SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing BWI76_RS01745 FitnessBrowser__Koxy:BWI76_RS01745 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
32% identity, 96% coverage: 7:263/267 of query aligns to 5:241/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
L
 
L
K
 
Q
E
 
D
K
 
K
I
 
V
I
 
A
T
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
A
S
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
E
I
 
A
V
 
A
D
 
R
E
 
V
L
 
F
L
 
M
A
 
K
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
N
 
K
V
 
V
Q
 
V
M
 
I
I
 
A
D
|
D
I
x
F
H
 
N
-
 
E
-
 
A
-
 
A
G
 
G
G
 
K
D
 
E
K
 
A
H
 
V
Q
 
E
S
 
A
S
 
N
G
 
P
N
 
G
Y
 
V
N
 
V
F
 
F
W
 
I
P
 
R
T
x
V
D
|
D
I
x
V
S
 
S
S
 
D
A
 
R
S
 
E
E
 
S
V
 
V
H
 
H
K
 
R
T
 
L
V
 
V
D
 
E
H
 
N
I
 
V
I
 
A
Q
 
E
R
 
R
F
 
F
G
 
G
R
 
K
I
 
I
D
 
D
G
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
N
 
T
-
 
R
-
x
D
-
 
S
-
 
M
F
 
L
P
 
S
R
x
K
L
 
M
L
 
T
V
 
V
D
 
D
E
 
Q
K
 
-
A
 
-
P
 
-
S
 
-
G
 
-
R
 
-
Y
 
-
E
 
-
L
 
-
N
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
F
 
F
E
 
Q
K
 
Q
M
 
V
V
 
I
N
 
N
I
 
V
N
|
N
Q
 
L
K
 
T
G
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
H
M
 
C
S
 
T
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
L
R
 
P
Q
 
Y
M
 
M
V
 
A
K
 
E
Q
 
Q
R
 
G
S
 
K
G
 
G
V
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
x
T
S
 
S
S
|
S
E
 
V
S
 
T
G
 
G
L
 
T
E
 
Y
G
 
G
S
x
N
E
x
V
G
 
G
Q
|
Q
S
 
T
C
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
L
 
V
N
 
I
S
 
G
F
 
M
T
 
T
R
 
K
S
 
T
W
 
W
S
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
L
G
 
A
K
 
R
H
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
V
 
N
G
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
I
x
F
L
x
T
E
 
E
K
x
T
T
 
A
G
x
M
L
 
V
-
 
A
R
 
E
T
 
V
P
 
P
E
 
E
Y
 
K
E
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
W
 
-
T
 
-
R
 
-
N
 
-
I
 
-
T
 
V
V
 
I
E
 
E
Q
x
K
L
 
M
R
 
-
E
 
-
G
 
-
Y
 
-
S
 
-
K
 
K
N
 
A
S
 
Q
I
 
V
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
R
S
 
L
G
 
G
R
 
K
L
 
P
T
 
E
E
 
D
V
 
I
A
 
A
D
 
N
F
 
A
V
 
Y
C
 
L
Y
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
E
 
H
R
 
E
A
 
S
S
 
D
Y
 
Y
M
 
V
T
 
N
G
 
G
V
 
H
T
 
V
T
 
L
N
 
H
I
 
V
A
 
D
G
 
G
G
 
G

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
33% identity, 97% coverage: 5:263/267 of query aligns to 1:244/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
L
 
M
N
 
T
L
 
L
K
 
Q
E
 
G
K
 
K
I
 
V
I
 
A
T
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
x
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
A
 
D
I
 
I
V
 
A
D
 
I
E
 
N
L
 
L
L
 
A
A
 
K
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
N
 
N
V
 
I
-
 
F
-
 
F
-
x
N
-
x
Y
-
x
N
-
x
G
-
x
S
-
 
P
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
T
-
 
A
Q
 
K
M
 
L
I
 
V
D
 
A
I
 
E
H
 
H
G
 
G
G
 
V
D
 
E
K
 
V
H
 
E
Q
 
A
S
 
M
S
 
K
G
 
A
N
|
N
Y
 
-
N
 
-
F
 
-
W
 
-
P
 
-
T
 
-
D
 
-
I
x
V
S
 
A
S
 
I
A
 
A
S
 
E
E
 
D
V
 
V
H
 
D
K
 
A
T
 
F
V
 
F
D
 
K
H
 
Q
I
 
A
I
 
I
Q
 
E
R
 
R
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
V
D
 
D
G
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
x
I
N
 
T
F
 
R
P
 
D
R
 
N
L
 
L
L
 
L
V
 
M
D
 
-
E
 
-
K
 
-
A
 
-
P
 
-
S
 
-
G
 
-
R
 
-
Y
 
-
E
 
R
L
 
M
N
 
K
E
 
E
A
 
D
A
 
E
F
 
W
E
 
D
K
 
D
M
 
V
V
 
I
N
 
N
I
|
I
N
 
N
Q
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
T
F
 
F
L
 
L
M
 
C
S
 
T
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
S
R
 
R
Q
 
T
M
 
M
V
 
M
K
 
K
Q
 
Q
R
 
R
S
 
A
G
 
G
V
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
M
S
 
A
S
|
S
E
 
V
S
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
I
G
 
G
S
 
N
E
 
A
G
 
G
Q
|
Q
S
 
A
C
 
N
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
A
A
 
G
L
 
V
N
 
I
S
 
G
F
 
L
T
 
T
R
 
K
S
 
T
W
 
T
S
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
A
K
 
P
H
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
V
 
N
G
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
I
 
F
L
x
I
E
 
-
K
 
-
T
 
T
G
x
T
L
 
D
R
 
M
T
 
T
P
 
D
E
 
K
Y
 
L
E
 
D
E
 
E
A
 
K
L
 
-
A
 
-
W
 
-
T
 
T
R
 
K
N
 
E
I
 
A
T
 
M
V
 
L
E
 
A
Q
 
Q
L
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
-
Y
 
-
S
 
-
K
 
-
N
 
-
S
 
-
I
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
A
S
 
Y
G
 
G
R
 
T
L
 
T
T
 
E
E
 
D
V
 
I
A
 
A
D
 
N
F
 
A
V
 
V
C
 
L
Y
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
E
 
D
R
 
A
A
 
S
S
 
K
Y
 
Y
M
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
Q
T
 
T
T
 
L
N
 
S
I
 
V
A
 
D
G
 
G
G
 
G

5itvA Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
33% identity, 98% coverage: 5:265/267 of query aligns to 3:253/255 of 5itvA

query
sites
5itvA
L
 
M
N
 
N
L
 
L
K
 
T
E
 
D
K
 
K
I
 
T
I
 
V
T
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
Y
A
 
A
I
 
A
V
 
V
D
 
Q
E
 
A
L
 
F
L
 
L
A
 
G
Q
 
Q
G
 
Q
A
 
A
N
 
N
V
 
V
Q
 
V
M
 
V
I
 
A
D
|
D
I
|
I
H
 
D
G
 
E
G
 
A
D
 
Q
-
 
G
-
 
E
-
 
A
-
 
M
-
 
V
K
 
R
H
 
K
Q
 
E
S
 
N
S
 
N
G
 
D
N
 
R
Y
 
L
N
 
H
F
 
F
W
 
V
P
 
Q
T
|
T
D
 
D
I
|
I
S
 
T
S
 
D
A
 
E
S
 
A
E
 
A
V
 
C
H
 
Q
K
 
H
T
 
A
V
 
V
D
 
E
H
 
S
I
 
A
I
 
V
Q
 
H
R
 
T
F
 
F
G
 
G
R
 
G
I
 
L
D
 
D
G
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
V
 
I
N
 
E
F
 
I
P
 
-
R
 
-
L
 
-
L
 
-
V
 
-
D
 
-
E
 
-
K
 
V
A
 
A
P
 
P
S
 
I
G
 
H
R
 
E
Y
 
M
E
 
E
L
 
L
N
 
S
E
 
D
A
 
-
A
 
-
F
 
W
E
 
N
K
 
K
M
 
V
V
 
L
N
 
Q
I
 
V
N
 
N
Q
 
L
K
 
T
G
 
G
V
 
M
F
 
F
L
 
L
M
 
M
S
 
S
Q
 
K
A
 
H
V
 
A
A
 
L
R
 
K
Q
 
H
M
 
M
V
 
L
K
 
A
Q
 
A
R
 
G
S
 
K
G
 
G
V
 
N
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
x
T
S
 
C
S
|
S
E
 
V
S
 
G
G
 
G
L
 
L
E
 
V
G
 
A
S
 
W
E
 
P
G
 
D
Q
 
I
S
 
P
C
 
A
Y
|
Y
A
 
N
A
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
G
L
 
V
N
 
L
S
 
Q
F
 
L
T
 
T
R
 
K
S
 
S
W
 
M
S
 
A
K
 
V
E
 
D
L
 
Y
G
 
A
K
 
K
H
 
H
G
 
Q
I
 
I
R
 
R
V
 
V
V
 
N
G
 
C
V
 
V
A
 
C
P
|
P
G
|
G
I
|
I
L
x
I
E
 
D
K
 
-
T
 
-
G
 
-
L
 
-
R
 
-
T
 
T
P
 
P
E
 
L
Y
 
N
E
 
E
E
 
K
A
 
S
L
 
F
A
 
L
W
 
E
T
 
N
R
 
N
N
 
E
I
 
G
T
 
T
V
 
L
E
 
E
Q
 
E
L
 
I
R
 
K
E
 
K
G
 
E
Y
 
K
S
 
A
K
 
K
N
 
V
S
 
N
I
 
-
P
 
P
L
 
L
G
 
L
R
 
R
S
 
L
G
 
G
R
 
K
L
 
P
T
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
N
F
 
V
V
 
M
C
 
L
Y
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
E
 
D
R
 
L
A
 
S
S
 
S
Y
 
Y
M
 
M
T
 
T
G
 
G
V
 
S
T
 
A
T
 
I
N
 
T
I
 
A
A
 
D
G
 
G
G
 
G
K
 
Y
T
 
T

3osuA Crystal structure of the 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase, fabg, from staphylococcus aureus
33% identity, 94% coverage: 14:263/267 of query aligns to 9:243/246 of 3osuA

query
sites
3osuA
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
A
 
S
S
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
L
 
R
A
 
S
I
 
I
V
 
A
D
 
L
E
 
Q
L
 
L
L
 
A
A
 
E
Q
 
E
G
 
G
A
 
Y
N
 
N
V
 
V
Q
 
A
M
 
V
I
 
N
D
 
-
I
 
-
H
 
Y
G
 
A
G
 
G
D
 
S
K
 
K
H
 
E
Q
 
K
S
 
A
-
 
E
-
 
A
-
 
V
-
 
V
-
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
A
S
 
K
G
 
G
N
 
V
Y
 
D
N
 
S
F
 
F
-
 
A
W
 
I
P
 
Q
T
 
A
D
 
N
I
 
V
S
 
A
S
 
D
A
 
A
S
 
D
E
 
E
V
 
V
H
 
K
K
 
A
T
 
M
V
 
I
D
 
K
H
 
E
I
 
V
I
 
V
Q
 
S
R
 
Q
F
 
F
G
 
G
R
 
S
I
 
L
D
 
D
G
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
N
 
T
F
 
R
P
 
D
R
 
N
L
 
L
L
 
L
V
 
M
D
 
-
E
 
-
K
 
-
A
 
-
P
 
-
S
 
-
G
 
-
R
 
-
Y
 
-
E
 
R
L
 
M
N
 
K
E
 
E
A
 
Q
A
 
E
F
 
W
E
 
D
K
 
D
M
 
V
V
 
I
N
 
D
I
 
T
N
 
N
Q
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
N
M
 
C
S
 
I
Q
 
Q
A
 
K
V
 
A
A
 
T
R
 
P
Q
 
Q
M
 
M
V
 
L
K
 
R
Q
 
Q
R
 
R
S
 
S
G
 
G
V
 
A
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
L
S
 
S
S
|
S
E
 
V
S
 
V
G
 
G
L
 
A
E
 
V
G
 
G
S
 
N
E
 
P
G
 
G
Q
|
Q
S
 
A
C
 
N
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
T
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
G
L
 
V
N
 
I
S
 
G
F
 
L
T
 
T
R
 
K
S
 
S
W
 
A
S
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
A
K
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
V
 
N
G
 
A
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
I
 
F
L
 
I
E
 
-
K
 
-
T
 
-
G
 
-
L
 
-
R
 
-
T
 
V
P
 
S
E
 
D
Y
 
M
E
 
T
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
S
W
 
-
T
 
-
R
 
-
N
 
-
I
 
-
T
 
-
V
 
-
E
 
D
Q
 
E
L
 
L
R
 
K
E
 
E
G
 
Q
Y
 
M
S
 
-
K
 
L
N
 
T
S
 
Q
I
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
A
R
 
R
S
 
F
G
 
G
R
 
Q
L
 
D
T
 
T
E
 
D
V
 
I
A
 
A
D
 
N
F
 
T
V
 
V
C
 
A
Y
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
E
 
D
R
 
K
A
 
A
S
 
K
Y
 
Y
M
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
Q
T
 
T
T
 
I
N
 
H
I
 
V
A
 
N
G
 
G
G
 
G

Q9LBG2 Levodione reductase; (6R)-2,2,6-trimethyl-1,4-cyclohexanedione reductase; EC 1.1.1.- from Leifsonia aquatica (Corynebacterium aquaticum) (see paper)
32% identity, 97% coverage: 7:265/267 of query aligns to 11:264/267 of Q9LBG2

query
sites
Q9LBG2
L
 
F
K
 
T
E
 
D
K
 
R
I
 
V
I
 
V
T
x
L
V
x
I
T
|
T
G
|
G
G
|
G
A
x
G
S
|
S
G
|
G
I
x
L
G
|
G
L
x
R
A
|
A
I
x
T
V
x
A
D
x
V
E
x
R
L
|
L
L
x
A
A
|
A
Q
x
E
G
|
G
A
|
A
N
x
K
V
x
L
Q
x
S
M
x
L
I
 
V
D
 
D
I
 
V
H
 
S
G
 
S
-
 
E
G
 
G
D
 
L
K
 
E
H
 
A
Q
 
S
S
 
K
S
 
A
G
 
A
N
 
V
Y
 
L
N
 
E
F
 
T
W
 
A
P
 
P
-
 
D
-
 
A
-
 
E
-
 
V
-
 
L
-
 
T
-
 
T
-
 
V
T
 
A
D
 
D
I
 
V
S
 
S
S
 
D
A
 
E
S
 
A
E
 
Q
V
 
V
H
 
E
K
 
A
T
 
Y
V
 
V
D
 
T
H
 
A
I
 
T
I
 
T
Q
 
E
R
 
R
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
G
 
G
L
 
F
V
 
F
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
N
x
E
F
 
-
P
 
-
R
 
-
L
 
-
L
 
-
V
 
-
D
 
G
E
 
K
K
 
Q
A
 
N
P
 
P
S
 
T
G
 
E
R
 
S
Y
 
F
E
 
T
L
 
A
N
 
A
E
 
E
A
 
-
A
 
-
F
 
F
E
 
D
K
 
K
M
 
V
V
 
V
N
 
S
I
 
I
N
 
N
Q
 
L
K
 
R
G
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
L
M
 
G
S
 
L
Q
 
E
A
 
K
V
 
V
A
 
L
R
 
K
Q
 
I
M
 
M
V
 
R
K
 
E
Q
 
Q
R
 
G
S
 
S
G
 
G
V
 
M
I
 
V
V
 
V
N
 
N
V
 
T
S
 
A
S
 
S
E
 
V
S
 
G
G
 
G
L
 
I
E
 
R
G
 
G
S
 
I
E
 
G
G
 
N
Q
 
Q
S
 
S
C
 
G
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
T
 
A
K
 
K
A
 
H
A
 
G
L
 
V
N
 
V
S
 
G
F
 
L
T
 
T
R
 
R
S
 
N
W
 
S
S
 
A
K
 
V
E
 
E
L
 
Y
G
 
G
K
 
R
H
 
Y
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
I
V
 
N
G
 
A
V
 
I
A
 
A
P
 
P
G
 
G
I
 
-
L
 
-
E
 
-
K
 
-
T
 
-
G
 
A
L
 
I
R
 
W
T
 
T
P
 
P
E
 
M
Y
 
V
E
 
E
E
 
N
A
 
S
L
 
M
A
 
-
W
 
-
T
 
-
R
 
K
N
 
Q
I
 
L
T
 
D
V
 
P
E
 
E
Q
 
N
L
 
P
R
 
R
E
 
K
G
 
A
Y
 
A
S
 
E
K
 
E
-
 
F
-
 
I
N
 
Q
S
 
V
I
 
N
P
 
P
L
 
S
G
 
K
R
 
R
S
 
Y
G
 
G
R
 
E
L
 
A
T
 
P
E
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
A
F
 
V
V
 
V
C
 
A
Y
 
F
L
 
L
L
 
L
S
 
S
E
 
D
R
 
D
A
 
A
S
 
S
Y
 
Y
M
 
V
T
 
N
G
 
A
V
 
T
T
 
V
T
 
V
N
 
P
I
 
I
A
 
D
G
 
G
G
 
G
K
 
Q
T
 
S

1iy8A Crystal structure of levodione reductase (see paper)
32% identity, 97% coverage: 7:265/267 of query aligns to 2:255/258 of 1iy8A

query
sites
1iy8A
L
 
F
K
 
T
E
 
D
K
 
R
I
 
V
I
 
V
T
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
G
S
|
S
G
|
G
I
x
L
G
 
G
L
 
R
A
 
A
I
 
T
V
 
A
D
 
V
E
 
R
L
 
L
L
 
A
A
 
A
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
N
 
K
V
 
L
Q
 
S
M
 
L
I
 
V
D
|
D
I
x
V
H
 
S
G
 
S
-
 
E
G
 
G
D
 
L
K
 
E
H
 
A
Q
 
S
S
 
K
S
 
A
G
 
A
N
 
V
Y
 
L
N
 
E
F
 
T
W
 
A
P
 
P
-
 
D
-
 
A
-
 
E
-
 
V
-
 
L
-
 
T
-
 
T
-
 
V
T
x
A
D
|
D
I
x
V
S
 
S
S
 
D
A
 
E
S
 
A
E
 
Q
V
 
V
H
 
E
K
 
A
T
 
Y
V
 
V
D
 
T
H
 
A
I
 
T
I
 
T
Q
 
E
R
 
R
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
G
 
G
L
 
F
V
 
F
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
V
x
I
N
 
E
F
 
-
P
 
-
R
 
-
L
 
-
L
 
-
V
 
-
D
 
G
E
 
K
K
 
Q
A
 
N
P
 
P
S
 
T
G
 
E
R
 
S
Y
 
F
E
 
T
L
 
A
N
 
A
E
 
E
A
 
-
A
 
-
F
 
F
E
 
D
K
 
K
M
 
V
V
 
V
N
 
S
I
 
I
N
 
N
Q
 
L
K
 
R
G
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
L
M
 
G
S
 
L
Q
 
E
A
 
K
V
 
V
A
 
L
R
 
K
Q
 
I
M
 
M
V
 
R
K
 
E
Q
 
Q
R
 
G
S
 
S
G
 
G
V
 
M
I
 
V
V
 
V
N
 
N
V
x
T
S
 
A
S
|
S
E
 
V
S
 
G
G
 
G
L
 
I
E
 
R
G
 
G
S
 
I
E
 
G
G
 
N
Q
|
Q
S
 
S
C
 
G
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
H
A
 
G
L
 
V
N
 
V
S
 
G
F
 
L
T
 
T
R
 
R
S
 
N
W
 
S
S
 
A
K
 
V
E
 
E
L
 
Y
G
 
G
K
 
R
H
 
Y
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
I
V
 
N
G
 
A
V
 
I
A
 
A
P
|
P
G
|
G
I
 
-
L
 
-
E
 
-
K
 
-
T
 
-
G
 
A
L
 
I
R
 
W
T
|
T
P
|
P
E
x
M
Y
 
V
E
 
E
E
 
N
A
 
S
L
 
M
A
 
-
W
 
-
T
 
-
R
 
K
N
 
Q
I
 
L
T
 
D
V
 
P
E
 
E
Q
 
N
L
 
P
R
 
R
E
 
K
G
 
A
Y
 
A
S
 
E
K
 
E
-
 
F
-
 
I
N
 
Q
S
 
V
I
 
N
P
 
P
L
 
S
G
 
K
R
 
R
S
 
Y
G
 
G
R
 
E
L
 
A
T
 
P
E
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
A
F
 
V
V
 
V
C
 
A
Y
 
F
L
 
L
L
 
L
S
 
S
E
 
D
R
 
D
A
 
A
S
 
S
Y
 
Y
M
 
V
T
 
N
G
 
A
V
 
T
T
 
V
T
 
V
N
 
P
I
 
I
A
 
D
G
 
G
G
 
G
K
 
Q
T
 
S

3sj7A Structure of beta-ketoacetyl-coa reductase (fabg) from staphylococcus aureus complex with NADPH (see paper)
33% identity, 94% coverage: 14:263/267 of query aligns to 6:236/239 of 3sj7A

query
sites
3sj7A
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
x
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
A
 
S
I
 
I
V
 
A
D
 
L
E
 
Q
L
 
L
L
 
A
A
 
E
Q
 
E
G
 
G
A
 
Y
N
 
N
V
 
V
Q
 
A
M
 
V
I
x
N
D
 
-
I
 
-
H
x
Y
G
x
A
G
|
G
D
x
S
K
 
K
H
 
E
Q
 
K
S
 
A
-
 
E
-
 
A
-
 
V
-
 
V
-
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
A
S
 
K
G
 
G
N
 
V
Y
 
D
N
 
S
F
 
F
-
 
A
W
 
I
P
 
Q
T
x
A
D
x
N
I
x
V
S
 
A
S
 
D
A
 
A
S
 
D
E
 
E
V
 
V
H
 
K
K
 
A
T
 
M
V
 
I
D
 
K
H
 
E
I
 
V
I
 
V
Q
 
S
R
 
Q
F
 
F
G
 
G
R
 
S
I
 
L
D
 
D
G
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
 
I
N
 
T
F
 
R
P
 
D
R
 
N
L
 
L
L
 
L
V
 
M
D
 
-
E
 
-
K
 
-
A
 
-
P
 
-
S
 
-
G
 
-
R
 
-
Y
 
-
E
 
R
L
 
M
N
 
K
E
 
E
A
 
Q
A
 
E
F
 
W
E
 
D
K
 
D
M
 
V
V
 
I
N
 
D
I
x
T
N
 
N
Q
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
N
M
 
C
S
 
I
Q
 
Q
A
 
K
V
 
A
A
 
T
R
 
P
Q
 
Q
M
 
M
V
 
L
K
 
R
Q
 
Q
R
 
R
S
 
S
G
 
G
V
 
A
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
L
S
 
S
S
|
S
E
 
V
S
 
V
G
 
G
L
 
A
E
 
V
G
 
G
S
 
N
E
 
P
G
 
G
Q
|
Q
S
 
A
C
 
N
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
T
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
G
L
 
V
N
 
I
S
 
G
F
 
L
T
 
T
R
 
K
S
 
S
W
 
A
S
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
A
K
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
V
 
N
G
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
I
 
F
L
 
I
E
 
V
K
 
S
T
 
D
G
 
-
L
 
-
R
 
M
T
 
T
P
 
D
E
 
E
Y
 
L
E
 
K
E
 
E
A
 
Q
L
 
M
A
 
L
W
 
-
T
 
-
R
 
-
N
 
-
I
 
-
T
 
-
V
 
-
E
 
-
Q
 
-
L
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
-
Y
 
-
S
 
-
K
 
-
N
 
T
S
 
Q
I
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
A
R
 
R
S
 
F
G
 
G
R
 
Q
L
 
D
T
 
T
E
 
D
V
 
I
A
 
A
D
 
N
F
 
T
V
 
V
C
 
A
Y
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
E
 
D
R
 
K
A
 
A
S
 
K
Y
 
Y
M
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
Q
T
 
T
T
 
I
N
 
H
I
 
V
A
 
N
G
 
G
G
 
G

6t77A Crystal structure of klebsiella pneumoniae fabg(NADPH-dependent) NADP- complex at 1.75 a resolution (see paper)
33% identity, 97% coverage: 5:263/267 of query aligns to 1:240/244 of 6t77A

query
sites
6t77A
L
 
M
N
 
S
L
 
F
K
 
E
E
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
A
T
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
x
S
S
x
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
I
 
I
V
 
A
D
 
E
E
 
T
L
 
L
L
 
V
A
 
A
Q
 
R
G
 
G
A
 
A
N
 
K
V
 
V
-
 
I
-
 
G
-
 
T
-
 
A
-
x
T
-
 
S
-
 
E
-
 
S
-
 
G
-
 
A
Q
 
Q
M
 
A
I
 
I
D
 
S
I
 
D
H
 
Y
G
 
L
G
 
G
D
 
-
K
 
-
H
 
-
Q
 
-
S
 
-
S
 
-
G
 
A
N
 
N
Y
 
G
N
 
K
F
 
G
W
 
L
P
 
M
T
x
L
D
x
N
I
x
V
S
 
T
S
 
D
A
 
P
S
 
A
E
 
S
V
 
I
H
 
E
K
 
S
T
 
V
V
 
L
D
 
E
H
 
N
I
 
V
I
 
R
Q
 
A
R
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
E
I
 
V
D
 
D
G
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
N
 
T
F
 
R
P
 
D
R
 
N
L
 
L
L
 
L
V
 
M
D
 
-
E
 
-
K
 
-
A
 
-
P
 
-
S
 
-
G
 
-
R
 
-
Y
 
-
E
 
R
L
 
M
N
 
K
E
 
D
A
 
D
A
 
E
F
 
W
E
 
N
K
 
D
M
 
I
V
 
I
N
 
E
I
 
T
N
 
N
Q
 
L
K
 
S
G
 
S
V
 
V
F
 
F
L
 
R
M
 
L
S
 
S
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
M
R
 
R
Q
 
A
M
 
M
V
 
M
K
 
K
Q
 
K
R
 
R
S
 
H
G
 
G
V
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
V
 
I
S
 
G
S
|
S
E
 
V
S
 
V
G
 
G
L
 
T
E
 
M
G
 
G
S
 
N
E
 
A
G
 
G
Q
 
Q
S
 
A
C
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
T
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
G
L
 
L
N
 
I
S
 
G
F
 
F
T
 
S
R
 
K
S
 
S
W
 
L
S
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
V
G
 
A
K
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
V
 
N
G
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
I
 
F
L
 
I
E
 
E
K
 
T
T
 
D
G
 
-
L
 
-
R
 
-
T
 
-
P
 
-
E
 
-
Y
 
-
E
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
W
 
M
T
 
T
R
 
R
N
 
A
I
 
L
T
 
T
V
 
D
E
 
E
Q
 
Q
L
 
-
R
 
R
E
 
A
G
 
G
Y
 
-
S
 
T
K
 
L
N
 
A
S
 
A
I
 
V
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
S
 
L
G
 
G
R
 
T
L
 
P
T
 
N
E
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
S
F
 
A
V
 
V
C
 
A
Y
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
E
 
D
R
 
E
A
 
A
S
 
S
Y
 
Y
M
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
E
T
 
T
T
 
L
N
 
H
I
 
V
A
 
N
G
 
G
G
 
G

3op4A Crystal structure of putative 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase from vibrio cholerae o1 biovar eltor str. N16961 in complex with NADP+ (see paper)
32% identity, 97% coverage: 4:263/267 of query aligns to 3:243/247 of 3op4A

query
sites
3op4A
W
 
F
L
 
M
N
 
N
L
 
L
K
 
E
E
 
G
K
 
K
I
 
V
I
 
A
T
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
x
S
S
x
R
G
 
G
I
|
I
G
 
G
L
 
K
A
 
A
I
 
I
V
 
A
D
 
E
E
 
L
L
 
L
L
 
A
A
 
E
Q
 
R
G
 
G
A
 
A
N
 
K
V
 
V
-
 
I
-
 
G
-
 
T
-
 
A
-
x
T
-
 
S
-
 
E
-
 
S
-
 
G
-
 
A
Q
 
Q
M
 
A
I
 
I
D
 
S
I
 
D
H
 
Y
G
 
L
G
 
G
D
 
D
K
 
-
H
 
-
Q
 
-
S
 
-
S
 
-
G
 
-
N
 
N
Y
 
G
N
 
K
F
 
G
W
 
M
P
 
A
T
 
L
D
x
N
I
x
V
S
 
T
S
 
N
A
 
P
S
 
E
E
 
S
V
 
I
H
 
E
K
 
A
T
 
V
V
 
L
D
 
K
H
 
A
I
 
I
I
 
T
Q
 
D
R
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
G
I
 
V
D
 
D
G
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
x
I
N
 
T
F
 
R
P
 
D
R
 
N
L
 
L
L
 
L
V
 
M
D
 
-
E
 
-
K
 
-
A
 
-
P
 
-
S
 
-
G
 
-
R
 
-
Y
 
-
E
 
R
L
 
M
N
 
K
E
 
E
A
 
E
A
 
E
F
 
W
E
 
S
K
 
D
M
 
I
V
 
M
N
 
E
I
 
T
N
 
N
Q
 
L
K
 
T
G
 
S
V
 
I
F
 
F
L
 
R
M
 
L
S
 
S
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
L
R
 
R
Q
 
G
M
 
M
V
 
M
K
 
K
Q
 
K
R
 
R
S
 
Q
G
 
G
V
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
|
V
S
 
G
S
|
S
E
 
V
S
 
V
G
 
G
L
 
T
E
 
M
G
 
G
S
 
N
E
 
A
G
 
G
Q
 
Q
S
 
A
C
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
L
 
V
N
 
I
S
 
G
F
 
F
T
 
T
R
 
K
S
 
S
W
 
M
S
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
V
G
 
A
K
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
T
V
 
V
V
 
N
G
 
T
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
I
 
F
L
x
I
E
 
E
K
x
T
T
 
D
G
x
M
L
 
T
R
 
K
T
 
A
P
 
L
E
 
N
Y
 
D
E
 
E
E
 
Q
A
 
-
L
 
-
A
 
-
W
 
-
T
 
-
R
 
R
N
 
T
I
 
A
T
 
T
V
 
L
E
 
A
Q
 
Q
L
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
-
Y
 
-
S
 
-
K
 
-
N
 
-
S
 
-
I
 
V
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
S
 
L
G
 
G
R
 
D
L
 
P
T
 
R
E
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
S
F
 
A
V
 
V
C
 
A
Y
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
E
 
P
R
 
E
A
 
A
S
 
A
Y
 
Y
M
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
E
T
 
T
T
 
L
N
 
H
I
 
V
A
 
N
G
 
G
G
 
G

4nbwA Crystal structure of fabg from plesiocystis pacifica (see paper)
32% identity, 97% coverage: 9:267/267 of query aligns to 1:252/253 of 4nbwA

query
sites
4nbwA
E
 
K
K
 
R
I
 
V
I
 
A
T
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
A
S
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
I
 
T
V
 
A
D
 
L
E
 
E
L
 
F
L
 
A
A
 
Q
Q
 
A
G
 
G
A
 
Y
N
 
H
V
 
V
Q
 
V
M
 
A
I
 
W
D
|
D
I
x
L
H
 
A
G
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
G
-
 
A
-
 
A
-
 
L
-
 
I
G
 
A
D
 
E
K
 
I
H
 
A
Q
 
D
S
 
A
S
 
G
G
 
G
N
 
S
Y
 
A
N
 
D
F
 
F
W
 
A
P
 
R
T
x
V
D
|
D
I
x
V
S
 
S
S
 
A
A
 
A
S
 
E
E
 
S
V
 
V
H
 
E
K
 
A
T
 
A
V
 
V
D
 
A
H
 
E
I
 
I
I
 
I
Q
 
A
R
 
E
F
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
V
D
 
D
G
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
 
I
N
 
L
F
 
H
P
 
D
R
 
G
L
 
Q
L
 
L
V
 
V
D
 
K
E
 
V
K
 
K
A
 
G
P
 
G
S
 
E
G
 
V
R
 
V
Y
 
K
E
 
K
L
 
M
N
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
Q
F
 
F
E
 
D
K
 
A
M
 
V
V
 
I
N
 
S
I
 
V
N
 
N
Q
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
L
M
 
C
S
 
T
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
A
R
 
P
Q
 
H
M
 
M
V
 
I
K
 
A
Q
 
A
R
 
K
S
 
Y
G
 
G
V
 
R
I
 
I
V
 
L
N
 
N
V
 
A
S
 
S
S
|
S
E
 
V
S
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
Y
G
 
G
S
 
N
E
 
F
G
 
G
Q
 
Q
S
 
T
C
 
N
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
S
A
 
G
L
 
V
N
 
I
S
 
G
F
 
M
T
 
T
R
 
K
S
 
V
W
 
W
S
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
G
K
 
R
H
 
Y
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
V
 
N
G
 
A
V
 
I
A
 
A
P
 
P
G
 
G
I
 
F
L
x
I
E
 
A
K
x
T
T
 
E
G
 
-
L
 
-
R
 
-
T
 
-
P
 
-
E
 
-
Y
 
-
E
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
W
 
-
T
 
-
R
 
-
N
 
-
I
 
-
T
 
M
V
 
V
E
 
Q
Q
 
Q
L
 
M
R
 
P
E
 
E
G
 
R
Y
 
V
S
 
L
K
 
E
N
 
A
S
 
M
I
 
V
-
 
A
-
 
R
-
 
T
P
 
P
L
 
V
G
 
G
R
 
R
S
 
I
G
 
G
R
 
D
L
 
P
T
 
V
E
 
D
V
 
I
A
 
A
D
 
R
F
 
A
V
 
Y
C
 
L
Y
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
E
 
E
R
 
E
A
 
S
S
 
G
Y
 
F
M
 
I
T
 
S
G
 
G
V
 
T
T
 
T
T
 
L
N
 
S
I
 
V
A
 
D
G
 
G
G
 
G
K
 
M
T
 
V
R
 
V
G
 
G

4nbtA Crystal structure of fabg from acholeplasma laidlawii (see paper)
33% identity, 96% coverage: 7:263/267 of query aligns to 3:236/239 of 4nbtA

query
sites
4nbtA
L
 
L
K
 
E
E
 
G
K
 
K
I
 
V
I
 
A
T
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
S
x
K
G
|
G
I
x
L
G
 
G
L
 
Q
A
 
A
I
 
I
V
 
A
D
 
L
E
 
A
L
 
Y
L
 
A
A
 
E
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
N
 
K
V
 
V
Q
 
I
M
 
A
I
 
G
D
|
D
I
x
L
H
 
-
G
 
-
G
 
G
D
 
D
K
 
L
H
 
T
Q
 
Y
S
 
S
S
 
H
G
 
P
N
 
N
Y
 
V
N
 
E
F
 
G
W
 
M
P
 
Y
T
x
L
D
x
N
I
x
V
S
 
T
S
 
D
A
 
V
S
 
T
E
 
G
V
 
V
H
 
E
K
 
K
T
 
F
V
 
Y
D
 
Q
H
 
S
I
 
V
I
 
I
Q
 
D
R
 
K
F
 
Y
G
 
G
R
 
K
I
 
I
D
 
D
G
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
 
I
N
 
T
F
 
-
P
 
-
R
 
-
L
 
-
L
 
-
V
 
-
D
 
-
E
 
-
K
 
K
A
 
D
P
 
A
S
 
M
G
 
T
R
 
R
Y
 
-
E
 
K
L
 
M
N
 
T
E
 
E
A
 
A
A
 
Q
F
 
W
E
 
D
K
 
A
M
 
V
V
 
I
N
 
D
I
 
V
N
 
N
Q
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
N
M
 
L
S
 
T
Q
 
R
A
 
L
V
 
V
A
 
G
R
 
P
Q
 
Q
M
 
M
V
 
Q
K
 
T
Q
 
N
R
 
G
S
 
Y
G
 
G
V
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
x
I
S
 
S
S
|
S
E
 
V
S
 
V
G
 
G
L
 
V
E
 
F
G
 
G
S
 
N
E
 
I
G
 
G
Q
 
Q
S
 
A
C
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
T
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
G
L
 
V
N
 
I
S
 
G
F
 
L
T
 
T
R
 
M
S
 
T
W
 
W
S
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
F
G
 
A
K
 
L
H
 
K
G
 
G
-
 
A
-
 
N
I
 
V
R
 
R
V
 
V
V
 
N
G
 
A
V
 
I
A
 
A
P
|
P
G
|
G
I
 
Y
L
x
I
E
 
M
K
x
T
T
 
D
G
 
I
L
 
L
R
 
K
T
 
T
P
 
V
E
 
P
Y
 
-
E
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
W
 
-
T
 
-
R
 
-
N
 
-
I
 
-
T
 
-
V
 
-
E
 
Q
Q
 
D
L
 
L
R
 
L
E
 
D
G
 
K
Y
 
F
S
 
A
K
 
A
N
 
L
S
 
T
I
 
M
P
 
-
L
 
L
G
 
N
R
 
R
S
 
L
G
 
G
R
 
Q
L
 
P
T
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
K
F
 
V
V
 
A
C
 
L
Y
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
E
 
D
R
 
D
A
 
A
S
 
S
Y
 
Y
M
 
V
T
 
T
G
 
G
V
 
Q
T
 
T
T
 
I
N
 
N
I
 
V
A
 
N
G
 
G
G
 
G

P0A2C9 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-Ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-ketoacyl-ACP reductase; EC 1.1.1.100 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
33% identity, 97% coverage: 5:263/267 of query aligns to 1:240/244 of P0A2C9

query
sites
P0A2C9
L
 
M
N
 
S
L
 
F
K
 
E
E
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
A
T
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
A
 
S
S
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
I
 
I
V
 
A
D
 
E
E
 
T
L
 
L
L
 
V
A
 
A
Q
 
R
G
 
G
A
 
A
N
 
K
V
 
V
-
 
I
Q
 
G
M
 
T
I
 
A
D
 
T
I
 
S
H
 
E
G
 
N
G
 
G
D
 
A
K
 
K
H
 
N
Q
 
I
S
 
S
S
 
D
-
 
Y
-
 
L
-
 
G
G
 
A
N
 
N
Y
 
G
N
 
K
F
 
G
W
 
L
P
 
M
T
 
L
D
 
N
I
 
V
S
 
T
S
 
D
A
 
P
S
 
A
E
 
S
V
 
I
H
 
E
K
 
S
T
 
V
V
 
L
D
 
E
H
 
N
I
 
I
I
 
R
Q
 
A
R
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
E
I
 
V
D
 
D
G
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
N
 
T
F
 
R
P
 
D
R
 
N
L
 
L
L
 
L
V
 
M
D
 
-
E
 
-
K
 
-
A
 
-
P
 
-
S
 
-
G
 
-
R
 
-
Y
 
-
E
 
R
L
 
M
N
 
K
E
 
D
A
 
D
A
 
E
F
 
W
E
 
N
K
 
D
M
 
I
V
 
I
N
 
E
I
 
T
N
 
N
Q
 
L
K
 
S
G
 
S
V
 
V
F
 
F
L
 
R
M
 
L
S
 
S
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
M
R
 
R
Q
 
A
M
|
M
V
 
M
K
 
K
Q
 
K
R
 
R
S
 
C
G
 
G
V
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
V
 
I
S
 
G
S
 
S
E
 
V
S
 
V
G
 
G
L
 
T
E
 
M
G
 
G
S
 
N
E
 
A
G
 
G
Q
 
Q
S
 
A
C
 
N
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
T
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
G
L
 
L
N
 
I
S
 
G
F
 
F
T
 
S
R
 
K
S
 
S
W
 
L
S
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
V
G
 
A
K
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
V
 
N
G
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
I
 
F
L
 
I
E
 
E
K
 
T
T
 
D
G
 
-
L
 
-
R
 
-
T
 
-
P
 
-
E
 
-
Y
 
-
E
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
W
 
M
T
 
T
R
 
R
N
 
A
I
 
L
T
 
S
V
 
D
E
 
D
Q
 
Q
L
 
-
R
 
R
E
 
A
G
 
G
Y
 
I
S
 
L
K
 
A
N
 
Q
S
 
-
I
 
V
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
S
 
L
G
 
G
R
 
G
L
 
A
T
 
Q
E
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
S
F
 
A
V
 
V
C
 
A
Y
 
F
L
 
L
L
x
A
S
|
S
E
 
D
R
 
E
A
 
A
S
 
S
Y
 
Y
M
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
E
T
 
T
T
 
L
N
 
H
I
 
V
A
 
N
G
 
G
G
 
G

4ag3A Crystal structure of 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase (fabg) from pseudomonas aeruginosa in complex with NADPH at 1.8a resolution (see paper)
36% identity, 97% coverage: 5:263/267 of query aligns to 8:250/254 of 4ag3A

query
sites
4ag3A
L
 
M
N
 
S
L
 
L
K
 
Q
E
 
G
K
 
K
I
 
V
I
 
A
T
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
x
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
Q
A
 
A
I
 
I
V
 
A
D
 
L
E
 
E
L
 
L
L
 
G
A
 
R
Q
 
L
G
 
G
A
 
A
N
 
V
V
 
V
-
 
I
-
 
G
Q
 
T
M
 
A
I
x
T
D
 
S
I
 
A
H
 
S
G
 
G
G
 
A
D
 
E
K
 
K
H
 
I
Q
 
A
S
 
E
S
 
T
G
 
L
N
 
K
Y
 
A
N
 
N
F
 
G
-
 
V
-
 
E
-
 
G
-
 
A
-
 
G
W
 
L
P
 
V
T
x
L
D
|
D
I
x
V
S
 
S
S
 
S
A
 
D
S
 
E
E
 
S
V
 
V
H
 
A
K
 
A
T
 
T
V
 
L
D
 
E
H
 
H
I
 
I
I
 
Q
Q
 
Q
R
 
H
F
 
L
G
 
G
R
 
Q
I
 
P
D
 
L
G
 
I
L
 
V
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
 
I
N
 
T
F
 
R
P
 
D
R
 
N
L
 
L
L
 
L
V
 
V
D
 
R
E
 
M
K
 
K
A
 
-
P
 
-
S
 
-
G
 
-
R
 
-
Y
 
-
E
 
-
L
 
-
N
 
D
E
 
D
A
 
E
A
 
W
F
 
F
E
 
D
K
 
-
M
 
V
V
 
V
N
 
N
I
 
T
N
 
N
Q
 
L
K
 
N
G
 
S
V
 
L
F
 
Y
L
 
R
M
 
L
S
 
S
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
L
R
 
R
Q
 
G
M
 
M
V
 
T
K
 
K
Q
 
A
R
 
R
S
 
W
G
 
G
V
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
x
I
S
 
G
S
|
S
E
 
V
S
 
V
G
 
G
L
 
A
E
 
M
G
 
G
S
 
N
E
 
A
G
 
G
Q
 
Q
S
 
T
C
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
L
 
L
N
 
E
S
 
G
F
 
F
T
 
T
R
 
R
S
 
A
W
 
L
S
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
V
G
 
G
K
 
S
H
 
R
G
 
A
I
 
I
R
 
T
V
 
V
V
 
N
G
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
I
x
F
L
x
I
E
 
D
K
x
T
T
 
D
G
x
M
L
x
T
R
 
R
-
 
E
T
 
L
P
 
P
E
 
E
Y
 
A
E
 
Q
-
 
R
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
L
W
 
-
T
 
-
R
 
-
N
 
-
I
 
-
T
 
-
V
 
-
E
 
-
Q
 
-
L
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
-
Y
 
-
S
 
-
K
 
-
N
 
G
S
 
Q
I
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
R
S
 
L
G
 
G
R
 
Q
L
 
A
T
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
K
F
 
V
V
 
V
C
 
G
Y
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
E
 
D
R
 
G
A
 
A
S
 
A
Y
 
Y
M
 
V
T
 
T
G
 
G
V
 
A
T
 
T
T
 
V
N
 
P
I
 
V
A
 
N
G
 
G
G
 
G

P73574 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; EC 1.1.1.100 from Synechocystis sp. (strain PCC 6803 / Kazusa) (see paper)
35% identity, 77% coverage: 59:263/267 of query aligns to 64:243/247 of P73574

query
sites
P73574
D
 
N
I
 
V
S
 
A
S
 
N
A
 
A
S
 
D
E
 
E
V
 
V
H
 
D
K
 
Q
T
 
L
V
 
I
D
 
K
H
 
T
I
 
T
I
 
L
Q
 
D
R
 
K
F
 
F
G
 
S
R
 
R
I
 
I
D
 
D
G
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
N
 
T
F
 
R
P
 
D
R
 
T
L
 
L
L
 
L
V
 
L
D
 
-
E
 
-
K
 
-
A
 
-
P
 
-
S
 
-
G
 
-
R
 
R
Y
 
M
E
 
K
L
 
L
N
 
E
E
 
D
A
 
-
A
 
-
F
 
W
E
 
Q
K
 
A
M
 
V
V
 
I
N
 
D
I
 
L
N
 
N
Q
 
L
K
 
T
G
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
L
M
 
C
S
 
T
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
S
R
 
K
Q
 
L
M
 
M
V
 
L
K
 
K
Q
 
Q
R
 
K
S
 
S
G
 
G
V
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
I
S
 
T
S
 
S
E
 
V
S
 
A
G
 
G
L
 
M
E
 
M
G
 
G
S
 
N
E
x
P
G
 
G
Q
 
Q
S
 
A
C
 
N
Y
 
Y
A
 
S
A
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
L
 
V
N
 
I
S
 
G
F
 
F
T
 
T
R
 
K
S
 
T
W
 
V
S
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
L
G
 
A
K
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
T
V
 
V
V
 
N
G
 
A
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
I
x
F
L
 
I
E
 
-
K
 
-
T
 
-
G
 
-
L
 
-
R
 
-
T
 
-
P
 
-
E
 
-
Y
 
-
E
 
-
E
 
-
A
 
A
L
 
T
A
 
D
W
 
M
T
 
T
R
 
E
N
 
N
I
 
L
T
x
N
V
 
A
E
 
E
Q
 
P
L
 
I
R
 
L
E
 
Q
G
 
-
Y
 
-
S
 
-
K
 
-
N
 
-
S
 
F
I
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
A
R
 
R
S
 
Y
G
 
G
R
 
Q
L
 
P
T
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
D
 
G
F
 
T
V
 
I
C
 
R
Y
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
T
E
 
D
-
 
P
R
 
A
A
 
A
S
 
A
Y
 
Y
M
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
Q
T
 
T
T
 
F
N
 
N
I
 
V
A
 
D
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

4i08A Crystal structure of beta-ketoacyl-acyl carrier protein reductase (fabg) from vibrio cholerae in complex with NADPH (see paper)
33% identity, 97% coverage: 4:263/267 of query aligns to 3:239/243 of 4i08A

query
sites
4i08A
W
 
F
L
 
M
N
 
N
L
 
L
K
 
E
E
 
G
K
 
K
I
 
V
I
 
A
T
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
x
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
K
A
 
A
I
 
I
V
 
A
D
 
E
E
 
L
L
 
L
L
 
A
A
 
E
Q
 
R
G
 
G
A
 
A
N
 
K
V
 
V
-
 
I
-
 
G
-
 
T
-
 
A
-
x
T
-
 
S
-
 
E
-
 
S
-
 
G
-
 
A
Q
 
Q
M
 
A
I
 
I
D
 
S
I
 
D
H
 
Y
G
 
L
G
 
G
D
 
D
K
 
-
H
 
-
Q
 
-
S
 
-
S
 
-
G
 
-
N
 
N
Y
 
G
N
 
K
F
 
G
W
 
M
P
 
A
T
 
L
D
x
N
I
x
V
S
 
T
S
 
N
A
 
P
S
 
E
E
 
S
V
 
I
H
 
E
K
 
A
T
 
V
V
 
L
D
 
K
H
 
A
I
 
I
I
 
T
Q
 
D
R
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
G
I
 
V
D
 
D
G
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
 
I
N
 
T
F
 
R
P
 
D
R
 
N
L
 
L
L
 
L
V
 
M
D
 
-
E
 
-
K
 
-
A
 
-
P
 
-
S
 
-
G
 
-
R
 
-
Y
 
-
E
 
R
L
 
M
N
 
K
E
 
E
A
 
E
A
 
E
F
 
W
E
 
S
K
 
D
M
 
I
V
 
M
N
 
E
I
 
T
N
|
N
Q
 
L
K
 
T
G
 
S
V
 
I
F
 
F
L
 
R
M
 
L
S
 
S
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
L
R
 
R
Q
 
G
M
 
M
V
 
M
K
 
K
Q
 
K
R
 
R
S
 
Q
G
 
G
V
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
V
S
x
G
S
|
S
E
 
V
S
 
V
G
 
G
L
 
T
E
 
M
G
 
G
S
 
N
E
 
A
G
 
G
Q
|
Q
S
 
A
C
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
L
 
V
N
 
I
S
 
G
F
 
F
T
 
T
R
 
K
S
 
S
W
 
M
S
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
V
G
 
A
K
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
T
V
 
V
V
 
N
G
 
T
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
I
 
F
L
 
I
E
 
E
K
 
-
T
 
-
G
 
-
L
 
-
R
 
-
T
|
T
P
 
D
E
 
M
Y
 
N
E
 
D
E
 
E
A
 
-
L
 
-
A
 
-
W
 
-
T
 
Q
R
 
R
N
 
T
I
 
A
T
 
T
V
 
L
E
 
A
Q
 
Q
L
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
-
Y
 
-
S
 
-
K
 
-
N
 
-
S
 
-
I
 
V
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
S
 
L
G
 
G
R
 
D
L
 
P
T
 
R
E
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
S
F
 
A
V
 
V
C
 
A
Y
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
E
 
P
R
 
E
A
 
A
S
 
A
Y
 
Y
M
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
E
T
 
T
T
 
L
N
 
H
I
 
V
A
 
N
G
 
G
G
 
G

P0AEK2 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-Ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-ketoacyl-ACP reductase; EC 1.1.1.100 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
32% identity, 97% coverage: 5:263/267 of query aligns to 1:240/244 of P0AEK2

query
sites
P0AEK2
L
 
M
N
 
N
L
 
F
K
 
E
E
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
A
T
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
x
A
A
x
S
S
x
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
I
 
I
V
 
A
D
 
E
E
 
T
L
 
L
L
 
A
A
 
A
Q
 
R
G
 
G
A
 
A
N
 
K
V
 
V
-
 
I
-
 
G
-
 
T
-
 
A
-
x
T
-
 
S
-
 
E
-
 
N
-
 
G
-
 
A
Q
 
Q
M
 
A
I
 
I
D
 
S
I
 
D
H
 
Y
G
 
L
G
 
G
D
 
-
K
 
-
H
 
-
Q
 
-
S
 
-
S
 
-
G
 
A
N
 
N
Y
 
G
N
 
K
F
 
G
W
 
L
P
 
M
T
 
L
D
x
N
I
x
V
S
 
T
S
 
D
A
 
P
S
 
A
E
 
S
V
 
I
H
 
E
K
 
S
T
 
V
V
 
L
D
 
E
H
 
K
I
 
I
I
 
R
Q
 
A
R
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
E
I
 
V
D
 
D
G
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
N
 
T
F
 
R
P
 
D
R
 
N
L
 
L
L
 
L
V
 
M
D
 
-
E
 
-
K
 
-
A
 
-
P
 
-
S
 
-
G
 
-
R
 
-
Y
 
-
E
 
R
L
 
M
N
 
K
E
 
D
A
 
E
A
 
E
F
 
W
E
 
N
K
 
D
M
 
I
V
 
I
N
 
E
I
 
T
N
 
N
Q
 
L
K
 
S
G
 
S
V
 
V
F
 
F
L
 
R
M
 
L
S
 
S
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
M
R
 
R
Q
 
A
M
 
M
V
 
M
K
 
K
Q
 
K
R
 
R
S
 
H
G
 
G
V
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
V
 
I
S
 
G
S
 
S
E
 
V
S
 
V
G
 
G
L
 
T
E
 
M
G
 
G
S
 
N
E
 
G
G
 
G
Q
 
Q
S
 
A
C
 
N
Y
|
Y
A
|
A
A
|
A
T
x
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
L
 
L
N
 
I
S
 
G
F
 
F
T
 
S
R
 
K
S
 
S
W
 
L
S
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
V
G
 
A
K
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
V
 
N
G
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
I
 
F
L
x
I
E
 
E
K
 
T
T
 
D
G
 
-
L
 
-
R
 
-
T
 
-
P
 
-
E
 
-
Y
 
-
E
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
W
 
M
T
 
T
R
 
R
N
 
A
I
 
L
T
 
S
V
 
D
E
 
D
Q
 
Q
L
 
-
R
 
R
E
 
A
G
 
G
Y
 
I
S
 
L
K
 
A
N
 
Q
S
 
-
I
 
V
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
S
 
L
G
 
G
R
 
G
L
 
A
T
 
Q
E
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
N
F
 
A
V
 
V
C
 
A
Y
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
E
 
D
R
 
E
A
 
A
S
 
A
Y
 
Y
M
 
I
T
 
T
G
 
G
V
x
E
T
 
T
T
 
L
N
 
H
I
 
V
A
 
N
G
 
G
G
 
G

7emgB Carbonyl reductase variant 4 (r123c/l209p/f183y/v61k) from serratia marcescens complexed with NADP+ (see paper)
34% identity, 95% coverage: 10:263/267 of query aligns to 5:239/243 of 7emgB

query
sites
7emgB
K
 
K
I
 
I
I
 
V
T
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
x
S
S
x
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
I
 
I
V
 
A
D
 
E
E
 
T
L
 
F
L
 
V
A
 
A
Q
 
R
G
 
G
A
 
A
N
 
K
V
 
V
Q
 
I
M
 
G
I
 
T
D
 
A
I
x
T
H
 
S
G
 
E
G
 
S
D
 
G
K
 
A
H
 
E
Q
 
A
S
 
I
S
 
S
G
 
G
-
 
Y
-
 
L
-
 
G
-
 
A
N
 
N
Y
 
G
N
 
K
F
 
G
W
 
F
P
 
M
T
 
L
D
x
N
I
x
V
S
 
K
S
 
D
A
 
A
S
 
Q
E
 
S
V
 
I
H
 
D
K
 
S
T
 
V
V
 
L
D
 
A
H
 
S
I
 
I
I
 
R
Q
 
A
R
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
E
I
 
I
D
 
D
G
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
V
x
I
N
 
T
F
 
R
P
 
D
R
 
N
L
 
L
L
 
L
V
 
M
D
 
-
E
 
-
K
 
-
A
 
-
P
 
-
S
 
-
G
 
-
R
 
-
Y
 
-
E
 
R
L
 
M
N
 
K
E
 
D
A
 
D
A
 
E
F
 
W
E
 
E
K
 
D
M
 
I
V
 
L
N
 
D
I
 
T
N
 
N
Q
 
L
K
 
T
G
 
S
V
 
V
F
 
F
L
 
R
M
 
L
S
 
S
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
M
R
 
C
Q
 
A
M
 
M
V
 
M
K
 
K
Q
 
K
R
 
R
S
 
F
G
 
G
V
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
V
 
I
S
 
G
S
 
S
E
 
V
S
 
V
G
 
G
L
 
T
E
 
M
G
 
G
S
 
N
E
 
A
G
 
G
Q
 
Q
S
 
A
C
 
N
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
T
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
G
L
 
L
N
 
I
S
 
G
F
 
F
T
 
S
R
 
K
S
 
S
W
 
L
S
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
V
G
 
A
K
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
V
 
N
G
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
I
 
Y
L
 
I
E
 
E
K
 
T
T
 
D
G
 
-
L
 
-
R
 
-
T
 
-
P
 
-
E
 
-
Y
 
-
E
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
W
 
M
T
 
T
R
 
R
N
 
A
I
 
L
T
 
T
V
 
D
E
 
D
Q
 
Q
L
 
-
R
 
R
E
 
A
G
 
G
Y
 
I
S
 
-
K
 
L
N
 
S
S
 
S
I
 
V
P
 
P
L
 
A
G
 
N
R
 
R
S
 
P
G
 
G
R
 
D
L
 
A
T
 
K
E
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
S
F
 
A
V
 
V
C
 
A
Y
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
E
 
D
R
 
E
A
 
A
S
 
G
Y
 
Y
M
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
E
T
 
T
T
 
L
N
 
H
I
 
V
A
 
N
G
 
G
G
 
G

4bo4C Crystal structure of 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase (fabg) from pseudomonas aeruginosa in complex with n-(2-methoxyphenyl)-3,4- dihydro-2h-quinoline-1-carboxamide at 2.7a resolution (see paper)
35% identity, 97% coverage: 5:263/267 of query aligns to 14:251/255 of 4bo4C

query
sites
4bo4C
L
 
M
N
 
S
L
 
L
K
 
Q
E
 
G
K
 
K
I
 
V
I
 
A
T
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
A
 
S
S
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
L
 
Q
A
 
A
I
 
I
V
 
A
D
 
L
E
 
E
L
 
L
L
 
G
A
 
R
Q
 
L
G
 
G
A
 
A
N
 
V
V
 
V
Q
 
I
M
 
-
I
 
-
D
 
-
I
 
-
H
 
-
G
 
-
G
 
G
D
 
T
K
 
A
H
 
T
Q
 
S
S
 
A
S
 
S
G
 
G
N
 
A
Y
 
E
N
 
K
F
 
I
W
 
A
P
 
E
T
 
T
-
 
L
-
 
K
-
 
A
-
 
N
-
 
G
-
 
V
-
 
E
-
 
G
-
 
A
-
 
G
-
 
L
-
 
V
-
 
L
D
 
D
I
 
V
S
 
S
S
 
S
A
 
D
S
 
E
E
 
S
V
 
V
H
 
A
K
 
A
T
 
T
V
 
L
D
 
E
H
 
H
I
 
I
I
 
Q
Q
 
Q
R
 
H
F
 
L
G
 
G
R
 
Q
I
 
P
D
 
L
G
 
I
L
 
V
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
N
 
T
F
 
R
P
 
D
R
 
N
L
 
L
L
 
L
V
 
V
D
 
R
E
 
M
K
 
K
A
 
-
P
 
-
S
 
-
G
 
-
R
 
-
Y
 
-
E
 
-
L
 
-
N
 
D
E
 
D
A
 
E
A
 
W
F
 
F
E
 
D
K
 
-
M
 
V
V
|
V
N
 
N
I
 
T
N
 
N
Q
x
L
K
 
N
G
 
S
V
 
L
F
 
Y
L
 
R
M
 
L
S
 
S
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
L
R
 
R
Q
 
G
M
 
M
V
 
T
K
 
K
Q
 
A
R
 
R
S
 
W
G
 
G
V
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
I
S
 
G
S
|
S
E
 
V
S
 
V
G
 
G
L
 
-
E
 
-
G
 
G
S
 
N
E
 
A
G
 
G
Q
 
Q
S
 
T
C
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
A
A
x
G
L
 
L
N
 
E
S
x
G
F
|
F
T
 
T
R
 
R
S
 
A
W
 
L
S
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
V
G
 
G
K
 
S
H
 
R
G
 
A
I
 
I
R
 
T
V
 
V
V
 
N
G
 
A
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
I
 
F
L
 
I
E
 
D
K
 
T
T
 
D
G
 
M
L
 
T
R
 
R
T
 
E
P
 
A
E
 
Q
Y
 
R
E
 
E
E
 
A
A
 
L
L
 
L
A
 
G
W
 
-
T
 
-
R
 
-
N
 
-
I
 
-
T
 
-
V
 
-
E
 
-
Q
 
-
L
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
-
Y
 
-
S
 
-
K
 
-
N
 
-
S
 
Q
I
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
R
S
 
L
G
 
G
R
 
Q
L
 
A
T
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
K
F
 
V
V
 
V
C
 
G
Y
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
E
 
D
R
 
G
A
 
A
S
 
A
Y
 
Y
M
 
V
T
 
T
G
 
G
V
 
A
T
 
T
T
 
V
N
 
P
I
 
V
A
 
N
G
 
G
G
 
G

1q7bA The structure of betaketoacyl-[acp] reductase from e. Coli in complex with NADP+ (see paper)
32% identity, 97% coverage: 6:263/267 of query aligns to 1:239/243 of 1q7bA

query
sites
1q7bA
N
 
N
L
 
F
K
 
E
E
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
A
T
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
x
S
S
x
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
I
 
I
V
 
A
D
 
E
E
 
T
L
 
L
L
 
A
A
 
A
Q
 
R
G
 
G
A
 
A
N
 
K
V
 
V
-
 
I
-
 
G
-
 
T
-
 
A
-
x
T
-
 
S
-
 
E
-
 
N
-
 
G
-
 
A
Q
 
Q
M
 
A
I
 
I
D
 
S
I
 
D
H
 
Y
G
 
L
G
 
G
D
 
-
K
 
-
H
 
-
Q
 
-
S
 
-
S
 
-
G
 
A
N
 
N
Y
 
G
N
 
K
F
 
G
W
 
L
P
 
M
T
 
L
D
x
N
I
x
V
S
 
T
S
 
D
A
 
P
S
 
A
E
 
S
V
 
I
H
 
E
K
 
S
T
 
V
V
 
L
D
 
E
H
 
K
I
 
I
I
 
R
Q
 
A
R
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
E
I
 
V
D
 
D
G
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
N
 
T
F
 
R
P
 
D
R
 
N
L
 
L
L
 
L
V
 
M
D
 
-
E
 
-
K
 
-
A
 
-
P
 
-
S
 
-
G
 
-
R
 
-
Y
 
-
E
 
R
L
 
M
N
 
K
E
 
D
A
 
E
A
x
E
F
 
W
E
 
N
K
 
D
M
 
I
V
 
I
N
 
E
I
 
T
N
 
N
Q
 
L
K
 
S
G
 
S
V
 
V
F
 
F
L
 
R
M
 
L
S
 
S
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
M
R
 
R
Q
 
A
M
 
M
V
 
M
K
 
K
Q
 
K
R
 
R
S
 
H
G
 
G
V
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
V
 
I
S
 
G
S
|
S
E
 
V
S
 
V
G
 
G
L
 
T
E
 
M
G
 
G
S
 
N
E
 
G
G
 
G
Q
|
Q
S
 
A
C
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
L
 
L
N
 
I
S
 
G
F
 
F
T
 
S
R
 
K
S
 
S
W
 
L
S
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
V
G
 
A
K
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
V
 
N
G
 
V
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
I
 
F
L
x
I
E
 
E
K
 
T
T
 
D
G
 
-
L
 
-
R
 
-
T
 
-
P
 
-
E
 
-
Y
 
-
E
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
W
 
M
T
 
T
R
 
R
N
 
A
I
 
L
T
 
S
V
 
D
E
 
D
Q
 
Q
L
 
-
R
 
R
E
 
A
G
 
G
Y
 
I
S
 
L
K
 
A
N
 
Q
S
 
-
I
 
V
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
S
 
L
G
 
G
R
 
G
L
 
A
T
 
Q
E
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
N
F
 
A
V
 
V
C
 
A
Y
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
E
 
D
R
 
E
A
 
A
S
 
A
Y
 
Y
M
 
I
T
 
T
G
 
G
V
x
E
T
|
T
T
 
L
N
 
H
I
 
V
A
 
N
G
 
G
G
 
G

6ixmC Crystal structure of the ketone reductase chkred20 from the genome of chryseobacterium sp. Ca49 complexed with NAD (see paper)
34% identity, 97% coverage: 7:265/267 of query aligns to 3:246/248 of 6ixmC

query
sites
6ixmC
L
 
L
K
 
D
E
 
N
K
 
K
I
 
V
I
 
A
T
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
G
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
I
 
V
V
 
A
D
 
H
E
 
S
L
 
Y
L
 
A
A
 
K
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
N
 
K
V
 
V
Q
 
I
M
 
V
I
 
S
D
|
D
I
|
I
-
 
N
-
 
E
-
 
D
H
 
H
G
 
G
G
 
N
-
 
K
-
 
A
-
 
V
-
 
E
D
 
D
K
 
I
H
 
K
Q
 
A
S
 
Q
S
 
G
G
 
G
N
 
E
Y
 
A
N
 
S
F
 
F
W
 
V
P
 
K
T
x
A
D
|
D
I
x
T
S
 
S
S
 
N
A
 
P
S
 
E
E
 
E
V
 
V
H
 
E
K
 
A
T
 
L
V
 
V
D
 
K
H
 
R
I
 
T
I
 
V
Q
 
E
R
 
I
F
 
Y
G
 
G
R
 
R
I
 
L
D
 
D
G
 
I
L
 
A
V
 
C
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
 
I
N
 
G
F
 
-
P
 
-
R
 
-
L
 
-
L
 
-
V
 
-
D
 
G
E
 
E
K
 
Q
A
 
A
P
 
L
S
 
A
G
 
G
R
 
D
Y
 
Y
E
 
G
L
 
L
N
 
D
E
 
-
A
 
-
A
 
S
F
 
W
E
 
R
K
 
K
M
 
V
V
 
L
N
 
S
I
 
I
N
 
N
Q
 
L
K
 
D
G
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
Y
M
 
G
S
 
C
Q
 
K
A
 
Y
V
 
E
A
 
L
R
 
E
Q
 
Q
M
 
M
V
 
E
K
 
K
Q
 
N
R
 
G
S
 
G
G
 
G
V
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
N
V
x
M
S
 
A
S
|
S
E
 
I
S
 
H
G
 
G
L
 
I
E
 
V
G
 
A
S
 
A
E
 
P
G
 
L
Q
 
S
S
 
S
C
 
A
Y
|
Y
A
 
T
A
 
S
T
 
A
K
|
K
A
 
H
A
 
A
L
 
V
N
 
V
S
 
G
F
 
L
T
 
T
R
 
K
S
 
N
W
 
I
S
 
G
K
 
A
E
 
E
L
 
Y
G
 
G
K
 
Q
H
 
K
G
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
C
V
 
N
G
 
A
V
 
V
A
 
G
P
|
P
G
x
A
I
x
Y
L
x
I
E
 
E
K
 
T
T
 
P
G
x
L
L
 
L
R
 
E
-
 
S
-
 
L
T
 
T
P
 
K
E
 
E
Y
 
M
E
 
K
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
-
W
 
-
T
 
-
R
 
-
N
 
-
I
 
-
T
 
-
V
 
-
E
 
-
Q
 
-
L
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
-
Y
 
I
S
 
S
K
 
K
N
 
H
S
 
-
I
 
-
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
R
S
 
L
G
 
G
R
 
K
L
 
P
T
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
D
 
E
F
 
L
V
 
V
C
 
L
Y
 
F
L
 
L
L
 
S
S
 
S
E
 
E
R
 
K
A
 
S
S
 
S
Y
 
F
M
 
M
T
 
T
G
 
G
V
 
G
T
 
Y
T
 
Y
N
 
L
I
 
V
A
 
D
G
 
G
G
 
G
K
 
Y
T
 
T

Query Sequence

>BWI76_RS01745 FitnessBrowser__Koxy:BWI76_RS01745
MNTWLNLKEKIITVTGGASGIGLAIVDELLAQGANVQMIDIHGGDKHQSSGNYNFWPTDI
SSASEVHKTVDHIIQRFGRIDGLVNNAGVNFPRLLVDEKAPSGRYELNEAAFEKMVNINQ
KGVFLMSQAVARQMVKQRSGVIVNVSSESGLEGSEGQSCYAATKAALNSFTRSWSKELGK
HGIRVVGVAPGILEKTGLRTPEYEEALAWTRNITVEQLREGYSKNSIPLGRSGRLTEVAD
FVCYLLSERASYMTGVTTNIAGGKTRG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory