SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing BWI76_RS07640 BWI76_RS07640 short chain dehydrogenase to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4urfB Molecular genetic and crystal structural analysis of 1-(4- hydroxyphenyl)-ethanol dehydrogenase from aromatoleum aromaticum ebn1 (see paper)
42% identity, 95% coverage: 13:260/261 of query aligns to 3:247/248 of 4urfB

query
sites
4urfB
L
 
L
Q
 
E
D
 
G
R
 
K
V
 
T
A
 
A
F
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
|
G
S
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
Q
 
R
M
 
T
I
 
I
A
 
A
Y
 
L
G
 
T
L
 
Y
A
 
A
S
 
A
A
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
N
V
 
V
V
 
V
C
 
V
F
 
S
D
|
D
L
x
I
R
 
S
E
 
D
D
 
E
G
 
W
G
 
G
L
 
-
A
 
R
E
 
E
T
 
T
V
 
L
K
 
A
N
 
L
I
 
I
E
 
E
A
 
G
I
 
K
G
 
G
G
 
G
E
 
K
A
 
A
C
 
V
F
 
F
Y
 
Q
T
 
H
G
 
A
D
|
D
V
x
T
R
 
A
Q
 
H
L
 
P
S
 
E
D
 
D
L
 
H
R
 
D
A
 
E
G
 
L
V
 
I
A
 
A
L
 
A
A
 
A
K
 
K
S
 
R
R
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
I
A
 
A
V
 
C
N
 
N
A
x
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
A
 
S
N
x
G
A
 
E
-
 
F
N
 
T
P
 
P
A
 
T
L
 
A
E
 
E
M
 
T
E
 
T
T
 
D
E
 
A
Q
 
Q
W
 
W
Q
 
Q
R
|
R
V
 
V
I
 
I
D
 
G
I
 
I
N
 
N
L
 
L
T
 
S
G
 
G
V
 
V
W
 
F
N
 
Y
S
 
G
C
 
V
K
 
R
A
 
A
E
 
Q
A
 
I
E
 
R
L
 
A
M
 
M
Q
 
L
E
 
E
T
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
A
I
 
I
I
 
V
N
 
N
I
|
I
A
 
S
S
|
S
M
 
I
S
 
A
G
 
G
I
 
Q
I
 
I
V
 
G
N
 
I
R
 
E
G
 
G
L
x
I
D
 
T
Q
 
P
A
 
-
H
 
-
Y
|
Y
N
 
T
C
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
H
G
 
G
V
 
V
I
 
V
H
 
G
L
 
L
S
 
T
K
 
K
S
 
T
L
 
V
A
 
A
M
 
W
E
 
E
W
 
Y
I
 
G
G
 
S
K
 
K
G
 
G
I
 
I
R
|
R
V
 
I
N
 
N
S
 
S
I
 
V
S
 
G
P
|
P
G
x
A
Y
 
F
T
x
I
A
 
N
T
|
T
-
 
T
-
 
L
-
 
V
-
 
Q
-
 
N
-
 
V
P
 
P
M
 
L
N
 
E
T
 
T
R
 
R
P
 
-
E
 
-
M
 
-
V
 
-
H
 
-
Q
 
-
T
 
-
R
 
R
E
 
Q
F
 
L
E
 
E
S
 
Q
Q
 
M
T
 
H
P
 
A
I
x
L
Q
x
R
R
|
R
M
 
L
A
 
G
K
 
E
V
 
T
E
 
E
E
 
E
M
 
V
A
 
A
G
 
N
P
 
L
A
 
V
L
 
A
F
 
W
L
 
L
A
 
S
S
|
S
D
 
D
A
 
K
A
 
A
S
 
S
F
 
F
C
 
V
T
 
T
G
 
G
V
 
S
D
 
Y
L
 
Y
V
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
Y
V
 
L
C
 
A

4urfA Molecular genetic and crystal structural analysis of 1-(4- hydroxyphenyl)-ethanol dehydrogenase from aromatoleum aromaticum ebn1 (see paper)
42% identity, 95% coverage: 13:260/261 of query aligns to 3:247/248 of 4urfA

query
sites
4urfA
L
 
L
Q
 
E
D
 
G
R
 
K
V
 
T
A
 
A
F
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
|
G
S
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
Q
 
R
M
 
T
I
 
I
A
 
A
Y
 
L
G
 
T
L
 
Y
A
 
A
S
 
A
A
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
N
V
 
V
V
 
V
C
 
V
F
 
S
D
|
D
L
x
I
R
 
S
E
 
D
D
 
E
G
x
W
G
 
G
L
 
-
A
 
R
E
 
E
T
 
T
V
 
L
K
 
A
N
 
L
I
 
I
E
 
E
A
 
G
I
 
K
G
 
G
G
 
G
E
 
K
A
 
A
C
 
V
F
 
F
Y
 
Q
T
 
H
G
 
A
D
|
D
V
x
T
R
 
A
Q
 
H
L
 
P
S
 
E
D
 
D
L
 
H
R
 
D
A
 
E
G
 
L
V
 
I
A
 
A
L
 
A
A
 
A
K
 
K
S
 
R
R
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
I
A
 
A
V
 
C
N
 
N
A
x
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
A
x
S
N
x
G
A
x
E
-
 
F
N
x
T
P
 
P
A
 
T
L
 
A
E
|
E
M
 
T
E
x
T
T
 
D
E
 
A
Q
|
Q
W
 
W
Q
 
Q
R
|
R
V
 
V
I
 
I
D
 
G
I
 
I
N
 
N
L
 
L
T
 
S
G
 
G
V
 
V
W
 
F
N
 
Y
S
 
G
C
 
V
K
 
R
A
 
A
E
 
Q
A
 
I
E
 
R
L
 
A
M
 
M
Q
 
L
E
 
E
T
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
A
I
 
I
I
 
V
N
 
N
I
|
I
A
 
S
S
|
S
M
 
I
S
 
A
G
 
G
I
 
Q
I
 
I
V
 
G
N
 
I
R
 
E
G
 
G
L
x
I
D
 
T
Q
 
P
A
 
-
H
 
-
Y
|
Y
N
 
T
C
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
H
G
 
G
V
 
V
I
 
V
H
 
G
L
 
L
S
 
T
K
 
K
S
 
T
L
 
V
A
 
A
M
 
W
E
 
E
W
 
Y
I
 
G
G
x
S
K
 
K
G
|
G
I
 
I
R
 
R
V
 
I
N
 
N
S
 
S
I
 
V
S
 
G
P
|
P
G
 
A
Y
 
F
T
x
I
A
 
N
T
|
T
-
 
T
-
 
L
-
 
V
-
 
Q
-
 
N
-
 
V
P
 
P
M
 
L
N
 
E
T
 
T
R
 
R
P
 
-
E
 
-
M
 
-
V
 
-
H
 
-
Q
 
-
T
 
-
R
 
R
E
 
Q
F
 
L
E
 
E
S
 
Q
Q
 
M
T
 
H
P
 
A
I
 
L
Q
 
R
R
 
R
M
 
L
A
 
G
K
 
E
V
 
T
E
 
E
E
 
E
M
 
V
A
 
A
G
 
N
P
 
L
A
 
V
L
 
A
F
 
W
L
 
L
A
 
S
S
 
S
D
 
D
A
 
K
A
 
A
S
 
S
F
 
F
C
 
V
T
 
T
G
 
G
V
x
S
D
x
Y
L
 
Y
V
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
Y
V
 
L
C
 
A

4ureB Molecular genetic and crystal structural analysis of 1-(4- hydroxyphenyl)-ethanol dehydrogenase from aromatoleum aromaticum ebn1 (see paper)
42% identity, 95% coverage: 13:260/261 of query aligns to 3:247/248 of 4ureB

query
sites
4ureB
L
 
L
Q
 
E
D
 
G
R
 
K
V
 
T
A
 
A
F
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
S
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
Q
 
R
M
 
T
I
 
I
A
 
A
Y
 
L
G
 
T
L
 
Y
A
 
A
S
 
A
A
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
N
V
 
V
V
 
V
C
 
V
F
 
S
D
 
D
L
 
I
R
 
S
E
 
D
D
 
E
G
 
W
G
 
G
L
 
-
A
 
R
E
 
E
T
 
T
V
 
L
K
 
A
N
 
L
I
 
I
E
 
E
A
 
G
I
 
K
G
 
G
G
 
G
E
 
K
A
 
A
C
 
V
F
 
F
Y
 
Q
T
 
H
G
 
A
D
 
D
V
 
T
R
 
A
Q
 
H
L
 
P
S
 
E
D
 
D
L
 
H
R
 
D
A
 
E
G
 
L
V
 
I
A
 
A
L
 
A
A
 
A
K
 
K
S
 
R
R
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
I
A
 
A
V
 
C
N
 
N
A
x
N
A
 
A
G
|
G
I
 
I
A
 
S
N
 
G
A
 
E
-
 
F
N
 
T
P
 
P
A
 
T
L
 
A
E
 
E
M
 
T
E
 
T
T
 
D
E
 
A
Q
 
Q
W
 
W
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
I
 
I
D
 
G
I
 
I
N
 
N
L
 
L
T
 
S
G
 
G
V
 
V
W
 
F
N
 
Y
S
 
G
C
 
V
K
 
R
A
 
A
E
 
Q
A
 
I
E
 
R
L
 
A
M
 
M
Q
 
L
E
 
E
T
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
A
I
 
I
I
 
V
N
 
N
I
 
I
A
 
S
S
|
S
M
 
I
S
 
A
G
 
G
I
 
Q
I
 
I
V
 
G
N
 
I
R
 
E
G
 
G
L
x
I
D
 
T
Q
 
P
A
 
-
H
 
-
Y
|
Y
N
 
T
C
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
H
G
 
G
V
 
V
I
 
V
H
 
G
L
 
L
S
 
T
K
 
K
S
 
T
L
 
V
A
 
A
M
 
W
E
 
E
W
 
Y
I
 
G
G
 
S
K
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
I
N
 
N
S
 
S
I
 
V
S
 
G
P
|
P
G
x
A
Y
 
F
T
 
I
A
 
N
T
 
T
-
 
T
-
 
L
-
 
V
-
 
Q
-
 
N
-
 
V
P
 
P
M
 
L
N
 
E
T
 
T
R
 
R
P
 
-
E
 
-
M
 
-
V
 
-
H
 
-
Q
 
-
T
 
-
R
 
R
E
 
Q
F
 
L
E
 
E
S
 
Q
Q
 
M
T
 
H
P
 
A
I
 
L
Q
 
R
R
 
R
M
 
L
A
 
G
K
 
E
V
 
T
E
 
E
E
 
E
M
 
V
A
 
A
G
 
N
P
 
L
A
 
V
L
 
A
F
 
W
L
 
L
A
 
S
S
 
S
D
 
D
A
 
K
A
 
A
S
 
S
F
 
F
C
 
V
T
 
T
G
 
G
V
 
S
D
 
Y
L
 
Y
V
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
Y
V
 
L
C
 
A

6ixmC Crystal structure of the ketone reductase chkred20 from the genome of chryseobacterium sp. Ca49 complexed with NAD (see paper)
40% identity, 94% coverage: 13:258/261 of query aligns to 3:245/248 of 6ixmC

query
sites
6ixmC
L
 
L
Q
 
D
D
 
N
R
 
K
V
 
V
A
 
A
F
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
G
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
Q
 
L
M
 
A
I
 
V
A
 
A
Y
 
H
G
 
S
L
 
Y
A
 
A
S
 
K
A
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
V
 
I
C
 
V
F
 
S
D
|
D
L
x
I
R
 
N
E
 
E
D
 
D
G
 
H
G
 
G
L
 
-
A
 
N
E
 
K
T
 
A
V
 
V
K
 
E
N
 
D
I
 
I
E
 
K
A
 
A
I
 
Q
G
 
G
G
 
G
E
 
E
A
 
A
C
 
S
F
 
F
Y
 
V
T
 
K
G
x
A
D
|
D
V
x
T
R
 
S
Q
 
N
L
 
P
S
 
E
D
 
E
L
 
V
R
 
E
A
 
A
G
 
L
V
 
V
A
 
K
L
 
R
A
 
T
K
 
V
S
 
E
R
 
I
F
 
Y
G
 
G
R
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
I
A
 
A
V
 
C
N
 
N
A
x
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
A
 
G
N
 
G
A
 
E
N
 
Q
P
 
A
-
 
L
A
 
A
L
 
G
E
 
D
M
 
Y
E
 
G
T
 
L
E
 
D
Q
 
S
W
 
W
Q
 
R
R
 
K
V
 
V
I
 
L
D
 
S
I
 
I
N
 
N
L
 
L
T
 
D
G
 
G
V
 
V
W
 
F
N
 
Y
S
 
G
C
 
C
K
 
K
A
 
Y
E
 
E
A
 
L
E
 
E
L
 
Q
M
 
M
Q
 
E
E
 
K
T
 
N
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
V
I
 
I
I
 
V
N
 
N
I
x
M
A
 
A
S
|
S
M
 
I
S
 
H
G
 
G
I
 
I
I
 
V
V
 
A
N
 
A
R
 
P
G
 
-
L
 
L
D
 
S
Q
 
S
A
 
A
H
 
-
Y
|
Y
N
 
T
C
 
S
S
 
A
K
|
K
A
 
H
G
 
A
V
 
V
I
 
V
H
 
G
L
 
L
S
 
T
K
 
K
S
 
N
L
 
I
A
 
G
M
 
A
E
 
E
W
 
Y
I
 
G
G
 
Q
K
 
K
G
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
S
 
A
I
 
V
S
 
G
P
|
P
G
x
A
Y
|
Y
T
x
I
A
 
E
T
 
T
P
 
P
M
x
L
N
 
-
T
 
-
R
 
L
P
 
E
E
 
S
M
 
L
V
 
T
H
 
K
Q
 
E
T
 
M
R
 
K
E
 
E
-
 
A
F
 
L
E
 
I
S
 
S
Q
 
K
T
 
H
P
 
P
I
 
M
Q
 
G
R
 
R
M
 
L
A
 
G
K
 
K
V
 
P
E
 
E
E
 
E
M
 
V
A
 
A
G
 
E
P
 
L
A
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
S
S
 
S
D
 
E
A
 
K
A
 
S
S
 
S
F
 
F
C
 
M
T
 
T
G
 
G
V
 
G
D
 
Y
L
 
Y
V
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
Y

3lqfA Crystal structure of the short-chain dehydrogenase galactitol- dehydrogenase (gatdh) of rhodobacter sphaeroides in complex with NAD and erythritol (see paper)
39% identity, 97% coverage: 8:261/261 of query aligns to 4:254/254 of 3lqfA

query
sites
3lqfA
Q
 
R
Q
 
T
L
 
V
F
 
F
N
 
R
L
 
L
Q
 
D
D
 
G
R
 
A
V
 
C
A
 
A
F
 
A
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
G
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
Q
 
L
M
 
E
I
 
I
A
 
C
Y
 
R
G
 
A
L
 
F
A
 
A
S
 
A
A
 
S
G
 
G
A
 
A
R
 
R
V
 
L
V
 
I
C
 
L
F
 
I
D
|
D
L
 
-
R
|
R
E
 
E
D
 
A
G
 
A
G
 
A
L
 
L
A
 
D
E
 
R
T
 
A
V
 
A
K
 
Q
N
 
E
I
 
L
E
 
G
A
 
A
I
 
-
G
 
-
G
 
A
E
 
V
A
 
A
C
 
A
F
 
R
Y
 
I
T
 
V
G
 
A
D
|
D
V
|
V
R
 
T
Q
 
D
L
 
A
S
 
E
D
 
A
L
 
M
R
 
T
A
 
A
G
 
A
V
 
A
A
 
A
L
 
E
A
 
A
K
 
E
S
 
A
R
 
V
F
 
A
G
 
-
R
 
P
L
 
V
D
 
S
I
 
I
A
 
L
V
 
V
N
 
N
A
x
S
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
A
N
 
R
A
 
L
N
 
H
P
 
D
A
 
A
L
 
L
E
 
E
M
 
T
E
 
D
T
 
D
E
 
A
Q
 
T
W
 
W
Q
 
R
R
 
Q
V
 
V
I
 
M
D
 
A
I
 
V
N
 
N
L
 
V
T
 
D
G
 
G
V
 
M
W
 
F
N
 
W
S
 
A
C
 
S
K
 
R
A
 
A
E
 
F
A
 
G
E
 
R
L
 
A
M
 
M
Q
 
V
E
 
A
T
 
R
G
 
G
G
 
A
G
 
G
S
 
A
I
 
I
I
 
V
N
 
N
I
x
L
A
 
G
S
|
S
M
 
M
S
 
S
G
 
G
I
 
T
I
 
I
V
 
V
N
|
N
R
 
R
G
 
P
L
 
Q
D
 
F
Q
 
A
A
 
S
H
 
S
Y
|
Y
N
 
M
C
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
A
V
 
V
I
 
H
H
 
Q
L
 
L
S
 
T
K
 
R
S
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
A
E
 
E
W
 
W
I
 
A
G
 
G
K
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
A
I
 
L
S
 
A
P
|
P
G
 
G
Y
|
Y
T
x
V
A
 
A
T
|
T
-
 
E
-
x
M
-
x
T
-
 
L
P
 
K
M
|
M
N
 
R
T
 
E
R
 
R
P
 
P
E
 
E
M
 
L
V
 
F
H
 
E
Q
 
T
T
 
-
R
 
-
E
 
-
F
 
W
E
 
L
S
 
D
Q
 
M
T
 
T
P
 
P
I
 
M
Q
 
G
R
 
R
M
 
C
A
 
G
K
 
E
V
 
P
E
 
S
E
 
E
M
 
I
A
 
A
G
 
A
P
 
A
A
 
A
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
P
A
 
A
A
 
A
S
 
S
F
 
Y
C
 
V
T
 
T
G
 
G
V
 
A
D
 
I
L
 
L
V
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
Y
V
 
T
C
 
V
W
 
W

2wsbA Crystal structure of the short-chain dehydrogenase galactitol-dehydrogenase (gatdh) of rhodobacter sphaeroides in complex with NAD (see paper)
39% identity, 97% coverage: 8:261/261 of query aligns to 4:254/254 of 2wsbA

query
sites
2wsbA
Q
 
R
Q
 
T
L
 
V
F
 
F
N
 
R
L
 
L
Q
 
D
D
 
G
R
 
A
V
 
C
A
 
A
F
 
A
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
G
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
Q
 
L
M
 
E
I
 
I
A
 
C
Y
 
R
G
 
A
L
 
F
A
 
A
S
 
A
A
 
S
G
 
G
A
 
A
R
 
R
V
 
L
V
 
I
C
 
L
F
 
I
D
|
D
L
 
-
R
|
R
E
 
E
D
 
A
G
 
A
G
 
A
L
 
L
A
 
D
E
 
R
T
 
A
V
 
A
K
 
Q
N
 
E
I
 
L
E
 
G
A
 
A
I
 
-
G
 
-
G
 
A
E
 
V
A
 
A
C
 
A
F
 
R
Y
 
I
T
 
V
G
 
A
D
|
D
V
|
V
R
 
T
Q
 
D
L
 
A
S
 
E
D
 
A
L
 
M
R
 
T
A
 
A
G
 
A
V
 
A
A
 
A
L
 
E
A
 
A
K
 
E
S
 
A
R
 
V
F
 
A
G
 
-
R
 
P
L
 
V
D
 
S
I
 
I
A
 
L
V
 
V
N
 
N
A
x
S
A
|
A
G
 
G
I
 
I
A
 
A
N
 
R
A
 
L
N
 
H
P
 
D
A
 
A
L
 
L
E
 
E
M
 
T
E
 
D
T
 
D
E
 
A
Q
 
T
W
 
W
Q
 
R
R
 
Q
V
 
V
I
 
M
D
 
A
I
 
V
N
 
N
L
 
V
T
 
D
G
 
G
V
 
M
W
 
F
N
 
W
S
 
A
C
 
S
K
 
R
A
 
A
E
 
F
A
 
G
E
 
R
L
 
A
M
 
M
Q
 
V
E
 
A
T
 
R
G
 
G
G
 
A
G
 
G
S
 
A
I
 
I
I
 
V
N
 
N
I
x
L
A
 
G
S
|
S
M
|
M
S
 
S
G
 
G
I
 
T
I
 
I
V
 
V
N
|
N
R
 
R
G
 
P
L
 
Q
D
 
F
Q
 
A
A
 
S
H
 
S
Y
|
Y
N
 
M
C
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
A
V
 
V
I
 
H
H
 
Q
L
 
L
S
 
T
K
 
R
S
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
A
E
 
E
W
 
W
I
 
A
G
 
G
K
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
A
I
 
L
S
 
A
P
|
P
G
 
G
Y
|
Y
T
x
V
A
 
A
T
|
T
-
 
E
-
x
M
-
x
T
-
 
L
P
 
K
M
 
M
N
 
R
T
 
E
R
 
R
P
 
P
E
 
E
M
 
L
V
 
F
H
 
E
Q
 
T
T
 
-
R
 
-
E
 
-
F
 
W
E
 
L
S
 
D
Q
 
M
T
 
T
P
 
P
I
 
M
Q
 
G
R
 
R
M
 
C
A
 
G
K
 
E
V
 
P
E
 
S
E
 
E
M
 
I
A
 
A
G
 
A
P
 
A
A
 
A
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
P
A
 
A
A
 
A
S
 
S
F
 
Y
C
 
V
T
 
T
G
 
G
V
 
A
D
 
I
L
 
L
V
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
Y
V
 
T
C
 
V
W
 
W

2wdzA Crystal structure of the short chain dehydrogenase galactitol-dehydrogenase (gatdh) of rhodobacter sphaeroides in complex with NAD+ and 1,2-pentandiol (see paper)
39% identity, 97% coverage: 8:261/261 of query aligns to 4:254/254 of 2wdzA

query
sites
2wdzA
Q
 
R
Q
 
T
L
 
V
F
 
F
N
 
R
L
 
L
Q
 
D
D
 
G
R
 
A
V
 
C
A
 
A
F
 
A
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
G
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
Q
 
L
M
 
E
I
 
I
A
 
C
Y
 
R
G
 
A
L
 
F
A
 
A
S
 
A
A
 
S
G
 
G
A
 
A
R
 
R
V
 
L
V
 
I
C
 
L
F
 
I
D
|
D
L
 
-
R
|
R
E
 
E
D
x
A
G
 
A
G
 
A
L
 
L
A
x
D
E
 
R
T
 
A
V
 
A
K
 
Q
N
 
E
I
 
L
E
 
G
A
 
A
I
 
-
G
 
-
G
 
A
E
 
V
A
 
A
C
 
A
F
x
R
Y
 
I
T
 
V
G
x
A
D
|
D
V
|
V
R
 
T
Q
 
D
L
 
A
S
 
E
D
 
A
L
 
M
R
 
T
A
 
A
G
 
A
V
 
A
A
 
A
L
 
E
A
 
A
K
 
E
S
 
A
R
 
V
F
 
A
G
 
-
R
 
P
L
 
V
D
 
S
I
 
I
A
 
L
V
 
V
N
 
N
A
x
S
A
|
A
G
 
G
I
 
I
A
 
A
N
 
R
A
 
L
N
 
H
P
 
D
A
 
A
L
 
L
E
 
E
M
 
T
E
 
D
T
 
D
E
 
A
Q
 
T
W
 
W
Q
 
R
R
 
Q
V
 
V
I
 
M
D
 
A
I
 
V
N
 
N
L
 
V
T
 
D
G
 
G
V
 
M
W
 
F
N
 
W
S
 
A
C
 
S
K
 
R
A
 
A
E
 
F
A
 
G
E
 
R
L
 
A
M
 
M
Q
 
V
E
 
A
T
 
R
G
 
G
G
 
A
G
 
G
S
 
A
I
 
I
I
 
V
N
 
N
I
x
L
A
 
G
S
|
S
M
 
M
S
|
S
G
 
G
I
 
T
I
 
I
V
 
V
N
 
N
R
 
R
G
 
P
L
 
Q
D
 
F
Q
 
A
A
 
S
H
 
S
Y
|
Y
N
 
M
C
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
A
V
 
V
I
 
H
H
 
Q
L
 
L
S
 
T
K
 
R
S
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
A
E
 
E
W
 
W
I
 
A
G
 
G
K
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
A
I
 
L
S
 
A
P
|
P
G
 
G
Y
 
Y
T
x
V
A
 
A
T
|
T
-
 
E
-
x
M
-
x
T
-
 
L
P
 
K
M
 
M
N
 
R
T
 
E
R
 
R
P
 
P
E
 
E
M
 
L
V
 
F
H
 
E
Q
 
T
T
 
-
R
 
-
E
 
-
F
 
W
E
 
L
S
 
D
Q
 
M
T
 
T
P
 
P
I
 
M
Q
 
G
R
 
R
M
 
C
A
 
G
K
 
E
V
 
P
E
 
S
E
 
E
M
 
I
A
 
A
G
 
A
P
 
A
A
 
A
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
P
A
 
A
A
 
A
S
 
S
F
 
Y
C
 
V
T
 
T
G
 
G
V
 
A
D
 
I
L
 
L
V
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
Y
V
 
T
C
 
V
W
 
W

C0KTJ6 Galactitol 2-dehydrogenase (L-tagatose-forming); Galactitol dehydrogenase; GDH; GatDH; Galactitol:NAD(+) 5-oxidoreductase; EC 1.1.1.406 from Cereibacter sphaeroides (Rhodobacter sphaeroides) (see paper)
39% identity, 97% coverage: 8:261/261 of query aligns to 4:254/254 of C0KTJ6

