SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing BWI76_RS14900 FitnessBrowser__Koxy:BWI76_RS14900 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1wwkA Crystal structure of phosphoglycerate dehydrogenase from pyrococcus horikoshii ot3
33% identity, 92% coverage: 9:314/331 of query aligns to 3:286/304 of 1wwkA

query
sites
1wwkA
L
 
V
F
 
L
I
 
V
N
 
A
A
 
A
A
 
P
M
 
L
M
 
H
D
 
E
A
 
K
G
 
A
L
 
I
N
 
Q
A
 
V
L
 
L
K
 
K
D
 
D
K
 
A
G
 
G
I
 
L
A
 
E
V
 
V
E
 
I
V
 
Y
R
 
E
E
 
E
W
 
Y
S
 
P
H
 
D
E
 
E
S
 
D
I
 
-
E
 
-
K
 
-
L
 
-
Q
 
-
E
 
-
D
 
-
N
 
-
L
 
-
L
 
-
V
 
-
E
 
-
Q
 
-
Q
 
-
G
 
-
S
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
-
A
 
R
L
 
L
L
 
V
Q
 
E
G
 
L
A
 
V
E
 
K
E
 
D
T
 
V
E
 
E
I
 
A
L
 
I
I
 
I
V
 
V
Q
 
R
F
 
S
A
 
K
P
 
P
-
 
K
V
 
V
N
 
T
A
 
R
A
 
R
V
 
V
F
 
I
D
 
E
K
 
S
L
 
A
P
 
P
K
 
K
L
 
L
K
 
K
Y
 
V
V
 
I
G
 
A
V
 
R
L
 
A
R
 
G
G
 
V
G
 
G
I
 
L
E
 
D
N
 
N
V
 
I
N
 
D
Q
 
V
A
 
E
E
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
E
R
 
K
G
 
G
I
 
I
E
 
E
V
 
V
M
 
V
N
 
N
T
 
A
P
 
P
G
 
A
R
 
A
N
x
S
A
 
S
R
 
R
S
 
S
V
|
V
A
 
A
E
 
E
F
 
L
T
 
A
V
 
V
G
 
G
M
 
L
I
 
M
L
 
F
A
 
S
E
 
V
M
 
A
R
 
R
N
 
K
I
 
I
A
 
A
R
 
F
S
 
A
H
 
D
D
 
R
A
 
K
L
 
M
R
 
R
D
 
E
K
 
G
F
 
V
W
 
W
R
 
A
K
 
K
E
 
K
S
 
E
P
 
A
N
 
M
H
 
G
R
 
I
A
 
-
I
 
-
P
 
-
E
 
E
L
 
L
G
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
T
V
 
I
G
 
G
L
 
I
V
 
I
G
|
G
L
x
F
G
|
G
H
x
R
I
|
I
A
 
G
Q
 
Y
L
 
Q
V
 
V
A
 
A
G
 
K
F
 
I
L
 
A
R
 
N
G
 
A
F
 
L
G
 
G
S
 
M
E
 
N
I
 
I
I
 
L
F
 
L
Y
|
Y
D
|
D
K
x
P
Y
 
Y
V
 
P
A
 
N
G
 
E
H
 
E
D
 
R
S
 
A
Y
 
K
E
 
E
-
 
V
-
 
N
-
 
G
K
 
K
V
 
F
D
 
V
S
 
D
L
 
L
D
 
E
E
 
T
L
 
L
V
 
L
R
 
K
R
 
E
A
 
S
D
 
D
V
 
V
I
 
V
S
 
T
L
 
I
H
 
H
A
x
V
R
x
P
L
 
L
T
 
V
A
 
E
E
 
S
T
|
T
E
 
Y
N
 
H
L
 
L
I
 
I
N
 
N
A
 
E
H
 
E
H
 
R
F
 
L
D
 
K
L
 
L
M
 
M
K
 
K
E
 
K
S
 
T
A
 
A
I
 
I
I
 
L
V
 
I
N
 
N
T
|
T
A
x
S
R
|
R
S
 
G
G
 
P
L
 
V
I
 
V
N
 
D
E
 
T
A
 
N
D
 
A
L
 
L
I
 
V
A
 
K
A
 
A
L
 
L
R
 
K
A
 
E
G
 
G
K
 
W
I
 
I
M
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
T
 
V
F
 
F
D
 
E
D
 
E
E
|
E
P
 
P
L
 
L
P
 
P
D
 
K
D
 
D
S
 
H
A
 
P
F
 
L
Y
 
T
S
 
K
L
 
F
N
 
D
N
 
N
V
 
V
T
 
V
I
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
A
x
G
G
 
A
S
 
S
T
 
T
I
 
V
D
 
E
A
 
A

3dc2A Crystal structure of serine bound d-3-phosphoglycerate dehydrogenase from mycobacterium tuberculosis (see paper)
40% identity, 76% coverage: 64:314/331 of query aligns to 35:285/526 of 3dc2A

query
sites
3dc2A
L
 
L
L
 
L
Q
 
A
G
 
A
A
 
V
E
 
P
E
 
E
T
 
A
E
 
D
I
 
A
L
 
L
I
 
L
V
 
V
Q
 
R
F
 
S
A
 
A
P
 
T
-
 
T
V
 
V
N
 
D
A
 
A
A
 
E
V
 
V
F
 
L
D
 
A
K
 
A
L
 
A
P
 
P
K
 
K
L
 
L
K
 
K
Y
 
I
V
 
V
G
 
A
V
 
R
L
 
A
R
 
G
G
 
V
G
 
G
I
 
L
E
 
D
N
 
N
V
 
V
N
 
D
Q
 
V
A
 
D
E
 
A
A
 
A
K
 
T
A
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
V
E
 
L
V
 
V
M
 
V
N
 
N
T
 
A
P
 
P
G
 
T
R
 
S
N
|
N
A
 
I
R
 
H
S
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
F
 
H
T
 
A
V
 
L
G
 
A
M
 
L
I
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
A
M
 
S
R
 
R
N
 
Q
I
 
I
A
 
P
R
 
A
S
 
A
H
 
D
D
 
A
A
 
S
L
 
L
R
 
R
D
 
E
K
 
H
F
 
T
W
 
W
R
 
K
K
 
R
E
 
S
S
 
S
P
 
F
N
 
S
H
 
G
R
 
T
A
 
-
I
 
-
P
 
-
E
 
E
L
 
I
G
 
F
G
 
G
K
 
K
V
 
T
V
 
V
G
 
G
L
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
G
H
 
R
I
 
I
A
 
G
Q
 
Q
L
 
L
V
 
V
A
 
A
G
 
Q
F
 
R
L
 
I
R
 
A
G
 
A
F
 
F
G
 
G
S
 
A
E
 
Y
I
 
V
I
 
V
F
 
A
Y
 
Y
D
 
D
K
 
P
Y
 
Y
V
 
V
A
 
S
G
 
P
H
 
A
D
 
R
S
 
A
Y
 
A
E
 
Q
-
 
L
-
 
G
-
 
I
K
 
E
V
 
L
D
 
L
S
 
S
L
 
L
D
 
D
E
 
D
L
 
L
V
 
L
R
 
A
R
 
R
A
 
A
D
 
D
V
 
F
I
 
I
S
 
S
L
 
V
H
 
H
A
 
L
R
 
P
L
 
K
T
 
T
A
 
P
E
 
E
T
 
T
E
 
A
N
 
G
L
 
L
I
 
I
N
 
D
A
 
K
H
 
E
H
 
A
F
 
L
D
 
A
L
 
K
M
 
T
K
 
K
E
 
P
S
 
G
A
 
V
I
 
I
I
 
I
V
 
V
N
 
N
T
 
A
A
 
A
R
|
R
S
 
G
G
 
G
L
 
L
I
 
V
N
 
D
E
 
E
A
 
A
D
 
A
L
 
L
I
 
A
A
 
D
A
 
A
L
 
I
R
 
T
A
 
G
G
 
G
K
 
H
I
 
V
M
 
R
G
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
T
 
V
F
 
F
D
 
A
D
 
T
E
|
E
P
 
P
L
 
C
P
 
-
D
 
T
D
 
D
S
 
S
A
 
P
F
 
L
Y
 
F
S
 
E
L
 
L
N
 
A
N
 
Q
V
 
V
T
 
V
I
 
V
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
L
A
 
G
G
 
A
S
 
S
T
 
T
I
 
A
D
 
E
A
 
A

Sites not aligning to the query:

3ddnB Crystal structure of hydroxypyruvic acid phosphate bound d-3- phosphoglycerate dehydrogenase in mycobacterium tuberculosis (see paper)
40% identity, 76% coverage: 64:314/331 of query aligns to 36:286/525 of 3ddnB

query
sites
3ddnB
L
 
L
L
 
L
Q
 
A
G
 
A
A
 
V
E
 
P
E
 
E
T
 
A
E
 
D
I
 
A
L
 
L
I
 
L
V
 
V
Q
 
R
F
 
S
A
 
A
P
 
T
-
 
T
V
 
V
N
 
D
A
 
A
A
 
E
V
 
V
F
 
L
D
 
A
K
 
A
L
 
A
P
 
P
K
 
K
L
 
L
K
 
K
Y
 
I
V
 
V
G
 
A
V
x
R
L
 
A
R
 
G
G
x
V
G
 
G
I
 
L
E
 
D
N
 
N
V
 
V
N
 
D
Q
 
V
A
 
D
E
 
A
A
 
A
K
 
T
A
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
V
E
 
L
V
 
V
M
 
V
N
 
N
T
 
A
P
 
P
G
 
T
R
 
S
N
|
N
A
 
I
R
 
H
S
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
F
 
H
T
 
A
V
 
L
G
 
A
M
 
L
I
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
A
M
 
S
R
 
R
N
 
Q
I
 
I
A
 
P
R
 
A
S
 
A
H
 
D
D
 
A
A
 
S
L
 
L
R
 
R
D
 
E
K
 
H
F
 
T
W
 
W
R
 
K
K
 
R
E
 
S
S
 
S
P
 
F
N
 
S
H
 
G
R
 
T
A
 
-
I
 
-
P
 
-
E
 
E
L
 
I
G
 
F
G
 
G
K
 
K
V
 
T
V
 
V
G
 
G
L
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
G
H
 
R
I
 
I
A
 
G
Q
 
Q
L
 
L
V
 
V
A
 
A
G
 
Q
F
 
R
L
 
I
R
 
A
G
 
A
F
 
F
G
 
G
S
 
A
E
 
Y
I
 
V
I
 
V
F
 
A
Y
 
Y
D
 
D
K
 
P
Y
 
Y
V
 
V
A
 
S
G
 
P
H
 
A
D
 
R
S
 
A
Y
 
A
E
 
Q
-
 
L
-
 
G
-
 
I
K
 
E
V
 
L
D
 
L
S
 
S
L
 
L
D
 
D
E
 
D
L
 
L
V
 
L
R
 
A
R
 
R
A
 
A
D
 
D
V
 
F
I
 
I
S
 
S
L
 
V
H
 
H
A
 
L
R
 
P
L
 
K
T
 
T
A
 
P
E
 
E
T
 
T
E
 
A
N
 
G
L
 
L
I
 
I
N
 
D
A
 
K
H
 
E
H
 
A
F
 
L
D
 
A
L
 
K
M
 
T
K
 
K
E
 
P
S
 
G
A
 
V
I
 
I
I
 
I
V
 
V
N
 
N
T
 
A
A
 
A
R
|
R
S
 
G
G
 
G
L
 
L
I
 
V
N
 
D
E
 
E
A
 
A
D
 
A
L
 
L
I
 
A
A
 
D
A
 
A
L
 
I
R
 
T
A
 
G
G
 
G
K
 
H
I
 
V
M
 
R
G
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
T
 
V
F
 
F
D
 
A
D
 
T
E
|
E
P
 
P
L
 
C
P
 
-
D
 
T
D
 
D
S
 
S
A
 
P
F
 
L
Y
 
F
S
 
E
L
 
L
N
 
A
N
 
Q
V
 
V
T
 
V
I
 
V
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
L
A
 
G
G
x
A
S
 
S
T
 
T
I
 
A
D
 
E
A
 
A

Sites not aligning to the query:

6cwaA Crystal structure phgdh in complex with nadh and 3-phosphoglycerate at 1.77 a resolution (see paper)
36% identity, 83% coverage: 43:318/331 of query aligns to 17:289/299 of 6cwaA

query
sites
6cwaA
L
 
L
Q
 
Q
E
 
D
D
 
G
N
 
G
L
 
L
-
 
Q
L
 
V
V
 
V
E
 
E
Q
 
K
Q
 
Q
G
 
N
S
 
L
E
 
S
A
 
K
L
 
E
A
 
E
L
 
L
P
 
I
A
 
A
A
 
E
L
 
L
L
 
-
Q
 
-
G
 
-
A
 
-
E
 
Q
E
 
D
T
 
C
E
 
E
I
 
G
L
 
L
I
 
I
V
 
V
Q
 
R
F
 
S
A
 
A
P
 
T
-
 
K
V
 
V
N
 
T
A
 
A
A
 
D
V
 
V
F
 
I
D
 
N
K
 
A
L
 
A
P
 
E
K
 
K
L
 
L
K
 
Q
Y
 
V
V
 
V
G
 
G
V
 
R
L
 
A
R
 
G
G
 
T
G
 
G
I
 
V
E
 
D
N
 
N
V
 
V
N
 
D
Q
 
L
A
 
E
E
 
A
A
 
A
K
 
T
A
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
E
 
L
V
 
V
M
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
R
 
G
N
|
N
A
 
S
R
 
L
S
 
S
V
x
A
A
 
A
E
 
E
F
 
L
T
 
T
V
 
C
G
 
G
M
 
M
I
 
I
L
 
M
A
 
C
E
 
L
M
 
A
R
 
R
N
 
Q
I
 
I
A
 
P
R
 
Q
S
 
A
H
 
T
D
 
A
A
 
S
L
 
M
R
 
K
D
 
D
K
 
G
F
 
K
W
 
W
R
 
E
K
 
R
E
 
K
S
 
K
P
 
F
N
 
M
H
 
G
R
 
T
A
 
-
I
 
-
P
 
-
E
 
E
L
 
L
G
 
N
G
 
G
K
 
K
V
 
T
V
 
L
G
 
G
L
 
I
V
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
H
x
R
I
|
I
A
 
G
Q
 
R
L
 
E
V
 
V
A
 
A
G
 
T
F
 
R
L
 
M
R
 
Q
G
 
S
F
 
F
G
 
G
S
 
M
E
 
K
I
 
T
I
 
I
F
 
G
Y
|
Y
D
|
D
K
x
P
Y
x
I
V
 
I
A
 
S
G
 
P
H
 
E
D
 
V
S
 
S
Y
 
A
E
 
S
-
 
F
-
 
G
-
 
V
K
 
Q
V
 
Q
D
 
L
S
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
L
 
I
V
 
W
R
 
P
R
 
L
A
 
C
D
 
D
V
 
F
I
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
A
x
T
R
x
P
L
 
L
T
 
L
A
 
P
E
 
S
T
|
T
E
 
T
N
 
G
L
 
L
I
 
L
N
 
N
A
 
D
H
 
N
H
 
T
F
 
F
D
 
A
L
 
Q
M
 
C
K
 
K
E
 
K
S
 
G
A
 
V
I
 
R
I
 
V
V
 
V
N
 
N
T
x
C
A
|
A
R
|
R
S
 
G
G
 
G
L
 
I
I
 
V
N
 
D
E
 
E
A
 
G
D
 
A
L
 
L
I
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
A
 
S
G
 
G
K
 
Q
I
 
C
M
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
V
F
 
F
D
 
T
D
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
-
P
 
P
D
 
R
D
 
D
S
 
R
A
 
A
F
 
L
Y
 
V
S
 
D
L
 
H
N
 
E
N
 
N
V
 
V
T
 
I
I
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
I
 
L
A
x
G
G
 
A
S
 
S
T
 
T
I
 
K
D
 
E
A
 
A
F
 
Q
S
 
S
N
 
R
S
 
C

6rj5A Crystal structure of phgdh in complex with compound 39 (see paper)
36% identity, 83% coverage: 43:318/331 of query aligns to 18:290/301 of 6rj5A

query
sites
6rj5A
L
 
L
Q
 
Q
E
 
D
D
 
G
N
 
G
L
 
L
-
 
Q
L
 
V
V
 
V
E
 
E
Q
 
K
Q
 
Q
G
 
N
S
 
L
E
 
S
A
 
K
L
 
E
A
 
E
L
 
L
P
 
I
A
 
A
A
 
E
L
 
L
L
 
-
Q
 
-
G
 
-
A
 
-
E
 
Q
E
 
D
T
 
C
E
 
E
I
 
G
L
 
L
I
 
I
V
 
V
Q
 
R
F
 
S
A
 
A
P
 
T
-
 
K
V
 
V
N
 
T
A
 
A
A
 
D
V
 
V
F
 
I
D
 
N
K
 
A
L
 
A
P
 
E
K
 
K
L
 
L
K
 
Q
Y
 
V
V
 
V
G
 
G
V
 
R
L
 
A
R
 
G
G
 
T
G
 
G
I
 
V
E
 
D
N
 
N
V
 
V
N
 
D
Q
 
L
A
 
E
E
 
A
A
 
A
K
 
T
A
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
E
 
L
V
 
V
M
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
R
 
G
N
 
N
A
 
S
R
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
F
 
L
T
 
T
V
 
C
G
 
G
M
 
M
I
 
I
L
 
M
A
 
C
E
 
L
M
 
A
R
 
R
N
 
Q
I
 
I
A
 
P
R
 
Q
S
 
A
H
 
T
D
 
A
A
 
S
L
 
M
R
 
K
D
 
D
K
 
G
F
 
K
W
 
W
R
 
E
K
 
R
E
 
K
S
 
K
P
 
F
N
 
M
H
 
G
R
 
T
A
 
-
I
 
-
P
 
-
E
 
E
L
 
L
G
 
N
G
 
G
K
 
K
V
 
T
V
 
L
G
 
G
L
 
I
V
x
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
H
 
R
I
 
I
A
 
G
Q
 
R
L
 
E
V
 
V
A
 
A
G
 
T
F
 
R
L
 
M
R
 
Q
G
 
S
F
 
F
G
 
G
S
 
M
E
 
K
I
 
T
I
 
I
F
 
G
Y
|
Y
D
|
D
K
x
P
Y
 
I
V
x
I
A
 
S
G
 
P
H
 
E
D
 
V
S
 
S
Y
 
A
E
 
S
-
 
F
-
 
G
-
 
V
K
 
Q
V
 
Q
D
 
L
S
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
L
 
I
V
 
W
R
 
P
R
 
L
A
 
C
D
 
D
V
 
F
I
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
A
x
T
R
x
P
L
 
L
T
 
L
A
 
P
E
 
S
T
 
T
E
 
T
N
 
G
L
|
L
I
 
L
N
 
N
A
 
D
H
 
N
H
 
T
F
 
F
D
 
A
L
 
Q
M
 
C
K
 
K
E
 
K
S
 
G
A
 
V
I
 
R
I
 
V
V
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
S
 
G
G
 
G
L
 
I
I
 
V
N
 
D
E
 
E
A
 
G
D
 
A
L
 
L
I
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
A
 
S
G
 
G
K
 
Q
I
 
C
M
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
V
F
 
F
D
 
T
D
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
-
P
 
P
D
 
R
D
 
D
S
 
R
A
 
A
F
 
L
Y
 
V
S
 
D
L
 
H
N
 
E
N
 
N
V
 
V
T
 
I
I
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
I
 
L
A
 
G
G
 
A
S
 
S
T
 
T
I
 
K
D
 
E
A
 
A
F
 
Q
S
 
S
N
 
R
S
 
C

6rj3A Crystal structure of phgdh in complex with compound 15 (see paper)
36% identity, 83% coverage: 43:318/331 of query aligns to 17:289/297 of 6rj3A

query
sites
6rj3A
L
 
L
Q
 
Q
E
 
D
D
 
G
N
 
G
L
 
L
-
 
Q
L
 
V
V
 
V
E
 
E
Q
 
K
Q
 
Q
G
 
N
S
 
L
E
 
S
A
 
K
L
 
E
A
 
E
L
 
L
P
 
I
A
 
A
A
 
E
L
 
L
L
 
-
Q
 
-
G
 
-
A
 
-
E
 
Q
E
 
D
T
 
C
E
 
E
I
 
G
L
 
L
I
 
I
V
 
V
Q
 
R
F
 
S
A
 
A
P
 
T
-
 
K
V
 
V
N
 
T
A
 
A
A
 
D
V
 
V
F
 
I
D
 
N
K
 
A
L
 
A
P
 
E
K
 
K
L
 
L
K
 
Q
Y
 
V
V
 
V
G
 
G
V
 
R
L
 
A
R
 
G
G
 
T
G
 
G
I
 
V
E
 
D
N
 
N
V
 
V
N
 
D
Q
 
L
A
 
E
E
 
A
A
 
A
K
 
T
A
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
E
 
L
V
 
V
M
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
R
 
G
N
 
N
A
 
S
R
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
F
 
L
T
 
T
V
 
C
G
 
G
M
 
M
I
 
I
L
 
M
A
 
C
E
 
L
M
 
A
R
 
R
N
 
Q
I
 
I
A
 
P
R
 
Q
S
 
A
H
 
T
D
 
A
A
 
S
L
 
M
R
 
K
D
 
D
K
 
G
F
 
K
W
 
W
R
 
E
K
 
R
E
 
K
S
 
K
P
 
F
N
 
M
H
 
G
R
 
T
A
 
-
I
 
-
P
 
-
E
 
E
L
 
L
G
 
N
G
 
G
K
 
K
V
 
T
V
 
L
G
 
G
L
 
I
V
x
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
H
 
R
I
 
I
A
 
G
Q
 
R
L
 
E
V
 
V
A
 
A
G
 
T
F
 
R
L
 
M
R
 
Q
G
 
S
F
 
F
G
 
G
S
 
M
E
 
K
I
 
T
I
 
I
F
 
G
Y
|
Y
D
|
D
K
x
P
Y
x
I
V
x
I
A
 
S
G
 
P
H
 
E
D
 
V
S
 
S
Y
 
A
E
 
S
-
 
F
-
 
G
-
 
V
K
 
Q
V
 
Q
D
 
L
S
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
L
 
I
V
 
W
R
 
P
R
 
L
A
 
C
D
 
D
V
 
F
I
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
A
x
T
R
x
P
L
 
L
T
 
L
A
 
P
E
 
S
T
 
T
E
 
T
N
 
G
L
|
L
I
 
L
N
 
N
A
 
D
H
 
N
H
 
T
F
 
F
D
 
A
L
 
Q
M
 
C
K
 
K
E
 
K
S
 
G
A
 
V
I
 
R
I
 
V
V
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
S
 
G
G
 
G
L
 
I
I
 
V
N
 
D
E
 
E
A
 
G
D
 
A
L
 
L
I
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
A
 
S
G
 
G
K
 
Q
I
 
C
M
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
V
F
 
F
D
 
T
D
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
-
P
 
P
D
 
R
D
 
D
S
 
R
A
 
A
F
 
L
Y
 
V
S
 
D
L
 
H
N
 
E
N
 
N
V
 
V
T
 
I
I
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
I
 
L
A
 
G
G
 
A
S
 
S
T
 
T
I
 
K
D
 
E
A
 
A
F
 
Q
S
 
S
N
 
R
S
 
C

7ewhA Crystal structure of human phgdh in complex with homoharringtonine (see paper)
36% identity, 83% coverage: 43:318/331 of query aligns to 18:290/302 of 7ewhA

query
sites
7ewhA
L
 
L
Q
 
Q
E
 
D
D
 
G
N
 
G
L
 
L
-
 
Q
L
 
V
V
 
V
E
 
E
Q
 
K
Q
 
Q
G
 
N
S
 
L
E
 
S
A
 
K
L
 
E
A
 
E
L
 
L
P
 
I
A
 
A
A
 
E
L
 
L
L
 
-
Q
 
-
G
 
-
A
 
-
E
 
Q
E
 
D
T
 
C
E
 
E
I
 
G
L
 
L
I
 
I
V
 
V
Q
 
R
F
 
S
A
 
A
P
 
T
-
 
K
V
 
V
N
 
T
A
 
A
A
 
D
V
 
V
F
 
I
D
 
N
K
 
A
L
 
A
P
 
E
K
 
K
L
 
L
K
 
Q
Y
 
V
V
 
V
G
 
G
V
 
R
L
 
A
R
 
G
G
 
T
G
 
G
I
 
V
E
 
D
N
 
N
V
 
V
N
 
D
Q
 
L
A
 
E
E
 
A
A
 
A
K
 
T
A
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
E
 
L
V
 
V
M
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
R
 
G
N
 
N
A
 
S
R
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
F
 
L
T
 
T
V
 
C
G
 
G
M
 
M
I
 
I
L
 
M
A
 
C
E
 
L
M
 
A
R
 
R
N
 
Q
I
 
I
A
 
P
R
 
Q
S
 
A
H
 
T
D
 
A
A
 
S
L
 
M
R
 
K
D
 
D
K
 
G
F
 
K
W
 
W
R
 
E
K
 
R
E
 
K
S
 
K
P
 
F
N
 
M
H
 
G
R
 
T
A
 
-
I
 
-
P
 
-
E
 
E
L
 
L
G
 
N
G
 
G
K
 
K
V
 
T
V
 
L
G
 
G
L
 
I
V
x
L
G
|
G
L
|
L
G
|
G
H
x
R
I
|
I
A
x
G
Q
 
R
L
 
E
V
 
V
A
 
A
G
 
T
F
 
R
L
 
M
R
 
Q
G
 
S
F
 
F
G
 
G
S
 
M
E
 
K
I
 
T
I
 
I
F
 
G
Y
 
Y
D
|
D
K
 
P
Y
 
I
V
 
I
A
 
S
G
 
P
H
 
E
D
 
V
S
 
S
Y
 
A
E
 
S
-
 
F
-
 
G
-
 
V
K
 
Q
V
 
Q
D
 
L
S
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
L
 
I
V
 
W
R
 
P
R
 
L
A
 
C
D
 
D
V
 
F
I
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
A
x
T
R
x
P
L
 
L
T
 
L
A
 
P
E
 
S
T
 
T
E
 
T
N
 
G
L
 
L
I
 
L
N
 
N
A
 
D
H
 
N
H
 
T
F
 
F
D
 
A
L
 
Q
M
 
C
K
 
K
E
 
K
S
 
G
A
 
V
I
 
R
I
 
V
V
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
S
 
G
G
 
G
L
 
I
I
 
V
N
 
D
E
 
E
A
 
G
D
 
A
L
 
L
I
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
A
 
S
G
 
G
K
 
Q
I
 
C
M
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
V
F
 
F
D
 
T
D
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
-
P
 
P
D
 
R
D
 
D
S
 
R
A
 
A
F
 
L
Y
 
V
S
 
D
L
 
H
N
 
E
N
 
N
V
 
V
T
 
I
I
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
I
 
L
A
 
G
G
 
A
S
 
S
T
 
T
I
 
K
D
 
E
A
 
A
F
 
Q
S
 
S
N
 
R
S
 
C

6rj2A Crystal structure of phgdh in complex with compound 40 (see paper)
36% identity, 83% coverage: 43:318/331 of query aligns to 15:287/299 of 6rj2A

query
sites
6rj2A
L
 
L
Q
 
Q
E
 
D
D
 
G
N
 
G
L
 
L
-
 
Q
L
 
V
V
 
V
E
 
E
Q
 
K
Q
 
Q
G
 
N
S
 
L
E
 
S
A
 
K
L
 
E
A
 
E
L
 
L
P
 
I
A
 
A
A
 
E
L
 
L
L
 
-
Q
 
-
G
 
-
A
 
-
E
 
Q
E
 
D
T
 
C
E
 
E
I
 
G
L
 
L
I
 
I
V
 
V
Q
 
R
F
 
S
A
 
A
P
 
T
-
 
K
V
 
V
N
 
T
A
 
A
A
 
D
V
 
V
F
 
I
D
 
N
K
 
A
L
 
A
P
 
E
K
 
K
L
 
L
K
 
Q
Y
 
V
V
 
V
G
 
G
V
 
R
L
 
A
R
 
G
G
 
T
G
 
G
I
 
V
E
 
D
N
 
N
V
 
V
N
 
D
Q
 
L
A
 
E
E
 
A
A
 
A
K
 
T
A
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
E
 
L
V
 
V
M
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
R
 
G
N
 
N
A
 
S
R
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
F
 
L
T
 
T
V
 
C
G
 
G
M
 
M
I
 
I
L
 
M
A
 
C
E
 
L
M
 
A
R
 
R
N
 
Q
I
 
I
A
 
P
R
 
Q
S
 
A
H
 
T
D
 
A
A
 
S
L
 
M
R
 
K
D
 
D
K
 
G
F
 
K
W
 
W
R
 
E
K
 
R
E
 
K
S
 
K
P
 
F
N
 
M
H
 
G
R
 
T
A
 
-
I
 
-
P
 
-
E
 
E
L
 
L
G
 
N
G
 
G
K
 
K
V
 
T
V
 
L
G
 
G
L
 
I
V
 
L
G
 
G
L
 
L
G
|
G
H
 
R
I
|
I
A
 
G
Q
 
R
L
 
E
V
 
V
A
 
A
G
 
T
F
 
R
L
 
M
R
 
Q
G
 
S
F
 
F
G
 
G
S
 
M
E
 
K
I
 
T
I
 
I
F
 
G
Y
|
Y
D
|
D
K
x
P
Y
x
I
V
x
I
A
 
S
G
 
P
H
 
E
D
 
V
S
 
S
Y
 
A
E
 
S
-
 
F
-
 
G
-
 
V
K
 
Q
V
 
Q
D
 
L
S
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
L
 
I
V
 
W
R
 
P
R
 
L
A
 
C
D
 
D
V
 
F
I
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
A
x
T
R
 
P
L
 
L
T
 
L
A
 
P
E
 
S
T
 
T
E
 
T
N
 
G
L
|
L
I
 
L
N
 
N
A
 
D
H
 
N
H
 
T
F
 
F
D
 
A
L
 
Q
M
 
C
K
 
K
E
 
K
S
 
G
A
 
V
I
 
R
I
 
V
V
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
|
R
S
 
G
G
 
G
L
 
I
I
 
V
N
 
D
E
 
E
A
 
G
D
 
A
L
 
L
I
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
A
 
S
G
 
G
K
 
Q
I
 
C
M
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
V
F
 
F
D
 
T
D
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
-
P
 
P
D
 
R
D
 
D
S
 
R
A
 
A
F
 
L
Y
 
V
S
 
D
L
 
H
N
 
E
N
 
N
V
 
V
T
 
I
I
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
I
 
L
A
 
G
G
 
A
S
 
S
T
 
T
I
 
K
D
 
E
A
 
A
F
 
Q
S
 
S
N
 
R
S
 
C

6rihA Crystal structure of phgdh in complex with compound 9 (see paper)
36% identity, 83% coverage: 43:318/331 of query aligns to 18:290/302 of 6rihA

query
sites
6rihA
L
 
L
Q
 
Q
E
 
D
D
 
G
N
 
G
L
 
L
-
 
Q
L
 
V
V
 
V
E
 
E
Q
 
K
Q
 
Q
G
 
N
S
 
L
E
 
S
A
 
K
L
 
E
A
 
E
L
 
L
P
 
I
A
 
A
A
 
E
L
 
L
L
 
-
Q
 
-
G
 
-
A
 
-
E
 
Q
E
 
D
T
 
C
E
 
E
I
 
G
L
 
L
I
 
I
V
 
V
Q
 
R
F
 
S
A
 
A
P
 
T
-
 
K
V
 
V
N
 
T
A
 
A
A
 
D
V
 
V
F
 
I
D
 
N
K
 
A
L
 
A
P
 
E
K
 
K
L
 
L
K
 
Q
Y
 
V
V
 
V
G
 
G
V
 
R
L
 
A
R
 
G
G
 
T
G
 
G
I
 
V
E
 
D
N
 
N
V
 
V
N
 
D
Q
 
L
A
 
E
E
 
A
A
 
A
K
 
T
A
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
E
 
L
V
 
V
M
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
R
 
G
N
 
N
A
 
S
R
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
F
 
L
T
 
T
V
 
C
G
 
G
M
 
M
I
 
I
L
 
M
A
 
C
E
 
L
M
 
A
R
 
R
N
 
Q
I
 
I
A
 
P
R
 
Q
S
 
A
H
 
T
D
 
A
A
 
S
L
 
M
R
 
K
D
 
D
K
 
G
F
 
K
W
 
W
R
 
E
K
 
R
E
 
K
S
 
K
P
 
F
N
 
M
H
 
G
R
 
T
A
 
-
I
 
-
P
 
-
E
 
E
L
 
L
G
 
N
G
 
G
K
 
K
V
 
T
V
 
L
G
 
G
L
 
I
V
 
L
G
 
G
L
 
L
G
|
G
H
 
R
I
 
I
A
 
G
Q
 
R
L
 
E
V
 
V
A
 
A
G
 
T
F
 
R
L
 
M
R
 
Q
G
 
S
F
 
F
G
 
G
S
 
M
E
 
K
I
 
T
I
 
I
F
 
G
Y
|
Y
D
|
D
K
x
P
Y
x
I
V
x
I
A
 
S
G
 
P
H
 
E
D
 
V
S
 
S
Y
 
A
E
 
S
-
 
F
-
 
G
-
 
V
K
 
Q
V
 
Q
D
 
L
S
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
L
 
I
V
 
W
R
 
P
R
 
L
A
 
C
D
 
D
V
 
F
I
 
I
S
 
T
L
 
V
H
 
H
A
x
T
R
x
P
L
 
L
T
 
L
A
 
P
E
 
S
T
 
T
E
 
T
N
 
G
L
|
L
I
 
L
N
 
N
A
 
D
H
 
N
H
 
T
F
 
F
D
 
A
L
 
Q
M
 
C
K
 
K
E
 
K
S
 
G
A
 
V
I
 
R
I
 
V
V
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
S
 
G
G
 
G
L
 
I
I
 
V
N
 
D
E
 
E
A
 
G
D
 
A
L
 
L
I
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
A
 
S
G
 
G
K
 
Q
I
 
C
M
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
V
F
 
F
D
 
T
D
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
-
P
 
P
D
 
R
D
 
D
S
 
R
A
 
A
F
 
L
Y
 
V
S
 
D
L
 
H
N
 
E
N
 
N
V
 
V
T
 
I
I
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
I
 
L
A
 
G
G
 
A
S
 
S
T
 
T
I
 
K
D
 
E
A
 
A
F
 
Q
S
 
S
N
 
R
S
 
C

7dkmA Phgdh covalently linked to oridonin (see paper)
36% identity, 83% coverage: 43:318/331 of query aligns to 19:291/306 of 7dkmA

query
sites
7dkmA
L
 
L
Q
 
Q
E
 
D
D
 
G
N
 
G
L
 
L
-
 
Q
L
 
V
V
 
V
E
 
E
Q
 
K
Q
 
Q
G
 
N
S
 
L
E
 
S
A
 
K
L
 
E
A
 
E
L
 
L
P
 
I
A
 
A
A
 
E
L
 
L
L
 
-
Q
 
-
G
 
-
A
 
-
E
 
Q
E
 
D
T
 
C
E
 
E
I
 
G
L
 
L
I
 
I
V
 
V
Q
 
R
F
 
S
A
 
A
P
 
T
-
 
K
V
 
V
N
 
T
A
 
A
A
 
D
V
 
V
F
 
I
D
 
N
K
 
A
L
 
A
P
 
E
K
 
K
L
 
L
K
 
Q
Y
 
V
V
 
V
G
 
G
V
 
R
L
 
A
R
 
G
G
x
T
G
 
G
I
 
V
E
 
D
N
 
N
V
 
V
N
 
D
Q
 
L
A
 
E
E
 
A
A
 
A
K
 
T
A
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
E
 
L
V
 
V
M
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
R
 
G
N
 
N
A
 
S
R
 
L
S
 
S
V
x
A
A
 
A
E
 
E
F
 
L
T
 
T
V
 
C
G
 
G
M
 
M
I
 
I
L
 
M
A
 
C
E
 
L
M
 
A
R
 
R
N
 
Q
I
 
I
A
 
P
R
 
Q
S
 
A
H
 
T
D
 
A
A
 
S
L
 
M
R
 
K
D
 
D
K
 
G
F
 
K
W
 
W
R
 
E
K
 
R
E
 
K
S
 
K
P
 
F
N
 
M
H
 
G
R
 
T
A
 
-
I
 
-
P
 
-
E
 
E
L
 
L
G
 
N
G
 
G
K
 
K
V
 
T
V
 
L
G
 
G
L
 
I
V
 
L
G
|
G
L
 
L
G
 
G
H
x
R
I
|
I
A
 
G
Q
 
R
L
 
E
V
 
V
A
 
A
G
 
T
F
 
R
L
 
M
R
 
Q
G
 
S
F
 
F
G
 
G
S
 
M
E
 
K
I
 
T
I
 
I
F
 
G
Y
|
Y
D
|
D
K
x
P
Y
x
I
V
 
I
A
 
S
G
 
P
H
 
E
D
 
V
S
 
S
Y
 
A
E
 
S
-
 
F
-
 
G
-
 
V
K
 
Q
V
 
Q
D
 
L
S
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
L
 
I
V
 
W
R
 
P
R
 
L
A
 
C
D
 
D
V
 
F
I
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
A
x
T
R
x
P
L
 
L
T
 
L
A
 
P
E
 
S
T
|
T
E
 
T
N
 
G
L
 
L
I
 
L
N
 
N
A
 
D
H
 
N
H
 
T
F
 
F
D
 
A
L
 
Q
M
 
C
K
 
K
E
 
K
S
 
G
A
 
V
I
 
R
I
 
V
V
 
V
N
 
N
T
x
C
A
|
A
R
|
R
S
 
G
G
 
G
L
 
I
I
 
V
N
 
D
E
 
E
A
 
G
D
 
A
L
 
L
I
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
A
 
S
G
 
G
K
 
Q
I
 
C
M
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
V
F
 
F
D
 
T
D
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
-
P
 
P
D
 
R
D
 
D
S
 
R
A
 
A
F
 
L
Y
 
V
S
 
D
L
 
H
N
 
E
N
 
N
V
 
V
T
 
I
I
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
I
 
L
A
x
G
G
 
A
S
 
S
T
 
T
I
 
K
D
 
E
A
 
A
F
 
Q
S
 
S
N
 
R
S
 
C

Sites not aligning to the query:

6plgA Crystal structure of human phgdh complexed with compound 15 (see paper)
36% identity, 83% coverage: 43:318/331 of query aligns to 18:290/303 of 6plgA

query
sites
6plgA
L
 
L
Q
 
Q
E
 
D
D
 
G
N
 
G
L
 
L
-
 
Q
L
 
V
V
 
V
E
 
E
Q
 
K
Q
 
Q
G
 
N
S
 
L
E
 
S
A
 
K
L
 
E
A
 
E
L
 
L
P
 
I
A
 
A
A
 
E
L
 
L
L
 
-
Q
 
-
G
 
-
A
 
-
E
 
Q
E
 
D
T
 
C
E
 
E
I
 
G
L
 
L
I
 
I
V
 
V
Q
 
R
F
 
S
A
 
A
P
 
T
-
 
K
V
 
V
N
 
T
A
 
A
A
 
D
V
 
V
F
 
I
D
 
N
K
 
A
L
 
A
P
 
E
K
 
K
L
 
L
K
 
Q
Y
 
V
V
 
V
G
 
G
V
 
R
L
 
A
R
 
G
G
 
T
G
 
G
I
 
V
E
 
D
N
 
N
V
 
V
N
 
D
Q
 
L
A
 
E
E
 
A
A
 
A
K
 
T
A
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
E
 
L
V
 
V
M
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
R
 
G
N
 
N
A
 
S
R
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
F
 
L
T
 
T
V
 
C
G
 
G
M
 
M
I
 
I
L
 
M
A
 
C
E
 
L
M
 
A
R
 
R
N
 
Q
I
 
I
A
 
P
R
 
Q
S
 
A
H
 
T
D
 
A
A
 
S
L
 
M
R
 
K
D
 
D
K
 
G
F
 
K
W
 
W
R
 
E
K
 
R
E
 
K
S
 
K
P
 
F
N
 
M
H
 
G
R
 
T
A
 
-
I
 
-
P
 
-
E
 
E
L
 
L
G
 
N
G
 
G
K
 
K
V
 
T
V
 
L
G
 
G
L
 
I
V
 
L
G
 
G
L
 
L
G
|
G
H
x
R
I
 
I
A
 
G
Q
 
R
L
 
E
V
 
V
A
 
A
G
 
T
F
 
R
L
 
M
R
 
Q
G
 
S
F
 
F
G
 
G
S
 
M
E
 
K
I
 
T
I
 
I
F
 
G
Y
 
Y
D
|
D
K
x
P
Y
x
I
V
x
I
A
 
S
G
 
P
H
 
E
D
 
V
S
 
S
Y
 
A
E
 
S
-
 
F
-
 
G
-
 
V
K
 
Q
V
 
Q
D
 
L
S
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
L
 
I
V
 
W
R
 
P
R
 
L
A
 
C
D
 
D
V
 
F
I
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
A
x
T
R
 
P
L
 
L
T
x
L
A
 
P
E
 
S
T
 
T
E
 
T
N
 
G
L
 
L
I
 
L
N
 
N
A
 
D
H
 
N
H
 
T
F
 
F
D
 
A
L
 
Q
M
 
C
K
 
K
E
 
K
S
 
G
A
 
V
I
 
R
I
 
V
V
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
S
 
G
G
 
G
L
 
I
I
 
V
N
 
D
E
 
E
A
 
G
D
 
A
L
 
L
I
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
A
 
S
G
 
G
K
 
Q
I
 
C
M
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
V
F
 
F
D
 
T
D
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
-
P
 
P
D
 
R
D
 
D
S
 
R
A
 
A
F
 
L
Y
 
V
S
 
D
L
 
H
N
 
E
N
 
N
V
 
V
T
 
I
I
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
I
 
L
A
 
G
G
 
A
S
 
S
T
 
T
I
 
K
D
 
E
A
 
A
F
 
Q
S
 
S
N
 
R
S
 
C

6plfA Crystal structure of human phgdh complexed with compound 1 (see paper)
36% identity, 83% coverage: 43:318/331 of query aligns to 19:291/305 of 6plfA

query
sites
6plfA
L
 
L
Q
 
Q
E
 
D
D
 
G
N
 
G
L
 
L
-
 
Q
L
 
V
V
 
V
E
 
E
Q
 
K
Q
 
Q
G
 
N
S
 
L
E
 
S
A
 
K
L
 
E
A
 
E
L
 
L
P
 
I
A
 
A
A
 
E
L
 
L
L
 
-
Q
 
-
G
 
-
A
 
-
E
 
Q
E
 
D
T
 
C
E
 
E
I
 
G
L
 
L
I
 
I
V
 
V
Q
 
R
F
 
S
A
 
A
P
 
T
-
 
K
V
 
V
N
 
T
A
 
A
A
 
D
V
 
V
F
 
I
D
 
N
K
 
A
L
 
A
P
 
E
K
 
K
L
 
L
K
 
Q
Y
 
V
V
 
V
G
 
G
V
 
R
L
 
A
R
 
G
G
 
T
G
 
G
I
 
V
E
 
D
N
 
N
V
 
V
N
 
D
Q
 
L
A
 
E
E
 
A
A
 
A
K
 
T
A
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
E
 
L
V
 
V
M
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
R
 
G
N
 
N
A
 
S
R
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
F
 
L
T
 
T
V
 
C
G
 
G
M
 
M
I
 
I
L
 
M
A
 
C
E
 
L
M
 
A
R
 
R
N
 
Q
I
 
I
A
 
P
R
 
Q
S
 
A
H
 
T
D
 
A
A
 
S
L
 
M
R
 
K
D
 
D
K
 
G
F
 
K
W
 
W
R
 
E
K
 
R
E
 
K
S
 
K
P
 
F
N
 
M
H
 
G
R
 
T
A
 
-
I
 
-
P
 
-
E
 
E
L
 
L
G
 
N
G
 
G
K
 
K
V
 
T
V
 
L
G
 
G
L
 
I
V
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
H
 
R
I
 
I
A
 
G
Q
 
R
L
 
E
V
 
V
A
 
A
G
 
T
F
 
R
L
 
M
R
 
Q
G
 
S
F
 
F
G
 
G
S
 
M
E
 
K
I
 
T
I
 
I
F
 
G
Y
|
Y
D
|
D
K
x
P
Y
 
I
V
 
I
A
 
S
G
 
P
H
 
E
D
 
V
S
 
S
Y
 
A
E
 
S
-
 
F
-
 
G
-
 
V
K
 
Q
V
 
Q
D
 
L
S
 
P
L
|
L
D
 
E
E
 
E
L
 
I
V
 
W
R
 
P
R
 
L
A
 
C
D
 
D
V
 
F
I
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
A
x
T
R
x
P
L
 
L
T
 
L
A
 
P
E
 
S
T
 
T
E
 
T
N
 
G
L
|
L
I
 
L
N
 
N
A
 
D
H
 
N
H
 
T
F
 
F
D
 
A
L
 
Q
M
 
C
K
 
K
E
 
K
S
 
G
A
 
V
I
 
R
I
 
V
V
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
S
 
G
G
 
G
L
 
I
I
 
V
N
 
D
E
 
E
A
 
G
D
 
A
L
 
L
I
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
A
 
S
G
 
G
K
 
Q
I
 
C
M
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
V
F
 
F
D
 
T
D
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
-
P
 
P
D
 
R
D
 
D
S
 
R
A
 
A
F
 
L
Y
 
V
S
 
D
L
 
H
N
 
E
N
 
N
V
 
V
T
 
I
I
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
I
 
L
A
 
G
G
 
A
S
 
S
T
 
T
I
 
K
D
 
E
A
 
A
F
 
Q
S
 
S
N
 
R
S
 
C

O43175 D-3-phosphoglycerate dehydrogenase; 3-PGDH; 2-oxoglutarate reductase; Malate dehydrogenase; EC 1.1.1.95; EC 1.1.1.399; EC 1.1.1.37 from Homo sapiens (Human) (see 3 papers)
36% identity, 76% coverage: 69:318/331 of query aligns to 46:295/533 of O43175

query
sites
O43175
E
 
Q
E
 
D
T
 
C
E
 
E
I
 
G
L
 
L
I
 
I
V
 
V
Q
 
R
F
 
S
A
 
A
P
 
T
-
 
K
V
 
V
N
 
T
A
 
A
A
 
D
V
 
V
F
 
I
D
 
N
K
 
A
L
 
A
P
 
E
K
 
K
L
 
L
K
 
Q
Y
 
V
V
 
V
G
 
G
V
 
R
L
 
A
R
 
G
G
x
T
G
 
G
I
 
V
E
 
D
N
 
N
V
 
V
N
 
D
Q
 
L
A
 
E
E
 
A
A
 
A
K
 
T
A
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
E
 
L
V
 
V
M
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
R
 
G
N
 
N
A
 
S
R
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
F
 
L
T
 
T
V
 
C
G
 
G
M
 
M
I
 
I
L
 
M
A
 
C
E
 
L
M
 
A
R
 
R
N
 
Q
I
 
I
A
 
P
R
 
Q
S
 
A
H
 
T
D
 
A
A
 
S
L
 
M
R
 
K
D
 
D
K
 
G
F
 
K
W
 
W
R
 
E
K
x
R
E
 
K
S
 
K
P
 
F
N
 
M
H
 
G
R
 
T
A
 
-
I
 
-
P
 
-
E
 
E
L
 
L
G
 
N
G
 
G
K
 
K
V
 
T
V
 
L
G
 
G
L
 
I
V
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
H
x
R
I
|
I
A
 
G
Q
 
R
L
 
E
V
 
V
A
 
A
G
 
T
F
 
R
L
 
M
R
 
Q
G
 
S
F
 
F
G
 
G
S
 
M
E
 
K
I
 
T
I
 
I
F
 
G
Y
 
Y
D
|
D
K
 
P
Y
 
I
V
 
I
A
 
S
G
 
P
H
 
E
D
 
V
S
 
S
Y
 
A
E
 
S
-
 
F
-
 
G
-
 
V
K
 
Q
V
 
Q
D
 
L
S
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
L
 
I
V
 
W
R
 
P
R
 
L
A
 
C
D
 
D
V
 
F
I
 
I
S
 
T
L
 
V
H
 
H
A
x
T
R
 
P
L
 
L
T
 
L
A
 
P
E
 
S
T
 
T
E
 
T
N
 
G
L
 
L
I
 
L
N
 
N
A
 
D
H
 
N
H
 
T
F
 
F
D
 
A
L
 
Q
M
 
C
K
 
K
E
 
K
S
 
G
A
 
V
I
 
R
I
 
V
V
 
V
N
 
N
T
x
C
A
|
A
R
|
R
S
 
G
G
 
G
L
 
I
I
 
V
N
 
D
E
 
E
A
 
G
D
 
A
L
 
L
I
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
A
 
S
G
 
G
K
 
Q
I
 
C
M
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
|
D
T
x
V
F
 
F
D
 
T
D
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
-
P
 
P
D
 
R
D
 
D
S
 
R
A
 
A
F
 
L
Y
 
V
S
 
D
L
 
H
N
 
E
N
 
N
V
 
V
T
 
I
I
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
I
x
L
A
x
G
G
x
A
S
 
S
T
 
T
I
 
K
D
 
E
A
 
A
F
 
Q
S
 
S
N
 
R
S
 
C

Sites not aligning to the query:

6plfB Crystal structure of human phgdh complexed with compound 1 (see paper)
36% identity, 76% coverage: 69:318/331 of query aligns to 36:281/292 of 6plfB

query
sites
6plfB
E
 
Q
E
 
D
T
 
C
E
 
E
I
 
G
L
 
L
I
 
I
V
 
V
Q
 
R
F
 
S
A
 
A
P
 
-
V
 
-
N
 
-
A
 
A
A
 
D
V
 
V
F
 
I
D
 
N
K
 
A
L
 
A
P
 
E
K
 
K
L
 
L
K
 
Q
Y
 
V
V
 
V
G
 
G
V
 
R
L
 
A
R
 
G
G
 
T
G
 
G
I
 
V
E
 
D
N
 
N
V
 
V
N
 
D
Q
 
L
A
 
E
E
 
A
A
 
A
K
 
T
A
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
E
 
L
V
 
V
M
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
R
 
G
N
 
N
A
 
S
R
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
F
 
L
T
 
T
V
 
C
G
 
G
M
 
M
I
 
I
L
 
M
A
 
C
E
 
L
M
 
A
R
 
R
N
 
Q
I
 
I
A
 
P
R
 
Q
S
 
A
H
 
T
D
 
A
A
 
S
L
 
M
R
 
K
D
 
D
K
 
G
F
 
K
W
 
W
R
 
E
K
 
R
E
 
K
S
 
K
P
 
F
N
 
M
H
 
G
R
 
T
A
 
-
I
 
-
P
 
-
E
 
E
L
 
L
G
 
N
G
 
G
K
 
K
V
 
T
V
 
L
G
 
G
L
 
I
V
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
H
x
R
I
 
I
A
 
G
Q
 
R
L
 
E
V
 
V
A
 
A
G
 
T
F
 
R
L
 
M
R
 
Q
G
 
S
F
 
F
G
 
G
S
 
M
E
 
K
I
 
T
I
 
I
F
 
G
Y
|
Y
D
|
D
K
x
P
Y
 
I
V
x
I
A
 
S
G
 
P
H
 
E
D
 
V
S
 
S
Y
 
A
E
 
S
-
 
F
-
 
G
-
 
V
K
 
Q
V
 
Q
D
 
L
S
 
P
L
|
L
D
 
E
E
 
E
L
 
I
V
 
W
R
 
P
R
 
L
A
 
C
D
 
D
V
 
F
I
 
I
S
 
T
L
 
V
H
 
H
A
x
T
R
x
P
L
 
L
T
 
L
A
 
P
E
x
S
T
 
T
E
 
T
N
 
G
L
|
L
I
 
L
N
 
N
A
 
D
H
 
N
H
 
T
F
 
F
D
 
A
L
 
Q
M
 
C
K
 
K
E
 
K
S
 
G
A
 
V
I
 
R
I
 
V
V
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
S
 
G
G
 
G
L
 
I
I
 
V
N
 
D
E
 
E
A
 
G
D
 
A
L
 
L
I
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
A
 
S
G
 
G
K
 
Q
I
 
C
M
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
V
F
 
F
D
 
T
D
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
-
P
 
P
D
 
R
D
 
D
S
 
R
A
 
A
F
 
L
Y
 
V
S
 
D
L
 
H
N
 
E
N
 
N
V
 
V
T
 
I
I
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
I
 
L
A
 
G
G
 
A
S
 
S
T
 
T
I
 
K
D
 
E
A
 
A
F
 
Q
S
 
S
N
 
R
S
 
C

5aovA Ternary crystal structure of pyrococcus furiosus glyoxylate hydroxypyruvate reductase in presence of glyoxylate (see paper)
33% identity, 76% coverage: 64:314/331 of query aligns to 39:296/334 of 5aovA

query
sites
5aovA
L
 
L
L
 
L
Q
 
E
G
 
K
A
 
V
E
 
K
E
 
D
T
 
V
E
 
D
I
 
A
L
 
L
I
 
V
V
 
T
Q
x
M
F
x
L
A
 
S
P
 
E
-
 
R
V
 
I
N
 
D
A
 
Q
A
 
E
V
 
V
F
 
F
D
 
E
K
 
N
L
 
A
P
 
P
K
 
R
L
 
L
K
 
R
Y
 
I
V
 
V
G
 
A
V
 
N
L
x
Y
R
x
A
G
x
V
G
|
G
I
 
Y
E
 
D
N
 
N
V
 
I
N
 
D
Q
 
V
A
 
E
E
 
E
A
 
A
K
 
T
A
 
R
R
 
R
G
 
G
I
 
I
E
 
Y
V
 
V
M
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
D
R
 
V
N
x
L
A
 
T
R
 
N
S
 
A
V
x
T
A
 
A
E
 
D
F
 
H
T
 
A
V
 
F
G
 
A
M
 
L
I
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
T
M
 
A
R
 
R
N
 
H
I
 
V
A
 
V
R
 
K
S
 
G
H
 
D
D
 
K
A
 
F
L
 
V
R
 
R
D
 
S
K
 
G
F
 
E
W
 
W
R
 
K
K
 
R
E
 
K
S
 
G
-
 
I
-
 
A
-
 
W
-
 
H
P
 
P
N
 
K
H
 
W
R
 
F
A
 
L
I
 
G
P
 
Y
E
 
E
L
 
L
G
 
Y
G
 
G
K
 
K
V
 
T
V
 
I
G
 
G
L
 
I
V
 
V
G
 
G
L
x
F
G
|
G
H
x
R
I
|
I
A
 
G
Q
 
Q
L
 
A
V
 
I
A
 
A
G
 
R
F
 
R
L
 
A
R
 
K
G
 
G
F
 
F
G
 
N
S
 
M
E
 
R
I
 
I
I
 
L
F
 
Y
Y
 
Y
D
x
S
K
x
R
Y
 
T
V
 
R
A
 
K
G
 
S
H
 
Q
D
 
A
S
 
E
Y
 
K
E
 
E
-
 
L
-
 
G
-
 
A
K
 
E
V
 
Y
D
 
R
S
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
L
 
V
V
 
L
R
 
K
R
 
E
A
 
S
D
 
D
V
 
F
I
 
V
S
 
I
L
 
L
H
x
A
A
x
V
R
x
P
L
 
L
T
 
T
A
 
K
E
 
E
T
|
T
E
 
M
N
 
Y
L
 
M
I
 
I
N
 
N
A
 
E
H
 
E
H
 
R
F
 
L
D
 
K
L
 
L
M
 
M
K
 
K
E
 
P
S
 
T
A
 
A
I
 
I
I
 
L
V
 
V
N
 
N
T
x
I
A
|
A
R
|
R
S
 
G
G
 
K
L
 
V
I
 
V
N
 
D
E
 
T
A
 
K
D
 
A
L
 
L
I
 
I
A
 
K
A
 
A
L
 
L
R
 
K
A
 
E
G
 
G
K
 
W
I
 
I
M
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
T
 
V
F
 
F
D
 
E
D
 
E
E
|
E
P
 
P
L
 
Y
P
 
Y
D
 
N
D
 
E
S
 
E
A
 
L
F
 
F
Y
 
-
S
 
S
L
 
L
N
 
D
N
 
N
V
 
V
T
 
V
I
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
A
x
G
G
 
S
S
 
A
T
 
T
I
 
F
D
 
E
A
 
A

P87228 Putative D-3-phosphoglycerate dehydrogenase; 3-PGDH; 2-oxoglutarate reductase; EC 1.1.1.95; EC 1.1.1.399 from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
30% identity, 95% coverage: 18:330/331 of query aligns to 67:368/466 of P87228

query
sites
P87228
A
 
S
G
 
A
L
 
L
N
 
S
A
 
N
L
 
L
K
 
K
D
 
D
K
 
E
G
 
G
I
 
Y
A
 
Q
V
 
V
E
 
E
V
 
F
R
 
L
E
 
K
W
 
T
S
 
S
H
 
-
E
 
-
S
 
-
I
 
-
E
 
-
K
 
-
L
 
M
Q
x
S
E
 
E
D
 
D
N
 
D
L
 
L
L
 
V
V
 
E
E
 
K
Q
 
I
Q
 
K
G
 
G
S
 
V
E
 
H
A
 
A
L
 
I
A
 
G
L
 
I
P
 
R
A
 
S
A
 
K
L
 
-
L
 
-
Q
 
-
G
 
-
A
 
-
E
 
-
E
 
-
T
 
-
E
 
-
I
 
-
L
 
-
I
 
-
V
 
-
Q
 
-
F
 
-
A
 
T
P
 
R
V
 
L
N
 
T
A
 
R
A
 
R
V
 
V
F
 
L
D
 
E
K
 
A
L
 
A
P
 
D
K
 
S
L
 
L
K
 
I
Y
 
V
V
 
I
G
 
G
V
 
C
L
 
F
R
 
C
G
 
I
G
 
G
I
 
T
E
 
N
N
 
Q
V
 
V
N
 
D
Q
 
L
A
 
D
E
 
F
A
 
A
K
 
A
A
 
E
R
 
R
G
 
G
I
 
I
E
 
A
V
 
V
M
 
F
N
 
N
T
 
S
P
 
P
G
 
Y
R
 
A
N
 
N
A
 
S
R
 
R
S
 
S
V
 
V
A
 
A
E
 
E
F
 
L
T
 
V
V
 
I
G
 
G
M
 
Y
I
 
I
L
 
I
A
 
S
E
 
L
M
 
A
R
 
R
N
 
Q
I
 
V
A
 
G
R
 
D
S
 
R
H
 
S
D
 
L
A
 
E
L
 
L
R
 
H
D
 
R
K
 
G
F
 
E
W
 
W
R
 
N
K
 
K
E
 
V
S
 
S
P
 
-
N
 
-
H
 
-
R
 
S
A
 
G
I
 
C
P
 
W
E
 
E
L
 
I
G
 
R
G
 
G
K
 
K
V
 
T
V
 
L
G
 
G
L
 
I
V
 
I
G
 
G
L
 
Y
G
 
G
H
 
H
I
 
I
A
 
G
Q
 
S
L
 
Q
V
 
L
A
 
S
G
 
V
F
 
L
L
 
A
R
 
E
G
 
A
F
 
M
G
 
G
S
 
L
E
 
H
I
 
V
I
 
V
F
 
Y
Y
 
Y
D
 
D
K
 
I
Y
 
L
-
 
P
V
 
I
A
 
M
G
 
P
H
 
L
D
 
G
S
 
S
Y
 
A
E
 
K
K
 
Q
V
 
L
D
 
S
S
 
S
L
 
L
D
 
P
E
 
E
L
 
L
V
 
L
R
 
H
R
 
R
A
 
A
D
 
D
V
 
F
I
 
V
S
 
S
L
 
L
H
 
H
A
 
V
R
 
P
L
 
A
T
x
S
A
 
P
E
 
E
T
 
T
E
 
K
N
 
N
L
 
M
I
 
I
N
 
S
A
 
S
H
 
K
H
 
E
F
 
F
D
 
A
L
 
A
M
 
M
K
 
K
E
 
E
S
 
G
A
 
S
I
 
Y
I
 
L
V
 
I
N
 
N
T
 
A
A
 
S
R
 
R
S
 
G
G
 
T
L
 
V
I
 
V
N
 
D
E
 
I
A
 
P
D
 
A
L
 
L
I
 
V
A
 
D
A
 
A
L
 
S
R
 
K
A
 
S
G
 
G
K
 
K
I
 
I
M
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
I
D
 
D
T
 
V
F
 
Y
D
 
P
D
 
S
E
 
E
P
 
P
L
 
A
P
 
G
D
 
N
-
 
G
-
 
K
D
 
D
S
 
K
A
 
F
F
 
V
Y
 
D
S
 
S
L
 
L
N
 
N
-
 
S
-
 
W
-
 
T
-
 
S
-
 
E
-
 
L
-
 
T
-
 
H
-
 
C
-
 
K
N
 
N
V
 
I
T
 
I
I
 
L
T
 
T
P
 
P
H
 
H
I
 
I
A
 
G
G
 
G
S
 
S
T
 
T
I
 
E
D
 
E
A
 
A
F
 
Q
S
 
Y
N
 
N
S
 
I
P
 
G
K
 
I
L
 
E
F
 
V
S
 
S
E
 
E
I
 
A
L
 
L
L
 
T
K
 
R
K
 
Y
I
 
I

1dxyA Structure of d-2-hydroxyisocaproate dehydrogenase (see paper)
31% identity, 73% coverage: 76:317/331 of query aligns to 51:306/330 of 1dxyA

query
sites
1dxyA
V
 
L
Q
 
Q
F
 
T
A
 
T
P
 
P
V
 
Y
N
 
A
A
 
A
A
 
G
V
 
V
F
 
F
D
 
E
K
 
K
L
 
M
P
 
H
K
 
A
-
 
Y
-
 
G
L
 
I
K
 
K
Y
 
F
V
 
L
G
 
T
V
 
I
L
 
R
R
 
N
G
x
V
G
 
G
I
 
T
E
 
D
N
 
N
V
 
I
N
 
D
Q
 
M
A
 
T
E
 
A
A
 
M
K
 
K
A
 
Q
R
 
Y
G
 
G
I
 
I
E
 
R
V
 
L
M
 
S
N
 
N
T
 
V
P
 
P
G
 
A
R
x
Y
N
x
S
A
 
P
R
 
A
S
 
A
V
 
I
A
 
A
E
 
E
F
 
F
T
 
A
V
 
L
G
 
T
M
 
D
I
 
T
L
 
L
A
 
Y
E
 
L
M
 
L
R
 
R
N
 
N
I
 
M
A
 
G
R
 
K
S
 
V
H
 
Q
D
 
A
A
 
Q
L
 
L
R
 
Q
D
 
A
K
 
G
F
 
D
W
 
Y
R
 
E
K
 
K
E
 
A
S
 
G
P
 
T
N
 
-
H
 
-
R
 
F
A
 
I
I
 
G
P
 
K
E
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
Q
K
 
Q
V
 
T
V
 
V
G
 
G
L
 
V
V
 
M
G
|
G
L
 
T
G
|
G
H
|
H
I
|
I
A
 
G
Q
 
Q
L
 
V
V
 
A
A
 
I
G
 
K
F
 
L
L
 
F
R
 
K
G
 
G
F
 
F
G
 
G
S
 
A
E
 
K
I
 
V
I
 
I
F
 
A
Y
|
Y
D
|
D
K
x
P
Y
 
Y
V
 
P
-
 
M
-
 
K
A
 
G
G
 
D
H
 
H
D
 
P
S
 
D
Y
 
F
E
 
D
K
 
Y
V
 
V
D
 
-
S
 
S
L
 
L
D
 
E
E
 
D
L
 
L
V
 
F
R
 
K
R
 
Q
A
 
S
D
 
D
V
 
V
I
 
I
S
 
D
L
 
L
H
|
H
A
x
V
R
x
P
L
 
G
T
 
I
A
 
E
E
 
Q
T
x
N
E
 
T
N
 
H
L
 
I
I
 
I
N
 
N
A
 
E
H
 
A
H
 
A
F
 
F
D
 
N
L
 
L
M
 
M
K
 
K
E
 
P
S
 
G
A
 
A
I
 
I
I
 
V
V
 
I
N
 
N
T
|
T
A
|
A
R
|
R
S
 
P
G
 
N
L
 
L
I
 
I
N
 
D
E
 
T
A
 
Q
D
 
A
L
 
M
I
 
L
A
 
S
A
 
N
L
 
L
R
 
K
A
 
S
G
 
G
K
 
K
I
 
L
M
 
A
G
 
G
A
 
V
A
 
G
L
 
I
D
|
D
T
 
T
F
 
Y
D
 
E
D
 
Y
E
|
E
-
 
T
-
 
E
-
 
D
-
 
L
-
 
L
-
 
N
-
 
L
-
 
A
-
 
K
-
 
H
-
 
G
-
 
S
-
 
F
-
 
K
-
 
D
P
 
P
L
 
L
P
 
W
D
 
D
D
 
E
S
 
-
A
 
-
F
 
L
Y
 
L
S
 
G
L
 
M
N
 
P
N
 
N
V
 
V
T
 
V
I
 
L
T
 
S
P
 
P
H
|
H
I
 
I
A
 
A
G
x
Y
S
 
Y
T
 
T
I
 
E
D
 
T
A
 
A
F
 
V
S
 
H
N
 
N

P17584 D-2-hydroxyisocaproate dehydrogenase; D-HICDH; EC 1.1.1.- from Lacticaseibacillus paracasei (Lactobacillus paracasei) (see paper)
31% identity, 73% coverage: 76:317/331 of query aligns to 51:306/333 of P17584

query
sites
P17584
V
 
L
Q
 
Q
F
 
T
A
 
T
P
 
P
V
 
Y
N
 
A
A
 
A
A
 
G
V
 
V
F
 
F
D
 
E
K
 
K
L
 
M
P
 
H
K
 
A
-
 
Y
-
 
G
L
 
I
K
 
K
Y
 
F
V
 
L
G
 
T
V
 
I
L
 
R
R
 
N
G
 
V
G
 
G
I
 
T
E
 
D
N
 
N
V
 
I
N
 
D
Q
 
M
A
 
T
E
 
A
A
 
M
K
 
K
A
 
Q
R
 
Y
G
 
G
I
 
I
E
 
R
V
 
L
M
 
S
N
 
N
T
 
V
P
 
P
G
 
A
R
 
Y
N
 
S
A
 
P
R
 
A
S
 
A
V
 
I
A
 
A
E
 
E
F
 
F
T
 
A
V
 
L
G
 
T
M
 
D
I
 
T
L
 
L
A
 
Y
E
 
L
M
 
L
R
 
R
N
 
N
I
 
M
A
 
G
R
 
K
S
 
V
H
 
Q
D
 
A
A
 
Q
L
 
L
R
 
Q
D
 
A
K
 
G
F
 
D
W
 
Y
R
 
E
K
 
K
E
 
A
S
 
G
P
 
T
N
 
-
H
 
-
R
 
F
A
 
I
I
 
G
P
 
K
E
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
Q
K
 
Q
V
 
T
V
 
V
G
 
G
L
 
V
V
 
M
G
 
G
L
 
T
G
 
G
H
|
H
I
|
I
A
 
G
Q
 
Q
L
 
V
V
 
A
A
 
I
G
 
K
F
 
L
L
 
F
R
 
K
G
 
G
F
 
F
G
 
G
S
 
A
E
 
K
I
 
V
I
 
I
F
 
A
Y
 
Y
D
|
D
K
 
P
Y
 
Y
V
 
P
-
 
M
-
 
K
A
 
G
G
 
D
H
 
H
D
 
P
S
 
D
Y
 
F
E
 
D
K
 
Y
V
 
V
D
 
-
S
 
S
L
 
L
D
 
E
E
 
D
L
 
L
V
 
F
R
 
K
R
 
Q
A
 
S
D
 
D
V
 
V
I
 
I
S
 
D
L
 
L
H
 
H
A
x
V
R
 
P
L
 
G
T
 
I
A
 
E
E
 
Q
T
x
N
E
 
T
N
 
H
L
 
I
I
 
I
N
 
N
A
 
E
H
 
A
H
 
A
F
 
F
D
 
N
L
 
L
M
 
M
K
 
K
E
 
P
S
 
G
A
 
A
I
 
I
I
 
V
V
 
I
N
 
N
T
|
T
A
|
A
R
|
R
S
 
P
G
 
N
L
 
L
I
 
I
N
 
D
E
 
T
A
 
Q
D
 
A
L
 
M
I
 
L
A
 
S
A
 
N
L
 
L
R
 
K
A
 
S
G
 
G
K
 
K
I
 
L
M
 
A
G
 
G
A
 
V
A
 
G
L
 
I
D
|
D
T
 
T
F
 
Y
D
 
E
D
 
Y
E
 
E
-
 
T
-
 
E
-
 
D
-
 
L
-
 
L
-
 
N
-
 
L
-
 
A
-
 
K
-
 
H
-
 
G
-
 
S
-
 
F
-
 
K
-
 
D
P
 
P
L
 
L
P
 
W
D
 
D
D
 
E
S
 
-
A
 
-
F
 
L
Y
 
L
S
 
G
L
 
M
N
 
P
N
 
N
V
 
V
T
 
V
I
 
L
T
 
S
P
 
P
H
 
H
I
 
I
A
 
A
G
 
Y
S
 
Y
T
 
T
I
 
E
D
 
T
A
 
A
F
 
V
S
 
H
N
 
N

6biiA Crystal structure of pyrococcus yayanosii glyoxylate hydroxypyruvate reductase in complex with NADP and malonate (re-refinement of 5aow) (see paper)
32% identity, 80% coverage: 64:327/331 of query aligns to 38:308/332 of 6biiA

query
sites
6biiA
L
 
L
L
 
L
Q
 
E
G
 
K
A
 
V
E
 
K
E
 
D
T
 
V
E
 
D
I
 
A
L
 
L
I
 
V
V
 
T
Q
 
M
F
 
L
A
 
S
-
 
E
P
 
K
V
 
I
N
 
D
A
 
R
A
 
E
V
 
V
F
 
F
D
 
D
K
 
A
L
 
A
P
 
P
K
 
R
L
 
L
K
 
R
Y
 
I
V
 
V
G
 
A
V
 
N
L
 
Y
R
 
A
G
x
V
G
 
G
I
 
Y
E
 
D
N
 
N
V
 
I
N
 
D
Q
 
I
A
 
E
E
 
E
A
 
A
K
 
T
A
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
E
 
Y
V
 
V
M
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
D
R
 
V
N
x
L
A
 
T
R
 
D
S
 
A
V
x
T
A
 
A
E
 
D
F
 
L
T
 
A
V
 
W
G
 
A
M
 
L
I
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
A
M
 
A
R
 
R
N
 
H
I
 
V
A
 
V
R
 
K
S
 
G
H
 
D
D
 
K
A
 
F
L
 
V
R
 
R
D
 
S
K
 
G
F
 
E
W
 
W
R
 
K
K
 
R
E
 
R
S
 
G
-
 
I
-
 
A
-
 
W
-
 
H
P
 
P
N
 
K
H
 
M
R
 
F
A
 
L
I
 
G
P
 
Y
E
 
D
L
 
V
G
 
Y
G
 
G
K
 
K
V
 
T
V
 
I
G
 
G
L
 
I
V
 
V
G
|
G
L
x
F
G
|
G
H
x
R
I
|
I
A
 
G
Q
 
Q
L
 
A
V
 
I
A
 
A
G
 
K
F
 
R
L
 
A
R
 
K
G
 
G
F
 
F
G
 
G
S
 
M
E
 
R
I
 
I
I
 
L
F
 
Y
Y
 
T
D
x
A
K
x
R
Y
x
S
V
 
R
A
x
K
G
 
P
H
 
E
D
 
A
S
 
E
Y
 
K
E
 
E
-
 
L
-
 
G
-
 
A
K
 
E
V
 
F
D
 
K
S
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
L
 
L
V
 
L
R
 
R
R
 
E
A
 
S
D
 
D
V
 
F
I
 
V
S
 
V
L
 
L
H
 
A
A
x
V
R
x
P
L
 
L
T
 
T
A
 
K
E
|
E
T
|
T
E
 
Y
N
 
H
L
 
M
I
 
I
N
 
N
A
 
E
H
 
E
H
 
R
F
 
L
D
 
R
L
 
L
M
 
M
K
 
K
E
 
P
S
 
T
A
 
A
I
 
V
I
 
L
V
 
V
N
 
N
T
x
V
A
|
A
R
|
R
S
 
G
G
 
K
L
 
V
I
 
V
N
 
D
E
 
T
A
 
K
D
 
A
L
 
L
I
 
I
A
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
K
A
 
E
G
 
G
K
 
W
I
 
I
M
 
A
G
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
T
 
V
F
 
F
D
 
E
D
 
E
E
|
E
P
 
P
L
 
Y
P
 
Y
D
 
D
D
 
E
S
 
E
A
 
L
F
 
F
Y
 
-
S
 
A
L
 
L
N
 
D
N
 
N
V
 
V
T
 
V
I
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
A
x
G
G
 
S
S
 
A
T
 
T
I
 
F
D
 
G
A
 
A
F
 
R
S
 
E
N
 
G
S
 
M
P
 
A
K
 
E
L
 
L
F
 
V
S
 
A
E
 
K
I
 
N
L
 
L
L
 
I

7cvpA The crystal structure of human phgdh from biortus.
36% identity, 62% coverage: 114:318/331 of query aligns to 41:244/254 of 7cvpA

query
sites
7cvpA
G
 
G
I
 
T
E
 
L
V
 
V
M
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
R
 
G
N
 
N
A
 
S
R
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
F
 
L
T
 
T
V
 
C
G
 
G
M
 
M
I
 
I
L
 
M
A
 
C
E
 
L
M
 
A
R
 
R
N
 
Q
I
 
I
A
 
P
R
 
Q
S
 
A
H
 
T
D
 
A
A
 
S
L
 
M
R
 
K
D
 
D
K
 
G
F
 
K
W
 
W
R
 
E
K
 
R
E
 
K
S
 
K
P
 
F
N
 
M
H
 
G
R
 
T
A
 
-
I
 
-
P
 
-
E
 
E
L
 
L
G
 
N
G
 
G
K
 
K
V
 
T
V
 
L
G
 
G
L
 
I
V
 
L
G
|
G
L
 
L
G
|
G
H
x
R
I
|
I
A
 
G
Q
 
R
L
 
E
V
 
V
A
 
A
G
 
T
F
 
R
L
 
M
R
 
Q
G
 
S
F
 
F
G
 
G
S
 
M
E
 
K
I
 
T
I
 
I
F
 
G
Y
|
Y
D
|
D
K
x
P
Y
x
I
V
 
I
A
 
S
G
 
P
H
 
E
D
 
V
S
 
S
Y
 
A
E
 
S
-
 
F
-
 
G
-
 
V
K
 
Q
V
 
Q
D
 
L
S
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
L
 
I
V
 
W
R
 
P
R
 
L
A
 
C
D
 
D
V
 
F
I
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
A
x
T
R
x
P
L
 
L
T
 
L
A
 
P
E
 
S
T
|
T
E
 
T
N
 
G
L
 
L
I
 
L
N
 
N
A
 
D
H
 
N
H
 
T
F
 
F
D
 
A
L
 
Q
M
 
C
K
 
K
E
 
K
S
 
G
A
 
V
I
 
R
I
 
V
V
 
V
N
 
N
T
x
C
A
|
A
R
|
R
S
 
G
G
 
G
L
 
I
I
 
V
N
 
D
E
 
E
A
 
G
D
 
A
L
 
L
I
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
A
 
S
G
 
G
K
 
Q
I
 
C
M
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
V
F
 
F
D
 
T
D
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
-
P
 
P
D
 
R
D
 
D
S
 
R
A
 
A
F
 
L
Y
 
V
S
 
D
L
 
H
N
 
E
N
 
N
V
 
V
T
 
I
I
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
I
 
L
A
x
G
G
 
A
S
 
S
T
 
T
I
 
K
D
 
E
A
 
A
F
 
Q
S
 
S
N
 
R
S
 
C

Query Sequence

>BWI76_RS14900 FitnessBrowser__Koxy:BWI76_RS14900
MKCLAIADLFINAAMMDAGLNALKDKGIAVEVREWSHESIEKLQEDNLLVEQQGSEALAL
PAALLQGAEETEILIVQFAPVNAAVFDKLPKLKYVGVLRGGIENVNQAEAKARGIEVMNT
PGRNARSVAEFTVGMILAEMRNIARSHDALRDKFWRKESPNHRAIPELGGKVVGLVGLGH
IAQLVAGFLRGFGSEIIFYDKYVAGHDSYEKVDSLDELVRRADVISLHARLTAETENLIN
AHHFDLMKESAIIVNTARSGLINEADLIAALRAGKIMGAALDTFDDEPLPDDSAFYSLNN
VTITPHIAGSTIDAFSNSPKLFSEILLKKIG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory