SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing BWI76_RS08720 FitnessBrowser__Koxy:BWI76_RS08720 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 15 hits to proteins with known functional sites (download)

2q09A Crystal structure of imidazolonepropionase from environmental sample with bound inhibitor 3-(2,5-dioxo-imidazolidin-4-yl)-propionic acid (see paper)
55% identity, 97% coverage: 10:403/405 of query aligns to 5:398/402 of 2q09A

query
sites
2q09A
I
 
V
W
 
W
R
 
L
N
 
N
A
 
V
R
 
T
L
 
P
A
 
A
T
 
T
L
 
L
D
 
R
P
 
S
R
 
D
S
 
L
S
 
A
Q
 
D
P
 
-
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
L
 
L
D
 
E
H
 
P
H
 
H
A
 
A
L
 
L
L
 
G
V
 
V
R
 
H
N
 
E
G
 
G
R
 
R
I
 
I
E
 
H
A
 
A
I
 
L
V
 
V
P
 
P
-
 
M
-
 
Q
E
 
D
G
 
L
E
 
K
A
 
Y
P
 
P
A
 
A
G
 
H
Q
 
W
S
 
Q
I
 
-
D
 
D
L
 
M
G
 
K
G
 
G
R
 
K
L
 
L
L
 
V
T
 
T
P
 
P
G
 
G
L
 
L
I
 
I
D
 
D
C
 
C
H
|
H
T
 
T
H
|
H
L
 
L
V
 
I
F
 
F
G
 
A
G
 
G
S
 
S
R
|
R
A
 
A
Q
 
E
E
 
E
W
 
F
E
 
E
Q
 
L
R
 
R
L
 
Q
N
 
K
G
 
G
V
 
V
S
 
P
Y
 
Y
Q
 
A
T
 
E
I
 
I
S
 
A
A
 
R
N
 
K
G
 
G
G
 
G
G
 
G
I
|
I
N
 
I
A
 
S
T
 
T
V
 
V
R
 
R
A
 
A
T
 
T
R
 
R
D
 
A
S
 
A
S
 
S
E
 
E
A
 
D
E
 
Q
L
 
L
L
 
F
A
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
L
Q
 
P
R
 
R
L
 
V
A
 
K
R
 
S
L
 
L
L
 
I
R
 
R
E
 
E
G
 
G
V
 
V
T
 
T
T
 
T
L
 
V
E
 
E
I
 
I
K
 
K
S
 
S
G
 
G
Y
|
Y
G
 
G
L
 
L
D
 
T
L
 
L
A
 
E
N
 
D
E
 
E
R
 
L
K
 
K
M
 
M
L
 
L
R
 
R
V
 
V
V
 
A
Q
 
R
Q
 
R
L
 
L
A
 
G
A
 
E
T
 
A
H
 
L
A
 
P
V
 
I
E
 
R
V
 
V
S
 
K
P
 
T
T
 
T
L
 
L
L
 
L
S
 
A
A
 
A
H
|
H
A
 
A
T
 
V
P
 
P
P
 
P
E
 
E
Y
 
Y
K
 
R
G
 
D
D
 
D
P
 
P
D
 
D
G
 
S
Y
 
W
I
 
V
N
 
E
L
 
T
V
 
I
C
 
C
E
 
Q
T
 
E
I
 
I
L
 
I
P
 
P
T
 
A
L
 
A
W
 
A
E
 
E
E
 
A
G
 
G
L
 
L
F
 
A
E
 
D
S
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
V
F
|
F
C
 
C
E
 
E
N
 
H
V
 
I
G
 
G
F
 
F
S
 
S
P
 
L
T
 
A
Q
 
Q
T
 
T
E
 
E
R
 
Q
I
 
V
Y
 
Y
S
 
L
T
 
A
A
 
A
Q
 
D
A
 
Q
L
 
Y
G
 
G
I
 
L
P
 
A
V
 
V
K
 
K
G
 
G
H
|
H
V
 
M
E
 
D
Q
|
Q
L
 
L
S
 
S
S
 
N
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
S
E
 
T
L
 
L
V
 
A
S
 
A
R
 
N
Y
 
F
H
 
G
G
 
A
L
 
L
S
 
S
A
 
V
D
 
D
H
|
H
I
 
L
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
T
 
D
P
 
P
E
 
E
G
 
G
V
 
I
A
 
Q
A
 
A
M
 
L
S
 
A
R
 
H
S
 
R
G
 
G
T
 
V
V
 
V
A
 
A
V
 
T
L
 
L
L
 
L
P
 
P
G
 
T
A
 
A
F
 
F
Y
 
Y
F
 
F
L
 
L
N
 
K
E
 
E
T
 
T
R
 
K
R
 
L
P
 
P
P
 
P
V
 
V
E
 
V
L
 
A
L
 
L
R
 
R
E
 
K
Y
 
A
Q
 
G
V
 
V
P
 
P
M
 
M
A
 
A
V
 
V
A
 
S
T
 
S
D
|
D
Y
 
I
N
|
N
P
 
P
G
|
G
T
|
T
S
 
A
P
 
P
F
 
I
A
 
V
S
 
S
L
 
L
H
 
R
L
 
M
A
 
A
M
 
M
N
 
N
M
 
M
A
 
A
C
 
C
V
 
T
K
 
L
F
 
F
G
 
G
L
 
L
T
 
T
P
 
P
E
 
V
E
 
E
A
 
A
W
 
M
A
 
A
G
 
G
V
 
V
T
 
T
R
 
R
H
 
H
A
 
A
A
 
A
Q
 
R
A
 
A
L
 
L
G
 
G
R
 
E
Q
 
Q
A
 
E
S
 
Q
H
 
L
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
A
 
R
P
 
V
G
 
G
F
 
M
V
 
L
A
 
A
D
 
D
F
 
F
A
 
L
I
 
V
W
 
W
D
 
N
A
 
C
E
 
G
H
 
H
P
 
P
V
 
A
E
 
E
M
 
L
V
 
S
Y
 
Y
E
 
L
P
 
I
G
 
G
R
 
V
S
 
D
P
 
Q
L
 
L
W
 
V
Q
 
S
R
 
R
V
 
V
V
 
V
R
 
N
G
 
G
E
 
E

A0KF84 Imidazolonepropionase; Imidazolone-5-propionate hydrolase; EC 3.5.2.7 from Aeromonas hydrophila subsp. hydrophila (strain ATCC 7966 / DSM 30187 / BCRC 13018 / CCUG 14551 / JCM 1027 / KCTC 2358 / NCIMB 9240 / NCTC 8049) (see paper)
54% identity, 97% coverage: 10:403/405 of query aligns to 11:406/411 of A0KF84

query
sites
A0KF84
I
 
V
W
 
W
R
 
L
N
 
N
A
 
V
R
 
T
L
 
P
A
 
A
T
 
T
L
 
L
D
 
R
P
 
S
R
 
D
S
 
L
S
 
A
Q
 
D
P
 
-
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
L
 
L
D
 
E
H
 
P
H
 
H
A
 
A
L
 
L
L
 
G
V
 
V
R
 
H
N
 
E
G
 
G
R
 
R
I
 
I
E
 
H
A
 
A
I
 
L
V
 
V
P
 
P
-
 
M
-
 
Q
-
 
D
-
 
L
E
 
K
G
 
G
E
 
P
A
 
Y
P
 
P
A
 
A
G
 
H
Q
 
W
S
 
Q
I
 
-
D
 
D
L
 
M
G
 
K
G
 
G
R
 
K
L
 
L
L
 
V
T
 
T
P
 
P
G
 
G
L
 
L
I
 
I
D
 
D
C
 
C
H
|
H
T
 
T
H
|
H
L
 
L
V
 
I
F
 
F
G
 
A
G
 
G
S
 
S
R
 
R
A
 
A
Q
 
E
E
 
E
W
 
F
E
 
E
Q
 
L
R
 
R
L
 
Q
N
 
K
G
 
G
V
 
V
S
 
P
Y
 
Y
Q
 
A
T
 
E
I
 
I
S
 
A
A
 
R
N
 
K
G
 
G
G
 
G
G
 
G
I
 
I
N
 
I
A
 
S
T
 
T
V
 
V
R
 
R
A
 
A
T
 
T
R
 
R
D
 
A
S
 
A
S
 
C
E
 
E
A
 
E
E
 
Q
L
 
L
L
 
F
A
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
L
Q
 
P
R
 
R
L
 
V
A
 
K
R
 
S
L
 
L
L
 
I
R
 
R
E
 
E
G
 
G
V
 
V
T
 
T
T
 
T
L
 
V
E
 
E
I
 
I
K
 
K
S
 
S
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
D
 
T
L
 
L
A
 
E
N
 
D
E
 
E
R
 
L
K
 
K
M
 
M
L
 
L
R
 
R
V
 
V
V
 
A
Q
 
R
Q
 
R
L
 
L
A
 
G
A
 
E
T
 
A
H
 
L
A
 
P
V
 
I
E
 
R
V
 
V
S
 
K
P
 
T
T
 
T
L
 
L
L
 
L
S
 
A
A
 
A
H
 
H
A
 
A
T
 
V
P
 
P
P
 
P
E
 
E
Y
 
Y
K
 
R
G
 
D
D
 
D
P
 
P
D
 
D
G
 
S
Y
 
W
I
 
V
N
 
E
L
 
T
V
 
I
C
 
C
E
 
Q
T
 
E
I
 
I
L
 
I
P
 
P
T
 
A
L
 
A
W
 
A
E
 
E
E
 
A
G
 
G
L
 
L
F
 
A
E
 
D
S
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
V
F
 
F
C
 
C
E
 
E
N
 
H
V
 
I
G
 
G
F
 
F
S
 
S
P
 
L
T
 
A
Q
 
Q
T
 
T
E
 
E
R
 
Q
I
 
V
Y
 
Y
S
 
L
T
 
A
A
 
A
Q
 
D
A
 
Q
L
 
Y
G
 
G
I
 
L
P
 
A
V
 
V
K
 
K
G
 
G
H
|
H
V
 
M
E
 
D
Q
 
Q
L
 
L
S
 
S
S
 
N
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
S
E
 
T
L
 
L
V
 
A
S
 
A
R
 
N
Y
 
F
H
 
G
G
 
A
L
 
L
S
 
S
A
 
V
D
 
D
H
 
H
I
 
L
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
T
 
D
P
 
P
E
 
E
G
 
G
V
 
I
A
 
Q
A
 
A
M
 
L
S
 
A
R
 
H
S
 
R
G
 
G
T
 
V
V
 
V
A
 
A
V
 
T
L
 
L
L
 
L
P
 
P
G
 
T
A
 
A
F
 
F
Y
 
Y
F
 
F
L
 
L
N
 
K
E
 
E
T
 
T
R
 
K
R
 
L
P
 
P
P
 
P
V
 
V
E
 
A
L
 
A
L
 
L
R
 
R
E
 
K
Y
 
A
Q
 
G
V
 
V
P
 
P
M
 
M
A
 
A
V
 
V
A
 
S
T
 
S
D
|
D
Y
 
I
N
 
N
P
 
P
G
 
G
T
 
T
S
 
A
P
 
P
F
 
I
A
 
V
S
 
S
L
 
L
H
 
R
L
 
M
A
 
A
M
 
M
N
 
N
M
 
M
A
 
A
C
 
C
V
 
T
K
 
L
F
 
F
G
 
G
L
 
L
T
 
T
P
 
P
E
 
V
E
 
E
A
 
A
W
 
M
A
 
A
G
 
G
V
 
V
T
 
T
R
 
R
H
 
H
A
 
A
A
 
A
Q
 
R
A
 
A
L
 
L
G
 
G
R
 
E
Q
 
Q
A
 
E
S
 
Q
H
 
L
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
A
 
R
P
 
V
G
 
G
F
 
M
V
 
L
A
 
A
D
 
D
F
 
F
A
 
L
I
 
V
W
 
W
D
 
N
A
 
C
E
 
G
H
 
H
P
 
P
V
 
A
E
 
E
M
 
L
V
 
S
Y
 
Y
E
 
L
P
 
I
G
 
G
R
 
V
S
 
D
P
 
Q
L
 
L
W
 
V
Q
 
S
R
 
R
V
 
V
V
 
I
R
 
N
G
 
G
E
 
E

2oofA The crystal structure of 4-imidazolone-5-propanoate amidohydrolase from environmental sample
55% identity, 97% coverage: 10:403/405 of query aligns to 6:399/403 of 2oofA

query
sites
2oofA
I
 
V
W
 
W
R
 
L
N
 
N
A
 
V
R
 
T
L
 
P
A
 
A
T
 
T
L
 
L
D
 
R
P
 
S
R
 
D
S
 
L
S
 
A
Q
 
D
P
 
-
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
L
 
L
D
 
E
H
 
P
H
 
H
A
 
A
L
 
L
L
 
G
V
 
V
R
 
H
N
 
E
G
 
G
R
 
R
I
 
I
E
 
H
A
 
A
I
 
L
V
 
V
P
 
P
-
 
M
-
 
Q
E
 
D
G
 
L
E
 
K
A
 
Y
P
 
P
A
 
A
G
 
H
Q
 
W
S
 
Q
I
 
-
D
 
D
L
 
M
G
 
K
G
 
G
R
 
K
L
 
L
L
 
V
T
 
T
P
 
P
G
 
G
L
 
L
I
 
I
D
 
D
C
 
C
H
|
H
T
 
T
H
|
H
L
 
L
V
 
I
F
 
F
G
 
A
G
 
G
S
 
S
R
 
R
A
 
A
Q
 
E
E
 
E
W
 
F
E
 
E
Q
 
L
R
 
R
L
 
Q
N
 
K
G
 
G
V
 
V
S
 
P
Y
 
Y
Q
 
A
T
 
E
I
 
I
S
 
A
A
 
R
N
 
K
G
 
G
G
 
G
G
 
G
I
 
I
N
 
I
A
 
S
T
 
T
V
 
V
R
 
R
A
 
A
T
 
T
R
 
R
D
 
A
S
 
A
S
 
S
E
 
E
A
 
D
E
 
Q
L
 
L
L
 
F
A
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
L
Q
 
P
R
 
R
L
 
V
A
 
K
R
 
S
L
 
L
L
 
I
R
 
R
E
 
E
G
 
G
V
 
V
T
 
T
T
 
T
L
 
V
E
 
E
I
 
I
K
 
K
S
 
S
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
D
 
T
L
 
L
A
 
E
N
 
D
E
 
E
R
 
L
K
 
K
M
 
M
L
 
L
R
 
R
V
 
V
V
 
A
Q
 
R
Q
 
R
L
 
L
A
 
G
A
 
E
T
 
A
H
 
L
A
 
P
V
 
I
E
 
R
V
 
V
S
 
K
P
 
T
T
 
T
L
 
L
L
 
L
S
 
A
A
 
A
H
 
H
A
 
A
T
 
V
P
 
P
P
 
P
E
 
E
Y
 
Y
K
 
R
G
 
D
D
 
D
P
 
P
D
 
D
G
 
S
Y
 
W
I
 
V
N
 
E
L
 
T
V
 
I
C
 
C
E
 
Q
T
 
E
I
 
I
L
 
I
P
 
P
T
 
A
L
 
A
W
 
A
E
 
E
E
 
A
G
 
G
L
 
L
F
 
A
E
 
D
S
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
V
F
 
F
C
 
C
E
 
E
N
 
H
V
 
I
G
 
G
F
 
F
S
 
S
P
 
L
T
 
A
Q
 
Q
T
 
T
E
 
E
R
 
Q
I
 
V
Y
 
Y
S
 
L
T
 
A
A
 
A
Q
 
D
A
 
Q
L
 
Y
G
 
G
I
 
L
P
 
A
V
 
V
K
 
K
G
 
G
H
|
H
V
 
M
E
 
D
Q
 
Q
L
 
L
S
 
S
S
 
N
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
S
E
 
T
L
 
L
V
 
A
S
 
A
R
 
N
Y
 
F
H
 
G
G
 
A
L
 
L
S
 
S
A
 
V
D
 
D
H
 
H
I
 
L
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
T
 
D
P
 
P
E
 
E
G
 
G
V
 
I
A
 
Q
A
 
A
M
 
L
S
 
A
R
 
H
S
 
R
G
 
G
T
 
V
V
 
V
A
 
A
V
 
T
L
 
L
L
 
L
P
 
P
G
 
T
A
 
A
F
 
F
Y
 
Y
F
 
F
L
 
L
N
 
K
E
 
E
T
 
T
R
 
K
R
 
L
P
 
P
P
 
P
V
 
V
E
 
V
L
 
A
L
 
L
R
 
R
E
 
K
Y
 
A
Q
 
G
V
 
V
P
 
P
M
 
M
A
 
A
V
 
V
A
 
S
T
 
S
D
|
D
Y
 
I
N
 
N
P
 
P
G
 
G
T
 
T
S
 
A
P
 
P
F
 
I
A
 
V
S
 
S
L
 
L
H
 
R
L
 
M
A
 
A
M
 
M
N
 
N
M
 
M
A
 
A
C
 
C
V
 
T
K
 
L
F
 
F
G
 
G
L
 
L
T
 
T
P
 
P
E
 
V
E
 
E
A
 
A
W
 
M
A
 
A
G
 
G
V
 
V
T
 
T
R
 
R
H
 
H
A
 
A
A
 
A
Q
 
R
A
 
A
L
 
L
G
 
G
R
 
E
Q
 
Q
A
 
E
S
 
Q
H
 
L
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
A
 
R
P
 
V
G
 
G
F
 
M
V
 
L
A
 
A
D
 
D
F
 
F
A
 
L
I
 
V
W
 
W
D
 
N
A
 
C
E
 
G
H
 
H
P
 
P
V
 
A
E
 
E
M
 
L
V
 
S
Y
 
Y
E
 
L
P
 
I
G
 
G
R
 
V
S
 
D
P
 
Q
L
 
L
W
 
V
Q
 
S
R
 
R
V
 
V
V
 
V
R
 
N
G
 
G
E
 
E

Q8U8Z6 Imidazolonepropionase; Imidazolone-5-propanoate hydrolase; Imidazolone-5-propionate hydrolase; EC 3.5.2.7 from Agrobacterium fabrum (strain C58 / ATCC 33970) (Agrobacterium tumefaciens (strain C58)) (see 2 papers)
50% identity, 100% coverage: 2:405/405 of query aligns to 10:417/419 of Q8U8Z6

query
sites
Q8U8Z6
T
 
T
H
 
A
T
 
T
L
 
G
S
 
N
E
 
A
R
 
T
V
 
A
I
 
L
W
 
W
R
 
R
N
 
N
A
 
A
R
 
Q
L
 
L
A
 
A
T
 
T
L
 
L
D
 
N
P
 
P
R
 
-
S
 
A
S
 
M
Q
 
D
P
 
G
Y
 
I
G
 
G
L
 
A
L
 
V
D
 
E
H
 
N
H
 
A
A
 
V
L
 
I
L
 
A
V
 
V
R
 
R
N
 
N
G
 
G
R
 
R
I
 
I
E
 
A
A
 
F
I
 
A
V
 
G
P
 
P
E
 
E
G
 
S
E
 
D
A
 
L
P
 
P
-
 
D
-
 
D
-
 
L
-
 
S
-
 
T
A
 
A
G
 
D
Q
 
E
S
 
T
I
 
T
D
 
D
L
 
C
G
 
G
G
 
G
R
 
R
L
 
W
L
 
I
T
 
T
P
 
P
G
 
A
L
 
L
I
 
I
D
 
D
C
 
C
H
|
H
T
 
T
H
|
H
L
 
L
V
 
V
F
 
F
G
 
G
G
 
G
S
 
N
R
 
R
A
 
A
Q
 
M
E
 
E
W
 
F
E
 
E
Q
 
M
R
 
R
L
 
L
N
 
N
G
 
G
V
 
A
S
 
T
Y
 
Y
Q
 
E
T
 
E
I
 
I
S
 
A
A
 
K
N
 
A
G
 
G
G
 
G
G
 
G
I
 
I
N
 
V
A
 
S
T
 
S
V
 
V
R
 
R
A
 
D
T
 
T
R
 
R
D
 
A
S
 
L
S
 
S
E
 
D
A
 
E
E
 
V
L
 
L
L
 
V
A
 
A
L
 
Q
A
 
A
R
 
L
Q
 
P
R
 
R
L
 
L
A
 
D
R
 
T
L
 
L
L
 
L
R
 
S
E
 
E
G
 
G
V
 
V
T
 
S
T
 
T
L
 
I
E
 
E
I
 
I
K
 
K
S
 
S
G
 
G
Y
|
Y
G
 
G
L
 
L
D
 
D
L
 
I
A
 
E
N
 
T
E
 
E
R
 
L
K
 
K
M
 
M
L
 
L
R
 
R
V
 
V
V
 
A
Q
 
R
Q
 
R
L
 
L
A
 
E
A
 
T
T
 
L
H
 
R
A
 
P
V
 
V
E
 
R
V
 
I
S
 
V
P
 
T
T
 
S
L
 
Y
L
 
L
S
 
A
A
 
A
H
 
H
A
 
A
T
 
T
P
 
P
P
 
A
E
 
D
Y
 
Y
K
 
K
G
 
G
D
 
R
P
 
N
D
 
A
G
 
D
Y
 
Y
I
 
I
N
 
T
L
 
-
V
 
-
C
 
-
E
 
D
T
 
V
I
 
V
L
 
L
P
 
P
T
 
G
L
 
L
W
 
E
E
 
K
-
 
A
-
 
H
-
 
A
E
 
E
G
 
G
L
 
L
F
 
A
E
 
D
S
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
G
F
 
F
C
 
C
E
 
E
N
 
G
V
 
I
G
 
A
F
 
F
S
 
S
P
 
V
T
 
K
Q
 
E
T
 
I
E
 
D
R
 
R
I
 
V
Y
 
F
S
 
A
T
 
A
A
 
A
Q
 
Q
A
 
Q
L
 
R
G
 
G
I
 
L
P
 
P
V
 
V
K
 
K
G
 
L
H
|
H
V
 
A
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
S
 
S
S
 
N
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
A
E
 
E
L
 
L
V
 
A
S
 
A
R
 
S
Y
 
Y
H
 
N
G
 
A
L
 
L
S
 
S
A
 
A
D
 
D
H
 
H
I
 
L
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
T
 
D
P
 
E
E
 
T
G
 
G
V
 
A
A
 
K
A
 
A
M
 
L
S
 
A
R
 
K
S
 
A
G
 
G
T
 
T
V
 
V
A
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
L
P
 
P
G
 
G
A
 
A
F
 
F
Y
 
Y
F
 
A
L
 
L
N
 
R
E
 
E
T
 
K
R
 
Q
R
 
L
P
 
P
P
 
P
V
 
V
E
 
Q
L
 
A
L
 
L
R
 
R
E
 
D
Y
 
A
Q
 
G
V
 
A
P
 
E
M
 
I
A
 
A
V
 
L
A
 
A
T
 
T
D
|
D
Y
 
C
N
|
N
P
 
P
G
|
G
T
 
T
S
 
S
P
 
P
F
 
L
A
 
T
S
 
S
L
 
L
H
 
L
L
 
L
A
 
T
M
 
M
N
 
N
M
 
M
A
 
G
C
 
A
V
 
T
K
 
L
F
 
F
G
 
R
L
 
M
T
 
T
P
 
V
E
 
E
E
 
E
A
 
C
W
 
L
A
 
T
G
 
A
V
 
T
T
 
T
R
 
R
H
 
N
A
 
A
A
 
A
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
G
 
G
R
 
L
Q
 
L
A
 
A
S
 
E
H
 
T
G
 
G
Q
 
T
L
 
L
A
 
E
P
 
A
G
 
G
F
 
K
V
 
S
A
 
A
D
 
D
F
 
F
A
 
A
I
 
I
W
 
W
D
 
D
A
 
I
E
 
E
H
 
R
P
 
P
V
 
A
E
 
E
M
 
L
V
 
V
Y
 
Y
E
 
R
P
 
I
G
 
G
R
 
F
S
 
N
P
 
P
L
 
L
W
 
H
Q
 
A
R
 
R
V
 
I
V
 
F
R
 
K
G
 
G
E
 
Q
I
 
K
V
 
V

2puzB Crystal structure of imidazolonepropionase from agrobacterium tumefaciens with bound product n-formimino-l-glutamate (see paper)
51% identity, 98% coverage: 10:405/405 of query aligns to 4:403/404 of 2puzB

query
sites
2puzB
I
 
L
W
 
W
R
 
R
N
 
N
A
 
A
R
 
Q
L
 
L
A
 
A
T
 
T
L
 
L
D
 
N
P
 
P
R
 
-
S
 
A
S
 
M
Q
 
D
P
 
G
Y
 
I
G
 
G
L
 
A
L
 
V
D
 
E
H
 
N
H
 
A
A
 
V
L
 
I
L
 
A
V
 
V
R
 
R
N
 
N
G
 
G
R
 
R
I
 
I
E
 
A
A
 
F
I
 
A
V
 
G
P
 
P
E
 
E
G
 
S
E
 
D
A
 
L
P
 
P
-
 
D
-
 
D
-
 
L
-
 
S
-
 
T
A
 
A
G
 
D
Q
 
E
S
 
T
I
 
T
D
 
D
L
 
C
G
 
G
G
 
G
R
 
R
L
 
W
L
 
I
T
 
T
P
 
P
G
 
A
L
 
L
I
 
I
D
 
D
C
 
C
H
|
H
T
 
T
H
|
H
L
 
L
V
 
V
F
 
F
G
 
G
G
 
G
S
 
N
R
|
R
A
 
A
Q
 
M
E
 
E
W
 
F
E
 
E
Q
 
M
R
 
R
L
 
L
N
 
N
G
 
G
V
 
A
S
 
T
Y
 
Y
Q
 
E
T
 
E
I
 
I
S
 
A
A
 
K
N
 
A
G
 
G
G
 
G
G
 
G
I
|
I
N
 
V
A
 
S
T
 
S
V
 
V
R
 
R
A
 
D
T
 
T
R
 
R
D
 
A
S
 
L
S
 
S
E
 
D
A
 
E
E
 
V
L
 
L
L
 
V
A
 
A
L
 
Q
A
 
A
R
 
L
Q
 
P
R
 
R
L
 
L
A
 
D
R
 
T
L
 
L
L
 
L
R
 
S
E
 
E
G
 
G
V
 
V
T
 
S
T
 
T
L
 
I
E
 
E
I
 
I
K
 
K
S
 
S
G
 
G
Y
|
Y
G
 
G
L
 
L
D
 
D
L
 
I
A
 
E
N
 
T
E
 
E
R
 
L
K
 
K
M
 
M
L
 
L
R
 
R
V
 
V
V
 
A
Q
 
R
Q
 
R
L
 
L
A
 
E
A
 
T
T
 
L
H
 
R
A
 
P
V
 
V
E
 
R
V
 
I
S
 
V
P
 
T
T
 
S
L
 
Y
L
 
L
S
 
A
A
 
A
H
|
H
A
 
A
T
 
T
P
 
P
P
 
A
E
 
D
Y
 
Y
K
 
K
G
 
G
D
 
R
P
 
N
D
 
A
G
 
D
Y
 
Y
I
 
I
N
 
T
L
 
-
V
 
-
C
 
-
E
 
D
T
 
V
I
 
V
L
 
L
P
 
P
T
 
G
L
 
L
W
 
E
E
 
K
-
 
A
-
 
H
-
 
A
E
 
E
G
 
G
L
 
L
F
 
A
E
 
D
S
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
G
F
|
F
C
 
C
E
 
E
N
 
G
V
x
I
G
 
A
F
 
F
S
 
S
P
 
V
T
 
K
Q
 
E
T
 
I
E
 
D
R
 
R
I
 
V
Y
 
F
S
 
A
T
 
A
A
 
A
Q
 
Q
A
 
Q
L
 
R
G
 
G
I
 
L
P
 
P
V
 
V
K
 
K
G
 
L
H
|
H
V
 
A
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
S
 
S
S
 
N
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
A
E
 
E
L
 
L
V
 
A
S
 
A
R
 
S
Y
 
Y
H
 
N
G
 
A
L
 
L
S
 
S
A
 
A
D
 
D
H
 
H
I
 
L
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
T
 
D
P
 
E
E
 
T
G
 
G
V
 
A
A
 
K
A
 
A
M
 
L
S
 
A
R
 
K
S
 
A
G
 
G
T
 
T
V
 
V
A
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
L
P
 
P
G
 
G
A
 
A
F
 
F
Y
 
Y
F
 
A
L
 
L
N
 
R
E
 
E
T
 
K
R
 
Q
R
 
L
P
 
P
P
 
P
V
 
V
E
 
Q
L
 
A
L
 
L
R
 
R
E
 
D
Y
 
A
Q
 
G
V
 
A
P
 
E
M
 
I
A
 
A
V
 
L
A
 
A
T
 
T
D
|
D
Y
 
C
N
|
N
P
 
P
G
|
G
T
|
T
S
 
S
P
 
P
F
 
L
A
 
T
S
 
S
L
 
L
H
 
L
L
 
L
A
 
T
M
 
M
N
 
N
M
 
M
A
 
G
C
 
A
V
 
T
K
 
L
F
 
F
G
 
R
L
 
M
T
 
T
P
 
V
E
 
E
E
 
E
A
 
C
W
 
L
A
 
T
G
 
A
V
 
T
T
 
T
R
 
R
H
 
N
A
 
A
A
 
A
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
G
 
G
R
 
L
Q
 
L
A
 
A
S
 
E
H
 
T
G
 
G
Q
 
T
L
 
L
A
 
E
P
 
A
G
 
G
F
 
K
V
 
S
A
 
A
D
 
D
F
 
F
A
 
A
I
 
I
W
 
W
D
 
D
A
 
I
E
 
E
H
 
R
P
 
P
V
 
A
E
 
E
M
 
L
V
 
V
Y
 
Y
E
 
R
P
 
I
G
 
G
R
 
F
S
 
N
P
 
P
L
 
L
W
 
H
Q
 
A
R
 
R
V
 
I
V
 
F
R
 
K
G
 
G
E
 
Q
I
 
K
V
 
V

2gokA Crystal structure of the imidazolonepropionase from agrobacterium tumefaciens at 1.87 a resolution (see paper)
51% identity, 98% coverage: 10:405/405 of query aligns to 4:403/404 of 2gokA

query
sites
2gokA
I
 
L
W
 
W
R
 
R
N
 
N
A
 
A
R
 
Q
L
 
L
A
 
A
T
 
T
L
 
L
D
 
N
P
 
P
R
 
-
S
 
A
S
 
M
Q
 
D
P
 
G
Y
 
I
G
 
G
L
 
A
L
 
V
D
 
E
H
 
N
H
 
A
A
 
V
L
 
I
L
 
A
V
 
V
R
 
R
N
 
N
G
 
G
R
 
R
I
 
I
E
 
A
A
 
F
I
 
A
V
 
G
P
 
P
E
 
E
G
 
S
E
 
D
A
 
L
P
 
P
-
 
D
-
 
D
-
 
L
-
 
S
-
 
T
A
 
A
G
 
D
Q
 
E
S
 
T
I
 
T
D
 
D
L
 
C
G
 
G
G
 
G
R
 
R
L
 
W
L
 
I
T
 
T
P
 
P
G
 
A
L
 
L
I
 
I
D
 
D
C
 
C
H
|
H
T
 
T
H
|
H
L
 
L
V
 
V
F
 
F
G
 
G
G
 
G
S
 
N
R
 
R
A
 
A
Q
 
M
E
 
E
W
 
F
E
 
E
Q
 
M
R
 
R
L
 
L
N
 
N
G
 
G
V
 
A
S
 
T
Y
 
Y
Q
 
E
T
 
E
I
 
I
S
 
A
A
 
K
N
 
A
G
 
G
G
 
G
G
 
G
I
 
I
N
 
V
A
 
S
T
 
S
V
 
V
R
 
R
A
 
D
T
 
T
R
 
R
D
 
A
S
 
L
S
 
S
E
 
D
A
 
E
E
 
V
L
 
L
L
 
V
A
 
A
L
 
Q
A
 
A
R
 
L
Q
 
P
R
 
R
L
 
L
A
 
D
R
 
T
L
 
L
L
 
L
R
 
S
E
 
E
G
 
G
V
 
V
T
 
S
T
 
T
L
 
I
E
 
E
I
 
I
K
 
K
S
 
S
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
D
 
D
L
 
I
A
 
E
N
 
T
E
 
E
R
 
L
K
 
K
M
 
M
L
 
L
R
 
R
V
 
V
V
 
A
Q
 
R
Q
 
R
L
 
L
A
 
E
A
 
T
T
 
L
H
 
R
A
 
P
V
 
V
E
 
R
V
 
I
S
 
V
P
 
T
T
 
S
L
 
Y
L
 
L
S
 
A
A
 
A
H
 
H
A
 
A
T
 
T
P
 
P
P
 
A
E
 
D
Y
 
Y
K
 
K
G
 
G
D
 
R
P
 
N
D
 
A
G
 
D
Y
 
Y
I
 
I
N
 
T
L
 
-
V
 
-
C
 
-
E
 
D
T
 
V
I
 
V
L
 
L
P
 
P
T
 
G
L
 
L
W
 
E
E
 
K
-
 
A
-
 
H
-
 
A
E
 
E
G
 
G
L
 
L
F
 
A
E
 
D
S
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
G
F
 
F
C
 
C
E
 
E
N
 
G
V
 
I
G
 
A
F
 
F
S
 
S
P
 
V
T
 
K
Q
 
E
T
 
I
E
 
D
R
 
R
I
 
V
Y
 
F
S
 
A
T
 
A
A
 
A
Q
 
Q
A
 
Q
L
 
R
G
 
G
I
 
L
P
 
P
V
 
V
K
 
K
G
 
L
H
|
H
V
 
A
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
S
 
S
S
 
N
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
A
E
 
E
L
 
L
V
 
A
S
 
A
R
 
S
Y
 
Y
H
 
N
G
 
A
L
 
L
S
 
S
A
 
A
D
 
D
H
 
H
I
 
L
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
T
 
D
P
 
E
E
 
T
G
 
G
V
 
A
A
 
K
A
 
A
M
 
L
S
 
A
R
 
K
S
 
A
G
 
G
T
 
T
V
 
V
A
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
L
P
 
P
G
 
G
A
 
A
F
 
F
Y
 
Y
F
 
A
L
 
L
N
 
R
E
 
E
T
 
K
R
 
Q
R
 
L
P
 
P
P
 
P
V
 
V
E
 
Q
L
 
A
L
 
L
R
 
R
E
 
D
Y
 
A
Q
 
G
V
 
A
P
 
E
M
 
I
A
 
A
V
 
L
A
 
A
T
 
T
D
|
D
Y
 
C
N
 
N
P
 
P
G
 
G
T
 
T
S
 
S
P
 
P
F
 
L
A
 
T
S
 
S
L
 
L
H
 
L
L
 
L
A
 
T
M
 
M
N
 
N
M
 
M
A
 
G
C
 
A
V
 
T
K
 
L
F
 
F
G
 
R
L
 
M
T
 
T
P
 
V
E
 
E
E
 
E
A
 
C
W
 
L
A
 
T
G
 
A
V
 
T
T
 
T
R
 
R
H
 
N
A
 
A
A
 
A
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
G
 
G
R
 
L
Q
 
L
A
 
A
S
 
E
H
 
T
G
 
G
Q
 
T
L
 
L
A
 
E
P
 
A
G
 
G
F
 
K
V
 
S
A
 
A
D
 
D
F
 
F
A
 
A
I
 
I
W
 
W
D
 
D
A
 
I
E
 
E
H
 
R
P
 
P
V
 
A
E
 
E
M
 
L
V
 
V
Y
 
Y
E
 
R
P
 
I
G
 
G
R
 
F
S
 
N
P
 
P
L
 
L
W
 
H
Q
 
A
R
 
R
V
 
I
V
 
F
R
 
K
G
 
G
E
 
Q
I
 
K
V
 
V

2g3fA Crystal structure of imidazolonepropionase complexed with imidazole-4- acetic acid sodium salt, a substrate homologue (see paper)
41% identity, 87% coverage: 53:405/405 of query aligns to 60:411/414 of 2g3fA

query
sites
2g3fA
A
 
A
G
 
D
Q
 
E
S
 
I
I
 
I
D
 
D
L
 
C
G
 
S
G
 
G
R
 
R
L
 
L
L
 
V
T
 
T
P
 
P
G
 
G
L
 
L
I
 
V
D
 
D
C
 
P
H
|
H
T
 
T
H
|
H
L
 
L
V
 
V
F
 
F
G
 
G
G
 
G
S
 
S
R
|
R
A
 
E
Q
 
K
E
 
E
W
 
M
E
 
N
Q
 
L
R
 
K
L
 
L
N
 
Q
G
 
G
V
 
I
S
 
S
Y
|
Y
Q
 
L
T
 
D
I
 
I
S
 
L
A
 
A
N
 
Q
G
 
G
G
 
G
G
 
G
I
|
I
N
 
L
A
 
S
T
 
T
V
 
V
R
 
K
A
 
D
T
 
T
R
 
R
D
 
A
S
 
A
S
 
S
E
 
E
A
 
E
E
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
Q
L
 
K
A
 
A
R
 
H
Q
 
F
R
 
H
L
 
L
A
 
Q
R
 
R
L
 
M
L
 
L
R
 
S
E
 
Y
G
 
G
V
 
T
T
 
T
T
 
T
L
 
A
E
 
E
I
 
V
K
 
K
S
 
S
G
 
G
Y
|
Y
G
 
G
L
 
L
D
 
E
L
 
K
A
 
E
N
 
T
E
 
E
R
 
L
K
 
K
M
 
Q
L
 
L
R
 
R
V
 
V
V
 
A
Q
 
K
Q
 
K
L
 
L
A
 
H
A
 
E
T
 
S
H
 
Q
A
 
P
V
 
V
E
 
D
V
 
L
S
 
V
P
 
S
T
 
T
L
 
F
L
 
M
S
 
G
A
 
A
H
|
H
A
 
A
T
 
I
P
 
P
P
 
P
E
 
E
Y
 
Y
K
 
Q
G
 
N
D
 
D
P
 
P
D
 
D
G
 
D
Y
 
F
I
 
L
N
 
D
L
 
Q
V
 
M
C
 
L
E
 
-
T
 
S
I
 
L
L
 
L
P
 
P
T
 
E
L
 
I
W
 
K
E
 
E
E
 
Q
G
 
E
L
 
L
F
 
A
E
 
S
S
 
F
V
 
A
D
 
D
A
 
I
F
|
F
C
 
T
E
 
E
N
 
T
V
 
G
G
 
V
F
 
F
S
 
T
P
 
V
T
 
S
Q
 
Q
T
 
S
E
 
R
R
 
R
I
 
Y
Y
 
L
S
 
Q
T
 
K
A
 
A
Q
 
A
A
 
E
L
 
A
G
 
G
I
 
F
P
 
G
V
 
L
K
 
K
G
 
I
H
|
H
V
 
A
E
 
D
Q
x
E
L
 
I
S
 
D
S
 
P
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
A
E
 
E
L
 
L
V
 
A
S
 
G
R
 
K
Y
 
L
H
 
K
G
 
A
L
 
V
S
 
S
A
 
A
D
 
D
H
 
H
I
 
L
E
 
V
Y
 
G
L
 
T
T
 
S
P
 
D
E
 
E
G
 
G
V
 
I
A
 
K
A
 
K
M
 
L
S
 
A
R
 
E
S
 
A
G
 
G
T
 
T
V
 
I
A
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
L
P
 
P
G
 
G
A
 
T
F
 
T
Y
 
F
F
 
Y
L
 
L
N
 
G
E
 
K
T
 
S
R
 
T
R
 
Y
P
 
A
P
 
R
V
 
A
E
 
R
L
 
A
L
 
M
R
 
I
E
 
D
Y
 
E
Q
 
G
V
 
V
P
 
C
M
 
V
A
 
S
V
 
L
A
 
A
T
 
T
D
|
D
Y
 
F
N
|
N
P
 
P
G
|
G
T
x
S
S
 
S
P
 
P
F
 
T
A
 
E
S
 
N
L
 
I
H
 
Q
L
 
L
A
 
I
M
 
M
N
 
S
M
 
I
A
 
A
C
 
A
V
 
L
K
 
H
F
 
L
G
 
K
L
 
M
T
 
T
P
 
A
E
 
E
E
 
E
A
 
I
W
 
W
A
 
H
G
 
A
V
 
V
T
 
T
R
 
V
H
 
N
A
 
A
A
 
A
Q
 
Y
A
 
A
L
 
I
G
 
G
R
 
K
Q
 
G
A
 
E
S
 
E
H
 
A
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
A
 
K
P
 
A
G
 
G
F
 
R
V
 
S
A
 
A
D
 
D
F
 
L
A
 
V
I
 
I
W
 
W
D
 
Q
A
 
A
E
 
P
H
 
N
P
 
Y
V
 
M
E
 
Y
M
 
I
V
 
P
Y
 
Y
E
 
H
P
 
Y
G
 
G
R
 
V
S
 
N
P
 
H
L
 
V
W
 
H
Q
 
Q
R
 
V
V
 
M
V
 
K
R
 
N
G
 
G
E
 
T
I
 
I
V
 
V

2bb0A Structure of imidazolonepropionase from bacillus subtilis (see paper)
41% identity, 87% coverage: 53:405/405 of query aligns to 59:410/413 of 2bb0A

query
sites
2bb0A
A
 
A
G
 
D
Q
 
E
S
 
I
I
 
I
D
 
D
L
 
C
G
 
S
G
 
G
R
 
R
L
 
L
L
 
V
T
 
T
P
 
P
G
 
G
L
 
L
I
 
V
D
 
D
C
 
P
H
|
H
T
 
T
H
|
H
L
 
L
V
 
V
F
 
F
G
 
G
G
 
G
S
 
S
R
|
R
A
 
E
Q
 
K
E
 
E
W
 
M
E
 
N
Q
 
L
R
 
K
L
 
L
N
 
Q
G
 
G
V
 
I
S
 
S
Y
|
Y
Q
 
L
T
 
D
I
 
I
S
 
L
A
 
A
N
 
Q
G
 
G
G
 
G
G
 
G
I
|
I
N
 
L
A
 
S
T
 
T
V
 
V
R
 
K
A
 
D
T
 
T
R
 
R
D
 
A
S
 
A
S
 
S
E
 
E
A
 
E
E
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
Q
L
 
K
A
 
A
R
 
H
Q
 
F
R
 
H
L
 
L
A
 
Q
R
 
R
L
 
M
L
 
L
R
 
S
E
 
Y
G
 
G
V
 
T
T
 
T
T
 
T
L
 
A
E
 
E
I
 
V
K
 
K
S
 
S
G
 
G
Y
|
Y
G
 
G
L
 
L
D
 
E
L
 
K
A
 
E
N
 
T
E
 
E
R
 
L
K
 
K
M
 
Q
L
 
L
R
 
R
V
 
V
V
 
A
Q
 
K
Q
 
K
L
 
L
A
 
H
A
 
E
T
 
S
H
 
Q
A
 
P
V
 
V
E
 
D
V
 
L
S
 
V
P
 
S
T
 
T
L
 
F
L
 
M
S
 
G
A
 
A
H
|
H
A
 
A
T
 
I
P
 
P
P
 
P
E
 
E
Y
 
Y
K
 
Q
G
 
N
D
 
D
P
 
P
D
 
D
G
 
D
Y
 
F
I
 
L
N
 
D
L
 
Q
V
 
M
C
 
L
E
 
-
T
 
S
I
 
L
L
 
L
P
 
P
T
 
E
L
 
I
W
 
K
E
 
E
E
 
Q
G
 
E
L
 
L
F
 
A
E
 
S
S
 
F
V
 
A
D
 
D
A
 
I
F
 
F
C
 
T
E
 
E
N
 
T
V
 
G
G
 
V
F
 
F
S
 
T
P
 
V
T
 
S
Q
 
Q
T
 
S
E
 
R
R
 
R
I
 
Y
Y
 
L
S
 
Q
T
 
K
A
 
A
Q
 
A
A
 
E
L
 
A
G
 
G
I
 
F
P
 
G
V
 
L
K
 
K
G
 
I
H
|
H
V
 
A
E
 
D
Q
 
E
L
 
I
S
 
D
S
 
P
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
A
E
 
E
L
 
L
V
 
A
S
 
G
R
 
K
Y
 
L
H
 
K
G
 
A
L
 
V
S
 
S
A
 
A
D
 
D
H
 
H
I
 
L
E
 
V
Y
 
G
L
 
T
T
 
S
P
 
D
E
 
E
G
 
G
V
 
I
A
 
K
A
 
K
M
 
L
S
 
A
R
 
E
S
 
A
G
 
G
T
 
T
V
 
I
A
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
L
P
 
P
G
 
G
A
 
T
F
 
T
Y
 
F
F
 
Y
L
 
L
N
 
G
E
 
K
T
 
S
R
 
T
R
 
Y
P
 
A
P
 
R
V
 
A
E
 
R
L
 
A
L
 
M
R
 
I
E
 
D
Y
 
E
Q
 
G
V
 
V
P
 
C
M
 
V
A
 
S
V
 
L
A
 
A
T
 
T
D
|
D
Y
 
F
N
|
N
P
 
P
G
|
G
T
x
S
S
 
S
P
 
P
F
 
T
A
 
E
S
 
N
L
 
I
H
 
Q
L
 
L
A
 
I
M
 
M
N
 
S
M
 
I
A
 
A
C
 
A
V
 
L
K
 
H
F
 
L
G
 
K
L
 
M
T
 
T
P
 
A
E
 
E
E
 
E
A
 
I
W
 
W
A
 
H
G
 
A
V
 
V
T
 
T
R
 
V
H
 
N
A
 
A
A
 
A
Q
 
Y
A
 
A
L
 
I
G
 
G
R
 
K
Q
 
G
A
 
E
S
 
E
H
 
A
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
A
 
K
P
 
A
G
 
G
F
 
R
V
 
S
A
 
A
D
 
D
F
 
L
A
 
V
I
 
I
W
 
W
D
 
Q
A
 
A
E
 
P
H
 
N
P
 
Y
V
 
M
E
 
Y
M
 
I
V
 
P
Y
 
Y
E
 
H
P
 
Y
G
 
G
R
 
V
S
 
N
P
 
H
L
 
V
W
 
H
Q
 
Q
R
 
V
V
 
M
V
 
K
R
 
N
G
 
G
E
 
T
I
 
I
V
 
V

P42084 Imidazolonepropionase; Imidazolone-5-propionate hydrolase; EC 3.5.2.7 from Bacillus subtilis (strain 168) (see paper)
41% identity, 87% coverage: 53:405/405 of query aligns to 61:412/421 of P42084

query
sites
P42084
A
 
A
G
 
D
Q
 
E
S
 
I
I
 
I
D
 
D
L
 
C
G
 
S
G
 
G
R
 
R
L
 
L
L
 
V
T
 
T
P
 
P
G
 
G
L
 
L
I
 
V
D
 
D
C
 
P
H
|
H
T
 
T
H
|
H
L
 
L
V
 
V
F
 
F
G
 
G
G
 
G
S
 
S
R
 
R
A
 
E
Q
 
K
E
 
E
W
 
M
E
 
N
Q
 
L
R
 
K
L
 
L
N
 
Q
G
 
G
V
 
I
S
 
S
Y
 
Y
Q
 
L
T
 
D
I
 
I
S
 
L
A
 
A
N
 
Q
G
 
G
G
 
G
G
 
G
I
 
I
N
 
L
A
 
S
T
 
T
V
 
V
R
 
K
A
 
D
T
 
T
R
 
R
D
 
A
S
 
A
S
 
S
E
 
E
A
 
E
E
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
Q
L
 
K
A
 
A
R
 
H
Q
 
F
R
 
H
L
 
L
A
 
Q
R
 
R
L
 
M
L
 
L
R
 
S
E
 
Y
G
 
G
V
 
T
T
 
T
T
 
T
L
 
A
E
 
E
I
 
V
K
 
K
S
 
S
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
D
 
E
L
 
K
A
 
E
N
 
T
E
 
E
R
 
L
K
 
K
M
 
Q
L
 
L
R
 
R
V
 
V
V
 
A
Q
 
K
Q
 
K
L
 
L
A
 
H
A
 
E
T
 
S
H
 
Q
A
 
P
V
 
V
E
 
D
V
 
L
S
 
V
P
 
S
T
 
T
L
 
F
L
 
M
S
 
G
A
 
A
H
 
H
A
 
A
T
 
I
P
 
P
P
 
P
E
 
E
Y
 
Y
K
 
Q
G
 
N
D
 
D
P
 
P
D
 
D
G
 
D
Y
 
F
I
 
L
N
 
D
L
 
Q
V
 
M
C
 
L
E
 
-
T
 
S
I
 
L
L
 
L
P
 
P
T
 
E
L
 
I
W
 
K
E
 
E
E
 
Q
G
 
E
L
 
L
F
 
A
E
 
S
S
 
F
V
 
A
D
 
D
A
 
I
F
 
F
C
 
T
E
 
E
N
 
T
V
 
G
G
 
V
F
 
F
S
 
T
P
 
V
T
 
S
Q
 
Q
T
 
S
E
 
R
R
 
R
I
 
Y
Y
 
L
S
 
Q
T
 
K
A
 
A
Q
 
A
A
 
E
L
 
A
G
 
G
I
 
F
P
 
G
V
 
L
K
 
K
G
 
I
H
|
H
V
 
A
E
 
D
Q
 
E
L
 
I
S
 
D
S
 
P
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
A
E
 
E
L
 
L
V
 
A
S
 
G
R
 
K
Y
 
L
H
 
K
G
 
A
L
 
V
S
 
S
A
 
A
D
 
D
H
 
H
I
 
L
E
 
V
Y
 
G
L
 
T
T
 
S
P
 
D
E
 
E
G
 
G
V
 
I
A
 
K
A
 
K
M
 
L
S
 
A
R
 
E
S
 
A
G
 
G
T
 
T
V
 
I
A
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
L
P
 
P
G
 
G
A
 
T
F
 
T
Y
 
F
F
 
Y
L
 
L
N
 
G
E
 
K
T
 
S
R
 
T
R
 
Y
P
 
A
P
 
R
V
 
A
E
 
R
L
 
A
L
 
M
R
 
I
E
 
D
Y
 
E
Q
 
G
V
 
V
P
 
C
M
 
V
A
 
S
V
 
L
A
 
A
T
 
T
D
|
D
Y
 
F
N
 
N
P
 
P
G
 
G
T
 
S
S
 
S
P
 
P
F
 
T
A
 
E
S
 
N
L
 
I
H
 
Q
L
 
L
A
 
I
M
 
M
N
 
S
M
 
I
A
 
A
C
 
A
V
 
L
K
 
H
F
 
L
G
 
K
L
 
M
T
 
T
P
 
A
E
 
E
E
 
E
A
 
I
W
 
W
A
 
H
G
 
A
V
 
V
T
 
T
R
 
V
H
 
N
A
 
A
A
 
A
Q
 
Y
A
 
A
L
 
I
G
 
G
R
 
K
Q
 
G
A
 
E
S
 
E
H
 
A
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
A
 
K
P
 
A
G
 
G
F
 
R
V
 
S
A
 
A
D
 
D
F
 
L
A
 
V
I
 
I
W
 
W
D
 
Q
A
 
A
E
 
P
H
 
N
P
 
Y
V
 
M
E
 
Y
M
 
I
V
 
P
Y
 
Y
E
 
H
P
 
Y
G
 
G
R
 
V
S
 
N
P
 
H
L
 
V
W
 
H
Q
 
Q
R
 
V
V
 
M
V
 
K
R
 
N
G
 
G
E
 
T
I
 
I
V
 
V

8dqnC Crystal structure of isoaspartyl dipeptidase from leucothrix mucor dsm2157 (see paper)
44% identity, 18% coverage: 10:82/405 of query aligns to 5:73/388 of 8dqnC

query
sites
8dqnC
I
 
I
W
 
L
R
 
R
N
 
N
A
 
A
R
 
N
L
 
V
A
 
-
T
 
-
L
 
-
D
 
-
P
 
-
R
 
Y
S
 
A
S
 
P
Q
 
Q
P
 
P
Y
 
L
G
 
G
L
 
L
L
 
-
D
 
-
H
 
-
H
 
K
A
 
T
L
 
V
L
 
L
V
 
V
R
 
G
N
 
G
G
 
G
R
 
K
I
 
I
E
 
L
A
 
A
I
 
I
V
 
T
P
 
D
E
 
E
G
 
A
-
 
L
E
 
E
A
 
L
P
 
P
A
 
A
-
 
S
-
 
I
-
 
V
G
 
A
Q
 
D
S
 
D
I
 
I
D
 
D
L
 
L
G
 
Q
G
 
G
R
 
R
L
 
I
L
 
L
T
 
T
P
 
P
G
 
G
L
 
F
I
 
I
D
 
D
C
 
A
H
|
H
T
 
A
H
 
H
L
 
I
V
 
T
F
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
G
R
 
E
A
 
A

Sites not aligning to the query:

1pokA Crystal structure of isoaspartyl dipeptidase (see paper)
43% identity, 12% coverage: 35:82/405 of query aligns to 28:78/377 of 1pokA

query
sites
1pokA
L
 
V
L
 
L
V
 
V
R
 
A
N
 
N
G
 
G
R
 
K
I
 
I
E
 
I
A
 
A
I
 
V
-
 
A
-
 
S
-
 
N
V
 
I
P
 
P
E
 
S
G
 
D
E
 
I
A
 
V
P
 
P
A
 
N
G
 
C
Q
 
T
S
 
V
I
 
V
D
 
D
L
 
L
G
 
S
G
 
G
R
 
Q
L
 
I
L
 
L
T
 
C
P
 
P
G
 
G
L
 
F
I
 
I
D
 
D
C
 
Q
H
|
H
T
 
V
H
|
H
L
 
L
V
 
I
F
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
G
R
 
E
A
 
A

Sites not aligning to the query:

P39377 Isoaspartyl dipeptidase; EC 3.4.19.- from Escherichia coli (strain K12) (see 4 papers)
43% identity, 12% coverage: 35:82/405 of query aligns to 28:78/390 of P39377

query
sites
P39377
L
 
V
L
 
L
V
 
V
R
 
A
N
 
N
G
 
G
R
 
K
I
 
I
E
 
I
A
 
A
I
 
V
-
 
A
-
 
S
-
 
N
V
 
I
P
 
P
E
 
S
G
 
D
E
 
I
A
 
V
P
 
P
A
 
N
G
 
C
Q
 
T
S
 
V
I
 
V
D
 
D
L
 
L
G
 
S
G
 
G
R
 
Q
L
 
I
L
 
L
T
 
C
P
 
P
G
 
G
L
 
F
I
 
I
D
 
D
C
 
Q
H
|
H
T
 
V
H
|
H
L
 
L
V
 
I
F
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
G
R
x
E
A
 
A

Sites not aligning to the query:

1ybqA Crystal structure of escherichia coli isoaspartyl dipeptidase mutant d285n complexed with beta-aspartylhistidine (see paper)
43% identity, 12% coverage: 35:82/405 of query aligns to 28:78/389 of 1ybqA

query
sites
1ybqA
L
 
V
L
 
L
V
 
V
R
 
A
N
 
N
G
 
G
R
 
K
I
 
I
E
 
I
A
 
A
I
 
V
-
 
A
-
 
S
-
 
N
V
 
I
P
 
P
E
 
S
G
 
D
E
 
I
A
 
V
P
 
P
A
 
N
G
 
C
Q
 
T
S
 
V
I
 
V
D
 
D
L
 
L
G
 
S
G
 
G
R
 
Q
L
 
I
L
 
L
T
 
C
P
 
P
G
 
G
L
 
F
I
 
I
D
 
D
C
 
Q
H
|
H
T
 
V
H
|
H
L
 
L
V
 
I
F
 
G
G
|
G
G
|
G
S
 
G
R
x
E
A
 
A

Sites not aligning to the query:

1pojA Isoaspartyl dipeptidase with bound inhibitor (see paper)
43% identity, 12% coverage: 35:82/405 of query aligns to 28:78/388 of 1pojA

query
sites
1pojA
L
 
V
L
 
L
V
 
V
R
 
A
N
 
N
G
 
G
R
 
K
I
 
I
E
 
I
A
 
A
I
 
V
-
 
A
-
 
S
-
 
N
V
 
I
P
 
P
E
 
S
G
 
D
E
 
I
A
 
V
P
 
P
A
 
N
G
 
C
Q
 
T
S
 
V
I
 
V
D
 
D
L
 
L
G
 
S
G
 
G
R
 
Q
L
 
I
L
 
L
T
 
C
P
 
P
G
 
G
L
 
F
I
 
I
D
 
D
C
 
Q
H
|
H
T
 
V
H
|
H
L
 
L
V
 
I
F
 
G
G
|
G
G
|
G
S
 
G
R
x
E
A
 
A

Sites not aligning to the query:

1onxA Crystal structure of isoaspartyl dipeptidase from escherichia coli complexed with aspartate (see paper)
43% identity, 12% coverage: 35:82/405 of query aligns to 28:78/389 of 1onxA

query
sites
1onxA
L
 
V
L
 
L
V
 
V
R
 
A
N
 
N
G
 
G
R
 
K
I
 
I
E
 
I
A
 
A
I
 
V
-
 
A
-
 
S
-
 
N
V
 
I
P
 
P
E
 
S
G
 
D
E
 
I
A
 
V
P
 
P
A
 
N
G
 
C
Q
 
T
S
 
V
I
 
V
D
 
D
L
 
L
G
 
S
G
 
G
R
 
Q
L
 
I
L
 
L
T
 
C
P
 
P
G
 
G
L
 
F
I
 
I
D
 
D
C
 
Q
H
|
H
T
 
V
H
|
H
L
 
L
V
 
I
F
 
G
G
|
G
G
|
G
S
 
G
R
x
E
A
 
A

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>BWI76_RS08720 FitnessBrowser__Koxy:BWI76_RS08720
MTHTLSERVIWRNARLATLDPRSSQPYGLLDHHALLVRNGRIEAIVPEGEAPAGQSIDLG
GRLLTPGLIDCHTHLVFGGSRAQEWEQRLNGVSYQTISANGGGINATVRATRDSSEAELL
ALARQRLARLLREGVTTLEIKSGYGLDLANERKMLRVVQQLAATHAVEVSPTLLSAHATP
PEYKGDPDGYINLVCETILPTLWEEGLFESVDAFCENVGFSPTQTERIYSTAQALGIPVK
GHVEQLSSLGGAELVSRYHGLSADHIEYLTPEGVAAMSRSGTVAVLLPGAFYFLNETRRP
PVELLREYQVPMAVATDYNPGTSPFASLHLAMNMACVKFGLTPEEAWAGVTRHAAQALGR
QASHGQLAPGFVADFAIWDAEHPVEMVYEPGRSPLWQRVVRGEIV

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory