
G
R
 
R
A
 
A
Q
 
A
V
 
E
P
 
P
D
 
V
D
 
E
V
 
V
T
 
S
G
 
N
P
 
L
V
 
V
L
 
V
F
 
Y
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
E
A
 
S
R
 
S
F
 
Y
V
 
S
T
 
T
G
 
G
Q
 
A
L
 
E
L
 
F
P
 
V
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
T
V
 
V

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
34% identity, 96% coverage: 9:254/255 of query aligns to 5:244/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
L
 
L
N
 
Q
G
 
D
R
 
K
R
 
V
V
 
A
L
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
|
A
R
x
N
G
|
G
L
x
I
G
 
G
A
 
L
A
 
E
F
 
A
V
 
A
R
 
R
S
 
V
L
 
F
V
 
M
Q
 
K
A
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
V
 
V
F
 
I
G
 
A
D
|
D
V
x
F
L
x
N
H
 
E
E
 
A
E
 
A
G
 
G
R
 
K
A
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
S
 
E
L
 
A
V
 
V
E
 
E
Q
 
A
G
 
N
H
 
P
A
 
G
V
 
V
T
 
V
Y
 
F
V
 
I
P
 
R
L
x
V
D
|
D
L
x
V
A
 
S
D
 
D
P
 
R
T
 
E
S
 
S
I
 
V
K
 
H
Q
 
R
F
 
L
A
 
V
E
 
E
Q
 
N
G
 
V
A
 
A
A
 
E
Q
 
R
L
 
F
G
 
G
G
 
K
L
 
I
D
 
D
A
 
I
L
 
L
I
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
G
I
|
I
T
|
T
N
 
R
S
x
D
G
 
S
G
 
-
K
 
-
F
 
M
A
 
L
D
 
S
E
x
K
L
 
M
S
 
T
V
 
V
D
 
D
T
 
Q
W
 
F
D
 
Q
A
 
Q
V
 
V
M
 
I
N
 
N
V
|
V
N
|
N
V
 
L
R
 
T
G
 
G
T
 
V
W
 
F
L
 
H
M
 
C
S
 
T
T
 
Q
A
 
A
A
 
V
L
 
L
P
 
P
Y
 
Y
L
 
M
R
 
A
D
 
E
S
 
Q
G
 
G
R
 
K
G
 
G
S
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
T
A
x
S
S
|
S
D
 
V
T
|
T
A
 
G
M
 
T
W
 
Y
G
 
G
A
x
N
P
x
V
K
x
G
L
x
Q
L
 
T
A
 
N
Y
|
Y
V
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
I
S
 
G
M
 
M
T
 
T
R
 
K
S
 
T
L
 
W
A
 
A
R
 
K
E
 
E
F
 
L
G
 
A
A
 
R
H
 
K
Q
 
G
V
 
I
T
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
L
x
F
T
|
T
E
 
E
V
x
T
E
x
A
A
x
M
T
x
V
A
 
A
Y
 
E
V
 
V
P
 
P
A
 
E
E
 
K
R
 
V
H
 
I
E
 
E
Y
x
K
Y
 
M
L
 
K
Q
 
A
G
 
Q
R
 
V
A
 
P
L
 
M
T
 
G
R
 
R
A
 
L
Q
 
G
V
 
K
P
 
P
D
 
E
D
 
D
V
 
I
T
 
A
G
 
N
P
 
A
V
 
Y
L
 
L
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
H
A
 
E
A
 
S
R
 
D
F
 
Y
V
 
V
T
 
N
G
 
G
Q
 
H
L
 
V
L
 
L
P
 
H
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
I
V
 
M
M
 
M

1vl8B Crystal structure of gluconate 5-dehydrogenase (tm0441) from thermotoga maritima at 2.07 a resolution
37% identity, 97% coverage: 9:255/255 of query aligns to 4:252/252 of 1vl8B

query
sites
1vl8B
L
 
L
N
 
R
G
 
G
R
 
R
R
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
x
S
R
|
R
G
|
G
L
|
L
G
 
G
A
 
F
A
 
G
F
 
I
V
 
A
R
 
Q
S
 
G
L
 
L
V
 
A
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
C
Q
 
S
V
 
V
V
 
V
F
 
V
G
 
A
D
x
S
V
x
R
L
x
N
H
 
L
E
 
E
E
 
E
G
 
A
R
 
S
A
 
E
L
 
A
A
 
A
A
 
Q
S
 
K
L
 
L
V
 
T
E
 
E
Q
 
K
-
 
Y
G
 
G
H
 
V
A
 
E
V
 
T
T
 
M
Y
 
A
V
 
F
P
 
R
L
x
C
D
|
D
L
x
V
A
 
S
D
 
N
P
 
Y
T
 
E
S
 
E
I
 
V
K
 
K
Q
 
K
F
 
L
A
 
L
E
 
E
Q
 
A
G
 
V
A
 
K
A
 
E
Q
 
K
L
 
F
G
 
G
G
 
K
L
 
L
D
 
D
A
 
T
L
 
V
I
 
V
N
 
N
N
x
A
A
|
A
A
x
G
I
|
I
T
 
N
N
 
R
S
 
R
G
 
H
G
 
P
K
 
-
F
 
-
A
 
A
D
 
E
E
 
E
L
 
F
S
 
P
V
 
L
D
 
D
T
 
E
W
 
F
D
 
R
A
 
Q
V
 
V
M
 
I
N
 
E
V
|
V
N
 
N
V
 
L
R
 
F
G
 
G
T
 
T
W
 
Y
L
 
Y
M
 
V
S
 
C
T
 
R
A
 
E
A
 
A
L
 
F
P
 
S
Y
 
L
L
 
L
R
 
R
D
 
E
S
 
S
G
 
D
R
 
N
G
 
P
S
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
|
I
A
x
G
S
|
S
D
 
L
T
 
T
A
 
V
M
 
E
W
 
E
-
 
V
G
 
T
A
 
M
P
 
P
K
 
N
L
x
I
L
 
S
A
 
A
Y
|
Y
V
 
A
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
G
V
 
V
I
 
A
S
 
S
M
 
L
T
 
T
R
 
K
S
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
K
E
 
E
F
 
W
G
 
G
A
 
R
H
 
Y
Q
 
G
V
 
I
T
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
V
I
 
I
A
 
A
P
|
P
G
|
G
L
x
W
-
x
Y
-
 
R
T
|
T
E
x
K
V
x
M
E
x
T
A
 
E
T
 
A
A
 
V
Y
 
F
V
 
S
P
 
D
A
 
P
E
 
E
R
 
K
H
 
L
E
 
D
Y
 
Y
Y
 
M
L
 
L
Q
 
K
G
 
R
R
 
I
A
 
P
L
 
L
T
 
G
R
 
R
A
 
T
Q
 
G
V
 
V
P
 
P
D
 
E
D
 
D
V
 
L
T
 
K
G
 
G
P
 
V
V
 
A
L
 
V
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
E
A
 
E
A
 
A
R
 
K
F
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
L
 
I
L
 
I
P
 
F
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
W
V
 
T
M
 
A
N
 
N

3rwbA Crystal structure of complex of 4pal (4-pyridoxolactone) and pldh (tetrameric pyridoxal 4-dehydrogenase) from mesorhizobium loti
37% identity, 96% coverage: 9:253/255 of query aligns to 4:245/247 of 3rwbA

query
sites
3rwbA
L
 
L
N
 
A
G
 
G
R
 
K
R
 
T
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
|
A
R
x
Q
G
|
G
L
x
I
G
 
G
A
 
K
A
 
A
F
 
I
V
 
A
R
 
A
S
 
R
L
 
L
V
 
A
Q
 
A
A
 
D
G
 
G
A
 
A
Q
 
T
V
 
V
V
 
I
F
 
V
G
 
S
D
|
D
V
x
I
L
 
N
H
 
A
E
 
E
E
 
G
G
 
A
R
 
K
A
 
A
L
 
A
A
 
A
A
 
A
S
 
S
L
 
I
V
 
G
E
 
K
Q
 
K
G
 
A
H
 
R
A
 
A
V
 
I
T
 
A
Y
x
A
V
 
-
P
 
-
L
 
-
D
|
D
L
x
I
A
 
S
D
 
D
P
 
P
T
 
G
S
 
S
I
 
V
K
 
K
Q
 
A
F
 
L
A
 
F
E
 
A
Q
 
E
G
 
I
A
 
Q
A
 
A
Q
 
L
L
 
T
G
 
G
G
 
G
L
 
I
D
 
D
A
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
S
I
 
I
T
x
V
N
 
-
S
 
-
G
 
-
G
 
-
K
 
P
F
 
F
A
 
V
-
 
A
-
 
W
D
 
D
E
 
D
L
 
V
S
 
D
V
 
L
D
 
D
T
 
H
W
 
W
D
 
R
A
 
K
V
 
I
M
 
I
N
 
D
V
|
V
N
 
N
V
 
L
R
 
T
G
 
G
T
 
T
W
 
F
L
 
I
M
 
V
S
 
T
T
 
R
A
 
A
A
 
G
L
 
T
P
 
D
Y
 
Q
L
 
M
R
 
R
D
 
A
S
 
A
G
 
G
R
 
K
-
 
A
G
 
G
S
 
R
I
 
V
V
 
I
N
 
S
I
|
I
A
|
A
S
|
S
D
x
N
T
|
T
A
 
F
M
 
F
W
 
A
G
 
G
A
 
T
P
 
P
K
 
N
L
x
M
L
 
A
A
 
A
Y
|
Y
V
 
V
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
G
A
 
G
V
 
V
I
 
I
S
 
G
M
 
F
T
 
T
R
 
R
S
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
T
E
 
E
F
 
L
G
 
G
A
 
K
H
 
Y
Q
 
N
V
 
I
T
 
T
V
 
A
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
T
P
|
P
G
|
G
L
|
L
T
x
I
E
 
E
V
x
S
E
x
D
A
x
G
T
x
V
A
 
K
Y
 
A
V
 
S
P
 
P
-
x
H
A
 
N
E
 
E
R
 
A
H
 
F
E
 
G
Y
 
F
Y
 
V
L
 
E
Q
 
M
G
 
L
R
 
Q
A
 
A
L
 
M
T
 
K
R
 
G
A
 
K
Q
 
G
V
 
Q
P
 
P
D
 
E
D
 
H
V
 
I
T
 
A
G
 
D
P
 
V
V
 
V
L
 
S
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
D
A
 
A
R
 
R
F
 
W
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
L
 
T
L
 
L
P
 
N
V
 
V
N
 
D
G
 
A
G
 
G
F
x
M
V
 
V

3ndrA Crystal structure of tetrameric pyridoxal 4-dehydrogenase from mesorhizobium loti
37% identity, 96% coverage: 9:253/255 of query aligns to 4:245/247 of 3ndrA

query
sites
3ndrA
L
 
L
N
 
A
G
 
G
R
 
K
R
 
T
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
A
R
x
Q
G
|
G
L
x
I
G
 
G
A
 
K
A
 
A
F
 
I
V
 
A
R
 
A
S
 
R
L
 
L
V
 
A
Q
 
A
A
 
D
G
 
G
A
 
A
Q
 
T
V
 
V
V
 
I
F
 
V
G
 
S
D
|
D
V
x
I
L
 
N
H
 
A
E
 
E
E
 
G
G
 
A
R
 
K
A
 
A
L
 
A
A
 
A
A
 
A
S
 
S
L
 
I
V
 
G
E
 
K
Q
 
K
G
 
A
H
 
R
A
 
A
V
 
I
T
 
A
Y
x
A
V
 
-
P
 
-
L
 
-
D
|
D
L
x
I
A
 
S
D
 
D
P
 
P
T
 
G
S
 
S
I
 
V
K
 
K
Q
 
A
F
 
L
A
 
F
E
 
A
Q
 
E
G
 
I
A
 
Q
A
 
A
Q
 
L
L
 
T
G
 
G
G
 
G
L
 
I
D
 
D
A
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
S
I
 
I
T
x
V
N
 
-
S
 
-
G
 
-
G
 
-
K
 
P
F
 
F
A
 
V
-
 
A
-
 
W
D
 
D
E
 
D
L
 
V
S
 
D
V
 
L
D
 
D
T
 
H
W
 
W
D
 
R
A
 
K
V
 
I
M
 
I
N
 
D
V
|
V
N
 
N
V
 
L
R
 
T
G
 
G
T
 
T
W
 
F
L
 
I
M
 
V
S
 
T
T
 
R
A
 
A
A
 
G
L
 
T
P
 
D
Y
 
Q
L
 
M
R
 
R
D
 
A
S
 
A
G
 
G
R
 
K
-
 
A
G
 
G
S
 
R
I
 
V
V
 
I
N
 
S
I
|
I
A
|
A
S
|
S
D
 
N
T
 
T
A
 
F
M
 
F
W
 
A
G
 
G
A
 
T
P
 
P
K
 
N
L
 
M
L
 
A
A
 
A
Y
|
Y
V
 
V
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
G
A
 
G
V
 
V
I
 
I
S
 
G
M
 
F
T
 
T
R
 
R
S
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
T
E
 
E
F
 
L
G
 
G
A
 
K
H
 
Y
Q
 
N
V
 
I
T
 
T
V
 
A
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
T
P
|
P
G
|
G
L
|
L
T
x
I
E
 
E
V
x
S
E
x
D
A
x
G
T
x
V
A
 
K
Y
 
A
V
 
S
P
 
P
-
 
H
A
 
N
E
 
E
R
 
A
H
 
F
E
 
G
Y
 
F
Y
 
V
L
 
E
Q
 
M
G
 
L
R
 
Q
A
 
A
L
 
M
T
 
K
R
 
G
A
 
K
Q
 
G
V
 
Q
P
 
P
D
 
E
D
 
H
V
 
I
T
 
A
G
 
D
P
 
V
V
 
V
L
 
S
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
D
A
 
A
R
 
R
F
 
W
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
L
 
T
L
 
L
P
 
N
V
 
V
N
 
D
G
 
A
G
 
G
F
 
M
V
 
V

5itvA Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
33% identity, 96% coverage: 9:252/255 of query aligns to 5:252/255 of 5itvA

query
sites
5itvA
L
 
L
N
 
T
G
 
D
R
 
K
R
 
T
V
 
V
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
|
A
R
x
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
F
 
A
V
 
V
R
 
Q
S
 
A
L
 
F
V
 
L
Q
 
G
A
 
Q
G
 
Q
A
 
A
Q
 
N
V
 
V
V
 
V
F
 
V
G
 
A
D
|
D
V
x
I
L
 
D
H
 
E
E
 
A
E
 
Q
G
 
G
R
 
E
A
 
A
L
 
M
A
 
V
A
 
R
S
 
K
L
 
-
V
 
-
E
 
E
Q
 
N
G
 
N
H
 
D
A
 
R
V
 
L
T
 
H
Y
 
F
V
 
V
P
 
Q
L
x
T
D
|
D
L
x
I
A
 
T
D
 
D
P
 
E
T
 
A
S
 
A
I
 
C
K
 
Q
Q
 
H
F
 
A
A
 
V
E
 
E
Q
 
S
G
 
A
A
 
V
A
 
H
Q
 
T
L
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
 
D
A
 
V
L
 
L
I
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
G
I
|
I
T
 
E
N
 
I
S
 
V
G
 
A
G
 
P
K
 
I
F
 
H
A
 
E
D
 
M
E
 
E
L
 
L
S
 
S
V
 
-
D
 
-
T
 
D
W
 
W
D
 
N
A
 
K
V
 
V
M
 
L
N
 
Q
V
|
V
N
 
N
V
 
L
R
 
T
G
 
G
T
 
M
W
 
F
L
 
L
M
 
M
S
 
S
T
 
K
A
 
H
A
 
A
L
 
L
P
 
K
Y
 
H
L
 
M
R
 
L
D
 
A
S
 
A
G
 
G
R
 
K
G
 
G
S
 
N
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
T
A
x
C
S
|
S
D
 
V
T
 
G
A
 
G
M
 
L
W
 
V
G
 
A
A
 
W
P
 
P
K
 
D
L
 
I
L
 
P
A
 
A
Y
|
Y
V
 
N
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
G
V
 
V
I
 
L
S
 
Q
M
 
L
T
 
T
R
 
K
S
 
S
L
 
M
A
 
A
R
 
V
E
 
D
F
 
Y
G
 
A
A
 
K
H
 
H
Q
 
Q
V
 
I
T
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
I
 
V
A
 
C
P
|
P
G
|
G
L
x
I
T
x
I
E
 
D
V
x
T
E
 
P
A
x
L
T
x
N
A
 
E
Y
 
K
V
 
S
P
 
F
A
 
L
E
 
E
R
 
N
H
 
N
E
 
E
Y
 
G
Y
 
T
L
 
L
Q
 
E
G
 
E
R
 
I
A
 
K
L
 
K
T
 
E
R
 
K
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
-
 
N
-
 
P
-
 
L
-
 
L
-
 
R
-
 
L
-
 
G
-
 
K
P
 
P
D
 
E
D
 
E
V
 
I
T
 
A
G
 
N
P
 
V
V
 
M
L
 
L
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
L
A
 
S
R
 
S
F
 
Y
V
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
S
L
 
A
L
 
I
P
 
T
V
 
A
N
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
Y

8cxaA Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase from mycobacterium smegmatis with bound NAD
33% identity, 96% coverage: 9:252/255 of query aligns to 3:248/251 of 8cxaA

query
sites
8cxaA
L
 
L
N
 
A
G
 
N
R
 
R
R
 
V
V
 
A
L
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
|
A
R
x
Q
G
|
G
L
x
I
G
 
G
A
 
R
A
 
I
F
 
Y
V
 
A
R
 
E
S
 
R
L
 
F
V
 
A
Q
 
E
A
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
A
V
 
V
V
 
V
F
 
V
G
 
A
D
|
D
V
x
I
L
 
N
H
 
E
E
 
P
E
 
K
G
 
A
R
 
T
A
 
E
L
 
V
A
 
A
A
 
S
S
 
S
L
 
I
V
 
T
E
 
S
Q
 
L
G
 
G
H
 
G
A
 
R
V
 
A
T
 
I
Y
 
A
V
 
A
P
 
A
L
x
V
D
|
D
L
x
V
A
 
S
D
 
D
P
 
V
T
 
E
S
 
S
I
 
V
K
 
N
Q
 
R
F
 
M
A
 
V
E
 
D
Q
 
S
G
 
A
A
 
V
A
 
E
Q
 
A
L
 
F
G
 
G
G
 
T
L
 
V
D
 
D
A
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
|
A
I
|
I
T
x
F
N
x
S
S
 
T
-
 
L
G
 
K
G
 
M
K
 
K
F
 
P
A
 
F
D
 
E
E
 
E
L
 
I
S
 
S
V
 
G
D
 
D
T
 
E
W
 
W
D
 
D
A
 
K
V
 
L
M
 
F
N
 
A
V
|
V
N
 
N
V
 
A
R
 
K
G
 
G
T
 
T
W
 
F
L
 
L
M
 
C
S
 
C
T
 
Q
A
 
A
A
 
V
L
 
S
P
 
P
Y
 
V
L
 
M
R
 
R
D
 
K
S
 
N
G
 
Q
R
 
Y
G
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
|
I
A
x
S
S
|
S
D
 
S
T
 
V
A
 
V
M
 
V
W
 
T
G
 
G
A
 
R
P
 
P
K
 
N
L
 
Y
L
 
A
A
 
H
Y
|
Y
V
 
I
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
W
S
 
A
M
 
L
T
 
T
R
 
H
S
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
T
E
 
E
F
 
M
G
 
G
A
 
T
H
 
D
Q
 
G
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
T
I
 
V
A
 
S
P
|
P
G
x
H
-
x
G
-
x
I
L
 
I
T
 
T
E
 
E
V
x
I
E
 
P
A
 
R
T
 
E
A
 
T
Y
 
-
V
 
I
P
 
S
A
 
E
E
 
E
R
 
G
H
 
W
E
 
R
Y
 
R
Y
 
N
L
 
L
Q
 
E
G
 
E
R
 
Q
A
 
A
L
 
L
T
 
K
R
 
R
A
 
K
Q
 
G
V
 
D
P
 
A
D
 
S
D
 
D
V
 
L
T
 
V
G
 
G
P
 
I
V
 
L
L
 
L
F
 
Y
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
E
A
 
S
R
 
K
F
 
F
V
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
L
 
T
L
 
V
P
 
A
V
 
L
N
 
D
G
 
A
G
 
G
F
 
L

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
34% identity, 96% coverage: 9:254/255 of query aligns to 3:247/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
L
 
L
N
 
Q
G
 
G
R
 
K
R
 
V
V
 
A
L
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
x
S
R
|
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
A
 
R
A
 
D
F
 
I
V
 
A
R
 
I
S
 
N
L
 
L
V
 
A
Q
 
K
A
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
N
V
 
I
V
 
F
F
 
F
G
x
N
D
x
Y
V
x
N
L
x
G
H
x
S
E
 
P
E
 
E
G
 
A
R
 
A
A
 
E
L
 
E
A
 
T
A
 
A
S
 
K
L
 
L
V
 
V
-
 
A
E
 
E
Q
 
H
G
 
G
H
 
V
A
 
E
V
 
V
T
 
E
Y
 
A
V
 
M
P
 
K
L
x
A
D
x
N
L
x
V
A
 
A
D
 
I
P
 
A
T
 
E
S
 
D
I
 
V
K
 
D
Q
 
A
F
 
F
A
 
F
E
 
K
Q
 
Q
G
 
A
A
 
I
A
 
E
Q
 
R
L
 
F
G
 
G
G
 
R
L
 
V
D
 
D
A
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
G
I
|
I
T
 
T
N
 
R
S
 
D
G
 
-
G
 
-
K
 
N
F
 
L
A
 
L
D
 
M
E
 
R
L
 
M
S
 
K
V
 
E
D
 
D
T
 
E
W
 
W
D
 
D
A
 
D
V
 
V
M
 
I
N
 
N
V
x
I
N
 
N
V
 
L
R
 
K
G
 
G
T
 
T
W
 
F
L
 
L
M
 
C
S
 
T
T
 
K
A
 
A
A
 
V
L
 
S
P
 
R
Y
 
T
L
 
M
R
 
M
D
 
K
S
 
Q
G
 
R
R
 
A
G
 
G
S
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
M
A
|
A
S
|
S
D
 
V
T
 
V
A
 
G
M
 
L
W
 
I
G
 
G
A
 
N
P
 
A
K
 
G
L
x
Q
L
 
A
A
 
N
Y
|
Y
V
 
V
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
I
S
 
G
M
 
L
T
 
T
R
 
K
S
 
T
L
 
T
A
 
A
R
 
R
E
 
E
F
 
L
G
 
A
A
 
P
H
 
R
Q
 
G
V
 
I
T
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
L
 
F
T
x
I
E
 
T
V
x
T
E
 
D
A
 
M
T
 
T
A
 
D
Y
 
K
V
 
L
P
 
D
A
 
E
E
 
K
R
 
T
H
 
K
E
 
E
Y
 
A
Y
 
M
L
 
L
Q
 
A
G
 
Q
R
 
I
A
 
P
L
 
L
T
 
G
R
 
A
A
 
Y
Q
 
G
V
 
T
P
 
T
D
 
E
D
 
D
V
 
I
T
 
A
G
 
N
P
 
A
V
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
A
A
 
S
R
 
K
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
L
 
T
L
 
L
P
 
S
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
M
V
 
V
M
 
M

2d1yA Crystal structure of tt0321 from thermus thermophilus hb8 (see paper)
39% identity, 95% coverage: 11:252/255 of query aligns to 5:236/240 of 2d1yA

query
sites
2d1yA
G
 
G
R
 
K
R
 
G
V
 
V
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
|
A
R
|
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
A
 
R
A
 
A
F
 
I
V
 
A
R
 
Q
S
 
A
L
 
F
V
 
A
Q
 
R
A
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
L
V
 
V
V
 
A
F
 
L
G
 
C
D
|
D
V
 
-
L
|
L
H
x
R
E
 
P
E
 
E
G
 
G
R
 
K
A
 
E
L
 
V
A
 
A
A
 
E
S
 
A
L
 
I
V
 
-
E
 
-
Q
 
-
G
 
G
H
 
G
A
 
A
V
 
-
T
 
-
Y
 
F
V
 
F
P
 
Q
L
x
V
D
|
D
L
|
L
A
 
E
D
 
D
P
 
E
T
 
R
S
 
E
I
 
R
K
 
V
Q
 
R
F
 
F
A
 
V
E
 
E
Q
 
E
G
 
A
A
 
A
A
 
Y
Q
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
R
L
 
V
D
 
D
A
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
|
A
I
|
I
T
 
A
N
 
A
S
 
P
G
 
G
G
 
S
K
 
A
F
 
L
A
 
T
D
 
V
E
 
R
L
 
L
S
 
P
V
 
-
D
 
-
T
 
E
W
 
W
D
 
R
A
 
R
V
 
V
M
 
L
N
 
E
V
|
V
N
 
N
V
 
L
R
 
T
G
 
A
T
 
P
W
 
M
L
 
H
M
 
L
S
 
S
T
 
A
A
 
L
A
 
A
L
 
A
P
 
R
Y
 
E
L
 
M
R
 
R
D
 
K
S
 
V
G
 
G
R
 
G
G
 
G
S
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
V
A
|
A
S
|
S
D
 
V
T
 
Q
A
 
G
M
 
L
W
 
F
G
 
A
A
 
E
P
 
Q
K
 
E
L
x
N
L
 
A
A
 
A
Y
|
Y
V
 
N
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
G
V
 
L
I
 
V
S
 
N
M
 
L
T
 
T
R
 
R
S
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
L
E
 
D
F
 
L
G
 
A
A
 
P
H
 
L
Q
 
R
V
 
I
T
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
L
x
A
T
x
I
E
 
A
V
x
T
E
 
E
A
|
A
T
x
V
A
 
L
Y
 
E
V
 
A
P
 
I
A
 
A
E
 
R
R
 
R
H
 
D
E
 
W
Y
 
E
Y
 
D
L
 
L
Q
 
H
G
 
-
R
 
-
A
 
A
L
 
L
T
 
R
R
 
R
A
 
L
Q
 
G
V
 
K
P
 
P
D
 
E
D
 
E
V
 
V
T
 
A
G
 
E
P
 
A
V
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
E
A
 
K
A
 
A
R
 
S
F
 
F
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
A
L
 
I
L
 
L
P
 
P
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
M

7tzpG Crystal structure of putataive short-chain dehydrogenase/reductase (fabg) from klebsiella pneumoniae subsp. Pneumoniae ntuh-k2044 in complex with nadh (see paper)
35% identity, 96% coverage: 9:254/255 of query aligns to 6:247/247 of 7tzpG

query
sites
7tzpG
L
 
L
N
 
A
G
 
S
R
 
K
R
 
T
V
 
A
L
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
|
A
R
|
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
A
 
F
A
 
G
F
 
I
V
 
A
R
 
Q
S
 
V
L
 
L
V
 
A
Q
 
R
A
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
R
V
 
V
V
 
I
F
 
I
G
 
A
D
|
D
V
 
-
L
x
R
H
 
D
E
 
A
E
 
H
G
 
G
R
 
E
A
 
A
L
 
A
A
 
A
A
 
A
S
 
S
L
 
L
V
 
R
E
 
E
Q
 
S
G
 
G
H
 
A
A
 
Q
V
 
A
T
 
L
Y
 
F
V
 
I
P
 
S
L
x
C
D
x
N
L
x
I
A
 
A
D
 
E
P
 
K
T
 
T
S
 
Q
I
 
V
K
 
E
Q
 
A
F
 
L
A
 
F
E
 
S
Q
 
Q
G
 
A
A
 
E
A
 
E
Q
 
A
L
 
F
G
 
G
G
 
P
L
 
V
D
 
D
A
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
G
I
|
I
T
 
N
N
 
R
S
 
D
G
 
A
G
 
-
K
 
-
F
 
M
A
 
L
D
 
H
E
 
K
L
 
L
S
 
T
V
 
E
D
 
A
T
 
D
W
 
W
D
 
D
A
 
T
V
 
V
M
 
I
N
 
D
V
|
V
N
 
N
V
 
L
R
 
K
G
 
G
T
 
T
W
 
F
L
 
L
M
 
C
S
 
M
T
 
Q
A
 
Q
A
 
A
L
 
A
P
 
I
Y
 
R
L
 
M
R
 
R
D
 
E
S
 
R
G
 
G
R
 
A
G
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
|
I
A
 
A
S
|
S
D
 
-
T
 
-
A
 
A
M
 
S
W
 
W
-
 
L
G
 
G
A
 
N
P
 
V
K
 
G
L
 
Q
L
 
T
A
 
N
Y
|
Y
V
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
V
S
 
G
M
 
M
T
 
T
R
 
K
S
 
T
L
 
A
A
 
C
R
 
R
E
 
E
F
 
L
G
 
A
A
 
K
H
 
K
Q
 
G
V
 
V
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
C
P
|
P
G
|
G
L
x
F
T
x
I
E
 
D
V
x
T
E
 
D
A
x
M
T
|
T
A
 
R
Y
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
E
E
 
N
R
 
V
H
 
W
E
 
Q
Y
 
I
Y
 
M
L
 
V
Q
 
S
G
 
K
R
 
I
A
 
P
L
 
A
T
 
G
R
 
Y
A
 
A
Q
 
G
V
 
E
P
 
A
D
 
K
D
 
D
V
 
V
T
 
G
G
 
E
P
 
C
V
 
V
L
 
A
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
G
A
 
A
R
 
R
F
 
Y
V
 
I
T
 
N
G
 
G
Q
 
E
L
 
V
L
 
I
P
 
N
V
 
V
N
 
G
G
 
G
G
 
G
F
 
M
V
 
V
M
 
L

3ak4A Crystal structure of nadh-dependent quinuclidinone reductase from agrobacterium tumefaciens
36% identity, 97% coverage: 9:255/255 of query aligns to 5:258/258 of 3ak4A

query
sites
3ak4A
L
 
L
N
 
S
G
 
G
R
 
R
R
 
K
V
 
A
L
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
x
S
R
x
K
G
|
G
L
x
I
G
 
G
A
 
A
A
 
A
F
 
I
V
 
A
R
 
R
S
 
A
L
 
L
V
 
D
Q
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
T
V
 
V
V
 
A
F
 
I
G
 
A
D
|
D
V
x
L
L
 
D
H
 
V
E
 
M
E
 
A
G
 
A
R
 
Q
A
 
A
L
 
V
A
 
V
A
 
A
S
 
G
L
 
L
V
 
E
E
 
N
Q
 
G
G
 
G
H
 
F
A
 
A
V
 
V
T
 
-
Y
 
-
V
 
-
P
 
E
L
x
V
D
|
D
L
x
V
A
 
T
D
 
K
P
 
R
T
 
A
S
 
S
I
 
V
K
 
D
Q
 
A
F
 
A
A
 
M
E
 
Q
Q
 
K
G
 
A
A
 
I
A
 
D
Q
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
F
D
 
D
A
 
L
L
 
L
I
 
C
N
 
A
N
|
N
A
|
A
A
x
G
I
x
V
T
 
S
N
 
T
S
 
M
G
 
-
G
 
-
K
 
R
F
 
P
A
 
A
D
 
V
E
 
D
L
 
I
S
 
T
V
 
D
D
 
E
T
 
E
W
 
W
D
 
D
A
 
F
V
 
N
M
 
F
N
 
D
V
|
V
N
 
N
V
 
A
R
 
R
G
 
G
T
 
V
W
 
F
L
 
L
M
 
A
S
 
N
T
 
Q
A
 
I
A
 
A
L
 
C
P
 
R
-
 
H
Y
 
F
L
 
L
R
 
A
D
 
S
S
 
N
G
 
T
R
 
K
G
 
G
S
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
T
A
|
A
S
|
S
D
 
L
T
 
A
A
 
A
M
 
K
W
 
V
G
 
G
A
 
A
P
 
P
K
 
L
L
|
L
L
 
A
A
 
H
Y
|
Y
V
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
F
A
 
A
V
 
V
I
 
F
S
 
G
M
 
W
T
 
T
R
 
Q
S
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
F
 
M
G
 
A
A
 
P
H
 
K
Q
 
N
V
 
I
T
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
I
 
V
A
 
C
P
|
P
G
|
G
L
x
F
T
x
V
-
 
K
-
x
T
-
 
A
-
x
M
-
 
Q
-
 
E
-
x
R
-
 
E
-
 
I
-
 
I
-
 
W
E
|
E
V
 
A
E
 
E
A
 
L
T
 
R
A
 
G
Y
 
M
V
 
T
P
 
P
A
 
E
E
 
A
R
 
V
H
 
R
E
 
A
Y
 
E
Y
 
Y
L
 
V
Q
 
S
G
 
L
R
 
T
A
 
P
L
 
L
T
 
G
R
 
R
A
 
I
Q
 
E
V
 
E
P
 
P
D
 
E
D
 
D
V
 
V
T
 
A
G
 
D
P
 
V
V
 
V
L
 
V
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
R
F
 
F
V
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
L
 
G
L
 
I
P
 
N
V
 
V
N
 
T
G
 
G
G
 
G
F
 
V
V
 
R
M
 
M
N
 
D

7pcsB Structure of the heterotetrameric sdr family member bbscd (see paper)
34% identity, 95% coverage: 9:251/255 of query aligns to 2:241/247 of 7pcsB

query
sites
7pcsB
L
 
I
N
 
Q
G
 
N
R
 
R
R
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
S
A
 
A
R
x
S
G
 
G
L
x
M
G
 
G
A
 
K
A
 
Q
F
 
T
V
 
A
R
 
L
S
 
R
L
 
F
V
 
A
Q
 
E
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
Q
 
A
V
 
V
V
 
V
F
 
I
G
 
N
D
|
D
V
x
I
L
 
D
H
 
A
E
 
E
E
 
K
G
 
V
R
 
R
A
 
A
L
 
T
A
 
V
A
 
D
S
 
E
L
 
F
V
 
S
E
 
A
Q
 
R
G
 
G
H
 
H
A
 
R
V
 
V
T
 
L
Y
 
G
V
 
A
P
 
V
L
x
A
D
|
D
L
x
I
A
 
G
D
 
N
P
 
K
T
 
A
S
 
A
I
 
V
K
 
D
Q
 
G
F
 
M
A
 
V
E
 
K
Q
 
Q
G
 
T
A
 
I
A
 
D
Q
 
A
L
 
F
G
 
G
G
 
R
L
 
I
D
 
D
A
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
G
I
 
M
T
 
E
N
 
R
S
 
A
G
 
G
G
 
A
K
 
-
F
 
-
A
 
L
D
 
R
E
 
K
L
 
L
S
 
S
V
 
E
D
 
A
T
 
D
W
 
W
D
 
D
A
 
V
V
 
T
M
 
I
N
 
N
V
|
V
N
|
N
V
 
L
R
 
K
G
 
G
T
 
T
W
 
F
L
 
L
M
 
C
S
 
T
T
 
Q
A
 
A
A
 
V
L
 
H
P
 
G
Y
 
H
L
 
M
R
 
V
D
 
E
S
 
N
G
 
K
R
 
H
G
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
|
I
A
|
A
S
|
S
D
 
R
T
 
A
A
 
W
M
 
L
W
 
G
G
 
G
A
 
A
P
 
G
K
 
Q
L
 
T
L
 
-
A
 
P
Y
|
Y
V
 
S
A
 
S
S
 
A
K
|
K
G
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
V
S
 
G
M
 
M
T
 
T
R
 
R
S
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
I
E
 
E
F
 
L
G
 
G
A
 
R
H
 
A
Q
 
G
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
C
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
L
 
L
T
x
I
E
 
H
V
 
T
E
 
P
A
x
M
T
 
W
A
 
D
Y
 
E
V
 
L
P
 
P
A
 
E
E
 
K
R
 
D
H
 
Q
E
 
Q
Y
 
F
Y
 
L
L
 
L
Q
 
S
G
 
R
R
 
Q
A
 
P
L
 
T
T
 
G
R
 
K
A
 
L
Q
 
G
V
 
E
P
 
P
D
 
D
D
 
D
V
 
I
T
 
A
G
 
N
P
 
T
V
 
L
L
 
L
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
D
D
 
D
A
 
D
A
 
S
R
 
G
F
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
L
 
V
L
 
L
P
 
Y
V
 
V
N
 
C
G
 
G
G
 
G

Q9KJF1 (2S)-[(R)-hydroxy(phenyl)methyl]succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; (S,R)-2-(alpha-hydroxybenzyl)succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; EC 1.1.1.429 from Thauera aromatica (see 2 papers)
34% identity, 95% coverage: 9:251/255 of query aligns to 3:242/248 of Q9KJF1

query
sites
Q9KJF1
L
 
I
N
 
Q
G
 
N
R
 
R
R
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
S
A
 
A
R
x
S
G
 
G
L
 
M
G
 
G
A
 
K
A
 
Q
F
 
T
V
 
A
R
 
L
S
 
R
L
 
F
V
 
A
Q
 
E
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
Q
 
A
V
 
V
V
 
V
F
 
I
G
 
N
D
|
D
V
 
I
L
 
D
H
 
A
E
 
E
E
 
K
G
 
V
R
 
R
A
 
A
L
 
T
A
 
V
A
 
D
S
 
E
L
 
F
V
 
S
E
 
A
Q
 
R
G
 
G
H
 
H
A
 
R
V
 
V
T
 
L
Y
 
G
V
 
A
P
 
V
L
 
A
D
|
D
L
x
I
A
 
G
D
 
N
P
 
K
T
 
A
S
 
A
I
 
V
K
 
D
Q
 
G
F
 
M
A
 
V
E
 
K
Q
 
Q
G
 
T
A
 
I
A
 
D
Q
 
A
L
 
F
G
 
G
G
 
R
L
 
I
D
 
D
A
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
 
G
I
 
M
T
 
E
N
 
R
S
 
A
G
 
G
G
 
A
K
 
-
F
 
-
A
 
L
D
 
R
E
 
K
L
 
L
S
 
S
V
 
E
D
 
A
T
 
D
W
 
W
D
 
D
A
 
V
V
 
T
M
 
I
N
 
N
V
 
V
N
 
N
V
 
L
R
 
K
G
 
G
T
 
T
W
 
F
L
 
L
M
 
C
S
 
T
T
 
Q
A
 
A
A
 
V
L
 
H
P
 
G
Y
 
H
L
 
M
R
 
V
D
 
E
S
 
N
G
 
K
R
 
H
G
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
I
A
 
A
S
 
S
D
 
R
T
 
A
A
 
W
M
 
L
W
 
G
G
 
G
A
 
A
P
 
G
K
 
Q
L
 
T
L
 
-
A
 
P
Y
|
Y
V
 
S
A
 
S
S
 
A
K
|
K
G
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
V
S
 
G
M
 
M
T
 
T
R
 
R
S
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
I
E
 
E
F
 
L
G
 
G
A
 
R
H
 
A
Q
 
G
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
C
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
L
 
L
T
 
I
E
 
H
V
 
T
E
 
P
A
 
M
T
 
W
A
 
D
Y
 
E
V
 
L
P
 
P
A
 
E
E
 
K
R
 
D
H
 
Q
E
 
Q
Y
 
F
Y
 
L
L
 
L
Q
 
S
G
 
R
R
 
Q
A
 
P
L
 
T
T
 
G
R
 
K
A
 
L
Q
 
G
V
 
E
P
 
P
D
 
D
D
 
D
V
 
I
T
 
A
G
 
N
P
 
T
V
 
L
L
 
L
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
D
D
 
D
A
 
D
A
 
S
R
 
G
F
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
L
 
V
L
 
L
P
 
Y
V
 
V
N
 
C
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

5ha5D Crystal structure of an NAD-bound oxidoreductase from brucella ovis
33% identity, 96% coverage: 9:253/255 of query aligns to 4:242/244 of 5ha5D

query
sites
5ha5D
L
 
L
N
 
K
G
 
E
R
 
K
R
 
L
V
 
V
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
G
R
|
R
G
|
G
L
|
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
F
 
I
V
 
S
R
 
S
S
 
G
L
 
A
V
 
A
Q
 
E
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
Q
 
R
V
 
V
V
 
I
F
 
L
G
 
V
D
|
D
V
x
I
L
 
D
H
 
G
E
 
T
E
 
A
G
 
A
R
 
K
A
 
A
L
 
Q
A
 
A
A
 
D
S
 
A
L
 
L
V
 
T
E
 
A
Q