SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing BWI76_RS09520 FitnessBrowser__Koxy:BWI76_RS09520 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4u00A Crystal structure of ttha1159 in complex with adp (see paper)
45% identity, 99% coverage: 3:242/242 of query aligns to 3:238/241 of 4u00A

query
sites
4u00A
I
 
I
K
 
R
L
 
I
N
 
R
G
 
N
I
 
L
N
 
H
C
 
K
F
 
W
Y
x
F
G
 
G
A
 
P
H
 
L
Q
 
H
A
x
V
L
 
L
F
 
K
D
 
G
I
 
I
T
 
H
L
 
L
D
 
E
C
 
V
P
 
A
Q
 
P
G
 
G
E
 
E
T
 
K
L
 
L
V
 
V
L
 
I
L
 
I
G
 
G
P
 
P
S
|
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
L
L
 
I
R
 
R
V
 
T
L
 
I
N
 
N
L
 
R
L
 
L
E
 
E
M
 
D
P
 
F
R
 
Q
S
 
E
G
 
G
T
 
E
L
 
V
H
 
V
I
 
V
A
 
D
G
 
G
N
 
-
H
 
-
F
 
-
D
 
-
F
 
-
T
 
L
K
 
S
A
 
V
P
 
K
S
 
D
D
 
D
K
 
R
A
 
A
I
 
L
R
 
R
E
 
E
L
 
I
R
 
R
Q
 
R
N
 
E
V
 
V
G
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
Q
Y
 
F
N
 
N
L
 
L
W
 
F
P
 
P
H
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
Q
 
L
Q
 
E
N
 
N
L
 
V
I
 
T
E
 
L
A
 
A
P
 
P
C
 
M
R
 
R
V
 
V
L
 
R
G
 
R
L
 
W
S
 
P
K
 
R
D
 
E
R
 
K
A
 
A
L
 
E
D
 
K
R
 
K
A
 
A
E
 
L
K
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
E
R
 
R
L
 
V
R
 
G
L
 
I
K
 
L
P
 
D
Y
 
Q
S
 
A
D
 
R
R
 
K
Y
 
Y
P
 
P
L
 
A
H
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
M
 
A
M
 
M
E
 
E
P
 
P
Q
 
K
V
 
I
L
 
M
L
 
L
F
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
I
 
M
T
 
V
A
 
G
Q
 
E
I
 
V
V
 
L
S
 
D
I
 
V
I
 
M
R
 
R
E
 
D
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
T
 
G
G
 
G
I
 
M
T
 
T
Q
 
M
V
 
V
I
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
V
 
M
E
 
G
V
 
F
A
 
A
R
 
R
K
 
E
T
 
V
A
 
A
S
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
V
Y
 
F
M
 
M
E
 
D
N
 
G
G
 
G
H
 
Q
I
 
I
V
 
V
E
 
E
Q
 
E
G
 
G
D
 
R
-
 
P
A
 
E
G
 
E
C
 
I
F
 
F
A
 
T
H
 
R
P
 
P
Q
 
K
T
 
E
D
 
E
A
 
R
F
 
T
K
 
R
N
 
S
Y
 
F
L
 
L
S
 
Q
H
 
R

4ymuJ Crystal structure of an amino acid abc transporter complex with arginines and atps (see paper)
44% identity, 99% coverage: 3:242/242 of query aligns to 2:238/240 of 4ymuJ

query
sites
4ymuJ
I
 
I
K
 
F
L
 
V
N
 
N
G
 
D
I
 
V
N
 
Y
C
 
K
F
 
N
Y
x
F
G
 
G
A
 
S
H
 
L
Q
 
E
A
x
V
L
 
L
F
 
K
D
 
G
I
 
V
T
 
T
L
 
L
D
 
K
C
 
V
P
 
N
Q
 
K
G
 
G
E
 
E
T
 
V
L
 
V
V
 
V
L
 
I
L
 
I
G
 
G
P
 
P
S
|
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
L
L
 
L
R
 
R
V
 
C
L
 
I
N
 
N
L
 
L
L
 
L
E
 
E
M
 
E
P
 
P
R
 
T
S
 
K
G
 
G
T
 
E
L
 
V
H
 
F
I
 
I
A
 
D
G
 
G
N
 
V
H
 
K
F
 
I
D
 
N
F
 
N
T
 
G
K
 
K
A
 
V
P
 
-
S
 
-
D
 
-
K
 
-
A
 
N
I
 
I
R
 
N
E
 
K
L
 
V
R
 
R
Q
 
Q
N
 
K
V
 
V
G
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
H
Y
 
F
N
 
N
L
 
L
W
 
F
P
 
P
H
 
H
L
 
L
T
 
T
V
 
A
Q
 
I
Q
 
E
N
 
N
L
 
I
I
 
T
E
 
L
A
 
A
P
 
P
C
 
V
R
 
K
V
 
V
L
 
K
G
 
K
L
 
M
S
 
N
K
 
K
D
 
K
R
 
E
A
 
A
L
 
E
D
 
E
R
 
L
A
 
A
E
 
V
K
 
D
L
 
L
L
 
L
E
 
A
R
 
K
L
 
V
R
 
G
L
 
L
K
 
L
P
 
D
Y
 
K
S
 
K
D
 
D
R
 
Q
Y
 
Y
P
 
P
L
 
I
H
 
K
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
M
 
A
M
 
M
E
 
Q
P
 
P
Q
 
E
V
 
V
L
 
M
L
 
L
F
 
F
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
T
A
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
I
 
M
T
 
V
A
 
K
Q
 
E
I
 
V
V
 
L
S
 
N
I
 
V
I
 
M
R
 
K
E
 
Q
L
 
L
A
 
A
E
 
N
T
 
E
G
 
G
I
 
M
T
 
T
Q
 
M
V
 
V
I
 
V
V
 
V
T
 
T
H
|
H
E
 
E
V
 
M
E
 
G
V
 
F
A
 
A
R
 
R
K
 
E
T
 
V
A
 
G
S
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
I
Y
 
F
M
 
M
E
 
D
N
 
D
G
 
G
H
 
V
I
 
I
V
 
V
E
 
E
Q
 
E
G
 
G
D
 
T
-
 
P
A
 
E
G
 
E
C
 
I
F
 
F
A
 
Y
H
 
R
P
 
A
Q
 
K
T
 
N
D
 
E
A
 
R
F
 
T
K
 
R
N
 
E
Y
 
F
L
 
L
S
 
S
H
 
K

3c4jA Abc protein artp in complex with atp-gamma-s
44% identity, 95% coverage: 12:241/242 of query aligns to 13:239/242 of 3c4jA

query
sites
3c4jA
Y
x
F
G
 
G
A
 
S
H
 
L
Q
 
E
A
x
V
L
 
L
F
 
K
D
 
G
I
 
I
T
 
N
L
 
V
D
 
H
C
 
I
P
 
R
Q
 
E
G
 
G
E
 
E
T
 
V
L
 
V
V
 
V
L
 
V
L
 
I
G
 
G
P
 
P
S
|
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
F
L
 
L
R
 
R
V
 
C
L
 
L
N
 
N
L
 
L
L
 
L
E
 
E
M
 
D
P
 
F
R
 
D
S
 
E
G
 
G
T
 
E
L
 
I
H
 
I
I
 
I
A
 
D
G
 
G
N
 
I
H
 
N
F
 
L
D
 
-
F
 
-
T
 
-
K
 
-
A
 
K
P
 
A
S
 
K
D
 
D
K
 
T
A
 
N
I
 
L
R
 
N
E
 
K
L
 
V
R
 
R
Q
 
E
N
 
E
V
 
V
G
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
R
Y
 
F
N
 
N
L
 
L
W
 
F
P
 
P
H
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
Q
 
L
Q
 
N
N
 
N
L
 
I
I
 
T
E
 
L
A
 
A
P
 
P
C
 
M
R
 
K
V
 
V
L
 
R
G
 
K
L
 
W
S
 
P
K
 
R
D
 
E
R
 
K
A
 
A
L
 
E
D
 
A
R
 
K
A
 
A
E
 
M
K
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
D
R
 
K
L
 
V
R
 
G
L
 
L
K
 
K
P
 
D
Y
 
K
S
 
A
D
 
H
R
 
A
Y
 
Y
P
 
P
L
 
D
H
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
M
 
A
M
 
M
E
 
E
P
 
P
Q
 
K
V
 
I
L
 
M
L
 
L
F
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
I
 
M
T
 
V
A
 
G
Q
 
E
I
 
V
V
 
L
S
 
S
I
 
V
I
 
M
R
 
K
E
 
Q
L
 
L
A
 
A
E
 
N
T
 
E
G
 
G
I
 
M
T
 
T
Q
 
M
V
 
V
I
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
V
 
M
E
 
G
V
 
F
A
 
A
R
 
R
K
 
E
T
 
V
A
 
G
S
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
L
Y
 
F
M
 
M
E
 
D
N
 
G
G
 
G
H
 
Y
I
 
I
V
 
I
E
 
E
Q
 
E
G
 
G
D
 
K
-
 
P
A
 
E
G
 
D
C
 
L
F
 
F
A
 
D
H
 
R
P
 
P
Q
 
Q
T
 
H
D
 
E
A
 
R
F
 
T
K
 
K
N
 
A
Y
 
F
L
 
L
S
 
S

3c41J Abc protein artp in complex with amp-pnp/mg2+
44% identity, 95% coverage: 12:241/242 of query aligns to 13:239/242 of 3c41J

query
sites
3c41J
Y
x
F
G
 
G
A
 
S
H
 
L
Q
 
E
A
x
V
L
 
L
F
 
K
D
 
G
I
 
I
T
 
N
L
 
V
D
 
H
C
 
I
P
 
R
Q
 
E
G
 
G
E
 
E
T
 
V
L
 
V
V
 
V
L
 
V
L
 
I
G
 
G
P
 
P
S
|
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
F
L
 
L
R
 
R
V
 
C
L
 
L
N
 
N
L
 
L
L
 
L
E
 
E
M
 
D
P
 
F
R
 
D
S
 
E
G
 
G
T
 
E
L
 
I
H
 
I
I
 
I
A
 
D
G
 
G
N
 
I
H
 
N
F
 
L
D
 
-
F
 
-
T
 
-
K
 
-
A
 
K
P
 
A
S
 
K
D
 
D
K
 
T
A
 
N
I
 
L
R
 
N
E
 
K
L
 
V
R
 
R
Q
 
E
N
 
E
V
 
V
G
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
R
Y
 
F
N
 
N
L
 
L
W
 
F
P
 
P
H
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
Q
 
L
Q
 
N
N
 
N
L
 
I
I
 
T
E
 
L
A
 
A
P
 
P
C
 
M
R
 
K
V
 
V
L
 
R
G
 
K
L
 
W
S
 
P
K
 
R
D
 
E
R
 
K
A
 
A
L
 
E
D
 
A
R
 
K
A
 
A
E
 
M
K
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
D
R
 
K
L
 
V
R
 
G
L
 
L
K
 
K
P
 
D
Y
 
K
S
 
A
D
 
H
R
 
A
Y
 
Y
P
 
P
L
 
D
H
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
M
 
A
M
 
M
E
 
E
P
 
P
Q
 
K
V
 
I
L
 
M
L
 
L
F
 
F
D
|
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
I
 
M
T
 
V
A
 
G
Q
 
E
I
 
V
V
 
L
S
 
S
I
 
V
I
 
M
R
 
K
E
 
Q
L
 
L
A
 
A
E
 
N
T
 
E
G
 
G
I
 
M
T
 
T
Q
 
M
V
 
V
I
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
V
 
M
E
 
G
V
 
F
A
 
A
R
 
R
K
 
E
T
 
V
A
 
G
S
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
L
Y
 
F
M
 
M
E
 
D
N
 
G
G
 
G
H
 
Y
I
 
I
V
 
I
E
 
E
Q
 
E
G
 
G
D
 
K
-
 
P
A
 
E
G
 
D
C
 
L
F
 
F
A
 
D
H
 
R
P
 
P
Q
 
Q
T
 
H
D
 
E
A
 
R
F
 
T
K
 
K
N
 
A
Y
 
F
L
 
L
S
 
S

2olkA Abc protein artp in complex with adp-beta-s
44% identity, 95% coverage: 12:241/242 of query aligns to 13:239/242 of 2olkA

query
sites
2olkA
Y
x
F
G
 
G
A
 
S
H
 
L
Q
 
E
A
x
V
L
 
L
F
 
K
D
 
G
I
 
I
T
 
N
L
 
V
D
 
H
C
 
I
P
 
R
Q
 
E
G
 
G
E
 
E
T
 
V
L
 
V
V
 
V
L
 
V
L
 
I
G
 
G
P
 
P
S
|
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
F
L
 
L
R
 
R
V
 
C
L
 
L
N
 
N
L
 
L
L
 
L
E
 
E
M
 
D
P
 
F
R
 
D
S
 
E
G
 
G
T
 
E
L
 
I
H
 
I
I
 
I
A
 
D
G
 
G
N
 
I
H
 
N
F
 
L
D
 
-
F
 
-
T
 
-
K
 
-
A
 
K
P
 
A
S
 
K
D
 
D
K
 
T
A
 
N
I
 
L
R
 
N
E
 
K
L
 
V
R
 
R
Q
 
E
N
 
E
V
 
V
G
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
R
Y
 
F
N
 
N
L
 
L
W
 
F
P
 
P
H
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
Q
 
L
Q
 
N
N
 
N
L
 
I
I
 
T
E
 
L
A
 
A
P
 
P
C
 
M
R
 
K
V
 
V
L
 
R
G
 
K
L
 
W
S
 
P
K
 
R
D
 
E
R
 
K
A
 
A
L
 
E
D
 
A
R
 
K
A
 
A
E
 
M
K
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
D
R
 
K
L
 
V
R
 
G
L
 
L
K
 
K
P
 
D
Y
 
K
S
 
A
D
 
H
R
 
A
Y
 
Y
P
 
P
L
 
D
H
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
M
 
A
M
 
M
E
 
E
P
 
P
Q
 
K
V
 
I
L
 
M
L
 
L
F
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
I
 
M
T
 
V
A
 
G
Q
 
E
I
 
V
V
 
L
S
 
S
I
 
V
I
 
M
R
 
K
E
 
Q
L
 
L
A
 
A
E
 
N
T
 
E
G
 
G
I
 
M
T
 
T
Q
 
M
V
 
V
I
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
V
 
M
E
 
G
V
 
F
A
 
A
R
 
R
K
 
E
T
 
V
A
 
G
S
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
L
Y
 
F
M
 
M
E
 
D
N
 
G
G
 
G
H
 
Y
I
 
I
V
 
I
E
 
E
Q
 
E
G
 
G
D
 
K
-
 
P
A
 
E
G
 
D
C
 
L
F
 
F
A
 
D
H
 
R
P
 
P
Q
 
Q
T
 
H
D
 
E
A
 
R
F
 
T
K
 
K
N
 
A
Y
 
F
L
 
L
S
 
S

2oljA Abc protein artp in complex with adp/mg2+
44% identity, 95% coverage: 12:241/242 of query aligns to 13:239/242 of 2oljA

query
sites
2oljA
Y
x
F
G
 
G
A
 
S
H
 
L
Q
 
E
A
x
V
L
 
L
F
 
K
D
 
G
I
 
I
T
 
N
L
 
V
D
 
H
C
 
I
P
 
R
Q
 
E
G
 
G
E
 
E
T
 
V
L
 
V
V
 
V
L
 
V
L
 
I
G
 
G
P
 
P
S
|
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
F
L
 
L
R
 
R
V
 
C
L
 
L
N
 
N
L
 
L
L
 
L
E
 
E
M
 
D
P
 
F
R
 
D
S
 
E
G
 
G
T
 
E
L
 
I
H
 
I
I
 
I
A
 
D
G
 
G
N
 
I
H
 
N
F
 
L
D
 
-
F
 
-
T
 
-
K
 
-
A
 
K
P
 
A
S
 
K
D
 
D
K
 
T
A
 
N
I
 
L
R
 
N
E
 
K
L
 
V
R
 
R
Q
 
E
N
 
E
V
 
V
G
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
R
Y
 
F
N
 
N
L
 
L
W
 
F
P
 
P
H
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
Q
 
L
Q
 
N
N
 
N
L
 
I
I
 
T
E
 
L
A
 
A
P
 
P
C
 
M
R
 
K
V
 
V
L
 
R
G
 
K
L
 
W
S
 
P
K
 
R
D
 
E
R
 
K
A
 
A
L
 
E
D
 
A
R
 
K
A
 
A
E
 
M
K
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
D
R
 
K
L
 
V
R
 
G
L
 
L
K
 
K
P
 
D
Y
 
K
S
 
A
D
 
H
R
 
A
Y
 
Y
P
 
P
L
 
D
H
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
M
 
A
M
 
M
E
 
E
P
 
P
Q
 
K
V
 
I
L
 
M
L
 
L
F
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
I
 
M
T
 
V
A
 
G
Q
 
E
I
 
V
V
 
L
S
 
S
I
 
V
I
 
M
R
 
K
E
 
Q
L
 
L
A
 
A
E
 
N
T
 
E
G
 
G
I
 
M
T
 
T
Q
 
M
V
 
V
I
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
V
 
M
E
 
G
V
 
F
A
 
A
R
 
R
K
 
E
T
 
V
A
 
G
S
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
L
Y
 
F
M
 
M
E
 
D
N
 
G
G
 
G
H
 
Y
I
 
I
V
 
I
E
 
E
Q
 
E
G
 
G
D
 
K
-
 
P
A
 
E
G
 
D
C
 
L
F
 
F
A
 
D
H
 
R
P
 
P
Q
 
Q
T
 
H
D
 
E
A
 
R
F
 
T
K
 
K
N
 
A
Y
 
F
L
 
L
S
 
S

P02915 Histidine/lysine/arginine/ornithine transport ATP-binding protein HisP; EC 7.4.2.1 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
44% identity, 95% coverage: 12:241/242 of query aligns to 16:254/258 of P02915

query
sites
P02915
Y
 
Y
G
 
G
A
 
G
H
 
H
Q
 
E
A
 
V
L
 
L
F
 
K
D
 
G
I
 
V
T
 
S
L
 
L
D
 
Q
C
 
A
P
 
R
Q
 
A
G
 
G
E
 
D
T
 
V
L
 
I
V
 
S
L
 
I
L
 
I
G
 
G
P
 
S
S
|
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
F
L
 
L
R
 
R
V
 
C
L
 
I
N
 
N
L
 
F
L
 
L
E
 
E
M
 
K
P
 
P
R
 
S
S
 
E
G
 
G
T
 
A
L
 
I
H
 
I
I
 
V
A
 
N
G
 
G
N
 
Q
H
 
N
F
 
I
D
 
N
F
 
L
T
 
V
-
 
R
-
 
D
-
 
K
-
 
D
-
 
G
-
 
Q
-
 
L
K
 
K
A
 
V
P
 
A
S
 
D
D
 
K
K
 
N
A
 
Q
I
 
L
R
 
R
E
 
L
L
 
L
R
 
R
Q
 
T
N
 
R
V
 
L
G
 
T
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
H
Y
 
F
N
 
N
L
 
L
W
 
W
P
 
S
H
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
Q
 
L
Q
 
E
N
 
N
L
 
V
I
 
M
E
 
E
A
 
A
P
 
P
C
 
I
R
 
Q
V
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
S
K
 
K
D
 
H
R
 
D
A
 
A
L
 
R
D
 
E
R
 
R
A
 
A
E
 
L
K
 
K
L
 
Y
L
 
L
E
 
A
R
 
K
L
 
V
R
 
G
L
 
I
K
 
D
P
 
E
Y
 
R
S
 
A
D
 
Q
-
 
G
R
 
K
Y
 
Y
P
 
P
L
 
V
H
 
H
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
M
 
A
M
 
M
E
 
E
P
 
P
Q
 
D
V
 
V
L
 
L
L
 
L
F
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
I
 
L
T
 
V
A
 
G
Q
 
E
I
 
V
V
 
L
S
 
R
I
 
I
I
 
M
R
 
Q
E
 
Q
L
 
L
A
 
A
E
 
E
T
 
E
G
 
G
I
 
K
T
 
T
Q
 
M
V
 
V
I
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
V
 
M
E
 
G
V
 
F
A
 
A
R
 
R
K
 
H
T
 
V
A
 
S
S
 
S
R
 
H
V
 
V
V
 
I
Y
 
F
M
 
L
E
 
H
N
 
Q
G
 
G
H
 
K
I
 
I
V
 
E
E
 
E
Q
 
E
G
 
G
D
 
D
-
 
P
A
 
E
G
 
Q
C
 
V
F
 
F
A
 
G
H
 
N
P
 
P
Q
 
Q
T
 
S
D
 
P
A
 
R
F
 
L
K
 
Q
N
 
Q
Y
 
F
L
 
L
S
 
K

1b0uA Atp-binding subunit of the histidine permease from salmonella typhimurium (see paper)
44% identity, 95% coverage: 12:241/242 of query aligns to 12:250/258 of 1b0uA

query
sites
1b0uA
Y
|
Y
G
 
G
A
 
G
H
|
H
Q
 
E
A
 
V
L
 
L
F
 
K
D
 
G
I
 
V
T
 
S
L
 
L
D
 
Q
C
 
A
P
 
R
Q
 
A
G
 
G
E
 
D
T
 
V
L
 
I
V
 
S
L
 
I
L
 
I
G
 
G
P
 
S
S
|
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
F
L
 
L
R
 
R
V
 
C
L
 
I
N
 
N
L
 
F
L
 
L
E
 
E
M
 
K
P
 
P
R
 
S
S
 
E
G
 
G
T
 
A
L
 
I
H
 
I
I
 
V
A
 
N
G
 
G
N
 
Q
H
 
N
F
 
I
D
 
N
F
 
L
T
 
V
-
 
R
-
 
D
-
 
K
-
 
D
-
 
G
-
 
Q
-
 
L
K
 
K
A
 
V
P
 
A
S
 
D
D
 
K
K
 
N
A
 
Q
I
 
L
R
 
R
E
 
L
L
 
L
R
 
R
Q
 
T
N
 
R
V
 
L
G
 
T
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
H
Y
 
F
N
 
N
L
 
L
W
 
W
P
 
S
H
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
Q
 
L
Q
 
E
N
 
N
L
 
V
I
 
M
E
 
E
A
 
A
P
 
P
C
 
I
R
 
Q
V
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
S
K
 
K
D
 
H
R
 
D
A
 
A
L
 
R
D
 
E
R
 
R
A
 
A
E
 
L
K
 
K
L
 
Y
L
 
L
E
 
A
R
 
K
L
 
V
R
 
G
L
 
I
K
 
D
P
 
E
Y
 
R
S
 
A
D
 
Q
-
 
G
R
 
K
Y
 
Y
P
 
P
L
 
V
H
 
H
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
M
 
A
M
 
M
E
 
E
P
 
P
Q
 
D
V
 
V
L
 
L
L
 
L
F
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
I
 
L
T
 
V
A
 
G
Q
 
E
I
 
V
V
 
L
S
 
R
I
 
I
I
 
M
R
 
Q
E
 
Q
L
 
L
A
 
A
E
 
E
T
 
E
G
 
G
I
 
K
T
 
T
Q
 
M
V
 
V
I
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
V
 
M
E
 
G
V
 
F
A
 
A
R
 
R
K
 
H
T
 
V
A
 
S
S
 
S
R
 
H
V
 
V
V
 
I
Y
 
F
M
 
L
E
 
H
N
 
Q
G
 
G
H
 
K
I
 
I
V
 
E
E
 
E
Q
 
E
G
 
G
D
 
D
-
 
P
A
 
E
G
 
Q
C
 
V
F
 
F
A
 
G
H
 
N
P
 
P
Q
 
Q
T
 
S
D
 
P
A
 
R
F
 
L
K
 
Q
N
 
Q
Y
 
F
L
 
L
S
 
K

P75831 Macrolide export ATP-binding/permease protein MacB; EC 7.6.2.- from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
43% identity, 85% coverage: 16:220/242 of query aligns to 22:222/648 of P75831

query
sites
P75831
Q
 
E
A
 
V
L
 
L
F
 
K
D
 
G
I
 
I
T
 
S
L
 
L
D
 
D
C
 
I
P
 
Y
Q
 
A
G
 
G
E
 
E
T
 
M
L
 
V
V
 
A
L
 
I
L
 
V
G
 
G
P
 
A
S
 
S
G
 
G
A
 
S
G
 
G
K
|
K
S
 
S
S
 
T
L
 
L
L
 
M
R
 
N
V
 
I
L
 
L
N
 
G
L
 
C
L
 
L
E
 
D
M
 
K
P
 
A
R
 
T
S
 
S
G
 
G
T
 
T
L
 
Y
H
 
R
I
 
V
A
 
A
G
 
G
N
 
Q
H
 
-
F
 
-
D
 
D
F
 
V
T
 
A
K
 
T
A
 
L
P
 
D
S
 
A
D
 
D
K
 
A
A
 
L
I
 
A
R
 
Q
E
 
L
L
 
R
R
 
R
Q
 
E
N
 
H
V
 
F
G
 
G
M
 
F
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
R
Y
 
Y
N
 
H
L
 
L
W
 
L
P
 
S
H
 
H
L
 
L
T
 
T
V
 
A
Q
 
E
Q
 
Q
N
 
N
L
 
-
I
 
V
E
 
E
A
 
V
P
 
P
C
 
A
R
 
V
V
 
Y
L
 
A
G
 
G
L
 
L
S
 
E
K
 
R
D
 
K
R
 
Q
A
 
R
L
 
L
D
 
L
R
 
R
A
 
A
E
 
Q
K
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
Q
R
 
R
L
 
L
R
 
G
L
 
L
K
 
E
P
 
D
Y
 
R
S
 
T
D
 
E
R
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
A
H
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
M
 
M
M
 
N
E
 
G
P
 
G
Q
 
Q
V
 
V
L
 
I
L
 
L
F
 
A
D
|
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
S
E
 
H
I
 
S
T
 
G
A
 
E
Q
 
E
I
 
V
V
 
M
S
 
A
I
 
I
I
 
L
R
 
H
E
 
Q
L
 
L
A
 
R
E
 
D
T
 
R
G
 
G
I
 
H
T
 
T
Q
 
V
V
 
I
I
 
I
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
D
V
 
P
E
 
Q
V
 
V
A
 
A
R
 
A
K
 
Q
T
 
-
A
 
A
S
 
E
R
 
R
V
 
V
V
 
I
Y
 
E
M
 
I
E
 
R
N
 
D
G
 
G
H
 
E
I
 
I
V
 
V

P30750 Methionine import ATP-binding protein MetN; EC 7.4.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
37% identity, 93% coverage: 16:240/242 of query aligns to 19:241/343 of P30750

query
sites
P30750
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
F
 
N
D
 
N
I
 
V
T
 
S
L
 
L
D
 
H
C
 
V
P
 
P
Q
 
A
G
 
G
E
 
Q
T
 
I
L
 
Y
V
 
G
L
 
V
L
 
I
G
 
G
P
 
A
S
|
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
L
L
 
I
R
 
R
V
 
C
L
 
V
N
 
N
L
 
L
L
 
L
E
 
E
M
 
R
P
 
P
R
 
T
S
 
E
G
 
G
T
 
S
L
 
V
H
 
L
I
 
V
A
 
D
G
 
G
N
 
Q
H
 
E
F
 
L
D
 
-
F
 
-
T
 
-
K
 
T
A
 
T
P
 
L
S
 
S
D
 
E
K
 
S
A
 
E
I
 
L
R
 
T
E
 
K
L
 
A
R
 
R
Q
 
R
N
 
Q
V
 
I
G
 
G
M
 
M
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
H
Y
 
F
N
 
N
L
 
L
W
 
L
P
 
S
H
 
S
L
 
R
T
 
T
V
 
V
Q
 
F
Q
 
G
N
 
N
L
 
-
I
 
V
E
 
A
A
 
L
P
 
P
C
 
L
R
 
E
V
 
L
L
 
D
G
 
N
L
 
T
S
 
P
K
 
K
D
 
D
R
 
E
A
 
V
L
 
K
D
 
R
R
 
R
A
 
V
E
 
T
K
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
S
R
 
L
L
 
V
R
 
G
L
 
L
K
 
G
P
 
D
Y
 
K
S
 
H
D
 
D
R
 
S
Y
 
Y
P
 
P
L
 
S
H
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
M
 
A
M
 
S
E
 
N
P
 
P
Q
 
K
V
 
V
L
 
L
L
 
L
F
 
C
D
 
D
E
|
E
P
 
A
T
 
T
A
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
A
I
 
T
T
 
T
A
 
R
Q
 
S
I
 
I
V
 
L
S
 
E
I
 
L
I
 
L
R
 
K
E
 
D
L
 
I
A
 
N
E
 
R
T
 
R
-
 
L
G
 
G
I
 
L
T
 
T
Q
 
I
V
 
L
I
 
L
V
 
I
T
 
T
H
 
H
E
 
E
V
 
M
E
 
D
V
 
V
A
 
V
R
 
K
K
 
R
T
 
I
A
 
C
S
 
D
R
 
C
V
 
V
V
 
A
Y
 
V
M
 
I
E
 
S
N
 
N
G
 
G
H
 
E
I
 
L
V
 
I
E
 
E
Q
 
Q
G
 
D
D
 
T
A
 
V
G
 
S
-
 
E
C
 
V
F
 
F
A
 
S
H
 
H
P
 
P
Q
 
K
T
 
T
D
 
P
A
 
L
F
 
A
K
 
Q
N
 
K
Y
 
F
L
 
I

Sites not aligning to the query:

6cvlD Crystal structure of the escherichia coli atpgs-bound metni methionine abc transporter in complex with its metq binding protein (see paper)
37% identity, 93% coverage: 16:240/242 of query aligns to 20:242/344 of 6cvlD

query
sites
6cvlD
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
F
 
N
D
 
N
I
 
V
T
 
S
L
 
L
D
 
H
C
 
V
P
 
P
Q
 
A
G
 
G
E
 
Q
T
 
I
L
 
Y
V
 
G
L
 
V
L
 
I
G
 
G
P
 
A
S
|
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
L
L
 
I
R
 
R
V
 
C
L
 
V
N
 
N
L
 
L
L
 
L
E
 
E
M
 
R
P
 
P
R
 
T
S
 
E
G
 
G
T
 
S
L
 
V
H
 
L
I
 
V
A
 
D
G
 
G
N
 
Q
H
 
E
F
 
L
D
 
-
F
 
-
T
 
-
K
 
T
A
 
T
P
 
L
S
 
S
D
 
E
K
 
S
A
 
E
I
 
L
R
 
T
E
 
K
L
 
A
R
 
R
Q
 
R
N
 
Q
V
 
I
G
 
G
M
 
M
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
H
Y
 
F
N
 
N
L
 
L
W
 
L
P
 
S
H
 
S
L
 
R
T
 
T
V
 
V
Q
 
F
Q
 
G
N
 
N
L
 
-
I
 
V
E
 
A
A
 
L
P
 
P
C
 
L
R
 
E
V
 
L
L
 
D
G
 
N
L
 
T
S
 
P
K
 
K
D
 
D
R
 
E
A
 
V
L
 
K
D
 
R
R
 
R
A
 
V
E
 
T
K
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
S
R
 
L
L
 
V
R
 
G
L
 
L
K
 
G
P
 
D
Y
 
K
S
 
H
D
 
D
R
 
S
Y
 
Y
P
 
P
L
 
S
H
x
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
Q
|
Q
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
M
 
A
M
 
S
E
 
N
P
 
P
Q
 
K
V
 
V
L
 
L
L
 
L
F
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
T
 
T
A
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
A
I
 
T
T
 
T
A
 
R
Q
 
S
I
 
I
V
 
L
S
 
E
I
 
L
I
 
L
R
 
K
E
 
D
L
 
I
A
 
N
E
 
R
T
 
R
-
 
L
G
 
G
I
 
L
T
 
T
Q
 
I
V
 
L
I
 
L
V
 
I
T
 
T
H
|
H
E
 
E
V
 
M
E
 
D
V
 
V
A
 
V
R
 
K
K
 
R
T
 
I
A
 
C
S
 
D
R
 
C
V
 
V
V
 
A
Y
 
V
M
 
I
E
 
S
N
 
N
G
 
G
H
 
E
I
 
L
V
 
I
E
 
E
Q
 
Q
G
 
D
D
 
T
A
 
V
G
 
S
-
 
E
C
 
V
F
 
F
A
 
S
H
 
H
P
 
P
Q
 
K
T
 
T
D
 
P
A
 
L
F
 
A
K
 
Q
N
 
K
Y
 
F
L
 
I

Sites not aligning to the query:

3tuzC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 semet soak crystal form (see paper)
37% identity, 93% coverage: 16:240/242 of query aligns to 20:242/344 of 3tuzC

query
sites
3tuzC
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
F
 
N
D
 
N
I
 
V
T
 
S
L
 
L
D
 
H
C
 
V
P
 
P
Q
 
A
G
 
G
E
 
Q
T
 
I
L
 
Y
V
 
G
L
 
V
L
 
I
G
 
G
P
 
A
S
 
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
L
L
 
I
R
 
R
V
 
C
L
 
V
N
 
N
L
 
L
L
 
L
E
 
E
M
 
R
P
 
P
R
 
T
S
 
E
G
 
G
T
 
S
L
 
V
H
 
L
I
 
V
A
 
D
G
 
G
N
 
Q
H
 
E
F
 
L
D
 
-
F
 
-
T
 
-
K
 
T
A
 
T
P
 
L
S
 
S
D
 
E
K
 
S
A
 
E
I
 
L
R
 
T
E
 
K
L
 
A
R
 
R
Q
 
R
N
 
Q
V
 
I
G
 
G
M
 
M
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
H
Y
 
F
N
 
N
L
 
L
W
 
L
P
 
S
H
 
S
L
 
R
T
 
T
V
 
V
Q
 
F
Q
 
G
N
 
N
L
 
-
I
 
V
E
 
A
A
 
L
P
 
P
C
 
L
R
 
E
V
 
L
L
 
D
G
 
N
L
 
T
S
 
P
K
 
K
D
 
D
R
 
E
A
 
V
L
 
K
D
 
R
R
 
R
A
 
V
E
 
T
K
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
S
R
 
L
L
 
V
R
 
G
L
 
L
K
 
G
P
 
D
Y
 
K
S
 
H
D
 
D
R
 
S
Y
 
Y
P
 
P
L
 
S
H
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
M
 
A
M
 
S
E
 
N
P
 
P
Q
 
K
V
 
V
L
 
L
L
 
L
F
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
T
 
T
A
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
A
I
 
T
T
 
T
A
 
R
Q
 
S
I
 
I
V
 
L
S
 
E
I
 
L
I
 
L
R
 
K
E
 
D
L
 
I
A
 
N
E
 
R
T
 
R
-
 
L
G
 
G
I
 
L
T
 
T
Q
 
I
V
 
L
I
 
L
V
 
I
T
 
T
H
 
H
E
 
E
V
 
M
E
 
D
V
 
V
A
 
V
R
 
K
K
 
R
T
 
I
A
 
C
S
 
D
R
 
C
V
 
V
V
 
A
Y
 
V
M
 
I
E
 
S
N
 
N
G
 
G
H
 
E
I
 
L
V
 
I
E
 
E
Q
 
Q
G
 
D
D
 
T
A
 
V
G
 
S
-
 
E
C
 
V
F
 
F
A
 
S
H
 
H
P
 
P
Q
 
K
T
 
T
D
 
P
A
 
L
F
 
A
K
 
Q
N
 
K
Y
 
F
L
 
I

Sites not aligning to the query:

3tuiC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 native crystal form (see paper)
37% identity, 93% coverage: 16:240/242 of query aligns to 20:242/344 of 3tuiC

query
sites
3tuiC
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
F
 
N
D
 
N
I
 
V
T
 
S
L
 
L
D
 
H
C
 
V
P
 
P
Q
 
A
G
 
G
E
 
Q
T
 
I
L
 
Y
V
 
G
L
 
V
L
 
I
G
 
G
P
 
A
S
 
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
L
L
 
I
R
 
R
V
 
C
L
 
V
N
 
N
L
 
L
L
 
L
E
 
E
M
 
R
P
 
P
R
 
T
S
 
E
G
 
G
T
 
S
L
 
V
H
 
L
I
 
V
A
 
D
G
 
G
N
 
Q
H
 
E
F
 
L
D
 
-
F
 
-
T
 
-
K
 
T
A
 
T
P
 
L
S
 
S
D
 
E
K
 
S
A
 
E
I
 
L
R
 
T
E
 
K
L
 
A
R
 
R
Q
 
R
N
 
Q
V
 
I
G
 
G
M
 
M
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
H
Y
 
F
N
 
N
L
 
L
W
 
L
P
 
S
H
 
S
L
 
R
T
 
T
V
 
V
Q
 
F
Q
 
G
N
 
N
L
 
-
I
 
V
E
 
A
A
 
L
P
 
P
C
 
L
R
 
E
V
 
L
L
 
D
G
 
N
L
 
T
S
 
P
K
 
K
D
 
D
R
 
E
A
 
V
L
 
K
D
 
R
R
 
R
A
 
V
E
 
T
K
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
S
R
 
L
L
 
V
R
 
G
L
 
L
K
 
G
P
 
D
Y
 
K
S
 
H
D
 
D
R
 
S
Y
 
Y
P
 
P
L
 
S
H
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
M
 
A
M
 
S
E
 
N
P
 
P
Q
 
K
V
 
V
L
 
L
L
 
L
F
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
T
 
T
A
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
A
I
 
T
T
 
T
A
 
R
Q
 
S
I
 
I
V
 
L
S
 
E
I
 
L
I
 
L
R
 
K
E
 
D
L
 
I
A
 
N
E
 
R
T
 
R
-
 
L
G
 
G
I
 
L
T
 
T
Q
 
I
V
 
L
I
 
L
V
 
I
T
 
T
H
 
H
E
 
E
V
 
M
E
 
D
V
 
V
A
 
V
R
 
K
K
 
R
T
 
I
A
 
C
S
 
D
R
 
C
V
 
V
V
 
A
Y
 
V
M
 
I
E
 
S
N
 
N
G
 
G
H
 
E
I
 
L
V
 
I
E
 
E
Q
 
Q
G
 
D
D
 
T
A
 
V
G
 
S
-
 
E
C
 
V
F
 
F
A
 
S
H
 
H
P
 
P
Q
 
K
T
 
T
D
 
P
A
 
L
F
 
A
K
 
Q
N
 
K
Y
 
F
L
 
I

Sites not aligning to the query:

7ahhC Opua inhibited inward-facing, sbd docked (see paper)
36% identity, 94% coverage: 13:240/242 of query aligns to 37:263/382 of 7ahhC

query
sites
7ahhC
G
 
G
A
 
A
H
x
T
Q
x
V
A
x
G
L
 
V
F
 
Y
D
 
D
I
 
T
T
 
N
L
 
F
D
 
E
C
 
I
P
 
N
Q
 
E
G
 
G
E
 
E
T
 
I
L
 
F
V
 
V
L
 
I
L
 
M
G
 
G
P
 
L
S
 
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
 
S
S
 
T
L
 
L
L
 
L
R
 
R
V
 
L
L
 
L
N
 
N
L
 
R
L
 
L
E
 
I
M
 
E
P
 
P
R
 
T
S
 
S
G
 
G
T
 
K
L
 
I
H
 
F
I
 
I
A
 
-
G
 
-
N
 
D
H
 
N
F
 
Q
D
 
D
F
 
V
T
 
A
K
 
T
A
 
L
P
 
N
S
 
K
D
 
E
K
 
D
A
 
L
I
 
L
R
 
Q
E
 
V
L
 
R
R
 
R
Q
 
K
N
 
T
V
 
M
G
 
S
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
N
Y
 
F
N
 
G
L
 
L
W
 
F
P
 
P
H
 
H
L
 
R
T
 
T
V
 
I
Q
 
L
Q
 
E
N
 
N
L
 
-
I
 
T
E
 
E
A
 
Y
P
 
G
C
 
L
R
 
E
V
 
V
L
 
Q
G
 
N
L
 
V
S
 
P
K
 
K
D
 
E
R
 
E
A
 
R
L
 
R
D
 
K
R
 
R
A
 
A
E
 
E
K
 
K
L
 
A
L
 
L
E
 
D
R
 
N
L
 
A
R
 
N
L
 
L
K
 
L
P
 
D
Y
 
F
S
 
K
D
 
D
R
 
Q
Y
 
Y
P
 
P
L
 
K
H
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
G
I
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
M
 
A
M
 
N
E
 
D
P
 
P
Q
 
E
V
 
I
L
 
L
L
 
L
F
 
M
D
|
D
E
|
E
P
 
A
T
 
F
A
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
L
I
 
I
T
 
R
A
 
R
Q
 
E
I
 
M
V
 
Q
S
 
D
I
 
E
I
 
L
R
 
L
E
 
E
L
 
L
-
 
Q
A
 
A
E
 
K
T
 
F
G
 
Q
I
 
K
T
 
T
Q
 
I
V
 
I
I
 
F
V
 
V
T
 
S
H
 
H
E
 
D
V
 
L
E
 
N
V
 
E
A
 
A
R
 
L
K
 
R
T
 
I
A
 
G
S
 
D
R
 
R
V
 
I
V
 
A
Y
 
I
M
 
M
E
 
K
N
 
D
G
 
G
H
 
K
I
 
I
V
 
M
E
 
Q
Q
 
I
G
 
G
D
 
T
A
 
G
-
 
E
G
 
E
C
 
I
F
 
L
A
 
T
H
 
N
P
 
P
Q
 
A
T
 
N
D
 
D
A
 
Y
F
 
V
K
 
K
N
 
T
Y
 
F
L
 
V

Sites not aligning to the query:

7aheC Opua inhibited inward facing (see paper)
36% identity, 94% coverage: 13:240/242 of query aligns to 37:263/382 of 7aheC

query
sites
7aheC
G
 
G
A
 
A
H
 
T
Q
 
V
A
 
G
L
 
V
F
 
Y
D
 
D
I
 
T
T
 
N
L
 
F
D
 
E
C
 
I
P
 
N
Q
 
E
G
 
G
E
 
E
T
 
I
L
 
F
V
 
V
L
 
I
L
 
M
G
 
G
P
 
L
S
 
S
G
 
G
A
 
S
G
 
G
K
 
K
S
 
S
S
 
T
L
 
L
L
 
L
R
 
R
V
 
L
L
 
L
N
 
N
L
 
R
L
 
L
E
 
I
M
 
E
P
 
P
R
 
T
S
 
S
G
 
G
T
 
K
L
 
I
H
 
F
I
 
I
A
 
-
G
 
-
N
 
D
H
 
N
F
 
Q
D
 
D
F
 
V
T
 
A
K
 
T
A
 
L
P
 
N
S
 
K
D
 
E
K
 
D
A
 
L
I
 
L
R
 
Q
E
 
V
L
 
R
R
 
R
Q
 
K
N
 
T
V
 
M
G
 
S
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
N
Y
 
F
N
 
G
L
 
L
W
 
F
P
 
P
H
 
H
L
 
R
T
 
T
V
 
I
Q
 
L
Q
 
E
N
 
N
L
 
-
I
 
T
E
 
E
A
 
Y
P
 
G
C
 
L
R
 
E
V
 
V
L
 
Q
G
 
N
L
 
V
S
 
P
K
 
K
D
 
E
R
 
E
A
 
R
L
 
R
D
 
K
R
 
R
A
 
A
E
 
E
K
 
K
L
 
A
L
 
L
E
 
D
R
 
N
L
 
A
R
 
N
L
 
L
K
 
L
P
 
D
Y
 
F
S
 
K
D
 
D
R
 
Q
Y
 
Y
P
 
P
L
 
K
H
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
G
I
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
M
 
A
M
 
N
E
 
D
P
 
P
Q
 
E
V
 
I
L
 
L
L
 
L
F
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
A
T
 
F
A
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
L
I
 
I
T
 
R
A
 
R
Q
 
E
I
 
M
V
 
Q
S
 
D
I
 
E
I
 
L
R
 
L
E
 
E
L
 
L
-
 
Q
A
 
A
E
 
K
T
 
F
G
 
Q
I
 
K
T
 
T
Q
 
I
V
 
I
I
 
F
V
 
V
T
 
S
H
 
H
E
 
D
V
 
L
E
 
N
V
 
E
A
 
A
R
 
L
K
 
R
T
 
I
A
 
G
S
 
D
R
 
R
V
 
I
V
 
A
Y
 
I
M
 
M
E
 
K
N
 
D
G
 
G
H
 
K
I
 
I
V
 
M
E
 
Q
Q
 
I
G
 
G
D
 
T
A
 
G
-
 
E
G
 
E
C
 
I
F
 
L
A
 
T
H
 
N
P
 
P
Q
 
A
T
 
N
D
 
D
A
 
Y
F
 
V
K
 
K
N
 
T
Y
 
F
L
 
V

Sites not aligning to the query:

2pclA Crystal structure of abc transporter with complex (aq_297) from aquifex aeolicus vf5
41% identity, 86% coverage: 14:220/242 of query aligns to 15:217/223 of 2pclA

query
sites
2pclA
A
 
G
H
 
Y
Q
 
E
A
 
I
L
 
L
F
 
K
D
 
G
I
 
I
T
 
S
L
 
L
D
 
S
C
 
V
P
 
K
Q
 
K
G
 
G
E
 
E
T
 
F
L
 
V
V
 
S
L
 
I
L
 
I
G
 
G
P
 
A
S
 
S
G
 
G
A
 
S
G
 
G
K
 
K
S
 
S
S
 
T
L
 
L
L
 
L
R
 
Y
V
 
I
L
 
L
N
 
G
L
 
L
L
 
L
E
 
D
M
 
A
P
 
P
R
 
T
S
 
E
G
 
G
T
 
K
L
 
V
H
 
F
I
 
L
A
 
E
G
 
G
N
 
K
H
 
E
F
 
V
D
 
D
F
 
Y
T
 
T
K
 
-
A
 
-
P
 
-
S
 
N
D
 
E
K
 
K
A
 
E
I
 
L
R
 
S
E
 
L
L
 
L
R
 
R
-
 
N
Q
 
R
N
 
K
V
 
L
G
 
G
M
 
F
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
F
Y
 
H
N
 
Y
L
 
L
W
 
I
P
 
P
H
 
E
L
 
L
T
 
T
V
 
A
Q
 
L
Q
 
E
N
 
N
L
 
V
I
 
I
E
 
-
A
 
V
P
 
P
C
 
M
R
 
L
V
 
K
L
 
M
G
 
G
L
 
K
S
 
P
K
 
K
D
 
K
R
 
E
A
 
A
L
 
K
D
 
E
R
 
R
A
 
G
E
 
E
K
 
Y
L
 
L
L
 
L
E
 
S
R
 
E
L
 
L
R
 
G
L
 
L
K
 
G
P
 
D
Y
 
K
S
 
L
D
 
S
R
 
R
Y
 
K
P
 
P
L
 
Y
H
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
M
 
A
M
 
N
E
 
E
P
 
P
Q
 
I
V
 
L
L
 
L
L
 
F
F
 
A
D
 
D
E
|
E
P
|
P
T
|
T
A
 
G
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
S
E
 
A
I
 
N
T
 
T
A
 
K
Q
 
R
I
 
V
V
 
M
S
 
D
I
 
I
I
 
F
R
 
L
E
 
K
L
 
I
A
 
N
E
 
E
T
 
G
G
 
G
I
 
T
T
 
S
Q
 
I
V
 
V
I
 
M
V
 
V
T
|
T
H
 
H
E
 
E
V
 
R
E
 
E
V
 
L
A
 
A
R
 
E
K
 
L
T
 
T
A
 
-
S
 
H
R
 
R
V
 
T
V
 
L
Y
 
E
M
 
M
E
 
K
N
 
D
G
 
G
H
 
K
I
 
V
V
 
V

1f3oA Crystal structure of mj0796 atp-binding cassette (see paper)
36% identity, 90% coverage: 3:219/242 of query aligns to 2:223/232 of 1f3oA

query
sites
1f3oA
I
 
I
K
 
K
L
 
L
N
 
K
G
 
N
I
 
V
N
 
T
C
 
K
F
 
T
Y
|
Y
G
 
K
A
 
M
H
 
G
Q
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
I
-
 
Y
A
 
A
L
 
L
F
 
K
D
 
N
I
 
V
T
 
N
L
 
L
D
 
N
C
 
I
P
 
K
Q
 
E
G
 
G
E
 
E
T
 
F
L
 
V
V
 
S
L
 
I
L
 
M
G
 
G
P
 
P
S
 
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
M
L
 
L
R
 
N
V
 
I
L
 
I
N
 
G
L
 
C
L
 
L
E
 
D
M
 
K
P
 
P
R
 
T
S
 
E
G
 
G
T
 
E
L
 
V
H
 
Y
I
 
I
A
 
-
G
 
-
N
 
D
H
 
N
F
 
I
D
 
K
F
 
T
T
 
N
K
 
D
A
 
L
P
 
D
S
 
D
D
 
D
K
 
E
A
 
L
I
 
T
R
 
K
E
 
I
L
 
R
R
 
R
Q
 
D
N
 
K
V
 
I
G
 
G
M
 
F
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
Q
Y
 
F
N
 
N
L
 
L
W
 
I
P
 
P
H
 
L
L
 
L
T
 
T
V
 
A
Q
 
L
Q
 
E
N
 
N
L
 
-
I
 
V
E
 
E
A
 
L
P
 
P
C
 
L
R
 
I
V
 
F
L
 
K
G
 
Y
L
 
R
S
 
G
K
 
A
D
 
M
R
 
S
A
 
G
L
 
E
D
 
E
R
 
R
A
 
R
E
 
K
K
 
R
L
 
A
L
 
L
E
 
E
R
 
C
L
 
L
R
 
K
L
 
M
K
 
A
P
 
E
Y
 
L
S
 
E
D
 
E
R
 
R
Y
 
F
-
 
A
-
 
N
-
 
H
-
 
K
P
 
P
L
 
N
H
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
M
 
A
M
 
N
E
 
N
P
 
P
Q
 
P
V
 
I
L
 
I
L
 
L
F
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
S
E
 
K
I
 
T
T
 
G
A
 
E
Q
 
K
I
 
I
V
 
M
S
 
Q
I
 
L
I
 
L
R
 
K
E
 
K
L
 
L
-
 
N
A
 
E
E
 
E
T
 
D
G
 
G
I
 
K
T
 
T
Q
 
V
V
 
V
I
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
D
V
 
I
E
 
N
V
 
V
A
 
A
R
 
R
K
 
-
T
 
F
A
 
G
S
 
E
R
 
R
V
 
I
V
 
I
Y
 
Y
M
 
L
E
 
K
N
 
D
G
 
G
H
 
E
I
 
V

7ahdC Opua (e190q) occluded (see paper)
36% identity, 93% coverage: 13:237/242 of query aligns to 37:260/260 of 7ahdC

query
sites
7ahdC
G
 
G
A
 
A
H
x
T
Q
 
V
A
 
G
L
 
V
F
 
Y
D
 
D
I
 
T
T
 
N
L
 
F
D
 
E
C
 
I
P
 
N
Q
 
E
G
 
G
E
 
E
T
 
I
L
 
F
V
 
V
L
 
I
L
 
M
G
 
G
P
 
L
S
|
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
L
L
 
L
R
 
R
V
 
L
L
 
L
N
 
N
L
 
R
L
 
L
E
 
I
M
 
E
P
 
P
R
 
T
S
 
S
G
 
G
T
 
K
L
 
I
H
 
F
I
 
I
A
 
-
G
 
-
N
 
D
H
 
N
F
 
Q
D
 
D
F
 
V
T
 
A
K
 
T
A
 
L
P
 
N
S
 
K
D
 
E
K
 
D
A
 
L
I
 
L
R
 
Q
E
 
V
L
 
R
R
 
R
Q
 
K
N
 
T
V
 
M
G
 
S
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
|
Q
Q
 
N
Y
 
F
N
 
G
L
 
L
W
 
F
P
 
P
H
 
H
L
 
R
T
 
T
V
 
I
Q
 
L
Q
 
E
N
 
N
L
 
-
I
 
T
E
 
E
A
 
Y
P
 
G
C
 
L
R
 
E
V
 
V
L
 
Q
G
 
N
L
 
V
S
 
P
K
 
K
D
 
E
R
 
E
A
 
R
L
 
R
D
 
K
R
 
R
A
 
A
E
 
E
K
 
K
L
 
A
L
 
L
E
 
D
R
 
N
L
 
A
R
 
N
L
 
L
K
 
L
P
 
D
Y
 
F
S
 
K
D
 
D
R
 
Q
Y
 
Y
P
 
P
L
x
K
H
x
Q
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
Q
x
M
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
G
I
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
M
 
A
M
 
N
E
 
D
P
 
P
Q
 
E
V
 
I
L
 
L
L
 
L
F
 
M
D
 
D
E
x
Q
P
 
A
T
 
F
A
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
L
I
 
I
T
 
R
A
 
R
Q
 
E
I
 
M
V
 
Q
S
 
D
I
 
E
I
 
L
R
 
L
E
 
E
L
 
L
-
 
Q
A
 
A
E
 
K
T
 
F
G
 
Q
I
 
K
T
 
T
Q
 
I
V
 
I
I
 
F
V
 
V
T
 
S
H
|
H
E
 
D
V
 
L
E
 
N
V
 
E
A
 
A
R
 
L
K
 
R
T
 
I
A
 
G
S
 
D
R
 
R
V
 
I
V
 
A
Y
 
I
M
 
M
E
 
K
N
 
D
G
 
G
H
 
K
I
 
I
V
 
M
E
 
Q
Q
 
I
G
 
G
D
 
T
A
 
G
-
 
E
G
 
E
C
 
I
F
 
L
A
 
T
H
 
N
P
 
P
Q
 
A
T
 
N
D
 
D
A
 
Y
F
 
V
K
 
K

Sites not aligning to the query:

5xu1B Structure of a non-canonical abc transporter from streptococcus pneumoniae r6 (see paper)
39% identity, 84% coverage: 16:219/242 of query aligns to 21:220/226 of 5xu1B

query
sites
5xu1B
Q
 
Q
A
 
V
L
 
L
F
 
K
D
 
N
I
 
I
T
 
N
L
 
L
D
 
E
C
 
V
P
 
N
Q
 
E
G
 
G
E
 
E
T
 
F
L
 
V
V
 
A
L
 
I
L
 
M
G
 
G
P
 
P
S
 
S
G
 
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
 
T
L
 
L
L
 
M
R
 
N
V
 
T
L
 
I
N
 
G
L
 
M
L
 
L
E
 
D
M
 
T
P
 
P
R
 
T
S
 
S
G
 
G
T
 
E
L
 
Y
H
 
Y
I
 
L
A
 
E
G
 
G
N
 
Q
H
 
E
F
 
-
D
 
-
F
 
-
T
 
V
K
 
A
A
 
G
P
 
L
S
 
G
D
 
E
K
 
K
A
 
Q
I
 
L
R
 
A
E
 
K
L
 
V
R
 
R
-
 
N
Q
 
Q
N
 
Q
V
 
I
G
 
G
M
 
F
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
Q
Y
 
F
N
 
F
L
 
L
W
 
L
P
 
S
H
 
K
L
 
L
T
 
N
V
 
A
Q
 
L
Q
 
Q
N
 
N
L
 
-
I
 
V
E
 
E
A
 
L
P
 
P
C
 
L
R
 
I
V
 
Y
L
 
A
G
 
G
L
 
V
S
 
S
K
 
S
D
 
S
R
 
K
A
 
R
L
 
R
D
 
K
R
 
L
A
 
A
E
 
E
K
 
E
L
 
Y
L
 
L
E
 
D
R
 
K
L
 
V
R
 
E
L
 
L
K
 
T
P
 
E
Y
 
R
S
 
S
D
 
H
R
 
H
Y
 
L
P
 
P
L
 
S
H
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
M
 
V
M
 
N
E
 
N
P
 
P
Q
 
S
V
 
I
L
 
I
L
 
L
F
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
T
E
 
K
I
 
T
T
 
G
A
 
N
Q
 
Q
I
 
I
V
 
M
S
 
Q
I
 
L
I
 
L
R
 
V
E
 
D
L
 
L
A
 
N
E
 
K
T
 
E
G
 
G
I
 
K
T
 
T
Q
 
I
V
 
I
I
 
M
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
V
 
P
E
 
E
V
 
I
A
 
A
R
 
-
K
 
A
T
 
Y
A
 
A
S
 
K
R
 
R
V
 
Q
V
 
I
Y
 
V
M
 
I
E
 
R
N
 
D
G
 
G
H
 
V
I
 
I

5lilA Structure of aggregatibacter actinomycetemcomitans macb bound to atpys (p21) (see paper)
35% identity, 90% coverage: 3:220/242 of query aligns to 4:221/615 of 5lilA

query
sites
5lilA
I
 
I
K
 
E
L
 
I
N
 
K
G
 
Q
I
 
L
N
 
N
C
 
R
F
 
Y
Y
x
F
G
 
G
A
 
E
H
 
G
Q
 
E
-
 
N
-
 
R
-
 
V
-
 
H
A
x
V
L
 
L
F
 
K
D
 
D
I
 
I
T
 
S
L
 
L
D
 
S
C
 
I
P
 
E
Q
 
R
G
 
G
E
 
D
T
 
F
L
 
V
V
 
A
L
 
I
L
 
M
G
 
G
P
 
Q
S
|
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
L
L
 
M
R
 
N
V
 
I
L
 
I
N
 
G
L
 
C
L
 
L
E
 
D
M
 
T
P
 
A
R
 
T
S
 
G
G
 
G
T
 
S
L
 
S
H
 
K
I
 
I
A
 
D
G
 
G
N
 
K
H
 
E
F
 
-
D
 
-
F
 
-
T
 
T
K
 
I
A
 
E
P
 
L
S
 
T
D
 
N
K
 
D
A
 
Q
I
 
L
R
 
S
E
 
D
L
 
L
R
 
R
-
 
S
Q
 
Q
N
 
K
V
 
F
G
 
G
M
 
F
V
 
I
F
 
F
Q
|
Q
Q
 
R
Y
 
Y
N
 
N
L
 
L
W
 
L
P
 
S
H
 
S
L
 
L
T
 
T
V
 
A
Q
 
A
Q
 
E
N
 
N
L
 
-
I
 
V
E
 
A
A
 
L
P
 
P
C
 
A
R
 
I
V
 
Y
L
 
A
G
 
G
L
 
M
S
 
P
K
 
Q
D
 
S
R
 
Q
A
 
R
L
 
L
D
 
E
R
 
R
A
 
A
E
 
K
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
E
 
E
R
 
K
L
 
L
R
 
G
L
 
L
K
 
G
P
 
D
Y
x
K
S
 
W
D
 
Q
R
 
N
Y
 
K
P
 
P
L
 
N
H
x
Q
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
Q
|
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
M
 
M
M
 
N
E
 
G
P
 
G
Q
 
E
V
 
I
L
 
I
L
 
L
F
 
A
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
T
A
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
S
E
 
H
I
 
S
T
 
G
A
 
E
Q
 
N
I
 
V
V
 
M
S
 
E
I
 
I
I
 
L
R
 
R
E
 
Q
L
 
L
A
 
H
E
 
E
T
 
E
G
 
G
I
 
H
T
 
T
Q
 
I
V
 
I
I
 
M
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
D
V
 
K
E
 
H
V
 
I
A
 
A
R
 
-
K
 
A
T
 
S
A
 
A
S
 
N
R
 
R
V
 
I
V
 
I
Y
 
E
M
 
I
E
 
K
N
 
D
G
 
G
H
 
E
I
 
I
V
 
I

Query Sequence

>BWI76_RS09520 FitnessBrowser__Koxy:BWI76_RS09520
MSIKLNGINCFYGAHQALFDITLDCPQGETLVLLGPSGAGKSSLLRVLNLLEMPRSGTLH
IAGNHFDFTKAPSDKAIRELRQNVGMVFQQYNLWPHLTVQQNLIEAPCRVLGLSKDRALD
RAEKLLERLRLKPYSDRYPLHLSGGQQQRVAIARALMMEPQVLLFDEPTAALDPEITAQI
VSIIRELAETGITQVIVTHEVEVARKTASRVVYMENGHIVEQGDAGCFAHPQTDAFKNYL
SH

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory