SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing BWI76_RS03895 FitnessBrowser__Koxy:BWI76_RS03895 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 13 hits to proteins with known functional sites (download)

2b33B Crystal structure of a putative endoribonuclease (tm0215) from thermotoga maritima msb8 at 2.30 a resolution
38% identity, 78% coverage: 20:121/130 of query aligns to 15:119/126 of 2b33B

query
sites
2b33B
P
 
P
F
 
Y
A
 
S
R
 
Q
A
 
A
V
 
V
E
 
V
A
 
V
G
 
G
G
 
N
W
 
M
L
 
M
Y
 
F
V
 
V
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
T
 
I
P
 
P
M
 
I
-
x
D
-
 
P
K
x
E
D
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
L
V
 
V
E
 
Q
G
 
G
G
 
T
I
 
I
V
 
E
E
 
E
Q
 
K
S
 
T
R
 
E
L
 
R
A
 
V
I
 
L
Q
 
E
N
 
N
C
 
L
V
 
K
D
 
A
I
 
I
M
 
L
N
 
E
E
 
A
A
 
G
G
 
G
Y
 
F
S
 
S
L
 
L
A
 
K
D
 
D
V
 
V
V
 
V
H
 
K
V
 
V
K
 
T
V
 
V
I
 
F
L
 
T
T
 
T
D
 
S
S
 
M
R
 
D
Y
 
Y
F
 
F
Q
 
Q
S
 
R
F
 
V
N
 
N
K
 
E
V
 
V
F
 
Y
R
 
S
E
 
R
F
 
Y
F
 
F
A
 
G
D
 
D
N
 
H
P
 
R
P
 
P
A
 
A
R
 
R
-
 
S
I
 
F
C
 
V
C
 
A
V
 
V
A
 
A
D
 
Q
L
 
L
V
 
P
V
 
R
D
 
N
C
 
V
K
 
E
V
 
I
E
 
E
V
 
I
D
 
E

7cd4A Crystal structure of the s103f mutant of bacillus subtilis (natto) yabj protein. (see paper)
35% identity, 79% coverage: 20:122/130 of query aligns to 15:119/124 of 7cd4A

query
sites
7cd4A
P
 
P
F
 
Y
A
 
S
R
 
Q
A
 
G
V
 
I
E
 
I
A
 
V
G
 
N
G
 
N
W
 
M
L
 
F
Y
 
Y
V
 
S
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
T
 
I
P
 
P
M
 
L
-
 
T
K
 
P
D
 
S
G
 
G
E
 
E
V
 
M
V
 
V
E
 
N
G
 
G
G
 
D
I
 
I
V
 
K
E
|
E
Q
 
Q
S
 
T
R
 
H
L
 
Q
A
 
V
I
 
F
Q
 
S
N
 
N
C
 
L
V
 
K
D
 
A
I
 
V
M
 
L
N
 
E
E
 
E
A
 
A
G
 
G
Y
 
A
S
 
S
L
 
F
A
 
E
D
 
T
V
 
V
V
 
V
H
 
K
V
 
A
K
 
T
V
 
V
I
 
F
L
 
I
T
 
A
D
 
D
S
 
M
R
 
E
Y
 
Q
F
 
F
Q
 
A
S
 
E
F
 
V
N
 
N
K
 
E
V
 
V
F
 
Y
R
 
G
E
 
Q
F
 
Y
F
 
F
A
 
D
D
 
T
N
 
H
P
 
K
P
 
P
A
 
A
R
 
R
I
 
F
C
 
C
C
 
V
-
 
E
V
 
V
A
 
A
D
 
R
L
 
L
V
 
P
V
 
K
D
 
D
C
 
A
K
 
L
V
 
V
E
 
E
V
 
I
D
 
E
V
 
V

Sites not aligning to the query:

2uynA Crystal structure of e. Coli tdcf with bound 2-ketobutyrate (see paper)
32% identity, 78% coverage: 20:121/130 of query aligns to 15:121/127 of 2uynA

query
sites
2uynA
P
 
P
F
 
Y
A
 
V
R
 
Q
A
 
G
V
 
V
E
 
D
A
 
L
G
 
G
G
 
S
W
 
M
L
 
V
Y
 
F
V
 
T
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
T
 
I
P
 
P
M
 
V
-
 
C
-
 
P
K
 
Q
D
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
V
 
-
E
 
P
G
 
A
G
 
D
I
 
V
V
 
Q
E
 
D
Q
 
Q
S
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
S
I
 
L
Q
 
E
N
 
N
C
 
V
V
 
K
D
 
A
I
 
I
M
 
V
N
 
V
E
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
 
L
S
 
S
L
 
V
A
 
G
D
 
D
V
 
I
V
 
I
H
 
K
V
 
M
K
 
T
V
 
V
I
 
F
L
 
I
T
 
T
D
 
D
S
 
L
R
 
N
Y
 
D
F
|
F
Q
 
A
S
 
T
F
 
I
N
 
N
K
 
E
V
 
V
F
 
Y
R
 
K
E
 
Q
F
 
F
F
 
F
A
 
D
D
 
E
N
 
H
P
 
Q
-
 
A
-
 
T
-
 
Y
P
 
P
A
 
T
R
|
R
I
x
S
C
|
C
C
 
V
-
 
Q
V
 
V
A
 
A
D
 
R
L
 
L
V
 
P
V
 
K
D
 
D
C
 
V
K
 
K
V
 
L
E
 
E
V
 
I
D
 
E

2uykC Crystal structure of e. Coli tdcf with bound serine (see paper)
32% identity, 78% coverage: 20:121/130 of query aligns to 15:121/127 of 2uykC

query
sites
2uykC
P
 
P
F
 
Y
A
 
V
R
 
Q
A
 
G
V
 
V
E
 
D
A
 
L
G
 
G
G
 
S
W
 
M
L
 
V
Y
 
F
V
 
T
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
T
 
I
P
 
P
M
 
V
-
 
C
-
 
P
K
 
Q
D
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
V
 
-
E
 
P
G
 
A
G
 
D
I
 
V
V
 
Q
E
 
D
Q
 
Q
S
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
S
I
 
L
Q
 
E
N
 
N
C
 
V
V
 
K
D
 
A
I
 
I
M
 
V
N
 
V
E
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
 
L
S
 
S
L
 
V
A
 
G
D
 
D
V
 
I
V
 
I
H
 
K
V
 
M
K
 
T
V
 
V
I
 
F
L
 
I
T
 
T
D
 
D
S
 
L
R
 
N
Y
 
D
F
 
F
Q
 
A
S
 
T
F
 
I
N
 
N
K
 
E
V
 
V
F
 
Y
R
 
K
E
 
Q
F
 
F
F
 
F
A
 
D
D
 
E
N
 
H
P
 
Q
-
 
A
-
 
T
-
 
Y
P
 
P
A
 
T
R
|
R
I
x
S
C
|
C
C
 
V
-
 
Q
V
 
V
A
 
A
D
 
R
L
 
L
V
 
P
V
 
K
D
 
D
C
 
V
K
 
K
V
 
L
E
 
E
V
 
I
D
 
E

P80601 2-iminobutanoate/2-iminopropanoate deaminase; 14.3 kDa perchloric acid soluble protein; Translation inhibitor L-PSP ribonuclease; UK114 antigen; EC 3.5.99.10; EC 3.1.-.- from Capra hircus (Goat) (see paper)
34% identity, 78% coverage: 20:121/130 of query aligns to 20:124/137 of P80601

query
sites
P80601
P
 
P
F
 
Y
A
 
S
R
 
Q
A
 
A
V
 
V
E
 
L
A
 
V
G
 
D
G
 
R
W
 
T
L
 
I
Y
 
Y
V
 
I
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
T
 
L
P
 
G
M
 
M
-
 
D
-
 
P
K
 
A
D
 
S
G
 
G
E
 
Q
V
 
L
V
 
V
E
 
P
G
 
G
G
 
G
I
 
V
V
 
V
E
 
E
Q
 
E
S
 
A
R
 
K
L
 
Q
A
 
A
I
 
L
Q
 
T
N
 
N
C
 
I
V
 
G
D
 
E
I
 
I
M
 
L
N
 
K
E
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
 
C
S
 
D
L
 
F
A
 
T
D
 
N
V
 
V
V
 
V
H
 
K
V
 
A
K
 
T
V
 
V
I
 
L
L
 
L
T
 
A
D
 
D
S
 
I
R
 
N
Y
 
D
F
 
F
Q
 
S
S
 
A
F
 
V
N
 
N
K
 
D
V
 
V
F
 
Y
R
 
K
E
 
Q
F
 
Y
F
 
F
A
 
Q
D
 
S
N
 
S
P
 
F
P
 
P
A
 
A
R
 
R
I
 
A
C
 
A
C
 
Y
-
 
Q
V
 
V
A
 
A
D
 
A
L
 
L
V
 
P
V
 
K
D
 
G
C
 
G
K
 
R
V
 
V
E
 
E
V
 
I
D
 
E

Sites not aligning to the query:

A0A1J1DL12 2-iminobutanoate/2-iminopropanoate deaminase; Allergen Der f 34; Enamine/imine deaminase; Allergen Der f 34.0101; EC 3.5.99.10 from Dermatophagoides farinae (American house dust mite) (see paper)
32% identity, 78% coverage: 20:121/130 of query aligns to 18:122/128 of A0A1J1DL12

query
sites
A0A1J1DL12
P
 
P
F
x
Y
A
 
S
R
 
Q
A
 
A
V
 
V
E
 
Q
A
 
V
G
 
G
G
 
N
W
 
T
L
 
V
Y
 
Y
V
 
L
S
 
S
G
|
G
Q
 
Q
T
 
I
P
 
G
M
 
M
-
 
N
-
 
V
K
 
R
D
 
T
G
 
N
E
 
E
V
 
M
V
 
V
E
 
T
G
 
G
G
 
P
I
 
I
V
 
R
E
 
D
Q
 
E
S
 
A
R
 
Q
L
 
Q
A
 
A
I
 
F
Q
 
T
N
|
N
C
 
M
V
 
K
D
 
A
I
 
V
M
 
V
N
 
E
E
 
A
A
 
S
G
 
G
Y
 
A
S
 
K
L
 
M
A
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
V
H
 
K
V
 
V
K
 
N
V
 
I
I
 
F
L
 
I
T
 
R
D
 
N
S
 
F
R
 
N
Y
 
D
F
 
F
Q
 
P
S
 
A
F
 
I
N
|
N
K
 
D
V
 
V
F
 
M
R
 
K
E
 
E
F
 
F
F
 
F
A
 
Q
D
 
S
N
 
P
P
 
F
P
 
P
A
 
A
R
|
R
I
 
S
C
 
T
C
 
V
-
 
G
V
 
V
A
 
A
D
 
E
L
 
L
V
x
P
V
 
K
D
 
N
C
 
A
K
 
R
V
 
V
E
|
E
V
 
I
D
 
E

Sites not aligning to the query:

3k0tC Crystal structure of pspto -psp protein in complex with d-beta-glucose from pseudomonas syringae pv. Tomato str. Dc3000 (see paper)
34% identity, 78% coverage: 20:121/130 of query aligns to 15:118/124 of 3k0tC

query
sites
3k0tC
P
 
P
F
x
Y
A
 
S
R
 
Q
A
 
A
V
 
I
E
 
K
A
 
A
G
 
G
G
 
N
W
 
T
L
 
V
Y
 
Y
V
 
M
S
 
S
G
|
G
Q
 
Q
T
x
I
P
 
P
M
 
L
K
 
D
D
 
P
G
 
S
-
 
T
-
 
M
E
 
E
V
 
L
V
 
V
E
 
E
G
 
G
G
 
-
I
 
I
V
 
E
E
 
A
Q
 
Q
S
 
I
R
 
T
L
 
Q
A
 
V
I
 
F
Q
 
E
N
 
N
C
 
L
V
 
K
D
 
S
I
 
V
M
 
A
N
 
Q
E
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
 
G
S
 
S
L
 
F
A
 
K
D
 
D
V
 
I
V
 
V
H
 
K
V
 
L
K
 
N
V
 
I
I
 
F
L
 
L
T
 
T
D
 
D
S
 
L
R
 
G
Y
 
H
F
|
F
Q
 
A
S
 
K
F
 
V
N
 
N
K
 
E
V
 
I
F
 
M
R
 
G
E
 
S
F
 
Y
F
 
F
A
 
S
D
 
Q
N
 
P
P
 
Y
P
 
P
A
 
A
R
|
R
I
 
A
C
 
A
C
 
I
-
 
G
V
 
V
A
 
A
D
 
A
L
 
L
V
 
P
V
x
R
D
 
G
C
 
A
K
 
Q
V
 
V
E
|
E
V
 
M
D
 
D

Q7CP78 2-iminobutanoate/2-iminopropanoate deaminase; Enamine/imine deaminase; EC 3.5.99.10 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
32% identity, 78% coverage: 20:121/130 of query aligns to 16:122/128 of Q7CP78

query
sites
Q7CP78
P
 
P
F
x
Y
A
 
V
R
 
Q
A
 
G
V
 
V
E
 
D
A
 
L
G
 
G
G
 
S
W
 
M
L
 
V
Y
 
I
V
 
T
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
T
 
I
P
 
P
M
 
V
-
 
D
-
 
P
K
 
K
D
 
T
G
 
G
E
 
A
V
 
V
V
 
A
E
 
E
G
 
D
G
 
-
I
 
V
V
 
S
E
 
A
Q
 
Q
S
 
A
R
 
R
L
 
Q
A
 
S
I
 
L
Q
 
E
N
 
N
C
 
V
V
 
K
D
 
A
I
 
I
M
 
V
N
 
E
E
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
 
L
S
 
K
L
 
V
A
 
G
D
 
D
V
 
I
V
 
V
H
 
K
V
 
T
K
 
T
V
 
V
I
 
F
L
 
V
T
 
K
D
 
D
S
 
L
R
 
N
Y
 
D
F
 
F
Q
 
A
S
 
T
F
 
V
N
 
N
K
 
A
V
 
T
F
 
Y
R
 
E
E
 
A
F
 
F
F
 
F
A
 
T
D
 
E
N
 
H
P
 
N
-
 
A
-
 
T
-
 
F
P
 
P
A
 
A
R
|
R
I
 
S
C
 
C
C
 
V
-
 
E
V
 
V
A
 
A
D
 
R
L
 
L
V
 
P
V
 
K
D
 
D
C
 
V
K
 
K
V
 
I
E
|
E
V
 
I
D
 
E

3vczB 1.80 angstrom resolution crystal structure of a putative translation initiation inhibitor from vibrio vulnificus cmcp6
30% identity, 78% coverage: 20:121/130 of query aligns to 15:122/127 of 3vczB

query
sites
3vczB
P
 
P
F
 
Y
A
 
I
R
 
Q
A
 
G
V
 
V
E
 
D
A
 
L
G
 
G
G
 
N
W
 
M
L
 
V
Y
 
L
V
 
T
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
T
 
I
P
 
P
M
 
V
K
 
N
D
 
P
-
 
A
-
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
V
V
 
-
E
 
P
G
 
A
G
 
D
I
 
I
V
 
A
E
 
A
Q
 
Q
S
 
A
R
 
R
L
 
Q
A
 
S
I
 
L
Q
 
D
N
 
N
C
 
V
V
 
K
D
 
A
I
 
V
M
 
V
N
 
E
E
 
A
A
 
S
G
 
G
Y
 
L
S
 
T
L
 
V
A
 
G
D
 
D
V
 
I
V
 
V
H
 
K
V
 
M
K
 
T
V
 
V
I
 
F
L
 
V
T
 
K
D
|
D
S
 
L
R
x
N
Y
 
D
F
 
F
Q
 
G
S
 
T
F
 
V
N
 
N
K
 
E
V
 
V
F
 
Y
R
 
G
E
 
N
F
 
F
F
 
F
A
 
D
D
 
E
N
 
H
P
 
N
-
 
V
-
 
A
-
 
H
-
 
Y
P
 
P
A
 
A
R
 
R
I
 
S
C
 
C
C
 
V
-
 
E
V
 
V
A
 
A
D
 
R
L
 
L
V
 
P
V
 
K
D
 
D
C
 
V
K
 
G
V
 
I
E
 
E
V
 
I
D
 
E

P0AFQ5 3-aminoacrylate deaminase RutC; 3-AA deaminase; EC 3.5.-.- from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
28% identity, 83% coverage: 13:120/130 of query aligns to 10:120/128 of P0AFQ5

query
sites
P0AFQ5
G
 
G
T
 
S
G
 
S
G
 
A
Q
 
P
H
 
L
L
 
A
P
 
P
F
 
F
A
 
V
R
 
P
A
 
G
V
 
T
E
 
L
A
 
A
G
 
D
G
 
G
W
 
V
L
 
V
Y
 
Y
V
 
V
S
 
S
G
 
G
Q
 
T
T
 
L
P
 
A
M
 
F
-
 
D
-
 
Q
K
 
H
D
 
N
G
 
N
E
 
V
V
 
L
V
 
F
E
 
A
G
 
D
G
 
D
I
 
P
V
 
K
E
 
A
Q
 
Q
S
 
T
R
 
R
L
 
H
A
 
V
I
 
L
Q
 
E
N
 
T
C
 
I
V
 
R
D
 
K
I
 
V
M
 
I
N
 
E
E
 
T
A
 
A
G
 
G
Y
 
G
S
 
T
L
 
M
A
 
A
D
 
D
V
 
V
V
 
T
H
 
F
V
 
N
K
 
S
V
 
I
I
 
F
L
 
I
T
 
T
D
 
D
S
 
W
R
 
K
Y
 
N
F
 
Y
Q
 
A
S
 
A
F
 
I
N
 
N
K
 
E
V
 
I
F
 
Y
R
 
A
E
 
E
F
 
F
F
 
F
A
 
P
D
 
G
N
 
D
P
 
K
P
 
P
A
 
A
R
|
R
I
 
F
C
 
C
C
 
I
V
 
Q
A
 
C
D
 
G
L
 
L
V
 
V
-
 
K
V
 
P
D
 
D
C
 
A
K
 
L
V
 
V
E
 
E
V
 
I

5v4dA Crystal structure of the protein of unknown function of the conserved rid protein family yyfa from yersinia pestis
27% identity, 61% coverage: 20:98/130 of query aligns to 17:97/127 of 5v4dA

query
sites
5v4dA
P
 
P
F
 
Y
A
 
S
R
 
Q
A
 
A
V
 
I
E
 
C
A
 
F
G
 
N
G
 
G
W
 
I
L
 
L
Y
 
Y
V
 
A
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
T
 
I
P
 
P
M
 
I
K
 
N
-
 
P
-
 
D
D
 
T
G
 
G
E
 
D
V
 
L
V
 
V
E
 
E
G
 
N
G
 
D
I
 
I
V
 
E
E
 
K
Q
 
Q
S
 
T
R
 
R
L
 
Q
A
 
V
I
 
L
Q
 
K
N
 
N
C
 
I
V
 
D
D
 
A
I
 
V
M
 
L
N
 
L
E
 
Q
A
 
A
G
 
G
Y
 
T
S
 
T
L
 
K
A
 
D
D
 
K
V
 
I
V
 
V
H
 
K
V
 
T
K
 
T
V
 
I
I
 
F
L
 
I
T
 
T
D
 
N
S
 
I
R
 
N
Y
 
N
F
 
S
Q
 
S
S
 
Q
F
 
V
N
 
N
K
x
D
V
 
I
F
 
Y
R
 
A
E
x
D
F
 
Y
F
 
F

O30478 3-hydroxybenzoate synthase; EC 4.1.3.45 from Streptomyces hygroscopicus (see paper)
28% identity, 88% coverage: 4:117/130 of query aligns to 209:336/340 of O30478

query
sites
O30478
K
 
K
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
P
E
 
R
G
 
A
G
 
P
T
 
R
G
 
F
T
 
A
G
x
R
G
 
A
Q
 
T
H
 
Y
L
 
L
P
 
P
F
 
S
A
 
R
R
 
A
A
 
A
V
 
D
E
 
G
A
 
V
G
 
G
G
 
G
W
 
Q
L
 
V
Y
 
F
V
 
V
S
 
S
G
|
G
Q
 
T
T
 
A
P
 
S
M
 
V
K
 
L
D
 
G
G
 
H
E
 
E
V
 
T
V
 
A
-
 
H
E
 
E
G
 
G
G
 
D
I
 
L
V
 
V
E
 
K
Q
 
Q
S
 
C
R
 
R
L
 
L
A
 
A
I
 
L
Q
 
E
N
 
N
C
 
I
V
 
E
D
 
L
I
 
V
M
 
I
N
 
S
-
 
G
-
 
G
-
 
N
-
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
H
-
 
G
-
 
I
E
 
S
A
 
A
G
 
G
Y
 
H
S
 
G
L
 
L
A
 
T
D
 
A
V
 
L
V
 
R
H
 
N
V
 
I
K
 
K
V
 
V
I
 
Y
L
 
V
T
 
R
D
 
R
S
 
S
R
 
E
Y
 
D
F
 
V
Q
 
P
S
 
A
F
 
V
N
 
R
K
 
E
V
 
I
F
 
C
R
 
R
E
 
E
F
 
A
F
 
F
A
 
S
D
 
-
N
 
-
P
 
P
P
 
D
A
 
A
R
 
D
I
 
I
-
 
V
-
 
Y
-
 
L
-
 
T
-
 
V
-
 
D
C
 
V
C
|
C
V
 
R
A
 
S
D
 
D
L
 
L
V
 
L
V
 
V
D
x
E
C
 
I
K
 
E

Sites not aligning to the query:

5ag3A Chorismatase mechanisms reveal fundamentally different types of reaction in a single conserved protein fold (see paper)
28% identity, 88% coverage: 4:117/130 of query aligns to 202:329/333 of 5ag3A

query
sites
5ag3A
K
 
K
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
P
E
 
R
G
 
A
G
 
P
T
 
R
G
x
F
T
 
A
G
 
R
G
 
A
Q
 
T
H
 
Y
L
 
L
P
 
P
F
 
S
A
 
R
R
 
A
A
 
A
V
 
D
E
 
G
A
 
V
G
 
G
G
 
G
W
 
Q
L
 
V
Y
 
F
V
 
V
S
 
S
G
|
G
Q
 
T
T
 
A
P
 
S
M
 
V
K
 
L
D
 
G
G
 
H
E
 
E
V
 
T
V
 
A
-
 
H
E
 
E
G
 
G
G
 
D
I
 
L
V
 
V
E
 
K
Q
 
Q
S
 
C
R
 
R
L
 
L
A
 
A
I
 
L
Q
 
E
N
 
N
C
 
I
V
 
E
D
 
L
I
 
V
M
 
I
N
 
S
-
 
G
-
 
G
-
 
N
-
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
H
-
 
G
-
 
I
E
 
S
A
 
A
G
 
G
Y
 
H
S
 
G
L
 
L
A
 
T
D
 
A
V
 
L
V
 
R
H
 
N
V
 
I
K
 
K
V
 
V
I
 
Y
L
 
V
T
 
R
D
 
R
S
 
S
R
 
E
Y
 
D
F
 
V
Q
 
P
S
 
A
F
 
V
N
 
R
K
 
E
V
 
I
F
 
C
R
 
R
E
 
E
F
 
A
F
 
F
A
 
S
D
 
-
N
 
-
P
 
P
P
 
D
A
 
A
R
 
D
I
 
I
-
 
V
-
 
Y
-
 
L
-
 
T
-
 
V
-
 
D
C
 
V
C
|
C
V
 
R
A
 
S
D
 
D
L
 
L
V
 
L
V
 
V
D
 
E
C
 
I
K
 
E

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>BWI76_RS03895 FitnessBrowser__Koxy:BWI76_RS03895
MSIKRYGVEGGTGTGGQHLPFARAVEAGGWLYVSGQTPMKDGEVVEGGIVEQSRLAIQNC
VDIMNEAGYSLADVVHVKVILTDSRYFQSFNKVFREFFADNPPARICCVADLVVDCKVEV
DVTCYNAARV

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory