SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing BWI76_RS16625 FitnessBrowser__Koxy:BWI76_RS16625 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5jydB Crystal structure of a putative short chain dehydrogenase from burkholderia cenocepacia
69% identity, 96% coverage: 11:293/294 of query aligns to 9:291/292 of 5jydB

query
sites
5jydB
Y
 
Y
P
 
P
R
 
K
P
 
P
P
 
P
F
 
F
V
 
P
D
 
H
Q
 
Q
P
 
V
Q
 
Q
S
 
A
P
 
P
P
 
P
G
 
G
L
 
L
A
 
A
E
 
S
E
 
R
M
 
M
K
 
Q
P
 
P
Q
 
R
P
 
P
D
 
D
H
 
H
G
 
G
E
 
E
L
 
Q
S
 
S
Y
 
Y
V
 
R
G
 
G
S
 
R
G
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
V
G
 
G
K
 
R
R
 
K
A
 
T
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
D
|
D
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
V
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
A
F
 
F
A
 
A
R
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
D
V
 
V
A
 
A
I
 
I
N
 
G
Y
 
Y
L
|
L
P
 
P
E
 
V
E
|
E
E
 
E
S
 
S
D
 
D
A
 
A
Q
 
R
T
 
E
V
 
V
I
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
I
E
 
R
A
 
A
E
 
A
G
 
G
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
A
I
 
L
P
 
P
G
 
G
D
|
D
V
x
I
R
 
R
D
 
D
E
 
E
S
 
T
F
 
F
C
 
C
E
 
Q
T
 
R
L
 
L
V
 
V
E
 
A
Q
 
R
A
 
A
A
 
A
S
 
E
E
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
x
A
R
 
R
Q
 
Q
Q
 
Q
Y
 
A
C
 
L
E
 
D
S
 
S
L
 
I
E
 
G
E
 
E
L
 
M
T
 
T
T
 
T
A
 
E
D
 
H
F
 
F
D
 
D
A
 
A
T
 
T
F
 
V
K
 
K
T
 
T
N
 
N
V
 
L
Y
 
Y
A
 
G
A
 
M
F
 
F
W
 
W
I
 
I
T
 
T
K
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
I
R
 
P
H
 
H
L
 
L
K
 
P
E
 
P
H
 
G
S
 
A
A
 
S
I
 
I
I
 
I
N
 
N
T
|
T
S
 
T
S
|
S
V
 
V
Q
 
Q
A
 
A
F
 
V
K
 
R
P
 
A
S
 
S
P
 
A
I
 
N
L
|
L
L
 
L
D
 
D
Y
|
Y
A
 
A
Q
 
T
T
 
T
K
|
K
A
 
A
C
 
G
L
 
I
V
 
I
A
 
A
F
 
F
T
 
T
K
 
R
S
 
S
L
 
L
A
 
A
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
P
 
P
K
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
P
|
P
Y
|
Y
W
 
W
T
|
T
V
 
P
L
|
L
Q
|
Q
S
 
S
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
D
x
P
E
 
E
K
 
T
V
 
V
R
 
V
Q
 
N
F
 
Y
G
 
A
A
 
A
D
 
G
T
 
S
P
 
P
L
 
Y
G
 
G
R
 
R
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
V
 
A
E
 
E
I
 
I
A
 
A
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
V
 
V
T
 
A
L
 
L
A
 
A
S
 
A
D
 
S
A
 
E
C
 
T
S
 
S
F
 
Y
T
 
A
S
 
N
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
W
 
W
C
 
G
S
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
D
 
L
G
 
G
V
 
I

3r3sA Structure of the ygha oxidoreductase from salmonella enterica
56% identity, 97% coverage: 8:291/294 of query aligns to 11:289/292 of 3r3sA

query
sites
3r3sA
T
 
T
A
 
G
K
 
E
Y
 
Y
P
 
P
R
 
K
P
 
-
P
 
-
F
 
-
V
 
-
D
 
-
Q
 
Q
P
 
K
Q
 
Q
S
 
P
P
 
A
P
 
P
G
 
G
L
 
V
A
 
Q
E
 
A
E
 
K
M
 
M
K
 
T
P
 
P
Q
 
V
P
 
P
D
 
D
H
 
C
G
 
G
E
 
E
L
 
K
S
 
S
Y
 
Y
V
 
V
G
 
G
S
 
S
G
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
K
G
 
D
K
 
R
R
 
K
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
D
|
D
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
V
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
A
F
 
Y
A
 
A
R
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
D
V
 
V
A
 
A
I
 
I
N
 
N
Y
 
Y
L
|
L
P
 
P
E
 
A
E
|
E
E
 
E
S
 
E
D
 
D
A
 
A
Q
 
Q
T
 
Q
V
 
V
I
 
K
A
 
A
L
 
L
I
 
I
E
 
E
A
 
E
E
 
C
G
 
G
R
 
R
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
L
I
 
L
P
 
P
G
 
G
D
|
D
V
x
L
R
 
S
D
 
D
E
 
E
S
 
S
F
 
F
C
 
A
E
 
R
T
 
S
L
 
L
V
 
V
E
 
H
Q
 
K
A
 
A
A
 
R
S
 
E
E
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
A
N
 
L
N
x
V
A
|
A
G
|
G
R
 
K
Q
 
Q
Q
 
T
Y
 
A
C
 
I
E
 
P
S
 
E
L
 
I
E
 
K
E
 
D
L
 
L
T
 
T
T
 
S
A
 
E
D
 
Q
F
 
F
D
 
Q
A
 
Q
T
 
T
F
 
F
K
 
A
T
 
V
N
 
N
V
 
V
Y
 
F
A
 
A
A
 
L
F
 
F
W
 
W
I
 
I
T
 
T
K
 
Q
A
 
E
A
 
A
L
 
I
R
 
P
H
 
L
L
 
L
K
 
P
E
 
K
H
 
G
S
 
A
A
 
S
I
 
I
I
 
I
N
 
T
T
 
T
S
 
S
S
|
S
V
 
I
Q
 
Q
A
 
A
F
 
Y
K
 
Q
P
 
P
S
 
S
P
 
P
I
 
H
L
|
L
L
 
L
D
 
D
Y
|
Y
A
 
A
Q
 
A
T
 
T
K
|
K
A
 
A
C
 
A
L
 
I
V
 
L
A
 
N
F
 
Y
T
 
S
K
 
R
S
 
G
L
 
L
A
 
A
K
 
K
Q
 
Q
L
 
V
G
 
A
P
 
E
K
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
I
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
P
 
P
Y
x
I
W
 
W
T
|
T
V
 
A
L
|
L
Q
|
Q
S
 
I
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
P
 
T
D
x
Q
E
 
D
K
 
K
V
 
I
R
 
P
Q
 
Q
F
 
F
G
 
G
A
 
Q
D
 
Q
T
 
T
P
 
P
L
 
M
G
 
K
R
 
R
P
 
A
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
V
 
A
E
 
E
I
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
V
Y
 
Y
V
 
V
T
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
Q
A
 
E
C
 
S
S
 
S
F
 
Y
T
 
V
S
 
T
G
 
A
Q
 
E
V
 
V
W
 
H
C
 
G
S
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G
D
 
E

P0AG84 Uncharacterized oxidoreductase YghA; EC 1.-.-.- from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
53% identity, 99% coverage: 1:291/294 of query aligns to 1:291/294 of P0AG84

query
sites
P0AG84
M
 
M
S
 
S
D
 
H
Y
 
L
A
 
K
N
 
D
N
 
P
T
 
T
A
 
T
K
 
Q
Y
 
Y
P
 
Y
R
 
T
P
 
G
P
 
E
F
 
Y
V
 
P
D
 
K
Q
 
Q
P
 
K
Q
 
Q
S
 
P
P
 
T
P
 
P
G
 
G
L
 
I
A
 
Q
E
 
A
E
 
K
M
 
M
K
 
T
P
 
P
Q
 
V
P
 
P
D
 
D
H
 
C
G
 
G
E
 
E
L
x
K
S
 
T
Y
 
Y
V
 
V
G
 
G
S
 
S
G
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
K
G
 
D
K
 
R
R
 
K
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
D
 
D
S
 
S
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
V
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
A
F
 
