SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing BWI76_RS06250 FitnessBrowser__Koxy:BWI76_RS06250 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

Q60053 Neopullulanase 1; Alpha-amylase I; TVA I; EC 3.2.1.135 from Thermoactinomyces vulgaris (see paper)
32% identity, 95% coverage: 10:586/605 of query aligns to 52:634/666 of Q60053

query
sites
Q60053
A
 
A
P
 
P
F
 
E
I
 
P
K
 
T
E
 
S
Q
 
T
Q
 
Q
E
 
S
R
 
V
L
 
T
M
 
L
I
 
K
T
 
L
L
 
R
W
 
T
L
 
F
S
 
K
G
 
G
D
|
D
D
 
I
L
 
T
P
 
S
P
 
A
R
 
N
V
 
I
T
 
K
L
 
Y
R
 
W
A
 
D
E
 
T
E
 
A
D
 
D
N
 
N
E
 
A
E
 
F
L
 
H
S
 
W
L
 
V
P
 
P
M
 
M
H
 
V
R
 
W
L
 
D
R
 
S
Q
 
N
A
 
D
P
 
P
H
 
T
P
 
G
G
 
T
V
 
F
V
 
D
A
 
Y
W
 
W
R
 
K
G
 
G
E
 
T
I
 
I
N
 
P
L
 
-
V
 
-
N
 
-
G
 
A
Q
 
S
P
 
P
R
 
S
-
 
I
R
 
K
R
 
Y
Y
 
Y
S
 
R
F
 
F
K
 
Q
L
 
I
L
 
N
W
x
D
A
 
G
D
 
T
R
 
S
Q
 
T
L
 
A
W
 
W
F
 
Y
T
 
N
P
 
G
Q
 
N
G
 
G
F
 
-
N
 
-
R
 
-
F
 
-
P
 
-
P
 
P
A
 
S
R
 
S
L
 
T
E
 
E
Q
 
P
F
 
N
A
 
A
V
 
D
D
 
D
-
 
F
-
 
Y
-
 
I
L
 
I
P
 
P
D
 
N
-
 
F
S
 
K
G
 
T
P
 
P
Q
 
D
W
 
W
V
 
L
A
 
K
D
 
N
Q
 
G
V
 
V
F
 
M
Y
 
Y
Q
 
Q
I
 
I
F
 
F
P
 
P
D
 
D
R
 
R
F
 
F
A
 
Y
R
x
N
S
 
G
Q
x
D
S
 
S
R
 
S
E
x
N
A
x
D
E
 
V
Q
 
Q
D
 
T
A
 
G
T
 
S
Y
 
Y
Y
 
T
H
 
Y
H
 
N
A
 
-
A
 
-
G
 
G
H
 
T
D
 
P
I
 
T
V
 
E
R
 
K
K
 
K
A
 
A
W
 
W
D
 
G
E
 
S
P
 
S
L
 
V
T
 
Y
A
 
A
E
 
D
A
 
P
G
 
G
-
 
Y
-
 
D
-
 
N
G
 
S
S
 
L
T
 
V
F
 
F
Y
 
F
G
|
G
G
 
G
D
|
D
L
 
L
D
 
A
G
 
G
I
 
I
S
 
D
E
 
Q
K
 
K
L
 
L
P
 
G
Y
 
Y
L
 
I
K
 
K
Q
 
K
-
 
T
L
 
L
G
 
G
V
 
A
T
 
N
A
 
I
L
 
L
Y
 
Y
L
 
L
N
 
N
P
 
P
V
 
I
F
 
F
V
 
K
A
 
A
P
 
P
S
 
T
V
 
N
H
 
H
K
 
K
Y
 
Y
D
 
D
T
 
T
E
 
Q
D
 
D
Y
 
Y
R
 
M
R
 
A
V
 
V
D
 
D
P
 
P
Q
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
D
D
 
N
A
 
S
A
 
T
L
 
L
L
 
Q
R
 
T
L
 
L
R
 
I
H
 
N
N
 
D
T
 
I
Q
 
H
K
 
S
E
 
T
G
 
A
M
 
N
-
 
G
-
 
P
-
 
K
-
 
G
R
 
Y
L
 
L
I
 
I
L
 
L
D
 
D
G
 
G
V
 
V
F
 
F
N
 
N
H
 
H
S
 
T
G
 
G
D
 
D
S
 
S
H
 
H
A
 
P
W
 
W
F
 
F
D
|
D
R
 
K
H
 
Y
Q
 
N
R
x
N
-
x
F
G
 
S
S
|
S
G
 
Q
G
 
G
A
 
A
C
 
Y
H
x
E
N
 
S
A
 
Q
D
 
S
S
 
S
P
 
P
W
 
W
R
 
Y
D
 
N
W
 
Y
Y
 
Y
N
 
T
F
 
F
S
 
Y
-
 
T
-
 
W
P
 
P
E
 
D
G
 
S
V
 
Y
A
 
A
H
 
-
D
 
S
W
 
F
L
 
L
G
 
G
Y
 
F
A
 
N
S
 
S
L
 
L
P
 
P
K
 
K
L
 
L
D
 
N
Y
 
Y
-
 
G
-
 
N
R
 
S
S
 
G
S
 
S
T
 
A
L
 
V
I
 
R
D
 
G
E
 
V
I
 
I
Y
 
Y
G
 
N
G
 
N
E
 
S
D
 
N
S
 
S
V
 
V
V
 
A
R
 
K
H
 
T
W
 
Y
L
 
L
K
 
N
A
 
P
P
 
P
W
 
Y
S
 
S
M
 
V
D
 
D
G
 
G
W
 
W
R
 
R
L
 
L
D
 
D
V
 
A
V
 
A
H
 
Q
M
 
Y
L
 
V
-
 
D
-
 
A
-
 
N
G
 
G
E
 
N
G
 
N
G
 
G
G
 
S
A
 
D
R
 
V
N
 
T
N
 
N
L
 
H
R
 
Q
H
 
I
I
 
W
A
 
S
G
 
E
I
 
F
T
 
R
Q
 
N
A
 
A
A
 
V
K
 
K
L
 
G
E
 
V
R
 
N
P
 
S
D
 
N
A
 
A
F
 
A
V
 
I
F
 
I
G
 
G
E
 
E
H
 
Y
F
 
W
G
 
G
D
 
N
A
 
A
R
 
N
Q
 
P
W
 
W
L
 
T
-
 
A
Q
 
Q
A
 
G
D
 
N
V
 
Q
E
 
W
D
 
D
S
 
A
A
 
A
M
 
T
N
 
N
Y
 
F
R
 
D
G
 
G
F
 
F
T
 
T
F
 
Q
P
 
P
L
 
V
W
 
S
G
 
E
F
 
W
L
 
I
A
 
T
N
 
G
T
 
K
D
 
D
I
 
Y
S
 
Q
Y
 
N
D
 
N
P
 
S
Q
 
A
K
 
S
I
 
I
D
 
S
A
 
T
Q
 
T
T
 
Q
C
 
F
M
 
D
A
 
S
W
 
W
M
 
L
D
 
R
N
 
G
Y
 
T
R
 
R
A
 
A
G
 
N
L
 
Y
S
 
P
H
 
T
Q
 
N
Q
 
V
Q
 
Q
L
 
Q
R
 
S
M
 
M
F
 
M
N
 
N
Q
 
F
L
 
L
D
 
S
S
 
N
H
 
H
D
 
D
T
 
I
A
 
T
R
 
R
F
 
F
K
 
A
S
 
T
L
 
R
L
 
S
G
 
G
K
 
G
D
 
D
V
 
L
A
 
W
R
 
K
L
 
T
P
 
Y
L
 
L
A
 
A
V
 
L
V
 
I
W
 
F
L
 
Q
F
 
M
S
 
T
W
 
Y
P
 
V
G
 
G
V
 
T
P
 
P
C
 
T
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
D
 
D
E
 
E
V
 
Y
G
 
G
V
 
M
D
 
Q
G
 
G
N
 
G
N
 
A
D
 
D
P
 
P
F
 
D
C
 
N
R
 
R
K
 
R
P
 
S
F
 
F
P
 
D
W
 
W
D
 
S
P
 
Q
A
 
A
L
 
T
Q
 
P
D
 
S
G
 
N
D
 
S
L
 
A
L
 
V
D
 
A
L
 
L
Y
 
T
K
 
Q
R
 
K
M
 
L
S
 
I
K
 
T
L
 
I
R
 
R
K
 
N
A
 
Q
H
 
Y
Q
 
P
A
 
A
L
 
L
R
 
R
Y
 
T
G
 
G
G
 
S
C
 
F
Q
 
M
V
 
T
I
 
L
Y
 
I
A
 
T
E
 
D
D
 
D
N
 
T
-
 
N
-
 
K
V
 
I
V
 
Y
V
 
S
F
 
Y
V
 
G
R
 
R
V
 
F
Y
 
D
K
 
N
Q
 
V
Q
 
N
R
 
R
V
 
I
L
 
A
V
 
V
A
 
V
I
 
L
N
 
N
R
 
N
G
 
D
E
 
S
A
 
V
C
 
S
E
 
H
V
 
T
V
 
V
I
 
-
E
 
-
D
 
-
S
 
-
P
 
-
L
 
-
L
 
-
D
 
N
V
 
V
N
 
P
G
 
V
W
 
W
Q
 
Q
L
 
L
K
 
S
E
 
M
G
 
P
A
 
N
G
 
G
A
 
S

Sites not aligning to the query:

1uh3A Thermoactinomyces vulgaris r-47 alpha-amylase/acarbose complex (see paper)
32% identity, 95% coverage: 10:586/605 of query aligns to 23:605/637 of 1uh3A

query
sites
1uh3A
A
 
A
P
 
P
F
 
E
I
 
P
K
 
T
E
 
S
Q
 
T
Q
 
Q
E
 
S
R
 
V
L
 
T
M
 
L
I
 
K
T
 
L
L
 
R
W
 
T
L
 
F
S
x
K
G
|
G
D
|
D
D
x
I
L
x
T
P
 
S
P
 
A
R
 
N
V
 
I
T
 
K
L
 
Y
R
x
W
A
 
D
E
 
T
E
 
A
D
 
D
N
 
N
E
 
A
E
x
F
L
 
H
S
 
W
L
 
V
P
 
P
M
 
M
H
 
V
R
x
W
L
 
D
R
 
S
Q
x
N
A
 
D
P
 
P
H
 
T
P
 
G
G
 
T
V
 
F
V
x
D
A
 
Y
W
|
W
R
 
K
G
 
G
E
 
T
I
 
I
N
 
P
L
 
A
V
 
-
N
 
-
G
 
S
Q
 
P
P
 
S
R
 
I
R
 
K
R
x
Y
Y
 
Y
S
 
R
F
 
F
K
 
Q
L
 
I
L
 
N
W
x
D
A
 
G
D
 
T
R
 
S
Q
 
T
L
 
A
W
 
W
F
 
Y
T
 
N
P
 
G
Q
 
N
G
 
G
F
 
-
N
 
-
R
 
-
F
 
-
P
 
-
P
 
P
A
 
S
R
 
S
L
 
T
E
 
E
Q
 
P
F
 
N
A
|
A
V
x
D
D
|
D
-
 
F
-
x
Y
-
 
I
L
 
I
P
 
P
D
 
N
-
 
F
S
 
K
G
 
T
P
 
P
Q
 
D
W
 
W
V
 
L
A
 
K
D
 
N
Q
 
G
V
 
V
F
 
M
Y
 
Y
Q
 
Q
I
 
I
F
 
F
P
 
P
D
 
D
R
 
R
F
 
F
A
 
Y
R
x
N
S
 
G
Q
x
D
S
 
S
R
 
S
E
x
N
A
x
D
E
 
V
Q
 
Q
D
 
T
A
 
G
T
 
S
Y
 
Y
Y
 
T
H
 
Y
H
 
N
A
 
-
A
 
-
G
 
G
H
 
T
D
 
P
I
 
T
V
 
E
R
 
K
K
 
K
A
 
A
W
 
W
D
 
G
E
 
S
P
 
S
L
 
V
T
 
Y
A
 
A
E
 
D
A
 
P
G
 
G
-
 
Y
-
 
D
-
 
N
G
 
S
S
 
L
T
 
V
F
 
F
Y
 
F
G
|
G
G
 
G
D
|
D
L
 
L
D
 
A
G
 
G
I
 
I
S
 
D
E
 
Q
K
 
K
L
 
L
P
 
G
Y
 
Y
L
 
I
K
 
K
Q
 
K
-
 
T
L
 
L
G
 
G
V
 
A
T
 
N
A
 
I
L
 
L
Y
 
Y
L
 
L
N
 
N
P
 
P
V
 
I
F
 
F
V
 
K
A
 
A
P
 
P
S
 
T
V
 
N
H
|
H
K
 
K
Y
|
Y
D
 
D
T
 
T
E
 
Q
D
 
D
Y
 
Y
R
 
M
R
 
A
V
 
V
D
 
D
P
 
P
Q
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
D
D
 
N
A
 
S
A
 
T
L
 
L
L
 
Q
R
 
T
L
 
L
R
 
I
H
 
N
N
 
D
T
 
I
Q
 
H
K
 
S
E
 
T
G
 
A
M
 
N
-
 
G
-
 
P
-
 
K
-
 
G
R
 
Y
L
 
L
I
 
I
L
 
L
D
|
D
G
 
G
V
 
V
F
 
F
N
 
N
H
|
H
S
 
T
G
 
G
D
 
D
S
 
S
H
 
H
A
 
P
W
 
W
F
 
F
D
|
D
R
 
K
H
 
Y
Q
x
N
R
 
N
-
x
F
G
x
S
S
|
S
G
 
Q
G
 
G
A
 
A
C
 
Y
H
x
E
N
 
S
A
 
Q
D
 
S
S
 
S
P
 
P
W
 
W
R
 
Y
D
 
N
W
 
Y
Y
 
Y
N
 
T
F
 
F
S
 
Y
-
 
T
-
 
W
P
 
P
E
 
D
G
 
S
V
 
Y
A
 
A
H
 
-
D
 
S
W
x
F
L
 
L
G
 
G
Y
x
F
A
 
N
S
 
S
L
 
L
P
 
P
K
 
K
L
 
L
D
 
N
Y
 
Y
-
 
G
-
 
N
R
 
S
S
 
G
S
 
S
T
 
A
L
 
V
I
 
R
D
 
G
E
 
V
I
 
I
Y
 
Y
G
 
N
G
 
N
E
 
S
D
 
N
S
 
S
V
 
V
V
 
A
R
 
K
H
 
T
W
 
Y
L
 
L
K
 
N
A
 
P
P
 
P
W
 
Y
S
 
S
M
 
V
D
 
D
G
 
G
W
 
W
R
|
R
L
 
L
D
|
D
V
x
A
V
 
A
H
 
Q
M
x
Y
L
 
V
-
 
D
-
 
A
-
 
N
G
 
G
E
 
N
G
 
N
G
 
G
G
 
S
A
 
D
R
 
V
N
 
T
N
 
N
L
 
H
R
 
Q
H
 
I
I
 
W
A
 
S
G
 
E
I
 
F
T
 
R
Q
 
N
A
 
A
A
 
V
K
 
K
L
 
G
E
 
V
R
 
N
P
 
S
D
 
N
A
 
A
F
 
A
V
 
I
F
 
I
G
 
G
E
|
E
H
 
Y
F
x
W
G
 
G
D
x
N
A
 
A
R
x
N
Q
x
P
W
 
W
L
 
T
-
 
A
Q
 
Q
A
 
G
D
 
N
V
 
Q
E
 
W
D
 
D
S
 
A
A
 
A
M
 
T
N
 
N
Y
 
F
R
x
D
G
 
G
F
 
F
T
 
T
F
 
Q
P
 
P
L
 
V
W
 
S
G
 
E
F
 
W
L
 
I
A
 
T
N
 
G
T
 
K
D
 
D
I
 
Y
S
 
Q
Y
 
N
D
 
N
P
 
S
Q
 
A
K
 
S
I
 
I
D
 
S
A
 
T
Q
 
T
T
 
Q
C
 
F
M
 
D
A
 
S
W
|
W
M
 
L
D
 
R
N
 
G
Y
x
T
R
 
R
A
 
A
G
x
N
L
 
Y
S
 
P
H
 
T
Q
 
N
Q
 
V
Q
 
Q
L
 
Q
R
 
S
M
 
M
F
 
M
N
 
N
Q
 
F
L
 
L
D
 
S
S
 
N
H
|
H
D
|
D
T
 
I
A
 
T
R
 
R
F
 
F
K
 
A
S
 
T
L
 
R
L
 
S
G
 
G
K
 
G
D
 
D
V
 
L
A
x
W
R
 
K
L
 
T
P
 
Y
L
 
L
A
 
A
V
 
L
V
 
I
W
 
F
L
 
Q
F
 
M
S
 
T
W
 
Y
P
 
V
G
 
G
V
 
T
P
 
P
C
 
T
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
D
 
D
E
 
E
V
 
Y
G
 
G
V
 
M
D
 
Q
G
 
G
N
 
G
N
 
A
D
|
D
P
 
P
F
 
D
C
 
N
R
|
R
K
 
R
P
 
S
F
 
F
P
 
D
W
 
W
D
 
S
P
 
Q
A
 
A
L
 
T
Q
 
P
D
 
S
G
 
N
D
 
S
L
 
A
L
 
V
D
 
A
L
 
L
Y
 
T
K
 
Q
R
 
K
M
 
L
S
 
I
K
 
T
L
 
I
R
 
R
K
 
N
A
 
Q
H
 
Y
Q
 
P
A
 
A
L
 
L
R
 
R
Y
 
T
G
 
G
G
 
S
C
 
F
Q
 
M
V
 
T
I
 
L
Y
 
I
A
 
T
E
 
D
D
 
D
N
 
T
-
 
N
-
 
K
V
 
I
V
 
Y
V
 
S
F
 
Y
V
 
G
R
 
R
V
 
F
Y
 
D
K
 
N
Q
 
V
Q
 
N
R
 
R
V
 
I
L
 
A
V
 
V
A
 
V
I
 
L
N
 
N
R
 
N
G
 
D
E
x
S
A
x
V
C
x
S
E
 
H
V
 
T
V
 
V
I
 
-
E
 
-
D
 
-
S
 
-
P
 
-
L
 
-
L
 
-
D
 
N
V
 
V
N
 
P
G
 
V
W
 
W
Q
 
Q
L
 
L
K
 
S
E
 
M
G
 
P
A
 
N
G
 
G
A
 
S

Sites not aligning to the query:

2d0fA Crystal structure of thermoactinomyces vulgaris r-47 alpha-amylase 1 (tvai) mutant d356n complexed with p2, a pullulan model oligosaccharide (see paper)
32% identity, 95% coverage: 10:586/605 of query aligns to 23:605/637 of 2d0fA

query
sites
2d0fA
A
 
A
P
 
P
F
 
E
I
 
P
K
 
T
E
 
S
Q
 
T
Q
 
Q
E
 
S
R
 
V
L
 
T
M
 
L
I
 
K
T
 
L
L
 
R
W
 
T
L
 
F
S
x
K
G
|
G
D
|
D
D
x
I
L
x
T
P
 
S
P
 
A
R
 
N
V
 
I
T
 
K
L
 
Y
R
 
W
A
 
D
E
 
T
E
 
A
D
 
D
N
 
N
E
 
A
E
 
F
L
 
H
S
 
W
L
 
V
P
 
P
M
 
M
H
 
V
R
x
W
L
 
D
R
 
S
Q
x
N
A
 
D
P
 
P
H
 
T
P
 
G
G
 
T
V
 
F
V
x
D
A
 
Y
W
|
W
R
 
K
G
 
G
E
 
T
I
 
I
N
 
P
L
 
A
V
 
-
N
 
-
G
 
S
Q
 
P
P
 
S
R
 
I
R
 
K
R
 
Y
Y
 
Y
S
 
R
F
 
F
K
 
Q
L
 
I
L
 
N
W
x
D
A
 
G
D
 
T
R
 
S
Q
 
T
L
 
A
W
 
W
F
 
Y
T
 
N
P
 
G
Q
 
N
G
 
G
F
 
-
N
 
-
R
 
-
F
 
-
P
 
-
P
 
P
A
 
S
R
 
S
L
 
T
E
 
E
Q
 
P
F
 
N
A
 
A
V
 
D
D
 
D
-
 
F
-
 
Y
-
 
I
L
 
I
P
 
P
D
 
N
-
 
F
S
 
K
G
 
T
P
 
P
Q
 
D
W
 
W
V
 
L
A
 
K
D
 
N
Q
 
G
V
 
V
F
 
M
Y
 
Y
Q
 
Q
I
 
I
F
 
F
P
 
P
D
 
D
R
 
R
F
 
F
A
 
Y
R
x
N
S
 
G
Q
x
D
S
|
S
R
 
S
E
x
N
A
x
D
E
 
V
Q
 
Q
D
 
T
A
 
G
T
 
S
Y
 
Y
Y
 
T
H
 
Y
H
 
N
A
 
-
A
 
-
G
 
G
H
 
T
D
 
P
I
 
T
V
 
E
R
 
K
K
 
K
A
 
A
W
 
W
D
 
G
E
 
S
P
 
S
L
 
V
T
 
Y
A
 
A
E
 
D
A
 
P
G
 
G
-
 
Y
-
x
D
-
x
N
G
x
S
S
 
L
T
 
V
F
 
F
Y
 
F
G
|
G
G
 
G
D
|
D
L
 
L
D
 
A
G
 
G
I
 
I
S
 
D
E
 
Q
K
 
K
L
 
L
P
 
G
Y
 
Y
L
 
I
K
 
K
Q
 
K
-
 
T
L
 
L
G
 
G
V
 
A
T
 
N
A
 
I
L
 
L
Y
 
Y
L
 
L
N
 
N
P
 
P
V
 
I
F
 
F
V
 
K
A
 
A
P
 
P
S
 
T
V
 
N
H
|
H
K
 
K
Y
|
Y
D
 
D
T
 
T
E
 
Q
D
 
D
Y
 
Y
R
 
M
R
 
A
V
 
V
D
 
D
P
 
P
Q
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
D
D
 
N
A
 
S
A
 
T
L
 
L
L
 
Q
R
 
T
L
 
L
R
 
I
H
 
N
N
 
D
T
 
I
Q
 
H
K
 
S
E
 
T
G
 
A
M
 
N
-
 
G
-
 
P
-
 
K
-
 
G
R
 
Y
L
 
L
I
 
I
L
 
L
D
|
D
G
 
G
V
 
V
F
 
F
N
 
N
H
|
H
S
 
T
G
 
G
D
 
D
S
 
S
H
 
H
A
 
P
W
 
W
F
 
F
D
|
D
R
 
K
H
 
Y
Q
x
N
R
 
N
-
x
F
G
x
S
S
|
S
G
 
Q
G
 
G
A
 
A
C
 
Y
H
x
E
N
 
S
A
 
Q
D
 
S
S
 
S
P
 
P
W
 
W
R
 
Y
D
 
N
W
 
Y
Y
 
Y
N
 
T
F
 
F
S
 
Y
-
 
T
-
 
W
P
 
P
E
 
D
G
 
S
V
 
Y
A
 
A
H
 
-
D
 
S
W
x
F
L
 
L
G
 
G
Y
x
F
A
 
N
S
|
S
L
|
L
P
 
P
K
 
K
L
 
L
D
 
N
Y
 
Y
-
 
G
-
 
N
R
 
S
S
 
G
S
 
S
T
 
A
L
 
V
I
 
R
D
 
G
E
 
V
I
 
I
Y
 
Y
G
 
N
G
 
N
E
 
S
D
 
N
S
 
S
V
 
V
V
 
A
R
 
K
H
 
T
W
 
Y
L
 
L
K
 
N
A
 
P
P
 
P
W
 
Y
S
 
S
M
 
V
D
 
D
G
 
G
W
 
W
R
|
R
L
 
L
D
x
N
V
x
A
V
 
A
H
 
Q
M
 
Y
L
 
V
-
 
D
-
 
A
-
 
N
G
 
G
E
 
N
G
 
N
G
 
G
G
 
S
A
 
D
R
 
V
N
 
T
N
 
N
L
 
H
R
 
Q
H
 
I
I
 
W
A
 
S
G
 
E
I
 
F
T
 
R
Q
 
N
A
 
A
A
 
V
K
 
K
L
 
G
E
 
V
R
 
N
P
 
S
D
 
N
A
 
A
F
 
A
V
 
I
F
 
I
G
 
G
E
|
E
H
 
Y
F
 
W
G
 
G
D
 
N
A
 
A
R
 
N
Q
 
P
W
 
W
L
 
T
-
 
A
Q
 
Q
A
 
G
D
 
N
V
 
Q
E
 
W
D
 
D
S
 
A
A
 
A
M
 
T
N
 
N
Y
 
F
R
 
D
G
 
G
F
 
F
T
 
T
F
 
Q
P
 
P
L
 
V
W
 
S
G
 
E
F
 
W
L
 
I
A
 
T
N
 
G
T
 
K
D
 
D
I
 
Y
S
 
Q
Y
 
N
D
 
N
P
 
S
Q
 
A
K
 
S
I
 
I
D
 
S
A
 
T
Q
 
T
T
 
Q
C
 
F
M
 
D
A
 
S
W
 
W
M
 
L
D
 
R
N
 
G
Y
 
T
R
 
R
A
 
A
G
 
N
L
 
Y
S
 
P
H
 
T
Q
 
N
Q
 
V
Q
 
Q
L
 
Q
R
 
S
M
 
M
F
 
M
N
 
N
Q
 
F
L
 
L
D
 
S
S
 
N
H
|
H
D
|
D
T
 
I
A
 
T
R
 
R
F
 
F
K
 
A
S
 
T
L
 
R
L
 
S
G
 
G
K
 
G
D
 
D
V
 
L
A
 
W
R
 
K
L
 
T
P
 
Y
L
 
L
A
 
A
V
 
L
V
 
I
W
 
F
L
 
Q
F
 
M
S
 
T
W
 
Y
P
 
V
G
 
G
V
 
T
P
 
P
C
 
T
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
D
 
D
E
 
E
V
 
Y
G
 
G
V
 
M
D
 
Q
G
 
G
N
 
G
N
 
A
D
|
D
P
 
P
F
 
D
C
 
N
R
|
R
K
 
R
P
 
S
F
 
F
P
 
D
W
 
W
D
 
S
P
 
Q
A
 
A
L
 
T
Q
 
P
D
 
S
G
 
N
D
 
S
L
 
A
L
 
V
D
 
A
L
 
L
Y
 
T
K
 
Q
R
 
K
M
 
L
S
 
I
K
 
T
L
 
I
R
 
R
K
 
N
A
 
Q
H
 
Y
Q
 
P
A
 
A
L
 
L
R
 
R
Y
 
T
G
 
G
G
 
S
C
 
F
Q
 
M
V
 
T
I
 
L
Y
 
I
A
 
T
E
 
D
D
 
D
N
 
T
-
 
N
-
 
K
V
 
I
V
 
Y
V
 
S
F
 
Y
V
 
G
R
 
R
V
 
F
Y
 
D
K
 
N
Q
 
V
Q
 
N
R
 
R
V
 
I
L
 
A
V
 
V
A
 
V
I
 
L
N
 
N
R
 
N
G
 
D
E
 
S
A
 
V
C
 
S
E
 
H
V
 
T
V
 
V
I
 
-
E
 
-
D
 
-
S
 
-
P
 
-
L
 
-
L
 
-
D
 
N
V
 
V
N
 
P
G
 
V
W
 
W
Q
 
Q
L
 
L
K
 
S
E
 
M
G
 
P
A
 
N
G
 
G
A
 
S

Sites not aligning to the query:

Q59226 Cyclomaltodextrinase; CDase; CDase I-5; Cyclomaltodextrin hydrolase, decycling; EC 3.2.1.135; EC 3.2.1.54 from Bacillus sp. (see paper)
34% identity, 80% coverage: 76:562/605 of query aligns to 78:537/558 of Q59226

query
sites
Q59226
R
 
R
R
 
V
R
 
K
Y
 
Y
S
 
G
F
 
F
K
 
L
L
 
L
L
 
Q
W
 
Q
A
 
G
D
 
H
R
 
E
Q
 
K
L
 
R
W
 
W
F
 
M
T
 
T
P
 
E
Q
 
Y
G
 
D
F
 
F
N
 
L
R
 
T
F
 
E
P
 
P
P
 
P
A
 
R
-
 
N
-
 
P
-
 
D
R
 
R
L
 
L
E
 
F
Q
 
E
F
 
Y
A
 
P
V
 
F
D
 
I
L
 
N
P
 
P
D
 
V
-
 
D
-
 
V
-
 
F
S
 
Q
G
 
P
P
 
P
Q
 
A
W
 
W
V
 
V
A
 
K
D
 
D
Q
 
A
V
 
I
F
 
F
Y
 
Y
Q
 
Q
I
 
I
F
 
F
P
 
P
D
 
E
R
 
R
F
 
F
A
 
A
R
 
N
S
 
G
Q
 
D
S
 
T
R
 
R
E
 
N
A
 
D
E
 
P
Q
 
E
D
 
G
A
 
T
T
 
L
Y
 
-
Y
 
-
H
 
-
H
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
H
 
-
D
 
-
I
 
-
V
 
-
R
 
-
K
 
-
A
 
P
W
 
W
D
 
G
E
 
-
P
 
-
L
 
-
T
 
S
A
 
A
E
 
D
A
 
P
G
 
T
G
 
P
S
 
S
T
 
C
F
 
F
Y
 
F
G
 
G
G
 
G
D
 
D
L
 
L
D
 
Q
G
 
G
I
 
V
S
 
I
E
 
D
K
 
H
L
 
L
P
 
D
Y
 
H
L
 
L
K
 
S
Q
 
K
L
 
L
G
 
G
V
 
V
T
 
N
A
 
A
L
 
V
Y
 
Y
L
 
F
N
 
T
P
 
P
V
 
L
F
 
F
V
 
K
A
 
A
P
 
T
S
 
T
V
 
N
H
 
H
K
 
K
Y
 
Y
D
 
D
T
 
T
E
 
E
D
 
D
Y
 
Y
R
 
F
R
 
Q
V
 
I
D
 
D
P
 
P
Q
 
Q
F
 
F
G
 
G
G
 
D
D
 
K
A
 
D
A
 
T
L
 
L
L
 
K
R
 
K
L
 
L
R
 
V
H
 
D
N
 
L
T
 
C
Q
 
H
K
 
E
E
 
R
G
 
G
M
 
I
R
 
R
L
 
V
I
 
L
L
 
L
D
 
D
G
 
A
V
 
V
F
 
F
N
 
N
H
 
H
S
 
S
G
 
G
D
 
R
S
 
T
H
 
F
A
 
P
W
 
P
F
 
F
-
 
V
D
 
D
R
 
V
H
 
L
Q
 
K
R
 
N
G
 
G
S
 
E
G
 
K
G
 
-
A
 
-
C
 
-
H
 
-
N
 
-
A
 
-
D
 
-
S
 
S
P
 
K
W
 
Y
R
 
K
D
 
D
W
 
W
Y
 
F
N
 
H
F
 
I
S
 
R
P
 
S
-
 
L
-
 
P
-
 
L
-
 
E
-
 
V
-
 
V
E
 
D
G
 
G
V
 
I
-
 
P
A
 
T
H
 
Y
D
 
D
W
 
T
L
 
F
G
 
A
Y
 
F
A
 
E
S
 
P
L
 
L
-
 
M
P
 
P
K
 
K
L
 
L
D
 
N
Y
 
T
R
 
E
S
 
H
S
 
P
T
 
D
L
 
V
I
 
K
D
 
E
E
 
Y
I
 
L
Y
 
L
G
 
-
G
 
-
E
 
-
D
 
-
S
 
K
V
 
A
V
 
A
R
 
E
H
 
Y
W
 
W
L
 
I
K
 
R
A
 
E
P
 
T
W
 
-
S
 
G
M
 
I
D
 
D
G
 
G
W
 
W
R
 
R
L
 
L
D
 
D
V
 
V
V
 
A
H
 
-
M
 
-
L
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
G
 
-
G
 
-
A
 
-
R
 
-
N
 
N
N
 
E
L
 
V
R
 
S
H
 
H
I
 
Q
-
 
F
-
 
W
A
 
R
G
 
E
I
 
F
T
 
R
Q
 
R
A
 
V
A
 
V
K
 
K
L
 
Q
E
 
A
R
 
N
P
 
P
D
 
D
A
 
A
F
 
Y
V
 
I
F
 
L
G
 
G
E
 
E
H
 
V
F
 
W
G
 
H
D
 
E
A
 
S
R
 
S
Q
 
I
W
 
W
L
 
L
Q
 
E
A
 
G
D
 
D
V
 
Q
E
 
F
D
 
D
S
 
A
A
 
V
M
 
M
N
 
N
Y
 
Y
R
 
-
G
 
P
F
 
F
T
 
T
F
 
N
P
 
A
L
x
V
W
 
L
G
 
D
F
 
F
L
 
F
A
 
I
N
 
H
T
 
-
D
 
-
I
 
-
S
 
-
Y
 
-
D
 
-
P
 
-
Q
 
Q
K
x
I
I
 
A
D
 
D
A
 
A
Q
 
E
T
 
K
C
 
F
M
 
S
A
 
F
W
 
M
M
 
L
D
 
G
N
 
K
Y
 
Q
R
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
Y
S
 
P
H
 
R
Q
 
Q
Q
 
A
Q
 
S
L
 
E
R
 
V
M
 
M
F
 
F
N
 
N
Q
 
L
L
 
L
D
 
D
S
 
S
H
 
H
D
 
D
T
 
T
A
 
A
R
 
R
F
 
L
K
 
L
S
 
T
L
 
Q
L
 
A
G
 
D
K
 
G
D
 
D
V
 
K
A
 
R
R
 
K
L
 
M
P
 
K
L
 
L
A
 
A
V
 
V
V
 
L
W
 
F
L
 
Q
F
 
F
S
 
T
W
 
Y
P
 
F
G
 
G
V
 
T
P
 
P
C
 
C
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
D
 
D
E
 
E
V
 
V
G
 
G
V
 
L
D
 
D
G
 
G
N
 
G
N
 
H
D
 
D
P
 
P
F
 
G
C
 
C
R
 
R
K
 
K
P
 
C
F
 
M
P
 
E
W
 
W
D
 
D
P
 
E
A
 
T
L
 
K
Q
 
H
D
 
D
G
 
K
D
 
D
L
 
L
L
 
F
D
 
A
L
 
F
Y
 
Y
K
 
Q
R
 
T
M
 
V
S
 
I
K
 
R
L
 
L
R
 
R
K
 
Q
A
 
A
H
 
H
Q
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
R
Y
 
T
G
 
G
G
 
T
C
 
F
Q
 
K
V
 
F
I
 
L
Y
 
T
A
 
A
E
 
E
D
 
K
N
 
N
V
 
S
-
 
R
-
 
Q
V
 
I
V
 
A
F
 
Y
V
 
L
R
 
R
V
 
E
Y
 
D
K
 
D
Q
 
Q
Q
 
D
R
 
T
V
 
I
L
 
L
V
 
V
A
 
V
I
 
M
N
 
N
R
 
N
G
 
D
E
 
K
A
 
A

1j0iA Crystal structure of neopullulanase complex with panose (see paper)
32% identity, 80% coverage: 76:561/605 of query aligns to 81:539/588 of 1j0iA

query
sites
1j0iA
R
 
R
R
 
L
R
 
R
Y
 
Y
S
 
G
F
 
F
K
 
V
L
 
L
L
 
Y
W
 
S
A
 
G
D
 
E
R
 
E
Q
 
K
L
 
L
W
 
V
F
 
Y
T
 
T
P
 
E
Q
 
K
G
 
G
F
 
F
N
 
Y
R
 
F
F
 
E
P
 
V
P
 
P
A
 
T
R
 
D
L
 
D
E
 
T
Q
 
A
F
 
Y
A
 
Y
V
 
F
D
 
C
L
 
F
P
 
P
D
 
F
-
 
L
-
 
H
-
 
R
-
 
V
-
 
D
-
 
L
-
 
F
S
 
E
G
 
A
P
 
P
Q
 
D
W
 
W
V
 
V
A
 
K
D
 
D
Q
 
T
V
 
V
F
 
W
Y
 
Y
Q
 
Q
I
 
I
F
 
F
P
 
P
D
 
E
R
 
R
F
 
F
A
 
A
R
 
N
S
 
G
Q
 
N
S
 
P
R
 
S
E
 
I
A
 
S
E
 
P
Q
 
E
D
 
G
A
 
S
T
 
-
Y
 
-
Y
 
-
H
 
-
H
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
H
 
-
D
 
-
I
 
-
V
 
-
R
 
-
K
 
R
A
 
P
W
 
W
D
 
G
E
 
-
P
 
-
L
 
-
T
 
S
A
 
E
E
 
D
A
 
P
G
 
T
G
x
P
S
 
T
T
 
S
F
 
F
Y
 
F
G
 
G
G
 
G
D
 
D
L
 
L
D
 
Q
G
 
G
I
 
I
S
 
I
E
 
D
K
 
H
L
 
L
P
 
D
Y
 
Y
L
 
L
K
 
V
Q
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
I
T
 
T
A
 
G
L
 
I
Y
 
Y
L
 
L
N
 
T
P
 
P
V
 
I
F
 
F
V
 
R
A
 
S
P
 
P
S
 
S
V
 
N
H
|
H
K
 
K
Y
|
Y
D
 
D
T
 
T
E
 
A
D
 
D
Y
 
Y
R
 
F
R
 
E
V
 
V
D
 
D
P
 
P
Q
 
H
F
 
F
G
 
G
G
 
D
D
 
K
A
 
E
A
 
T
L
 
L
L
 
K
R
 
T
L
 
L
R
 
I
H
 
D
N
 
R
T
 
C
Q
 
H
K
 
E
E
 
K
G
 
G
M
 
I
R
 
R
L
 
V
I
 
M
L
 
L
D
|
D
G
 
A
V
 
V
F
 
F
N
 
N
H
|
H
S
 
C
G
 
G
D
 
Y
S
 
E
H
 
F
A
 
A
W
 
P
F
 
F
-
 
Q
D
 
D
R
 
V
H
 
W
Q
 
K
R
 
N
G
 
G
S
 
E
G
 
S
G
 
-
A
 
-
C
 
-
H
 
-
N
 
-
A
 
-
D
 
-
S
 
S
P
 
K
W
 
Y
R
 
K
D
 
D
W
 
W
Y
 
F
N
 
H
F
 
I
S
 
H
P
 
E
E
 
F
G
 
P
V
 
L
A
 
Q
H
 
T
D
 
E
-
 
P
-
 
R
-
 
P
-
 
N
W
 
Y
L
 
D
G
 
T
Y
x
F
A
 
A
S
 
F
L
x
V
P
 
P
K
 
Q
L
x
M
D
 
P
Y
 
-
R
 
K
S
 
L
S
 
N
T
 
T
L
 
A
I
 
N
D
 
P
E
 
E
I
 
V
Y
 
K
G
 
R
G
 
Y
E
 
L
D
 
L
S
 
D
V
 
V
V
 
A
R
 
T
H
 
Y
W
 
W
L
 
I
K
 
R
A
 
E
P
 
-
W
 
F
S
 
D
M
 
I
D
 
D
G
 
G
W
 
W
R
|
R
L
 
L
D
|
D
V
|
V
V
 
A
H
 
-
M
 
-
L
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
G
 
-
G
 
-
A
 
-
R
 
-
N
 
N
N
 
E
L
 
I
R
 
D
H
 
H
I
 
E
-
 
F
-
 
W
A
 
R
G
 
E
I
 
F
T
 
R
Q
 
Q
A
 
E
A
 
V
K
 
K
L
 
A
E
 
L
R
 
K
P
 
P
D
 
D
A
 
V
F
 
Y
V
 
I
F
 
L
G
 
G
E
|
E
H
 
I
F
 
W
G
 
H
D
 
D
A
 
A
R
 
M
Q
 
P
W
 
W
L
 
L
Q
 
R
A
 
G
D
 
D
V
 
Q
E
 
F
D
 
D
S
 
A
A
 
V
M
 
M
N
 
N
Y
 
Y
R
 
-
G
 
P
F
 
F
T
 
T
F
 
D
P
 
G
L
 
V
W
 
L
G
 
R
F
 
F
L
 
F
A
 
A
N
 
K
T
 
E
D
 
E
I
 
I
S
 
S
Y
 
-
D
 
-
P
 
-
Q
 
A
K
 
R
I
 
Q
D
 
F
A
 
A
Q
 
N
T
 
Q
C
 
M
M
 
M
A
 
H
W
 
V
M
 
L
D
 
H
N
 
S
Y
 
Y
R
 
P
A
 
N
G
 
N
L
 
V
S
 
N
H
 
E
Q
 
A
Q
 
A
Q
 
-
L
 
-
R
 
-
M
 
-
F
 
F
N
 
N
Q
 
L
L
 
L
D
 
G
S
 
S
H
|
H
D
|
D
T
 
T
A
 
S
R
 
R
F
 
I
K
 
L
S
 
T
L
 
V
L
 
C
G
 
G
K
 
G
D
 
D
V
 
I
A
 
R
R
 
K
L
 
V
P
 
K
L
 
L
A
 
L
V
 
F
V
 
L
W
 
F
L
 
Q
F
 
L
S
 
T
W
 
F
P
 
T
G
 
G
V
 
S
P
 
P
C
 
C
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
D
 
D
E
 
E
V
 
I
G
 
G
V
 
M
D
 
T
G
 
G
N
 
G
N
 
N
D
|
D
P
 
P
F
 
E
C
 
C
R
|
R
K
 
K
P
 
C
F
 
M
P
 
V
W
 
W
D
 
D
P
 
P
A
 
M
L
 
Q
Q
 
Q
D
 
N
G
 
K
D
 
E
L
 
L
L
 
H
D
 
Q
L
 
H
Y
 
V
K
 
K
R
 
Q
M
 
L
S
 
I
K
 
A
L
 
L
R
 
R
K
 
K
A
 
Q
H
 
Y
Q
 
R
A
 
S
L
 
L
R
 
R
Y
 
R
G
 
G
G
 
E
C
 
I
Q
 
S
V
 
F
I
 
L
Y
 
H
A
 
A
E
 
D
D
 
D
-
 
E
-
 
M
N
 
N
V
 
Y
V
 
L
V
 
I
F
 
Y
V
 
K
R
 
K
V
 
T
Y
 
D
K
 
G
Q
 
D
Q
 
E
R
 
T
V
 
V
L
 
L
V
 
V
A
 
I
I
 
I
N
 
N
R
 
R
G
 
S
E
 
D

1j0hA Crystal structure of bacillus stearothermophilus neopullulanase (see paper)
32% identity, 80% coverage: 76:561/605 of query aligns to 81:539/588 of 1j0hA

query
sites
1j0hA
R
 
R
R
 
L
R
 
R
Y
 
Y
S
 
G
F
 
F
K
 
V
L
 
L
L
 
Y
W
 
S
A
 
G
D
 
E
R
 
E
Q
 
K
L
 
L
W
 
V
F
 
Y
T
 
T
P
 
E
Q
 
K
G
 
G
F
 
F
N
 
Y
R
 
F
F
 
E
P
 
V
P
 
P
A
 
T
R
 
D
L
 
D
E
 
T
Q
 
A
F
 
Y
A
 
Y
V
 
F
D
 
C
L
 
F
P
 
P
D
 
F
-
 
L
-
 
H
-
 
R
-
 
V
-
 
D
-
 
L
-
 
F
S
 
E
G
 
A
P
 
P
Q
 
D
W
 
W
V
 
V
A
 
K
D
 
D
Q
 
T
V
 
V
F
 
W
Y
 
Y
Q
 
Q
I
 
I
F
 
F
P
 
P
D
 
E
R
 
R
F
 
F
A
 
A
R
x
N
S
 
G
Q
x
N
S
x
P
R
 
S
E
 
I
A
x
S
E
 
P
Q
 
E
D
 
G
A
 
S
T
 
-
Y
 
-
Y
 
-
H
 
-
H
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
H
 
-
D
 
-
I
 
-
V
 
-
R
 
-
K
 
R
A
 
P
W
 
W
D
 
G
E
 
-
P
 
-
L
 
-
T
 
S
A
 
E
E
 
D
A
 
P
G
 
T
G
 
P
S
 
T
T
 
S
F
 
F
Y
 
F
G
|
G
G
 
G
D
|
D
L
 
L
D
 
Q
G
 
G
I
 
I
S
 
I
E
 
D
K
 
H
L
 
L
P
 
D
Y
 
Y
L
 
L
K
 
V
Q
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
I
T
 
T
A
 
G
L
 
I
Y
 
Y
L
 
L
N
 
T
P
 
P
V
 
I
F
 
F
V
 
R
A
 
S
P
 
P
S
 
S
V
 
N
H
 
H
K
 
K
Y
 
Y
D
 
D
T
 
T
E
 
A
D
 
D
Y
 
Y
R
 
F
R
 
E
V
 
V
D
 
D
P
 
P
Q
 
H
F
 
F
G
 
G
G
 
D
D
 
K
A
 
E
A
 
T
L
 
L
L
 
K
R
 
T
L
 
L
R
 
I
H
 
D
N
 
R
T
 
C
Q
 
H
K
 
E
E
 
K
G
 
G
M
 
I
R
 
R
L
 
V
I
 
M
L
 
L
D
|
D
G
 
A
V
 
V
F
 
F
N
 
N
H
 
H
S
 
C
G
 
G
D
 
Y
S
 
E
H
 
F
A
 
A
W
 
P
F
 
F
-
 
Q
D
 
D
R
 
V
H
 
W
Q
 
K
R
 
N
G
 
G
S
 
E
G
 
S
G
 
-
A
 
-
C
 
-
H
 
-
N
 
-
A
 
-
D
 
-
S
 
S
P
 
K
W
 
Y
R
 
K
D
 
D
W
 
W
Y
 
F
N
 
H
F
 
I
S
 
H
P
 
E
E
 
F
G
 
P
V
 
L
A
 
Q
H
 
T
D
 
E
-
 
P
-
 
R
-
 
P
-
 
N
W
 
Y
L
 
D
G
 
T
Y
 
F
A
 
A
S
 
F
L
 
V
P
 
P
K
 
Q
L
 
M
D
 
P
Y
 
-
R
 
K
S
 
L
S
 
N
T
 
T
L
 
A
I
 
N
D
 
P
E
 
E
I
 
V
Y
 
K
G
 
R
G
 
Y
E
 
L
D
 
L
S
 
D
V
 
V
V
 
A
R
 
T
H
 
Y
W
 
W
L
 
I
K
 
R
A
 
E
P
 
-
W
 
F
S
 
D
M
 
I
D
 
D
G
 
G
W
 
W
R
|
R
L
 
L
D
|
D
V
 
V
V
 
A
H
 
-
M
 
-
L
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
G
 
-
G
 
-
A
 
-
R
 
-
N
 
N
N
 
E
L
 
I
R
 
D
H
 
H
I
 
E
-
 
F
-
 
W
A
 
R
G
 
E
I
 
F
T
 
R
Q
 
Q
A
 
E
A
 
V
K
 
K
L
 
A
E
 
L
R
 
K
P
 
P
D
 
D
A
 
V
F
 
Y
V
 
I
F
 
L
G
 
G
E
|
E
H
 
I
F
 
W
G
 
H
D
 
D
A
 
A
R
 
M
Q
 
P
W
 
W
L
 
L
Q
 
R
A
 
G
D
 
D
V
 
Q
E
 
F
D
 
D
S
 
A
A
 
V
M
 
M
N
 
N
Y
 
Y
R
 
-
G
 
P
F
 
F
T
 
T
F
 
D
P
 
G
L
 
V
W
 
L
G
 
R
F
 
F
L
 
F
A
 
A
N
 
K
T
 
E
D
 
E
I
 
I
S
 
S
Y
 
-
D
 
-
P
 
-
Q
 
A
K
 
R
I
 
Q
D
 
F
A
 
A
Q
 
N
T
 
Q
C
 
M
M
 
M
A
 
H
W
 
V
M
 
L
D
 
H
N
 
S
Y
 
Y
R
 
P
A
 
N
G
 
N
L
 
V
S
 
N
H
 
E
Q
 
A
Q
 
A
Q
 
-
L
 
-
R
 
-
M
 
-
F
 
F
N
 
N
Q
 
L
L
 
L
D
 
G
S
 
S
H
|
H
D
|
D
T
 
T
A
 
S
R
 
R
F
 
I
K
 
L
S
 
T
L
 
V
L
 
C
G
 
G
K
 
G
D
 
D
V
 
I
A
 
R
R
 
K
L
 
V
P
 
K
L
 
L
A
 
L
V
 
F
V
 
L
W
 
F
L
 
Q
F
 
L
S
 
T
W
 
F
P
 
T
G
 
G
V
 
S
P
 
P
C
 
C
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
D
 
D
E
 
E
V
 
I
G
 
G
V
 
M
D
 
T
G
 
G
N
 
G
N
 
N
D
 
D
P
 
P
F
 
E
C
 
C
R
 
R
K
 
K
P
 
C
F
 
M
P
 
V
W
 
W
D
 
D
P
 
P
A
 
M
L
 
Q
Q
 
Q
D
 
N
G
 
K
D
 
E
L
 
L
L
 
H
D
 
Q
L
 
H
Y
 
V
K
 
K
R
 
Q
M
 
L
S
 
I
K
 
A
L
 
L
R
 
R
K
 
K
A
 
Q
H
 
Y
Q
 
R
A
 
S
L
 
L
R
 
R
Y
 
R
G
 
G
G
 
E
C
 
I
Q
 
S
V
 
F
I
 
L
Y
 
H
A
 
A
E
 
D
D
 
D
-
 
E
-
 
M
N
 
N
V
 
Y
V
 
L
V
 
I
F
 
Y
V
 
K
R
 
K
V
 
T
Y
 
D
K
 
G
Q
 
D
Q
 
E
R
 
T
V
 
V
L
 
L
V
 
V
A
 
I
I
 
I
N
 
N
R
 
R
G
 
S
E
 
D

P38940 Neopullulanase; EC 3.2.1.135 from Geobacillus stearothermophilus (Bacillus stearothermophilus) (see paper)
32% identity, 80% coverage: 76:561/605 of query aligns to 81:539/588 of P38940

query
sites
P38940
R
 
R
R
 
L
R
 
R
Y
 
Y
S
 
G
F
 
F
K
 
V
L
 
L
L
 
Y
W
 
S
A
 
G
D
 
E
R
 
E
Q
 
K
L
 
L
W
 
V
F
 
Y
T
 
T
P
 
E
Q
 
K
G
 
G
F
 
F
N
 
Y
R
 
F
F
 
E
P
 
V
P
 
P
A
 
T
R
 
D
L
 
D
E
 
T
Q
 
A
F
 
Y
A
 
Y
V
 
F
D
 
C
L
 
F
P
 
P
D
 
F
-
 
L
-
 
H
-
 
R
-
 
V
-
 
D
-
 
L
-
 
F
S
 
E
G
 
A
P
 
P
Q
 
D
W
 
W
V
 
V
A
 
K
D
 
D
Q
 
T
V
 
V
F
 
W
Y
 
Y
Q
 
Q
I
 
I
F
 
F
P
 
P
D
 
E
R
 
R
F
 
F
A
 
A
R
x
N
S
 
G
Q
x
N
S
 
P
R
 
S
E
 
I
A
x
S
E
 
P
Q
 
E
D
 
G
A
 
S
T
 
-
Y
 
-
Y
 
-
H
 
-
H
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
H
 
-
D
 
-
I
 
-
V
 
-
R
 
-
K
 
R
A
 
P
W
 
W
D
 
G
E
 
-
P
 
-
L
 
-
T
 
S
A
 
E
E
 
D
A
 
P
G
 
T
G
 
P
S
 
T
T
 
S
F
 
F
Y
 
F
G
|
G
G
 
G
D
|
D
L
 
L
D
 
Q
G
 
G
I
 
I
S
 
I
E
 
D
K
 
H
L
 
L
P
 
D
Y
 
Y
L
 
L
K
 
V
Q
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
I
T
 
T
A
 
G
L
 
I
Y
 
Y
L
 
L
N
 
T
P
 
P
V
 
I
F
 
F
V
 
R
A
 
S
P
 
P
S
 
S
V
 
N
H
 
H
K
 
K
Y
 
Y
D
 
D
T
 
T
E
 
A
D
 
D
Y
 
Y
R
 
F
R
 
E
V
 
V
D
 
D
P
 
P
Q
 
H
F
 
F
G
 
G
G
 
D
D
 
K
A
 
E
A
 
T
L
 
L
L
 
K
R
 
T
L
 
L
R
 
I
H
 
D
N
 
R
T
 
C
Q
 
H
K
 
E
E
 
K
G
 
G
M
 
I
R
 
R
L
 
V
I
 
M
L
 
L
D
 
D
G
 
A
V
 
V
F
 
F
N
 
N
H
 
H
S
 
C
G
 
G
D
 
Y
S
 
E
H
 
F
A
 
A
W
 
P
F
 
F
-
 
Q
D
 
D
R
 
V
H
 
W
Q
 
K
R
 
N
G
 
G
S
 
E
G
 
S
G
 
-
A
 
-
C
 
-
H
 
-
N
 
-
A
 
-
D
 
-
S
 
S
P
 
K
W
 
Y
R
 
K
D
 
D
W
 
W
Y
 
F
N
 
H
F
 
I
-
 
H
-
 
E
-
 
F
-
 
P
-
 
L
-
 
Q
-
 
T
S
 
E
P
 
P
E
 
R
G
 
P
V
 
N
A
 
Y
H
 
D
D
 
T
W
 
F
L
 
R
G
 
F
Y
 
V
A
 
P
S
 
Q
L
 
M
P
 
P
K
 
K
L
 
L
D
 
N
Y
 
-
R
 
-
S
 
-
S
 
-
T
 
T
L
 
A
I
 
N
D
 
P
E
 
E
I
 
V
Y
 
K
G
 
R
G
 
Y
E
 
L
D
 
L
S
 
D
V
 
V
V
 
A
R
 
T
H
 
Y
W
 
W
L
 
I
K
 
R
A
 
E
P
 
-
W
 
F
S
 
D
M
 
I
D
 
D
G
 
G
W
 
W
R
 
R
L
 
L
D
 
D
V
 
V
V
 
A
H
 
-
M
 
-
L
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
G
 
-
G
 
-
A
 
-
R
 
-
N
 
N
N
 
E
L
 
I
R
 
D
H
 
H
I
 
E
-
 
F
-
 
W
A
 
R
G
 
E
I
 
F
T
 
R
Q
 
Q
A
 
E
A
 
V
K
 
K
L
 
A
E
 
L
R
 
K
P
 
P
D
 
D
A
 
V
F
 
Y
V
 
I
F
 
L
G
 
G
E
 
E
H
 
I
F
 
W
G
 
H
D
 
D
A
 
A
R
 
M
Q
 
P
W
 
W
L
 
L
Q
 
R
A
 
G
D
 
D
V
 
Q
E
 
F
D
 
D
S
 
A
A
 
V
M
 
M
N
 
N
Y
 
Y
R
 
-
G
 
P
F
 
F
T
 
T
F
 
D
P
 
G
L
 
V
W
 
L
G
 
R
F
 
F
L
 
F
A
 
A
N
 
K
T
 
E
D
 
E
I
 
I
S
 
S
Y
 
-
D
 
-
P
 
-
Q
 
A
K
 
R
I
 
Q
D
 
F
A
 
A
Q
 
N
T
 
Q
C
 
M
M
 
M
A
 
H
W
 
V
M
 
L
D
 
H
N
 
S
Y
 
Y
R
 
P
A
 
N
G
 
N
L
 
V
S
 
N
H
 
E
Q
 
A
Q
 
A
Q
 
-
L
 
-
R
 
-
M
 
-
F
 
F
N
 
N
Q
 
L
L
 
L
D
 
G
S
 
S
H
 
H
D
 
D
T
 
T
A
 
S
R
 
R
F
 
I
K
 
L
S
 
T
L
 
V
L
 
C
G
 
G
K
 
G
D
 
D
V
 
I
A
 
R
R
 
K
L
 
V
P
 
K
L
 
L
A
 
L
V
 
F
V
 
L
W
 
F
L
 
Q
F
 
L
S
 
T
W
 
F
P
 
T
G
 
G
V
 
S
P
 
P
C
 
C
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
D
 
D
E
 
E
V
 
I
G
 
G
V
 
M
D
 
T
G
 
G
N
 
G
N
 
N
D
 
D
P
 
P
F
 
E
C
 
C
R
 
R
K
 
K
P
 
C
F
 
M
P
 
V
W
 
W
D
 
D
P
 
P
A
 
M
L
 
Q
Q
 
Q
D
 
N
G
 
K
D
 
E
L
 
L
L
 
H
D
 
Q
L
 
H
Y
 
V
K
 
K
R
 
Q
M
 
L
S
 
I
K
 
A
L
 
L
R
 
R
K
 
K
A
 
Q
H
 
Y
Q
 
R
A
 
S
L
 
L
R
 
R
Y
 
R
G
 
G
G
 
E
C
 
I
Q
 
S
V
 
F
I
 
L
Y
 
H
A
 
A
E
 
D
D
 
D
-
 
E
-
 
M
N
 
N
V
 
Y
V
 
L
V
 
I
F
 
Y
V
 
K
R
 
K
V
 
T
Y
 
D
K
 
G
Q
 
D
Q
 
E
R
 
T
V
 
V
L
 
L
V
 
V
A
 
I
I
 
I
N
 
N
R
 
R
G
 
S
E
 
D

1gviB Thermus maltogenic amylase in complex with beta-cd (see paper)
33% identity, 81% coverage: 76:565/605 of query aligns to 81:544/588 of 1gviB

query
sites
1gviB
R
 
R
R
 
L
R
 
R
Y
 
Y
S
 
G
F
 
F
K
 
V
L
 
L
L
 
R
W
 
A
A
 
G
D
 
G
R
 
E
Q
 
K
L
 
L
W
 
V
F
 
Y
T
 
T
P
 
E
Q
 
K
G
 
G
F
 
F
N
 
Y
R
 
H
F
 
E
P
 
A
P
 
P
A
 
S
R
 
D
L
x
D
E
x
T
Q
 
A
F
 
Y
A
 
Y
V
 
F
D
 
C
L
 
F
P
 
P
D
 
F
-
 
L
-
 
H
-
 
R
-
 
V
-
 
D
-
 
L
-
 
F
S
 
Q
G
 
A
P
 
P
Q
 
D
W
 
W
V
 
V
A
 
K
D
 
D
Q
 
T
V
 
V
F
 
W
Y
 
Y
Q
 
Q
I
 
I
F
 
F
P
 
P
D
 
E
R
 
R
F
 
F
A
 
A
R
 
N
S
 
G
Q
 
N
S
 
P
R
 
A
E
 
I
A
 
S
E
 
P
Q
 
K
D
 
G
A
 
A
T
 
-
Y
 
-
Y
 
-
H
 
-
H
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
H
 
-
D
 
-
I
 
-
V
 
-
R
 
-
K
 
R
A
 
P
W
 
W
D
 
G
E
 
-
P
 
-
L
 
-
T
 
S
A
 
E
E
 
D
A
 
P
G
 
T
G
 
P
S
 
T
T
 
S
F
 
F
Y
 
F
G
 
G
G
 
G
D
 
D
L
 
L
D
 
Q
G
 
G
I
 
I
S
 
I
E
 
D
K
 
H
L
 
L
P
 
D
Y
 
Y
L
 
L
K
 
A
Q
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
I
T
 
T
A
 
G
L
 
I
Y
 
Y
L
 
L
N
 
T
P
 
P
V
 
I
F
 
F
V
 
R
A
 
A
P
 
P
S
 
S
V
 
N
H
|
H
K
 
K
Y
|
Y
D
 
D
T
 
T
E
 
A
D
 
D
Y
 
Y
R
 
F
R
 
E
V
 
I
D
 
D
P
 
P
Q
 
H
F
 
F
G
 
G
G
 
D
D
 
K
A
 
E
A
 
T
L
 
L
L
 
K
R
 
T
L
 
L
R
 
V
H
 
K
N
 
R
T
 
C
Q
 
H
K
 
E
E
 
K
G
 
G
M
 
I
R
 
R
L
 
V
I
 
M
L
 
L
D
|
D
G
 
A
V
 
V
F
 
F
N
 
N
H
|
H
S
 
C
G
 
G
D
 
Y
S
 
E
H
 
F
A
 
A
W
 
P
F
 
F
D
 
Q
R
 
D
H
 
V
Q
 
L
R
 
K
G
 
-
S
 
-
G
 
-
G
 
-
A
 
-
C
 
-
H
 
N
N
 
G
A
 
A
D
 
A
S
 
S
P
 
R
W
 
Y
R
 
K
D
 
D
W
 
W
Y
 
F
N
 
H
F
 
I
-
 
R
-
 
E
-
 
F
-
 
P
-
 
L
-
 
Q
-
 
T
S
 
E
P
 
P
E
 
R
G
 
P
V
 
N
A
 
Y
H
 
D
D
 
T
W
x
F
L
 
A
G
 
F
Y
x
V
A
 
P
S
 
H
L
x
M
P
 
P
K
 
K
L
 
L
D
 
N
Y
 
-
R
 
-
S
 
-
S
 
-
T
 
T
L
 
A
I
 
H
D
 
P
E
 
E
I
 
V
Y
 
K
G
 
R
G
 
Y
E
 
L
D
 
L
S
 
D
V
 
V
V
 
A
R
 
T
H
 
Y
W
 
W
L
 
I
K
 
R
A
 
E
P
 
-
W
 
F
S
 
D
M
 
I
D
 
D
G
 
G
W
 
W
R
|
R
L
 
L
D
|
D
V
 
V
V
 
A
H
 
-
M
 
-
L
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
G
 
-
G
 
-
A
 
-
R
 
-
N
 
N
N
 
E
L
 
I
R
 
D
H
 
H
I
 
Q
-
 
F
-
 
W
A
 
R
G
 
E
I
 
F
T
 
R
Q
 
Q
A
 
A
A
 
V
K
 
K
L
 
A
E
 
L
R
 
K
P
 
P
D
 
D
A
 
V
F
 
Y
V
 
I
F
 
L
G
 
G
E
x
L
H
 
I
F
x
W
G
 
H
D
 
D
A
 
A
R
 
M
Q
 
P
W
 
W
L
 
L
Q
 
R
A
 
G
D
 
D
V
 
Q
E
 
F
D
 
D
S
 
A
A
 
V
M
 
M
N
 
N
Y
|
Y
R
 
P
G
 
L
F
 
A
T
 
D
F
 
A
P
 
A
L
 
L
W
 
-
G
 
R
F
 
F
L
 
F
A
 
A
N
 
K
T
 
E
D
 
D
I
 
M
S
 
S
Y
 
A
D
 
S
P
 
E
Q
 
F
K
 
-
I
 
-
D
 
-
A
 
A
Q
 
D
T
 
R
C
 
L
M
 
M
A
 
H
W
 
V
M
 
L
D
 
H
N
 
S
Y
 
Y
R
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
S
 
P
H
 
K
Q
 
Q
Q
 
V
Q
 
N
L
 
E
R
 
A
M
 
A
F
 
F
N
 
N
Q
 
L
L
 
L
D
 
G
S
 
S
H
|
H
D
|
D
T
 
T
A
 
P
R
 
R
F
 
L
K
 
L
S
 
T
L
 
V
L
 
C
G
 
G
K
 
G
D
 
D
V
 
V
A
 
R
R
 
K
L
 
V
P
 
K
L
 
L
A
 
L
V
 
F
V
 
L
W
 
F
L
 
Q
F
 
L
S
 
T
W
 
F
P
 
T
G
 
G
V
 
S
P
 
P
C
 
C
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
D
 
D
E
 
E
V
 
I
G
 
G
V
 
M
D
 
T
G
 
G
N
 
G
N
 
N
D
|
D
P
 
P
F
 
E
C
 
C
R
|
R
K
 
K
P
 
C
F
 
M
P
 
V
W
 
W
D
 
D
P
 
P
A
 
E
L
 
K
Q
 
Q
D
 
N
G
 
K
D
 
E
L
 
L
L
 
Y
D
 
E
L
 
H
Y
 
V
K
 
K
R
 
Q
M
 
L
S
 
I
K
 
A
L
 
L
R
 
R
K
 
K
A
 
Q
H
 
Y
Q
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
R
Y
 
R
G
 
G
G
 
D
C
 
V
Q
 
A
V
 
F
I
 
L
Y
 
T
A
 
A
E
 
D
D
 
D
N
 
E
V
 
V
-
 
N
-
 
H
V
 
L
V
 
V
F
 
Y
V
 
A
R
 
K
V
 
T
Y
 
D
K
 
G
Q
 
N
Q
 
E
R
 
T
V
 
V
L
 
M
V
 
I
A
 
I
I
 
I
N
 
N
R
 
R
G
 
S
-
 
N
E
 
E
A
 
A
C
 
A
E
 
E
V
 
I

Sites not aligning to the query:

3a6oA Crystal structure of thermoactinomyces vulgaris r-47 alpha- amylase 2/acarbose complex (see paper)
34% identity, 75% coverage: 115:568/605 of query aligns to 123:544/585 of 3a6oA

query
sites
3a6oA
S
 
T
G
 
T
P
 
P
Q
 
E
W
 
W
V
 
A
A
 
K
D
 
E
Q
 
A
V
 
V
F
 
I
Y
 
Y
Q
 
Q
I
 
I
F
 
F
P
 
P
D
 
E
R
 
R
F
 
F
A
 
A
R
x
N
S
 
G
Q
x
D
S
 
P
R
 
S
E
x
N
A
 
-
E
 
-
Q
 
-
D
 
-
A
 
-
T
 
-
Y
 
-
Y
 
-
H
 
-
H
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
H
 
-
D
 
-
I
 
-
V
 
-
R
 
-
K
 
-
A
 
-
W
 
-
D
|
D
E
 
P
P
 
P
L
 
G
T
 
T
-
 
E
-
 
Q
-
 
W
-
 
A
-
 
K
-
 
D
A
 
A
E
 
R
A
 
P
G
 
R
G
x
H
S
 
D
T
 
S
F
 
F
Y
 
Y
G
|
G
G
 
G
D
|
D
L
 
L
D
 
K
G
 
G
I
 
V
S
 
I
E
 
D
K
 
R
L
 
L
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
K
 
E
Q
 
E
L
 
L
G
 
G
V
 
V
T
 
T
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
L
 
F
N
 
T
P
 
P
V
 
I
F
 
F
V
 
A
A
 
S
P
 
P
S
 
S
V
 
H
H
|
H
K
 
K
Y
|
<