query
sites
C0KTJ6
Q
 
R
Q
 
T
L
 
V
F
 
F
N
 
R
L
 
L
Q
 
D
D
 
G
R
 
A
V
 
C
A
 
A
F
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
Q
 
L
M
 
E
I
 
I
A
 
C
Y
 
R
G
 
A
L
 
F
A
 
A
S
 
A
A
 
S
G
 
G
A
 
A
R
 
R
V
 
L
V
 
I
C
 
L
F
 
I
D
|
D
L
 
-
R
 
R
E
 
E
D
 
A
G
 
A
G
 
A
L
 
L
A
 
D
E
 
R
T
 
A
V
 
A
K
 
Q
N
 
E
I
 
L
E
 
G
A
 
A
I
 
-
G
 
-
G
 
A
E
 
V
A
 
A
C
 
A
F
 
R
Y
 
I
T
 
V
G
 
A
D
|
D
V
|
V
R
 
T
Q
 
D
L
 
A
S
 
E
D
 
A
L
 
M
R
 
T
A
 
A
G
 
A
V
 
A
A
 
A
L
 
E
A
 
A
K
 
E
S
 
A
R
 
V
F
 
A
G
 
-
R
 
P
L
 
V
D
 
S
I
 
I
A
 
L
V
 
V
N
 
N
A
 
S
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
A
N
 
R
A
 
L
N
 
H
P
 
D
A
 
A
L
 
L
E
 
E
M
 
T
E
 
D
T
 
D
E
 
A
Q
 
T
W
 
W
Q
 
R
R
 
Q
V
 
V
I
 
M
D
 
A
I
 
V
N
 
N
L
 
V
T
 
D
G
 
G
V
 
M
W
 
F
N
 
W
S
 
A
C
 
S
K
 
R
A
 
A
E
 
F
A
 
G
E
 
R
L
 
A
M
 
M
Q
 
V
E
 
A
T
 
R
G
 
G
G
 
A
G
 
G
S
 
A
I
 
I
I
 
V
N
 
N
I
 
L
A
 
G
S
 
S
M
 
M
S
 
S
G
 
G
I
 
T
I
 
I
V
 
V
N
 
N
R
 
R
G
 
P
L
 
Q
D
 
F
Q
 
A
A
 
S
H
 
S
Y
|
Y
N
 
M
C
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
A
V
 
V
I
 
H
H
 
Q
L
 
L
S
 
T
K
 
R
S
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
A
E
 
E
W
 
W
I
 
A
G
 
G
K
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
A
I
 
L
S
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
T
x
V
A
|
A
T
|
T
-
 
E
-
 
M
-
 
T
-
 
L
P
 
K
M
 
M
N
 
R
T
 
E
R
 
R
P
 
P
E
 
E
M
 
L
V
 
F
H
 
E
Q
 
T
T
 
-
R
 
-
E
 
-
F
 
W
E
 
L
S
 
D
Q
 
M
T
 
T
P
 
P
I
 
M
Q
 
G
R
 
R
M
 
C
A
 
G
K
 
E
V
 
P
E
 
S
E
 
E
M
 
I
A
 
A
G
 
A
P
 
A
A
 
A
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
P
A
 
A
A
 
A
S
 
S
F
 
Y
C
 
V
T
 
T
G
 
G
V
 
A
D
 
I
L
 
L
V
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
Y
V
 
T
C
 
V
W
|
W

3uf0A Crystal structure of a putative NAD(p) dependent gluconate 5- dehydrogenase from beutenbergia cavernae(efi target efi-502044) with bound NADP (low occupancy)
42% identity, 96% coverage: 11:260/261 of query aligns to 3:248/249 of 3uf0A

query
sites
3uf0A
F
 
F
N
 
S
L
 
L
Q
 
A
D
 
G
R
 
R
V
 
T
A
 
A
F
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
G
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
Q
 
R
M
 
A
I
 
I
A
 
A
Y
 
H
G
 
G
L
 
Y
A
 
A
S
 
R
A
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
H
V
 
V
V
 
L
C
 
A
F
 
W
D
 
G
L
 
-
R
|
R
E
 
T
D
 
D
G
 
G
G
 
-
L
 
V
A
 
K
E
 
E
T
 
V
V
 
A
K
 
D
N
 
E
I
 
I
E
 
A
A
 
D
I
 
G
G
 
G
G
 
G
E
 
S
A
 
A
C
 
E
F
 
A
Y
 
V
T
 
V
G
 
A
D
|
D
V
 
-
R
 
-
Q
 
-
L
|
L
S
 
A
D
 
D
L
 
L
R
 
E
-
 
G
-
 
A
A
 
A
G
 
N
V
 
V
A
 
A
-
 
E
-
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
A
S
 
T
R
 
R
F
 
-
G
 
-
R
 
R
L
 
V
D
 
D
I
 
V
A
 
L
V
 
V
N
 
N
A
x
N
A
 
A
G
|
G
I
|
I
A
 
I
N
 
A
A
 
R
N
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
E
E
 
E
M
 
V
E
 
S
T
 
L
E
 
G
Q
 
R
W
 
W
Q
 
R
R
 
E
V
 
V
I
 
L
D
 
T
I
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
D
G
 
A
V
 
A
W
 
W
N
 
V
S
 
L
C
 
S
K
 
R
A
 
S
E
 
F
A
 
G
E
 
T
L
 
A
M
 
M
Q
 
L
E
 
A
T
 
H
G
 
G
G
 
S
G
 
G
S
 
R
I
 
I
I
 
V
N
 
T
I
|
I
A
|
A
S
|
S
M
 
M
S
 
-
G
 
-
I
 
L
I
 
S
V
 
F
N
 
Q
R
 
G
G
 
G
L
 
R
D
 
N
Q
x
V
A
 
A
H
 
A
Y
|
Y
N
 
A
C
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
H
G
 
A
V
 
V
I
 
V
H
 
G
L
 
L
S
 
T
K
 
R
S
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
S
E
 
E
W
 
W
I
 
A
G
 
G
K
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
G
V
 
V
N
 
N
S
 
A
I
 
L
S
 
A
P
|
P
G
|
G
Y
 
Y
T
x
V
A
 
V
T
|
T
P
 
-
M
 
A
N
|
N
T
|
T
R
 
A
P
 
A
E
 
L
M
 
R
V
 
A
H
 
D
Q
 
D
T
 
E
R
 
R
-
 
A
-
 
A
E
 
E
F
 
I
E
 
T
S
 
A
Q
 
R
T
 
I
P
 
P
I
 
A
Q
 
G
R
 
R
M
 
W
A
 
A
K
 
T
V
 
P
E
 
E
E
 
D
M
 
M
A
 
V
G
 
G
P
 
P
A
 
A
L
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
A
A
 
A
S
 
S
F
 
Y
C
 
V
T
 
H
G
 
G
V
 
Q
D
 
V
L
 
L
V
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
W
V
 
L
C
 
A

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
40% identity, 95% coverage: 13:259/261 of query aligns to 3:246/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
L
 
L
Q
 
Q
D
 
G
R
 
K
V
 
V
A
 
A
F
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
G
x
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
Q
 
R
M
 
D
I
 
I
A
 
A
Y
 
I
G
 
N
L
 
L
A
 
A
S
 
K
A
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
N
V
 
I
V
 
F
C
 
F
F
x
N
D
x
Y
L
x
N
R
x
G
E
x
S
D
 
P
G
 
E
G
 
A
L
 
A
A
 
E
E
 
E
T
 
T
V
 
A
K
 
K
N
 
L
I
 
V
E
 
A
A
 
E
I
 
H
G
 
G
G
 
V
E
 
E
A
 
V
C
 
E
F
 
A
Y
 
M
T
 
K
G
 
A
D
x
N
V
|
V
R
 
A
Q
 
I
L
 
A
S
 
E
D
 
D
L
 
V
R
 
D
A
 
A
G
 
F
V
 
F
A
 
K
L
 
Q
A
 
A
K
 
I
S
 
E
R
 
R
F
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
L
V
 
V
N
 
N
A
x
N
A
|
A
G
 
G
I
|
I
A
 
T
N
 
R
A
 
D
N
 
N
P
 
L
A
 
L
L
 
M
E
 
R
M
 
M
E
 
K
T
 
E
E
 
D
Q
 
E
W
 
W
Q
 
D
R
 
D
V
 
V
I
 
I
D
 
N
I
|
I
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
V
 
T
W
 
F
N
 
L
S
 
C
C
 
T
K
 
K
A
 
A
E
 
V
A
 
S
E
 
R
L
 
T
M
 
M
Q
 
M
E
 
K
T
 
Q
G
 
R
G
 
A
G
 
G
S
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
M
A
 
A
S
|
S
M
 
V
S
 
V
G
 
G
I
 
L
I
 
I
V
 
G
N
 
N
R
 
A
G
 
G
L
 
-
D
 
-
Q
|
Q
A
 
A
H
 
N
Y
|
Y
N
 
V
C
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
H
 
G
L
 
L
S
 
T
K
 
K
S
 
T
L
 
T
A
 
A
M
 
R
E
 
E
W
 
L
I
 
A
G
 
P
K
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
S
 
A
I
 
V
S
 
A
P
|
P
G
 
G
Y
 
F
T
x
I
A
 
T
T
|
T
P
 
D
M
 
M
N
 
T
T
 
D
R
 
K
P
 
L
E
 
D
M
 
-
V
 
-
H
 
E
Q
 
K
T
 
T
R
 
K
E
 
E
-
 
A
F
 
M
E
 
L
S
 
A
Q
 
Q
T
 
I
P
 
P
I
 
L
Q
 
G
R
 
A
M
 
Y
A
 
G
K
 
T
V
 
T
E
 
E
E
 
D
M
 
I
A
 
A
G
 
N
P
 
A
A
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
A
A
 
S
S
 
K
F
 
Y
C
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
Q
D
 
T
L
 
L
V
 
S
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
M
V
 
V

4dmmB 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase from synechococcus elongatus pcc 7942 in complex with NADP
43% identity, 95% coverage: 13:259/261 of query aligns to 3:238/240 of 4dmmB

query
sites
4dmmB
L
 
L
Q
 
T
D
 
D
R
 
R
V
 
I
A
 
A
F
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
x
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
Q
 
R
M
 
A
I
 
I
A
 
A
Y
 
L
G
 
E
L
 
L
A
 
A
S
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
V
 
A
C
 
V
F
 
N
D
 
Y
L
x
A
R
x
S
E
x
S
D
 
A
G
 
G
G
 
A
L
 
A
A
 
D
E
 
E
T
 
V
V
 
V
K
 
A
N
 
A
I
 
I
E
 
A
A
 
A
I
 
A
G
 
G
G
 
G
E
 
E
A
 
A
C
 
F
F
 
A
Y
 
V
T
 
K
G
x
A
D
|
D
V
|
V
R
 
S
Q
 
Q
L
 
E
S
 
S
D
 
E
L
 
V
R
 
E
A
 
A
G
 
L
V
 
F
A
 
A
L
 
A
A
 
V
K
 
I
S
 
E
R
 
R
F
 
W
G
 
G
R
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
V
A
 
L
V
 
V
N
 
N
A
x
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
A
 
T
N
 
R
A
 
D
N
 
T
P
 
L
A
 
L
L
 
L
E
 
R
M
 
M
E
 
K
T
 
R
E
 
D
Q
 
D
W
 
W
Q
 
Q
R
 
S
V
 
V
I
 
L
D
 
D
I
x
L
N
 
N
L
 
L
T
 
G
G
 
G
V
 
V
W
 
F
N
 
L
S
 
C
C
 
S
K
 
R
A
 
A
E
 
A
A
 
A
E
 
K
L
 
I
M
 
M
Q
 
L
E
 
K
T
 
Q
G
 
R
G
 
S
G
 
G
S
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
|
I
A
 
A
S
|
S
M
 
V
S
 
V
G
 
G
I
 
E
I
 
M
V
 
G
N
 
N
R
 
P
G
 
G
L
 
-
D
 
-
Q
|
Q
A
 
A
H
 
N
Y
|
Y
N
 
S
C
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
H
 
G
L
 
L
S
 
T
K
 
K
S
 
T
L
 
V
A
 
A
M
 
K
E
 
E
W
 
L
I
 
A
G
 
S
K
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
S
 
A
I
 
V
S
 
A
P
|
P
G
|
G
Y
 
F
T
x
I
A
 
A
T
|
T
P
 
D
M
|
M
N
 
T
T
 
S
R
 
L
P
 
L
E
 
E
M
 
V
V
 
I
H
 
-
Q
 
-
T
 
-
R
 
-
E
 
-
F
 
-
E
 
-
S
 
-
Q
 
-
T
 
-
P
 
P
I
 
L
Q
 
G
R
 
R
M
 
Y
A
 
G
K
 
E
V
 
A
E
 
A
E
 
E
M
 
V
A
 
A
G
 
G
P
 
V
A
 
V
L
 
R
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
A
D
 
D
-
 
P
A
 
A
A
 
A
S
 
A
F
 
Y
C
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
Q
D
 
V
L
 
I
V
 
N
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
L
V
 
V

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
38% identity, 96% coverage: 9:259/261 of query aligns to 1:243/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
Q
 
H
L
 
M
F
 
S
N
 
R
L
 
L
Q
 
Q
D
 
D
R
 
K
V
 
V
A
 
A
F
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
A
S
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
Q
 
L
M
 
E
I
 
A
A
 
A
Y
 
R
G
 
V
L
 
F
A
 
M
S
 
K
A
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
V
 
V
C
 
I
F
 
A
D
|
D
L
x
F
R
 
N
E
 
E
D
 
A
G
 
A
G
 
G
L
 
K
A
 
-
E
 
-
T
 
-
V
 
-
K
 
E
N
 
A
I
 
V
E
 
E
A
 
A
I
 
N
G
 
P
G
 
G
E
 
-
A
 
V
C
 
V
F
 
F
Y
 
I
T
 
R
G
x
V
D
|
D
V
|
V
R
 
S
Q
 
D
L
 
R
S
 
E
D
 
S
L
 
V
R
 
H
A
 
R
G
 
L
V
 
V
A
 
E
L
 
N
A
 
V
K
 
A
S
 
E
R
 
R
F
 
F
G
 
G
R
 
K
L
 
I
D
 
D
I
 
I
A
 
L
V
 
I
N
 
N
A
x
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
A
 
T
N
 
R
A
x
D
N
 
S
P
 
M
A
 
L
L
 
S
E
x
K
M
 
M
E
 
T
T
 
V
E
 
D
Q
 
Q
W
 
F
Q
 
Q
R
 
Q
V
 
V
I
 
I
D
 
N
I
 
V
N
|
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
V
 
V
W
 
F
N
 
H
S
 
C
C
 
T
K
 
Q
A
 
A
E
 
V
A
 
L
E
 
P
L
 
Y
M
 
M
Q
 
A
E
 
E
T
 
Q
G
 
G
G
 
K
G
 
G
S
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
x
T
A
 
S
S
|
S
M
 
V
S
 
T
G
 
G
I
 
T
I
 
Y
V
 
G
N
|
N
R
x
V
G
 
G
L
 
-
D
 
-
Q
|
Q
A
 
T
H
 
N
Y
|
Y
N
 
A
C
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
H
 
G
L
 
M
S
 
T
K
 
K
S
 
T
L
 
W
A
 
A
M
 
K
E
 
E
W
 
L
I
 
A
G
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
S
 
A
I
 
V
S
 
A
P
|
P
G
 
G
Y
x
F
T
|
T
A
 
E
T
|
T
P
 
A
M
|
M
N
 
V
T
 
A
R
 
E
-
 
V
P
 
P
E
 
E
M
 
K
V
 
V
H
 
-
Q
 
-
T
 
I
R
 
E
E
x
K
F
 
M
E
 
K
S
 
A
Q
 
Q
T
 
V
P
 
P
I
 
M
Q
 
G
R
 
R
M
 
L
A
 
G
K
 
K
V
 
P
E
 
E
E
 
D
M
 
I
A
 
A
G
 
N
P
 
A
A
 
Y
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
H
A
 
E
A
 
S
S
 
D
F
 
Y
C
 
V
T
 
N
G
 
G
V
 
H
D
 
V
L
 
L
V
 
H
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
I
V
 
M

1edoA The x-ray structure of beta-keto acyl carrier protein reductase from brassica napus complexed with NADP+ (see paper)
40% identity, 93% coverage: 17:258/261 of query aligns to 3:242/244 of 1edoA

query
sites
1edoA
V
 
V
A
 
V
F
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
x
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
Q
 
K
M
 
A
I
 
I
A
 
A
Y
 
L
G
 
S
L
 
L
A
 
G
S
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
C
R
 
K
V
 
V
V
 
L
C
 
V
F
x
N
D
x
Y
L
x
A
R
|
R
E
x
S
D
 
A
G
 
K
G
 
A
L
 
A
A
 
E
E
 
E
T
 
V
V
 
S
K
 
K
N
 
Q
I
 
I
E
 
E
A
 
A
I
 
Y
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
A
 
A
C
 
I
F
 
T
Y
 
F
T
 
G
G
 
G
D
|
D
V
|
V
R
 
S
Q
 
K
L
 
E
S
 
A
D
 
D
L
 
V
R
 
E
A
 
A
G
 
M
V
 
M
A
 
K
L
 
T
A
 
A
K
 
I
S
 
D
R
 
A
F
 
W
G
 
G
R
 
T
L
 
I
D
 
D
I
 
V
A
 
V
V
 
V
N
 
N
A
x
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
A
 
T
N
 
R
A
 
D
N
 
T
P
 
L
A
 
L
L
 
I
E
 
R
M
 
M
E
 
K
T
 
K
E
 
S
Q
 
Q
W
 
W
Q
 
D
R
 
E
V
 
V
I
 
I
D
 
D
I
 
L
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
V
 
V
W
 
F
N
 
L
S
 
C
C
 
T
K
 
Q
A
 
A
E
 
A
A
 
T
E
 
K
L
 
I
M
 
M
Q
 
M
E
 
K
T
 
K
G
 
R
G
 
K
G
 
G
S
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
I
A
 
A
S
|
S
M
 
V
S
 
V
G
 
G
I
 
L
I
 
I
V
 
G
N
 
N
R
 
I
G
 
G
L
 
-
D
 
-
Q
 
Q
A
 
A
H
 
N
Y
|
Y
N
 
A
C
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
H
 
G
L
 
F
S
 
S
K
 
K
S
 
T
L
 
A
A
 
A
M
 
R
E
 
E
W
 
G
I
 
A
G
 
S
K
 
R
G
 
N
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
S
 
V
I
 
V
S
 
C
P
|
P
G
|
G
Y
 
F
T
x
I
A
 
A
T
x
S
P
 
D
M
|
M
N
 
T
T
 
A
R
 
K
P
 
L
E
 
G
M
 
E
V
 
-
H
 
D
Q
 
M
T
 
E
R
 
K
E
 
K
F
 
I
E
 
L
S
 
G
Q
 
T
T
 
I
P
 
P
I
 
L
Q
 
G
R
 
R
M
 
T
A
 
G
K
 
Q
V
 
P
E
 
E
E
 
N
M
 
V
A
 
A
G
 
G
P
 
L
A
 
V
L
 
E
F
 
F
L
 
L
A
 
A
-
 
L
S
 
S
D
 
P
A
 
A
A
 
A
S
 
S
F
 
Y
C
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
Q
D
 
A
L
 
F
V
 
T
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
I

P73574 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; EC 1.1.1.100 from Synechocystis sp. (strain PCC 6803 / Kazusa) (see paper)
39% identity, 95% coverage: 13:261/261 of query aligns to 4:247/247 of P73574

query
sites
P73574
L
 
L
Q
 
T
D
 
A
R
 
Q
V
 
V
A
 
A
F
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
|
A
G
 
S
S
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
Q
 
K
M
 
A
I
 
T
A
 
A
Y
 
L
G
 
A
L
 
L
A
 
A
S
 
A
A
 
T
G
 
G
A
 
M
R
 
K
V
 
V
V
 
V
C
 
V
F
 
N
D
 
Y
L
 
A
R
 
Q
E
 
S
D
 
S
G
 
T
G
 
A
L
 
A
A
 
D
E
 
A
T
 
V
V
 
V
K
 
A
N
 
E
I
 
I
E
 
I
A
 
A
I
 
N
G
 
G
G
 
G
E
 
E
A
 
A
C
 
I
F
 
A
Y
 
V
T
 
Q
G
 
A
D
 
N
V
 
V
R
 
A
Q
 
N
L
 
A
S
 
D
D
 
E
L
 
V
R
 
D
A
 
Q
G
 
L
V
 
I
A
 
K
L
 
T
A
 
T
K
 
L
S
 
D
R
 
K
F
 
F
G
 
S
R
 
R
L
 
I
D
 
D
I
 
V
A
 
L
V
 
V
N
 
N
A
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
T
N
 
R
A
 
D
N
 
T
P
 
L
A
 
L
L
 
L
E
 
R
M
 
M
E
 
K
T
 
L
E
 
E
Q
 
D
W
 
W
Q
 
Q
R
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
D
I
 
L
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
V
 
V
W
 
F
N
 
L
S
 
C
C
 
T
K
 
K
A
 
A
E
 
V
A
 
S
E
 
K
L
 
L
M
 
M
Q
 
L
E
 
K
T
 
Q
G
 
K
G
 
S
G
 
G
S
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
I
A
 
T
S
 
S
M
 
V
S
 
A
G
 
G
I
 
M
I
 
M
V
 
G
N
 
N
R
x
P
G
 
G
L
 
-
D
 
-
Q
 
Q
A
 
A
H
 
N
Y
 
Y
N
 
S
C
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
H
 
G
L
 
F
S
 
T
K
 
K
S
 
T
L
 
V
A
 
A
M
 
K
E
 
E
W
 
L
I
 
A
G
 
S
K
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
T
V
 
V
N
 
N
S
 
A
I
 
V
S
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
x
F
T
 
I
A
 
A
T
 
T
P
 
D
M
 
M
-
 
T
-
 
E
N
 
N
T
 
L
R
x
N
P
 
A
E
 
E
M
 
P
V
 
I
H
 
L
Q
 
Q
T
 
F
R
 
-
E
 
-
F
 
-
E
 
-
S
 
-
Q
 
-
T
 
I
P
 
P
I
 
L
Q
 
A
R
 
R
M
 
Y
A
 
G
K
 
Q
V
 
P
E
 
E
E
 
E
M
 
V
A
 
A
G
 
G
P
 
T
A
 
I
L
 
R
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
T
D
 
D
-
 
P
A
 
A
A
 
A
S
 
A
F
 
Y
C
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
Q
D
 
T
L
 
F
V
 
N
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
M
V
 
V
C
 
M
W
 
F

4nbtA Crystal structure of fabg from acholeplasma laidlawii (see paper)
39% identity, 94% coverage: 13:258/261 of query aligns to 3:237/239 of 4nbtA

query
sites
4nbtA
L
 
L
Q
 
E
D
 
G
R
 
K
V
 
V
A
 
A
F
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
G
 
A
S
x
K
G
|
G
I
x
L
G
 
G
Q
 
Q
M
 
A
I
 
I
A
 
A
Y
 
L
G
 
A
L
 
Y
A
 
A
S
 
E
A
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
V
 
I
C
 
A
F
 
G
D
|
D
L
|
L
R
 
-
E
 
-
D
 
-
G
 
G
G
 
D
L
 
L
A
 
T
E
 
Y
T
 
S
V
 
H
K
 
P
N
 
N
I
 
V
E
 
E
A
 
G
I
 
M
G
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
-
C
 
Y
F
x
L
Y
x
N
T
x
V
G
 
T
D
 
D
V
 
V
R
 
T
Q
 
G
L
 
V
S
 
E
D
 
K
L
 
F
R
 
Y
A
 
Q
G
 
S
V
 
V
A
 
I
L
 
-
A
 
-
K
 
-
S
 
D
R
 
K
F
 
Y
G
 
G
R
 
K
L
 
I
D
 
D
I
 
I
A
 
L
V
 
V
N
 
N
A
x
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
A
 
T
N
 
K
A
 
D
N
 
A
P
 
M
A
 
T
L
 
R
E
 
K
M
 
M
E
 
T
T
 
E
E
 
A
Q
 
Q
W
 
W
Q
 
D
R
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
D
I
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
V
 
V
W
 
F
N
 
N
S
 
L
C
 
T
K
 
R
A
 
L
E
 
V
A
 
G
E
 
P
L
 
Q
M
 
M
Q
 
Q
E
 
T
T
 
N
G
 
G
G
 
Y
G
 
G
S
 
S
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
|
I
A
 
S
S
|
S
M
 
V
S
 
V
G
 
G
I
 
V
I
 
F
V
 
G
N
 
N
R
 
I
G
 
G
L
 
-
D
 
-
Q
 
Q
A
 
A
H
 
N
Y
|
Y
N
 
A
C
 
A
S
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
H
 
G
L
 
L
S
 
T
K
 
M
S
 
T
L
 
W
A
 
A
M
 
K
E
 
E
W
 
F
I
 
A
G
 
L
K
 
K
G
 
G
-
 
A
-
 
N
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
A
I
 
I
S
 
A
P
|
P
G
|
G
Y
 
Y
T
x
I
A
 
M
T
|
T
P
 
D
-
 
I
M
 
L
N
 
K
T
 
T
R
 
V
P
 
P
E
 
Q
M
 
-
V
 
-
H
 
D
Q
 
L
T
 
L
R
 
D
E
 
K
F
 
F
E
 
A
S
 
A
Q
 
L
T
 
T
P
 
M
I
 
L
Q
 
N
R
 
R
M
 
L
A
 
G
K
 
Q
V
 
P
E
 
E
E
 
E
M
 
I
A
 
A
G
 
K
P
 
V
A
 
A
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
D
A
 
A
S
 
S
F
 
Y
C
 
V
T
 
T
G
 
G
V
 
Q
D
 
T
L
 
I
V
 
N
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
F
 
M

1vl8B Crystal structure of gluconate 5-dehydrogenase (tm0441) from thermotoga maritima at 2.07 a resolution
37% identity, 95% coverage: 10:258/261 of query aligns to 1:249/252 of 1vl8B

query
sites
1vl8B
L
 
V
F
 
F
N
 
D
L
 
L
Q
 
R
D
 
G
R
 
R
V
 
V
A
 
A
F
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
G
 
S
S
x
R
G
|
G
I
x
L
G
 
G
Q
 
F
M
 
G
I
 
I
A
 
A
Y
 
Q
G
 
G
L
 
L
A
 
A
S
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
C
R
 
S
V
 
V
V
 
V
C
 
V
F
 
A
D
x
S
L
x
R
R
 
N
E
 
L
D
 
E
G
 
E
G
 
A
L
 
S
A
 
E
E
 
A
T
 
A
V
 
Q
K
 
K
N
 
L
I
 
T
E
 
E
A
 
K
I
 
Y
G
 
G
G
 
V
E
 
E
A
 
T
C
 
M
F
 
A
Y
 
F
T
 
R
G
x
C
D
|
D
V
|
V
R
 
S
Q
 
N
L
 
Y
S
 
E
D
 
E
L
 
V
R
 
K
A
 
K
G
 
L
V
 
L
A
 
E
L
 
A
A
 
V
K
 
K
S
 
E
R
 
K
F
 
F
G
 
G
R
 
K
L
 
L
D
 
D
I
 
T
A
 
V
V
 
V
N
 
N
A
|
A
A
|
A
G
|
G
I
|
I
A
 
N
N
 
R
A
 
R
N
 
H
P
 
P
A
 
A
L
 
E
E
 
E
M
 
F
E
 
P
T
 
L
E
 
D
Q
 
E
W
 
F
Q
 
R
R
 
Q
V
 
V
I
 
I
D
 
E
I
x
V
N
 
N
L
 
L
T
 
F
G
 
G
V
 
T
W
 
Y
N
 
Y
S
 
V
C
 
C
K
 
R
A
 
E
E
 
A
A
 
F
E
 
S
L
 
L
M
 
L
Q
 
R
E
 
E
T
 
S
G
 
D
G
 
N
G
 
P
S
 
S
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
|
I
A
 
G
S
|
S
M
 
L
S
 
T
G
 
V
I
 
E
I
 
E
V
 
V
N
 
T
R
 
M
G
 
P
L
 
-
D
 
N
Q
x
I
A
 
S
H
 
A
Y
|
Y
N
 
A
C
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
G
V
 
V
I
 
A
H
 
S
L
 
L
S
 
T
K
 
K
S
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
K
E
 
E
W
 
W
I
 
G
G
 
R
K
 
Y
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
V
I
 
I
S
 
A
P
|
P
G
|
G
Y
 
W
T
x
Y
A
 
R
T
|
T
P
 
K
M
|
M
N
x
T
-
 
E
-
 
A
-
 
V
-
 
F
T
 
S
R
 
D
P
 
P
E
 
E
M
 
K
V
 
L
H
 
D
Q
 
Y
T
 
M
R
 
L
E
 
K
F
 
-
E
 
-
S
 
-
Q
 
R
T
 
I
P
 
P
I
 
L
Q
 
G
R
 
R
M
 
T
A
 
G
K
 
V
V
 
P
E
 
E
E
 
D
M
 
L
A
 
K
G
 
G
P
 
V
A
 
A
L
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
E
A
 
E
A
 
A
S
 
K
F
 
Y
C
 
V
T
 
T
G
 
G
V
 
Q
D
 
I
L
 
I
V
 
F
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
W

3ay6B Crystal structure of bacillus megaterium glucose dehydrogenase 4 a258f mutant in complex with nadh and d-glucose (see paper)
35% identity, 96% coverage: 12:261/261 of query aligns to 10:259/267 of 3ay6B

query
sites
3ay6B
N
 
D
L
 
L
Q
 
K
D
 
D
R
 
K
V
 
V
A
 
V
F
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
G
 
S
S
x
T
G
|
G
I
x
L
G
 
G
Q
 
R
M
 
A
I
 
M
A
 
A
Y
 
V
G
 
R
L
 
F
A
 
G
S
 
Q
A
 
E
G
 
E
A
 
A
R
 
K
V
 
V
V
 
V
C
 
I
F
 
N
D
 
Y
L
x
Y
R
 
N
E
 
N
D
 
E
G
 
E
G
 
E
L
 
A
A
 
L
E
 
D
T
 
A
V
 
K
K
 
K
N
 
E
I
 
V
E
 
E
A
 
E
I
 
A
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
A
 
A
C
 
I
F
 
I
Y
 
V
T
 
Q
G
 
G
D
|
D
V
|
V
R
 
T
Q
 
K
L
 
E
S
 
E
D
 
D
L
 
V
R
 
V
A
 
N
G
 
L
V
 
V
A
 
Q
L
 
T
A
 
A
K
 
I
S
 
K
R
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
T
L
 
L
D
 
D
I
 
V
A
 
M
V
 
I
N
 
N
A
x
N
A
|
A
G
|
G
I
x
V
A
x
E
N
 
N
A
 
P
N
 
V
P
 
P
A
 
S
L
 
H
E
 
E
M
 
L
E
 
S
T
 
L
E
 
D
Q
 
N
W
 
W
Q
 
N
R
 
K
V
 
V
I
 
I
D
 
D
I
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
V
 
A
W
 
F
-
 
L
N
 
G
S
 
S
C
 
R
K
 
E
A
 
A
E
 
I
A
 
K
E
 
Y
L
 
F
M
 
V
Q
 
E
E
 
N
T
 
D
G
 
I
G
 
K
G
 
G
S
 
N
I
 
V
I
 
I
N
 
N
I
x
M
A
 
S
S
|
S
M
 
V
S
x
H
G
 
E
I
 
M
I
 
I
V
 
P
N
x
W
R
 
P
G
 
L
L
 
F
D
 
-
Q
 
-
A
 
V
H
 
H
Y
|
Y
N
 
A
C
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
G
V
 
M
I
 
K
H
 
L
L
 
M
S
 
T
K
 
E
S
 
T
L
 
L
A
 
A
M
 
L
E
 
E
W
 
Y
I
 
A
G
 
P
K
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
N
I
 
I
S
 
G
P
|
P
G
|
G
Y
 
A
T
x
M
A
 
N
T
|
T
P
|
P
M
x
I
N
|
N
T
 
A
R
 
E
P
x
K
-
 
F
-
 
A
E
 
D
M
 
P
V
 
V
H
 
-
Q
 
Q
T
 
R
R
 
A
E
 
D
F
 
V
E
 
E
S
 
S
Q
 
M
T
 
I
P
 
P
I
 
M
Q
 
G
R
 
Y
M
 
I
A
 
G
K
 
K
V
 
P
E
 
E
E
 
E
M
 
V
A
 
A
G
 
A
P
 
V
A
 
A
L
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
S
A
 
Q
A
 
A
S
 
S
F
 
Y
C
 
V
T
 
T
G
 
G
V
 
I
D
 
T
L
 
L
V
 
F
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
M
V
 
T
C
 
K
W
 
Y

2d1yA Crystal structure of tt0321 from thermus thermophilus hb8 (see paper)
38% identity, 93% coverage: 19:260/261 of query aligns to 9:238/240 of 2d1yA

query
sites
2d1yA
F
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
G
 
A
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
Q
 
R
M
 
A
I
 
I
A
 
A
Y
 
Q
G
 
A
L
 
F
A
 
A
S
 
R
A
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
L
V
 
V
V
 
A
C
 
L
F
 
C
D
|
D
L
|
L
R
|
R
E
 
P
D
 
E
G
 
G
G
 
-
L
 
-
A
 
-
E
 
-
T
 
-
V
 
-
K
 
K
N
 
E
I
 
V
-
 
A
E
 
E
A
 
A
I
 
I
G
 
G
G
 
G
E
 
-
A
 
-
C
 
A
F
 
F
Y
 
F
T
 
Q
G
x
V
D
|
D
V
x
L
R
 
E
Q
 
D
L
 
E
S
 
R
D
 
E
L
 
R
R
 
V
A
 
R
G
 
F
V
 
V
A
 
E
L
 
E
A
 
A
K
 
A
S
 
Y
R
 
A
F
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
V
D
 
D
I
 
V
A
 
L
V
 
V
N
 
N
A
x
N
A
|
A
G
x
A
I
|
I
A
 
A
N
 
A
A
 
P
N
 
G
P
 
S
A
 
A
L
 
L
E
 
T
M
 
V
E
 
R
T
 
L
E
 
P
Q
 
E
W
 
W
Q
 
R
R
 
R
V
 
V
I
 
L
D
 
E
I
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
A
V
 
P
W
 
M
N
 
H
S
 
L
C
 
S
K
 
A
A
 
L
E
 
A
A
 
A
E
 
R
L
 
E
M
 
M
Q
 
R
E
 
K
T
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
A
I
 
I
I
 
V
N
 
N
I
x
V
A
 
A
S
|
S
M
 
V
S
 
Q
G
 
G
I
 
L
I
 
F
V
 
A
N
 
E
R
 
Q
G
 
-
L
 
-
D
 
E
Q
x
N
A
 
A
H
 
A
Y
|
Y
N
 
N
C
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
G
V
 
L
I
 
V
H
 
N
L
 
L
S
 
T
K
 
R
S
 
S
L
 
L
A
 
A
M
 
L
E
 
D
W
 
L
I
 
A
G
 
P
K
 
L
G
 
R
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
A
I
 
V
S
 
A
P
|
P
G
|
G
Y
 
A
T
x
I
A
 
A
T
|
T
P
 
-
M
 
-
N
 
-
T
 
-
R
 
-
P
 
-
E
 
E
M
x
A
V
|
V
H
 
L
Q
 
E
T
 
A
-
 
I
-
 
A
-
 
R
R
 
R
E
 
D
F
 
W
E
 
E
S
 
D
Q
 
L
T
 
H
P
 
A
I
 
L
Q
 
R
R
 
R
M
 
L
A
 
G
K
 
K
V
 
P
E
 
E
E
 
E
M
 
V
A
 
A
G
 
E
P
 
A
A
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
E
A
 
K
A
 
A
S
 
S
F
 
F
C
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
A
D
 
I
L
 
L
V
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
M
V
 
T
C
 
A

1g6kA Crystal structure of glucose dehydrogenase mutant e96a complexed with NAD+
35% identity, 96% coverage: 12:261/261 of query aligns to 4:253/261 of 1g6kA

query
sites
1g6kA
N
 
D
L
 
L
Q
 
E
D
 
G
R
 
K
V
 
V
A
 
V
F
 
V
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
S
G
 
S
S
x
T
G
|
G
I
x
L
G
 
G
Q
 
K
M
 
S
I
 
M
A
 
A
Y
 
I
G
 
R
L
 
F
A
 
A
S
 
T
A
 
E
G
 
K
A
 
A
R
 
K
V
 
V
V
 
V
C
 
V
F
 
N
D
 
Y
L
x
R
R
 
S
E
 
K
D
 
E
G
 
D
G
 
E
L
 
A
A
 
N
E
 
S
T
 
V
V
 
L
K
 
E
N
 
E
I
 
I
E
 
K
A
 
K
I
 
V
G
 
G
G
 
G
E
 
E
A
 
A
C
 
I
F
 
A
Y
 
V
T
 
K
G
 
G
D
|
D
V
|
V
R
 
T
Q
 
V
L
 
E
S
 
S
D
 
D
L
 
V
R
 
I
A
 
N
G
 
L
V
 
V
A
 
Q
L
 
S
A
 
A
K
 
I
S
 
K
R
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
K
L
 
L
D
 
D
I
 
V
A
 
M
V
 
I
N
 
N
A
x
N
A
|
A
G
|
G
I
 
L
A
 
A
N
 
N
A
 
P
N
 
V
P
 
S
A
 
S
L
 
H
E
 
E
M
 
M
E
 
S
T
 
L
E
 
S
Q
 
D
W
 
W
Q
 
N
R
 
K
V
 
V
I
 
I
D
 
D
I
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
V
 
A
W
 
F
-
 
L
N
 
G
S
 
S
C
 
R
K
 
E
A
 
A
E
 
I
A
 
K
E
 
Y
L
 
F
M
 
V
Q
 
E
E
 
N
T
 
D
G
 
I
G
 
K
G
 
G
S
 
T
I
 
V
I
 
I
N
 
N
I
x
M
A
 
S
S
|
S
M
 
V
S
 
H
G
 
E
I
 
K
I
 
I
V
 
P
N
 
W
R
 
P
G
 
L
L
 
F
D
 
-
Q
 
-
A
 
V
H
 
H
Y
|
Y
N
 
A
C
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
G
V
 
M
I
 
K
H
 
L
L
 
M
S
 
T
K
 
E
S
 
T
L
 
L
A
 
A
M
 
L
E
 
E
W
 
Y
I
 
A
G
 
P
K
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
N
I
 
I
S
 
G
P
|
P
G
|
G
Y
 
A
T
x
I
A
 
N
T
|
T
P
 
P
M
 
I
N
 
N
T
 
A
R
 
E
-
 
K
-
 
F
-
 
A
-
 
D
P
 
P
E
 
E
M
 
-
V
 
-
H
 
-
Q
 
Q
T
 
R
R
 
A
E
 
D
F
 
V
E
 
E
S
 
S
Q
 
M
T
 
I
P
 
P
I
 
M
Q
 
G
R
 
Y
M
 
I
A
 
G
K
 
E
V
 
P
E
 
E
E
 
E
M
 
I
A
 
A
G
 
A
P
 
V
A
 
A
L
 
A
F
 
W
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
S
A
 
E
A
 
A
S
 
S
F
 
Y
C
 
V
T
 
T
G
 
G
V
 
I
D
 
T
L
 
L
V
 
F
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
M
V
 
T
C
 
Q
W
 
Y

5jc8D Crystal structure of a putative short-chain dehydrogenase/reductase from burkholderia xenovorans
37% identity, 94% coverage: 13:258/261 of query aligns to 4:257/262 of 5jc8D

query
sites
5jc8D
L
 
L
Q
 
Q
D
 
G
R
 
K
V
 
V
A
 
A
F
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
S
 
C
-
 
I
-
 
G
-
 
P
-
 
G
-
 
W
G
|
G
I
 
N
G
 
G
Q
 
R
M
 
A
I
 
I
A
 
A
Y
 
V
G
 
R
L
 
F
A
 
A
S
 
E
A
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
H
V
 
V
V
 
I
C
 
A
F
 
V
D
 
D
L
 
-
R
 
R
E
 
D
D
 
L
G
 
A
G
 
S
L
 
M
A
 
D
E
 
A
T
 
T
V
 
L
K
 
E
N
 
L
I
 
V
E
 
R
A
 
A
I
 
A
G
 
G
G
 
G
E
 
S
A
 
V
C
 
T
F
 
P
Y
 
C
T
 
L
G
 
C
D
 
D
V
 
V
R
 
T
Q
 
D
L
 
S
S
 
A
D
 
S
L
 
V
R
 
E
A
 
R
G
 
L
V
 
V
A
 
A
L
 
D
A
 
S
K
 
V
S
 
A
R
 
R
F
 
C
G
 
G
R
 
R
L
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
L
V
 
V
N
 
N
A
 
N
A
 
V
G
 
G
I
 
A
A
 
P
N
 
S
A
 
P
N
 
G
P
 
G
A
 
P
L
 
V
E
 
A
M
 
L
E
 
D
T
 
E
E
 
A
Q
 
Q
W
 
W
Q
 
A
R
 
M
V
 
Q
I
 
L
D
 
E
I
 
L
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
T
V
 
A
W
 
F
N
 
L
S
 
M
C
 
C
K
 
K
A
 
Y
E
 
V
A
 
L
E
 
P
L
 
V
M
 
M
Q
 
E
E
 
Q
T
 
Q
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
A
I
 
I
I
 
V
N
 
N
I
 
I
A
 
A
S
|
S
M
 
T
S
 
S
G
 
G
I
 
I
I
 
R
V
 
W
N
 
T
R
 
-
G
 
G
L
 
A
D
 
A
Q
 
Q
A
 
V
H
 
G
Y
|
Y
N
 
A
C
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
M
I
 
I
H
 
Q
L
 
M
S
 
G
K
 
R
S
 
V
L
 
V
A
 
A
M
 
V
E
 
E
W
 
Y
I
 
A
G
 
A
K
 
K
G
 
N
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
S
 
S
I
 
V
S
 
V
P
 
P
G
 
G
Y
 
L
T
 
L
A
 
H
T
 
T
P
|
P
M
|
M
N
 
-
T
 
V
R
 
D
P
 
T
E
 
K
M
 
I
V
 
A
H
 
H
Q
 
N
-
 
G
-
 
D
-
 
V
-
 
E
-
 
L
-
 
L
T
 
L
R
 
R
E
 
K
F
 
R
E
 
Q
S
 
A
Q
 
R
T
 
I
P
 
P
I
 
M
Q
 
P
R
 
F
M
 
M
A
 
G
K
 
D
V
 
G
E
 
R
E
 
D
M
 
T
A
 
A
G
 
N
P
 
A
A
 
A
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
E
A
 
A
S
 
R
F
 
F
C
 
V
T
 
T
G
 
G
V
 
T
D
 
E
L
 
I
V
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
M

Query Sequence

>BWI76_RS07640 BWI76_RS07640 short chain dehydrogenase
MIAKDFAQQLFNLQDRVAFVTGAGSGIGQMIAYGLASAGARVVCFDLREDGGLAETVKNI
EAIGGEACFYTGDVRQLSDLRAGVALAKSRFGRLDIAVNAAGIANANPALEMETEQWQRV
IDINLTGVWNSCKAEAELMQETGGGSIINIASMSGIIVNRGLDQAHYNCSKAGVIHLSKS
LAMEWIGKGIRVNSISPGYTATPMNTRPEMVHQTREFESQTPIQRMAKVEEMAGPALFLA
SDAASFCTGVDLVVDGGFVCW

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory