SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing BWI76_RS13210 FitnessBrowser__Koxy:BWI76_RS13210 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P25553 Lactaldehyde dehydrogenase; Aldehyde dehydrogenase A; Glycolaldehyde dehydrogenase; EC 1.2.1.22; EC 1.2.1.21 from Escherichia coli (strain K12) (see 5 papers)
88% identity, 100% coverage: 1:479/479 of query aligns to 1:479/479 of P25553

query
sites
P25553
M
|
M
T
 
S
A
 
V
P
 
P
V
 
V
Q
 
Q
H
 
H
P
 
P
M
 
M
Y
 
Y
I
 
I
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
E
 
V
P
 
T
G
 
W
R
 
R
G
 
G
D
 
D
A
 
A
W
 
W
I
 
I
D
 
D
V
 
V
I
 
V
N
 
N
P
 
P
A
 
A
T
 
T
E
 
E
A
 
A
L
 
V
L
 
I
S
 
S
R
 
R
I
 
I
P
 
P
D
 
D
G
 
G
S
 
Q
A
 
A
E
 
E
D
 
D
A
 
A
R
 
R
R
 
K
A
 
A
I
 
I
L
 
D
A
 
A
A
 
A
E
 
E
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
P
 
P
G
 
E
W
 
W
E
 
E
A
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
A
I
 
I
E
 
E
R
 
R
A
 
A
R
 
S
W
 
W
L
 
L
R
 
R
K
 
K
I
 
I
A
 
S
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
E
 
E
R
 
R
A
 
A
E
 
S
E
 
E
I
 
I
A
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
I
V
 
V
A
 
E
E
 
E
G
 
G
G
 
G
K
 
K
I
 
I
Q
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
A
 
E
V
 
V
E
 
E
V
 
V
S
 
A
F
 
F
T
 
T
A
 
A
D
 
D
Y
 
Y
L
 
I
D
 
D
Y
 
Y
M
 
M
A
 
A
E
 
E
W
 
W
A
 
A
R
 
R
R
 
R
Y
 
Y
E
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
I
V
 
I
Q
 
Q
S
 
S
D
 
D
R
 
R
T
 
P
G
 
G
E
 
E
N
 
N
I
 
I
L
 
L
V
 
L
F
 
F
K
 
K
R
 
R
A
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
V
T
 
T
T
 
T
G
 
G
I
 
I
L
|
L
P
 
P
W
 
W
N
 
N
F
 
F
P
 
P
F
 
F
F
 
F
L
 
L
I
 
I
A
 
A
R
|
R
K
 
K
L
 
M
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
I
 
L
T
 
T
G
 
G
N
 
N
T
 
T
I
 
I
V
 
V
I
 
I
K
|
K
P
|
P
S
|
S
E
|
E
F
|
F
T
 
T
P
 
P
N
 
N
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
A
F
 
F
A
 
A
Q
 
K
I
 
I
V
 
V
H
 
D
D
 
E
I
 
I
G
 
G
L
 
L
P
 
P
K
 
R
G
 
G
V
 
V
F
 
F
N
 
N
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
R
 
R
G
 
G
E
 
E
T
 
T
V
 
V
G
 
G
Q
|
Q
E
 
E
L
 
L
A
 
A
S
 
G
N
 
N
P
 
P
K
 
K
V
 
V
A
 
A
M
 
M
V
 
V
S
 
S
M
 
M
T
 
T
G
 
G
S
|
S
V
 
V
A
 
S
A
 
A
G
 
G
E
 
E
K
 
K
I
 
I
M
 
M
A
 
A
A
 
T
A
 
A
A
 
A
K
 
K
N
 
N
I
 
I
T
 
T
K
 
K
V
 
V
C
 
C
L
 
L
E
|
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
A
 
A
P
 
P
A
 
A
I
 
I
V
 
V
M
 
M
D
 
D
D
 
D
A
 
A
D
 
D
L
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
A
 
A
V
 
I
V
 
V
D
 
D
S
 
S
R
 
R
V
 
V
I
 
I
N
 
N
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
C
 
C
N
|
N
C
 
C
V
 
A
E
 
E
R
 
R
V
 
V
Y
 
Y
V
 
V
Q
 
Q
K
 
K
G
 
G
I
 
I
Y
 
Y
D
 
D
R
 
Q
F
 
F
V
 
V
N
 
N
R
 
R
L
 
L
G
 
G
E
 
E
A
 
A
L
 
M
K
 
Q
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
F
 
F
G
 
G
D
 
N
P
 
P
A
 
A
S
 
E
R
 
R
D
 
N
D
 
D
I
 
I
A
 
A
M
 
M
G
 
G
P
 
P
L
 
L
I
 
I
N
 
N
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
E
R
|
R
V
 
V
E
 
E
Q
 
Q
K
 
K
V
 
V
A
 
A
K
 
R
A
 
A
V
 
V
A
 
E
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
F
G
 
G
G
 
G
K
 
K
A
 
A
V
 
V
T
 
E
G
 
G
R
 
K
G
 
G
Y
 
Y
F
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
P
 
P
T
 
T
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
V
 
V
R
 
R
Q
 
Q
E
 
E
M
 
M
D
 
S
I
 
I
V
 
M
H
 
H
E
 
E
E
 
E
T
 
T
F
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
L
P
 
P
V
 
V
V
 
V
A
 
A
F
 
F
D
 
D
T
 
T
L
 
L
E
 
E
E
 
D
A
 
A
L
 
I
A
 
S
M
 
M
A
 
A
N
 
N
D
 
D
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
T
 
T
S
 
S
S
 
S
I
 
I
Y
 
Y
T
 
T
R
 
Q
D
 
N
L
 
L
N
 
N
V
 
V
A
 
A
M
 
M
K
 
K
A
 
A
I
 
I
K
 
K
G
 
G
L
 
L
K
 
K
F
 
F
G
 
G
E
 
E
T
 
T
Y
 
Y
I
 
I
N
 
N
R
 
R
E
 
E
N
 
N
F
 
F
E
|
E
A
 
A
M
 
M
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
H
|
H
A
 
A
G
 
G
W
 
W
R
 
R
K
 
K
S
 
S
G
 
G
I
 
I
G
 
G
G
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
G
R
 
K
H
 
H
G
 
G
L
 
L
N
 
H
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
Q
T
 
T
Q
 
Q
V
 
V
V
 
V
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
Q
A
 
S

2opxA Crystal structure of lactaldehyde dehydrogenase from escherichia coli
89% identity, 99% coverage: 4:479/479 of query aligns to 2:477/477 of 2opxA

query
sites
2opxA
P
 
P
V
 
V
Q
 
Q
H
 
H
P
 
P
M
 
M
Y
 
Y
I
 
I
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
E
 
V
P
 
T
G
 
W
R
 
R
G
 
G
D
 
D
A
 
A
W
 
W
I
 
I
D
 
D
V
 
V
I
 
V
N
 
N
P
 
P
A
 
A
T
 
T
E
 
E
A
 
A
L
 
V
L
 
I
S
 
S
R
 
R
I
 
I
P
 
P
D
 
D
G
 
G
S
 
Q
A
 
A
E
 
E
D
 
D
A
 
A
R
 
R
R
 
K
A
 
A
I
 
I
L
 
D
A
 
A
A
 
A
E
 
E
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
P
 
P
G
 
E
W
 
W
E
 
E
A
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
A
I
 
I
E
 
E
R
 
R
A
 
A
R
 
S
W
 
W
L
 
L
R
 
R
K
 
K
I
 
I
A
 
S
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
E
 
E
R
 
R
A
 
A
E
 
T
E
 
E
I
 
I
A
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
I
V
 
V
A
 
E
E
 
E
G
 
G
G
 
G
K
 
K
I
 
I
Q
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
A
 
E
V
 
V
E
 
E
V
 
V
S
 
A
F
|
F
T
 
T
A
 
A
D
 
D
Y
 
Y
L
 
I
D
 
D
Y
 
Y
M
 
M
A
 
A
E
 
E
W
 
W
A
 
A
R
 
R
R
 
R
Y
 
Y
E
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
I
V
 
I
Q
 
Q
S
 
S
D
 
D
R
 
R
T
 
P
G
 
G
E
 
E
N
 
N
I
 
I
L
 
L
V
 
L
F
 
F
K
 
K
R
 
R
A
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
V
T
 
T
T
 
T
G
 
G
I
 
I
L
 
L
P
 
P
W
 
W
N
|
N
F
|
F
P
 
P
F
 
F
F
 
F
L
 
L
I
 
I
A
 
A
R
 
R
K
 
K
L
 
M
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
I
 
L
T
 
T
G
 
G
N
 
N
T
 
T
I
 
I
V
 
V
I
 
I
K
|
K
P
 
P
S
 
S
E
 
E
F
 
F
T
 
T
P
 
P
N
 
N
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
A
F
 
F
A
 
A
Q
 
K
I
 
I
V
 
V
H
 
D
D
 
E
I
 
I
G
 
G
L
 
L
P
 
P
K
 
R
G
 
G
V
 
V
F
 
F
N
 
N
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
R
 
R
G
 
G
E
 
E
T
 
T
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
L
 
L
A
 
A
S
 
G
N
 
N
P
 
P
K
 
K
V
 
V
A
 
A
M
 
M
V
 
V
S
 
S
M
 
M
T
 
T
G
 
G
S
 
S
V
 
V
A
 
S
A
 
A
G
 
G
E
 
E
K
 
K
I
 
I
M
 
M
A
 
A
A
 
T
A
 
A
A
 
A
K
 
K
N
 
N
I
 
I
T
 
T
K
 
K
V
 
V
C
 
C
L
 
L
E
|
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
A
 
A
P
 
P
A
 
A
I
 
I
V
 
V
M
 
M
D
 
D
D
 
D
A
 
A
D
 
D
L
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
A
 
A
V
 
I
V
 
V
D
 
D
S
 
S
R
 
R
V
 
V
I
 
I
N
 
N
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
C
|
C
N
|
N
C
 
C
V
 
A
E
 
E
R
 
R
V
 
V
Y
 
Y
V
 
V
Q
 
Q
K
 
K
G
 
G
I
 
I
Y
 
Y
D
 
D
R
 
Q
F
 
F
V
 
V
N
 
N
R
 
R
L
 
L
G
 
G
E
 
E
A
 
A
L
 
M
K
 
Q
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
F
|
F
G
|
G
D
 
N
P
 
P
A
 
A
S
 
E
R
|
R
D
 
N
D
|
D
I
|
I
A
|
A
M
 
M
G
 
G
P
 
P
L
 
L
I
 
I
N
 
N
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
E
R
 
R
V
 
V
E
 
E
Q
 
Q
K
 
K
V
 
V
A
 
A
K
 
R
A
 
A
V
 
V
A
 
E
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
A
 
A
V
 
V
T
 
E
G
 
G
R
 
K
G
 
G
Y
 
Y
F
x
Y
Y
 
Y
P
 
P
P
 
P
T
 
T
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
V
 
V
R
 
R
Q
 
Q
E
 
E
M
 
M
D
 
S
I
 
I
V
 
M
H
 
H
E
 
E
E
|
E
T
 
T
F
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
L
P
 
P
V
 
V
V
 
V
A
 
A
F
 
F
D
 
D
T
 
T
L
 
L
E
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
S
M
 
M
A
 
A
N
 
N
D
 
D
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
T
 
T
S
 
S
S
 
S
I
 
I
Y
 
Y
T
 
T
R
 
Q
D
 
N
L
 
L
N
 
N
V
 
V
A
 
A
M
 
M
K
 
K
A
 
A
I
 
I
K
 
K
G
 
G
L
 
L
K
 
K
F
 
F
G
 
G
E
 
E
T
 
T
Y
 
Y
I
 
I
N
 
N
R
 
R
E
 
E
N
 
N
F
|
F
E
|
E
A
 
A
M
 
M
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
H
 
H
A
 
A
G
 
G
W
 
W
R
 
R
K
 
K
S
 
S
G
 
G
I
 
I
G
 
G
G
 
G
A
|
A
D
 
D
G
 
G
R
 
K
H
 
H
G
 
G
L
 
L
N
 
H
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
Q
T
 
T
Q
 
Q
V
 
V
V
 
V
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
Q
A
 
S

2impA Crystal structure of lactaldehyde dehydrogenase from e. Coli: the ternary complex with lactate (occupancy 0.5) and nadh. Crystals soaked with (l)-lactate. (see paper)
88% identity, 99% coverage: 4:479/479 of query aligns to 2:477/477 of 2impA

query
sites
2impA
P
 
P
V
 
V
Q
 
Q
H
 
H
P
 
P
M
 
M
Y
 
Y
I
 
I
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
E
 
V
P
 
T
G
 
W
R
 
R
G
 
G
D
 
D
A
 
A
W
 
W
I
 
I
D
 
D
V
 
V
I
 
V
N
 
N
P
 
P
A
 
A
T
 
T
E
 
E
A
 
A
L
 
V
L
 
I
S
 
S
R
 
R
I
 
I
P
 
P
D
 
D
G
 
G
S
 
Q
A
 
A
E
 
E
D
 
D
A
 
A
R
 
R
R
 
K
A
 
A
I
 
I
L
 
D
A
 
A
A
 
A
E
 
E
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
P
 
P
G
 
E
W
 
W
E
 
E
A
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
A
I
 
I
E
 
E
R
 
R
A
 
A
R
 
S
W
 
W
L
 
L
R
 
R
K
 
K
I
 
I
A
 
S
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
E
 
E
R
 
R
A
 
A
E
 
S
E
 
E
I
 
I
A
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
I
V
 
V
A
 
E
E
 
E
G
 
G
G
 
G
K
 
K
I
 
I
Q
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
A
 
E
V
 
V
E
 
E
V
 
V
S
 
A
F
 
F
T
 
T
A
 
A
D
 
D
Y
 
Y
L
 
I
D
 
D
Y
 
Y
M
 
M
A
 
A
E
 
E
W
 
W
A
 
A
R
 
R
R
 
R
Y
 
Y
E
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
I
V
 
I
Q
 
Q
S
 
S
D
 
D
R
 
R
T
 
P
G
 
G
E
 
E
N
 
N
I
 
I
L
 
L
V
 
L
F
 
F
K
 
K
R
 
R
A
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
V
T
 
T
T
 
T
G
 
G
I
|
I
L
|
L
P
|
P
W
|
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
F
 
F
F
 
F
L
 
L
I
 
I
A
 
A
R
 
R
K
 
K
L
 
M
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
I
 
L
T
 
T
G
 
G
N
 
N
T
 
T
I
 
I
V
 
V
I
 
I
K
|
K
P
 
P
S
 
S
E
|
E
F
|
F
T
 
T
P
 
P
N
 
N
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
A
F
 
F
A
 
A
Q
 
K
I
 
I
V
 
V
H
 
D
D
 
E
I
 
I
G
 
G
L
 
L
P
 
P
K
 
R
G
 
G
V
 
V
F
 
F
N
 
N
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
R
 
R
G
|
G
E
 
E
T
 
T
V
 
V
G
|
G
Q
|
Q
E
 
E
L
 
L
A
 
A
S
 
G
N
 
N
P
 
P
K
 
K
V
 
V
A
 
A
M
 
M
V
 
V
S
 
S
M
 
M
T
 
T
G
 
G
S
|
S
V
 
V
A
 
S
A
|
A
G
 
G
E
 
E
K
|
K
I
 
I
M
 
M
A
 
A
A
 
T
A
 
A
A
 
A
K
 
K
N
 
N
I
 
I
T
 
T
K
 
K
V
 
V
C
 
C
L
 
L
E
|
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
A
 
A
P
 
P
A
 
A
I
 
I
V
 
V
M
 
M
D
 
D
D
 
D
A
 
A
D
 
D
L
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
A
 
A
V
 
I
V
 
V
D
 
D
S
 
S
R
 
R
V
 
V
I
 
I
N
 
N
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
C
|
C
N
 
N
C
 
C
V
 
A
E
 
E
R
 
R
V
 
V
Y
 
Y
V
 
V
Q
 
Q
K
 
K
G
 
G
I
 
I
Y
 
Y
D
 
D
R
 
Q
F
 
F
V
 
V
N
 
N
R
 
R
L
 
L
G
 
G
E
 
E
A
 
A
L
 
M
K
 
Q
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
F
 
F
G
 
G
D
 
N
P
 
P
A
 
A
S
 
E
R
 
R
D
 
N
D
 
D
I
 
I
A
 
A
M
 
M
G
 
G
P
 
P
L
 
L
I
 
I
N
 
N
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
E
R
|
R
V
 
V
E
 
E
Q
 
Q
K
 
K
V
 
V
A
 
A
K
 
R
A
 
A
V
 
V
A
 
E
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
F
G
 
G
G
 
G
K
 
K
A
 
A
V
 
V
T
 
E
G
 
G
R
 
K
G
 
G
Y
 
Y
F
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
P
 
P
T
 
T
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
V
 
V
R
 
R
Q
 
Q
E
 
E
M
 
M
D
 
S
I
 
I
V
 
M
H
 
H
E
 
E
E
|
E
T
 
T
F
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
L
P
 
P
V
 
V
V
 
V
A
 
A
F
 
F
D
 
D
T
 
T
L
 
L
E
 
E
E
 
D
A
 
A
L
 
I
A
 
S
M
 
M
A
 
A
N
 
N
D
 
D
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
T
 
T
S
 
S
S
 
S
I
 
I
Y
 
Y
T
 
T
R
 
Q
D
 
N
L
 
L
N
 
N
V
 
V
A
 
A
M
 
M
K
 
K
A
 
A
I
 
I
K
 
K
G
 
G
L
 
L
K
 
K
F
 
F
G
 
G
E
 
E
T
 
T
Y
 
Y
I
 
I
N
 
N
R
 
R
E
 
E
N
 
N
F
 
F
E
 
E
A
 
A
M
 
M
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
H
 
H
A
 
A
G
 
G
W
 
W
R
 
R
K
 
K
S
 
S
G
 
G
I
 
I
G
 
G
G
 
G
A
|
A
D
 
D
G
 
G
R
 
K
H
 
H
G
 
G
L
 
L
N
 
H
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
Q
T
 
T
Q
 
Q
V
 
V
V
 
V
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
Q
A
 
S

2iluA Crystal structure of lactaldehyde dehydrogenase from e. Coli: the binary complex with NADPH (see paper)
88% identity, 99% coverage: 4:479/479 of query aligns to 2:477/477 of 2iluA

query
sites
2iluA
P
 
P
V
 
V
Q
 
Q
H
 
H
P
 
P
M
 
M
Y
 
Y
I
 
I
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
E
 
V
P
 
T
G
 
W
R
 
R
G
 
G
D
 
D
A
 
A
W
 
W
I
 
I
D
 
D
V
 
V
I
 
V
N
 
N
P
 
P
A
 
A
T
 
T
E
 
E
A
 
A
L
 
V
L
 
I
S
 
S
R
 
R
I
 
I
P
 
P
D
 
D
G
 
G
S
 
Q
A
 
A
E
 
E
D
 
D
A
 
A
R
 
R
R
 
K
A
 
A
I
 
I
L
 
D
A
 
A
A
 
A
E
 
E
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
P
 
P
G
 
E
W
 
W
E
 
E
A
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
A
I
 
I
E
 
E
R
 
R
A
 
A
R
 
S
W
 
W
L
 
L
R
 
R
K
 
K
I
 
I
A
 
S
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
E
 
E
R
 
R
A
 
A
E
 
S
E
 
E
I
 
I
A
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
I
V
 
V
A
 
E
E
 
E
G
 
G
G
 
G
K
 
K
I
 
I
Q
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
A
 
E
V
 
V
E
 
E
V
 
V
S
 
A
F
 
F
T
 
T
A
 
A
D
 
D
Y
 
Y
L
 
I
D
 
D
Y
 
Y
M
 
M
A
 
A
E
 
E
W
 
W
A
 
A
R
 
R
R
 
R
Y
 
Y
E
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
I
V
 
I
Q
 
Q
S
 
S
D
 
D
R
 
R
T
 
P
G
 
G
E
 
E
N
 
N
I
 
I
L
 
L
V
 
L
F
 
F
K
 
K
R
 
R
A
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
V
T
 
T
T
 
T
G
 
G
I
|
I
L
|
L
P
|
P
W
|
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
F
 
F
F
 
F
L
 
L
I
 
I
A
 
A
R
 
R
K
 
K
L
 
M
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
I
 
L
T
 
T
G
 
G
N
 
N
T
 
T
I
 
I
V
 
V
I
 
I
K
|
K
P
 
P
S
|
S
E
|
E
F
 
F
T
 
T
P
 
P
N
 
N
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
A
F
 
F
A
 
A
Q
 
K
I
 
I
V
 
V
H
 
D
D
 
E
I
 
I
G
 
G
L
 
L
P
 
P
K
 
R
G
 
G
V
 
V
F
 
F
N
 
N
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
R
|
R
G
|
G
E
 
E
T
 
T
V
 
V
G
|
G
Q
|
Q
E
 
E
L
 
L
A
 
A
S
 
G
N
 
N
P
 
P
K
 
K
V
 
V
A
 
A
M
 
M
V
 
V
S
 
S
M
 
M
T
 
T
G
 
G
S
|
S
V
 
V
A
 
S
A
|
A
G
 
G
E
 
E
K
|
K
I
|
I
M
 
M
A
 
A
A
 
T
A
 
A
A
 
A
K
 
K
N
 
N
I
 
I
T
 
T
K
 
K
V
 
V
C
 
C
L
 
L
E
|
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
A
 
A
P
 
P
A
 
A
I
 
I
V
 
V
M
 
M
D
 
D
D
 
D
A
 
A
D
 
D
L
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
A
 
A
V
 
I
V
 
V
D
 
D
S
 
S
R
 
R
V
 
V
I
 
I
N
 
N
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
C
|
C
N
 
N
C
 
C
V
 
A
E
 
E
R
 
R
V
 
V
Y
 
Y
V
 
V
Q
 
Q
K
 
K
G
 
G
I
 
I
Y
 
Y
D
 
D
R
 
Q
F
 
F
V
 
V
N
 
N
R
 
R
L
 
L
G
 
G
E
 
E
A
 
A
L
 
M
K
 
Q
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
F
 
F
G
 
G
D
 
N
P
 
P
A
 
A
S
 
E
R
 
R
D
 
N
D
 
D
I
 
I
A
 
A
M
 
M
G
 
G
P
 
P
L
 
L
I
 
I
N
|
N
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
E
R
|
R
V
 
V
E
 
E
Q
 
Q
K
 
K
V
 
V
A
 
A
K
 
R
A
 
A
V
 
V
A
 
E
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
F
G
 
G
G
 
G
K
 
K
A
 
A
V
 
V
T
 
E
G
 
G
R
 
K
G
 
G
Y
 
Y
F
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
P
 
P
T
 
T
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
V
 
V
R
 
R
Q
 
Q
E
 
E
M
 
M
D
 
S
I
 
I
V
 
M
H
 
H
E
 
E
E
|
E
T
 
T
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
L
P
 
P
V
 
V
V
 
V
A
 
A
F
 
F
D
 
D
T
 
T
L
 
L
E
 
E
E
 
D
A
 
A
L
 
I
A
 
S
M
 
M
A
 
A
N
 
N
D
 
D
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
T
 
T
S
 
S
S
 
S
I
 
I
Y
 
Y
T
 
T
R
 
Q
D
 
N
L
 
L
N
 
N
V
 
V
A
 
A
M
 
M
K
 
K
A
 
A
I
 
I
K
 
K
G
 
G
L
 
L
K
 
K
F
 
F
G
 
G
E
 
E
T
 
T
Y
 
Y
I
 
I
N
 
N
R
 
R
E
 
E
N
 
N
F
 
F
E
 
E
A
 
A
M
 
M
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
H
 
H
A
 
A
G
 
G
W
 
W
R
 
R
K
 
K
S
 
S
G
 
G
I
 
I
G
 
G
G
 
G
A
|
A
D
 
D
G
 
G
R
 
K
H
 
H
G
 
G
L
 
L
N
 
H
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
Q
T
 
T
Q
 
Q
V
 
V
V
 
V
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
Q
A
 
S

6j76A Structure of 3,6-anhydro-l-galactose dehydrogenase in complex with nap (see paper)
43% identity, 99% coverage: 6:477/479 of query aligns to 1:475/477 of 6j76A

query
sites
6j76A
Q
 
Q
H
 
Y
P
 
Q
M
 
M
Y
 
Y
I
 
V
D
 
G
G
 
G
Q
 
E
F
 
W
E
 
I
P
 
D
G
 
A
R
 
S
G
 
N
D
 
G
A
 
Q
W
 
T
I
 
E
D
 
P
V
 
V
I
 
V
N
 
S
P
 
P
A
 
I
T
 
N
E
 
E
A
 
E
L
 
V
L
 
L
S
 
A
R
 
Y
I
 
I
P
 
Q
D
 
D
G
 
A
S
 
D
A
 
A
E
 
S
D
 
D
A
 
A
R
 
E
R
 
R
A
 
V
I
 
L
L
 
A
A
 
V
A
 
A
E
 
T
R
 
T
A
 
A
Q
 
Q
P
 
K
G
 
E
W
 
W
E
 
A
A
 
K
L
 
Q
P
 
P
A
 
A
I
 
R
E
 
Q
R
 
R
A
 
A
R
 
E
W
 
V
L
 
L
R
 
R
K
 
K
I
 
F
A
 
A
A
 
Q
G
 
L
I
 
I
R
 
R
E
 
D
R
 
N
A
 
K
E
 
Q
E
 
Y
I
 
L
A
 
A
A
 
E
L
 
L
I
 
L
V
 
V
A
 
K
E
 
E
G
 
Q
G
 
G
K
 
K
I
 
L
Q
 
L
Q
 
K
L
 
V
A
 
A
A
 
L
V
 
G
E
 
E
V
 
V
S
 
E
F
 
A
T
 
T
A
 
S
D
 
T
Y
 
F
L
 
I
D
 
E
Y
 
Y
M
 
A
A
 
C
E
 
D
W
 
W
A
 
A
R
 
R
R
 
Q
Y
 
M
E
 
D
G
 
G
E
 
D
I
 
I
V
 
V
Q
 
K
S
 
S
D
 
D
R
 
N
T
 
A
G
 
N
E
 
E
N
 
Q
I
 
I
L
 
M
V
 
I
F
 
H
K
 
K
R
 
I
A
 
P
L
 
R
G
 
G
V
 
V
T
 
V
T
 
V
G
 
A
I
|
I
L
x
T
P
x
A
W
|
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
F
 
L
F
 
A
L
 
L
I
 
A
A
 
G
R
 
R
K
 
K
L
 
I
A
 
G
P
 
P
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
A
G
 
G
N
 
N
T
 
S
I
 
I
V
 
V
I
 
V
K
|
K
P
 
P
S
x
T
E
x
S
F
 
E
T
 
T
P
 
P
N
 
L
N
 
A
A
 
T
I
 
L
A
 
E
F
 
L
A
 
G
Q
 
Y
I
 
L
V
 
A
H
 
E
D
 
Q
I
 
A
G
 
G
L
 
I
P
 
P
K
 
A
G
 
G
V
 
V
F
 
L
N
 
N
L
 
I
V
 
V
L
 
T
G
 
G
R
 
G
G
|
G
E
 
R
T
 
T
V
 
L
G
|
G
Q
 
N
E
 
E
L
 
L
A
 
V
S
 
G
N
 
H
P
 
R
K
 
M
V
 
T
A
 
N
M
 
M
V
 
V
S
 
S
M
 
M
T
|
T
G
|
G
S
|
S
V
 
T
A
 
P
A
|
A
G
 
G
E
 
Q
K
x
S
I
|
I
M
 
I
A
 
R
A
 
A
A
 
S
A
 
A
K
 
N
N
 
N
I
 
M
T
 
A
K
 
H
V
 
V
C
 
Q
L
 
L
E
|
E
L
|
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
A
 
A
P
 
P
A
 
F
I
 
I
V
 
V
M
 
M
D
 
E
D
 
D
A
 
A
D
 
D
L
 
L
E
 
E
L
 
Q
A
 
A
V
 
A
K
 
A
A
 
A
V
 
A
V
 
L
D
 
H
S
 
S
R
 
R
V
 
F
I
 
D
N
 
N
S
 
C
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
C
|
C
N
 
T
C
 
C
V
 
N
E
 
E
R
 
R
V
 
M
Y
 
Y
V
 
V
Q
 
H
K
 
G
G
 
A
I
 
V
Y
 
Y
D
 
D
R
 
E
F
 
F
V
 
M
N
 
R
R
 
I
L
 
F
G
 
M
E
 
G
A
 
K
L
 
V
K
 
E
A
 
A
V
 
I
Q
 
K
F
 
V
G
 
G
D
 
D
P
 
P
A
 
M
S
 
D
R
 
P
D
 
A
D
 
S
I
 
-
A
 
D
M
 
M
G
 
G
P
 
P
L
 
K
I
 
V
N
 
N
A
 
A
A
 
N
A
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
H
V
 
M
E
 
E
Q
 
E
K
 
L
V
 
V
A
 
A
K
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
D
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
T
V
 
V
A
 
L
L
 
F
G
 
G
G
 
G
K
 
K
A
 
K
V
 
L
T
 
E
G
 
G
-
 
P
-
 
E
-
 
F
-
 
E
R
 
K
G
 
G
Y
 
F
F
 
W
Y
 
F
P
 
E
P
 
P
T
 
T
L
 
V
L
 
L
L
 
T
D
 
N
V
 
V
R
 
T
Q
 
Q
E
 
D
M
 
M
D
 
T
I
 
I
V
 
V
H
 
H
E
 
E
E
|
E
T
 
S
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
I
L
 
L
P
 
P
V
 
V
V
 
I
A
 
K
F
 
F
D
 
D
T
 
S
L
 
F
E
 
D
E
 
E
A
 
V
L
 
I
A
 
E
M
 
Y
A
 
A
N
 
N
D
 
D
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
T
 
A
S
 
A
S
 
M
I
 
I
Y
 
C
T
 
T
R
 
Q
D
 
N
L
 
M
N
 
H
V
 
Y
A
 
I
M
 
N
K
 
R
A
 
L
I
 
L
K
 
T
G
 
E
L
 
L
K
 
E
F
 
S
G
 
G
E
 
E
T
 
I
Y
 
Y
I
 
V
N
 
N
R
 
R
E
 
G
N
 
H
F
 
G
E
 
E
A
 
Q
M
 
H
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
H
|
H
A
 
N
G
 
G
W
 
Y
R
 
K
K
 
L
S
 
S
G
 
G
I
 
T
G
 
G
G
 
G
A
x
E
D
 
D
G
 
G
R
 
K
H
 
Y
G
 
G
L
 
F
N
 
E
E
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
E
T
 
K
Q
 
K
V
 
T
V
 
F
Y
 
Y
L
 
I

5izdA Wild-type glyceraldehyde dehydrogenase from thermoplasma acidophilum in complex with NADP
38% identity, 98% coverage: 9:477/479 of query aligns to 5:475/494 of 5izdA

query
sites
5izdA
M
 
L
Y
 
Y
I
 
I
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
F
 
W
E
 
V
P
 
N
G
 
S
R
 
S
G
 
S
D
 
G
A
 
K
W
 
T
I
 
V
D
 
D
V
 
K
I
 
Y
N
 
S
P
 
P
A
 
V
T
 
T
E
 
G
A
 
Q
L
 
V
L
 
I
S
 
G
R
 
R
I
 
F
P
 
E
D
 
A
G
 
A
S
 
T
A
 
R
E
 
D
D
 
D
A
 
V
R
 
D
R
 
R
A
 
A
I
 
I
L
 
D
A
 
A
A
 
A
E
 
E
R
 
D
A
 
A
Q
 
F
P
 
W
G
 
A
W
 
W
E
 
N
A
 
D
L
 
L
P
 
G
A
 
S
I
 
V
E
 
E
R
 
R
A
 
S
R
 
K
W
 
I
L
 
I
R
 
Y
K
 
R
I
 
A
A
 
K
A
 
E
G
 
L
I
 
I
R
 
E
E
 
K
R
 
N
A
 
R
E
 
A
E
 
E
I
 
L
A
 
E
A
 
N
L
 
I
I
 
I
V
 
M
A
 
E
E
 
E
G
 
N
G
 
G
K
 
K
I
 
P
Q
 
V
Q
 
K
L
 
E
A
 
A
A
 
K
V
 
E
E
 
E
V
 
V
S
 
D
F
 
G
T
 
V
A
 
I
D
 
D
Y
 
Q
L
 
I
D
 
Q
Y
 
Y
M
 
Y
A
 
A
E
 
E
W
 
W
A
 
A
R
 
R
R
 
K
Y
 
L
E
 
N
G
 
G
E
 
E
I
 
V
V
 
V
Q
 
E
S
 
G
D
 
T
R
 
S
T
 
S
G
 
H
E
 
R
N
 
K
I
 
I
L
 
F
V
 
Q
F
 
Y
K
 
K
R
 
V
A
 
P
L
 
Y
G
 
G
V
 
I
T
 
V
T
 
V
G
 
A
I
x
L
L
x
T
P
 
P
W
|
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
F
 
A
F
 
G
L
 
M
I
 
V
A
 
A
R
 
R
K
 
K
L
 
L
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
I
 
L
T
 
T
G
 
G
N
 
N
T
 
T
I
 
V
V
 
V
I
 
L
K
|
K
P
|
P
S
|
S
E
x
S
F
 
D
T
 
T
P
 
P
N
 
G
N
 
S
A
 
A
I
 
E
A
 
W
F
 
I
A
 
V
Q
 
R
I
 
K
V
 
F
H
 
V
D
 
E
I
 
A
G
 
G
L
 
V
P
 
P
K
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
L
N
 
N
L
 
F
V
 
I
L
 
T
G
 
G
R
|
R
G
|
G
E
 
S
T
 
E
V
 
I
G
|
G
Q
x
D
E
 
Y
L
 
I
A
 
V
S
 
E
N
 
H
P
 
K
K
 
K
V
 
V
A
 
N
M
 
L
V
 
I
S
 
T
M
 
M
T
 
T
G
|
G
S
|
S
V
 
T
A
 
A
A
x
T
G
 
G
E
 
Q
K
 
R
I
 
I
M
 
M
A
 
Q
A
 
K
A
 
A
A
 
S
K
 
A
N
 
N
I
 
M
T
 
A
K
 
K
V
 
L
C
 
I
L
 
L
E
|
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
A
 
A
P
 
P
A
 
F
I
 
M
V
 
V
M
 
W
D
 
K
D
 
D
A
 
A
D
 
D
L
 
M
E
 
D
L
 
N
A
 
A
V
 
L
K
 
K
A
 
T
V
 
L
V
 
L
D
 
W
S
 
A
R
 
K
V
 
Y
I
 
W
N
 
N
S
 
A
G
 
G
Q
 
Q
V
 
S
C
|
C
N
 
I
C
 
A
V
 
A
E
 
E
R
 
R
V
 
L
Y
 
Y
V
 
V
Q
 
H
K
 
E
G
 
D
I
 
I
Y
 
Y
D
 
D
R
 
T
F
 
F
V
 
M
N
 
S
R
 
R
L
 
F
G
 
V
E
 
E
A
 
L
L
 
S
K
 
R
A
 
K
V
 
L
Q
 
A
F
 
L
G
 
G
D
 
D
P
 
P
A
 
K
S
 
N
R
 
A
D
 
D
D
 
-
I
 
-
A
 
-
M
 
M
G
 
G
P
 
P
L
 
L
I
 
I
N
 
N
A
 
K
A
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
Q
R
 
A
V
 
T
E
 
S
Q
 
E
K
 
I
V
 
V
A
 
E
K
 
E
A
 
A
V
 
K
A
 
E
Q
 
S
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
I
A
 
L
L
 
F
G
 
G
G
 
G
K
 
S
-
 
Q
-
 
P
A
 
S
V
 
L
T
 
S
G
 
G
-
 
P
-
 
Y
-
 
R
R
 
N
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
F
P
 
L
P
 
P
T
 
T
L
 
I
L
 
I
L
 
G
D
 
N
V
 
A
R
 
D
Q
 
Q
E
 
K
M
 
S
D
 
K
I
 
I
V
 
F
H
 
Q
E
 
E
E
|
E
T
 
I
F
 
F
G
 
A
P
 
P
V
 
V
L
 
I
P
 
G
V
 
A
V
 
R
A
 
K
F
 
I
D
 
S
T
 
S
L
 
V
E
 
E
E
 
E
A
 
M
L
 
Y
A
 
D
M
 
L
A
 
A
N
 
N
D
 
D
S
 
S
D
 
K
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
T
 
A
S
 
S
S
 
Y
I
 
L
Y
 
F
T
 
T
R
 
K
D
 
D
L
 
P
N
 
N
V
 
I
A
 
I
M
 
F
K
 
E
A
 
A
I
 
S
K
 
E
G
 
R
L
 
I
K
 
R
F
 
F
G
 
G
E
 
E
T
 
L
Y
 
Y
I
 
V
N
 
N
R
 
M
E
 
P
N
 
G
F
 
P
E
 
E
A
 
A
M
 
S
Q
 
Q
G
 
G
F
 
Y
H
 
H
A
 
T
G
 
G
W
 
F
R
 
R
K
 
M
S
 
T
G
 
G
I
 
Q
G
 
A
G
 
G
A
x
E
D
 
G
G
 
S
R
 
K
H
 
Y
G
 
G
L
 
I
N
 
S
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
K
T
 
L
Q
 
K
V
 
N
V
 
I
Y
 
Y
L
 
V

3jz4A Crystal structure of e. Coli NADP dependent enzyme (see paper)
40% identity, 97% coverage: 11:477/479 of query aligns to 14:479/481 of 3jz4A

query
sites
3jz4A
I
 
I
D
 
N
G
 
G
Q
 
E
F
 
W
E
 
L
P
 
D
G
 
A
R
 
N
G
 
N
D
 
G
A
 
E
W
 
A
I
 
I
D
 
D
V
 
V
I
 
T
N
 
N
P
 
P
A
 
A
T
 
N
E
 
G
A
 
D
L
 
K
L
 
L
S
 
G
R
 
S
I
 
V
P
 
P
D
 
K
G
 
M
S
 
G
A
 
A
E
 
D
D
 
E
A
 
T
R
 
R
R
 
A
A
 
A
I
 
I
L
 
D
A
 
A
A
 
A
E
 
N
R
 
R
A
 
A
Q
 
L
P
 
P
G
 
A
W
 
W
E
 
R
A
 
A
L
 
L
P
 
T
A
 
A
I
 
K
E
 
E
R
 
R
A
 
A
R
 
T
W
 
I
L
 
L
R
 
R
K
 
N
I
 
W
A
 
F
A
 
N
G
 
L
I
 
M
R
 
M
E
 
E
R
 
H
A
 
Q
E
 
D
E
 
D
I
 
L
A
 
A
A
 
R
L
 
L
I
 
M
V
 
T
A
 
L
E
 
E
G
 
Q
G
 
G
K
 
K
I
 
P
Q
 
L
Q
 
A
L
 
E
A
 
A
A
 
K
V
 
G
E
 
E
V
 
I
S
 
S
F
 
Y
T
 
A
A
 
A
D
 
S
Y
 
F
L
 
I
D
 
E
Y
 
W
M
 
F
A
 
A
E
 
E
W
 
E
A
 
G
R
 
K
R
 
R
Y
 
I
E
 
Y
G
 
G
E
 
D
I
 
T
V
 
I
Q
 
P
S
 
G
D
 
H
R
 
Q
T
 
A
G
 
D
E
 
K
N
 
R
I
 
L
L
 
I
V
 
V
F
 
I
K
 
K
R
 
Q
A
 
P
L
 
I
G
 
G
V
 
V
T
 
T
T
 
A
G
 
A
I
 
I
L
 
T
P
|
P
W
|
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
F
 
A
F
 
A
L
 
M
I
 
I
A
 
T
R
 
R
K
 
K
L
 
A
A
 
G
P
 
P
A
 
A
L
 
L
I
 
A
T
 
A
G
 
G
N
 
C
T
 
T
I
 
M
V
 
V
I
 
L
K
|
K
P
 
P
S
x
A
E
x
S
F
 
Q
T
 
T
P
 
P
N
 
F
N
 
S
A
 
A
I
 
L
A
 
A
F
 
L
A
 
A
Q
 
E
I
 
L
V
 
A
H
 
I
D
 
R
I
 
A
G
 
G
L
 
V
P
 
P
K
 
A
G
 
G
V
 
V
F
 
F
N
 
N
L
 
V
V
 
V
L
 
T
G
 
G
R
 
S
G
x
A
E
 
G
T
 
A
V
 
V
G
|
G
Q
 
N
E
 
E
L
 
L
A
 
T
S
 
S
N
 
N
P
 
P
K
 
L
V
 
V
A
 
R
M
 
K
V
 
L
S
 
S
M
 
F
T
 
T
G
|
G
S
|
S
V
 
T
A
 
E
A
x
I
G
 
G
E
 
R
K
 
Q
I
 
L
M
 
M
A
 
E
A
 
Q
A
 
C
A
 
A
K
 
K
N
 
D
I
 
I
T
 
K
K
 
K
V
 
V
C
 
S
L
 
L
E
|
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
N
A
 
A
P
 
P
A
 
F
I
 
I
V
 
V
M
 
F
D
 
D
D
 
D
A
 
A
D
 
D
L
 
L
E
 
D
L
 
K
A
 
A
V
 
V
K
 
E
A
 
G
V
 
A
V
 
L
D
 
A
S
 
S
R
 
K
V
 
F
I
 
R
N
 
N
S
 
A
G
 
G
Q
 
Q
V
 
T
C
|
C
N
 
V
C
 
C
V
 
A
E
 
N
R
 
R
V
 
L
Y
 
Y
V
 
V
Q
 
Q
K
 
D
G
 
G
I
 
V
Y
 
Y
D
 
D
R
 
R
F
 
F
V
 
A
N
 
E
R
 
K
L
 
L
G
 
Q
E
 
Q
A
 
A
L
 
M
K
 
S
A
 
K
V
 
L
Q
 
H
F
 
I
G
 
G
D
 
D
P
 
-
A
 
G
S
 
L
R
 
D
D
 
N
D
 
G
I
 
V
A
 
T
M
 
I
G
 
G
P
 
P
L
 
L
I
 
I
N
 
D
A
 
E
A
 
K
A
 
A
L
 
V
A
 
A
R
x
K
V
 
V
E
 
E
Q
 
E
K
 
H
V
 
I
A
 
A
K
 
D
A
 
A
V
 
L
A
 
E
Q
 
K
G
 
G
A
 
A
R
 
R
V
 
V
A
 
V
L
 
C
G
 
G
G
 
G
K
 
K
A
 
A
V
 
H
T
 
E
G
 
R
R
 
G
G
 
G
Y
 
N
F
 
F
Y
 
F
P
 
Q
P
 
P
T
 
T
L
 
I
L
 
L
L
 
V
D
 
D
V
 
V
R
 
P
Q
 
A
E
 
N
M
 
A
D
 
K
I
 
V
V
 
S
H
 
K
E
 
E
E
|
E
T
 
T
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
L
L
 
A
P
 
P
V
 
L
V
 
F
A
 
R
F
 
F
D
 
K
T
 
D
L
 
E
E
 
A
E
 
D
A
 
V
L
 
I
A
 
A
M
 
Q
A
 
A
N
 
N
D
 
D
S
 
T
D
 
E
Y
 
F
G
 
G
L
 
L
T
 
A
S
 
A
S
 
Y
I
 
F
Y
 
Y
T
 
A
R
 
R
D
 
D
L
 
L
N
 
S
V
 
R
A
 
V
M
 
F
K
 
R
A
 
V
I
 
G
K
 
E
G
 
A
L
 
L
K
 
E
F
 
Y
G
 
G
E
 
I
T
 
V
Y
 
G
I
 
I
N
 
N
R
 
T
E
 
G
N
 
I
F
 
I
E
 
S
A
 
N
M
 
E
Q
 
V
G
 
A
F
 
P
H
 
F
A
 
G
G
 
G
W
 
I
R
 
K
K
 
A
S
 
S
G
 
G
I
 
L
G
 
G
G
 
R
A
x
E
D
 
G
G
 
S
R
 
K
H
 
Y
G
 
G
L
 
I
N
 
E
E
 
D
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
E
T
 
I
Q
 
K
V
 
Y
V
 
M
Y
 
C
L
 
I

P25526 Succinate-semialdehyde dehydrogenase [NADP(+)] GabD; SSDH; Glutarate-semialdehyde dehydrogenase; EC 1.2.1.79; EC 1.2.1.- from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
40% identity, 97% coverage: 11:477/479 of query aligns to 15:480/482 of P25526

query
sites
P25526
I
 
I
D
 
N
G
 
G
Q
 
E
F
 
W
E
 
L
P
 
D
G
 
A
R
 
N
G
 
N
D
 
G
A
 
E
W
 
A
I
 
I
D
 
D
V
 
V
I
 
T
N
 
N
P
 
P
A
 
A
T
 
N
E
 
G
A
 
D
L
 
K
L
 
L
S
 
G
R
 
S
I
 
V
P
 
P
D
 
K
G
 
M
S
 
G
A
 
A
E
 
D
D
 
E
A
 
T
R
 
R
R
 
A
A
 
A
I
 
I
L
 
D
A
 
A
A
 
A
E
 
N
R
 
R
A
 
A
Q
 
L
P
 
P
G
 
A
W
 
W
E
 
R
A
 
A
L
 
L
P
 
T
A
 
A
I
 
K
E
 
E
R
 
R
A
 
A
R
 
T
W
 
I
L
 
L
R
 
R
K
 
N
I
 
W
A
 
F
A
 
N
G
 
L
I
 
M
R
 
M
E
 
E
R
 
H
A
 
Q
E
 
D
E
 
D
I
 
L
A
 
A
A
 
R
L
 
L
I
 
M
V
 
T
A
 
L
E
 
E
G
 
Q
G
 
G
K
 
K
I
 
P
Q
 
L
Q
 
A
L
 
E
A
 
A
A
 
K
V
 
G
E
 
E
V
 
I
S
 
S
F
 
Y
T
 
A
A
 
A
D
 
S
Y
 
F
L
 
I
D
 
E
Y
 
W
M
 
F
A
 
A
E
 
E
W
 
E
A
 
G
R
 
K
R
 
R
Y
 
I
E
 
Y
G
 
G
E
 
D
I
 
T
V
 
I
Q
 
P
S
 
G
D
 
H
R
 
Q
T
 
A
G
 
D
E
 
K
N
 
R
I
 
L
L
 
I
V
 
V
F
 
I
K
 
K
R
 
Q
A
 
P
L
 
I
G
 
G
V
 
V
T
 
T
T
 
A
G
 
A
I
 
I
L
 
T
P
 
P
W
|
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
F
 
A
F
 
A
L
 
M
I
 
I
A
 
T
R
 
R
K
 
K
L
 
A
A
 
G
P
 
P
A
 
A
L
 
L
I
 
A
T
 
A
G
 
G
N
 
C
T
 
T
I
 
M
V
 
V
I
 
L
K
|
K
P
|
P
S
x
A
E
x
S
F
 
Q
T
 
T
P
 
P
N
 
F
N
 
S
A
 
A
I
 
L
A
 
A
F
 
L
A
 
A
Q
 
E
I
 
L
V
 
A
H
 
I
D
 
R
I
 
A
G
 
G
L
 
V
P
 
P
K
 
A
G
 
G
V
 
V
F
 
F
N
 
N
L
 
V
V
 
V
L
 
T
G
 
G
R
 
S
G
 
A
E
 
G
T
 
A
V
 
V
G
 
G
Q
 
N
E
 
E
L
 
L
A
 
T
S
 
S
N
 
N
P
 
P
K
 
L
V
 
V
A
 
R
M
 
K
V
 
L
S
 
S
M
 
F
T
 
T
G
|
G
S
|
S
V
 
T
A
 
E
A
 
I
G
 
G
E
 
R
K
 
Q
I
 
L
M
 
M
A
 
E
A
 
Q
A
 
C
A
 
A
K
 
K
N
 
D
I
 
I
T
 
K
K
 
K
V
 
V
C
 
S
L
 
L
E
 
E
L
|
L
G
 
G
G
 
G
K
 
N
A
 
A
P
 
P
A
 
F
I
 
I
V
 
V
M
 
F
D
 
D
D
 
D
A
 
A
D
 
D
L
 
L
E
 
D
L
 
K
A
 
A
V
 
V
K
 
E
A
 
G
V
 
A
V
 
L
D
 
A
S
 
S
R
 
K
V
 
F
I
 
R
N
 
N
S
 
A
G
 
G
Q
 
Q
V
 
T
C
 
C
N
 
V
C
 
C
V
 
A
E
 
N
R
 
R
V
 
L
Y
 
Y
V
 
V
Q
 
Q
K
 
D
G
 
G
I
 
V
Y
 
Y
D
 
D
R
 
R
F
 
F
V
 
A
N
 
E
R
 
K
L
 
L
G
 
Q
E
 
Q
A
 
A
L
 
V
K
 
S
A
 
K
V
 
L
Q
 
H
F
 
I
G
 
G
D
 
D
P
 
-
A
 
G
S
 
L
R
 
D
D
 
N
D
 
G
I
 
V
A
 
T
M
 
I
G
 
G
P
 
P
L
 
L
I
 
I
N
 
D
A
 
E
A
 
K
A
 
A
L
 
V
A
 
A
R
 
K
V
 
V
E
 
E
Q
 
E
K
 
H
V
 
I
A
 
A
K
 
D
A
 
A
V
 
L
A
 
E
Q
 
K
G
 
G
A
 
A
R
 
R
V
 
V
A
 
V
L
 
C
G
 
G
G
 
G
K
 
K
A
 
A
V
 
H
T
 
E
G
 
R
R
 
G
G
 
G
Y
 
N
F
 
F
Y
 
F
P
 
Q
P
 
P
T
 
T
L
 
I
L
 
L
L
 
V
D
 
D
V
 
V
R
 
P
Q
 
A
E
 
N
M
 
A
D
 
K
I
 
V
V
 
S
H
 
K
E
 
E
E
|
E
T
 
T
F
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
L
L
 
A
P
 
P
V
 
L
V
 
F
A
 
R
F
 
F
D
 
K
T
 
D
L
 
E
E
 
A
E
 
D
A
 
V
L
 
I
A
 
A
M
 
Q
A
 
A
N
 
N
D
 
D
S
 
T
D
 
E
Y
 
F
G
 
G
L
 
L
T
 
A
S
 
A
S
 
Y
I
 
F
Y
 
Y
T
 
A
R
 
R
D
 
D
L
 
L
N
 
S
V
 
R
A
 
V
M
 
F
K
 
R
A
 
V
I
 
G
K
 
E
G
 
A
L
 
L
K
 
E
F
 
Y
G
 
G
E
 
I
T
 
V
Y
 
G
I
 
I
N
 
N
R
 
T
E
 
G
N
 
I
F
 
I
E
 
S
A
 
N
M
 
E
Q
 
V
G
 
A
F
 
P
H
 
F
A
 
G
G
 
G
W
 
I
R
 
K
K
 
A
S
 
S
G
 
G
I
 
L
G
 
G
G
 
R
A
 
E
D
 
G
G
 
S
R
 
K
H
 
Y
G
 
G
L
 
I
N
 
E
E
 
D
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
E
T
 
I
Q
 
K
V
 
Y
V
 
M
Y
 
C
L
 
I

8of1A Structure of aldh5f1 from moss physcomitrium patens in complex with NAD+ in the contracted conformation
39% identity, 96% coverage: 20:477/479 of query aligns to 33:497/505 of 8of1A

query
sites
8of1A
G
 
G
D
 
D
A
 
K
W
 
W
I
 
V
D
 
D
-
 
A
-
 
E
-
 
N
-
 
G
-
 
H
-
 
T
-
 
L
-
 
P
V
 
V
I
 
N
N
 
N
P
 
P
A
 
A
T
 
T
E
 
G
A
 
E
L
 
I
L
 
L
S
 
T
R
 
S
I
 
V
P
 
P
D
 
F
G
 
M
S
 
G
A
 
K
E
 
R
D
 
E
A
 
A
R
 
E
R
 
K
A
 
A
I
 
I
L
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
S
R
 
Q
A
 
A
Q
 
F
P
 
T
G
 
S
W
 
W
E
 
S
A
 
K
L
 
R
P
 
T
A
 
A
I
 
N
E
 
D
R
 
R
A
 
S
R
 
K
W
 
I
L
 
L
R
 
R
K
 
Q
I
 
W
A
 
F
A
 
N
G
 
L
I
 
L
R
 
I
E
 
K
R
 
N
A
 
K
E
 
D
E
 
D
I
 
L
A
 
G
A
 
K
L
 
L
I
 
I
V
 
V
A
 
L
E
 
E
G
 
Q
G
 
G
K
 
K
I
 
P
Q
 
L
Q
 
A
L
 
E
A
 
A
A
 
V
V
 
G
E
 
E
V
 
I
S
 
V
F
 
Y
T
 
G
A
 
A
D
 
A
Y
 
F
L
 
V
D
 
E
Y
 
Y
M
 
Y
A
 
A
E
 
E
W
 
E
A
 
A
R
 
K
R
 
R
Y
 
V
E
 
Y
G
 
G
E
 
D
I
 
I
V
 
I
Q
 
P
S
 
S
D
 
P
R
 
F
T
 
P
G
 
E
E
 
K
N
 
R
I
 
M
L
 
L
V
 
V
F
 
M
K
 
K
R
 
Q
A
 
P
L
 
V
G
 
G
V
 
V
T
 
V
T
 
A
G
 
A
I
|
I
L
x
A
P
|
P
W
|
W
N
 
N
F
 
F
P
 
P
F
 
L
F
 
A
L
 
M
I
 
I
A
 
T
R
 
R
K
 
K
L
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
I
 
A
T
 
A
G
 
G
N
 
C
T
 
T
I
 
V
V
 
V
I
 
I
K
|
K
P
 
P
S
 
S
E
 
E
F
 
L
T
 
T
P
 
P
N
 
L
N
 
T
A
 
A
I
 
L
A
 
A
F
 
A
A
 
A
Q
 
E
I
 
L
V
 
A
H
 
L
D
 
Q
I
 
A
G
 
G
L
 
I
P
 
P
K
 
P
G
 
G
V
 
V
F
 
V
N
 
N
L
 
V
V
 
V
L
 
M
G
 
G
R
 
D
G
x
A
E
 
K
T
 
G
V
 
I
G
 
G
Q
 
D
E
 
A
L
 
M
A
 
L
S
 
D
N
 
S
P
 
T
K
 
E
V
 
V
A
 
R
M
 
K
V
 
I
S
 
T
M
x
F
T
 
T
G
|
G
S
|
S
V
 
T
A
 
G
A
x
V
G
 
G
E
 
K
K
x
M
I
 
L
M
 
L
A
 
A
A
 
G
A
 
A
A
 
G
K
 
K
N
 
T
I
 
V
T
 
K
K
 
K
V
 
V
C
 
S
L
 
L
E
 
E
L
|
L
G
 
G
G
 
G
K
 
N
A
 
A
P
 
P
A
 
C
I
 
I
V
 
V
M
 
F
D
 
D
D
 
D
A
 
A
D
 
N
L
 
L
E
 
D
L
 
V
A
 
A
V
 
V
K
 
K
A
 
G
V
 
V
V
 
L
D
 
A
S
 
G
R
 
K
V
 
Y
I
 
R
N
 
N
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
V
 
T
C
|
C
N
 
V
C
 
C
V
 
I
E
 
N
R
 
K
V
 
I
Y
 
F
V
 
V
Q
 
Q
K
 
D
G
 
G
I
 
I
Y
 
Y
D
 
D
R
 
K
F
 
F
V
 
A
N
 
E
R
 
A
L
 
F
G
 
A
E
 
K
A
 
A
L
 
V
K
 
S
A
 
G
V
 
L
Q
 
R
F
 
A
G
 
G
D
 
N
P
 
-
A
 
G
S
 
L
R
 
E
D
 
P
D
 
G
I
 
I
A
 
T
M
 
Q
G
 
G
P
 
P
L
 
L
I
 
I
N
 
N
A
 
E
A
 
T
A
 
A
L
 
L
A
 
E
R
x
K
V
 
V
E
 
E
Q
 
R
K
 
H
V
 
V
A
 
Q
K
 
D
A
 
A
V
 
V
A
 
S
Q
 
K
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
A
 
L
L
 
V
G
 
G
G
 
G
K
 
K
A
 
R
V
 
H
T
 
S
G
 
L
R
 
G
G
 
R
Y
 
T
F
 
F
Y
 
Y
P
 
E
P
 
P
T
 
T
L
 
I
L
 
L
L
 
G
D
 
N
V
 
A
R
 
S
Q
 
D
E
 
E
M
 
M
D
 
L
I
 
I
V
 
F
H
 
R
E
 
E
E
|
E
T
 
V
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
A
P
 
P
V
 
L
V
 
V
A
 
R
F
 
F
D
 
N
T
 
T
L
 
D
E
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
K
M
 
L
A
 
A
N
 
N
D
 
N
S
 
S
D
 
E
Y
 
F
G
 
G
L
 
L
T
 
A
S
 
A
S
 
Y
I
 
A
Y
 
F
T
 
T
R
 
E
D
 
N
L
 
I
N
 
T
V
 
R
A
 
G
M
 
W
K
 
R
A
 
V
I
 
A
K
 
E
G
 
S
L
 
L
K
 
E
F
 
F
G
 
G
E
 
M
T
 
V
Y
 
G
I
 
L
N
 
N
R
 
E
E
 
G
N
 
L
F
 
I
E
 
S
A
 
T
M
 
E
Q
 
V
G
 
A
F
 
P
H
 
F
A
 
G
G
 
G
W
 
M
R
 
K
K
 
Q
S
 
S
G
 
G
I
 
L
G
 
G
G
 
R
A
 
E
D
 
G
G
 
S
R
 
K
H
 
Y
G
 
G
L
 
L
N
 
D
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
E
T
 
M
Q
 
K
V
 
Y
V
 
V
Y
 
C
L
 
L

4neaA 1.90 angstrom resolution crystal structure of betaine aldehyde dehydrogenase (betb) from staphylococcus aureus in complex with NAD+ and bme-free cys289 (see paper)
37% identity, 97% coverage: 10:475/479 of query aligns to 21:491/505 of 4neaA

query
sites
4neaA
Y
 
Y
I
 
I
D
 
D
G
 
G
Q
 
E
F
 
W
E
 
V
P
 
E
G
 
S
R
 
A
G
 
N
D
 
K
A
 
N
W
 
T
I
 
R
D
 
D
V
 
I
I
 
I
N
 
N
P
 
P
A
 
Y
T
 
N
E
 
Q
A
 
E
L
 
V
L
 
I
S
 
F
R
 
T
I
 
V
P
 
S
D
 
E
G
 
G
S
 
T
A
 
K
E
 
E
D
 
D
A
 
A
R
 
E
R
 
R
A
 
A
I
 
I
L
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
R
R
 
R
A
 
A
-
 
F
Q
 
E
P
 
S
G
 
G
-
 
E
W
 
W
E
 
S
A
 
Q
L
 
E
P
 
T
A
 
A
I
 
E
E
 
T
R
 
R
A
 
G
R
 
K
W
 
K
L
 
V
R
 
R
K
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
D
G
 
K
I
 
I
R
 
K
E
 
E
R
 
H
A
 
R
E
 
E
E
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
R
L
 
L
I
 
E
V
 
T
A
 
L
E
 
D
G
 
T
G
 
G
K
 
K
I
 
T
Q
 
L
Q
 
E
L
 
E
A
 
S
A
 
Y
V
 
A
E
 
D
V
 
M
S
 
D
F
 
D
T
 
I
A
 
H
D
 
N
Y
 
V
L
 
F
D
 
M
Y
 
Y
M
 
F
A
 
A
E
 
G
W
 
L
A
 
A
R
 
D
R
 
K
Y
 
D
E
 
G
G
 
G
E
 
E
I
 
M
V
 
I
Q
 
D
S
 
S
D
 
P
R
 
I
T
 
P
G
 
D
E
 
T
N
 
E
I
 
S
L
 
K
V
 
I
F
 
V
K
 
K
R
 
E
A
 
P
L
 
V
G
 
G
V
 
V
T
 
V
T
 
T
G
 
Q
I
 
I
L
 
T
P
|
P
W
 
W
N
|
N
F
 
Y
P
 
P
F
 
L
F
 
L
L
 
Q
I
 
A
A
 
S
R
 
W
K
 
K
L
 
I
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
I
 
A
T
 
T
G
 
G
N
 
C
T
 
S
I
 
L
V
 
V
I
 
M
K
|
K