Y
A
 
A
R
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
D
V
 
V
A
 
A
I
 
I
N
 
S
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
E
 
V
E
 
E
E
 
E
S
 
E
D
 
D
A
 
A
Q
 
Q
T
 
D
V
 
V
I
 
K
A
 
K
L
 
I
I
 
I
E
 
E
A
 
E
E
 
C
G
 
G
R
 
R
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
L
I
 
L
P
 
P
G
 
G
D
 
D
V
 
L
R
 
S
D
 
D
E
 
E
S
 
K
F
 
F
C
 
A
E
 
R
T
 
S
L
 
L
V
 
V
E
 
H
Q
 
E
A
 
A
A
 
H
S
 
K
E
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
M
V
 
A
N
 
L
N
 
V
A
 
A
G
 
G
R
 
K
Q
 
Q
Q
 
V
Y
 
A
C
 
I
E
 
P
S
 
D
L
 
I
E
 
A
E
 
D
L
 
L
T
 
T
T
 
S
A
 
E
D
 
Q
F
 
F
D
 
Q
A
 
K
T
 
T
F
 
F
K
 
A
T
 
I
N
 
N
V
 
V
Y
 
F
A
 
A
A
 
L
F
 
F
W
 
W
I
 
L
T
 
T
K
 
Q
A
 
E
A
 
A
L
 
I
R
 
P
H
 
L
L
 
L
K
 
P
E
 
K
H
 
G
S
 
A
A
 
S
I
 
I
I
 
I
N
 
T
T
 
T
S
 
S
S
 
S
V
 
I
Q
 
Q
A
 
A
F
 
Y
K
 
Q
P
 
P
S
 
S
P
 
P
I
 
H
L
 
L
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
Q
 
A
T
 
T
K
 
K
A
 
A
C
 
A
L
 
I
V
 
L
A
 
N
F
 
Y
T
 
S
K
 
R
S
 
G
L
 
L
A
 
A
K
 
K
Q
 
Q
L
 
V
G
 
A
P
 
E
K
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
I
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
P
 
P
Y
 
I
W
 
W
T
 
T
V
 
A
L
 
L
Q
 
Q
S
 
I
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
P
 
T
D
 
Q
E
 
D
K
 
K
V
 
I
R
 
P
Q
 
Q
F
 
F
G
 
G
A
 
Q
D
 
Q
T
 
T
P
 
P
L
 
M
G
 
K
R
 
R
P
 
A
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
V
 
A
E
 
E
I
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
V
Y
 
Y
V
 
V
T
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
Q
A
 
E
C
 
S
S
 
S
F
 
Y
T
 
V
S
 
T
G
 
A
Q
 
E
V
 
V
W
 
H
C
 
G
S
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G
D
 
E

3ijrF 2.05 angstrom resolution crystal structure of a short chain dehydrogenase from bacillus anthracis str. 'Ames ancestor' in complex with NAD+
49% identity, 91% coverage: 24:290/294 of query aligns to 21:285/290 of 3ijrF

query
sites
3ijrF
P
|
P
G
 
G
L
 
I
A
 
E
E
 
S
E
 
L
M
 
M
K
 
N
P
 
P
Q
 
L
P
 
P
D
 
Q
H
 
F
G
 
E
E
 
D
L
 
P
S
 
N
Y
 
Y
V
 
K
G
 
G
S
 
S
G
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
K
G
 
G
K
 
K
R
 
N
A
 
V
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
G
D
|
D
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
V
 
V
A
 
S
I
 
I
A
 
A
F
 
F
A
 
A
R
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
N
V
 
I
A
 
A
I
 
I
N
 
A
Y
|
Y
L
|
L
P
 
-
E
 
D
E
|
E
E
 
E
S
 
G
D
 
D
A
 
A
Q
 
N
T
 
E
V
 
T
I
 
K
A
 
Q
L
 
Y
I
 
V
E
 
E
A
 
K
E
 
E
G
 
G
R
 
V
Q
 
K
A
 
C
V
 
V
A
 
L
I
 
L
P
 
P
G
|
G
D
|
D
V
x
L
R
 
S
D
 
D
E
 
E
S
 
Q
F
 
H
C
 
C
E
 
K
T
 
D
L
 
I
V
 
V
E
 
Q
Q
 
E
A
 
T
A
 
V
S
 
R
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
G
 
S
L
 
L
D
 
N
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
x
V
G
x
A
R
x
Q
Q
 
Q
Q
 
Y
Y
 
P
C
 
Q
E
 
Q
S
 
G
L
 
L
E
 
E
E
 
Y
L
 
I
T
 
T
T
 
A
A
 
E
D
 
Q
F
 
L
D
 
E
A
 
K
T
 
T
F
 
F
K
 
R
T
x
I
N
 
N
V
 
I
Y
 
F
A
 
S
A
 
Y
F
 
F
W
 
H
I
 
V
T
 
T
K
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
S
H
 
H
L
 
L
K
 
K
E
 
Q
H
 
G
S
 
D
A
 
V
I
 
I
I
 
I
N
 
N
T
|
T
S
 
A
S
|
S
V
 
I
Q
 
V
A
 
A
F
 
Y
K
 
E
P
 
G
S
 
N
P
 
E
I
 
T
L
|
L
L
 
I
D
 
D
Y
|
Y
A
 
S
Q
 
A
T
 
T
K
|
K
A
 
G
C
 
A
L
 
I
V
 
V
A
 
A
F
 
F
T
 
T
K
 
R
S
 
S
L
 
L
A
 
S
K
 
Q
Q
 
S
L
 
L
G
 
V
P
 
Q
K
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
G
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
P
|
P
Y
x
I
W
 
W
T
|
T
V
 
P
L
|
L
Q
 
I
S
 
P
S
 
S
G
 
S
G
 
F
Q
 
D
P
 
-
D
 
E
E
x
K
K
 
K
V
 
V
R
 
S
Q
 
Q
F
 
F
G
 
G
A
 
S
D
 
N
T
 
V
P
 
P
L
 
M
G
 
Q
R
 
R
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
V
 
Y
E
 
E
I
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
A
Y
 
Y
V
 
V
T
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
S
A
 
D
C
 
S
S
 
S
F
 
Y
T
 
V
S
 
T
G
 
G
Q
 
Q
V
 
M
W
 
I
C
 
H
S
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

3i3oA 2.06 angstrom resolution crystal structure of a short chain dehydrogenase from bacillus anthracis str. 'Ames ancestor' in complex with NAD-acetone
48% identity, 94% coverage: 16:290/294 of query aligns to 1:277/282 of 3i3oA

query
sites
3i3oA
F
 
F
V
 
V
D
 
T
Q
 
M
P
 
P
-
 
A
-
 
Q
-
 
H
-
 
Q
Q
 
N
S
 
K
P
 
Q
P
 
P
G
 
G
L
 
I
A
 
E
E
 
S
E
 
L
M
 
M
K
 
N
P
 
P
Q
 
L
P
 
P
D
 
Q
H
 
F
G
 
E
E
 
D
L
 
P
S
 
N
Y
 
Y
V
 
K
G
 
G
S
 
S
G
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
K
G
 
G
K
 
K
R
 
N
A
 
V
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
D
|
D
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
V
 
V
A
 
S
I
 
I
A
 
A
F
 
F
A
 
A
R
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
N
V
 
I
A
 
A
I
 
I
N
 
A
Y
|
Y
L
|
L
P
 
-
E
 
D
E
|
E
E
 
E
S
 
G
D
 
D
A
 
A
Q
 
N
T
 
E
V
 
T
I
 
K
A
 
Q
L
 
Y
I
 
V
E
 
E
A
 
K
E
 
E
G
 
G
R
 
V
Q
 
K
A
 
C
V
 
V
A
 
L
I
 
L
P
 
P
G
|
G
D
|
D
V
x
L
R
 
S
D
 
D
E
 
E
S
 
Q
F
 
H
C
 
C
E
 
K
T
 
D
L
 
I
V
 
V
E
 
Q
Q
 
E
A
 
T
A
 
V
S
 
R
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
G
 
S
L
 
L
D
 
N
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
x
V
G
x
A
R
x
Q
Q
|
Q
Q
 
Y
Y
 
P
C
 
Q
E
 
Q
S
 
G
L
 
L
E
 
E
E
 
Y
L
 
I
T
 
T
T
 
A
A
 
E
D
 
Q
F
 
L
D
 
E
A
 
K
T
 
T
F
 
F
K
 
R
T
x
I
N
 
N
V
 
I
Y
 
F
A
 
S
A
 
Y
F
 
F
W
 
H
I
 
V
T
 
T
K
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
S
H
 
H
L
 
L
K
 
K
E
 
Q
H
 
G
S
 
D
A
 
V
I
 
I
I
 
I
N
 
N
T
|
T
S
 
A
S
|
S
V
 
I
Q
 
V
A
 
A
F
 
Y
K
 
E
P
 
G
S
 
N
P
 
E
I
 
T
L
|
L
L
 
I
D
 
D
Y
|
Y
A
 
S
Q
 
A
T
 
T
K
|
K
A
 
G
C
 
A
L
 
I
V
 
V
A
 
A
F
 
F
T
 
T
K
 
R
S
 
S
L
 
L
A
 
S
K
 
Q
Q
 
S
L
 
L
G
 
V
P
 
Q
K
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
G
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
P
 
P
Y
x
I
W
 
W
T
|
T
V
 
P
L
|
L
Q
 
I
S
 
P
S
 
S
G
 
S
G
 
F
Q
 
D
P
 
-
D
 
E
E
x
K
K
 
K
V
 
V
R
 
S
Q
 
Q
F
 
F
G
 
G
A
 
S
D
 
N
T
 
V
P
 
P
L
 
M
G
 
Q
R
 
R
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
V
 
Y
E
 
E
I
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
A
Y
 
Y
V
 
V
T
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
S
A
 
D
C
 
S
S
 
S
F
 
Y
T
 
V
S
 
T
G
 
G
Q
 
Q
V
 
M
W
 
I
C
 
H
S
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

7v0hG Crystal structure of putative glucose 1-dehydrogenase from burkholderia cenocepacia in complex with NADP and a potential reaction product
40% identity, 83% coverage: 46:290/294 of query aligns to 8:251/253 of 7v0hG

query
sites
7v0hG
R
 
K
L
 
L
A
 
A
G
 
G
K
 
K
R
 
V
A
 
A
L
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
D
x
S
S
x
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
A
A
 
A
V
 
I
A
 
A
I
 
K
A
 
A
F
 
L
A
 
A
R
 
D
E
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
A
V
 
V
A
 
V
I
 
V
N
 
N
Y
 
Y
L
x
A
P
x
S
E
x
S
E
 
K
E
 
A
S
 
G
D
 
A
A
 
D
Q
 
A
T
 
V
V
 
V
I
 
S
A
 
A
L
 
I
I
 
T
E
 
E
A
 
A
E
 
G
G
 
G
R
 
R
Q
 
-
A
 
A
V
 
V
A
 
A
I
 
V
P
 
G
G
|
G
D
|
D
V
|
V
R
 
S
D
 
K
E
 
A
S
 
A
F
 
D
C
 
A
E
 
Q
T
 
R
L
 
I
V
 
V
E
 
D
Q
 
T
A
 
A
A
 
I
S
 
E
E
 
T
L
 
Y
G
 
G
G
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
x
S
G
|
G
R
 
V
Q
x
Y
Q
 
E
Y
 
F
C
 
A
E
 
P
S
 
-
L
 
I
E
 
E
E
 
A
L
 
I
T
 
T
T
 
E
A
 
E
D
 
H
F
 
Y
D
 
R
A
 
R
T
 
Q
F
 
F
K
 
D
T
 
T
N
 
N
V
 
V
Y
 
F
A
 
G
A
 
V
F
 
L
W
 
L
I
 
T
T
 
T
K
 
Q
A
 
A
A
 
A
L
 
V
R
 
K
H
 
H
L
 
L
K
 
G
E
 
E
H
 
G
S
 
A
A
 
S
I
 
I
I
 
I
N
 
N
T
x
I
S
 
S
S
|
S
V
 
V
Q
 
V
A
 
T
F
 
S
K
 
I
P
 
T
S
 
P
P
 
P
I
 
A
L
 
S
L
 
A
D
 
V
Y
|
Y
A
 
S
Q
 
G
T
 
T
K
|
K
A
 
G
C
 
A
L
 
V
V
 
D
A
 
A
F
 
I
T
 
T
K
 
G
S
 
V
L
 
L
A
 
A
K
 
L
Q
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
P
K
 
R
G
 
K
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
I
A
 
N
P
|
P
G
|
G
P
x
M
Y
x
I
W
 
V
T
|
T
V
 
E
L
x
G
Q
x
T
S
 
H
S
 
S
G
 
A
G
 
G
Q
x
I
P
 
I
D
 
G
E
 
S
K
 
D
V
 
L
R
 
E
-
 
A
Q
 
Q
F
 
V
G
 
L
A
 
G
D
 
Q
T
 
T
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
R
P
 
L
G
 
G
Q
 
E
P
 
P
V
 
N
E
 
D
I
 
I
A
 
A
P
 
S
L
 
V
Y
 
A
V
 
V
T
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
D
C
 
A
S
 
R
F
 
W
T
 
M
S
 
T
G
 
G
Q
 
E
V
 
H
W
 
L
C
 
V
S
 
V
D
 
S
G
 
G
G
 
G

P40288 Glucose 1-dehydrogenase; EC 1.1.1.47 from Priestia megaterium (Bacillus megaterium) (see 2 papers)
36% identity, 83% coverage: 47:290/294 of query aligns to 5:249/261 of P40288

query
sites
P40288
L
 
L
A
 
E
G
 
G
K
 
K
R
 
V
A
 
V
L
x
V
I
|
I
T
|
T
G
|
G
G
x
S
D
x
S
S
x
T
G
|
G
I
x
L
G
|
G
R
x
K
A
x
S
V
x
M
A
|
A
I
|
I
A
x
R
F
|
F
A
|
A
R
x
T
E
|
E
G
x
K
A
|
A
D
x
K
V
|
V
A
x
V
I
 
V
N
 
N
Y
 
Y
L
 
R
P
 
S
E
 
K
E
 
E
E
 
D
S
 
-
D
 
E
A
 
A
Q
 
N
T
 
S
V
 
V
I
 
L
A
 
E
L
 
E
I
 
I
E
 
K
A
 
K
E
 
V
G
 
G
R
 
G
Q
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
A
I
 
V
P
 
K
G
 
G
D
 
D
V
 
V
R
 
T
D
 
V
E
 
E
S
 
S
F
 
D
C
 
V
E
 
I
T
 
N
L
 
L
V
 
V
E
 
Q
Q
 
S
A
 
A
A
 
I
S
 
K
E
 
E
L
 
F
G
 
G
G
 
K
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
M
V
 
I
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
R
 
L
Q
x
E
Q
 
N
Y
 
P
C
 
V
E
 
S
S
 
S
L
 
-
E
 
H
E
 
E
L
 
M
T
 
S
T
 
L
A
 
S
D
|
D
F
 
W
D
 
N
A
 
K
T
x
V
F
 
I
K
 
D
T
 
T
N
 
N
V
 
L
Y
 
T
A
 
G
A
 
A
F
 
F
W
 
L
I
 
G
T
 
S
K
 
R
A
 
E
A
 
A
L
 
I
R
 
K
H
 
Y
L
 
F
K
 
V
E
|
E
H
 
N
S
 
D
-
 
I
-
 
K
-
 
G
A
 
T
I
 
V
I
 
I
N
 
N
T
 
M
S
 
S
S
 
S
V
 
V
Q
 
H
A
 
E
F
 
K
K
 
I
P
 
P
S
 
W
P
 
P
I
 
L
L
 
F
L
 
V
D
 
H
Y
 
Y
A
 
A
Q
 
A
T
 
S
K
 
K
A
 
G
C
 
G
L
 
M
V
 
K
A
 
L
F
 
M
T
 
T
K
 
E
S
 
T
L
 
L
A
 
A
K
 
L
Q
 
E
L
 
Y
G
 
A
P
 
P
K
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
|
V
N
 
N
A
 
N
V
 
I
A
 
G
P
 
P
G
 
G
P
 
A
Y
 
I
W
 
N
T
 
T
V
x
P
L
 
I
Q
 
N
S
 
A
S
 
E
G
 
K
G
 
F
Q
 
A
P
 
D
D
 
P
E
 
E
K
 
Q
V
 
R
R
 
A
Q
 
D
F
 
V
G
x
E
A
 
S
D
 
M
T
 
I
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
x
Y
P
 
I
G
 
G
Q
 
E
P
 
P
V
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
P
 
A
L
 
V
Y
 
A
V
 
A
T
 
W
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
S
A
 
E
C
 
A
S
 
S
F
 
Y
T
 
V
S
 
T
G
 
G
Q
 
I
V
 
T
W
 
L
C
 
F
S
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

1g6kA Crystal structure of glucose dehydrogenase mutant e96a complexed with NAD+
36% identity, 83% coverage: 47:290/294 of query aligns to 5:249/261 of 1g6kA

query
sites
1g6kA
L
 
L
A
 
E
G
 
G
K
 
K
R
 
V
A
 
V
L
 
V
I
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
S
D
 
S
S
x
T
G
|
G
I
x
L
G
 
G
R
 
K
A
 
S
V
 
M
A
 
A
I
 
I
A
 
R
F
 
F
A
 
A
R
 
T
E
 
E
G
 
K
A
 
A
D
 
K
V
 
V
A
 
V
I
 
V
N
 
N
Y
 
Y
L
x
R
P
 
S
E
 
K
E
 
E
E
 
D
S
 
-
D
 
E
A
 
A
Q
 
N
T
 
S
V
 
V
I
 
L
A
 
E
L
 
E
I
 
I
E
 
K
A
 
K
E
 
V
G
 
G
R
 
G
Q
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
A
I
 
V
P
 
K
G
 
G
D
|
D
V
|
V
R
 
T
D
 
V
E
 
E
S
 
S
F
 
D
C
 
V
E
 
I
T
 
N
L
 
L
V
 
V
E
 
Q
Q
 
S
A
 
A
A
 
I
S
 
K
E
 
E
L
 
F
G
 
G
G
 
K
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
M
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
R
 
L
Q
 
A
Q
 
N
Y
 
P
C
 
V
E
 
S
S
 
S
L
 
-
E
 
H
E
 
E
L
 
M
T
 
S
T
 
L
A
 
S
D
 
D
F
 
W
D
 
N
A
 
K
T
 
V
F
 
I
K
 
D
T
 
T
N
 
N
V
 
L
Y
 
T
A
 
G
A
 
A
F
 
F
W
 
L
I
 
G
T
 
S
K
 
R
A
 
E
A
 
A
L
 
I
R
 
K
H
 
Y
L
 
F
K
 
V
E
 
E
H
 
N
S
 
D
-
 
I
-
 
K
-
 
G
A
 
T
I
 
V
I
 
I
N
 
N
T
x
M
S
 
S
S
|
S
V
 
V
Q
 
H
A
 
E
F
 
K
K
 
I
P
 
P
S
 
W
P
 
P
I
 
L
L
 
F
L
 
V
D
 
H
Y
|
Y
A
 
A
Q
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
G
C
 
G
L
 
M
V
 
K
A
 
L
F
 
M
T
 
T
K
 
E
S
 
T
L
 
L
A
 
A
K
 
L
Q
 
E
L
 
Y
G
 
A
P
 
P
K
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
N
V
 
I
A
 
G
P
|
P
G
|
G
P
 
A
Y
x
I
W
 
N
T
|
T
V
 
P
L
 
I
Q
 
N
S
 
A
S
 
E
G
 
K
G
 
F
Q
 
A
P
 
D
D
 
P
E
 
E
K
 
Q
V
 
R
R
 
A
Q
 
D
F
 
V
G
 
E
A
 
S
D
 
M
T
 
I
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
Y
P
 
I
G
 
G
Q
 
E
P
 
P
V
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
P
 
A
L
 
V
Y
 
A
V
 
A
T
 
W
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
S
A
 
E
C
 
A
S
 
S
F
 
Y
T
 
V
S
 
T
G
 
G
Q
 
I
V
 
T
W
 
L
C
 
F
S
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Q9ZNN8 L-2,3-butanediol dehydrogenase; L-BDH; (S,S)-butanediol dehydrogenase; Diacetyl reductase [(S)-acetoin forming]; EC 1.1.1.76; EC 1.1.1.304 from Corynebacterium glutamicum (Brevibacterium saccharolyticum) (see paper)
36% identity, 82% coverage: 50:290/294 of query aligns to 3:254/258 of Q9ZNN8

query
sites
Q9ZNN8
K
 
K
R
 
V
A
 
A
L
 
M
I
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
D
 
A
S
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
G
V
 
I
A
 
S
I
 
E
A
 
K
F
 
L
A
 
A
R
 
A
E
 
D
G
 
G
A
 
F
D
 
D
V
 
I
A
 
A
I
 
V
N
 
A
Y
x
D
L
 
L
P
 
P
E
 
Q
E
x
Q
E
 
E
S
 
E
D
 
Q
A
 
A
Q
 
A
T
 
E
V
 
T
I
 
I
A
 
K
L
 
L
I
 
I
E
 
E
A
 
A
E
 
A
G
 
D
R
 
Q
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
F
I
 
V
P
 
G
G
 
L
D
|
D
V
|
V
R
 
T
D
 
D
E
 
K
S
 
A
F
 
N
C
 
F
E
 
D
T
 
S
L
 
A
V
 
I
E
 
D
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
S
 
E
E
 
K
L
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
F
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
R
 
I
Q
 
A
Q
 
Q
Y
 
-
C
 
I
E
 
K
S
 
P
L
 
L
E
 
L
E
 
E
L
 
V
T
 
T
T
 
E
A
 
E
D
 
D
F
 
L
D
 
K
A
 
Q
T
 
I
F
 
Y
K
 
S
T
 
V
N
 
N
V
 
V
Y
 
F
A
 
S
A
 
V
F
 
F
W
 
F
I
 
G
T
 
I
K
 
Q
A
 
A
A
 
A
L
 
S
R
 
R
H
 
K
L
 
F
K
 
D
E
 
E
-
 
L
-
 
G
-
 
V
-
 
K
-
 
G
-
 
K
H
 
I
S
 
I
A
 
N
I
 
A
I
 
A
N
 
S
T
x
I
S
 
A
S
 
A
V
 
I
Q
 
Q
A
 
G
F
|
F
K
 
-
P
 
-
S
 
-
P
 
P
I
 
I
L
 
L
L
 
S
D
 
A
Y
|
Y
A
 
S
Q
 
T
T
 
T
K
|
K
A
 
F
C
 
A
L
 
V
V
 
R
A
 
G
F
 
L
T
 
T
K
 
Q
S
 
A
L
 
A
A
 
A
K
 
Q
Q
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
P
K
 
K
G
 
G
I
 
H
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
Y
A
 
A
P
|
P
G
|
G
P
x
I
Y
x
V
W
x
G
T
|
T
-
 
G
-
 
M
-
 
W
-
 
E
-
 
Q
-
 
I
-
 
D
-
 
A
V
 
E
L
 
L
Q
 
S
S
 
K
S
 
I
G
 
N
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
-
 
I
D
 
G
E
 
E
K
 
N
V
 
F
R
 
K
Q
 
E
F
 
Y
G
 
S
A
 
S
D
 
S
T
 
I
P
 
A
L
 
L
G
 
G
R
 
R
P
 
P
G
 
S
Q
 
V
P
 
P
V
 
E
E
 
D
I
 
V
A
 
A
P
 
G
L
 
L
Y
 
V
V
 
S
T
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
E
A
 
N
C
 
S
S
 
N
F
 
Y
T
 
V
S
 
T
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
W
 
M
C
 
L
S
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

3a28C Crystal structure of l-2,3-butanediol dehydrogenase (see paper)
36% identity, 82% coverage: 50:290/294 of query aligns to 2:253/257 of 3a28C

query
sites
3a28C
K
 
K
R
 
V
A
 
A
L
 
M
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
D
 
A
S
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
G
V
 
I
A
 
S
I
 
E
A
 
K
F
 
L
A
 
A
R
 
A
E
 
D
G
 
G
A
 
F
D
 
D
V
 
I
A
 
A
I
 
V
N
 
A
Y
x
D
L
|
L
P
 
P
E
 
Q
E
x
Q
E
 
E
S
 
E
D
 
Q
A
 
A
Q
 
A
T
 
E
V
 
T
I
 
I
A
 
K
L
 
L
I
 
I
E
 
E
A
 
A
E
 
A
G
 
D
R
 
Q
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
F
I
 
V
P
 
G
G
x
L
D
|
D
V
|
V
R
 
T
D
 
D
E
 
K
S
 
A
F
 
N
C
 
F
E
 
D
T
 
S
L
 
A
V
 
I
E
 
D
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
S
 
E
E
 
K
L
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
F
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
R
 
I
Q
 
A
Q
 
Q
Y
 
-
C
 
I
E
 
K
S
 
P
L
 
L
E
 
L
E
 
E
L
 
V
T
 
T
T
 
E
A
 
E
D
 
D
F
 
L
D
 
K
A
 
Q
T
 
I
F
 
Y
K
 
S
T
 
V
N
 
N
V
 
V
Y
 
F
A
 
S
A
 
V
F
 
F
W
 
F
I
 
G
T
 
I
K
 
Q
A
 
A
A
 
A
L
 
S
R
 
R
H
 
K
L
 
F
K
 
D
E
 
E
-
 
L
-
 
G
-
 
V
-
 
K
-
 
G
-
 
K
H
 
I
S
 
I
A
 
N
I
 
A
I
 
A
N
x
S
T
 
I
S
 
A
S
 
A
V
 
I
Q
 
Q
A
 
G
F
 
F
K
 
-
P
 
-
S
 
-
P
 
P
I
 
I
L
 
L
L
 
S
D
 
A
Y
|
Y
A
 
S
Q
 
T
T
 
T
K
|
K
A
 
F
C
 
A
L
 
V
V
 
R
A
 
G
F
 
L
T
 
T
K
 
Q
S
 
A
L
 
A
A
 
A
K
 
Q
Q
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
P
K
 
K
G
 
G
I
 
H
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
Y
A
 
A
P
|
P
G
 
G
P
 
I
Y
x
V
W
 
G
T
|
T
-
 
G
-
x
M
-
x
W
-
 
E
-
 
Q
-
 
I
-
 
D
-
 
A
V
 
E
L
|
L
Q
 
S
S
 
K
S
 
I
G
 
N
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
-
 
I
D
 
G
E
 
E
K
 
N
V
 
F
R
 
K
Q
 
E
F
 
Y
G
 
S
A
 
S
D
 
S
T
 
I
P
 
A
L
 
L
G
 
G
R
 
R
P
 
P
G
 
S
Q
 
V
P
 
P
V
 
E
E
 
D
I
 
V
A
 
A
P
 
G
L
 
L
Y
 
V
V
 
S
T
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
E
A
 
N
C
 
S
S
 
N
F
 
Y
T
 
V
S
 
T
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
W
 
M
C
 
L
S
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

3ay6B Crystal structure of bacillus megaterium glucose dehydrogenase 4 a258f mutant in complex with nadh and d-glucose (see paper)
35% identity, 83% coverage: 47:290/294 of query aligns to 11:255/267 of 3ay6B

query
sites
3ay6B
L
 
L
A
 
K
G
 
D
K
 
K
R
 
V
A
 
V
L
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
D
 
S
S
x
T
G
|
G
I
x
L
G
 
G
R
 
R
A
 
A
V
 
M
A
 
A
I
 
V
A
 
R
F
 
F
A
 
G
R
 
Q
E
 
E
G
 
E
A
 
A
D
 
K
V
 
V
A
 
V
I
 
I
N
 
N
Y
 
Y
L
x
Y
P
 
N
E
 
N
E
 
E
E
 
E
S
 
-
D
 
E
A
 
A
Q
 
L
T
 
D
V
 
A
I
 
K
A
 
K
L
 
E
I
 
V
E
 
E
A
 
E
E
 
A
G
 
G
R
 
G
Q
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
I
I
 
V
P
 
Q
G
 
G
D
|
D
V
|
V
R
 
T
D
 
K
E
 
E
S
 
E
F
 
D
C
 
V
E
 
V
T
 
N
L
 
L
V
 
V
E
 
Q
Q
 
T
A
 
A
A
 
I
S
 
K
E
 
E
L
 
F
G
 
G
G
 
T
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
M
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
R
x
V
Q
x
E
Q
 
N
Y
 
P
C
 
V
E
 
P
S
 
S
L
 
-
E
 
H
E
 
E
L
 
L
T
 
S
T
 
L
A
 
D
D
 
N
F
 
W
D
 
N
A
 
K
T
 
V
F
 
I
K
 
D
T
 
T
N
 
N
V
 
L
Y
 
T
A
 
G
A
 
A
F
 
F
W
 
L
I
 
G
T
 
S
K
 
R
A
 
E
A
 
A
L
 
I
R
 
K
H
 
Y
L
 
F
K
 
V
E
 
E
H
 
N
S
 
D
A
 
I
-
 
K
-
 
G
-
 
N
I
 
V
I
 
I
N
 
N
T
x
M
S
 
S
S
|
S
V
 
V
Q
x
H
A
 
E
F
 
M
K
 
I
P
 
P
S
x
W
P
 
P
I
 
L
L
 
F
L
 
V
D
 
H
Y
|
Y
A
 
A
Q
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
G
C
 
G
L
 
M
V
 
K
A
 
L
F
 
M
T
 
T
K
 
E
S
 
T
L
 
L
A
 
A
K
 
L
Q
 
E
L
 
Y
G
 
A
P
 
P
K
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
N
V
 
I
A
 
G
P
|
P
G
|
G
P
 
A
Y
x
M
W
 
N
T
|
T
V
x
P
L
x
I
Q
x
N
S
 
A
S
 
E
G
x
K
G
 
F
Q
 
A
P
 
D
D
 
P
E
 
V
K
 
Q
V
 
R
R
 
A
Q
 
D
F
 
V
G
 
E
A
 
S
D
 
M
T
 
I
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
Y
P
 
I
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
V
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
P
 
A
L
 
V
Y
 
A
V
 
A
T
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
S
A
 
Q
C
 
A
S
 
S
F
 
Y
T
 
V
S
 
T
G
 
G
Q
 
I
V
 
T
W
 
L
C
 
F
S
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G

3osuA Crystal structure of the 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase, fabg, from staphylococcus aureus
38% identity, 82% coverage: 50:290/294 of query aligns to 5:243/246 of 3osuA

query
sites
3osuA
K
 
K
R
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
D
 
S
S
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
S
V
 
I
A
 
A
I
 
L
A
 
Q
F
 
L
A
 
A
R
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
Y
D
 
N
V
 
V
A
 
A
I
 
V
N
 
N
Y
 
Y
L
 
A
P
 
G
E
 
S
E
 
K
E
 
E
S
 
K
D
 
-
A
 
A
Q
 
E
T
 
A
V
 
V
I
 
V
A
 
E
L
 
E
I
 
I
E
 
K
A
 
A
E
 
K
G
 
G
R
 
V
Q
 
D
A
 
S
V
 
F
A
 
A
I
 
I
P
 
Q
G
 
A
D
 
N
V
 
V
R
 
A
D
 
D
E
 
A
S
 
D
F
 
E
C
 
V
E
 
K
T
 
A
L
 
M
V
 
I
E
 
K
Q
 
E
A
 
V
A
 
V
S
 
S
E
 
Q
L
 
F
G
 
G
G
 
S
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
-
 
I
-
 
T
R
 
R
Q
 
D
Q
 
N
Y
 
L
C
 
L
E
 
M
S
 
R
L
 
M
E
 
K
E
 
E
L
 
-
T
 
-
T
 
-
A
 
Q
D
 
E
F
 
W
D
 
D
A
 
D
T
 
V
F
 
I
K
 
D
T
 
T
N
 
N
V
 
L
Y
 
K
A
 
G
A
 
V
F
 
F
-
 
N
W
 
C
I
 
I
T
 
Q
K
 
K
A
 
A
A
 
T
L
 
P
R
 
Q
H
 
M
L
 
L
K
 
R
E
 
Q
H
 
R
S
 
S
-
 
G
A
 
A
I
 
I
I
 
I
N
 
N
T
 
L
S
 
S
S
|
S
V
 
V
Q
 
V
A
 
G
F
 
A
K
 
V
P
 
G
S
 
N
P
 
P
I
 
G
L
x
Q
L
 
A
D
 
N
Y
|
Y
A
 
V
Q
 
A
T
 
T
K
|
K
A
 
A
C
 
G
L
 
V
V
 
I
A
 
G
F
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
S
L
 
A
A
 
A
K
 
R
Q
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
S
K
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
P
 
-
Y
 
-
W
 
F
T
 
I
V
 
V
L
 
S
Q
 
D
S
 
M
S
 
T
G
 
D
G
 
A
Q
 
L
P
 
S
D
 
D
E
 
E
K
 
L
V
 
K
R
 
E
Q
 
Q
F
 
M
G
 
L
A
 
T
D
 
Q
T
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
A
R
 
R
P
 
F
G
 
G
Q
 
Q
P
 
D
V
 
T
E
 
D
I
 
I
A
 
A
P
 
N
L
 
T
Y
 
V
V
 
A
T
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
K
C
 
A
S
 
K
F
 
Y
T
 
I
S
 
T
G
 
G
Q
 
Q
V
 
T
W
 
I
C
 
H
S
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

3sj7A Structure of beta-ketoacetyl-coa reductase (fabg) from staphylococcus aureus complex with NADPH (see paper)
38% identity, 82% coverage: 50:290/294 of query aligns to 2:236/239 of 3sj7A

query
sites
3sj7A
K
 
K
R
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
D
x
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
S
V
 
I
A
 
A
I
 
L
A
 
Q
F
 
L
A
 
A
R
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
Y
D
 
N
V
 
V
A
 
A
I
 
V
N
|
N
Y
|
Y
L
x
A
P
x
G
E
x
S
E
 
K
E
 
E
S
 
K
D
 
-
A
 
A
Q
 
E
T
 
A
V
 
V
I
 
V
A
 
E
L
 
E
I
 
I
E
 
K
A
 
A
E
 
K
G
 
G
R
 
V
Q
 
D
A
 
S
V
 
F
A
 
A
I
 
I
P
 
Q
G
x
A
D
x
N
V
|
V
R
 
A
D
 
D
E
 
A
S
 
D
F
 
E
C
 
V
E
 
K
T
 
A
L
 
M
V
 
I
E
 
K
Q
 
E
A
 
V
A
 
V
S
 
S
E
 
Q
L
 
F
G
 
G
G
 
S
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
-
 
I
-
 
T
R
 
R
Q
 
D
Q
 
N
Y
 
L
C
 
L
E
 
M
S
 
R
L
 
M
E
 
K
E
 
E
L
 
-
T
 
-
T
 
-
A
 
Q
D
 
E
F
 
W
D
 
D
A
 
D
T
 
V
F
 
I
K
 
D
T
|
T
N
 
N
V
 
L
Y
 
K
A
 
G
A
 
V
F
 
F
-
 
N
W
 
C
I
 
I
T
 
Q
K
 
K
A
 
A
A
 
T
L
 
P
R
 
Q
H
 
M
L
 
L
K
 
R
E
 
Q
H
 
R
S
 
S
-
 
G
A
 
A
I
 
I
I
 
I
N
 
N
T
 
L
S
 
S
S
|
S
V
 
V
Q
 
V
A
 
G
F
 
A
K
 
V
P
 
G
S
 
N
P
 
P
I
 
G
L
x
Q
L
 
A
D
 
N
Y
|
Y
A
 
V
Q
 
A
T
 
T
K
|
K
A
 
A
C
 
G
L
 
V
V
 
I
A
 
G
F
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
S
L
 
A
A
 
A
K
 
R
Q
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
S
K
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
P
 
F
Y
 
I
W
 
V
T
 
S
V
 
D
L
 
M
Q
 
-
S
 
-
S
 
-
G
 
-
G
 
-
Q
 
-
P
 
T
D
 
D
E
 
E
K
 
L
V
 
K
R
 
E
Q
 
Q
F
 
M
G
 
L
A
 
T
D
 
Q
T
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
A
R
 
R
P
 
F
G
 
G
Q
 
Q
P
 
D
V
 
T
E
 
D
I
 
I
A
 
A
P
 
N
L
 
T
Y
 
V
V
 
A
T
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
K
C
 
A
S
 
K
F
 
Y
T
 
I
S
 
T
G
 
G
Q
 
Q
V
 
T
W
 
I
C
 
H
S
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

8bcjB Crystal structure of short-chain dehydrogenase pa3128 from pseudomonas aeruginosa pao1 in complex with NADP+
36% identity, 81% coverage: 53:290/294 of query aligns to 8:249/250 of 8bcjB

query
sites
8bcjB
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
D
x
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
A
A
 
A
V
 
T
A
 
A
I
 
L
A
 
L
F
 
A
A
 
A
R
 
E
E
 
R
G
 
G
A
 
Y
D
 
A
V
 
V
A
 
V
I
 
L
N
 
N
Y
 
Y
L
|
L
P
x
R
E
x
N
E
 
R
E
 
E
S
 
A
D
 
-
A
 
A
Q
 
E
T
 
A
V
 
L
I
 
R
A
 
Q
L
 
R
I
 
I
E
 
E
A
 
R
E
 
Q
G
 
G
R
 
G
Q
 
E
A
 
A
V
 
L
A
 
A
I
 
V
P
 
A
G
x
A
D
|
D
V
|
V
R
 
A
D
 
E
E
 
E
S
 
G
F
 
D
C
 
V
E
 
E
T
 
R
L
 
L
V
 
F
E
 
A
Q
 
S
A
 
I
A
 
D
S
 
E
E
 
R
L
 
F
G
 
G
G
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
R
 
M
Q
 
L
Q
 
E
Y
 
A
C
 
Q
E
 
T
S
 
R
L
 
L
E
 
E
E
 
N
L
 
I
T
 
D
T
 
A
A
 
A
D
 
R
F
 
L
D
 
H
A
 
R
T
 
V
F
 
F
K
 
A
T
|
T
N
 
N
V
 
V
Y
 
T
A
 
G
A
 
S
F
 
F
W
 
L
I
 
C
T
 
A
K
 
R
A
 
E
A
 
A
L
 
V
-
 
K
-
 
R
-
 
L
-
 
S
-
 
T
R
 
R
H
 
H
L
 
G
K
 
G
E
 
R
H
 
G
S
 
G
A
 
S
I
 
I
I
 
V
N
 
N
T
x
V
S
 
S
S
|
S
V
 
M
Q
 
A
A
 
S
F
 
R
K
 
L
P
 
G
S
 
S
P
 
P
I
 
N
-
 
E
L
 
Y
L
 
I
D
 
D
Y
|
Y
A
 
A
Q
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
G
C
 
A
L
 
I
V
 
D
A
 
S
F
 
M
T
 
T
K
 
I
S
 
G
L
 
L
A
 
A
K
 
R
Q
 
E
L
 
V
G
 
A
P
 
A
K
 
E
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
R
P
|
P
G
|
G
P
 
L
Y
x
I
W
 
D
T
|
T
V
 
E
L
x
I
Q
x
H
S
 
A
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
P
 
P
D
 
G
E
 
-
K
 
R
V
 
I
R
 
E
Q
 
R
F
 
L
G
 
K
A
 
G
D
 
G
T
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
R
P
 
G
G
 
G
Q
 
T
P
 
A
V
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
P
 
R
L
 
A
Y
 
I
V
 
L
T
 
W
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
E
C
 
A
S
 
S
F
 
Y
T
 
S
S
 
T
G
 
G
Q
 
T
V
 
F
W
 
I
C
 
D
S
 
V
D
 
S
G
 
G
G
 
G

5u2wA Crystal structure of a short chain dehydrogenase from burkholderia cenocepacia j2315 in complex with NADP
45% identity, 70% coverage: 46:251/294 of query aligns to 3:213/246 of 5u2wA

query
sites
5u2wA
R
 
R
L
 
L
A
 
Q
G
 
G
K
 
K
R
 
R
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
D
x
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
A
A
 
A
V
 
I
A
 
A
I
 
K
A
 
R
F
 
L
A
 
A
R
 
A
E
 
D
G
 
G
A
 
A
D
 
D
V
 
V
A
 
A
I
 
I
N
 
T
Y
|
Y
L
x
E
P
x
K
E
x
S
E
 
A
E
 
E
S
 
R
D
 
-
A
 
A
Q
 
Q
T
 
A
V
 
V
I
 
V
A
 
A
L
 
G
I
 
I
E
 
E
A
 
A
E
 
L
G
 
G
R
 
R
Q
 
R
A
 
A
V
 
I
A
 
A
I
 
I
P
 
Q
G
x
A
D
|
D
V
x
S
R
 
A
D
 
D
E
 
P
S
 
V
F
 
A
C
 
V
E
 
R
T
 
N
L
 
A
V
 
V
E
 
D
Q
 
R
A
 
V
A
 
A
S
 
E
E
 
A
L
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
R
 
I
Q
 
F
Q
 
R
Y
 
-
C
 
A
E
 
G
S
 
S
L
 
L
E
 
D
E
 
D
L
 
L
T
 
T
T
 
L
A
 
D
D
 
D
F
 
I
D
 
D
A
 
A
T
 
T
F
 
L
K
 
N
T
 
V
N
 
N
V
 
V
Y
 
R
A
 
A
A
 
V
F
 
I
W
 
V
I
 
A
T
 
S
K
 
Q
A
 
A
A
 
A
L
 
A
R
 
R
H
 
H
L
 
L
K
 
G
E
 
E
H
 
G
S
 
G
A
 
R
I
 
I
I
 
V
N
 
S
T
|
T
S
 
G
S
|
S
V
 
C
Q
 
L
A
 
A
F
 
T
K
 
R
-
 
V
P
 
P
S
 
D
P
 
A
I
 
G
L
x
M
L
 
S
D
 
L
Y
|
Y
A
 
A
Q
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
A
C
 
A
L
 
L
V
 
I
A
 
G
F
 
W
T
 
T
K
 
Q
S
 
G
L
 
L
A
 
A
K
 
R
Q
 
D
L
 
L
G
 
G
P
 
P
K
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
I
V
 
V
A
 
H
P
|
P
G
|
G
P
 
S
Y
x
T
W
 
D
T
|
T
V
 
D
L
x
M
Q
x
N
-
 
P
S
 
A
S
 
D
G
 
G
G
 
A
Q
 
H
P
 
A
D
 
D
E
 
A
K
 
Q
-
 
R
-
 
S
-
 
R
-
 
M
-
 
A
V
 
I
R
 
Q
Q
 
Q
F
 
Y
G
 
G

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
37% identity, 83% coverage: 46:290/294 of query aligns to 4:241/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
R
 
R
L
 
L
A
 
Q
G
 
D
K
 
K
R
 
V
A
 
A
L
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
D
 
A
S
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
E
V
 
A
A
 
A
I
 
R
A
 
V
F
 
F
A
 
M
R
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
K
V
 
V
A
 
V
I
 
I
N
 
-
Y
 
-
L
 
-
P
 
-
E
 
-
E
 
-
E
 
-
S
 
A
D
|
D
A
x
F
Q
 
N
T
 
-
V
 
-
I
 
-
A
 
-
L
 
-
I
 
-
E
 
E
A
 
A
E
 
A
G
 
G
R
 
K
Q
 
E
A
 
A
V
 
V
-
 
E
A
 
A
I
 
N
P
 
P
G
 
G
-
 
V
-
 
V
-
 
F
-
 
I
-
 
R
-
x
V
D
|
D
V
|
V
R
 
S
D
 
D
E
 
R
S
 
E
F
 
S
C
 
V
E
 
H
T
 
R
L
 
L
V
 
V
E
 
E
Q
 
N
A
 
V
A
 
A
S
 
E
E
 
R
L
 
F
G
 
G
G
 
K
L
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
R
x
I
Q
 
T
Q
 
R
Y
x
D
C
 
S
E
 
-
S
 
M
L
 
L
E
 
S
E
x
K
L
 
M
T
 
T
T
 
V
A
 
D
D
 
Q
F
 
F
D
 
Q
A
 
Q
T
 
V
F
 
I
K
 
N
T
 
V
N
|
N
V
 
L
Y
 
T
A
 
G
A
 
V
F
 
F
W
 
H
I
 
C
T
 
T
K
 
Q
A
 
A
A
 
V
L
 
L
R
 
P
H
 
Y
L
 
M
K
 
A
E
 
E
H
 
Q
S
 
G
A
 
K
-
 
G
-
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
T
|
T
S
 
S
S
|
S
V
 
V
Q
 
T
A
 
G
F
 
T
K
 
Y
P
 
G
S
x
N
P
x
V
I
 
G
L
x
Q
L
 
T
D
 
N
Y
|
Y
A
 
A
Q
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
A
C
 
G
L
 
V
V
 
I
A
 
G
F
 
M
T
 
T
K
 
K
S
 
T
L
 
W
A
 
A
K
 
K
Q
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
P
x
F
Y
x
T
W
 
E
T
|
T
V
 
A
L
x
M
Q
 
V
S
 
A
S
 
E
G
 
-
G
 
-
Q
 
V
P
 
P
D
 
E
E
 
K
K
 
V
V
 
I
R
 
E
Q
x
K
F
 
M
G
 
K
A
 
A
D
 
Q
T
 
V
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
R
P
 
L
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
V
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
A
P
 
N
L
 
A
Y
 
Y
V
 
L
T
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
H
A
 
E
C
 
S
S
 
D
F
 
Y
T
 
V
S
 
N
G
 
G
Q
 
H
V
 
V
W
 
L
C
 
H
S
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

5wuwA Serratia marcescens short-chain dehydrogenase/reductase f98l/f202l mutant (see paper)
36% identity, 83% coverage: 47:290/294 of query aligns to 3:242/245 of 5wuwA

query
sites
5wuwA
L
 
L
A
 
Q
G
 
G
K
 
K
R
 
V
A
 
A
L
 
F
I
 
V
T
 
Q
G
|
G
G
 
G
D
 
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
A
A
 
A
V
 
I
A
 
V
I
 
K
A
 
R
F
 
L
A
 
A
R
 
S
E
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
A
V
 
V
A
 
A
I
 
F
N
 
T
Y
|
Y
L
x
A
P
x
A
E
 
S
E
 
A
E
 
D
S
 
R
D
 
-
A
 
A
Q
 
E
T
 
A
V
 
V
I
 
A
A
 
S
L
 
A
I
 
V
E
 
T
A
 
T
E
 
A
G
 
G
R
 
G
Q
 
K
A
 
V
V
 
L
A
 
A
I
 
I
P
 
K
G
 
A
D
|
D
V
x
S
R
 
A
D
 
D
E
 
A
S
 
A
F
 
A
C
 
L
E
 
Q
T
 
Q
L
 
A
V
 
V
E
 
R
Q
 
Q
A
 
A
A
 
V
S
 
S
E
 
H
L
 
F
G
 
G
G
 
N
L
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
R
 
V
Q
 
L
Q
 
T
Y
 
L
C
 
G
E
 
G
S
 
T
L
 
-
E
 
E
E
 
E
L
 
L
T
 
A
T
 
L
A
 
D
D
 
D
F
 
L
D
 
D
A
 
R
T
 
M
F
 
L
K
 
A
T
 
V
N
 
N
V
 
V
Y
 
R
A
 
S
A
 
V
F
 
F
W
 
V
I
 
A
T
 
S
K
 
Q
A
 
E
A
 
A
L
 
A
R
 
R
H
 
H
L
 
M
K
 
N
E
 
D
H
 
G
S
 
G
A
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
H
T
 
I
S
 
G
S
|
S
V
 
T
Q
 
N
A
 
A
F
 
E
K
 
R
-
 
V
P
 
P
S
 
F
P
 
G
I
 
G
L
 
A
L
 
A
D
 
V
Y
|
Y
A
 
A
Q
 
M
T
 
S
K
|
K
A
 
S
C
 
A
L
|
L
V
 
V
A
 
G
F
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
G
L
 
M
A
 
A
K
 
R
Q
 
D
L
 
L
G
 
G
P
 
P
K
 
R
G
 
S
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
N
V
 
V
A
 
Q
P
 
P
G
|
G
P
|
P
Y
x
V
W
 
D
T
 
T
V
 
E
L
 
M
Q
 
N
S
 
P
S
 
D
G
 
A
G
 
G
Q
 
E
P
 
L
D
 
A
E
 
D
K
 
Q
V
 
L
R
 
K
Q
 
Q
F
 
L
G
 
M
A
 
A
D
 
-
T
 
-
P
 
-
L
 
I
G
 
G
R
 
R
P
 
Y
G
 
G
Q
 
K
P
 
D
V
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
P
 
G
L
 
F
Y
 
V
V
 
A
T
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
G
D
 
P
A
 
Q
C
 
A
S
 
G
F
 
Y
T
 
I
S
 
T
G
 
G
Q
 
A
V
 
S
W
 
L
C
 
S
S
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
36% identity, 83% coverage: 47:290/294 of query aligns to 3:244/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
L
 
L
A
 
Q
G
 
G
K
 
K
R
 
V
A
 
A
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
D
x
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
D
V
 
I
A
 
A
I
 
I
A
 
N
F
 
L
A
 
A
R
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
N
V
 
I
A
 
F
I
 
F
N
|
N
Y
|
Y
L
x
N
P
x
G
E
x
S
E
 
P
E
 
E
S
 
A
D
 
A
A
 
E
Q
 
E
T
 
T
V
 
A
I
 
-
A
 
K
L
 
L
I
 
V
E
 
A
A
 
E
E
 
H
G
 
G
R
 
V
Q
 
E
A
 
V
V
 
E
A
 
A
I
 
M
P
 
K
G
 
A
D
x
N
V
|
V
R
 
A
D
 
I
E
 
A
S
 
E
F
 
D
C
 
V
E
 
D
T
 
A
L
 
F
V
 
F
E
 
K
Q
 
Q
A
 
A
A
 
I
S
 
E
E
 
R
L
 
F
G
 
G
G
 
R
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
-
x
I
-
 
T
R
 
R
Q
 
D
Q
 
N
Y
 
L
C
 
L
E
 
M
S
 
R
L
 
M
E
 
K
E
 
E
L
 
-
T
 
-
T
 
-
A
 
D
D
 
E
F
 
W
D
 
D
A
 
D
T
 
V
F
 
I
K
 
N
T
x
I
N
 
N
V
 
L
Y
 
K
A
 
G
A
 
T
F
 
F
W
 
L
I
 
C
T
 
T
K
 
K
A
 
A
A
 
V
L
 
S
R
 
R
H
 
T
L
 
M
K
 
M
E
 
K
H
 
Q
S
 
R
A
 
A
-
 
G
-
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
T
 
M
S
 
A
S
|
S
V
 
V
Q
 
V
A
 
G
F
 
L
K
 
I
P
 
G
S
 
N
P
 
A
I
 
G
L
x
Q
L
 
A
D
 
N
Y
|
Y
A
 
V
Q
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
A
C
 
G
L
 
V
V
 
I
A
 
G
F
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
T
L
 
T
A
 
A
K
 
R
Q
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
P
K
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
P
 
F
Y
x
I
W
 
T
T
|
T
V
 
D
L
 
M
Q
 
T
S
 
D
S
 
-
G
 
-
G
 
-
Q
 
K
P
 
L
D
 
D
E
 
E
K
 
K
V
 
T
R
 
K
Q
 
E
-
 
A
F
 
M
G
 
L
A
 
A
D
 
Q
T
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
A
P
 
Y
G
 
G
Q
 
T
P
 
T
V
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
A
P
 
N
L
 
A
Y
 
V
V
 
L
T
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
A
C
 
S
S
 
K
F
 
Y
T
 
I
S
 
T
G
 
G
Q
 
Q
V
 
T
W
 
L
C
 
S
S
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

4iqgD Crystal structure of bpro0239 oxidoreductase from polaromonas sp. Js666 in NADP bound form
36% identity, 82% coverage: 50:290/294 of query aligns to 3:247/248 of 4iqgD

query
sites
4iqgD
K
 
K
R
 
V
A
 
V
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
D
x
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
A
A
 
A
V
 
S
A
 
A
I
 
L
A
 
L
F
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
Q
G
 
G
A
 
Y
D
 
A
V
 
V
A
 
A
I
 
V
N
|
N
Y
 
Y
L
 
-
P
x
A
E
x
S
E
x
N
E
 
S
S
 
A
D
 
A
A
 
A
Q
 
D
T
 
E
V
 
V
I
 
V
A
 
R
L
 
Q
I
 
I
E
 
R
A
 
E
E
 
A
G
 
G
R
 
G
Q
 
Q
A
 
A
V
 
L
A
 
A
I
 
V
P
 
Q
G
x
A
D
|
D
V
|
V
R
 
A
D
 
K
E
 
E
S
 
R
F
 
E
C
 
V
E
 
L
T
 
A
L
 
M
V
 
F
E
 
E
Q
 
T
A
 
V
A
 
D
S
 
A
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
G
 
R
L
 
L
D
 
S
I
 
A
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
R
 
V
Q
 
V
Q
 
D
Y
 
Q
C
 
T
E
 
T
S
 
R
L
 
V
E
 
D
E
 
G
L
 
I
T
 
T
T
 
L
A
 
E
D
 
R
F
 
L
D
 
Q
A
 
R
T
 
M
F
 
F
K
 
E
T
 
I
N
|
N
V
 
V
Y
 
F
A
 
G
A
 
S
F
 
F
W
 
L
I
 
C
T
 
A
K
 
R
A
 
E
A
 
A
L
 
V
R
 
K
H
 
R
L
 
M
K
 
S
E
 
T
H
 
R
-
 
Y
-
 
G
-
 
G
-
 
S
-
 
G
S
 
G
A
 
S
I
 
I
I
 
V
N
 
N
T
x
V
S
 
S
S
|
S
V
 
A
Q
 
A
A
 
A
F
 
R
K
 
L
P
 
G
S
 
S
P
 
P
-
 
G
I
 
Q
L
x
Y
L
 
V
D
 
D
Y
|
Y
A
 
A
Q
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
G
C
 
A
L
 
I
V
 
D
A
 
T
F
 
F
T
 
T
K
 
L
S
 
G
L
 
L
A
 
A
K
 
K
Q
 
E
L
 
V
G
 
A
P
 
T
K
 
E
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
R
P
|
P
G
|
G
P
 
I
Y
x
I
W
 
E
T
|
T
V
 
D
L
x
I
Q
x
H
S
 
A
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
L
P
 
P
D
 
N
E
 
-
K
 
R
V
 
A
R
 
R
Q
 
D
F
 
V
G
 
A
A
 
P
D
 
Q
T
 
V
P
 
P
L
 
M
G
 
Q
R
 
R
P
 
A
G
 
G
Q
 
T
P
 
A
V
 
R
E
 
E
I
 
V
A
 
A
P
 
E
L
 
A
Y
 
I
V
 
V
T
 
W
L
 
L
A
 
L
S
 
G
D
 
D
A
 
Q
C
 
A
S
 
S
F
 
Y
T
 
T
S
 
T
G
 
G
Q
 
A
V
 
L
W
 
L
C
 
D
S
 
V
D
 
T
G
 
G
G
 
G

4fj0D Crystal structure of the ternary complex between a fungal 17beta- hydroxysteroid dehydrogenase (holo form) and 3,7-dihydroxy flavone (see paper)
35% identity, 84% coverage: 45:290/294 of query aligns to 5:259/261 of 4fj0D

query
sites
4fj0D
G
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
D
G
 
G
K
 
K
R
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
S
D
 
G
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
A
I
 
V
A
 
H
F
 
L
A
 
G
R
 
R
E
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
K
V
 
V
A
 
V
I
 
V
N
 
N
Y
 
Y
L
 
-
P
x
A
E
x
N
E
x
S
E
 
T
S
 
K
D
 
D
A
 
A
Q
 
E
T
 
K
V
 
V
I
 
V
A
 
S
L
 
E
I
 
I
E
 
K
A
 
A
E
 
L
G
 
G
R
 
S
Q
 
D
A
 
A
V
 
I
A
 
A
I
 
I
P
 
K
G
 
A
D
 
D
V
x
I
R
 
R
D
 
Q
E
 
V
S
 
P
F
 
E
C
 
I
E
 
V
T
 
K
L
 
L
V
 
F
E
 
D
Q
 
Q
A
 
A
A
 
V
S
 
A
E
 
H
L
 
F
G
 
G
G
 
H
L
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
A
V
 
V
N
 
S
N
|
N
A
x
S
G
|
G
R
 
V
Q
 
V
Q
 
S
Y
 
F
C
 
G
E
 
H
S
 
-
L
 
L
E
 
K
E
 
D
L
 
V
T
 
T
T
 
E
A
 
E
D
 
E
F
 
F
D
 
D
A
 
R
T
 
V
F
 
F
K
 
S
T
x
L
N
 
N
V
 
T
Y
 
R
A
 
G
A
 
Q
F
 
F
W
 
F
I
 
V
T
 
A
K
 
R
A
 
E
A
 
A
L
 
Y
R
 
R
H
 
H
L
 
L
K
 
T
E
 
E
H
 
G
S
 
G
A
 
R
I
 
I
I
 
V
N
 
L
T
|
T
S
 
S
S
|
S
V
x
N
Q
 
T
A
 
S
F
 
K
K
 
D
P
 
F
S
 
S
-
 
V
P
 
P
I
 
K
L
x
H
L
 
S
D
 
L
Y
|
Y
A
 
S
Q
 
G
T
 
S
K
|
K
A
 
G
C
 
A
L
 
V
V
 
D
A
 
S
F
 
F
T
 
V
K
 
R
S
 
I
L
 
F
A
 
S
K
 
K
Q
 
D
L
 
C
G
 
G
P
 
D
K
 
K
G
 
K
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
P
x
G
Y
x
T
W
 
V
T
|
T
-
 
D
-
x
M
-
x
F
-
 
H
-
 
E
-
 
V
-
x
S
-
 
H
-
 
H
V
x
Y
L
 
I
Q
 
P
S
 
N
S
 
G
G
 
T
G
 
S
Q
 
Y
P
 
T
D
 
A
E
 
E
K
 
Q
V
 
R
R
 
Q
Q
 
Q
F
 
M
G
x
A
A
 
A
D
 
H
-
 
A
T
 
S
P
 
P
L
 
L
G
 
H
R
 
R
P
 
N
G
 
G
Q
 
W
P
 
P
V
 
Q
E
 
D
I
 
V
A
 
A
P
 
N
L
 
V
Y
 
V
V
 
G
T
 
F
L
 
L
A
 
V
S
 
S
D
 
K
A
 
E
C
 
G
S
 
E
F
 
W
T
 
V
S
 
N
G
 
G
Q
 
K
V
 
V
W
 
L
C
 
T
S
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Query Sequence

>BWI76_RS16625 FitnessBrowser__Koxy:BWI76_RS16625
MSDYANNTAKYPRPPFVDQPQSPPGLAEEMKPQPDHGELSYVGSGRLAGKRALITGGDSG
IGRAVAIAFAREGADVAINYLPEEESDAQTVIALIEAEGRQAVAIPGDVRDESFCETLVE
QAASELGGLDILVNNAGRQQYCESLEELTTADFDATFKTNVYAAFWITKAALRHLKEHSA
IINTSSVQAFKPSPILLDYAQTKACLVAFTKSLAKQLGPKGIRVNAVAPGPYWTVLQSSG
GQPDEKVRQFGADTPLGRPGQPVEIAPLYVTLASDACSFTSGQVWCSDGGDGVV

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory