SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing BWI76_RS00585 FitnessBrowser__Koxy:BWI76_RS00585 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4dxvA Crystal structure of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii complexed with mg and cl ions at 1.80 a resolution
30% identity, 72% coverage: 3:223/307 of query aligns to 1:215/291 of 4dxvA

query
sites
4dxvA
T
 
T
I
 
I
N
 
Q
G
 
G
I
 
S
V
 
I
P
 
V
V
 
A
M
 
I
L
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
A
 
L
A
 
K
D
 
D
E
 
G
R
 
G
I
 
V
D
 
D
Y
 
W
P
 
K
A
 
S
L
 
L
A
 
E
K
 
K
L
 
L
I
 
V
D
 
E
W
 
W
Y
 
H
L
 
I
E
 
E
K
 
Q
G
 
G
V
 
T
D
 
N
A
 
S
L
 
I
F
 
V
A
 
A
V
 
V
C
 
G
Q
x
T
S
 
T
S
 
G
E
 
E
M
 
A
Q
 
S
F
 
T
L
 
L
S
 
S
L
 
M
E
 
E
E
 
E
R
 
H
V
 
T
E
 
Q
L
 
V
A
 
I
R
 
K
F
 
E
V
 
I
V
 
I
Q
 
R
R
 
V
V
 
A
N
 
N
G
 
K
R
 
R
I
 
I
P
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
A
S
 
G
G
 
T
H
 
G
I
 
A
S
 
N
D
 
S
D
 
T
I
 
R
E
 
E
A
 
A
Q
 
-
K
 
-
A
 
I
E
 
E
L
 
L
L
 
T
A
 
K
M
 
A
A
 
A
Q
 
K
T
 
D
-
 
L
G
 
G
I
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
A
V
 
L
L
 
L
V
 
V
T
|
T
N
 
P
H
 
Y
L
x
Y
D
 
N
-
 
K
P
 
P
R
 
T
N
 
Q
E
 
E
G
 
G
S
 
L
D
 
Y
V
 
Q
F
 
H
Y
 
Y
A
 
K
V
 
A
L
 
I
N
 
A
T
 
E
L
 
A
L
 
V
E
 
E
T
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
-
S
 
-
L
 
L
P
 
P
L
 
L
G
 
I
L
 
L
Y
|
Y
E
x
N
C
x
V
P
|
P
A
 
G
P
x
R
Y
x
T
R
 
G
R
 
V
L
 
D
L
 
L
T
 
S
D
 
N
D
 
D
E
 
T
F
 
A
T
 
V
W
 
R
C
 
L
A
 
A
N
 
E
S
 
I
G
 
P
R
 
N
F
 
I
V
 
V
V
 
G
L
 
I
K
|
K
D
 
D
V
 
A
S
 
T
C
 
G
D
 
D
L
 
V
P
 
P
T
 
R
V
 
G
E
 
K
R
 
A
R
 
L
V
 
I
R
 
D
L
 
A
A
 
L
Q
 
N
G
 
G
T
 
K
P
 
-
L
 
M
N
 
A
V
 
V
I
 
Y
N
 
S
A
 
G
N
 
D
A
 
D
A
 
E
I
 
T
A
 
A
W
 
W
P
 
E
A
 
L
I
 
M
L
 
L
A
 
L
G
 
G
S
 
A
Q
 
D
G
 
G
F
 
N
S
x
I
G
 
S
V
 
V
F
 
T
T
 
A
N
 
N
F
 
I
H
 
A
P
 
P
E
 
K
L
 
A
Y
 
M
S
 
S

3u8gA Crystal structure of the complex of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with oxalic acid at 1.80 a resolution
30% identity, 72% coverage: 3:223/307 of query aligns to 1:215/291 of 3u8gA

query
sites
3u8gA
T
 
T
I
 
I
N
 
Q
G
 
G
I
 
S
V
 
I
P
 
V
V
x
A
M
 
I
L
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
A
 
L
A
 
K
D
 
D
E
 
G
R
 
G
I
 
V
D
 
D
Y
 
W
P
 
K
A
 
S
L
 
L
A
 
E
K
 
K
L
 
L
I
 
V
D
 
E
W
 
W
Y
 
H
L
 
I
E
 
E
K
 
Q
G
 
G
V
 
T
D
 
N
A
 
S
L
 
I
F
 
V
A
 
A
V
 
V
C
x
G
Q
x
T
S
x
T
S
 
G
E
 
E
M
 
A
Q
 
S
F
 
T
L
 
L
S
 
S
L
 
M
E
 
E
E
 
E
R
 
H
V
 
T
E
 
Q
L
 
V
A
 
I
R
 
K
F
 
E
V
 
I
V
 
I
Q
 
R
R
 
V
V
 
A
N
 
N
G
 
K
R
 
R
I
 
I
P
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
A
S
 
G
G
 
T
H
 
G
I
 
A
S
 
N
D
 
S
D
 
T
I
 
R
E
 
E
A
 
A
Q
 
-
K
 
-
A
 
I
E
 
E
L
 
L
L
 
T
A
 
K
M
 
A
A
 
A
Q
 
K
T
 
D
-
 
L
G
 
G
I
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
A
V
x
L
L
 
L
V
 
V
T
 
T
N
 
P
H
 
Y
L
x
Y
D
 
N
-
 
K
P
 
P
R
 
T
N
 
Q
E
 
E
G
 
G
S
 
L
D
 
Y
V
 
Q
F
 
H
Y
 
Y
A
 
K
V
 
A
L
 
I
N
 
A
T
 
E
L
 
A
L
 
V
E
 
E
T
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
-
S
 
-
L
 
L
P
 
P
L
 
L
G
 
I
L
 
L
Y
|
Y
E
 
N
C
 
V
P
 
P
A
 
G
P
x
R
Y
 
T
R
 
G
R
 
V
L
 
D
L
 
L
T
 
S
D
 
N
D
 
D
E
 
T
F
 
A
T
 
V
W
 
R
C
 
L
A
 
A
N
 
E
S
 
I
G
 
P
R
 
N
F
 
I
V
 
V
V
 
G
L
 
I
K
|
K
D
 
D
V
 
A
S
 
T
C
 
G
D
 
D
L
 
V
P
 
P
T
 
R
V
 
G
E
 
K
R
 
A
R
 
L
V
 
I
R
 
D
L
 
A
A
 
L
Q
 
N
G
 
G
T
 
K
P
 
-
L
 
M
N
 
A
V
 
V
I
 
Y
N
 
S
A
 
G
N
 
D
A
 
D
A
 
E
I
 
T
A
 
A
W
 
W
P
 
E
A
 
L
I
 
M
L
 
L
A
 
L
G
 
G
S
 
A
Q
 
D
G
 
G
F
 
N
S
x
I
G
 
S
V
 
V
F
 
T
T
 
A
N
 
N
F
 
I
H
 
A
P
 
P
E
 
K
L
 
A
Y
 
M
S
 
S

3tdfA Crystal structure of the complex of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with 2-ketobutanoic acid at 1.99 a resolution
30% identity, 72% coverage: 3:223/307 of query aligns to 1:215/291 of 3tdfA

query
sites
3tdfA
T
 
T
I
 
I
N
 
Q
G
 
G
I
 
S
V
 
I
P
 
V
V
x
A
M
 
I
L
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
A
 
L
A
 
K
D
 
D
E
 
G
R
 
G
I
 
V
D
 
D
Y
 
W
P
 
K
A
 
S
L
 
L
A
 
E
K
 
K
L
 
L
I
 
V
D
 
E
W
 
W
Y
 
H
L
 
I
E
 
E
K
 
Q
G
 
G
V
 
T
D
 
N
A
 
S
L
 
I
F
 
V
A
 
A
V
 
V
C
 
G
Q
x
T
S
x
T
S
 
G
E
 
E
M
 
A
Q
 
S
F
 
T
L
 
L
S
 
S
L
 
M
E
 
E
E
 
E
R
 
H
V
 
T
E
 
Q
L
 
V
A
 
I
R
 
K
F
 
E
V
 
I
V
 
I
Q
 
R
R
 
V
V
 
A
N
 
N
G
 
K
R
 
R
I
 
I
P
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
A
S
 
G
G
 
T
H
 
G
I
 
A
S
 
N
D
 
S
D
 
T
I
 
R
E
 
E
A
 
A
Q
 
-
K
 
-
A
 
I
E
 
E
L
 
L
L
 
T
A
 
K
M
 
A
A
 
A
Q
 
K
T
 
D
-
 
L
G
 
G
I
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
A
V
 
L
L
 
L
V
 
V
T
 
T
N
 
P
H
 
Y
L
x
Y
D
 
N
-
 
K
P
 
P
R
 
T
N
 
Q
E
 
E
G
 
G
S
 
L
D
 
Y
V
 
Q
F
 
H
Y
 
Y
A
 
K
V
 
A
L
 
I
N
 
A
T
 
E
L
 
A
L
 
V
E
 
E
T
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
-
S
 
-
L
 
L
P
 
P
L
 
L
G
 
I
L
 
L
Y
|
Y
E
 
N
C
 
V
P
 
P
A
 
G
P
x
R
Y
 
T
R
 
G
R
 
V
L
 
D
L
 
L
T
 
S
D
 
N
D
 
D
E
 
T
F
 
A
T
 
V
W
 
R
C
 
L
A
 
A
N
 
E
S
 
I
G
 
P
R
 
N
F
 
I
V
 
V
V
 
G
L
 
I
K
|
K
D
 
D
V
 
A
S
 
T
C
 
G
D
 
D
L
 
V
P
 
P
T
 
R
V
 
G
E
 
K
R
 
A
R
 
L
V
 
I
R
 
D
L
 
A
A
 
L
Q
 
N
G
 
G
T
 
K
P
 
-
L
 
M
N
 
A
V
 
V
I
 
Y
N
 
S
A
 
G
N
 
D
A
 
D
A
 
E
I
 
T
A
 
A
W
 
W
P
 
E
A
 
L
I
 
M
L
 
L
A
 
L
G
 
G
S
 
A
Q
 
D
G
 
G
F
 
N
S
x
I
G
 
S
V
 
V
F
 
T
T
 
A
N
 
N
F
 
I
H
 
A
P
 
P
E
 
K
L
 
A
Y
 
M
S
 
S

3tceA Crystal structure of the complex of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with 5-hydroxylysine at 2.6 a resolution
30% identity, 72% coverage: 3:223/307 of query aligns to 1:215/291 of 3tceA

query
sites
3tceA
T
 
T
I
 
I
N
 
Q
G
 
G
I
 
S
V
 
I
P
 
V
V
 
A
M
 
I
L
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
A
 
L
A
 
K
D
 
D
E
 
G
R
 
G
I
 
V
D
 
D
Y
 
W
P
 
K
A
 
S
L
 
L
A
 
E
K
 
K
L
 
L
I
 
V
D
 
E
W
 
W
Y
 
H
L
 
I
E
 
E
K
 
Q
G
 
G
V
 
T
D
 
N
A
 
S
L
 
I
F
 
V
A
 
A
V
 
V
C
 
G
Q
x
T
S
 
T
S
 
G
E
 
E
M
 
A
Q
x
S
F
 
T
L
|
L
S
 
S
L
 
M
E
 
E
E
 
E
R
x
H
V
 
T
E
 
Q
L
 
V
A
 
I
R
 
K
F
 
E
V
 
I
V
 
I
Q
 
R
R
 
V
V
 
A
N
 
N
G
 
K
R
 
R
I
 
I
P
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
A
S
 
G
G
 
T
H
 
G
I
 
A
S
 
N
D
 
S
D
 
T
I
 
R
E
 
E
A
 
A
Q
 
-
K
 
-
A
 
I
E
 
E
L
 
L
L
 
T
A
 
K
M
 
A
A
 
A
Q
 
K
T
 
D
-
 
L
G
 
G
I
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
A
V
 
L
L
 
L
V
 
V
T
 
T
N
 
P
H
x
Y
L
x
Y
D
 
N
-
 
K
P
 
P
R
 
T
N
 
Q
E
 
E
G
 
G
S
 
L
D
 
Y
V
 
Q
F
 
H
Y
 
Y
A
 
K
V
 
A
L
 
I
N
 
A
T
 
E
L
 
A
L
 
V
E
 
E
T
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
-
S
 
-
L
 
L
P
 
P
L
 
L
G
 
I
L
 
L
Y
|
Y
E
 
N
C
 
V
P
 
P
A
 
G
P
x
R
Y
 
T
R
 
G
R
 
V
L
 
D
L
 
L
T
 
S
D
 
N
D
 
D
E
 
T
F
 
A
T
 
V
W
 
R
C
 
L
A
 
A
N
 
E
S
 
I
G
 
P
R
 
N
F
 
I
V
 
V
V
 
G
L
 
I
K
|
K
D
 
D
V
 
A
S
 
T
C
 
G
D
 
D
L
 
V
P
 
P
T
 
R
V
 
G
E
 
K
R
 
A
R
 
L
V
 
I
R
 
D
L
 
A
A
 
L
Q
 
N
G
 
G
T
 
K
P
 
-
L
 
M
N
 
A
V
 
V
I
 
Y
N
 
S
A
 
G
N
 
D
A
 
D
A
 
E
I
 
T
A
 
A
W
 
W
P
 
E
A
 
L
I
 
M
L
 
L
A
 
L
G
 
G
S
 
A
Q
 
D
G
 
G
F
 
N
S
x
I
G
 
S
V
 
V
F
 
T
T
 
A
N
 
N
F
 
I
H
 
A
P
 
P
E
 
K
L
 
A
Y
 
M
S
 
S

3rk8A Crystal structure of the chloride inhibited dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii complexed with pyruvate at 1.8 a resolution
30% identity, 72% coverage: 3:223/307 of query aligns to 1:215/291 of 3rk8A

query
sites
3rk8A
T
 
T
I
 
I
N
 
Q
G
 
G
I
 
S
V
 
I
P
 
V
V
 
A
M
 
I
L
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
A
 
L
A
 
K
D
 
D
E
 
G
R
 
G
I
 
V
D
 
D
Y
 
W
P
 
K
A
 
S
L
 
L
A
 
E
K
 
K
L
 
L
I
 
V
D
 
E
W
 
W
Y
 
H
L
 
I
E
 
E
K
 
Q
G
 
G
V
 
T
D
 
N
A
 
S
L
 
I
F
 
V
A
 
A
V
 
V
C
 
G
Q
x
T
S
 
T
S
 
G
E
 
E
M
 
A
Q
 
S
F
 
T
L
 
L
S
 
S
L
 
M
E
 
E
E
 
E
R
 
H
V
 
T
E
 
Q
L
 
V
A
 
I
R
 
K
F
 
E
V
 
I
V
 
I
Q
 
R
R
 
V
V
 
A
N
 
N
G
 
K
R
 
R
I
 
I
P
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
A
S
 
G
G
 
T
H
 
G
I
 
A
S
 
N
D
 
S
D
 
T
I
 
R
E
 
E
A
 
A
Q
 
-
K
 
-
A
 
I
E
 
E
L
 
L
L
 
T
A
 
K
M
 
A
A
 
A
Q
 
K
T
 
D
-
 
L
G
 
G
I
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
A
V
 
L
L
 
L
V
 
V
T
 
T
N
 
P
H
 
Y
L
x
Y
D
 
N
-
 
K
P
 
P
R
 
T
N
 
Q
E
 
E
G
 
G
S
 
L
D
 
Y
V
 
Q
F
 
H
Y
 
Y
A
 
K
V
 
A
L
 
I
N
 
A
T
 
E
L
 
A
L
 
V
E
 
E
T
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
-
S
 
-
L
 
L
P
 
P
L
 
L
G
 
I
L
 
L
Y
|
Y
E
 
N
C
 
V
P
 
P
A
 
G
P
x
R
Y
 
T
R
 
G
R
 
V
L
 
D
L
 
L
T
 
S
D
 
N
D
 
D
E
 
T
F
 
A
T
 
V
W
 
R
C
 
L
A
 
A
N
 
E
S
 
I
G
 
P
R
 
N
F
 
I
V
 
V
V
 
G
L
 
I
K
|
K
D
 
D
V
 
A
S
 
T
C
 
G
D
 
D
L
 
V
P
 
P
T
 
R
V
 
G
E
 
K
R
 
A
R
 
L
V
 
I
R
 
D
L
 
A
A
 
L
Q
 
N
G
 
G
T
 
K
P
 
-
L
 
M
N
 
A
V
 
V
I
 
Y
N
 
S
A
x
G
N
 
D
A
 
D
A
 
E
I
 
T
A
 
A
W
 
W
P
 
E
A
 
L
I
 
M
L
 
L
A
 
L
G
 
G
S
 
A
Q
 
D
G
 
G
F
 
N
S
x
I
G
 
S
V
 
V
F
 
T
T
 
A
N
 
N
F
 
I
H
 
A
P
 
P
E
 
K
L
 
A
Y
 
M
S
 
S

Sites not aligning to the query:

3pueB Crystal structure of the complex of dhydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with lysine at 2.6a resolution
30% identity, 72% coverage: 3:223/307 of query aligns to 1:215/291 of 3pueB

query
sites
3pueB
T
 
T
I
 
I
N
 
Q
G
 
G
I
 
S
V
 
I
P
 
V
V
 
A
M
 
I
L
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
A
 
L
A
 
K
D
 
D
E
 
G
R
 
G
I
 
V
D
 
D
Y
 
W
P
 
K
A
 
S
L
 
L
A
 
E
K
 
K
L
 
L
I
 
V
D
 
E
W
 
W
Y
 
H
L
 
I
E
 
E
K
 
Q
G
 
G
V
 
T
D
 
N
A
 
S
L
 
I
F
 
V
A
 
A
V
 
V
C
 
G
Q
x
T
S
 
T
S
 
G
E
 
E
M
 
A
Q
 
S
F
 
T
L
 
L
S
 
S
L
 
M
E
 
E
E
 
E
R
 
H
V
 
T
E
 
Q
L
 
V
A
 
I
R
 
K
F
 
E
V
 
I
V
 
I
Q
 
R
R
 
V
V
 
A
N
 
N
G
 
K
R
 
R
I
 
I
P
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
A
S
 
G
G
 
T
H
 
G
I
 
A
S
 
N
D
 
S
D
 
T
I
 
R
E
 
E
A
 
A
Q
 
-
K
 
-
A
 
I
E
 
E
L
 
L
L
 
T
A
 
K
M
 
A
A
 
A
Q
 
K
T
 
D
-
 
L
G
 
G
I
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
A
V
 
L
L
 
L
V
 
V
T
 
T
N
 
P
H
 
Y
L
x
Y
D
 
N
-
 
K
P
 
P
R
 
T
N
 
Q
E
 
E
G
 
G
S
 
L
D
 
Y
V
 
Q
F
 
H
Y
 
Y
A
 
K
V
 
A
L
 
I
N
 
A
T
 
E
L
 
A
L
 
V
E
 
E
T
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
-
S
 
-
L
 
L
P
 
P
L
 
L
G
 
I
L
 
L
Y
|
Y
E
 
N
C
 
V
P
 
P
A
 
G
P
x
R
Y
 
T
R
 
G
R
 
V
L
 
D
L
 
L
T
 
S
D
 
N
D
 
D
E
 
T
F
 
A
T
 
V
W
 
R
C
 
L
A
 
A
N
 
E
S
 
I
G
 
P
R
 
N
F
 
I
V
 
V
V
 
G
L
 
I
K
|
K
D
 
D
V
 
A
S
 
T
C
 
G
D
 
D
L
 
V
P
 
P
T
 
R
V
 
G
E
 
K
R
 
A
R
 
L
V
 
I
R
 
D
L
 
A
A
 
L
Q
 
N
G
 
G
T
 
K
P
 
-
L
 
M
N
 
A
V
 
V
I
 
Y
N
 
S
A
 
G
N
 
D
A
 
D
A
 
E
I
 
T
A
 
A
W
 
W
P
 
E
A
 
L
I
 
M
L
 
L
A
 
L
G
 
G
S
 
A
Q
 
D
G
 
G
F
 
N
S
x
I
G
 
S
V
 
V
F
 
T
T
 
A
N
 
N
F
 
I
H
 
A
P
 
P
E
 
K
L
 
A
Y
 
M
S
 
S

Sites not aligning to the query:

8u8wA Crystal structure of n-acetylneuraminate lyase (nana) from klebsiella aerogenes (pyruvate and halides bound)
29% identity, 69% coverage: 4:216/307 of query aligns to 6:212/297 of 8u8wA

query
sites
8u8wA
I
 
L
N
 
R
G
 
G
I
 
V
V
 
M
P
 
P
V
x
A
M
 
L
L
 
L
T
 
T
P
 
P
F
 
F
A
 
D
A
 
A
D
 
Q
E
 
Q
R
 
N
I
 
I
D
 
D
Y
 
R
P
 
A
A
 
S
L
 
L
A
 
R
K
 
R
L
 
L
I
 
V
D
 
R
W
 
F
Y
 
N
L
 
I
E
 
E
K
 
Q
G
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
G
L
 
V
F
 
Y
A
 
V
V
 
G
C
x
G
Q
x
S
S
x
T
S
 
G
E
 
E
M
 
A
Q
 
F
F
 
V
L
 
Q
S
 
S
L
 
L
E
 
S
E
 
E
R
 
R
V
 
E
E
 
E
L
 
V
A
 
L
R
 
E
F
 
I
V
 
V
V
 
A
Q
 
E
R
 
E
V
 
A
N
 
K
G
 
G
R
 
K
I
 
I
P
 
T
V
 
L
I
 
I
A
 
A
S
 
-
G
 
-
H
 
H
I
 
V
S
 
G
D
 
C
D
 
V
I
 
S
E
 
T
A
 
A
Q
 
E
K
 
S
A
 
Q
E
 
Q
L
 
L
L
 
A
A
 
A
M
 
A
A
 
A
Q
 
K
T
 
R
-
 
Y
G
 
G
I
 
F
D
 
D
A
 
A
L
 
V
V
 
S
L
 
A
V
 
V
T
 
T
N
 
P
H
 
F
L
 
Y
D
 
Y
P
 
P
R
 
F
N
 
S
-
 
F
-
 
E
E
 
E
G
 
H
S
 
C
D
 
D
V
 
H
F
 
Y
Y
 
R
A
 
A
V
 
I
L
 
I
N
 
D
T
 
S
L
 
-
L
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
-
P
 
A
A
 
D
S
 
G
L
 
I
P
 
P
L
 
M
G
 
V
L
 
V
Y
|
Y
E
 
N
C
 
I
P
 
P
A
 
A
P
 
L
Y
 
S
R
 
G
R
 
V
L
 
K
L
 
L
T
 
T
D
 
L
D
 
E
E
 
Q
F
 
I
T
 
N
W
 
Q
C
 
L
A
 
V
N
 
T
S
 
L
G
 
P
R
 
G
F
 
V
V
 
G
V
 
A
L
 
L
K
|
K
D
 
Q
V
 
T
S
 
S
C
 
G
D
 
D
L
 
L
P
 
Y
T
 
Q
V
 
M
E
 
E
R
 
-
R
 
Q
V
 
I
R
 
R
L
 
R
A
 
A
Q
 
H
G
 
-
T
 
P
P
 
E
L
 
L
N
 
V
V
 
L
I
 
Y
N
 
N
A
 
G
N
 
Y
A
 
D
A
 
E
I
 
I
A
 
F
W
 
A
P
 
S
A
 
G
I
 
L
L
 
L
A
 
A
G
 
G
S
 
A
Q
 
D
G
 
G
F
 
G
S
 
I
G
 
G
V
 
S
F
 
T
T
 
Y
N
 
N

4pfmA Shewanella benthica dhdps with lysine and pyruvate
25% identity, 77% coverage: 4:238/307 of query aligns to 3:234/295 of 4pfmA

query
sites
4pfmA
I
 
I
N
 
N
G
 
G
I
 
S
V
 
I
P
 
V
V
 
A
M
 
L
L
 
I
T
 
T
P
 
P
F
 
L
A
 
N
A
 
S
D
 
D
E
 
G
R
 
T
I
 
V
D
 
D
Y
 
Y
P
 
T
A
 
S
L
 
L
A
 
E
K
 
K
L
 
L
I
 
V
D
 
E
W
 
Y
Y
 
H
L
 
I
E
 
T
K
 
E
G
 
G
V
 
T
D
 
D
A
 
A
L
 
I
F
 
V
A
 
A
V
 
V
C
 
G
Q
x
T
S
 
T
S
 
G
E
 
E
M
x
S
Q
x
A
F
 
T
L
|
L
S
 
P
L
 
I
E
 
S
E
 
E
R
x
H
V
 
I
E
 
A
L
 
V
A
 
V
R
 
G
F
 
Q
V
 
T
V
 
V
Q
 
K
R
 
F
V
 
A
N
 
S
G
 
G
R
 
R
I
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
-
S
 
-
G
 
G
H
 
G
I
 
N
S
 
G
D
 
A
D
x
N
I
 
A
E
 
T
A
 
A
Q
x
E
K
 
A
A
 
I
E
 
E
L
 
L
L
 
T
-
 
K
A
 
A
M
 
Q
A
 
N
Q
 
K
T
 
L
G
 
G
I
 
V
D
 
A
A
 
A
L
 
M
V
 
L
L
 
G
V
 
V
T
 
T
N
 
P
H
x
Y
L
x
Y
D
 
N
-
 
K
P
 
P
R
 
S
N
 
P
E
 
K
G
 
G
S
 
L
D
 
I
V
 
A
F
 
H
Y
 
Y
A
 
T
V
 
A
L
 
V
N
 
-
T
 
-
L
 
-
L
 
-
E
 
-
T
 
A
L
 
A
P
 
S
A
 
T
S
 
D
L
 
I
P
 
P
L
 
Q
G
 
I
L
 
L
Y
|
Y
E
 
N
C
 
V
P
 
P
A
 
G
P
x
R
Y
 
T
R
 
A
R
 
V
L
 
D
L
 
M
T
 
L
D
 
P
D
 
E
E
 
T
F
 
I
T
 
A
W
 
Q
C
 
L
A
 
V
N
 
E
S
 
V
G
 
P
R
 
N
F
 
I
V
 
I
V
 
G
L
 
V
K
|
K
D
 
D
V
 
A
S
 
T
C
 
G
D
 
D
L
 
V
P
 
A
T
 
R
V
 
V
E
 
-
R
 
K
R
 
Q
V
 
L
R
 
R
L
 
D
A
 
L
Q
 
C
G
 
G
T
 
N
P
 
D
L
 
F
N
 
L
V
 
L
I
 
Y
N
 
S
A
 
G
N
 
D
A
 
D
A
 
A
I
 
T
A
 
A
W
 
R
P
 
E
A
 
F
I
 
L
L
 
T
A
 
L
G
 
G
S
 
G
Q
 
D
G
 
G
F
 
V
S
x
I
G
 
S
V
 
V
F
 
A
T
 
N
N
 
N
F
 
I
H
 
V
P
 
P
E
 
K
L
 
L
Y
 
F
S
 
K
W
 
L
L
 
M
W
 
C
R
 
D
-
 
A
-
 
A
-
 
L
E
 
A
G
 
G
K
 
D
N
 
T
Q
 
Q
R
 
A
A
 
A
L
 
M
A
 
A
D
 
A
E
 
E

4ptnA Crystal structure of yage, a kdg aldolase protein in complex with magnesium cation coordinated l-glyceraldehyde (see paper)
28% identity, 75% coverage: 5:234/307 of query aligns to 4:234/298 of 4ptnA

