SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing BWI76_RS02995 FitnessBrowser__Koxy:BWI76_RS02995 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P0A786 Aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit; Aspartate transcarbamylase; ATCase; EC 2.1.3.2 from Escherichia coli (strain K12) (see 4 papers)
93% identity, 100% coverage: 1:311/311 of query aligns to 1:311/311 of P0A786

query
sites
P0A786
M
|
M
A
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
Q
K
 
K
H
 
H
I
 
I
I
 
I
S
 
S
I
 
I
N
 
N
D
 
D
L
 
L
S
 
S
R
 
R
E
 
D
D
 
D
L
 
L
E
 
N
L
 
L
V
 
V
L
 
L
A
 
A
T
 
T
A
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
L
K
 
K
A
 
A
H
 
N
P
 
P
Q
 
Q
P
 
P
E
 
E
L
 
L
L
 
L
K
 
K
H
 
H
K
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
A
S
 
S
C
 
C
F
 
F
F
 
F
E
 
E
A
 
A
S
 
S
T
 
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
L
 
L
S
 
S
F
 
F
E
 
E
T
 
T
S
 
S
M
 
M
H
 
H
R
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
F
 
F
S
 
S
D
 
D
S
 
S
S
 
A
N
 
N
T
 
T
S
 
S
L
 
L
G
 
G
K
 
K
K
 
K
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
D
T
 
T
I
 
I
S
 
S
V
 
V
I
 
I
S
 
S
T
 
T
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
V
M
 
M
R
|
R
H
 
H
P
 
P
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
A
T
 
T
E
 
E
F
 
F
S
 
S
G
 
G
G
 
N
I
 
V
P
 
P
V
 
V
L
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
A
 
S
N
 
N
Q
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
T
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
F
 
F
T
 
T
I
 
I
Q
 
Q
E
 
E
T
 
T
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
L
 
L
E
 
D
N
 
N
L
 
L
N
 
H
V
 
V
A
 
A
M
 
M
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
K
F
 
F
N
 
D
G
 
G
N
 
N
R
 
R
F
 
F
Y
 
Y
F
 
F
I
 
I
A
 
A
P
 
P
D
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
P
 
P
Q
 
Q
Y
 
Y
I
 
I
L
 
L
D
 
D
M
 
M
L
 
L
D
 
D
D
 
E
K
 
K
G
 
G
I
 
I
A
 
A
W
 
W
S
 
S
L
 
L
H
 
H
S
 
S
A
 
S
I
 
I
E
 
E
E
 
E
V
 
V
M
 
M
E
 
A
E
 
E
V
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
Y
 
Y
M
 
M
T
 
T
R
 
R
V
 
V
Q
 
Q
K
 
K
E
 
E
R
 
R
L
 
L
D
 
D
P
 
P
S
 
S
E
 
E
Y
 
Y
A
 
A
N
 
N
V
 
V
K
 
K
A
 
A
Q
 
Q
F
 
F
V
 
V
L
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
S
D
 
D
L
 
L
E
 
H
G
 
N
A
 
A
R
 
K
A
 
A
N
 
N
M
 
M
K
 
K
V
 
V
L
 
L
H
 
H
P
 
P
L
|
L
P
|
P
R
 
R
I
 
V
D
 
D
E
 
E
I
 
I
T
 
A
T
 
T
D
 
D
V
 
V
D
 
D
K
 
K
T
 
T
P
 
P
H
 
H
A
 
A
W
 
W
Y
 
Y
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
N
 
N
G
 
G
I
 
I
F
 
F
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
N
 
N
S
 
R
D
 
D
L
 
L
A
 
V
L
 
L

2ipoA E. Coli aspartate transcarbamoylase complexed with n-phosphonacetyl-l- asparagine (see paper)
93% identity, 100% coverage: 2:311/311 of query aligns to 1:310/310 of 2ipoA

query
sites
2ipoA
A
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
Q
K
 
K
H
 
H
I
 
I
I
 
I
S
 
S
I
 
I
N
 
N
D
 
D
L
 
L
S
 
S
R
 
R
E
 
D
D
 
D
L
 
L
E
 
N
L
 
L
V
 
V
L
 
L
A
 
A
T
 
T
A
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
L
K
 
K
A
 
A
H
 
N
P
 
P
Q
 
Q
P
 
P
E
 
E
L
 
L
L
 
L
K
 
K
H
 
H
K
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
A
S
 
S
C
 
C
F
 
F
F
 
F
E
 
E
A
 
A
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
L
 
L
S
 
S
F
 
F
E
 
E
T
 
T
S
 
S
M
 
M
H
 
H
R
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
F
 
F
S
 
S
D
 
D
S
 
S
S
 
A
N
 
N
T
 
T
S
 
S
L
 
L
G
 
G
K
 
K
K
|
K
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
D
T
 
T
I
 
I
S
 
S
V
 
V
I
 
I
S
 
S
T
 
T
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
V
M
 
M
R
|
R
H
 
H
P
 
P
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
A
T
 
T
E
 
E
F
 
F
S
 
S
G
 
G
G
 
N
I
 
V
P
 
P
V
 
V
L
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
A
 
S
N
 
N
Q
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
T
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
F
 
F
T
 
T
I
 
I
Q
 
Q
E
 
E
T
 
T
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
L
 
L
E
 
D
N
 
N
L
 
L
N
 
H
V
 
V
A
 
A
M
 
M
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
R
|
R
T
|
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
K
F
 
F
N
 
D
G
 
G
N
 
N
R
 
R
F
 
F
Y
 
Y
F
 
F
I
 
I
A
 
A
P
 
P
D
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
P
 
P
Q
 
Q
Y
 
Y
I
 
I
L
 
L
D
 
D
M
 
M
L
 
L
D
 
D
D
 
E
K
 
K
G
 
G
I
 
I
A
 
A
W
 
W
S
 
S
L
 
L
H
 
H
S
 
S
A
 
S
I
 
I
E
 
E
E
 
E
V
 
V
M
 
M
E
 
A
E
 
E
V
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
Y
 
Y
M
 
M
T
|
T
R
|
R
V
 
V
Q
 
Q
K
 
K
E
 
E
R
 
R
L
 
L
D
 
D
P
 
P
S
 
S
E
 
E
Y
 
Y
A
 
A
N
 
N
V
 
V
K
 
K
A
 
A
Q
 
Q
F
 
F
V
 
V
L
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
S
D
 
D
L
 
L
E
 
H
G
 
N
A
 
A
R
 
K
A
 
A
N
 
N
M
 
M
K
 
K
V
 
V
L
 
L
H
 
H
P
|
P
L
|
L
P
 
P
R
 
R
I
 
V
D
 
D
E
 
E
I
 
I
T
 
A
T
 
T
D
 
D
V
 
V
D
 
D
K
 
K
T
 
T
P
 
P
H
 
H
A
 
A
W
 
W
Y
 
Y
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
N
 
N
G
|
G
I
 
I
F
 
F
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
N
 
N
S
 
R
D
 
D
L
 
L
A
 
V
L
 
L

2h3eA Structure of wild-type e. Coli aspartate transcarbamoylase in the presence of n-phosphonacetyl-l-isoasparagine at 2.3a resolution (see paper)
93% identity, 100% coverage: 2:311/311 of query aligns to 1:310/310 of 2h3eA

query
sites
2h3eA
A
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
Q
K
 
K
H
 
H
I
 
I
I
 
I
S
 
S
I
 
I
N
 
N
D
 
D
L
 
L
S
 
S
R
 
R
E
 
D
D
 
D
L
 
L
E
 
N
L
 
L
V
 
V
L
 
L
A
 
A
T
 
T
A
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
L
K
 
K
A
 
A
H
 
N
P
 
P
Q
 
Q
P
 
P
E
 
E
L
 
L
L
 
L
K
 
K
H
 
H
K
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
A
S
 
S
C
 
C
F
 
F
F
 
F
E
 
E
A
 
A
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
L
 
L
S
 
S
F
 
F
E
 
E
T
 
T
S
 
S
M
 
M
H
 
H
R
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
F
 
F
S
 
S
D
 
D
S
 
S
S
 
A
N
 
N
T
 
T
S
 
S
L
 
L
G
 
G
K
 
K
K
|
K
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
D
T
 
T
I
 
I
S
 
S
V
 
V
I
 
I
S
 
S
T
 
T
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
V
M
 
M
R
|
R
H
 
H
P
 
P
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
A
T
 
T
E
 
E
F
 
F
S
 
S
G
 
G
G
 
N
I
 
V
P
 
P
V
 
V
L
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
A
 
S
N
 
N
Q
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
T
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
F
 
F
T
 
T
I
 
I
Q
 
Q
E
 
E
T
 
T
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
L
 
L
E
 
D
N
 
N
L
 
L
N
 
H
V
 
V
A
 
A
M
 
M
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
R
|
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
K
F
 
F
N
 
D
G
 
G
N
 
N
R
 
R
F
 
F
Y
 
Y
F
 
F
I
 
I
A
 
A
P
 
P
D
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
P
 
P
Q
 
Q
Y
 
Y
I
 
I
L
 
L
D
 
D
M
 
M
L
 
L
D
 
D
D
 
E
K
 
K
G
 
G
I
 
I
A
 
A
W
 
W
S
 
S
L
 
L
H
 
H
S
 
S
A
 
S
I
 
I
E
 
E
E
 
E
V
 
V
M
 
M
E
 
A
E
 
E
V
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
Y
 
Y
M
 
M
T
|
T
R
|
R
V
 
V
Q
 
Q
K
 
K
E
 
E
R
 
R
L
 
L
D
 
D
P
 
P
S
 
S
E
 
E
Y
 
Y
A
 
A
N
 
N
V
 
V
K
 
K
A
 
A
Q
 
Q
F
 
F
V
 
V
L
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
S
D
 
D
L
 
L
E
 
H
G
 
N
A
 
A
R
 
K
A
 
A
N
 
N
M
 
M
K
 
K
V
 
V
L
 
L
H
 
H
P
|
P
L
|
L
P
 
P
R
 
R
I
 
V
D
 
D
E
 
E
I
 
I
T
 
A
T
 
T
D
 
D
V
 
V
D
 
D
K
 
K
T
 
T
P
 
P
H
 
H
A
 
A
W
 
W
Y
 
Y
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
N
 
N
G
|
G
I
 
I
F
 
F
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
N
 
N
S
 
R
D
 
D
L
 
L
A
 
V
L
 
L

2fzkA The structure of wild-type e. Coli aspartate transcarbamoylase in complex with novel t state inhibitors at 2.50 resolution (see paper)
93% identity, 100% coverage: 2:311/311 of query aligns to 1:310/310 of 2fzkA

query
sites
2fzkA
A
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
Q
K
 
K
H
 
H
I
 
I
I
 
I
S
 
S
I
 
I
N
 
N
D
 
D
L
 
L
S
 
S
R
 
R
E
 
D
D
 
D
L
 
L
E
 
N
L
 
L
V
 
V
L
 
L
A
 
A
T
 
T
A
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
L
K
 
K
A
 
A
H
 
N
P
 
P
Q
 
Q
P
 
P
E
 
E
L
 
L
L
 
L
K
 
K
H
 
H
K
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
A
S
 
S
C
 
C
F
 
F
F
 
F
E
 
E
A
 
A
S
 
S
T
 
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
L
 
L
S
 
S
F
 
F
E
 
E
T
 
T
S
 
S
M
 
M
H
 
H
R
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
F
 
F
S
 
S
D
 
D
S
 
S
S
 
A
N
 
N
T
 
T
S
 
S
L
 
L
G
 
G
K
 
K
K
|
K
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
D
T
 
T
I
 
I
S
 
S
V
 
V
I
 
I
S
 
S
T
 
T
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
V
M
 
M
R
|
R
H
 
H
P
 
P
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
A
T
 
T
E
 
E
F
 
F
S
 
S
G
 
G
G
 
N
I
 
V
P
 
P
V
 
V
L
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
A
 
S
N
 
N
Q
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
T
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
F
 
F
T
 
T
I
 
I
Q
 
Q
E
 
E
T
 
T
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
L
 
L
E
 
D
N
 
N
L
 
L
N
 
H
V
 
V
A
 
A
M
 
M
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
T
|
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
K
F
 
F
N
 
D
G
 
G
N
 
N
R
 
R
F
 
F
Y
 
Y
F
 
F
I
 
I
A
 
A
P
 
P
D
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
P
 
P
Q
 
Q
Y
 
Y
I
 
I
L
 
L
D
 
D
M
 
M
L
 
L
D
 
D
D
 
E
K
 
K
G
 
G
I
 
I
A
 
A
W
 
W
S
 
S
L
 
L
H
 
H
S
 
S
A
 
S
I
 
I
E
 
E
E
 
E
V
 
V
M
 
M
E
 
A
E
 
E
V
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
Y
 
Y
M
 
M
T
|
T
R
|
R
V
 
V
Q
 
Q
K
 
K
E
 
E
R
 
R
L
 
L
D
 
D
P
 
P
S
 
S
E
 
E
Y
 
Y
A
 
A
N
 
N
V
 
V
K
 
K
A
 
A
Q
 
Q
F
 
F
V
 
V
L
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
S
D
 
D
L
 
L
E
 
H
G
 
N
A
 
A
R
 
K
A
 
A
N
 
N
M
 
M
K
 
K
V
 
V
L
 
L
H
 
H
P
|
P
L
|
L
P
 
P
R
 
R
I
 
V
D
 
D
E
 
E
I
 
I
T
 
A
T
 
T
D
 
D
V
 
V
D
 
D
K
 
K
T
 
T
P
 
P
H
 
H
A
 
A
W
 
W
Y
 
Y
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
N
 
N
G
|
G
I
 
I
F
 
F
A
 
A
R
|
R
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
N
 
N
S
 
R
D
 
D
L
 
L
A
 
V
L
 
L

2fzgA The structure of wild-type e. Coli aspartate transcarbamoylase in complex with novel t state inhibitors at 2.25 resolution (see paper)
93% identity, 100% coverage: 2:311/311 of query aligns to 1:310/310 of 2fzgA

query
sites
2fzgA
A
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
Q
K
 
K
H
 
H
I
 
I
I
 
I
S
 
S
I
 
I
N
 
N
D
 
D
L
 
L
S
 
S
R
 
R
E
 
D
D
 
D
L
 
L
E
 
N
L
 
L
V
 
V
L
 
L
A
 
A
T
 
T
A
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
L
K
 
K
A
 
A
H
 
N
P
 
P
Q
 
Q
P
 
P
E
 
E
L
 
L
L
 
L
K
 
K
H
 
H
K
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
A
S
 
S
C
 
C
F
 
F
F
 
F
E
 
E
A
 
A
S
|
S
T
 
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
L
 
L
S
 
S
F
 
F
E
 
E
T
 
T
S
 
S
M
 
M
H
 
H
R
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
F
 
F
S
 
S
D
 
D
S
 
S
S
 
A
N
 
N
T
 
T
S
 
S
L
 
L
G
 
G
K
 
K
K
|
K
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
D
T
 
T
I
 
I
S
 
S
V
 
V
I
 
I
S
 
S
T
 
T
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
V
M
 
M
R
|
R
H
 
H
P
 
P
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
A
T
 
T
E
 
E
F
 
F
S
 
S
G
 
G
G
 
N
I
 
V
P
 
P
V
 
V
L
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
A
 
S
N
 
N
Q
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
T
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
F
 
F
T
 
T
I
 
I
Q
 
Q
E
 
E
T
 
T
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
L
 
L
E
 
D
N
 
N
L
 
L
N
 
H
V
 
V
A
 
A
M
 
M
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
R
|
R
T
|
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
K
F
 
F
N
 
D
G
 
G
N
 
N
R
 
R
F
 
F
Y
 
Y
F
 
F
I
 
I
A
 
A
P
 
P
D
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
P
 
P
Q
 
Q
Y
 
Y
I
 
I
L
 
L
D
 
D
M
 
M
L
 
L
D
 
D
D
 
E
K
 
K
G
 
G
I
 
I
A
 
A
W
 
W
S
 
S
L
 
L
H
 
H
S
 
S
A
 
S
I
 
I
E
 
E
E
 
E
V
 
V
M
 
M
E
 
A
E
 
E
V
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
Y
 
Y
M
 
M
T
|
T
R
|
R
V
 
V
Q
 
Q
K
 
K
E
 
E
R
 
R
L
 
L
D
 
D
P
 
P
S
 
S
E
 
E
Y
 
Y
A
 
A
N
 
N
V
 
V
K
 
K
A
 
A
Q
 
Q
F
 
F
V
 
V
L
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
S
D
 
D
L
 
L
E
 
H
G
 
N
A
 
A
R
 
K
A
 
A
N
 
N
M
 
M
K
 
K
V
 
V
L
 
L
H
 
H
P
|
P
L
|
L
P
 
P
R
 
R
I
 
V
D
 
D
E
 
E
I
 
I
T
 
A
T
 
T
D
 
D
V
 
V
D
 
D
K
 
K
T
 
T
P
 
P
H
 
H
A
 
A
W
 
W
Y
 
Y
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
N
 
N
G
|
G
I
 
I
F
 
F
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
N
 
N
S
 
R
D
 
D
L
 
L
A
 
V
L
 
L

2fzcA The structure of wild-type e. Coli aspartate transcarbamoylase in complex with novel t state inhibitors at 2.10 resolution (see paper)
93% identity, 100% coverage: 2:311/311 of query aligns to 1:310/310 of 2fzcA

query
sites
2fzcA
A
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
Q
K
 
K
H
 
H
I
 
I
I
 
I
S
 
S
I
 
I
N
 
N
D
 
D
L
 
L
S
 
S
R
 
R
E
 
D
D
 
D
L
 
L
E
 
N
L
 
L
V
 
V
L
 
L
A
 
A
T
 
T
A
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
L
K
 
K
A
 
A
H
 
N
P
 
P
Q
 
Q
P
 
P
E
 
E
L
 
L
L
 
L
K
 
K
H
 
H
K
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
A
S
 
S
C
 
C
F
 
F
F
 
F
E
 
E
A
 
A
S
|
S
T
 
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
L
 
L
S
 
S
F
 
F
E
 
E
T
 
T
S
 
S
M
 
M
H
 
H
R
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
F
 
F
S
 
S
D
 
D
S
 
S
S
 
A
N
 
N
T
 
T
S
 
S
L
 
L
G
 
G
K
 
K
K
|
K
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
D
T
 
T
I
 
I
S
 
S
V
 
V
I
 
I
S
 
S
T
 
T
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
V
M
 
M
R
|
R
H
 
H
P
 
P
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
A
T
 
T
E
 
E
F
 
F
S
 
S
G
 
G
G
 
N
I
 
V
P
 
P
V
 
V
L
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
A
 
S
N
 
N
Q
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
T
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
F
 
F
T
 
T
I
 
I
Q
 
Q
E
 
E
T
 
T
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
L
 
L
E
 
D
N
 
N
L
 
L
N
 
H
V
 
V
A
 
A
M
 
M
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
R
|
R
T
|
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
K
F
 
F
N
 
D
G
 
G
N
 
N
R
 
R
F
 
F
Y
 
Y
F
 
F
I
 
I
A
 
A
P
 
P
D
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
P
 
P
Q
 
Q
Y
 
Y
I
 
I
L
 
L
D
 
D
M
 
M
L
 
L
D
 
D
D
 
E
K
 
K
G
 
G
I
 
I
A
 
A
W
 
W
S
 
S
L
 
L
H
 
H
S
 
S
A
 
S
I
 
I
E
 
E
E
 
E
V
 
V
M
 
M
E
 
A
E
 
E
V
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
Y
 
Y
M
 
M
T
|
T
R
 
R
V
 
V
Q
 
Q
K
 
K
E
 
E
R
 
R
L
 
L
D
 
D
P
 
P
S
 
S
E
 
E
Y
 
Y
A
 
A
N
 
N
V
 
V
K
 
K
A
 
A
Q
 
Q
F
 
F
V
 
V
L
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
S
D
 
D
L
 
L
E
 
H
G
 
N
A
 
A
R
 
K
A
 
A
N
 
N
M
 
M
K
 
K
V
 
V
L
 
L
H
 
H
P
|
P
L
|
L
P
 
P
R
 
R
I
 
V
D
 
D
E
 
E
I
 
I
T
 
A
T
 
T
D
 
D
V
 
V
D
 
D
K
 
K
T
 
T
P
 
P
H
 
H
A
 
A
W
 
W
Y
 
Y
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
N
 
N
G
|
G
I
 
I
F
 
F
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
N
 
N
S
 
R
D
 
D
L
 
L
A
 
V
L
 
L

2airA T-state active site of aspartate transcarbamylase:crystal structure of the carbamyl phosphate and l-alanosine ligated enzyme (see paper)
93% identity, 100% coverage: 2:311/311 of query aligns to 1:310/310 of 2airA

query
sites
2airA
A
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
Q
K
 
K
H
 
H
I
 
I
I
 
I
S
 
S
I
 
I
N
 
N
D
 
D
L
 
L
S
 
S
R
 
R
E
 
D
D
 
D
L
 
L
E
 
N
L
 
L
V
 
V
L
 
L
A
 
A
T
 
T
A
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
L
K
 
K
A
 
A
H
 
N
P
 
P
Q
 
Q
P
 
P
E
 
E
L
 
L
L
 
L
K
 
K
H
 
H
K
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
A
S
 
S
C
 
C
F
 
F
F
 
F
E
 
E
A
 
A
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
L
 
L
S
 
S
F
 
F
E
 
E
T
 
T
S
 
S
M
 
M
H
 
H
R
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
F
 
F
S
 
S
D
 
D
S
 
S
S
 
A
N
 
N
T
 
T
S
 
S
L
 
L
G
 
G
K
 
K
K
|
K
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
D
T
 
T
I
 
I
S
 
S
V
 
V
I
 
I
S
 
S
T
 
T
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
V
M
 
M
R
|
R
H
 
H
P
 
P
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
A
T
 
T
E
 
E
F
 
F
S
 
S
G
 
G
G
 
N
I
 
V
P
 
P
V
 
V
L
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
A
 
S
N
 
N
Q
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
T
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
F
 
F
T
 
T
I
 
I
Q
 
Q
E
 
E
T
 
T
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
L
 
L
E
 
D
N
 
N
L
 
L
N
 
H
V
 
V
A
 
A
M
 
M
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
K
F
 
F
N
 
D
G
 
G
N
 
N
R
 
R
F
 
F
Y
 
Y
F
 
F
I
 
I
A
 
A
P
 
P
D
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
P
 
P
Q
 
Q
Y
 
Y
I
 
I
L
 
L
D
 
D
M
 
M
L
 
L
D
 
D
D
 
E
K
 
K
G
 
G
I
 
I
A
 
A
W
 
W
S
 
S
L
 
L
H
 
H
S
 
S
A
 
S
I
 
I
E
 
E
E
 
E
V
 
V
M
 
M
E
 
A
E
 
E
V
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
Y
 
Y
M
 
M
T
|
T
R
 
R
V
 
V
Q
 
Q
K
 
K
E
 
E
R
 
R
L
 
L
D
 
D
P
 
P
S
 
S
E
 
E
Y
 
Y
A
 
A
N
 
N
V
 
V
K
 
K
A
 
A
Q
 
Q
F
 
F
V
 
V
L
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
S
D
 
D
L
 
L
E
 
H
G
 
N
A
 
A
R
 
K
A
 
A
N
 
N
M
 
M
K
 
K
V
 
V
L
 
L
H
 
H
P
|
P
L
 
L
P
 
P
R
 
R
I
 
V
D
 
D
E
 
E
I
 
I
T
 
A
T
 
T
D
 
D
V
 
V
D
 
D
K
 
K
T
 
T
P
 
P
H
 
H
A
 
A
W
 
W
Y
 
Y
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
N
 
N
G
|
G
I
 
I
F
 
F
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
N
 
N
S
 
R
D
 
D
L
 
L
A
 
V
L
 
L

1za2A Structure of wild-type e. Coli aspartate transcarbamoylase in the presence of ctp, carbamoyl phosphate at 2.50 a resolution (see paper)
93% identity, 100% coverage: 2:311/311 of query aligns to 1:310/310 of 1za2A

query
sites
1za2A
A
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
Q
K
 
K
H
 
H
I
 
I
I
 
I
S
 
S
I
 
I
N
 
N
D
 
D
L
 
L
S
 
S
R
 
R
E
 
D
D
 
D
L
 
L
E
 
N
L
 
L
V
 
V
L
 
L
A
 
A
T
 
T
A
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
L
K
 
K
A
 
A
H
 
N
P
 
P
Q
 
Q
P
 
P
E
 
E
L
 
L
L
 
L
K
 
K
H
 
H
K
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
A
S
 
S
C
 
C
F
 
F
F
 
F
E
 
E
A
 
A
S
 
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
L
 
L
S
 
S
F
 
F
E
 
E
T
 
T
S
 
S
M
 
M
H
 
H
R
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
F
 
F
S
 
S
D
 
D
S
 
S
S
 
A
N
 
N
T
 
T
S
 
S
L
 
L
G
 
G
K
 
K
K
|
K
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
D
T
 
T
I
 
I
S
 
S
V
 
V
I
 
I
S
 
S
T
 
T
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
V
M
 
M
R
|
R
H
 
H
P
 
P
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
A
T
 
T
E
 
E
F
 
F
S
 
S
G
 
G
G
 
N
I
 
V
P
 
P
V
 
V
L
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
A
 
S
N
 
N
Q
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
T
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
F
 
F
T
 
T
I
 
I
Q
 
Q
E
 
E
T
 
T
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
L
 
L
E
 
D
N
 
N
L
 
L
N
 
H
V
 
V
A
 
A
M
 
M
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
R
|
R
T
|
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
K
F
 
F
N
 
D
G
 
G
N
 
N
R
 
R
F
 
F
Y
 
Y
F
 
F
I
 
I
A
 
A
P
 
P
D
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
P
 
P
Q
 
Q
Y
 
Y
I
 
I
L
 
L
D
 
D
M
 
M
L
 
L
D
 
D
D
 
E
K
 
K
G
 
G
I
 
I
A
 
A
W
 
W
S
 
S
L
 
L
H
 
H
S
 
S
A
 
S
I
 
I
E
 
E
E
 
E
V
 
V
M
 
M
E
 
A
E
 
E
V
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
Y
 
Y
M
 
M
T
|
T
R
 
R
V
 
V
Q
 
Q
K
 
K
E
 
E
R
 
R
L
 
L
D
 
D
P
 
P
S
 
S
E
 
E
Y
 
Y
A
 
A
N
 
N
V
 
V
K
 
K
A
 
A
Q
 
Q
F
 
F
V
 
V
L
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
S
D
 
D
L
 
L
E
 
H
G
 
N
A
 
A
R
 
K
A
 
A
N
 
N
M
 
M
K
 
K
V
 
V
L
 
L
H
 
H
P
|
P
L
|
L
P
 
P
R
 
R
I
 
V
D
 
D
E
 
E
I
 
I
T
 
A
T
 
T
D
 
D
V
 
V
D
 
D
K
 
K
T
 
T
P
 
P
H
 
H
A
 
A
W
 
W
Y
 
Y
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
N
 
N
G
|
G
I
 
I
F
 
F
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
N
 
N
S
 
R
D
 
D
L
 
L
A
 
V
L
 
L

1r0cA Products in the t state of aspartate transcarbamylase: crystal structure of the phosphate and n-carbamyl-l-aspartate ligated enzyme (see paper)
93% identity, 100% coverage: 2:311/311 of query aligns to 1:310/310 of 1r0cA

query
sites
1r0cA
A
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
Q
K
 
K
H
 
H
I
 
I
I
 
I
S
 
S
I
 
I
N
 
N
D
 
D
L
 
L
S
 
S
R
 
R
E
 
D
D
 
D
L
 
L
E
 
N
L
 
L
V
 
V
L
 
L
A
 
A
T
 
T
A
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
L
K
 
K
A
 
A
H
 
N
P
 
P
Q
 
Q
P
 
P
E
 
E
L
 
L
L
 
L
K
 
K
H
 
H
K
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
A
S
 
S
C
 
C
F
 
F
F
 
F
E
 
E
A
 
A
S
|
S
T
 
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
L
 
L
S
 
S
F
 
F
E
 
E
T
 
T
S
 
S
M
 
M
H
 
H
R
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
F
 
F
S
 
S
D
 
D
S
 
S
S
 
A
N
 
N
T
 
T
S
 
S
L
 
L
G
 
G
K
 
K
K
|
K
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
D
T
 
T
I
 
I
S
 
S
V
 
V
I
 
I
S
 
S
T
 
T
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
V
M
 
M
R
|
R
H
 
H
P
 
P
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
A
T
 
T
E
 
E
F
 
F
S
 
S
G
 
G
G
 
N
I
 
V
P
 
P
V
 
V
L
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
A
 
S
N
 
N
Q
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
T
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
F
 
F
T
 
T
I
 
I
Q
 
Q
E
 
E
T
 
T
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
L
 
L
E
 
D
N
 
N
L
 
L
N
 
H
V
 
V
A
 
A
M
 
M
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
K
F
 
F
N
 
D
G
 
G
N
 
N
R
 
R
F
 
F
Y
 
Y
F
 
F
I
 
I
A
 
A
P
 
P
D
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
P
 
P
Q
 
Q
Y
 
Y
I
 
I
L
 
L
D
 
D
M
 
M
L
 
L
D
 
D
D
 
E
K
 
K
G
 
G
I
 
I
A
 
A
W
 
W
S
 
S
L
 
L
H
 
H
S
 
S
A
 
S
I
 
I
E
 
E
E
 
E
V
 
V
M
 
M
E
 
A
E
 
E
V
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
Y
 
Y
M
 
M
T
|
T
R
 
R
V
 
V
Q
 
Q
K
 
K
E
 
E
R
 
R
L
 
L
D
 
D
P
 
P
S
 
S
E
 
E
Y
 
Y
A
 
A
N
 
N
V
 
V
K
 
K
A
 
A
Q
 
Q
F
 
F
V
 
V
L
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
S
D
 
D
L
 
L
E
 
H
G
 
N
A
 
A
R
 
K
A
 
A
N
 
N
M
 
M
K
 
K
V
 
V
L
 
L
H
 
H
P
|
P
L
 
L
P
 
P
R
 
R
I
 
V
D
 
D
E
 
E
I
 
I
T
 
A
T
 
T
D
 
D
V
 
V
D
 
D
K
 
K
T
 
T
P
 
P
H
 
H
A
 
A
W
 
W
Y
 
Y
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
N
 
N
G
|
G
I
 
I
F
 
F
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
N
 
N
S
 
R
D
 
D
L
 
L
A
 
V
L
 
L

1r0bA Aspartate transcarbamylase (atcase) of escherichia coli: a new crystalline r state bound to pala, or to product analogues phosphate and citrate (see paper)
93% identity, 100% coverage: 2:311/311 of query aligns to 1:310/310 of 1r0bA

query
sites
1r0bA
A
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
Q
K
 
K
H
 
H
I
 
I
I
 
I
S
 
S
I
 
I
N
 
N
D
 
D
L
 
L
S
 
S
R
 
R
E
 
D
D
 
D
L
 
L
E
 
N
L
 
L
V
 
V
L
 
L
A
 
A
T
 
T
A
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
L
K
 
K
A
 
A
H
 
N
P
 
P
Q
 
Q
P
 
P
E
 
E
L
 
L
L
 
L
K
 
K
H
 
H
K
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
A
S
 
S
C
 
C
F
 
F
F
 
F
E
 
E
A
 
A
S
 
S
T
 
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
L
 
L
S
 
S
F
 
F
E
 
E
T
 
T
S
 
S
M
 
M
H
 
H
R
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
F
 
F
S
 
S
D
 
D
S
 
S
S
 
A
N
 
N
T
 
T
S
|
S
L
 
L
G
 
G
K
 
K
K
|
K
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
D
T
 
T
I
 
I
S
 
S
V
 
V
I
 
I
S
 
S
T
 
T
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
V
M
 
M
R
|
R
H
 
H
P
 
P
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
A
T
 
T
E
 
E
F
 
F
S
 
S
G
 
G
G
 
N
I
 
V
P
 
P
V
 
V
L
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
A
 
S
N
 
N
Q
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
T
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
F
 
F
T
 
T
I
 
I
Q
 
Q
E
 
E
T
 
T
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
L
 
L
E
 
D
N
 
N
L
 
L
N
 
H
V
 
V
A
 
A
M
 
M
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
R
|
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
K
F
 
F
N
 
D
G
 
G
N
 
N
R
 
R
F
 
F
Y
 
Y
F
 
F
I
 
I
A
 
A
P
 
P
D
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
P
 
P
Q
 
Q
Y
 
Y
I
 
I
L
 
L
D
 
D
M
 
M
L
 
L
D
 
D
D
 
E
K
 
K
G
 
G
I
 
I
A
 
A
W
 
W
S
 
S
L
 
L
H
 
H
S
 
S
A
 
S
I
 
I
E
 
E
E
 
E
V
 
V
M
 
M
E
 
A
E
 
E
V
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
Y
 
Y
M
 
M
T
|
T
R
|
R
V
 
V
Q
|
Q
K
 
K
E
 
E
R
 
R
L
 
L
D
 
D
P
 
P
S
 
S
E
 
E
Y
 
Y
A
 
A
N
 
N
V
 
V
K
 
K
A
 
A
Q
 
Q
F
 
F
V
 
V
L
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
S
D
 
D
L
 
L
E
 
H
G
 
N
A
 
A
R
 
K
A
 
A
N
 
N
M
 
M
K
 
K
V
 
V
L
 
L
H
 
H
P
|
P
L
 
L
P
|
P
R
 
R
I
 
V
D
 
D
E
 
E
I
 
I
T
 
A
T
 
T
D
 
D
V
 
V
D
 
D
K
 
K
T
 
T
P
 
P
H
 
H
A
 
A
W
 
W
Y
 
Y
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
N
 
N
G
|
G
I
 
I
F
 
F
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
N
 
N
S
 
R
D
 
D
L
 
L
A
 
V
L
 
L

2hseA Structure of d236a e. Coli aspartate transcarbamoylase in the presence of phosphonoacetamide and l-aspartate at 2.60 a resolution
93% identity, 100% coverage: 2:311/311 of query aligns to 1:310/310 of 2hseA

query
sites
2hseA
A
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
Q
K
 
K
H
 
H
I
 
I
I
 
I
S
 
S
I
 
I
N
 
N
D
 
D
L
 
L
S
 
S
R
 
R
E
 
D
D
 
D
L
 
L
E
 
N
L
 
L
V
 
V
L
 
L
A
 
A
T
 
T
A
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
L
K
 
K
A
 
A
H
 
N
P
 
P
Q
 
Q
P
 
P
E
 
E
L
 
L
L
 
L
K
 
K
H
 
H
K
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
A
S
 
S
C
 
C
F
 
F
F
 
F
E
 
E
A
 
A
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
L
 
L
S
|
S
F
 
F
E
 
E
T
 
T
S
 
S
M
 
M
H
 
H
R
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
F
 
F
S
 
S
D
 
D
S
 
S
S
 
A
N
 
N
T
 
T
S
 
S
L
 
L
G
 
G
K
 
K
K
|
K
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
D
T
 
T
I
 
I
S
 
S
V
 
V
I
 
I
S
 
S
T
 
T
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
V
M
 
M
R
|
R
H
 
H
P
 
P
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
A
T
 
T
E
 
E
F
 
F
S
 
S
G
 
G
G
 
N
I
 
V
P
 
P
V
 
V
L
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
A
 
S
N
 
N
Q
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
T
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
F
 
F
T
 
T
I
 
I
Q
 
Q
E
 
E
T
 
T
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
L
 
L
E
 
D
N
 
N
L
 
L
N
 
H
V
 
V
A
 
A
M
 
M
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
R
|
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
K
F
 
F
N
 
D
G
 
G
N
 
N
R
 
R
F
 
F
Y
 
Y
F
 
F
I
 
I
A
 
A
P
 
P
D
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
P
 
P
Q
 
Q
Y
 
Y
I
 
I
L
 
L
D
 
D
M
 
M
L
 
L
D
 
D
D
 
E
K
 
K
G
 
G
I
 
I
A
 
A
W
 
W
S
 
S
L
 
L
H
 
H
S
 
S
A
 
S
I
 
I
E
 
E
E
 
E
V
 
V
M
 
M
E
 
A
E
 
E
V
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
Y
 
Y
M
 
M
T
|
T
R
|
R
V
 
V
Q
|
Q
K
 
K
E
 
E
R
 
R
L
 
L
D
 
A
P
 
P
S
 
S
E
 
E
Y
 
Y
A
 
A
N
 
N
V
 
V
K
 
K
A
 
A
Q
 
Q
F
 
F
V
 
V
L
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
S
D
 
D
L
 
L
E
 
H
G
 
N
A
 
A
R
 
K
A
 
A
N
 
N
M
 
M
K
 
K
V
 
V
L
 
L
H
 
H
P
|
P
L
|
L
P
|
P
R
 
R
I
 
V
D
 
D
E
 
E
I
 
I
T
 
A
T
 
T
D
 
D
V
 
V
D
 
D
K
 
K
T
 
T
P
 
P
H
 
H
A
 
A
W
 
W
Y
 
Y
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
Q
A
|
A
G
 
G
N
 
N
G
|
G
I
 
I
F
 
F
A
 
A
R
|
R
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
N
 
N
S
 
R
D
 
D
L
 
L
A
 
V
L
 
L

2a0fA Structure of d236a mutant e. Coli aspartate transcarbamoylase in presence of phosphonoacetamide at 2.90 a resolution (see paper)
93% identity, 100% coverage: 2:311/311 of query aligns to 1:310/310 of 2a0fA

query
sites
2a0fA
A
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
Q
K
 
K
H
 
H
I
 
I
I
 
I
S
 
S
I
 
I
N
 
N
D
 
D
L
 
L
S
 
S
R
 
R
E
 
D
D
 
D
L
 
L
E
 
N
L
 
L
V
 
V
L
 
L
A
 
A
T
 
T
A
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
L
K
 
K
A
 
A
H
 
N
P
 
P
Q
 
Q
P
 
P
E
 
E
L
 
L
L
 
L
K
 
K
H
 
H
K
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
A
S
 
S
C
 
C
F
 
F
F
 
F
E
 
E
A
 
A
S
 
S
T
 
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
L
 
L
S
 
S
F
 
F
E
 
E
T
 
T
S
 
S
M
 
M
H
 
H
R
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
F
 
F
S
 
S
D
 
D
S
 
S
S
 
A
N
 
N
T
 
T
S
 
S
L
 
L
G
 
G
K
 
K
K
|
K
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
D
T
 
T
I
 
I
S
 
S
V
 
V
I
 
I
S
 
S
T
 
T
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
V
M
 
M
R
|
R
H
 
H
P
 
P
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
A
T
 
T
E
 
E
F
 
F
S
 
S
G
 
G
G
 
N
I
 
V
P
 
P
V
 
V
L
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
A
 
S
N
 
N
Q
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
T
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
F
 
F
T
 
T
I
 
I
Q
 
Q
E
 
E
T
 
T
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
L
 
L
E
 
D
N
 
N
L
 
L
N
 
H
V
 
V
A
 
A
M
 
M
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
K
F
 
F
N
 
D
G
 
G
N
 
N
R
 
R
F
 
F
Y
 
Y
F
 
F
I
 
I
A
 
A
P
 
P
D
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
P
 
P
Q
 
Q
Y
 
Y
I
 
I
L
 
L
D
 
D
M
 
M
L
 
L
D
 
D
D
 
E
K
 
K
G
 
G
I
 
I
A
 
A
W
 
W
S
 
S
L
 
L
H
 
H
S
 
S
A
 
S
I
 
I
E
 
E
E
 
E
V
 
V
M
 
M
E
 
A
E
 
E
V
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
Y
 
Y
M
 
M
T
|
T
R
 
R
V
 
V
Q
 
Q
K
 
K
E
 
E
R
 
R
L
 
L
D
 
A
P
 
P
S
 
S
E
 
E
Y
 
Y
A
 
A
N
 
N
V
 
V
K
 
K
A
 
A
Q
 
Q
F
 
F
V
 
V
L
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
S
D
 
D
L
 
L
E
 
H
G
 
N
A
 
A
R
 
K
A
 
A
N
 
N
M
 
M
K
 
K
V
 
V
L
 
L
H
 
H
P
|
P
L
|
L
P
 
P
R
 
R
I
 
V
D
 
D
E
 
E
I
 
I
T
 
A
T
 
T
D
 
D
V
 
V
D
 
D
K
 
K
T
 
T
P
 
P
H
 
H
A
 
A
W
 
W
Y
 
Y
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
N
 
N
G
|
G
I
 
I
F
 
F
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
N
 
N
S
 
R
D
 
D
L
 
L
A
 
V
L
 
L

5vmqC Structure of the r105a mutant catalytic trimer of escherichia coli aspartate transcarbamoylase at 2.0-a resolution (see paper)
93% identity, 99% coverage: 2:309/311 of query aligns to 1:308/309 of 5vmqC

query
sites
5vmqC
A
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
Q
K
 
K
H
 
H
I
 
I
I
 
I
S
 
S
I
 
I
N
 
N
D
 
D
L
 
L
S
 
S
R
 
R
E
 
D
D
 
D
L
 
L
E
 
N
L
 
L
V
 
V
L
 
L
A
 
A
T
 
T
A
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
L
K
 
K
A
 
A
H
 
N
P
 
P
Q
 
Q
P
 
P
E
 
E
L
 
L
L
 
L
K
 
K
H
 
H
K
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
A
S
 
S
C
 
C
F
 
F
F
 
F
E
 
E
A
 
A
S
 
S
T
 
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
L
 
L
S
 
S
F
 
F
E
 
E
T
 
T
S
 
S
M
 
M
H
 
H
R
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
F
 
F
S
 
S
D
 
D
S
 
S
S
 
A
N
 
N
T
 
T
S
 
S
L
 
L
G
 
G
K
 
K
K
|
K
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
D
T
 
T
I
 
I
S
 
S
V
 
V
I
 
I
S
 
S
T
 
T
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
V
M
 
M
R
x
A
H
 
H
P
 
P
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
A
T
 
T
E
 
E
F
 
F
S
 
S
G
 
G
G
 
N
I
 
V
P
 
P
V
 
V
L
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
A
 
S
N
 
N
Q
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
T
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
F
 
F
T
 
T
I
 
I
Q
 
Q
E
 
E
T
 
T
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
L
 
L
E
 
D
N
 
N
L
 
L
N
 
H
V
 
V
A
 
A
M
 
M
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
K
F
 
F
N
 
D
G
 
G
N
 
N
R
 
R
F
 
F
Y
 
Y
F
 
F
I
 
I
A
 
A
P
 
P
D
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
P
 
P
Q
 
Q
Y
 
Y
I
 
I
L
 
L
D
 
D
M
 
M
L
 
L
D
 
D
D
 
E
K
 
K
G
 
G
I
 
I
A
 
A
W
 
W
S
 
S
L
 
L
H
 
H
S
 
S
A
 
S
I
 
I
E
|
E
E
 
E
V
 
V
M
 
M
E
 
A
E
 
E
V
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
Y
 
Y
M
 
M
T
|
T
R
 
R
V
 
V
Q
 
Q
K
 
K
E
 
E
R
 
R
L
 
L
D
 
D
P
 
P
S
 
S
E
 
E
Y
 
Y
A
 
A
N
 
N
V
 
V
K
 
K
A
 
A
Q
 
Q
F
 
F
V
 
V
L
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
S
D
|
D
L
 
L
E
 
H
G
 
N
A
 
A
R
 
K
A
 
A
N
 
N
M
 
M
K
 
K
V
 
V
L
 
L
H
 
H
P
|
P
L
 
L
P
 
P
R
 
R
I
 
V
D
 
D
E
 
E
I
 
I
T
 
A
T
 
T
D
 
D
V
 
V
D
 
D
K
 
K
T
 
T
P
 
P
H
 
H
A
 
A
W
 
W
Y
 
Y
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
N
 
N
G
|
G
I
 
I
F
 
F
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
N
 
N
S
 
R
D
 
D
L
 
L

2at1A Crystal structures of phosphonoacetamide ligated t and phosphonoacetamide and malonate ligated r states of aspartate carbamoyltransferase at 2.8-angstroms resolution and neutral ph (see paper)
92% identity, 100% coverage: 2:311/311 of query aligns to 1:310/310 of 2at1A

query
sites
2at1A
A
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
Q
K
 
K
H
 
H
I
 
I
I
 
I
S
 
S
I
 
I
N
 
N
D
 
D
L
 
L
S
 
S
R
 
R
E
 
D
D
 
D
L
 
L
E
 
N
L
 
L
V
 
V
L
 
L
A
 
A
T
 
T
A
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
L
K
 
K
A
 
A
H
 
N
P
 
P
Q
 
Q
P
 
P
E
 
E
L
 
L
L
 
L
K
 
K
H
 
H
K
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
A
S
 
S
C
 
C
F
 
F
F
 
F
E
 
E
A
 
A
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
L
 
L
S
 
S
F
 
F
E
 
Q
T
 
T
S
 
S
M
 
M
H
 
H
R
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
V
 
V
G
 
G
F
 
F
S
 
S
D
 
D
S
 
S
S
 
A
N
 
N
T
 
T
S
 
S
L
 
L
G
 
G
K
 
K
K
|
K
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
D
T
 
T
I
 
I
S
 
S
V
 
V
I
 
I
S
 
S
T
 
T
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
V
M
 
M
R
|
R
H
 
H
P
 
P
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
A
T
 
T
E
 
E
F
 
F
S
 
S
G
 
G
G
 
N
I
 
V
P
 
P
V
 
V
L
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
A
 
S
N
 
N
Q
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
T
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
F
 
F
T
 
T
I
 
I
Q
 
Q
E
 
Q
T
 
T
Q
 
E
G
 
G
R
 
R
L
 
L
E
 
D
N
 
N
L
 
L
N
 
H
V
 
V
A
 
A
M
 
M
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
R
|
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
K
F
 
F
N
 
D
G
 
G
N
 
N
R
 
R
F
 
F
Y
 
Y
F
 
F
I
 
I
A
 
A
P
 
P
D
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
P
 
P
Q
 
E
Y
 
Y
I
 
I
L
 
L
D
 
D
M
 
M
L
 
L
D
 
D
D
 
E
K
 
K
G
 
G
I
 
I
A
 
A
W
 
W
S
 
S
L
 
L
H
 
H
S
 
S
A
 
S
I
 
I
E
 
E
E
 
E
V
 
V
M
 
M
E
 
A
E
 
E
V
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
Y
 
Y
M
 
M
T
|
T
R
|
R
V
 
V
Q
 
Q
K
 
K
E
 
E
R
 
R
L
 
L
D
 
D
P
 
P
S
 
S
E
 
E
Y
 
Y
A
 
A
N
 
N
V
 
V
K
 
K
A
 
A
Q
 
Q
F
 
F
V
 
V
L
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
S
D
 
D
L
 
L
E
 
H
G
 
N
A
 
A
R
 
K
A
 
A
N
 
N
M
 
M
K
 
K
V
 
V
L
 
L
H
 
H
P
|
P
L
 
L
P
 
P
R
 
R
I
 
V
D
 
D
E
 
E
I
 
I
T
 
A
T
 
T
D
 
D
V
 
V
D
 
D
K
 
K
T
 
T
P
 
P
H
 
H
A
 
A
W
 
W
Y
 
Y
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
N
 
N