SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing BWI76_RS16075 FitnessBrowser__Koxy:BWI76_RS16075 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4esoB Crystal structure of a putative oxidoreductase protein from sinorhizobium meliloti 1021 in complex with NADP
33% identity, 98% coverage: 4:243/246 of query aligns to 3:244/251 of 4esoB

query
sites
4esoB
F
 
Y
S
 
Q
A
 
G
K
 
K
R
 
K
V
 
A
L
 
I
I
 
V
T
 
I
G
|
G
A
 
G
T
|
T
S
x
H
G
|
G
I
x
M
G
 
G
L
 
L
A
 
A
G
 
T
A
 
V
Q
 
R
R
 
R
I
 
L
D
 
V
R
 
E
E
 
G
G
 
G
G
 
A
W
 
E
V
 
V
I
 
L
A
 
L
T
 
T
G
 
G
R
|
R
D
x
N
P
 
E
R
 
S
R
x
N
L
 
I
A
 
A
L
 
R
L
 
I
R
 
R
R
 
E
Q
 
E
L
 
F
S
 
G
D
 
P
R
 
R
A
 
V
R
 
H
V
 
A
I
 
L
D
 
R
N
x
S
D
|
D
A
x
I
S
 
A
D
 
D
-
 
L
-
 
N
-
 
E
-
 
I
P
 
A
L
 
V
T
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
A
A
 
G
K
 
Q
E
 
T
I
 
L
H
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
G
G
 
A
L
 
I
D
 
D
G
 
L
L
 
L
W
 
H
L
 
I
N
|
N
A
|
A
G
|
G
Y
 
V
A
 
S
A
 
E
V
 
L
G
 
E
E
 
P
L
 
F
S
 
D
Q
 
Q
I
 
V
D
 
S
A
 
E
A
 
A
A
 
S
F
 
Y
D
 
D
H
 
R
M
 
Q
M
 
F
A
 
A
T
 
V
N
 
N
V
 
T
R
 
K
G
 
G
P
 
A
V
 
F
L
 
F
Q
 
T
M
 
V
A
 
Q
A
 
R
L
 
L
A
 
T
G
 
P
K
 
L
L
 
I
N
 
R
P
 
E
G
 
G
A
 
G
S
 
S
V
 
I
V
 
V
V
 
F
T
|
T
A
 
S
S
|
S
T
 
V
S
 
A
A
 
D
Y
 
E
E
 
G
G
 
G
A
 
H
A
 
P
A
 
G
A
x
M
S
 
S
L
 
V
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
T
 
S
K
|
K
G
 
A
A
 
A
L
 
L
I
 
V
S
 
S
L
 
F
T
 
A
R
 
S
C
 
V
W
 
L
A
 
A
S
 
A
A
 
E
L
 
L
G
 
L
E
 
P
K
 
R
N
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
S
L
 
V
V
 
S
P
|
P
G
|
G
P
 
F
I
|
I
D
 
D
T
|
T
D
 
P
F
x
T
R
x
K
H
x
G
F
 
V
-
 
A
-
 
G
M
 
I
R
 
T
D
 
E
E
 
A
A
 
E
R
 
R
R
 
A
E
 
E
F
 
F
E
 
K
A
 
T
S
 
L
V
 
G
V
 
D
S
 
N
R
 
I
L
 
T
A
 
P
L
 
M
H
 
K
R
 
R
Q
 
N
G
 
G
T
 
T
A
 
A
A
 
D
E
 
E
A
 
V
A
 
A
E
 
R
V
 
A
A
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
F
D
 
E
A
 
-
A
 
A
S
 
T
F
 
F
V
 
T
S
 
T
G
 
G
G
 
A
Q
 
K
Y
 
L
A
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
L

4bmsF Short chain alcohol dehydrogenase from ralstonia sp. Dsm 6428 in complex with NADPH
35% identity, 99% coverage: 1:244/246 of query aligns to 1:247/249 of 4bmsF

query
sites
4bmsF
M
 
M
A
 
Y
R
 
R
F
 
L
S
 
L
A
 
N
K
 
K
R
 
T
V
 
A
L
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
T
x
N
S
|
S
G
 
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
G
 
T
A
 
A
Q
 
K
R
 
R
I
 
F
D
 
V
R
 
A
E
 
E
G
 
G
G
 
A
W
 
Y
V
 
V
I
 
F
A
 
I
T
 
V
G
 
G
R
|
R
D
x
R
P
 
R
R
 
K
R
 
E
L
 
L
A
 
E
-
 
Q
-
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
E
L
 
I
L
 
G
R
 
R
R
 
N
Q
 
V
L
 
T
S
 
A
D
 
V
R
 
K
A
|
A
R
x
D
V
|
V
I
 
T
D
 
K
N
 
L
D
 
E
A
 
D
S
 
L
D
 
D
P
 
R
L
 
L
T
 
Y
G
 
-
A
 
-
A
 
A
L
 
I
A
 
V
K
 
R
E
 
E
I
 
-
H
 
-
A
 
Q
S
 
R
G
 
G
G
 
S
L
 
I
D
 
D
G
 
V
L
 
L
W
 
F
L
 
A
N
|
N
A
x
S
G
|
G
Y
 
A
A
 
I
A
 
E
V
 
Q
G
 
K
E
 
T
L
 
L
S
 
E
Q
 
E
I
 
I
D
 
T
A
 
P
A
 
E
A
 
H
F
 
Y
D
 
D
H
 
R
M
 
T
M
 
F
A
 
D
T
x
V
N
 
N
V
 
V
R
 
R
G
 
G
P
 
L
V
 
I
L
 
F
Q
 
T
M
 
V
A
 
Q
A
 
K
L
 
A
A
 
L
G
 
P
K
 
L
L
 
L
N
 
R
P
 
D
G
 
G
A
 
G
S
 
S
V
 
V
V
 
I
V
 
L
T
 
T
A
 
S
S
|
S
T
 
V
S
 
A
A
 
G
Y
 
V
E
 
L
G
 
G
A
 
L
A
 
Q
A
 
A
A
x
H
S
 
D
L
 
T
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
T
 
A
K
|
K
G
 
A
A
 
A
L
 
V
I
 
R
S
 
S
L
 
L
T
 
A
R
 
R
C
 
T
W
 
W
A
 
T
S
 
T
A
 
E
L
 
L
G
 
K
E
 
G
K
 
R
N
 
S
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
V
 
S
P
 
P
G
|
G
P
 
A
I
|
I
D
 
D
T
|
T
D
 
P
F
x
I
-
 
I
-
 
E
R
 
N
H
 
Q
F
 
V
M
 
S
R
 
T
D
x
Q
E
 
E
A
 
E
R
 
A
R
 
D
E
 
E
F
 
L
E
 
R
A
 
A
S
 
K
V
 
F
V
 
A
S
 
A
R
 
A
L
 
T
A
 
P
L
 
L
H
 
G
R
 
R
Q
 
V
G
 
G
T
 
R
A
 
P
A
 
E
E
 
E
A
 
L
A
 
A
E
 
A
V
 
A
A
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
D
A
 
S
S
 
S
F
 
Y
V
 
V
S
 
A
G
 
G
G
 
I
Q
 
E
Y
 
L
A
 
F
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T

6ihhA Crystal structure of rasadh f12 from ralstonia.Sp in complex with NADPH and a6o
35% identity, 99% coverage: 1:244/246 of query aligns to 1:247/249 of 6ihhA

query
sites
6ihhA
M
 
M
A
 
Y
R
 
R
F
 
L
S
 
L
A
 
N
K
 
K
R
 
T
V
 
A
L
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
T
x
N
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
G
 
T
A
 
A
Q
 
K
R
 
R
I
 
F
D
 
V
R
 
A
E
 
E
G
 
G
G
 
A
W
 
Y
V
 
V
I
 
F
A
 
I
T
 
V
G
 
G
R
|
R
D
x
R
P
 
R
R
 
K
R
 
E
L
 
L
A
 
E
-
 
Q
-
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
E
L
 
I
L
 
G
R
 
R
R
 
N
Q
 
V
L
 
T
S
 
A
D
 
V
R
 
K
A
 
A
R
x
D
V
|
V
I
 
T
D
 
K
N
 
L
D
 
E
A
 
D
S
 
L
D
 
D
P
 
R
L
 
L
T
 
Y
G
 
-
A
 
-
A
 
A
L
 
I
A
 
V
K
 
R
E
 
E
I
 
-
H
 
-
A
 
Q
S
 
R
G
 
G
G
 
S
L
 
I
D
 
D
G
 
V
L
 
L
W
 
F
L
 
A
N
|
N
A
x
S
G
|
G
Y
 
A
A
 
V
A
 
E
V
 
Q
G
 
K
E
 
T
L
 
L
S
 
E
Q
 
E
I
 
I
D
 
T
A
 
P
A
 
E
A
 
H
F
 
Y
D
 
D
H
 
R
M
 
T
M
 
F
A
 
D
T
x
V
N
 
N
V
 
V
R
 
R
G
 
G
P
 
L
V
 
I
L
 
F
Q
 
T
M
 
V
A
 
Q
A
 
K
L
 
A
A
 
L
G
 
P
K
 
L
L
 
L
N
 
R
P
 
D
G
 
G
A
 
G
S
 
S
V
 
V
V
 
I
V
 
L
T
|
T
A
 
S
S
|
S
T
 
V
S
 
A
A
 
G
Y
 
V
E
 
L
G
 
G
A
 
L
A
 
Q
A
 
A
A
x
H
S
 
D
L
 
T
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
T
 
A
K
|
K
G
 
A
A
 
A
L
 
V
I
 
R
S
 
S
L
 
L
T
 
A
R
 
R
C
 
T
W
 
W
A
 
T
S
 
T
A
 
E
L
 
L
G
 
K
E
 
G
K
 
R
N
 
S
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
V
 
S
P
|
P
G
|
G
P
x
A
I
|
I
D
 
D
T
|
T
D
 
P
F
x
S
-
x
L
-
 
E
R
 
N
H
 
N
F
 
V
M
 
S
R
 
T
D
 
Q
E
 
E
A
 
E
R
 
A
R
 
D
E
 
E
F
 
L
E
 
R
A
 
A
S
 
K
V
 
A
V
 
A
S
 
A
R
 
A
L
 
T
A
 
P
L
 
L
H
 
G
R
 
R
Q
 
V
G
 
G
T
 
R
A
 
P
A
 
E
E
 
E
A
 
L
A
 
A
E
 
A
V
 
A
A
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
D
A
 
S
S
 
S
F
 
Y
V
 
V
S
 
A
G
 
G
G
 
I
Q
 
E
Y
 
L
A
 
F
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
|
L
T
 
T

5t2uA Short chain dehydrogenase/reductase family protein (see paper)
38% identity, 95% coverage: 10:242/246 of query aligns to 10:237/241 of 5t2uA

query
sites
5t2uA
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
T
 
T
S
 
S
G
|
G
I
 
I
G
 
G
L
 
L
A
 
E
G
 
S
A
 
A
Q
 
R
R
 
L
I
 
M
D
 
A
R
 
A
E
 
E
G
 
G
G
 
A
W
 
D
V
 
V
I
 
V
A
 
I
T
 
T
G
 
G
R
|
R
D
|
D
P
 
A
R
 
Q
R
|
R
L
 
G
A
 
E
L
 
Q
L
 
A
R
 
A
R
 
A
Q
 
D
L
 
I
S
 
G
D
 
H
R
 
G
A
 
A
R
 
R
V
 
F
I
 
V
D
 
Q
N
 
A
D
|
D
A
x
L
S
 
G
D
 
D
P
 
L
L
 
D
T
 
S
G
 
V
A
 
A
A
 
D
L
 
L
A
 
A
K
 
A
E
 
Q
I
 
-
H
 
-
A
 
-
S
 
A
G
 
P
G
 
D
L
 
V
D
 
D
G
 
I
L
 
L
W
 
V
L
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
Y
 
I
A
x
Y
A
 
P
V
 
Q
G
 
A
E
 
S
L
 
T
S
 
F
Q
 
D
I
 
Q
D
 
D
A
 
V
A
 
A
A
 
G
F
 
F
D
 
Q
H
 
Q
M
 
L
M
 
F
A
 
D
T
 
T
N
 
N
V
 
V
R
 
R
G
 
G
P
 
T
V
 
Y
L
 
F
Q
 
L
M
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
A
A
 
A
-
 
K
G
 
G
K
 
M
L
 
V
N
 
A
P
 
R
G
 
G
A
 
H
S
 
G
V
 
S
V
 
I
V
 
V
T
 
N
A
x
I
S
 
T
T
|
T
-
 
L
S
 
A
A
 
A
Y
 
H
E
 
K
G
 
G
A
 
F
A
 
P
A
 
G
A
x
T
S
 
S
L
 
V
Y
|
Y
S
 
G
A
 
A
T
 
T
K
|
K
G
 
A
A
 
A
L
 
L
I
 
E
S
 
S
L
 
L
T
 
T
R
 
R
C
 
T
W
 
W
A
 
A
S
 
A
A
 
E
L
 
F
G
 
G
E
 
A
K
 
N
N
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
S
L
 
V
V
 
S
P
|
P
G
 
G
P
|
P
I
x
T
D
 
-
T
 
-
D
 
-
F
 
-
R
 
R
H
x
T
F
 
P
M
x
T
R
x
T
D
 
L
E
 
E
A
 
Q
R
 
L
R
 
G
E
 
D
F
 
F
E
 
I
A
 
D
S
 
D
V
 
V
V
 
A
S
 
A
R
 
G
L
 
L
A
 
P
L
 
L
H
 
R
R
 
R
Q
 
T
G
 
A
T
 
A
A
 
P
A
 
E
E
 
E
A
 
I
A
 
A
E
 
Q
V
 
A
A
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
P
A
 
R
A
 
A
S
 
S
F
 
F
V
 
V
S
 
T
G
 
G
G
 
S
Q
 
T
Y
 
L
A
 
Y
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

4ituA Crystal structure of s-2-hydroxypropyl coenzyme m dehydrogenase (s- hpcdh) bound to s-hpc and nadh (see paper)
38% identity, 72% coverage: 68:244/246 of query aligns to 71:251/253 of 4ituA

query
sites
4ituA
A
 
A
A
 
A
L
 
I
A
 
T
K
 
S
E
 
A
I
 
E
H
 
Q
A
 
T
S
 
I
G
 
G
G
 
S
L
 
L
D
 
T
G
 
G
L
 
L
W
 
V
L
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
Y
 
I
A
 
A
A
 
G
V
 
F
G
 
G
E
 
S
L
 
V
S
 
H
Q
 
D
I
 
A
D
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
A
F
 
W
D
 
D
H
 
R
M
 
I
M
 
M
A
 
A
T
x
V
N
|
N
V
 
V
R
 
T
G
 
G
P
 
T
V
 
F
L
 
L
-
 
A
Q
 
S
M
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
K
 
M
L
 
L
N
 
E
P
 
R
G
 
H
A
 
K
S
 
G
V
 
T
V
 
I
V
 
V
T
 
N
-
x
F
A
 
G
S
|
S
T
 
V
S
 
A
A
 
G
Y
 
L
E
 
V
G
 
G
A
 
I
A
 
P
A
 
T
A
 
M
S
 
A
L
 
A
Y
|
Y
S
 
C
A
 
A
T
 
A
K
|
K
G
 
G
A
 
A
L
 
I
I
 
V
S
 
N
L
 
L
T
 
T
R
 
R
C
 
Q
W
 
M
A
 
A
S
 
A
A
 
D
L
 
Y
G
 
S
E
 
G
K
 
R
N
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
V
 
C
P
|
P
G
 
G
P
x
T
I
x
V
D
 
T
T
 
S
D
x
T
F
 
G
-
x
M
-
 
G
R
 
Q
H
 
Q
F
 
L
M
 
L
R
 
G
D
 
S
E
 
D
A
 
T
R
 
S
R
 
P
E
 
E
F
 
V
E
 
Q
A
 
A
S
 
R
V
x
R
V
 
L
S
 
A
R
 
K
L
x
Y
A
 
P
L
 
I
H
 
G
R
 
R
Q
 
F
G
 
G
T
 
T
A
 
P
A
 
E
E
 
D
A
 
I
A
 
A
E
 
E
V
 
A
A
 
V
L
 
I
F
 
F
L
 
L
L
 
L
S
 
S
D
 
D
A
 
Q
A
 
A
S
 
A
F
 
F
V
 
V
S
 
T
G
 
G
G
 
A
Q
 
A
Y
 
F
A
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
T

Sites not aligning to the query:

A7IQH5 2-(S)-hydroxypropyl-CoM dehydrogenase 3; S-HPCDH 3; 2-[(S)-2-hydroxypropylthio]ethanesulfonate dehydrogenase 3; Aliphatic epoxide carboxylation component IV; Epoxide carboxylase component IV; SHPCDH3; EC 1.1.1.269 from Xanthobacter autotrophicus (strain ATCC BAA-1158 / Py2) (see 2 papers)
38% identity, 72% coverage: 68:244/246 of query aligns to 73:253/255 of A7IQH5

query
sites
A7IQH5
A
 
A
A
 
A
L
 
I
A
 
T
K
 
S
E
 
A
I
 
E
H
 
Q
A
 
T
S
 
I
G
 
G
G
 
S
L
 
L
D
 
T
G
 
G
L
 
L
W
 
V
L
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
Y
 
I
A
 
A
A
 
G
V
 
F
G
 
G
E
 
S
L
 
V
S
 
H
Q
 
D
I
 
A
D
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
A
F
 
W
D
 
D
H
 
R
M
 
I
M
 
M
A
 
A
T
 
V
N
 
N
V
 
V
R
 
T
G
 
G
P
 
T
V
 
F
L
 
L
-
 
A
Q
 
S
M
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
K
 
M
L
 
L
N
 
E
P
 
R
G
 
H
A
 
K
S
 
G
V
 
T
V
 
I
V
 
V
T
 
N
-
 
F
A
 
G
S
|
S
T
 
V
S
 
A
A
 
G
Y
 
L
E
 
V
G
 
G
A
 
I
A
 
P
A
 
T
A
 
M
S
 
A
L
 
A
Y
|
Y
S
 
C
A
 
A
T
 
A
K
|
K
G
 
G
A
 
A
L
 
I
I
 
V
S
 
N
L
 
L
T
 
T
R
 
R
C
 
Q
W
 
M
A
 
A
S
 
A
A
 
D
L
 
Y
G
 
S
E
 
G
K
 
R
N
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
V
 
C
P
 
P
G
 
G
P
x
T
I
x
V
D
x
T
T
x
S
D
x
T
F
x
G
-
 
M
-
 
G
R
 
Q
H
 
Q
F
 
L
M
 
L
R
 
G
D
 
S
E
 
D
A
 
T
R
 
S
R
 
P
E
 
E
F
 
V
E
 
Q
A
 
A
S
 
R
V
x
R
V
 
L
S
 
A
R
x
K
L
x
Y
A
 
P
L
 
I
H
 
G
R
 
R
Q
 
F
G
 
G
T
 
T
A
 
P
A
 
E
E
 
D
A
 
I
A
 
A
E
 
E
V
 
A
A
 
V
L
 
I
F
 
F
L
 
L
L
 
L
S
 
S
D
 
D
A
 
Q
A
 
A
S
 
A
F
 
F
V
 
V
S
 
T
G
 
G
G
 
A
Q
 
A
Y
 
F
A
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
T

Sites not aligning to the query:

4gh5A Crystal structure of s-2-hydroxypropyl coenzyme m dehydrogenase (s- hpcdh) (see paper)
39% identity, 72% coverage: 68:244/246 of query aligns to 71:246/248 of 4gh5A

query
sites
4gh5A
A
 
A
A
 
A
L
 
I
A
 
T
K
 
S
E
 
A
I
 
E
H
 
Q
A
 
T
S
 
I
G
 
G
G
 
S
L
 
L
D
 
T
G
 
G
L
 
L
W
 
V
L
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
Y
 
I
A
 
A
A
 
G
V
 
F
G
 
G
E
 
S
L
 
V
S
 
H
Q
 
D
I
 
A
D
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
A
F
 
W
D
 
D
H
 
R
M
 
I
M
 
M
A
 
A
T
x
V
N
|
N
V
 
V
R
 
T
G
 
G
P
 
T
V
 
F
L
 
L
-
 
A
Q
 
S
M
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
K
 
M
L
 
L
N
 
E
P
 
R
G
 
H
A
 
K
S
 
G
V
 
T
V
 
I
V
 
V
T
 
N
-
x
F
A
 
G
S
|
S
T
 
V
S
 
A
A
 
G
Y
 
L
E
 
V
G
 
G
A
 
I
A
 
P
A
 
T
A
 
M
S
 
A
L
 
A
Y
|
Y
S
 
C
A
 
A
T
 
A
K
|
K
G
 
G
A
 
A
L
 
I
I
 
V
S
 
N
L
 
L
T
 
T
R
 
R
C
 
Q
W
 
M
A
 
A
S
 
A
A
 
D
L
 
Y
G
 
S
E
 
G
K
 
R
N
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
V
 
C
P
|
P
G
 
G
P
 
T
I
x
V
D
 
T
T
 
S
D
x
T
F
x
G
R
 
-
H
 
-
F
 
-
M
|
M
R
 
G
D
 
Q
E
 
Q
A
 
L
R
 
L
R
 
P
E
 
E
F
 
V
E
 
Q
A
 
A
S
 
R
V
 
R
V
 
L
S
 
A
R
 
K
L
 
Y
A
 
P
L
 
I
H
 
G
R
 
R
Q
 
F
G
 
G
T
 
T
A
 
P
A
 
E
E
 
D
A
 
I
A
 
A
E
 
E
V
 
A
A
 
V
L
 
I
F
 
F
L
 
L
L
 
L
S
 
S
D
 
D
A
 
Q
A
 
A
S
 
A
F
 
F
V
 
V
S
 
T
G
 
G
G
 
A
Q
 
A
Y
 
F
A
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
T

Sites not aligning to the query:

5itvA Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
30% identity, 99% coverage: 1:244/246 of query aligns to 2:253/255 of 5itvA

query
sites
5itvA
M
 
I
A
 
M
R
 
N
F
 
L
S
 
T
A
 
D
K
 
K
R
 
T
V
 
V
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
T
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
Y
A
 
A
G
 
A
A
 
V
Q
 
Q
R
 
A
-
 
F
I
 
L
D
 
G
R
 
Q
E
 
Q
G
 
A
G
 
N
W
 
V
V
 
V
I
 
V
A
 
A
T
x
D
G
x
I
R
 
D
D
 
E
P
 
A
R
 
Q
R
 
G
L
 
E
A
 
A
L
 
M
L
 
V
R
 
R
R
 
K
Q
 
E
L
 
N
S
 
N
D
 
D
R
 
R
A
 
L
R
 
H
V
 
F
I
 
V
D
 
Q
N
x
T
D
 
D
A
x
I
S
 
T
D
 
D
P
 
E
L
 
A
-
 
A
T
 
C
G
 
Q
A
 
H
A
 
A
L
 
V
A
 
E
K
 
S
E
 
A
I
 
V
H
 
H
A
 
T
S
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
 
D
G
 
V
L
 
L
W
 
I
L
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
Y
 
I
A
 
E
A
 
I
V
 
V
G
 
A
E
 
P
L
 
I
S
 
H
Q
 
E
I
 
M
D
 
E
A
 
L
A
 
S
A
 
D
F
 
W
D
 
N
H
 
K
M
 
V
M
 
L
A
 
Q
T
 
V
N
 
N
V
 
L
R
 
T
G
 
G
P
 
M
V
 
F
L
 
L
Q
 
M
-
 
S
M
 
K
A
 
H
A
 
A
L
 
L
A
 
K
G
 
H
K
 
M
L
 
L
N
 
A
P
 
A
G
 
G
-
 
K
A
 
G
S
 
N
V
 
I
V
 
I
V
 
N
T
|
T
A
 
C
S
|
S
T
 
V
S
 
G
A
 
G
Y
 
L
E
 
V
G
 
A
A
 
W
A
 
P
A
 
D
A
 
I
S
 
P
L
 
A
Y
|
Y
S
 
N
A
 
A
T
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
G
L
 
V
I
 
L
S
 
Q
L
 
L
T
 
T
R
 
K
C
 
S
W
 
M
A
 
A
S
 
V
A
 
D
L
 
Y
G
 
A
E
 
K
K
 
H
N
 
Q
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
L
 
V
V
 
C
P
|
P
G
|
G
P
x
I
I
|
I
D
 
D
T
 
T
D
 
P
F
 
L
-
 
N
-
 
E
R
 
K
H
 
S
F
 
F
M
 
L
R
 
E
D
 
N
E
 
N
-
 
E
-
 
G
A
 
T
R
 
L
R
 
E
E
 
E
F
 
I
E
 
K
A
 
K
S
 
E
V
 
K
V
 
A
S
 
K
R
 
V
L
 
N
A
 
P
L
 
L
H
 
L
R
 
R
Q
 
L
G
 
G
T
 
K
A
 
P
A
 
E
E
 
E
A
 
I
A
 
A
E
 
N
V
 
V
A
 
M
L
 
L
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
L
A
 
S
S
 
S
F
 
Y
V
 
M
S
 
T
G
 
G
G
 
S
Q
 
A
Y
 
I
A
 
T
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
Y
T
 
T

2zatA Crystal structure of a mammalian reductase (see paper)
33% identity, 96% coverage: 7:242/246 of query aligns to 6:246/251 of 2zatA

query
sites
2zatA
K
 
K
R
 
V
V
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
x
A
A
 
S
T
|
T
S
x
D
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
G
 
I
A
 
A
Q
 
R
R
 
R
I
 
L
D
 
A
R
 
Q
E
 
D
G
 
G
G
 
A
W
 
H
V
 
V
I
 
V
A
 
V
T
 
S
G
x
S
R
|
R
D
x
K
P
 
Q
-
 
E
-
x
N
-
 
V
-
 
D
R
 
R
R
 
T
L
 
V
A
 
A
L
 
T
L
 
L
R
 
Q
R
 
G
Q
 
E
-
 
G
L
 
L
S
 
S
D
 
V
R
 
T
A
 
G
R
 
T
V
 
V
I
 
C
D
x
H
-
 
V
N
 
G
D
 
K
A
 
A
S
 
E
D
 
D
P
 
R
L
 
E
T
 
R
G
 
L
A
 
V
A
 
A
L
 
M
A
 
A
K
 
V
E
 
N
I
 
L
H
 
H
A
 
-
S
 
-
G
 
G
G
 
G
L
 
V
D
 
D
G
 
I
L
 
L
W
 
V
L
 
S
N
|
N
A
 
A
G
x
A
Y
 
V
A
 
N
A
 
P
V
 
F
-
 
F
G
 
G
E
 
N
L
 
I
S
 
I
Q
 
D
I
 
A
D
 
T
A
 
E
A
 
E
A
 
V
F
 
W
D
 
D
H
 
K
M
 
I
M
 
L
A
 
H
T
 
V
N
 
N
V
 
V
R
 
K
G
 
A
P
 
T
V
 
V
L
 
L
Q
 
M
M
 
T
A
 
K
A
 
A
L
 
V
A
 
V
G
 
P
K
 
E
L
 
M
N
 
E
P
 
K
-
 
R
-
 
G
G
 
G
A
 
G
S
 
S
V
 
V
V
 
L
V
 
I
T
x
V
A
 
S
S
|
S
T
 
V
S
 
G
A
 
A
Y
 
Y
E
 
H
G
 
P
A
 
F
A
 
P
A
 
N
A
x
L
S
 
G
L
 
P
Y
|
Y
S
 
N
A
 
V
T
 
S
K
|
K
G
 
T
A
 
A
L
 
L
I
 
L
S
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
C
 
N
W
 
L
A
 
A
S
 
V
A
 
E
L
 
L
G
 
A
E
 
P
K
 
R
N
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
L
 
L
V
 
A
P
|
P
G
|
G
P
 
L
I
|
I
D
 
K
T
|
T
D
 
N
F
|
F
R
x
S
H
 
Q
F
 
V
M
 
L
-
 
W
R
 
M
D
 
D
E
x
K
A
 
A
R
 
R
R
 
K
E
 
E
F
 
Y
E
 
-
A
 
-
S
 
-
V
 
M
V
 
K
S
 
E
R
 
S
L
 
L
A
 
R
L
 
I
H
 
R
R
 
R
Q
 
L
G
 
G
T
 
N
A
 
P
A
 
E
E
 
D
A
 
C
A
 
A
E
 
G
V
 
I
A
 
V
L
 
S
F
 
F
L
 
L
L
 
C
S
 
S
D
 
E
A
 
D
A
 
A
S
 
S
F
 
Y
V
 
I
S
 
T
G
 
G
G
 
E
Q
 
T
Y
 
V
A
 
V
V
 
V
D
 
G
G
 
G
G
 
G

Q8WNV7 Dehydrogenase/reductase SDR family member 4; NADPH-dependent carbonyl reductase; CR; PHCR; NADPH-dependent retinol dehydrogenase/reductase; NDRD; Peroxisomal carbonyl reductase; PerCR; Peroxisomal short-chain alcohol dehydrogenase; PSCD; Short chain dehydrogenase/reductase family 25C member 2; Protein SDR25C2; EC 1.1.1.184; EC 1.1.1.300 from Sus scrofa (Pig) (see 2 papers)
33% identity, 96% coverage: 7:242/246 of query aligns to 34:274/279 of Q8WNV7

query
sites
Q8WNV7
K
 
K
R
 
V
V
 
A
L
|
L
I
x
V
T
|
T
G
x
A
A
x
S
T
|
T
S
x
D
G
|
G
I
|
I
G
|
G
L
|
L
A
|
A
G
x
I
A
|
A
Q
x
R
R
|
R
I
x
L
D
x
A
R
x
Q
E
x
D
G
|
G
G
x
A
W
x
H
V
|
V
I
x
V
A
 
V
T
 
S
G
 
S
R
 
R
D
 
K
P
 
Q
-
 
E
-
 
N
-
 
V
-
 
D
R
 
R
R
 
T
L
 
V
A
 
A
L
 
T
L
 
L
R
 
Q
R
 
G
Q
 
E
-
 
G
L
 
L
S
 
S
D
 
V
R
 
T
A
 
G
R
 
T
V
 
V
I
 
C
D
 
H
-
 
V
N
 
G
D
 
K
A
 
A
S
 
E
D
 
D
P
 
R
L
 
E
T
 
R
G
 
L
A
 
V
A
 
A
L
 
M
A
 
A
K
 
V
E
 
N
I
 
L
H
 
H
A
 
-
S
 
-
G
 
G
G
 
G
L
 
V
D
 
D
G
 
I
L
 
L
W
 
V
L
 
S
N
 
N
A
 
A
G
 
A
Y
 
V
A
 
N
A
 
P
V
 
F
-
 
F
G
 
G
E
 
N
L
 
I
S
 
I
Q
 
D
I
 
A
D
 
T
A
 
E
A
 
E
A
 
V
F
 
W
D
 
D
H
 
K
M
 
I
M
 
L
A
 
H
T
 
V
N
 
N
V
 
V
R
 
K
G
 
A
P
 
T
V
 
V
L
 
L
Q
 
M
M
 
T
A
 
K
A
 
A
L
 
V
A
 
V
G
 
P
K
 
E
L
 
M
N
 
E
P
 
K
-
 
R
-
 
G
G
 
G
A
 
G
S
 
S
V
 
V
V
 
L
V
 
I
T
 
V
A
 
S
S
 
S
T
 
V
S
 
G
A
 
A
Y
 
Y
E
 
H
G
 
P
A
x
F
A
 
P
A
 
N
A
x
L
S
 
G
L
 
P
Y
|
Y
S
 
N
A
 
V
T
 
S
K
|
K
G
 
T
A
 
A
L
 
L
I
 
L
S
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
C
x
N
W
 
L
A
 
A
S
 
V
A
 
E
L
 
L
G
 
A
E
 
P
K
 
R
N
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
L
 
L
V
 
A
P
 
P
G
 
G
P
 
L
I
 
I
D
 
K
T
 
T
D
 
N
F
 
F
R
 
S
H
 
Q
F
 
V
M
 
L
-
 
W
R
 
M
D
 
D
E
 
K
A
 
A
R
 
R
R
 
K
E
 
E
F
 
Y
E
 
-
A
 
-
S
 
-
V
 
M
V
 
K
S
 
E
R
 
S
L
 
L
A
 
R
L
 
I
H
 
R
R
 
R
Q
 
L
G
 
G
T
 
N
A
 
P
A
 
E
E
 
D
A
 
C
A
 
A
E
 
G
V
 
I
A
 
V
L
 
S
F
 
F
L
 
L
L
 
C
S
 
S
D
 
E
A
 
D
A
 
A
S
 
S
F
 
Y
V
 
I
S
 
T
G
 
G
G
 
E
Q
 
T
Y
 
V
A
 
V
V
 
V
D
 
G
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3o4rA Crystal structure of human dehydrogenase/reductase (sdr family) member 4 (dhrs4)
31% identity, 98% coverage: 7:246/246 of query aligns to 9:253/254 of 3o4rA

query
sites
3o4rA
K
 
K
R
 
V
V
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
x
A
A
 
S
T
|
T
S
x
D
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
F
A
 
A
G
 
I
A
 
A
Q
 
R
R
 
R
I
 
L
D
 
A
R
 
Q
E
 
D
G
 
G
G
 
A
W
 
H
V
 
V
I
 
V
A
 
V
T
 
S
G
x
S
R
|
R
D
x
K
P
 
Q
R
 
Q
R
x
N
L
 
V
-
 
D
-
 
Q
-
 
A
-
 
V
-
 
A
A
 
T
L
 
L
L
 
Q
R
 
G
R
 
E
Q
 
G
L
 
L
S
 
S
D
 
V
R
 
T
A
 
G
R
 
T
V
 
V
I
 
C
D
x
H
-
x
V
N
 
G
D
 
K
A
 
A
S
 
E
D
 
D
P
 
R
L
 
E
T
 
R
G
 
L
A
 
V
A
 
A
L
 
T
A
 
A
K
 
V
E
 
K
I
 
L
H
 
H
A
 
-
S
 
-
G
 
G
G
 
G
L
 
I
D
 
D
G
 
I
L
 
L
W
 
V
L
 
S
N
|
N
A
 
A
G
x
A
Y
 
V
A
 
N
A
 
P
V
 
F
-
 
F
G
 
G
E
 
S
L
 
I
S
 
M
Q
 
D
I
 
V
D
 
T
A
 
E
A
 
E
A
 
V
F
 
W
D
 
D
H
 
K
M
 
T
M
 
L
A
 
D
T
 
I
N
 
N
V
 
V
R
 
K
G
 
A
P
 
P
V
 
A
L
 
L
Q
 
M
M
 
T
A
 
K
A
 
A
L
 
V
A
 
V
G
 
P
K
 
E
L
 
M
N
 
E
P
 
K
-
 
R
-
 
G
G
 
G
A
 
G
S
 
S
V
 
V
V
 
V
V
 
I
T
 
V
A
 
S
S
|
S
T
 
I
S
 
A
A
 
A
Y
 
F
E
 
S
G
 
P
A
 
S
A
 
P
A
 
G
A
x
F
S
 
S
L
 
P
Y
|
Y
S
 
N
A
 
V
T
 
S
K
|
K
G
 
T
A
 
A
L
 
L
I
 
L
S
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
C
 
T
W
 
L
A
 
A
S
 
I
A
 
E
L
 
L
G
 
A
E
 
P
K
 
R
N
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
L
 
L
V
 
A
P
|
P
G
|
G
P
x
L
I
|
I
D
 
K
T
|
T
D
 
S
F
|
F
R
x
S
H
 
R
F
 
M
M
 
L
R
 
W
D
 
M
E
 
D
A
 
-
R
 
-
R
x
K
E
 
E
F
 
K
E
 
E
A
 
E
S
 
S
V
 
M
V
 
K
S
 
E
R
 
T
L
 
L
A
 
R
L
 
I
H
 
R
R
 
R
Q
 
L
G
 
G
T
 
E
A
 
P
A
 
E
E
 
D
A
 
C
A
 
A
E
 
G
V
 
I
A
 
V
L
 
S
F
 
F
L
 
L
L
 
C
S
 
S
D
 
E
A
 
D
A
 
A
S
 
S
F
 
Y
V
 
I
S
 
T
G
 
G
G
 
E
Q
 
T
Y
 
V
A
 
V
V
 
V
D
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
T
T
 
P
L
 
S
R
 
R

Q9BTZ2 Dehydrogenase/reductase SDR family member 4; NADPH-dependent carbonyl reductase; CR; NADPH-dependent retinol dehydrogenase/reductase; NRDR; humNRDR; Peroxisomal short-chain alcohol dehydrogenase; PSCD; SCAD-SRL; Short chain dehydrogenase/reductase family 25C member 2; Protein SDR25C2; Short-chain dehydrogenase/reductase family member 4; EC 1.1.1.184 from Homo sapiens (Human) (see 2 papers)
31% identity, 98% coverage: 7:246/246 of query aligns to 33:277/278 of Q9BTZ2

query
sites
Q9BTZ2
K
 
K
R
 
V
V
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
A
A
 
S
T
 
T
S
 
D
G
 
G
I
 
I
G
 
G
L
 
F
A
 
A
G
 
I
A
 
A
Q
 
R
R
 
R
I
 
L
D
 
A
R
 
Q
E
 
D
G
 
G
G
 
A
W
 
H
V
 
V
I
 
V
A
 
V
T
 
S
G
 
S
R
 
R
D
 
K
P
 
Q
R
 
Q
R
 
N
L
 
V
-
 
D
-
 
Q
-
 
A
-
 
V
-
 
A
A
 
T
L
 
L
L
 
Q
R
 
G
R
 
E
Q
 
G
L
 
L
S
 
S
D
 
V
R
 
T
A
 
G
R
 
T
V
 
V
I
 
C
D
 
H
-
 
V
N
 
G
D
 
K
A
 
A
S
 
E
D
 
D
P
 
R
L
 
E
T
 
R
G
 
L
A
 
V
A
 
A
L
 
T
A
 
A
K
 
V
E
 
K
I
 
L
H
 
H
A
 
-
S
 
-
G
 
G
G
 
G
L
 
I
D
 
D
G
 
I
L
 
L
W
 
V
L
 
S
N
 
N
A
 
A
G
 
A
Y
 
V
A
 
N
A
 
P
V
 
F
-
 
F
G
 
G
E
 
S
L
 
I
S
 
M
Q
 
D
I
 
V
D
 
T
A
 
E
A
 
E
A
 
V
F
 
W
D
 
D
H
 
K
M
 
T
M
 
L
A
 
D
T
 
I
N
 
N
V
 
V
R
 
K
G
 
A
P
 
P
V
 
A
L
 
L
Q
 
M
M
 
T
A
 
K
A
 
A
L
 
V
A
 
V
G
 
P
K
 
E
L
 
M
N
 
E
P
 
K
-
 
R
-
 
G
G
 
G
A
 
G
S
 
S
V
 
V
V
 
V
V
 
I
T
 
V
A
 
S
S
 
S
T
 
I
S
 
A
A
 
A
Y
 
F
E
 
S
G
 
P
A
x
S
A
 
P
A
 
G
A
x
F
S
 
S
L
 
P
Y
 
Y
S
 
N
A
 
V
T
 
S
K
 
K
G
 
T
A
 
A
L
 
L
I
 
L
S
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
C
x
T
W
 
L
A
 
A
S
 
I
A
 
E
L
 
L
G
 
A
E
 
P
K
 
R
N
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
L
 
L
V
 
A
P
 
P
G
 
G
P
 
L
I
 
I
D
 
K
T
 
T
D
 
S
F
 
F
R
 
S
H
 
R
F
 
M
M
 
L
R
 
W
D
 
M
E
 
D
A
 
-
R
 
-
R
 
K
E
 
E
F
 
K
E
 
E
A
 
E
S
 
S
V
 
M
V
 
K
S
 
E
R
 
T
L
 
L
A
 
R
L
 
I
H
 
R
R
 
R
Q
 
L
G
 
G
T
 
E
A
 
P
A
 
E
E
 
D
A
 
C
A
 
A
E
 
G
V
 
I
A
 
V
L
 
S
F
 
F
L
 
L
L
 
C
S
 
S
D
 
E
A
 
D
A
 
A
S
 
S
F
 
Y
V
 
I
S
 
T
G
 
G
G
 
E
Q
 
T
Y
 
V
A
 
V
V
 
V
D
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
T
T
 
P
L
 
S
R
 
R

D4A1J4 Dehydrogenase/reductase SDR family member 6; (R)-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase; 3-hydroxybutyrate dehydrogenase type 2; 4-oxo-L-proline reductase; Oxidoreductase UCPA; Short chain dehydrogenase/reductase family 15C member 1; EC 1.1.1.-; EC 1.1.1.30; EC 1.1.1.104 from Rattus norvegicus (Rat) (see paper)
30% identity, 100% coverage: 1:245/246 of query aligns to 1:245/245 of D4A1J4

query
sites
D4A1J4
M
 
M
A
 
G
R
 
R
F
 
L
S
 
E
A
 
G
K
 
K
R
 
V
V
 
I
L
 
V
I
 
L
T
 
T
G
 
A
A
 
A
T
 
A
S
 
Q
G
 
G
I
 
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
G
 
S
A
 
A
Q
 
L
R
 
A
I
 
F
D
 
A
R
 
R
E
 
E
G
 
G
G
 
A
W
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
A
T
 
T
G
 
D
R
 
I
D
 
N
P
 
E
R
 
A
R
 
K
L
 
L
A
 
Q
L
 
E
L
 
L
R
 
E
R
 
N
Q
 
Y
L
 
P
S
 
G
D
 
I
R
 
Q
A
 
T
R
 
R
V
 
V
I
 
L
D
 
D
N
 
V
D
 
T
A
 
K
S
 
K
D
 
R
P
 
Q
L
 
I
T
 
D
G
 
-
A
 
-
A
 
Q
L
 
F
A
 
A
K
 
S
E
 
E
I
 
I
H
 
E
A
 
K
S
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
I
D
 
D
G
 
V
L
 
L
W
 
F
L
 
N
N
 
V
A
 
A
G
 
G
Y
 
F
A
 
V
A
 
H
V
 
H
G
 
G
E
 
T
L
 
I
S
 
L
Q
 
D
I
 
C
D
 
E
A
 
E
A
 
K
A
 
D
F
 
W
D
 
D
H
 
F
M
 
S
M
 
M
A
 
N
T
 
L
N
 
N
V
 
V
R
 
R
G
 
S
P
 
M
V
 
Y
L
 
L
Q
 
M
M
 
I
A
 
K
A
 
A
L
 
F
A
 
L
G
 
P
K
 
K
L
 
M
-
 
L
-
 
A
-
 
Q
N
 
K
P
 
S
G
 
G
A
 
N
S
 
I
V
 
I
V
 
N
V
 
M
T
 
S
A
 
S
S
 
V
T
 
A
S
 
S
A
 
S
Y
 
I
E
 
K
G
 
G
A
 
V
A
 
E
A
 
N
A
 
R
S
 
C
L
 
V
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
T
 
T
K
 
K
G
 
A
A
 
A
L
 
V
I
 
I
S
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
C
 
S
W
 
V
A
 
A
S
 
A
A
 
D
L
 
F
G
 
I
E
 
Q
K
 
Q
N
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
C
L
 
V
V
 
C
P
 
P
G
 
G
P
 
T
I
 
V
D
 
D
T
 
T
-
 
P
-
 
S
-
 
L
D
 
Q
F
 
E
R
 
R
H
 
I
F
 
Q
M
 
A
R
 
R
D
 
D
E
 
D
A
 
P
R
 
K
R
 
E
E
 
A
F
 
L
E
 
K
A
 
A
S
 
-
V
 
F
V
 
L
S
 
N
R
 
R
L
 
Q
A
 
K
L
 
T
H
 
G
R
 
R
Q
 
F
G
 
A
T
 
S
A
 
A
A
 
E
E
 
E
A
 
V
A
 
A
E
 
L
V
 
L
A
 
C
L
 
V
F
 
Y
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
E
A
 
S
S
 
A
F
 
Y
V
 
V
S
 
T
G
 
G
G
 
T
Q
 
P
Y
 
V
A
 
V
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
W
T
 
S
L
 
L

6xewA Structure of serratia marcescens 2,3-butanediol dehydrogenase (see paper)
32% identity, 98% coverage: 3:244/246 of query aligns to 2:242/251 of 6xewA

query
sites
6xewA
R
 
R
F
 
F
S
 
D
A
 
N
K
 
K
R
 
V
V
 
V
L
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
T
 
G
S
x
N
G
|
G
I
x
M
G
 
G
L
 
E
A
 
A
G
 
A
A
 
A
Q
 
R
R
 
R
I
 
F
D
 
S
R
 
A
E
 
E
G
 
G
G
 
A
W
 
I
V
 
V
I
 
V
A
 
L
T
 
A
G
x
D
R
x
W
D
x
A
P
 
K
R
 
E
R
 
A
L
 
V
A
 
D
L
 
K
L
 
V
R
 
A
R
 
A
Q
 
S
L
 
L
S
 
P
D
 
K
-
 
G
R
 
R
A
 
A
R
 
M
V
 
A
I
 
V
D
 
H
N
x
I
D
|
D
A
x
V
S
 
S
D
 
D
P
 
H
L
 
V
T
 
A
G
 
V
A
 
E
A
 
K
L
 
M
A
 
M
K
 
N
E
 
E
I
 
V
H
 
A
A
 
E
S
 
K
-
 
L
G
 
G
G
 
R
L
 
I
D
 
D
G
 
V
L
 
L
W
 
L
L
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
Y
 
V
A
 
H
A
 
V
V
 
A
G
 
G
E
 
S
L
 
V
S
 
L
Q
 
E
I
 
T
D
 
S
A
 
I
A
 
D
A
 
D
F
 
W
D
 
R
H
 
R
M
 
I
M
 
A
A
 
G
T
x
V
N
 
D
V
 
I
R
 
D
G
 
G
P
 
V
V
 
V
L
 
F
-
 
C
Q
 
S
M
 
K
A
 
F
A
 
A
L
 
L
A
 
P
G
 
H
K
 
L
L
 
L
N
 
K
P
 
T
G
 
K
A
 
G
S
 
C
V
 
I
V
 
V
V
 
N
T
|
T
A
 
A
S
|
S
T
 
V
S
|
S
A
 
G
Y
 
L
E
 
G
G
 
G
A
 
D
A
 
W
A
 
G
A
 
A
S
 
A
L
 
Y
Y
|
Y
S
 
C
A
 
A
T
 
A
K
|
K
G
 
G
A
 
A
L
 
V
I
 
V
S
 
N
L
 
L
T
 
T
R
 
R
C
 
A
W
 
M
A
 
A
S
 
L
A
 
D
L
 
H
G
 
G
E
 
G
K
 
D
N
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
S
L
 
V
V
 
C
P
 
P
G
x
S
P
x
L
I
x
V
D
 
K
T
|
T
D
x
N
F
x
M
R
x
T
H
 
N
F
 
G
M
 
W
R
 
P
D
 
Q
E
 
E
A
 
I
R
 
R
R
 
D
E
 
K
F
 
F
E
 
N
A
 
-
S
 
-
V
 
-
V
 
-
S
 
E
R
 
R
L
 
I
A
 
A
L
 
L
H
 
G
R
 
R
Q
 
A
G
 
A
T
 
E
A
 
P
A
 
E
E
 
E
A
 
V
A
 
A
E
 
A
V
 
V
A
 
M
L
 
A
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
D
A
 
A
S
 
S
F
 
F
V
 
I
S
 
N
G
 
G
G
 
A
Q
 
N
Y
 
I
A
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
A
T
 
T

3toxA Crystal structure of a short chain dehydrogenase in complex with NAD(p) from sinorhizobium meliloti 1021
35% identity, 98% coverage: 2:242/246 of query aligns to 1:249/254 of 3toxA

query
sites
3toxA
A
 
S
R
 
R
F
 
L
S
 
E
A
 
G
K
 
K
R
 
I
V
 
A
L
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
T
x
S
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
G
 
A
A
 
A
Q
 
L
R
 
L
I
 
F
D
 
A
R
 
R
E
 
E
G
 
G
G
 
A
W
 
K
V
 
V
I
 
V
A
 
V
T
 
T
G
x
A
R
|
R
D
x
N
P
 
G
R
 
N
R
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
E
L
 
L
R
 
T
R
 
D
Q
 
E
L
 
I
S
 
A
D
 
G
R
 
G
A
 
G
R
 
G
V
 
E
I
 
A
D
 
A
N
 
A
D
 
L
A
 
A
S
 
G
D
 
D
-
x
V
-
 
G
-
 
D
-
 
E
P
 
A
L
 
L
T
 
H
G
 
E
A
 
A
A
 
L
L
 
V
A
 
E
K
 
L
E
 
A
I
 
V
H
 
R
A
 
R
S
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
 
D
G
 
T
L
 
A
W
 
F
L
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
-
 
A
Y
 
L
A
 
G
A
 
A
V
 
M
G
 
G
E
 
E
L
 
I
S
 
S
Q
 
S
I
 
L
D
 
S
A
 
V
A
 
E
A
 
G
F
 
W
D
 
R
H
 
E
M
 
T
M
 
L
A
 
D
T
 
T
N
 
N
V
 
L
R
 
T
G
 
S
P
 
A
V
 
F
L
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
K
-
 
Y
Q
 
Q
M
 
V
A
 
P
A
 
A
L
 
I
A
 
A
G
 
A
K
 
L
L
 
-
N
 
-
P
 
G
G
 
G
A
 
G
S
 
S
V
 
L
V
 
T
V
 
F
T
|
T
A
 
S
S
|
S
T
 
F
S
 
V
A
 
G
Y
 
H
E
 
T
-
 
A
G
 
G
A
 
F
A
 
A
A
 
G
A
x
V
S
 
A
L
 
P
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
T
 
S
K
|
K
G
 
A
A
 
G
L
 
L
I
 
I
S
 
G
L
 
L
T
 
V
R
 
Q
C
 
A
W
 
L
A
 
A
S
 
V
A
 
E
L
 
L
G
 
G
E
 
A
K
 
R
N
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
L
V
 
L
P
|
P
G
 
G
P
x
G
I
x
T
D
 
D
T
|
T
D
 
P
F
 
A
R
 
N
H
 
F
F
 
A
M
 
N
R
 
L
D
 
P
E
 
G
A
 
A
R
 
A
R
 
P
E
 
E
F
 
T
E
 
R
A
 
G
S
 
F
V
 
V
V
 
E
S
 
G
R
 
L
L
 
H
A
 
A
L
 
L
H
 
K
R
 
R
Q
 
I
G
 
A
T
 
R
A
 
P
A
 
E
E
 
E
A
 
I
A
 
A
E
 
E
V
 
A
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
G
A
 
A
S
 
S
F
 
F
V
 
V
S
 
T
G
 
G
G
 
A
Q
 
A
Y
 
L
A
 
L
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G

6vspA Structure of serratia marcescens 2,3-butanediol dehydrogenase mutant q247a (see paper)
32% identity, 98% coverage: 3:244/246 of query aligns to 2:242/251 of 6vspA

query
sites
6vspA
R
 
R
F
 
F
S
 
D
A
 
N
K
 
K
R
 
V
V
 
V
L
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
T
 
G
S
x
N
G
|
G
I
x
M
G
 
G
L
 
E
A
 
A
G
 
A
A
 
A
Q
 
R
R
 
R
I
 
F
D
 
S
R
 
A
E
 
E
G
 
G
G
 
A
W
 
I
V
 
V
I
 
V
A
 
L
T
 
A
G
x
D
R
x
W
D
x
A
P
 
K
R
 
E
R
 
A
L
 
V
A
 
D
L
 
K
L
 
V
R
 
A
R
 
A
Q
 
S
L
 
L
S
 
P
D
 
K
-
 
G
R
 
R
A
 
A
R
 
M
V
 
A
I
 
V
D
 
H
N
x
I
D
|
D
A
x
V
S
 
S
D
 
D
P
 
H
L
 
V
T
 
A
G
 
V
A
 
E
A
 
K
L
 
M
A
 
M
K
 
N
E
 
E
I
 
V
H
 
A
A
 
E
S
 
K
-
 
L
G
 
G
G
 
R
L
 
I
D
 
D
G
 
V
L
 
L
W
 
L
L
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
Y
x
V
A
 
H
A
 
V
V
 
A
G
 
G
E
 
S
L
 
V
S
 
L
Q
 
E
I
 
T
D
 
S
A
 
I
A
 
D
A
 
D
F
 
W
D
 
R
H
 
R
M
 
I
M
 
A
A
 
G
T
x
V
N
 
D
V
 
I
R
 
D
G
 
G
P
 
V
V
 
V
L
 
F
-
 
C
Q
 
S
M
 
K
A
 
F
A
 
A
L
 
L
A
 
P
G
 
H
K
 
L
L
 
L
N
 
K
P
 
T
G
 
K
A
 
G
S
 
C
V
 
I
V
 
V
V
 
N
T
|
T
A
 
A
S
|
S
T
 
V
S
 
S
A
 
G
Y
 
L
E
 
G
G
 
G
A
 
D
A
 
W
A
 
G
A
 
A
S
 
A
L
 
Y
Y
|
Y
S
 
C
A
 
A
T
 
A
K
|
K
G
 
G
A
 
A
L
 
V
I
 
V
S
 
N
L
 
L
T
 
T
R
 
R
C
 
A
W
 
M
A
 
A
S
 
L
A
 
D
L
 
H
G
 
G
E
 
G
K
 
D
N
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
S
L
 
V
V
 
C
P
|
P
G
x
S
P
x
L
I
x
V
D
 
K
T
|
T
D
x
N
F
x
M
R
x
T
H
 
N
F
 
G
M
 
W
R
 
P
D
 
Q
E
 
E
A
 
I
R
 
R
R
 
D
E
 
K
F
 
F
E
 
N
A
 
-
S
 
-
V
 
-
V
 
-
S
 
E
R
 
R
L
 
I
A
 
A
L
 
L
H
 
G
R
 
R
Q
 
A
G
 
A
T
 
E
A
 
P
A
 
E
E
 
E
A
 
V
A
 
A
E
 
A
V
 
V
A
 
M
L
 
A
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
D
A
 
A
S
 
S
F
 
F
V
 
I
S
 
N
G
 
G
G
 
A
Q
 
N
Y
 
I
A
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
A
T
 
T

H9XP47 Meso-2,3-butanediol dehydrogenase; BDH; meso-2,3-BDH; (R,S)-butane-2,3-diol dehydrogenase; NAD(H)-dependent meso-2,3-BDH; SmBdh; EC 1.1.1.- from Serratia marcescens (see paper)
32% identity, 98% coverage: 3:244/246 of query aligns to 2:242/251 of H9XP47

query
sites
H9XP47
R
 
R
F
 
F
S
 
D
A
 
N
K
 
K
R
 
V
V
 
V
L
 
V
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
G
S
x
N
G
 
G
I
x
M
G
 
G
L
 
E
A
 
A
G
 
A
A
 
A
Q
 
R
R
 
R
I
 
F
D
 
S
R
 
A
E
 
E
G
 
G
G
 
A
W
 
I
V
 
V
I
 
V
A
 
L
T
 
A
G
x
D
R
 
W
D
 
A
P
 
K
R
 
E
R
 
A
L
 
V
A
 
D
L
 
K
L
 
V
R
 
A
R
 
A
Q
 
S
L
 
L
S
 
P
D
 
K
-
 
G
R
 
R
A
 
A
R
 
M
V
 
A
I
 
V
D
 
H
N
 
I
D
|
D
A
x
V
S
 
S
D
 
D
P
 
H
L
 
V
T
 
A
G
 
V
A
 
E
A
 
K
L
 
M
A
 
M
K
 
N
E
 
E
I
 
V
-
 
A
H
 
E
A
 
K
S
 
L
G
 
G
G
 
R
L
 
I
D
 
D
G
 
V
L
 
L
W
 
L
L
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
Y
 
V
A
 
H
A
 
V
V
 
A
G
 
G
E
 
S
L
 
V
S
 
L
Q
 
E
I
 
T
D
 
S
A
 
I
A
 
D
A
 
D
F
 
W
D
 
R
H
 
R
M
 
I
M
 
A
A
 
G
T
 
V
N
 
D
V
 
I
R
 
D
G
 
G
P
 
V
V
 
V
L
 
F
-
 
C
Q
 
S
M
 
K
A
 
F
A
 
A
L
 
L
A
 
P
G
 
H
K
 
L
L
 
L
N
 
K
P
 
T
G
 
K
A
 
G
S
 
C
V
 
I
V
 
V
V
 
N
T
 
T
A
 
A
S
|
S
T
x
V
S
|
S
A
 
G
Y
 
L
E
 
G
G
 
G
A
 
D
A
 
W
A
 
G
A
 
A
S
 
A
L
 
Y
Y
|
Y
S
 
C
A
 
A
T
 
A
K
|
K
G
 
G
A
 
A
L
 
V
I
 
V
S
 
N
L
 
L
T
 
T
R
 
R
C
 
A
W
 
M
A
 
A
S
 
L
A
 
D
L
 
H
G
 
G
E
 
G
K
 
D
N
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
S
L
 
V
V
 
C
P
 
P
G
 
S
P
 
L
I
x
V
D
 
K
T
|
T
D
 
N
F
 
M
R
 
T
H
 
N
F
 
G
M
 
W
R
 
P
D
 
Q
E
 
E
A
 
I
R
|
R
R
x
D
E
x
K
F
 
F
E
 
N
A
 
-
S
 
-
V
 
-
V
 
-
S
 
E
R
 
R
L
 
I
A
 
A
L
 
L
H
 
G
R
 
R
Q
 
A
G
 
A
T
 
E