SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing BWI76_RS20520 FitnessBrowser__Koxy:BWI76_RS20520 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P23234 Indole-3-pyruvate decarboxylase; Indolepyruvate decarboxylase; EC 4.1.1.74 from Enterobacter cloacae (see paper)
63% identity, 100% coverage: 1:551/553 of query aligns to 1:551/552 of P23234

query
sites
P23234
M
 
M
Q
 
R
P
 
T
T
 
P
Y
 
Y
T
 
C
I
 
V
G
 
A
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
L
 
L
D
 
D
R
 
R
L
 
L
V
 
T
D
 
D
C
 
C
G
 
G
I
 
A
D
 
D
R
 
H
L
 
L
F
 
F
G
 
G
V
 
V
P
 
P
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
N
 
N
L
 
L
Q
 
Q
F
 
F
L
 
L
D
 
D
S
 
H
V
 
V
I
 
I
A
 
D
H
 
S
R
 
P
N
 
D
L
 
I
G
 
C
W
 
W
V
 
V
G
 
G
C
 
C
A
 
A
N
 
N
E
|
E
L
 
L
N
 
N
A
 
A
A
 
S
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
D
 
D
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
I
 
C
K
 
K
G
 
G
A
 
F
G
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
L
T
 
T
T
 
T
Y
 
F
G
 
G
V
 
V
G
 
G
E
 
E
L
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
M
N
 
N
G
 
G
I
 
I
A
 
A
G
 
G
S
 
S
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
H
 
H
V
 
V
P
 
P
V
 
V
L
 
L
H
 
H
I
 
I
V
 
V
G
 
G
A
 
A
P
 
P
C
 
G
T
 
T
G
 
A
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
L
 
L
H
 
H
H
 
H
T
 
T
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
D
 
E
F
 
F
S
 
R
H
 
H
F
 
F
S
 
Y
R
 
H
M
 
M
S
 
S
E
 
E
Q
 
P
I
 
I
T
 
T
C
 
V
S
 
A
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
L
 
L
A
 
T
A
 
E
G
 
Q
N
 
N
A
 
A
C
 
C
H
 
Y
E
 
E
I
 
I
D
 
D
R
 
R
V
 
V
L
 
L
S
 
T
E
 
T
M
 
M
L
 
L
T
 
R
H
 
E
H
 
R
R
 
R
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
M
 
M
L
 
L
P
 
P
A
 
A
D
 
D
V
 
V
A
 
A
K
 
K
A
 
K
K
 
A
T
 
A
T
 
T
P
 
P
P
 
P
A
 
V
H
 
N
R
 
A
L
 
L
L
 
T
I
 
H
Q
 
K
G
 
Q
L
 
A
P
 
H
A
 
A
D
 
D
E
 
S
N
 
A
Q
 
C
L
 
L
A
 
K
G
 
A
F
 
F
R
 
R
E
 
D
H
 
A
A
 
A
G
 
E
R
 
N
M
 
K
L
 
L
R
 
A
S
 
M
S
 
S
R
 
K
R
 
R
V
 
T
S
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
D
 
D
F
 
F
L
 
L
A
 
V
Q
 
L
R
 
R
Y
 
H
G
 
G
L
 
L
Q
 
K
N
 
H
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
E
 
K
W
 
W
V
 
V
A
 
K
K
 
E
V
 
V
P
 
P
V
 
M
A
 
A
Y
 
H
A
 
A
T
 
T
M
 
M
L
 
L
M
 
M
G
 
G
K
 
K
G
 
G
L
 
I
F
 
F
D
 
D
E
 
E
Q
 
R
Q
 
Q
S
 
A
G
 
G
F
 
F
V
 
Y
G
 
G
T
 
T
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
I
 
S
A
 
A
S
 
S
A
 
T
E
 
G
E
 
A
T
 
V
R
 
K
D
 
E
A
 
A
I
 
I
E
 
E
N
 
G
A
 
A
D
 
D
T
 
T
I
 
V
I
 
L
C
 
C
I
 
V
G
 
G
T
 
T
R
 
R
F
 
F
T
 
T
D
 
D
T
 
T
I
 
L
T
 
T
A
 
A
G
 
G
F
 
F
T
 
T
Q
 
H
H
 
Q
L
 
L
P
 
T
L
 
P
E
 
A
K
 
Q
T
 
T
I
 
I
E
 
E
I
 
V
Q
 
Q
P
 
P
F
 
H
A
 
A
V
 
A
R
 
R
V
 
V
A
 
G
D
 
D
R
 
V
W
 
W
F
 
F
S
 
T
R
 
G
I
 
I
P
 
P
M
 
M
E
 
N
K
 
Q
A
 
A
L
 
I
A
 
E
I
 
T
L
 
L
I
 
V
E
 
E
L
 
L
S
 
C
A
 
K
S
 
Q
L
 
H
A
 
V
A
 
H
E
 
A
W
 
G
V
 
L
S
 
M
P
 
S
N
 
S
I
 
S
Q
 
S
A
 
G
P
 
A
G
 
I
V
 
P
S
 
F
G
 
P
A
 
Q
P
 
P
E
 
D
G
 
G
S
 
S
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
K
 
E
N
 
N
F
 
F
W
 
W
N
 
R
T
 
T
V
 
L
Q
 
Q
K
 
T
Q
 
F
L
 
I
R
 
R
P
 
P
G
 
G
D
 
D
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
D
 
D
Q
 
Q
G
 
G
T
 
T
A
 
S
A
 
A
F
 
F
G
 
G
A
 
A
A
 
I
A
 
D
L
 
L
K
 
R
L
 
L
P
 
P
V
 
A
D
 
D
A
 
V
T
 
N
L
 
F
I
 
I
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
L
 
L
W
 
W
G
 
G
S
 
S
I
 
I
G
 
G
F
 
Y
T
 
T
L
 
L
P
 
A
A
 
A
A
 
A
Y
 
F
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
I
 
T
A
 
A
A
 
C
A
 
P
E
 
N
R
 
R
R
 
R
V
 
V
V
 
I
L
 
V
I
 
L
V
 
T
G
 
G
D
|
D
G
 
G
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
T
 
T
I
 
I
Q
 
Q
E
 
E
L
 
L
G
 
G
S
 
S
M
 
M
L
 
L
R
 
R
D
 
D
K
 
K
Q
 
Q
R
 
H
P
 
P
L
 
I
I
 
I
L
 
L
L
 
V
L
 
L
N
 
N
N
|
N
E
 
E
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
V
 
V
E
 
E
R
 
R
A
 
A
I
 
I
H
 
H
G
 
G
P
 
A
E
 
E
Q
 
Q
R
 
R
Y
 
Y
N
 
N
D
 
D
I
 
I
A
 
A
L
 
L
W
 
W
D
 
N
W
 
W
N
 
T
R
 
H
L
 
I
P
 
P
D
 
Q
A
 
A
F
 
L
A
 
S
P
 
L
D
 
D
V
 
P
P
 
Q
S
 
S
R
 
E
C
 
C
W
 
W
R
 
R
V
 
V
T
 
S
R
 
E
T
 
A
Q
 
E
E
 
Q
L
 
L
Q
 
A
E
 
D
A
 
V
M
 
L
N
 
E
S
 
K
S
 
V
V
 
A
A
 
H
S
 
H
D
 
E
R
 
R
L
 
L
T
 
S
L
 
L
V
 
I
E
 
E
V
 
V
M
 
M
L
 
L
P
 
P
K
 
K
M
 
A
D
 
D
I
 
I
P
 
P
D
 
P
F
 
L
L
 
L
R
 
G
T
 
A
V
 
L
T
 
T
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
E
 
E
E
 
A
R
 
C
N
 
N
S
 
N

1ovmA Crystal structure of indolepyruvate decarboxylase from enterobacter cloacae (see paper)
64% identity, 99% coverage: 5:551/553 of query aligns to 3:535/535 of 1ovmA

query
sites
1ovmA
Y
 
Y
T
 
C
I
 
V
G
 
A
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
L
 
L
D
 
D
R
 
R
L
 
L
V
 
T
D
 
D
C
 
C
G
 
G
I
 
A
D
 
D
R
 
H
L
 
L
F
 
F
G
 
G
V
|
V
P
|
P
G
|
G
D
|
D
Y
|
Y
N
|
N
L
 
L
Q
 
Q
F
 
F
L
 
L
D
 
D
S
 
H
V
 
V
I
 
I
A
 
D
H
 
S
R
 
P
N
 
D
L
 
I
G
 
C
W
 
W
V
 
V
G
 
G
C
 
C
A
 
A
N
 
N
E
|
E
L
 
L
N
 
N
A
 
A
A
 
S
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
D
 
D
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
I
 
C
K
 
K
G
 
G
A
 
F
G
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
L
T
 
T
T
|
T
Y
 
F
G
 
G
V
|
V
G
 
G
E
 
E
L
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
M
N
 
N
G
 
G
I
 
I
A
 
A
G
 
G
S
 
S
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
H
 
H
V
 
V
P
 
P
V
 
V
L
 
L
H
 
H
I
 
I
V
 
V
G
 
G
A
 
A
P
 
P
C
 
G
T
 
T
G
 
A
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
L
 
L
H
|
H
H
|
H
T
 
T
L
|
L
G
|
G
D
 
D
G
 
G
D
 
E
F
 
F
S
 
R
H
 
H
F
 
F
S
 
Y
R
 
H
M
 
M
S
 
S
E
 
E
Q
 
P
I
 
I
T
 
T
C
 
V
S
 
A
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
L
 
L
A
 
T
A
 
E
G
 
Q
N
 
N
A
 
A
C
 
C
H
 
Y
E
 
E
I
 
I
D
 
D
R
 
R
V
 
V
L
 
L
S
 
T
E
 
T
M
 
M
L
 
L
T
 
R
H
 
E
H
 
R
R
 
R
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
M
 
M
L
 
L
P
 
P
A
|
A
D
 
D
V
 
V
A
 
A
K
 
K
A
 
K
K
 
A
T
 
A
T
 
T
P
 
P
P
 
P
A
 
V
H
 
N
R
 
A
L
 
L
L
 
T
I
 
H
Q
 
K
G
 
Q
L
 
A
P
 
H
A
 
A
D
 
D
E
 
S
N
 
A
Q
 
C
L
 
L
A
 
K
G
 
A
F
 
F
R
 
R
E
 
D
H
 
A
A
 
A
G
 
E
R
 
N
M
 
K
L
 
L
R
 
A
S
 
M
S
 
S
R
 
K
R
 
R
V
 
T
S
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
D
 
D
F
 
F
L
 
L
A
 
V
Q
 
L
R
 
R
Y
 
H
G
 
G
L
 
L
Q
 
K
N
 
H
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
E
 
K
W
 
W
V
 
V
A
 
K
K
 
E
V
 
V
P
 
P
V
 
M
A
 
A
Y
 
H
A
 
A
T
 
T
M
 
M
L
 
L
M
 
M
G
 
G
K
 
K
G
 
G
L
 
I
F
 
F
D
 
D
E
 
E
Q
 
R
Q
 
Q
S
 
A
G
 
G
F
 
F
V
 
Y
G
 
G
T
 
T
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
I
x
S
A
 
A
S
 
S
A
 
T
E
 
G
E
 
A
T
 
V
R
 
K
D
 
E
A
 
A
I
 
I
E
 
E
N
 
G
A
 
A
D
 
D
T
 
T
I
 
V
I
 
L
C
 
C
I
 
V
G
 
G
T
 
T
R
 
R
F
 
F
T
 
T
D
 
D
T
 
T
I
x
L
T
 
T
A
 
A
G
 
G
F
 
F
T
 
T
Q
 
H
H
 
Q
L
 
L
P
 
T
L
 
P
E
 
A
K
 
Q
T
 
T
I
 
I
E
 
E
I
 
V
Q
 
Q
P
 
P
F
 
H
A
 
A
V
 
A
R
 
R
V
 
V
A
 
G
D
 
D
R
 
V
W
 
W
F
 
F
S
 
T
R
 
G
I
 
I
P
 
P
M
 
M
E
 
N
K
 
Q
A
 
A
L
 
I
A
 
E
I
 
T
L
 
L
I
 
V
E
 
E
L
 
L
S
 
C
A
 
K
S
 
Q
L
 
H
A
 
V
A
 
H
E
 
-
W
 
-
V
 
-
S
 
-
P
 
-
N
 
-
I
 
-
Q
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
-
G
 
-
A
 
A
P
 
P
E
 
D
G
 
G
S
 
S
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
K
 
E
N
 
N
F
 
F
W
 
W
N
 
R
T
 
T
V
 
L
Q
 
Q
K
 
T
Q
 
F
L
 
I
R
 
R
P
 
P
G
 
G
D
 
D
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
D
 
D
Q
|
Q
G
|
G
T
|
T
A
 
S
A
 
A
F
 
F
G
 
G
A
 
A
A
 
I
A
 
D
L
 
L
K
 
R
L
 
L
P
 
P
V
 
A
D
 
D
A
 
V
T
 
N
L
 
F
I
 
I
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
L
 
L
W
 
W
G
|
G
S
|
S
I
|
I
G
 
G
F
 
Y
T
 
T
L
 
L
P
 
A
A
 
A
A
 
A
Y
 
F
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
I
 
T
A
 
A
A
 
C
A
 
P
E
 
N
R
 
R
R
 
R
V
 
V
V
 
I
L
 
V
I
 
L
V
 
T
G
|
G
D
|
D
G
|
G
A
|
A
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
T
 
T
I
 
I
Q
 
Q
E
 
E
L
 
L
G
 
G
S
 
S
M
 
M
L
 
L
R
 
R
D
 
D
K
 
K
Q
 
Q
R
 
H
P
 
P
L
 
I
I
 
I
L
 
L
L
 
V
L
 
L
N
 
N
N
|
N
E
 
E
G
|
G
Y
|
Y
T
|
T
V
|
V
E
|
E
R
 
R
A
 
A
I
|
I
H
 
H
G
 
G
P
 
A
E
 
E
Q
 
Q
R
 
R
Y
 
Y
N
 
N
D
 
D
I
 
I
A
 
A
L
 
L
W
 
W
D
 
N
W
 
W
N
 
T
R
 
H
L
 
I
P
 
P
D
 
Q
A
 
A
F
 
L
A
 
S
P
 
L
D
 
D
V
 
P
P
 
Q
S
 
S
R
 
E
C
 
C
W
 
W
R
 
R
V
 
V
T
 
S
R
 
E
T
 
A
Q
 
E
E
 
Q
L
 
L
Q
 
A
E
 
D
A
 
V
M
 
L
N
 
E
S
 
K
S
 
V
V
 
A
A
 
H
S
 
H
D
 
E
R
 
R
L
 
L
T
 
S
L
 
L
V
 
I
E
 
E
V
 
V
M
 
M
L
 
L
P
 
P
K
|
K
M
 
A
D
 
D
I
 
I
P
 
P
D
 
P
F
 
L
L
 
L
R
 
G
T
 
A
V
 
L
T
 
T
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
E
 
E
E
 
A
R
 
C
N
 
N
S
 
N

2vbgA The complex structure of the branched-chain keto acid decarboxylase (kdca) from lactococcus lactis with 2r-1- hydroxyethyl-deazathdp (see paper)
41% identity, 99% coverage: 5:550/553 of query aligns to 7:545/546 of 2vbgA

query
sites
2vbgA
Y
 
Y
T
 
T
I
 
V
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
L
 
L
D
 
D
R
 
R
L
 
L
V
 
H
D
 
E
C
 
L
G
 
G
I
 
I
D
 
E
R
 
E
L
 
I
F
 
F
G
 
G
V
|
V
P
|
P
G
|
G
D
|
D
Y
|
Y
N
|
N
L
 
L
Q
 
Q
F
 
F
L
 
L
D
 
D
S
 
Q
V
 
I
I
 
I
A
 
S
H
 
R
R
 
E
N
 
D
L
 
M
G
 
K
W
 
W
V
 
I
G
 
G
C
 
N
A
 
A
N
|
N
E
|
E
L
 
L
N
 
N
A
 
A
A
 
S
Y
 
Y
A
 
M
A
 
A
D
 
D
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
I
 
T
K
 
K
G
 
K
A
 
A
G
 
A
A
 
A
L
 
F
L
 
L
T
 
T
T
|
T
Y
 
F
G
 
G
V
|
V
G
 
G
E
 
E
L
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
I
N
 
N
G
 
G
I
 
L
A
 
A
G
 
G
S
 
S
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
H
 
N
V
 
L
P
 
P
V
 
V
L
 
V
H
 
E
I
 
I
V
 
V
G
 
G
A
 
S
P
 
P
C
 
T
T
 
S
G
 
K
A
 
V
Q
 
Q
Q
 
N
R
 
D
G
 
G
E
 
K
L
x
F
L
x
V
H
|
H
H
|
H
T
 
T
L
|
L
G
x
A
D
 
D
G
 
G
D
 
D
F
 
F
S
 
K
H
 
H
F
 
F
S
 
M
R
 
K
M
 
M
S
 
H
E
 
E
Q
 
P
I
 
V
T
 
T
C
 
A
S
 
A
Q
 
R
A
 
T
V
 
L
L
 
L
A
 
T
A
 
A
G
 
E
N
 
N
A
 
A
C
 
T
H
 
Y
E
 
E
I
 
I
D
 
D
R
 
R
V
 
V
L
 
L
S
 
S
E
 
Q
M
 
L
L
 
L
T
 
K
H
 
E
H
 
R
R
 
K
P
 
P
G
 
V
Y
 
Y
L
 
I
M
 
N
L
 
L
P
 
P
A
x
V
D
 
D
V
 
V
A
 
A
K
 
A
A
 
A
K
 
K
T
 
A
T
 
E
P
 
K
P
 
P
A
 
A
H
 
L
R
 
S
L
 
L
L
 
-
I
 
-
Q
 
-
G
 
E
L
 
N
P
 
T
A
 
T
D
 
E
E
 
Q
N
 
V
Q
 
I
L
 
L
A
 
S
G
 
K
F
 
I
R
 
E
E
 
E
H
 
S
A
 
-
G
 
-
R
 
-
M
 
-
L
 
L
R
 
K
S
 
N
S
 
A
R
 
Q
R
 
K
V
 
P
S
 
V
L
 
V
L
 
I
A
 
A
D
 
G
F
 
H
L
 
E
A
 
V
Q
 
I
R
 
S
Y
 
F
G
 
G
L
 
L
Q
 
E
N
 
K
A
 
T
L
 
V
R
 
T
E
 
Q
W
 
F
V
 
V
A
 
S
K
 
E
V
 
T
P
 
K
V
 
L
A
 
P
Y
 
I
A
 
T
T
 
T
M
 
L
L
 
N
M
 
F
G
 
G
K
 
K
G
 
S
L
 
A
F
 
V
D
 
D
E
 
E
Q
 
S
Q
 
L
S
 
P
G
 
S
F
 
F
V
 
L
G
 
G
T
 
I
Y
 
Y
S
 
N
G
 
G
I
x
K
A
 
L
S
 
S
A
 
E
E
 
I
E
 
S
T
 
L
R
 
K
D
 
N
A
 
F
I
 
V
E
 
E
N
 
S
A
 
A
D
 
D
T
 
F
I
 
I
I
 
L
C
 
M
I
 
L
G
 
G
T
 
V
R
 
K
F
 
L
T
 
T
D
 
D
T
 
S
I
x
S
T
 
T
A
 
G
G
 
A
F
 
F
T
 
T
Q
 
H
H
 
H
L
 
L
P
 
D
L
 
E
E
 
N
K
 
K
T
 
M
I
 
I
E
 
S
I
 
L
Q
 
N
P
 
I
F
 
D
A
 
E
V
 
G
R
 
I
V
 
I
A
 
F
D
 
N
R
 
K
W
 
V
F
 
V
S
 
E
R
 
D
I
 
F
P
 
D
M
 
F
E
 
R
K
 
A
A
 
V
L
 
V
A
 
S
I
 
S
L
 
L
I
 
S
E
 
E
L
 
L
S
 
K
A
 
G
-
 
I
S
 
E
L
 
Y
A
 
E
A
 
G
E
 
Q
W
 
Y
V
 
I
S
 
D
P
 
K
N
 
Q
I
 
Y
Q
 
E
A
 
E
P
 
F
G
 
I
V
 
P
S
 
S
G
 
S
A
 
A
P
 
P
E
 
-
G
 
-
S
 
-
L
 
L
T
 
S
Q
 
Q
K
 
D
N
 
R
F
 
L
W
 
W
N
 
Q
T
 
A
V
 
V
Q
 
E
K
 
S
Q
 
L
L
 
T
R
 
Q
P
 
S
G
 
N
D
 
E
I
 
T
I
 
I
L
 
V
A
 
A
D
x
E
Q
|
Q
G
|
G
T
|
T
A
 
S
A
 
F
F
 
F
G
 
G
A
 
A
A
 
S
A
 
T
L
 
I
K
 
F
L
 
L
P
 
K
V
 
S
D
 
N
A
 
S
T
 
R
L
 
F
I
 
I
V
 
G
Q
 
Q
P
 
P
L
 
L
W
 
W
G
|
G
S
|
S
I
|
I
G
 
G
F
 
Y
T
 
T
L
 
F
P
 
P
A
 
A
A
 
A
Y
 
L
G
 
G
A
 
S
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
A
 
D
A
 
K
E
 
E
R
 
S
R
 
R
V
 
H
V
 
L
L
 
L
I
 
F
V
 
I
G
|
G
D
|
D
G
|
G
A
x
S
A
 
L
Q
 
Q
L
 
L
T
 
T
I
 
V
Q
 
Q
E
 
E
L
 
L
G
 
G
S
 
L
M
 
S
L
 
I
R
 
R
D
 
E
K
 
K
Q
 
L
R
 
N
P
 
P
L
 
I
I
 
C
L
 
F
L
 
I
L
 
I
N
 
N
N
|
N
E
 
D
G
|
G
Y
|
Y
T
|
T
V
|
V
E
|
E
R
 
R
A
 
E
I
 
I
H
 
H
G
 
G
P
 
P
E
 
T
Q
 
Q
R
 
S
Y
 
Y
N
 
N
D
 
D
I
 
I
A
 
P
L
 
M
W
 
W
D
 
N
W
 
Y
N
 
S
R
 
K
L
 
L
P
 
P
D
 
E
A
 
T
F
 
F
A
 
G
P
 
A
D
 
T
V
 
E
P
 
D
S
 
R
R
 
V
C
 
V
W
 
S
R
 
K
V
 
I
T
 
V
R
 
R
T
 
T
Q
 
E
-
 
N
E
 
E
L
 
F
Q
 
V
E
 
S
A
 
V
M
 
M
N
 
K
S
 
E
S
 
A
V
 
Q
A
 
A
S
 
D
-
 
V
D
 
N
R
 
R
L
 
M
T
 
Y
L
 
W
V
 
I
E
 
E
V
 
L
M
 
V
L
 
L
P
 
E
K
|
K
M
 
E
D
 
D
I
 
A
P
 
P
D
 
K
F
 
L
L
 
L
R
 
K
T
 
K
V
 
M
T
 
G
Q
 
K
A
 
L
L
 
F
E
 
A
E
 
E
R
 
Q
N
 
N

2vbfB The holostructure of the branched-chain keto acid decarboxylase (kdca) from lactococcus lactis (see paper)
41% identity, 99% coverage: 5:550/553 of query aligns to 7:545/546 of 2vbfB

query
sites
2vbfB
Y
 
Y
T
 
T
I
 
V
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
L
 
L
D
 
D
R
 
R
L
 
L
V
 
H
D
 
E
C
 
L
G
 
G
I
 
I
D
 
E
R
 
E
L
 
I
F
 
F
G
 
G
V
|
V
P
|
P
G
|
G
D
|
D
Y
|
Y
N
|
N
L
 
L
Q
 
Q
F
 
F
L
 
L
D
 
D
S
 
Q
V
 
I
I
 
I
A
 
S
H
 
R
R
 
E
N
 
D
L
 
M
G
 
K
W
 
W
V
 
I
G
 
G
C
 
N
A
 
A
N
|
N
E
|
E
L
 
L
N
 
N
A
 
A
A
 
S
Y
 
Y
A
 
M
A
 
A
D
 
D
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
I
 
T
K
 
K
G
 
K
A
 
A
G
 
A
A
 
A
L
 
F
L
 
L
T
 
T
T
|
T
Y
 
F
G
 
G
V
|
V
G
 
G
E
 
E
L
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
I
N
 
N
G
 
G
I
 
L
A
 
A
G
 
G
S
 
S
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
H
 
N
V
 
L
P
 
P
V
 
V
L
 
V
H
 
E
I
 
I
V
 
V
G
 
G
A
 
S
P
 
P
C
 
T
T
 
S
G
 
K
A
 
V
Q
 
Q
Q
 
N
R
 
D
G
 
G
E
 
K
L
x
F
L
x
V
H
|
H
H
|
H
T
 
T
L
|
L
G
x
A
D
 
D
G
 
G
D
 
D
F
 
F
S
 
K
H
 
H
F
 
F
S
 
M
R
 
K
M
 
M
S
 
H
E
 
E
Q
 
P
I
 
V
T
 
T
C
 
A
S
 
A
Q
 
R
A
 
T
V
 
L
L
 
L
A
 
T
A
 
A
G
 
E
N
 
N
A
 
A
C
 
T
H
 
Y
E
 
E
I
 
I
D
 
D
R
 
R
V
 
V
L
 
L
S
 
S
E
 
Q
M
 
L
L
 
L
T
 
K
H
 
E
H
 
R
R
 
K
P
 
P
G
 
V
Y
 
Y
L
 
I
M
 
N
L
 
L
P
 
P
A
x
V
D
 
D
V
 
V
A
 
A
K
 
A
A
 
A
K
 
K
T
 
A
T
 
E
P
 
K
P
 
P
A
 
A
H
 
L
R
 
S
L
 
L
L
 
-
I
 
-
Q
 
-
G
 
E
L
 
N
P
 
T
A
 
T
D
 
E
E
 
Q
N
 
V
Q
 
I
L
 
L
A
 
S
G
 
K
F
 
I
R
 
E
E
 
E
H
 
S
A
 
-
G
 
-
R
 
-
M
 
-
L
 
L
R
 
K
S
 
N
S
 
A
R
 
Q
R
 
K
V
 
P
S
 
V
L
 
V
L
 
I
A
 
A
D
 
G
F
 
H
L
 
E
A
 
V
Q
 
I
R
 
S
Y
 
F
G
 
G
L
 
L
Q
 
E
N
 
K
A
 
T
L
 
V
R
 
T
E
 
Q
W
 
F
V
 
V
A
 
S
K
 
E
V
 
T
P
 
K
V
 
L
A
 
P
Y
 
I
A
 
T
T
 
T
M
 
L
L
 
N
M
 
F
G
 
G
K
 
K
G
 
S
L
 
A
F
 
V
D
 
D
E
 
E
Q
 
S
Q
 
L
S
 
P
G
 
S
F
 
F
V
 
L
G
 
G
T
 
I
Y
 
Y
S
 
N
G
 
G
I
x
K
A
 
L
S
 
S
A
 
E
E
 
I
E
 
S
T
 
L
R
 
K
D
 
N
A
 
F
I
 
V
E
 
E
N
 
S
A
 
A
D
 
D
T
 
F
I
 
I
I
 
L
C
 
M
I
 
L
G
 
G
T
 
V
R
 
K
F
 
L
T
 
T
D
 
D
T
 
S
I
x
S
T
 
T
A
 
G
G
 
A
F
 
F
T
 
T
Q
 
H
H
 
H
L
 
L
P
 
D
L
 
E
E
 
N
K
 
K
T
 
M
I
 
I
E
 
S
I
 
L
Q
 
N
P
 
I
F
 
D
A
 
E
V
 
G
R
 
I
V
 
I
A
 
F
D
 
N
R
 
K
W
 
V
F
 
V
S
 
E
R
 
D
I
 
F
P
 
D
M
 
F
E
 
R
K
 
A
A
 
V
L
 
V
A
 
S
I
 
S
L
 
L
I
 
S
E
 
E
L
 
L
S
 
K
A
 
G
-
 
I
S
 
E
L
 
Y
A
 
E
A
 
G
E
 
Q
W
 
Y
V
 
I
S
 
D
P
 
K
N
 
Q
I
 
Y
Q
 
E
A
 
E
P
 
F
G
 
I
V
 
P
S
 
S
G
 
S
A
 
A
P
 
P
E
 
-
G
 
-
S
 
-
L
 
L
T
 
S
Q
 
Q
K
 
D
N
 
R
F
 
L
W
 
W
N
 
Q
T
 
A
V
 
V
Q
 
E
K
 
S
Q
 
L
L
 
T
R
 
Q
P
 
S
G
 
N
D
 
E
I
 
T
I
 
I
L
 
V
A
 
A
D
x
E
Q
|
Q
G
|
G
T
|
T
A
 
S
A
 
F
F
 
F
G
 
G
A
 
A
A
 
S
A
 
T
L
 
I
K
 
F
L
 
L
P
 
K
V
 
S
D
 
N
A
 
S
T
 
R
L
 
F
I
 
I
V
 
G
Q
 
Q
P
 
P
L
 
L
W
 
W
G
|
G
S
|
S
I
|
I
G
 
G
F
 
Y
T
 
T
L
 
F
P
 
P
A
 
A
A
 
A
Y
 
L
G
 
G
A
 
S
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
A
 
D
A
 
K
E
 
E
R
 
S
R
 
R
V
 
H
V
 
L
L
 
L
I
 
F
V
 
I
G
|
G
D
|
D
G
|
G
A
x
S
A
 
L
Q
 
Q
L
 
L
T
 
T
I
 
V
Q
 
Q
E
 
E
L
 
L
G
 
G
S
 
L
M
 
S
L
 
I
R
 
R
D
 
E
K
 
K
Q
 
L
R
 
N
P
 
P
L
 
I
I
 
C
L
 
F
L
 
I
L
 
I
N
 
N
N
|
N
E
 
D
G
|
G
Y
|
Y
T
|
T
V
|
V
E
|
E
R
 
R
A
 
E
I
 
I
H
 
H
G
 
G
P
 
P
E
 
T
Q
 
Q
R
 
S
Y
 
Y
N
 
N
D
 
D
I
 
I
A
 
P
L
 
M
W
 
W
D
 
N
W
 
Y
N
 
S
R
 
K
L
 
L
P
 
P
D
 
E
A
 
T
F
 
F
A
 
G
P
 
A
D
 
T
V
 
E
P
 
D
S
 
R
R
 
V
C
 
V
W
 
S
R
 
K
V
 
I
T
 
V
R
 
R
T
 
T
Q
 
E
-
 
N
E
 
E
L
 
F
Q
 
V
E
 
S
A
 
V
M
 
M
N
 
K
S
 
E
S
 
A
V
 
Q
A
 
A
S
 
D
-
 
V
D
 
N
R
 
R
L
 
M
T
 
Y
L
 
W
V
 
I
E
 
E
V
 
L
M
 
V
L
 
L
P
 
E
K
|
K
M
 
E
D
 
D
I
 
A
P
 
P
D
 
K
F
 
L
L
 
L
R
 
K
T
 
K
V
 
M
T
 
G
Q
 
K
A
 
L
L
 
F
E
 
A
E
 
E
R
 
Q
N
 
N

6vgsBBB Alpha-keto acid decarboxylase (see paper)
41% identity, 99% coverage: 5:550/553 of query aligns to 2:541/543 of 6vgsBBB

query
sites
6vgsBBB
Y
 
Y
T
 
T
I
 
V
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
L
 
L
D
 
D
R
 
R
L
 
L
V
 
H
D
 
E
C
 
L
G
 
G
I
 
I
D
 
E
R
 
E
L
 
I
F
 
F
G
 
G
V
|
V
P
|
P
G
|
G
D
|
D
Y
|
Y
N
|
N
L
 
L
Q
 
Q
F
 
F
L
 
L
D
 
D
S
 
H
V
 
I
I
 
I
A
 
S
H
 
R
R
 
K
N
 
D
L
 
M
G
 
K
W
 
W
V
 
V
G
 
G
C
 
N
A
 
A
N
 
N
E
|
E
L
 
L
N
 
N
A
 
A
A
 
S
Y
 
Y
A
 
M
A
 
A
D
 
D
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
I
 
T
K
 
K
G
 
K
A
 
A
G
 
A
A
 
A
L
 
F
L
 
L
T
 
T
T
|
T
Y
 
F
G
 
G
V
|
V
G
 
G
E
 
E
L
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
V
N
 
N
G
 
G
I
 
L
A
 
A
G
 
G
S
 
S
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
H
 
N
V
 
L
P
 
P
V
 
V
L
 
V
H
 
E
I
 
I
V
 
V
G
 
G
A
 
S
P
 
P
C
 
T
T
 
S
G
 
K
A
 
V
Q
 
Q
Q
 
N
R
 
E
G
 
G
E
 
K
L
 
F
L
 
V
H
|
H
H
|
H
T
 
T
L
|
L
G
x
A
D
 
D
G
 
G
D
 
D
F
 
F
S
 
K
H
 
H
F
 
F
S
 
M
R
 
K
M
 
M
S
 
H
E
 
E
Q
 
P
I
 
V
T
 
T
C
 
A
S
 
A
Q
 
R
A
 
T
V
 
L
L
 
L
A
 
T
A
 
A
G
 
E
N
 
N
A
 
A
C
 
T
H
 
V
E
 
E
I
 
I
D
 
D
R
 
R
V
 
V
L
 
L
S
 
S
E
 
A
M
 
L
L
 
L
T
 
K
H
 
E
H
 
R
R
 
K
P
 
P
G
 
V
Y
 
Y
L
 
I
M
 
N
L
 
L
P
 
P
A
x
V
D
 
D
V
 
V
A
 
A
K
 
A
A
 
A
K
 
K
T
 
A
T
 
E
P
 
K
P
 
P
A
 
S
H
 
-
R
 
-
L
 
L
L
 
P
I
 
L
Q
 
T
G
 
S
L
 
N
P
 
T
A
 
S
D
 
D
E
 
Q
N
 
E
Q
 
I
L
 
L
A
 
N
G
 
K
F
 
I
R
 
Q
E
 
E
H
 
S
A
 
-
G
 
-
R
 
-
M
 
-
L
 
L
R
 
K
S
 
N
S
 
A
R
 
K
R
 
K
V
 
P
S
 
I
L
 
V
L
 
I
A
 
T
D
 
G
F
 
H
L
 
E
A
 
I
Q
 
I
R
 
S
Y
 
F
G
 
G
L
 
L
Q
 
E
N
 
K
A
 
T
L
 
V
R
 
S
E
 
Q
W
 
F
V
 
I
A
 
S
K
 
K
V
 
T
P
 
K
V
 
L
A
 
P
Y
 
I
A
 
T
T
 
T
M
 
L
L
 
N
M
 
F
G
 
G
K
 
K
G
 
S
L
 
S
F
 
V
D
 
D
E
 
E
Q
 
A
Q
 
L
S
 
P
G
 
S
F
 
F
V
 
L
G
 
G
T
 
I
Y
 
Y
S
 
N
G
 
G
I
 
K
A
 
L
S
 
S
A
 
E
E
 
P
E
 
N
T
 
L
R
 
K
D
 
E
A
 
F
I
 
V
E
 
E
N
 
S
A
 
A
D
 
D
T
 
F
I
 
I
I
 
L
C
 
M
I
 
L
G
 
G
T
 
V
R
 
K
F
 
L
T
 
T
D
 
D
T
 
S
I
x
S
T
 
T
A
 
G
G
 
V
F
 
F
T
 
T
Q
 
H
H
 
H
L
 
L
P
 
N
L
 
E
E
 
N
K
 
K
T
 
M
I
 
I
E
 
S
I
 
L
Q
 
N
P
 
I
F
 
D
A
 
E
V
 
G
R
 
K
V
 
I
A
 
F
D
 
N
R
 
E
W
 
S
F
 
I
S
 
Q
R
 
N
I
 
F
P
 
D
M
 
F
E
 
E
K
 
S
A
 
L
L
 
I
A
 
S
I
 
-
L
 
-
I
 
-
E
 
S
L
 
L
S
 
L
A
 
D
S
 
L
L
 
S
A
 
E
A
 
I
E
 
E
W
 
Y
V
 
K
S
 
G
P
 
K
N
 
Y
I
 
I
Q
 
D
A
 
K
P
 
K
G
 
Q
V
 
E
S
 
D
G
 
F
A
 
V
P
 
P
E
 
S
G
 
N
S
 
A
-
 
L
L
 
L
T
 
S
Q
 
Q
K
 
D
N
 
R
F
 
L
W
 
W
N
 
Q
T
 
A
V
 
V
Q
 
E
K
 
N
Q
 
L
L
 
T
R
 
Q
P
 
S
G
 
N
D
 
E
I
 
T
I
 
I
L
 
V
A
 
A
D
 
E
Q
|
Q
G
|
G
T
|
T
A
 
S
A
 
F
F
 
F
G
 
G
A
 
A
A
 
S
A
 
P
L
 
I
K
 
F
L
 
L
P
 
K
V
 
P
D
 
K
A
 
S
T
 
H
L
 
F
I
 
I
V
 
G
Q
 
Q
P
 
P
L
 
L
W
 
W
G
|
G
S
|
S
I
|
I
G
 
G
F
 
Y
T
 
T
L
 
F
P
 
P
A
 
A
A
 
A
Y
 
L
G
 
G
A
 
S
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
A
 
D
A
 
K
E
 
E
R
 
S
R
 
R
V
 
H
V
 
L
L
 
L
I
 
F
V
 
I
G
|
G
D
|
D
G
|
G
A
x
S
A
 
L
Q
 
Q
L
 
L
T
 
T
I
 
V
Q
 
Q
E
 
E
L
 
L
G
 
G
S
 
L
M
 
A
L
 
I
R
 
R
D
 
E
K
 
K
Q
 
I
R
 
N
P
 
P
L
 
I
I
 
C
L
 
F
L
 
I
L
 
I
N
 
N
N
|
N
E
 
D
G
|
G
Y
|
Y
T
|
T
V
|
V
E
|
E
R
 
R
A
 
E
I
 
I
H
 
H
G
 
G
P
 
P
E
 
N
Q
 
Q
R
 
S
Y
 
Y
N
 
N
D
 
D
I
 
I
A
 
P
L
 
M
W
 
W
D
 
N
W
 
Y
N
 
S
R
 
K
L
 
L
P
 
P
D
 
E
A
 
S
F
 
F
A
 
G
P
 
A
D
 
T
V
 
E
P
 
E
S
 
R
R
 
V
C
 
V
W
 
S
R
 
K
V
 
I
T
 
V
R
 
R
T
 
T
Q
 
E
-
 
N
E
 
E
L
 
F
Q
 
V
E
 
S
A
 
V
M
 
M
N
 
K
S
 
E
S
 
A
V
 
Q
A
 
A
S
 
D
-
 
P
D
 
N
R
 
R
L
 
M
T
 
Y
L
 
W
V
 
I
E
 
E
V
 
L
M
 
I
L
 
L
P
 
A
K
 
K
M
 
E
D
 
D
I
 
A
P
 
P
D
 
K
F
 
V
L
 
L
R
 
K
T
 
K
V
 
M
T
 
G
Q
 
K
A
 
L
L
 
F
E
 
A
E
 
E
R
 
Q
N
 
N

1qpbA Pyruvate decarboyxlase from yeast (form b) complexed with pyruvamide (see paper)
38% identity, 97% coverage: 6:539/553 of query aligns to 4:548/555 of 1qpbA

query
sites
1qpbA
T
 
T
I
 
L
G
 
G
D
 
K
Y
 
Y
L
 
L
L
 
F
D
 
E
R
 
R
L
 
L
V
 
K
D
 
Q
C
 
V
G
 
N
I
 
V
D
 
N
R
 
T
L
 
V
F
 
F
G
 
G
V
x
L
P
|
P
G
|
G
D
|
D
Y
x
F
N
|
N
L
 
L
Q
 
S
F
 
L
L
 
L
D
 
D
S
 
K
V
 
I
I
 
Y
A
 
E
H
 
V
R
 
E
N
 
G
L
 
M
G
 
R
W
 
W
V
 
A
G
 
G
C
 
N
A
 
A
N
 
N
E
|
E
L
 
L
N
 
N
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
D
 
D
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
I
 
I
K
 
K
G
 
G
A
 
M
G
 
S
A
 
C
L
 
I
L
 
I
T
 
T
T
|
T
Y
 
F
G
 
G
V
|
V
G
|
G
E
 
E
L
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
N
 
N
G
 
G
I
 
I
A
 
A
G
 
G
S
 
S
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
H
 
H
V
 
V
P
 
G
V
 
V
L
 
L
H
 
H
I
 
V
V
 
V
G
 
G
A
 
V
P
 
P
C
 
S
T
 
I
G
 
S
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
A
R
 
K
G
 
Q
E
 
L
L
 
L
L
 
L
H
|
H
H
|
H
T
 
T
L
|
L
G
|
G
D
 
N
G
 
G
D
 
D
F
 
F
S
 
T
H
 
V
F
 
F
S
 
H
R
 
R
M
 
M
S
 
S
E
 
A
Q
 
N
I
 
I
T
 
S
C
 
E
S
 
T
Q
 
T
A
 
A
V
 
M
L
 
I
A
 
T
-
 
D
A
 
I
G
 
A
N
 
T
A
 
A
C
 
P
H
 
A
E
 
E
I
 
I
D
 
D
R
 
R
V
 
C
L
 
I
S
 
R
E
 
T
M
 
T
L
x
Y
T
 
V
H
 
T
H
x
Q
R
 
R
P
 
P
G
 
V
Y
 
Y
L
 
L
M
 
G
L
 
L
P
 
P
A
|
A
D
 
N
V
 
L
-
 
V
-
 
D
-
 
L
-
 
N
-
 
V
-
 
P
A
 
A
K
 
K
A
 
L
K
 
L
T
 
Q
T
 
T
P
 
P
P
 
I
A
 
D
H
 
M
R
 
S
L
 
L
L
 
-
I
 
-
Q
 
-
G
 
-
L
 
K
P
 
P
A
 
N
D
 
D
E
 
A
N
 
E
Q
 
S
L
 
E
A
 
K
G
 
E
F
 
V
R
 
I
E
 
D
H
 
T
A
 
I
G
 
L
R
 
V
M
 
L
L
 
I
R
 
K
S
 
D
S
 
A
R
 
K
R
 
N
V
 
P
S
 
V
L
 
I
L
 
L
A
 
A
D
 
D
F
 
A
L
 
C
A
 
C
Q
 
S
R
|
R
Y
x
H
G
x
D
L
 
V
Q
 
K
N
 
A
A
 
E
L
 
T
R
 
K
E
 
K
W
 
L
V
 
I
A
 
D
K
 
L
V
 
T
P
 
Q
V
 
F
A
 
P
Y
 
A
A
 
F
T
 
V
M
 
T
L
 
P
M
 
M
G
 
G
K
 
K
G
 
G
L
 
S
F
 
I
D
 
D
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
H
S
 
P
G
 
R
F
 
Y
V
 
G
G
 
G
T
 
V
Y
 
Y
S
 
V
G
 
G
I
x
T
A
 
L
S
 
S
A
 
K
E
 
P
E
 
E
T
 
V
R
 
K
D
 
E
A
 
A
I
 
V
E
 
E
N
 
S
A
 
A
D
 
D
T
 
L
I
 
I
I
 
L
C
 
S
I
 
V
G
 
G
T
 
A
R
 
L
F
 
L
T
 
S
D
 
D
T
 
F
I
x
N
T
 
T
A
 
G
G
 
S
F
 
F
T
 
S
Q
 
Y
H
 
S
L
 
Y
P
 
K
L
 
T
E
 
K
K
 
N
T
 
I
I
 
V
E
 
E
I
 
F
Q
 
H
P
 
S
F
 
D
A
 
H
V
 
M
R
 
K
V
 
I
A
 
R
D
 
N
R
 
A
W
 
T
F
 
F
S
 
P
R
 
G
I
 
V
P
 
Q
M
 
M
E
 
K
K
 
F
A
 
V
L
 
L
A
 
Q
I
 
K
L
 
L
I
 
L
E
 
T
L
 
A
S
 
I
A
 
A
S
 
D
L
 
A
A
 
A
A
 
K
E
 
G
W
 
Y
-
 
K
-
 
P
V
 
V
S
 
A
P
 
V
N
 
P
I
 
A
Q
 
R
A
 
T
P
 
P
G
 
A
V
 
N
S
 
A
G
 
A
A
 
V
P
 
P
E
 
A
G
 
S
S
 
T
-
 
P
L
 
L
T
 
K
Q
 
Q
K
 
E
N
 
W
F
 
M
W
 
W
N
 
N
T
 
Q
V
 
L
Q
 
G
K
 
N
Q
 
F
L
 
L
R
 
Q
P
 
E
G
 
G
D
 
D
I
 
V
I
 
V
L
 
I
A
 
A
D
 
E
Q
x
T
G
|
G
T
|
T
A
 
S
A
 
A
F
 
F
G
 
G
A
 
I
A
 
N
A
 
Q
L
 
T
K
 
T
L
 
F
P
 
P
V
 
N
D
 
N
A
 
T
T
 
Y
L
 
G
I
 
I
V
 
S
Q
 
Q
P
 
V
L
 
L
W
 
W
G
|
G
S
|
S
I
|
I
G
 
G
F
 
F
T
 
T
L
 
T
P
 
G
A
 
A
A
 
T
Y
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
A
I
 
F
A
 
A
A
 
A
A
 
E
E
 
E
-
 
I
-
 
D
-
 
P
-
 
K
R
 
K
R
 
R
V
 
V
V
 
I
L
 
L
I
 
F
V
 
I
G
|
G
D
|
D
G
|
G
A
x
S
A
 
L
Q
 
Q
L
 
L
T
 
T
I
 
V
Q
 
Q
E
 
E
L
 
I
G
 
S
S
 
T
M
 
M
L
 
I
R
 
R
D
 
W
K
 
G
Q
 
L
R
 
K
P
 
P
L
 
Y
I
 
L
L
 
F
L
 
V
L
 
L
N
 
N
N
|
N
E
 
D
G
|
G
Y
|
Y
T
|
T
V
x
I
E
|
E
R
 
K
A
 
L
I
|
I
H
 
H
G
 
G
P
 
P
E
 
K
Q
 
A
R
 
Q
Y
 
Y
N
 
N
D
 
E
I
 
I
A
 
Q
L
 
G
W
 
W
D
 
D
-
 
H
W
 
L
N
 
S
R
 
L
L
 
L
P
 
P
D
 
T
A
 
F
F
 
G
A
 
A
P
 
K
D
 
D
V
 
Y
P
 
E
S
 
T
R
 
H
C
 
-
W
 
-
R
 
R
V
 
V
T
 
A
R
 
T
T
 
T
Q
 
G
E
 
E
L
 
W
Q
 
D
E
 
K
A
 
L
M
 
T
N
 
Q
S
 
D
S
 
K
V
 
S
A
 
F
S
 
N
D
 
D
-
 
N
-
 
S
R
 
K
L
 
I
T
 
R
L
 
M
V
 
I
E
 
E
V
 
V
M
 
M
L
 
L
P
 
P
K
x
V
M
 
F
D
 
D
I
 
A
P
 
P
D
 
Q
F
 
N
L
 
L

P06169 Pyruvate decarboxylase isozyme 1; Thiamine pyrophosphate-dependent 2-oxo-acid decarboxylase; 2ODC; EC 4.1.1.-; EC 4.1.1.43; EC 4.1.1.72; EC 4.1.1.74 from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast) (see 5 papers)
38% identity, 97% coverage: 6:539/553 of query aligns to 5:549/563 of P06169

query
sites
P06169
T
 
T
I
 
L
G
 
G
D
 
K
Y
 
Y
L
 
L
L
 
F
D
 
E
R
 
R
L
 
L
V
 
K
D
 
Q
C
 
V
G
 
N
I
 
V
D
 
N
R
 
T
L
 
V
F
 
F
G
 
G
V
 
L
P
 
P
G
 
G
D
 
D
Y
 
F
N
 
N
L
 
L
Q
 
S
F
 
L
L
 
L
D
 
D
S
 
K
V
 
I
I
 
Y
A
 
E
H
 
V
R
 
E
N
 
G
L
 
M
G
 
R
W
 
W
V
 
A
G
 
G
C
 
N
A
 
A
N
 
N
E
 
E
L
 
L
N
 
N
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
D
 
D
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
I
 
I
K
 
K
G
 
G
A
 
M
G
 
S
A
 
C
L
 
I
L
 
I
T
 
T
T
 
T
Y
 
F
G
 
G
V
 
V
G
 
G
E
 
E
L
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
N
 
N
G
 
G
I
 
I
A
 
A
G
 
G
S
 
S
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
H
 
H
V
 
V
P
 
G
V
 
V
L
 
L
H
 
H
I
 
V
V
 
V
G
 
G
A
 
V
P
 
P
C
 
S
T
 
I
G
 
S
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
A
R
 
K
G
 
Q
E
 
L
L
 
L
L
 
L
H
 
H
H
 
H
T
 
T
L
 
L
G
 
G
D
 
N
G
 
G
D
 
D
F
 
F
S
 
T
H
 
V
F
 
F
S
 
H
R
 
R
M
 
M
S
 
S
E
 
A
Q
 
N
I
 
I
T
 
S
C
 
E
S
 
T
Q
 
T
A
 
A
V
 
M
L
 
I
A
 
T
-
 
D
A
 
I
G
 
A
N
 
T
A
 
A
C
 
P
H
 
A
E
 
E
I
 
I
D
 
D
R
 
R
V
 
C
L
 
I
S
 
R
E
 
T
M
 
T
L
 
Y
T
 
V
H
 
T
H
 
Q
R
|
R
P
 
P
G
 
V
Y
 
Y
L
 
L
M
 
G
L
 
L
P
 
P
A
 
A
D
 
N
V
 
L
-
 
V
-
 
D
-
 
L
-
 
N
-
 
V
-
 
P
A
 
A
K
 
K
A
 
L
K
 
L
T
 
Q
T
 
T
P
 
P
P
 
I
A
 
D
H
 
M
R
 
S
L
 
L
L
 
-
I
 
-
Q
 
-
G
 
-
L
 
K
P
 
P
A
 
N
D
 
D
E
 
A
N
 
E
Q
 
S
L
 
E
A
 
K
G
 
E
F
 
V
R
 
I
E
 
D
H
 
T
A
 
I
G
 
L
R
 
A
M
 
L
L
 
V
R
 
K
S
 
D
S
 
A
R
 
K
R
 
N
V
 
P
S
 
V
L
 
I
L
 
L
A
 
A
D
 
D
F
 
A
L
 
C
A
 
C
Q
 
S
R
 
R
Y
 
H
G
 
D
L
 
V
Q
 
K
N
 
A
A
 
E
L
 
T
R
 
K
E
 
K
W
 
L
V
 
I
A
 
D
K
 
L
V
 
T
P
 
Q
V
 
F
A
 
P
Y
 
A
A
 
F
T
 
V
M
 
T
L
 
P
M
 
M
G
 
G
K
 
K
G
 
G
L
 
S
F
 
I
D
 
D
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
H
S
 
P
G
 
R
F
 
Y
V
 
G
G
 
G
T
 
V
Y
 
Y
S
 
V
G
 
G
I
 
T
A
 
L
S
 
S
A
 
K
E
 
P
E
 
E
T
 
V
R
 
K
D
 
E
A
 
A
I
 
V
E
 
E
N
 
S
A
 
A
D
 
D
T
 
L
I
 
I
I
 
L
C
 
S
I
 
V
G
 
G
T
 
A
R
 
L
F
 
L
T
 
S
D
|
D
T
 
F
I
 
N
T
 
T
A
 
G
G
 
S
F
 
F
T
 
S
Q
 
Y
H
 
S
L
 
Y
P
 
K
L
 
T
E
 
K
K
 
N
T
 
I
I
 
V
E
 
E
I
 
F
Q
 
H
P
 
S
F
 
D
A
 
H
V
 
M
R
 
K
V
 
I
A
 
R
D
 
N
R
 
A
W
 
T
F
 
F
S
 
P
R
 
G
I
 
V
P
 
Q
M
 
M
E
 
K
K
 
F
A
 
V
L
 
L
A
 
Q
I
 
K
L
 
L
I
 
L
E
 
T
L
 
T
S
 
I
A
 
A
S
 
D
L
 
A
A
 
A
A
 
K
E
 
G
W
 
Y
-
 
K
-
 
P
V
 
V
S
 
A
P
 
V
N
 
P
I
 
A
Q
 
R
A
 
T
P
 
P
G
 
A
V
 
N
S
 
A
G
 
A
A
 
V
P
 
P
E
 
A
G
 
S
S
 
T
-
 
P
L
 
L
T
 
K
Q
 
Q
K
 
E
N
 
W
F
 
M
W
 
W
N
 
N
T
 
Q
V
 
L
Q
 
G
K
 
N
Q
 
F
L
 
L
R
 
Q
P
 
E
G
 
G
D
 
D
I
 
V
I
 
V
L
 
I
A
 
A
D
 
E
Q
 
T
G
 
G
T
|
T
A
 
S
A
 
A
F
 
F
G
 
G
A
 
I
A
 
N
A
 
Q
L
 
T
K
 
T
L
 
F
P
 
P
V
 
N
D
 
N
A
 
T
T
 
Y
L
 
G
I
 
I
V
 
S
Q
 
Q
P
 
V
L
 
L
W
 
W
G
|
G
S
|
S
I
|
I
G
 
G
F
 
F
T
 
T
L
 
T
P
 
G
A
 
A
A
 
T
Y
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
A
I
 
F
A
 
A
A
 
A
A
 
E
E
 
E
-
 
I
-
 
D
-
 
P
-
 
K
R
 
K
R
 
R
V
 
V
V
 
I
L
 
L
I
 
F
V
 
I
G
 
G
D
|
D
G
|
G
A
x
S
A
 
L
Q
 
Q
L
 
L
T
 
T
I
 
V
Q
 
Q
E
 
E
L
 
I
G
 
S
S
 
T
M
 
M
L
 
I
R
 
R
D
 
W
K
 
G
Q
 
L
R
 
K
P
 
P
L
 
Y
I
 
L
L
 
F
L
 
V
L
 
L
N
 
N
N
|
N
E
x
D
G
|
G
Y
|
Y
T
|
T
V
x
I
E
 
E
R
 
K
A
 
L
I
 
I
H
 
H
G
 
G
P
 
P
E
 
K
Q
 
A
R
 
Q
Y
 
Y
N
 
N
D
 
E
I
 
I
A
 
Q
L
 
G
W
 
W
D
 
D
-
 
H
W
 
L
N
 
S
R
 
L
L
 
L
P
 
P
D
 
T
A
 
F
F
 
G
A
 
A
P
 
K
D
 
D
V
 
Y
P
 
E
S
 
T
R
 
H
C
 
-
W
 
-
R
 
R
V
 
V
T
 
A
R
 
T
T
 
T
Q
 
G
E
 
E
L
 
W
Q
 
D
E
 
K
A
 
L
M
 
T
N
 
Q
S
 
D
S
 
K
V
 
S
A
 
F
S
 
N
D
 
D
-
 
N
-
 
S
R
 
K
L
 
I
T
 
R
L
 
M
V
 
I
E
 
E
V
 
I
M
 
M
L
 
L
P
 
P
K
 
V
M
 
F
D
 
D
I
 
A
P
 
P
D
 
Q
F
 
N
L
 
L

Sites not aligning to the query:

2vk1A Crystal structure of the saccharomyces cerevisiae pyruvate decarboxylase variant d28a in complex with its substrate (see paper)
38% identity, 97% coverage: 6:539/553 of query aligns to 4:548/562 of 2vk1A

query
sites
2vk1A
T
 
T
I
 
L
G
 
G
D
 
K
Y
 
Y
L
 
L
L
 
F
D
 
E
R
 
R
L
 
L
V
 
K
D
 
Q
C
 
V
G
 
N
I
 
V
D
 
N
R
 
T
L
 
V
F
 
F
G
 
G
V
x
L
P
|
P
G
|
G
D
x
A
Y
x
F
N
|
N
L
 
L
Q
 
S
F
 
L
L
 
L
D
 
D
S
 
K
V
 
I
I
 
Y
A
 
E
H
 
V
R
 
E
N
 
G
L
 
M
G
 
R
W
 
W
V
 
A
G
 
G
C
 
N
A
 
A
N
 
N
E
|
E
L
 
L
N
 
N
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
D
 
D
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
I
 
I
K
 
K
G
 
G
A
 
M
G
 
S
A
 
C
L
 
I
L
 
I
T
 
T
T
|
T
Y
 
F
G
 
G
V
|
V
G
 
G
E
 
E
L
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
N
 
N
G
 
G
I
 
I
A
 
A
G
 
G
S
 
S
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
H
|
H
V
 
V
P
 
G
V
 
V
L
 
L
H
 
H
I
 
V
V
 
V
G
 
G
A
 
V
P
 
P
C
 
S
T
 
I
G
 
S
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
A
R
 
K
G
 
Q
E
 
L
L
 
L
L
 
L
H
|
H
H
|
H
T
 
T
L
|
L
G
|
G
D
 
N
G
 
G
D
 
D
F
 
F
S
 
T
H
 
V
F
 
F
S
 
H
R
 
R
M
 
M
S
 
S
E
 
A
Q
 
N
I
 
I
T
 
S
C
 
E
S
 
T
Q
 
T
A
 
A
V
 
M
L
 
I
A
 
T
-
 
D
A
 
I
G
 
A
N
 
T
A
 
A
C
 
P
H
 
A
E
 
E
I
 
I
D
 
D
R
 
R
V
 
C
L
 
I
S
 
R
E
 
T
M
 
T
L
 
Y
T
 
V
H
 
T
H
 
Q
R
 
R
P
 
P
G
 
V
Y
 
Y
L
 
L
M
 
G
L
 
L
P
 
P
A
|
A
D
 
N
V
 
L
-
 
V
-
 
D
-
 
L
-
 
N
-
 
V
-
 
P
A
 
A
K
 
K
A
 
L
K
 
L
T
 
Q
T
 
T
P
 
P
P
 
I
A
 
D
H
 
M
R
 
S
L
 
L
L
 
-
I
 
-
Q
 
-
G
 
-
L
 
K
P
 
P
A
 
N
D
 
D
E
 
A
N
 
E
Q
 
S
L
 
E
A
 
K
G
 
E
F
 
V
R
 
I
E
 
D
H
 
T
A
 
I
G
 
L
R
 
V
M
 
L
L
 
D
R
 
K
S
 
D
S
 
A
R
 
K
R
 
N
V
 
P
S
 
V
L
 
I
L
 
L
A
 
A
D
 
D
F
 
A
L
x
C
A
 
C
Q
 
S
R
 
R
Y
x
H
G
 
D
L
 
V
Q
 
K
N
 
A
A
 
E
L
 
T
R
 
K
E
 
K
W
 
L
V
 
I
A
 
D
K
 
L
V
 
T
P
 
Q
V
 
F
A
 
P
Y
 
A
A
 
F
T
 
V
M
 
T
L
 
P
M
 
M
G
 
G
K
 
K
G
 
G
L
 
S
F
 
I
D
 
D
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
H
S
 
P
G
 
R
F
 
Y
V
 
G
G
 
G
T
 
V
Y
 
Y
S
 
V
G
 
G
I
x
T
A
 
L
S
 
S
A
 
K
E
 
P
E
 
E
T
 
V
R
 
K
D
 
E
A
 
A
I
 
V
E
 
E
N
 
S
A
 
A
D
 
D
T
 
L
I
 
I
I
 
L
C
 
S
I
 
V
G
|
G
T
x
A
R
 
L
F
 
L
T
 
S
D
 
D
T
 
F
I
x
N
T
 
T
A
 
G
G
 
S
F
 
F
T
 
S
Q
 
Y
H
 
S
L
 
Y
P
 
K
L
 
T
E
 
K
K
 
N
T
 
I
I
 
V
E
 
E
I
 
F
Q
x
H
P
x
S
F
 
D
A
 
H
V
 
M
R
 
K
V
 
I
A
 
R
D
 
N
R
 
A
W
 
T
F
 
F
S
 
P
R
 
G
I
 
V
P
 
Q
M
 
M
E
 
K
K
 
F
A
 
V
L
 
L
A
 
Q
I
 
K
L
 
L
I
 
L
E
 
T
L
 
A
S
 
I
A
 
A
S
 
D
L
 
A
A
 
A
A
 
K
E
 
G
W
 
Y
-
 
K
-
 
P
V
 
V
S
 
A
P
 
V
N
 
P
I
 
A
Q
 
R
A
 
T
P
 
P
G
 
A
V
 
N
S
 
A
G
 
A
A
 
V
P
 
P
E
 
A
G
 
S
S
 
T