SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing BWI76_RS16140 FitnessBrowser__Koxy:BWI76_RS16140 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 9 hits to proteins with known functional sites (download)

9cryB Ctfab e46s active site mutant inactive (see paper)
45% identity, 95% coverage: 6:212/218 of query aligns to 3:207/214 of 9cryB

query
sites
9cryB
R
 
K
D
 
E
D
 
K
M
 
I
A
 
A
Q
 
I
R
 
R
V
 
V
A
 
A
R
 
Q
D
 
E
I
 
L
P
 
K
E
 
K
G
 
G
A
 
Q
Y
 
L
V
 
V
N
 
N
L
 
L
R
 
G
I
 
I
G
 
G
L
 
L
P
 
P
T
 
T
R
 
L
I
 
V
A
 
A
N
 
N
Y
 
Y
L
 
I
P
 
P
A
 
K
D
 
D
K
 
I
E
 
H
I
 
V
F
 
F
L
 
F
H
 
Q
S
 
S
E
x
S
N
 
N
G
 
G
L
 
I
L
 
I
G
 
G
M
 
M
G
 
G
P
 
P
K
 
A
P
 
P
L
 
K
P
 
E
G
 
G
E
 
Y
E
 
E
D
 
N
P
 
S
E
 
D
L
 
L
I
 
T
N
 
N
A
 
A
G
 
G
K
 
A
E
 
S
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
L
 
A
L
 
L
E
 
P
G
 
G
G
 
A
C
 
M
Y
 
T
F
 
F
H
 
D
H
 
S
G
 
A
D
 
F
S
 
S
F
 
F
A
 
G
M
 
I
M
 
I
R
 
R
G
 
G
G
 
G
H
 
H
L
 
L
D
 
D
I
 
V
C
 
T
V
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
G
Y
 
L
Q
 
Q
V
 
V
S
 
D
A
 
E
S
 
E
G
 
G
D
 
H
L
 
L
A
 
A
N
 
N
W
 
W
S
 
M
T
 
I
G
 
P
A
 
G
P
 
-
D
 
K
A
 
M
I
 
I
P
 
P
A
 
G
V
 
M
G
 
G
G
|
G
A
 
A
M
 
M
D
 
D
L
 
L
A
 
V
I
 
T
G
 
G
A
 
A
R
 
K
Q
 
K
V
 
V
F
 
I
V
 
V
M
 
A
M
 
M
D
 
T
H
 
H
L
 
-
T
 
T
R
 
A
D
 
K
G
 
G
E
 
T
C
 
P
K
 
K
L
 
I
V
 
V
E
 
K
H
 
K
C
 
C
T
 
T
Y
 
L
P
 
P
L
 
L
T
 
T
G
 
S
V
 
I
G
 
R
C
 
K
V
 
V
S
 
D
R
 
L
I
 
I
Y
 
V
T
 
T
D
 
E
L
 
L
A
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
E
I
 
P
S
 
T
E
 
D
S
 
E
G
 
G
P
 
L
V
 
L
V
 
L
R
 
K
E
 
E
I
 
I
F
 
S
N
 
K
G
 
E
L
 
T
S
 
T
F
 
L
E
 
D
E
 
E
L
 
V
Q
 
L
R
 
K
I
 
L
T
 
T
P
 
E
V
 
A
A
 
K
L
 
L
T
 
I
F
 
I
A
 
A

9ctdB Ctfab f42ts45c mutant co-crystallized with acetyl-coa (see paper)
44% identity, 95% coverage: 6:212/218 of query aligns to 3:207/214 of 9ctdB

query
sites
9ctdB
R
x
K
D
 
E
D
 
K
M
 
I
A
 
A
Q
 
I
R
 
R
V
 
V
A
 
A
R
 
Q
D
 
E
I
 
L
P
 
K
E
 
K
G
 
G
A
 
Q
Y
 
L
V
 
V
N
 
N
L
 
L
R
 
G
I
 
I
G
 
G
L
|
L
P
 
P
T
 
T
R
 
L
I
 
V
A
 
A
N
 
N
Y
 
Y
L
 
I
P
 
P
A
 
K
D
 
D
K
 
I
E
 
H
I
 
V
F
 
T
L
 
F
H
 
Q
S
 
C
E
|
E
N
 
N
G
 
G
L
 
I
L
 
I
G
 
G
M
 
M
G
 
G
P
 
P
K
 
A
P
 
P
L
 
K
P
 
E
G
 
G
E
 
Y
E
 
E
D
 
N
P
 
S
E
 
D
L
 
L
I
 
T
N
 
N
A
 
A
G
 
G
K
 
A
E
 
S
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
L
 
A
L
 
L
E
 
P
G
 
G
G
 
A
C
 
M
Y
 
T
F
 
F
H
 
D
H
 
S
G
 
A
D
 
F
S
 
S
F
 
F
A
 
G
M
 
I
M
 
I
R
 
R
G
 
G
G
 
G
H
 
H
L
 
L
D
 
D
I
 
V
C
 
T
V
 
V
L
 
L
G
 
G
A
x
G
Y
x
L
Q
 
Q
V
 
V
S
 
D
A
 
E
S
 
E
G
 
G
D
 
H
L
 
L
A
 
A
N
 
N
W
 
W
S
 
M
T
 
I
G
 
P
A
 
G
P
 
-
D
 
K
A
x
M
I
 
I
P
 
P
A
 
G
V
 
M
G
|
G
G
|
G
A
 
A
M
 
M
D
 
D
L
 
L
A
 
V
I
 
T
G
 
G
A
 
A
R
 
K
Q
 
K
V
 
V
F
 
I
V
 
V
M
 
A
M
 
M
D
 
T
H
 
H
L
 
-
T
 
T
R
x
A
D
 
K
G
 
G
E
 
T
C
 
P
K
|
K
L
 
I
V
 
V
E
 
K
H
 
K
C
 
C
T
 
T
Y
 
L
P
 
P
L
 
L
T
 
T
G
 
S
V
 
I
G
 
R
C
 
K
V
 
V
S
 
D
R
 
L
I
 
I
Y
 
V
T
 
T
D
 
E
L
 
L
A
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
E
I
 
P
S
 
T
E
 
D
S
 
E
G
 
G
P
 
L
V
 
L
V
 
L
R
 
K
E
 
E
I
 
I
F
 
S
N
 
K
G
 
E
L
 
T
S
 
T
F
 
L
E
 
D
E
 
E
L
 
V
Q
 
L
R
 
K
I
 
L
T
 
T
P
 
E
V
 
A
A
 
K
L
 
L
T
 
I
F
 
I
A
 
A

Q29551 Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial; SCOT; 3-oxoacid CoA-transferase 1; Somatic-type succinyl-CoA:3-oxoacid CoA-transferase; SCOT-s; Succinate-coenzyme A transferase; Succinyl-CoA:3-oxoacid CoA transferase; EC 2.8.3.5 from Sus scrofa (Pig) (see 3 papers)
45% identity, 92% coverage: 6:205/218 of query aligns to 302:502/520 of Q29551

query
sites
Q29551
R
 
R
D
 
E
D
 
R
M
 
I
A
 
I
Q
 
K
R
 
R
V
 
A
A
 
A
R
 
L
D
 
E
I
 
F
P
 
E
E
 
D
G
 
G
A
 
M
Y
 
Y
V
 
A
N
 
N
L
 
L
R
 
G
I
 
I
G
 
G
L
 
I
P
 
P
T
 
L
R
 
L
I
 
A
A
 
S
N
 
N
Y
 
F
L
 
I
P
 
S
A
 
P
D
 
N
K
 
M
E
 
T
I
 
V
F
 
H
L
 
L
H
 
Q
S
 
S
E
|
E
N
 
N
G
 
G
L
 
I
L
 
L
G
 
G
M
 
L
G
 
G
P
 
P
K
 
Y
P
 
P
L
 
L
P
 
Q
G
 
N
E
 
E
E
 
V
D
 
D
P
 
A
E
 
D
L
 
L
I
 
I
N
 
N
A
 
A
G
 
G
K
 
K
E
 
E
Y
 
T
V
 
V
T
 
T
L
 
V
L
 
L
E
 
P
G
 
G
G
 
A
C
 
S
Y
 
Y
F
 
F
H
 
S
H
 
S
G
 
D
D
 
E
S
 
S
F
 
F
A
 
A
M
 
M
M
 
I
R
 
R
G
 
G
G
 
G
H
 
H
L
 
V
D
 
N
I
 
L
C
 
T
V
 
M
L
 
L
G
 
G
A
 
A
Y
 
M
Q
 
Q
V
 
V
S
 
S
A
 
K
S
 
Y
G
 
G
D
 
D
L
 
L
A
 
A
N
 
N
W
 
W
S
 
M
T
 
I
G
 
P
A
 
G
P
 
-
D
 
K
A
 
L
I
 
V
P
 
K
A
 
G
V
 
M
G
 
G
G
 
G
A
 
A
M
 
M
D
 
D
L
 
L
A
 
V
I
 
S
G
 
S
A
 
A
R
 
K
-
 
T
Q
 
K
V
 
V
F
 
V
V
 
V
M
 
T
M
 
M
D
 
E
H
 
H
L
 
S
T
 
A
R
 
K
D
 
G
G
 
N
E
 
A
C
 
H
K
 
K
L
 
I
V
 
M
E
 
E
H
 
K
C
 
C
T
 
T
Y
 
L
P
 
P
L
 
L
T
 
T
G
 
G
V
 
K
G
 
Q
C
 
C
V
 
V
S
 
N
R
 
R
I
 
I
Y
 
I
T
 
T
D
 
E
L
 
K
A
 
A
V
 
V
I
 
F
D
 
D
I
 
V
-
 
D
S
 
S
E
 
K
S
 
K
G
 
G
P
 
L
V
 
T
V
 
L
R
 
I
E
 
E
I
 
L
F
 
W
N
 
E
G
 
G
L
 
L
S
 
T
F
 
V
E
 
D
E
 
D
L
 
I
Q
 
K
R
 
K
I
 
S
T
 
T

Sites not aligning to the query:

1o9lA Succinate:coenzyme-a transferase (pig heart)
43% identity, 94% coverage: 1:205/218 of query aligns to 245:450/468 of 1o9lA

query
sites
1o9lA
M
 
V
Q
 
R
K
 
K
L
 
N
T
 
V
R
 
R
D
 
E
D
 
R
M
 
I
A
 
I
Q
 
K
R
 
R
V
 
A
A
 
A
R
 
L
D
 
E
I
 
F
P
 
E
E
 
D
G
 
G
A
 
M
Y
 
Y
V
 
A
N
 
N
L
 
L
R
 
G
I
 
I
G
 
G
L
 
I
P
 
P
T
 
L
R
 
L
I
 
A
A
 
S
N
 
N
Y
 
F
L
 
I
P
 
S
A
 
P
D
 
N
K
 
M
E
 
T
I
 
V
F
 
H
L
 
L
H
 
Q
S
 
S
E
 
E
N
 
N
G
 
G
L
 
I
L
 
L
G
 
G
M
 
L
G
 
G
P
 
P
K
 
Y
P
 
P
L
 
L
P
 
Q
G
 
N
E
 
E
E
 
V
D
 
D
P
 
A
E
 
D
L
 
L
I
 
I
N
 
N
A
 
A
G
 
G
K
 
K
E
 
E
Y
 
T
V
 
V
T
 
T
L
 
V
L
 
L
E
 
P
G
 
G
G
 
A
C
 
S
Y
 
Y
F
 
F
H
 
S
H
 
S
G
 
D
D
 
E
S
 
S
F
 
F
A
 
A
M
 
M
M
 
I
R
 
R
G
 
G
G
 
G
H
 
H
L
 
V
D
 
N
I
 
L
C
 
T
V
 
M
L
 
L
G
 
G
A
 
A
Y
 
M
Q
 
Q
V
 
V
S
 
S
A
 
K
S
 
Y
G
 
G
D
 
D
L
 
L
A
 
A
N
 
N
W
 
W
S
 
M
T
 
I
G
 
P
A
 
G
P
 
-
D
 
K
A
 
L
I
 
V
P
 
K
A
 
G
V
 
M
G
 
G
G
 
G
A
 
A
M
 
M
D
 
D
L
 
L
A
 
V
I
 
S
G
 
S
A
 
A
R
 
K
-
 
T
Q
 
K
V
 
V
F
 
V
V
 
V
M
 
T
M
 
M
D
 
E
H
 
H
L
 
S
T
 
A
R
 
K
D
 
G
G
 
N
E
 
A
C
 
H
K
 
K
L
 
I
V
 
M
E
 
E
H
 
K
C
 
C
T
 
T
Y
 
L
P
 
P
L
 
L
T
 
T
G
 
G
V
 
K
G
 
Q
C
 
C
V
 
V
S
 
N
R
 
R
I
 
I
Y
 
I
T
 
T
D
 
E
L
 
K
A
 
A
V
 
V
I
 
F
D
 
D
I
 
V
S
 
D
-
 
R
E
 
K
S
 
K
G
 
G
P
 
L
V
 
T
V
 
L
R
 
I
E
 
E
I
 
L
F
 
W
N
 
E
G
 
G
L
 
L
S
 
T
F
 
V
E
 
D
E
 
D
L
 
I
Q
 
K
R
 
K
I
 
S
T
 
T

Sites not aligning to the query:

3k6mC Dynamic domains of succinyl-coa:3-ketoacid-coenzyme a transferase from pig heart. (see paper)
44% identity, 92% coverage: 6:205/218 of query aligns to 249:449/466 of 3k6mC

query
sites
3k6mC
R
 
R
D
 
E
D
 
R
M
 
I
A
 
I
Q
 
K
R
 
R
V
 
A
A
 
A
R
 
L
D
 
E
I
 
F
P
 
E
E
 
D
G
 
G
A
 
M
Y
 
Y
V
 
A
N
 
N
L
 
L
R
 
G
I
|
I
G
 
G
L
 
I
P
 
P
T
 
L
R
 
L
I
 
A
A
 
S
N
 
N
Y
 
F
L
 
I
P
 
S
A
 
P
D
 
N
K
 
M
E
 
T
I
 
V
F
 
H
L
 
L
H
 
Q
S
 
S
E
|
E
N
 
N
G
 
G
L
 
I
L
 
L
G
 
G
M
 
L
G
 
G
P
 
P
K
 
Y
P
 
P
L
 
L
P
 
Q
G
 
N
E
 
E
E
 
V
D
 
D
P
 
A
E
 
D
L
 
L
I
 
I
N
 
N
A
|
A
G
 
G
K
 
K
E
 
E
Y
 
T
V
 
V
T
 
T
L
 
V
L
 
L
E
 
P
G
 
G
G
 
A
C
 
S
Y
 
Y
F
 
F
H
 
S
H
 
S
G
 
D
D
 
E
S
 
S
F
 
F
A
 
A
M
 
M
M
 
I
R
 
R
G
 
G
G
 
G
H
 
H
L
 
V
D
 
N
I
 
L
C
 
T
V
 
M
L
 
L
G
 
G
A
 
A
Y
 
M
Q
 
Q
V
 
V
S
 
S
A
 
K
S
 
Y
G
 
G
D
 
D
L
 
L
A
 
A
N
 
N
W
 
W
S
 
M
T
 
I
G
 
P
A
 
G
P
 
-
D
 
K
A
 
L
I
 
V
P
 
K
A
 
G
V
 
M
G
 
G
G
 
G
A
 
A
M
 
M
D
 
D
L
 
L
A
x
V
I
 
S
G
 
S
A
|
A
R
 
K
-
x
T
Q
 
K
V
 
V
F
 
V
V
 
V
M
 
T
M
 
M
D
 
E
H
 
H
L
 
S
T
 
A
R
 
K
D
 
G
G
 
N
E
 
A
C
 
H
K
 
K
L
 
I
V
 
M
E
 
E
H
 
K
C
 
C
T
 
T
Y
 
L
P
 
P
L
 
L
T
 
T
G
 
G
V
 
K
G
 
Q
C
|
C
V
 
V
S
x
N
R
 
R
I
 
I
Y
 
I
T
 
T
D
 
E
L
 
K
A
 
A
V
 
V
I
 
F
D
 
D
I
 
V
S
 
D
-
 
R
E
 
K
S
 
K
G
 
G
P
 
L
V
 
T
V
 
L
R
 
I
E
 
E
I
 
L
F
 
W
N
 
E
G
 
G
L
 
L
S
 
T
F
 
V
E
 
D
E
 
D
L
 
I
Q
 
K
R
 
K
I
 
S
T
 
T

Sites not aligning to the query:

3oxoE Succinyl-coa:3-ketoacid coa transferase from pig heart covalently bound to coa (see paper)
43% identity, 94% coverage: 1:205/218 of query aligns to 240:445/462 of 3oxoE

query
sites
3oxoE
M
 
I
Q
 
E
K
 
R
L
 
L
T
 
S
R
 
V
D
 
R
D
 
R
M
 
I
A
 
I
Q
 
K
R
 
R
V
 
A
A
 
A
R
 
L
D
 
E
I
 
F
P
 
E
E
 
D
G
 
G
A
 
M
Y
 
Y
V
 
A
N
 
N
L
 
L
R
 
G
I
|
I
G
|
G
L
x
I
P
 
P
T
 
L
R
 
L
I
 
A
A
 
S
N
 
N
Y
 
F
L
 
I
P
 
S
A
 
P
D
 
N
K
 
M
E
 
T
I
 
V
F
 
H
L
 
L
H
 
Q
S
 
S
E
|
E
N
 
N
G
 
G
L
 
I
L
 
L
G
 
G
M
 
L
G
 
G
P
 
P
K
 
Y
P
 
P
L
 
L
P
 
Q
G
 
N
E
 
E
E
 
V
D
 
D
P
 
A
E
 
D
L
 
L
I
 
I
N
 
N
A
 
A
G
 
G
K
 
K
E
 
E
Y
 
T
V
 
V
T
 
T
L
 
V
L
 
L
E
 
P
G
 
G
G
 
A
C
 
S
Y
 
Y
F
 
F
H
 
S
H
 
S
G
 
D
D
 
E
S
 
S
F
 
F
A
 
A
M
 
M
M
 
I
R
 
R
G
 
G
G
 
G
H
 
H
L
 
V
D
 
N
I
 
L
C
 
T
V
 
M
L
 
L
G
|
G
A
 
A
Y
x
M
Q
 
Q
V
 
V
S
 
S
A
 
K
S
 
Y
G
 
G
D
 
D
L
 
L
A
 
A
N
|
N
W
 
W
S
 
M
T
x
I
G
 
P
A
 
G
P
 
-
D
 
K
A
 
L
I
 
V
P
 
K
A
 
G
V
x
M
G
 
G
G
 
G
A
|
A
M
 
M
D
 
D
L
 
L
A
 
V
I
 
S
G
 
S
A
 
A
R
 
K
-
 
T
Q
 
K
V
 
V
F
 
V
V
 
V
M
 
T
M
 
M
D
 
E
H
 
H
L
 
S
T
 
A
R
x
K
D
 
G
G
 
N
E
 
A
C
 
H
K
 
K
L
 
I
V
 
M
E
 
E
H
 
K
C
 
C
T
 
T
Y
 
L
P
 
P
L
 
L
T
 
T
G
 
G
V
 
K
G
 
Q
C
 
C
V
 
V
S
 
N
R
 
R
I
 
I
Y
 
I
T
 
T
D
 
E
L
 
K
A
 
A
V
 
V
I
 
F
D
 
D
I
 
V
S
 
D
-
 
R
E
 
K
S
 
K
G
 
G
P
 
L
V
 
T
V
 
L
R
 
I
E
 
E
I
 
L
F
 
W
N
 
E
G
 
G
L
 
L
S
 
T
F
 
V
E
 
D
E
 
D
L
 
I
Q
 
K
R
 
K
I
 
S
T
 
T

8i3yD Crystal structure of asct from trypanosoma brucei in complex with succinyl-coa.
42% identity, 94% coverage: 6:209/218 of query aligns to 257:459/471 of 8i3yD

query
sites
8i3yD
R
 
R
D
 
Q
D
 
R
M
 
I
A
 
A
Q
 
R
R
 
R
V
 
A
A
 
A
R
 
L
D
 
E
I
 
F
P
 
A
E
 
N
G
 
G
A
 
M
Y
 
Y
V
 
V
N
 
N
L
 
L
R
 
G
I
 
I
G
 
G
L
 
I
P
 
P
T
 
T
R
 
E
I
 
S
A
 
S
N
 
N
Y
 
Y
L
 
I
P
 
P
A
 
A
D
 
G
K
 
V
E
 
N
I
 
V
F
 
V
L
 
L
H
 
Q
S
 
S
E
 
E
N
 
N
G
 
G
L
 
L
L
 
I
G
 
G
M
 
M
G
 
G
P
 
P
K
 
F
P
 
P
L
 
T
P
 
E
G
 
D
E
 
K
E
 
V
D
 
D
P
 
A
E
 
D
L
 
W
I
 
I
N
 
N
A
 
A
G
 
G
K
 
K
E
 
Q
Y
 
T
V
 
I
T
 
S
L
 
H
L
 
L
E
 
A
G
 
G
G
 
S
C
 
A
Y
 
L
F
 
F
H
 
D
H
 
S
G
 
A
D
 
T
S
 
S
F
 
F
A
 
A
M
 
M
M
 
I
R
 
R
G
 
G
G
 
G
H
 
H
L
 
M
D
 
D
I
 
L
C
 
T
V
 
M
L
 
L
G
 
G
A
 
A
Y
 
L
Q
 
E
V
 
V
S
 
A
A
 
A
S
 
N
G
 
G
D
 
D
L
 
L
A
 
A
N
 
N
W
 
F
S
 
M
T
 
I
G
 
P
A
 
G
P
 
-
D
 
K
A
 
L
I
 
V
P
 
K
A
 
G
V
 
P
G
 
G
G
 
G
A
 
A
M
 
M
D
 
D
L
 
L
A
 
V
I
 
S
G
 
C
A
 
G
R
 
T
Q
 
R
V
 
V
F
 
V
V
 
V
M
 
T
M
 
T
D
 
T
H
 
H
L
 
C
T
 
N
R
 
K
D
 
N
G
 
G
E
 
D
C
 
P
K
 
K
L
 
I
V
 
V
E
 
E
H
 
R
C
 
C
T
 
R
Y
 
L
P
 
P
L
 
V
T
 
T
G
 
G
V
 
K
G
 
H
C
 
C
V
 
V
S
 
C
R
 
R
I
 
I
Y
 
I
T
 
T
D
 
E
L
 
Y
A
 
A
V
 
V
I
 
F
D
 
D
I
 
V
S
 
V
E
 
D
S
 
G
G
 
R
P
 
L
V
 
V
V
 
L
R
 
K
E
 
E
I
 
I
F
 
A
N
 
E
G
 
D
L
 
T
S
 
T
F
 
V
E
 
D
E
 
Q
L
 
V
Q
 
K
R
 
K
I
 
L
T
 
T
P
 
G
V
 
V
A
 
G
L
 
F

Sites not aligning to the query:

8i40A Crystal structure of asct from trypanosoma brucei in complex with coa.
42% identity, 94% coverage: 6:209/218 of query aligns to 253:455/467 of 8i40A

query
sites
8i40A
R
 
R
D
 
Q
D
 
R
M
 
I
A
 
A
Q
 
R
R
 
R
V
 
A
A
 
A
R
 
L
D
 
E
I
 
F
P
 
A
E
 
N
G
 
G
A
 
M
Y
 
Y
V
 
V
N
 
N
L
 
L
R
 
G
I
|
I
G
 
G
L
x
I
P
 
P
T
 
T
R
 
E
I
 
S
A
 
S
N
 
N
Y
 
Y
L
 
I
P
 
P
A
 
A
D
 
G
K
 
V
E
 
N
I
 
V
F
 
V
L
 
L
H
 
Q
S
 
S
E
|
E
N
 
N
G
 
G
L
 
L
L
 
I
G
 
G
M
 
M
G
 
G
P
 
P
K
 
F
P
 
P
L
 
T
P
 
E
G
 
D
E
 
K
E
 
V
D
 
D
P
 
A
E
 
D
L
 
W
I
 
I
N
 
N
A
 
A
G
 
G
K
 
K
E
 
Q
Y
 
T
V
 
I
T
 
S
L
 
H
L
 
L
E
 
A
G
 
G
G
 
S
C
 
A
Y
 
L
F
 
F
H
 
D
H
 
S
G
 
A
D
 
T
S
 
S
F
 
F
A
 
A
M
 
M
M
 
I
R
 
R
G
 
G
G
 
G
H
 
H
L
 
M
D
 
D
I
 
L
C
 
T
V
 
M
L
 
L
G
|
G
A
 
A
Y
x
L
Q
 
E
V
 
V
S
 
A
A
 
A
S
 
N
G
 
G
D
 
D
L
 
L
A
 
A
N
|
N
W
 
F
S
 
M
T
 
I
G
 
P
A
 
G
P
 
-
D
 
K
A
 
L
I
 
V
P
 
K
A
 
G
V
 
P
G
 
G
G
|
G
A
 
A
M
 
M
D
 
D
L
 
L
A
 
V
I
 
S
G
 
C
A
 
G
R
 
T
Q
 
R
V
 
V
F
 
V
V
 
V
M
 
T
M
 
T
D
 
T
H
 
H
L
 
C
T
 
N
R
 
K
D
 
N
G
 
G
E
 
D
C
 
P
K
|
K
L
 
I
V
 
V
E
 
E
H
 
R
C
 
C
T
 
R
Y
 
L
P
 
P
L
 
V
T
 
T
G
 
G
V
 
K
G
 
H
C
 
C
V
 
V
S
 
C
R
 
R
I
 
I
Y
 
I
T
 
T
D
 
E
L
 
Y
A
 
A
V
 
V
I
 
F
D
 
D
I
 
V
S
 
V
E
 
D
S
 
G
G
 
R
P
 
L
V
 
V
V
 
L
R
 
K
E
 
E
I
 
I
F
 
A
N
 
E
G
 
D
L
 
T
S
 
T
F
 
V
E
 
D
E
 
Q
L
 
V
Q
 
K
R
 
K
I
 
L
T
 
T
P
 
G
V
 
V
A
 
G
L
 
F

8i3yA Crystal structure of asct from trypanosoma brucei in complex with succinyl-coa.
42% identity, 92% coverage: 9:209/218 of query aligns to 250:449/459 of 8i3yA

query
sites
8i3yA
M
 
I
A
 
A
Q
 
R
R
 
R
V
 
A
A
 
A
R
 
L
D
 
E
I
 
F
P
 
A
E
 
N
G
 
G
A
 
M
Y
 
Y
V
 
V
N
 
N
L
 
L
R
x
G
I
|
I
G
|
G
L
 
I
P
 
P
T
 
T
R
 
E
I
 
S
A
 
S
N
 
N
Y
 
Y
L
 
I
P
 
P
A
 
A
D
 
G
K
 
V
E
 
N
I
 
V
F
 
V
L
 
L
H
 
Q
S
 
S
E
|
E
N
 
N
G
 
G
L
 
L
L
 
I
G
 
G
M
 
M
G
 
G
P
 
P
K
 
F
P
 
P
L
 
T
P
 
E
G
 
D
E
 
K
E
 
V
D
 
D
P
 
A
E
 
D
L
 
W
I
 
I
N
 
N
A
|
A
G
 
G
K
|
K
E
 
Q
Y
 
T
V
 
I
T
 
S
L
 
H
L
 
L
E
 
A
G
 
G
G
 
S
C
 
A
Y
 
L
F
 
F
H
 
D
H
 
S
G
 
A
D
 
T
S
 
S
F
 
F
A
 
A
M
 
M
M
 
I
R
 
R
G
 
G
G
 
G
H
 
H
L
 
M
D
 
D
I
 
L
C
 
T
V
 
M
L
 
L
G
 
G
A
 
A
Y
 
L
Q
 
E
V
 
V
S
 
A
A
 
A
S
 
N
G
 
G
D
 
D
L
 
L
A
 
A
N
|
N
W
 
F
S
 
M
T
 
I
G
 
P
A
 
G
P
 
K
D
 
-
A
 
L
I
 
V
P
 
K
A
 
G
V
 
P
G
|
G
G
|
G
A
|
A
M
 
M
D
 
D
L
 
L
A
 
V
I
 
S
G
 
C
A
 
G
R
 
T
Q
 
R
V
 
V
F
 
V
V
 
V
M
 
T
M
 
T
D
 
T
H
 
H
L
 
C
T
x
N
R
x
K
D
 
N
G
 
G
E
 
D
C
 
P
K
|
K
L
 
I
V
 
V
E
 
E
H
 
R
C
 
C
T
 
R
Y
 
L
P
 
P
L
 
V
T
 
T
G
 
G
V
 
K
G
 
H
C
 
C
V
 
V
S
 
C
R
 
R
I
 
I
Y
 
I
T
 
T
D
 
E
L
 
Y
A
 
A
V
 
V
I
 
F
D
 
D
I
 
V
S
 
V
E
 
D
S
 
G
G
 
R
P
 
L
V
 
V
V
 
L
R
 
K
E
 
E
I
 
I
F
 
A
N
 
E
G
 
D
L
 
T
S
 
T
F
 
V
E
 
D
E
 
Q
L
 
V
Q
 
K
R
 
K
I
 
L
T
 
T
P
 
G
V
 
V
A
 
G
L
 
F

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>BWI76_RS16140 FitnessBrowser__Koxy:BWI76_RS16140
MQKLTRDDMAQRVARDIPEGAYVNLRIGLPTRIANYLPADKEIFLHSENGLLGMGPKPLP
GEEDPELINAGKEYVTLLEGGCYFHHGDSFAMMRGGHLDICVLGAYQVSASGDLANWSTG
APDAIPAVGGAMDLAIGARQVFVMMDHLTRDGECKLVEHCTYPLTGVGCVSRIYTDLAVI
DISESGPVVREIFNGLSFEELQRITPVALTFAQLAESA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory