SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing BWI76_RS00850 FitnessBrowser__Koxy:BWI76_RS00850 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

2x2wA Acetylglutamate kinase from escherichia coli bound to n-acetyl-l- glutamyl-5-phosphate (see paper)
94% identity, 100% coverage: 1:257/257 of query aligns to 2:258/258 of 2x2wA

query
sites
2x2wA
M
 
M
N
 
N
P
 
P
L
 
L
I
 
I
I
 
I
K
|
K
L
 
L
G
|
G
G
|
G
V
|
V
L
 
L
L
 
L
D
 
D
S
 
S
E
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
E
R
 
R
L
 
L
F
 
F
T
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
N
 
N
Y
 
Y
R
 
R
E
 
E
S
 
S
H
 
H
Q
 
Q
R
 
R
P
 
P
L
 
L
I
 
V
I
 
I
V
 
V
H
 
H
G
|
G
G
 
G
G
|
G
C
 
C
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
E
L
 
L
M
 
M
K
 
K
Q
 
G
L
 
L
N
 
N
L
 
L
P
 
P
V
 
V
N
 
K
K
 
K
K
 
K
N
 
N
G
 
G
L
 
L
R
|
R
V
 
V
T
 
T
P
 
P
A
 
A
D
 
D
Q
 
Q
I
 
I
D
 
D
I
 
I
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
T
 
T
A
 
A
N
 
N
K
 
K
T
 
T
L
 
L
L
 
L
A
 
A
W
 
W
A
 
A
K
 
K
K
 
K
H
 
H
G
 
Q
L
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
F
 
F
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
D
 
D
S
 
S
V
 
V
K
 
K
V
 
V
T
 
T
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
E
 
E
E
 
E
L
 
L
G
 
G
H
 
H
V
 
V
G
 
G
F
 
L
A
 
A
Q
 
Q
P
 
P
G
 
G
S
 
S
P
 
P
A
 
K
L
 
L
I
 
I
N
 
N
T
 
S
L
 
L
L
 
L
A
 
E
G
 
N
G
 
G
Y
 
Y
M
 
L
P
 
P
V
 
V
V
 
V
S
 
S
S
 
S
I
 
I
G
 
G
V
 
V
T
 
T
D
 
D
E
 
E
G
 
G
E
 
Q
L
 
L
M
 
M
N
|
N
V
 
V
N
 
N
A
|
A
D
|
D
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
T
 
T
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
T
 
T
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
L
I
 
I
L
 
L
L
 
L
S
|
S
D
 
D
V
 
V
S
 
S
G
 
G
I
 
I
L
 
L
D
 
D
G
 
G
K
 
K
G
 
G
Q
 
Q
R
 
R
I
 
I
A
 
A
E
 
E
M
 
M
T
 
T
A
 
A
E
 
A
K
 
K
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
I
 
I
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
I
 
I
T
 
T
D
 
D
G
 
G
M
 
M
I
 
I
V
 
V
K
|
K
V
 
V
N
 
N
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
R
T
 
T
L
 
L
G
 
G
R
 
R
P
 
P
V
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
A
S
 
S
W
 
W
R
 
R
H
 
H
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
P
 
P
A
 
A
L
 
L
F
 
F
N
 
N
G
 
G
T
 
M
P
 
P
I
 
M
G
 
G
T
 
T
R
 
R
I
 
I
L
 
L
A
 
A

1oh9A Acetylglutamate kinase from escherichia coli complexed with mgadp, n- acetyl-l-glutamate and the transition-state mimic alf4- (see paper)
94% identity, 100% coverage: 1:257/257 of query aligns to 2:258/258 of 1oh9A

query
sites
1oh9A
M
 
M
N
 
N
P
 
P
L
 
L
I
 
I
I
 
I
K
|
K
L
 
L
G
|
G
G
|
G
V
 
V
L
 
L
L
 
L
D
 
D
S
 
S
E
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
E
R
 
R
L
 
L
F
 
F
T
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
N
 
N
Y
 
Y
R
 
R
E
 
E
S
 
S
H
 
H
Q
 
Q
R
 
R
P
 
P
L
 
L
I
 
V
I
 
I
V
 
V
H
 
H
G
|
G
G
|
G
G
|
G
C
 
C
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
E
L
 
L
M
 
M
K
 
K
Q
 
G
L
 
L
N
 
N
L
 
L
P
 
P
V
 
V
N
 
K
K
 
K
K
 
K
N
 
N
G
 
G
L
 
L
R
|
R
V
 
V
T
 
T
P
 
P
A
 
A
D
 
D
Q
 
Q
I
 
I
D
 
D
I
 
I
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
|
L
A
 
A
G
 
G
T
 
T
A
 
A
N
 
N
K
 
K
T
 
T
L
 
L
L
 
L
A
 
A
W
 
W
A
 
A
K
 
K
K
 
K
H
 
H
G
 
Q
L
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
F
 
F
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
D
 
D
S
 
S
V
 
V
K
 
K
V
 
V
T
 
T
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
E
 
E
E
 
E
L
 
L
G
 
G
H
 
H
V
 
V
G
 
G
F
 
L
A
 
A
Q
 
Q
P
 
P
G
 
G
S
 
S
P
 
P
A
 
K
L
 
L
I
 
I
N
 
N
T
 
S
L
 
L
L
 
L
A
 
E
G
 
N
G
 
G
Y
 
Y
M
 
L
P
 
P
V
 
V
V
 
V
S
 
S
S
 
S
I
 
I
G
 
G
V
 
V
T
 
T
D
 
D
E
 
E
G
 
G
E
 
Q
L
 
L
M
 
M
N
|
N
V
 
V
N
|
N
A
|
A
D
|
D
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
T
 
T
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
T
 
T
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
L
I
 
I
L
 
L
L
 
L
S
 
S
D
 
D
V
 
V
S
 
S
G
 
G
I
 
I
L
|
L
D
 
D
G
 
G
K
 
K
G
 
G
Q
 
Q
R
 
R
I
 
I
A
 
A
E
 
E
M
 
M
T
 
T
A
 
A
E
 
A
K
 
K
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
I
 
I
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
I
|
I
I
 
I
T
|
T
D
|
D
G
 
G
M
|
M
I
 
I
V
 
V
K
|
K
V
 
V
N
 
N
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
R
T
 
T
L
 
L
G
 
G
R
 
R
P
 
P
V
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
A
S
 
S
W
 
W
R
 
R
H
 
H
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
P
 
P
A
 
A
L
 
L
F
 
F
N
 
N
G
 
G
T
 
M
P
 
P
I
 
M
G
 
G
T
 
T
R
 
R
I
 
I
L
 
L
A
 
A

1gs5A N-acetyl-l-glutamate kinase from escherichia coli complexed with its substrate n-acetylglutamate and its substrate analog amppnp (see paper)
94% identity, 100% coverage: 1:257/257 of query aligns to 2:258/258 of 1gs5A

query
sites
1gs5A
M
 
M
N
 
N
P
 
P
L
 
L
I
 
I
I
 
I
K
|
K
L
 
L
G
|
G
G
|
G
V
 
V
L
 
L
L
 
L
D
 
D
S
 
S
E
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
E
R
 
R
L
 
L
F
 
F
T
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
N
 
N
Y
 
Y
R
 
R
E
 
E
S
 
S
H
 
H
Q
 
Q
R
 
R
P
 
P
L
 
L
I
 
V
I
 
I
V
 
V
H
 
H
G
|
G
G
 
G
G
|
G
C
 
C
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
E
L
 
L
M
 
M
K
 
K
Q
 
G
L
 
L
N
 
N
L
 
L
P
 
P
V
 
V
N
 
K
K
 
K
K
 
K
N
 
N
G
 
G
L
 
L
R
|
R
V
 
V
T
 
T
P
 
P
A
 
A
D
 
D
Q
 
Q
I
 
I
D
 
D
I
 
I
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
|
L
A
 
A
G
 
G
T
 
T
A
 
A
N
 
N
K
 
K
T
 
T
L
 
L
L
 
L
A
 
A
W
 
W
A
 
A
K
 
K
K
 
K
H
 
H
G
 
Q
L
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
F
 
F
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
D
 
D
S
 
S
V
 
V
K
 
K
V
 
V
T
 
T
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
E
 
E
E
 
E
L
 
L
G
 
G
H
 
H
V
 
V
G
 
G
F
 
L
A
 
A
Q
 
Q
P
 
P
G
 
G
S
 
S
P
 
P
A
 
K
L
 
L
I
 
I
N
 
N
T
 
S
L
 
L
L
 
L
A
 
E
G
 
N
G
 
G
Y
 
Y
M
 
L
P
 
P
V
 
V
V
 
V
S
 
S
S
 
S
I
 
I
G
 
G
V
 
V
T
 
T
D
 
D
E
 
E
G
 
G
E
 
Q
L
 
L
M
 
M
N
|
N
V
 
V
N
|
N
A
|
A
D
|
D
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
T
 
T
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
T
 
T
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
L
I
 
I
L
 
L
L
 
L
S
 
S
D
 
D
V
 
V
S
 
S
G
 
G
I
 
I
L
|
L
D
 
D
G
 
G
K
 
K
G
 
G
Q
 
Q
R
 
R
I
 
I
A
 
A
E
 
E
M
 
M
T
 
T
A
 
A
E
 
A
K
 
K
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
I
 
I
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
I
|
I
I
 
I
T
|
T
D
 
D
G
 
G
M
|
M
I
 
I
V
 
V
K
|
K
V
 
V
N
 
N
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
R
T
 
T
L
 
L
G
 
G
R
 
R
P
 
P
V
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
A
S
 
S
W
 
W
R
 
R
H
 
H
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
P
 
P
A
 
A
L
 
L
F
 
F
N
 
N
G
 
G
T
 
M
P
 
P
I
 
M
G
 
G
T
 
T
R
 
R
I
 
I
L
 
L
A
 
A

P0A6C8 Acetylglutamate kinase; N-acetyl-L-glutamate 5-phosphotransferase; NAG kinase; NAGK; EC 2.7.2.8 from Escherichia coli (strain K12) (see 4 papers)
94% identity, 100% coverage: 1:257/257 of query aligns to 2:258/258 of P0A6C8

query
sites
P0A6C8
M
 
M
N
 
N
P
 
P
L
 
L
I
 
I
I
 
I
K
|
K
L
 
L
G
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
L
L
 
L
D
 
D
S
 
S
E
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
E
R
 
R
L
 
L
F
 
F
T
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
N
 
N
Y
 
Y
R
 
R
E
 
E
S
 
S
H
 
H
Q
 
Q
R
 
R
P
 
P
L
 
L
I
 
V
I
 
I
V
 
V
H
 
H
G
 
G
G
|
G
G
|
G
C
 
C
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
E
L
 
L
M
 
M
K
 
K
Q
 
G
L
 
L
N
 
N
L
 
L
P
 
P
V
 
V
N
 
K
K
 
K
K
 
K
N
 
N
G
 
G
L
 
L
R
|
R
V
 
V
T
 
T
P
 
P
A
 
A
D
 
D
Q
 
Q
I
 
I
D
 
D
I
 
I
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
T
 
T
A
 
A
N
 
N
K
 
K
T
 
T
L
 
L
L
 
L
A
 
A
W
 
W
A
 
A
K
 
K
K
 
K
H
 
H
G
 
Q
L
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
F
 
F
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
D
 
D
S
 
S
V
 
V
K
 
K
V
 
V
T
 
T
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
E
 
E
E
 
E
L
 
L
G
 
G
H
 
H
V
 
V
G
 
G
F
 
L
A
 
A
Q
 
Q
P
 
P
G
 
G
S
 
S
P
 
P
A
 
K
L
 
L
I
 
I
N
 
N
T
 
S
L
 
L
L
 
L
A
 
E
G
 
N
G
 
G
Y
 
Y
M
 
L
P
 
P
V
 
V
V
 
V
S
 
S
S
 
S
I
 
I
G
 
G
V
 
V
T
 
T
D
 
D
E
 
E
G
 
G
E
 
Q
L
 
L
M
 
M
N
|
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
D
|
D
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
T
 
T
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
T
 
T
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
L
I
 
I
L
 
L
L
 
L
S
 
S
D
|
D
V
|
V
S
|
S
G
|
G
I
|
I
L
|
L
D
 
D
G
 
G
K
 
K
G
 
G
Q
 
Q
R
 
R
I
 
I
A
 
A
E
 
E
M
 
M
T
 
T
A
 
A
E
 
A
K
 
K
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
I
 
I
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
I
|
I
I
|
I
T
|
T
D
 
D
G
 
G
M
 
M
I
 
I
V
 
V
K
 
K
V
 
V
N
 
N
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
R
T
 
T
L
 
L
G
 
G
R
 
R
P
 
P
V
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
A
S
 
S
W
 
W
R
 
R
H
 
H
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
P
 
P
A
 
A
L
 
L
F
 
F
N
 
N
G
 
G
T
 
M
P
 
P
I
 
M
G
 
G
T
 
T
R
 
R
I
 
I
L
 
L
A
 
A

Sites not aligning to the query:

3t7bB Crystal structure of n-acetyl-l-glutamate kinase from yersinia pestis
85% identity, 99% coverage: 1:255/257 of query aligns to 2:256/258 of 3t7bB

query
sites
3t7bB
M
 
M
N
 
N
P
 
P
L
 
L
I
 
V
I
 
I
K
|
K
L
 
L
G
 
G
G
|
G
V
 
V
L
 
L
L
 
L
D
 
D
S
 
S
E
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
E
R
 
R
L
 
L
F
 
F
T
 
T
A
 
A
L
 
L
V
 
V
N
 
T
Y
 
Y
R
 
R
E
 
E
S
 
K
H
 
H
Q
 
E
R
 
R
P
 
P
L
 
L
I
 
V
I
 
I
V
 
M
H
 
H
G
 
G
G
 
G
G
|
G
C
 
C
V
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
E
L
 
L
M
 
M
K
 
K
Q
 
R
L
 
L
N
 
A
L
 
L
P
 
P
V
 
V
N
 
V
K
 
K
K
 
K
N
 
N
G
 
G
L
 
L
R
|
R
V
 
V
T
 
T
P
 
P
A
 
A
D
 
D
Q
 
Q
I
 
I
D
 
D
I
 
I
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
T
 
T
A
 
A
N
 
N
K
 
K
T
 
T
L
 
L
L
 
L
A
 
A
W
 
W
A
 
A
K
 
V
K
 
K
H
 
H
G
 
Q
L
 
I
A
 
N
A
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
F
 
C
L
 
L
G
 
A
D
 
D
G
 
G
D
 
N
S
 
T
V
 
V
K
 
T
V
 
V
T
 
T
Q
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
A
E
 
E
L
 
L
G
 
G
H
 
H
V
 
V
G
 
G
F
 
K
A
 
A
Q
 
Q
P
 
P
G
 
G
S
 
S
P
 
A
A
 
A
L
 
L
I
 
V
N
 
Q
T
 
T
L
 
L
L
 
L
A
 
A
G
 
A
G
 
G
Y
 
Y
M
 
M
P
 
P
V
 
I
V
 
I
S
 
S
S
 
S
I
 
I
G
 
G
V
 
I
T
 
T
D
 
V
E
 
E
G
 
G
E
 
Q
L
 
L
M
 
M
N
|
N
V
 
V
N
|
N
A
|
A
D
|
D
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
T
 
T
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
T
 
T
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
L
I
 
I
L
 
L
L
 
L
S
 
S
D
 
D
V
 
V
S
 
S
G
 
G
I
 
I
L
 
L
D
 
D
G
 
G
K
 
K
G
 
G
Q
 
Q
R
 
R
I
 
I
A
 
A
E
 
E
M
 
M
T
 
T
A
 
A
E
 
Q
K
 
K
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
I
 
I
E
 
A
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
I
 
I
T
 
T
D
 
D
G
 
G
M
 
M
I
 
V
V
 
V
K
|
K
V
 
V
N
 
N
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
R
T
 
S
L
 
L
G
 
G
R
 
R
P
 
P
V
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
A
S
 
S
W
 
W
R
 
R
H
 
H
A
 
S
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
P
 
P
A
 
A
L
 
L
F
 
F
N
 
N
G
 
G
T
 
V
P
 
P
I
 
I
G
 
G
T
 
T
R
 
R
I
 
I

2btyA Acetylglutamate kinase from thermotoga maritima complexed with its inhibitor arginine (see paper)
35% identity, 86% coverage: 4:225/257 of query aligns to 24:246/282 of 2btyA

query
sites
2btyA
L
 
F
I
 
V
I
 
I
K
|
K
L
 
F
G
|
G
G
|
G
V
 
S
L
 
A
L
 
M
D
 
K
S
 
Q
E
 
E
E
 
N
A
 
A
L
 
K
E
 
K
R
 
A
L
 
F
F
 
I
T
 
Q
A
 
D
L
 
I
V
 
I
N
 
L
Y
 
L
R
 
K
E
 
Y
S
 
T
H
 
G
Q
 
I
R
 
K
P
 
P
L
 
-
I
 
I
I
 
I
V
 
V
H
 
H
G
|
G
G
|
G
G
|
G
C
 
P
V
 
A
V
 
I
D
 
S
E
 
Q
L
 
M
M
 
M
K
 
K
Q
 
D
L
 
L
N
 
G
L
 
I
P
 
E
V
 
P
N
 
V
K
 
F
K
 
K
N
 
N
G
 
G
L
 
H
R
 
R
V
 
V
T
 
T
P
 
D
A
 
E
D
 
K
Q
 
T
I
 
M
D
 
E
I
 
I
I
 
V
T
 
E
G
 
M
A
 
V
L
 
L
A
 
V
G
 
G
T
 
K
A
 
I
N
 
N
K
 
K
T
 
E
L
 
I
L
 
V
A
 
M
W
 
N
A
 
L
K
 
N
K
 
L
H
 
H
G
 
G
L
 
G
A
 
R
A
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
I
F
 
C
L
 
G
G
 
K
D
 
D
G
 
S
D
 
K
S
 
L
V
 
I
K
 
V
V
 
A
T
 
E
Q
 
K
L
 
E
D
 
T
E
 
K
-
 
H
-
 
G
E
 
D
L
 
I
G
 
G
H
 
Y
V
 
V
G
 
G
F
 
K
A
 
V
Q
 
K
P
 
K
G
 
V
S
 
N
P
 
P
A
 
E
L
 
I
I
 
L
N
 
H
T
 
A
L
 
L
L
 
I
A
 
E
G
 
N
G
 
D
Y
 
Y
M
 
I
P
 
P
V
 
V
V
 
I
S
 
A
S
 
P
I
 
V
G
 
G
V
 
I
T
 
G
D
 
E
E
 
D
G
 
G
E
 
H
L
 
S
M
 
Y
N
 
N
V
 
I
N
|
N
A
 
A
D
|
D
Q
 
T
A
 
A
A
 
A
T
 
A
A
 
E
L
 
I
A
 
A
A
 
K
T
 
S
L
 
L
G
 
M
A
 
A
D
 
E
-
x
K
L
 
L
I
 
I
L
 
L
L
 
L
S
 
T
D
 
D
V
 
V
S
 
D
G
 
G
I
 
V
L
 
L
D
 
K
G
 
-
K
 
D
G
 
G
Q
 
K
R
 
L
I
 
I
A
x
S
E
 
T
M
 
L
T
 
T
A
 
P
E
 
D
K
 
E
A
 
A
E
 
E
Q
 
E
L
 
L
I
 
I
E
 
R
Q
 
D
G
 
G
I
 
T
I
 
V
T
 
T
D
 
G
G
 
G
M
 
M
I
 
I
V
 
P
K
|
K
V
 
V
N
 
E
A
 
C
A
 
A
L
 
V
D
 
S
A
 
A
A
 
V
R
 
R

Sites not aligning to the query:

Q9X2A4 Acetylglutamate kinase; N-acetyl-L-glutamate 5-phosphotransferase; NAG kinase; NAGK; EC 2.7.2.8 from Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / DSM 3109 / JCM 10099 / NBRC 100826 / MSB8) (see paper)
35% identity, 86% coverage: 4:225/257 of query aligns to 24:246/282 of Q9X2A4

query
sites
Q9X2A4
L
 
F
I
 
V
I
 
I
K
 
K
L
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
S
L
 
A
L
 
M
D
 
K
S
 
Q
E
 
E
E
 
N
A
 
A
L
 
K
E
 
K
R
 
A
L
 
F
F
 
I
T
 
Q
A
 
D
L
 
I
V
 
I
N
 
L
Y
 
L
R
 
K
E
 
Y
S
 
T
H
 
G
Q
 
I
R
 
K
P
 
P
L
 
-
I
 
I
I
 
I
V
 
V
H
 
H
G
 
G
G
 
G
G
 
G
C
 
P
V
 
A
V
 
I
D
 
S
E
 
Q
L
 
M
M
 
M
K
 
K
Q
 
D
L
 
L
N
 
G
L
 
I
P
 
E
V
 
P
N
 
V
K
 
F
K
 
K
N
 
N
G
 
G
L
 
H
R
 
R
V
 
V
T
 
T
P
 
D
A
 
E
D
 
K
Q
 
T
I
 
M
D
 
E
I
 
I
I
 
V
T
 
E
G
 
M
A
 
V
L
 
L
A
 
V
G
 
G
T
 
K
A
 
I
N
 
N
K
 
K
T
 
E
L
 
I
L
 
V
A
 
M
W
 
N
A
 
L
K
 
N
K
 
L
H
 
H
G
 
G
L
 
G
A
 
R
A
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
I
F
 
C
L
 
G
G
 
K
D
 
D
G
 
S
D
 
K
S
 
L
V
 
I
K
 
V
V
 
A
T
 
E
Q
 
K
L
 
E
D
 
T
E
 
K
-
 
H
-
 
G
E
 
D
L
 
I
G
 
G
H
 
Y
V
 
V
G
 
G
F
 
K
A
 
V
Q
 
K
P
 
K
G
 
V
S
 
N
P
 
P
A
 
E
L
 
I
I
 
L
N
 
H
T
 
A
L
 
L
L
 
I
A
 
E
G
 
N
G
 
D
Y
 
Y
M
 
I
P
 
P
V
 
V
V
 
I
S
 
A
S
 
P
I
 
V
G
 
G
V
 
I
T
 
G
D
 
E
E
 
D
G
 
G
E
 
H
L
 
S
M
 
Y
N
|
N
V
 
I
N
 
N
A
 
A
D
 
D
Q
 
T
A
 
A
A
 
A
T
 
A
A
 
E
L
 
I
A
 
A
A
 
K
T
 
S
L
 
L
G
 
M
A
 
A
D
 
E
-
x
K
L
 
L
I
 
I
L
 
L
L
 
L
S
 
T
D
 
D
V
 
V
S
 
D
G
 
G
I
 
V
L
 
L
D
 
K
G
 
-
K
 
D
G
 
G
Q
 
K
R
 
L
I
 
I
A
x
S
E
 
T
M
 
L
T
 
T
A
 
P
E
 
D
K
 
E
A
 
A
E
 
E
Q
 
E
L
 
L
I
 
I
E
 
R
Q
 
D
G
 
G
I
 
T
I
 
V
T
 
T
D
 
G
G
 
G
M
 
M
I
 
I
V
 
P
K
 
K
V
 
V
N
 
E
A
 
C
A
 
A
L
 
V
D
 
S
A
 
A
A
 
V
R
 
R

Sites not aligning to the query:

2bufA Arginine feed-back inhibitable acetylglutamate kinase (see paper)
34% identity, 86% coverage: 4:225/257 of query aligns to 29:255/292 of 2bufA

query
sites
2bufA
L
 
L
I
 
V
I
 
I
K
|
K
L
 
Y
G
 
G
G
|
G
V
 
N
L
 
A
L
 
M
D
 
E
S
 
S
E
 
E
E
 
E
A
 
L
L
 
K
E
 
A
R
 
G
L
 
F
F
 
A
T
 
R
A
 
D
L
 
V
V
 
V
N
 
L
Y
 
M
R
 
K
E
 
A
S
 
V
H
 
G
Q
 
I
R
 
N
P
 
P
L
 
-
I
 
V
I
 
V
V
 
V
H
 
H
G
|
G
G
|
G
G
|
G
C
 
P
V
 
Q
V
 
I
D
 
G
E
 
D
L
 
L
M
 
L
K
 
K
Q
 
R
L
 
L
N
 
S
L
 
I
P
 
E
V
 
S
N
 
H
K
 
F
K
 
I
N
 
D
G
 
G
L
 
M
R
|
R
V
 
V
T
 
T
P
 
D
A
 
A
D
 
A
Q
 
T
I
 
M
D
 
D
I
 
V
I
 
V
T
 
E
G
 
M
A
 
V
L
 
L
A
 
G
G
 
G
T
 
Q
A
 
V
N
 
N
K
 
K
T
 
D
L
 
I
L
 
V
A
 
N
W
 
L
A
 
I
K
 
N
K
 
R
H
 
H
G
 
G
L
 
G
A
 
S
A
 
A
V
 
I
G
 
G
L
 
L
F
 
T
L
 
G
G
 
K
D
 
D
G
 
A
D
 
E
S
 
L
V
 
I
K
 
R
-
 
A
-
 
K
-
 
K
-
 
L
-
 
T
V
 
V
T
 
T
Q
 
R
L
 
Q
D
 
I
E
 
I
E
 
D
L
 
I
G
 
G
H
 
H
V
 
V
G
 
G
F
 
E
A
 
V
Q
 
T
P
 
G
G
 
V
S
 
N
P
 
V
A
 
G
L
 
L
I
 
L
N
 
N
T
 
M
L
 
L
L
 
V
A
 
K
G
 
G
G
 
D
Y
 
F
M
 
I
P
 
P
V
 
V
V
 
I
S
 
A
S
 
P
I
 
I
G
 
G
V
 
V
T
 
G
D
 
S
E
 
N
G
 
G
E
 
E
L
 
S
M
 
Y
N
|
N
V
 
I
N
 
N
A
|
A
D
|
D
Q
 
L
A
 
V
A
 
A
T
 
G
A
 
K
L
 
V
A
 
A
A
 
E
T
 
A
L
 
L
G
 
K
A
 
A
D
 
E
-
 
K
L
 
L
I
 
M
L
 
L
L
 
L
S
 
T
D
 
N
V
 
I
S
 
A
G
 
G
I
 
L
L
 
M
D
 
D
G
 
K
K
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
R
 
V
I
 
L
A
 
T
E
 
G
M
 
L
T
 
S
A
 
T
E
 
E
K
 
Q
A
 
V
E
 
N
Q
 
E
L
 
L
I
 
I
E
 
A
Q
 
D
G
 
G
I
 
T
I
 
I
T
 
Y
D
 
G
G
 
G
M
 
M
I
 
L
V
 
P
K
|
K
V
 
I
N
 
R
A
 
C
A
 
A
L
 
L
D
 
E
A
 
A
A
 
V
R
 
Q

Q9HTN2 Acetylglutamate kinase; N-acetyl-L-glutamate 5-phosphotransferase; NAG kinase; NAGK; EC 2.7.2.8 from Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1) (see 2 papers)
32% identity, 86% coverage: 4:225/257 of query aligns to 30:264/301 of Q9HTN2

query
sites
Q9HTN2
L
 
L
I
 
V
I
 
I
K
 
K
L
 
Y
G
 
G
G
 
G
V
 
N
L
 
A
L
 
M
D
 
E
S
 
S
E
 
E
E
 
E
A
 
L
L
 
K
E
 
A
R
 
G
L
 
F
F
 
A
T
 
R
A
 
D
L
 
V
V
 
V
N
 
L
Y
 
M
R
 
K
E
 
A
S
 
V
H
 
G
Q
 
I
R
 
N
P
 
P
L
 
-
I
 
V
I
 
V
V
 
V
H
 
H
G
 
G
G
 
G
G
 
G
C
 
P
V
 
Q
V
 
I
D
 
G
E
 
D
L
 
L
M
 
L
K
 
K
Q
 
R
L
 
L
N
 
S
L
 
I
P
 
E
V
 
S
N
 
H
K
 
F
K
 
I
N
 
D
G
 
G
L
 
M
R
|
R
V
 
V
T
 
T
P
 
D
A
 
A
D
 
A
Q
 
T
I
 
M
D
 
D
I
 
V
I
 
V
T
 
E
G
 
M
A
 
V
L
 
L
A
 
G
G
 
G
T
 
Q
A
 
V
N
 
N
K
 
K
T
 
D
L
 
I
L
 
V
A
 
N
W
 
L
A
 
I
K
 
N
K
 
R
H
 
H
G
 
G
L
 
G
A
 
S
A
 
A
V
 
I
G
 
G
L
 
L
F
 
T
L
 
G
G
 
K
D
 
D
G
 
A
D
 
E
S
 
L
V
 
I
K
 
R
V
 
A
T
 
K
Q
 
K
L
 
L
D
 
T
E
 
V
-
 
T
-
 
R
-
 
Q
-
 
T
-
 
P
-
 
E
-
 
M
-
 
T
-
 
K
-
 
P
-
 
E
-
 
I
-
 
I
E
 
D
L
 
I
G
 
G
H
 
H
V
 
V
G
 
G
F
 
E
A
 
V
Q
 
T
P
 
G
G
 
V
S
 
N
P
 
V
A
 
G
L
 
L
I
 
L
N
 
N
T
 
M
L
 
L
L
 
V
A
 
K
G
 
G
G
 
D
Y
 
F
M
 
I
P
 
P
V
 
V
V
 
I
S
 
A
S
 
P
I
 
I
G
 
G
V
 
V
T
 
G
D
 
S
E
 
N
G
 
G
E
 
E
L
 
S
M
 
Y
N
|
N
V
 
I
N
 
N
A
 
A
D
 
D
Q
 
L
A
 
V
A
 
A
T
 
G
A
 
K
L
 
V
A
 
A
A
 
E
T
 
A
L
 
L
G
 
K
A
 
A
D
 
E
-
 
K
L
 
L
I
 
M
L
 
L
L
 
L
S
 
T
D
 
N
V
 
I
S
 
A
G
 
G
I
 
L
L
 
M
D
 
D
G
 
K
K
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
R
 
V
I
 
L
A
 
T
E
 
G
M
 
L
T
 
S
A
 
T
E
 
E
K
 
Q
A
 
V
E
 
N
Q
 
E
L
 
L
I
 
I
E
 
A
Q
 
D
G
 
G
I
 
T
I
 
I
T
 
Y
D
 
G
G
 
G
M
 
M
I
 
L
V
 
P
K
 
K
V
 
I
N
 
R
A
 
C
A
 
A
L
 
L
D
 
E
A
 
A
A
 
V
R
 
Q

Sites not aligning to the query:

2bufC Arginine feed-back inhibitable acetylglutamate kinase (see paper)
32% identity, 86% coverage: 4:225/257 of query aligns to 29:263/298 of 2bufC

query
sites
2bufC
L
 
L
I
 
V
I
 
I
K
|
K
L
 
Y
G
 
G
G
|
G
V
x
N
L
 
A
L
 
M
D
 
E
S
 
S
E
 
E
E
 
E
A
 
L
L
 
K
E
 
A
R
 
G
L
 
F
F
 
A
T
 
R
A
 
D
L
 
V
V
 
V
N
 
L
Y
 
M
R
 
K
E
 
A
S
 
V
H
 
G
Q
 
I
R
 
N
P
 
P
L
 
-
I
 
V
I
 
V
V
 
V
H
 
H
G
 
G
G
 
G
G
|
G
C
 
P
V
 
Q
V
 
I
D
 
G
E
 
D
L
 
L
M
 
L
K
 
K
Q
 
R
L
 
L
N
 
S
L
 
I
P
 
E
V
 
S
N
 
H
K
 
F
K
 
I
N
 
D
G
 
G
L
 
M
R
 
R
V
 
V
T
 
T
P
 
D
A
 
A
D
 
A
Q
 
T
I
 
M
D
 
D
I
 
V
I
 
V
T
 
E
G
 
M
A
 
V
L
 
L
A
 
G
G
 
G
T
 
Q
A
 
V
N
 
N
K
 
K
T
 
D
L
 
I
L
 
V
A
 
N
W
 
L
A
 
I
K
 
N
K
 
R
H
 
H
G
 
G
L
 
G
A
 
S
A
 
A
V
 
I
G
 
G
L
 
L
F
 
T
L
 
G
G
 
K
D
 
D
G
 
A
D
 
E
S
 
L
V
 
I
K
 
R
V
 
A
T
 
K
Q
 
K
L
 
L
D
 
T
E
 
V
-
 
T
-
 
R
-
 
Q
-
 
T
-
 
P
-
 
E
-
 
M
-
 
T
-
 
K
-
 
P
-
 
E
-
 
I
-
 
I
E
 
D
L
 
I
G
 
G
H
 
H
V
 
V
G
 
G
F
 
E
A
 
V
Q
 
T
P
 
G
G
 
V
S
 
N
P
 
V
A
 
G
L
 
L
I
 
L
N
 
N
T
 
M
L
 
L
L
 
V
A
 
K
G
 
G
G
 
D
Y
 
F
M
 
I
P
 
P
V
 
V
V
 
I
S
 
A
S
 
P
I
 
I
G
 
G
V
 
V
T
 
G
D
 
S
E
 
N
G
 
G
E
 
E
L
 
S
M
 
Y
N
 
N
V
 
I
N
 
N
A
 
A
D
|
D
Q
 
L
A
 
V
A
 
A
T
 
G
A
 
K
L
 
V
A
 
A
A
 
E
T
 
A
L
 
L
G
 
K
A
 
A
D
 
E
-
 
K
L
 
L
I
 
M
L
 
L
L
 
L
S
 
T
D
x
N
V
 
I
S
 
A
G
 
G
I
x
L
L
x
M
D
 
D
G
 
K
K
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
R
 
V
I
 
L
A
 
T
E
 
G
M
 
L
T
 
S
A
 
T
E
 
E
K
 
Q
A
 
V
E
 
N
Q
 
E
L
 
L
I
 
I
E
 
A
Q
 
D
G
 
G
I
x
T
I
|
I
T
x
Y
D
 
G
G
|
G
M
|
M
I
 
L
V
 
P
K
|
K
V
 
I
N
 
R
A
 
C
A
 
A
L
 
L
D
 
E
A
 
A
A
 
V
R
 
Q

Q9SCL7 Acetylglutamate kinase, chloroplastic; N-acetyl-L-glutamate 5-phosphotransferase; NAG kinase; AtNAGK; EC 2.7.2.8 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see 3 papers)
35% identity, 90% coverage: 4:235/257 of query aligns to 88:321/347 of Q9SCL7

query
sites
Q9SCL7
L
 
I
I
 
V
I
 
V
K
 
K
L
 
Y
G
 
G
G
|
G
V
x
A
L
 
A
L
 
M
D
 
T
S
 
S
E
 
P
E
 
E
A
 
L
L
 
K
E
 
S
R
 
S
L
 
V
F
 
V
T
 
S
A
 
D
L
 
L
V
 
V
N
 
L
Y
 
L
R
 
A
E
 
C
S
 
V
H
 
G
Q
 
L
R
 
R
P
 
P
L
 
-
I
 
I
I
 
L
V
 
V
H
 
H
G
 
G
G
|
G
G
 
G
C
 
P
V
 
D
V
 
I
D
 
N
E
 
R
L
 
Y
M
 
L
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
N
 
N
L
 
I
P
 
P
V
 
A
N
 
E
K
 
F
K
 
R
N
 
D
G
 
G
L
 
L
R
|
R
V
 
V
T
 
T
P
 
D
A
 
A
D
 
T
Q
 
T
I
 
M
D
 
E
I
 
I
I
 
V
T
 
S
G
 
M
A
 
V
L
 
L
A
 
V
G
 
G
T
 
K
A
 
V
N
 
N
K
 
K
T
 
N
L
 
L
L
 
V
A
 
S
W
 
L
A
 
I
K
 
N
K
 
A
H
 
A
G
 
G
L
 
A
A
 
T
A
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
F
 
S
L
 
G
G
 
H
D
 
D
G
 
G
D
 
R
-
 
L
-
 
L
S
 
T
V
 
A
K
 
R
V
 
P
T
 
V
Q
 
P
L
 
N
D
 
S
E
 
A
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
H
 
F
V
 
V
G
 
G
F
 
E
A
 
V
Q
 
A
P
 
R
G
 
V
S
 
D
P
 
P
A
 
S
L
 
V
I
 
L
N
 
R
T
 
P
L
 
L
L
 
V
A
 
D
G
 
Y
G
 
G
Y
 
Y
M
 
I
P
 
P
V
 
V
V
 
I
S
 
A
S
 
S
I
 
V
G
 
A
V
 
A
T
 
D
D
 
D
E
 
S
G
 
G
E
 
Q
L
 
A
M
 
Y
N
|
N
V
x
I
N
|
N
A
|
A
D
 
D
Q
 
T
A
 
V
-
 
A
A
 
G
T
 
E
A
 
L
L
 
A
A
 
A
A
 
A
T
 
L
L
 
G
G
 
A
A
 
E
D
x
K
L
 
L
I
 
I
L
 
L
L
 
L
S
x
T
D
|
D
V
 
V
S
 
A
G
 
G
I
 
I
L
|
L
D
 
E
G
 
N
K
 
K
-
 
E
-
 
D
-
 
P
G
 
S
Q
 
S
R
 
L
I
 
I
A
x
K
E
 
E
M
 
I
T
 
D
A
 
I
E
 
K
K
 
G
A
 
V
E
 
K
Q
 
K
L
 
M
I
 
I
E
 
E
Q
 
D
G
 
G
I
x
K
I
x
V
T
x
A
D
x
G
G
|
G
M
|
M
I
|
I
V
x
P
K
|
K
V
 
V
N
 
K
A
 
C
A
 
C
L
 
I
D
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
R
T
 
S
L
 
L
G
 
A
R
 
Q
P
 
G
V
 
V
D
 
K
I
 
T
A
 
A
S
 
S

Sites not aligning to the query:

4usjB N-acetylglutamate kinase from arabidopsis thaliana in complex with pii from chlamydomonas reinhardtii (see paper)
35% identity, 90% coverage: 4:235/257 of query aligns to 22:255/281 of 4usjB

query
sites
4usjB
L
 
I
I
 
V
I
 
V
K
|
K
L
 
Y
G
 
G
G
|
G
V
 
A
L
 
A
L
 
M
D
 
T
S
 
S
E
 
P
E
 
E
A
 
L
L
 
K
E
 
S
R
 
S
L
 
V
F
 
V
T
 
S
A
 
D
L
 
L
V
 
V
N
 
L
Y
 
L
R
 
A
E
 
C
S
 
V
H
 
G
Q
 
L
R
 
R
P
 
P
L
 
-
I
 
I
I
 
L
V
 
V
H
 
H
G
|
G
G
|
G
G
|
G
C
 
P
V
 
D
V
 
I
D
 
N
E
 
R
L
 
Y
M
 
L
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
N
 
N
L
 
I
P
 
P
V
 
A
N
 
E
K
 
F
K
 
R
N
 
D
G
 
G
L
 
L
R
|
R
V
 
V
T
 
T
P
 
D
A
 
A
D
 
T
Q
 
T
I
 
M
D
 
E
I
 
I
I
 
V
T
 
S
G
 
M
A
 
V
L
 
L
A
 
V
G
 
G
T
 
K
A
 
V
N
 
N
K
 
K
T
 
N
L
 
L
L
 
V
A
 
S
W
 
L
A
 
I
K
 
N
K
 
A
H
 
A
G
 
G
L
 
A
A
 
T
A
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
F
 
S
L
 
G
G
 
H
D
 
D
G
 
G
D
 
R
-
 
L
-
 
L
S
 
T
V
 
A
K
 
R
V
 
P
T
 
V
Q
 
P
L
 
N
D
 
S
E
 
A
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
H
 
F
V
 
V
G
 
G
F
 
E
A
 
V
Q
 
A
P
 
R
G
 
V
S
 
D
P
 
P
A
 
S
L
 
V
I
 
L
N
 
R
T
 
P
L
 
L
L
 
V
A
 
D
G
 
Y
G
 
G
Y
 
Y
M
 
I
P
 
P
V
 
V
V
 
I
S
 
A
S
 
S
I
 
V
G
 
A
V
 
A
T
 
D
D
 
D
E
 
S
G
 
G
E
 
Q
L
 
A
M
 
Y
N
|
N
V
 
I
N
 
N
A
|
A
D
|
D
Q
 
T
A
 
V
-
 
A
A
 
G
T
 
E
A
 
L
L
 
A
A
 
A
A
 
A
T
 
L
L
 
G
G
 
A
A
 
E
D
x
K
L
 
L
I
 
I
L
 
L
L
 
L
S
 
T
D
 
D
V
 
V
S
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
L
D
 
E
G
 
N
K
 
K
-
 
E
-
 
D
-
 
P
G
 
S
Q
 
S
R
 
L
I
 
I
A
x
K
E
 
E
M
 
I
T
 
D
A
 
I
E
 
K
K
 
G
A
 
V
E
 
K
Q
 
K
L
 
M
I
 
I
E
 
E
Q
 
D
G
 
G
I
 
K
I
 
V
T
 
A
D
 
G
G
 
G
M
 
M
I
 
I
V
 
P
K
|
K
V
 
V
N
 
K
A
 
C
A
 
C
L
 
I
D
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
R
T
 
S
L
 
L
G
 
A
R
 
Q
P
 
G
V
 
V
D
 
K
I
 
T
A
 
A
S
 
S

Sites not aligning to the query:

2rd5B Structural basis for the regulation of n-acetylglutamate kinase by pii in arabidopsis thaliana (see paper)
35% identity, 90% coverage: 4:235/257 of query aligns to 24:257/283 of 2rd5B

query
sites
2rd5B
L
 
I
I
 
V
I
 
V
K
|
K
L
 
Y
G
 
G
G
|
G
V
x
A
L
 
A
L
 
M
D
 
T
S
 
S
E
 
P
E
 
E
A
 
L
L
 
K
E
 
S
R
 
S
L
 
V
F
 
V
T
 
S
A
 
D
L
 
L
V
 
V
N
 
L
Y
 
L
R
 
A
E
 
C
S
 
V
H
 
G
Q
 
L
R
 
R
P
 
P
L
 
-
I
 
I
I
 
L
V
 
V
H
 
H
G
|
G
G
 
G
G
|
G
C
 
P
V
 
D
V
 
I
D
 
N
E
 
R
L
 
Y
M
 
L
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
N
 
N
L
 
I
P
 
P
V
 
A
N
 
E
K
 
F
K
 
R
N
 
D
G
 
G
L
 
L
R
|
R
V
 
V
T
 
T
P
 
D
A
 
A
D
 
T
Q
 
T
I
 
M
D
 
E
I
 
I
I
 
V
T
 
S
G
 
M
A
 
V
L
 
L
A
 
V
G
 
G
T
 
K
A
 
V
N
 
N
K
 
K
T
 
N
L
 
L
L
 
V
A
 
S
W
 
L
A
 
I
K
 
N
K
 
A
H
 
A
G
 
G
L
 
A
A
 
T
A
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
F
 
S
L
 
G
G
 
H
D
 
D
G
 
G
D
 
R
-
 
L
-
 
L
S
 
T
V
 
A
K
 
R
V
 
P
T
 
V
Q
 
P
L
 
N
D
 
S
E
 
A
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
H
 
F
V
 
V
G
 
G
F
 
E
A
 
V
Q
 
A
P
 
R
G
 
V
S
 
D
P
 
P
A
 
S
L
 
V
I
 
L
N
 
R
T
 
P
L
 
L
L
 
V
A
 
D
G
 
Y
G
 
G
Y
 
Y
M
 
I
P
 
P
V
 
V
V
 
I
S
 
A
S
 
S
I
 
V
G
 
A
V
 
A
T
 
D
D
 
D
E
 
S
G
 
G
E
 
Q
L
 
A
M
 
Y
N
|
N
V
 
I
N
|
N
A
|
A
D
|
D
Q
 
T
A
 
V
-
 
A
A
 
G
T
 
E
A
 
L
L
 
A
A
 
A
A
 
A
T
 
L
L
 
G
G
 
A
A
 
E
D
x
K
L
 
L
I
 
I
L
 
L
L
 
L
S
x
T
D
|
D
V
 
V
S
 
A
G
 
G
I
 
I
L
|
L
D
 
E
G
 
N
K
|
K
-
 
E
-
 
D
-
 
P
G
 
S
Q
 
S
R
 
L
I
 
I
A
x
K
E
 
E
M
 
I
T
 
D
A
 
I
E
 
K
K
 
G
A
 
V
E
 
K
Q
 
K
L
 
M
I
 
I
E
 
E
Q
 
D
G
 
G
I
 
K
I
 
V
T
x
A
D
 
G
G
|
G
M
|
M
I
 
I
V
 
P
K
|
K
V
 
V
N
 
K
A
 
C
A
 
C
L
 
I
D
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
R
T
 
S
L
 
L
G
 
A
R
 
Q
P
 
G
V
 
V
D
 
K
I
 
T
A
 
A
S
 
S

Sites not aligning to the query:

2v5hB Controlling the storage of nitrogen as arginine: the complex of pii and acetylglutamate kinase from synechococcus elongatus pcc 7942 (see paper)
33% identity, 98% coverage: 4:256/257 of query aligns to 25:282/289 of 2v5hB

query
sites
2v5hB
L
 
V
I
 
V
I
 
V
K
|
K
L
 
Y
G
 
G
G
|
G
V
 
A
L
 
A
L
 
M
D
 
K
S
 
Q
E
 
E
E
 
E
A
 
L
L
 
K
E
 
E
R
 
A
L
 
V
F
 
M
T
 
R
A
 
D
L
 
I
V
 
V
N
 
F
Y
 
L
R
 
A
E
 
C
S
 
V
H
 
G
Q
 
M
R
 
R
P
 
P
L
 
-
I
 
V
I
 
V
V
 
V
H
 
H
G
|
G
G
 
G
G
|
G
C
 
P
V
 
E
V
 
I
D
 
N
E
 
A
L
 
W
M
 
L
K
 
G
Q
 
R
L
 
V
N
 
G
L
 
I
P
 
E
V
 
P
N
 
Q
K
 
F
K
 
H
N
 
N
G
 
G
L
 
L
R
|
R
V
 
V
T
 
T
P
 
D
A
 
A
D
 
D
Q
 
T
I
 
M
D
 
E
I
 
V
I
 
V
T
 
E
G
 
M
A
 
V
L
 
L
A
 
V
G
 
G
T
 
R
A
 
V
N
 
N
K
 
K
T
 
D
L
 
I
L
 
V
A
 
S
W
 
R
A
 
I
K
 
N
K
 
T
H
 
T
G
 
G
L
 
G
A
 
R
A
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
F
F
 
C
L
 
G
G
 
T
D
 
D
G
 
G
D
 
R
S
 
L
V
 
V
K
 
L
V
 
A
T
 
R
Q
 
P
L
 
H
D
 
D
E
 
Q
E
 
E
-
 
G
L
 
I
G
 
G
H
 
F
V
 
V
G
 
G
F
 
E
A
 
V
Q
 
N
P
 
S
G
 
V
S
 
N
P
 
S
A
 
E
L
 
V
I
 
I
N
 
E
T
 
P
L
 
L
L
 
L
A
 
E
G
 
R
G
 
G
Y
 
Y
M
 
I
P
 
P
V
 
V
V
 
I
S
 
S
S
 
S
I
 
V
G
 
A
V
 
A
T
 
D
D
 
E
E
 
N
G
 
G
E
 
Q
L
 
S
M
 
F
N
|
N
V
 
I
N
 
N
A
|
A
D
|
D
Q
 
T
A
 
V
A
 
A
T
 
G
A
 
E
L
 
I
A
 
A
A
 
A
T
 
A
L
 
L
G
 
N
A
 
A
D
 
E
-
 
K
L
 
L
I
 
I
L
 
L
L
 
L
S
 
T
D
 
D
V
 
T
S
 
R
G
 
G
I
 
I
L
 
L
D
 
E
G
 
D
K
 
P
G
 
K
Q
 
R
R
 
P
-
 
E
-
 
S
-
 
L
I
 
I
A
 
P
E
 
R
M
 
L
T
 
N
A
 
I
E
 
P
K
 
Q
A
 
S
E
 
R
Q
 
E
L
 
L
I
 
I
E
 
A
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
I
 
V
T
 
G
D
 
G
G
 
G
M
 
M
I
 
I
V
 
P
K
|
K
V
 
V
N
 
D
A
 
C
A
 
C
L
 
I
D
 
R
A
 
S
A
 
L
R
 
A
T
 
Q
L
 
G
G
 
V
R
 
R
P
 
A
V
 
A
D
 
H
I
 
I
A
 
I
S
 
D
W
 
G
R
 
R
-
 
I
-
 
P
H
 
H
A
 
A
E
 
L
Q
 
L
L
 
L
P
 
-
A
 
E
L
 
I
F
 
F
N
 
T
G
 
D
T
 
A
P
 
G
I
 
I
G
 
G
T
 
T
R
 
M
I
 
I
L
 
V

2bufK Arginine feed-back inhibitable acetylglutamate kinase (see paper)
33% identity, 86% coverage: 4:225/257 of query aligns to 29:240/273 of 2bufK

query
sites
2bufK
L
 
L
I
 
V
I
 
I
K
|
K
L
 
Y
G
 
G
G
|
G
V
 
N
L
 
A
L
 
M
D
 
E
S
 
S
E
 
E
E
 
E
A
 
L
L
 
K
E
 
A
R
 
G
L
 
F
F
 
A
T
 
R
A
 
D
L
 
V
V
 
V
N
 
L
Y
 
M
R
 
K
E
 
A
S
 
V
H
 
G
Q
 
I
R
 
N
P
 
P
L
 
-
I
 
V
I
 
V
V
 
V
H
 
H
G
 
G
G
 
G
G
|
G
C
 
P
V
 
Q
V
 
I
D
 
G
E
 
D
L
 
L
M
 
L
K
 
K
Q
 
R
L
 
L
N
 
S
L
 
I
P
 
E
V
 
S
N
 
H
K
 
-
K
 
-
N
 
-
G
 
-
L
 
-
R
|
R
V
 
V
T
 
T
P
 
D
A
 
A
D
 
A
Q
 
T
I
 
M
D
 
D
I
 
V
I
 
V
T
 
E
G
 
M
A
 
V
L
 
L
A
 
G
G
 
G
T
 
Q
A
 
V
N
 
N
K
 
K
T
 
D
L
 
I
L
 
V
A
 
N
W
 
L
A
 
I
K
 
N
K
 
R
H
 
H
G
 
G
L
 
G
A
 
S
A
 
A
V
 
I
G
 
G
L
 
L
F
 
T
L
 
G
G
 
K
D
 
D
G
 
A
D
 
E
S
 
L
V
 
I
K
 
R
V
 
A
T
 
K
Q
 
K
L
 
L
D
 
T
E
 
-
E
 
-
L
 
-
G
 
-
H
 
-
V
 
V
G
 
G
F
 
E
A
 
V
Q
 
T
P
 
G
G
 
V
S
 
N
P
 
V
A
 
G
L
 
L
I
 
L
N
 
N
T
 
M
L
 
L
L
 
V
A
 
K
G
 
G
G
 
D
Y
 
F
M
 
I
P
 
P
V
 
V
V
 
I
S
 
A
S
 
P
I
 
I
G
 
G
V
 
V
T
 
G
D
 
S
E
 
N
G
 
G
E
 
E
L
 
S
M
 
Y
N
|
N
V
 
I
N
|
N
A
|
A
D
|
D
Q
 
L
A
 
V
A
 
A
T
 
G
A
 
K
L
 
V
A
 
A
A
 
E
T
 
A
L
 
L
G
 
K
A
 
A
D
 
E
-
 
K
L
 
L
I
 
M
L
 
L
L
 
L
S
 
T
D
 
N
V
 
I
S
 
A
G
 
G
I
 
L
L
 
M
D
 
D
G
 
K
K
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
R
 
V
I
 
L
A
 
T
E
 
G
M
 
L
T
 
S
A
 
T
E
 
E
K
 
Q
A
 
V
E
 
N
Q
 
E
L
 
L
I
 
I
E
 
A
Q
 
D
G
 
G
I
 
T
I
 
I
T
 
Y
D
 
G
G
 
G
M
 
M
I
 
L
V
 
P
K
|
K
V
 
I
N
 
R
A
 
C
A
 
A
L
 
L
D
 
E
A
 
A
A
 
V
R
 
Q

3l86A The crystal structure of smu.665 from streptococcus mutans ua159
33% identity, 84% coverage: 4:220/257 of query aligns to 5:219/245 of 3l86A

query
sites
3l86A
L
 
I
I
 
V
I
 
I
K
|
K
L
 
I
G
 
G
G
|
G
V
 
V
L
 
-
L
 
-
D
 
-
S
 
A
E
 
S
E
 
Q
A
 
Q
L
 
L
E
 
S
R
 
G
L
 
D
F
 
F
T
 
L
A
 
S
L
 
Q
V
 
I
N
 
K
Y
 
N
R
 
W
E
 
Q
S
 
D
H
 
A
Q
 
G
R
 
K
P
 
Q
L
 
L
I
 
V
I
 
I
V
 
V
H
 
H
G
|
G
G
|
G
G
|
G
C
 
F
V
 
A
V
x
I
D
 
N
E
 
K
L
 
L
M
 
M
K
 
E
Q
 
E
L
 
N
N
 
Q
L
 
V
P
 
P
V
 
V
N
 
K
K
 
K
K
 
I
N
 
N
G
 
G
L
 
L
R
|
R
V
 
V
T
 
T
P
 
S
A
 
K
D
 
D
Q
 
D
I
 
M
D
 
V
I
 
L
I
 
V
T
 
S
G
 
H
A
 
A
L
 
L
A
 
L
G
 
D
T
 
L
A
 
V
N
 
G
K
 
K
T
 
N
L
 
L
L
 
Q
A
 
E
W
 
K
A
 
L
K
 
R
K
 
Q
H
 
A
G
 
G
L
 
V
A
 
S
A
 
C
V
 
Q
G
 
Q
L
 
L
F
 
K
L
 
S
G
 
D
D
 
I
G
 
K
D
 
H
S
 
V
V
 
V
K
 
A
V
 
A
T
 
D
Q
 
Y
L
 
L
D
 
D
E
 
K
E
 
D
-
 
T
L
 
Y
G
 
G
H
 
Y
V
 
V
G
 
G
F
 
D
A
 
V
Q
 
T
P
 
H
G
 
I
S
 
N
P
 
K
A
 
R
L
 
V
I
 
I
N
 
E
T
 
E
L
 
F
L
 
L
A
 
E
G
 
N
G
 
R
Y
 
Q
M
 
I
P
 
P
V
 
I
V
 
L
S
 
A
S
|
S
I
 
L
G
 
G
V
 
Y
T
 
S
D
 
K
E
 
E
G
 
G
E
 
D
L
 
M
M
 
L
N
|
N
V
x
I
N
|
N
A
|
A
D
|
D
Q
 
Y
A
 
L
A
 
A
T
 
T
A
 
A
L
 
V
A
 
A
A
 
V
T
 
A
L
 
L
G
 
A
A
 
A
D
 
D
-
 
K
L
 
L
I
 
I
L
 
L
L
 
M
S
x
T
D
 
N
V
 
V
S
 
K
G
 
G
I
 
V
L
|
L
D
 
E
G
 
N
K
 
-
G
 
G
Q
 
A
R
 
V
I
 
L
A
 
E
E
 
K
M
 
I
T
 
T
A
 
S
E
 
H
K
 
Q
A
 
V
E
 
Q
Q
 
E
L
 
K
I
 
I
E
 
D
Q
 
T
G
 
A
I
 
V
I
 
I
T
|
T
D
 
A
G
|
G
M
|
M
I
 
I
V
 
P
K
|
K
V
 
I
N
 
E
A
 
S
A
 
A

7nloA Crystal structure of mycobacterium tuberculosis argb in complex with l-arginine
30% identity, 86% coverage: 4:223/257 of query aligns to 26:253/289 of 7nloA

query
sites
7nloA
L
 
V
I
 
V
I
 
V
K
 
K
L
 
Y
G
 
G
G
 
G
V
 
N
L
 
A
L
 
M
D
 
-
S
 
T
E
 
D
E
 
D
A
 
T
L
 
L
E
 
R
R
 
R
L
 
A
F
 
F
T
 
A
A
 
A
L
 
D
V
 
M
N
 
A
Y
 
F
R
 
L
E
 
R
S
 
N
H
 
C
Q
 
G
R
 
I
P
 
H
L
 
P
I
 
V
I
 
V
V
 
V
H
 
H
G
 
G
G
 
G
G
 
G
C
 
P
V
 
Q
V
 
I
D
 
T
E
 
A
L
 
M
M
 
L
K
 
R
Q
 
R
L
 
L
N
 
G
L
 
I
P
 
E
V
 
G
N
 
D
K
 
F
K
 
K
N
 
G
G
 
G
L
 
F
R
 
R
V
 
V
T
 
T
P
 
T
A
 
P
D
 
E
Q
 
V
I
 
L
D
 
D
I
 
V
I
 
A
T
 
R
G
 
M
A
 
V
L
 
L
A
 
F
G
 
G
T
 
Q
A
 
V
N
 
G
K
 
R
T
 
E
L
 
L
L
 
V
A
 
N
W
 
L
A
 
I
K
 
N
K
 
A
H
 
H
G
 
G
L
 
P
A
 
Y
A
 
A
V
 
V
G
 
G
-
 
I
-
 
T
-
 
G
-
 
E
-
 
D
-
 
A
-
 
Q
L
 
L
F
 
F
L
 
T
G
 
A
D
 
V
G
 
R
D
 
R
S
 
S
V
 
V
K
 
T
V
 
V
T
 
D
Q
 
G
L
 
V
D
 
A
E
 
T
E
 
D
L
 
I
G
 
G
H
 
L
V
 
V
G
 
G
F
 
D
A
 
V
Q
 
D
P
 
Q
G
 
V
S
 
N
P
 
T
A
 
A
L
 
A
I
 
M
N
 
L
T
 
D
L
 
L
L
 
V
A
 
A
G
 
A
G
 
G
Y
 
R
M
 
I
P
 
P
V
 
V
V
 
V
S
 
S
S
 
T
I
 
L
G
 
A
V
 
P
T
 
D
D
 
A
E
 
D
G
 
G
E
 
V
L
 
V
M
 
H
N
 
N
V
 
I
N
 
N
A
 
A
D
 
D
Q
 
T
A
 
A
A
 
A
T
 
A
A
 
A
L
 
V
A
 
A
A
 
E
T
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
E
-
x
K
L
 
L
I
 
L
L
 
M
L
 
L
S
 
T
D
 
D
V
 
I
S
 
D
G
 
G
I
 
L
L
 
Y
D
 
T
G
 
R
K
 
W
G
 
P
Q
 
D
R
 
R
-
 
D
-
 
S
-
 
L
I
 
V
A
x
S
E
 
E
M
 
I
T
 
D
A
 
T
E
 
G
K
 
T
A
 
L
E
 
A
Q
 
Q
L
 
L
I
 
L
E
 
P
Q
 
T
G
 
-
I
 
-
I
 
L
T
 
E
D
 
S
G
 
G
M
 
M
I
 
V
V
 
P
K
 
K
V
 
V
N
 
E
A
 
A
A
 
C
L
 
L
D
 
R
A
 
A

Sites not aligning to the query:

7nlyA Crystal structure of mycobacterium tuberculosis argb in complex with 2-chlorobenzimidazole.
30% identity, 86% coverage: 4:223/257 of query aligns to 30:257/293 of 7nlyA

query
sites
7nlyA
L
 
V
I
 
V
I
 
V
K
 
K
L
 
Y
G
 
G
G
 
G
V
 
N
L
 
A
L
 
M
D
 
-
S
 
T
E
 
D
E
 
D
A
 
T
L
 
L
E
 
R
R
 
R
L
 
A
F
 
F
T
 
A
A
 
A
L
 
D
V
 
M
N
 
A
Y
 
F
R
 
L
E
 
R
S
 
N
H
 
C
Q
 
G
R
 
I
P
 
H
L
 
P
I
 
V
I
 
V
V
 
V
H
 
H
G
 
G
G
 
G
G
 
G
C
 
P
V
 
Q
V
 
I
D
 
T
E
 
A
L
 
M
M
 
L
K
 
R
Q
 
R
L
 
L
N
 
G
L
 
I
P
 
E
V
 
G
N
 
D
K
 
F
K
 
K
N
 
G
G
 
G
L
 
F
R
 
R
V
 
V
T
 
T
P
 
T
A
 
P
D
 
E
Q
 
V
I
 
L
D
 
D
I
 
V
I
 
A
T
 
R
G
 
M
A
 
V
L
 
L
A
 
F
G
 
G
T
 
Q
A
 
V
N
 
G
K
 
R
T
 
E
L
 
L
L
 
V
A
 
N
W
 
L
A
 
I
K
 
N
K
 
A
H
 
H
G
 
G
L
 
P
A
 
Y
A
 
A
V
|
V
G
 
G
-
 
I
-
 
T
-
 
G
-
 
E
-
 
D
-
 
A
-
 
Q
L
 
L
F
 
F
L
 
T
G
 
A
D
 
V
G
 
R
D
 
R
S
 
S
V
 
V
K
 
T
V
 
V
T
 
D
Q
 
G
L
 
V
D
 
A
E
 
T
E
 
D
L
 
I
G
 
G
H
 
L
V
 
V
G
 
G
F
 
D
A
 
V
Q
 
D
P
 
Q
G
 
V
S
 
N
P
 
T
A
 
A
L
 
A
I
 
M
N
 
L
T
 
D
L
|
L
L
 
V
A
 
A
G
 
A
G
 
G
Y
 
R
M
 
I
P
 
P
V
 
V
V
 
V
S
 
S
S
 
T
I
 
L
G
 
A
V
 
P
T
 
D
D
 
A
E
 
D
G
 
G
E
 
V
L
 
V
M
 
H
N
 
N
V
 
I
N
 
N
A
 
A
D
 
D
Q
 
T
A
 
A
A
 
A
T
 
A
A
 
A
L
 
V
A
 
A
A
 
E
T
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
E
-
 
K
L
 
L
I
 
L
L
 
M
L
 
L
S
 
T
D
 
D
V
 
I
S
 
D
G
 
G
I
 
L
L
 
Y
D
 
T
G
 
R
K
 
W
G
 
P
Q
 
D
R
 
R
-
 
D
-
 
S
-
 
L
I
 
V
A
 
S
E
 
E
M
 
I
T
 
D
A
 
T
E
 
G
K
 
T
A
 
L
E
 
A
Q
 
Q
L
 
L
I
 
L
E
 
P
Q
 
T
G
 
-
I
 
-
I
 
L
T
 
E
D
 
S
G
 
G
M
 
M
I
 
V
V
 
P
K
 
K
V
 
V
N
 
E
A
 
A
A
 
C
L
 
L
D
 
R
A
 
A

7nlpA Crystal structure of mycobacterium tuberculosis argb in complex with l-canavanine
30% identity, 86% coverage: 4:223/257 of query aligns to 29:256/292 of 7nlpA

query
sites
7nlpA
L
 
V
I
 
V
I
 
V
K
 
K
L
 
Y
G
 
G
G
 
G
V
 
N
L
 
A
L
 
M
D
 
-
S
 
T
E
 
D
E
 
D
A
 
T
L
 
L
E
 
R
R
 
R
L
 
A
F
 
F