SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing BWI76_RS20065 FitnessBrowser__Koxy:BWI76_RS20065 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

Q7CQ56 1,4-dihydroxy-2-naphthoyl-CoA synthase; DHNA-CoA synthase; EC 4.1.3.36 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720)
96% identity, 100% coverage: 1:285/285 of query aligns to 1:285/285 of Q7CQ56

query
sites
Q7CQ56
M
 
M
I
 
I
S
 
Y
L
 
P
D
 
D
E
 
E
A
 
T
M
 
M
L
 
L
Y
 
Y
A
 
A
P
 
P
I
 
V
E
 
E
W
 
W
Q
 
H
D
 
D
C
 
C
S
 
S
E
 
E
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
D
 
D
I
 
I
R
 
R
Y
 
Y
Q
 
E
K
 
K
S
 
S
A
 
T
D
 
D
G
 
G
I
 
I
A
 
A
K
 
K
I
 
I
T
 
T
I
 
I
N
 
N
R
 
R
P
 
P
Q
 
Q
V
 
V
R
 
R
N
 
N
A
 
A
F
 
F
R
 
R
P
 
P
L
 
L
T
 
T
V
 
V
K
 
K
E
 
E
M
 
M
I
 
I
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
A
R
 
R
Y
 
Y
D
 
D
D
 
D
N
 
N
I
 
V
G
 
G
V
 
V
I
 
I
V
 
I
L
 
L
T
 
T
G
 
G
E
 
E
G
 
G
D
 
D
K
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
C
A
 
A
G
 
G
G
 
G
D
 
D
Q
 
Q
K
 
K
V
 
V
R
 
R
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
Q
D
 
D
D
 
D
S
 
S
G
 
G
V
 
V
H
 
H
H
 
H
L
 
L
N
 
N
V
 
V
L
 
L
D
 
D
F
 
F
Q
 
Q
R
 
R
Q
 
Q
I
 
I
R
 
R
T
 
T
C
 
C
P
 
P
K
 
K
P
 
P
V
 
V
L
 
V
A
 
A
M
 
M
V
 
V
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
S
 
S
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
H
 
H
V
 
V
L
 
L
H
 
H
M
 
M
M
 
M
C
 
C
D
 
D
L
 
L
T
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
E
N
 
N
A
 
A
I
 
I
F
 
F
G
 
G
Q
|
Q
T
|
T
G
|
G
P
 
P
K
 
K
V
 
V
G
 
G
S
 
S
F
 
F
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
W
G
 
G
A
 
A
S
 
S
Y
 
Y
M
 
M
A
 
A
R
 
R
I
 
I
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
K
 
K
A
 
A
R
 
R
E
 
E
I
 
I
W
 
W
F
 
F
L
 
L
C
 
C
R
 
R
Q
 
Q
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
D
 
D
M
 
M
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N
T
 
T
V
 
V
V
 
V
P
 
P
L
 
L
A
 
A
D
 
D
L
 
L
E
 
E
K
 
K
E
 
E
T
 
T
V
 
V
R
 
R
W
 
W
C
 
C
R
 
R
E
 
E
M
 
M
L
 
L
Q
 
Q
N
 
N
S
 
S
P
 
P
M
 
M
A
 
A
L
 
L
R
 
R
C
 
C
L
 
L
K
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
D
 
D
C
 
C
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
L
Q
 
Q
E
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
T
 
T
M
 
M
L
 
L
F
 
F
Y
 
Y
M
 
M
T
 
T
E
 
E
E
 
E
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
R
 
R
N
 
N
A
 
A
F
 
F
N
 
N
Q
 
Q
K
 
K
R
 
R
Q
 
Q
P
 
P
D
 
D
F
 
F
S
 
S
K
 
K
F
 
F
K
 
K
R
 
R
N
 
N
P
 
P

4i42A E.Coli. 1,4-dihydroxy-2-naphthoyl coenzyme a synthase (ecmenb) in complex with 1-hydroxy-2-naphthoyl-coa (see paper)
95% identity, 100% coverage: 1:285/285 of query aligns to 1:285/285 of 4i42A

query
sites
4i42A
M
 
M
I
 
I
S
 
Y
L
 
P
D
 
D
E
 
E
A
 
A
M
 
M
L
 
L
Y
 
Y
A
 
A
P
 
P
I
 
V
E
 
E
W
 
W
Q
 
H
D
 
D
C
 
C
S
 
S
E
 
E
G
 
G
Y
 
F
T
 
E
D
 
D
I
 
I
R
 
R
Y
 
Y
Q
 
E
K
 
K
S
 
S
A
 
T
D
 
D
G
 
G
I
 
I
A
 
A
K
 
K
I
 
I
T
 
T
I
 
I
N
 
N
R
 
R
P
 
P
Q
 
Q
V
|
V
R
|
R
N
 
N
A
 
A
F
 
F
R
 
R
P
 
P
L
 
L
T
 
T
V
 
V
K
 
K
E
 
E
M
 
M
I
 
I
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
A
R
 
R
Y
 
Y
D
 
D
D
 
D
N
 
N
I
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
I
V
 
I
L
 
L
T
 
T
G
 
G
E
 
A
G
 
G
D
 
D
K
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
C
A
x
S
G
|
G
G
|
G
D
|
D
Q
|
Q
K
|
K
V
 
V
R
|
R
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
Y
|
Y
Q
 
K
D
 
D
D
 
D
S
 
S
G
 
G
V
 
V
H
 
H
H
|
H
L
 
L
N
 
N
V
|
V
L
|
L
D
 
D
F
 
F
Q
 
Q
R
 
R
Q
 
Q
I
 
I
R
 
R
T
 
T
C
 
C
P
 
P
K
 
K
P
 
P
V
 
V
L
 
V
A
 
A
M
 
M
V
 
V
A
 
A
G
 
G
Y
|
Y
S
 
S
I
 
I
G
 
G
G
|
G
G
 
G
H
 
H
V
|
V
L
 
L
H
 
H
M
 
M
M
 
M
C
 
C
D
 
D
L
 
L
T
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
D
N
 
N
A
 
A
I
 
I
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
T
|
T
G
|
G
P
 
P
K
 
K
V
 
V
G
 
G
S
|
S
F
 
F
D
|
D
G
|
G
G
 
G
W
 
W
G
 
G
A
 
A
S
 
S
Y
 
Y
M
 
M
A
 
A
R
 
R
I
 
I
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
K
 
K
A
 
A
R
 
R
E
 
E
I
 
I
W
 
W
F
 
F
L
 
L
C
 
C
R
 
R
Q
 
Q
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
Q
 
K
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
D
 
D
M
 
M
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N
T
 
T
V
 
V
V
 
V
P
 
P
L
 
L
A
 
A
D
 
D
L
 
L
E
 
E
K
 
K
E
 
E
T
 
T
V
 
V
R
 
R
W
 
W
C
 
C
R
 
R
E
 
E
M
 
M
L
 
L
Q
 
Q
N
 
N
S
 
S
P
 
P
M
 
M
A
 
A
L
 
L
R
 
R
C
 
C
L
 
L
K
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
D
 
D
C
 
C
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
L
Q
 
Q
E
 
E
L
 
L
A
|
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
T
|
T
M
 
M
L
 
L
F
 
F
Y
|
Y
M
 
M
T
 
T
E
 
E
E
 
E
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
R
 
R
N
 
N
A
 
A
F
|
F
N
 
N
Q
 
Q
K
|
K
R
 
R
Q
 
Q
P
 
P
D
 
D
F
 
F
S
 
S
K
 
K
F
 
F
K
 
K
R
 
R
N
 
N
P
 
P

P0ABU0 1,4-dihydroxy-2-naphthoyl-CoA synthase; DHNA-CoA synthase; EC 4.1.3.36 from Escherichia coli (strain K12) (see 4 papers)
95% identity, 100% coverage: 1:285/285 of query aligns to 1:285/285 of P0ABU0

query
sites
P0ABU0
M
 
M
I
 
I
S
 
Y
L
 
P
D
 
D
E
 
E
A
 
A
M
 
M
L
 
L
Y
 
Y
A
 
A
P
 
P
I
 
V
E
 
E
W
 
W
Q
 
H
D
 
D
C
 
C
S
 
S
E
 
E
G
 
G
Y
 
F
T
 
E
D
 
D
I
 
I
R
 
R
Y
 
Y
Q
 
E
K
 
K
S
 
S
A
 
T
D
 
D
G
 
G
I
 
I
A
 
A
K
 
K
I
 
I
T
 
T
I
 
I
N
 
N
R
 
R
P
 
P
Q
 
Q
V
 
V
R
|
R
N
 
N
A
 
A
F
 
F
R
 
R
P
 
P
L
 
L
T
 
T
V
 
V
K
 
K
E
 
E
M
 
M
I
 
I
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
A
R
 
R
Y
 
Y
D
 
D
D
 
D
N
 
N
I
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
I
V
 
I
L
 
L
T
 
T
G
 
G
E
 
A
G
 
G
D
 
D
K
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
C
A
x
S
G
|
G
G
|
G
D
|
D
Q
|
Q
K
|
K
V
 
V
R
|
R
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
Y
|
Y
Q
 
K
D
 
D
D
 
D
S
 
S
G
 
G
V
 
V
H
 
H
H
 
H
L
 
L
N
 
N
V
 
V
L
 
L
D
 
D
F
 
F
Q
 
Q
R
 
R
Q
 
Q
I
 
I
R
 
R
T
 
T
C
 
C
P
 
P
K
 
K
P
 
P
V
 
V
L
 
V
A
 
A
M
 
M
V
 
V
A
 
A
G
 
G
Y
|
Y
S
|
S
I
|
I
G
|
G
G
|
G
G
 
G
H
 
H
V
 
V
L
 
L
H
 
H
M
 
M
M
 
M
C
 
C
D
 
D
L
 
L
T
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
D
N
 
N
A
 
A
I
 
I
F
 
F
G
 
G
Q
|
Q
T
|
T
G
|
G
P
 
P
K
 
K
V
 
V
G
 
G
S
|
S
F
 
F
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
W
G
 
G
A
 
A
S
 
S
Y
 
Y
M
 
M
A
 
A
R
 
R
I
 
I
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
K
 
K
A
 
A
R
 
R
E
 
E
I
 
I
W
|
W
F
 
F
L
 
L
C
 
C
R
 
R
Q
 
Q
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
Q
 
K
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
D
 
D
M
 
M
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N
T
 
T
V
 
V
V
 
V
P
 
P
L
 
L
A
 
A
D
 
D
L
 
L
E
 
E
K
 
K
E
 
E
T
 
T
V
 
V
R
 
R
W
 
W
C
 
C
R
 
R
E
 
E
M
 
M
L
 
L
Q
 
Q
N
 
N
S
 
S
P
 
P
M
 
M
A
 
A
L
 
L
R
 
R
C
 
C
L
 
L
K
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
D
 
D
C
 
C
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
L
Q
 
Q
E
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
T
 
T
M
 
M
L
 
L
F
 
F
Y
|
Y
M
 
M
T
 
T
E
 
E
E
 
E
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
R
|
R
N
 
N
A
 
A
F
|
F
N
 
N
Q
 
Q
K
|
K
R
 
R
Q
 
Q
P
 
P
D
 
D
F
 
F
S
 
S
K
 
K
F
 
F
K
 
K
R
 
R
N
 
N
P
 
P

3t88A Crystal structure of escherichia coli menb in complex with substrate analogue, osb-ncoa (see paper)
95% identity, 99% coverage: 5:285/285 of query aligns to 1:281/281 of 3t88A

query
sites
3t88A
D
 
D
E
 
E
A
 
A
M
 
M
L
 
L
Y
 
Y
A
 
A
P
 
P
I
 
V
E
 
E
W
 
W
Q
 
H
D
 
D
C
 
C
S
 
S
E
 
E
G
 
G
Y
 
F
T
 
E
D
 
D
I
 
I
R
 
R
Y
 
Y
Q
 
E
K
 
K
S
 
S
A
 
T
D
 
D
G
 
G
I
 
I
A
 
A
K
 
K
I
 
I
T
 
T
I
 
I
N
 
N
R
 
R
P
 
P
Q
|
Q
V
|
V
R
|
R
N
 
N
A
|
A
F
 
F
R
 
R
P
 
P
L
 
L
T
 
T
V
 
V
K
 
K
E
 
E
M
 
M
I
 
I
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
A
R
 
R
Y
 
Y
D
 
D
D
 
D
N
 
N
I
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
I
V
 
I
L
 
L
T
 
T
G
 
G
E
 
A
G
 
G
D
 
D
K
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
C
A
x
S
G
|
G
G
|
G
D
|
D
Q
|
Q
K
|
K
V
 
V
R
|
R
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
Y
|
Y
Q
 
K
D
 
D
D
 
D
S
 
S
G
 
G
V
 
V
H
 
H
H
|
H
L
 
L
N
 
N
V
|
V
L
|
L
D
 
D
F
 
F
Q
 
Q
R
 
R
Q
 
Q
I
 
I
R
 
R
T
 
T
C
 
C
P
 
P
K
 
K
P
 
P
V
 
V
L
 
V
A
 
A
M
 
M
V
 
V
A
 
A
G
 
G
Y
|
Y
S
 
S
I
 
I
G
 
G
G
|
G
G
 
G
H
 
H
V
|
V
L
 
L
H
 
H
M
 
M
M
 
M
C
 
C
D
 
D
L
 
L
T
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
D
N
 
N
A
 
A
I
 
I
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
T
|
T
G
|
G
P
 
P
K
 
K
V
|
V
G
 
G
S
|
S
F
|
F
D
|
D
G
|
G
G
 
G
W
 
W
G
 
G
A
 
A
S
 
S
Y
 
Y
M
 
M
A
 
A
R
 
R
I
 
I
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
K
 
K
A
 
A
R
 
R
E
 
E
I
 
I
W
 
W
F
 
F
L
 
L
C
 
C
R
 
R
Q
 
Q
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
Q
 
K
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
D
 
D
M
 
M
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N
T
 
T
V
 
V
V
 
V
P
 
P
L
 
L
A
 
A
D
 
D
L
 
L
E
 
E
K
 
K
E
 
E
T
 
T
V
 
V
R
 
R
W
 
W
C
 
C
R
 
R
E
 
E
M
 
M
L
 
L
Q
 
Q
N
 
N
S
 
S
P
 
P
M
 
M
A
 
A
L
 
L
R
 
R
C
 
C
L
 
L
K
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
D
 
D
C
 
C
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
L
Q
 
Q
E
 
E
L
 
L
A
|
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
T
|
T
M
 
M
L
 
L
F
 
F
Y
|
Y
M
 
M
T
 
T
E
 
E
E
 
E
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
R
 
R
N
 
N
A
 
A
F
|
F
N
 
N
Q
 
Q
K
|
K
R
 
R
Q
 
Q
P
 
P
D
 
D
F
 
F
S
 
S
K
 
K
F
 
F
K
 
K
R
 
R
N
 
N
P
 
P

3h02A 2.15 angstrom resolution crystal structure of naphthoate synthase from salmonella typhimurium.
92% identity, 99% coverage: 5:285/285 of query aligns to 1:266/266 of 3h02A

query
sites
3h02A
D
 
D
E
 
E
A
 
T
M
 
M
L
 
L
Y
 
Y
A
 
A
P
 
P
I
 
V
E
 
E
W
 
W
Q
 
H
D
 
D
C
 
C
S
 
S
E
 
E
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
D
 
D
I
 
I
R
 
R
Y
 
Y
Q
 
E
K
 
K
S
 
S
A
 
T
D
 
D
G
 
G
I
 
I
A
 
A
K
 
K
I
 
I
T
 
T
I
 
I
N
 
N
R
 
R
P
 
P
Q
 
Q
V
 
V
R
 
R
N
 
N
A
 
A
F
 
F
R
 
R
P
 
P
L
 
L
T
 
T
V
 
V
K
 
K
E
 
E
M
 
M
I
 
I
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
A
R
 
R
Y
 
Y
D
 
D
D
 
D
N
 
N
I
 
V
G
 
G
V
 
V
I
 
I
V
 
I
L
 
L
T
 
T
G
 
G
E
 
E
G
 
G
D
 
D
K
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
C
A
 
A
G
 
G
G
|
G
D
 
D
Q
 
Q
K
 
-
V
 
-
R
 
-
G
 
-
D
 
-
Y
 
-
G
 
-
G
 
-
Y
 
-
Q
 
-
D
 
-
D
 
-
S
 
-
G
 
-
V
 
-
H
 
H
H
|
H
L
 
L
N
 
N
V
 
V
L
|
L
D
 
D
F
 
F
Q
 
Q
R
 
R
Q
 
Q
I
 
I
R
 
R
T
 
T
C
 
C
P
 
P
K
 
K
P
 
P
V
 
V
L
 
V
A
 
A
M
 
M
V
 
V
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
S
 
S
I
 
I
G
|
G
G
|
G
G
 
G
H
 
H
V
|
V
L
 
L
H
 
H
M
 
M
M
 
M
C
 
C
D
 
D
L
 
L
T
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
E
N
 
N
A
 
A
I
 
I
F
 
F
G
 
G
Q
|
Q
T
 
T
G
|
G
P
 
P
K
 
K
V
 
V
G
 
G
S
|
S
F
 
F
D
|
D
G
|
G
G
 
G
W
 
W
G
 
G
A
 
A
S
 
S
Y
 
Y
M
 
M
A
 
A
R
 
R
I
 
I
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
K
 
K
A
 
A
R
 
R
E
 
E
I
 
I
W
|
W
F
 
F
L
 
L
C
 
C
R
 
R
Q
 
Q
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
D
 
D
M
 
M
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N
T
 
T
V
 
V
V
 
V
P
 
P
L
 
L
A
 
A
D
 
D
L
 
L
E
 
E
K
 
K
E
 
E
T
 
T
V
 
V
R
 
R
W
 
W
C
 
C
R
 
R
E
 
E
M
 
M
L
 
L
Q
 
Q
N
 
N
S
 
S
P
 
P
M
 
M
A
 
A
L
 
L
R
 
R
C
 
C
L
 
L
K
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
D
 
D
C
 
C
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
L
Q
 
Q
E
 
E
L
 
L
A
|
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
T
 
T
M
 
M
L
 
L
F
 
F
Y
|
Y
M
 
M
T
 
T
E
 
E
E
 
E
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
R
 
R
N
 
N
A
 
A
F
 
F
N
 
N
Q
 
Q
K
 
K
R
 
R
Q
 
Q
P
 
P
D
 
D
F
 
F
S
 
S
K
 
K
F
 
F
K
 
K
R
 
R
N
 
N
P
 
P

4elxA Structure of apo e.Coli. 1,4-dihydroxy-2- naphthoyl coa synthases with cl (see paper)
91% identity, 99% coverage: 5:285/285 of query aligns to 2:268/268 of 4elxA

query
sites
4elxA
D
 
D
E
 
E
A
 
A
M
 
M
L
 
L
Y
 
Y
A
 
A
P
 
P
I
 
V
E
 
E
W
 
W
Q
 
H
D
 
D
C
 
C
S
 
S
E
 
E
G
 
G
Y
 
F
T
 
E
D
 
D
I
 
I
R
 
R
Y
 
Y
Q
 
E
K
 
K
S
 
S
A
 
T
D
 
D
G
 
G
I
 
I
A
 
A
K
 
K
I
 
I
T
 
T
I
 
I
N
 
N
R
 
R
P
 
P
Q
 
Q
V
 
V
R
 
R
N
 
N
A
 
A
F
 
F
R
 
R
P
 
P
L
 
L
T
 
T
V
 
V
K
 
K
E
 
E
M
 
M
I
 
I
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
A
R
 
R
Y
 
Y
D
 
D
D
 
D
N
 
N
I
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
I
V
 
I
L
 
L
T
 
T
G
 
G
E
 
A
G
 
G
D
 
D
K
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
C
A
 
S
G
 
G
G
|
G
D
 
D
Q
 
Q
K
 
K
V
 
-
R
 
-
G
 
-
D
 
-
Y
 
-
G
 
-
G
 
-
Y
 
-
Q
 
-
D
 
-
D
 
-
S
 
-
G
 
-
V
 
-
H
 
H
H
|
H
L
 
L
N
 
N
V
 
V
L
|
L
D
 
D
F
 
F
Q
 
Q
R
 
R
Q
 
Q
I
 
I
R
 
R
T
 
T
C
 
C
P
 
P
K
 
K
P
 
P
V
 
V
L
 
V
A
 
A
M
 
M
V
 
V
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
S
 
S
I
 
I
G
|
G
G
|
G
G
 
G
H
 
H
V
|
V
L
 
L
H
 
H
M
 
M
M
 
M
C
 
C
D
 
D
L
 
L
T
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
D
N
 
N
A
 
A
I
 
I
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
G
|
G
P
 
P
K
 
K
V
 
V
G
 
G
S
|
S
F
 
F
D
|
D
G
|
G
G
 
G
W
 
W
G
 
G
A
 
A
S
 
S
Y
 
Y
M
 
M
A
 
A
R
 
R
I
 
I
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
K
 
K
A
 
A
R
 
R
E
 
E
I
 
I
W
|
W
F
 
F
L
 
L
C
 
C
R
 
R
Q
 
Q
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
Q
 
K
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
D
 
D
M
 
M
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N
T
 
T
V
 
V
V
 
V
P
 
P
L
 
L
A
 
A
D
 
D
L
 
L
E
 
E
K
 
K
E
 
E
T
 
T
V
 
V
R
 
R
W
 
W
C
 
C
R
 
R
E
 
E
M
 
M
L
 
L
Q
 
Q
N
 
N
S
 
S
P
 
P
M
 
M
A
 
A
L
 
L
R
 
R
C
 
C
L
 
L
K
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
D
 
D
C
 
C
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
L
Q
 
Q
E
 
E
L
 
L
A
|
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
T
 
T
M
 
M
L
 
L
F
 
F
Y
|
Y
M
 
M
T
 
T
E
 
E
E
 
E
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
R
 
R
N
 
N
A
 
A
F
 
F
N
 
N
Q
 
Q
K
 
K
R
 
R
Q
 
Q
P
 
P
D
 
D
F
 
F
S
 
S
K
 
K
F
 
F
K
 
K
R
 
R
N
 
N
P
 
P

4elwA Structure of e. Coli. 1,4-dihydroxy-2- naphthoyl coenzyme a synthases (menb) in complex with nitrate (see paper)
90% identity, 99% coverage: 5:285/285 of query aligns to 2:267/267 of 4elwA

query
sites
4elwA
D
 
D
E
 
E
A
 
A
M
 
M
L
 
L
Y
 
Y
A
 
A
P
 
P
I
 
V
E
 
E
W
 
W
Q
 
H
D
 
D
C
 
C
S
 
S
E
 
E
G
 
G
Y
 
F
T
 
E
D
 
D
I
 
I
R
 
R
Y
 
Y
Q
 
E
K
 
K
S
 
S
A
 
T
D
 
D
G
 
G
I
 
I
A
 
A
K
 
K
I
 
I
T
 
T
I
 
I
N
 
N
R
 
R
P
 
P
Q
 
Q
V
 
V
R
 
R
N
 
N
A
 
A
F
 
F
R
 
R
P
 
P
L
 
L
T
 
T
V
 
V
K
 
K
E
 
E
M
 
M
I
 
I
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
A
R
 
R
Y
 
Y
D
 
D
D
 
D
N
 
N
I
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
I
V
 
I
L
 
L
T
 
T
G
 
G
E
 
A
G
 
G
D
 
D
K
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
C
A
 
S
G
 
G
G
|
G
D
 
D
Q
 
Q
K
 
K
V
 
-
R
 
-
G
 
-
D
 
-
Y
 
-
G
 
-
G
 
-
Y
 
-
Q
 
-
D
 
-
D
 
-
S
 
-
G
 
-
V
 
-
H
 
-
H
 
H
L
 
L
N
 
N
V
 
V
L
|
L
D
 
D
F
 
F
Q
 
Q
R
 
R
Q
 
Q
I
 
I
R
 
R
T
 
T
C
 
C
P
 
P
K
 
K
P
 
P
V
 
V
L
 
V
A
 
A
M
 
M
V
 
V
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
S
 
S
I
 
I
G
|
G
G
|
G
G
 
G
H
 
H
V
|
V
L
 
L
H
 
H
M
 
M
M
 
M
C
 
C
D
 
D
L
 
L
T
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
D
N
 
N
A
 
A
I
 
I
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
T
|
T
G
|
G
P
 
P
K
 
K
V
 
V
G
 
G
S
|
S
F
|
F
D
|
D
G
|
G
G
 
G
W
 
W
G
 
G
A
 
A
S
 
S
Y
 
Y
M
 
M
A
 
A
R
 
R
I
 
I
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
K
 
K
A
 
A
R
 
R
E
 
E
I
 
I
W
|
W
F
 
F
L
 
L
C
 
C
R
 
R
Q
 
Q
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
Q
 
K
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
D
 
D
M
 
M
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N
T
 
T
V
 
V
V
 
V
P
 
P
L
 
L
A
 
A
D
 
D
L
 
L
E
 
E
K
 
K
E
 
E
T
 
T
V
 
V
R
 
R
W
 
W
C
 
C
R
 
R
E
 
E
M
 
M
L
 
L
Q
 
Q
N
 
N
S
 
S
P
 
P
M
 
M
A
 
A
L
 
L
R
 
R
C
 
C
L
 
L
K
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
D
 
D
C
 
C
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
L
Q
 
Q
E
 
E
L
 
L
A
|
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
T
 
T
M
 
M
L
 
L
F
 
F
Y
|
Y
M
 
M
T
 
T
E
 
E
E
 
E
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
R
 
R
N
 
N
A
 
A
F
 
F
N
 
N
Q
 
Q
K
 
K
R
 
R
Q
 
Q
P
 
P
D
 
D
F
 
F
S
 
S
K
 
K
F
 
F
K
 
K
R
 
R
N
 
N
P
 
P

Q5HH38 1,4-dihydroxy-2-naphthoyl-CoA synthase; DHNA-CoA synthase; EC 4.1.3.36 from Staphylococcus aureus (strain COL) (see paper)
65% identity, 95% coverage: 14:285/285 of query aligns to 5:273/273 of Q5HH38

query
sites
Q5HH38
E
 
Q
W
 
W
Q
 
E
D
 
T
C
 
L
S
 
R
E
 
E
G
 
-
Y
 
Y
T
 
D
D
 
E
I
 
I
R
 
K
Y
 
Y
Q
 
E
K
 
-
S
 
F
A
 
Y
D
 
E
G
 
G
I
 
I
A
 
A
K
 
K
I
 
V
T
 
T
I
 
I
N
 
N
R
 
R
P
 
P
Q
 
E
V
 
V
R
|
R
N
 
N
A
 
A
F
 
F
R
 
T
P
 
P
L
 
K
T
 
T
V
 
V
K
 
A
E
 
E
M
 
M
I
 
I
Q
 
D
A
 
A
L
 
F
A
 
S
D
 
R
A
 
A
R
 
R
Y
 
D
D
 
D
D
 
Q
N
 
N
I
 
V
G
 
S
V
 
V
I
 
I
V
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
E
 
E
G
 
G
D
 
D
K
 
L
A
 
A
F
 
F
C
 
C
A
x
S
G
|
G
G
|
G
D
|
D
Q
|
Q
K
 
K
V
 
K
R
 
R
G
 
G
D
 
-
Y
 
H
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
V
D
 
G
D
 
E
S
 
D
G
 
Q
V
 
I
H
 
P
H
 
R
L
 
L
N
 
N
V
 
V
L
 
L
D
 
D
F
 
L
Q
 
Q
R
 
R
Q
 
L
I
 
I
R
 
R
T
 
I
C
 
I
P
 
P
K
 
K
P
 
P
V
 
V
L
 
I
A
 
A
M
 
M
V
 
V
A
 
K
G
 
G
Y
 
Y
S
 
A
I
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
H
 
N
V
 
V
L
 
L
H
 
N
M
 
V
M
 
V
C
 
C
D
 
D
L
 
L
T
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
D
N
 
N
A
 
A
I
 
I
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
G
 
G
P
 
P
K
 
K
V
 
V
G
 
G
S
|
S
F
 
F
D
 
D
G
 
A
G
 
G
W
 
Y
G
 
G
A
 
S
S
 
G
Y
 
Y
M
 
L
A
 
A
R
 
R
I
 
I
V
 
V
G
 
G
Q
 
H
K
 
K
K
 
K
A
 
A
R
 
R
E
 
E
I
 
I
W
 
W
F
 
Y
L
 
L
C
 
C
R
 
R
Q
 
Q
Y
 
Y
D
 
N
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
E
A
 
A
L
 
L
D
 
D
M
 
M
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N
T
 
T
V
 
V
V
 
V
P
 
P
L
 
L
A
 
E
D
 
K
L
 
V
E
 
E
K
 
D
E
 
E
T
 
T
V
 
V
R
 
Q
W
 
W
C
 
C
R
 
K
E
 
E
M
 
I
L
 
M
Q
 
K
N
 
H
S
 
S
P
 
P
M
 
T
A
 
A
L
 
L
R
 
R
C
 
F
L
 
L
K
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
M
N
 
N
A
 
A
D
 
D
C
 
T
D
 
D
G
 
G
Q
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
L
Q
 
Q
E
 
Q
L
 
M
A
 
A
G
 
G
N
 
D
A
 
A
T
 
T
M
 
L
L
 
L
F
 
Y
Y
 
Y
M
 
T
T
 
T
E
 
D
E
 
E
G
 
A
Q
 
K
E
 
E
G
 
G
R
 
R
N
 
D
A
 
A
F
 
F
N
 
K
Q
 
E
K
 
K
R
 
R
Q
 
D
P
 
P
D
 
D
F
 
F
S
 
D
K
 
Q
F
 
F
K
 
P
R
 
K
N
 
F
P
 
P

4i52A Scmenb im complex with 1-hydroxy-2-naphthoyl-coa (see paper)
66% identity, 96% coverage: 13:285/285 of query aligns to 1:275/275 of 4i52A

query
sites
4i52A
I
 
M
E
 
D
W
 
W
Q
 
H
D
 
-
C
 
I
S
 
A
E
 
K
G
 
H
Y
 
Y
T
 
D
D
 
D
I
 
I
R
 
L
Y
 
Y
Q
 
Y
K
 
K
S
 
-
A
 
A
D
 
G
G
 
G
I
 
I
A
 
A
K
 
K
I
 
I
T
 
V
I
 
I
N
 
N
R
 
R
P
 
P
Q
x
H
V
x
K
R
|
R
N
 
N
A
|
A
F
 
F
R
 
R
P
 
P
L
 
Q
T
 
T
V
 
V
K
 
F
E
 
E
M
 
L
I
 
Y
Q
 
D
A
 
A
L
 
F
A
 
C
D
 
N
A
 
A
R
 
R
Y
 
E
D
 
D
D
 
N
N
 
R
I
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
V
V
 
L
L
 
L
T
 
T
G
 
G
-
 
A
-
 
G
-
 
P
-
 
H
-
 
S
E
 
D
G
 
G
D
 
K
K
 
Y
A
 
A
F
 
F
C
 
C
A
x
S
G
|
G
G
|
G
D
|
D
Q
|
Q
K
 
S
V
 
V
R
|
R
G
 
G
D
 
E
Y
 
-
G
 
G
G
 
G
Y
|
Y
Q
 
I
D
 
D
D
 
D
S
 
Q
G
 
G
V
 
T
H
 
P
H
x
R
L
|
L
N
 
N
V
|
V
L
|
L
D
 
D
F
 
L
Q
 
Q
R
 
R
Q
 
L
I
 
I
R
 
R
T
 
S
C
 
M
P
 
P
K
 
K
P
 
V
V
 
V
L
 
I
A
 
A
M
 
L
V
 
V
A
 
A
G
 
G
Y
|
Y
S
 
A
I
|
I
G
 
G
G
|
G
G
 
G
H
 
H
V
|
V
L
 
L
H
 
H
M
 
L
M
 
V
C
 
C
D
 
D
L
 
L
T
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
D
N
 
N
A
 
A
I
 
I
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
T
|
T
G
|
G
P
 
P
K
 
K
V
|
V
G
 
G
S
|
S
F
|
F
D
|
D
G
|
G
G
 
G
W
 
F
G
 
G
A
 
S
S
 
S
Y
 
Y
M
 
L
A
 
A
R
 
R
I
 
I
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
K
 
K
A
 
A
R
 
R
E
 
E
I
 
I
W
 
W
F
 
Y
L
 
L
C
 
C
R
 
R
Q
 
Q
Y
 
Y
D
 
S
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
E
A
 
A
L
 
E
D
 
R
M
 
M
G
 
G
L
 
M
V
 
V
N
 
N
T
 
T
V
 
V
V
 
V
P
 
P
L
 
V
A
 
D
D
 
R
L
 
L
E
 
E
K
 
E
E
 
E
T
 
G
V
 
I
R
 
Q
W
 
W
C
 
A
R
 
K
E
 
E
M
 
I
L
 
L
Q
 
S
N
 
K
S
 
S
P
 
P
M
 
L
A
 
A
L
 
I
R
 
R
C
 
C
L
 
L
K
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
F
N
 
N
A
 
A
D
 
D
C
 
C
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
L
Q
 
Q
E
 
E
L
 
L
A
|
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
T
 
T
M
 
L
L
 
L
F
 
Y
Y
|
Y
M
 
M
T
 
T
E
 
E
E
 
E
G
 
G
Q
 
S
E
 
E
G
 
G
R
 
K
N
 
Q
A
 
A
F
 
F
N
 
L
Q
 
E
K
 
K
R
 
R
Q
 
P
P
 
P
D
 
D
F
 
F
S
 
S
K
 
Q
F
 
Y
K
 
P
R
 
W
N
 
L
P
 
P

4i4zA Synechocystis sp. Pcc 6803 1,4-dihydroxy-2-naphthoyl-coenzyme a synthase (menb) in complex with salicylyl-coa (see paper)
66% identity, 96% coverage: 13:285/285 of query aligns to 1:275/275 of 4i4zA

query
sites
4i4zA
I
 
M
E
 
D
W
 
W
Q
 
H
D
 
-
C
 
I
S
 
A
E
 
K
G
 
H
Y
 
Y
T
 
D
D
 
D
I
 
I
R
 
L
Y
 
Y
Q
 
Y
K
 
K
S
 
-
A
 
A
D
 
G
G
 
G
I
 
I
A
 
A
K
 
K
I
 
I
T
 
V
I
 
I
N
 
N
R
 
R
P
 
P
Q
x
H
V
x
K
R
|
R
N
 
N
A
 
A
F
 
F
R
 
R
P
 
P
L
 
Q
T
 
T
V
 
V
K
 
F
E
 
E
M
 
L
I
 
Y
Q
 
D
A
 
A
L
 
F
A
 
C
D
 
N
A
 
A
R
 
R
Y
 
E
D
 
D
D
 
N
N
 
R
I
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
V
V
 
L
L
 
L
T
 
T
G
 
G
-
 
A
-
 
G
-
 
P
-
 
H
-
 
S
E
 
D
G
 
G
D
 
K
K
 
Y
A
 
A
F
 
F
C
 
C
A
x
S
G
|
G
G
|
G
D
|
D
Q
|
Q
K
 
S
V
 
V
R
|
R
G
 
G
D
 
E
Y
 
-
G
 
G
G
 
G
Y
|
Y
Q
 
I
D
 
D
D
 
D
S
 
Q
G
 
G
V
 
T
H
 
P
H
x
R
L
 
L
N
 
N
V
|
V
L
|
L
D
 
D
F
 
L
Q
 
Q
R
 
R
Q
 
L
I
 
I
R
 
R
T
 
S
C
 
M
P
 
P
K
 
K
P
 
V
V
 
V
L
 
I
A
 
A
M
 
L
V
 
V
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
S
 
A
I
 
I
G
|
G
G
|
G
G
 
G
H
 
H
V
|
V
L
 
L
H
 
H
M
 
L
M
 
V
C
 
C
D
 
D
L
 
L
T
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
D
N
 
N
A
 
A
I
 
I
F
 
F
G
 
G
Q
|
Q
T
|
T
G
|
G
P
 
P
K
 
K
V
|
V
G
 
G
S
|
S
F
 
F
D
|
D
G
|
G
G
 
G
W
 
F
G
 
G
A
 
S
S
 
S
Y
 
Y
M
 
L
A
 
A
R
 
R
I
 
I
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
K
 
K
A
 
A
R
 
R
E
 
E
I
 
I
W
|
W
F
 
Y
L
 
L
C
 
C
R
 
R
Q
 
Q
Y
 
Y
D
 
S
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
E
A
 
A
L
 
E
D
 
R
M
 
M
G
 
G
L
 
M
V
 
V
N
 
N
T
 
T
V
 
V
V
 
V
P
 
P
L
 
V
A
 
D
D
 
R
L
 
L
E
 
E
K
 
E
E
 
E
T
 
G
V
 
I
R
 
Q
W
 
W
C
 
A
R
 
K
E
 
E
M
 
I
L
 
L
Q
 
S
N
 
K
S
 
S
P
 
P
M
 
L
A
 
A
L
 
I
R
 
R
C
 
C
L
 
L
K
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
F
N
 
N
A
 
A
D
 
D
C
 
C
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
L
Q
 
Q
E
 
E
L
 
L
A
|
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
T
 
T
M
 
L
L
 
L
F
 
Y
Y
|
Y
M
 
M
T
 
T
E
 
E
E
 
E
G
 
G
Q
 
S
E
 
E
G
 
G
R
 
K
N
 
Q
A
 
A
F
|
F
N
 
L
Q
 
E
K
|
K
R
 
R
Q
 
P
P
 
P
D
 
D
F
 
F
S
 
S
K
 
Q
F
 
Y
K
 
P
R
 
W
N
 
L
P
 
P

Q8GYN9 1,4-dihydroxy-2-naphthoyl-CoA synthase, peroxisomal; DHNS; Enoyl-CoA hydratase/isomerase D; ECHID; Naphthoate synthase; EC 4.1.3.36 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
67% identity, 93% coverage: 22:285/285 of query aligns to 74:337/337 of Q8GYN9

query
sites
Q8GYN9
Y
 
F
T
 
V
D
 
D
I
 
I
R
 
I
Y
 
Y
Q
 
E
K
 
K
S
 
A
A
 
L
D
 
D
-
 
E
G
 
G
I
 
I
A
 
A
K
 
K
I
 
I
T
 
T
I
 
I
N
 
N
R
 
R
P
 
P
Q
 
E
V
 
R
R
 
R
N
 
N
A
 
A
F
 
F
R
 
R
P
 
P
L
 
Q
T
 
T
V
 
V
K
 
K
E
 
E
M
 
L
I
 
M
Q
 
R
A
 
A
L
 
F
A
 
N
D
 
D
A
 
A
R
 
R
Y
 
D
D
 
D
D
 
S
N
 
S
I
 
V
G
 
G
V
 
V
I
 
I
V
 
I
L
 
L
T
 
T
G
 
G
E
 
K
G
 
G
D
 
T
K
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
C
A
 
S
G
 
G
G
 
G
D
 
D
Q
 
Q
K
 
A
V
 
L
R
 
R
G
 
T
D
 
Q
Y
 
-
G
 
D
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
A
D
 
D
D
 
P
S
 
N
G
 
D
V
 
V
H
 
G
H
 
R
L
 
L
N
 
N
V
 
V
L
 
L
D
 
D
F
 
L
Q
 
Q
R
 
V
Q
 
Q
I
 
I
R
 
R
T
 
R
C
 
L
P
 
P
K
 
K
P
 
P
V
 
V
L
 
I
A
 
A
M
 
M
V
 
V
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
S
 
A
I
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
H
 
H
V
 
I
L
 
L
H
 
H
M
 
M
M
 
V
C
 
C
D
 
D
L
 
L
T
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
D
N
 
N
A
 
A
I
 
I
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
G
 
G
P
 
P
K
 
K
V
 
V
G
 
G
S
 
S
F
 
F
D
 
D
G
 
A
G
 
G
W
 
Y
G
 
G
A
 
S
S
 
S
Y
 
I
M
 
M
A
 
S
R
 
R
I
 
L
V
 
V
G
 
G
Q
 
P
K
 
K
K
 
K
A
 
A
R
 
R
E
 
E
I
 
M
W
 
W
F
 
F
L
 
M
C
 
T
R
 
R
Q
 
F
Y
 
Y
D
 
T
A
 
A
Q
 
S
Q
 
E
A
 
A
L
 
E
D
 
K
M
 
M
G
 
G
L
 
L
V
 
I
N
 
N
T
 
T
V
 
V
V
 
V
P
 
P
L
 
L
A
 
E
D
 
D
L
 
L
E
 
E
K
 
K
E
 
E
T
 
T
V
 
V
R
 
K
W
 
W
C
 
C
R
 
R
E
 
E
M
 
I
L
 
L
Q
 
R
N
 
N
S
 
S
P
 
P
M
 
T
A
 
A
L
 
I
R
 
R
C
 
V
L
 
L
K
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
D
 
V
C
 
D
D
 
D
G
 
G
Q
 
H
A
 
A
G
 
G
L
 
L
Q
 
Q
E
 
G
L
 
L
A
 
G
G
 
G
N
 
D
A
 
A
T
 
T
M
 
L
L
 
L
F
 
F
Y
 
Y
M
 
G
T
 
T
E
 
E
E
 
E
G
 
A
Q
 
T
E
 
E
G
 
G
R
 
R
N
 
T
A
 
A
F
 
Y
N
 
M
Q
 
H
K
 
R
R
 
R
Q
 
P
P
 
P
D
 
D
F
 
F
S
 
S
K
 
K
F
 
F
K
 
H
R
 
R
N
 
R
P
 
P

Sites not aligning to the query:

2uzfA Crystal structure of staphylococcus aureus 1,4-dihydroxy-2-naphthoyl coa synthase (menb) in complex with acetoacetyl coa (see paper)
63% identity, 95% coverage: 15:285/285 of query aligns to 1:260/260 of 2uzfA

query
sites
2uzfA
W
 
W
Q
 
E
D
 
T
C
 
L
S
 
R
E
 
E
G
 
-
Y
 
Y
T
 
D
D
 
E
I
 
I
R
 
K
Y
 
Y
Q
 
E
K
 
-
S
 
F
A
 
Y
D
 
E
G
 
G
I
 
I
A
 
A
K
 
K
I
 
V
T
 
T
I
 
I
N
 
N
R
 
R
P
 
P
Q
 
E
V
|
V
R
|
R
N
 
N
A
 
A
F
 
F
R
 
T
P
 
P
L
 
K
T
 
T
V
 
V
K
 
A
E
 
E
M
 
M
I
 
I
Q
 
D
A
 
A
L
 
F
A
 
S
D
 
R
A
 
A
R
 
R
Y
 
D
D
 
D
D
 
Q
N
 
N
I
 
V
G
 
S
V
 
V
I
 
I
V
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
E
 
E
G
 
G
D
 
D
K
 
L
A
 
A
F
 
F
C
 
C
A
x
S
G
|
G
G
|
G
D
|
D
Q
 
Q
K
 
K
V
 
-
R
 
-
G
 
-
D
 
-
Y
 
-
G
 
-
G
 
-
Y
 
-
Q
 
-
D
 
G
D
 
E
S
 
D
G
 
Q
V
 
I
H
 
P
H
x
R
L
 
L
N
 
N
V
 
V
L
|
L
D
 
D
F
 
L
Q
 
Q
R
 
R
Q
 
L
I
 
I
R
 
R
T
 
I
C
 
I
P
 
P
K
 
K
P
 
P
V
 
V
L
 
I
A
 
A
M
 
M
V
 
V
A
 
K
G
 
G
Y
|
Y
S
 
A
I
 
V
G
 
G
G
|
G
G
 
G
H
 
N
V
|
V
L
 
L
H
 
N
M
 
V
M
 
V
C
 
C
D
 
D
L
 
L
T
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
D
N
 
N
A
 
A
I
 
I
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
T
|
T
G
|
G
P
 
P
K
 
K
V
 
V
G
 
G
S
|
S
F
 
F
D
|
D
G
x
A
G
 
G
W
 
Y
G
 
G
A
 
S
S
 
G
Y
 
Y
M
 
L
A
 
A
R
 
R
I
 
I
V
 
V
G
 
G
Q
 
H
K
 
K
K
 
K
A
 
A
R
 
R
E
 
E
I
 
I
W
 
W
F
 
Y
L
 
L
C
 
C
R
 
R
Q
 
Q
Y
 
Y
D
 
N
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
E
A
 
A
L
 
L
D
 
D
M
 
M
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N
T
 
T
V
 
V
V
 
V
P
 
P
L
 
L
A
 
E
D
 
K
L
 
V
E
 
E
K
 
D
E
 
E
T
 
T
V
 
V
R
 
Q
W
 
W
C
 
C
R
 
K
E
 
E
M
 
I
L
 
M
Q
 
K
N
 
H
S
 
S
P
 
P
M
 
T
A
 
A
L
 
L
R
 
R
C
 
F
L
 
L
K
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
M
N
 
N
A
 
A
D
 
D
C
 
T
D
 
D
G
 
G
Q
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
L
Q
 
Q
E
 
Q
L
 
M
A
|
A
G
 
G
N
 
D
A
 
A
T
 
T
M
 
L
L
 
L
F
 
Y
Y
|
Y
M
 
T
T
 
T
E
 
D
E
 
E
G
 
A
Q
 
K
E
 
E
G
 
G
R
 
R
N
 
D
A
 
A
F
 
F
N
 
K
Q
 
E
K
 
K
R
 
R
Q
 
D
P
 
P
D
 
D
F
 
F
S
 
D
K
 
Q
F
 
F
K
 
P
R
 
K
N
 
F
P
 
P

4emlA Synechocystis sp. Pcc 6803 1,4-dihydroxy-2-naphthoyl-coenzyme a synthase (menb) in complex with bicarbonate (see paper)
63% identity, 96% coverage: 13:285/285 of query aligns to 1:261/261 of 4emlA

query
sites
4emlA
I
 
M
E
 
D
W
 
W
Q
 
H
D
 
-
C
 
I
S
 
A
E
 
K
G
 
H
Y
 
Y
T
 
D
D
 
D
I
 
I
R
 
L
Y
 
Y
Q
 
Y
K
 
K
S
 
-
A
 
A
D
 
G
G
 
G
I
 
I
A
 
A
K
 
K
I
 
I
T
 
V
I
 
I
N
 
N
R
 
R
P
 
P
Q
 
H
V
 
K
R
 
R
N
 
N
A
 
A
F
 
F
R
 
R
P
 
P
L
 
Q
T
 
T
V
 
V
K
 
F
E
 
E
M
 
L
I
 
Y
Q
 
D
A
 
A
L
 
F
A
 
C
D
 
N
A
 
A
R
 
R
Y
 
E
D
 
D
D
 
N
N
 
R
I
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
V
V
 
L
L
 
L
T
 
T
G
 
G
-
 
A
-
 
G
-
 
P
-
 
H
-
 
S
E
 
D
G
 
G
D
 
K
K
 
Y
A
 
A
F
 
F
C
 
C
A
 
S
G
 
G
G
|
G
D
 
D
Q
 
Q
K
 
S
V
 
-
R
 
-
G
 
-
D
 
-
Y
 
-
G
 
-
G
 
-
Y
 
-
Q
 
-
D
 
-
D
 
-
S
 
-
G
 
-
V
 
-
H
 
-
H
x
R
L
 
L
N
 
N
V
 
V
L
|
L
D
 
D
F
 
L
Q
 
Q
R
 
R
Q
 
L
I
 
I
R
 
R
T
 
S
C
 
M
P
 
P
K
 
K
P
 
V
V
 
V
L
 
I
A
 
A
M
 
L
V
 
V
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
S
 
A
I
 
I
G
|
G
G
|
G
G
 
G
H
 
H
V
|
V
L
 
L
H
 
H
M
 
L
M
 
V
C
 
C
D
 
D
L
 
L
T
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
D
N
 
N
A
 
A
I
 
I
F
 
F
G
 
G
Q
|
Q
T
 
T
G
|
G
P
 
P
K
 
K
V
 
V
G
 
G
S
|
S
F
 
F
D
|
D
G
|
G
G
 
G
W
 
F
G
 
G
A
 
S
S
 
S
Y
 
Y
M
 
L
A
 
A
R
 
R
I
 
I
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
K
 
K
A
 
A
R
 
R
E
 
E
I
 
I
W
|
W
F
 
Y
L
 
L
C
 
C
R
 
R
Q
 
Q
Y
 
Y
D
 
S
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
E
A
 
A
L
 
E
D
 
R
M
 
M
G
 
G
L
 
M
V
 
V
N
 
N
T
 
T
V
 
V
V
 
V
P
 
P
L
 
V
A
x
D
D
x
R
L
 
L
E
|
E
K
x
E
E
 
E
T
 
G
V
 
I
R
 
Q
W
 
W
C
 
A
R
 
K
E
 
E
M
 
I
L
 
L
Q
 
S
N
 
K
S
 
S
P
 
P
M
 
L
A
 
A
L
 
I
R
 
R
C
 
C
L
 
L
K
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
F
N
 
N
A
 
A
D
 
D
C
 
C
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
L
Q
 
Q
E
 
E
L
 
L
A
|
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
T
 
T
M
 
L
L
 
L
F
 
Y
Y
|
Y
M
 
M
T
 
T
E
 
E
E
 
E
G
 
G
Q
 
S
E
 
E
G
 
G
R
 
K
N
 
Q
A
 
A
F
 
F
N
 
L
Q
 
E
K
 
K
R
 
R
Q
 
P
P
 
P
D
 
D
F
 
F
S
 
S
K
 
Q
F
 
Y
K
 
P
R
 
W
N
 
L
P
 
P

P9WNP5 1,4-dihydroxy-2-naphthoyl-CoA synthase; DHNA-CoA synthase; EC 4.1.3.36 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see 4 papers)
48% identity, 94% coverage: 17:283/285 of query aligns to 29:312/314 of P9WNP5

query
sites
P9WNP5
D
 
D
C
 
G
S
 
F
E
 
D
G
 
D
Y
 
L
T
 
T
D
 
D
I
 
I
R
 
T
Y
 
Y
Q
 
H
K
 
R
S
 
H
A
 
V
D
 
D
-
 
D
G
 
A
I
 
T
A
 
V
K
 
R
I
 
V
T
 
A
I
 
F
N
 
N
R
 
R
P
 
P
Q
 
E
V
 
V
R
|
R
N
 
N
A
 
A
F
 
F
R
 
R
P
 
P
L
 
H
T
 
T
V
 
V
K
 
D
E
 
E
M
 
L
I
 
Y
Q
 
R
A
 
V
L
 
L
A
 
D
D
 
H
A
 
A
R
 
R
Y
 
M
D
 
S
D
 
P
N
 
D
I
 
V
G
 
G
V
 
V
I
 
V
V
 
L
L
 
L
T
 
T
G
 
G
E
 
N
G
 
G
D
 
P
K
 
S
-
 
P
-
x
K
-
 
D
-
 
G
-
 
G
-
 
W
A
 
A
F
 
F
C
 
C
A
x
S
G
|
G
G
|
G
D
|
D
Q
|
Q
K
 
R
V
 
I
R
 
R
G
 
G
D
 
-
Y
 
R
G
 
S
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
Q
D
 
Y
D
 
A
S
 
S
G
 
G
-
 
D
-
 
T
-
 
A
-
 
D
-
 
T
-
 
V
-
 
D
-
 
V
-
 
A
-
 
R
V
 
A
H
 
G
H
x
R
L
 
L
N
 
H
V
 
I
L
 
L
D
 
E
F
 
V
Q
 
Q
R
 
R
Q
 
L
I
 
I
R
 
R
T
 
F
C
 
M
P
 
P
K
 
K
P
 
V
V
 
V
L
 
I
A
 
C
M
 
L
V
 
V
A
 
N
G
 
G
Y
x
W
S
x
A
I
x
A
G
|
G
G
|
G
G
 
G
H
 
H
V
 
S
L
 
L
H
 
H
M
 
V
M
 
V
C
 
C
D
 
D
L
 
L
T
 
T
I
 
L
A
 
A
A
 
S
-
 
R
E
 
E
N
 
Y
A
 
A
I
 
R
F
 
F
G
 
K
Q
 
Q
T
|
T
G
x
D
P
 
A
K
 
D
V
 
V
G
 
G
S
|
S
F
 
F
D
|
D
G
 
G
G
 
G
W
 
Y
G
 
G
A
 
S
S
 
A
Y
 
Y
M
 
L
A
 
A
R
 
R
I
 
Q
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
K
 
F
A
 
A
R
 
R
E
 
E
I
 
I
W
 
F
F
 
F
L
 
L
C
 
G
R
 
R
Q
 
T
Y
 
Y
D
 
T
A
 
A
Q
 
E
Q
 
Q
A
 
M
L
 
H
D
 
Q
M
 
M
G
 
G
L
 
A
V
 
V
N
 
N
T
 
A
V
 
V
V
 
A
P
 
E
L
 
H
A
 
A
D
 
E
L
 
L
E
 
E
K
 
T
E
 
V
T
 
G
V
 
L
R
 
Q
W
 
W
C
 
A
R
 
A
E
 
E
M
 
I
L
 
N
Q
 
A
N
 
K
S
 
S
P
 
P
M
 
Q
A
 
A
L
 
Q
R
 
R
C
 
M
L
 
L
K
 
K
A
 
F
A
 
A
L
 
F
N
 
N
A
 
L
D
 
L
C
 
D
D
 
D
G
 
G
Q
 
L
A
 
V
G
 
G
L
 
Q
Q
 
Q
E
 
L
L
 
F
A
 
A
G
 
G
N
 
E
A
 
A
T
 
T
M
 
R
L
 
L
F
 
A
Y
|
Y
M
 
M
T
 
T
E
 
D
E
 
E
G
 
A
Q
 
V
E
 
E
G
 
G
R
 
R
N
 
D
A
 
A
F
 
F
N
 
L
Q
 
Q
K
 
K
R
 
R
Q
 
P
P
 
P
D
 
D
F
 
W
S
 
S
K
 
P
F
 
F
K
 
P
R
 
R

4qijA Crystal structure of menb from mycobacteria tuberculosis in complex with 1-hna-coa (see paper)
48% identity, 94% coverage: 17:283/285 of query aligns to 16:299/301 of 4qijA

query
sites
4qijA
D
 
D
C
 
G
S
 
F
E
 
D
G
 
D
Y
 
L
T
 
T
D
 
D
I
 
I
R
 
T
Y
 
Y
Q
 
H
K
 
R
S
 
H
A
 
V
D
 
D
-
 
D
G
 
A
I
 
T
A
 
V
K
 
R
I
 
V
T
 
A
I
 
F
N
 
N
R
 
R
P
 
P
Q
 
E
V
|
V
R
|
R
N
 
N
A
|
A
F
|
F
R
 
R
P
 
P
L
 
H
T
 
T
V
 
V
K
 
D
E
 
E
M
 
L
I
 
Y
Q
 
R
A
 
V
L
 
L
A
 
D
D
 
H
A
 
A
R
 
R
Y
 
M
D
 
S
D
 
P
N
 
D
I
 
V
G
 
G
V
 
V
I
 
V
V
 
L
L
 
L
T
 
T
G
 
G
E
 
N
G
 
G
D
 
P
K
 
S
-
 
P
-
x
K
-
 
D
-
 
G
-
 
G
-
 
W
A
 
A
F
 
F
C
 
C
A
x
S
G
|
G
G
|
G
D
|
D
Q
|
Q
K
 
R
V
 
I
R
|
R
G
 
G
D
 
-
Y
 
R
G
 
S
G
 
G
Y
|
Y
Q
 
Q
D
 
Y
D
 
A
S
 
S
G
 
G
-
 
D
-
 
T
-
 
A
-
 
D
-
 
T
-
 
V
-
 
D
-
 
V
-
 
A
-
x
R
V
 
A
H
 
G
H
 
R
L
|
L
N
x
H
V
x
I
L
 
L
D
 
E
F
 
V
Q
 
Q
R
 
R
Q
 
L
I
 
I
R
 
R
T
 
F
C
 
M
P
 
P
K
 
K
P
 
V
V
 
V
L
 
I
A
 
C
M
 
L
V
 
V
A
 
N
G
 
G
Y
x
W
S
 
A
I
 
A
G
 
G
G
|
G
G
 
G
H
 
H
V
x
S
L
 
L
H
 
H
M
 
V
M
 
V
C
 
C
D
 
D
L
 
L
T
 
T
I
 
L
A
 
A
A
 
S
-
 
R
E
 
E
N
 
Y
A
 
A
I
 
R
F
 
F
G
 
K
Q
 
Q
T
|
T
G
x
D
P
 
A
K
 
D
V
 
V
G
 
G
S
|
S
F
 
F
D
|
D
G
|
G
G
 
G
W
 
Y
G
 
G
A
 
S
S
 
A
Y
 
Y
M
 
L
A
 
A
R
 
R
I
 
Q
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
K
 
F
A
 
A
R
 
R
E
 
E
I
 
I
W
 
F
F
 
F
L
 
L
C
 
G
R
 
R
Q
 
T
Y
 
Y
D
 
T
A
 
A
Q
 
E
Q
 
Q
A
 
M
L
 
H
D
 
Q
M
 
M
G
 
G
L
 
A
V
 
V
N
 
N
T
 
A
V
 
V
V
 
A
P
 
E
L
 
H
A
 
A
D
 
E
L
 
L
E
 
E
K
 
T
E
 
V
T
 
G
V
 
L
R
 
Q
W
 
W
C
 
A
R
 
A
E
 
E
M
 
I
L
 
N
Q
 
A
N
 
K
S
 
S
P
 
P
M
 
Q
A
 
A
L
 
Q
R
 
R
C
 
M
L
 
L
K
 
K
A
 
F
A
 
A
L
 
F
N
 
N
A
 
L
D
 
L
C
 
D
D
 
D
G
 
G
Q
 
L
A
 
V
G
 
G
L
 
Q
Q
 
Q
E
 
L
L
 
F
A
|
A
G
 
G
N
 
E
A
 
A
T
 
T
M
 
R
L
 
L
F
 
A
Y
|
Y
M
 
M
T
 
T
E
 
D
E
 
E
G
 
A
Q
 
V
E
 
E
G
 
G
R
 
R
N
 
D
A
 
A
F
|
F
N
 
L
Q
 
Q
K
|
K
R
 
R
Q
 
P
P
 
P
D
 
D
F
 
W
S
 
S
K
 
P
F
 
F
K
 
P
R
 
R