query
sites
4ptnA
N
 
T
G
 
G
I
 
I
V
 
I
P
 
P
V
x
P
M
 
V
L
 
S
T
 
T
P
 
I
F
 
F
A
 
T
A
 
A
D
 
D
E
 
G
R
 
Q
I
 
L
D
 
D
Y
 
K
P
 
P
A
 
G
L
 
T
A
 
A
K
 
A
L
 
L
I
 
I
D
 
D
W
 
D
Y
 
L
L
 
I
E
 
K
K
 
A
G
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
G
L
 
L
F
 
F
A
 
F
V
 
L
C
 
G
Q
x
S
S
x
G
S
 
G
E
 
E
M
 
F
Q
 
S
F
 
Q
L
 
L
S
 
G
L
 
A
E
 
E
E
 
E
R
 
R
V
 
K
E
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
F
 
F
V
 
A
V
 
I
Q
 
D
R
 
H
V
 
V
N
 
D
G
 
R
R
 
R
I
 
V
P
 
P
V
 
V
-
 
L
I
 
I
A
 
G
S
 
T
G
 
G
H
 
G
I
 
T
S
 
N
-
 
A
-
 
R
D
 
E
D
 
T
I
 
I
E
 
E
-
 
L
A
 
S
Q
 
Q
K
 
H
A
 
A
E
 
Q
L
 
-
L
 
-
A
 
-
M
 
-
A
 
-
Q
 
Q
T
 
A
G
 
G
I
 
A
D
 
D
A
 
G
L
 
I
V
 
V
L
 
V
V
 
I
T
 
N
N
 
P
H
 
Y
L
x
Y
D
 
W
P
 
K
R
 
V
N
 
S
E
 
E
G
 
A
S
 
N
D
 
L
V
 
I
F
 
R
Y
 
Y
A
 
-
V
 
-
L
 
F
N
 
E
T
 
Q
L
 
V
L
 
A
E
 
D
T
 
S
L
 
V
P
 
-
A
 
-
S
 
T
L
 
L
P
 
P
L
 
V
G
 
M
L
 
L
Y
|
Y
E
 
N
C
 
F
P
 
P
A
 
A
P
x
L
Y
 
T
R
 
G
R
 
Q
L
 
D
L
 
L
T
 
T
D
 
P
D
 
A
E
 
L
F
 
V
T
 
K
W
 
T
C
 
L
A
 
A
N
 
D
S
 
S
-
 
R
G
 
S
R
 
N
F
 
I
V
 
I
V
 
G
L
 
I
K
|
K
D
 
D
V
 
T
S
 
I
C
 
D
D
 
S
L
 
V
P
 
A
T
 
H
V
 
L
E
 
R
R
 
S
R
 
M
V
 
I
R
 
H
L
 
T
A
 
V
Q
 
K
G
 
G
T
 
A
-
 
H
-
 
P
P
 
H
L
 
F
N
 
T
V
 
V
I
 
L
N
 
C
A
x
G
N
x
Y
A
 
D
A
 
D
I
 
H
A
 
L
W
 
F
P
 
N
A
 
T
I
 
L
L
 
L
A
 
L
G
 
G
S
 
G
Q
 
D
G
 
G
F
 
A
S
x
I
G
 
S
V
x
A
F
 
S
T
 
G
N
 
N
F
 
F
H
 
A
P
 
P
E
 
Q
L
 
V
Y
 
S
S
 
V
W
 
N
L
 
L
-
 
L
-
 
K
-
 
A
W
 
W
R
 
R
E
 
D
G
 
G
K
 
D
N
 
V
Q
 
A
R
 
K
A
 
A

4onvA Crystal structure of yage, a kdg aldolase protein in complex with 2- keto-3-deoxy gluconate
28% identity, 75% coverage: 5:234/307 of query aligns to 4:234/298 of 4onvA

query
sites
4onvA
N
 
T
G
 
G
I
 
I
V
 
I
P
 
P
V
x
P
M
 
V
L
 
S
T
 
T
P
 
I
F
 
F
A
 
T
A
 
A
D
 
D
E
 
G
R
 
Q
I
 
L
D
 
D
Y
 
K
P
 
P
A
 
G
L
 
T
A
 
A
K
 
A
L
 
L
I
 
I
D
 
D
W
 
D
Y
 
L
L
 
I
E
 
K
K
 
A
G
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
G
L
 
L
F
|
F
A
 
F
V
 
L
C
x
G
Q
x
S
S
 
G
S
 
G
E
 
E
M
 
F
Q
 
S
F
 
Q
L
 
L
S
 
G
L
 
A
E
 
E
E
 
E
R
 
R
V
 
K
E
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
F
 
F
V
 
A
V
 
I
Q
 
D
R
 
H
V
 
V
N
 
D
G
 
R
R
 
R
I
 
V
P
 
P
V
 
V
-
 
L
I
 
I
A
 
G
S
 
T
G
 
G
H
 
G
I
 
T
S
 
N
-
 
A
-
 
R
D
 
E
D
 
T
I
 
I
E
 
E
-
 
L
A
 
S
Q
 
Q
K
 
H
A
 
A
E
 
Q
L
 
-
L
 
-
A
 
-
M
 
-
A
 
-
Q
 
Q
T
 
A
G
 
G
I
 
A
D
 
D
A
 
G
L
 
I
V
 
V
L
 
V
V
 
I
T
 
N
N
 
P
H
 
Y
L
x
Y
D
 
W
P
 
K
R
 
V
N
 
S
E
 
E
G
 
A
S
 
N
D
 
L
V
 
I
F
 
R
Y
 
Y
A
 
-
V
 
-
L
 
F
N
 
E
T
 
Q
L
 
V
L
 
A
E
 
D
T
 
S
L
 
V
P
 
-
A
 
-
S
 
T
L
 
L
P
 
P
L
 
V
G
 
M
L
 
L
Y
|
Y
E
 
N
C
 
F
P
 
P
A
 
A
P
x
L
Y
 
T
R
 
G
R
 
Q
L
 
D
L
 
L
T
 
T
D
 
P
D
 
A
E
 
L
F
 
V
T
 
K
W
 
T
C
 
L
A
 
A
N
 
D
S
 
S
-
 
R
G
 
S
R
 
N
F
 
I
V
 
I
V
 
G
L
 
I
K
|
K
D
 
D
V
 
T
S
 
I
C
 
D
D
 
S
L
 
V
P
 
A
T
 
H
V
 
L
E
 
R
R
 
S
R
 
M
V
 
I
R
 
H
L
 
T
A
 
V
Q
 
K
G
 
G
T
 
A
-
 
H
-
 
P
P
 
H
L
 
F
N
 
T
V
 
V
I
 
L
N
 
C
A
x
G
N
x
Y
A
 
D
A
 
D
I
 
H
A
 
L
W
 
F
P
 
N
A
 
T
I
 
L
L
 
L
A
 
L
G
 
G
S
 
G
Q
 
D
G
 
G
F
 
A
S
x
I
G
x
S
V
 
A
F
 
S
T
 
G
N
 
N
F
 
F
H
 
A
P
 
P
E
 
Q
L
 
V
Y
 
S
S
 
V
W
 
N
L
 
L
-
 
L
-
 
K
-
 
A
W
 
W
R
 
R
E
 
D
G
 
G
K
 
D
N
 
V
Q
 
A
R
 
K
A
 
A

4oe7D Crystal structure of yage, a kdg aldolase protein, in complex with aldol condensed product of pyruvate and glyoxal
28% identity, 75% coverage: 5:234/307 of query aligns to 4:234/298 of 4oe7D

query
sites
4oe7D
N
 
T
G
 
G
I
 
I
V
 
I
P
 
P
V
x
P
M
 
V
L
 
S
T
 
T
P
 
I
F
 
F
A
 
T
A
 
A
D
 
D
E
 
G
R
 
Q
I
 
L
D
 
D
Y
 
K
P
 
P
A
 
G
L
 
T
A
 
A
K
 
A
L
 
L
I
 
I
D
 
D
W
 
D
Y
 
L
L
 
I
E
 
K
K
 
A
G
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
G
L
 
L
F
 
F
A
 
F
V
 
L
C
x
G
Q
x
S
S
x
G
S
 
G
E
 
E
M
 
F
Q
 
S
F
 
Q
L
 
L
S
 
G
L
 
A
E
 
E
E
 
E
R
 
R
V
 
K
E
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
F
 
F
V
 
A
V
 
I
Q
 
D
R
 
H
V
 
V
N
 
D
G
 
R
R
 
R
I
 
V
P
 
P
V
 
V
-
 
L
I
 
I
A
 
G
S
 
T
G
 
G
H
 
G
I
 
T
S
 
N
-
 
A
-
 
R
D
 
E
D
 
T
I
 
I
E
 
E
-
 
L
A
 
S
Q
 
Q
K
 
H
A
 
A
E
 
Q
L
 
-
L
 
-
A
 
-
M
 
-
A
 
-
Q
 
Q
T
 
A
G
 
G
I
 
A
D
 
D
A
 
G
L
 
I
V
 
V
L
 
V
V
 
I
T
 
N
N
 
P
H
 
Y
L
x
Y
D
 
W
P
 
K
R
 
V
N
 
S
E
 
E
G
 
A
S
 
N
D
 
L
V
 
I
F
 
R
Y
 
Y
A
 
-
V
 
-
L
 
F
N
 
E
T
 
Q
L
 
V
L
 
A
E
 
D
T
 
S
L
 
V
P
 
-
A
 
-
S
 
T
L
 
L
P
 
P
L
 
V
G
 
M
L
 
L
Y
|
Y
E
 
N
C
x
F
P
 
P
A
 
A
P
x
L
Y
 
T
R
 
G
R
 
Q
L
 
D
L
 
L
T
 
T
D
 
P
D
 
A
E
 
L
F
 
V
T
 
K
W
 
T
C
 
L
A
 
A
N
 
D
S
 
S
-
 
R
G
 
S
R
 
N
F
 
I
V
 
I
V
 
G
L
 
I
K
|
K
D
 
D
V
x
T
S
 
I
C
 
D
D
 
S
L
 
V
P
 
A
T
 
H
V
 
L
E
 
R
R
 
S
R
 
M
V
 
I
R
 
H
L
 
T
A
 
V
Q
 
K
G
 
G
T
 
A
-
 
H
-
 
P
P
 
H
L
 
F
N
 
T
V
 
V
I
 
L
N
 
C
A
x
G
N
 
Y
A
 
D
A
 
D
I
 
H
A
 
L
W
 
F
P
 
N
A
 
T
I
 
L
L
 
L
A
 
L
G
 
G
S
 
G
Q
 
D
G
 
G
F
 
A
S
x
I
G
 
S
V
 
A
F
 
S
T
 
G
N
 
N
F
 
F
H
 
A
P
 
P
E
 
Q
L
 
V
Y
 
S
S
 
V
W
 
N
L
 
L
-
 
L
-
 
K
-
 
A
W
 
W
R
 
R
E
 
D
G
 
G
K
 
D
N
 
V
Q
 
A
R
 
K
A
 
A

4oe7B Crystal structure of yage, a kdg aldolase protein, in complex with aldol condensed product of pyruvate and glyoxal
28% identity, 75% coverage: 5:234/307 of query aligns to 4:234/298 of 4oe7B

query
sites
4oe7B
N
 
T
G
 
G
I
 
I
V
 
I
P
 
P
V
x
P
M
 
V
L
 
S
T
 
T
P
 
I
F
 
F
A
 
T
A
 
A
D
 
D
E
 
G
R
 
Q
I
 
L
D
 
D
Y
 
K
P
 
P
A
 
G
L
 
T
A
 
A
K
 
A
L
 
L
I
 
I
D
 
D
W
 
D
Y
 
L
L
 
I
E
 
K
K
 
A
G
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
G
L
 
L
F
 
F
A
 
F
V
 
L
C
x
G
Q
x
S
S
x
G
S
 
G
E
 
E
M
 
F
Q
 
S
F
 
Q
L
 
L
S
 
G
L
 
A
E
 
E
E
 
E
R
 
R
V
 
K
E
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
F
 
F
V
 
A
V
 
I
Q
 
D
R
 
H
V
 
V
N
 
D
G
 
R
R
 
R
I
 
V
P
 
P
V
 
V
-
 
L
I
 
I
A
 
G
S
 
T
G
 
G
H
 
G
I
 
T
S
 
N
-
 
A
-
 
R
D
 
E
D
 
T
I
 
I
E
 
E
-
 
L
A
 
S
Q
 
Q
K
 
H
A
 
A
E
 
Q
L
 
-
L
 
-
A
 
-
M
 
-
A
 
-
Q
 
Q
T
 
A
G
 
G
I
 
A
D
 
D
A
 
G
L
 
I
V
 
V
L
 
V
V
 
I
T
 
N
N
 
P
H
 
Y
L
x
Y
D
 
W
P
 
K
R
 
V
N
 
S
E
 
E
G
 
A
S
 
N
D
 
L
V
 
I
F
 
R
Y
 
Y
A
 
-
V
 
-
L
 
F
N
 
E
T
 
Q
L
 
V
L
 
A
E
 
D
T
 
S
L
 
V
P
 
-
A
 
-
S
 
T
L
 
L
P
 
P
L
 
V
G
 
M
L
 
L
Y
|
Y
E
 
N
C
x
F
P
 
P
A
 
A
P
x
L
Y
 
T
R
 
G
R
 
Q
L
 
D
L
 
L
T
 
T
D
 
P
D
 
A
E
 
L
F
 
V
T
 
K
W
 
T
C
 
L
A
 
A
N
 
D
S
 
S
-
 
R
G
 
S
R
 
N
F
 
I
V
 
I
V
 
G
L
 
I
K
|
K
D
 
D
V
x
T
S
 
I
C
 
D
D
 
S
L
 
V
P
 
A
T
 
H
V
 
L
E
 
R
R
 
S
R
 
M
V
 
I
R
 
H
L
 
T
A
 
V
Q
 
K
G
 
G
T
 
A
-
 
H
-
 
P
P
 
H
L
 
F
N
 
T
V
 
V
I
 
L
N
 
C
A
x
G
N
 
Y
A
 
D
A
 
D
I
 
H
A
 
L
W
 
F
P
 
N
A
 
T
I
 
L
L
 
L
A
 
L
G
 
G
S
 
G
Q
 
D
G
 
G
F
 
A
S
x
I
G
 
S
V
 
A
F
 
S
T
 
G
N
 
N
F
 
F
H
 
A
P
 
P
E
 
Q
L
 
V
Y
 
S
S
 
V
W
 
N
L
 
L
-
 
L
-
 
K
-
 
A
W
 
W
R
 
R
E
 
D
G
 
G
K
 
D
N
 
V
Q
 
A
R
 
K
A
 
A

4oe7A Crystal structure of yage, a kdg aldolase protein, in complex with aldol condensed product of pyruvate and glyoxal
28% identity, 75% coverage: 5:234/307 of query aligns to 4:234/298 of 4oe7A

query
sites
4oe7A
N
 
T
G
 
G
I
 
I
V
 
I
P
 
P
V
x
P
M
 
V
L
 
S
T
 
T
P
 
I
F
 
F
A
 
T
A
 
A
D
 
D
E
 
G
R
 
Q
I
 
L
D
 
D
Y
 
K
P
 
P
A
 
G
L
 
T
A
 
A
K
 
A
L
 
L
I
 
I
D
 
D
W
 
D
Y
 
L
L
 
I
E
 
K
K
 
A
G
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
G
L
 
L
F
 
F
A
 
F
V
 
L
C
x
G
Q
x
S
S
x
G
S
 
G
E
 
E
M
 
F
Q
 
S
F
 
Q
L
 
L
S
 
G
L
 
A
E
 
E
E
 
E
R
 
R
V
 
K
E
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
F
 
F
V
 
A
V
 
I
Q
 
D
R
 
H
V
 
V
N
 
D
G
 
R
R
 
R
I
 
V
P
 
P
V
 
V
-
 
L
I
 
I
A
 
G
S
 
T
G
 
G
H
 
G
I
 
T
S
 
N
-
 
A
-
 
R
D
 
E
D
 
T
I
 
I
E
 
E
-
 
L
A
 
S
Q
 
Q
K
 
H
A
 
A
E
 
Q
L
 
-
L
 
-
A
 
-
M
 
-
A
 
-
Q
 
Q
T
 
A
G
 
G
I
 
A
D
 
D
A
 
G
L
 
I
V
 
V
L
 
V
V
 
I
T
 
N
N
 
P
H
 
Y
L
x
Y
D
 
W
P
 
K
R
 
V
N
 
S
E
 
E
G
 
A
S
 
N
D
 
L
V
 
I
F
 
R
Y
 
Y
A
 
-
V
 
-
L
 
F
N
 
E
T
 
Q
L
 
V
L
 
A
E
 
D
T
 
S
L
 
V
P
 
-
A
 
-
S
 
T
L
 
L
P
 
P
L
 
V
G
 
M
L
 
L
Y
|
Y
E
 
N
C
 
F
P
 
P
A
 
A
P
x
L
Y
 
T
R
 
G
R
 
Q
L
 
D
L
 
L
T
 
T
D
 
P
D
 
A
E
 
L
F
 
V
T
 
K
W
 
T
C
 
L
A
 
A
N
 
D
S
 
S
-
 
R
G
 
S
R
 
N
F
 
I
V
 
I
V
 
G
L
 
I
K
|
K
D
 
D
V
 
T
S
 
I
C
 
D
D
 
S
L
 
V
P
 
A
T
 
H
V
 
L
E
 
R
R
 
S
R
 
M
V
 
I
R
 
H
L
 
T
A
 
V
Q
 
K
G
 
G
T
 
A
-
 
H
-
 
P
P
 
H
L
 
F
N
 
T
V
 
V
I
 
L
N
 
C
A
 
G
N
 
Y
A
 
D
A
 
D
I
 
H
A
 
L
W
 
F
P
 
N
A
 
T
I
 
L
L
 
L
A
 
L
G
 
G
S
 
G
Q
 
D
G
 
G
F
 
A
S
x
I
G
 
S
V
 
A
F
 
S
T
 
G
N
 
N
F
 
F
H
 
A
P
 
P
E
 
Q
L
 
V
Y
 
S
S
 
V
W
 
N
L
 
L
-
 
L
-
 
K
-
 
A
W
 
W
R
 
R
E
 
D
G
 
G
K
 
D
N
 
V
Q
 
A
R
 
K
A
 
A

3nevA Crystal structure of yage, a prophage protein from e. Coli k12 in complex with kdgal (see paper)
28% identity, 75% coverage: 5:234/307 of query aligns to 4:234/298 of 3nevA

query
sites
3nevA
N
 
T
G
 
G
I
 
I
V
 
I
P
 
P
V
x
P
M
 
V
L
 
S
T
 
T
P
 
I
F
 
F
A
 
T
A
 
A
D
 
D
E
 
G
R
 
Q
I
 
L
D
 
D
Y
 
K
P
 
P
A
 
G
L
 
T
A
 
A
K
 
A
L
 
L
I
 
I
D
 
D
W
 
D
Y
 
L
L
 
I
E
 
K
K
 
A
G
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
G
L
 
L
F
 
F
A
 
F
V
 
L
C
x
G
Q
x
S
S
x
G
S
 
G
E
 
E
M
 
F
Q
 
S
F
 
Q
L
 
L
S
 
G
L
 
A
E
 
E
E
 
E
R
 
R
V
 
K
E
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
F
 
F
V
 
A
V
 
I
Q
 
D
R
 
H
V
 
V
N
 
D
G
 
R
R
 
R
I
 
V
P
 
P
V
 
V
-
 
L
I
 
I
A
 
G
S
 
T
G
 
G
H
 
G
I
 
T
S
 
N
-
 
A
-
 
R
D
 
E
D
 
T
I
 
I
E
 
E
-
 
L
A
 
S
Q
 
Q
K
 
H
A
 
A
E
 
Q
L
 
-
L
 
-
A
 
-
M
 
-
A
 
-
Q
 
Q
T
 
A
G
 
G
I
 
A
D
 
D
A
 
G
L
 
I
V
 
V
L
 
V
V
 
I
T
 
N
N
 
P
H
 
Y
L
x
Y
D
 
W
P
 
K
R
 
V
N
 
S
E
 
E
G
 
A
S
 
N
D
 
L
V
 
I
F
 
R
Y
 
Y
A
 
-
V
 
-
L
 
F
N
 
E
T
 
Q
L
 
V
L
 
A
E
 
D
T
 
S
L
 
V
P
 
-
A
 
-
S
 
T
L
 
L
P
 
P
L
 
V
G
 
M
L
 
L
Y
|
Y
E
 
N
C
x
F
P
 
P
A
 
A
P
x
L
Y
 
T
R
 
G
R
 
Q
L
 
D
L
 
L
T
 
T
D
 
P
D
 
A
E
 
L
F
 
V
T
 
K
W
 
T
C
 
L
A
 
A
N
 
D
S
 
S
-
 
R
G
 
S
R
 
N
F
 
I
V
 
I
V
 
G
L
 
I
K
|
K
D
 
D
V
x
T
S
 
I
C
 
D
D
 
S
L
 
V
P
 
A
T
 
H
V
 
L
E
 
R
R
 
S
R
 
M
V
 
I
R
 
H
L
 
T
A
 
V
Q
 
K
G
 
G
T
 
A
-
 
H
-
 
P
P
 
H
L
 
F
N
 
T
V
 
V
I
 
L
N
 
C
A
x
G
N
 
Y
A
 
D
A
 
D
I
 
H
A
 
L
W
 
F
P
 
N
A
 
T
I
 
L
L
 
L
A
 
L
G
 
G
S
 
G
Q
 
D
G
 
G
F
 
A
S
x
I
G
 
S
V
x
A
F
 
S
T
 
G
N
 
N
F
 
F
H
 
A
P
 
P
E
 
Q
L
 
V
Y
 
S
S
 
V
W
 
N
L
 
L
-
 
L
-
 
K
-
 
A
W
 
W
R
 
R
E
 
D
G
 
G
K
 
D
N
 
V
Q
 
A
R
 
K
A
 
A

3s8hA Structure of dihydrodipicolinate synthase complexed with 3- hydroxypropanoic acid(hpa)at 2.70 a resolution
30% identity, 72% coverage: 4:225/307 of query aligns to 2:217/292 of 3s8hA

query
sites
3s8hA
I
 
I
N
 
A
G
 
G
I
 
S
V
 
M
P
 
V
V
x
A
M
x
L
L
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
F
A
 
D
A
 
A
D
 
Q
E
 
G
R
 
R
I
 
L
D
 
D
Y
 
W
P
 
D
A
 
S
L
 
L
A
 
A
K
 
K
L
 
L
I
 
V
D
 
D
W
 
F
Y
 
H
L
 
L
E
 
Q
K
 
D
G
 
G
V
 
T
D
 
N
A
 
A
L
 
I
F
x
V
A
 
A
V
 
V
C
x
G
Q
x
T
S
x
T
S
x
G
E
 
E
M
 
S
Q
 
A
F
 
T
L
 
L
S
 
D
L
 
V
E
 
E
E
 
E
R
 
H
V
 
I
E
 
Q
L
 
V
A
 
V
R
 
R
F
 
R
V
 
V
V
 
V
Q
 
D
R
 
Q
V
 
V
N
 
K
G
 
G
R
 
R
I
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
A
S
 
G
G
 
T
H
 
G
I
 
A
S
 
N
D
 
S
D
 
T
I
 
R
E
 
E
A
 
A
Q
 
-
K
 
V
A
 
A
E
 
L
L
 
T
L
 
E
A
 
A
M
 
A
A
 
K
Q
 
S
T
 
G
G
 
G
I
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
C
V
 
L
L
 
L
V
 
V
T
 
T
N
 
P
H
 
Y
L
x
Y
D
 
N
-
 
K
P
 
P
R
 
T
N
 
Q
E
 
E
G
 
G
S
 
-
D
 
-
V
 
-
F
 
M
Y
 
Y
A
 
Q
V
 
H
L
 
F
N
 
R
T
 
H
L
 
I
L
 
A
E
 
E
T
 
A
L
 
V
P
 
-
A
 
-
S
 
A
L
 
I
P
 
P
L
 
Q
G
 
I
L
 
L
Y
|
Y
E
 
N
C
 
V
P
 
P
A
 
G
P
x
R
Y
 
T
R
 
S
R
 
C
L
 
D
L
 
M
T
 
L
D
 
P
D
 
E
E
 
T
F
 
V
T
 
E
W
 
R
C
 
L
A
 
S
N
 
K
S
 
V
G
 
P
R
 
N
F
 
I
V
 
I
V
 
G
L
 
I
K
|
K
D
 
E
V
 
A
S
 
T
C
 
G
D
 
D
L
 
L
P
 
Q
T
 
R
V
 
A
E
 
K
R
 
E
R
 
V
V
 
I
R
 
E
L
 
R
A
 
V
Q
 
-
G
 
G
T
 
K
P
 
D
L
 
F
N
 
L
V
 
V
I
 
Y
N
 
S
A
 
G
N
 
D
A
 
D
A
 
A
I
 
T
A
 
A
W
 
V
P
 
E
A
 
L
I
 
M
L
 
L
A
 
L
G
 
G
S
 
G
Q
 
K
G
 
G
F
 
N
S
x
I
G
 
S
V
 
V
F
 
T
T
 
A
N
 
N
F
 
V
H
 
A
P
 
P
E
 
R
L
 
A
Y
 
M
S
 
S
W
 
D
L
 
L

3puoA Crystal structure of dihydrodipicolinate synthase from pseudomonas aeruginosa(psdhdps)complexed with l-lysine at 2.65a resolution (see paper)
30% identity, 72% coverage: 4:225/307 of query aligns to 2:217/292 of 3puoA

query
sites
3puoA
I
 
I
N
 
A
G
 
G
I
 
S
V
 
M
P
 
V
V
 
A
M
 
L
L
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
F
A
 
D
A
 
A
D
 
Q
E
 
G
R
 
R
I
 
L
D
 
D
Y
 
W
P
 
D
A
 
S
L
 
L
A
 
A
K
 
K
L
 
L
I
 
V
D
 
D
W
 
F
Y
 
H
L
 
L
E
 
Q
K
 
D
G
 
G
V
 
T
D
 
N
A
 
A
L
 
I
F
 
V
A
 
A
V
 
V
C
 
G
Q
x
T
S
 
T
S
 
G
E
 
E
M
x
S
Q
x
A
F
 
T
L
|
L
S
x
D
L
x
V
E
 
E
E
 
E
R
 
H
V
 
I
E
 
Q
L
 
V
A
 
V
R
 
R
F
 
R
V
 
V
V
 
V
Q
 
D
R
 
Q
V
 
V
N
 
K
G
 
G
R
 
R
I
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
A
S
 
G
G
 
T
H
 
G
I
 
A
S
 
N
D
 
S
D
 
T
I
 
R
E
 
E
A
 
A
Q
 
-
K
 
V
A
 
A
E
 
L
L
 
T
L
 
E
A
 
A
M
 
A
A
 
K
Q
 
S
T
 
G
G
 
G
I
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
C
V
 
L
L
 
L
V
 
V
T
 
T
N
 
P
H
 
Y
L
x
Y
D
 
N
-
 
K
P
 
P
R
 
T
N
 
Q
E
 
E
G
 
G
S
 
-
D
 
-
V
 
-
F
 
M
Y
 
Y
A
 
Q
V
 
H
L
 
F
N
 
R
T
 
H
L
 
I
L
 
A
E
 
E
T
 
A
L
 
V
P
 
-
A
 
-
S
 
A
L
 
I
P
 
P
L
 
Q
G
 
I
L
 
L
Y
|
Y
E
 
N
C
 
V
P
 
P
A
 
G
P
x
R
Y
 
T
R
 
S
R
 
C
L
 
D
L
 
M
T
 
L
D
 
P
D
 
E
E
 
T
F
 
V
T
 
E
W
 
R
C
 
L
A
 
S
N
 
K
S
 
V
G
 
P
R
 
N
F
 
I
V
 
I
V
 
G
L
 
I
K
|
K
D
 
E
V
 
A
S
 
T
C
 
G
D
 
D
L
 
L
P
 
Q
T
 
R
V
 
A
E
 
K
R
 
E
R
 
V
V
 
I
R
 
E
L
 
R
A
 
V
Q
 
-
G
 
G
T
 
K
P
 
D
L
 
F
N
 
L
V
 
V
I
 
Y
N
 
S
A
 
G
N
 
D
A
 
D
A
 
A
I
 
T
A
 
A
W
 
V
P
 
E
A
 
L
I
 
M
L
 
L
A
 
L
G
 
G
S
 
G
Q
 
K
G
 
G
F
 
N
S
x
I
G
 
S
V
 
V
F
 
T
T
 
A
N
 
N
F
 
V
H
 
A
P
 
P
E
 
R
L
 
A
Y
 
M
S
 
S
W
 
D
L
 
L

Sites not aligning to the query:

3lbcD D-sialic acid aldolase complexed with l-arabinose
27% identity, 75% coverage: 4:234/307 of query aligns to 5:232/296 of 3lbcD

query
sites
3lbcD
I
 
L
N
 
R
G
 
G
I
 
V
V
 
M
P
 
A
V
 
A
M
 
L
L
 
L
T
 
T
P
 
P
F
 
F
A
 
D
A
 
Q
D
 
Q
E
 
Q
R
 
A
I
 
L
D
 
D
Y
 
K
P
 
A
A
 
S
L
 
L
A
 
R
K
 
R
L
 
L
I
 
V
D
 
Q
W
 
F
Y
 
N
L
 
I
E
 
Q
K
 
Q
G
 
G
V
 
I
D
 
D
A
 
G
L
 
L
F
 
Y
A
 
V
V
 
G
C
 
G
Q
x
S
S
 
T
S
 
G
E
 
E
M
 
A
Q
 
F
F
 
V
L
 
Q
S
 
S
L
 
L
E
 
S
E
 
E
R
 
R
V
 
E
E
 
Q
L
 
V
A
 
L
R
 
E
F
 
I
V
 
V
V
 
A
Q
 
E
R
 
E
V
 
A
N
 
K
G
 
G
R
 
K
I
 
I
P
 
K
V
 
L
I
 
I
A
 
A
S
 
-
G
 
-
H
 
H
I
 
V
S
 
G
D
 
C
D
 
V
I
 
S
E
 
T
A
 
A
Q
 
E
K
 
S
A
 
Q
E
 
Q
L
 
L
L
 
A
A
 
A
M
 
S
A
 
A
Q
 
K
T
 
R
-
 
Y
G
 
G
I
 
F
D
 
D
A
 
A
L
 
V
V
 
S
L
 
A
V
 
V
T
 
T
N
 
P
H
 
F
L
x
Y
D
 
Y
P
 
P
R
 
F
N
 
S
-
 
F
-
 
E
E
 
E
G
 
H
S
 
C
D
 
D
V
 
H
F
 
Y
Y
 
R
A
 
A
V
 
I
L
 
I
N
 
D
T
 
S
L
 
-
L
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
-
P
 
A
A
 
D
S
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
M
G
 
V
L
 
V
Y
|
Y
E
 
N
C
 
I
P
 
P
A
 
A
P
x
L
Y
 
S
R
 
G
R
 
V
L
 
K
L
 
L
T
 
T
D
 
L
D
 
D
E
 
Q
F
 
I
T
 
N
W
 
T
C
 
L
A
 
V
N
 
T
S
 
L
G
 
P
R
 
G
F
 
V
V
 
G
V
 
A
L
 
L
K
|
K
D
 
Q
V
 
T
S
 
S
C
 
G
D
|
D
L
 
L
P
x
Y
T
 
Q
V
 
M
E
 
E
R
 
Q
R
 
I
V
 
R
R
 
R
L
 
-
A
 
-
Q
 
E
G
 
H
T
 
P
P
 
D
L
 
L
N
 
V
V
 
L
I
 
Y
N
 
N
A
 
G
N
 
Y
A
 
D
A
 
E
I
 
I
A
 
F
W
 
A
P
 
S
A
 
G
I
 
L
L
 
L
A
 
A
G
 
G
S
 
A
Q
 
D
G
 
G
F
 
G
S
x
I
G
 
G
V
 
S
F
 
T
T
 
Y
N
 
N
F
 
I
H
 
M
P
 
G
E
 
W
L
 
R
Y
 
Y
S
 
Q
W
 
G
L
 
I
-
 
V
-
 
K
-
 
A
W
 
L
R
 
K
E
 
E
G
 
G
K
 
D
N
 
I
Q
 
Q
R
 
T
A
 
A

2wpbA Crystal structure of the e192n mutant of e. Coli n-acetylneuraminic acid lyase in complex with pyruvate and the inhibitor (2r,3r)-2,3,4- trihydroxy-n,n-dipropylbutanamide in space group p21 crystal form i (see paper)
27% identity, 75% coverage: 4:234/307 of query aligns to 10:237/302 of 2wpbA

query
sites
2wpbA
I
 
L
N
 
R
G
 
G
I
 
V
V
 
M
P
 
A
V
 
A
M
 
L
L
 
L
T
 
T
P
 
P
F
 
F
A
 
D
A
 
Q
D
 
Q
E
 
Q
R
 
A
I
 
L
D
 
D
Y
 
K
P
 
A
A
 
S
L
 
L
A
 
R
K
 
R
L
 
L
I
 
V
D
 
Q
W
 
F
Y
 
N
L
 
I
E
 
Q
K
 
Q
G
 
G
V
 
I
D
 
D
A
 
G
L
 
L
F
 
Y
A
 
V
V
 
G
C
 
G
Q
x
S
S
 
T
S
 
G
E
 
E
M
 
A
Q
 
F
F
 
V
L
 
Q
S
 
S
L
 
L
E
 
S
E
 
E
R
 
R
V
 
E
E
 
Q
L
 
V
A
 
L
R
 
E
F
 
I
V
 
V
V
 
A
Q
 
E
R
 
E
V
 
A
N
 
K
G
 
G
R
 
K
I
 
I
P
 
K
V
 
L
I
 
I
A
 
A
S
 
-
G
 
-
H
 
H
I
 
V
S
 
G
D
 
C
D
 
V
I
 
S
E
 
T
A
 
A
Q
 
E
K
 
S
A
 
Q
E
 
Q
L
 
L
L
 
A
A
 
A
M
 
S
A
 
A
Q
 
K
T
 
R
-
 
Y
G
 
G
I
 
F
D
 
D
A
 
A
L
 
V
V
 
S
L
 
A
V
 
V
T
 
T
N
 
P
H
 
F
L
x
Y
D
 
Y
P
 
P
R
 
F
N
 
S
-
 
F
-
 
E
E
 
E
G
 
H
S
 
C
D
 
D
V
 
H
F
 
Y
Y
 
R
A
 
A
V
 
I
L
 
I
N
 
D
T
 
S
L
 
-
L
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
-
P
 
A
A
 
D
S
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
M
G
 
V
L
 
V
Y
|
Y
E
 
N
C
 
I
P
 
P
A
 
A
P
x
L
Y
 
S
R
 
G
R
 
V
L
 
K
L
 
L
T
 
T
D
 
L
D
 
D
E
 
Q
F
 
I
T
 
N
W
 
T
C
 
L
A
 
V
N
 
T
S
 
L
G
 
P
R
 
G
F
 
V
V
 
G
V
 
A
L
 
L
K
|
K
D
 
Q
V
 
T
S
 
S
C
 
G
D
 
D
L
 
L
P
 
Y
T
 
Q
V
 
M
E
 
E
R
 
Q
R
 
I
V
 
R
R
 
R
L
 
-
A
 
-
Q
 
E
G
 
H
T
 
P
P
 
D
L
 
L
N
 
V
V
 
L
I
 
Y
N
 
N
A
x
G
N
x
Y
A
x
D
A
x
N
I
 
I
A
 
F
W
 
A
P
 
S
A
 
G
I
 
L
L
 
L
A
 
A
G
 
G
S
 
A
Q
 
D
G
 
G
F
 
G
S
x
I
G
 
G
V
x
S
F
 
T
T
 
Y
N
 
N
F
 
I
H
 
M
P
 
G
E
 
W
L
 
R
Y
 
Y
S
 
Q
W
 
G
L
 
I
-
 
V
-
 
K
-
 
A
W
 
L
R
 
K
E
 
E
G
 
G
K
 
D
N
 
I
Q
 
Q
R
 
T
A
 
A

1fdzA N-acetylneuraminate lyase in complex with pyruvate via borohydride reduction (see paper)
27% identity, 75% coverage: 4:234/307 of query aligns to 2:229/292 of 1fdzA

query
sites
1fdzA
I
 
L
N
 
R
G
 
G
I
 
V
V
 
M
P
 
A
V
 
A
M
 
L
L
 
L
T
 
T
P
 
P
F
 
F
A
 
D
A
 
Q
D
 
Q
E
 
Q
R
 
A
I
 
L
D
 
D
Y
 
K
P
 
A
A
 
S
L
 
L
A
 
R
K
 
R
L
 
L
I
 
V
D
 
Q
W
 
F
Y
 
N
L
 
I
E
 
Q
K
 
Q
G
 
G
V
 
I
D
 
D
A
 
G
L
 
L
F
x
Y
A
 
V
V
 
G
C
x
G
Q
x
S
S
x
T
S
 
G
E
 
E
M
 
A
Q
 
F
F
 
V
L
 
Q
S
 
S
L
 
L
E
 
S
E
 
E
R
 
R
V
 
E
E
 
Q
L
 
V
A
 
L
R
 
E
F
 
I
V
 
V
V
 
A
Q
 
E
R
 
E
V
 
G
N
 
K
G
 
G
R
 
K
I
 
I
P
 
K
V
 
L
I
 
I
A
 
A
S
 
-
G
 
-
H
 
H
I
 
V
S
 
G
D
 
C
D
 
V
I
 
T
E
 
T
A
 
A
Q
 
E
K
 
S
A
 
Q
E
 
Q
L
 
L
L
 
A
A
 
A
M
 
S
A
 
A
Q
 
K
T
 
R
-
 
Y
G
 
G
I
 
F
D
 
D
A
 
A
L
 
V
V
 
S
L
 
A
V
 
V
T
 
T
N
 
P
H
 
F
L
x
Y
D
 
Y
P
 
P
R
 
F
N
 
S
-
 
F
-
 
E
E
 
E
G
 
H
S
 
C
D
 
D
V
 
H
F
 
Y
Y
 
R
A
 
A
V
 
I
L
 
I
N
 
D
T
 
S
L
 
-
L
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
-
P
 
A
A
 
D
S
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
M
G
 
V
L
 
V
Y
|
Y
E
 
N
C
 
I
P
 
P
A
 
A
P
x
L
Y
 
S
R
 
G
R
 
V
L
 
K
L
 
L
T
 
T
D
 
L
D
 
D
E
 
Q
F
 
I
T
 
N
W
 
T
C
 
L
A
 
V
N
 
T
S
 
L
G
 
P
R
 
G
F
 
V
V
 
G
V
 
A
L
 
L
K
|
K
D
 
Q
V
 
T
S
 
S
C
 
G
D
 
D
L
 
L
P
 
Y
T
 
Q
V
 
M
E
 
E
R
 
Q
R
 
I
V
 
R
R
 
R
L
 
-
A
 
-
Q
 
E
G
 
H
T
 
P
P
 
D
L
 
L
N
 
V
V
 
L
I
 
Y
N
 
N
A
 
G
N
 
Y
A
 
D
A
 
E
I
 
I
A
 
F
W
 
A
P
 
S
A
 
G
I
 
L
L
 
L
A
 
A
G
 
G
S
 
A
Q
 
D
G
 
G
F
 
G
S
x
I
G
 
G
V
 
S
F
 
T
T
 
Y
N
 
N
F
 
I
H
 
M
P
 
G
E
 
W
L
 
R
Y
 
Y
S
 
Q
W
 
G
L
 
I
-
 
V
-
 
K
-
 
A
W
 
L
R
 
K
E
 
E
G
 
G
K
 
D
N
 
I
Q
 
Q
R
 
T
A
 
A

1fdyA N-acetylneuraminate lyase in complex with hydroxypyruvate (see paper)
27% identity, 75% coverage: 4:234/307 of query aligns to 2:229/292 of 1fdyA

query
sites
1fdyA
I
 
L
N
 
R
G
 
G
I
 
V
V
 
M
P
 
A
V
 
A
M
 
L
L
 
L
T
 
T
P
 
P
F
 
F
A
 
D
A
 
Q
D
 
Q
E
 
Q
R
 
A
I
 
L
D
 
D
Y
 
K
P
 
A
A
 
S
L
 
L
A
 
R
K
 
R
L
 
L
I
 
V
D
 
Q
W
 
F
Y
 
N
L
 
I
E
 
Q
K
 
Q
G
 
G
V
 
I
D
 
D
A
 
G
L
 
L
F
x
Y
A
 
V
V
 
G
C
x
G
Q
x
S
S
x
T
S
 
G
E
 
E
M
 
A
Q
 
F
F
 
V
L
 
Q
S
 
S
L
 
L
E
 
S
E
 
E
R
 
R
V
 
E
E
 
Q
L
 
V
A
 
L
R
 
E
F
 
I
V
 
V
V
 
A
Q
 
E
R
 
E
V
 
G
N
 
K
G
 
G
R
 
K
I
 
I
P
 
K
V
 
L
I
 
I
A
 
A
S
 
-
G
 
-
H
 
H
I
 
V
S
 
G
D
 
C
D
 
V
I
 
T
E
 
T
A
 
A
Q
 
E
K
 
S
A
 
Q
E
 
Q
L
 
L
L
 
A
A
 
A
M
 
S
A
 
A
Q
 
K
T
 
R
-
 
Y
G
 
G
I
 
F
D
 
D
A
 
A
L
 
V
V
 
S
L
 
A
V
 
V
T
 
T
N
 
P
H
 
F
L
x
Y
D
 
Y
P
 
P
R
 
F
N
 
S
-
 
F
-
 
E
E
 
E
G
 
H
S
 
C
D
 
D
V
 
H
F
 
Y
Y
 
R
A
 
A
V
 
I
L
 
I
N
 
D
T
 
S
L
 
-
L
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
-
P
 
A
A
 
D
S
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
M
G
 
V
L
 
V
Y
|
Y
E
 
N
C
 
I
P
 
P
A
 
A
P
x
L
Y
 
S
R
 
G
R
 
V
L
 
K
L
 
L
T
 
T
D
 
L
D
 
D
E
 
Q
F
 
I
T
 
N
W
 
T
C
 
L
A
 
V
N
 
T
S
 
L
G
 
P
R
 
G
F
 
V
V
 
G
V
 
A
L
 
L
K
|
K
D
 
Q
V
 
T
S
 
S
C
 
G
D
 
D
L
 
L
P
 
Y
T
 
Q
V
 
M
E
 
E
R
 
Q
R
 
I
V
 
R
R
 
R
L
 
-
A
 
-
Q
 
E
G
 
H
T
 
P
P
 
D
L
 
L
N
 
V
V
 
L
I
 
Y
N
 
N
A
 
G
N
 
Y
A
 
D
A
 
E
I
 
I
A
 
F
W
 
A
P
 
S
A
 
G
I
 
L
L
 
L
A
 
A
G
 
G
S
 
A
Q
 
D
G
 
G
F
 
G
S
x
I
G
 
G
V
 
S
F
 
T
T
 
Y
N
 
N
F
 
I
H
 
M
P
 
G
E
 
W
L
 
R
Y
 
Y
S
 
Q
W
 
G
L
 
I
-
 
V
-
 
K
-
 
A
W
 
L
R
 
K
E
 
E
G
 
G
K
 
D
N
 
I
Q
 
Q
R
 
T
A
 
A

Query Sequence

>BWI76_RS00585 FitnessBrowser__Koxy:BWI76_RS00585
MKTINGIVPVMLTPFAADERIDYPALAKLIDWYLEKGVDALFAVCQSSEMQFLSLEERVE
LARFVVQRVNGRIPVIASGHISDDIEAQKAELLAMAQTGIDALVLVTNHLDPRNEGSDVF
YAVLNTLLETLPASLPLGLYECPAPYRRLLTDDEFTWCANSGRFVVLKDVSCDLPTVERR
VRLAQGTPLNVINANAAIAWPAILAGSQGFSGVFTNFHPELYSWLWREGKNQRALADELA
IFLSLGAVSETLGYPKNAKIYHQRLGTFDSITCRVNKDDVLNKYWGLTVILDQIRAGTEQ
WRQRIVG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory