SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing BWI76_RS07270 BWI76_RS07270 ABC transporter ATP-binding protein to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1g6hA Crystal structure of the adp conformation of mj1267, an atp-binding cassette of an abc transporter (see paper)
31% identity, 98% coverage: 1:250/255 of query aligns to 2:253/254 of 1g6hA

query
sites
1g6hA
M
 
M
S
 
E
L
 
I
L
 
L
S
 
R
V
 
T
C
 
E
H
 
N
M
 
I
T
 
V
K
 
K
R
 
Y
F
|
F
G
 
G
G
 
E
L
x
F
T
 
K
A
 
A
V
 
L
D
 
D
N
 
G
V
 
V
S
 
S
L
 
I
S
 
S
I
 
V
N
 
N
Q
 
K
G
 
G
E
 
D
I
 
V
Y
 
T
G
 
L
L
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
C
 
L
F
 
I
N
 
N
L
 
V
I
 
I
T
 
T
G
 
G
L
 
F
Y
 
L
P
 
K
A
 
A
D
 
D
S
 
E
G
 
G
E
 
R
F
 
V
A
 
Y
I
 
F
G
 
E
G
 
N
E
 
K
A
 
D
Y
 
I
F
 
T
P
 
N
S
 
K
N
 
E
I
 
P
E
 
A
K
 
E
V
 
L
T
 
Y
A
 
H
A
 
Y
G
 
G
I
 
I
A
 
V
R
 
R
T
 
T
F
 
F
Q
 
Q
N
 
T
V
 
P
R
 
Q
L
 
P
F
 
L
N
 
K
N
 
E
M
 
M
S
 
T
V
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
L
M
 
L
V
 
I
G
 
G
R
 
E
H
 
I
V
 
C
R
 
P
T
 
G
R
 
E
N
 
S
G
 
P
L
 
L
W
 
N
A
 
S
A
 
L
I
 
F
S
 
-
R
 
-
H
 
Y
K
 
K
R
 
K
A
 
W
R
 
I
A
 
P
E
 
K
E
 
E
T
 
E
Q
 
E
T
 
M
R
 
V
E
 
E
L
 
K
A
 
A
W
 
F
H
 
K
L
 
I
L
 
L
D
 
E
Y
 
F
T
 
L
G
 
K
I
 
L
S
 
S
Q
 
H
F
 
L
A
 
Y
H
 
D
Y
 
R
R
 
K
A
 
A
C
 
G
D
 
E
L
 
L
A
 
S
Y
 
G
G
 
G
H
 
Q
Q
 
M
R
 
K
R
 
L
L
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
M
T
 
T
E
 
N
P
 
P
R
 
K
L
 
M
L
 
I
A
 
V
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
I
A
 
A
G
 
G
M
 
V
N
 
A
A
 
P
A
 
G
E
 
L
K
 
A
M
 
H
A
 
D
L
 
I
G
 
F
E
 
N
L
 
H
L
 
V
L
 
L
R
 
E
I
 
L
R
 
K
D
 
A
D
 
K
G
 
G
K
 
I
T
 
T
L
 
F
L
 
L
M
 
I
I
 
I
E
 
E
H
 
H
D
 
R
V
 
L
K
 
D
L
 
I
V
 
V
M
 
L
G
 
N
I
 
Y
C
 
I
D
 
D
R
 
H
L
 
L
M
 
Y
V
 
V
L
 
M
D
 
F
Y
 
N
G
 
G
K
 
Q
T
 
I
L
 
I
T
 
A
S
 
E
G
 
G
T
 
R
P
 
G
D
 
E
-
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
K
T
 
N
V
 
V
R
 
L
R
 
S
D
 
D
P
 
P
A
 
K
V
 
V
I
 
V
A
 
E
A
 
I
W
 
Y
L
 
I
G
 
G

1g9xB Characterization of the twinning structure of mj1267, an atp-binding cassette of an abc transporter (see paper)
31% identity, 98% coverage: 1:250/255 of query aligns to 2:253/253 of 1g9xB

query
sites
1g9xB
M
 
M
S
 
E
L
 
I
L
 
L
S
 
R
V
 
T
C
 
E
H
 
N
M
 
I
T
 
V
K
 
K
R
 
Y
F
|
F
G
 
G
G
 
E
L
x
F
T
 
K
A
 
A
V
 
L
D
 
D
N
 
G
V
 
V
S
 
S
L
 
I
S
 
S
I
 
V
N
 
C
Q
 
K
G
 
G
E
 
D
I
 
V
Y
 
T
G
 
L
L
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
C
 
L
F
 
I
N
 
N
L
 
V
I
 
I
T
 
T
G
 
G
L
 
F
Y
 
L
P
 
K
A
 
A
D
 
D
S
 
E
G
 
G
E
 
R
F
 
V
A
 
Y
I
 
F
G
 
E
G
 
N
E
 
K
A
 
D
Y
 
I
F
 
T
P
 
N
S
 
K
N
 
E
I
 
P
E
 
A
K
 
E
V
 
L
T
 
Y
A
 
H
A
 
Y
G
 
G
I
 
I
A
 
V
R
 
R
T
 
T
F
 
F
Q
 
Q
N
 
T
V
 
P
R
 
Q
L
 
P
F
 
L
N
 
K
N
 
E
M
 
M
S
 
T
V
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
L
M
 
L
V
 
I
G
 
G
R
 
E
H
 
I
V
 
N
R
 
P
T
 
G
R
 
E
N
 
S
G
 
P
L
 
L
W
 
N
A
 
S
A
 
L
I
 
F
S
 
-
R
 
-
H
 
Y
K
 
K
R
 
K
A
 
W
R
 
I
A
 
P
E
 
K
E
 
E
T
 
E
Q
 
E
T
 
M
R
 
V
E
 
E
L
 
K
A
 
A
W
 
F
H
 
K
L
 
I
L
 
L
D
 
E
Y
 
F
T
 
L
G
 
K
I
 
L
S
 
S
Q
 
H
F
 
L
A
 
Y
H
 
D
Y
 
R
R
 
K
A
 
A
C
 
G
D
 
E
L
 
L
A
 
S
Y
 
G
G
 
G
H
 
Q
Q
 
M
R
 
K
R
 
L
L
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
M
T
 
T
E
 
N
P
 
P
R
 
K
L
 
M
L
 
I
A
 
V
L
 
M
D
 
D
E
|
E
P
 
P
A
 
I
A
 
A
G
 
G
M
 
V
N
 
A
A
 
P
A
 
G
E
 
L
K
 
A
M
 
H
A
 
D
L
 
I
G
 
F
E
 
N
L
 
H
L
 
V
L
 
L
R
 
E
I
 
L
R
 
K
D
 
A
D
 
K
G
 
G
K
 
I
T
 
T
L
 
F
L
 
L
M
 
I
I
 
I
E
 
E
H
 
H
D
 
R
V
 
L
K
 
D
L
 
I
V
 
V
M
 
L
G
 
N
I
 
Y
C
 
I
D
 
D
R
 
H
L
 
L
M
 
Y
V
 
V
L
 
M
D
 
F
Y
 
N
G
 
G
K
 
Q
T
 
I
L
 
I
T
 
A
S
 
E
G
 
G
T
 
R
P
 
G
D
 
E
-
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
K
T
 
N
V
 
V
R
 
L
R
 
S
D
 
D
P
 
P
A
 
K
V
 
V
I
 
V
A
 
E
A
 
I
W
 
Y
L
 
I
G
 
G

6s8nB Cryo-em structure of lptb2fgc in complex with lipopolysaccharide (see paper)
33% identity, 97% coverage: 4:250/255 of query aligns to 3:235/238 of 6s8nB

query
sites
6s8nB
L
 
L
S
 
T
V
 
A
C
 
K
H
 
N
M
 
L
T
 
A
K
 
K
R
 
A
F
 
Y
G
 
K
G
 
G
L
 
R
T
 
R
A
 
V
V
 
V
D
 
E
N
 
D
V
 
V
S
 
S
L
 
L
S
 
T
I
 
V
N
 
N
Q
 
S
G
 
G
E
 
E
I
 
I
Y
 
V
G
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
T
C
 
T
F
 
F
N
 
Y
L
 
M
I
 
V
T
 
V
G
 
G
L
 
I
Y
 
V
P
 
P
A
 
R
D
 
D
S
 
A
G
 
G
E
 
N
F
 
I
A
 
I
I
 
I
G
 
D
G
 
D
E
 
D
A
 
D
Y
 
I
F
 
S
P
 
L
S
 
L
N
 
P
I
 
L
E
 
H
K
 
A
V
 
R
T
 
A
A
 
R
A
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
G
R
 
Y
T
 
L
F
 
P
Q
 
Q
N
 
E
V
 
A
R
 
S
L
 
I
F
 
F
N
x
R
N
 
R
M
 
L
S
 
S
V
 
V
L
 
Y
E
 
D
N
 
N
V
 
L
M
 
M
V
 
A
G
 
V
R
 
-
H
 
-
V
 
L
R
 
Q
T
 
I
R
 
R
N
 
D
G
 
D
L
 
L
W
 
S
A
 
A
A
 
-
I
 
-
S
 
-
R
 
E
H
 
Q
K
 
R
R
 
E
A
 
D
R
 
R
A
 
A
E
 
N
E
 
E
T
 
L
Q
 
M
T
 
E
R
 
E
E
 
F
L
 
H
A
 
I
W
 
E
H
 
H
L
 
L
L
 
R
D
 
D
Y
 
S
T
x
M
G
|
G
I
x
Q
S
 
S
Q
 
-
F
 
-
A
 
-
H
 
-
Y
 
-
R
 
-
A
 
-
C
 
-
D
 
-
L
 
L
A
 
S
Y
 
G
G
 
G
H
 
E
Q
 
R
R
 
R
R
 
R
L
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
A
E
 
N
P
 
P
R
 
K
L
 
F
L
 
I
A
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
V
N
 
D
A
 
P
A
 
I
E
 
S
K
 
V
M
 
I
A
 
D
L
 
I
G
 
K
E
 
R
L
 
I
L
 
I
L
 
E
R
 
H
I
 
L
R
 
R
D
 
D
D
 
S
G
 
G
K
 
L
T
 
G
L
 
V
L
 
L
M
 
I
I
 
T
E
 
D
H
 
H
D
 
N
V
 
V
K
 
R
L
 
E
V
 
T
M
 
L
G
 
A
I
 
V
C
 
C
D
 
E
R
 
R
L
 
A
M
 
Y
V
 
I
L
 
V
D
 
S
Y
 
Q
G
 
G
K
 
H
T
 
L
L
 
I
T
 
A
S
 
H
G
 
G
T
 
T
P
 
P
D
 
T
T
 
E
V
 
I
R
 
L
R
 
Q
D
 
D
P
 
E
A
 
H
V
 
V
I
 
K
A
 
R
A
 
V
W
 
Y
L
 
L
G
 
G

6s8gA Cryo-em structure of lptb2fgc in complex with amp-pnp (see paper)
33% identity, 97% coverage: 4:250/255 of query aligns to 3:235/238 of 6s8gA

query
sites
6s8gA
L
 
L
S
 
T
V
 
A
C
 
K
H
 
N
M
 
L
T
 
A
K
 
K
R
 
A
F
x
Y
G
 
K
G
 
G
L
x
R
T
 
R
A
 
V
V
 
V
D
 
E
N
 
D
V
 
V
S
 
S
L
 
L
S
 
T
I
 
V
N
 
N
Q
 
S
G
 
G
E
 
E
I
 
I
Y
 
V
G
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
 
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
C
 
T
F
 
F
N
 
Y
L
 
M
I
 
V
T
 
V
G
 
G
L
 
I
Y
 
V
P
 
P
A
 
R
D
 
D
S
 
A
G
 
G
E
 
N
F
 
I
A
 
I
I
 
I
G
 
D
G
 
D
E
 
D
A
 
D
Y
 
I
F
 
S
P
 
L
S
 
L
N
 
P
I
 
L
E
 
H
K
 
A
V
 
R
T
 
A
A
 
R
A
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
G
R
 
Y
T
 
L
F
 
P
Q
|
Q
N
 
E
V
 
A
R
 
S
L
 
I
F
 
F
N
 
R
N
 
R
M
 
L
S
 
S
V
 
V
L
 
Y
E
 
D
N
 
N
V
 
L
M
 
M
V
 
A
G
 
V
R
 
-
H
 
-
V
 
L
R
 
Q
T
 
I
R
 
R
N
 
D
G
 
D
L
 
L
W
 
S
A
 
A
A
 
-
I
 
-
S
 
-
R
 
E
H
 
Q
K
 
R
R
 
E
A
 
D
R
 
R
A
 
A
E
 
N
E
 
E
T
 
L
Q
 
M
T
 
E
R
 
E
E
 
F
L
 
H
A
 
I
W
 
E
H
 
H
L
 
L
L
 
R
D
 
D
Y
 
S
T
 
M
G
 
G
I
 
Q
S
|
S
Q
 
-
F
 
-
A
 
-
H
 
-
Y
 
-
R
 
-
A
 
-
C
 
-
D
 
-
L
 
L
A
x
S
Y
 
G
G
 
G
H
x
E
Q
 
R
R
 
R
R
 
R
L
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
A
E
 
N
P
 
P
R
 
K
L
 
F
L
 
I
A
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
V
N
 
D
A
 
P
A
 
I
E
 
S
K
 
V
M
 
I
A
 
D
L
 
I
G
 
K
E
 
R
L
 
I
L
 
I
L
 
E
R
 
H
I
 
L
R
 
R
D
 
D
D
 
S
G
 
G
K
 
L
T
 
G
L
 
V
L
 
L
M
 
I
I
 
T
E
 
D
H
 
H
D
 
N
V
 
V
K
 
R
L
 
E
V
 
T
M
 
L
G
 
A
I
 
V
C
 
C
D
 
E
R
 
R
L
 
A
M
 
Y
V
 
I
L
 
V
D
 
S
Y
 
Q
G
 
G
K
 
H
T
 
L
L
 
I
T
 
A
S
 
H
G
 
G
T
 
T
P
 
P
D
 
T
T
 
E
V
 
I
R
 
L
R
 
Q
D
 
D
P
 
E
A
 
H
V
 
V
I
 
K
A
 
R
A
 
V
W
 
Y
L
 
L
G
 
G

6mhzA Vanadate trapped cryo-em structure of e.Coli lptb2fg transporter (see paper)
33% identity, 97% coverage: 4:250/255 of query aligns to 3:235/235 of 6mhzA

query
sites
6mhzA
L
 
L
S
 
T
V
 
A
C
 
K
H
 
N
M
 
L
T
 
A
K
 
K
R
 
A
F
x
Y
G
 
K
G
 
G
L
 
R
T
 
R
A
 
V
V
 
V
D
 
E
N
 
D
V
 
V
S
 
S
L
 
L
S
 
T
I
 
V
N
 
N
Q
 
S
G
 
G
E
 
E
I
 
I
Y
 
V
G
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
C
 
T
F
 
F
N
 
Y
L
 
M
I
 
V
T
 
V
G
 
G
L
 
I
Y
 
V
P
 
P
A
 
R
D
 
D
S
 
A
G
 
G
E
 
N
F
 
I
A
 
I
I
 
I
G
 
D
G
 
D
E
 
D
A
 
D
Y
 
I
F
 
S
P
 
L
S
 
L
N
 
P
I
 
L
E
 
H
K
 
A
V
 
R
T
 
A
A
 
R
A
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
G
R
 
Y
T
 
L
F
 
P
Q
|
Q
N
 
E
V
 
A
R
 
S
L
 
I
F
 
F
N
 
R
N
 
R
M
 
L
S
 
S
V
 
V
L
 
Y
E
 
D
N
 
N
V
 
L
M
 
M
V
 
A
G
 
V
R
 
-
H
 
-
V
 
L
R
 
Q
T
 
I
R
 
R
N
 
D
G
 
D
L
 
L
W
 
S
A
 
A
A
 
-
I
 
-
S
 
-
R
 
E
H
 
Q
K
 
R
R
 
E
A
 
D
R
 
R
A
 
A
E
 
N
E
 
E
T
 
L
Q
 
M
T
 
E
R
 
E
E
 
F
L
 
H
A
 
I
W
 
E
H
 
H
L
 
L
L
 
R
D
 
D
Y
 
S
T
 
M
G
 
G
I
 
Q
S
|
S
Q
 
-
F
 
-
A
 
-
H
 
-
Y
 
-
R
 
-
A
 
-
C
 
-
D
 
-
L
 
L
A
x
S
Y
x
G
G
|
G
H
 
E
Q
 
R
R
 
R
R
 
R
L
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
A
E
 
N
P
 
P
R
 
K
L
 
F
L
 
I
A
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
A
 
F
A
 
A
G
|
G
M
 
V
N
 
D
A
 
P
A
 
I
E
 
S
K
 
V
M
 
I
A
 
D
L
 
I
G
 
K
E
 
R
L
 
I
L
 
I
L
 
E
R
 
H
I
 
L
R
 
R
D
 
D
D
 
S
G
 
G
K
 
L
T
 
G
L
 
V
L
 
L
M
 
I
I
 
T
E
 
D
H
|
H
D
 
N
V
 
V
K
 
R
L
 
E
V
 
T
M
 
L
G
 
A
I
 
V
C
 
C
D
 
E
R
 
R
L
 
A
M
 
Y
V
 
I
L
 
V
D
 
S
Y
 
Q
G
 
G
K
 
H
T
 
L
L
 
I
T
 
A
S
 
H
G
 
G
T
 
T
P
 
P
D
 
T
T
 
E
V
 
I
R
 
L
R
 
Q
D
 
D
P
 
E
A
 
H
V
 
V
I
 
K
A
 
R
A
 
V
W
 
Y
L
 
L
G
 
G

6mbnA Lptb e163q in complex with atp (see paper)
32% identity, 97% coverage: 4:250/255 of query aligns to 4:236/241 of 6mbnA

query
sites
6mbnA
L
 
L
S
 
T
V
 
A
C
 
K
H
 
N
M
 
L
T
 
A
K
 
K
R
 
A
F
x
Y
G
 
K
G
 
G
L
x
R
T
 
R
A
x
V
V
 
V
D
 
E
N
 
D
V
 
V
S
 
S
L
 
L
S
 
T
I
 
V
N
 
N
Q
 
S
G
 
G
E
 
E
I
 
I
Y
 
V
G
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
C
 
T
F
 
F
N
 
Y
L
 
M
I
 
V
T
 
V
G
 
G
L
 
I
Y
 
V
P
 
P
A
 
R
D
 
D
S
 
A
G
 
G
E
 
N
F
 
I
A
 
I
I
 
I
G
 
D
G
 
D
E
 
D
A
 
D
Y
 
I
F
 
S
P
 
L
S
 
L
N
 
P
I
 
L
E
 
H
K
 
A
V
 
R
T
 
A
A
 
R
A
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
G
R
 
Y
T
 
L
F
 
P
Q
 
Q
N
 
E
V
 
A
R
 
S
L
 
I
F
 
F
N
 
R
N
 
R
M
 
L
S
 
S
V
 
V
L
 
Y
E
 
D
N
 
N
V
 
L
M
 
M
V
 
A
G
 
V
R
 
-
H
 
-
V
 
L
R
 
Q
T
 
I
R
 
R
N
 
D
G
 
D
L
 
L
W
 
S
A
 
A
A
 
-
I
 
-
S
 
-
R
 
E
H
 
Q
K
 
R
R
 
E
A
 
D
R
 
R
A
 
A
E
 
N
E
 
E
T
 
L
Q
 
M
T
 
E
R
 
E
E
 
F
L
 
H
A
 
I
W
 
E
H
 
H
L
 
L
L
 
R
D
 
D
Y
 
S
T
 
M
G
 
G
I
 
Q
S
 
S
Q
 
-
F
 
-
A
 
-
H
 
-
Y
 
-
R
 
-
A
 
-
C
 
-
D
 
-
L
 
L
A
 
S
Y
 
G
G
 
G
H
 
E
Q
 
R
R
 
R
R
 
R
L
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
A
E
 
N
P
 
P
R
 
K
L
 
F
L
 
I
A
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
A
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
V
N
 
D
A
 
P
A
 
I
E
 
S
K
 
V
M
 
I
A
 
D
L
 
I
G
 
K
E
 
R
L
 
I
L
 
I
L
 
E
R
 
H
I
 
L
R
 
R
D
 
D
D
 
S
G
 
G
K
 
L
T
 
G
L
 
V
L
 
L
M
 
I
I
 
T
E
 
D
H
|
H
D
 
N
V
 
V
K
 
R
L
 
E
V
 
T
M
 
L
G
 
A
I
 
V
C
 
C
D
 
E
R
 
R
L
 
A
M
 
Y
V
 
I
L
 
V
D
 
S
Y
 
Q
G
 
G
K
 
H
T
 
L
L
 
I
T
 
A
S
 
H
G
 
G
T
 
T
P
 
P
D
 
T
T
 
E
V
 
I
R
 
L
R
 
Q
D
 
D
P
 
E
A
 
H
V
 
V
I
 
K
A
 
R
A
 
V
W
 
Y
L
 
L
G
 
G

6b89A E. Coli lptb in complex with adp and novobiocin (see paper)
33% identity, 96% coverage: 4:249/255 of query aligns to 3:234/234 of 6b89A

query
sites
6b89A
L
 
L
S
 
T
V
 
A
C
 
K
H
 
N
M
 
L
T
 
A
K
 
K
R
 
A
F
x
Y
G
 
K
G
 
G
L
x
R
T
 
R
A
x
V
V
 
V
D
 
E
N
 
D
V
 
V
S
 
S
L
 
L
S
 
T
I
 
V
N
 
N
Q
 
S
G
 
G
E
 
E
I
 
I
Y
 
V
G
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
C
 
T
F
 
F
N
 
Y
L
 
M
I
 
V
T
 
V
G
 
G
L
 
I
Y
 
V
P
 
P
A
 
R
D
 
D
S
 
A
G
 
G
E
 
N
F
 
I
A
 
I
I
 
I
G
 
D
G
 
D
E
 
D
A
 
D
Y
 
I
F
 
S
P
 
L
S
 
L
N
 
P
I
x
L
E
x
H
K
 
A
V
 
R
T
 
A
A
 
R
A
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
G
R
 
Y
T
 
L
F
x
P
Q
|
Q
N
 
E
V
x
A
R
x
S
L
 
I
F
|
F
N
x
R
N
x
R
M
x
L
S
 
S
V
 
V
L
 
Y
E
 
D
N
 
N
V
 
L
M
 
M
V
 
A
G
x
V
R
 
-
H
 
-
V
 
L
R
 
Q
T
 
I
R
 
R
N
 
D
G
 
D
L
 
L
W
 
S
A
 
A
A
 
-
I
 
-
S
 
-
R
 
E
H
 
Q
K
 
R
R
 
E
A
 
D
R
 
R
A
 
A
E
 
N
E
 
E
T
 
L
Q
 
M
T
 
E
R
 
E
E
 
F
L
 
H
A
 
I
W
 
E
H
 
H
L
 
L
L
 
R
D
 
D
Y
 
S
T
 
M
G
 
G
I
x
Q
S
 
S
Q
 
-
F
 
-
A
 
-
H
 
-
Y
 
-
R
 
-
A
 
-
C
 
-
D
 
-
L
 
L
A
 
S
Y
 
G
G
 
G
H
 
E
Q
 
R
R
 
R
R
 
R
L
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
|
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
A
E
 
N
P
 
P
R
 
K
L
 
F
L
 
I
A
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
V
N
 
D
A
 
P
A
 
I
E
 
S
K
 
V
M
 
I
A
 
D
L
 
I
G
 
K
E
 
R
L
 
I
L
 
I
L
 
E
R
 
H
I
 
L
R
 
R
D
 
D
D
 
S
G
 
G
K
 
L
T
 
G
L
 
V
L
 
L
M
 
I
I
 
T
E
 
D
H
 
H
D
 
N
V
 
V
K
 
R
L
 
E
V
 
T
M
 
L
G
 
A
I
 
V
C
 
C
D
 
E
R
 
R
L
 
A
M
 
Y
V
 
I
L
 
V
D
 
S
Y
 
Q
G
 
G
K
 
H
T
 
L
L
 
I
T
 
A
S
 
H
G
 
G
T
 
T
P
 
P
D
 
T
T
 
E
V
 
I
R
 
L
R
 
Q
D
 
D
P
 
E
A
 
H
V
 
V
I
 
K
A
 
R
A
 
V
W
 
Y
L
 
L

4p31A Crystal structure of a selenomethionine derivative of e. Coli lptb in complex with adp-magensium (see paper)
33% identity, 96% coverage: 4:249/255 of query aligns to 3:234/234 of 4p31A

query
sites
4p31A
L
 
L
S
 
T
V
 
A
C
 
K
H
 
N
M
 
L
T
 
A
K
 
K
R
 
A
F
x
Y
G
 
K
G
 
G
L
x
R
T
 
R
A
x
V
V
 
V
D
 
E
N
 
D
V
 
V
S
 
S
L
 
L
S
 
T
I
 
V
N
 
N
Q
 
S
G
 
G
E
 
E
I
 
I
Y
 
V
G
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
C
 
T
F
 
F
N
 
Y
L
 
M
I
 
V
T
 
V
G
 
G
L
 
I
Y
 
V
P
 
P
A
 
R
D
 
D
S
 
A
G
 
G
E
 
N
F
 
I
A
 
I
I
 
I
G
 
D
G
 
D
E
 
D
A
 
D
Y
 
I
F
 
S
P
 
L
S
 
L
N
 
P
I
 
L
E
 
H
K
 
A
V
 
R
T
 
A
A
 
R
A
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
G
R
 
Y
T
 
L
F
 
P
Q
|
Q
N
 
E
V
 
A
R
 
S
L
 
I
F
 
F
N
 
R
N
 
R
M
 
L
S
 
S
V
 
V
L
 
Y
E
 
D
N
 
N
V
 
L
M
 
M
V
 
A
G
 
V
R
 
-
H
 
-
V
 
L
R
 
Q
T
 
I
R
 
R
N
 
D
G
 
D
L
 
L
W
 
S
A
 
A
A
 
-
I
 
-
S
 
-
R
 
E
H
 
Q
K
 
R
R
 
E
A
 
D
R
 
R
A
 
A
E
 
N
E
 
E
T
 
L
Q
 
M
T
 
E
R
 
E
E
 
F
L
 
H
A
 
I
W
 
E
H
 
H
L
 
L
L
 
R
D
 
D
Y
 
S
T
 
M
G
 
G
I
 
Q
S
 
S
Q
 
-
F
 
-
A
 
-
H
 
-
Y
 
-
R
 
-
A
 
-
C
 
-
D
 
-
L
 
L
A
 
S
Y
 
G
G
 
G
H
 
E
Q
 
R
R
 
R
R
 
R
L
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
A
E
 
N
P
 
P
R
 
K
L
 
F
L
 
I
A
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
V
N
 
D
A
 
P
A
 
I
E
 
S
K
 
V
M
 
I
A
 
D
L
 
I
G
 
K
E
 
R
L
 
I
L
 
I
L
 
E
R
 
H
I
 
L
R
 
R
D
 
D
D
 
S
G
 
G
K
 
L
T
 
G
L
 
V
L
 
L
M
 
I
I
 
T
E
 
D
H
 
H
D
 
N
V
 
V
K
 
R
L
 
E
V
 
T
M
 
L
G
 
A
I
 
V
C
 
C
D
 
E
R
 
R
L
 
A
M
 
Y
V
 
I
L
 
V
D
 
S
Y
 
Q
G
 
G
K
 
H
T
 
L
L
 
I
T
 
A
S
 
H
G
 
G
T
 
T
P
 
P
D
 
T
T
 
E
V
 
I
R
 
L
R
 
Q
D
 
D
P
 
E
A
 
H
V
 
V
I
 
K
A
 
R
A
 
V
W
 
Y
L
 
L

6b8bA E. Coli lptb in complex with adp and a novobiocin derivative (see paper)
32% identity, 96% coverage: 4:248/255 of query aligns to 3:233/233 of 6b8bA

query
sites
6b8bA
L
 
L
S
 
T
V
 
A
C
 
K
H
 
N
M
 
L
T
 
A
K
 
K
R
 
A
F
x
Y
G
 
K
G
 
G
L
x
R
T
 
R
A
x
V
V
 
V
D
 
E
N
 
D
V
 
V
S
 
S
L
 
L
S
 
T
I
 
V
N
 
N
Q
 
S
G
 
G
E
 
E
I
 
I
Y
 
V
G
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
C
 
T
F
 
F
N
 
Y
L
 
M
I
 
V
T
 
V
G
 
G
L
 
I
Y
 
V
P
 
P
A
 
R
D
 
D
S
 
A
G
 
G
E
 
N
F
 
I
A
 
I
I
 
I
G
 
D
G
 
D
E
 
D
A
 
D
Y
 
I
F
 
S
P
 
L
S
 
L
N
 
P
I
 
L
E
 
H
K
 
A
V
 
R
T
 
A
A
 
R
A
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
G
R
 
Y
T
 
L
F
 
P
Q
 
Q
N
 
E
V
 
A
R
 
S
L
 
I
F
|
F
N
x
R
N
x
R
M
 
L
S
 
S
V
 
V
L
 
Y
E
 
D
N
 
N
V
 
L
M
 
M
V
 
A
G
 
V
R
 
-
H
 
-
V
 
L
R
 
Q
T
 
I
R
 
R
N
 
D
G
 
D
L
 
L
W
 
S
A
 
A
A
 
-
I
 
-
S
 
-
R
 
E
H
 
Q
K
 
R
R
 
E
A
 
D
R
 
R
A
 
A
E
 
N
E
 
E
T
 
L
Q
 
M
T
 
E
R
 
E
E
 
F
L
 
H
A
 
I
W
 
E
H
 
H
L
 
L
L
 
R
D
 
D
Y
 
S
T
 
M
G
 
G
I
 
Q
S
 
S
Q
 
-
F
 
-
A
 
-
H
 
-
Y
 
-
R
 
-
A
 
-
C
 
-
D
 
-
L
 
L
A
 
S
Y
 
G
G
 
G
H
 
E
Q
 
R
R
 
R
R
 
R
L
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
A
E
 
N
P
 
P
R
 
K
L
 
F
L
 
I
A
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
V
N
 
D
A
 
P
A
 
I
E
 
S
K
 
V
M
 
I
A
 
D
L
 
I
G
 
K
E
 
R
L
 
I
L
 
I
L
 
E
R
 
H
I
 
L
R
 
R
D
 
D
D
 
S
G
 
G
K
 
L
T
 
G
L
 
V
L
 
L
M
 
I
I
 
T
E
 
D
H
 
H
D
 
N
V
 
V
K
 
R
L
 
E
V
 
T
M
 
L
G
 
A
I
 
V
C
 
C
D
 
E
R
 
R
L
 
A
M
 
Y
V
 
I
L
 
V
D
 
S
Y
 
Q
G
 
G
K
 
H
T
 
L
L
 
I
T
 
A
S
 
H
G
 
G
T
 
T
P
 
P
D
 
T
T
 
E
V
 
I
R
 
L
R
 
Q
D
 
D
P
 
E
A
 
H
V
 
V
I
 
K
A
 
R
A
 
V
W
 
Y

6mjpA Lptb(e163q)fgc from vibrio cholerae (see paper)
30% identity, 98% coverage: 2:250/255 of query aligns to 1:235/240 of 6mjpA

query
sites
6mjpA
S
 
A
L
 
I
L
 
L
S
 
K
V
 
A
C
 
Q
H
 
H
M
 
L
T
 
A
K
 
K
R
 
S
F
 
Y
G
 
K
G
 
K
L
 
R
T
 
K
A
 
V
V
 
V
D
 
S
N
 
D
V
 
V
S
 
S
L
 
L
S
 
Q
I
 
V
N
 
E
Q
 
S
G
 
G
E
 
Q
I
 
I
Y
 
V
G
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
T
C
 
S
F
 
F
N
 
Y
L
 
M
I
 
I
T
 
V
G
 
G
L
 
L
Y
 
V
P
 
A
A
 
R
D
 
D
S
 
E
G
 
G
E
 
T
F
 
I
A
 
T
I
 
I
G
 
D
G
 
D
E
 
N
A
 
D
Y
 
I
F
 
S
P
 
I
S
 
L
N
 
P
I
 
M
E
 
H
K
 
S
V
 
R
T
 
S
A
 
R
A
 
M
G
 
G
I
 
I
A
 
G
R
 
Y
T
 
L
F
 
P
Q
 
Q
N
 
E
V
 
A
R
 
S
L
 
I
F
 
F
N
 
R
N
 
K
M
 
L
S
 
S
V
 
V
L
 
E
E
 
D
N
 
N
V
 
I
M
 
M
V
 
-
G
 
-
R
 
-
H
 
-
V
 
-
R
 
-
T
 
-
R
 
-
N
 
-
G
 
-
L
 
-
W
 
-
A
 
A
A
 
V
I
 
L
S
 
Q
R
 
T
H
 
R
K
 
E
R
 
E
A
 
L
R
 
T
A
 
H
E
|
E
E
 
E
T
 
R
Q
 
Q
T
x
D
R
 
K
E
 
-
L
 
-
A
 
L
W
 
E
H
 
D
L
 
L
L
 
L
D
 
E
Y
 
E
T
 
F
G
 
H
I
 
I
S
 
Q
Q
 
H
F
 
I
A
 
R
H
 
K
Y
 
S
R
 
A
A
 
G
C
 
M
D
 
A
L
 
L
A
 
S
Y
 
G
G
 
G
H
 
E
Q
 
R
R
 
R
R
 
R
L
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
A
E
 
N
P
 
P
R
 
Q
L
 
F
L
 
I
A
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
A
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
V
N
 
D
A
 
P
A
 
I
E
 
S
K
 
V
M
 
I
A
 
D
L
 
I
G
 
K
E
 
K
L
 
I
L
 
I
L
 
E
R
 
H
I
 
L
R
 
R
D
 
D
D
 
R
G
 
G
K
 
L
T
 
G
L
 
V
L
 
L
M
 
I
I
 
T
E
 
D
H
 
H
D
 
N
V
 
V
K
 
R
L
 
E
V
 
T
M
 
L
G
 
D
I
 
V
C
 
C
D
 
E
R
 
K
L
 
A
M
 
Y
V
 
I
L
 
V
D
 
S
Y
 
Q
G
 
G
K
 
R
T
 
L
L
 
I
T
 
A
S
 
E
G
 
G
T
 
T
P
 
P
D
 
Q
T
 
D
V
 
V
R
 
L
R
 
N
D
 
N
P
 
E
A
 
Q
V
 
V
I
 
K
A
 
Q
A
 
V
W
 
Y
L
 
L
G
 
G

P69874 Spermidine/putrescine import ATP-binding protein PotA; EC 7.6.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
31% identity, 97% coverage: 3:250/255 of query aligns to 17:249/378 of P69874

query
sites
P69874
L
 
L
L
 
V
S
 
Q
V
 
L
C
 
A
H
 
G
M
 
I
T
 
R
K
 
K
R
x
C
F
|
F
G
 
D
G
 
G
L
 
K
T
 
E
A
 
V
V
 
I
D
 
P
N
 
Q
V
 
L
S
 
D
L
 
L
S
 
T
I
 
I
N
 
N
Q
 
N
G
 
G
E
 
E
I
x
F
Y
 
L
G
 
T
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
 
G
A
x
C
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
T
C
 
V
F
x
L
N
 
R
L
 
L
I
 
I
T
 
A
G
 
G
L
 
L
Y
 
E
P
 
T
A
 
V
D
 
D
S
 
S
G
 
G
E
 
R
F
 
I
A
 
M
I
x
L
G
 
D
G
 
N
E
 
E
A
 
-
Y
 
-
F
 
-
P
 
-
S
 
-
N
 
D
I
 
I
E
 
T
K
 
H
V
 
V
T
 
P
A
 
A
A
 
E
G
 
N
-
 
R
-
 
Y
I
 
V
A
 
N
R
 
T
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
S
V
 
Y
R
 
A
L
 
L
F
 
F
N
 
P
N
 
H
M
 
M
S
 
T
V
 
V
L
 
F
E
 
E
N
 
N
V
 
V
M
 
A
V
 
F
G
 
G
R
 
-
H
 
-
V
 
-
R
 
-
T
 
-
R
 
-
N
 
-
G
 
-
L
 
-
W
 
-
A
 
-
A
 
-
I
 
-
S
 
L
R
 
R
H
 
M
K
 
Q
R
 
K
A
 
T
R
 
P
A
 
A
E
 
A
E
 
E
T
 
I
Q
 
T
T
 
P
R
 
R
E
 
-
L
 
-
A
 
V
W
 
M
H
 
E
L
 
A
L
 
L
D
 
R
Y
 
M
T
x
V
G
 
Q
I
 
L
S
 
E
Q
 
T
F
 
F
A
 
A
H
 
Q
Y
 
R
R
 
K
A
 
P
C
 
H
D
 
Q
L
 
L
A
 
S
Y
 
G
G
 
G
H
 
Q
Q
 
Q
R
 
Q
R
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
V
A
 
V
T
 
N
E
 
K
P
 
P
R
 
R
L
 
L
L
 
L
A
 
L
L
 
L
D
|
D
E
 
E
P
 
S
A
 
L
A
 
S
G
 
A
M
 
L
N
 
D
-
 
Y
A
 
K
A
 
L
E
 
R
K
 
K
M
 
Q
A
 
M
L
 
Q
G
 
N
E
 
E
L
 
L
L
 
K
L
 
A
R
 
L
I
 
Q
R
 
R
D
 
K
D
 
L
G
 
G
K
 
I
T
 
T
L
 
F
L
 
V
M
 
F
I
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
D
V
 
Q
K
 
E
L
 
E
V
 
A
M
 
L
G
 
T
I
 
M
C
 
S
D
 
D
R
 
R
L
 
I
M
 
V
V
 
V
L
 
M
D
 
R
Y
 
D
G
 
G
K
 
R
T
 
I
L
 
E
T
 
Q
S
 
D
G
 
G
T
 
T
P
 
P
D
 
R
T
 
E
V
 
I
R
 
Y
R
 
E
D
 
E
P
 
P
A
 
K
-
 
N
-
 
L
V
 
F
I
 
V
A
 
A
A
 
G
W
 
F
L
 
I
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3c4jA Abc protein artp in complex with atp-gamma-s
28% identity, 95% coverage: 1:242/255 of query aligns to 1:229/242 of 3c4jA

query
sites
3c4jA
M
 
L
S
 
Q
L
 
M
L
 
I
S
 
D
V
 
V
C
 
H
H
 
Q
M
 
L
T
 
K
K
 
K
R
 
S
F
|
F
G
 
G
G
 
S
L
 
L
T
 
E
A
x
V
V
 
L
D
 
K
N
 
G
V
 
I
S
 
N
L
 
V
S
 
H
I
 
I
N
 
R
Q
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
V
Y
 
V
G
 
V
L
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
C
 
F
F
 
L
N
 
R
L
 
C
I
 
L
T
 
N
G
 
L
L
 
L
Y
 
E
P
 
D
A
 
F
D
 
D
S
 
E
G
 
G
E
 
E
F
 
I
A
 
I
I
 
I
G
 
D
G
 
G
-
 
I
-
 
N
E
 
L
A
 
K
Y
 
A
F
 
K
P
 
D
S
 
T
N
 
N
I
 
L
E
 
N
K
 
K
V
 
V
T
 
R
A
 
E
A
 
E
G
 
-
I
 
V
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
R
V
 
F
R
 
N
L
 
L
F
 
F
N
 
P
N
 
H
M
 
M
S
 
T
V
 
V
L
 
L
E
 
N
N
 
N
V
 
I
M
 
T
V
 
L
G
 
A
R
 
-
H
 
P
V
 
M
R
 
K
T
 
V
R
 
R
N
 
K
G
 
-
L
 
-
W
 
W
A
 
P
A
 
-
I
 
-
S
 
-
R
 
-
H
 
-
K
 
-
R
 
R
A
 
E
R
 
K
A
 
A
E
 
E
E
 
A
T
 
K
Q
 
-
T
 
-
R
 
-
E
 
-
L
 
-
A
 
A
W
 
M
H
 
E
L
 
L
L
 
L
D
 
D
Y
 
K
T
 
V
G
 
G
I
 
L
S
 
K
Q
 
D
F
 
K
A
 
A
H
 
H
Y
 
A
R
 
Y
A
 
P
C
 
D
D
 
S
L
 
L
A
 
S
Y
 
G
G
 
G
H
 
Q
Q
 
A
R
 
Q
R
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
M
E
 
E
P
 
P
R
 
K
L
 
I
L
 
M
A
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
L
N
 
D
A
 
P
A
 
E
E
 
M
K
 
V
M
 
G
A
 
E
L
 
V
G
 
L
E
 
S
L
 
V
L
 
M
L
 
K
R
 
Q
I
 
L
R
 
A
D
 
N
D
 
E
G
 
G
K
 
M
T
 
T
L
 
M
L
 
V
M
 
V
I
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
E
V
 
M
K
 
G
L
 
F
V
 
A
M
 
R
G
 
E
I
 
V
C
 
G
D
 
D
R
 
R
L
 
V
M
 
L
V
 
F
L
 
M
D
 
D
Y
 
G
G
 
G
K
 
Y
T
 
I
L
 
I
T
 
E
S
 
E
G
 
G
T
 
K
P
 
P
D
 
E
T
 
D
V
 
L
R
 
F
R
 
D
D
 
R
P
 
P

3c41J Abc protein artp in complex with amp-pnp/mg2+
28% identity, 95% coverage: 1:242/255 of query aligns to 1:229/242 of 3c41J

query
sites
3c41J
M
 
L
S
 
Q
L
 
M
L
 
I
S
 
D
V
 
V
C
 
H
H
 
Q
M
 
L
T
 
K
K
 
K
R
 
S
F
|
F
G
 
G
G
 
S
L
 
L
T
 
E
A
x
V
V
 
L
D
 
K
N
 
G
V
 
I
S
 
N
L
 
V
S
 
H
I
 
I
N
 
R
Q
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
V
Y
 
V
G
 
V
L
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
C
 
F
F
 
L
N
 
R
L
 
C
I
 
L
T
 
N
G
 
L
L
 
L
Y
 
E
P
 
D
A
 
F
D
 
D
S
 
E
G
 
G
E
 
E
F
 
I
A
 
I
I
 
I
G
 
D
G
 
G
-
 
I
-
 
N
E
 
L
A
 
K
Y
 
A
F
 
K
P
 
D
S
 
T
N
 
N
I
 
L
E
 
N
K
 
K
V
 
V
T
 
R
A
 
E
A
 
E
G
 
-
I
 
V
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
R
V
 
F
R
 
N
L
 
L
F
 
F
N
 
P
N
 
H
M
 
M
S
 
T
V
 
V
L
 
L
E
 
N
N
 
N
V
 
I
M
 
T
V
 
L
G
 
A
R
 
-
H
 
P
V
 
M
R
 
K
T
 
V
R
 
R
N
 
K
G
 
-
L
 
-
W
 
W
A
 
P
A
 
-
I
 
-
S
 
-
R
 
-
H
 
-
K
 
-
R
 
R
A
 
E
R
 
K
A
 
A
E
 
E
E
 
A
T
 
K
Q
 
-
T
 
-
R
 
-
E
 
-
L
 
-
A
 
A
W
 
M
H
 
E
L
 
L
L
 
L
D
 
D
Y
 
K
T
 
V
G
 
G
I
 
L
S
 
K
Q
 
D
F
 
K
A
 
A
H
 
H
Y
 
A
R
 
Y
A
 
P
C
 
D
D
 
S
L
 
L
A
 
S
Y
 
G
G
 
G
H
 
Q
Q
 
A
R
 
Q
R
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
M
E
 
E
P
 
P
R
 
K
L
 
I
L
 
M
A
 
L
L
 
F
D
|
D
E
 
E
P
 
P
A
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
L
N
 
D
A
 
P
A
 
E
E
 
M
K
 
V
M
 
G
A
 
E
L
 
V
G
 
L
E
 
S
L
 
V
L
 
M
L
 
K
R
 
Q
I
 
L
R
 
A
D
 
N
D
 
E
G
 
G
K
 
M
T
 
T
L
 
M
L
 
V
M
 
V
I
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
E
V
 
M
K
 
G
L
 
F
V
 
A
M
 
R
G
 
E
I
 
V
C
 
G
D
 
D
R
 
R
L
 
V
M
 
L
V
 
F
L
 
M
D
 
D
Y
 
G
G
 
G
K
 
Y
T
 
I
L
 
I
T
 
E
S
 
E
G
 
G
T
 
K
P
 
P
D
 
E
T
 
D
V
 
L
R
 
F
R
 
D
D
 
R
P
 
P

2olkA Abc protein artp in complex with adp-beta-s
28% identity, 95% coverage: 1:242/255 of query aligns to 1:229/242 of 2olkA

query
sites
2olkA
M
 
L
S
 
Q
L
 
M
L
 
I
S
 
D
V
 
V
C
 
H
H
 
Q
M
 
L
T
 
K
K
 
K
R
 
S
F
|
F
G
 
G
G
 
S
L
 
L
T
 
E
A
x
V
V
 
L
D
 
K
N
 
G
V
 
I
S
 
N
L
 
V
S
 
H
I
 
I
N
 
R
Q
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
V
Y
 
V
G
 
V
L
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
C
 
F
F
 
L
N
 
R
L
 
C
I
 
L
T
 
N
G
 
L
L
 
L
Y
 
E
P
 
D
A
 
F
D
 
D
S
 
E
G
 
G
E
 
E
F
 
I
A
 
I
I
 
I
G
 
D
G
 
G
-
 
I
-
 
N
E
 
L
A
 
K
Y
 
A
F
 
K
P
 
D
S
 
T
N
 
N
I
 
L
E
 
N
K
 
K
V
 
V
T
 
R
A
 
E
A
 
E
G
 
-
I
 
V
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
R
V
 
F
R
 
N
L
 
L
F
 
F
N
 
P
N
 
H
M
 
M
S
 
T
V
 
V
L
 
L
E
 
N
N
 
N
V
 
I
M
 
T
V
 
L
G
 
A
R
 
-
H
 
P
V
 
M
R
 
K
T
 
V
R
 
R
N
 
K
G
 
-
L
 
-
W
 
W
A
 
P
A
 
-
I
 
-
S
 
-
R
 
-
H
 
-
K
 
-
R
 
R
A
 
E
R
 
K
A
 
A
E
 
E
E
 
A
T
 
K
Q
 
-
T
 
-
R
 
-
E
 
-
L
 
-
A
 
A
W
 
M
H
 
E
L
 
L
L
 
L
D
 
D
Y
 
K
T
 
V
G
 
G
I
 
L
S
 
K
Q
 
D
F
 
K
A
 
A
H
 
H
Y
 
A
R
 
Y
A
 
P
C
 
D
D
 
S
L
 
L
A
 
S
Y
 
G
G
 
G
H
 
Q
Q
 
A
R
 
Q
R
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
M
E
 
E
P
 
P
R
 
K
L
 
I
L
 
M
A
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
L
N
 
D
A
 
P
A
 
E
E
 
M
K
 
V
M
 
G
A
 
E
L
 
V
G
 
L
E
 
S
L
 
V
L
 
M
L
 
K
R
 
Q
I
 
L
R
 
A
D
 
N
D
 
E
G
 
G
K
 
M
T
 
T
L
 
M
L
 
V
M
 
V
I
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
E
V
 
M
K
 
G
L
 
F
V
 
A
M
 
R
G
 
E
I
 
V
C
 
G
D
 
D
R
 
R
L
 
V
M
 
L
V
 
F
L
 
M
D
 
D
Y
 
G
G
 
G
K
 
Y
T
 
I
L
 
I
T
 
E
S
 
E
G
 
G
T
 
K
P
 
P
D
 
E
T
 
D
V
 
L
R
 
F
R
 
D
D
 
R
P
 
P

2oljA Abc protein artp in complex with adp/mg2+
28% identity, 95% coverage: 1:242/255 of query aligns to 1:229/242 of 2oljA

query
sites
2oljA
M
 
L
S
 
Q
L
 
M
L
 
I
S
 
D
V
 
V
C
 
H
H
 
Q
M
 
L
T
 
K
K
 
K
R
 
S
F
|
F
G
 
G
G
 
S
L
 
L
T
 
E
A
x
V
V
 
L
D
 
K
N
 
G
V
 
I
S
 
N
L
 
V
S
 
H
I
 
I
N
 
R
Q
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
V
Y
 
V
G
 
V
L
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
C
 
F
F
 
L
N
 
R
L
 
C
I
 
L
T
 
N
G
 
L
L
 
L
Y
 
E
P
 
D
A
 
F
D
 
D
S
 
E
G
 
G
E
 
E
F
 
I
A
 
I
I
 
I
G
 
D
G
 
G
-
 
I
-
 
N
E
 
L
A
 
K
Y
 
A
F
 
K
P
 
D
S
 
T
N
 
N
I
 
L
E
 
N
K
 
K
V
 
V
T
 
R
A
 
E
A
 
E
G
 
-
I
 
V
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
R
V
 
F
R
 
N
L
 
L
F
 
F
N
 
P
N
 
H
M
 
M
S
 
T
V
 
V
L
 
L
E
 
N
N
 
N
V
 
I
M
 
T
V
 
L
G
 
A
R
 
-
H
 
P
V
 
M
R
 
K
T
 
V
R
 
R
N
 
K
G
 
-
L
 
-
W
 
W
A
 
P
A
 
-
I
 
-
S
 
-
R
 
-
H
 
-
K
 
-
R
 
R
A
 
E
R
 
K
A
 
A
E
 
E
E
 
A
T
 
K
Q
 
-
T
 
-
R
 
-
E
 
-
L
 
-
A
 
A
W
 
M
H
 
E
L
 
L
L
 
L
D
 
D
Y
 
K
T
 
V
G
 
G
I
 
L
S
 
K
Q
 
D
F
 
K
A
 
A
H
 
H
Y
 
A
R
 
Y
A
 
P
C
 
D
D
 
S
L
 
L
A
 
S
Y
 
G
G
 
G
H
 
Q
Q
 
A
R
 
Q
R
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
M
E
 
E
P
 
P
R
 
K
L
 
I
L
 
M
A
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
L
N
 
D
A
 
P
A
 
E
E
 
M
K
 
V
M
 
G
A
 
E
L
 
V
G
 
L
E
 
S
L
 
V
L
 
M
L
 
K
R
 
Q
I
 
L
R
 
A
D
 
N
D
 
E
G
 
G
K
 
M
T
 
T
L
 
M
L
 
V
M
 
V
I
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
E
V
 
M
K
 
G
L
 
F
V
 
A
M
 
R
G
 
E
I
 
V
C
 
G
D
 
D
R
 
R
L
 
V
M
 
L
V
 
F
L
 
M
D
 
D
Y
 
G
G
 
G
K
 
Y
T
 
I
L
 
I
T
 
E
S
 
E
G
 
G
T
 
K
P
 
P
D
 
E
T
 
D
V
 
L
R
 
F
R
 
D
D
 
R
P
 
P

4u00A Crystal structure of ttha1159 in complex with adp (see paper)
29% identity, 95% coverage: 2:242/255 of query aligns to 1:227/241 of 4u00A

query
sites
4u00A
S
 
P
L
 
I
L
 
I
S
 
R
V
 
I
C
 
R
H
 
N
M
 
L
T
 
H
K
 
K
R
 
W
F
|
F
G
 
G
G
 
P
L
 
L
T
 
H
A
x
V
V
 
L
D
 
K
N
 
G
V
 
I
S
 
H
L
 
L
S
 
E
I
 
V
N
 
A
Q
 
P
G
 
G
E
 
E
I
 
K
Y
 
L
G
 
V
L
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
C
 
L
F
 
I
N
 
R
L
 
T
I
 
I
T
 
N
G
 
R
L
 
L
Y
 
E
P
 
D
A
 
F
D
 
Q
S
 
E
G
 
G
E
 
E
F
 
V
A
 
V
I
 
V
G
 
D
G
 
G
E
 
L
A
 
S
Y
 
V
F
 
K
P
 
D
S
 
D
N
 
R
I
 
A
E
 
L
K
 
R
V
 
E
T
 
I
A
 
R
A
 
R
G
 
E
I
 
V
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
Q
V
 
F
R
 
N
L
 
L
F
 
F
N
 
P
N
 
H
M
 
M
S
 
T
V
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
V
M
 
T
V
 
L
G
 
A
R
 
-
H
 
P
V
 
M
R
 
R
T
 
V
R
 
R
N
 
-
G
 
-
L
 
-
W
 
-
A
 
-
A
 
-
I
 
-
S
 
-
R
 
R
H
 
W
K
 
P
R
 
R
A
 
E
R
 
K
A
 
A
E
 
E
E
 
K
T
 
K
Q
 
-
T
 
-
R
 
-
E
 
-
L
 
-
A
 
A
W
 
L
H
 
E
L
 
L
L
 
L
D
 
E
Y
 
R
T
 
V
G
 
G
I
 
I
S
 
L
Q
 
D
F
 
Q
A
 
A
H
 
R
Y
 
K
R
 
Y
A
 
P
C
 
A
D
 
Q
L
 
L
A
 
S
Y
 
G
G
 
G
H
 
Q
Q
 
Q
R
 
Q
R
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
M
E
 
E
P
 
P
R
 
K
L
 
I
L
 
M
A
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
L
N
 
D
A
 
P
A
 
E
E
 
-
K
 
-
M
 
-
A
 
M
L
 
V
G
 
G
E
 
E
L
 
V
L
 
L
L
 
D
R
 
V
I
 
M
R
 
R
D
 
D
-
 
L
-
 
A
-
 
Q
D
 
G
G
 
G
K
 
M
T
 
T
L
 
M
L
 
V
M
 
V
I
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
E
V
 
M
K
 
G
L
 
F
V
 
A
M
 
R
G
 
E
I
 
V
C
 
A
D
 
D
R
 
R
L
 
V
M
 
V
V
 
F
L
 
M
D
 
D
Y
 
G
G
 
G
K
 
Q
T
 
I
L
 
V
T
 
E
S
 
E
G
 
G
T
 
R
P
 
P
D
 
E
T
 
E
V
 
I
R
 
F
R
 
T
D
 
R
P
 
P

1oxvD Crystal structure of glcv, the abc-atpase of the glucose abc transporter from sulfolobus solfataricus (see paper)
31% identity, 100% coverage: 1:254/255 of query aligns to 1:245/353 of 1oxvD

query
sites
1oxvD
M
 
M
S
 
V
L
 
R
L
 
I
S
 
I
V
 
V
C
 
K
H
 
N
M
 
V
T
 
S
K
 
K
R
 
V
F
|
F
-
 
K
-
 
K
G
 
G
G
 
K
L
 
V
T
 
V
A
 
A
V
 
L
D
 
D
N
 
N
V
 
V
S
 
N
L
 
I
S
 
N
I
 
I
N
 
E
Q
 
N
G
 
G
E
 
E
I
 
R
Y
 
F
G
 
G
L
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
C
 
F
F
 
M
N
 
R
L
 
I
I
 
I
T
 
A
G
 
G
L
 
L
Y
 
D
P
 
V
A
 
P
D
 
S
S
 
T
G
 
G
E
 
E
F
 
L
-
 
Y
-
 
F
-
 
D
-
 
D
-
 
R
-
 
L
-
 
V
A
 
A
I
 
S
G
 
N
G
 
G
E
 
K
A
 
L
Y
 
I
F
 
V
P
 
P
S
 
P
N
 
E
I
 
D
E
 
R
K
 
K
V
 
-
T
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
I
 
I
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
|
Q
N
 
T
V
 
W
R
 
A
L
 
L
F
 
Y
N
 
P
N
 
N
M
 
L
S
 
T
V
 
A
L
 
F
E
 
E
N
 
N
V
 
I
M
 
A
V
 
F
G
 
-
R
 
-
H
 
-
V
 
-
R
 
-
T
 
-
R
 
-
N
 
-
G
 
-
L
 
-
W
 
-
A
 
-
A
 
P
I
 
L
S
 
T
R
 
N
H
 
M
K
 
K
R
 
M
A
 
S
R
 
K
A
 
E
E
 
E
E
 
I
T
 
R
Q
 
K
T
 
R
R
 
V
E
 
E
L
 
E
A
 
V
W
 
A
H
 
K
L
 
I
L
 
L
D
 
D
Y
 
-
T
 
-
G
 
-
I
 
I
S
 
H
Q
 
H
F
 
V
A
 
L
H
 
N
Y
 
H
R
 
F
A
 
P
C
 
R
D
 
E
L
 
L
A
 
S
Y
 
G
G
 
G
H
 
Q
Q
 
Q
R
 
Q
R
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
V
T
 
K
E
 
D
P
 
P
R
 
S
L
 
L
L
 
L
A
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
A
 
F
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
A
 
A
A
 
R
E
 
M
K
 
R
M
 
D
A
 
S
L
 
A
G
 
R
E
 
A
L
 
L
L
 
V
L
 
K
R
 
E
I
 
V
R
 
Q
D
 
S
D
 
R
-
 
L
G
 
G
K
 
V
T
 
T
L
 
L
L
 
L
M
 
V
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
V
 
P
K
 
A
L
 
D
V
 
I
M
 
F
G
 
A
I
 
I
C
 
A
D
 
D
R
 
R
L
 
V
M
 
G
V
 
V
L
 
L
D
 
V
Y
 
K
G
 
G
K
 
K
T
 
L
L
 
V
T
 
Q
S
 
V
G
 
G
T
 
K
P
 
P
D
 
E
T
 
D
V
 
L
R
 
Y
R
 
D
D
 
N
P
 
P
A
 
V
V
 
S
I
 
I
-
 
Q
A
 
V
A
 
A
W
 
S
L
 
L
G
 
I
G
 
G
N
 
E
I
 
I
H
 
N

1oxvA Crystal structure of glcv, the abc-atpase of the glucose abc transporter from sulfolobus solfataricus (see paper)
31% identity, 100% coverage: 1:254/255 of query aligns to 1:245/353 of 1oxvA

query
sites
1oxvA
M
 
M
S
 
V
L
 
R
L
 
I
S
 
I
V
 
V
C
 
K
H
 
N
M
 
V
T
 
S
K
 
K
R
 
V
F
|
F
-
 
K
-
 
K
G
 
G
G
 
K
L
 
V
T
 
V
A
 
A
V
 
L
D
 
D
N
 
N
V
 
V
S
 
N
L
 
I
S
 
N
I
 
I
N
 
E
Q
 
N
G
 
G
E
 
E
I
 
R
Y
 
F
G
 
G
L
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
C
 
F
F
 
M
N
 
R
L
 
I
I
 
I
T
 
A
G
 
G
L
 
L
Y
 
D
P
 
V
A
 
P
D
 
S
S
 
T
G
 
G
E
 
E
F
 
L
-
 
Y
-
 
F
-
 
D
-
 
D
-
 
R
-
 
L
-
 
V
A
 
A
I
 
S
G
 
N
G
 
G
E
 
K
A
 
L
Y
 
I
F
 
V
P
 
P
S
 
P
N
 
E
I
 
D
E
 
R
K
 
K
V
 
-
T
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
I
 
I
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
T
V
 
W
R
 
A
L
 
L
F
 
Y
N
 
P
N
 
N
M
 
L
S
 
T
V
 
A
L
 
F
E
 
E
N
 
N
V
 
I
M
 
A
V
 
F
G
 
-
R
 
-
H
 
-
V
 
-
R
 
-
T
 
-
R
 
-
N
 
-
G
 
-
L
 
-
W
 
-
A
 
-
A
 
P
I
 
L
S
 
T
R
 
N
H
 
M
K
 
K
R
 
M
A
 
S
R
 
K
A
 
E
E
 
E
E
 
I
T
 
R
Q
 
K
T
 
R
R
 
V
E
 
E
L
 
E
A
 
V
W
 
A
H
 
K
L
 
I
L
 
L
D
 
D
Y
 
-
T
 
-
G
 
-
I
 
I
S
 
H
Q
 
H
F
 
V
A
 
L
H
 
N
Y
 
H
R
 
F
A
 
P
C
 
R
D
 
E
L
 
L
A
 
S
Y
 
G
G
 
G
H
 
Q
Q
 
Q
R
 
Q
R
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
V
T
 
K
E
 
D
P
 
P
R
 
S
L
 
L
L
 
L
A
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
A
 
F
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
A
 
A
A
 
R
E
 
M
K
 
R
M
 
D
A
 
S
L
 
A
G
 
R
E
 
A
L
 
L
L
 
V
L
 
K
R
 
E
I
 
V
R
 
Q
D
 
S
D
 
R
-
 
L
G
 
G
K
 
V
T
 
T
L
 
L
L
 
L
M
 
V
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
V
 
P
K
 
A
L
 
D
V
 
I
M
 
F
G
 
A
I
 
I
C
 
A
D
 
D
R
 
R
L
 
V
M
 
G
V
 
V
L
 
L
D
 
V
Y
 
K
G
 
G
K
 
K
T
 
L
L
 
V
T
 
Q
S
 
V
G
 
G
T
 
K
P
 
P
D
 
E
T
 
D
V
 
L
R
 
Y
R
 
D
D
 
N
P
 
P
A
 
V
V
 
S
I
 
I
-
 
Q
A
 
V
A
 
A
W
 
S
L
 
L
G
 
I
G
 
G
N
 
E
I
 
I
H
 
N

1oxuA Crystal structure of glcv, the abc-atpase of the glucose abc transporter from sulfolobus solfataricus (see paper)
31% identity, 100% coverage: 1:254/255 of query aligns to 1:245/353 of 1oxuA

query
sites
1oxuA
M
 
M
S
 
V
L
 
R
L
 
I
S
 
I
V
 
V
C
 
K
H
 
N
M
 
V
T
 
S
K
 
K
R
 
V
F
|
F
-
 
K
-
 
K
G
 
G
G
 
K
L
 
V
T
 
V
A
|
A
V
 
L
D
 
D
N
 
N
V
 
V
S
 
N
L
 
I
S
 
N
I
 
I
N
 
E
Q
 
N
G
 
G
E
 
E
I
 
R
Y
 
F
G
 
G
L
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
C
 
F
F
 
M
N
 
R
L
 
I
I
 
I
T
 
A
G
 
G
L
 
L
Y
 
D
P
 
V
A
 
P
D
 
S
S
 
T
G
 
G
E
 
E
F
 
L
-
 
Y
-
 
F
-
 
D
-
 
D
-
 
R
-
 
L
-
 
V
A
 
A
I
 
S
G
 
N
G
 
G
E
 
K
A
 
L
Y
 
I
F
 
V
P
 
P
S
 
P
N
 
E
I
 
D
E
 
R
K
 
K
V
 
-
T
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
I
 
I
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
T
V
 
W
R
 
A
L
 
L
F
 
Y
N
 
P
N
 
N
M
 
L
S
 
T
V
 
A
L
 
F
E
 
E
N
 
N
V
 
I
M
 
A
V
 
F
G
 
-
R
 
-
H
 
-
V
 
-
R
 
-
T
 
-
R
 
-
N
 
-
G
 
-
L
 
-
W
 
-
A
 
-
A
 
P
I
 
L
S
 
T
R
 
N
H
 
M
K
 
K
R
 
M
A
 
S
R
 
K
A
 
E
E
 
E
E
 
I
T
 
R
Q
 
K
T
 
R
R
 
V
E
 
E
L
 
E
A
 
V
W
 
A
H
 
K
L
 
I
L
 
L
D
 
D
Y
 
-
T
 
-
G
 
-
I
 
I
S
 
H
Q
 
H
F
 
V
A
 
L
H
 
N
Y
 
H
R
 
F
A
 
P
C
 
R
D
 
E
L
 
L
A
 
S
Y
 
G
G
 
G
H
 
Q
Q
 
Q
R
 
Q
R
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
V
T
 
K
E
 
D
P
 
P
R
 
S
L
 
L
L
 
L
A
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
F
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
A
 
A
A
 
R
E
 
M
K
 
R
M
 
D
A
 
S
L
 
A
G
 
R
E
 
A
L
 
L
L
 
V
L
 
K
R
 
E
I
 
V
R
 
Q
D
 
S
D
 
R
-
 
L
G
 
G
K
 
V
T
 
T
L
 
L
L
 
L
M
 
V
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
V
 
P
K
 
A
L
 
D
V
 
I
M
 
F
G
 
A
I
 
I
C
 
A
D
 
D
R
 
R
L
 
V
M
 
G
V
 
V
L
 
L
D
 
V
Y
 
K
G
 
G
K
 
K
T
 
L
L
 
V
T
 
Q
S
 
V
G
 
G
T
 
K
P
 
P
D
 
E
T
 
D
V
 
L
R
 
Y
R
 
D
D
 
N
P
 
P
A
 
V
V
 
S
I
 
I
-
 
Q
A
 
V
A
 
A
W
 
S
L
 
L
G
 
I
G
 
G
N
 
E
I
 
I
H
 
N

Q97UY8 Glucose import ATP-binding protein GlcV; EC 7.5.2.- from Saccharolobus solfataricus (strain ATCC 35092 / DSM 1617 / JCM 11322 / P2) (Sulfolobus solfataricus) (see paper)
31% identity, 100% coverage: 1:254/255 of query aligns to 1:245/353 of Q97UY8

query
sites
Q97UY8
M
 
M
S
 
V
L
 
R
L
 
I
S
 
I
V
 
V
C
 
K
H
 
N
M
 
V
T
 
S
K
 
K
R
 
V
F
 
F
-
 
K
-
 
K
G
 
G
G
 
K
L
 
V
T
 
V
A
 
A
V
 
L
D
 
D
N
 
N
V
 
V
S
 
N
L
 
I
S
 
N
I
 
I
N
 
E
Q
 
N
G
 
G
E
 
E
I
 
R
Y
 
F
G
 
G
L
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
T
C
 
F
F
 
M
N
 
R
L
 
I
I
 
I
T
 
A
G
 
G
L
 
L
Y
 
D
P
 
V
A
 
P
D
 
S
S
 
T
G
 
G
E
 
E
F
 
L
-
 
Y
-
 
F
-
 
D
-
 
D
-
 
R
-
 
L
-
 
V
A
 
A
I
 
S
G
 
N
G
 
G
E
 
K
A
 
L
Y
 
I
F
 
V
P
 
P
S
 
P
N
 
E
I
 
D
E
 
R
K
 
K
V
 
-
T
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
I
 
I
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
T
V
 
W
R
 
A
L
 
L
F
 
Y
N
 
P
N
 
N
M
 
L
S
 
T
V
 
A
L
 
F
E
 
E
N
 
N
V
 
I
M
 
A
V
 
F
G
 
-
R
 
-
H
 
-
V
 
-
R
 
-
T
 
-
R
 
-
N
 
-
G
 
-
L
 
-
W
 
-
A
 
-
A
 
P
I
 
L
S
 
T
R
 
N
H
 
M
K
 
K
R
 
M
A
 
S
R
 
K
A
 
E
E
 
E
E
 
I
T
 
R
Q
 
K
T
 
R
R
 
V
E
 
E
L
 
E
A
 
V
W
 
A
H
 
K
L
 
I
L
 
L
D
 
D
Y
 
-
T
 
-
G
 
-
I
 
I
S
 
H
Q
 
H
F
 
V
A
 
L
H
 
N
Y
 
H
R
 
F
A
 
P
C
 
R
D
 
E
L
 
L
A
x
S
Y
 
G
G
|
G
H
 
Q
Q
 
Q
R
 
Q
R
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
V
T
 
K
E
 
D
P
 
P
R
 
S
L
 
L
L
 
L
A
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
A
 
F
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
A
 
A
A
 
R
E
 
M
K
 
R
M
 
D
A
 
S
L
 
A
G
 
R
E
 
A
L
 
L
L
 
V
L
 
K
R
 
E
I
 
V
R
 
Q
D
 
S
D
 
R
-
 
L
G
 
G
K
 
V
T
 
T
L
 
L
L
 
L
M
 
V
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
V
 
P
K
 
A
L
 
D
V
 
I
M
 
F
G
 
A
I
 
I
C
 
A
D
 
D
R
 
R
L
 
V
M
 
G
V
 
V
L
 
L
D
 
V
Y
 
K
G
 
G
K
 
K
T
 
L
L
 
V
T
 
Q
S
 
V
G
 
G
T
 
K
P
 
P
D
 
E
T
 
D
V
 
L
R
 
Y
R
 
D
D
 
N
P
 
P
A
 
V
V
 
S
I
 
I
-
 
Q
A
 
V
A
 
A
W
 
S
L
 
L
G
 
I
G
 
G
N
 
E
I
 
I
H
 
N

Query Sequence

>BWI76_RS07270 BWI76_RS07270 ABC transporter ATP-binding protein
MSLLSVCHMTKRFGGLTAVDNVSLSINQGEIYGLIGPNGAGKTTCFNLITGLYPADSGEF
AIGGEAYFPSNIEKVTAAGIARTFQNVRLFNNMSVLENVMVGRHVRTRNGLWAAISRHKR
ARAEETQTRELAWHLLDYTGISQFAHYRACDLAYGHQRRLEIARALATEPRLLALDEPAA
GMNAAEKMALGELLLRIRDDGKTLLMIEHDVKLVMGICDRLMVLDYGKTLTSGTPDTVRR
DPAVIAAWLGGNIHV

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory