SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing BWI76_RS05130 FitnessBrowser__Koxy:BWI76_RS05130 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P07821 Iron(3+)-hydroxamate import ATP-binding protein FhuC; Ferric hydroxamate uptake protein C; Ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC; Iron(III)-hydroxamate import ATP-binding protein FhuC; EC 7.2.2.16 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
92% identity, 100% coverage: 1:265/265 of query aligns to 1:265/265 of P07821

query
sites
P07821
M
 
M
Q
 
Q
E
 
E
N
 
Y
I
 
T
P
 
N
H
 
H
S
 
S
D
 
D
T
 
T
T
 
T
F
 
F
S
 
A
L
 
L
D
 
R
R
 
N
V
 
I
T
 
S
F
 
F
R
 
R
V
 
V
P
 
P
G
 
G
R
 
R
T
 
T
L
 
L
L
 
L
H
 
H
P
 
P
L
 
L
S
 
S
L
 
L
T
 
T
F
 
F
P
 
P
A
 
A
G
 
G
K
 
K
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
I
 
I
G
 
G
H
 
H
N
 
N
G
 
G
S
 
S
G
 
G
K
|
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
L
 
L
K
 
K
M
 
M
L
 
L
G
 
G
R
 
R
H
 
H
Q
 
Q
P
 
P
P
 
P
S
 
S
D
 
E
G
 
G
D
 
E
I
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
G
 
A
Q
 
Q
P
 
P
L
 
L
D
 
E
S
 
S
W
 
W
G
 
S
S
 
S
K
 
K
A
 
A
F
 
F
A
 
A
R
 
R
K
 
K
V
 
V
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
P
 
P
P
 
P
A
 
A
E
 
E
G
 
G
M
 
M
T
 
T
V
 
V
R
 
R
E
 
E
L
 
L
V
 
V
A
 
A
I
 
I
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
P
 
P
W
 
W
H
 
H
G
 
G
A
 
A
L
 
L
G
 
G
R
 
R
F
 
F
G
 
G
A
 
A
A
 
A
D
 
D
R
 
R
E
 
E
K
 
K
V
 
V
E
 
E
E
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
S
L
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
K
 
K
P
 
P
L
 
L
A
 
A
Q
 
H
R
 
R
L
 
L
V
 
V
D
 
D
S
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
R
Q
 
Q
R
 
R
A
 
A
W
 
W
I
 
I
A
 
A
M
 
M
L
 
L
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q
D
 
D
S
 
S
R
 
R
C
 
C
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
|
D
E
|
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
I
 
I
A
 
A
H
 
H
Q
 
Q
V
 
V
D
 
D
V
 
V
L
 
L
A
 
S
L
 
L
V
 
V
H
 
H
R
 
R
L
 
L
S
 
S
Q
 
Q
Q
 
E
R
 
R
G
 
G
L
 
L
T
 
T
V
 
V
I
 
I
A
 
A
V
 
V
L
 
L
H
 
H
D
 
D
I
 
I
N
 
N
M
 
M
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Y
 
Y
C
 
C
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
V
 
V
A
 
A
L
 
L
R
 
R
G
 
G
G
 
G
E
 
E
M
 
M
I
 
I
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
T
 
T
P
 
P
A
 
A
A
 
E
L
 
I
M
 
M
R
 
R
S
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
E
 
E
Q
 
M
I
 
I
Y
 
Y
G
 
G
I
 
I
P
 
P
M
 
M
G
 
G
I
 
I
L
 
L
P
 
P
H
 
H
P
 
P
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
P
 
P
V
 
V
S
 
S
F
 
F
V
 
V
Y
 
Y

P30750 Methionine import ATP-binding protein MetN; EC 7.4.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
31% identity, 79% coverage: 27:236/265 of query aligns to 21:229/343 of P30750

query
sites
P30750
L
 
L
H
 
N
P
 
N
L
 
V
S
 
S
L
 
L
T
 
H
F
 
V
P
 
P
A
 
A
G
 
G
K
 
Q
V
 
I
T
 
Y
G
 
G
L
 
V
I
 
I
G
 
G
H
 
A
N
x
S
G
|
G
S
x
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
K
 
R
M
 
C
L
 
V
G
 
N
R
 
L
H
 
L
Q
 
E
P
 
R
P
 
P
S
 
T
D
 
E
G
 
G
D
 
S
I
 
V
L
 
L
L
 
V
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
P
 
E
L
 
L
D
 
T
S
 
T
W
 
L
G
 
S
S
 
E
K
 
S
A
 
E
F
 
L
A
 
T
-
 
K
-
 
A
-
 
R
R
 
R
K
 
Q
V
 
I
A
 
G
Y
 
M
L
 
I
P
 
F
Q
 
Q
Q
 
H
L
 
F
P
 
N
P
 
L
A
 
L
E
 
S
G
 
S
M
 
R
T
 
T
V
 
V
R
 
F
E
 
G
L
 
N
V
 
V
A
 
A
I
 
L
-
 
P
-
 
L
-
 
E
-
 
L
G
 
D
R
 
N
Y
 
T
P
 
P
W
 
K
H
 
D
G
 
E
A
 
V
L
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
D
 
-
R
 
K
E
 
R
K
 
R
V
 
V
E
 
T
E
 
E
A
 
L
I
 
L
A
 
S
L
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
K
 
G
P
 
D
L
 
K
A
 
H
Q
 
D
R
 
S
L
 
Y
V
 
P
D
 
S
S
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
R
 
K
Q
 
Q
R
 
R
A
 
V
W
 
A
I
 
I
A
 
A
M
 
R
L
 
A
V
 
L
A
 
A
Q
 
S
D
 
N
S
 
P
R
 
K
C
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
C
D
 
D
E
|
E
P
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
I
 
P
A
 
A
H
 
T
Q
 
T
V
 
R
D
 
S
V
 
I
L
 
L
A
 
E
L
 
L
V
 
L
H
 
K
R
 
D
L
 
I
S
 
N
Q
 
R
Q
 
R
R
 
L
G
 
G
L
 
L
T
 
T
V
 
I
I
 
L
A
 
L
V
 
I
L
 
T
H
 
H
D
 
E
I
 
M
N
 
D
M
 
V
A
 
V
A
 
K
R
 
R
Y
 
I
C
 
C
D
 
D
Y
 
C
L
 
V
V
 
A
A
 
V
L
 
I
R
 
S
G
 
N
G
 
G
E
 
E
M
 
L
I
 
I
A
 
E
Q
 
Q
G
 
D
T
 
T
P
 
V
A
 
S
A
 
E
L
 
V
M
 
F

Sites not aligning to the query:

6cvlD Crystal structure of the escherichia coli atpgs-bound metni methionine abc transporter in complex with its metq binding protein (see paper)
32% identity, 80% coverage: 19:231/265 of query aligns to 12:225/344 of 6cvlD

query
sites
6cvlD
F
|
F
R
 
H
V
x
Q
P
 
G
G
 
T
R
 
R
T
 
T
L
x
I
-
 
Q
-
 
A
L
 
L
H
 
N
P
 
N
L
 
V
S
 
S
L
 
L
T
 
H
F
 
V
P
 
P
A
 
A
G
 
G
K
 
Q
V
 
I
T
 
Y
G
 
G
L
 
V
I
 
I
G
 
G
H
 
A
N
x
S
G
|
G
S
x
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
K
 
R
M
 
C
L
 
V
G
 
N
R
 
L
H
 
L
Q
 
E
P
 
R
P
 
P
S
 
T
D
 
E
G
 
G
D
 
S
I
 
V
L
 
L
L
 
V
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
P
 
E
L
 
L
D
 
T
S
 
T
W
 
L
G
 
S
S
 
E
K
 
S
A
 
E
F
 
L
A
 
T
-
 
K
-
 
A
-
 
R
R
 
R
K
 
Q
V
 
I
A
 
G
Y
 
M
L
 
I
P
 
F
Q
 
Q
Q
 
H
L
 
F
P
 
N
P
 
L
A
 
L
E
 
S
G
 
S
M
 
R
T
 
T
V
 
V
R
 
F
E
 
G
L
 
N
V
 
V
A
 
A
I
 
L
-
 
P
-
 
L
-
 
E
-
 
L
G
 
D
R
 
N
Y
 
T
P
 
P
W
 
K
H
 
D
G
 
E
A
 
V
L
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
D
 
-
R
 
K
E
 
R
K
 
R
V
 
V
E
 
T
E
 
E
A
 
L
I
 
L
A
 
S
L
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
K
 
G
P
 
D
L
 
K
A
 
H
Q
 
D
R
 
S
L
 
Y
V
 
P
D
 
S
S
x
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
E
x
Q
R
 
K
Q
 
Q
R
 
R
A
 
V
W
 
A
I
 
I
A
 
A
M
 
R
L
 
A
V
 
L
A
 
A
Q
 
S
D
 
N
S
 
P
R
 
K
C
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
I
 
P
A
 
A
H
 
T
Q
 
T
V
 
R
D
 
S
V
 
I
L
 
L
A
 
E
L
 
L
V
 
L
H
 
K
R
 
D
L
 
I
S
 
N
Q
 
R
Q
 
R
R
 
L
G
 
G
L
 
L
T
 
T
V
 
I
I
 
L
A
 
L
V
 
I
L
 
T
H
|
H
D
 
E
I
 
M
N
 
D
M
 
V
A
 
V
A
 
K
R
 
R
Y
 
I
C
 
C
D
 
D
Y
 
C
L
 
V
V
 
A
A
 
V
L
 
I
R
 
S
G
 
N
G
 
G
E
 
E
M
 
L
I
 
I
A
 
E
Q
 
Q
G
 
D
T
 
T

3tuzC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 semet soak crystal form (see paper)
31% identity, 82% coverage: 19:236/265 of query aligns to 12:230/344 of 3tuzC

query
sites
3tuzC
F
|
F
R
 
H
V
x
Q
P
 
G
G
 
T
R
 
R
T
 
T
L
 
I
-
 
Q
-
 
A
L
 
L
H
 
N
P
 
N
L
 
V
S
 
S
L
 
L
T
 
H
F
 
V
P
 
P
A
 
A
G
 
G
K
 
Q
V
 
I
T
 
Y
G
 
G
L
 
V
I
 
I
G
 
G
H
 
A
N
 
S
G
|
G
S
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
K
 
R
M
 
C
L
 
V
G
 
N
R
 
L
H
 
L
Q
 
E
P
 
R
P
 
P
S
 
T
D
 
E
G
 
G
D
 
S
I
 
V
L
 
L
L
 
V
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
P
 
E
L
 
L
D
 
T
S
 
T
W
 
L
G
 
S
S
 
E
K
 
S
A
 
E
F
 
L
A
 
T
-
 
K
-
 
A
-
 
R
R
 
R
K
 
Q
V
 
I
A
 
G
Y
 
M
L
 
I
P
 
F
Q
 
Q
Q
 
H
L
 
F
P
 
N
P
 
L
A
 
L
E
 
S
G
 
S
M
 
R
T
 
T
V
 
V
R
 
F
E
 
G
L
 
N
V
 
V
A
 
A
I
 
L
-
 
P
-
 
L
-
 
E
-
 
L
G
 
D
R
 
N
Y
 
T
P
 
P
W
 
K
H
 
D
G
 
E
A
 
V
L
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
D
 
-
R
 
K
E
 
R
K
 
R
V
 
V
E
 
T
E
 
E
A
 
L
I
 
L
A
 
S
L
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
K
 
G
P
 
D
L
 
K
A
 
H
Q
 
D
R
 
S
L
 
Y
V
 
P
D
 
S
S
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
R
 
K
Q
 
Q
R
 
R
A
 
V
W
 
A
I
 
I
A
 
A
M
 
R
L
 
A
V
 
L
A
 
A
Q
 
S
D
 
N
S
 
P
R
 
K
C
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
I
 
P
A
 
A
H
 
T
Q
 
T
V
 
R
D
 
S
V
 
I
L
 
L
A
 
E
L
 
L
V
 
L
H
 
K
R
 
D
L
 
I
S
 
N
Q
 
R
Q
 
R
R
 
L
G
 
G
L
 
L
T
 
T
V
 
I
I
 
L
A
 
L
V
 
I
L
 
T
H
 
H
D
 
E
I
 
M
N
 
D
M
 
V
A
 
V
A
 
K
R
 
R
Y
 
I
C
 
C
D
 
D
Y
 
C
L
 
V
V
 
A
A
 
V
L
 
I
R
 
S
G
 
N
G
 
G
E
 
E
M
 
L
I
 
I
A
 
E
Q
 
Q
G
 
D
T
 
T
P
 
V
A
 
S
A
 
E
L
 
V
M
 
F

Sites not aligning to the query:

3tuiC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 native crystal form (see paper)
31% identity, 82% coverage: 19:236/265 of query aligns to 12:230/344 of 3tuiC

query
sites
3tuiC
F
|
F
R
 
H
V
 
Q
P
 
G
G
 
T
R
 
R
T
 
T
L
 
I
-
 
Q
-
 
A
L
 
L
H
 
N
P
 
N
L
 
V
S
 
S
L
 
L
T
 
H
F
 
V
P
 
P
A
 
A
G
 
G
K
 
Q
V
 
I
T
 
Y
G
 
G
L
 
V
I
 
I
G
 
G
H
 
A
N
 
S
G
|
G
S
x
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
K
 
R
M
 
C
L
 
V
G
 
N
R
 
L
H
 
L
Q
 
E
P
 
R
P
 
P
S
 
T
D
 
E
G
 
G
D
 
S
I
 
V
L
 
L
L
 
V
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
P
 
E
L
 
L
D
 
T
S
 
T
W
 
L
G
 
S
S
 
E
K
 
S
A
 
E
F
 
L
A
 
T
-
 
K
-
 
A
-
 
R
R
 
R
K
 
Q
V
 
I
A
 
G
Y
 
M
L
 
I
P
 
F
Q
 
Q
Q
 
H
L
 
F
P
 
N
P
 
L
A
 
L
E
 
S
G
 
S
M
 
R
T
 
T
V
 
V
R
 
F
E
 
G
L
 
N
V
 
V
A
 
A
I
 
L
-
 
P
-
 
L
-
 
E
-
 
L
G
 
D
R
 
N
Y
 
T
P
 
P
W
 
K
H
 
D
G
 
E
A
 
V
L
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
D
 
-
R
 
K
E
 
R
K
 
R
V
 
V
E
 
T
E
 
E
A
 
L
I
 
L
A
 
S
L
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
K
 
G
P
 
D
L
 
K
A
 
H
Q
 
D
R
 
S
L
 
Y
V
 
P
D
 
S
S
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
R
 
K
Q
 
Q
R
 
R
A
 
V
W
 
A
I
 
I
A
 
A
M
 
R
L
 
A
V
 
L
A
 
A
Q
 
S
D
 
N
S
 
P
R
 
K
C
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
I
 
P
A
 
A
H
 
T
Q
 
T
V
 
R
D
 
S
V
 
I
L
 
L
A
 
E
L
 
L
V
 
L
H
 
K
R
 
D
L
 
I
S
 
N
Q
 
R
Q
 
R
R
 
L
G
 
G
L
 
L
T
 
T
V
 
I
I
 
L
A
 
L
V
 
I
L
 
T
H
 
H
D
 
E
I
 
M
N
 
D
M
 
V
A
 
V
A
 
K
R
 
R
Y
 
I
C
 
C
D
 
D
Y
 
C
L
 
V
V
 
A
A
 
V
L
 
I
R
 
S
G
 
N
G
 
G
E
 
E
M
 
L
I
 
I
A
 
E
Q
 
Q
G
 
D
T
 
T
P
 
V
A
 
S
A
 
E
L
 
V
M
 
F

8bmpA Cryo-em structure of the folate-specific ecf transporter complex in msp2n2 lipid nanodiscs bound to atp and adp (see paper)
35% identity, 89% coverage: 8:244/265 of query aligns to 2:237/278 of 8bmpA

query
sites
8bmpA
S
 
S
D
 
D
T
 
N
T
 
I
F
 
I
S
 
S
L
 
F
D
 
D
R
 
H
V
 
V
T
 
T
F
|
F
R
 
D
V
 
S
P
 
P
G
 
-
R
 
R
T
 
P
L
 
A
L
 
L
H
 
S
P
 
D
L
 
L
S
 
S
L
 
F
T
 
A
F
 
I
P
 
E
A
 
R
G
 
G
K
 
S
V
 
W
T
 
T
G
 
A
L
 
L
I
 
I
G
 
G
H
 
H
N
|
N
G
 
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
V
L
 
S
K
 
K
M
 
L
L
 
I
G
 
N
R
 
G
H
 
L
Q
 
L
P
 
A
P
 
P
S
 
D
D
 
D
G
 
L
D
 
D
-
 
K
-
 
S
-
 
S
I
 
I
L
 
T
L
 
V
D
 
D
G
 
G
Q
 
V
P
 
K
L
 
L
D
 
G
S
 
A
W
 
D
G
 
T
S
 
V
K
 
W
A
 
E
F
 
V
A
 
R
R
 
E
K
 
K
V
 
V
A
 
G
Y
 
I
L
 
V
P
 
F
Q
 
Q
Q
 
N
L
 
-
P
 
P
P
 
D
A
 
N
E
 
Q
-
 
F
-
 
V
G
 
G
M
 
A
T
 
T
V
 
V
R
 
S
E
 
D
L
 
D
V
 
V
A
 
A
I
 
-
G
 
-
R
 
-
Y
 
-
P
 
-
W
 
-
H
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
F
G
 
G
A
 
L
A
 
E
D
 
N
R
 
R
-
 
A
-
 
V
-
 
P
-
 
R
-
 
P
-
 
E
-
 
M
-
 
L
E
 
K
K
 
I
V
 
V
E
 
A
E
 
Q
A
 
A
I
 
V
A
 
A
L
 
D
V
 
V
G
 
G
L
 
M
K
 
A
P
 
D
L
 
Y
A
 
A
Q
 
D
R
 
S
L
 
E
V
 
P
D
 
S
S
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
R
 
K
Q
 
Q
R
 
R
A
 
V
W
 
A
I
 
I
A
 
A
M
 
G
L
 
I
V
 
L
A
 
A
Q
 
V
D
 
K
S
 
P
R
 
Q
C
 
V
L
 
I
L
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
S
T
 
T
S
 
S
A
 
M
L
 
L
D
 
D
I
 
P
A
 
E
H
 
G
Q
 
K
V
 
E
D
 
Q
V
 
I
L
 
L
A
 
D
L
 
L
V
 
V
H
 
R
R
 
K
L
 
I
S
 
K
Q
 
E
Q
 
D
R
 
N
G
 
N
L
 
L
T
 
T
V
 
V
I
 
I
A
 
S
V
 
I
L
 
T
H
 
H
D
 
D
I
 
L
N
 
E
M
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
G
Y
 
-
C
 
A
D
 
D
Y
 
Q
L
 
V
V
 
L
A
 
V
L
 
L
R
 
D
G
 
D
G
 
G
E
 
Q
M
 
L
I
 
L
A
 
D
Q
 
Q
G
 
G
T
 
K
P
 
P
A
 
E
A
 
E
L
 
I
M
 
F
-
 
P
R
 
K
S
 
V
E
 
E
T
 
M
L
 
L
E
 
K
Q
 
R
I
 
I

5d3mA Folate ecf transporter: amppnp bound state (see paper)
34% identity, 89% coverage: 8:244/265 of query aligns to 2:240/280 of 5d3mA

query
sites
5d3mA
S
 
S
D
 
D
T
 
N
T
 
I
F
 
I
S
 
S
L
 
F
D
 
D
R
 
H
V
 
V
T
 
T
F
|
F
R
 
T
V
 
Y
P
 
P
G
 
D
-
 
S
-
 
P
R
 
R
T
 
P
L
 
A
L
 
L
H
 
S
P
 
D
L
 
L
S
 
S
L
 
F
T
 
A
F
 
I
P
 
E
A
 
R
G
 
G
K
 
S
V
 
W
T
 
T
G
 
A
L
 
L
I
 
I
G
 
G
H
 
H
N
|
N
G
|
G
S
 
S
G
 
G
K
|
K
S
|
S
T
 
T
L
 
V
L
 
S
K
 
K
M
 
L
L
 
I
G
 
N
R
 
G
H
 
L
Q
 
L
P
 
A
P
 
P
S
 
D
D
 
D
G
 
L
D
 
D
-
 
K
-
 
S
-
 
S
I
 
I
L
 
T
L
 
V
D
 
D
G
 
G
Q
 
V
P
 
K
L
 
L
D
 
G
S
 
A
W
 
D
G
 
T
S
 
V
K
 
W
A
 
E
F
 
V
A
 
R
R
 
E
K
 
K
V
 
V
A
 
G
Y
 
I
L
 
V
P
 
F
Q
 
Q
Q
 
N
L
 
-
P
 
P
P
 
D
A
 
N
E
 
Q
-
 
F
-
 
V
G
 
G
M
 
A
T
 
T
V
 
V
R
 
S
E
 
D
L
 
D
V
 
V
A
 
A
I
 
-
G
 
-
R
 
-
Y
 
-
P
 
-
W
 
-
H
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
F
G
 
G
A
 
L
A
 
E
D
 
N
R
 
R
-
 
A
-
 
V
-
 
P
-
 
R
-
 
P
-
 
E
-
 
M
-
 
L
E
 
K
K
 
I
V
 
V
E
 
A
E
 
Q
A
 
A
I
 
V
A
 
A
L
 
D
V
 
V
G
 
G
L
 
M
K
 
A
P
 
D
L
 
Y
A
 
A
Q
 
D
R
 
S
L
 
E
V
 
P
D
 
S
S
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
R
 
K
Q
 
Q
R
 
R
A
 
V
W
 
A
I
 
I
A
 
A
M
 
G
L
 
I
V
 
L
A
 
A
Q
 
V
D
 
K
S
 
P
R
 
Q
C
 
V
L
 
I
L
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
S
T
 
T
S
 
S
A
 
M
L
 
L
D
 
D
I
 
P
A
 
E
H
 
G
Q
 
K
V
 
E
D
 
Q
V
 
I
L
 
L
A
 
D
L
 
L
V
 
V
H
 
R
R
 
K
L
 
I
S
 
K
Q
 
E
Q
 
D
R
 
N
G
 
N
L
 
L
T
 
T
V
 
V
I
 
I
A
 
S
V
 
I
L
 
T
H
 
H
D
 
D
I
 
L
N
 
E
M
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
G
Y
 
-
C
 
A
D
 
D
Y
 
Q
L
 
V
V
 
L
A
 
V
L
 
L
R
 
D
G
 
D
G
 
G
E
 
Q
M
 
L
I
 
L
A
 
D
Q
 
Q
G
 
G
T
 
K
P
 
P
A
 
E
A
 
E
L
 
I
M
 
F
-
 
P
R
 
K
S
 
V
E
 
E
T
 
M
L
 
L
E
 
K
Q
 
R
I
 
I

8bmsA Cryo-em structure of the mutant solitary ecf module 2eq in msp2n2 lipid nanodiscs in the atpase closed and atp-bound conformation (see paper)
34% identity, 89% coverage: 8:244/265 of query aligns to 1:237/278 of 8bmsA

query
sites
8bmsA
S
 
S
D
 
D
T
 
N
T
 
I
F
 
I
S
 
S
L
 
F
D
 
D
R
 
H
V
 
V
T
 
T
F
|
F
R
 
T
V
 
D
P
 
S
G
 
P
R
 
R
T
 
P
L
 
A
L
 
L
H
 
S
P
 
D
L
 
L
S
 
S
L
 
F
T
 
A
F
 
I
P
 
E
A
 
R
G
 
G
K
 
S
V
 
W
T
 
T
G
 
A
L
 
L
I
 
I
G
 
G
H
 
H
N
|
N
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
V
L
 
S
K
 
K
M
 
L
L
 
I
G
 
N
R
 
G
H
 
L
Q
 
L
P
 
A
P
 
P
S
 
D
D
 
D
G
 
L
D
 
D
-
 
K
-
 
S
-
 
S
I
 
I
L
 
T
L
 
V
D
 
D
G
 
G
Q
 
V
P
 
K
L
 
L
D
 
G
S
 
A
W
 
D
G
 
T
S
 
V
K
 
W
A
 
E
F
 
V
A
 
R
R
 
E
K
 
K
V
 
V
A
 
G
Y
 
I
L
 
V
P
 
F
Q
|
Q
Q
 
N
L
 
-
P
 
P
P
 
D
A
 
N
E
 
Q
-
 
F
-
 
V
G
 
G
M
 
A
T
 
T
V
 
V
R
 
S
E
 
D
L
 
D
V
 
V
A
 
A
I
 
-
G
 
-
R
 
-
Y
 
-
P
 
-
W
 
-
H
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
F
G
 
G
A
 
L
A
 
E
D
 
N
R
 
R
-
 
A
-
 
V
-
 
P
-
 
R
-
 
P
-
 
E
-
 
M
-
 
L
E
 
K
K
 
I
V
 
V
E
 
A
E
 
Q
A
 
A
I
 
V
A
 
A
L
 
D
V
 
V
G
 
G
L
 
M
K
 
A
P
 
D
L
x
Y
A
 
A
Q
 
D
R
 
S
L
 
E
V
 
P
D
 
S
S
x
N
L
 
L
S
|
S
G
|
G
G
|
G
E
x
Q
R
 
K
Q
 
Q
R
 
R
A
 
V
W
 
A
I
 
I
A
 
A
M
 
G
L
 
I
V
 
L
A
 
A
Q
 
V
D
 
K
S
 
P
R
 
Q
C
 
V
L
 
I
L
 
I
L
 
L
D
 
D
E
x
Q
P
 
S
T
 
T
S
 
S
A
 
M
L
 
L
D
 
D
I
 
P
A
 
E
H
 
G
Q
 
K
V
 
E
D
 
Q
V
 
I
L
 
L
A
 
D
L
 
L
V
 
V
H
 
R
R
 
K
L
 
I
S
 
K
Q
 
E
Q
 
D
R
 
N
G
 
N
L
 
L
T
 
T
V
 
V
I
 
I
A
 
S
V
 
I
L
 
T
H
|
H
D
 
D
I
 
L
N
 
E
M
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
G
Y
 
-
C
 
A
D
 
D
Y
 
Q
L
 
V
V
 
L
A
 
V
L
 
L
R
 
D
G
 
D
G
 
G
E
 
Q
M
 
L
I
 
L
A
 
D
Q
 
Q
G
 
G
T
 
K
P
 
P
A
 
E
A
 
E
L
 
I
M
 
F
-
 
P
R
 
K
S
 
V
E
 
E
T
 
M
L
 
L
E
 
K
Q
 
R
I
 
I

4fi3C Structure of vitamin b12 transporter btucd-f in a nucleotide-bound state (see paper)
34% identity, 86% coverage: 21:247/265 of query aligns to 9:231/248 of 4fi3C

query
sites
4fi3C
V
 
V
P
 
A
G
 
E
R
 
S
T
 
T
L
x
R
L
 
L
H
 
G
P
 
P
L
 
L
S
 
S
L
 
G
T
 
E
F
 
V
P
 
R
A
 
A
G
 
G
K
 
E
V
 
I
T
 
L
G
 
H
L
 
L
I
 
V
G
 
G
H
 
P
N
|
N
G
|
G
S
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
-
 
A
K
 
R
M
 
M
L
 
A
G
 
G
R
 
-
H
 
-
Q
 
M
P
 
T
P
 
S
S
 
G
D
 
K
G
 
G
D
 
S
I
 
I
L
 
Q
L
 
F
D
 
A
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
L
 
L
D
 
E
S
 
A
W
 
W
G
 
S
S
 
A
K
 
T
A
 
K
F
 
L
A
 
A
R
 
L
K
 
H
V
 
R
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
P
 
S
Q
|
Q
Q
 
Q
L
 
Q
P
 
T
P
 
P
A
 
P
E
 
F
G
 
A
M
 
T
T
 
P
V
 
V
R
 
-
E
 
-
L
 
-
V
 
-
A
 
-
I
 
-
G
 
-
R
 
-
Y
 
-
P
 
-
W
 
W
H
 
H
G
 
Y
-
 
L
A
 
T
L
 
L
G
 
H
R
 
Q
F
 
H
G
 
D
A
 
K
A
 
T
D
 
R
R
 
T
E
 
E
K
 
L
V
 
L
E
 
N
E
 
D
A
 
V
I
 
A
A
 
G
L
 
A
V
 
L
G
 
A
L
 
L
K
 
D
P
 
D
L
 
K
A
 
L
Q
 
G
R
|
R
L
 
S
V
 
T
D
 
N
S
x
Q
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
E
|
E
R
 
W
Q
 
Q
R
 
R
A
 
V
W
 
R
I
 
L
A
 
A
M
 
A
L
 
V
V
 
V
A
 
L
Q
 
Q
D
 
I
S
 
T
-
 
P
-
 
Q
-
 
A
-
 
N
-
 
P
-
 
A
-
 
G
R
 
Q
C
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
x
Q
P
 
P
T
 
M
S
 
C
A
 
S
L
 
L
D
 
D
I
 
V
A
 
A
H
 
Q
Q
 
Q
V
 
S
D
 
A
V
 
L
L
 
D
A
 
K
L
 
I
V
 
L
H
 
S
R
 
A
L
 
L
S
 
S
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
-
G
 
G
L
 
L
T
 
A
V
 
I
I
 
V
A
 
M
V
 
S
L
 
S
H
 
H
D
 
D
I
 
L
N
 
N
M
 
H
A
 
T
A
 
L
R
 
R
Y
 
H
C
 
A
D
 
H
Y
 
R
L
 
A
V
 
W
A
 
L
L
 
L
R
 
K
G
 
G
G
 
G
E
 
K
M
 
M
I
 
L
A
 
A
Q
 
S
G
 
G
T
 
R
P
 
R
A
 
E
A
 
E
L
 
V
M
 
L
R
 
T
S
 
P
E
 
P
T
 
N
L
 
L
E
 
A
Q
 
Q
I
 
A
Y
 
Y
G
 
G
I
 
M

1l7vC Bacterial abc transporter involved in b12 uptake (see paper)
34% identity, 86% coverage: 21:247/265 of query aligns to 9:231/231 of 1l7vC

query
sites
1l7vC
V
 
V
P
 
A
G
 
E
R
 
S
T
 
T
L
 
R
L
 
L
H
 
G
P
 
P
L
 
L
S
 
S
L
 
G
T
 
E
F
 
V
P
 
R
A
 
A
G
 
G
K
 
E
V
 
I
T
 
L
G
 
H
L
 
L
I
 
V
G
 
G
H
 
P
N
|
N
G
|
G
S
x
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
-
 
A
K
 
R
M
 
M
L
 
A
G
 
G
R
 
-
H
 
-
Q
 
M
P
 
T
P
 
S
S
 
G
D
 
K
G
 
G
D
 
S
I
 
I
L
 
Q
L
 
F
D
 
A
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
L
 
L
D
 
E
S
 
A
W
 
W
G
 
S
S
 
A
K
 
T
A
 
K
F
 
L
A
 
A
R
 
L
K
 
H
V
 
R
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
P
 
S
Q
 
Q
Q
 
Q
L
 
Q
P
 
T
P
 
P
A
 
P
E
 
F
G
 
A
M
 
T
T
 
P
V
 
V
R
 
-
E
 
-
L
 
-
V
 
-
A
 
-
I
 
-
G
 
-
R
 
-
Y
 
-
P
 
-
W
 
W
H
 
H
G
 
Y
-
 
L
A
 
T
L
 
L
G
 
H
R
 
Q
F
 
H
G
 
D
A
 
K
A
 
T
D
 
R
R
 
T
E
 
E
K
 
L
V
 
L
E
 
N
E
 
D
A
 
V
I
 
A
A
 
G
L
 
A
V
 
L
G
 
A
L
 
L
K
 
D
P
 
D
L
 
K
A
 
L
Q
 
G
R
 
R
L
 
S
V
 
T
D
 
N
S
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
W
Q
 
Q
R
 
R
A
 
V
W
 
R
I
 
L
A
 
A
M
 
A
L
 
V
V
 
V
A
 
L
Q
 
Q
D
 
I
S
 
T
-
 
P
-
 
Q
-
 
A
-
 
N
-
 
P
-
 
A
-
 
G
R
 
Q
C
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
M
S
 
N
A
 
S
L
 
L
D
 
D
I
 
V
A
 
A
H
 
Q
Q
 
Q
V
 
S
D
 
A
V
 
L
L
 
D
A
 
K
L
 
I
V
 
L
H
 
S
R
 
A
L
 
L
S
 
C
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
-
G
 
G
L
 
L
T
 
A
V
 
I
I
 
V
A
 
M
V
 
S
L
 
S
H
 
H
D
 
D
I
 
L
N
 
N
M
 
H
A
 
T
A
 
L
R
 
R
Y
 
H
C
 
A
D
 
H
Y
 
R
L
 
A
V
 
W
A
 
L
L
 
L
R
 
K
G
 
G
G
 
G
E
 
K
M
 
M
I
 
L
A
 
A
Q
 
S
G
 
G
T
 
R
P
 
R
A
 
E
A
 
E
L
 
V
M
 
L
R
 
T
S
 
P
E
 
P
T
 
N
L
 
L
E
 
A
Q
 
Q
I
 
A
Y
 
Y
G
 
G
I
 
M

O06967 Multidrug resistance ABC transporter ATP-binding/permease protein BmrA; EC 7.6.2.- from Bacillus subtilis (strain 168) (see 2 papers)
32% identity, 90% coverage: 3:241/265 of query aligns to 332:569/589 of O06967

query
sites
O06967
E
 
K
N
 
Q
I
 
I
P
 
E
H
 
N
S
 
A
D
 
H
T
 
L
T
 
P
F
 
I
S
 
Q
L
 
L
D
 
D
R
 
R
V
 
V
T
 
S
F
 
F
-
 
G
R
 
Y
V
 
K
P
 
P
G
 
D
R
 
Q
T
 
L
L
 
I
L
 
L
H
 
K
P
 
E
L
 
V
S
 
S
L
 
A
T
 
V
F
 
I
P
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
K
V
 
V
T
 
T
G
 
A
L
 
I
I
 
V
G
 
G
H
 
P
N
 
S
G
 
G
S
 
G
G
 
G
K
|
K
S
 
T
T
 
T
L
 
L
L
 
F
K
 
K
M
 
L
L
 
L
G
 
E
R
 
R
H
 
F
Q
 
Y
P
 
S
P
 
P
S
 
T
D
 
A
G
 
G
D
 
T
I
 
I
L
 
R
L
 
L
D
 
G
G
 
D
Q
 
E
P
 
P
L
 
V
D
 
D
S
 
T
W
 
Y
G
 
S
S
 
L
K
 
E
A
 
S
F
 
W
A
 
R
R
 
E
K
 
H
V
 
I
A
 
G
Y
 
Y
L
 
V
P
 
S
Q
 
Q
Q
 
E
L
 
S
P
 
P
P
 
L
A
 
M
E
 
S
G
 
G
M
 
-
T
 
T
V
 
I
R
 
R
E
 
E
L
 
N
V
 
I
A
 
C
I
 
-
G
 
-
R
 
-
Y
 
-
P
 
-
W
 
-
H
 
Y
G
 
G
A
 
L
L
 
E
G
 
R
R
 
D
F
 
V
G
 
T
A
 
D
A
 
A
D
 
E
R
 
I
E
 
E
K
 
K
V
 
A
E
 
A
E
 
E
-
 
M
A
 
A
I
 
Y
A
 
A
L
 
L
V
 
N
G
 
F
L
 
I
K
 
K
P
 
E
L
 
L
A
 
P
Q
 
N
R
 
Q
L
 
F
V
 
D
D
 
T
S
 
E
-
 
V
-
 
G
-
 
E
-
 
R
-
 
G
-
 
I
-
 
M
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
R
 
R
Q
 
Q
R
 
R
A
 
I
W
 
A
I
 
I
A
 
A
M
 
R
L
 
A
V
 
L
A
 
L
Q
 
R
D
 
N
S
 
P
R
 
S
C
 
I
L
 
L
L
 
M
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
S
L
 
L
D
 
D
I
 
S
A
 
Q
H
 
S
Q
 
E
V
 
K
D
 
S
V
 
V
L
 
Q
A
 
Q
L
 
A
V
 
L
H
 
E
R
 
V
L
 
L
S
 
M
Q
 
E
Q
 
G
R
 
R
G
 
-
L
 
-
T
 
T
V
 
T
I
 
I
A
 
V
V
 
I
L
 
A
H
 
H
D
 
R
I
 
L
N
 
S
M
 
T
A
 
V
A
 
V
R
 
D
Y
 
-
C
 
A
D
 
D
Y
 
Q
L
 
L
V
 
L
A
 
F
L
 
V
R
 
E
G
 
K
G
 
G
E
 
E
M
 
I
I
 
T
A
 
G
Q
 
R
G
 
G
T
 
T
P
 
H
A
 
H
A
 
E
L
 
L
M
 
M
R
 
A
S
 
S
E
 
H
T
 
G
L
 
L

4hluC Structure of the ecfa-a' heterodimer bound to adp (see paper)
32% identity, 86% coverage: 13:239/265 of query aligns to 6:223/249 of 4hluC

query
sites
4hluC
S
 
E
L
 
L
D
 
N
R
 
S
V
 
V
T
 
S
F
 
F
R
 
R
V
x
Y
P
 
N
G
 
G
R
 
D
T
 
Y
L
 
V
L
 
L
H
 
K
P
 
D
L
 
V
S
 
N
L
 
A
T
 
E
F
 
F
P
 
E
A
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
I
T
 
Y
G
 
V
L
 
V
I
 
V
G
 
G
H
 
K
N
|
N
G
|
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
L
L
 
L
K
 
K
M
 
I
L
 
L
G
 
A
R
 
G
H
 
L
Q
 
L
P
 
A
P
 
A
S
 
A
D
 
-
G
 
G
D
 
E
I
 
I
L
 
F
L
 
L
D
 
D
G
 
G
Q
 
S
P
 
P
L
 
A
D
 
D
S
 
P
W
 
F
G
 
-
S
 
-
K
 
-
A
 
L
F
 
L
A
 
R
R
 
K
K
 
N
V
 
V
A
 
G
Y
 
Y
L
 
V
P
 
F
Q
 
Q
Q
 
N
L
 
-
P
 
P
P
 
S
A
 
S
E
 
Q
-
 
I
-
 
I
G
 
G
M
 
A
T
 
T
V
 
V
R
 
E
E
 
E
L
 
D
V
 
V
A
 
A
I
 
F
G
 
S
R
 
L
Y
 
E
P
 
-
W
 
-
H
 
-
G
 
-
A
 
I
L
 
M
G
 
G
R
 
L
F
 
D
G
 
E
A
 
S
A
 
E
D
 
M
R
 
R
E
 
K
K
 
R
V
 
I
E
 
K
E
 
K
A
 
V
I
 
L
A
 
E
L
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
K
 
S
P
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
R
 
A
L
 
D
V
 
P
D
 
L
S
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
R
 
K
Q
 
Q
R
 
R
A
 
L
W
 
A
I
 
I
A
 
A
M
 
S
L
 
M
V
 
L
A
 
A
Q
 
R
D
 
D
S
 
T
R
 
R
C
 
F
L
 
L
L
 
A
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
V
S
 
S
A
 
M
L
 
L
D
 
D
I
 
P
A
 
P
H
 
S
Q
 
Q
V
 
R
D
 
E
V
 
I
L
 
F
A
 
Q
L
 
V
V
 
L
H
 
E
R
 
S
L
 
L
S
 
K
Q
 
N
Q
 
E
R
 
-
G
 
G
L
 
K
T
 
G
V
 
I
I
 
I
A
 
L
V
 
V
L
 
T
H
 
H
D
 
E
I
 
L
N
 
E
M
 
Y
A
 
L
A
 
D
R
 
D
Y
 
-
C
 
M
D
 
D
Y
 
F
L
 
I
V
 
L
A
 
H
L
 
I
R
 
S
G
 
N
G
 
G
E
 
T
M
 
I
I
 
D
A
 
F
Q
 
C
G
 
G
T
 
S
P
 
W
A
 
E
A
 
E
L
 
F
M
 
V
R
 
E
S
 
R
E
 
E

4zirB Crystal structure of ecfaa' heterodimer bound to amppnp (see paper)
32% identity, 86% coverage: 13:239/265 of query aligns to 5:219/247 of 4zirB

query
sites
4zirB
S
 
E
L
 
L
D
 
N
R
 
S
V
 
V
T
 
S
F
 
F
R
 
R
V
x
Y
P
 
N
G
 
G
R
 
D
T
 
Y
L
x
V
L
 
L
H
 
K
P
 
D
L
 
V
S
 
N
L
 
A
T
 
E
F
 
F
P
 
E
A
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
I
T
 
Y
G
 
V
L
 
V
I
 
V
G
 
G
H
 
K
N
|
N
G
|
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
L
L
 
L
K
 
K
M
 
I
L
 
L
G
 
A
R
 
G
H
 
L
Q
 
L
P
 
A
P
 
A
S
 
A
D
 
-
G
 
G
D
 
E
I
 
I
L
 
F
L
 
L
D
 
D
G
 
G
Q
 
S
P
 
P
L
 
A
D
 
D
S
 
P
W
 
F
G
 
-
S
 
-
K
 
-
A
 
L
F
 
L
A
 
R
R
 
K
K
 
N
V
 
V
A
 
G
Y
 
Y
L
 
V
P
 
F
Q
|
Q
Q
 
N
L
 
-
P
 
P
P
 
S
A
 
S
E
 
Q
-
 
I
-
 
I
G
 
G
M
 
A
T
 
T
V
 
V
R
 
E
E
 
E
L
 
D
V
 
V
A
 
A
I
 
F
G
 
-
R
 
-
Y
 
-
P
 
-
W
 
-
H
 
-
G
 
-
A
 
S
L
 
L
G
 
E
R
 
I
F
 
D
G
 
E
A
 
S
A
 
E
D
 
M
R
 
R
E
 
K
K
 
R
V
 
I
E
 
K
E
 
K
A
 
V
I
 
L
A
 
E
L
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
K
 
S
P
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
R
 
A
L
 
D
V
 
P
D
 
L
S
x
N
L
 
L
S
|
S
G
|
G
G
|
G
E
 
Q
R
 
K
Q
 
Q
R
 
R
A
 
L
W
 
A
I
 
I
A
 
A
M
 
S
L
 
M
V
 
L
A
 
A
Q
 
R
D
 
D
S
 
T
R
 
R
C
 
F
L
 
L
L
 
A
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
V
S
 
S
A
 
M
L
 
L
D
 
D
I
 
P
A
 
P
H
 
S
Q
 
Q
V
 
R
D
 
E
V
 
I
L
 
F
A
 
Q
L
 
V
V
 
L
H
 
E
R
 
S
L
 
L
S
 
K
Q
 
N
Q
 
E
R
 
-
G
 
G
L
 
K
T
 
G
V
 
I
I
 
I
A
 
L
V
 
V
L
 
T
H
 
H
D
 
E
I
 
L
N
 
E
M
 
Y
A
 
L
A
 
D
R
 
D
Y
 
-
C
 
M
D
 
D
Y
 
F
L
 
I
V
 
L
A
 
H
L
 
I
R
 
S
G
 
N
G
 
G
E
 
T
M
 
I
I
 
D
A
 
F
Q
 
C
G
 
G
T
 
S
P
 
W
A
 
E
A
 
E
L
 
F
M
 
V
R
 
E
S
 
R
E
 
E

4myhB Structure of the glutathione bound mitochondrial abc transporter, atm1 (see paper)
30% identity, 88% coverage: 3:236/265 of query aligns to 333:563/598 of 4myhB

query
sites
4myhB
E
 
E
N
 
N
I
 
V
P
 
P
H
 
Y
S
 
-
D
 
D
T
 
I
T
 
T
F
 
F
S
 
-
L
 
-
D
 
E
R
 
N
V
 
V
T
 
T
F
 
F
R
 
G
V
 
Y
-
 
H
P
 
P
G
 
D
R
 
R
T
 
K
L
 
I
L
 
L
H
 
K
P
 
N
L
 
A
S
 
S
L
 
F
T
 
T
F
 
I
P
 
P
A
 
A
G
 
G
K
 
W
V
 
K
T
 
T
G
 
A
L
 
I
I
 
V
G
 
G
H
 
S
N
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
T
L
 
I
L
 
L
K
 
K
M
 
L
L
 
V
G
 
F
R
 
R
H
 
F
Q
 
Y
P
 
D
P
 
P
S
 
E
D
 
S
G
 
G
D
 
R
I
 
I
L
 
L
L
 
I
D
 
N
G
 
G
Q
 
R
P
 
D
L
 
I
D
 
K
S
 
E
W
 
Y
G
 
D
S
 
I
K
 
D
A
 
A
F
 
L
A
 
R
R
 
K
K
 
V
V
 
I
A
 
G
Y
 
V
L
 
V
P
 
P
Q
 
Q
Q
 
D
L
 
T
P
 
P
P
 
L
A
 
F
E
 
N
G
 
D
M
 
-
T
 
T
V
 
I
R
 
W
E
 
E
L
 
N
V
 
V
A
 
K
I
 
F
G
 
G
R
 
R
Y
 
I
P
 
D
W
 
-
H
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
A
D
 
T
R
 
D
E
 
E
K
 
E
V
 
V
E
 
I
E
 
T
A
 
V
I
 
V
A
 
E
L
 
K
V
 
A
G
 
Q
L
 
L
K
 
A
P
 
P
L
 
L
A
 
I
Q
 
K
R
 
K
L
 
L
-
 
P
-
 
Q
-
 
G
V
 
F
D
 
D
S
 
T
-
 
I
-
 
V
-
 
G
-
 
E
-
 
R
-
 
G
-
 
L
-
 
M
L
 
I
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
K
Q
 
Q
R
 
R
A
 
L
W
 
A
I
 
I
A
 
A
M
 
R
L
 
V
V
 
L
A
 
L
Q
 
K
D
 
N
S
 
A
R
 
R
C
 
I
L
 
M
L
 
F
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
I
 
T
A
 
H
H
 
T
Q
 
E
V
 
Q
D
 
A
V
 
L
L
 
L
A
 
R
L
 
T
V
 
I
H
 
R
R
 
D
L
 
N
S
 
F
Q
 
T
Q
 
S
R
 
G
G
 
S
L
 
R
T
 
T
V
 
S
I
 
V
A
 
Y
V
 
I
L
 
A
H
 
H
D
 
R
I
 
L
N
 
R
M
 
T
A
 
I
A
 
A
R
 
D
Y
 
-
C
 
A
D
 
D
Y
 
K
L
 
I
V
 
I
A
 
V
L
 
L
R
 
D
G
 
N
G
 
G
E
 
R
M
 
V
I
 
R
A
 
E
Q
 
E
G
 
G
T
 
K
P
 
H
A
 
L
A
 
E
L
 
L
M
 
L

Sites not aligning to the query:

7psnA S. Cerevisiae atm1 in msp1e3d1 nanodiscs with bound amp-pnp and mg2+ (see paper)
30% identity, 88% coverage: 3:236/265 of query aligns to 339:569/585 of 7psnA

query
sites
7psnA
E
 
E
N
 
N
I
 
V
P
 
P
H
 
Y
S
 
-
D
 
D
T
 
I
T
 
T
F
 
F
S
 
-
L
 
-
D
 
E
R
 
N
V
 
V
T
 
T
F
 
F
R
 
G
V
x
Y
-
x
H
P
 
P
G
 
D
R
|
R
T
 
K
L
 
I
L
 
L
H
 
K
P
 
N
L
 
A
S
 
S
L
 
F
T
 
T
F
 
I
P
 
P
A
 
A
G
 
G
K
 
W
V
 
K
T
 
T
G
 
A
L
 
I
I
 
V
G
 
G
H
 
S
N
 
S
G
|
G
S
 
S
G
 
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
I
L
 
L
K
 
K
M
 
L
L
 
V
G
 
F
R
 
R
H
 
F
Q
 
Y
P
 
D
P
 
P
S
 
E
D
 
S
G
 
G
D
 
R
I
 
I
L
 
L
L
 
I
D
 
N
G
 
G
Q
 
R
P
 
D
L
 
I
D
 
K
S
 
E
W
 
Y
G
 
D
S
 
I
K
 
D
A
 
A
F
 
L
A
 
R
R
 
K
K
 
V
V
 
I
A
 
G
Y
 
V
L
 
V
P
 
P
Q
|
Q
Q
 
D
L
 
T
P
 
P
P
 
L
A
 
F
E
 
N
G
 
D
M
 
-
T
 
T
V
 
I
R
 
W
E
 
E
L
 
N
V
 
V
A
 
K
I
 
F
G
 
G
R
 
R
Y
 
I
P
 
D
W
 
-
H
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
A
D
 
T
R
 
D
E
 
E
K
 
E
V
 
V
E
 
I
E
 
T
A
 
V
I
 
V
A
 
E
L
 
K
V
 
A
G
 
Q
L
 
L
K
 
A
P
 
P
L
 
L
A
 
I
Q
 
K
R
 
K
L
 
L
-
 
P
-
 
Q
-
 
G
V
 
F
D
 
D
S
 
T
-
 
I
-
 
V
-
 
G
-
 
E
-
 
R
-
 
G
-
 
L
-
x
M
L
x
I
S
|
S
G
 
G
G
 
G
E
|
E
R
 
K
Q
 
Q
R
 
R
A
 
L
W
 
A
I
 
I
A
 
A
M
 
R
L
 
V
V
 
L
A
 
L
Q
 
K
D
 
N
S
 
A
R
 
R
C
 
I
L
 
M
L
 
F
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
I
 
T
A
 
H
H
 
T
Q
 
E
V
 
Q
D
 
A
V
 
L
L
 
L
A
 
R
L
 
T
V
 
I
H
 
R
R
 
D
L
 
N
S
 
F
Q
 
T
Q
 
S
R
 
G
G
 
S
L
 
R
T
 
T
V
 
S
I
 
V
A
 
Y
V
 
I
L
 
A
H
|
H
D
 
R
I
 
L
N
 
R
M
 
T
A
 
I
A
 
A
R
 
D
Y
 
-
C
 
A
D
 
D
Y
 
K
L
 
I
V
 
I
A
 
V
L
 
L
R
 
D
G
 
N
G
 
G
E
 
R
M
 
V
I
 
R
A
 
E
Q
 
E
G
 
G
T
 
K
P
 
H
A
 
L
A
 
E
L
 
L
M
 
L

Sites not aligning to the query:

7psmA S. Cerevisiae atm1 in msp1d1 nanodiscs with bound amp-pnp and mg2+ (see paper)
30% identity, 88% coverage: 3:236/265 of query aligns to 339:569/585 of 7psmA

query
sites
7psmA
E
 
E
N
 
N
I
 
V
P
 
P
H
 
Y
S
 
-
D
 
D
T
 
I
T
 
T
F
 
F
S
 
-
L
 
-
D
 
E
R
 
N
V
 
V
T
 
T
F
 
F
R
 
G
V
x
Y
-
 
H
P
 
P
G
 
D
R
|
R
T
 
K
L
 
I
L
 
L
H
 
K
P
 
N
L
 
A
S
 
S
L
 
F
T
 
T
F
 
I
P
 
P
A
 
A
G
 
G
K
 
W
V
 
K
T
 
T
G
 
A
L
 
I
I
 
V
G
 
G
H
 
S
N
x
S
G
|
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
S
 
S
T
|
T
L
 
I
L
 
L
K
 
K
M
 
L
L
 
V
G
 
F
R
 
R
H
 
F
Q
 
Y
P
 
D
P
 
P
S
 
E
D
 
S
G
 
G
D
 
R
I
 
I
L
 
L
L
 
I
D
 
N
G
 
G
Q
 
R
P
 
D
L
 
I
D
 
K
S
 
E
W
 
Y
G
 
D
S
 
I
K
 
D
A
 
A
F
 
L
A
 
R
R
 
K
K
 
V
V
 
I
A
 
G
Y
 
V
L
 
V
P
 
P
Q
|
Q
Q
 
D
L
 
T
P
 
P
P
 
L
A
 
F
E
 
N
G
 
D
M
 
-
T
 
T
V
 
I
R
 
W
E
 
E
L
 
N
V
 
V
A
 
K
I
 
F
G
 
G
R
 
R
Y
 
I
P
 
D
W
 
-
H
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
A
D
 
T
R
 
D
E
 
E
K
 
E
V
 
V
E
 
I
E
 
T
A
 
V
I
 
V
A
 
E
L
 
K
V
 
A
G
 
Q
L
 
L
K
 
A
P
 
P
L
 
L
A
 
I
Q
 
K
R
 
K
L
 
L
-
 
P
-
 
Q
-
 
G
V
 
F
D
 
D
S
 
T
-
 
I
-
 
V
-
 
G
-
 
E
-
 
R
-
 
G
-
 
L
-
x
M
L
x
I
S
|
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
K
Q
 
Q
R
 
R
A
 
L
W
 
A
I
 
I
A
 
A
M
 
R
L
 
V
V
 
L
A
 
L
Q
 
K
D
 
N
S
 
A
R
 
R
C
 
I
L
 
M
L
 
F
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
I
 
T
A
 
H
H
 
T
Q
 
E
V
 
Q
D
 
A
V
 
L
L
 
L
A
 
R
L
 
T
V
 
I
H
 
R
R
 
D
L
 
N
S
 
F
Q
 
T
Q
 
S
R
 
G
G
 
S
L
 
R
T
 
T
V
 
S
I
 
V
A
 
Y
V
 
I
L
 
A
H
 
H
D
 
R
I
 
L
N
 
R
M
 
T
A
 
I
A
 
A
R
 
D
Y
 
-
C
 
A
D
 
D
Y
 
K
L
 
I
V
 
I
A
 
V
L
 
L
R
 
D
G
 
N
G
 
G
E
 
R
M
 
V
I
 
R
A
 
E
Q
 
E
G
 
G
T
 
K
P
 
H
A
 
L
A
 
E
L
 
L
M
 
L

Sites not aligning to the query:

7pslA S. Cerevisiae atm1 in msp1d1 nanodiscs in nucleotide-free state (see paper)
30% identity, 88% coverage: 3:236/265 of query aligns to 339:569/600 of 7pslA

query
sites
7pslA
E
 
E
N
 
N
I
 
V
P
 
P
H
 
Y
S
 
-
D
 
D
T
 
I
T
 
T
F
 
F
S
 
-
L
 
-
D
 
E
R
 
N
V
 
V
T
 
T
F
 
F
R
 
G
V
 
Y
-
 
H
P
 
P
G
 
D
R
 
R
T
 
K
L
 
I
L
 
L
H
 
K
P
 
N
L
 
A
S
 
S
L
 
F
T
 
T
F
 
I
P
 
P
A
 
A
G
 
G
K
 
W
V
 
K
T
 
T
G
 
A
L
 
I
I
 
V
G
 
G
H
 
S
N
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
T
L
 
I
L
 
L
K
 
K
M
 
L
L
 
V
G
 
F
R
 
R
H
 
F
Q
 
Y
P
 
D
P
 
P
S
 
E
D
 
S
G
 
G
D
 
R
I
 
I
L
 
L
L
 
I
D
 
N
G
 
G
Q
 
R
P
 
D
L
 
I
D
 
K
S
 
E
W
 
Y
G
 
D
S
 
I
K
 
D
A
 
A
F
 
L
A
 
R
R
 
K
K
 
V
V
 
I
A
 
G
Y
 
V
L
 
V
P
 
P
Q
 
Q
Q
 
D
L
 
T
P
 
P
P
 
L
A
 
F
E
 
N
G
 
D
M
 
-
T
 
T
V
 
I
R
 
W
E
 
E
L
 
N
V
 
V
A
 
K
I
 
F
G
 
G
R
 
R
Y
 
I
P
 
D
W
 
-
H
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
A
D
 
T
R
 
D
E
 
E
K
 
E
V
 
V
E
 
I
E
 
T
A
 
V
I
 
V
A
 
E
L
 
K
V
 
A
G
 
Q
L
 
L
K
 
A
P
 
P
L
 
L
A
 
I
Q
 
K
R
 
K
L
 
L
-
 
P
-
 
Q
-
 
G
V
 
F
D
 
D
S
 
T
-
 
I
-
 
V
-
 
G
-
 
E
-
 
R
-
 
G
-
 
L
-
 
M
L
 
I
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
K
Q
 
Q
R
 
R
A
 
L
W
 
A
I
 
I
A
 
A
M
 
R
L
 
V
V
 
L
A
 
L
Q
 
K
D
 
N
S
 
A
R
 
R
C
 
I
L
 
M
L
 
F
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
I
 
T
A
 
H
H
 
T
Q
 
E
V
 
Q
D
 
A
V
 
L
L
 
L
A
 
R
L
 
T
V
 
I
H
 
R
R
 
D
L
 
N
S
 
F
Q
 
T
Q
 
S
R
 
G
G
 
S
L
 
R
T
 
T
V
 
S
I
 
V
A
 
Y
V
 
I
L
 
A
H
 
H
D
 
R
I
 
L
N
 
R
M
 
T
A
 
I
A
 
A
R
 
D
Y
 
-
C
 
A
D
 
D
Y
 
K
L
 
I
V
 
I
A
 
V
L
 
L
R
 
D
G
 
N
G
 
G
E
 
R
M
 
V
I
 
R
A
 
E
Q
 
E
G
 
G
T
 
K
P
 
H
A
 
L
A
 
E
L
 
L
M
 
L

Sites not aligning to the query:

P40416 Iron-sulfur clusters transporter ATM1, mitochondrial; EC 7.-.-.- from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast) (see 3 papers)
30% identity, 88% coverage: 3:236/265 of query aligns to 430:660/690 of P40416

query
sites
P40416
E
 
E
N
 
N
I
 
V
P
 
P
H
 
Y
S
 
-
D
 
D
T
 
I
T
 
T
F
 
F
S
 
-
L
 
-
D
 
E
R
 
N
V
 
V
T
 
T
F
 
F
R
 
G
V
 
Y
-
 
H
P
 
P
G
 
D
R
 
R
T
 
K
L
 
I
L
 
L
H
 
K
P
 
N
L
 
A
S
 
S
L
 
F
T
 
T
F
 
I
P
 
P
A
 
A
G
 
G
K
 
W
V
 
K
T
 
T
G
 
A
L
 
I
I
 
V
G
 
G
H
 
S
N
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
K
|
K
S
 
S
T
 
T
L
 
I
L
 
L
K
 
K
M
 
L
L
 
V
G
 
F
R
 
R
H
 
F
Q
 
Y
P
 
D
P
 
P
S
 
E
D
 
S
G
 
G
D
 
R
I
 
I
L
 
L
L
 
I
D
 
N
G
 
G
Q
 
R
P
 
D
L
 
I
D
 
K
S
 
E
W
 
Y
G
 
D
S
 
I
K
 
D
A
 
A
F
 
L
A
 
R
R
 
K
K
 
V
V
 
I
A
 
G
Y
 
V
L
 
V
P
 
P
Q
 
Q
Q
 
D
L
 
T
P
 
P
P
 
L
A
 
F
E
 
N
G
 
D
M
 
-
T
 
T
V
 
I
R
 
W
E
 
E
L
 
N
V
 
V
A
 
K
I
 
F
G
 
G
R
 
R
Y
 
I
P
 
D
W
 
-
H
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
A
D
 
T
R
 
D
E
 
E
K
 
E
V
 
V
E
 
I
E
 
T
A
 
V
I
 
V
A
 
E
L
 
K
V
 
A
G
 
Q
L
 
L
K
 
A
P
 
P
L
 
L
A
 
I
Q
 
K
R
 
K
L
 
L
-
 
P
-
 
Q
-
 
G
V
 
F
D
 
D
S
 
T
-
 
I
-
 
V
-
 
G
-
 
E
-
 
R
-
 
G
-
 
L
-
 
M
L
 
I
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
K
Q
 
Q
R
 
R
A
 
L
W
 
A
I
 
I
A
 
A
M
 
R
L
 
V
V
 
L
A
 
L
Q
 
K
D
 
N
S
 
A
R
 
R
C
 
I
L
 
M
L
 
F
L
 
F
D
 
D
E
|
E
P
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
I
 
T
A
 
H
H
 
T
Q
 
E
V
 
Q
D
 
A
V
 
L
L
 
L
A
 
R
L
 
T
V
 
I
H
 
R
R
 
D
L
 
N
S
 
F
Q
 
T
Q
 
S
R
 
G
G
 
S
L
 
R
T
 
T
V
 
S
I
 
V
A
 
Y
V
 
I
L
 
A
H
 
H
D
 
R
I
 
L
N
 
R
M
 
T
A
 
I
A
 
A
R
 
D
Y
 
-
C
 
A
D
 
D
Y
 
K
L
 
I
V
 
I
A
 
V
L
 
L
R
 
D
G
 
N
G
 
G
E
 
R
M
 
V
I
 
R
A
 
E
Q
 
E
G
 
G
T
 
K
P
 
H
A
 
L
A
 
E
L
 
L
M
 
L

Sites not aligning to the query:

7ow8A Cryoem structure of the abc transporter bmra e504a mutant in complex with atp-mg (see paper)
31% identity, 90% coverage: 3:241/265 of query aligns to 323:560/577 of 7ow8A

query
sites
7ow8A
E
 
K
N
 
Q
I
 
I
P
 
E
H
 
N
S
 
A
D
 
H
T
 
L
T
 
P
F
 
I
S
 
Q
L
 
L
D
 
D
R
 
R
V
 
V
T
 
S
F
 
F
-
 
G
R
x
Y
V
 
K
P
 
P
G
 
D
R
 
Q
T
 
L
L
 
I
L
 
L
H
 
K
P
 
E
L
 
V
S
 
S
L
 
A
T
 
V
F
 
I
P
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
K
V
 
V
T
 
T
G
 
A
L
 
I
I
 
V
G
 
G
H
 
P
N
x
S
G
|
G
S
 
G
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
L
L
 
F
K
 
K
M
 
L
L
 
L
G
 
E
R
 
R
H
 
F
Q
 
Y
P
 
S
P
 
P
S
 
T
D
 
A
G
 
G
D
 
T
I
 
I
L
 
R
L
 
L
D
 
G
G
 
D
Q
 
E
P
 
P
L
 
V
D
 
D
S
 
T
W
 
Y
G
 
S
S
 
L
K
 
E
A
 
S
F
 
W
A
 
R
R
 
E
K
 
H
V
 
I
A
 
G
Y
 
Y
L
 
V
P
 
S
Q
|
Q
Q
 
E
L
 
S
P
 
P
P
 
L
A
 
M
E
 
S
G
 
G
M
 
-
T
 
T
V
 
I
R
 
R
E
 
E
L
 
N
V
 
I
A
 
C
I
 
-
G
 
-
R
 
-
Y
 
-
P
 
-
W
 
-
H
 
Y
G
 
G
A
 
L
L
 
E
G
 
R
R
 
D
F
 
V
G
 
T
A
 
D
A
 
A
D
 
E
R
 
I
E
 
E
K
 
K
V
 
A
E
 
A
E
 
E
-
 
M
A
 
A
I
 
Y
A
 
A
L
 
L
V
 
N
G
 
F
L
 
I
K
 
K
P
 
E
L
 
L
A
 
P
Q
 
N
R
 
Q
L
 
F
V
 
D
D
 
T
S
 
E
-
 
V
-
 
G
-
 
E
-
 
R
-
 
G
-
x
I
-
 
M
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
E
 
Q
R
 
R
Q
 
Q
R
 
R
A
 
I
W
 
A
I
 
I
A
 
A
M
 
R
L
 
A
V
 
L
A
 
L
Q
 
R
D
 
N
S
 
P
R
 
S
C
 
I
L
 
L
L
 
M
L
 
L
D
 
D
E
 
A
P
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
S
L
 
L
D
 
D
I
 
S
A
 
Q
H
 
S
Q
 
E
V
 
K
D
 
S
V
 
V
L
 
Q
A
 
Q
L
 
A
V
 
L
H
 
E
R
 
V
L
 
L
S
 
M
Q
 
E
Q
 
G
R
 
R
G
 
-
L
 
-
T
 
T
V
 
T
I
 
I
A
 
V
V
 
I
L
 
A
H
|
H
D
 
R
I
 
L
N
 
S
M
 
T
A
 
V
A
 
V
R
 
D
Y
 
-
C
 
A
D
 
D
Y
 
Q
L
 
L
V
 
L
A
 
F
L
 
V
R
 
E
G
 
K
G
 
G
E
 
E
M
 
I
I
 
T
A
 
G
Q
 
R
G
 
G
T
 
T
P
 
H
A
 
H
A
 
E
L
 
L
M
 
M
R
 
A
S
 
S
E
 
H
T
 
G
L
 
L

Sites not aligning to the query:

7bg4A Multidrug resistance transporter bmra mutant e504a bound with atp, mg, and rhodamine 6g solved by cryo-em (see paper)
31% identity, 90% coverage: 3:241/265 of query aligns to 315:552/572 of 7bg4A

query
sites
7bg4A
E
 
K
N
 
Q
I
 
I
P
 
E
H
 
N
S
 
A
D
 
H
T
 
L
T
 
P
F
 
I
S
 
Q
L
 
L
D
 
D
R
 
R
V
 
V
T
 
S
F
 
F
-
 
G
R
x
Y
V
 
K
P
 
P
G
 
D
R
 
Q
T
 
L
L
 
I
L
 
L
H
 
K
P
 
E
L
 
V
S
 
S
L
 
A
T
 
V
F
 
I
P
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
K
V
 
V
T
 
T
G
 
A
L
 
I
I
 
V
G
 
G
H
 
P
N
x
S
G
|
G
S
x
G
G
 
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
L
L
 
F
K
 
K
M
 
L
L
 
L
G
 
E
R
 
R
H
 
F
Q
 
Y
P
 
S
P
 
P
S
 
T
D
 
A
G
 
G
D
 
T
I
 
I
L
 
R
L
 
L
D
 
G
G
 
D
Q
 
E
P
 
P
L
 
V
D
 
D
S
 
T
W
 
Y
G
 
S
S
 
L
K
 
E
A
 
S
F
 
W
A
 
R
R
 
E
K
 
H
V
 
I
A
 
G
Y
 
Y
L
 
V
P
 
S
Q
|
Q
Q
 
E
L
 
S
P
 
P
P
 
L
A
 
M
E
 
S
G
 
G
M
 
-
T
 
T
V
 
I
R
 
R
E
 
E
L
 
N
V
 
I
A
 
C
I
 
-
G
 
-
R
 
-
Y
 
-
P
 
-
W
 
-
H
 
Y
G
 
G
A
 
L
L
 
E
G
 
R
R
 
D
F
 
V
G
 
T
A
 
D
A
 
A
D
 
E
R
 
I
E
 
E
K
 
K
V
 
A
E
 
A
E
 
E
-
 
M
A
 
A
I
 
Y
A
 
A
L
 
L
V
 
N
G
 
F
L
 
I
K
 
K
P
 
E
L
 
L
A
 
P
Q
 
N
R
 
Q
L
 
F
V
 
D
D
 
T
S
 
E
-
 
V
-
 
G
-
 
E
-
 
R
-
 
G
-
x
I
-
x
M
L
 
L
S
|
S
G
|
G
G
|
G
E
 
Q
R
 
R
Q
 
Q
R
 
R
A
 
I
W
 
A
I
 
I
A
 
A
M
 
R
L
 
A
V
 
L
A
 
L
Q
 
R
D
 
N
S
 
P
R
 
S
C
 
I
L
 
L
L
 
M
L
 
L
D
 
D
E
 
A
P
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
S
L
 
L
D
 
D
I
 
S
A
 
Q
H
 
S
Q
 
E
V
 
K
D
 
S
V
 
V
L
 
Q
A
 
Q
L
 
A
V
 
L
H
 
E
R
 
V
L
 
L
S
 
M
Q
 
E
Q
 
G
R
 
R
G
 
-
L
 
-
T
 
T
V
 
T
I
 
I
A
 
V
V
 
I
L
 
A
H
 
H
D
 
R
I
 
L
N
 
S
M
 
T
A
 
V
A
 
V
R
 
D
Y
 
-
C
 
A
D
 
D
Y
 
Q
L
 
L
V
 
L
A
 
F
L
 
V
R
 
E
G
 
K
G
 
G
E
 
E
M
 
I
I
 
T
A
 
G
Q
 
R
G
 
G
T
 
T
P
 
H
A
 
H
A
 
E
L
 
L
M
 
M
R
 
A
S
 
S
E
 
H
T
 
G
L
 
L

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>BWI76_RS05130 FitnessBrowser__Koxy:BWI76_RS05130
MQENIPHSDTTFSLDRVTFRVPGRTLLHPLSLTFPAGKVTGLIGHNGSGKSTLLKMLGRH
QPPSDGDILLDGQPLDSWGSKAFARKVAYLPQQLPPAEGMTVRELVAIGRYPWHGALGRF
GAADREKVEEAIALVGLKPLAQRLVDSLSGGERQRAWIAMLVAQDSRCLLLDEPTSALDI
AHQVDVLALVHRLSQQRGLTVIAVLHDINMAARYCDYLVALRGGEMIAQGTPAALMRSET
LEQIYGIPMGILPHPAGAAPVSFVY

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory