SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing BWI76_RS02160 FitnessBrowser__Koxy:BWI76_RS02160 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P04983 Ribose import ATP-binding protein RbsA; EC 7.5.2.7 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
41% identity, 98% coverage: 6:507/510 of query aligns to 5:492/501 of P04983

query
sites
P04983
I
 
L
S
 
Q
M
 
L
A
 
K
G
 
G
I
 
I
G
 
D
K
 
K
S
 
A
F
 
F
G
 
P
P
 
G
V
 
V
H
 
K
A
 
A
L
 
L
K
 
S
S
 
G
V
 
A
D
 
A
L
 
L
T
 
N
I
 
V
Y
 
Y
P
 
P
H
 
G
E
 
R
I
 
V
H
 
M
A
 
A
L
 
L
L
 
V
G
 
G
E
 
E
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
|
K
S
 
S
T
 
T
L
 
M
M
 
M
K
 
K
V
 
V
L
 
L
S
 
T
G
 
G
I
 
I
H
 
Y
E
 
T
P
 
R
T
 
D
K
 
A
G
 
G
T
 
T
I
 
L
T
 
L
I
 
W
N
 
L
N
 
G
V
 
K
N
 
E
Y
 
T
D
 
T
K
 
F
L
 
T
D
 
G
H
 
P
K
 
K
L
 
S
A
 
S
A
 
Q
Q
 
E
L
 
A
G
 
G
I
 
I
G
 
G
I
 
I
I
 
I
Y
 
H
Q
 
Q
E
 
E
L
 
L
S
 
N
V
 
L
I
 
I
D
 
P
E
 
Q
L
 
L
T
 
T
V
 
I
L
 
A
E
 
E
N
 
N
L
 
I
Y
 
F
I
 
L
G
 
G
R
 
R
H
 
E
L
 
F
T
 
V
K
 
N
K
 
R
V
 
F
C
 
-
G
 
-
V
 
-
N
 
G
V
 
K
I
 
I
D
 
D
W
 
W
R
 
K
E
 
T
M
 
M
R
 
Y
V
 
A
R
 
E
A
 
A
A
 
D
M
 
K
M
 
L
L
 
L
L
 
A
R
 
K
V
 
L
G
 
N
L
 
L
K
 
R
I
 
F
D
 
K
L
 
S
D
 
D
E
 
K
K
 
L
V
 
V
V
 
G
N
 
D
L
 
L
S
 
S
I
 
I
S
 
G
H
 
D
K
 
Q
Q
 
Q
M
 
M
L
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
K
 
K
T
 
V
L
 
L
M
 
S
L
 
F
D
 
E
A
 
S
K
 
K
V
 
V
L
 
I
I
 
I
M
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
D
S
 
A
L
 
L
T
 
T
N
 
D
K
 
T
E
 
E
V
 
T
D
 
E
Y
 
S
L
 
L
F
 
F
L
 
R
I
 
V
M
 
I
N
 
R
Q
 
E
L
 
L
R
 
K
K
 
S
E
 
Q
G
 
G
T
 
R
A
 
G
I
 
I
V
 
V
Y
 
Y
I
 
I
S
 
S
H
 
H
K
 
R
L
 
M
A
 
K
E
 
E
I
 
I
R
 
F
R
 
E
I
 
I
C
 
C
D
 
D
R
 
D
Y
 
V
T
 
T
V
 
V
M
 
F
K
 
R
D
 
D
G
 
G
S
 
Q
S
 
F
V
 
I
C
 
A
S
 
E
G
 
R
M
 
E
V
 
V
S
 
A
E
 
S
V
 
L
N
 
T
N
 
E
D
 
D
D
 
S
I
 
L
V
 
I
R
 
E
L
 
M
M
 
M
V
 
V
G
 
G
R
 
R
E
 
K
L
 
L
Q
 
E
N
 
D
R
 
Q
F
 
Y
N
 
P
A
 
H
M
 
L
K
 
D
E
 
K
S
 
A
T
 
P
G
 
G
N
 
D
I
 
I
V
 
-
R
 
-
E
 
-
T
 
-
V
 
R
F
 
L
E
 
K
V
 
V
K
 
D
N
 
N
V
 
L
T
 
C
S
 
G
H
 
-
D
 
-
K
 
-
K
 
P
K
 
G
V
 
V
R
 
N
D
 
D
I
 
V
S
 
S
F
 
F
S
 
T
V
 
L
N
 
R
R
 
K
G
 
G
E
 
E
I
 
I
L
 
L
G
 
G
F
 
V
A
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
M
G
 
G
S
 
A
G
 
G
R
 
R
T
 
T
E
 
E
L
 
L
M
 
M
D
 
K
C
 
V
L
 
L
F
 
Y
G
 
G
V
 
A
D
 
L
K
 
P
R
 
R
S
 
T
G
 
S
G
 
G
E
 
Y
I
 
V
Y
 
T
L
 
L
N
 
D
G
 
G
K
 
H
A
 
E
I
 
V
S
 
V
P
 
T
R
 
R
S
 
S
P
 
P
L
 
Q
D
 
D
A
 
G
L
 
L
K
 
A
K
 
N
G
 
G
M
 
I
G
 
V
Y
 
Y
I
 
I
T
 
S
E
 
E
S
 
D
R
 
R
R
 
K
E
 
R
N
 
D
G
 
G
F
 
L
F
 
V
P
 
L
N
 
G
F
 
M
S
 
S
I
 
V
A
 
K
Q
 
E
N
 
N
M
 
M
A
 
S
V
 
L
S
 
T
Q
 
-
S
 
A
L
 
L
K
 
R
R
 
Y
G
 
-
G
 
-
Y
 
F
K
 
S
G
 
R
A
 
A
M
 
G
G
 
G
L
 
S
F
 
L
R
 
K
E
 
H
G
 
A
D
 
D
E
 
E
R
 
Q
K
 
Q
T
 
A
A
 
V
E
 
S
E
 
D
Q
 
F
R
 
I
K
 
R
L
 
L
L
 
F
A
 
N
L
 
V
K
 
K
C
 
T
H
 
P
S
 
S
V
 
M
D
 
E
Q
 
Q
N
 
A
I
 
I
T
 
G
E
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
N
 
N
Q
 
Q
Q
 
Q
K
 
K
V
 
V
L
 
A
I
 
I
S
 
A
K
 
R
W
 
G
L
 
L
C
 
M
C
 
T
S
 
R
P
 
P
E
 
K
V
 
V
I
 
L
I
 
I
F
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
R
 
R
G
 
G
I
 
V
D
 
D
V
 
V
G
 
G
A
 
A
K
 
K
A
 
K
E
 
E
I
 
I
Y
 
Y
K
 
Q
V
 
L
M
 
I
R
 
N
Q
 
Q
L
 
F
A
 
K
D
 
A
D
 
D
G
 
G
K
 
L
V
 
S
I
 
I
L
 
I
M
 
L
V
 
V
S
 
S
S
 
S
E
 
E
L
 
M
P
 
P
E
 
E
I
 
V
I
 
L
A
 
G
V
 
M
C
 
S
D
 
D
R
 
R
I
 
I
A
 
I
V
 
V
F
 
M
C
 
H
E
 
E
G
 
G
R
 
H
L
 
L
T
 
S
Q
 
G
I
 
E
L
 
F
T
 
T
N
 
-
R
 
R
D
 
E
D
 
Q
L
 
A
S
 
T
E
 
Q
E
 
E
E
 
V
I
 
L
M
 
M
A
 
A
W
 
A
A
 
A
L
 
V

4ymuJ Crystal structure of an amino acid abc transporter complex with arginines and atps (see paper)
33% identity, 43% coverage: 13:232/510 of query aligns to 9:223/240 of 4ymuJ

query
sites
4ymuJ
K
 
K
S
 
N
F
|
F
G
 
G
P
 
S
V
x
L
H
 
E
A
x
V
L
 
L
K
 
K
S
 
G
V
 
V
D
 
T
L
 
L
T
 
K
I
 
V
Y
 
N
P
 
K
H
 
G
E
 
E
I
 
V
H
 
V
A
 
V
L
 
I
L
 
I
G
 
G
E
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
M
 
L
K
 
R
V
 
C
L
 
I
S
 
N
G
 
L
I
 
L
H
x
E
E
 
E
P
 
P
T
 
T
K
 
K
G
 
G
T
 
E
I
 
V
-
 
F
-
 
I
-
 
D
-
 
G
-
 
V
T
 
K
I
 
I
N
 
N
N
 
N
-
 
G
-
 
K
V
 
V
N
 
N
Y
 
I
D
 
N
K
 
K
L
 
V
D
 
R
H
 
Q
K
 
K
L
 
-
A
 
-
A
 
-
Q
 
-
L
 
-
G
 
-
I
 
V
G
 
G
I
 
M
I
 
V
Y
 
F
Q
 
Q
E
 
H
L
 
F
S
 
N
V
 
L
I
 
F
D
 
P
E
 
H
L
 
L
T
 
T
V
 
A
L
 
I
E
 
E
N
 
N
L
 
I
Y
 
T
I
 
L
G
 
A
R
 
P
H
 
V
L
 
K
T
 
V
K
 
K
K
 
K
V
 
-
C
 
-
G
 
-
V
 
-
N
 
-
V
 
-
I
 
M
D
 
N
W
 
K
R
 
K
E
 
E
M
 
A
R
 
E
V
 
E
R
 
L
A
 
A
A
 
V
M
 
D
M
 
L
L
 
L
L
 
A
R
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
K
 
L
I
 
D
D
 
K
L
 
K
D
 
D
E
 
Q
K
 
Y
V
 
P
V
 
I
N
 
K
L
 
L
S
 
S
I
 
G
S
 
G
H
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
M
 
R
L
 
L
E
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
R
T
 
A
L
 
L
M
 
A
L
 
M
D
 
Q
A
 
P
K
 
E
V
 
V
L
 
M
I
 
L
M
 
F
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
S
 
A
L
 
L
T
 
D
N
 
P
K
 
E
E
 
M
V
 
V
D
 
K
Y
 
E
L
 
V
F
 
L
L
 
N
I
 
V
M
 
M
N
 
K
Q
 
Q
L
 
L
R
 
A
K
 
N
E
 
E
G
 
G
T
 
M
A
 
T
I
 
M
V
 
V
Y
 
V
I
 
V
S
 
T
H
|
H
K
 
E
L
 
M
A
 
G
E
 
F
I
 
A
R
 
R
R
 
E
I
 
V
C
 
G
D
 
D
R
 
R
Y
 
V
T
 
I
V
 
F
M
 
M
K
 
D
D
 
D
G
 
G
S
 
V
S
 
I
V
 
V
C
 
E
S
 
E
G
 
G
M
 
T
V
 
P
S
 
E
E
 
E
V
 
I

4u00A Crystal structure of ttha1159 in complex with adp (see paper)
29% identity, 45% coverage: 4:232/510 of query aligns to 1:223/241 of 4u00A

query
sites
4u00A
P
 
P
Y
 
I
I
 
I
S
 
R
M
 
I
A
 
R
G
 
N
I
 
L
G
 
H
K
 
K
S
 
W
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
x
L
H
 
H
A
x
V
L
 
L
K
 
K
S
 
G
V
 
I
D
 
H
L
 
L
T
 
E
I
 
V
Y
 
A
P
 
P
H
 
G
E
 
E
I
 
K
H
 
L
A
 
V
L
 
I
L
 
I
G
 
G
E
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
M
 
I
K
 
R
V
 
T
L
 
I
S
 
N
G
 
R
I
 
L
H
 
E
E
 
D
P
 
F
T
 
Q
K
 
E
G
 
G
T
 
E
I
 
V
T
 
V
I
 
V
N
 
D
N
 
G
V
 
L
N
 
S
Y
 
V
D
 
-
K
 
K
L
 
D
D
 
D
H
 
R
K
 
A
L
 
L
A
 
R
A
 
E
-
 
I
Q
 
R
L
 
R
G
 
E
I
 
V
G
 
G
I
 
M
I
 
V
Y
 
F
Q
 
Q
E
 
Q
L
 
F
S
 
N
V
 
L
I
 
F
D
 
P
E
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
N
L
 
V
Y
 
T
I
 
L
G
 
-
R
 
-
H
 
-
L
 
-
T
 
-
K
 
-
K
 
-
V
 
-
C
 
A
G
 
P
V
 
M
N
 
R
V
 
V
I
 
R
D
 
R
W
 
W
-
 
P
R
 
R
E
 
E
M
 
K
R
 
A
V
 
E
R
 
K
A
 
K
A
 
A
M
 
L
M
 
E
L
 
L
L
 
L
-
 
E
R
 
R
V
 
V
G
 
G
L
 
I
K
 
L
I
 
D
D
 
Q
L
 
A
D
 
R
E
 
K
K
 
Y
V
 
P
V
 
A
N
 
Q
L
 
L
S
 
S
I
 
G
S
 
G
H
 
Q
K
 
Q
Q
 
Q
M
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
R
T
 
A
L
 
L
M
 
A
L
 
M
D
 
E
A
 
P
K
 
K
V
 
I
L
 
M
I
 
L
M
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
S
 
A
L
 
L
T
 
D
N
 
P
K
 
E
E
 
M
V
 
V
D
 
G
Y
 
E
L
 
V
F
 
L
L
 
D
I
 
V
M
 
M
N
 
R
Q
 
D
L
 
L
R
 
A
K
 
Q
E
 
G
G
 
G
T
 
M
A
 
T
I
 
M
V
 
V
Y
 
V
I
 
V
S
 
T
H
 
H
K
 
E
L
 
M
A
 
G
E
 
F
I
 
A
R
 
R
R
 
E
I
 
V
C
 
A
D
 
D
R
 
R
Y
 
V
T
 
V
V
 
F
M
 
M
K
 
D
D
 
G
G
 
G
S
 
Q
S
 
I
V
 
V
C
 
E
S
 
E
G
 
G
M
 
R
V
 
P
S
 
E
E
 
E
V
 
I

7w79A Heme exporter hrtba in complex with mn-amppnp (see paper)
32% identity, 41% coverage: 18:224/510 of query aligns to 21:216/216 of 7w79A

query
sites
7w79A
V
|
V
H
 
T
A
|
A
L
 
L
K
 
D
S
 
S
V
 
A
D
 
N
L
 
V
T
x
E
I
 
I
Y
 
F
P
 
P
H
 
G
E
 
E
I
 
L
H
 
V
A
 
A
L
 
I
L
 
V
G
 
G
E
|
E
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
M
 
L
K
 
S
V
 
I
L
 
A
S
 
G
G
 
F
I
 
L
H
 
Q
E
 
E
P
 
P
T
 
T
K
 
S
G
 
G
T
 
T
I
 
V
T
 
T
I
 
L
N
 
H
N
 
G
V
 
A
N
 
-
Y
 
-
D
 
E
K
 
G
L
 
L
D
 
D
H
 
A
K
 
T
L
 
S
A
 
T
A
 
R
Q
 
R
L
 
E
G
 
H
I
 
I
G
 
G
I
 
F
I
 
V
Y
 
F
Q
|
Q
E
 
Q
L
 
P
S
 
N
V
 
L
I
 
L
D
 
G
E
 
S
L
 
L
T
 
T
V
 
A
L
 
R
E
 
E
N
 
Q
L
 
L
Y
 
L
I
 
I
G
 
T
R
 
D
H
 
H
L
 
L
T
 
R
K
 
-
K
 
-
V
 
-
C
 
-
G
 
-
V
 
-
N
 
-
V
 
-
I
 
-
D
 
G
W
 
I
R
 
K
E
 
P
M
 
R
R
 
K
V
 
D
R
 
R
A
 
A
A
 
D
M
 
E
M
 
L
L
 
L
L
 
A
R
 
R
V
 
V
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
 
G
D
 
L
L
 
G
D
 
G
E
 
R
K
 
R
V
 
V
V
 
A
N
 
Q
L
 
L
S
 
S
I
 
G
S
 
G
H
 
Q
K
 
R
Q
 
Q
M
 
R
L
 
V
E
 
N
I
 
I
A
 
A
K
 
R
T
 
A
L
 
L
M
 
M
L
 
G
D
 
N
A
 
P
K
 
Q
V
 
L
L
 
L
I
 
L
M
 
A
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
S
 
A
L
 
L
T
 
D
N
 
A
K
 
R
E
 
L
V
 
S
D
 
K
Y
 
E
L
 
I
F
 
V
L
 
E
I
 
L
M
 
L
N
 
R
Q
 
D
L
 
V
R
 
T
K
 
K
E
 
E
-
 
F
G
 
A
T
 
L
A
 
A
I
 
T
V
 
L
Y
 
M
I
 
V
S
 
T
H
|
H
K
 
D
L
 
R
A
 
S
E
 
Q
I
 
L
R
 
-
R
 
A
I
 
Y
C
 
A
D
 
D
R
 
R
Y
 
F
T
 
V
V
 
E
M
 
M
K
 
A
D
 
D
G
 
G
S
 
K
S
 
A
V
 
L

Sites not aligning to the query:

7w78A Heme exporter hrtba in complex with mg-amppnp (see paper)
32% identity, 41% coverage: 18:224/510 of query aligns to 21:216/218 of 7w78A

query
sites
7w78A
V
|
V
H
 
T
A
|
A
L
 
L
K
 
D
S
 
S
V
 
A
D
 
N
L
 
V
T
 
E
I
 
I
Y
 
F
P
 
P
H
 
G
E
 
E
I
 
L
H
 
V
A
 
A
L
 
I
L
 
V
G
 
G
E
|
E
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
M
 
L
K
 
S
V
 
I
L
 
A
S
 
G
G
 
F
I
 
L
H
 
Q
E
 
E
P
 
P
T
 
T
K
 
S
G
 
G
T
 
T
I
 
V
T
 
T
I
 
L
N
 
H
N
 
G
V
 
A
N
 
-
Y
 
-
D
 
E
K
 
G
L
 
L
D
 
D
H
 
A
K
 
T
L
 
S
A
 
T
A
 
R
Q
 
R
L
 
E
G
 
H
I
 
I
G
 
G
I
 
F
I
 
V
Y
 
F
Q
|
Q
E
 
Q
L
 
P
S
 
N
V
 
L
I
 
L
D
 
G
E
 
S
L
 
L
T
 
T
V
 
A
L
 
R
E
 
E
N
 
Q
L
 
L
Y
 
L
I
 
I
G
 
T
R
 
D
H
 
H
L
 
L
T
 
R
K
 
-
K
 
-
V
 
-
C
 
-
G
 
-
V
 
-
N
 
-
V
 
-
I
 
-
D
 
G
W
 
I
R
 
K
E
 
P
M
 
R
R
 
K
V
 
D
R
 
R
A
 
A
A
 
D
M
 
E
M
 
L
L
 
L
L
 
A
R
 
R
V
 
V
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
 
G
D
 
L
L
 
G
D
 
G
E
 
R
K
 
R
V
 
V
V
 
A
N
 
Q
L
 
L
S
 
S
I
 
G
S
 
G
H
 
Q
K
 
R
Q
 
Q
M
 
R
L
 
V
E
 
N
I
 
I
A
 
A
K
 
R
T
 
A
L
 
L
M
 
M
L
 
G
D
 
N
A
 
P
K
 
Q
V
 
L
L
 
L
I
 
L
M
 
A
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
S
 
A
L
 
L
T
 
D
N
 
A
K
 
R
E
 
L
V
 
S
D
 
K
Y
 
E
L
 
I
F
 
V
L
 
E
I
 
L
M
 
L
N
 
R
Q
 
D
L
 
V
R
 
T
K
 
K
E
 
E
-
 
F
G
 
A
T
 
L
A
 
A
I
 
T
V
 
L
Y
 
M
I
 
V
S
 
T
H
|
H
K
 
D
L
 
R
A
 
S
E
 
Q
I
 
L
R
 
-
R
 
A
I
 
Y
C
 
A
D
 
D
R
 
R
Y
 
F
T
 
V
V
 
E
M
 
M
K
 
A
D
 
D
G
 
G
S
 
K
S
 
A
V
 
L

Sites not aligning to the query:

3c4jA Abc protein artp in complex with atp-gamma-s
30% identity, 44% coverage: 6:227/510 of query aligns to 4:220/242 of 3c4jA

query
sites
3c4jA
I
 
I
S
 
D
M
 
V
A
 
H
G
 
Q
I
 
L
G
 
K
K
 
K
S
 
S
F
|
F
G
 
G
P
 
S
V
 
L
H
 
E
A
x
V
L
 
L
K
 
K
S
 
G
V
 
I
D
 
N
L
 
V
T
 
H
I
 
I
Y
 
R
P
 
E
H
 
G
E
 
E
I
 
V
H
 
V
A
 
V
L
 
V
L
 
I
G
 
G
E
x
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
M
 
L
K
 
R
V
 
C
L
 
L
S
 
N
G
 
L
I
 
L
H
 
E
E
 
D
P
 
F
T
 
D
K
 
E
G
 
G
T
 
E
I
 
I
T
 
I
I
 
I
N
 
D
N
 
G
V
 
I
N
 
N
Y
 
L
D
 
K
K
 
A
L
 
K
D
 
D
H
 
T
K
 
N
L
 
L
-
 
N
A
 
K
A
 
V
Q
 
R
L
 
E
G
 
E
I
 
V
G
 
G
I
 
M
I
 
V
Y
 
F
Q
 
Q
E
 
R
L
 
F
S
 
N
V
 
L
I
 
F
D
 
P
E
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
L
 
L
E
 
N
N
 
N
L
 
I
Y
 
T
I
 
L
G
 
A
R
 
P
H
 
M
L
 
K
T
 
V
K
 
R
K
 
K
V
 
-
C
 
-
G
 
-
V
 
-
N
 
-
V
 
-
I
 
-
D
 
-
W
 
W
-
 
P
R
 
R
E
 
E
M
 
K
R
 
A
V
 
E
R
 
A
A
 
K
A
 
A
M
 
M
M
 
E
L
 
L
L
 
L
-
 
D
R
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
 
D
D
 
K
L
 
A
D
x
H
E
 
A
K
x
Y
V
 
P
V
 
D
N
 
S
L
 
L
S
 
S
I
 
G
S
 
G
H
 
Q
K
 
A
Q
 
Q
M
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
R
T
 
A
L
 
L
M
 
A
L
 
M
D
 
E
A
 
P
K
 
K
V
 
I
L
 
M
I
 
L
M
 
F
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
S
 
A
L
 
L
T
 
D
N
 
P
K
 
E
E
 
M
V
 
V
D
 
G
Y
 
E
L
 
V
F
 
L
L
 
S
I
 
V
M
 
M
N
 
K
Q
 
Q
L
 
L
R
 
A
K
 
N
E
 
E
G
 
G
T
 
M
A
 
T
I
 
M
V
 
V
Y
 
V
I
 
V
S
 
T
H
 
H
K
 
E
L
 
M
A
 
G
E
 
F
I
 
A
R
 
R
R
 
E
I
 
V
C
 
G
D
 
D
R
 
R
Y
 
V
T
 
L
V
 
F
M
 
M
K
 
D
D
 
G
G
 
G
S
 
Y
S
 
I
V
 
I
C
 
E
S
 
E
G
 
G

3c41J Abc protein artp in complex with amp-pnp/mg2+
30% identity, 44% coverage: 6:227/510 of query aligns to 4:220/242 of 3c41J

query
sites
3c41J
I
 
I
S
 
D
M
 
V
A
 
H
G
 
Q
I
 
L
G
 
K
K
 
K
S
 
S
F
|
F
G
 
G
P
 
S
V
 
L
H
 
E
A
x
V
L
 
L
K
 
K
S
 
G
V
 
I
D
 
N
L
 
V
T
 
H
I
 
I
Y
 
R
P
 
E
H
 
G
E
 
E
I
 
V
H
 
V
A
 
V
L
 
V
L
 
I
G
 
G
E
x
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
M
 
L
K
x
R
V
 
C
L
 
L
S
 
N
G
 
L
I
 
L
H
 
E
E
 
D
P
 
F
T
 
D
K
 
E
G
 
G
T
 
E
I
 
I
T
 
I
I
 
I
N
 
D
N
 
G
V
 
I
N
 
N
Y
 
L
D
 
K
K
 
A
L
 
K
D
 
D
H
 
T
K
 
N
L
 
L
-
 
N
A
 
K
A
 
V
Q
 
R
L
 
E
G
 
E
I
 
V
G
 
G
I
 
M
I
 
V
Y
 
F
Q
 
Q
E
 
R
L
 
F
S
 
N
V
 
L
I
 
F
D
 
P
E
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
L
 
L
E
 
N
N
 
N
L
 
I
Y
 
T
I
 
L
G
 
A
R
 
P
H
 
M
L
 
K
T
 
V
K
 
R
K
 
K
V
 
-
C
 
-
G
 
-
V
 
-
N
 
-
V
 
-
I
 
-
D
 
-
W
 
W
-
 
P
R
 
R
E
 
E
M
 
K
R
 
A
V
 
E
R
 
A
A
 
K
A
 
A
M
 
M
M
 
E
L
 
L
L
 
L
-
 
D
R
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
 
D
D
 
K
L
 
A
D
x
H
E
 
A
K
x
Y
V
 
P
V
 
D
N
 
S
L
 
L
S
 
S
I
 
G
S
 
G
H
 
Q
K
 
A
Q
 
Q
M
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
R
T
 
A
L
 
L
M
 
A
L
 
M
D
 
E
A
 
P
K
 
K
V
 
I
L
 
M
I
 
L
M
 
F
D
|
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
S
 
A
L
 
L
T
 
D
N
 
P
K
 
E
E
 
M
V
 
V
D
 
G
Y
 
E
L
 
V
F
 
L
L
 
S
I
 
V
M
 
M
N
 
K
Q
 
Q
L
 
L
R
 
A
K
 
N
E
 
E
G
 
G
T
 
M
A
 
T
I
 
M
V
 
V
Y
 
V
I
 
V
S
 
T
H
 
H
K
 
E
L
 
M
A
 
G
E
 
F
I
 
A
R
 
R
R
 
E
I
 
V
C
 
G
D
 
D
R
 
R
Y
 
V
T
 
L
V
 
F
M
 
M
K
 
D
D
 
G
G
 
G
S
 
Y
S
 
I
V
 
I
C
 
E
S
 
E
G
 
G

2olkA Abc protein artp in complex with adp-beta-s
30% identity, 44% coverage: 6:227/510 of query aligns to 4:220/242 of 2olkA

query
sites
2olkA
I
 
I
S
 
D
M
 
V
A
 
H
G
 
Q
I
 
L
G
 
K
K
 
K
S
 
S
F
|
F
G
 
G
P
 
S
V
x
L
H
 
E
A
x
V
L
 
L
K
 
K
S
 
G
V
 
I
D
 
N
L
 
V
T
 
H
I
 
I
Y
 
R
P
 
E
H
 
G
E
 
E
I
 
V
H
 
V
A
 
V
L
 
V
L
 
I
G
 
G
E
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
M
 
L
K
 
R
V
 
C
L
 
L
S
 
N
G
 
L
I
 
L
H
 
E
E
 
D
P
 
F
T
 
D
K
 
E
G
 
G
T
 
E
I
 
I
T
 
I
I
 
I
N
 
D
N
 
G
V
 
I
N
 
N
Y
 
L
D
 
K
K
 
A
L
 
K
D
 
D
H
 
T
K
 
N
L
 
L
-
 
N
A
 
K
A
 
V
Q
 
R
L
 
E
G
 
E
I
 
V
G
 
G
I
 
M
I
 
V
Y
 
F
Q
 
Q
E
 
R
L
 
F
S
 
N
V
 
L
I
 
F
D
 
P
E
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
L
 
L
E
 
N
N
 
N
L
 
I
Y
 
T
I
 
L
G
 
A
R
 
P
H
 
M
L
 
K
T
 
V
K
 
R
K
 
K
V
 
-
C
 
-
G
 
-
V
 
-
N
 
-
V
 
-
I
 
-
D
 
-
W
 
W
-
 
P
R
 
R
E
 
E
M
 
K
R
 
A
V
 
E
R
 
A
A
 
K
A
 
A
M
 
M
M
 
E
L
 
L
L
 
L
-
 
D
R
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
 
D
D
 
K
L
 
A
D
 
H
E
 
A
K
 
Y
V
 
P
V
 
D
N
 
S
L
 
L
S
 
S
I
 
G
S
 
G
H
 
Q
K
 
A
Q
 
Q
M
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
R
T
 
A
L
 
L
M
 
A
L
 
M
D
 
E
A
 
P
K
 
K
V
 
I
L
 
M
I
 
L
M
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
S
 
A
L
 
L
T
 
D
N
 
P
K
 
E
E
 
M
V
 
V
D
 
G
Y
 
E
L
 
V
F
 
L
L
 
S
I
 
V
M
 
M
N
 
K
Q
 
Q
L
 
L
R
 
A
K
 
N
E
 
E
G
 
G
T
 
M
A
 
T
I
 
M
V
 
V
Y
 
V
I
 
V
S
 
T
H
 
H
K
 
E
L
 
M
A
 
G
E
 
F
I
 
A
R
 
R
R
 
E
I
 
V
C
 
G
D
 
D
R
 
R
Y
 
V
T
 
L
V
 
F
M
 
M
K
 
D
D
 
G
G
 
G
S
 
Y
S
 
I
V
 
I
C
 
E
S
 
E
G
 
G

2oljA Abc protein artp in complex with adp/mg2+
30% identity, 44% coverage: 6:227/510 of query aligns to 4:220/242 of 2oljA

query
sites
2oljA
I
 
I
S
 
D
M
 
V
A
 
H
G
 
Q
I
 
L
G
 
K
K
 
K
S
 
S
F
|
F
G
 
G
P
 
S
V
 
L
H
 
E
A
x
V
L
 
L
K
 
K
S
 
G
V
 
I
D
 
N
L
 
V
T
 
H
I
 
I
Y
 
R
P
 
E
H
 
G
E
 
E
I
 
V
H
 
V
A
 
V
L
 
V
L
 
I
G
 
G
E
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
M
 
L
K
 
R
V
 
C
L
 
L
S
 
N
G
 
L
I
 
L
H
 
E
E
 
D
P
 
F
T
 
D
K
 
E
G
 
G
T
 
E
I
 
I
T
 
I
I
 
I
N
 
D
N
 
G
V
 
I
N
 
N
Y
 
L
D
 
K
K
 
A
L
 
K
D
 
D
H
 
T
K
 
N
L
 
L
-
 
N
A
 
K
A
 
V
Q
 
R
L
 
E
G
 
E
I
 
V
G
 
G
I
 
M
I
 
V
Y
 
F
Q
 
Q
E
 
R
L
 
F
S
 
N
V
 
L
I
 
F
D
 
P
E
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
L
 
L
E
 
N
N
 
N
L
 
I
Y
 
T
I
 
L
G
 
A
R
 
P
H
 
M
L
 
K
T
 
V
K
 
R
K
 
K
V
 
-
C
 
-
G
 
-
V
 
-
N
 
-
V
 
-
I
 
-
D
 
-
W
 
W
-
 
P
R
 
R
E
 
E
M
 
K
R
 
A
V
 
E
R
 
A
A
 
K
A
 
A
M
 
M
M
 
E
L
 
L
L
 
L
-
 
D
R
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
 
D
D
 
K
L
 
A
D
x
H
E
 
A
K
x
Y
V
 
P
V
 
D
N
 
S
L
 
L
S
 
S
I
 
G
S
 
G
H
 
Q
K
 
A
Q
 
Q
M
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
R
T
 
A
L
 
L
M
 
A
L
 
M
D
 
E
A
 
P
K
 
K
V
 
I
L
 
M
I
 
L
M
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
S
 
A
L
 
L
T
 
D
N
 
P
K
 
E
E
 
M
V
 
V
D
 
G
Y
 
E
L
 
V
F
 
L
L
 
S
I
 
V
M
 
M
N
 
K
Q
 
Q
L
 
L
R
 
A
K
 
N
E
 
E
G
 
G
T
 
M
A
 
T
I
 
M
V
 
V
Y
 
V
I
 
V
S
 
T
H
 
H
K
 
E
L
 
M
A
 
G
E
 
F
I
 
A
R
 
R
R
 
E
I
 
V
C
 
G
D
 
D
R
 
R
Y
 
V
T
 
L
V
 
F
M
 
M
K
 
D
D
 
G
G
 
G
S
 
Y
S
 
I
V
 
I
C
 
E
S
 
E
G
 
G

1ji0A Crystal structure analysis of the abc transporter from thermotoga maritima
29% identity, 44% coverage: 15:239/510 of query aligns to 16:233/240 of 1ji0A

query
sites
1ji0A
F
x
Y
G
 
G
P
 
A
V
x
I
H
 
H
A
|
A
L
 
I
K
 
K
S
 
G
V
 
I
D
 
D
L
 
L
T
 
K
I
 
V
Y
 
P
P
 
R
H
 
G
E
 
Q
I
 
I
H
 
V
A
 
T
L
 
L
L
 
I
G
 
G
E
 
A
N
|
N
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
T
M
 
L
K
 
S
V
 
A
L
 
I
S
 
A
G
 
G
I
 
L
H
 
V
E
 
R
P
 
A
T
 
Q
K
 
K
G
 
G
T
 
K
I
 
I
T
 
I
I
 
F
N
 
N
N
 
G
V
 
Q
N
 
D
Y
 
I
D
 
T
K
 
N
L
 
K
D
 
P
H
 
A
K
 
H
L
 
V
A
 
I
A
 
N
Q
 
R
L
 
M
G
 
G
I
 
I
G
 
A
I
 
L
I
 
V
Y
 
P
Q
x
E
E
 
G
L
 
R
S
 
R
V
 
I
I
 
F
D
 
P
E
 
E
L
 
L
T
 
T
V
 
V
L
 
Y
E
 
E
N
 
N
L
 
L
Y
 
M
I
 
M
G
 
G
R
 
A
H
 
Y
L
 
N
T
 
R
K
 
K
K
 
D
V
 
K
C
 
E
G
 
G
V
 
I
N
 
K
V
 
R
-
 
D
I
 
L
D
 
E
W
 
W
R
 
-
E
 
-
M
 
-
R
 
-
V
 
-
R
 
-
A
 
-
A
 
-
M
 
I
M
 
F
L
 
S
L
 
L
R
 
F
V
 
P
G
 
R
L
 
L
K
 
K
I
 
E
D
 
R
L
 
L
D
 
K
E
 
Q
K
 
L
V
 
G
V
 
G
N
 
T
L
 
L
S
 
S
I
 
G
S
 
G
H
 
E
K
 
Q
Q
 
Q
M
 
M
L
 
L
E
 
A
I
 
I
A
 
G
K
 
R
T
 
A
L
 
L
M
 
M
L
 
S
D
 
R
A
 
P
K
 
K
V
 
L
L
 
L
I
 
M
M
 
M
D
|
D
E
|
E
P
 
P
T
 
S
S
 
L
S
 
G
L
 
L
T
 
A
N
 
P
K
 
I
E
 
L
V
 
V
D
 
S
Y
 
E
L
 
V
F
 
F
L
 
E
I
 
V
M
 
I
N
 
Q
Q
 
K
L
 
I
R
 
N
K
 
Q
E
 
E
G
 
G
T
 
T
A
 
T
I
 
I
V
 
L
Y
 
L
I
 
V
S
 
E
H
 
Q
K
 
N
L
 
A
A
 
L
E
 
G
I
 
A
R
 
L
R
 
K
I
 
V
C
 
A
D
 
H
R
 
Y
Y
 
G
T
 
Y
V
 
V
M
 
L
K
 
E
D
 
T
G
 
G
S
 
Q
S
 
I
V
 
V
C
 
L
S
 
E
G
 
G
M
 
K
V
 
A
S
 
S
E
 
E
V
 
L
N
 
L
N
 
D
D
 
N
D
 
E
I
 
M
V
 
V
R
 
R

7arlD Lolcde in complex with lipoprotein and adp (see paper)
31% identity, 39% coverage: 21:221/510 of query aligns to 22:218/222 of 7arlD

query
sites
7arlD
L
 
L
K
 
H
S
 
N
V
 
V
D
 
S
L
 
F
T
 
S
I
 
V
Y
 
G
P
 
E
H
 
G
E
 
E
I
 
M
H
 
M
A
 
A
L
 
I
L
 
V
G
 
G
E
 
S
N
 
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
M
 
L
K
 
H
V
 
L
L
 
L
S
 
G
G
 
G
I
 
L
H
 
D
E
 
T
P
 
P
T
 
T
K
 
S
G
 
G
T
 
D
I
 
V
T
 
I
I
 
F
N
 
N
N
 
G
V
 
Q
N
 
P
Y
 
M
D
 
S
K
 
K
L
 
L
D
 
S
H
 
S
K
 
A
L
 
A
A
 
K
A
 
A
Q
 
E
L
 
L
-
 
R
-
 
N
-
 
Q
G
 
K
I
 
L
G
 
G
I
 
F
I
 
I
Y
 
Y
Q
 
Q
E
 
F
L
 
H
S
 
H
V
 
L
I
 
L
D
 
P
E
 
D
L
 
F
T
 
T
V
 
A
L
 
L
E
 
E
N
 
N
L
 
V
Y
 
A
I
 
M
G
 
P
R
 
L
H
 
L
L
 
I
T
 
G
K
 
K
K
 
K
V
 
K
C
 
P
G
 
A
V
 
-
N
 
-
V
 
-
I
 
-
D
 
-
W
 
-
R
 
-
E
 
E
M
 
I
R
 
N
V
 
S
R
 
R
A
 
A
A
 
L
M
 
E
M
 
M
L
 
L
L
 
K
R
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
K
 
D
I
 
H
D
 
R
L
 
A
D
 
N
E
 
H
K
 
R
V
 
P
V
 
S
N
 
E
L
 
L
S
 
S
I
 
G
S
 
G
H
 
E
K
 
R
Q
 
Q
M
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
R
T
 
A
L
 
L
M
 
V
L
 
N
D
 
N
A
 
P
K
 
R
V
 
L
L
 
V
I
 
L
M
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
G
S
 
N
L
 
L
T
 
D
N
 
A
K
 
R
E
 
N
V
 
A
D
 
D
Y
 
S
L
 
I
F
 
F
L
 
Q
I
 
L
M
 
L
N
 
G
Q
 
E
L
 
L
-
 
N
R
 
R
K
 
L
E
 
Q
G
 
G
T
 
T
A
 
A
I
 
F
V
 
L
Y
 
V
I
 
V
S
 
T
H
 
H
K
 
D
L
 
L
A
 
Q
E
 
L
I
 
A
R
 
K
R
 
R
I
 
M
C
 
S
D
 
-
R
 
R
Y
 
Q
T
 
L
V
 
E
M
 
M
K
 
R
D
 
D
G
 
G

Sites not aligning to the query:

P75957 Lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD; EC 7.6.2.- from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
31% identity, 39% coverage: 21:221/510 of query aligns to 25:221/233 of P75957

query
sites
P75957
L
 
L
K
 
H
S
 
N
V
 
V
D
 
S
L
 
F
T
 
S
I
 
V
Y
 
G
P
 
E
H
 
G
E
 
E
I
 
M
H
 
M
A
 
A
L
 
I
L
 
V
G
|
G
E
 
S
N
 
S
G
 
G
A
 
S
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
L
K
 
H
V
 
L
L
 
L
S
 
G
G
 
G
I
 
L
H
 
D
E
 
T
P
 
P
T
 
T
K
 
S
G
 
G
T
 
D
I
 
V
T
 
I
I
 
F
N
 
N
N
 
G
V
 
Q
N
 
P
Y
 
M
D
 
S
K
 
K
L
 
L
D
 
S
H
 
S
K
 
A
L
 
A
A
 
K
A
 
A
Q
 
E
L
 
L
-
 
R
-
 
N
-
 
Q
G
 
K
I
 
L
G
 
G
I
 
F
I
 
I
Y
 
Y
Q
 
Q
E
 
F
L
 
H
S
 
H
V
 
L
I
 
L
D
 
P
E
 
D
L
 
F
T
 
T
V
 
A
L
 
L
E
 
E
N
 
N
L
 
V
Y
 
A
I
 
M
G
 
P
R
 
L
H
 
L
L
 
I
T
 
G
K
 
K
K
 
K
V
 
K
C
 
P
G
 
A
V
 
-
N
 
-
V
 
-
I
 
-
D
 
-
W
 
-
R
 
-
E
 
E
M
 
I
R
 
N
V
 
S
R
 
R
A
 
A
A
 
L
M
 
E
M
 
M
L
 
L
L
 
K
R
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
K
 
D
I
 
H
D
 
R
L
 
A
D
 
N
E
 
H
K
 
R
V
 
P
V
 
S
N
 
E
L
 
L
S
 
S
I
 
G
S
 
G
H
 
E
K
 
R
Q
 
Q
M
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
R
T
 
A
L
 
L
M
 
V
L
 
N
D
 
N
A
 
P
K
 
R
V
 
L
L
 
V
I
 
L
M
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
G
S
 
N
L
 
L
T
 
D
N
 
A
K
 
R
E
 
N
V
 
A
D
 
D
Y
 
S
L
 
I
F
 
F
L
 
Q
I
 
L
M
 
L
N
 
G
Q
 
E
L
 
L
-
 
N
R
 
R
K
 
L
E
 
Q
G
 
G
T
 
T
A
 
A
I
 
F
V
 
L
Y
 
V
I
 
V
S
 
T
H
 
H
K
 
D
L
 
L
A
 
Q
E
 
L
I
 
A
R
 
K
R
 
R
I
 
M
C
 
S
D
 
-
R
 
R
Y
 
Q
T
 
L
V
 
E
M
 
M
K
 
R
D
 
D
G
 
G

7mdyC Lolcde nucleotide-bound
31% identity, 39% coverage: 21:221/510 of query aligns to 22:218/226 of 7mdyC

query
sites
7mdyC
L
 
L
K
 
H
S
 
N
V
 
V
D
 
S
L
 
F
T
 
S
I
 
V
Y
 
G
P
 
E
H
 
G
E
 
E
I
 
M
H
 
M
A
 
A
L
 
I
L
 
V
G
 
G
E
x
S
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
M
 
L
K
 
H
V
 
L
L
 
L
S
 
G
G
 
G
I
 
L
H
 
D
E
 
T
P
 
P
T
 
T
K
 
S
G
 
G
T
 
D
I
 
V
T
 
I
I
 
F
N
 
N
N
 
G
V
 
Q
N
 
P
Y
 
M
D
 
S
K
 
K
L
 
L
D
 
S
H
 
S
K
 
A
L
 
A
A
 
K
A
 
A
Q
 
E
L
 
L
-
 
R
-
 
N
-
 
Q
G
 
K
I
 
L
G
 
G
I
 
F
I
 
I
Y
 
Y
Q
|
Q
E
 
F
L
 
H
S
 
H
V
 
L
I
 
L
D
 
P
E
 
D
L
 
F
T
 
T
V
 
A
L
 
L
E
 
E
N
 
N
L
 
V
Y
 
A
I
 
M
G
 
P
R
 
L
H
 
L
L
 
I
T
 
G
K
 
K
K
 
K
V
 
K
C
 
P
G
 
A
V
 
-
N
 
-
V
 
-
I
 
-
D
 
-
W
 
-
R
 
-
E
 
E
M
 
I
R
 
N
V
 
S
R
 
R
A
 
A
A
 
L
M
 
E
M
 
M
L
 
L
L
 
K
R
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
K
 
D
I
 
H
D
x
R
L
 
A
D
 
N
E
x
H
K
 
R
V
 
P
V
 
S
N
x
E
L
 
L
S
|
S
I
x
G
S
x
G
H
x
E
K
 
R
Q
 
Q
M
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
R
T
 
A
L
 
L
M
 
V
L
 
N
D
 
N
A
 
P
K
 
R
V
 
L
L
 
V
I
 
L
M
 
A
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
T
S
 
G
S
x
N
L
 
L
T
 
D
N
 
A
K
 
R
E
 
N
V
 
A
D
 
D
Y
 
S
L
 
I
F
 
F
L
 
Q
I
 
L
M
 
L
N
 
G
Q
 
E
L
 
L
-
 
N
R
 
R
K
 
L
E
 
Q
G
 
G
T
 
T
A
 
A
I
 
F
V
 
L
Y
 
V
I
 
V
S
 
T
H
|
H
K
 
D
L
 
L
A
 
Q
E
 
L
I
 
A
R
 
K
R
 
R
I
 
M
C
 
S
D
 
-
R
 
R
Y
 
Q
T
 
L
V
 
E
M
 
M
K
 
R
D
 
D
G
 
G

Sites not aligning to the query:

7v8iD Lolcd(e171q)e with bound amppnp in nanodiscs
31% identity, 39% coverage: 21:221/510 of query aligns to 24:220/229 of 7v8iD

query
sites
7v8iD
L
 
L
K
 
H
S
 
N
V
 
V
D
 
S
L
 
F
T
 
S
I
 
V
Y
 
G
P
 
E
H
 
G
E
 
E
I
 
M
H
 
M
A
 
A
L
 
I
L
 
V
G
 
G
E
 
S
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
M
 
L
K
 
H
V
 
L
L
 
L
S
 
G
G
 
G
I
 
L
H
 
D
E
 
T
P
 
P
T
 
T
K
 
S
G
 
G
T
 
D
I
 
V
T
 
I
I
 
F
N
 
N
N
 
G
V
 
Q
N
 
P
Y
 
M
D
 
S
K
 
K
L
 
L
D
 
S
H
 
S
K
 
A
L
 
A
A
 
K
A
 
A
Q
 
E
L
 
L
-
 
R
-
 
N
-
 
Q
G
 
K
I
 
L
G
 
G
I
 
F
I
 
I
Y
 
Y
Q
|
Q
E
 
F
L
 
H
S
 
H
V
 
L
I
 
L
D
 
P
E
 
D
L
 
F
T
 
T
V
 
A
L
 
L
E
 
E
N
 
N
L
 
V
Y
 
A
I
 
M
G
 
P
R
 
L
H
 
L
L
 
I
T
 
G
K
 
K
K
 
K
V
 
K
C
 
P
G
 
A
V
 
-
N
 
-
V
 
-
I
 
-
D
 
-
W
 
-
R
 
-
E
 
E
M
 
I
R
 
N
V
 
S
R
 
R
A
 
A
A
 
L
M
 
E
M
 
M
L
 
L
L
 
K
R
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
K
 
D
I
 
H
D
x
R
L
 
A
D
 
N
E
x
H
K
 
R
V
 
P
V
 
S
N
x
E
L
|
L
S
|
S
I
x
G
S
x
G
H
x
E
K
 
R
Q
 
Q
M
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
R
T
 
A
L
 
L
M
 
V
L
 
N
D
 
N
A
 
P
K
 
R
V
 
L
L
 
V
I
 
L
M
 
A
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
T
S
 
G
S
x
N
L
 
L
T
 
D
N
 
A
K
 
R
E
 
N
V
 
A
D
 
D
Y
 
S
L
 
I
F
 
F
L
 
Q
I
 
L
M
 
L
N
 
G
Q
 
E
L
 
L
-
 
N
R
 
R
K
 
L
E
 
Q
G
 
G
T
 
T
A
 
A
I
 
F
V
 
L
Y
 
V
I
 
V
S
 
T
H
|
H
K
 
D
L
 
L
A
 
Q
E
 
L
I
 
A
R
 
K
R
 
R
I
 
M
C
 
S
D
 
-
R
 
R
Y
 
Q
T
 
L
V
 
E
M
 
M
K
 
R
D
 
D
G
 
G

Sites not aligning to the query:

4yerA Crystal structure of an abc transporter atp-binding protein (tm_1403) from thermotoga maritima msb8 at 2.35 a resolution
29% identity, 46% coverage: 13:246/510 of query aligns to 12:231/285 of 4yerA

query
sites
4yerA
K
 
K
S
 
K
F
|
F
G
 
G
P
 
D
V
x
F
H
 
E
A
|
A
L
 
V
K
 
K
S
 
G
V
 
V
D
 
S
L
 
F
T
 
S
I
 
V
Y
 
K
P
 
K
H
 
G
E
 
E
I
 
I
H
 
F
A
 
A
L
 
F
L
 
L
G
 
G
E
x
P
N
|
N
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
T
M
 
I
K
 
H
V
 
M
L
 
L
S
 
T
G
 
T
I
 
L
H
 
L
E
 
K
P
 
P
T
 
T
K
 
S
G
 
G
T
 
K
I
 
A
T
 
W
I
 
V
N
 
-
N
 
-
V
 
A
N
 
G
Y
 
H
D
 
D
K
 
V
L
 
L
D
 
K
H
 
E
K
 
P
L
 
R
A
 
E
A
 
V
Q
 
R
L
 
R
G
 
K
I
 
I
G
 
G
I
 
I
I
 
V
Y
 
F
Q
 
Q
E
 
D
L
 
Q
S
 
S
V
 
L
I
 
D
D
 
R
E
 
E
L
 
L
T
 
T
V
 
A
L
 
Y
E
 
E
N
 
N
L
 
M
Y
 
Y
I
 
I
G
 
-
R
 
-
H
 
-
L
 
-
T
 
H
K
 
G
K
 
K
V
 
I
C
 
Y
G
 
G
V
 
Y
N
 
G
V
 
-
I
 
-
D
 
-
W
 
G
R
 
E
E
 
K
M
 
L
R
 
K
V
 
K
R
 
R
A
 
I
A
 
L
M
 
E
M
 
L
L
 
L
L
 
E
R
 
F
V
 
V
G
 
E
L
 
L
K
 
L
I
 
E
D
 
F
L
 
K
D
 
D
E
 
K
K
 
P
V
 
V
V
 
K
N
x
T
L
x
F
S
|
S
I
 
G
S
 
G
H
 
M
K
 
A
Q
 
R
M
 
R
L
 
L
E
 
E
I
 
I
A
 
A
K
 
R
T
 
S
L
 
L
M
 
I
L
 
H
D
 
E
A
 
P
K
 
E
V
 
V
L
 
L
I
 
F
M
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
I
S
 
G
L
 
L
T
 
D
N
 
P
K
 
H
E
 
T
V
 
R
D
 
A
Y
 
H
L
 
M
F
 
W
L
 
E
I
 
Y
M
 
I
N
 
S
Q
 
K
L
 
M
R
 
K
K
 
K
E
 
E
G
 
H
T
 
N
A
 
M
I
 
T
V
 
I
Y
 
F
I
 
L
-
 
T
S
 
T
H
 
H
K
 
Y
L
 
M
A
 
D
E
 
E
I
 
A
R
 
E
R
 
Q
I
 
L
C
 
A
D
 
D
R
 
R
Y
 
V
T
 
A
V
 
I
M
 
I
K
 
D
D
 
H
G
 
G
S
 
K
S
 
I
V
 
I
C
 
A
S
 
L
G
 
G
M
 
T
V
 
P
S
 
T
E
 
E
V
 
L
N
 
K
N
 
R
D
 
-
D
 
-
I
 
-
V
 
-
R
 
-
L
 
-
M
 
M
V
 
V
G
 
G
R
 
K
E
 
E
L
 
I

P75831 Macrolide export ATP-binding/permease protein MacB; EC 7.6.2.- from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
29% identity, 44% coverage: 2:224/510 of query aligns to 1:222/648 of P75831

query
sites
P75831
L
 
M
T
 
T
P
 
P
Y
 
L
I
 
L
S
 
E
M
 
L
A
 
K
G
 
D
I
 
I
G
 
R
K
 
R
S
 
S
F
 
Y
G
 
P
P
 
A
-
 
G
-
 
D
-
 
E
-
 
Q
V
 
V
H
 
E
A
 
V
L
 
L
K
 
K
S
 
G
V
 
I
D
 
S
L
 
L
T
 
D
I
 
I
Y
 
Y
P
 
A
H
 
G
E
 
E
I
 
M
H
 
V
A
 
A
L
 
I
L
 
V
G
 
G
E
 
A
N
 
S
G
 
G
A
 
S
G
 
G
K
|
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
K
 
N
V
 
I
L
 
L
S
 
G
G
 
C
I
 
L
H
 
D
E
 
K
P
 
A
T
 
T
K
 
S
G
 
G
T
 
T
I
 
Y
T
 
R
I
 
V
N
 
A
N
 
G
V
 
Q
N
 
D
Y
 
V
D
 
A
K
 
T
L
 
L
D
 
D
H
 
A
K
 
D
L
 
A
A
 
L
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
-
 
R
-
 
R
-
 
E
G
 
H
I
 
F
G
 
G
I
 
F
I
 
I
Y
 
F
Q
 
Q
E
 
R
L
 
Y
S
 
H
V
 
L
I
 
L
D
 
S
E
 
H
L
 
L
T
 
T
V
 
A
L
 
E
E
 
Q
N
 
N
L
 
V
Y
 
-
I
 
-
G
 
-
R
 
-
H
 
-
L
 
-
T
 
-
K
 
-
K
 
E
V
 
V
C
 
P
G
 
A
V
 
V
N
 
Y
V
 
A
I
 
G
D
 
L
W
 
E
R
 
R
E
 
K
M
 
Q
R
 
R
V
 
L
-
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
Q
M
 
E
M
 
L
L
 
L
L
 
Q
R
 
R
V
 
L
G
 
G
L
 
L
K
 
E
I
 
D
D
 
R
L
 
T
D
 
E
E
 
Y
K
 
Y
V
 
P
V
 
A
N
 
Q
L
 
L
S
 
S
I
 
G
S
 
G
H
 
Q
K
 
Q
Q
 
Q
M
 
R
L
 
V
E
 
S
I
 
I
A
 
A
K
 
R
T
 
A
L
 
L
M
 
M
L
 
N
D
 
G
A
 
G
K
 
Q
V
 
V
L
 
I
I
 
L
M
 
A
D
|
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
G
S
 
A
L
 
L
T
 
D
N
 
S
K
 
H
E
 
S
V
 
G
D
 
E
Y
 
E
L
 
V
F
 
M
L
 
A
I
 
I
M
 
L
N
 
H
Q
 
Q
L
 
L
R
 
R
K
 
D
E
 
R
G
 
G
T
 
H
A
 
T
I
 
V
V
 
I
Y
 
I
I
 
V
S
 
T
H
 
H
K
 
D
L
 
-
A
 
P
E
 
Q
I
 
V
R
 
A
R
 
A
I
 
Q
C
 
A
D
 
E
R
 
R
Y
 
V
T
 
I
V
 
E
M
 
I
K
 
R
D
 
D
G
 
G
S
 
E
S
 
I
V
 
V

5ws4A Crystal structure of tripartite-type abc transporter macb from acinetobacter baumannii (see paper)
29% identity, 40% coverage: 18:221/510 of query aligns to 21:219/650 of 5ws4A

query
sites
5ws4A
V
 
I
H
 
Q
A
x
I
L
 
L
K
 
K
S
 
G
V
 
I
D
 
D
L
 
L
T
 
T
I
 
I
Y
 
Y
P
 
E
H
 
G
E
 
E
I
 
L
H
 
V
A
 
A
L
 
I
L
 
V
G
 
G
E
 
Q
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
M
 
M
K
 
N
V
 
I
L
 
L
S
 
G
G
 
C
I
 
L
H
 
D
E
 
R
P
 
P
T
 
T
K
 
S
G
 
G
T
 
S
I
 
Y
T
 
K
I
 
V
N
 
N
N
 
G
V
 
Q
N
 
E
Y
 
T
D
 
G
K
 
K
L
 
L
D
 
E
H
 
P
K
 
D
L
 
Q
A
 
L
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
G
 
R
-
 
R
-
 
E
-
 
Y
I
 
F
G
 
G
I
 
F
I
 
I
Y
 
F
Q
 
Q
E
 
R
L
 
Y
S
 
H
V
 
L
I
 
L
D
 
G
E
 
D
L
 
L
T
 
S
V
 
A
L
 
E
E
 
G
N
 
N
L
 
V
Y
 
-
I
 
-
G
 
-
R
 
-
H
 
E
L
 
V
T
 
P
K
 
A
K
 
V
V
 
Y
C
 
A
G
 
G
V
 
V
N
 
T
V
 
P
I
 
A
D
 
D
W
 
R
R
 
K
E
 
Q
M
 
-
R
 
-
V
 
-
R
 
R
A
 
A
A
 
T
M
 
A
M
 
L
L
 
L
L
 
T
R
 
E
V
 
L
G
 
G
L
 
L
K
 
G
I
 
T
D
 
K
L
 
T
D
 
Q
E
 
N
K
 
R
V
 
P
V
 
S
N
 
Q
L
 
L
S
 
S
I
 
G
S
 
G
H
 
Q
K
 
Q
Q
 
Q
M
 
R
L
 
V
E
 
S
I
 
I
A
 
A
K
 
R
T
 
A
L
 
L
M
 
M
L
 
N
D
 
G
A
 
G
K
 
D
V
 
V
L
 
I
I
 
L
M
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
G
S
 
A
L
 
L
T
 
D
N
 
S
K
 
H
E
 
S
V
 
G
D
 
V
Y
 
E
L
 
V
F
 
M
L
 
R
I
 
I
M
 
L
N
 
R
Q
 
E
L
 
L
R
 
N
K
 
A
E
 
A
G
 
G
T
 
H
A
 
T
I
 
I
V
 
I
Y
 
L
I
 
V
S
 
T
H
 
H
K
 
D
L
 
M
A
 
-
E
 
Q
I
 
V
R
 
A
R
 
K
I
 
N
C
 
A
D
 
T
R
 
R
Y
 
I
T
 
I
V
 
E
M
 
I
K
 
S
D
 
D
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Q8N139 ATP-binding cassette sub-family A member 6; EC 7.6.2.- from Homo sapiens (Human) (see 2 papers)
31% identity, 42% coverage: 12:227/510 of query aligns to 489:695/1617 of Q8N139

query
sites
Q8N139
G
 
G
K
 
K
S
 
S
F
 
-
G
 
G
P
 
K
V
 
V
H
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
K
S
 
G
V
 
L
D
 
L
L
 
F
T
 
D
I
 
I
Y
 
Y
P
 
E
H
 
G
E
 
Q
I
 
I
H
 
T
A
 
A
L
 
I
L
 
L
G
 
G
E
 
H
N
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
S
L
 
L
M
 
L
K
 
N
V
 
I
L
 
L
S
 
N
G
 
G
I
 
L
H
 
S
E
 
V
P
 
P
T
 
T
K
 
E
G
 
G
T
 
S
I
 
V
T
 
T
I
 
I
N
 
Y
N
 
N
V
 
K
N
 
N
Y
 
L
D
 
S
K
 
E
L
 
M
D
 
Q
H
 
D
K
 
L
L
 
E
A
 
E
A
 
I
Q
 
R
L
 
K
G
 
I
I
 
T
G
 
G
I
 
V
I
 
C
Y
 
P
Q
 
Q
E
 
F
L
 
N
S
 
V
V
 
Q
I
 
F
D
 
D
E
 
I
L
 
L
T
 
T
V
 
V
L
 
K
E
 
E
N
 
N
L
 
L
Y
 
-
I
 
-
G
 
-
R
 
-
H
 
S
L
 
L
T
 
F
K
 
A
K
 
K
V
 
I
C
 
K
G
 
G
V
 
I
N
 
H
V
 
L
I
 
-
D
 
-
W
 
-
R
 
K
E
 
E
M
 
V
R
 
E
V
 
Q
R
 
E
A
 
V
A
 
Q
M
 
R
M
 
I
L
 
L
L
 
L
R
 
E
V
 
L
G
 
D
L
 
M
K
 
Q
I
 
N
D
 
I
L
 
Q
D
 
D
E
 
N
K
 
L
V
 
A
V
 
K
N
 
H
L
 
L
S
 
S
I
 
E
S
 
G
H
 
Q
K
 
K
Q
 
R
M
 
K
L
 
L
E
 
T
I
 
F
A
 
G
K
 
I
T
 
T
L
 
I
M
 
L
L
 
G
D
 
D
A
 
P
K
 
Q
V
 
I
L
 
L
I
 
L
M
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
T
S
 
G
L
 
L
T
 
D
N
 
P
K
 
F
E
 
S
V
 
R
D
 
D
Y
 
Q
L
 
V
F
 
W
L
 
S
I
 
L
M
 
L
N
 
R
Q
 
E
L
 
-
R
 
R
K
 
R
E
 
A
G
 
D
T
 
H
A
 
V
I
 
I
V
 
L
Y
 
F
I
 
S
S
 
T
H
 
Q
K
 
S
L
 
M
A
 
D
E
 
E
I
 
A
R
 
D
R
 
I
I
 
L
C
 
A
D
 
D
R
 
R
Y
 
K
T
 
V
V
 
I
M
 
M
K
 
S
D
 
N
G
 
G
S
 
R
S
 
L
V
 
K
C
 
C
S
 
A
G
 
G

Sites not aligning to the query:

P30750 Methionine import ATP-binding protein MetN; EC 7.4.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
29% identity, 45% coverage: 6:232/510 of query aligns to 2:228/343 of P30750

query
sites
P30750
I
 
I
S
 
K
M
 
L
A
 
S
G
 
N
I
 
I
G
 
T
K
 
K
S
 
V
F
 
F
G
 
H
-
 
Q
-
 
G
-
 
T
-
 
R
P
 
T
V
 
I
H
 
Q
A
 
A
L
 
L
K
 
N
S
 
N
V
 
V
D
 
S
L
 
L
T
 
H
I
 
V
Y
 
P
P
 
A
H
 
G
E
 
Q
I
 
I
H
 
Y
A
 
G
L
 
V
L
 
I
G
 
G
E
 
A
N
x
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
M
 
I
K
 
R
V
 
C
L
 
V
S
 
N
G
 
L
I
 
L
H
 
E
E
 
R
P
 
P
T
 
T
K
 
E
G
 
G
T
 
S
I
 
V
T
 
L
I
 
V
N
 
D
N
 
G
V
 
Q
N
 
E
Y
 
L
D
 
T
K
 
T
L
 
L
D
 
S
H
 
E
K
 
S
-
 
E
-
 
L
L
 
T
A
 
K
A
 
A
Q
 
R
L
 
R
G
 
Q
I
 
I
G
 
G
I
 
M
I
 
I
Y
 
F
Q
 
Q
E
 
H
L
 
F
S
 
N
V
 
L
I
 
L
D
 
S
E
 
S
L
 
R
T
 
T
V
 
V
L
 
F
E
 
G
N
 
N
L
 
V
Y
 
A
I
 
L
G
 
P
R
 
L
H
 
E
L
 
L
T
 
D
K
 
N
K
 
T
V
 
-
C
 
-
G
 
-
V
 
-
N
 
-
V
 
-
I
 
-
D
 
P
W
 
K
R
 
D
E
 
E
M
 
V
R
 
K
V
 
R
R
 
R
A
 
V
A
 
T
M
 
E
M
 
L
L
 
L
L
 
S
R
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
K
 
G
I
 
D
D
 
K
L
 
H
D
 
D
E
 
S
K
 
Y
V
 
P
V
 
S
N
 
N
L
 
L
S
 
S
I
 
G
S
 
G
H
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
M
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
R
T
 
A
L
 
L
M
 
A
L
 
S
D
 
N
A
 
P
K
 
K
V
 
V
L
 
L
I
 
L
M
 
C
D
 
D
E
|
E
P
 
A
T
 
T
S
 
S
S
 
A