SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing BWI76_RS16830 FitnessBrowser__Koxy:BWI76_RS16830 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P07821 Iron(3+)-hydroxamate import ATP-binding protein FhuC; Ferric hydroxamate uptake protein C; Ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC; Iron(III)-hydroxamate import ATP-binding protein FhuC; EC 7.2.2.16 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
43% identity, 88% coverage: 22:260/273 of query aligns to 23:260/265 of P07821

query
sites
P07821
G
 
G
Q
 
R
T
 
T
L
 
L
I
 
L
V
 
-
D
 
H
N
 
P
I
 
L
H
 
S
L
 
L
T
 
T
I
 
F
P
 
P
H
 
A
G
 
G
K
 
K
M
 
V
T
 
T
V
 
G
L
 
L
A
 
I
G
 
G
A
 
H
N
 
N
G
 
G
S
 
S
G
 
G
K
|
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
L
 
L
S
 
K
T
 
M
I
 
L
A
 
G
R
 
R
M
 
H
L
 
Q
K
 
P
P
 
P
L
 
S
G
 
E
G
 
G
C
 
E
V
 
I
R
 
L
L
 
L
D
 
D
G
 
A
E
 
Q
V
 
P
I
 
L
H
 
E
Q
 
S
M
 
W
P
 
S
T
 
S
R
 
K
E
 
A
V
 
F
S
 
A
R
 
R
R
 
K
L
 
V
G
 
A
I
 
Y
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
S
 
Q
P
 
L
L
 
P
T
 
P
P
 
A
E
 
E
G
 
G
L
 
M
T
 
T
V
 
V
F
 
R
E
 
E
L
 
L
V
 
V
S
 
A
R
 
I
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
P
 
P
W
 
W
Q
 
H
G
 
G
L
 
A
M
 
L
R
 
G
Q
 
R
W
 
F
S
 
G
E
 
A
A
 
A
D
 
D
E
 
R
R
 
E
A
 
K
V
 
V
E
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
I
M
 
S
L
 
L
T
 
V
G
 
G
T
 
L
A
 
K
E
 
P
F
 
L
A
 
A
H
 
H
L
 
R
A
 
L
V
 
V
D
 
D
S
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
R
 
R
Q
 
Q
R
 
R
C
 
A
W
 
W
I
 
I
A
 
A
M
 
M
A
 
L
L
 
V
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
D
T
 
S
A
 
R
T
 
C
I
 
L
L
 
L
L
 
L
D
|
D
E
|
E
P
 
P
T
 
T
T
 
S
W
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
I
R
 
A
Y
 
H
Q
 
Q
V
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
L
E
 
S
L
 
L
L
 
V
Q
 
H
T
 
R
L
 
L
T
 
S
R
 
Q
D
 
E
H
 
R
G
 
G
R
 
L
T
 
T
V
 
V
V
 
I
T
 
A
V
 
V
L
 
L
H
 
H
D
 
D
L
 
I
N
 
N
F
 
M
A
 
A
V
 
A
N
 
R
Y
 
Y
A
 
C
D
 
D
L
 
Y
L
 
L
V
 
V
F
 
A
L
 
L
K
 
R
K
 
G
G
 
G
Q
 
E
I
 
M
A
 
I
G
 
A
V
 
Q
I
 
G
N
 
T
E
 
P
Q
 
A
E
 
E
I
 
I
C
 
M
T
 
R
P
 
G
E
 
E
L
 
T
I
 
L
K
 
E
T
 
M
V
 
I
F
 
Y
D
 
G
V
 
I
D
 
P
V
 
M
Q
 
G
M
 
I
S
 
L
L
 
P
N
 
H
P
 
P
Q
 
A
T
 
G
G
 
A
K
 
A
P
 
P

1f3oA Crystal structure of mj0796 atp-binding cassette (see paper)
34% identity, 79% coverage: 12:226/273 of query aligns to 2:223/232 of 1f3oA

query
sites
1f3oA
I
 
I
V
 
K
L
 
L
D
 
K
S
 
N
L
 
V
S
 
T
A
 
K
G
 
T
Y
|
Y
-
 
K
-
 
M
G
 
G
Q
 
E
T
 
E
L
 
I
I
 
I
-
 
Y
-
 
A
V
 
L
D
 
K
N
 
N
I
 
V
H
 
N
L
 
L
T
 
N
I
 
I
P
 
K
H
 
E
G
 
G
K
 
E
M
 
F
T
 
V
V
 
S
L
 
I
A
 
M
G
 
G
A
 
P
N
 
S
G
|
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
M
L
 
L
S
 
N
T
 
I
I
 
I
A
 
G
R
 
C
M
 
L
L
 
D
K
 
K
P
 
P
L
 
T
G
 
E
G
 
G
C
 
E
V
 
V
R
 
Y
L
 
I
D
 
D
G
 
N
E
 
I
V
 
K
I
 
T
H
 
N
Q
 
D
M
 
L
P
 
D
T
 
D
R
 
D
E
 
E
V
 
L
S
 
T
R
 
K
-
 
I
-
 
R
-
 
R
-
 
D
R
 
K
L
 
I
G
 
G
-
 
F
I
 
V
L
 
F
P
 
Q
Q
 
Q
S
 
F
P
 
N
L
 
L
T
 
I
P
 
P
E
 
L
G
 
-
L
 
L
T
 
T
V
 
A
F
 
L
E
 
E
L
 
N
V
 
V
S
 
E
R
 
L
G
 
P
R
 
L
-
 
I
Y
 
F
P
 
K
W
 
Y
Q
 
R
G
 
G
L
 
A
M
 
M
R
 
-
Q
 
S
W
 
G
S
 
E
E
 
E
A
 
R
D
 
R
E
 
K
R
 
R
A
 
A
V
 
L
E
 
E
E
 
C
A
 
L
L
 
K
M
 
M
L
 
A
T
 
E
G
 
L
T
 
E
A
 
E
E
 
R
F
 
F
A
 
A
H
 
N
L
 
H
A
 
K
V
 
P
D
 
N
S
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
R
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
C
 
V
W
 
A
I
 
I
A
 
A
M
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
N
Q
 
N
T
 
P
A
 
P
T
 
I
I
 
I
L
 
L
L
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
T
 
G
W
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
S
R
 
K
Y
 
T
Q
 
G
V
 
E
D
 
K
I
 
I
L
 
M
E
 
Q
L
 
L
L
 
L
Q
 
K
T
 
K
L
 
L
T
 
N
R
 
E
D
 
E
H
 
D
G
 
G
R
 
K
T
 
T
V
 
V
V
 
V
T
 
V
V
 
V
L
 
T
H
 
H
D
 
D
L
 
I
N
 
N
F
 
V
A
 
A
V
 
-
N
 
R
Y
 
F
A
 
G
D
 
E
L
 
R
L
 
I
V
 
I
F
 
Y
L
 
L
K
 
K
K
 
D
G
 
G
Q
 
E
I
 
V

4u00A Crystal structure of ttha1159 in complex with adp (see paper)
36% identity, 83% coverage: 12:237/273 of query aligns to 3:225/241 of 4u00A

query
sites
4u00A
I
 
I
V
 
R
L
 
I
D
 
R
S
 
N
L
 
L
S
 
H
A
 
K
G
 
W
Y
x
F
G
 
G
Q
 
P
T
 
L
L
 
H
I
x
V
V
 
L
D
 
K
N
 
G
I
 
I
H
 
H
L
 
L
T
 
E
I
 
V
P
 
A
H
 
P
G
 
G
K
 
E
M
 
K
T
 
L
V
 
V
L
 
I
A
 
I
G
 
G
A
 
P
N
x
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
S
 
R
T
 
T
I
 
I
A
 
N
R
 
R
M
 
L
L
 
E
K
 
D
P
 
F
L
 
Q
G
 
E
G
 
G
C
 
E
V
 
V
R
 
V
L
 
V
D
 
D
G
 
G
-
 
L
E
 
S
V
 
V
I
 
K
H
 
D
Q
 
D
M
 
R
P
 
A
T
 
L
R
 
R
E
 
E
V
 
I
S
 
R
R
 
R
R
 
E
L
 
V
G
 
G
-
 
M
I
 
V
L
 
F
P
 
Q
Q
 
Q
S
 
F
P
 
N
L
 
L
T
 
F
P
 
P
E
 
H
G
 
-
L
 
M
T
 
T
V
 
V
F
 
L
E
 
E
L
 
N
V
 
V
S
 
T
R
 
L
G
 
A
R
 
-
Y
 
-
P
 
P
W
 
M
Q
 
R
G
 
-
L
 
-
M
 
V
R
 
R
Q
 
R
W
 
W
-
 
P
S
 
R
E
 
E
A
 
K
D
 
A
E
 
E
R
 
K
A
 
K
V
 
A
E
 
L
E
 
E
A
 
L
L
 
L
M
 
E
L
 
R
T
 
V
G
 
G
T
 
I
A
 
L
E
 
D
F
 
Q
A
 
A
H
 
R
L
 
K
A
 
Y
V
 
P
D
 
A
S
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
R
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
C
 
V
W
 
A
I
 
I
A
 
A
M
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
M
Q
 
E
T
 
P
A
 
K
T
 
I
I
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
T
 
S
W
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
P
R
 
E
Y
 
M
Q
 
V
V
 
G
D
 
E
I
 
V
L
 
L
E
 
D
L
 
V
L
 
M
Q
 
R
T
 
D
L
 
L
T
 
A
R
 
Q
D
 
G
H
 
-
G
 
G
R
 
M
T
 
T
V
 
M
V
 
V
T
 
V
V
 
V
L
 
T
H
 
H
D
 
E
L
 
M
N
 
G
F
 
F
A
 
A
V
 
R
N
 
E
Y
 
V
A
 
A
D
 
D
L
 
R
L
 
V
V
 
V
F
 
F
L
 
M
K
 
D
K
 
G
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
A
 
V
G
 
E
V
 
E
I
 
G
N
 
R
E
 
P
Q
 
E
E
 
E
I
 
I
C
 
F
T
 
T

1l2tA Dimeric structure of mj0796, a bacterial abc transporter cassette (see paper)
34% identity, 79% coverage: 12:226/273 of query aligns to 2:223/230 of 1l2tA

query
sites
1l2tA
I
 
I
V
 
K
L
 
L
D
 
K
S
 
N
L
 
V
S
 
T
A
 
K
G
 
T
Y
|
Y
-
 
K
-
 
M
G
 
G
Q
 
E
T
 
E
L
 
I
I
 
I
-
 
Y
-
 
A
V
 
L
D
 
K
N
 
N
I
 
V
H
 
N
L
 
L
T
 
N
I
 
I
P
 
K
H
 
E
G
 
G
K
 
E
M
 
F
T
 
V
V
 
S
L
 
I
A
 
M
G
 
G
A
 
P
N
x
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
M
L
 
L
S
 
N
T
 
I
I
 
I
A
 
G
R
 
C
M
 
L
L
 
D
K
 
K
P
 
P
L
 
T
G
 
E
G
 
G
C
 
E
V
 
V
R
 
Y
L
 
I
D
 
D
G
 
N
E
 
I
V
 
K
I
 
T
H
 
N
Q
 
D
M
 
L
P
 
D
T
 
D
R
 
D
E
 
E
V
 
L
S
 
T
R
 
K
-
 
I
-
 
R
-
 
R
-
 
D
R
 
K
L
 
I
G
 
G
-
 
F
I
 
V
L
 
F
P
 
Q
Q
 
Q
S
 
F
P
 
N
L
 
L
T
 
I
P
 
P
E
 
L
G
 
-
L
 
L
T
 
T
V
 
A
F
 
L
E
 
E
L
 
N
V
 
V
S
 
E
R
 
L
G
 
P
R
 
L
-
 
I
Y
 
F
P
 
K
W
 
Y
Q
 
R
G
 
G
L
 
A
M
 
M
R
 
-
Q
 
S
W
 
G
S
 
E
E
 
E
A
 
R
D
 
R
E
 
K
R
 
R
A
 
A
V
 
L
E
 
E
E
 
C
A
 
L
L
 
K
M
 
M
L
 
A
T
 
E
G
 
L
T
 
E
A
 
E
E
 
R
F
|
F
A
 
A
H
 
N
L
 
H
A
 
K
V
 
P
D
 
N
S
x
Q
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
Q
|
Q
R
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
C
 
V
W
 
A
I
 
I
A
 
A
M
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
N
Q
 
N
T
 
P
A
 
P
T
 
I
I
 
I
L
 
L
L
 
A
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
T
T
 
G
W
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
S
R
 
K
Y
 
T
Q
 
G
V
 
E
D
 
K
I
 
I
L
 
M
E
 
Q
L
 
L
L
 
L
Q
 
K
T
 
K
L
 
L
T
 
N
R
 
E
D
 
E
H
 
D
G
 
G
R
 
K
T
 
T
V
 
V
V
 
V
T
 
V
V
 
V
L
 
T
H
|
H
D
 
D
L
 
I
N
 
N
F
 
V
A
 
A
V
 
-
N
 
R
Y
 
F
A
 
G
D
 
E
L
 
R
L
 
I
V
 
I
F
 
Y
L
 
L
K
 
K
K
 
D
G
 
G
Q
 
E
I
 
V

4ymuJ Crystal structure of an amino acid abc transporter complex with arginines and atps (see paper)
31% identity, 84% coverage: 12:241/273 of query aligns to 2:223/240 of 4ymuJ

query
sites
4ymuJ
I
 
I
V
 
F
L
 
V
D
 
N
S
 
D
L
 
V
S
 
Y
A
 
K
G
 
N
Y
x
F
G
 
G
Q
 
S
T
 
L
L
 
E
I
x
V
V
 
L
D
 
K
N
 
G
I
 
V
H
 
T
L
 
L
T
 
K
I
 
V
P
 
N
H
 
K
G
 
G
K
 
E
M
 
V
T
 
V
V
 
V
L
 
I
A
 
I
G
 
G
A
 
P
N
x
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
S
 
R
T
 
C
I
 
I
A
 
N
R
 
L
M
 
L
L
 
E
K
 
E
P
 
P
L
 
T
G
 
K
G
 
G
C
 
E
V
 
V
R
 
F
L
 
I
D
 
D
G
 
G
E
 
V
V
 
K
I
 
I
H
 
N
-
 
N
-
 
G
Q
 
K
M
 
V
P
 
N
T
 
I
R
 
N
E
 
K
V
 
V
S
 
R
R
 
Q
R
 
K
L
 
V
G
 
G
I
 
M
L
 
V
P
 
F
Q
 
Q
S
 
H
P
 
F
L
 
N
T
 
L
P
 
F
E
 
P
G
 
H
L
 
L
T
 
T
V
 
A
F
 
I
E
 
E
L
 
N
V
 
I
S
 
T
R
 
L
G
 
A
R
 
-
Y
 
-
P
 
P
W
 
V
Q
 
K
G
 
V
L
 
K
M
 
K
R
 
M
Q
 
N
W
 
K
S
 
K
E
 
E
A
 
A
D
 
E
E
 
E
R
 
L
A
 
A
V
 
V
E
 
D
E
 
-
A
 
L
L
 
L
M
 
A
L
 
K
T
 
V
G
 
G
T
 
L
A
 
L
E
 
D
F
 
K
A
 
K
H
 
D
L
 
Q
A
 
Y
V
 
P
D
 
I
S
 
K
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
R
 
K
Q
 
Q
R
 
R
C
 
L
W
 
A
I
 
I
A
 
A
M
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
M
Q
 
Q
T
 
P
A
 
E
T
 
V
I
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
T
T
 
S
W
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
P
R
 
E
Y
 
M
Q
 
V
V
 
K
D
 
E
I
 
V
L
 
L
E
 
N
L
 
V
L
 
M
Q
 
K
T
 
Q
L
 
L
T
 
A
R
 
-
D
 
N
H
 
E
G
 
G
R
 
M
T
 
T
V
 
M
V
 
V
T
 
V
V
 
V
L
 
T
H
|
H
D
 
E
L
 
M
N
 
G
F
 
F
A
 
A
V
 
R
N
 
E
Y
 
V
A
 
G
D
 
D
L
 
R
L
 
V
V
 
I
F
 
F
L
 
M
K
 
D
K
 
D
G
 
G
Q
 
V
I
 
I
A
 
V
G
 
-
V
 
-
I
 
-
N
 
-
E
 
-
Q
 
-
E
 
E
I
 
E
C
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
E
L
 
E
I
 
I

3fvqB Crystal structure of the nucleotide binding domain fbpc complexed with atp (see paper)
34% identity, 86% coverage: 17:251/273 of query aligns to 9:236/350 of 3fvqB

query
sites
3fvqB
L
 
L
S
 
S
A
 
K
G
 
S
Y
x
F
G
x
Q
Q
 
N
T
|
T
L
 
P
I
x
V
V
 
L
D
 
N
N
 
D
I
 
I
H
 
S
L
 
L
T
 
S
I
 
L
P
 
D
H
 
P
G
 
G
K
 
E
M
 
I
T
 
L
V
 
F
L
 
I
A
 
I
G
 
G
A
 
A
N
x
S
G
|
G
S
x
C
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
L
L
 
L
S
 
R
T
 
C
I
 
L
A
 
A
R
 
G
M
 
F
L
 
E
K
 
Q
P
 
P
L
 
D
G
 
S
G
 
G
C
 
E
V
 
I
R
 
S
L
 
L
D
 
S
G
 
G
E
 
K
V
 
T
I
 
I
H
 
F
-
 
S
-
 
K
-
 
N
-
 
T
Q
 
N
M
 
L
P
 
P
T
 
V
R
 
R
E
 
E
V
 
-
S
 
-
R
 
R
R
 
R
L
 
L
G
 
G
I
 
Y
L
 
L
P
 
V
Q
|
Q
S
 
E
P
 
G
L
 
V
T
 
L
P
 
F
E
 
P
G
 
H
L
 
L
T
 
T
V
 
V
F
 
Y
E
 
R
L
 
N
V
 
I
S
 
A
R
 
Y
G
 
G
R
 
L
Y
 
G
P
 
N
W
 
G
Q
 
K
G
 
G
L
 
R
M
 
T
R
 
A
Q
 
Q
W
 
-
S
 
-
E
 
-
A
 
-
D
 
E
E
 
R
R
 
Q
A
 
R
V
 
I
E
 
E
E
 
A
A
 
M
L
 
L
M
 
E
L
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
I
A
 
S
E
 
E
F
 
L
A
 
A
H
 
G
L
x
R
A
 
Y
V
 
P
D
 
H
S
x
E
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
Q
|
Q
R
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
C
 
A
W
 
A
I
 
L
A
 
A
M
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
P
Q
 
D
T
 
P
A
 
E
T
 
L
I
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
F
T
 
S
W
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
E
R
 
Q
Y
 
L
Q
 
R
V
 
R
D
 
Q
I
 
I
L
 
R
E
 
E
L
 
D
L
 
M
Q
 
I
T
 
A
L
 
A
T
 
L
R
 
R
D
 
A
H
 
N
G
 
G
R
 
K
T
 
S
V
 
A
V
 
V
T
 
F
V
 
V
L
 
S
H
 
H
D
 
D
L
 
R
N
 
E
F
 
E
A
 
A
V
 
L
N
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
D
 
D
L
 
R
L
 
I
V
 
A
F
 
V
L
 
M
K
 
K
K
 
Q
G
 
G
Q
 
R
I
 
I
A
 
L
G
 
-
V
 
-
I
 
-
N
 
-
E
 
-
Q
 
Q
E
 
T
I
 
A
C
 
S
T
 
P
P
 
H
E
 
E
L
 
L
I
 
Y
K
 
R
T
 
Q
V
 
P
F
 
A
D
 
D
V
 
L
D
 
D
V
 
A
Q
 
A
M
 
L

O06967 Multidrug resistance ABC transporter ATP-binding/permease protein BmrA; EC 7.6.2.- from Bacillus subtilis (strain 168) (see 2 papers)
33% identity, 79% coverage: 12:228/273 of query aligns to 341:556/589 of O06967

query
sites
O06967
I
 
I
V
 
Q
L
 
L
D
 
D
S
 
R
L
 
V
S
 
S
A
 
F
G
 
G
Y
 
Y
G
 
K
-
 
P
Q
 
D
T
 
Q
L
 
L
I
 
I
V
 
L
D
 
K
N
 
E
I
 
V
H
 
S
L
 
A
T
 
V
I
 
I
P
 
E
H
 
A
G
 
G
K
 
K
M
 
V
T
 
T
V
 
A
L
 
I
A
 
V
G
 
G
A
 
P
N
 
S
G
 
G
S
 
G
G
 
G
K
|
K
S
 
T
T
 
T
L
 
L
L
 
F
S
 
K
T
 
L
I
 
L
A
 
E
R
 
R
M
 
F
L
 
Y
K
 
S
P
 
P
L
 
T
G
 
A
G
 
G
C
 
T
V
 
I
R
 
R
L
 
L
D
 
G
G
 
D
E
 
E
V
 
P
I
 
V
H
 
D
Q
 
T
M
 
Y
P
 
S
T
 
L
R
 
E
E
 
S
V
 
W
S
 
R
R
 
E
R
 
H
L
 
I
G
 
G
I
 
Y
L
 
V
P
 
S
Q
 
Q
-
 
E
S
 
S
P
 
P
L
 
L
T
 
M
P
 
S
E
 
G
G
 
-
L
 
-
T
 
T
V
 
I
F
 
R
E
 
E
L
 
N
V
 
I
S
 
C
R
 
-
G
 
-
R
 
-
Y
 
-
P
 
-
W
 
-
Q
 
Y
G
 
G
L
 
L
M
 
E
R
 
R
Q
 
D
W
 
V
S
 
T
E
 
D
A
 
A
D
 
E
-
 
I
E
 
E
R
 
K
A
 
A
V
 
A
E
 
E
E
 
M
A
 
A
L
 
Y
M
 
A
L
 
L
T
 
N
G
 
F
T
 
I
A
 
K
E
 
E
F
 
L
A
 
P
H
 
N
L
 
-
A
 
Q
V
 
F
D
 
D
S
 
T
-
 
E
-
 
V
-
 
G
-
 
E
-
 
R
-
 
G
-
 
I
-
 
M
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
R
 
R
Q
 
Q
R
 
R
C
 
I
W
 
A
I
 
I
A
 
A
M
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
L
Q
 
R
Q
 
N
T
 
P
A
 
S
T
 
I
I
 
L
L
 
M
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
A
T
 
T
T
 
S
W
 
S
L
 
L
D
 
D
L
 
S
R
 
Q
Y
 
S
Q
 
E
V
 
K
D
 
S
I
 
V
L
 
Q
E
 
Q
L
 
A
L
 
L
Q
 
E
T
 
V
L
 
L
T
 
M
R
 
-
D
 
-
H
 
E
G
 
G
R
 
R
T
 
T
V
 
T
V
 
I
T
 
V
V
 
I
L
 
A
H
 
H
D
 
R
L
 
L
N
 
S
F
 
T
A
 
V
V
 
V
N
 
D
Y
 
-
A
 
A
D
 
D
L
 
Q
L
 
L
V
 
L
F
 
F
L
 
V
K
 
E
K
 
K
G
 
G
Q
 
E
I
 
I
A
 
T
G
 
G

Q5M243 Energy-coupling factor transporter ATP-binding protein EcfA1; ECF transporter A component EcfA1; EC 7.-.-.- from Streptococcus thermophilus (strain ATCC BAA-250 / LMG 18311) (see paper)
26% identity, 86% coverage: 12:247/273 of query aligns to 2:238/276 of Q5M243

query
sites
Q5M243
I
 
I
V
 
E
L
 
I
D
 
K
S
 
N
L
 
L
S
 
K
A
 
F
G
 
K
Y
 
Y
G
 
N
Q
 
Q
-
 
D
-
 
Q
-
 
T
T
 
S
L
 
Y
I
 
T
V
 
L
D
 
N
N
 
D
I
 
V
H
 
S
L
 
F
T
 
H
I
 
V
P
 
K
H
 
H
G
 
G
K
 
E
M
 
W
T
 
L
V
 
S
L
 
I
A
 
V
G
 
G
A
 
H
N
 
N
G
 
G
S
 
S
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
T
L
 
T
L
 
A
S
 
R
T
 
L
I
 
I
A
 
G
R
 
G
M
 
L
L
 
L
K
 
V
P
 
A
L
 
D
G
 
S
G
 
G
C
 
Q
V
 
I
R
 
I
L
 
V
D
 
D
G
 
G
E
 
Q
V
 
E
I
 
L
H
 
T
Q
 
E
M
 
E
P
 
T
T
 
V
R
 
W
E
 
D
V
 
I
S
 
R
R
 
D
R
 
K
L
 
I
G
 
G
I
 
M
L
 
V
P
 
F
Q
 
Q
S
 
N
P
 
P
-
 
D
-
 
N
-
x
Q
-
 
F
-
 
V
-
 
G
L
 
A
T
 
T
P
 
V
E
 
E
G
 
D
L
 
D
T
 
V
V
 
A
F
 
F
E
 
G
L
 
L
V
 
E
S
 
N
R
 
K
G
 
G
R
 
-
Y
 
L
P
 
P
W
 
Y
Q
 
K
G
 
E
L
 
M
M
 
V
R
 
S
Q
 
R
W
 
-
S
 
-
E
 
-
A
 
-
D
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
V
E
 
Q
E
 
E
A
 
A
L
 
L
M
 
S
L
 
F
T
 
V
G
 
G
T
 
M
A
 
M
E
 
D
F
 
F
A
 
K
H
 
D
L
 
R
A
 
E
V
 
P
D
 
A
S
 
R
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
R
 
K
Q
 
Q
R
 
R
C
 
V
W
 
A
I
 
I
A
 
A
M
 
G
A
 
I
L
 
I
A
 
A
Q
 
M
Q
 
R
T
 
P
A
 
S
T
 
I
I
 
L
L
 
I
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
A
T
 
T
T
 
S
W
 
M
L
 
L
D
 
D
L
 
P
R
 
E
Y
 
G
Q
 
R
V
 
Q
D
 
E
I
 
L
L
 
I
E
 
Q
L
 
Y
L
 
I
Q
 
E
T
 
D
L
 
I
T
 
R
R
 
Q
D
 
Q
H
 
Y
G
 
G
R
 
M
T
 
T
V
 
V
V
 
L
T
 
S
V
 
I
L
 
T
H
 
H
D
 
D
L
 
L
N
 
D
F
 
-
A
 
E
V
 
V
N
 
A
Y
 
M
A
 
S
D
 
N
L
 
R
L
 
V
V
 
L
F
 
V
L
 
L
K
 
K
K
 
Q
G
 
G
Q
 
K
I
 
V
A
 
E
G
 
S
V
 
I
I
 
S
N
 
S
E
 
P
Q
 
R
E
 
E
I
 
L
C
 
F
T
 
S
-
 
R
-
 
G
P
 
S
E
 
E
L
 
L
I
 
V
K
 
D
T
 
L
V
 
G
F
 
L
D
 
D
V
 
I

P0AAH0 Phosphate import ATP-binding protein PstB; ABC phosphate transporter; Phosphate-transporting ATPase; EC 7.3.2.1 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
31% identity, 89% coverage: 5:246/273 of query aligns to 4:250/257 of P0AAH0

query
sites
P0AAH0
V
 
V
L
 
E
P
 
T
A
 
A
E
 
P
Q
 
S
G
 
K
I
 
I
V
 
Q
L
 
V
D
 
R
S
 
N
L
 
L
S
 
N
A
 
F
G
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
K
T
 
F
L
 
H
I
 
A
V
 
L
D
 
K
N
 
N
I
 
I
H
 
N
L
 
L
T
 
D
I
 
I
P
 
A
H
 
K
G
 
N
K
 
Q
M
 
V
T
 
T
V
 
A
L
 
F
A
 
I
G
 
G
A
 
P
N
 
S
G
 
G
S
 
C
G
|
G
K
|
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
L
 
L
S
 
R
T
 
T
I
 
F
A
 
N
R
 
K
M
 
M
L
 
F
-
 
E
-
 
L
-
 
Y
-
 
P
-
 
E
K
 
Q
P
 
R
L
 
A
G
 
E
G
 
G
C
 
E
V
 
I
R
 
L
L
 
L
D
 
D
G
 
G
E
 
D
V
 
N
I
 
I
-
 
L
-
 
T
H
 
N
Q
 
S
M
 
Q
P
 
D
T
 
I
R
 
A
E
 
L
V
 
L
S
 
R
R
 
A
R
 
K
L
 
V
G
 
G
I
 
M
L
 
V
P
 
F
Q
 
Q
S
 
K
P
 
P
L
 
-
T
 
T
P
 
P
E
 
F
G
 
P
L
 
M
T
 
S
V
 
I
F
 
Y
E
 
D
L
 
N
V
 
I
S
 
A
R
 
F
G
 
G
R
 
V
Y
 
R
P
 
L
W
 
F
Q
 
E
G
 
K
L
 
L
M
 
S
R
 
R
Q
 
-
W
 
-
S
 
A
E
 
D
A
 
M
D
 
D
E
 
E
R
 
R
-
 
V
-
 
Q
-
 
W
A
 
A
V
 
L
E
 
T
E
 
K
A
 
A
L
 
A
M
 
L
L
 
W
T
 
N
G
 
E
T
 
T
A
 
K
E
 
D
F
 
K
A
 
L
H
 
H
L
 
Q
A
 
S
V
 
G
D
 
Y
S
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
R
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
C
 
L
W
 
C
I
 
I
A
 
A
M
 
R
A
 
G
L
 
I
A
 
A
Q
 
I
Q
 
R
T
 
P
A
 
E
T
 
V
I
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
C
T
 
S
W
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
P
R
 
I
Y
 
S
Q
 
T
V
 
G
D
 
R
I
 
I
L
 
E
E
 
E
L
 
L
L
 
I
Q
 
T
T
 
E
L
 
L
T
 
K
R
 
Q
D
 
D
H
 
Y
G
 
-
R
 
-
T
 
T
V
 
V
V
 
V
T
 
I
V
 
V
L
 
T
H
 
H
D
 
N
L
 
M
N
 
Q
F
 
Q
A
 
A
V
 
A
N
 
R
Y
 
C
A
 
S
D
 
D
L
 
H
L
 
T
V
 
A
F
 
F
L
 
M
K
 
Y
K
 
L
G
 
G
Q
 
E
I
 
L
A
 
I
G
 
E
V
 
F
I
 
S
N
 
N
E
 
T
Q
 
D
E
 
D
I
 
L
C
 
F
T
 
T
P
 
K
E
 
P
L
 
A
I
 
K
K
 
K
T
 
Q
V
 
T
F
 
E
D
 
D

Sites not aligning to the query:

7bg4A Multidrug resistance transporter bmra mutant e504a bound with atp, mg, and rhodamine 6g solved by cryo-em (see paper)
33% identity, 79% coverage: 12:228/273 of query aligns to 324:539/572 of 7bg4A

query
sites
7bg4A
I
 
I
V
 
Q
L
 
L
D
 
D
S
 
R
L
 
V
S
 
S
A
 
F
G
 
G
Y
|
Y
G
 
K
-
 
P
Q
 
D
T
 
Q
L
 
L
I
 
I
V
 
L
D
 
K
N
 
E
I
 
V
H
 
S
L
 
A
T
 
V
I
 
I
P
 
E
H
 
A
G
 
G
K
 
K
M
 
V
T
 
T
V
 
A
L
 
I
A
 
V
G
 
G
A
 
P
N
x
S
G
|
G
S
x
G
G
 
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
L
L
 
F
S
 
K
T
 
L
I
 
L
A
 
E
R
 
R
M
 
F
L
 
Y
K
 
S
P
 
P
L
 
T
G
 
A
G
 
G
C
 
T
V
 
I
R
 
R
L
 
L
D
 
G
G
 
D
E
 
E
V
 
P
I
 
V
H
 
D
Q
 
T
M
 
Y
P
 
S
T
 
L
R
 
E
E
 
S
V
 
W
S
 
R
R
 
E
R
 
H
L
 
I
G
 
G
I
 
Y
L
 
V
P
 
S
Q
|
Q
-
 
E
S
 
S
P
 
P
L
 
L
T
 
M
P
 
S
E
 
G
G
 
-
L
 
-
T
 
T
V
 
I
F
 
R
E
 
E
L
 
N
V
 
I
S
 
C
R
 
-
G
 
-
R
 
-
Y
 
-
P
 
-
W
 
-
Q
 
Y
G
 
G
L
 
L
M
 
E
R
 
R
Q
 
D
W
 
V
S
 
T
E
 
D
A
 
A
D
 
E
-
 
I
E
 
E
R
 
K
A
 
A
V
 
A
E
 
E
E
 
M
A
 
A
L
 
Y
M
 
A
L
 
L
T
 
N
G
 
F
T
 
I
A
 
K
E
 
E
F
 
L
A
 
P
H
 
N
L
 
-
A
 
Q
V
 
F
D
 
D
S
 
T
-
 
E
-
 
V
-
 
G
-
 
E
-
 
R
-
 
G
-
x
I
-
x
M
L
 
L
S
|
S
G
|
G
G
|
G
Q
 
Q
R
 
R
Q
 
Q
R
 
R
C
 
I
W
 
A
I
 
I
A
 
A
M
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
L
Q
 
R
Q
 
N
T
 
P
A
 
S
T
 
I
I
 
L
L
 
M
L
 
L
D
 
D
E
 
A
P
 
A
T
 
T
T
 
S
W
 
S
L
 
L
D
 
D
L
 
S
R
 
Q
Y
 
S
Q
 
E
V
 
K
D
 
S
I
 
V
L
 
Q
E
 
Q
L
 
A
L
 
L
Q
 
E
T
 
V
L
 
L
T
 
M
R
 
-
D
 
-
H
 
E
G
 
G
R
 
R
T
 
T
V
 
T
V
 
I
T
 
V
V
 
I
L
 
A
H
 
H
D
 
R
L
 
L
N
 
S
F
 
T
A
 
V
V
 
V
N
 
D
Y
 
-
A
 
A
D
 
D
L
 
Q
L
 
L
V
 
L
F
 
F
L
 
V
K
 
E
K
 
K
G
 
G
Q
 
E
I
 
I
A
 
T
G
 
G

Sites not aligning to the query:

7ow8A Cryoem structure of the abc transporter bmra e504a mutant in complex with atp-mg (see paper)
33% identity, 79% coverage: 12:228/273 of query aligns to 332:547/577 of 7ow8A

query
sites
7ow8A
I
 
I
V
 
Q
L
 
L
D
 
D
S
 
R
L
 
V
S
 
S
A
 
F
G
 
G
Y
|
Y
G
 
K
-
 
P
Q
 
D
T
 
Q
L
 
L
I
 
I
V
 
L
D
 
K
N
 
E
I
 
V
H
 
S
L
 
A
T
 
V
I
 
I
P
 
E
H
 
A
G
 
G
K
 
K
M
 
V
T
 
T
V
 
A
L
 
I
A
 
V
G
 
G
A
 
P
N
x
S
G
|
G
S
 
G
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
L
L
 
F
S
 
K
T
 
L
I
 
L
A
 
E
R
 
R
M
 
F
L
 
Y
K
 
S
P
 
P
L
 
T
G
 
A
G
 
G
C
 
T
V
 
I
R
 
R
L
 
L
D
 
G
G
 
D
E
 
E
V
 
P
I
 
V
H
 
D
Q
 
T
M
 
Y
P
 
S
T
 
L
R
 
E
E
 
S
V
 
W
S
 
R
R
 
E
R
 
H
L
 
I
G
 
G
I
 
Y
L
 
V
P
 
S
Q
|
Q
-
 
E
S
 
S
P
 
P
L
 
L
T
 
M
P
 
S
E
 
G
G
 
-
L
 
-
T
 
T
V
 
I
F
 
R
E
 
E
L
 
N
V
 
I
S
 
C
R
 
-
G
 
-
R
 
-
Y
 
-
P
 
-
W
 
-
Q
 
Y
G
 
G
L
 
L
M
 
E
R
 
R
Q
 
D
W
 
V
S
 
T
E
 
D
A
 
A
D
 
E
-
 
I
E
 
E
R
 
K
A
 
A
V
 
A
E
 
E
E
 
M
A
 
A
L
 
Y
M
 
A
L
 
L
T
 
N
G
 
F
T
 
I
A
 
K
E
 
E
F
 
L
A
 
P
H
 
N
L
 
-
A
 
Q
V
 
F
D
 
D
S
 
T
-
 
E
-
 
V
-
 
G
-
 
E
-
 
R
-
 
G
-
x
I
-
 
M
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
Q
 
Q
R
 
R
Q
 
Q
R
 
R
C
 
I
W
 
A
I
 
I
A
 
A
M
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
L
Q
 
R
Q
 
N
T
 
P
A
 
S
T
 
I
I
 
L
L
 
M
L
 
L
D
 
D
E
 
A
P
 
A
T
 
T
T
 
S
W
 
S
L
 
L
D
 
D
L
 
S
R
 
Q
Y
 
S
Q
 
E
V
 
K
D
 
S
I
 
V
L
 
Q
E
 
Q
L
 
A
L
 
L
Q
 
E
T
 
V
L
 
L
T
 
M
R
 
-
D
 
-
H
 
E
G
 
G
R
 
R
T
 
T
V
 
T
V
 
I
T
 
V
V
 
I
L
 
A
H
|
H
D
 
R
L
 
L
N
 
S
F
 
T
A
 
V
V
 
V
N
 
D
Y
 
-
A
 
A
D
 
D
L
 
Q
L
 
L
V
 
L
F
 
F
L
 
V
K
 
E
K
 
K
G
 
G
Q
 
E
I
 
I
A
 
T
G
 
G

Sites not aligning to the query:

7chaI Cryo-em structure of p.Aeruginosa mlafebd with amppnp (see paper)
29% identity, 95% coverage: 14:272/273 of query aligns to 6:258/262 of 7chaI

query
sites
7chaI
L
 
L
D
 
K
S
 
G
L
 
L
S
 
T
A
 
F
G
 
K
Y
x
R
G
 
G
Q
 
S
T
 
R
L
 
A
I
 
I
V
 
F
D
 
D
N
 
N
I
 
I
H
 
D
L
 
V
T
 
R
I
 
I
P
 
P
H
 
R
G
 
G
K
 
K
M
 
V
T
 
T
V
 
G
L
 
I
A
 
M
G
 
G
A
 
P
N
x
S
G
|
G
S
x
C
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
L
L
 
L
S
 
R
T
 
L
I
 
I
A
 
A
R
 
S
M
 
Q
L
 
L
K
 
R
P
 
P
L
 
S
G
 
K
G
 
G
C
 
E
V
 
V
R
 
W
L
 
V
D
 
N
G
 
G
E
 
Q
V
 
N
I
 
L
H
 
P
Q
 
Q
M
 
L
P
 
S
T
 
R
R
 
G
E
 
D
V
 
L
-
 
F
-
 
D
-
 
M
S
 
R
R
 
K
R
 
Q
L
 
F
G
 
G
I
 
V
L
 
L
P
 
F
Q
 
Q
S
 
S
P
 
G
L
 
A
T
 
L
P
 
F
E
 
T
G
 
D
L
 
L
T
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
E
L
 
N
V
 
V
S
 
A
R
 
-
G
 
-
R
 
-
Y
 
F
P
 
P
W
 
-
Q
 
-
G
 
-
L
 
-
M
 
L
R
 
R
Q
 
V
W
 
H
S
 
T
E
 
Q
A
 
L
D
 
P
E
 
E
R
 
E
A
 
M
V
 
I
E
 
R
E
 
D
A
 
I
L
 
V
M
 
L
L
 
M
-
 
K
-
 
L
-
 
Q
-
 
A
T
 
V
G
 
G
T
 
L
A
 
R
E
 
G
F
 
A
A
 
V
H
 
E
L
 
L
A
 
M
V
 
P
D
 
D
S
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
R
 
K
Q
 
R
R
 
R
C
 
V
W
 
A
I
 
L
A
 
A
M
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
A
Q
 
L
Q
 
D
T
 
P
A
 
Q
T
 
I
I
 
L
L
 
L
L
 
Y
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
F
T
 
V
W
 
G
L
 
Q
D
 
D
L
 
P
R
 
I
Y
 
A
Q
 
M
V
 
G
D
 
V
I
 
L
L
 
V
E
 
R
L
 
L
L
 
I
Q
 
R
T
 
L
L
 
L
T
 
N
R
 
D
D
 
A
H
 
L
G
 
G
R
 
I
T
 
T
V
 
S
V
 
I
T
 
V
V
 
V
L
 
S
H
 
H
D
 
D
L
 
L
N
 
A
F
 
E
A
 
T
V
 
A
N
 
S
Y
 
I
A
 
A
D
 
D
L
 
Y
L
 
I
V
 
Y
F
 
I
L
 
V
K
 
G
K
 
D
G
 
G
Q
 
R
I
 
V
A
 
L
G
 
G
V
 
H
I
 
-
N
 
-
E
 
-
Q
 
-
E
 
-
I
 
-
C
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
D
L
 
V
I
 
L
K
 
K
T
 
E
V
 
T
F
 
D
D
 
D
V
 
P
D
 
R
V
 
I
Q
 
R
M
 
Q
S
 
F
L
 
V
N
 
K
-
 
G
-
 
I
P
 
P
Q
 
D
T
 
G
G
 
P
K
 
V
P
 
P
F
 
F
F
 
H
M
 
Y
P
 
P
F
 
-
R
 
-
A
 
A
R
 
R
E
 
D
E
 
Y
K
 
R
A
 
A

G7CBF5 Mycobactin import ATP-binding/permease protein IrtA; EC 7.2.2.- from Mycolicibacterium thermoresistibile (strain ATCC 19527 / DSM 44167 / CIP 105390 / JCM 6362 / NCTC 10409 / 316) (Mycobacterium thermoresistibile) (see paper)
32% identity, 82% coverage: 12:235/273 of query aligns to 654:874/908 of G7CBF5

query
sites
G7CBF5
I
 
V
V
 
E
L
 
L
D
 
D
S
 
R
L
 
V
S
 
S
A
 
F
G
 
E
Y
 
Y
G
 
R
Q
 
P
T
 
G
L
 
V
-
 
P
I
 
V
V
 
I
D
 
R
N
 
D
I
 
V
H
 
T
L
 
L
T
 
T
I
 
L
P
 
R
H
 
P
G
 
G
K
 
T
M
 
V
T
 
T
V
 
A
L
 
L
A
 
V
G
 
G
A
 
P
N
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
L
 
A
S
 
A
T
 
L
I
 
V
A
 
A
R
 
R
M
 
F
L
 
H
K
 
D
P
 
V
L
 
T
G
 
Q
G
 
G
C
 
A
V
 
I
R
 
R
L
 
V
D
 
D
G
 
G
E
 
R
V
 
D
I
 
I
H
 
R
Q
 
T
M
 
L
P
 
T
T
 
A
R
 
D
E
 
E
V
 
L
S
 
Y
R
 
R
R
 
R
L
 
V
G
 
G
I
 
F
L
 
V
P
 
L
Q
 
Q
S
 
D
P
 
A
L
 
Q
T
 
L
P
 
V
E
 
H
G
 
G
L
 
-
T
 
S
V
 
V
F
 
A
E
 
E
L
 
N
V
 
I
S
 
A
R
 
L
G
 
A
R
 
E
Y
 
-
P
 
P
W
 
D
Q
 
A
G
 
G
L
 
L
M
 
E
R
 
R
Q
 
I
W
 
R
S
 
T
E
 
A
A
 
A
D
 
R
E
 
D
R
 
A
A
 
Q
V
 
I
E
 
H
E
 
D
A
 
R
L
 
I
M
 
T
L
 
R
T
 
M
G
 
P
T
 
D
A
 
G
E
 
Y
F
 
D
A
 
S
H
 
V
L
 
L
A
 
G
V
 
A
D
 
G
S
 
S
-
 
A
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
R
 
R
Q
 
Q
R
 
R
C
 
V
W
 
T
I
 
I
A
 
A
M
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
L
Q
 
A
Q
 
D
T
 
T
A
 
P
T
 
V
I
 
L
L
 
V
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
A
T
 
T
T
 
A
W
 
F
L
 
A
D
 
D
L
 
P
R
 
E
Y
 
S
Q
 
E
V
 
Y
D
 
L
I
 
V
L
 
Q
E
 
Q
L
 
A
L
 
I
Q
 
N
T
 
R
L
 
L
T
 
T
R
 
R
D
 
D
H
 
-
G
 
-
R
 
R
T
 
T
V
 
V
V
 
L
T
 
V
V
 
I
L
 
A
H
 
H
D
 
R
L
 
L
N
 
H
F
 
-
A
 
T
V
 
I
N
 
T
Y
 
H
A
 
A
D
 
D
L
 
Q
L
 
I
V
 
V
F
 
V
L
 
L
K
 
D
K
 
D
G
 
G
Q
 
R
I
 
I
A
 
V
G
 
E
V
 
V
I
 
G
N
 
T
E
 
H
Q
 
D
E
 
E
I
 
L

Sites not aligning to the query:

P30750 Methionine import ATP-binding protein MetN; EC 7.4.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
31% identity, 73% coverage: 27:226/273 of query aligns to 21:219/343 of P30750

query
sites
P30750
V
 
L
D
 
N
N
 
N
I
 
V
H
 
S
L
 
L
T
 
H
I
 
V
P
 
P
H
 
A
G
 
G
K
 
Q
M
 
I
T
 
Y
V
 
G
L
 
V
A
 
I
G
 
G
A
 
A
N
x
S
G
|
G
S
x
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
S
 
R
T
 
C
I
 
V
A
 
N
R
 
L
M
 
L
L
 
E
K
 
R
P
 
P
L
 
T
G
 
E
G
 
G
C
 
S
V
 
V
R
 
L
L
 
V
D
 
D
G
 
G
E
 
Q
V
 
E
I
 
L
H
 
T
Q
 
T
M
 
L
P
 
S
T
 
E
R
 
S
E
 
E
V
 
L
S
 
T
-
 
K
-
 
A
-
 
R
R
 
R
R
 
Q
L
 
I
G
 
G
I
 
M
L
 
I
P
 
F
Q
 
Q
S
 
H
P
 
F
L
 
N
T
 
L
P
 
L
E
 
S
G
 
S
L
 
R
T
 
T
V
 
V
F
 
F
E
 
G
L
 
N
V
 
V
S
 
A
R
 
-
G
 
-
R
 
-
Y
 
L
P
 
P
W
 
L
Q
 
E
G
 
-
L
 
L
M
 
D
R
 
N
Q
 
T
W
 
P
S
 
K
E
 
D
A
 
E
D
 
V
E
 
K
R
 
R
A
 
R
V
 
V
E
 
T
E
 
E
A
 
L
L
 
L
M
 
S
L
 
L
T
 
V
G
 
G
T
 
L
A
 
G
E
 
D
F
 
K
A
 
H
H
 
D
L
 
S
A
 
Y
V
 
P
D
 
S
S
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
R
 
K
Q
 
Q
R
 
R
C
 
V
W
 
A
I
 
I
A
 
A
M
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
S
Q
 
N
T
 
P
A
 
K
T
 
V
I
 
L
L
 
L
L
 
C
D
 
D
E
|
E
P
 
A
T
 
T
T
 
S
W
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
P
R
 
A
Y
 
T
Q
 
T
V
 
R
D
 
S
I
 
I
L
 
L
E
 
E
L
 
L
L
 
L
Q
 
K
T
 
D
L
 
I
T
 
N
R
 
R
D
 
R
H
 
L
G
 
G
R
 
L
T
 
T
V
 
I
V
 
L
T
 
L
V
 
I
L
 
T
H
 
H
D
 
E
L
 
M
N
 
D
F
 
V
A
 
V
V
 
K
N
 
R
Y
 
I
A
 
C
D
 
D
L
 
C
L
 
V
V
 
A
F
 
V
L
 
I
K
 
S
K
 
N
G
 
G
Q
 
E
I
 
L

Sites not aligning to the query:

3c4jA Abc protein artp in complex with atp-gamma-s
31% identity, 79% coverage: 10:226/273 of query aligns to 2:216/242 of 3c4jA

query
sites
3c4jA
Q
 
Q
G
 
M
I
 
I
V
 
D
L
 
V
D
 
H
S
 
Q
L
 
L
S
 
K
A
 
K
G
 
S
Y
x
F
G
 
G
Q
 
S
T
 
L
L
 
E
I
x
V
V
 
L
D
 
K
N
 
G
I
 
I
H
 
N
L
 
V
T
 
H
I
 
I
P
 
R
H
 
E
G
 
G
K
 
E
M
 
V
T
 
V
V
 
V
L
 
V
A
 
I
G
 
G
A
 
P
N
x
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
L
S
 
R
T
 
C
I
 
L
A
 
N
R
 
L
M
 
L
L
 
E
K
 
D
P
 
F
L
 
D
G
 
E
G
 
G
C
 
E
V
 
I
R
 
I
L
 
I
D
 
D
G
 
G
E
 
I
V
 
N
I
 
L
H
 
K
Q
 
A
M
 
K
P
 
D
T
 
T
R
 
N
-
 
L
-
 
N
E
 
K
V
 
V
S
 
R
R
 
E
R
 
E
L
 
V
G
 
G
I
 
M
L
 
V
P
 
F
Q
 
Q
S
 
R
P
 
F
L
 
N
T
 
L
P
 
F
E
 
P
G
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
F
 
L
E
 
N
L
 
N
V
 
I
S
 
T
R
 
L
G
 
A
R
 
-
Y
 
-
P
 
P
W
 
M
Q
 
K
G
 
-
L
 
-
M
 
V
R
 
R
Q
 
K
W
 
W
-
 
P
S
 
R
E
 
E
A
 
K
D
 
A
E
 
E
R
 
A
A
 
K
V
 
A
E
 
M
E
 
E
A
 
L
L
 
L
M
 
D
L
 
K
T
 
V
G
 
G
T
 
L
A
 
K
E
 
D
F
 
K
A
 
A
H
 
H
L
 
A
A
 
Y
V
 
P
D
 
D
S
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
R
 
A
Q
 
Q
R
 
R
C
 
V
W
 
A
I
 
I
A
 
A
M
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
M
Q
 
E
T
 
P
A
 
K
T
 
I
I
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
T
 
S
W
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
P
R
 
E
Y
 
M
Q
 
V
V
 
G
D
 
E
I
 
V
L
 
L
E
 
S
L
 
V
L
 
M
Q
 
K
T
 
Q
L
 
L
T
 
A
R
 
-
D
 
N
H
 
E
G
 
G
R
 
M
T
 
T
V
 
M
V
 
V
T
 
V
V
 
V
L
 
T
H
 
H
D
 
E
L
 
M
N
 
G
F
 
F
A
 
A
V
 
R
N
 
E
Y
 
V
A
 
G
D
 
D
L
 
R
L
 
V
V
 
L
F
 
F
L
 
M
K
 
D
K
 
G
G
 
G
Q
 
Y
I
 
I

3c41J Abc protein artp in complex with amp-pnp/mg2+
31% identity, 79% coverage: 10:226/273 of query aligns to 2:216/242 of 3c41J

query
sites
3c41J
Q
 
Q
G
 
M
I
 
I
V
 
D
L
 
V
D
 
H
S
 
Q
L
 
L
S
 
K
A
 
K
G
 
S
Y
x
F
G
 
G
Q
 
S
T
 
L
L
 
E
I
x
V
V
 
L
D
 
K
N
 
G
I
 
I
H
 
N
L
 
V
T
 
H
I
 
I
P
 
R
H
 
E
G
 
G
K
 
E
M
 
V
T
 
V
V
 
V
L
 
V
A
 
I
G
 
G
A
 
P
N
x
S
G
|
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
L
S
 
R
T
 
C
I
 
L
A
 
N
R
 
L
M
 
L
L
 
E
K
 
D
P
 
F
L
 
D
G
 
E
G
 
G
C
 
E
V
 
I
R
 
I
L
 
I
D
 
D
G
 
G
E
 
I
V
 
N
I
 
L
H
 
K
Q
 
A
M
 
K
P
 
D
T
 
T
R
 
N
-
 
L
-
 
N
E
 
K
V
 
V
S
 
R
R
 
E
R
 
E
L
 
V
G
 
G
I
 
M
L
 
V
P
 
F
Q
 
Q
S
 
R
P
 
F
L
 
N
T
 
L
P
 
F
E
 
P
G
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
F
 
L
E
 
N
L
 
N
V
 
I
S
 
T
R
 
L
G
 
A
R
 
-
Y
 
-
P
 
P
W
 
M
Q
 
K
G
 
-
L
 
-
M
 
V
R
 
R
Q
 
K
W
 
W
-
 
P
S
 
R
E
 
E
A
 
K
D
 
A
E
 
E
R
 
A
A
 
K
V
 
A
E
 
M
E
 
E
A
 
L
L
 
L
M
 
D
L
 
K
T
 
V
G
 
G
T
 
L
A
 
K
E
 
D
F
 
K
A
 
A
H
 
H
L
 
A
A
 
Y
V
 
P
D
 
D
S
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
R
 
A
Q
 
Q
R
 
R
C
 
V
W
 
A
I
 
I
A
 
A
M
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
M
Q
 
E
T
 
P
A
 
K
T
 
I
I
 
M
L
 
L
L
 
F
D
|
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
T
 
S
W
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
P
R
 
E
Y
 
M
Q
 
V
V
 
G
D
 
E
I
 
V
L
 
L
E
 
S
L
 
V
L
 
M
Q
 
K
T
 
Q
L
 
L
T
 
A
R
 
-
D
 
N
H
 
E
G
 
G
R
 
M
T
 
T
V
 
M
V
 
V
T
 
V
V
 
V
L
 
T
H
 
H
D
 
E
L
 
M
N
 
G
F
 
F
A
 
A
V
 
R
N
 
E
Y
 
V
A
 
G
D
 
D
L
 
R
L
 
V
V
 
L
F
 
F
L
 
M
K
 
D
K
 
G
G
 
G
Q
 
Y
I
 
I

2olkA Abc protein artp in complex with adp-beta-s
31% identity, 79% coverage: 10:226/273 of query aligns to 2:216/242 of 2olkA

query
sites
2olkA
Q
 
Q
G
 
M
I
 
I
V
 
D
L
 
V
D
 
H
S
 
Q
L
 
L
S
 
K
A
 
K
G
 
S
Y
x
F
G
 
G
Q
 
S
T
 
L
L
 
E
I
x
V
V
 
L
D
 
K
N
 
G
I
 
I
H
 
N
L
 
V
T
 
H
I
 
I
P
 
R
H
 
E
G
 
G
K
 
E
M
 
V
T
 
V
V
 
V
L
 
V
A
 
I
G
 
G
A
 
P
N
x
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
L
S
 
R
T
 
C
I
 
L
A
 
N
R
 
L
M
 
L
L
 
E
K
 
D
P
 
F
L
 
D
G
 
E
G
 
G
C
 
E
V
 
I
R
 
I
L
 
I
D
 
D
G
 
G
E
 
I
V
 
N
I
 
L
H
 
K
Q
 
A
M
 
K
P
 
D
T
 
T
R
 
N
-
 
L
-
 
N
E
 
K
V
 
V
S
 
R
R
 
E
R
 
E
L
 
V
G
 
G
I
 
M
L
 
V
P
 
F
Q
 
Q
S
 
R
P
 
F
L
 
N
T
 
L
P
 
F
E
 
P
G
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
F
 
L
E
 
N
L
 
N
V
 
I
S
 
T
R
 
L
G
 
A
R
 
-
Y
 
-
P
 
P
W
 
M
Q
 
K
G
 
-
L
 
-
M
 
V
R
 
R
Q
 
K
W
 
W
-
 
P
S
 
R
E
 
E
A
 
K
D
 
A
E
 
E
R
 
A
A
 
K
V
 
A
E
 
M
E
 
E
A
 
L
L
 
L
M
 
D
L
 
K
T
 
V
G
 
G
T
 
L
A
 
K
E
 
D
F
 
K
A
 
A
H
 
H
L
 
A
A
 
Y
V
 
P
D
 
D
S
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
R
 
A
Q
 
Q
R
 
R
C
 
V
W
 
A
I
 
I
A
 
A
M
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
M
Q
 
E
T
 
P
A
 
K
T
 
I
I
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
T
 
S
W
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
P
R
 
E
Y
 
M
Q
 
V
V
 
G
D
 
E
I
 
V
L
 
L
E
 
S
L
 
V
L
 
M
Q
 
K
T
 
Q
L
 
L
T
 
A
R
 
-
D
 
N
H
 
E
G
 
G
R
 
M
T
 
T
V
 
M
V
 
V
T
 
V
V
 
V
L
 
T
H
 
H
D
 
E
L
 
M
N
 
G
F
 
F
A
 
A
V
 
R
N
 
E
Y
 
V
A
 
G
D
 
D
L
 
R
L
 
V
V
 
L
F
 
F
L
 
M
K
 
D
K
 
G
G
 
G
Q
 
Y
I
 
I

2oljA Abc protein artp in complex with adp/mg2+
31% identity, 79% coverage: 10:226/273 of query aligns to 2:216/242 of 2oljA

query
sites
2oljA
Q
 
Q
G
 
M
I
 
I
V
 
D
L
 
V
D
 
H
S
 
Q
L
 
L
S
 
K
A
 
K
G
 
S
Y
x
F
G
 
G
Q
 
S
T
 
L
L
 
E
I
x
V
V
 
L
D
 
K
N
 
G
I
 
I
H
 
N
L
 
V
T
 
H
I
 
I
P
 
R
H
 
E
G
 
G
K
 
E
M
 
V
T
 
V
V
 
V
L
 
V
A
 
I
G
 
G
A
 
P
N
x
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
L
S
 
R
T
 
C
I
 
L
A
 
N
R
 
L
M
 
L
L
 
E
K
 
D
P
 
F
L
 
D
G
 
E
G
 
G
C
 
E
V
 
I
R
 
I
L
 
I
D
 
D
G
 
G
E
 
I
V
 
N
I
 
L
H
 
K
Q
 
A
M
 
K
P
 
D
T
 
T
R
 
N
-
 
L
-
 
N
E
 
K
V
 
V
S
 
R
R
 
E
R
 
E
L
 
V
G
 
G
I
 
M
L
 
V
P
 
F
Q
 
Q
S
 
R
P
 
F
L
 
N
T
 
L
P
 
F
E
 
P
G
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
F
 
L
E
 
N
L
 
N
V
 
I
S
 
T
R
 
L
G
 
A
R
 
-
Y
 
-
P
 
P
W
 
M
Q
 
K
G
 
-
L
 
-
M
 
V
R
 
R
Q
 
K
W
 
W
-
 
P
S
 
R
E
 
E
A
 
K
D
 
A
E
 
E
R
 
A
A
 
K
V
 
A
E
 
M
E
 
E
A
 
L
L
 
L
M
 
D
L
 
K
T
 
V
G
 
G
T
 
L
A
 
K
E
 
D
F
 
K
A
 
A
H
 
H
L
 
A
A
 
Y
V
 
P
D
 
D
S
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
R
 
A
Q
 
Q
R
 
R
C
 
V
W
 
A
I
 
I
A
 
A
M
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
M
Q
 
E
T
 
P
A
 
K
T
 
I
I
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
T
 
S
W
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
P
R
 
E
Y
 
M
Q
 
V
V
 
G
D
 
E
I
 
V
L
 
L
E
 
S
L
 
V
L
 
M
Q
 
K
T
 
Q
L
 
L
T
 
A
R
 
-
D
 
N
H
 
E
G
 
G
R
 
M
T
 
T
V
 
M
V
 
V
T
 
V
V
 
V
L
 
T
H
 
H
D
 
E
L
 
M
N
 
G
F
 
F
A
 
A
V
 
R
N
 
E
Y
 
V
A
 
G
D
 
D
L
 
R
L
 
V
V
 
L
F
 
F
L
 
M
K
 
D
K
 
G
G
 
G
Q
 
Y
I
 
I

A0R6H8 Mycobactin import ATP-binding/permease protein IrtA; EC 7.2.2.- from Mycolicibacterium smegmatis (strain ATCC 700084 / mc(2)155) (Mycobacterium smegmatis) (see paper)
32% identity, 80% coverage: 8:226/273 of query aligns to 605:820/860 of A0R6H8

query
sites
A0R6H8
A
 
G
E
 
E
Q
 
P
G
 
A
I
 
V
V
 
V
L
 
F
D
 
D
S
 
N
L
 
V
S
 
T
A
 
F
G
 
G
Y
 
Y
G
 
R
Q
 
P
T
 
D
L
 
I
-
 
P
I
 
V
V
 
L
D
 
H
N
 
D
I
 
I
H
 
S
L
 
L
T
 
Q
I
 
L
P
 
T
H
 
P
G
 
G
K
 
T
M
 
V
T
 
T
V
 
A
L
 
L
A
 
V
G
 
G
A
 
P
N
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
L
 
A
S
 
A
T
 
L
I
 
L
A
 
A
R
 
R
M
 
F
L
 
H
K
 
D
P
 
V
L
 
D
G
 
A
G
 
G
C
 
A
V
 
I
R
 
R
L
 
L
D
 
G
G
 
G
E
 
R
V
 
D
I
 
I
H
 
R
Q
 
T
M
 
L
P
 
T
T
 
A
R
 
D
E
 
E
V
 
L
S
 
Y
R
 
R
R
 
Q
L
 
V
G
 
G
I
 
F
L
 
V
P
 
L
Q
 
Q
S
 
D
P
 
T
L
 
Q
T
 
L
P
 
V
E
 
G
G
 
G
L
 
-
T
 
T
V
 
V
F
 
A
E
 
E
L
 
N
V
 
I
S
 
A
R
 
L
G
 
A
R
 
D
Y
 
-
P
 
P
W
 
D
Q
 
A
G
 
S
L
 
I
M
 
E
R
 
R
Q
 
I
W
 
Q
S
 
D
E
 
A
A
 
A
D
 
R
E
 
D
R
 
A
A
 
Q
V
 
I
E
 
H
E
 
D
A
 
R
L
 
I
M
 
M
-
 
R
L
 
L
T
 
P
G
 
N
T
 
G
A
 
Y
E
 
D
F
 
T
A
 
P
H
 
L
L
 
G
A
 
A
V
 
A
D
 
S
S
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
R
 
K
Q
 
Q
R
 
R
C
 
L
W
 
T
I
 
I
A
 
A
M
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
L
Q
 
A
Q
 
D
T
 
T
A
 
P
T
 
V
I
 
L
L
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
A
T
 
T
T
 
A
W
 
F
L
 
A
D
 
D
L
 
P
R
 
E
Y
 
S
Q
 
E
V
 
Y
D
 
L
I
 
V
L
 
Q
E
 
Q
L
 
A
L
 
L
Q
 
N
T
 
R
L
 
L
T
 
T
R
 
R
D
 
D
H
 
-
G
 
-
R
 
R
T
 
T
V
 
V
V
 
L
T
 
V
V
 
I
L
 
A
H
 
H
D
 
R
L
 
L
N
 
H
F
 
-
A
 
T
V
 
I
N
 
T
Y
 
H
A
 
A
D
 
D
L
 
Q
L
 
I
V
 
V
F
 
V
L
 
L
K
 
E
K
 
G
G
 
G
Q
 
R
I
 
I

Sites not aligning to the query:

5x40A Structure of a cbio dimer bound with amppcp (see paper)
35% identity, 75% coverage: 22:226/273 of query aligns to 16:218/280 of 5x40A

query
sites
5x40A
G
 
G
Q
 
G
T
x
V
L
 
K
I
x
A
V
 
L
D
 
D
N
 
D
I
 
L
H
 
S
L
 
L
T
 
A
I
 
V
P
 
P
H
 
K
G
 
G
K
 
E
M
 
S
T
 
L
V
 
A
L
 
I
A
 
L
G
 
G
A
 
P
N
|
N
G
|
G
S
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
S
 
L
T
 
H
I
 
L
A
 
N
R
 
G
M
 
T
L
 
L
K
 
R
P
 
P
L
 
Q
G
 
S
G
 
G
C
 
R
V
 
V
R
 
L
L
 
L
D
 
G
G
 
G
E
 
T
V
 
A
I
 
T
H
 
G
Q
 
H
M
 
-
P
 
S
T
 
R
R
 
K
E
 
D
V
 
L
S
 
T
-
 
G
-
 
W
-
 
R
R
 
R
R
 
R
L
 
V
G
 
G
I
 
L
L
 
V
P
 
L
Q
|
Q
S
 
D
P
 
A
L
 
D
T
 
D
P
 
Q
-
 
L
E
 
F
G
 
A
L
 
T
T
 
T
V
 
V
F
 
F
E
 
E
L
 
D
V
 
V
S
 
S
R
 
F
G
 
G
R
 
P
Y
 
-
P
 
-
W
 
-
Q
 
-
G
 
-
L
 
L
M
 
N
R
 
L
Q
 
G
W
 
L
S
 
S
E
 
E
A
 
A
D
 
E
E
 
A
R
 
R
A
 
A
-
 
R
V
 
V
E
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
L
M
 
A
L
 
A
T
 
L
G
 
S
T
 
I
A
 
S
E
 
D
F
 
L
A
 
R
H
 
D
L
 
R
A
 
P
V
 
T
D
x
H
S
x
M
L
|
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
Q
|
Q
R
 
K
Q
 
R
R
 
R
C
 
V
W
 
A
I
 
I
A
 
A
M
 
G
A
 
A
L
 
V
A
 
A
Q
 
M
Q
 
R
T
 
P
A
 
E
T
 
V
I
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
x
Q
P
 
P
T
 
T
T
 
A
W
 
G
L
 
L
D
 
D
L
 
L
R
 
A
Y
 
G
Q
 
T
V
 
E
D
 
Q
I
 
L
L
 
L
E
 
T
L
 
L
L
 
L
Q
 
R
T
 
G
L
 
L
T
 
-
R
 
R
D
 
A
H
 
A
G
 
G
R
 
M
T
 
T
V
 
L
V
 
V
T
 
F
V
 
S
L
 
T
H
|
H
D
 
D
L
 
V
N
 
E
F
 
L
A
 
A
V
 
A
N
 
A
Y
 
L
A
 
A
D
 
D
L
 
R
L
 
V
V
 
A
F
 
L
L
 
F
K
 
R
K
 
T
G
 
G
Q
 
R
I
 
V

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>BWI76_RS16830 FitnessBrowser__Koxy:BWI76_RS16830
MPQRVLPAEQGIVLDSLSAGYGQTLIVDNIHLTIPHGKMTVLAGANGSGKSTLLSTIARM
LKPLGGCVRLDGEVIHQMPTREVSRRLGILPQSPLTPEGLTVFELVSRGRYPWQGLMRQW
SEADERAVEEALMLTGTAEFAHLAVDSLSGGQRQRCWIAMALAQQTATILLDEPTTWLDL
RYQVDILELLQTLTRDHGRTVVTVLHDLNFAVNYADLLVFLKKGQIAGVINEQEICTPEL
IKTVFDVDVQMSLNPQTGKPFFMPFRAREEKAL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory