SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing BWI76_RS20790 BWI76_RS20790 aldehyde dehydrogenase to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

Q9XDN1 Propanal dehydrogenase (CoA-propanoylating); Coenzyme-A-acylating propionaldehyde dehydrogenase; Propanediol utilization protein PduP; EC 1.2.1.87 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see 2 papers)
46% identity, 100% coverage: 1:466/467 of query aligns to 1:463/464 of Q9XDN1

query
sites
Q9XDN1
M
|
M
N
|
N
Q
x
T
Q
x
S
D
x
E
I
x
L
E
|
E
Q
x
T
V
x
L
V
x
I
K
x
R
A
x
T
V
x
I
L
|
L
L
x
S
-
x
E
K
x
Q
M
x
L
T
 
T
D
 
T
S
 
P
S
 
A
K
 
Q
P
 
T
D
 
P
S
 
V
T
 
Q
V
 
P
H
 
Q
E
 
G
M
 
K
G
 
G
V
 
I
F
 
F
A
 
Q
S
 
S
L
 
V
D
 
S
D
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
D
A
 
A
A
 
A
-
 
H
-
 
Q
-
 
A
-
 
F
-
 
L
K
 
R
V
 
Y
A
 
Q
Q
 
Q
Q
 
C
G
 
P
L
 
L
K
 
K
S
 
T
V
 
-
A
 
-
M
 
-
R
 
R
Q
 
S
L
 
A
A
 
I
I
 
I
H
 
S
A
 
A
I
 
M
R
 
R
E
 
Q
A
 
E
G
 
L
E
 
T
K
 
P
Y
 
L
A
 
L
R
 
A
E
 
P
L
 
L
A
 
A
E
 
E
L
 
E
A
 
S
V
 
A
S
 
N
E
 
E
T
 
T
G
 
G
M
 
M
G
 
G
R
 
N
V
 
K
E
 
E
D
 
D
K
 
K
F
 
F
A
 
L
K
 
K
N
 
N
V
 
K
A
 
A
Q
 
A
A
 
L
R
 
D
G
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
G
V
 
V
E
 
E
C
 
D
L
 
L
S
 
T
P
 
T
Q
 
T
V
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
D
 
D
N
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
V
L
 
L
I
 
F
E
 
E
N
 
Y
A
 
S
P
 
P
W
 
F
G
 
G
V
 
V
V
 
I
A
 
G
S
 
S
V
 
V
T
 
A
P
 
P
S
 
S
T
 
T
N
 
N
P
 
P
A
 
T
A
 
E
T
 
T
V
 
I
I
 
I
N
 
N
N
 
N
A
 
S
I
 
I
S
 
S
L
 
M
I
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
N
S
 
S
V
 
I
V
 
Y
F
 
F
A
 
S
P
 
P
H
 
H
P
 
P
A
 
G
A
 
A
K
 
K
K
 
K
V
 
V
S
 
S
Q
 
L
R
 
K
A
 
L
I
 
I
M
 
S
L
 
L
L
 
I
N
 
E
Q
 
E
A
 
I
V
 
A
I
 
F
A
 
R
A
 
C
G
 
C
G
 
G
P
 
I
A
 
R
N
 
N
L
 
L
L
 
V
V
 
V
T
 
T
V
 
V
A
 
A
N
 
E
P
 
P
D
 
T
I
 
F
E
 
E
T
 
A
A
 
T
Q
 
Q
R
 
Q
L
 
M
F
 
M
K
 
A
Y
 
H
P
 
P
G
 
R
I
 
I
G
 
A
L
 
V
L
 
L
V
 
A
V
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
G
E
 
P
A
 
G
V
 
I
V
 
V
E
 
A
S
 
M
A
 
G
R
 
M
K
 
K
H
 
-
T
 
S
N
 
G
K
 
K
R
 
K
L
 
V
I
 
I
A
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
N
 
N
P
 
P
P
 
P
V
 
C
V
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
T
 
T
A
 
A
D
 
D
L
 
L
A
 
V
R
 
K
A
 
A
A
 
A
Q
 
E
S
 
D
I
 
I
V
 
I
K
 
N
G
 
G
A
 
A
S
 
S
F
 
F
D
 
D
N
 
Y
N
 
N
I
 
L
I
 
P
C
 
C
A
 
I
D
 
A
E
 
E
K
 
K
V
 
S
L
 
L
I
 
I
V
 
V
V
 
V
D
 
E
S
 
S
V
 
V
A
 
A
D
 
E
E
 
R
L
 
L
M
 
V
R
 
Q
L
 
Q
M
 
M
E
 
Q
G
 
T
Q
 
F
Q
 
G
A
 
A
V
 
L
K
 
L
L
 
L
T
 
S
A
 
P
A
 
A
Q
 
D
A
 
T
E
 
D
Q
 
K
L
 
L
Q
 
R
P
 
A
V
 
V
L
 
C
L
 
L
K
 
P
N
 
-
I
 
-
D
 
-
E
 
-
R
 
-
G
 
-
K
 
E
G
 
G
T
 
Q
V
 
A
S
 
N
R
 
K
D
 
K
W
 
L
V
 
V
G
 
G
R
 
K
D
 
S
A
 
P
G
 
S
K
 
A
I
 
M
A
 
L
A
 
E
A
 
A
I
 
A
G
 
G
L
 
I
N
 
A
V
 
V
P
 
P
P
 
A
Q
 
K
T
 
A
-
 
P
R
 
R
L
 
L
L
 
L
F
 
I
V
 
A
E
 
L
T
 
V
P
 
N
A
 
A
S
 
D
H
 
D
P
 
P
F
 
W
A
 
V
V
 
T
T
 
S
E
 
E
L
 
Q
M
 
L
M
 
M
P
 
P
V
 
M
L
 
L
P
 
P
V
 
V
V
 
V
R
 
K
V
 
V
A
 
S
N
 
D
V
 
F
D
 
D
E
 
S
A
 
A
I
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
L
Q
 
K
L
 
V
E
 
E
G
 
E
G
 
G
C
 
L
H
 
H
H
 
H
T
 
T
A
 
A
A
 
I
M
 
M
H
 
H
S
 
S
R
 
Q
N
 
N
I
 
V
D
 
S
N
 
R
M
 
L
N
 
N
Q
 
L
M
 
A
A
 
A
N
 
R
A
 
T
I
 
L
D
 
Q
T
 
T
S
 
S
I
 
I
F
 
F
V
 
V
K
 
K
N
 
N
G
 
G
P
 
P
C
 
S
I
 
Y
A
 
A
G
 
G
L
 
I
G
 
G
L
 
V
G
 
G
G
 
G
E
 
E
G
 
G
W
 
F
T
 
T
T
 
T
M
 
F
T
 
T
I
 
I
T
 
A
T
 
T
P
 
P
T
 
T
G
 
G
E
 
E
G
 
G
V
 
T
T
 
T
S
 
S
A
 
A
R
 
R
T
 
T
F
 
F
V
 
A
R
 
R
L
 
S
R
 
R
R
 
R
C
 
C
V
 
V
L
 
L
V
 
T
D
 
N
A
 
G
F
 
F
R
 
S
I
 
I

4c3sA Structure of a propionaldehyde dehydrogenase from the clostridium phytofermentans fucose utilisation bacterial microcompartment (see paper)
44% identity, 94% coverage: 29:466/467 of query aligns to 1:434/435 of 4c3sA

query
sites
4c3sA
E
 
E
M
 
L
G
 
G
V
 
V
F
 
F
A
 
D
S
 
D
L
 
M
D
 
N
D
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
E
A
 
A
A
 
A
K
 
K
V
 
E
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
L
G
 
V
L
 
V
K
 
K
S
 
K
V
 
M
A
 
S
M
 
M
-
 
D
-
 
Q
R
 
R
Q
 
E
L
 
K
A
 
I
I
 
I
H
 
S
A
 
A
I
 
I
R
 
R
E
 
K
A
 
K
G
 
T
E
 
I
K
 
E
Y
 
H
A
 
A
R
 
E
E
 
T
L
 
L
A
 
A
E
 
R
L
 
M
A
 
A
V
 
V
S
 
E
E
 
E
T
 
T
G
 
G
M
 
M
G
 
G
R
 
N
V
 
V
E
 
G
D
 
H
K
 
K
F
 
I
A
 
L
K
 
K
N
 
H
V
 
Q
A
 
L
Q
 
V
A
 
A
R
 
E
G
 
K
T
 
T
P
 
P
G
 
G
V
 
T
E
 
E
C
 
D
L
 
I
S
 
T
P
 
T
Q
 
T
V
 
A
L
 
W
T
 
S
G
 
G
D
 
D
N
 
R
G
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
L
I
 
V
E
 
E
N
 
M
A
 
G
P
 
P
W
 
F
G
 
G
V
 
V
V
 
I
A
 
G
S
 
A
V
x
I
T
|
T
P
|
P
S
x
C
T
|
T
N
 
N
P
 
P
A
 
S
A
 
E
T
 
T
V
 
I
I
 
I
N
 
C
N
 
N
A
 
T
I
 
I
S
 
G
L
 
M
I
 
L
A
 
A
A
 
G
G
 
G
N
 
N
S
 
T
V
 
V
V
 
V
F
 
F
A
 
N
P
 
P
H
|
H
P
 
P
A
 
A
A
 
A
K
 
I
K
 
K
V
 
T
S
 
S
Q
 
N
R
 
F
A
 
A
I
 
V
M
 
Q
L
 
L
L
 
I
N
 
N
Q
 
E
A
 
A
V
 
S
I
 
L
A
 
S
A
 
A
G
 
G
G
 
G
P
 
P
A
 
V
N
 
N
L
 
I
L
 
A
V
 
C
T
 
S
V
 
V
A
 
R
N
 
K
P
 
P
D
 
T
I
x
L
E
 
D
T
 
S
A
 
S
Q
 
K
R
 
I
L
 
M
F
 
M
K
 
S
Y
 
H
P
 
Q
G
 
D
I
 
I
G
 
P
L
 
L
L
 
I
V
 
A
V
 
A
T
|
T
G
|
G
G
|
G
E
 
P
A
 
G
V
|
V
V
 
V
E
 
-
S
 
T
A
 
A
R
 
V
K
 
L
H
 
Q
T
 
S
N
 
G
K
 
K
R
 
R
L
 
G
I
 
I
A
 
G
A
|
A
G
|
G
A
 
A
G
 
G
N
 
N
P
 
P
P
 
P
V
 
V
V
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
E
T
 
T
A
 
A
D
 
D
L
 
I
A
 
R
R
 
K
A
 
A
A
 
A
Q
 
E
S
 
D
I
 
I
V
 
I
K
 
N
G
 
G
A
 
C
S
 
T
F
 
F
D
 
D
N
 
N
N
 
N
I
 
L
I
 
P
C
|
C
A
 
I
D
 
A
E
 
E
K
 
K
V
 
E
L
 
V
I
 
V
V
 
A
V
 
I
D
 
D
S
 
A
V
 
I
A
 
A
D
 
N
E
 
E
L
 
L
M
 
M
R
 
N
L
 
Y
M
 
M
E
 
V
G
 
K
Q
 
E
Q
 
Q
A
 
G
V
 
C
K
 
Y
-
 
A
L
 
I
T
 
T
A
 
K
A
 
E
Q
 
Q
A
 
Q
E
 
E
Q
 
K
L
 
L
Q
 
T
P
 
N
V
 
L
L
 
V
L
 
-
K
 
-
N
 
-
I
 
I
D
 
T
E
 
P
R
 
K
G
 
G
K
 
-
G
 
-
T
 
-
V
 
L
S
 
N
R
 
R
D
 
N
W
 
C
V
 
V
G
 
G
R
 
K
D
 
D
A
 
A
G
 
R
K
 
T
I
 
L
A
 
L
A
 
G
A
 
M
I
 
I
G
 
G
L
 
I
N
 
D
V
 
V
P
 
P
P
 
S
Q
 
N
T
 
I
R
 
R
L
 
C
L
 
I
F
 
I
V
 
F
E
 
E
T
 
G
P
 
E
A
 
K
S
 
E
H
 
H
P
 
P
F
 
L
A
 
I
V
 
S
T
 
E
E
|
E
L
 
L
M
|
M
M
 
M
P
 
P
V
 
I
L
 
L
P
 
G
V
 
I
V
 
V
R
 
R
V
 
A
A
 
K
N
 
S
V
 
F
D
 
D
E
 
D
A
 
A
I
 
V
A
 
E
L
 
K
A
 
A
V
 
V
Q
 
W
L
 
L
E
 
E
G
 
H
G
 
G
C
 
N
H
 
R
H
|
H
T
 
S
A
 
A
A
 
H
M
 
I
H
 
H
S
 
S
R
 
K
N
 
N
I
 
V
D
 
D
N
 
R
M
 
I
N
 
T
Q
 
T
M
 
Y
A
 
A
N
 
K
A
 
A
I
 
I
D
 
D
T
 
T
S
 
A
I
 
I
F
 
L
V
 
V
K
 
K
N
 
N
G
 
A
P
 
P
C
 
S
I
 
Y
A
 
A
G
 
A
L
 
I
G
 
G
L
 
F
G
 
G
G
 
G
E
 
E
G
 
G
W
 
F
T
 
C
T
 
T
M
 
F
T
|
T
I
|
I
T
 
A
T
 
S
P
 
R
T
 
T
G
 
G
E
 
E
G
 
G
V
 
L
T
 
T
S
 
S
A
 
A
R
 
S
T
 
T
F
 
F
V
 
T
R
 
K
L
 
R
R
 
R
R
 
R
C
 
C
V
 
V
L
 
M
V
 
S
D
 
D
A
 
S
F
 
L
R
 
C
I
 
I

5jfmA Crystal structure of rhodopseudomonas palustris propionaldehyde dehydrogenase with bound propionyl-coa (see paper)
46% identity, 93% coverage: 31:466/467 of query aligns to 4:438/439 of 5jfmA

query
sites
5jfmA
G
 
G
V
 
V
F
 
F
A
 
E
S
 
T
L
 
M
D
 
D
D
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
A
K
 
A
V
 
L
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
Q
G
 
Q
L
 
Y
K
 
L
S
 
L
V
 
C
A
 
S
M
 
M
-
 
S
-
 
D
R
 
R
Q
 
A
L
 
R
A
 
F
I
 
V
H
 
Q
A
 
G
I
 
I
R
 
R
E
 
D
A
 
V
-
 
I
-
 
L
G
 
N
E
 
Q
K
 
D
Y
 
T
A
 
L
R
 
E
E
 
K
L
 
M
A
 
S
E
 
R
L
 
M
A
 
A
V
 
V
S
 
E
E
 
E
T
 
T
G
 
G
M
 
M
G
 
G
R
 
N
V
 
Y
E
 
E
D
 
H
K
 
K
F
 
L
A
 
I
K
 
K
N
 
N
V
 
R
A
 
L
Q
 
A
A
 
G
R
 
E
G
 
K
T
 
T
P
 
P
G
 
G
V
 
I
E
 
E
C
 
D
L
 
L
S
 
T
P
 
T
Q
 
D
V
 
A
L
 
F
T
 
S
G
 
G
D
 
D
N
 
N
G
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
L
I
 
V
E
 
E
N
 
Y
A
 
S
P
 
P
W
 
F
G
 
G
V
 
V
V
 
I
A
 
G
S
 
A
V
x
I
T
|
T
P
 
P
S
 
T
T
|
T
N
|
N
P
 
P
A
 
T
A
 
E
T
 
T
V
 
I
I
 
V
N
 
C
N
 
N
A
 
S
I
 
I
S
 
G
L
 
M
I
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
N
S
 
S
V
 
V
V
 
V
F
 
F
A
x
S
P
|
P
H
|
H
P
 
P
A
 
R
A
 
A
K
 
R
K
 
Q
V
 
V
S
 
S
Q
 
L
R
 
L
A
 
L
I
 
V
M
 
R
L
 
L
L
 
I
N
 
N
Q
 
Q
A
 
K
V
 
L
I
 
A
A
 
A
A
 
L
G
 
G
G
 
A
P
 
P
A
 
E
N
 
N
L
 
L
L
 
V
V
 
V
T
 
T
V
 
V
A
 
E
N
 
K
P
 
P
D
 
S
I
|
I
E
 
E
T
 
N
A
 
T
Q
 
N
R
 
A
L
 
M
F
 
M
K
 
A
Y
 
H
P
 
P
G
 
K
I
 
V
G
 
R
L
 
M
L
 
L
V
 
V
V
 
A
T
|
T
G
|
G
G
|
G
E
 
P
A
 
A
V
 
I
V
 
V
E
 
K
S
 
A
A
 
V
R
 
L
K
 
S
H
 
-
T
 
T
N
 
G
K
 
K
R
 
K
L
 
A
I
 
I
A
 
G
A
|
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
N
 
N
P
 
P
P
 
P
V
 
V
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
E
T
 
T
A
 
A
D
 
N
L
 
I
A
 
E
R
 
K
A
 
A
A
 
A
Q
 
C
S
 
D
I
 
I
V
 
V
K
 
N
G
 
G
A
 
C
S
 
S
F
 
F
D
 
D
N
 
N
N
 
N
I
 
L
I
x
P
C
|
C
A
 
V
D
 
A
E
 
E
K
 
K
V
 
E
L
 
I
I
 
I
V
 
A
V
 
V
D
 
A
S
 
Q
V
 
I
A
 
A
D
 
D
E
 
Y
L
 
L
M
 
I
R
 
F
L
 
N
M
 
L
E
 
K
G
 
K
Q
 
N
Q
 
G
A
 
A
V
 
Y
K
 
E
L
 
I
T
 
K
-
 
D
A
 
P
A
 
A
Q
 
V
A
 
L
E
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
Q
P
 
D
V
 
L
L
 
V
L
 
L
K
 
T
N
 
-
I
 
-
D
 
-
E
 
-
R
 
-
G
 
A
K
 
K
G
 
G
T
 
G
V
 
P
S
 
Q
R
 
T
D
 
K
W
 
C
V
 
V
G
 
G
R
 
K
D
 
S
A
 
A
G
 
V
K
 
W
I
 
L
A
 
L
A
 
S
A
 
Q
I
 
I
G
 
G
L
 
I
N
 
S
V
 
V
P
 
D
P
 
A
Q
 
S
T
 
I
R
 
K
L
 
I
L
 
I
F
 
L
V
 
M
E
 
E
T
 
V
P
 
P
A
 
R
S
 
E
H
 
H
P
 
P
F
 
F
A
 
V
V
 
Q
T
 
E
E
 
E
L
 
L
M
 
M
M
 
M
P
 
P
V
 
I
L
 
L
P
 
P
V
 
L
V
 
V
R
 
R
V
 
V
A
 
E
N
 
T
V
 
V
D
 
D
E
 
D
A
 
A
I
 
I
A
 
D
L
 
L
A
 
A
V
 
I
Q
 
E
L
 
V
E
 
E
G
 
H
G
 
D
C
 
N
H
 
R
H
 
H
T
 
T
A
 
A
A
 
I
M
 
M
H
 
H
S
 
S
R
 
T
N
 
D
I
 
V
D
 
R
N
 
K
M
 
L
N
 
T
Q
 
K
M
 
M
A
 
A
N
 
K
A
 
L
I
 
I
D
 
Q
T
 
T
S
 
T
I
 
I
F
 
F
V
 
V
K
 
K
N
 
N
G
 
G
P
 
P
C
 
S
I
 
Y
A
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
A
G
 
G
G
 
G
E
 
E
G
 
G
W
 
Y
T
 
S
T
 
T
M
 
F
T
 
T
I
 
I
T
 
A
T
 
G
P
 
P
T
 
T
G
 
G
E
 
E
G
 
G
V
 
L
T
 
T
S
 
S
A
 
A
R
 
K
T
 
S
F
 
F
V
 
A
R
 
R
L
 
R
R
 
R
R
 
K
C
 
C
V
 
V
L
 
M
V
 
V
D
 
E
A
 
A
F
 
L
R
 
N
I
 
I

5jfmB Crystal structure of rhodopseudomonas palustris propionaldehyde dehydrogenase with bound propionyl-coa (see paper)
46% identity, 93% coverage: 31:466/467 of query aligns to 17:451/452 of 5jfmB

query
sites
5jfmB
G
 
G
V
 
V
F
 
F
A
 
E
S
 
T
L
 
M
D
 
D
D
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
A
K
 
A
V
 
L
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
Q
G
 
Q
L
 
Y
K
 
L
S
 
L
V
 
C
A
 
S
M
 
M
-
 
S
-
 
D
R
 
R
Q
 
A
L
 
R
A
 
F
I
 
V
H
 
Q
A
 
G
I
 
I
R
 
R
E
 
D
A
 
V
-
 
I
-
 
L
G
 
N
E
 
Q
K
 
D
Y
 
T
A
 
L
R
 
E
E
 
K
L
 
M
A
 
S
E
 
R
L
 
M
A
 
A
V
 
V
S
 
E
E
 
E
T
 
T
G
 
G
M
 
M
G
 
G
R
 
N
V
 
Y
E
 
E
D
 
H
K
 
K
F
 
L
A
 
I
K
 
K
N
 
N
V
 
R
A
 
L
Q
 
A
A
 
G
R
 
E
G
 
K
T
 
T
P
 
P
G
 
G
V
 
I
E
 
E
C
 
D
L
 
L
S
 
T
P
 
T
Q
 
D
V
 
A
L
 
F
T
 
S
G
 
G
D
 
D
N
 
N
G
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
L
I
 
V
E
 
E
N
 
Y
A
 
S
P
 
P
W
 
F
G
 
G
V
 
V
V
 
I
A
 
G
S
 
A
V
x
I
T
 
T
P
|
P
S
x
T
T
|
T
N
|
N
P
 
P
A
 
T
A
 
E
T
 
T
V
 
I
I
 
V
N
 
C
N
 
N
A
 
S
I
 
I
S
 
G
L
 
M
I
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
N
S
 
S
V
 
V
V
 
V
F
 
F
A
 
S
P
|
P
H
|
H
P
 
P
A
 
R
A
 
A
K
 
R
K
 
Q
V
 
V
S
 
S
Q
 
L
R
 
L
A
 
L
I
 
V
M
 
R
L
 
L
L
 
I
N
 
N
Q
 
Q
A
 
K
V
 
L
I
 
A
A
 
A
A
 
L
G
 
G
G
 
A
P
 
P
A
 
E
N
 
N
L
 
L
L
 
V
V
 
V
T
 
T
V
 
V
A
 
E
N
 
K
P
 
P
D
x
S
I
|
I
E
 
E
T
 
N
A
x
T
Q
 
N
R
 
A
L
 
M
F
 
M
K
 
A
Y
 
H
P
 
P
G
 
K
I
 
V
G
 
R
L
 
M
L
 
L
V
 
V
V
 
A
T
|
T
G
|
G
G
|
G
E
 
P
A
 
A
V
 
I
V
 
V
E
 
K
S
 
A
A
 
V
R
 
L
K
 
S
H
 
-
T
 
T
N
 
G
K
 
K
R
 
K
L
 
A
I
 
I
A
 
G
A
|
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
N
 
N
P
 
P
P
 
P
V
 
V
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
E
T
 
T
A
 
A
D
 
N
L
 
I
A
 
E
R
 
K
A
 
A
A
 
A
Q
 
C
S
 
D
I
 
I
V
 
V
K
 
N
G
 
G
A
 
C
S
 
S
F
 
F
D
 
D
N
 
N
N
 
N
I
 
L
I
 
P
C
|
C
A
 
V
D
 
A
E
 
E
K
 
K
V
 
E
L
 
I
I
 
I
V
 
A
V
 
V
D
 
A
S
 
Q
V
 
I
A
 
A
D
 
D
E
 
Y
L
 
L
M
 
I
R
 
F
L
 
N
M
 
L
E
 
K
G
 
K
Q
 
N
Q
 
G
A
 
A
V
 
Y
K
 
E
L
 
I
T
 
K
-
 
D
A
 
P
A
 
A
Q
 
V
A
 
L
E
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
Q
P
 
D
V
 
L
L
 
V
L
 
L
K
 
T
N
 
-
I
 
-
D
 
-
E
 
-
R
 
-
G
 
A
K
 
K
G
 
G
T
 
G
V
 
P
S
 
Q
R
x
T
D
 
K
W
 
C
V
 
V
G
 
G
R
 
K
D
 
S
A
 
A
G
 
V
K
 
W
I
 
L
A
 
L
A
 
S
A
 
Q
I
 
I
G
 
G
L
 
I
N
 
S
V
 
V
P
 
D
P
 
A
Q
 
S
T
 
I
R
 
K
L
 
I
L
 
I
F
 
L
V
 
M
E
 
E
T
 
V
P
 
P
A
 
R
S
 
E
H
 
H
P
 
P
F
 
F
A
 
V
V
 
Q
T
 
E
E
 
E
L
 
L
M
 
M
M
 
M
P
 
P
V
 
I
L
 
L
P
 
P
V
 
L
V
 
V
R
 
R
V
 
V
A
 
E
N
 
T
V
 
V
D
 
D
E
 
D
A
 
A
I
 
I
A
 
D
L
 
L
A
 
A
V
 
I
Q
 
E
L
 
V
E
 
E
G
 
H
G
 
D
C
 
N
H
 
R
H
 
H
T
 
T
A
 
A
A
 
I
M
 
M
H
 
H
S
 
S
R
 
T
N
 
D
I
 
V
D
 
R
N
 
K
M
 
L
N
 
T
Q
 
K
M
 
M
A
 
A
N
 
K
A
 
L
I
 
I
D
 
Q
T
 
T
S
 
T
I
 
I
F
 
F
V
 
V
K
 
K
N
 
N
G
 
G
P
 
P
C
 
S
I
 
Y
A
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
A
G
 
G
G
 
G
E
 
E
G
 
G
W
 
Y
T
 
S
T
 
T
M
 
F
T
 
T
I
 
I
T
 
A
T
 
G
P
 
P
T
 
T
G
 
G
E
 
E
G
 
G
V
 
L
T
 
T
S
 
S
A
 
A
R
 
K
T
 
S
F
 
F
V
 
A
R
 
R
L
 
R
R
 
R
R
 
K
C
 
C
V
 
V
L
 
M
V
 
V
D
 
E
A
 
A
F
 
L
R
 
N
I
 
I

5jflA Crystal structure of rhodopseudomonas palustris propionaldehyde dehydrogenase with bound NAD+ (see paper)
46% identity, 93% coverage: 31:466/467 of query aligns to 5:439/440 of 5jflA

query
sites
5jflA
G
 
G
V
 
V
F
 
F
A
 
E
S
 
T
L
 
M
D
 
D
D
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
A
K
 
A
V
 
L
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
Q
G
 
Q
L
 
Y
K
 
L
S
 
L
V
 
C
A
 
S
M
 
M
-
 
S
-
 
D
R
 
R
Q
 
A
L
 
R
A
 
F
I
 
V
H
 
Q
A
 
G
I
 
I
R
 
R
E
 
D
A
 
V
-
 
I
-
 
L
G
 
N
E
 
Q
K
 
D
Y
 
T
A
 
L
R
 
E
E
 
K
L
 
M
A
 
S
E
 
R
L
 
M
A
 
A
V
 
V
S
 
E
E
 
E
T
 
T
G
 
G
M
 
M
G
 
G
R
 
N
V
 
Y
E
 
E
D
 
H
K
 
K
F
 
L
A
 
I
K
 
K
N
 
N
V
 
R
A
 
L
Q
 
A
A
 
G
R
 
E
G
 
K
T
 
T
P
 
P
G
 
G
V
 
I
E
 
E
C
 
D
L
 
L
S
 
T
P
 
T
Q
 
D
V
 
A
L
 
F
T
 
S
G
 
G
D
 
D
N
 
N
G
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
L
I
 
V
E
 
E
N
 
Y
A
 
S
P
 
P
W
 
F
G
 
G
V
 
V
V
 
I
A
 
G
S
 
A
V
x
I
T
|
T
P
|
P
S
x
T
T
|
T
N
 
N
P
 
P
A
 
T
A
 
E
T
 
T
V
 
I
I
 
V
N
 
C
N
 
N
A
 
S
I
 
I
S
 
G
L
 
M
I
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
N
S
 
S
V
 
V
V
 
V
F
 
F
A
 
S
P
 
P
H
|
H
P
 
P
A
 
R
A
 
A
K
 
R
K
 
Q
V
 
V
S
 
S
Q
 
L
R
 
L
A
 
L
I
 
V
M
 
R
L
 
L
L
 
I
N
 
N
Q
 
Q
A
 
K
V
 
L
I
 
A
A
 
A
A
 
L
G
 
G
G
 
A
P
 
P
A
 
E
N
 
N
L
 
L
L
 
V
V
 
V
T
 
T
V
 
V
A
 
E
N
 
K
P
 
P
D
 
S
I
|
I
E
 
E
T
 
N
A
 
T
Q
 
N
R
 
A
L
 
M
F
 
M
K
 
A
Y
 
H
P
 
P
G
 
K
I
 
V
G
 
R
L
 
M
L
 
L
V
 
V
V
 
A
T
|
T
G
|
G
G
 
G
E
 
P
A
 
A
V
x
I
V
 
V
E
 
K
S
 
A
A
 
V
R
 
L
K
 
S
H
 
-
T
 
T
N
 
G
K
 
K
R
 
K
L
 
A
I
 
I
A
 
G
A
|
A
G
|
G
A
|
A
G
 
G
N
 
N
P
 
P
P
 
P
V
 
V
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
E
T
 
T
A
 
A
D
 
N
L
 
I
A
 
E
R
 
K
A
 
A
A
 
A
Q
 
C
S
 
D
I
 
I
V
 
V
K
 
N
G
 
G
A
 
C
S
 
S
F
 
F
D
 
D
N
 
N
N
 
N
I
 
L
I
 
P
C
|
C
A
 
V
D
 
A
E
 
E
K
 
K
V
 
E
L
 
I
I
 
I
V
 
A
V
 
V
D
 
A
S
 
Q
V
 
I
A
 
A
D
 
D
E
 
Y
L
 
L
M
 
I
R
 
F
L
 
N
M
 
L
E
 
K
G
 
K
Q
 
N
Q
 
G
A
 
A
V
 
Y
K
 
E
L
 
I
T
 
K
-
 
D
A
 
P
A
 
A
Q
 
V
A
 
L
E
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
Q
P
 
D
V
 
L
L
 
V
L
 
L
K
 
T
N
 
-
I
 
-
D
 
-
E
 
-
R
 
-
G
 
A
K
 
K
G
 
G
T
 
G
V
 
P
S
 
Q
R
 
T
D
 
K
W
 
C
V
 
V
G
 
G
R
 
K
D
 
S
A
 
A
G
 
V
K
 
W
I
 
L
A
 
L
A
 
S
A
 
Q
I
 
I
G
 
G
L
 
I
N
 
S
V
 
V
P
 
D
P
 
A
Q
 
S
T
 
I
R
 
K
L
 
I
L
 
I
F
 
L
V
 
M
E
 
E
T
 
V
P
 
P
A
 
R
S
 
E
H
 
H
P
 
P
F
 
F
A
 
V
V
 
Q
T
 
E
E
|
E
L
 
L
M
 
M
M
 
M
P
 
P
V
 
I
L
 
L
P
 
P
V
 
L
V
 
V
R
 
R
V
 
V
A
 
E
N
 
T
V
 
V
D
 
D
E
 
D
A
 
A
I
 
I
A
 
D
L
 
L
A
 
A
V
 
I
Q
 
E
L
 
V
E
 
E
G
 
H
G
 
D
C
 
N
H
 
R
H
|
H
T
 
T
A
 
A
A
 
I
M
 
M
H
 
H
S
 
S
R
 
T
N
 
D
I
 
V
D
 
R
N
 
K
M
 
L
N
 
T
Q
 
K
M
 
M
A
 
A
N
 
K
A
 
L
I
 
I
D
 
Q
T
 
T
S
 
T
I
 
I
F
 
F
V
 
V
K
 
K
N
 
N
G
 
G
P
 
P
C
 
S
I
 
Y
A
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
A
G
 
G
G
 
G
E
 
E
G
 
G
W
 
Y
T
 
S
T
 
T
M
x
F
T
|
T
I
|
I
T
 
A
T
 
G
P
 
P
T
 
T
G
 
G
E
 
E
G
 
G
V
 
L
T
 
T
S
 
S
A
 
A
R
 
K
T
 
S
F
 
F
V
 
A
R
 
R
L
 
R
R
 
R
R
 
K
C
 
C
V
 
V
L
 
M
V
 
V
D
 
E
A
 
A
F
 
L
R
 
N
I
 
I

6gvsA Engineered glycolyl-coa reductase comprising 8 mutations with bound NADP+ (see paper)
45% identity, 93% coverage: 31:466/467 of query aligns to 6:440/441 of 6gvsA

query
sites
6gvsA
G
 
G
V
 
V
F
 
F
A
 
E
S
 
T
L
 
M
D
 
D
D
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
A
K
 
A
V
 
L
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
Q
G
 
Q
L
 
Y
K
 
L
S
 
L
V
 
C
A
 
S
M
 
M
-
 
S
-
 
D
R
 
R
Q
 
A
L
 
R
A
 
F
I
 
V
H
 
Q
A
 
G
I
 
I
R
 
R
E
 
D
A
 
V
-
 
I
-
 
L
G
 
N
E
 
Q
K
 
D
Y
 
T
A
 
L
R
 
E
E
 
K
L
 
M
A
 
S
E
 
R
L
 
M
A
 
A
V
 
V
S
 
E
E
 
E
T
 
T
G
 
G
M
 
M
G
 
G
R
 
N
V
 
Y
E
 
E
D
 
H
K
 
K
F
 
L
A
 
I
K
 
K
N
 
N
V
 
R
A
 
L
Q
 
A
A
 
G
R
 
E
G
 
K
T
 
T
P
 
P
G
 
G
V
 
I
E
 
E
C
 
D
L
 
L
S
 
T
P
 
T
Q
 
D
V
 
A
L
 
F
T
 
S
G
 
G
D
 
D
N
 
N
G
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
L
I
 
V
E
 
E
N
 
Y
A
 
S
P
 
P
W
 
F
G
 
G
V
 
V
V
 
I
A
 
G
S
 
A
V
 
I
T
 
T
P
|
P
S
x
T
T
 
T
N
 
N
P
 
P
A
 
T
A
 
E
T
 
T
V
 
I
I
 
V
N
 
C
N
 
N
A
 
S
I
 
I
S
 
G
L
 
M
I
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
N
S
 
S
V
 
V
V
 
V
F
 
F
A
 
S
P
 
P
H
|
H
P
 
G
A
 
R
A
 
A
K
 
R
K
 
Q
V
 
V
S
 
S
Q
 
L
R
 
L
A
 
L
I
 
V
M
 
R
L
 
L
L
 
I
N
 
N
Q
 
Q
A
 
K
V
 
L
I
 
A
A
 
A
A
 
L
G
 
G
G
 
A
P
 
P
A
 
E
N
 
N
L
 
L
L
 
V
V
 
V
T
 
T
V
 
V
A
 
E
N
 
K
P
 
P
D
 
S
I
x
R
E
 
E
T
 
N
A
 
T
Q
 
L
R
 
A
L
 
M
F
 
M
K
 
A
Y
 
H
P
 
P
G
 
K
I
 
V
G
 
R
L
 
M
L
 
L
V
 
V
V
 
A
T
|
T
G
|
G
G
|
G
E
 
P
A
 
A
V
x
L
V
 
V
E
 
K
S
 
A
A
 
V
R
 
L
K
 
S
H
 
-
T
 
T
N
 
G
K
 
K
R
 
K
L
 
A
I
 
I
A
 
G
A
|
A
G
|
G
A
|
A
G
 
G
N
 
N
P
 
P
P
 
P
V
 
V
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
E
T
 
T
A
 
A
D
 
N
L
 
I
A
 
E
R
 
K
A
 
A
A
 
A
Q
 
C
S
 
D
I
 
I
V
 
V
K
 
N
G
 
G
A
 
C
S
 
S
F
 
F
D
 
D
N
 
N
N
 
N
I
 
I
I
 
T
C
|
C
A
 
T
D
 
A
E
 
E
K
 
K
V
 
E
L
 
I
I
 
I
V
 
A
V
 
V
D
 
A
S
 
Q
V
 
I
A
 
A
D
 
D
E
 
Y
L
 
L
M
 
I
R
 
F
L
 
N
M
 
L
E
 
K
G
 
K
Q
 
N
Q
 
G
A
 
A
V
 
Y
K
 
E
L
 
I
T
 
K
-
 
D
A
 
P
A
 
A
Q
 
V
A
 
L
E
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
Q
P
 
D
V
 
L
L
 
V
L
 
L
K
 
T
N
 
-
I
 
-
D
 
-
E
 
-
R
 
-
G
 
A
K
 
K
G
 
G
T
 
G
V
 
P
S
 
Q
R
 
T
D
 
K
W
 
C
V
 
V
G
 
G
R
 
K
D
 
S
A
 
A
G
 
V
K
 
W
I
 
L
A
 
L
A
 
S
A
 
Q
I
 
I
G
 
G
L
 
I
N
 
S
V
 
V
P
 
D
P
 
A
Q
 
S
T
 
I
R
 
K
L
 
I
L
 
I
F
 
L
V
 
M
E
 
E
T
 
V
P
 
P
A
 
R
S
 
E
H
 
H
P
 
P
F
 
F
A
 
V
V
 
Q
T
 
E
E
|
E
L
 
L
M
 
M
M
 
M
P
 
P
V
 
I
L
 
L
P
 
P
V
 
L
V
 
V
R
 
R
V
 
V
A
 
E
N
 
T
V
 
V
D
 
D
E
 
D
A
 
A
I
 
I
A
 
D
L
 
L
A
 
A
V
 
I
Q
 
E
L
 
V
E
 
E
G
 
H
G
 
D
C
 
N
H
 
R
H
|
H
T
 
T
A
 
A
A
 
I
M
 
M
H
 
H
S
 
S
R
 
T
N
 
D
I
 
V
D
 
R
N
 
K
M
 
L
N
 
T
Q
 
K
M
 
M
A
 
A
N
 
K
A
 
L
I
 
I
D
 
Q
T
 
T
S
 
T
I
 
I
F
 
F
V
 
V
K
 
K
N
 
N
G
 
G
P
 
P
C
 
S
I
 
Y
A
 
A
G
 
G
L
 
H
G
 
G
L
 
A
G
 
G
G
 
G
E
 
E
G
 
G
W
 
Y
T
 
S
T
 
T
M
 
F
T
 
T
I
|
I
T
 
A
T
 
G
P
 
P
T
 
T
G
 
G
E
 
E
G
 
G
V
 
L
T
 
T
S
 
S
A
 
A
R
 
K
T
 
S
F
 
F
V
 
A
R
 
R
L
 
R
R
 
R
R
 
K
C
 
C
V
 
V
L
 
M
V
 
V
D
 
E
A
 
A
F
 
L
R
 
N
I
 
I

5dbvA Structure of a c269a mutant of propionaldehyde dehydrogenase from the clostridium phytofermentans fucose utilisation bacterial microcompartment (see paper)
43% identity, 94% coverage: 30:466/467 of query aligns to 1:430/431 of 5dbvA

query
sites
5dbvA
M
 
L
G
 
G
V
 
V
F
 
F
A
 
D
S
 
D
L
 
M
D
 
N
D
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
E
A
 
A
A
 
A
K
 
K
V
 
E
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
L
G
 
V
L
 
V
K
 
K
S
 
K
V
 
M
A
 
S
M
 
M
-
 
D
-
 
Q
R
 
R
Q
 
E
L
 
K
A
 
I
I
 
I
H
 
S
A
 
A
I
 
I
R
 
R
E
 
K
A
 
K
G
 
T
E
 
I
K
 
E
Y
 
H
A
 
A
R
 
E
E
 
T
L
 
L
A
 
A
E
 
R
L
 
M
A
 
A
V
 
V
S
 
E
E
 
E
T
 
T
G
 
G
M
 
M
G
 
G
R
 
N
V
 
V
E
 
G
D
 
H
K
 
K
F
 
I
A
 
L
K
 
K
N
 
H
V
 
Q
A
 
L
Q
 
V
A
 
A
R
 
E
G
 
K
T
 
T
P
 
P
G
 
G
V
 
T
E
 
E
C
 
D
L
 
I
S
 
T
P
 
T
Q
 
T
V
 
A
L
 
W
T
 
S
G
 
G
D
 
D
N
 
R
G
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
L
I
 
V
E
 
E
N
 
M
A
 
G
P
 
P
W
 
F
G
 
G
V
 
V
V
 
I
A
 
G
S
 
A
V
x
I
T
 
T
P
 
P
S
x
C
T
|
T
N
 
N
P
 
P
A
 
S
A
 
E
T
 
T
V
 
I
I
 
I
N
 
C
N
 
N
A
 
T
I
 
I
S
 
G
L
 
M
I
 
L
A
 
A
A
 
G
G
 
G
N
 
N
S
 
T
V
 
V
V
 
V
F
 
F
A
x
N
P
|
P
H
|
H
P
 
P
A
 
A
A
 
A
K
 
I
K
 
K
V
 
T
S
 
S
Q
 
N
R
 
F
A
 
A
I
 
V
M
 
Q
L
 
L
L
 
I
N
 
N
Q
 
E
A
 
A
V
 
S
I
 
L
A
 
S
A
 
A
G
 
G
G
 
G
P
 
P
A
 
V
N
 
N
L
 
I
L
 
A
V
 
C
T
 
S
V
 
V
A
 
R
N
 
K
P
 
P
D
 
T
I
 
L
E
 
D
T
 
S
A
 
S
Q
 
K
R
 
I
L
 
M
F
 
M
K
 
S
Y
 
H
P
 
Q
G
 
D
I
 
I
G
 
P
L
 
L
L
 
I
V
 
A
V
 
A
T
 
T
G
|
G
G
|
G
E
 
P
A
 
G
V
|
V
V
 
V
E
 
-
S
 
T
A
 
A
R
 
V
K
 
L
H
 
Q
T
 
S
N
 
G
K
 
K
R
 
R
L
 
G
I
 
I
A
 
G
A
 
A
G
|
G
A
 
A
G
 
G
N
 
N
P
 
P
P
 
P
V
 
V
V
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
E
T
 
T
A
 
A
D
 
D
L
 
I
A
 
R
R
 
K
A
 
A
A
 
A
Q
 
E
S
 
D
I
 
I
V
 
I
K
 
N
G
 
G
A
 
C
S
 
T
F
 
F
D
 
D
N
 
N
N
 
N
I
 
L
I
 
P
C
x
A
A
 
I
D
 
A
E
 
E
K
|
K
V
 
E
L
 
V
I
 
V
V
 
A
V
 
I
D
 
D
S
 
A
V
 
I
A
 
A
D
 
N
E
 
E
L
 
L
M
 
M
R
 
N
L
 
Y
M
 
M
E
 
V
G
 
K
Q
 
E
Q
 
Q
A
 
G
V
 
C
K
 
Y
-
 
A
L
 
I
T
 
T
A
 
K
A
 
E
Q
 
Q
A
 
Q
E
 
E
Q
 
K
L
 
L
Q
 
T
P
 
N
V
 
L
L
 
V
L
 
-
K
 
-
N
 
-
I
 
I
D
 
T
E
 
P
R
 
K
G
 
G
K
 
-
G
 
-
T
 
-
V
 
L
S
 
N
R
|
R
D
 
N
W
 
C
V
 
V
G
 
G
R
 
K
D
 
D
A
 
A
G
 
R
K
 
T
I
 
L
A
 
L
A
 
G
A
 
M
I
 
I
G
 
G
L
 
I
N
 
D
V
 
-
P
 
-
P
 
-
Q
 
N
T
 
I
R
 
R
L
 
C
L
 
I
F
 
I
V
 
F
E
 
E
T
 
G
P
 
E
A
 
K
S
 
E
H
 
H
P
 
P
F
 
L
A
 
I
V
 
S
T
 
E
E
|
E
L
 
L
M
|
M
M
 
M
P
 
P
V
 
I
L
 
L
P
 
G
V
 
I
V
 
V
R
 
R
V
 
A
A
 
K
N
 
S
V
 
F
D
 
D
E
 
D
A
 
A
I
 
V
A
 
E
L
 
K
A
 
A
V
 
V
Q
 
W
L
 
L
E
 
E
G
 
H
G
 
G
C
 
N
H
 
R
H
 
H
T
 
S
A
 
A
A
 
H
M
 
I
H
 
H
S
 
S
R
 
K
N
 
N
I
 
V
D
 
D
N
 
R
M
 
I
N
 
T
Q
 
T
M
 
Y
A
 
A
N
 
K
A
 
A
I
 
I
D
 
D
T
 
T
S
 
A
I
 
I
F
 
L
V
 
V
K
 
K
N
 
N
G
 
A
P
 
P
C
 
S
I
 
Y
A
 
A
G
 
A
L
 
I
G
 
G
L
 
F
G
 
G
G
 
G
E
 
E
G
 
G
W
 
F
T
 
C
T
 
T
M
 
F
T
 
T
I
 
I
T
 
A
T
 
S
P
 
R
T
 
T
G
 
G
E
 
E
G
 
G
V
 
L
T
 
T
S
 
S
A
 
A
R
 
S
T
 
T
F
 
F
V
 
T
R
 
K
L
 
R
R
 
R
R
 
R
C
 
C
V
 
V
L
 
M
V
 
S
D
 
D
A
 
S
F
 
L
R
 
C
I
 
I

P0A9Q7 Bifunctional aldehyde-alcohol dehydrogenase AdhE; Alcohol dehydrogenase E; EC 1.2.1.10; EC 1.1.1.1 from Escherichia coli (strain K12) (see 8 papers)
36% identity, 72% coverage: 74:408/467 of query aligns to 49:380/891 of P0A9Q7

query
sites
P0A9Q7
L
 
L
A
 
A
E
 
K
L
 
M
A
 
A
V
 
V
S
 
A
E
 
E
T
 
S
G
 
G
M
 
M
G
 
G
R
 
I
V
 
V
E
 
E
D
 
D
K
 
K
F
 
V
A
 
I
K
 
K
N
 
N
-
 
H
-
 
F
V
 
A
A
 
S
Q
 
E
A
 
Y
R
 
I
G
 
Y
T
 
N
P
 
A
G
 
Y
V
 
K
E
 
D
C
 
E
L
 
K
S
 
T
P
 
C
Q
 
G
V
 
V
L
 
L
T
 
S
G
 
E
D
 
D
N
 
D
G
 
T
L
 
F
T
 
G
L
 
T
I
 
I
E
 
T
N
 
I
A
 
A
-
 
E
P
 
P
W
 
I
G
 
G
V
 
I
V
 
I
A
 
C
S
 
G
V
x
I
T
x
V
P
|
P
S
x
T
T
|
T
N
|
N
P
 
P
A
 
T
A
 
S
T
 
T
V
 
A
I
 
I
N
 
F
N
 
K
A
 
S
I
 
L
S
 
I
L
 
S
I
 
L
A
 
K
A
 
T
G
 
R
N
 
N
S
 
A
V
 
I
V
 
I
F
 
F
A
 
S
P
 
P
H
 
H
P
 
P
A
 
R
A
 
A
K
 
K
K
 
D
V
 
A
S
 
T
Q
 
N
R
 
K
A
 
A
I
 
A
M
 
D
L
 
I
L
 
V
N
 
L
Q
 
Q
A
 
A
V
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
A
G
 
G
G
 
A
P
 
P
A
 
K
N
 
D
L
 
L
L
 
I
V
 
G
T
 
W
V
 
I
A
 
D
N
 
Q
P
 
P
D
 
S
I
 
V
E
 
E
T
 
L
A
 
S
Q
 
N
R
 
A
L
 
L
F
 
M
K
 
H
Y
 
H
P
 
P
G
 
D
I
 
I
G
 
N
L
 
L
L
 
I
V
 
L
V
 
A
T
 
T
G
 
G
G
|
G
E
 
P
A
 
G
V
 
M
V
 
V
E
 
K
S
 
A
A
 
A
R
 
Y
K
 
S
H
 
-
T
 
S
N
 
G
K
 
K
R
 
P
L
 
A
I
 
I
A
 
G
A
 
V
G
|
G
A
 
A
G
 
G
N
 
N
P
 
T
P
 
P
V
 
V
V
 
V
V
 
I
D
 
D
E
 
E
T
 
T
A
 
A
D
 
D
L
 
I
A
 
K
R
 
R
A
 
A
A
 
V
Q
 
A
S
 
S
I
 
V
V
 
L
K
 
M
G
 
S
A
 
K
S
 
T
F
 
F
D
 
D
N
 
N
N
 
G
I
 
V
I
 
I
C
 
C
A
 
A
D
 
S
E
 
E
K
 
Q
V
 
S
L
 
V
I
 
V
V
 
V
V
 
V
D
 
D
S
 
S
V
 
V
A
 
Y
D
 
D
E
 
A
L
 
V
M
 
R
R
 
E
L
 
R
M
 
F
E
x
A
G
 
T
Q
 
H
Q
 
G
A
 
G
V
 
Y
K
 
L
L
 
L
T
 
Q
A
 
G
A
 
K
Q
 
E
A
 
L
E
 
K
Q
 
A
L
 
V
Q
 
Q
P
 
D
V
 
V
L
 
I
L
 
L
K
 
K
N
 
N
I
 
-
D
 
-
E
 
-
R
 
-
G
 
-
K
 
-
G
 
G
T
 
A
V
 
L
S
 
N
R
 
A
D
 
A
W
 
I
V
 
V
G
 
G
R
 
Q
D
 
P
A
 
A
G
 
Y
K
 
K
I
 
I
A
 
A
A
 
E
A
 
L
I
 
A
G
 
G
L
 
F
N
 
S
V
 
V
P
 
P
P
 
E
Q
 
N
T
 
T
R
 
K
L
 
I
L
 
L
F
 
I
V
 
G
E
 
E
T
 
V
P
 
T
A
 
V
-
 
V
-
 
D
-
 
E
S
 
S
H
 
E
P
 
P
F
 
F
A
 
A
V
 
-
T
 
H
E
|
E
L
 
K
M
 
L
M
 
S
P
 
P
V
 
T
L
 
L
P
 
A
V
 
M
V
 
Y
R
 
R
V
 
A
A
 
K
N
 
D
V
 
F
D
 
E
E
 
D
A
 
A
I
 
V
A
 
E
L
 
K
A
 
A
V
 
E
Q
x
K
L
 
L
-
 
V
-
 
A
E
 
M
G
 
G
G
 
G
C
 
I
H
 
G
H
 
H
T
 
T
A
 
S
A
 
C
M
 
L
H
 
Y
S
 
T
R
 
-
N
 
-
I
 
-
D
 
D
N
 
Q
M
 
D
N
 
N
Q
 
Q
M
 
P
A
 
A

Sites not aligning to the query:

P0A9Q8 Bifunctional aldehyde-alcohol dehydrogenase AdhE; Alcohol dehydrogenase E; EC 1.2.1.10; EC 1.1.1.1 from Escherichia coli O157:H7 (see paper)
36% identity, 72% coverage: 74:408/467 of query aligns to 49:380/891 of P0A9Q8

query
sites
P0A9Q8
L
 
L
A
 
A
E
 
K
L
 
M
A
 
A
V
 
V
S
 
A
E
 
E
T
 
S
G
 
G
M
 
M
G
 
G
R
 
I
V
 
V
E
 
E
D
 
D
K
 
K
F
 
V
A
 
I
K
 
K
N
 
N
-
 
H
-
 
F
V
 
A
A
 
S
Q
 
E
A
 
Y
R
 
I
G
 
Y
T
 
N
P
 
A
G
 
Y
V
 
K
E
 
D
C
 
E
L
 
K
S
 
T
P
 
C
Q
 
G
V
 
V
L
 
L
T
 
S
G
 
E
D
 
D
N
 
D
G
 
T
L
 
F
T
 
G
L
 
T
I
 
I
E
 
T
N
 
I
A
 
A
-
 
E
P
 
P
W
 
I
G
 
G
V
 
I
V
 
I
A
 
C
S
 
G
V
 
I
T
 
V
P
 
P
S
 
T
T
 
T
N
 
N
P
 
P
A
 
T
A
 
S
T
 
T
V
 
A
I
 
I
N
 
F
N
 
K
A
 
S
I
 
L
S
 
I
L
 
S
I
 
L
A
 
K
A
 
T
G
 
R
N
 
N
S
 
A
V
 
I
V
 
I
F
 
F
A
 
S
P
 
P
H
 
H
P
 
P
A
 
R
A
 
A
K
 
K
K
 
D
V
 
A
S
 
T
Q
 
N
R
 
K
A
 
A
I
 
A
M
 
D
L
 
I
L
 
V
N
 
L
Q
 
Q
A
 
A
V
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
A
G
 
G
G
 
A
P
 
P
A
 
K
N
 
D
L
 
L
L
 
I
V
 
G
T
 
W
V
 
I
A
 
D
N
 
Q
P
 
P
D
 
S
I
 
V
E
 
E
T
 
L
A
 
S
Q
 
N
R
 
A
L
 
L
F
 
M
K
 
H
Y
 
H
P
 
P
G
 
D
I
 
I
G
 
N
L
 
L
L
 
I
V
 
L
V
 
A
T
 
T
G
 
G
G
 
G
E
 
P
A
 
G
V
 
M
V
 
V
E
 
K
S
 
A
A
 
A
R
 
Y
K
 
S
H
 
-
T
 
S
N
 
G
K
 
K
R
 
P
L
 
A
I
 
I
A
 
G
A
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
G
N
 
N
P
 
T
P
 
P
V
 
V
V
 
V
V
 
I
D
 
D
E
 
E
T
 
T
A
 
A
D
 
D
L
 
I
A
 
K
R
 
R
A
 
A
A
 
V
Q
 
A
S
 
S
I
 
V
V
 
L
K
 
M
G
 
S
A
 
K
S
 
T
F
 
F
D
 
D
N
 
N
N
 
G
I
 
V
I
 
I
C
 
C
A
 
A
D
 
S
E
 
E
K
 
Q
V
 
S
L
 
V
I
 
V
V
 
V
V
 
V
D
 
D
S
 
S
V
 
V
A
 
Y
D
 
D
E
 
A
L
 
V
M
 
R
R
 
E
L
 
R
M
 
F
E
 
A
G
 
T
Q
 
H
Q
 
G
A
 
G
V
 
Y
K
 
L
L
 
L
T
 
Q
A
 
G
A
 
K
Q
 
E
A
 
L
E
 
K
Q
 
A
L
 
V
Q
 
Q
P
 
D
V
 
V
L
 
I
L
 
L
K
 
K
N
 
N
I
 
-
D
 
-
E
 
-
R
 
-
G
 
-
K
 
-
G
 
G
T
 
A
V
 
L
S
 
N
R
 
A
D
 
A
W
 
I
V
 
V
G
 
G
R
 
Q
D
 
P
A
 
A
G
 
Y
K
 
K
I
 
I
A
 
A
A
 
E
A
 
L
I
 
A
G
 
G
L
 
F
N
 
S
V
 
V
P
 
P
P
 
E
Q
 
N
T
 
T
R
 
K
L
 
I
L
 
L
F
 
I
V
 
G
E
 
E
T
 
V
P
 
T
A
 
V
-
 
V
-
 
D
-
 
E
S
 
S
H
 
E
P
 
P
F
 
F
A
 
A
V
 
-
T
 
H
E
 
E
L
 
K
M
 
L
M
 
S
P
 
P
V
 
T
L
 
L
P
 
A
V
 
M
V
 
Y
R
 
R
V
 
A
A
 
K
N
 
D
V
 
F
D
 
E
E
 
D
A
 
A
I
 
V
A
 
E
L
 
K
A
 
A
V
 
E
Q
 
K
L
 
L
-
 
V
-
 
A
E
 
M
G
 
G
G
 
G
C
 
I
H
 
G
H
 
H
T
 
T
A
 
S
A
 
C
M
 
L
H
 
Y
S
 
T
R
 
-
N
 
-
I
 
-
D
 
D
N
 
Q
M
 
D
N
 
N
Q
 
Q
M
 
P
A
 
A

Sites not aligning to the query:

7bvpA Adhe spirosome in extended conformation (see paper)
36% identity, 72% coverage: 74:408/467 of query aligns to 49:380/869 of 7bvpA

query
sites
7bvpA
L
 
L
A
 
A
E
 
K
L
 
M
A
 
A
V
 
V
S
 
A
E
 
E
T
 
S
G
 
G
M
 
M
G
 
G
R
 
I
V
 
V
E
 
E
D
 
D
K
 
K
F
 
V
A
 
I
K
 
K
N
 
N
-
 
H
-
 
F
V
 
A
A
 
S
Q
 
E
A
 
Y
R
 
I
G
 
Y
T
 
N
P
 
A
G
 
Y
V
 
K
E
 
D
C
 
E
L
 
K
S
 
T
P
 
C
Q
 
G
V
 
V
L
 
L
T
 
S
G
 
E
D
 
D
N
 
D
G
 
T
L
 
F
T
 
G
L
 
T
I
 
I
E
 
T
N
 
I
A
 
A
-
 
E
P
 
P
W
 
I
G
 
G
V
 
I
V
 
I
A
 
C
S
 
G
V
 
I
T
 
V
P
|
P
S
x
T
T
 
T
N
 
N
P
 
P
A
 
T
A
 
S
T
 
T
V
 
A
I
 
I
N
 
F
N
 
K
A
 
S
I
 
L
S
 
I
L
 
S
I
 
L
A
 
K
A
 
T
G
 
R
N
 
N
S
 
A
V
 
I
V
 
I
F
 
F
A
 
S
P
 
P
H
|
H
P
 
P
A
 
R
A
 
A
K
 
K
K
 
D
V
 
A
S
 
T
Q
 
N
R
 
K
A
 
A
I
 
A
M
 
D
L
 
I
L
 
V
N
 
L
Q
 
Q
A
 
A
V
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
A
G
 
G
G
 
A
P
 
P
A
 
K
N
 
D
L
 
L
L
 
I
V
 
G
T
 
W
V
 
I
A
 
D
N
 
Q
P
 
P
D
 
S
I
 
V
E
 
E
T
 
L
A
 
S
Q
 
N
R
 
A
L
 
L
F
 
M
K
 
H
Y
 
H
P
 
P
G
 
D
I
 
I
G
 
N
L
 
L
L
 
I
V
 
L
V
 
A
T
 
T
G
|
G
G
|
G
E
 
P
A
 
G
V
x
M
V
 
V
E
 
K
S
 
A
A
 
A
R
 
Y
K
 
S
H
 
-
T
 
S
N
 
G
K
 
K
R
 
P
L
 
A
I
 
I
A
 
G
A
x
V
G
|
G
A
|
A
G
 
G
N
 
N
P
 
T
P
 
P
V
 
V
V
 
V
V
 
I
D
 
D
E
 
E
T
 
T
A
 
A
D
 
D
L
 
I
A
 
K
R
 
R
A
 
A
A
 
V
Q
 
A
S
 
S
I
 
V
V
 
L
K
 
M
G
 
S
A
 
K
S
 
T
F
 
F
D
 
D
N
 
N
N
 
G
I
 
V
I
 
I
C
|
C
A
 
A
D
 
S
E
 
E
K
 
Q
V
 
S
L
 
V
I
 
V
V
 
V
V
 
V
D
 
D
S
 
S
V
 
V
A
 
Y
D
 
D
E
 
A
L
 
V
M
 
R
R
 
E
L
 
R
M
 
F
E
 
A
G
 
T
Q
 
H
Q
 
G
A
 
G
V
 
Y
K
 
L
L
 
L
T
 
Q
A
 
G
A
 
K
Q
 
E
A
 
L
E
 
K
Q
 
A
L
 
V
Q
 
Q
P
 
D
V
 
V
L
 
I
L
 
L
K
 
K
N
 
N
I
 
-
D
 
-
E
 
-
R
 
-
G
 
-
K
 
-
G
 
G
T
 
A
V
 
L
S
 
N
R
 
A
D
 
A
W
 
I
V
 
V
G
 
G
R
 
Q
D
 
P
A
 
A
G
 
Y
K
 
K
I
 
I
A
 
A
A
 
E
A
 
L
I
 
A
G
 
G
L
 
F
N
 
S
V
 
V
P
 
P
P
 
E
Q
 
N
T
 
T
R
 
K
L
 
I
L
 
L
F
 
I
V
 
G
E
 
E
T
 
V
P
 
T
A
 
V
-
 
V
-
 
D
-
 
E
S
 
S
H
 
E
P
 
P
F
 
F
A
 
A
V
 
-
T
 
H
E
|
E
L
 
K
M
x
L
M
 
S
P
 
P
V
 
T
L
 
L
P
 
A
V
 
M
V
 
Y
R
 
R
V
 
A
A
 
K
N
 
D
V
 
F
D
 
E
E
 
D
A
 
A
I
 
V
A
 
E
L
 
K
A
 
A
V
 
E
Q
 
K
L
 
L
-
 
V
-
 
A
E
 
M
G
 
G
G
 
G
C
 
I
H
 
G
H
|
H
T
 
T
A
 
S
A
 
C
M
 
L
H
 
Y
S
 
T
R
 
-
N
 
-
I
 
-
D
 
D
N
 
Q
M
 
D
N
 
N
Q
 
Q
M
 
P
A
 
A

Sites not aligning to the query:

6tqmA Escherichia coli adhe structure in its compact conformation (see paper)
36% identity, 72% coverage: 74:408/467 of query aligns to 49:380/869 of 6tqmA

query
sites
6tqmA
L
 
L
A
 
A
E
 
K
L
 
M
A
 
A
V
 
V
S
 
A
E
 
E
T
 
S
G
 
G
M
 
M
G
 
G
R
 
I
V
 
V
E
 
E
D
 
D
K
 
K
F
 
V
A
 
I
K
 
K
N
 
N
-
 
H
-
 
F
V
 
A
A
 
S
Q
 
E
A
 
Y
R
 
I
G
 
Y
T
 
N
P
 
A
G
 
Y
V
 
K
E
 
D
C
 
E
L
 
K
S
 
T
P
 
C
Q
 
G
V
 
V
L
 
L
T
 
S
G
 
E
D
 
D
N
 
D
G
 
T
L
 
F
T
 
G
L
 
T
I
 
I
E
 
T
N
 
I
A
 
A
-
 
E
P
 
P
W
 
I
G
 
G
V
 
I
V
 
I
A
 
C
S
 
G
V
 
I
T
 
V
P
 
P
S
 
T
T
 
T
N
 
N
P
 
P
A
 
T
A
 
S
T
 
T
V
 
A
I
 
I
N
 
F
N
 
K
A
 
S
I
 
L
S
 
I
L
 
S
I
 
L
A
 
K
A
 
T
G
 
R
N
 
N
S
 
A
V
 
I
V
 
I
F
 
F
A
 
S
P
 
P
H
 
H
P
 
P
A
 
R
A
 
A
K
 
K
K
 
D
V
 
A
S
 
T
Q
 
N
R
 
K
A
 
A
I
 
A
M
 
D
L
 
I
L
 
V
N
 
L
Q
 
Q
A
 
A
V
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
A
G
 
G
G
 
A
P
 
P
A
 
K
N
 
D
L
 
L
L
 
I
V
 
G
T
 
W
V
 
I
A
 
D
N
 
Q
P
 
P
D
 
S
I
 
V
E
 
E
T
 
L
A
 
S
Q
 
N
R
 
A
L
 
L
F
 
M
K
 
H
Y
 
H
P
 
P
G
 
D
I
 
I
G
 
N
L
 
L
L
 
I
V
 
L
V
 
A
T
 
T
G
 
G
G
 
G
E
 
P
A
 
G
V
 
M
V
 
V
E
 
K
S
 
A
A
 
A
R
 
Y
K
 
S
H
 
-
T
 
S
N
 
G
K
 
K
R
 
P
L
 
A
I
 
I
A
 
G
A
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
G
N
 
N
P
 
T
P
 
P
V
 
V
V
 
V
V
 
I
D
 
D
E
 
E
T
 
T
A
 
A
D
 
D
L
 
I
A
 
K
R
 
R
A
 
A
A
 
V
Q
 
A
S
 
S
I
 
V
V
 
L
K
 
M
G
 
S
A
 
K
S
 
T
F
 
F
D
 
D
N
 
N
N
 
G
I
 
V
I
 
I
C
 
C
A
 
A
D
 
S
E
 
E
K
 
Q
V
 
S
L
 
V
I
 
V
V
 
V
V
 
V
D
 
D
S
 
S
V
 
V
A
 
Y
D
 
D
E
 
A
L
 
V
M
 
R
R
 
E
L
 
R
M
 
F
E
 
A
G
 
T
Q
 
H
Q
 
G
A
 
G
V
 
Y
K
 
L
L
 
L
T
 
Q
A
 
G
A
 
K
Q
 
E
A
 
L
E
 
K
Q
 
A
L
 
V
Q
 
Q
P
 
D
V
 
V
L
 
I
L
 
L
K
 
K
N
 
N
I
 
-
D
 
-
E
 
-
R
 
-
G
 
-
K
 
-
G
 
G
T
 
A
V
 
L
S
 
N
R
 
A
D
 
A
W
 
I
V
 
V
G
 
G
R
 
Q
D
 
P
A
 
A
G
 
Y
K
 
K
I
 
I
A
 
A
A
 
E
A
 
L
I
 
A
G
 
G
L
 
F
N
 
S
V
 
V
P
 
P
P
 
E
Q
 
N
T
 
T
R
 
K
L
 
I
L
 
L
F
 
I
V
 
G
E
 
E
T
 
V
P
 
T
A
 
V
-
 
V
-
 
D
-
 
E
S
 
S
H
 
E
P
 
P
F
 
F
A
 
A
V
 
-
T
 
H
E
 
E
L
 
K
M
 
L
M
 
S
P
 
P
V
 
T
L
 
L
P
 
A
V
 
M
V
 
Y
R
 
R
V
 
A
A
 
K
N
 
D
V
 
F
D
 
E
E
 
D
A
 
A
I
 
V
A
 
E
L
 
K
A
 
A
V
 
E
Q
 
K
L
 
L
-
 
V
-
 
A
E
 
M
G
 
G
G
 
G
C
 
I
H
 
G
H
 
H
T
 
T
A
 
S
A
 
C
M
 
L
H
 
Y
S
 
T
R
 
-
N
 
-
I
 
-
D
 
D
N
 
Q
M
 
D
N
 
N
Q
 
Q
M
 
P
A
 
A

Sites not aligning to the query:

5j7iC Crystal structure of a geobacillus thermoglucosidasius acetylating aldehyde dehydrogenase in complex with adp (see paper)
31% identity, 84% coverage: 36:427/467 of query aligns to 18:408/455 of 5j7iC

query
sites
5j7iC
L
 
L
D
 
E
D
 
E
A
 
A
V
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
Q
K
 
K
V
 
I
A
 
L
Q
 
E
Q
 
K
G
 
-
L
 
-
K
 
-
S
 
-
V
 
-
A
 
-
M
 
M
R
 
T
Q
 
Q
L
 
S
A
 
E
I
 
I
H
 
D
A
 
K
I
 
I
R
 
V
E
 
E
A
 
S
G
 
M
E
 
A
K
 
N
Y
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
G
-
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
A
L
 
M
A
 
A
V
 
V
S
 
E
E
 
E
T
 
T
G
 
G
M
 
F
G
 
G
R
 
N
V
 
V
E
 
E
D
 
D
K
 
K
F
 
T
A
 
L
K
 
K
N
 
N
V
 
L
A
 
F
Q
 
A
A
 
A
R
 
N
G
 
D
T
 
V
P
 
Y
G
 
N
V
 
S
-
 
I
-
 
K
E
 
D
C
 
V
L
 
K
S
 
T
P
 
V
Q
 
G
V
 
I
L
 
I
T
 
R
G
 
R
D
 
D
N
 
E
G
 
E
L
 
N
T
 
R
L
 
V
I
 
W
E
 
E
N
 
I
A
 
A
-
 
Q
P
 
P
W
 
V
G
 
G
V
 
I
V
 
V
A
 
A
S
 
G
V
 
I
T
 
I
P
 
P
S
 
S
T
 
T
N
 
N
P
 
P
A
 
T
A
 
S
T
 
T
V
 
V
I
 
I
N
 
F
N
 
K
A
 
A
I
 
L
S
 
I
L
 
A
I
 
V
A
 
K
A
 
A
G
 
R
N
 
N
S
 
A
V
 
I
V
 
V
F
 
F
A
 
S
P
 
P
H
|
H
P
|
P
A
 
S
A
 
A
K
 
A
K
 
K
V
 
C
S
 
T
Q
 
A
R
 
E
A
 
A
I
 
A
M
 
R
L
 
I
L
 
M
N
 
Q
Q
 
E
A
 
A
V
 
A
I
 
E
A
 
R
A
 
A
G
 
G
G
 
A
P
 
P
A
 
K
N
 
G
L
 
L
L
 
I
V
 
S
T
 
C
V
 
I
A
 
T
N
 
Q
P
 
P
D
 
T
I
 
M
E
 
A
T
 
A
A
 
T
Q
 
N
R
 
E
L
 
L
F
 
M
K
 
K
Y
 
H
P
 
K
G
 
L
I
 
T
G
 
D
L
 
V
L
 
I
V
 
L
V
 
A
T
 
T
G
 
G
G
 
G
E
 
P
A
 
G
V
x
L
V
 
V
E
 
K
S
 
A
A
 
A
R
 
Y
K
 
-
H
 
S
T
 
S
N
 
G
K
 
K
R
 
P
L
 
A
I
 
Y
A
 
G
A
 
V
G
 
G
A
 
P
G
 
G
N
 
N
P
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
Y
V
 
I
D
 
H
E
 
E
T
 
S
A
 
A
D
 
N
L
 
I
A
 
A
R
 
K
A
 
A
A
 
V
Q
 
Q
S
 
L
I
 
I
V
 
I
K
 
Q
G
 
S
A
 
K
S
 
T
F
 
F
D
 
D
N
 
Y
N
 
G
I
 
T
I
 
I
C
 
C
A
 
A
D
 
S
E
 
E
K
 
Q
V
 
A
L
 
L
I
 
L
V
 
V
V
 
D
D
 
E
S
 
S
V
 
I
A
 
K
D
 
E
E
 
K
L
 
V
M
 
V
R
 
A
L
 
E
M
 
L
E
 
K
G
 
Q
Q
 
Q
Q
 
G
A
 
A
V
 
Y
K
 
F
L
 
L
T
 
N
A
 
E
A
 
E
Q
 
E
A
 
K
E
 
Q
Q
 
K
L
 
V
Q
 
A
P
 
S
V
 
I
L
 
I
L
 
M
K
 
V
N
 
N
I
 
-
D
 
-
E
 
-
R
 
-
G
 
-
K
 
-
G
 
G
T
 
S
V
 
L
S
 
N
R
 
A
D
 
K
W
 
I
V
 
V
G
 
G
R
 
K
D
 
A
A
 
P
G
 
Q
K
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
E
A
 
M
I
 
A
G
 
G
L
 
I
N
 
E
V
 
I
P
 
P
P
 
S
Q
 
D
T
 
V
R
 
K
L
 
L
L
 
L
F
 
V
V
 
A
E
 
E
T
 
E
P
 
T
-
 
E
-
 
V
-
 
G
A
 
K
S
 
E
H
 
Y
P
 
P
F
 
F
A
 
S
V
 
I
T
 
-
E
 
E
L
 
K
M
 
L
M
 
S
P
 
P
V
 
I
L
 
L
P
 
A
V
 
F
V
 
Y
R
 
I
V
 
V
A
 
K
N
 
G
V
 
M
D
 
E
E
 
E
A
 
A
I
 
S
A
 
E
L
 
L
A
 
A
V
 
Q
Q
 
K
L
 
L
-
 
L
-
 
E
E
 
V
G
 
G
G
 
G
C
 
L
H
 
G
H
 
H
T
 
T
A
 
V
A
 
G
M
 
I
H
 
H
S
 
A
R
 
E
N
 
-
I
 
-
D
 
D
N
 
E
M
 
K
N
 
V
Q
 
I
M
 
E
A
 
A
N
 
Y
A
 
T
I
 
I
D
 
D
T
 
K
-
 
P
-
 
A
-
 
G
S
 
R
I
 
I
F
 
V
V
 
V
K
 
N
N
 
A
G
 
G
P
 
T
C
 
T
I
 
F
A
 
G
G
 
G
L
 
I
G
 
G

5j7iB Crystal structure of a geobacillus thermoglucosidasius acetylating aldehyde dehydrogenase in complex with adp (see paper)
31% identity, 84% coverage: 36:427/467 of query aligns to 19:409/456 of 5j7iB

query
sites
5j7iB
L
 
L
D
 
E
D
 
E
A
 
A
V
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
Q
K
 
K
V
 
I
A
 
L
Q
 
E
Q
 
K
G
 
-
L
 
-
K
 
-
S
 
-
V
 
-
A
 
-
M
 
M
R
 
T
Q
 
Q
L
 
S
A
 
E
I
 
I
H
 
D
A
 
K
I
 
I
R
 
V
E
 
E
A
 
S
G
 
M
E
 
A
K
 
N
Y
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
G
-
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
A
L
 
M
A
 
A
V
 
V
S
 
E
E
 
E
T
 
T
G
 
G
M
 
F
G
 
G
R
 
N
V
 
V
E
 
E
D
 
D
K
 
K
F
 
T
A
 
L
K
 
K
N
 
N
V
 
L
A
 
F
Q
 
A
A
 
A
R
 
N
G
 
D
T
 
V
P
 
Y
G
 
N
V
 
S
-
 
I
-
 
K
E
 
D
C
 
V
L
 
K
S
 
T
P
 
V
Q
 
G
V
 
I
L
 
I
T
 
R
G
 
R
D
 
D
N
 
E
G
 
E
L
 
N
T
 
R
L
 
V
I
 
W
E
 
E
N
 
I
A
 
A
-
 
Q
P
 
P
W
 
V
G
 
G
V
 
I
V
 
V
A
 
A
S
 
G
V
 
I
T
 
I
P
 
P
S
 
S
T
 
T
N
 
N
P
 
P
A
 
T
A
 
S
T
 
T
V
 
V
I
 
I
N
 
F
N
 
K
A
 
A
I
 
L
S
 
I
L
 
A
I
 
V
A
 
K
A
 
A
G
 
R
N
 
N
S
 
A
V
 
I
V
 
V
F
 
F
A
 
S
P
 
P
H
 
H
P
 
P
A
 
S
A
 
A
K
 
A
K
 
K
V
 
C
S
 
T
Q
 
A
R
 
E
A
 
A
I
 
A
M
 
R
L
 
I
L
 
M
N
 
Q
Q
 
E
A
 
A
V
 
A
I
 
E
A
 
R
A
 
A
G
 
G
G
 
A
P
 
P
A
 
K
N
 
G
L
 
L
L
 
I
V
 
S
T
 
C
V
 
I
A
 
T
N
 
Q
P
 
P
D
 
T
I
 
M
E
 
A
T
 
A
A
 
T
Q
 
N
R
 
E
L
 
L
F
 
M
K
 
K
Y
 
H
P
 
K
G
 
L
I
 
T
G
 
D
L
 
V
L
 
I
V
 
L
V
 
A
T
 
T
G
 
G
G
 
G
E
 
P
A
 
G
V
x
L
V
 
V
E
 
K
S
 
A
A
 
A
R
 
Y
K
 
-
H
 
S
T
 
S
N
 
G
K
 
K
R
 
P
L
 
A
I
 
Y
A
 
G
A
 
V
G
 
G
A
 
P
G
 
G
N
 
N
P
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
Y
V
 
I
D
 
H
E
 
E
T
 
S
A
 
A
D
 
N
L
 
I
A
 
A
R
 
K
A
 
A
A
 
V
Q
 
Q
S
 
L
I
 
I
V
 
I
K
 
Q
G
 
S
A
 
K
S
 
T
F
 
F
D
 
D
N
 
Y
N
 
G
I
 
T
I
 
I
C
 
C
A
 
A
D
 
S
E
 
E
K
 
Q
V
 
A
L
 
L
I
 
L
V
 
V
V
 
D
D
 
E
S
 
S
V
 
I
A
 
K
D
 
E
E
 
K
L
 
V
M
 
V
R
 
A
L
 
E
M
 
L
E
 
K
G
 
Q
Q
 
Q
Q
 
G
A
 
A
V
 
Y
K
 
F
L
 
L
T
 
N
A
 
E
A
 
E
Q
 
E
A
 
K
E
 
Q
Q
 
K
L
 
V
Q
 
A
P
 
S
V
 
I
L
 
I
L
 
M
K
 
V
N
 
N
I
 
-
D
 
-
E
 
-
R
 
-
G
 
-
K
 
-
G
 
G
T
 
S
V
 
L
S
 
N
R
x
A
D
 
K
W
 
I
V
 
V
G
 
G
R
 
K
D
 
A
A
 
P
G
 
Q
K
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
E
A
 
M
I
 
A
G
 
G
L
 
I
N
 
E
V
 
I
P
 
P
P
 
S
Q
 
D
T
 
V
R
 
K
L
 
L
L
 
L
F
 
V
V
 
A
E
 
E
T
 
E
P
 
T
-
 
E
-
 
V
-
 
G
A
 
K
S
 
E
H
 
Y
P
 
P
F
 
F
A
 
S
V
 
I
T
 
-
E
 
E
L
 
K
M
 
L
M
 
S
P
 
P
V
 
I
L
 
L
P
 
A
V
 
F
V
 
Y
R
 
I
V
 
V
A
 
K
N
 
G
V
 
M
D
 
E
E
 
E
A
 
A
I
 
S
A
 
E
L
 
L
A
 
A
V
 
Q
Q
 
K
L
 
L
-
 
L
-
 
E
E
 
V
G
 
G
G
 
G
C
 
L
H
 
G
H
 
H
T
 
T
A
 
V
A
 
G
M
 
I
H
 
H
S
 
A
R
 
E
N
 
-
I
 
-
D
 
D
N
 
E
M
 
K
N
 
V
Q
 
I
M
 
E
A
 
A
N
 
Y
A
 
T
I
 
I
D
 
D
T
 
K
-
 
P
-
 
A
-
 
G
S
 
R
I
 
I
F
 
V
V
 
V
K
 
N
N
 
A
G
 
G
P
 
T
C
 
T
I
 
F
A
 
G
G
 
G
L
 
I
G
 
G

8cekA Succinyl-coa reductase from clostridium kluyveri (sucd) with NADPH (see paper)
29% identity, 86% coverage: 35:437/467 of query aligns to 2:405/449 of 8cekA

query
sites
8cekA
S
 
S
L
 
I
D
 
K
D
 
E
A
 
L
V
 
I
A
 
E
A
 
K
A
 
A
K
 
K
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
K
G
 
K
L
 
L
K
 
E
S
 
A
V
 
Y
A
 
S
M
 
Q
R
 
E
Q
 
Q
L
 
V
A
 
D
I
 
V
-
 
L
-
 
V
-
 
K
-
 
A
-
 
L
-
 
G
H
 
K
A
 
V
I
 
V
R
 
Y
E
 
D
A
 
N
G
 
A
E
 
E
K
 
M
Y
 
F
A
 
A
R
 
K
E
 
E
L
 
-
A
 
-
E
 
-
L
 
-
A
 
A
V
 
V
S
 
E
E
 
E
T
 
T
G
 
E
M
 
M
G
 
G
R
 
V
V
 
Y
E
 
E
D
 
D
K
 
K
F
 
V
A
 
A
K
 
K
-
 
C
-
 
H
-
 
L
-
 
K
-
 
S
-
 
G
-
 
A
-
 
I
-
 
W
N
 
N
V
 
H
A
 
I
Q
 
K
A
 
D
R
 
K
G
 
K
T
 
T
P
 
V
G
 
G
V
 
I
E
 
I
C
 
K
L
 
E
S
 
E
P
 
P
Q
 
E
V
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
D
 
-
N
 
R
G
 
A
L
 
L
T
 
V
L
 
Y
I
 
V
E
 
A
N
 
K
A
 
-
P
 
P
W
 
K
G
 
G
V
 
V
V
 
V
A
 
A
S
 
A
V
 
T
T
 
T
P
|
P
S
x
I
T
 
T
N
 
N
P
 
P
A
 
V
A
 
V
T
 
T
V
 
P
I
 
M
N
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
M
S
 
A
L
 
A
I
 
I
A
 
K
A
 
G
G
 
R
N
 
N
S
 
T
V
 
I
V
 
I
F
 
V
A
 
A
P
 
P
H
|
H
P
|
P
A
 
K
A
 
A
K
 
K
K
 
K
V
 
V
S
 
S
Q
 
A
R
 
H
A
 
T
I
 
V
M
 
E
L
 
L
L
 
M
N
 
N
Q
 
A
A
 
E
V
 
L
I
 
K
A
 
K
A
 
L
G
 
G
G
 
A
P
 
P
A
 
E
N
 
N
L
 
I
L
 
I
V
 
Q
T
 
I
V
 
V
A
 
E
N
 
A
P
 
P
D
 
S
I
 
R
E
 
E
T
 
A
A
 
A
Q
 
K
R
 
E
L
 
L
F
 
M
K
 
E
Y
 
-
P
 
-
G
 
S
I
 
A
G
 
D
L
 
V
L
 
V
V
 
I
V
 
A
T
|
T
G
|
G
G
|
G
E
 
A
A
 
G
V
x
R
V
 
V
E
 
K
S
 
A
A
 
A
R
 
Y
K
 
S
H
 
-
T
 
S
N
 
G
K
 
R
R
 
P
L
 
A
I
 
Y
A
 
G
A
x
V
G
 
G
A
 
P
G
 
G
N
 
N
P
 
S
P
 
Q
V
 
V
V
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
K
T
 
G
A
 
Y
D
 
D
L
 
Y
A
 
N
R
 
K
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
S
 
D
I
 
I
V
 
I
K
 
T
G
 
G
A
 
R
S
 
K
F
 
Y
D
 
D
N
 
N
N
 
G
I
 
I
I
 
I
C
|
C
A
 
S
D
 
S
E
 
E
K
 
Q
V
 
S
L
 
V
I
 
I
V
 
A
V
 
P
D
 
A
S
 
E
V
 
D
A
 
Y
D
 
D
E
 
K
L
 
V
M
 
I
R
 
A
L
 
A
M
 
F
E
 
V
G
 
E
Q
 
N
Q
 
G
A
 
A
V
 
F
K
 
Y
L
 
V
T
 
E
A
 
D
A
 
E
Q
 
E
A
 
T
-
 
V
E
 
E
Q
 
K
L
 
F
Q
 
R
P
 
S
V
 
T
L
 
L
L
 
F
K
 
K
N
 
D
I
 
-
D
 
-
E
 
-
R
 
-
G
 
-
K
 
-
G
 
G
T
 
K
V
 
I
S
 
N
R
 
S
D
 
K
W
 
I
V
 
I
G
 
G
R
 
K
D
 
S
A
 
V
G
 
Q
K
 
I
I
 
I
A
 
A
A
 
D
A
 
L
I
 
A
G
 
G
L
 
V
N
 
K
V
 
V
P
 
P
P
 
E
Q
 
G
T
 
T
R
 
K
L
 
V
L
 
I
F
 
V
V
 
L
E
 
K
T
 
G
P
 
K
A
 
G
S
 
A
H
 
G
P
 
E
F
 
K
A
 
D
V
 
V
-
 
L
-
 
C
T
 
K
E
|
E
L
 
K
M
 
M
M
 
C
P
 
P
V
 
V
L
 
L
P
 
V
V
 
A
V
 
L
R
 
K
V
 
Y
A
 
D
N
 
T
V
 
F
D
 
E
E
 
E
A
 
A
-
 
V
-
 
E
I
 
I
A
 
A
L
 
M
A
 
A
V
 
N
Q
 
Y
L
 
M
E
 
Y
G
 
E
G
 
G
C
 
A
H
 
G
H
 
H
T
 
T
A
 
A
A
 
G
M
 
I
H
 
H
S
 
S
R
 
D
N
 
N
I
 
D
D
 
E
N
 
N
M
 
I
N
 
R
Q
 
Y
M
 
A
A
 
G
N
 
T
A
 
V
I
 
L
D
 
P
T
 
I
S
 
S
I
 
R
F
 
L
V
 
V
K
 
V
N
 
N
G
 
Q
P
 
P
C
 
A
I
 
T
A
 
T
G
 
A
L
 
G
G
 
G
L
 
S
G
 
F
G
 
N
E
 
N
G
 
G
W
 
F
T
 
N
T
 
P
M
 
T
T
 
T

Sites not aligning to the query:

8cejC Succinyl-coa reductase from clostridium kluyveri (sucd) with mesaconyl-c1-coa (see paper)
29% identity, 86% coverage: 35:437/467 of query aligns to 2:405/449 of 8cejC

query
sites
8cejC
S
 
S
L
 
I
D
 
K
D
 
E
A
 
L
V
 
I
A
 
E
A
 
K
A
 
A
K
 
K
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
K
G
 
K
L
 
L
K
 
E
S
 
A
V
 
Y
A
 
S
M
 
Q
R
 
E
Q
 
Q
L
 
V
A
 
D
I
 
V
-
 
L
-
 
V
-
 
K
-
 
A
-
 
L
-
 
G
H
 
K
A
 
V
I
 
V
R
 
Y
E
 
D
A
 
N
G
 
A
E
 
E
K
 
M
Y
 
F
A
 
A
R
 
K
E
 
E
L
 
-
A
 
-
E
 
-
L
 
-
A
 
A
V
 
V
S
 
E
E
 
E
T
 
T
G
 
E
M
 
M
G
 
G
R
 
V
V
 
Y
E
 
E
D
 
D
K
 
K
F
 
V
A
 
A
K
 
K
-
 
C
-
 
H
-
 
L
-
x
K
-
 
S
-
 
G
-
 
A
-
 
I
-
 
W
N
 
N
V
 
H
A
 
I
Q
 
K
A
 
D
R
 
K
G
 
K
T
 
T
P
 
V
G
 
G
V
 
I
E
 
I
C
 
K
L
 
E
S
 
E
P
 
P
Q
 
E
V
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
D
 
-
N
 
R
G
 
A
L
 
L
T
 
V
L
 
Y
I
 
V
E
 
A
N
 
K
A
 
-
P
 
P
W
 
K
G
 
G
V
 
V
V
 
V
A
 
A
S
 
A
V
 
T
T
 
T
P
|
P
S
 
I
T
|
T
N
|
N
P
 
P
A
 
V
A
 
V
T
 
T
V
 
P
I
 
M
N
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
M
S
 
A
L
 
A
I
 
I
A
 
K
A
 
G
G
 
R
N
 
N
S
 
T
V
 
I
V
 
I
F
 
V
A
|
A
P
|
P
H
|
H
P
|
P
A
 
K
A
 
A
K
 
K
K
 
K
V
 
V
S
 
S
Q
 
A
R
 
H
A
 
T
I
 
V
M
 
E
L
 
L
L
 
M
N
 
N
Q
 
A
A
 
E
V
 
L
I
 
K
A
 
K
A
 
L
G
 
G
G
 
A
P
 
P
A
 
E
N
 
N
L
 
I
L
 
I
V
 
Q
T
 
I
V
 
V
A
 
E
N
 
A
P
 
P
D
 
S
I
x
R
E
 
E
T
 
A
A
 
A
Q
 
K
R
 
E
L
 
L
F
 
M
K
 
E
Y
 
-
P
 
-
G
 
S
I
 
A
G
 
D
L
 
V
L
 
V
V
 
I
V
 
A
T
 
T
G
 
G
G
 
G
E
 
A
A
x
G
V
x
R
V
 
V
E
 
K
S
 
A
A
 
A
R
 
Y
K
 
S
H
 
-
T
 
S
N
 
G
K
 
R
R
 
P
L
 
A
I
 
Y
A
 
G
A
 
V
G
 
G
A
 
P
G
 
G
N
 
N
P
 
S
P
 
Q
V
 
V
V
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
K
T
 
G
A
 
Y
D
 
D
L
 
Y
A
 
N
R
 
K
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
S
 
D
I
 
I
V
 
I
K
 
T
G
 
G
A
 
R
S
 
K
F
 
Y
D
 
D
N
 
N
N
 
G
I
 
I
I
|
I
C
|
C
A
x
S
D
 
S
E
 
E
K
 
Q
V
 
S
L
 
V
I
 
I
V
 
A
V
 
P
D
 
A
S
 
E
V
 
D
A
 
Y
D
 
D
E
 
K
L
 
V
M
 
I
R
 
A
L
 
A
M
 
F
E
 
V
G
 
E
Q
 
N
Q
 
G
A
 
A
V
 
F
K
 
Y
L
 
V
T
 
E
A
 
D
A
 
E
Q
 
E
A
 
T
-
 
V
E
 
E
Q
 
K
L
 
F
Q
 
R
P
 
S
V
 
T
L
 
L
L
 
F
K
 
K
N
 
D
I
 
-
D
 
-
E
 
-
R
 
-
G
 
-
K
 
-
G
 
G
T
 
K
V
 
I
S
 
N
R
 
S
D
 
K
W
 
I
V
 
I
G
 
G
R
 
K
D
 
S
A
 
V
G
 
Q
K
 
I
I
 
I
A
 
A
A
 
D
A
 
L
I
 
A
G
 
G
L
 
V
N
 
K
V
 
V
P
 
P
P
 
E
Q
 
G
T
 
T
R
 
K
L
 
V
L
 
I
F
 
V
V
 
L
E
 
K
T
 
G
P
 
K
A
 
G
S
 
A
H
 
G
P
 
E
F
 
K
A
 
D
V
 
V
-
 
L
-
 
C
T
 
K
E
 
E
L
 
K
M
 
M
M
 
C
P
 
P
V
 
V
L
 
L
P
 
V
V
 
A
V
 
L
R
 
K
V
 
Y
A
 
D
N
 
T
V
 
F
D
 
E
E
 
E
A
 
A
-
 
V
-
 
E
I
 
I
A
 
A
L
 
M
A
 
A
V
 
N
Q
 
Y
L
 
M
E
 
Y
G
 
E
G
 
G
C
 
A
H
 
G
H
 
H
T
 
T
A
 
A
A
 
G
M
 
I
H
 
H
S
 
S
R
 
D
N
 
N
I
 
D
D
 
E
N
 
N
M
 
I
N
 
R
Q
 
Y
M
 
A
A
 
G
N
 
T
A
 
V
I
 
L
D
 
P
T
 
I
S
 
S
I
 
R
F
 
L
V
 
V
K
 
V
N
 
N
G
 
Q
P
 
P
C
 
A
I
x
T
A
 
T
G
 
A
L
x
G
G
 
G
L
 
S
G
 
F
G
 
N
E
 
N
G
 
G
W
 
F
T
 
N
T
 
P
M
 
T
T
|
T

Sites not aligning to the query:

8cejA Succinyl-coa reductase from clostridium kluyveri (sucd) with mesaconyl-c1-coa (see paper)
29% identity, 86% coverage: 35:437/467 of query aligns to 2:405/449 of 8cejA

query
sites
8cejA
S
 
S
L
 
I
D
 
K
D
 
E
A
 
L
V
 
I
A
 
E
A
 
K
A
 
A
K
 
K
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
K
G
 
K
L
 
L
K
 
E
S
 
A
V
 
Y
A
 
S
M
 
Q
R
 
E
Q
 
Q
L
 
V
A
 
D
I
 
V
-
 
L
-
 
V
-
 
K
-
 
A
-
 
L
-
 
G
H
 
K
A
 
V
I
 
V
R
 
Y
E
 
D
A
 
N
G
 
A
E
 
E
K
 
M
Y
 
F
A
 
A
R
 
K
E
 
E
L
 
-
A
 
-
E
 
-
L
 
-
A
 
A
V
 
V
S
 
E
E
 
E
T
 
T
G
 
E
M
 
M
G
 
G
R
 
V
V
 
Y
E
 
E
D
 
D
K
 
K
F
 
V
A
 
A
K
 
K
-
 
C
-
 
H
-
 
L
-
x
K
-
 
S
-
 
G
-
 
A
-
 
I
-
 
W
N
 
N
V
 
H
A
 
I
Q
 
K
A
 
D
R
 
K
G
 
K
T
 
T
P
 
V
G
 
G
V
 
I
E
 
I
C
 
K
L
 
E
S
 
E
P
 
P
Q
 
E
V
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
D
 
-
N
 
R
G
 
A
L
 
L
T
 
V
L
 
Y
I
 
V
E
 
A
N
 
K
A
 
-
P
 
P
W
 
K
G
 
G
V
 
V
V
 
V
A
 
A
S
 
A
V
 
T
T
 
T
P
 
P
S
 
I
T
 
T
N
 
N
P
 
P
A
 
V
A
 
V
T
 
T
V
 
P
I
 
M
N
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
M
S
 
A
L
 
A
I
 
I
A
 
K
A
 
G
G
 
R
N
 
N
S
 
T
V
 
I
V
 
I
F
 
V
A
 
A
P
 
P
H
 
H
P
 
P
A
 
K
A
 
A
K
 
K
K
 
K
V
 
V
S
 
S
Q
 
A
R
 
H
A
 
T
I
 
V
M
 
E
L
 
L
L
 
M
N
 
N
Q
 
A
A
 
E
V
 
L
I
 
K
A
 
K
A
 
L
G
 
G
G
 
A
P
 
P
A
 
E
N
 
N
L
 
I
L
 
I
V
 
Q
T
 
I
V
 
V
A
 
E
N
 
A
P
 
P
D
 
S
I
 
R
E
 
E
T
 
A
A
 
A
Q
 
K
R
 
E
L
 
L
F
 
M
K
 
E
Y
 
-
P
 
-
G
 
S
I
 
A
G
 
D
L
 
V
L
 
V
V
 
I
V
 
A
T
 
T
G
 
G
G
 
G
E
 
A
A
 
G
V
 
R
V
 
V
E
 
K
S
 
A
A
 
A
R
 
Y
K
 
S
H
 
-
T
 
S
N
 
G
K
 
R
R
 
P
L
 
A
I
 
Y
A
 
G
A
 
V
G
 
G
A
 
P
G
 
G
N
 
N
P
 
S
P
 
Q
V
 
V
V
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
K
T
 
G
A
 
Y
D
 
D
L
 
Y
A
 
N
R
 
K
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
S
 
D
I
 
I
V
 
I
K
 
T
G
 
G
A
 
R
S
 
K
F
 
Y
D
 
D
N
 
N
N
 
G
I
 
I
I
 
I
C
|
C
A
x
S
D
 
S
E
 
E
K
 
Q
V
 
S
L
 
V
I
 
I
V
 
A
V
 
P
D
 
A
S
 
E
V
 
D
A
 
Y
D
 
D
E
 
K
L
 
V
M
 
I
R
 
A
L
 
A
M
 
F
E
 
V
G
 
E
Q
 
N
Q
 
G
A
 
A
V
 
F
K
 
Y
L
 
V
T
 
E
A
 
D
A
 
E
Q
 
E
A
 
T
-
 
V
E
 
E
Q
 
K
L
 
F
Q
 
R
P
 
S
V
 
T
L
 
L
L
 
F
K
 
K
N
 
D
I
 
-
D
 
-
E
 
-
R
 
-
G
 
-
K
 
-
G
 
G
T
 
K
V
 
I
S
 
N
R
 
S
D
 
K
W
 
I
V
 
I
G
 
G
R
 
K
D
 
S
A
 
V
G
 
Q
K
 
I
I
 
I
A
 
A
A
 
D
A
 
L
I
 
A
G
 
G
L
 
V
N
 
K
V
 
V
P
 
P
P
 
E
Q
 
G
T
 
T
R
 
K
L
 
V
L
 
I
F
 
V
V
 
L
E
 
K
T
 
G
P
 
K
A
 
G
S
 
A
H
 
G
P
 
E
F
 
K
A
 
D
V
 
V
-
 
L
-
 
C
T
 
K
E
 
E
L
 
K
M
 
M
M
 
C
P
 
P
V
 
V
L
 
L
P
 
V
V
 
A
V
 
L
R
 
K
V
 
Y
A
 
D
N
 
T
V
 
F
D
 
E
E
 
E
A
 
A
-
 
V
-
 
E
I
 
I
A
 
A
L
 
M
A
 
A
V
 
N
Q
 
Y
L
 
M
E
 
Y
G
 
E
G
 
G
C
 
A
H
 
G
H
 
H
T
 
T
A
 
A
A
 
G
M
 
I
H
 
H
S
 
S
R
 
D
N
 
N
I
 
D
D
 
E
N
 
N
M
 
I
N
 
R
Q
 
Y
M
 
A
A
 
G
N
 
T
A
 
V
I
 
L
D
 
P
T
 
I
S
 
S
I
 
R
F
 
L
V
 
V
K
 
V
N
 
N
G
 
Q
P
 
P
C
 
A
I
 
T
A
 
T
G
 
A
L
x
G
G
 
G
L
 
S
G
 
F
G
 
N
E
 
N
G
 
G
W
 
F
T
 
N
T
 
P
M
 
T
T
|
T

Sites not aligning to the query:

7w5nA The crystal structure of the reduced form of gluconobacter oxydans wsh-004 sndh (see paper)
25% identity, 69% coverage: 114:433/467 of query aligns to 135:462/492 of 7w5nA

query
sites
7w5nA
G
 
G
D
 
E
N
 
G
G
 
L
L
 
F
T
 
G
L
 
M
I
 
V
E
 
L
N
 
R
A
 
E
P
 
P
W
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
V
A
 
G
S
 
L
V
 
I
T
 
T
P
 
P
S
x
W
T
 
N
N
 
F
P
 
P
A
 
F
A
 
M
T
 
I
V
 
L
I
 
C
N
 
E
N
 
R
A
 
A
I
 
P
S
 
F
L
 
I
I
 
L
A
 
A
A
 
S
G
 
G
N
 
C
S
 
T
V
 
L
V
 
V
F
 
V
A
x
K
P
 
P
H
 
-
P
 
-
A
 
-
A
 
-
K
x
A
K
 
E
V
 
V
S
 
T
Q
 
S
R
 
A
A
 
T
I
 
T
M
 
L
L
 
L
L
 
L
N
 
A
Q
 
E
A
 
I
V
 
L
I
 
A
A
 
D
A
 
A
G
 
G
G
 
L
P
 
P
A
 
K
N
 
G
L
 
V
L
 
F
V
 
N
T
 
V
V
 
V
A
 
T
N
 
G
P
x
T
D
x
G
I
 
R
E
 
T
T
 
V
A
x
G
Q
 
Q
R
 
A
L
 
M
F
 
T
K
 
E
Y
 
H
P
 
Q
G
 
D
I
 
I
G
 
D
L
 
M
L
 
L
V
 
S
V
x
F
T
 
T
G
|
G
-
x
S
-
 
T
-
 
G
-
x
V
G
 
G
E
 
K
A
 
S
V
 
C
V
 
I
E
 
H
S
 
A
A
 
A
R
 
A
K
 
D
H
 
S
T
 
N
N
 
L
K
 
K
R
 
K
L
 
L
I
 
G
A
 
L
A
 
E
G
 
L
A
 
G
G
 
G
N
 
K
P
 
N
P
 
P
V
 
I
V
 
V
V
 
V
D
 
F
E
 
A
T
 
D
A
 
S
D
 
N
L
 
L
A
 
E
R
 
D
A
 
A
A
 
A
Q
 
D
S
 
A
I
 
V
V
 
A
K
 
F
G
 
G
A
 
I
S
 
S
F
 
F
D
 
N
N
 
T
N
 
G
I
 
Q
I
 
C
C
 
C
A
 
V
D
 
S
E
 
S
K
 
S
V
 
R
L
 
L
I
 
I
V
 
V
V
 
E
D
 
R
S
 
S
V
 
V
A
 
A
D
 
E
E
 
K
L
 
F
M
 
E
R
 
R
L
 
L
M
 
V
E
 
V
G
 
A
Q
 
K
Q
 
M
-
 
E
-
 
K
-
 
I
-
 
R
-
 
V
-
 
G
-
 
D
-
 
P
-
 
F
-
 
D
-
 
P
A
 
E
V
 
T
K
 
Q
L
 
I
T
 
G
A
 
A
A
 
I
Q
 
T
A
 
T
E
 
E
Q
 
A
L
x
Q
Q
 
N
P
 
K
V
 
T
L
 
I
L
 
L
K
 
D
N
 
Y
I
 
I
D
 
-
E
 
A
R
 
K
G
 
G
K
 
K
G
 
A
T
 
E
V
 
G
S
 
A
R
 
K
D
 
L
W
 
L
V
 
C
G
 
G
R
 
-
D
 
-
A
 
G
G
 
G
K
 
I
I
 
V
A
 
D
A
 
F
A
 
G
I
 
K
G
 
G
L
 
Q
N
 
Y
V
 
I
P
 
Q
P
 
P
Q
 
T
T
 
-
R
 
-
L
 
-
L
 
L
F
 
F
V
 
T
E
 
D
T
 
V
P
 
K
A
 
P
S
 
S
H
 
M
P
 
G
F
 
I
A
 
A
V
 
R
T
 
D
E
|
E
L
 
I
M
x
F
M
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
L
P
 
A
V
 
S
V
 
F
R
 
H
V
 
F
A
 
D
N
 
T
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
I
A
 
A
V
 
N
Q
 
D
L
 
T
E
 
V
G
 
Y
G
 
G
C
 
L
H
 
-
H
 
-
T
 
A
A
 
A
A
 
S
M
 
V
H
 
W
S
 
S
R
 
K
N
 
D
I
 
I
D
 
D
N
 
K
M
 
A
N
 
L
Q
 
A
M
 
V
A
 
T
N
 
R
A
 
R
I
 
V
D
 
R
T
 
A
S
 
G
I
 
R
F
 
F
V
 
W
K
 
V
N
 
N
-
 
T
-
 
I
-
 
M
-
 
S
-
 
G
G
 
G
P
 
P
C
 
E
I
 
T
A
 
P
G
 
L
L
 
G
G
 
G
L
 
F
G
 
K
G
 
Q
E
 
S
G
 
G
W
 
W

2esdA Crystal structure of thioacylenzyme intermediate of an NADP dependent aldehyde dehydrogenase (see paper)
27% identity, 59% coverage: 118:391/467 of query aligns to 135:405/474 of 2esdA

query
sites
2esdA
L
 
I
T
 
A
L
 
V
I
 
V
E
 
R
N
 
R
A
 
E
P
 
P
W
 
V
G
 
G
V
 
L
V
 
V
A
 
L
S
 
A
V
 
I
T
 
S
P
 
P
S
x
F
T
x
N
N
x
Y
P
 
P
A
 
-
A
 
-
T
 
-
V
 
-
I
 
V
N
 
N
N
 
L
A
 
A
I
 
G
S
 
S
L
 
K
I
 
I
A
 
A
-
 
P
-
 
A
-
 
L
-
 
I
A
 
A
G
 
G
N
 
N
S
 
V
V
 
I
V
 
A
F
 
F
A
x
K
P
 
P
H
 
-
P
|
P
A
x
T
A
 
Q
K
 
G
K
 
S
V
 
I
S
 
S
Q
 
G
R
 
-
A
 
-
I
 
-
M
 
L
L
 
L
L
 
L
N
 
A
Q
 
E
A
 
A
V
 
F
I
 
A
A
 
E
A
 
A
G
 
G
G
 
L
P
 
P
A
 
A
N
 
G
L
 
V
L
 
F
V
 
N
T
 
T
V
 
I
A
 
T
N
 
G
P
 
R
D
x
G
I
 
S
E
 
E
T
 
I
A
x
G
Q
x
D
R
 
Y
L
 
I
F
 
V
K
 
E
Y
 
H
P
 
Q
G
 
A
I
 
V
G
 
N
L
 
F
L
 
I
V
 
N
V
x
F
T
 
T
G
 
G
G
x
S
E
 
T
A
 
G
V
x
I
V
 
G
E
 
E
S
 
R
A
 
I
R
 
G
K
 
K
H
 
M
T
 
A
N
 
G
K
 
M
R
 
R
-
 
P
L
 
I
I
 
M
A
 
L
A
|
A
G
 
L
A
 
G
G
 
G
N
 
K
P
 
D
P
 
S
V
 
A
V
 
I
V
 
V
D
 
L
E
 
E
T
 
D
A
 
A
D
 
D
L
 
L
A
 
E
R
 
L
A
 
T
A
 
A
Q
 
K
S
 
N
I
 
I
V
 
I
K
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
F
F
 
G
D
 
Y
N
 
S
N
 
G
I
 
Q
I
x
R
C
|
C
A
x
T
D
 
A
E
 
V
K
 
K
V
 
R
L
 
V
I
 
L
V
 
V
V
 
M
D
 
E
S
 
S
V
 
V
A
 
A
D
 
D
E
 
E
L
 
L
M
 
V
R
 
E
L
 
K
M
 
I
E
 
R
G
 
-
Q
 
E
Q
 
K
A
 
V
V
 
L
K
 
A
L
 
L
T
 
T
A
 
I
A
 
G
Q
 
N
A
 
P
E
 
E
-
 
D
-
 
D
-
 
A
Q
 
D
L
 
I
Q
 
T
P
 
P
V
 
L
L
 
I
-
 
D
-
 
T
-
x
K
-
x
S
-
 
A
-
 
D
-
x
Y
-
 
V
-
 
E
-
 
G
L
 
L
K
 
I
N
 
N
I
 
-
D
 
D
E
 
A
R
 
N
G
 
D
K
 
K
G
 
G
T
 
A
V
 
T
S
 
A
R
 
L
D
 
T
W
 
E
V
 
I
G
 
K
R
 
R
D
 
E
A
 
G
G
 
N
K
 
L
I
 
I
A
 
C
A
 
P
A
 
I
I
 
L
G
 
F
L
 
D
N
 
K
V
 
V
P
 
T
P
 
T
Q
 
D
T
 
M
R
 
R
L
 
L
L
 
A
F
 
W
V
 
E
E
|
E
T
 
-
P
 
-
A
 
-
S
 
-
H
 
-
P
 
P
F
 
F
A
 
G
V
 
-
T
 
-
E
 
-
L
 
-
M
 
-
M
 
-
P
 
P
V
 
V
L
 
L
P
 
P
V
 
I
V
 
I
R
 
R
V
 
V
A
 
T
N
 
S
V
 
V
D
 
E
E
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
E
L
 
I
A
 
S
V
 
N
Q
 
K
L
 
S
E
 
E
G
 
Y
G
 
G
C
 
L
H
 
Q

Sites not aligning to the query:

Q59931 NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase; Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase [NADP(+)]; Non-phosphorylating glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase; Triosephosphate dehydrogenase; EC 1.2.1.9 from Streptococcus mutans serotype c (strain ATCC 700610 / UA159) (see 3 papers)
27% identity, 59% coverage: 118:391/467 of query aligns to 136:406/475 of Q59931

query
sites
Q59931
L
 
I
T
 
A
L
 
V
I
 
V
E
 
R
N
 
R
A
 
E
P
 
P
W
 
V
G
 
G
V
 
L
V
 
V
A
 
L
S
 
A
V
 
I
T
x
S
P
 
P
S
 
F
T
 
N
N
 
Y
P
 
P
A
 
-
A
 
-
T
 
-
V
 
-
I
 
V
N
 
N
N
 
L
A
 
A
I
 
G
S
 
S
L
 
K
I
 
I
A
 
A
-
 
P
-
 
A
-
 
L
-
 
I
A
 
A
G
 
G
N
 
N
S
 
V
V
 
I
V
 
A
F
 
F
A
x
K
P
 
P
H
 
-
P
 
P
A
x
T
A
 
Q
K
 
G
K
 
S
V
 
I
S
 
S
Q
 
G
R
 
-
A
 
-
I
 
-
M
 
L
L
 
L
L
 
L
N
 
A
Q
 
E
A
 
A
V
 
F
I
 
A
A
 
E
A
 
A
G
 
G
G
 
L
P
 
P
A
 
A
N
 
G
L
 
V
L
 
F
V
 
N
T
 
T
V
 
I
A
 
T
N
 
G
P
 
R
D
 
G
I
 
S
E
 
E
T
 
I
A
 
G
Q
x
D
R
 
Y
L
 
I
F
 
V
K
 
E
Y
 
H
P
 
Q
G
 
A
I
 
V
G
 
N
L
 
F
L
 
I
V
 
N
V
 
F
T
 
T
G
|
G
G
x
S
E
x
T
A
x
G
V
x
I
V
x
G
E
|
E
S
x
R
A
x
I
R
x
G
K
|
K
H
x
M
T
x
A
N
x
G
K
x
M
R
|
R
-
x
P
L
x
I
I
x
M
A
x
L
A
x
E
G
x
L
A
 
G
G
 
G
N
 
K
P
 
D
P
 
S
V
 
A
V
 
I
V
 
V
D
 
L
E
 
E
T
 
D
A
 
A
D
 
D
L
 
L
A
 
E
R
 
L
A
 
T
A
 
A
Q
 
K
S
 
N
I
 
I
V
 
I
K
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
F
F
 
G
D
 
Y
N
 
S
N
 
G
I
 
Q
I
 
R
C
 
C
A
 
T
D
 
A
E
 
V
K
 
K
V
 
R
L
 
V
I
 
L
V
 
V
V
 
M
D
 
E
S
 
S
V
 
V
A
 
A
D
 
D
E
 
E
L
 
L
M
 
V
R
 
E
L
 
K
M
 
I
E
 
R
G
 
-
Q
 
E
Q
 
K
A
 
V
V
 
L
K
 
A
L
 
L
T
 
T
A
 
I
A
 
G
Q
 
N
A
 
P
E
 
E
-
 
D
-
 
D
-
 
A
Q
 
D
L
 
I
Q
 
T
P
 
P
V
 
L
L
 
I
L
 
-
K
 
-
N
 
-
I
 
-
D
 
-
E
 
-
R
 
-
G
 
-
K
 
-
G
 
D
T
 
T
V
 
K
S
 
S
R
 
A
D
 
D
W
 
Y
V
 
V
G
 
E
-
 
G
-
 
L
-
 
I
R
 
N
D
 
D
A
 
A
G
 
N
K
 
D
I
 
K
A
 
G
A
 
A
A
 
A
I
 
A
G
 
L
L
 
T
N
 
E
V
 
I
P
 
K
P
 
R
Q
 
E
T
 
G
R
 
N
L
 
L
-
 
I
-
 
C
-
 
P
-
 
I
L
 
L
F
 
F
V
 
D
E
 
K
T
 
V
P
 
T
A
 
T
S
 
D
H
 
M
P
 
R
F
 
L
A
 
A
V
 
W
T
 
E
E
|
E
L
 
P
M
 
F
M
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
L
P
 
P
V
 
I
V
 
I
R
 
R
V
 
V
A
 
T
N
 
S
V
 
V
D
 
E
E
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
E
L
 
I
A
 
S
V
 
N
Q
 
K
L
 
S
E
 
E
G
 
Y
G
 
G
C
 
L
H
 
Q

Sites not aligning to the query:

3rhhD Crystal structure of NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase from bacillus halodurans c-125 complexed with NADP
27% identity, 63% coverage: 107:402/467 of query aligns to 119:416/480 of 3rhhD

query
sites
3rhhD
L
 
L
S
 
N
P
 
G
Q
 
E
V
 
T
L
 
L
T
 
K
G
 
G
D
 
D
-
 
Q
-
 
F
-
 
K
-
 
G
-
 
G
-
 
S
-
 
S
N
 
K
G
 
K
L
 
I
T
 
A
L
 
L
I
 
V
E
 
E
N
 
R
A
 
E
P
 
P
W
 
L
G
 
G
V
 
V
V
 
V
A
 
L
S
 
A
V
x
I
T
 
S
P
|
P
S
x
F
T
x
N
N
 
Y
P
 
P
A
 
V
A
 
N
T
 
L
V
 
A
I
 
A
N
 
A
N
 
K
A
 
I
I
 
A
S
 
P
L
 
A
I
 
L
A
 
V
A
 
T
G
 
G
N
 
N
S
 
T
V
 
V
V
 
V
F
 
F
A
x
K
P
|
P
H
 
-
P
 
-
A
 
-
A
|
A
K
x
T
K
 
Q
V
 
G
S
 
S
Q
 
L
R
 
S
A
 
G
I
 
I
M
 
K
L
 
M
L
 
V
N
 
-
Q
 
E
A
 
A
V
 
L
I
 
A
A
 
D
A
 
A
G
 
G
G
 
A
P
 
P
A
 
E
N
 
G
L
 
I
L
 
I
V
 
Q
T
 
V
V
 
V
A
 
T
N
 
G
P
 
R
D
x
G
I
 
S
E
 
V
T
 
I
A
x
G
Q
x
D
R
 
H
L
 
L
F
 
V
K
 
E
Y
 
H
P
 
P
G
 
G
I
 
I
G
 
D
L
 
M
L
 
I
V
 
T
V
x
F
T
 
T
G
|
G
G
|
G
E
 
T
A
 
T
V
x
T
V
 
G
E
 
E
-
 
R
-
 
I
S
 
S
A
 
E
R
 
K
K
 
A
H
 
K
T
 
M
N
 
I
K
 
P
R
 
V
L
 
V
I
 
L
A
x
E
A
 
L
G
 
G
A
 
G
G
 
K
N
 
D
P
 
P
P
 
A
V
 
I
V
 
V
V
 
L
D
 
D
E
 
D
T
 
-
A
 
A
D
 
D
L
 
L
A
 
K
R
 
L
A
 
T
A
 
A
Q
 
S
S
 
Q
I
 
I
V
 
V
K
 
S
G
 
G
A
 
A
S
 
F
F
 
S
D
 
Y
N
 
S
N
 
G
I
 
Q
I
 
R
C
|
C
A
 
T
D
 
A
E
 
I
K
 
K
V
 
R
L
 
V
I
 
F
V
 
V
V
 
Q
D
 
D
S
 
S
V
 
V
A
 
A
D
 
D
E
 
Q
L
 
L
M
 
V
R
 
A
L
 
N
M
 
I
E
 
K
G
 
-
Q
 
E
Q
 
L
A
 
V
V
 
E
K
 
Q
L
 
L
T
 
T
A
 
V
A
 
G
Q
 
S
A
 
P
E
 
E
-
 
D
-
 
D
-
 
A
Q
 
D
L
 
I
Q
 
T
P
 
P
V
 
V
-
 
I
-
 
D
-
 
E
-
 
K
-
 
S
-
 
A
-
 
A
-
 
F
-
 
I
-
 
Q
-
 
G
L
 
L
L
 
I
K
 
D
N
 
D
I
 
A
D
 
L
E
 
E
R
 
N
G
 
G
K
 
A
G
 
T
T
 
L
V
 
L
S
 
S
R
 
G
D
 
N
W
 
-
V
 
-
G
 
K
R
 
R
D
 
Q
A
 
G
G
 
N
K
 
L
I
 
L
A
 
S
A
 
P
A
 
T
I
 
L
G
 
L
L
 
D
N
 
D
V
 
V
P
 
T
P
 
P
Q
 
A
T
 
M
R
 
R
L
 
V
L
 
A
F
 
W
V
 
E
E
|
E
T
 
-
P
 
-
A
 
-
S
 
-
H
 
-
P
 
P
F
 
F
A
 
G
V
 
-
T
 
-
E
 
-
L
 
-
M
 
-
M
 
-
P
 
P
V
 
V
L
 
L
P
 
P
V
 
I
V
 
I
R
 
R
V
 
V
A
 
K
N
 
D
V
 
A
D
 
N
E
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
S
L
 
L
A
 
S
V
 
N
Q
 
Q
L
 
S
E
 
D
G
 
Y
G
 
G
C
 
L
H
 
Q
H
 
-
T
 
-
A
 
A
A
 
S
M
 
I
H
 
F
S
 
T
R
 
K
N
 
D
I
 
T
D
 
D

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>BWI76_RS20790 BWI76_RS20790 aldehyde dehydrogenase
MNQQDIEQVVKAVLLKMTDSSKPDSTVHEMGVFASLDDAVAAAKVAQQGLKSVAMRQLAI
HAIREAGEKYARELAELAVSETGMGRVEDKFAKNVAQARGTPGVECLSPQVLTGDNGLTL
IENAPWGVVASVTPSTNPAATVINNAISLIAAGNSVVFAPHPAAKKVSQRAIMLLNQAVI
AAGGPANLLVTVANPDIETAQRLFKYPGIGLLVVTGGEAVVESARKHTNKRLIAAGAGNP
PVVVDETADLARAAQSIVKGASFDNNIICADEKVLIVVDSVADELMRLMEGQQAVKLTAA
QAEQLQPVLLKNIDERGKGTVSRDWVGRDAGKIAAAIGLNVPPQTRLLFVETPASHPFAV
TELMMPVLPVVRVANVDEAIALAVQLEGGCHHTAAMHSRNIDNMNQMANAIDTSIFVKNG
PCIAGLGLGGEGWTTMTITTPTGEGVTSARTFVRLRRCVLVDAFRIV

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory