SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing BWI76_RS05835 FitnessBrowser__Koxy:BWI76_RS05835 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 7 hits to proteins with known functional sites (download)

7wxiA Gpr domain of drosophila p5cs filament with glutamate and atpgammas (see paper)
38% identity, 99% coverage: 2:413/417 of query aligns to 2:408/430 of 7wxiA

query
sites
7wxiA
L
 
V
E
 
E
Q
 
V
M
 
M
G
 
A
I
 
E
A
 
N
A
 
A
K
 
R
A
 
T
A
 
G
S
 
S
Y
 
R
K
 
Q
L
 
M
A
 
Q
Q
 
A
L
 
L
S
 
T
S
 
P
R
 
A
E
 
Q
K
 
R
N
 
A
Q
 
S
V
 
A
L
 
V
E
 
N
K
 
T
I
 
L
A
 
A
D
 
D
Y
 
L
L
 
L
E
 
V
A
 
S
Q
 
R
T
 
E
D
 
K
A
 
F
I
 
I
L
 
L
R
 
D
A
 
A
N
 
N
A
 
A
E
 
K
D
 
D
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
A
R
 
Q
A
 
K
N
 
S
G
 
G
L
 
L
S
 
A
E
 
K
A
 
P
L
 
L
L
 
L
D
 
S
R
 
R
L
 
L
A
 
S
L
 
L
N
 
N
P
 
P
A
 
A
R
 
K
L
 
L
S
 
K
G
 
N
I
 
L
A
 
S
N
 
V
D
 
G
V
 
L
R
 
K
Q
 
Q
V
 
I
C
 
A
S
 
E
L
 
D
A
 
S
D
 
H
P
 
K
-
 
N
V
 
V
G
 
G
Q
 
R
V
 
V
I
 
L
D
 
R
G
 
R
G
 
T
L
 
R
L
 
L
D
 
A
S
 
D
G
 
Q
L
 
L
R
 
E
I
 
L
E
 
K
R
 
Q
R
 
V
R
 
T
V
 
V
P
 
P
L
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
L
G
 
L
V
 
V
I
 
I
Y
 
F
E
 
E
A
 
S
R
 
R
P
 
P
N
 
D
V
 
S
T
 
L
V
 
P
D
 
Q
V
 
V
A
 
A
S
 
A
L
 
L
C
 
A
L
 
M
K
 
A
T
 
S
G
 
A
N
 
N
A
 
G
A
 
L
I
 
L
L
 
L
R
 
K
G
 
G
G
 
G
K
 
K
E
 
E
T
 
A
W
 
A
R
 
H
T
 
S
N
 
N
A
 
K
A
 
A
T
 
L
V
 
M
K
 
E
V
 
L
I
 
V
Q
 
K
Q
 
E
A
 
A
L
 
L
Q
 
A
E
 
T
C
 
V
G
 
G
L
 
A
P
 
E
A
 
H
A
 
A
T
 
-
V
 
V
Q
 
S
A
 
L
I
 
V
E
 
S
S
 
T
P
 
-
D
 
-
R
 
R
A
 
E
L
 
E
V
 
I
G
 
S
E
 
D
M
 
L
L
 
L
K
 
S
M
 
M
D
 
E
K
 
N
Y
 
H
I
 
I
D
 
D
M
 
L
L
 
I
I
 
I
P
 
P
R
 
R
G
 
G
G
 
S
A
 
S
G
 
D
L
 
L
H
 
V
K
 
R
L
 
S
C
 
I
R
 
Q
E
 
Q
Q
 
Q
S
 
S
T
 
L
-
 
H
I
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
L
T
 
G
G
 
H
G
 
A
I
 
E
G
 
G
V
 
V
C
 
C
H
 
H
I
 
V
Y
 
Y
I
 
I
D
 
D
H
 
R
S
 
D
A
 
A
D
 
D
V
 
L
A
 
E
E
 
K
A
 
A
L
 
L
K
 
R
V
 
I
I
 
A
V
 
R
N
 
D
A
 
A
K
 
K
V
 
C
Q
 
D
R
 
Y
P
 
P
S
 
A
A
 
A
C
 
C
N
 
N
S
 
A
V
 
M
E
 
E
T
 
T
L
 
L
L
 
L
V
 
I
H
 
H
Q
 
E
D
 
D
I
 
L
A
 
M
E
 
S
-
 
G
R
 
A
F
 
I
L
 
F
P
 
G
A
 
D
L
 
V
S
 
C
K
 
N
Q
 
M
M
 
L
A
 
K
E
 
R
S
 
E
G
 
G
V
 
V
S
 
K
L
 
I
H
 
Y
A
 
A
D
 
G
A
 
P
A
 
R
S
 
L
L
 
N
P
 
Q
A
 
Q
L
 
L
Q
 
T
N
 
F
G
 
G
P
 
P
A
 
P
S
 
A
V
 
A
E
 
K
P
 
S
V
 
L
K
 
K
A
 
-
E
 
-
Q
 
-
Y
 
-
D
 
-
N
 
H
E
 
E
Y
 
Y
L
 
G
S
 
A
L
 
L
D
 
E
L
 
C
N
 
C
V
 
I
K
 
E
V
 
V
V
 
V
A
 
P
D
 
S
Q
 
L
D
 
D
E
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
N
H
 
H
I
 
I
R
 
H
E
 
T
H
 
Y
G
 
G
T
 
S
Q
 
S
H
 
H
S
 
T
D
 
D
A
 
V
I
 
I
L
 
V
T
 
T
R
 
E
T
 
N
L
 
D
G
 
A
N
 
A
A
 
A
N
 
R
R
 
Q
F
 
F
I
 
L
N
 
G
E
 
S
V
 
V
D
 
D
S
 
S
S
 
A
A
 
C
V
 
V
Y
 
F
V
 
H
N
 
N
A
 
A
S
 
S
T
 
S
R
|
R
F
 
F
T
 
A
D
|
D
G
 
G
G
 
F
Q
 
R
F
 
F
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
E
V
 
V
A
 
G
V
 
I
S
 
S
T
 
T
Q
 
A
K
 
R
L
 
I
H
 
H
A
 
A
R
 
R
G
 
G
P
 
P
M
 
V
G
 
G
L
 
V
E
 
E
A
 
G
L
 
L
T
 
L
T
 
T
Y
 
T
K
 
K
W
 
W
I
 
I
G
 
L
F
 
E
G
 
G
D
 
Q
D
 
D

7wxgA Gpr domain closed form of drosophila p5cs filament with glutamate, atp, and NADPH (see paper)
38% identity, 99% coverage: 2:413/417 of query aligns to 2:408/430 of 7wxgA

query
sites
7wxgA
L
 
V
E
 
E
Q
 
V
M
 
M
G
 
A
I
 
E
A
 
N
A
 
A
K
 
R
A
 
T
A
 
G
S
 
S
Y
 
R
K
 
Q
L
 
M
A
 
Q
Q
 
A
L
 
L
S
 
T
S
 
P
R
 
A
E
 
Q
K
 
R
N
 
A
Q
 
S
V
 
A
L
 
V
E
 
N
K
 
T
I
 
L
A
 
A
D
 
D
Y
 
L
L
 
L
E
 
V
A
 
S
Q
 
R
T
 
E
D
 
K
A
 
F
I
 
I
L
 
L
R
 
D
A
 
A
N
 
N
A
 
A
E
 
K
D
 
D
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
A
R
 
Q
A
 
K
N
 
S
G
 
G
L
 
L
S
 
A
E
 
K
A
 
P
L
 
L
L
 
L
D
 
S
R
 
R
L
 
L
A
 
S
L
 
L
N
 
N
P
 
P
A
 
A
R
 
K
L
 
L
S
 
K
G
 
N
I
 
L
A
 
S
N
 
V
D
 
G
V
 
L
R
 
K
Q
 
Q
V
 
I
C
 
A
S
 
E
L
 
D
A
 
S
D
 
H
P
 
K
-
 
N
V
 
V
G
 
G
Q
 
R
V
 
V
I
 
L
D
 
R
G
 
R
G
 
T
L
 
R
L
 
L
D
 
A
S
 
D
G
 
Q
L
 
L
R
 
E
I
 
L
E
 
K
R
 
Q
R
 
V
R
 
T
V
 
V
P
 
P
L
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
L
G
 
L
V
 
V
I
 
I
Y
 
F
E
|
E
A
 
S
R
 
R
P
 
P
N
 
D
V
 
S
T
 
L
V
 
P
D
 
Q
V
 
V
A
 
A
S
 
A
L
 
L
C
 
A
L
 
M
K
 
A
T
 
S
G
 
A
N
 
N
A
 
G
A
 
L
I
 
L
L
 
L
R
 
K
G
 
G
G
 
G
K
 
K
E
 
E
T
 
A
W
 
A
R
 
H
T
 
S
N
 
N
A
 
K
A
 
A
T
 
L
V
 
M
K
 
E
V
 
L
I
 
V
Q
 
K
Q
 
E
A
 
A
L
 
L
Q
 
A
E
 
T
C
 
V
G
 
G
L
 
A
P
 
E
A
 
H
A
 
A
T
 
-
V
 
V
Q
 
S
A
 
L
I
 
V
E
 
S
S
 
T
P
 
-
D
 
-
R
|
R
A
 
E
L
 
E
V
 
I
G
 
S
E
 
D
M
 
L
L
 
L
K
 
S
M
 
M
D
 
E
K
 
N
Y
 
H
I
 
I
D
 
D
M
 
L
L
 
I
I
 
I
P
 
P
R
 
R
G
|
G
G
x
S
A
x
S
G
 
D
L
|
L
H
 
V
K
 
R
L
 
S
C
 
I
R
 
Q
E
 
Q
Q
 
Q
S
 
S
T
 
L
-
 
H
I
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
L
T
 
G
G
 
H
G
 
A
I
 
E
G
|
G
V
 
V
C
 
C
H
 
H
I
 
V
Y
 
Y
I
 
I
D
 
D
H
 
R
S
 
D
A
 
A
D
 
D
V
 
L
A
 
E
E
 
K
A
 
A
L
 
L
K
 
R
V
 
I
I
 
A
V
 
R
N
 
D
A
 
A
K
 
K
V
 
C
Q
 
D
R
 
Y
P
 
P
S
 
A
A
 
A
C
 
C
N
 
N
S
 
A
V
 
M
E
 
E
T
 
T
L
 
L
L
 
L
V
 
I
H
 
H
Q
 
E
D
 
D
I
 
L
A
 
M
E
 
S
-
 
G
R
 
A
F
 
I
L
 
F
P
 
G
A
 
D
L
 
V
S
 
C
K
 
N
Q
 
M
M
 
L
A
 
K
E
 
R
S
 
E
G
 
G
V
 
V
S
 
K
L
 
I
H
 
Y
A
 
A
D
 
G
A
 
P
A
 
R
S
 
L
L
 
N
P
 
Q
A
 
Q
L
 
L
Q
 
T
N
 
F
G
 
G
P
 
P
A
 
P
S
 
A
V
 
A
E
 
K
P
 
S
V
 
L
K
 
K
A
 
-
E
 
-
Q
 
-
Y
 
-
D
 
-
N
 
H
E
|
E
Y
 
Y
L
 
G
S
 
A
L
 
L
D
 
E
L
 
C
N
 
C
V
 
I
K
 
E
V
 
V
V
 
V
A
 
P
D
 
S
Q
 
L
D
 
D
E
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
N
H
 
H
I
 
I
R
 
H
E
 
T
H
 
Y
G
 
G
T
 
S
Q
 
S
H
 
H
S
 
T
D
 
D
A
 
V
I
 
I
L
 
V
T
 
T
R
 
E
T
 
N
L
 
D
G
 
A
N
 
A
A
 
A
N
 
R
R
 
Q
F
 
F
I
 
L
N
 
G
E
 
S
V
 
V
D
 
D
S
 
S
S
 
A
A
 
C
V
 
V
Y
 
F
V
 
H
N
 
N
A
 
A
S
 
S
T
 
S
R
 
R
F
 
F
T
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
F
Q
 
R
F
 
F
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
E
V
 
V
A
 
G
V
 
I
S
 
S
T
 
T
Q
 
A
K
 
R
L
 
I
H
 
H
A
 
A
R
 
R
G
 
G
P
 
P
M
 
V
G
 
G
L
 
V
E
 
E
A
 
G
L
 
L
T
 
L
T
 
T
Y
 
T
K
 
K
W
 
W
I
 
I
G
 
L
F
 
E
G
 
G
D
 
Q
D
 
D

4jbeB 1.95 angstrom crystal structure of gamma-glutamyl phosphate reductase from saccharomonospora viridis.
33% identity, 95% coverage: 2:397/417 of query aligns to 8:395/412 of 4jbeB

query
sites
4jbeB
L
 
V
E
 
E
Q
 
E
M
 
C
G
 
A
I
 
R
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
S
A
 
A
S
 
A
Y
 
P
K
 
S
L
 
L
A
 
S
Q
 
G
L
 
A
S
 
P
S
 
D
R
 
T
E
 
A
K
 
I
N
 
D
Q
 
A
V
 
A
L
 
L
E
 
E
K
 
S
I
 
M
A
 
A
D
 
D
Y
 
R
L
 
L
E
 
L
A
 
A
Q
 
H
T
 
R
D
 
D
A
 
A
I
 
V
L
 
L
R
 
A
A
 
A
N
 
N
A
 
A
E
 
E
D
 
D
L
 
I
A
 
A
E
 
K
A
 
A
R
 
E
A
 
A
N
 
G
G
 
G
L
 
M
S
 
S
E
 
A
A
 
G
L
 
L
L
 
L
D
 
D
R
 
R
L
 
L
A
 
T
L
 
I
N
 
T
P
 
E
A
 
S
R
 
R
L
 
L
S
 
T
G
 
D
I
 
M
A
 
A
N
 
D
D
 
Q
V
 
L
R
 
R
Q
 
L
V
 
L
C
 
A
S
 
G
L
 
A
A
 
P
D
 
H
P
 
P
V
 
-
G
 
Q
Q
 
R
V
 
T
I
 
V
D
 
E
G
 
L
G
 
S
L
 
T
L
 
L
D
 
D
S
 
G
G
 
G
L
 
L
R
 
R
I
 
L
E
 
V
R
 
E
R
 
R
R
 
R
V
 
R
P
 
P
L
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
I
G
 
G
V
 
A
I
 
N
Y
 
Y
E
 
E
A
 
A
R
 
R
P
 
P
N
 
N
V
 
V
T
 
T
V
 
V
D
 
D
V
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
Q
C
 
L
L
 
V
K
 
K
T
 
S
G
 
R
N
 
N
A
 
A
A
 
G
I
 
V
L
 
L
R
 
R
G
 
T
G
 
G
K
 
S
E
 
A
T
 
A
W
 
L
R
 
K
T
 
S
N
 
A
A
 
Q
A
 
R
T
 
L
V
 
L
K
 
E
-
 
V
V
 
V
I
 
I
Q
 
R
Q
 
P
A
 
A
L
 
L
Q
 
T
E
 
D
C
 
S
G
 
G
L
 
I
P
 
D
A
 
A
A
 
N
T
 
V
V
 
V
Q
 
Q
A
 
L
I
 
V
E
 
P
S
 
R
P
 
P
D
 
E
R
 
R
A
 
E
L
 
A
V
 
A
G
 
G
E
 
A
M
 
L
L
 
V
K
 
R
M
 
L
D
 
P
K
 
D
Y
 
L
I
 
V
D
 
P
M
 
L
L
 
V
I
 
I
P
 
L
R
 
R
G
 
G
-
 
S
G
 
G
A
 
E
G
 
S
L
 
T
H
 
R
K
 
A
L
 
L
C
 
A
R
 
L
E
 
E
-
 
A
-
 
A
Q
 
Q
S
 
H
T
 
G
I
 
V
P
 
R
V
 
T
I
 
L
T
 
A
G
 
H
G
 
A
I
 
D
G
 
G
V
 
G
C
 
G
H
 
V
I
 
L
Y
 
Y
I
 
V
D
 
D
H
 
E
S
 
K
A
 
A
D
|
D
V
 
R
A
x
D
E
 
T
A
 
V
L
 
R
K
 
S
V
 
L
I
 
V
V
 
V
N
 
N
A
 
S
K
 
-
V
 
L
Q
 
D
R
 
R
P
 
L
S
 
G
A
 
V
C
 
C
N
 
N
S
 
R
V
 
L
E
 
N
T
 
L
L
 
L
L
 
L
V
 
I
H
 
H
Q
 
D
D
x
A
I
 
V
A
 
Y
E
 
E
R
x
E
F
 
F
L
 
W
P
 
P
A
 
V
L
 
V
S
 
S
K
x
E
Q
 
A
M
 
L
A
 
A
E
|
E
S
 
R
G
 
G
V
 
V
S
 
S
L
 
-
H
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
P
S
 
S
L
 
L
P
 
P
A
 
P
L
 
Y
Q
 
D
N
 
H
G
 
-
P
 
-
A
 
-
S
 
-
V
 
-
E
 
-
P
 
P
V
 
I
K
 
G
A
 
Y
E
 
E
Q
 
W
Y
 
A
D
 
L
N
 
D
E
 
S
Y
 
E
L
 
R
S
 
E
L
 
A
D
 
T
L
 
V
N
 
T
V
 
V
K
 
A
V
 
R
V
 
V
A
 
D
D
 
G
Q
 
V
D
 
A
E
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
R
H
 
I
I
 
A
R
 
N
E
 
E
H
 
E
G
 
T
T
 
S
Q
 
G
H
 
L
S
 
A
D
 
A
A
 
G
I
 
I
L
 
A
T
 
T
R
 
E
T
 
D
L
 
A
G
 
R
N
 
A
A
 
A
N
 
E
R
 
E
F
 
F
I
 
F
N
 
D
E
 
G
V
 
Y
D
 
Q
S
 
G
S
 
T
A
 
G
V
 
V
Y
 
F
V
 
W
N
 
N
A
 
A
S
 
P
T
 
T
R
 
R
F
 
L
T
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
F
Q
 
K
F
 
L
G
 
L
L
 
G
G
 
V
A
 
P
E
 
E
V
 
T
A
 
G
V
 
I
S
 
N
T
 
L
Q
 
D
K
 
K
L
 
V
H
 
P
A
 
G
-
 
P
R
 
R
G
 
G
P
 
P
M
 
V

5j7iC Crystal structure of a geobacillus thermoglucosidasius acetylating aldehyde dehydrogenase in complex with adp (see paper)
27% identity, 61% coverage: 26:278/417 of query aligns to 9:276/455 of 5j7iC

query
sites
5j7iC
Q
 
Q
V
 
S
L
 
I
E
 
Q
K
 
E
I
 
V
A
 
R
D
 
N
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
K
-
 
A
A
 
A
Q
 
Q
T
 
K
-
 
I
-
 
L
D
 
E
A
 
K
I
 
M
L
 
T
R
 
Q
A
 
S
N
 
E
A
 
I
E
 
D
D
 
K
L
 
I
A
 
V
E
 
E
A
 
S
R
 
M
A
 
A
N
 
N
G
 
A
L
 
A
S
 
R
E
 
E
A
 
E
L
 
A
L
 
-
D
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
A
L
 
A
N
 
M
P
 
A
A
 
V
R
 
E
L
 
E
S
 
T
G
 
G
I
 
F
A
 
G
N
 
N
-
 
V
-
 
E
-
 
D
-
 
K
D
 
T
V
 
L
R
 
K
Q
 
N
V
 
L
C
 
F
S
 
A
L
 
A
A
 
N
D
 
D
P
 
V
V
 
Y
G
 
N
Q
 
S
V
 
I
I
 
K
D
 
D
G
 
V
G
 
K
L
 
T
L
 
V
D
 
G
S
 
I
G
 
I
L
 
R
R
 
R
I
 
D
E
 
E
R
 
E
R
 
N
R
 
R
V
 
V
-
 
W
-
 
E
-
 
I
-
 
A
-
 
Q
P
 
P
L
 
V
G
 
G
V
 
I
V
 
V
-
 
A
G
 
G
V
 
I
I
 
I
Y
 
P
E
 
S
A
 
T
R
 
N
P
 
P
N
 
T
V
 
S
T
 
T
V
 
V
D
 
I
V
 
F
A
 
K
S
 
A
L
 
L
-
 
I
C
 
A
L
 
V
K
 
K
T
 
A
G
 
R
N
 
N
A
 
A
A
 
I
I
 
V
L
 
F
R
 
S
G
 
P
G
x
H
K
x
P
E
 
S
T
 
A
W
 
A
R
 
K
T
 
C
N
 
T
A
 
A
A
 
E
T
 
A
V
 
A
K
 
R
V
 
I
I
 
M
Q
 
Q
Q
 
E
A
 
A
L
 
A
Q
 
E
E
 
R
C
 
A
G
 
G
L
 
A
P
 
P
A
 
K
A
 
G
T
 
L
V
 
I
Q
 
S
A
 
C
I
 
I
E
 
T
S
 
Q
P
 
P
D
 
T
R
 
M
A
 
A
L
 
A
V
 
T
G
 
N
E
 
E
M
 
L
L
 
M
K
 
K
M
 
-
D
 
H
K
 
K
Y
 
L
I
 
T
D
 
D
M
 
V
L
 
I
I
 
L
P
 
A
R
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
P
G
 
G
L
|
L
H
 
V
K
 
K
L
 
A
C
 
A
R
 
Y
E
 
-
Q
 
S
S
 
S
T
 
G
I
 
K
P
 
P
V
 
A
I
 
Y
T
 
G
G
 
V
G
 
G
I
 
P
G
 
G
V
 
N
C
 
V
H
 
P
I
 
V
Y
 
Y
I
 
I
D
 
H
H
 
E
S
 
S
A
 
A
D
 
N
V
 
I
A
 
A
E
 
K
A
 
A
L
 
V
K
 
Q
V
 
L
I
 
I
V
 
I
N
 
Q
A
 
S
K
 
K
-
 
T
V
 
F
Q
 
D
R
 
Y
P
 
G
S
 
T
A
 
I
C
 
C
N
 
A
S
 
S
V
 
E
E
 
Q
T
 
A
L
 
L
L
 
L
V
 
V
H
 
D
Q
 
E
D
 
S
I
 
I
A
 
K
E
 
E
R
 
K
F
 
V
L
 
V
P
 
A
A
 
E
L
 
L
S
 
K
K
 
Q
Q
 
Q
M
 
G
A
 
A

5j7iB Crystal structure of a geobacillus thermoglucosidasius acetylating aldehyde dehydrogenase in complex with adp (see paper)
27% identity, 61% coverage: 26:278/417 of query aligns to 10:277/456 of 5j7iB

query
sites
5j7iB
Q
 
Q
V
 
S
L
 
I
E
 
Q
K
 
E
I
 
V
A
 
R
D
 
N
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
K
-
 
A
A
 
A
Q
 
Q
T
 
K
-
 
I
-
 
L
D
 
E
A
 
K
I
 
M
L
 
T
R
 
Q
A
 
S
N
 
E
A
 
I
E
 
D
D
 
K
L
 
I
A
 
V
E
 
E
A
 
S
R
 
M
A
 
A
N
 
N
G
 
A
L
 
A
S
 
R
E
 
E
A
 
E
L
 
A
L
 
-
D
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
A
L
 
A
N
 
M
P
 
A
A
 
V
R
 
E
L
 
E
S
 
T
G
 
G
I
 
F
A
 
G
N
 
N
-
 
V
-
 
E
-
 
D
-
 
K
D
 
T
V
 
L
R
 
K
Q
 
N
V
 
L
C
 
F
S
 
A
L
 
A
A
 
N
D
 
D
P
 
V
V
 
Y
G
 
N
Q
 
S
V
 
I
I
 
K
D
 
D
G
 
V
G
 
K
L
 
T
L
 
V
D
 
G
S
 
I
G
 
I
L
 
R
R
 
R
I
 
D
E
 
E
R
 
E
R
 
N
R
 
R
V
 
V
-
 
W
-
 
E
-
 
I
-
 
A
-
 
Q
P
 
P
L
 
V
G
 
G
V
 
I
V
 
V
-
 
A
G
 
G
V
 
I
I
 
I
Y
 
P
E
 
S
A
 
T
R
 
N
P
 
P
N
 
T
V
 
S
T
 
T
V
 
V
D
 
I
V
 
F
A
 
K
S
 
A
L
 
L
-
 
I
C
 
A
L
 
V
K
 
K
T
 
A
G
 
R
N
 
N
A
 
A
A
 
I
I
 
V
L
 
F
R
 
S
G
 
P
G
 
H
K
 
P
E
 
S
T
 
A
W
 
A
R
 
K
T
 
C
N
 
T
A
 
A
A
 
E
T
 
A
V
 
A
K
 
R
V
 
I
I
 
M
Q
 
Q
Q
 
E
A
 
A
L
 
A
Q
 
E
E
 
R
C
 
A
G
 
G
L
 
A
P
 
P
A
 
K
A
 
G
T
 
L
V
 
I
Q
 
S
A
 
C
I
 
I
E
 
T
S
 
Q
P
 
P
D
 
T
R
 
M
A
 
A
L
 
A
V
 
T
G
 
N
E
 
E
M
 
L
L
 
M
K
 
K
M
 
-
D
 
H
K
 
K
Y
 
L
I
 
T
D
 
D
M
 
V
L
 
I
I
 
L
P
 
A
R
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
P
G
 
G
L
|
L
H
 
V
K
 
K
L
 
A
C
 
A
R
 
Y
E
 
-
Q
 
S
S
 
S
T
 
G
I
 
K
P
 
P
V
 
A
I
 
Y
T
 
G
G
 
V
G
 
G
I
 
P
G
 
G
V
 
N
C
 
V
H
 
P
I
 
V
Y
 
Y
I
 
I
D
 
H
H
 
E
S
 
S
A
 
A
D
 
N
V
 
I
A
 
A
E
 
K
A
 
A
L
 
V
K
 
Q
V
 
L
I
 
I
V
 
I
N
 
Q
A
 
S
K
 
K
-
 
T
V
 
F
Q
 
D
R
 
Y
P
 
G
S
 
T
A
 
I
C
 
C
N
 
A
S
 
S
V
 
E
E
 
Q
T
 
A
L
 
L
L
 
L
V
 
V
H
 
D
Q
 
E
D
 
S
I
 
I
A
 
K
E
 
E
R
 
K
F
 
V
L
 
V
P
 
A
A
 
E
L
 
L
S
 
K
K
 
Q
Q
 
Q
M
 
G
A
 
A

Sites not aligning to the query:

8uhwB The structure of the clostridium thermocellum adhe spirosome
27% identity, 41% coverage: 100:269/417 of query aligns to 90:262/859 of 8uhwB

query
sites
8uhwB
D
 
D
S
 
P
G
 
A
L
 
F
R
 
G
I
 
I
E
 
K
R
 
K
R
 
I
R
 
A
V
 
E
P
 
P
L
 
L
G
 
G
V
 
V
V
 
I
G
 
A
-
 
A
V
 
V
I
 
I
Y
 
P
E
 
T
A
 
T
R
 
N
P
 
P
N
 
T
V
 
S
T
 
T
V
 
A
D
 
I
V
 
F
A
 
K
S
 
T
L
 
L
-
 
I
C
 
A
L
 
L
K
 
K
T
 
T
G
 
R
N
 
N
A
 
A
A
 
I
I
 
I
L
 
I
R
 
S
G
 
P
G
 
H
K
 
P
E
 
R
T
 
A
W
 
K
R
 
N
T
 
S
N
 
T
A
 
I
A
 
E
T
 
A
V
 
A
K
 
K
V
 
I
I
 
V
Q
 
L
Q
 
E
A
 
A
L
 
A
Q
 
V
E
 
K
C
 
A
G
 
G
L
 
A
P
 
P
A
 
E
A
 
G
T
 
I
V
 
I
Q
 
G
A
 
W
I
 
I
E
 
D
S
 
V
P
 
P
D
 
S
R
 
L
A
 
E
L
 
L
V
 
T
G
 
N
E
 
L
M
 
V
L
 
M
K
 
R
M
 
E
D
 
-
K
 
-
Y
 
-
I
 
A
D
 
D
M
 
V
L
 
I
I
 
L
P
 
A
R
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
P
G
 
G
L
 
L
H
 
V
K
 
K
L
 
A
C
 
A
R
 
Y
E
 
-
Q
 
S
S
 
S
T
 
G
I
 
K
P
 
P
V
 
A
I
 
I
T
 
G
G
 
V
G
 
G
I
 
A
G
 
G
V
 
N
C
 
T
H
 
P
I
 
A
Y
 
I
I
 
I
D
 
D
H
 
D
S
 
S
A
 
A
D
 
D
V
 
I
A
 
V
E
 
L
A
 
A
L
 
V
K
 
N
V
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
H
A
 
S
K
 
K
-
 
T
V
 
F
Q
 
D
R
 
N
P
 
G
S
 
M
A
 
I
C
 
C
N
 
A
S
 
S
V
 
E
E
 
Q
T
 
S
L
 
V
L
 
I
-
 
V
-
 
L
-
 
D
-
 
G
V
 
V
H
 
Y
Q
 
K
D
 
E
I
 
V
A
 
K
E
 
K
R
 
E
F
 
F

Sites not aligning to the query:

5izdA Wild-type glyceraldehyde dehydrogenase from thermoplasma acidophilum in complex with NADP
20% identity, 65% coverage: 8:278/417 of query aligns to 48:309/494 of 5izdA

query
sites
5izdA
A
 
A
A
 
A
K
 
E
A
 
D
A
 
A
S
 
F
Y
 
W
K
 
A
L
 
W
A
 
N
Q
 
D
L
 
L
S
 
G
S
 
S
R
 
V
E
 
E
K
 
R
N
 
S
Q
 
K
V
 
I
L
 
I
E
 
Y
K
 
R
I
 
A
A
 
K
D
 
E
Y
 
L
L
 
I
E
 
E
A
 
K
Q
 
N
-
 
R
-
 
A
-
 
E
-
 
L
T
 
E
D
 
N
A
 
I
I
 
I
L
 
M
R
 
E
A
 
E
N
 
N
A
 
G
E
 
K
D
 
P
L
 
V
A
 
K
E
 
E
A
 
A
R
 
K
A
 
E
N
 
-
G
 
-
L
 
-
S
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
-
D
 
-
R
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
-
N
 
-
P
 
-
A
 
-
R
 
E
L
 
V
S
 
D
G
 
G
I
 
V
A
 
I
N
 
D
D
 
Q
V
 
I
R
 
Q
Q
 
Y
V
 
Y
C
 
A
S
 
E
L
 
W
A
 
A
D
 
R
P
 
K
V
 
L
-
 
N
G
 
G
Q
 
E
V
 
V
I
 
V
D
 
E
G
 
G
G
 
-
L
 
-
L
 
T
D
 
S
S
 
S
G
 
H
L
 
R
R
 
K
I
 
I
E
 
F
R
 
Q
R
 
Y
R
 
K
V
 
V
P
 
P
L
 
Y
G
 
G
V
 
I
V
 
V
G
 
V
V
 
A
I
x
L
-
x
T
-
 
P
Y
x
W
E
x
N
A
 
F
R
 
P
P
 
A
N
 
G
V
 
M
T
 
V
V
 
A
D
 
R
V
 
K
A
 
L
S
 
A
L
 
P
C
 
A
L
 
L
K
 
L
T
 
T
G
 
G
N
 
N
A
 
T
A
 
V
I
 
V
L
 
L
R
x
K
G
x
P
G
x
S
K
x
S
E
 
D
T
 
T
W
 
-
R
 
-
T
 
-
N
 
-
A
 
P
A
 
G
T
 
S
V
 
A
K
 
E
V
 
W
I
 
I
Q
 
V
Q
 
R
A
 
K
L
 
F
Q
 
V
E
 
E
C
 
A
G
 
G
L
 
V
P
 
P
A
 
K
A
 
G
T
 
V
V
 
L
Q
 
N
A
 
F
I
 
I
E
 
-
S
 
T
P
 
G
D
x
R
R
x
G
A
 
S
L
 
E
V
 
I
G
|
G
E
x
D
M
 
Y
L
 
I
K
 
V
M
 
E
D
 
H
K
 
K
Y
 
K
I
 
V
D
 
N
M
 
L
L
 
I
I
 
T
P
 
M
R
 
T
G
|
G
G
x
S
A
 
T
G
 
A
-
x
T
-
 
G
-
 
Q
-
 
R
-
 
I
L
 
M
H
 
Q
K
 
K
L
 
A
C
 
S
R
 
A
E
 
N
Q
 
M
S
 
A
T
 
K
I
 
L
P
 
I
V
 
L
I
x
E
T
 
L
G
 
G
G
 
G
I
 
K
G
 
A
V
 
P
C
 
F
H
 
M
I
 
V
Y
 
W
I
 
K
D
 
D
H
 
-
S
 
-
A
 
A
D
 
D
V
 
M
A
 
D
E
 
N
A
 
A
L
 
L
K
 
K
V
 
T
I
 
L
V
 
L
N
 
W
A
 
A
K
 
K
V
 
Y
Q
 
W
R
 
N
P
 
A
S
 
G
-
 
Q
A
 
S
C
|
C
N
 
I
S
 
A
V
 
A
E
 
E
T
 
R
L
 
L
L
 
Y
V
 
V
H
 
H
Q
 
E
D
 
D
I
 
I
A
 
Y
E
 
D
R
 
T
F
 
F
L
 
M
P
 
S
-
 
R
-
 
F
-
 
V
A
 
E
L
 
L
S
 
S
K
 
R
Q
 
K
M
 
L
A
 
A

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>BWI76_RS05835 FitnessBrowser__Koxy:BWI76_RS05835
MLEQMGIAAKAASYKLAQLSSREKNQVLEKIADYLEAQTDAILRANAEDLAEARANGLSE
ALLDRLALNPARLSGIANDVRQVCSLADPVGQVIDGGLLDSGLRIERRRVPLGVVGVIYE
ARPNVTVDVASLCLKTGNAAILRGGKETWRTNAATVKVIQQALQECGLPAATVQAIESPD
RALVGEMLKMDKYIDMLIPRGGAGLHKLCREQSTIPVITGGIGVCHIYIDHSADVAEALK
VIVNAKVQRPSACNSVETLLVHQDIAERFLPALSKQMAESGVSLHADAASLPALQNGPAS
VEPVKAEQYDNEYLSLDLNVKVVADQDEAVAHIREHGTQHSDAILTRTLGNANRFINEVD
SSAVYVNASTRFTDGGQFGLGAEVAVSTQKLHARGPMGLEALTTYKWIGFGDDTIRA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory