SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing BWI76_RS22825 FitnessBrowser__Koxy:BWI76_RS22825 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P0AES2 Glucarate dehydratase; GDH; GlucD; D-glucarate dehydratase; EC 4.2.1.40 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
97% identity, 100% coverage: 1:446/446 of query aligns to 1:446/446 of P0AES2

query
sites
P0AES2
M
|
M
S
 
S
A
 
S
Q
 
Q
F
 
F
S
 
T
T
 
T
P
 
P
V
 
V
V
 
V
S
 
T
S
 
E
M
 
M
Q
 
Q
V
 
V
I
 
I
P
 
P
V
 
V
A
 
A
G
 
G
H
 
H
D
 
D
S
 
S
M
 
M
L
 
L
M
 
M
N
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
A
 
A
H
 
H
A
 
A
P
 
P
F
 
F
F
 
F
T
 
T
R
 
R
N
 
N
I
 
I
V
 
V
V
 
I
I
 
I
K
 
K
D
 
D
N
 
N
S
 
S
G
 
G
H
 
H
T
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
G
E
 
E
I
 
I
P
 
P
G
 
G
G
 
G
E
 
E
K
 
K
I
 
I
R
 
R
K
 
K
T
 
T
L
 
L
E
 
E
D
 
D
A
 
A
I
 
I
P
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
V
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
E
 
E
Y
 
Y
K
 
K
N
 
N
V
 
V
L
 
L
T
 
T
A
 
L
V
 
V
R
 
R
N
 
N
T
 
T
F
 
F
A
 
A
D
 
D
R
 
R
D
 
D
A
 
A
G
 
G
G
 
G
R
 
R
G
 
G
L
 
L
Q
 
Q
T
 
T
F
 
F
D
 
D
L
 
L
R
 
R
T
 
T
T
 
T
I
 
I
H
 
H
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
I
 
I
E
 
E
A
 
A
A
 
A
M
 
M
L
 
L
D
 
D
L
 
L
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
H
 
H
L
 
L
G
 
G
V
 
V
N
 
N
V
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
S
 
S
E
 
E
V
 
V
E
 
E
M
 
M
L
 
L
G
 
G
Y
|
Y
L
 
L
F
 
F
F
 
F
V
 
V
G
 
G
N
 
N
R
 
R
K
 
K
A
 
A
T
 
T
P
 
P
L
 
L
P
 
P
Y
 
Y
Q
 
Q
S
 
S
Q
 
Q
P
 
P
D
 
D
D
 
D
K
 
S
C
 
C
D
 
D
W
 
W
Y
 
Y
R
 
R
L
 
L
R
 
R
H
 
H
D
 
E
E
 
E
A
 
A
M
 
M
T
 
T
P
 
P
D
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
N
 
N
D
 
D
F
 
F
K
 
K
L
 
L
K
|
K
G
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
L
A
 
A
G
 
G
E
 
E
E
 
E
E
 
E
A
 
A
E
 
E
S
 
S
I
 
I
V
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
Q
R
 
R
F
 
F
P
 
P
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
V
 
I
T
 
T
L
 
L
D
|
D
P
 
P
N
 
N
G
 
G
A
 
A
W
 
W
S
 
S
L
 
L
N
 
N
E
 
E
A
 
A
I
 
I
K
 
K
I
 
I
G
 
G
K
 
K
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
G
 
G
S
 
S
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
D
 
D
P
 
P
C
 
C
G
 
G
A
 
A
E
|
E
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
S
 
S
G
 
G
R
 
R
E
 
E
V
 
V
M
 
M
A
 
A
E
 
E
F
 
F
R
 
R
R
 
R
A
 
A
T
 
T
G
 
G
L
 
L
P
 
P
T
 
T
A
 
A
T
 
T
N
|
N
M
 
M
I
 
I
A
 
A
T
 
T
D
 
D
W
 
W
R
 
R
Q
 
Q
M
 
M
G
 
G
H
 
H
T
 
T
L
 
L
S
 
S
L
 
L
Q
 
Q
S
 
S
V
 
V
D
 
D
I
 
I
P
 
P
L
 
L
A
 
A
D
 
D
P
 
P
H
 
H
F
 
F
W
 
W
T
 
T
M
 
M
Q
 
Q
G
 
G
S
 
S
V
 
V
R
 
R
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q
M
 
M
C
 
C
H
 
H
E
 
E
F
 
F
G
 
G
L
 
L
T
 
T
W
 
W
G
 
G
S
 
S
H
|
H
S
 
S
N
|
N
N
 
N
H
 
H
F
 
F
D
 
D
I
 
I
S
 
S
L
 
L
A
 
A
M
 
M
F
 
F
T
 
T
H
 
H
V
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
A
P
 
P
G
 
G
K
 
K
I
 
I
T
 
T
A
 
A
I
 
I
D
|
D
T
 
T
H
 
H
W
 
W
I
 
I
W
 
W
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
N
 
N
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
T
 
T
K
 
K
E
 
E
P
 
P
F
 
F
E
 
E
I
 
I
K
 
K
G
 
G
G
 
G
M
 
L
V
 
V
Q
 
Q
V
 
V
P
 
P
A
 
E
K
 
K
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
E
L
 
I
D
 
D
M
 
M
D
 
D
Q
 
Q
V
 
V
M
 
M
K
 
K
A
 
A
H
 
H
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
Q
K
 
K
H
 
H
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
R
 
R
D
 
D
D
 
D
A
 
A
M
 
M
G
 
G
M
 
M
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
I
 
I
P
 
P
N
 
G
W
 
W
T
 
T
F
 
F
D
 
D
N
 
N
K
 
K
R
 
R
P
 
P
C
 
C
M
 
M
V
 
V
R
 
R

1ecqA E. Coli glucarate dehydratase bound to 4-deoxyglucarate (see paper)
97% identity, 100% coverage: 3:446/446 of query aligns to 1:444/444 of 1ecqA

query
sites
1ecqA
A
 
S
Q
 
Q
F
 
F
S
 
T
T
 
T
P
 
P
V
 
V
V
 
V
S
 
T
S
 
E
M
 
M
Q
 
Q
V
 
V
I
 
I
P
 
P
V
 
V
A
 
A
G
 
G
H
 
H
D
 
D
S
 
S
M
 
M
L
 
L
M
 
M
N
|
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
A
 
A
H
|
H
A
 
A
P
 
P
F
 
F
F
 
F
T
 
T
R
 
R
N
 
N
I
 
I
V
 
V
V
 
I
I
 
I
K
 
K
D
 
D
N
 
N
S
 
S
G
 
G
H
 
H
T
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
G
E
 
E
I
 
I
P
 
P
G
 
G
G
 
G
E
 
E
K
 
K
I
 
I
R
 
R
K
 
K
T
 
T
L
 
L
E
 
E
D
 
D
A
 
A
I
 
I
P
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
V
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
E
 
E
Y
 
Y
K
 
K
N
 
N
V
 
V
L
 
L
T
 
T
A
 
L
V
 
V
R
 
R
N
 
N
T
 
T
F
 
F
A
 
A
D
 
D
R
 
R
D
 
D
A
 
A
G
 
G
G
 
G
R
 
R
G
 
G
L
 
L
Q
 
Q
T
|
T
F
 
F
D
 
D
L
 
L
R
 
R
T
 
T
T
 
T
I
 
I
H
 
H
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
I
 
I
E
 
E
A
 
A
A
 
A
M
 
M
L
 
L
D
 
D
L
 
L
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
H
 
H
L
 
L
G
 
G
V
 
V
N
 
N
V
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
S
 
S
E
 
E
V
 
V
E
 
E
M
 
M
L
 
L
G
 
G
Y
|
Y
L
 
L
F
|
F
F
 
F
V
 
V
G
 
G
N
 
N
R
 
R
K
 
K
A
 
A
T
 
T
P
 
P
L
 
L
P
 
P
Y
 
Y
Q
 
Q
S
 
S
Q
 
Q
P
 
P
D
 
D
D
 
D
K
 
S
C
 
C
D
 
D
W
 
W
Y
 
Y
R
 
R
L
 
L
R
 
R
H
 
H
D
 
E
E
 
E
A
 
A
M
 
M
T
 
T
P
 
P
D
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
N
 
N
D
 
D
F
 
F
K
|
K
L
 
L
K
|
K
G
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
L
A
 
A
G
 
G
E
 
E
E
 
E
E
 
E
A
 
A
E
 
E
S
 
S
I
 
I
V
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
Q
R
 
R
F
 
F
P
 
P
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
V
 
I
T
 
T
L
 
L
D
|
D
P
 
P
N
|
N
G
 
G
A
 
A
W
 
W
S
 
S
L
 
L
N
 
N
E
 
E
A
 
A
I
 
I
K
 
K
I
 
I
G
 
G
K
 
K
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
G
 
G
S
 
S
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
E
|
E
D
 
D
P
 
P
C
 
C
G
 
G
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
S
 
S
G
 
G
R
 
R
E
 
E
V
 
V
M
 
M
A
 
A
E
 
E
F
 
F
R
 
R
R
 
R
A
 
A
T
 
T
G
 
G
L
 
L
P
 
P
T
 
T
A
 
A
T
 
T
N
|
N
M
|
M
I
 
I
A
 
A
T
 
T
D
 
D
W
 
W
R
 
R
Q
 
Q
M
 
M
G
 
G
H
 
H
T
 
T
L
 
L
S
 
S
L
 
L
Q
 
Q
S
 
S
V
 
V
D
 
D
I
 
I
P
 
P
L
 
L
A
 
A
D
|
D
P
 
P
H
 
H
F
 
F
W
 
W
T
 
T
M
 
M
Q
 
Q
G
 
G
S
 
S
V
 
V
R
 
R
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q
M
 
M
C
 
C
H
 
H
E
 
E
F
 
F
G
 
G
L
 
L
T
 
T
W
 
W
G
 
G
S
 
S
H
|
H
S
|
S
N
|
N
N
 
N
H
 
H
F
 
F
D
 
D
I
 
I
S
 
S
L
 
L
A
 
A
M
 
M
F
 
F
T
 
T
H
 
H
V
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
A
P
 
P
G
 
G
K
 
K
I
 
I
T
 
T
A
 
A
I
|
I
D
 
D
T
 
T
H
|
H
W
 
W
I
 
I
W
 
W
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
N
 
N
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
T
 
T
K
 
K
E
 
E
P
 
P
F
 
F
E
 
E
I
 
I
K
 
K
G
 
G
G
 
G
M
 
L
V
 
V
Q
 
Q
V
 
V
P
 
P
A
 
E
K
 
K
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
E
L
 
I
D
 
D
M
 
M
D
 
D
Q
 
Q
V
 
V
M
 
M
K
 
K
A
 
A
H
 
H
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
Q
K
 
K
H
 
H
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
R
|
R
D
 
D
D
 
D
A
 
A
M
 
M
G
 
G
M
 
M
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
I
 
I
P
 
P
N
 
G
W
 
W
T
 
T
F
 
F
D
 
D
N
 
N
K
 
K
R
 
R
P
 
P
C
 
C
M
 
M
V
 
V
R
 
R

1ec9D E. Coli glucarate dehydratase bound to xylarohydroxamate (see paper)
97% identity, 100% coverage: 3:446/446 of query aligns to 1:444/444 of 1ec9D

query
sites
1ec9D
A
 
S
Q
 
Q
F
 
F
S
 
T
T
 
T
P
 
P
V
 
V
V
 
V
S
 
T
S
 
E
M
 
M
Q
 
Q
V
 
V
I
 
I
P
 
P
V
 
V
A
 
A
G
 
G
H
 
H
D
 
D
S
 
S
M
 
M
L
 
L
M
 
M
N
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
A
 
A
H
|
H
A
 
A
P
 
P
F
 
F
F
 
F
T
 
T
R
 
R
N
 
N
I
 
I
V
 
V
V
 
I
I
 
I
K
 
K
D
 
D
N
 
N
S
 
S
G
 
G
H
 
H
T
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
G
E
 
E
I
 
I
P
 
P
G
 
G
G
 
G
E
 
E
K
 
K
I
 
I
R
 
R
K
 
K
T
 
T
L
 
L
E
 
E
D
 
D
A
 
A
I
 
I
P
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
V
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
E
 
E
Y
 
Y
K
 
K
N
 
N
V
 
V
L
 
L
T
 
T
A
 
L
V
 
V
R
 
R
N
 
N
T
 
T
F
 
F
A
 
A
D
 
D
R
 
R
D
 
D
A
 
A
G
 
G
G
 
G
R
 
R
G
 
G
L
 
L
Q
 
Q
T
|
T
F
 
F
D
 
D
L
 
L
R
 
R
T
 
T
T
 
T
I
 
I
H
 
H
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
I
 
I
E
 
E
A
 
A
A
 
A
M
 
M
L
 
L
D
 
D
L
 
L
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
H
 
H
L
 
L
G
 
G
V
 
V
N
 
N
V
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
S
 
S
E
 
E
V
 
V
E
 
E
M
 
M
L
 
L
G
 
G
Y
|
Y
L
 
L
F
|
F
F
 
F
V
 
V
G
 
G
N
 
N
R
 
R
K
 
K
A
 
A
T
 
T
P
 
P
L
 
L
P
 
P
Y
 
Y
Q
 
Q
S
 
S
Q
 
Q
P
 
P
D
 
D
D
 
D
K
 
S
C
 
C
D
 
D
W
 
W
Y
 
Y
R
 
R
L
 
L
R
 
R
H
 
H
D
 
E
E
 
E
A
 
A
M
 
M
T
 
T
P
 
P
D
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
N
 
N
D
 
D
F
 
F
K
|
K
L
 
L
K
|
K
G
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
L
A
 
A
G
 
G
E
 
E
E
 
E
E
 
E
A
 
A
E
 
E
S
 
S
I
 
I
V
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
Q
R
 
R
F
 
F
P
 
P
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
V
 
I
T
 
T
L
 
L
D
|
D
P
 
P
N
|
N
G
 
G
A
 
A
W
 
W
S
 
S
L
 
L
N
 
N
E
 
E
A
 
A
I
 
I
K
 
K
I
 
I
G
 
G
K
 
K
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
G
 
G
S
 
S
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
E
|
E
D
 
D
P
 
P
C
 
C
G
 
G
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
S
 
S
G
 
G
R
 
R
E
 
E
V
 
V
M
 
M
A
 
A
E
 
E
F
 
F
R
 
R
R
 
R
A
 
A
T
 
T
G
 
G
L
 
L
P
 
P
T
 
T
A
 
A
T
 
T
N
|
N
M
|
M
I
 
I
A
 
A
T
 
T
D
 
D
W
 
W
R
 
R
Q
 
Q
M
 
M
G
 
G
H
 
H
T
 
T
L
 
L
S
 
S
L
 
L
Q
 
Q
S
 
S
V
 
V
D
 
D
I
 
I
P
 
P
L
 
L
A
 
A
D
|
D
P
 
P
H
 
H
F
 
F
W
 
W
T
 
T
M
 
M
Q
 
Q
G
 
G
S
 
S
V
 
V
R
 
R
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q
M
 
M
C
 
C
H
 
H
E
 
E
F
 
F
G
 
G
L
 
L
T
 
T
W
 
W
G
 
G
S
 
S
H
|
H
S
|
S
N
|
N
N
 
N
H
 
H
F
 
F
D
 
D
I
 
I
S
 
S
L
 
L
A
 
A
M
 
M
F
 
F
T
 
T
H
 
H
V
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
A
P
 
P
G
 
G
K
 
K
I
 
I
T
 
T
A
 
A
I
|
I
D
 
D
T
 
T
H
|
H
W
 
W
I
 
I
W
 
W
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
N
 
N
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
T
 
T
K
 
K
E
 
E
P
 
P
F
 
F
E
 
E
I
 
I
K
 
K
G
 
G
G
 
G
M
 
L
V
 
V
Q
 
Q
V
 
V
P
 
P
A
 
E
K
 
K
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
E
L
 
I
D
 
D
M
 
M
D
 
D
Q
 
Q
V
 
V
M
 
M
K
 
K
A
 
A
H
 
H
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
Q
K
 
K
H
 
H
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
R
|
R
D
 
D
D
 
D
A
 
A
M
 
M
G
 
G
M
 
M
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
I
 
I
P
 
P
N
 
G
W
 
W
T
 
T
F
 
F
D
 
D
N
 
N
K
 
K
R
 
R
P
 
P
C
 
C
M
 
M
V
 
V
R
 
R

1ec8A E. Coli glucarate dehydratase bound to product 2,3-dihydroxy-5-oxo- hexanedioate (see paper)
97% identity, 99% coverage: 5:446/446 of query aligns to 1:442/442 of 1ec8A

query
sites
1ec8A
F
 
F
S
 
T
T
 
T
P
 
P
V
 
V
V
 
V
S
 
T
S
 
E
M
 
M
Q
 
Q
V
 
V
I
 
I
P
 
P
V
 
V
A
 
A
G
 
G
H
 
H
D
 
D
S
 
S
M
 
M
L
 
L
M
 
M
N
|
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
A
 
A
H
|
H
A
 
A
P
 
P
F
 
F
F
 
F
T
 
T
R
 
R
N
 
N
I
 
I
V
 
V
V
 
I
I
 
I
K
 
K
D
 
D
N
 
N
S
 
S
G
 
G
H
 
H
T
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
G
E
 
E
I
 
I
P
 
P
G
 
G
G
 
G
E
 
E
K
 
K
I
 
I
R
 
R
K
 
K
T
 
T
L
 
L
E
 
E
D
 
D
A
 
A
I
 
I
P
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
V
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
E
 
E
Y
 
Y
K
 
K
N
 
N
V
 
V
L
 
L
T
 
T
A
 
L
V
 
V
R
 
R
N
 
N
T
 
T
F
 
F
A
 
A
D
 
D
R
 
R
D
 
D
A
 
A
G
 
G
G
 
G
R
 
R
G
 
G
L
 
L
Q
 
Q
T
|
T
F
 
F
D
 
D
L
 
L
R
 
R
T
 
T
T
 
T
I
 
I
H
 
H
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
I
 
I
E
 
E
A
 
A
A
 
A
M
 
M
L
 
L
D
 
D
L
 
L
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
H
 
H
L
 
L
G
 
G
V
 
V
N
 
N
V
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
S
 
S
E
 
E
V
 
V
E
 
E
M
 
M
L
 
L
G
 
G
Y
|
Y
L
 
L
F
 
F
F
 
F
V
 
V
G
 
G
N
 
N
R
 
R
K
 
K
A
 
A
T
 
T
P
 
P
L
 
L
P
 
P
Y
 
Y
Q
 
Q
S
 
S
Q
 
Q
P
 
P
D
 
D
D
 
D
K
 
S
C
 
C
D
 
D
W
 
W
Y
 
Y
R
 
R
L
 
L
R
 
R
H
 
H
D
 
E
E
 
E
A
 
A
M
 
M
T
 
T
P
 
P
D
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
N
 
N
D
 
D
F
 
F
K
|
K
L
 
L
K
|
K
G
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
L
A
 
A
G
 
G
E
 
E
E
 
E
E
 
E
A
 
A
E
 
E
S
 
S
I
 
I
V
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
Q
R
 
R
F
 
F
P
 
P
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
V
 
I
T
 
T
L
 
L
D
|
D
P
 
P
N
|
N
G
 
G
A
 
A
W
 
W
S
 
S
L
 
L
N
 
N
E
 
E
A
 
A
I
 
I
K
 
K
I
 
I
G
 
G
K
 
K
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
G
 
G
S
 
S
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
E
|
E
D
 
D
P
 
P
C
 
C
G
 
G
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
S
 
S
G
 
G
R
 
R
E
 
E
V
 
V
M
 
M
A
 
A
E
 
E
F
 
F
R
 
R
R
 
R
A
 
A
T
 
T
G
 
G
L
 
L
P
 
P
T
 
T
A
 
A
T
 
T
N
|
N
M
|
M
I
 
I
A
 
A
T
 
T
D
 
D
W
 
W
R
 
R
Q
 
Q
M
 
M
G
 
G
H
 
H
T
 
T
L
 
L
S
 
S
L
 
L
Q
 
Q
S
 
S
V
 
V
D
 
D
I
 
I
P
 
P
L
 
L
A
 
A
D
|
D
P
 
P
H
 
H
F
 
F
W
 
W
T
 
T
M
 
M
Q
 
Q
G
 
G
S
 
S
V
 
V
R
 
R
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q
M
 
M
C
 
C
H
 
H
E
 
E
F
 
F
G
 
G
L
 
L
T
 
T
W
 
W
G
 
G
S
 
S
H
|
H
S
|
S
N
|
N
N
 
N
H
 
H
F
 
F
D
 
D
I
 
I
S
 
S
L
 
L
A
 
A
M
 
M
F
 
F
T
 
T
H
 
H
V
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
A
P
 
P
G
 
G
K
 
K
I
 
I
T
 
T
A
 
A
I
|
I
D
 
D
T
 
T
H
|
H
W
 
W
I
 
I
W
 
W
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
N
 
N
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
T
 
T
K
 
K
E
 
E
P
 
P
F
 
F
E
 
E
I
 
I
K
 
K
G
 
G
G
 
G
M
 
L
V
 
V
Q
 
Q
V
 
V
P
 
P
A
 
E
K
 
K
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
E
L
 
I
D
 
D
M
 
M
D
 
D
Q
 
Q
V
 
V
M
 
M
K
 
K
A
 
A
H
 
H
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
Q
K
 
K
H
 
H
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
R
|
R
D
 
D
D
 
D
A
 
A
M
 
M
G
 
G
M
 
M
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
I
 
I
P
 
P
N
 
G
W
 
W
T
 
T
F
 
F
D
 
D
N
 
N
K
 
K
R
 
R
P
 
P
C
 
C
M
 
M
V
 
V
R
 
R

1jctA Glucarate dehydratase, n341l mutant orthorhombic form (see paper)
97% identity, 99% coverage: 4:446/446 of query aligns to 1:443/443 of 1jctA

query
sites
1jctA
Q
 
Q
F
 
F
S
 
T
T
 
T
P
 
P
V
 
V
V
 
V
S
 
T
S
 
E
M
 
M
Q
 
Q
V
 
V
I
 
I
P
 
P
V
 
V
A
 
A
G
 
G
H
 
H
D
 
D
S
 
S
M
 
M
L
 
L
M
 
M
N
|
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
A
 
A
H
|
H
A
 
A
P
 
P
F
 
F
F
 
F
T
 
T
R
 
R
N
 
N
I
 
I
V
 
V
V
 
I
I
 
I
K
 
K
D
 
D
N
 
N
S
 
S
G
 
G
H
 
H
T
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
G
E
 
E
I
 
I
P
 
P
G
 
G
G
 
G
E
 
E
K
 
K
I
 
I
R
 
R
K
 
K
T
 
T
L
 
L
E
 
E
D
 
D
A
 
A
I
 
I
P
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
V
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
E
 
E
Y
 
Y
K
 
K
N
 
N
V
 
V
L
 
L
T
 
T
A
 
L
V
 
V
R
 
R
N
 
N
T
 
T
F
 
F
A
 
A
D
 
D
R
 
R
D
 
D
A
 
A
G
 
G
G
 
G
R
 
R
G
 
G
L
 
L
Q
 
Q
T
|
T
F
 
F
D
 
D
L
 
L
R
 
R
T
 
T
T
 
T
I
 
I
H
 
H
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
I
 
I
E
 
E
A
 
A
A
 
A
M
 
M
L
 
L
D
 
D
L
 
L
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
H
 
H
L
 
L
G
 
G
V
 
V
N
 
N
V
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
S
 
S
E
 
E
V
 
V
E
 
E
M
 
M
L
 
L
G
 
G
Y
|
Y
L
 
L
F
|
F
F
 
F
V
 
V
G
 
G
N
 
N
R
 
R
K
 
K
A
 
A
T
 
T
P
 
P
L
 
L
P
 
P
Y
 
Y
Q
 
Q
S
 
S
Q
 
Q
P
 
P
D
 
D
D
 
D
K
 
S
C
 
C
D
 
D
W
 
W
Y
 
Y
R
 
R
L
 
L
R
 
R
H
 
H
D
 
E
E
 
E
A
 
A
M
 
M
T
 
T
P
 
P
D
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
N
 
N
D
 
D
F
 
F
K
|
K
L
 
L
K
|
K
G
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
L
A
 
A
G
 
G
E
 
E
E
 
E
E
 
E
A
 
A
E
 
E
S
 
S
I
 
I
V
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
Q
R
 
R
F
 
F
P
 
P
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
V
 
I
T
 
T
L
 
L
D
|
D
P
 
P
N
|
N
G
 
G
A
 
A
W
 
W
S
 
S
L
 
L
N
 
N
E
 
E
A
 
A
I
 
I
K
 
K
I
 
I
G
 
G
K
 
K
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
G
 
G
S
 
S
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
E
|
E
D
 
D
P
 
P
C
 
C
G
 
G
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
S
 
S
G
 
G
R
 
R
E
 
E
V
 
V
M
 
M
A
 
A
E
 
E
F
 
F
R
 
R
R
 
R
A
 
A
T
 
T
G
 
G
L
 
L
P
 
P
T
 
T
A
 
A
T
 
T
N
|
N
M
|
M
I
 
I
A
 
A
T
 
T
D
 
D
W
 
W
R
 
R
Q
 
Q
M
 
M
G
 
G
H
 
H
T
 
T
L
 
L
S
 
S
L
 
L
Q
 
Q
S
 
S
V
 
V
D
 
D
I
 
I
P
 
P
L
 
L
A
 
A
D
|
D
P
 
P
H
 
H
F
 
F
W
 
W
T
 
T
M
 
M
Q
 
Q
G
 
G
S
 
S
V
 
V
R
 
R
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q
M
 
M
C
 
C
H
 
H
E
 
E
F
 
F
G
 
G
L
 
L
T
 
T
W
 
W
G
 
G
S
 
S
H
|
H
S
|
S
N
x
L
N
 
N
H
 
H
F
 
F
D
 
D
I
 
I
S
 
S
L
 
L
A
 
A
M
 
M
F
 
F
T
 
T
H
 
H
V
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
A
P
 
P
G
 
G
K
 
K
I
 
I
T
 
T
A
 
A
I
|
I
D
 
D
T
 
T
H
 
H
W
 
W
I
 
I
W
 
W
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
N
 
N
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
T
 
T
K
 
K
E
 
E
P
 
P
F
 
F
E
 
E
I
 
I
K
 
K
G
 
G
G
 
G
M
 
L
V
 
V
Q
 
Q
V
 
V
P
 
P
A
 
E
K
 
K
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
E
L
 
I
D
 
D
M
 
M
D
 
D
Q
 
Q
V
 
V
M
 
M
K
 
K
A
 
A
H
 
H
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
Q
K
 
K
H
 
H
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
R
|
R
D
 
D
D
 
D
A
 
A
M
 
M
G
 
G
M
 
M
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
I
 
I
P
 
P
N
 
G
W
 
W
T
 
T
F
 
F
D
 
D
N
 
N
K
 
K
R
 
R
P
 
P
C
 
C
M
 
M
V
 
V
R
 
R

3p0wB Crystal structure of d-glucarate dehydratase from ralstonia solanacearum complexed with mg and d-glucarate
67% identity, 98% coverage: 7:444/446 of query aligns to 2:428/428 of 3p0wB

query
sites
3p0wB
T
 
T
P
 
P
V
 
R
V
 
V
S
 
T
S
 
E
M
 
M
Q
 
Q
V
 
V
I
 
I
P
 
P
V
 
V
A
 
A
G
 
G
H
 
R
D
 
D
S
 
S
M
 
M
L
 
L
M
 
L
N
 
N
L
 
L
S
 
C
G
 
G
A
 
A
H
|
H
A
 
A
P
 
P
F
 
F
F
 
F
T
 
T
R
 
R
N
 
N
I
 
L
V
 
V
V
 
I
I
 
L
K
 
K
D
 
D
N
 
N
S
 
A
G
 
G
H
 
R
T
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
G
E
 
E
I
 
V
P
 
P
G
 
G
G
 
G
E
 
E
K
 
G
I
 
I
R
 
R
K
 
Q
T
 
A
L
 
L
E
 
E
D
 
R
A
 
V
I
 
I
P
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
V
G
 
G
K
 
Q
T
 
S
L
 
I
G
 
G
E
 
R
Y
 
T
K
 
N
N
 
G
V
 
V
L
 
L
T
 
S
A
 
S
V
 
I
R
 
R
N
 
-
T
 
-
F
 
-
A
 
-
D
 
-
R
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
R
G
 
A
L
 
L
Q
 
A
T
 
E
F
 
I
D
 
N
L
 
L
R
 
R
T
 
M
T
 
D
I
 
-
H
 
N
V
 
V
V
 
I
T
 
T
G
 
A
I
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
A
M
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
H
 
F
L
 
L
G
 
E
V
 
V
N
 
P
V
 
V
A
 
A
S
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
A
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
S
 
D
E
 
S
V
 
A
E
 
P
M
 
M
L
 
L
G
 
A
Y
|
Y
L
 
L
F
 
F
F
 
Y
V
 
V
G
 
G
N
 
D
R
 
R
K
 
R
A
 
K
T
 
T
P
 
D
L
 
L
P
 
P
Y
 
Y
Q
 
L
S
 
E
Q
 
G
P
 
A
D
 
N
D
 
G
K
 
A
C
 
D
D
 
D
W
 
W
Y
 
L
R
 
R
L
 
L
R
 
R
H
 
H
D
 
E
E
 
A
A
 
A
M
 
M
T
 
T
P
 
P
D
 
A
A
 
A
V
 
I
V
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
A
Y
 
T
E
 
E
K
 
R
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
N
 
A
D
 
D
F
 
F
K
|
K
L
 
L
K
|
K
G
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
M
A
 
P
G
 
G
E
 
A
E
 
E
E
 
E
A
 
M
E
 
E
S
 
A
I
 
I
V
 
A
A
 
A
L
 
I
A
 
K
K
 
A
R
 
R
F
 
F
P
 
P
Q
 
H
A
 
A
R
 
R
V
 
V
T
 
T
L
 
L
D
|
D
P
 
P
N
|
N
G
 
G
A
 
A
W
 
W
S
 
S
L
 
L
N
 
N
E
 
E
A
 
A
I
 
I
K
 
A
I
 
L
G
 
C
K
 
K
Y
 
G
L
 
Q
K
 
G
G
 
H
S
 
L
L
 
V
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
E
|
E
D
 
D
P
 
P
C
 
C
G
 
G
A
 
P
E
 
E
Q
 
A
G
 
G
F
 
Y
S
 
S
G
 
G
R
 
R
E
 
E
V
 
V
M
 
M
A
 
A
E
 
E
F
 
F
R
 
K
R
 
R
A
 
A
T
 
T
G
 
G
L
 
I
P
 
P
T
 
T
A
 
A
T
 
T
N
|
N
M
 
M
I
 
I
A
 
A
T
 
T
D
 
D
W
 
W
R
 
R
Q
 
Q
M
 
M
G
 
G
H
 
H
T
 
A
L
 
V
S
 
Q
L
 
L
Q
 
H
S
 
A
V
 
V
D
 
D
I
 
I
P
 
P
L
 
L
A
 
A
D
|
D
P
 
P
H
 
H
F
 
F
W
 
W
T
 
T
M
 
M
Q
 
Q
G
 
G
S
 
S
V
 
V
R
 
R
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q
M
 
L
C
 
C
H
 
D
E
 
E
F
 
W
G
 
G
L
 
L
T
 
T
W
 
W
G
 
G
S
 
S
H
|
H
S
 
S
N
|
N
N
 
N
H
 
H
F
 
F
D
 
D
I
 
V
S
 
S
L
 
L
A
 
A
M
 
M
F
 
F
T
 
T
H
 
H
V
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
A
P
 
P
G
 
G
K
 
N
I
 
I
T
 
T
A
 
A
I
 
I
D
 
D
T
 
T
H
|
H
W
 
W
I
 
I
W
 
W
Q
 
Q
E
 
E
G
 
A
N
 
Q
Q
 
E
R
 
R
L
 
L
T
 
T
K
 
R
E
 
E
P
 
P
F
 
L
E
 
R
I
 
I
K
 
Q
G
 
G
G
 
G
M
 
H
V
 
V
Q
 
A
V
 
V
P
 
P
A
 
E
K
 
R
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
I
E
 
E
L
 
I
D
 
D
M
 
M
D
 
D
Q
 
R
V
 
V
M
 
M
K
 
A
A
 
A
H
 
H
E
 
A
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
K
K
 
T
H
 
L
G
 
G
L
 
P
G
 
G
A
 
A
R
|
R
D
 
D
D
 
D
A
 
A
M
 
M
G
 
A
M
 
M
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
I
 
V
P
 
P
N
 
G
W
 
W
T
 
T
F
 
Y
D
 
D
N
 
P
K
 
K
R
 
R
P
 
P
C
 
S
M
 
L

3nxlC Crystal structure of glucarate dehydratase from burkholderia cepacia complexed with magnesium
64% identity, 98% coverage: 7:442/446 of query aligns to 2:422/425 of 3nxlC

query
sites
3nxlC
T
 
T
P
 
P
V
 
R
V
 
V
S
 
T
S
 
R
M
 
M
Q
 
Q
V
 
V
I
 
I
P
 
P
V
 
V
A
 
A
G
 
G
H
 
R
D
 
D
S
 
S
M
 
M
L
 
L
M
 
L
N
 
N
L
 
L
S
 
C
G
 
G
A
 
A
H
|
H
A
 
A
P
 
P
F
 
Y
F
 
F
T
 
T
R
 
R
N
 
N
I
 
L
V
 
V
V
 
I
I
 
L
K
 
D
D
 
D
N
 
S
S
 
S
G
 
G
H
 
H
T
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
G
E
 
E
I
 
V
P
 
P
G
 
G
G
 
G
E
 
E
K
 
G
I
 
I
R
 
R
K
 
H
T
 
A
L
 
L
E
 
E
D
 
R
A
 
M
I
 
T
P
 
D
L
 
L
V
 
V
V
 
V
G
 
G
K
 
Q
T
 
S
L
 
I
G
 
G
E
 
R
Y
 
Y
K
 
Q
N
 
A
V
 
T
L
 
L
T
 
N
A
 
A
V
 
V
R
 
R
N
 
A
T
 
A
F
 
L
A
 
S
D
 
R
R
 
L
D
 
D
A
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
G
 
-
L
 
-
Q
 
-
T
 
-
F
 
-
D
 
-
L
 
-
R
 
-
T
 
-
T
 
-
I
 
-
H
 
N
V
 
V
V
 
I
T
 
T
G
 
A
I
 
I
E
 
E
A
 
A
A
 
A
M
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
H
 
H
L
 
L
G
 
D
V
 
V
N
 
P
V
 
V
A
 
A
S
 
A
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
E
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
S
 
D
E
 
A
V
 
V
E
 
P
M
 
M
L
 
L
G
 
A
Y
 
Y
L
 
L
F
 
F
F
 
Y
V
 
I
G
 
G
N
 
D
R
 
R
K
 
G
A
 
R
T
 
T
P
 
D
L
 
L
P
 
P
Y
 
Y
Q
 
R
S
 
D
Q
 
E
P
 
A
D
 
Q
D
 
A
K
 
R
C
 
T
D
 
P
W
 
W
Y
 
F
R
 
R
L
 
L
R
 
R
H
 
N
D
 
E
E
 
E
A
 
A
M
 
L
T
 
T
P
 
P
D
 
A
A
 
A
V
 
I
V
 
A
R
 
R
L
 
Q
A
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
A
Y
 
V
E
 
D
K
 
R
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
N
 
A
D
 
D
F
 
F
K
 
K
L
 
L
K
 
K
G
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
M
A
 
A
G
 
G
E
 
A
E
 
D
E
 
E
A
 
M
E
 
E
S
 
A
I
 
I
V
 
A
A
 
A
L
 
I
A
 
K
K
 
A
R
 
C
F
 
F
P
 
P
Q
 
D
A
 
A
R
 
R
V
 
A
T
 
T
L
 
L
D
|
D
P
 
P
N
 
N
G
 
G
A
 
A
W
 
W
S
 
S
L
 
L
N
 
D
E
 
E
A
 
A
I
 
V
K
 
A
I
 
L
G
 
C
K
 
R
Y
 
G
L
 
Q
K
 
G
G
 
H
S
 
L
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
E
|
E
D
 
D
P
 
P
C
 
C
G
 
G
A
 
P
E
 
E
Q
 
G
G
 
G
F
 
Y
S
 
S
G
 
G
R
 
R
E
 
E
V
 
V
M
 
M
A
 
A
E
 
E
F
 
F
R
 
R
R
 
R
A
 
A
T
 
T
G
 
G
L
 
I
P
 
P
T
 
T
A
 
A
T
 
T
N
|
N
M
 
M
I
 
I
A
 
A
T
 
T
D
 
D
W
 
W
R
 
R
Q
 
Q
M
 
M
G
 
D
H
 
H
T
 
A
L
 
V
S
 
R
L
 
L
Q
 
Q
S
 
A
V
 
V
D
 
D
I
 
I
P
 
P
L
 
L
A
 
A
D
 
D
P
 
P
H
 
H
F
 
F
W
 
W
T
 
T
M
 
M
Q
 
Q
G
 
G
S
 
S
V
 
V
R
 
R
V
 
L
A
 
A
Q
 
Q
M
 
L
C
 
C
H
 
R
E
 
D
F
 
W
G
 
G
L
 
L
T
 
T
W
 
W
G
 
G
S
 
S
H
 
H
S
 
S
N
 
N
N
 
N
H
 
H
F
 
F
D
 
D
I
 
V
S
 
S
L
 
L
A
 
A
M
 
M
F
 
F
T
 
T
H
 
H
V
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
A
P
 
P
G
 
G
K
 
T
I
 
I
T
 
T
A
 
A
I
 
I
D
 
D
T
 
T
H
|
H
W
 
W
I
 
I
W
 
W
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
N
 
D
Q
 
A
R
 
R
L
 
L
T
 
T
K
 
R
E
 
E
P
 
P
F
 
L
E
 
K
I
 
I
K
 
V
G
 
G
G
 
G
M
 
Q
V
 
V
Q
 
A
V
 
V
P
 
P
A
 
E
K
 
R
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
I
E
 
E
L
 
L
D
 
D
M
 
M
D
 
A
Q
 
Q
V
 
V
M
 
E
K
 
A
A
 
A
H
 
H
E
 
A
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
K
K
 
E
H
 
V
G
 
G
L
 
G
G
 
T
A
 
A
R
 
R
D
 
D
D
 
D
A
 
A
M
 
V
G
 
A
M
 
M
Q
 
R
Y
 
Y
L
 
L
I
 
V
P
 
P
N
 
G
W
 
W
T
 
T
F
 
Y
D
 
D
N
 
P
K
 
K
R
 
R
P
 
P

3nfuA Crystal structure of probable glucarate dehydratase from chromohalobacter salexigens dsm 3043 complexed with magnesium
59% identity, 98% coverage: 8:445/446 of query aligns to 3:440/441 of 3nfuA

query
sites
3nfuA
P
 
P
V
 
K
V
 
I
S
 
T
S
 
K
M
 
M
Q
 
N
V
 
V
I
 
V
P
 
P
V
 
V
A
 
A
G
 
G
H
 
E
D
 
D
S
 
G
M
 
F
L
 
L
M
 
L
N
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
A
 
G
H
 
H
A
 
E
P
 
P
F
 
W
F
 
F
T
 
I
R
 
R
N
 
C
I
 
V
V
 
L
V
 
V
I
 
L
K
 
E
D
 
D
N
 
E
S
 
S
G
 
G
H
 
N
T
 
R
G
 
G
V
 
V
G
 
G
E
 
E
I
 
I
P
 
P
G
 
S
G
 
S
E
 
E
K
 
G
I
 
I
R
 
L
K
 
N
T
 
G
L
 
L
E
 
E
D
 
K
A
 
C
I
 
R
P
 
S
L
 
L
V
 
V
V
 
E
G
 
G
K
 
A
T
 
R
L
 
V
G
 
N
E
 
E
Y
 
V
K
 
K
N
 
Q
V
 
V
L
 
L
T
 
S
A
 
R
V
 
A
R
 
R
N
 
G
T
 
L
F
 
L
A
 
A
D
 
Q
R
 
G
D
 
G
A
 
P
G
 
E
G
 
E
R
 
R
G
 
G
L
 
R
Q
 
Q
T
 
T
F
 
F
D
 
D
L
 
L
R
 
R
T
 
V
T
 
A
I
 
V
H
 
H
V
 
V
V
 
I
T
 
T
G
 
A
I
 
I
E
 
E
A
 
S
A
 
A
M
 
L
L
 
F
D
 
D
L
 
L
L
 
F
G
 
G
Q
 
Q
H
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
M
N
 
P
V
 
V
A
 
A
S
 
D
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
Q
-
 
Y
G
 
G
Q
 
R
Q
 
Q
R
 
R
S
 
D
E
 
E
V
 
V
E
 
E
M
 
A
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
F
 
F
F
 
L
V
 
L
G
 
G
N
 
D
R
 
P
K
 
D
A
 
K
T
 
T
P
 
D
L
 
L
P
 
P
Y
 
Y
Q
 
P
S
 
R
Q
 
V
P
 
A
D
 
D
D
 
P
K
 
V
C
 
D
D
 
A
W
 
W
Y
 
D
R
 
E
L
 
V
R
 
R
H
 
Y
D
 
R
E
 
E
A
 
A
M
 
M
T
 
T
P
 
P
D
 
E
A
 
A
V
 
V
V
 
A
R
 
N
L
 
L
A
 
A
E
 
R
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
E
 
D
K
 
R
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
N
 
K
D
 
D
F
 
F
K
|
K
L
 
L
K
|
K
G
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
L
A
 
R
G
 
G
E
 
E
E
 
E
E
 
E
A
 
A
E
 
D
S
 
C
I
 
I
V
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
H
K
 
E
R
 
A
F
 
F
P
 
P
Q
 
E
A
 
A
R
 
R
V
 
L
T
 
A
L
 
L
D
|
D
P
 
P
N
|
N
G
 
G
A
 
A
W
 
W
S
 
K
L
 
L
N
 
D
E
 
E
A
 
A
I
 
V
K
 
R
I
 
V
G
 
L
K
 
E
Y
 
P
L
 
I
K
 
K
G
 
H
S
 
L
L
 
L
A
 
S
Y
 
Y
A
 
A
E
|
E
D
|
D
P
 
P
C
 
C
G
 
G
A
 
Q
E
 
E
Q
 
G
G
 
G
F
 
F
S
 
S
G
 
G
R
 
R
E
 
E
V
 
T
M
 
M
A
 
A
E
 
E
F
 
F
R
 
K
R
 
K
A
 
R
T
 
T
G
 
G
L
 
L
P
 
P
T
 
T
A
 
A
T
 
T
N
|
N
M
 
M
I
 
I
A
 
A
T
 
T
D
 
D
W
 
Y
R
 
K
Q
 
Q
M
 
L
G
 
Q
H
 
Y
T
 
A
L
 
V
S
 
Q
L
 
L
Q
 
N
S
 
S
V
 
V
D
 
D
I
 
I
P
 
P
L
 
L
A
 
A
D
|
D
P
 
C
H
 
H
F
 
F
W
 
W
T
 
T
M
 
M
Q
 
Q
G
 
G
S
 
A
V
 
V
R
 
A
V
 
V
A
 
G
Q
 
E
M
 
L
C
 
C
H
 
N
E
 
E
F
 
W
G
 
G
L
 
M
T
 
T
W
 
W
G
 
G
S
 
S
H
|
H
S
 
S
N
|
N
N
 
N
H
 
H
F
 
F
D
 
D
I
 
I
S
 
S
L
 
L
A
 
A
M
 
M
F
 
M
T
 
T
H
 
H
V
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
C
P
 
P
G
 
G
K
 
E
I
 
I
T
 
T
A
 
A
I
 
I
D
 
D
T
 
T
H
 
H
W
 
W
I
 
I
W
 
W
Q
 
Q
E
 
D
G
 
G
N
 
-
Q
 
Q
R
 
R
L
 
I
T
 
T
K
 
R
E
 
E
P
 
P
F
 
F
E
 
Q
I
 
I
K
 
R
G
 
D
G
 
G
M
 
K
V
 
L
Q
 
T
V
 
V
P
 
P
A
 
K
K
 
T
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
I
E
 
E
L
 
L
D
 
D
M
 
D
D
 
D
Q
 
K
V
 
L
M
 
M
K
 
E
A
 
A
H
 
H
E
 
E
L
 
T
Y
 
Y
Q
 
K
K
 
R
H
 
L
G
 
D
L
 
V
G
 
T
A
 
Q
R
 
R
D
 
N
D
 
D
A
 
A
M
 
M
G
 
A
M
 
M
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
I
 
I
P
 
P
N
 
G
W
 
W
T
 
E
F
 
F
D
 
D
N
 
P
K
 
K
R
 
R
P
 
P
C
 
A
M
 
L
V
 
V

3n6hB Crystal structure of mandelate racemase/muconate lactonizing protein from actinobacillus succinogenes 130z complexed with magnesium/sulfate
60% identity, 99% coverage: 6:446/446 of query aligns to 2:430/432 of 3n6hB

query
sites
3n6hB
S
 
S
T
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
I
S
 
T
S
 
D
M
 
M
Q
 
K
V
 
V
I
 
I
P
 
P
V
 
V
A
 
A
G
 
G
H
 
H
D
 
D
S
 
S
M
 
M
L
 
L
M
 
M
N
 
N
L
 
V
S
 
G
G
 
G
A
 
A
H
 
H
A
 
S
P
 
P
F
 
Y
F
 
F
T
 
T
R
 
R
N
 
N
I
 
I
V
 
V
V
 
I
I
 
L
K
 
T
D
 
D
N
 
N
S
 
S
G
 
G
H
 
H
T
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
G
E
 
E
I
 
A
P
 
P
G
 
G
G
 
G
E
 
A
K
 
T
I
 
I
R
 
E
K
 
N
T
 
A
L
 
L
E
 
T
D
 
E
A
 
A
I
 
I
P
 
P
L
 
H
V
 
V
V
 
V
G
 
G
K
 
R
T
 
P
L
 
I
G
 
S
E
 
I
Y
 
L
K
 
N
N
 
K
V
 
I
L
 
V
T
 
N
A
 
D
V
 
M
R
 
H
N
 
N
T
 
-
F
 
-
A
 
-
D
 
-
R
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
G
 
G
L
 
Y
Q
 
W
T
 
T
F
 
F
D
 
E
L
 
L
R
 
R
T
 
-
T
 
-
I
 
V
H
 
N
V
 
A
V
 
V
T
 
A
G
 
A
I
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
A
M
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
L
 
M
G
 
G
Q
 
Q
H
 
F
L
 
L
G
 
G
V
 
V
N
 
P
V
 
V
A
 
A
S
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
P
G
 
G
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
S
 
D
E
 
E
V
 
V
E
 
T
M
 
V
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
F
 
F
F
 
Y
V
 
V
G
 
G
N
 
D
R
 
D
K
 
K
A
 
I
T
 
T
P
 
D
L
 
L
P
 
P
Y
 
Y
Q
 
Q
S
 
Q
Q
 
P
P
 
V
D
 
T
D
 
G
K
 
K
C
 
H
D
 
E
W
 
W
Y
 
Y
R
 
D
L
 
I
R
 
R
H
 
R
D
 
K
E
 
K
A
 
A
M
 
M
T
 
D
P
 
T
D
 
Q
A
 
A
V
 
V
V
 
I
R
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
A
A
 
A
A
 
S
Y
 
K
E
 
D
K
 
R
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
N
 
K
D
 
D
F
 
F
K
|
K
L
 
L
K
|
K
G
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
F
A
 
E
G
 
G
E
 
S
E
 
K
E
 
E
A
 
I
E
 
D
S
 
T
I
 
V
V
 
I
A
 
E
L
 
L
A
 
K
K
 
K
R
 
H
F
 
F
P
 
P
Q
 
D
A
 
A
R
 
R
V
 
I
T
 
T
L
 
L
D
|
D
P
 
P
N
|
N
G
 
G
A
 
C
W
 
W
S
 
S
L
 
L
N
 
D
E
 
E
A
 
A
I
 
I
K
 
Q
I
 
L
G
 
C
K
 
K
Y
 
G
L
 
L
K
 
N
G
 
D
S
 
V
L
 
L
A
 
T
Y
 
Y
A
 
A
E
|
E
D
 
D
P
 
P
C
 
C
G
 
I
A
 
G
E
 
E
Q
 
N
G
 
G
F
 
Y
S
 
S
G
 
G
R
 
R
E
 
E
V
 
I
M
 
M
A
 
A
E
 
E
F
 
F
R
 
R
R
 
R
A
 
R
T
 
T
G
 
G
L
 
I
P
 
P
T
 
T
A
 
A
T
 
T
N
|
N
M
 
M
I
 
I
A
 
A
T
 
T
D
 
N
W
 
W
R
 
R
Q
 
E
M
 
M
G
 
C
H
 
H
T
 
A
L
 
I
S
 
M
L
 
L
Q
 
Q
S
 
S
V
 
V
D
 
D
I
 
I
P
 
P
L
 
L
A
 
A
D
|
D
P
 
P
H
 
H
F
 
F
W
 
W
T
 
T
M
 
L
Q
 
T
G
 
G
S
 
A
V
 
S
R
 
R
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q
M
 
L
C
 
C
H
 
N
E
 
E
F
 
W
G
 
G
L
 
L
T
 
T
W
 
W
G
 
G
S
 
C
H
|
H
S
 
S
N
|
N
N
 
N
H
 
H
F
 
F
D
 
D
I
 
I
S
 
S
L
 
L
A
 
A
M
 
M
F
 
F
T
 
S
H
 
H
V
 
V
A
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
A
P
 
P
G
 
G
K
 
N
I
 
P
T
 
T
A
 
A
I
 
L
D
 
D
T
 
T
H
 
H
W
 
W
I
 
I
W
 
W
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
N
 
D
Q
 
F
R
 
Y
L
 
L
T
 
T
K
 
K
E
 
N
P
 
P
F
 
L
E
 
E
I
 
I
K
 
K
G
 
D
G
 
G
M
 
K
V
 
I
Q
 
K
V
 
L
P
 
N
A
 
D
K
 
K
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
I
E
 
E
L
 
L
D
 
N
M
 
M
D
 
D
Q
 
N
V
 
V
M
 
L
K
 
K
A
 
A
H
 
H
E
 
E
L
 
L
Y
 
H
Q
 
K
K
 
K
H
 
L
G
 
P
L
 
N
G
 
G
A
 
A
R
 
R
D
 
N
D
 
D
A
 
A
M
 
I
G
 
P
M
 
M
Q
 
Q
Y
 
F
L
 
Y
I
 
Y
P
 
P
N
 
G
W
 
W
T
 
K
F
 
F
D
 
D
N
 
R
K
 
K
R
 
R
P
 
P
C
 
A
M
 
M
V
 
V
R
 
R

3pfrA Crystal structure of d-glucarate dehydratase related protein from actinobacillus succinogenes complexed with d-glucarate
60% identity, 99% coverage: 6:446/446 of query aligns to 1:426/426 of 3pfrA

query
sites
3pfrA
S
 
S
T
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
I
S
 
T
S
 
D
M
 
M
Q
 
K
V
 
V
I
 
I
P
 
P
V
 
V
A
 
A
G
 
G
H
 
H
D
 
D
S
 
S
M
 
M
L
 
L
M
 
M
N
|
N
L
 
V
S
 
G
G
 
G
A
 
A
H
|
H
A
 
S
P
 
P
F
 
Y
F
 
F
T
 
T
R
 
R
N
 
N
I
 
I
V
 
V
V
 
I
I
 
L
K
 
T
D
 
D
N
 
N
S
 
S
G
 
G
H
 
H
T
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
G
E
 
E
I
 
A
P
 
P
G
 
G
G
 
G
E
 
A
K
 
T
I
 
I
R
 
E
K
 
N
T
 
A
L
 
L
E
 
T
D
 
E
A
 
A
I
 
I
P
 
P
L
 
H
V
 
V
V
 
V
G
 
G
K
 
R
T
 
P
L
 
I
G
 
S
E
 
I
Y
 
L
K
 
N
N
 
K
V
 
I
L
 
V
T
 
N
A
 
D
V
 
M
R
 
H
N
 
N
T
 
T
F
 
F
A
 
E
D
 
L
R
 
R
D
 
-
A
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
G
 
-
L
 
-
Q
 
-
T
 
-
F
 
-
D
 
-
L
 
-
R
 
-
T
 
-
T
 
-
I
 
V
H
 
N
V
 
A
V
 
V
T
 
A
G
 
A
I
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
A
M
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
L
 
M
G
 
G
Q
 
Q
H
 
F
L
 
L
G
 
G
V
 
V
N
 
P
V
 
V
A
 
A
S
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
P
G
 
G
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
S
 
D
E
 
E
V
 
V
E
 
T
M
 
V
L
 
L
G
 
G
Y
|
Y
L
 
L
F
|
F
F
 
Y
V
 
V
G
 
G
N
 
D
R
 
D
K
 
K
A
 
I
T
 
T
P
 
D
L
 
L
P
 
P
Y
 
Y
Q
 
Q
S
 
Q
Q
 
P
P
 
V
D
 
T
D
 
G
K
 
K
C
 
H
D
 
E
W
 
W
Y
 
Y
R
 
D
L
 
I
R
 
R
H
 
R
D
 
K
E
 
K
A
 
A
M
 
M
T
 
D
P
 
T
D
 
Q
A
 
A
V
 
V
V
 
I
R
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
A
A
 
A
A
 
S
Y
 
K
E
 
D
K
 
R
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
N
 
K
D
 
D
F
 
F
K
|
K
L
 
L
K
|
K
G
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
F
A
 
E
G
 
G
E
 
S
E
 
K
E
 
E
A
 
I
E
 
D
S
 
T
I
 
V
V
 
I
A
 
E
L
 
L
A
 
K
K
 
K
R
 
H
F
 
F
P
 
P
Q
 
D
A
 
A
R
 
R
V
 
I
T
 
T
L
 
L
D
|
D
P
 
P
N
|
N
G
 
G
A
 
C
W
 
W
S
 
S
L
 
L
N
 
D
E
 
E
A
 
A
I
 
I
K
 
Q
I
 
L
G
 
C
K
 
K
Y
 
G
L
 
L
K
 
N
G
 
D
S
 
V
L
 
L
A
 
T
Y
 
Y
A
 
A
E
|
E
D
 
D
P
 
P
C
 
C
G
 
I
A
 
G
E
 
E
Q
 
N
G
 
G
F
 
Y
S
 
S
G
 
G
R
 
R
E
 
E
V
 
I
M
 
M
A
 
A
E
 
E
F
 
F
R
 
R
R
 
R
A
 
R
T
 
T
G
 
G
L
 
I
P
 
P
T
 
T
A
 
A
T
 
T
N
|
N
M
 
M
I
 
I
A
 
A
T
 
T
D
 
N
W
 
W
R
 
R
Q
 
E
M
 
M
G
 
C
H
 
H
T
 
A
L
 
I
S
 
M
L
 
L
Q
 
Q
S
 
S
V
 
V
D
 
D
I
 
I
P
 
P
L
 
L
A
 
A
D
|
D
P
 
P
H
 
H
F
 
F
W
 
W
T
 
T
M
 
L
Q
 
T
G
 
G
S
 
A
V
 
S
R
 
R
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q
M
 
L
C
 
C
H
 
N
E
 
E
F
 
W
G
 
G
L
 
L
T
 
T
W
 
W
G
 
G
S
 
C
H
|
H
S
|
S
N
|
N
N
 
N
H
 
H
F
 
F
D
 
D
I
 
I
S
 
S
L
 
L
A
 
A
M
 
M
F
 
F
T
 
S
H
 
H
V
 
V
A
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
A
P
 
P
G
 
G
K
 
N
I
 
P
T
 
T
A
 
A
I
 
L
D
 
D
T
 
T
H
|
H
W
 
W
I
 
I
W
 
W
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
N
 
D
Q
 
F
R
 
Y
L
 
L
T
 
T
K
 
K
E
 
N
P
 
P
F
 
L
E
 
E
I
 
I
K
 
K
G
 
D
G
 
G
M
 
K
V
 
I
Q
 
K
V
 
L
P
 
N
A
 
D
K
 
K
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
I
E
 
E
L
 
L
D
 
N
M
 
M
D
 
D
Q
 
N
V
 
V
M
 
L
K
 
K
A
 
A
H
 
H
E
 
E
L
 
L
Y
 
H
Q
 
K
K
 
K
H
 
L
G
 
P
L
 
N
G
 
G
A
 
A
R
 
R
D
 
N
D
 
D
A
 
A
M
 
I
G
 
P
M
 
M
Q
 
Q
Y
 
F
L
 
Y
I
 
Y
P
 
P
N
 
G
W
 
W
T
 
K
F
 
F
D
 
D
N
 
R
K
 
K
R
 
R
P
 
P
C
 
A
M
 
M
V
 
V
R
 
R

4it1D Crystal structure of enolase pfl01_3283 (target efi-502286) from pseudomonas fluorescens pf0-1 with bound magnesium, potassium and tartrate
36% identity, 97% coverage: 5:435/446 of query aligns to 1:420/427 of 4it1D

query
sites
4it1D
F
 
F
S
 
Q
T
 
S
P
 
M
V
 
K
V
 
I
S
 
T
S
 
R
M
 
V
Q
 
T
V
 
V
I
 
T
P
 
P
V
 
I
A
 
A
G
 
F
H
 
R
D
 
D
S
 
P
M
 
P
L
 
L
M
 
L
N
 
N
L
 
A
S
 
S
G
 
G
A
 
I
H
 
H
A
 
E
P
 
P
F
 
F
F
 
A
T
 
L
R
 
R
N
 
S
I
 
I
V
 
I
V
 
E
I
 
I
K
 
E
D
 
S
N
 
D
S
 
N
G
 
G
H
 
Y
T
 
I
G
 
G
V
 
L
G
 
G
E
 
E
I
x
S
P
 
Y
G
 
G
G
x
D
E
 
A
K
 
P
I
 
A
R
 
L
K
 
A
T
 
I
L
 
Q
E
 
Q
D
 
Q
A
 
V
I
 
Q
P
 
S
L
 
Q
V
 
L
V
 
I
G
 
G
K
 
L
T
 
D
L
 
P
G
 
F
E
 
N
Y
 
L
K
 
N
N
 
Q
V
 
L
L
 
R
T
 
R
A
 
I
V
 
V
R
 
Q
N
 
T
T
 
T
F
 
V
A
 
A
-
 
A
D
 
H
R
 
K
D
 
P
A
 
A
G
 
S
G
 
L
R
 
A
G
 
G
L
x
A
Q
 
E
-
 
L
-
 
A
-
 
P
-
 
G
T
 
S
F
 
H
D
 
A
L
 
S
R
 
K
T
 
A
T
 
V
I
 
S
H
 
N
V
 
A
V
 
Y
T
 
S
G
 
A
I
 
F
E
 
E
A
 
V
A
 
A
M
 
F
L
 
L
D
 
D
L
 
L
L
 
Q
G
 
A
Q
 
R
H
 
Y
L
 
L
G
 
N
V
 
V
N
 
P
V
 
L
A
 
V
S
 
D
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
-
G
 
G
Q
 
A
Q
 
V
R
 
R
S
 
D
E
 
E
V
 
V
E
 
P
M
 
F
L
 
S
G
 
A
Y
|
Y
L
 
L
F
 
F
F
 
F
V
 
-
G
 
-
N
 
-
R
 
K
K
 
Y
A
 
A
T
 
Q
P
 
H
L
 
V
P
 
D
Y
 
S
Q
 
P
S
 
Y
Q
 
K
P
 
P
D
 
D
D
 
N
K
 
-
C
 
-
D
 
-
W
 
W
Y
 
-
R
 
-
L
 
-
R
 
-
H
 
-
D
 
G
E
 
E
A
 
A
M
 
L
T
 
N
P
 
E
D
 
Q
A
 
Q
V
 
I
V
 
V
R
 
A
L
 
Q
A
 
A
E
 
A
A
 
R
A
 
M
Y
 
I
E
 
E
K
 
A
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
N
 
K
D
 
S
F
 
I
K
|
K
L
 
L
K
|
K
G
 
A
G
 
G
V
 
T
L
 
L
A
 
P
G
 
P
E
 
E
E
 
H
E
 
E
A
 
V
E
 
A
S
 
C
I
 
I
V
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
K
K
 
K
R
 
A
F
 
F
P
 
P
Q
 
G
A
 
Y
R
 
P
V
 
L
T
 
R
L
 
I
D
|
D
P
 
P
N
|
N
G
 
G
A
 
N
W
 
W
S
 
S
L
 
L
N
 
E
E
 
T
A
 
S
I
 
I
K
 
R
I
 
M
G
 
A
K
 
E
Y
 
L
L
 
L
K
 
G
G
 
D
S
 
D
L
 
L
A
 
Q
Y
|
Y
A
 
Y
E
|
E
D
 
D
P
 
P
C
 
T
G
 
-
A
 
-
E
 
-
Q
 
-
G
 
-
F
 
-
S
 
P
G
 
G
R
 
L
E
 
E
V
 
G
M
 
M
A
 
A
E
 
E
F
 
L
R
 
H
R
 
K
A
 
R
T
 
T
G
 
G
L
 
L
P
 
P
T
 
L
A
 
A
T
|
T
N
|
N
M
|
M
I
 
V
A
 
V
T
 
T
D
 
D
W
 
F
R
 
D
Q
 
E
M
 
F
G
 
R
H
 
R
T
 
S
L
 
V
S
 
A
L
 
Q
Q
 
N
S
 
S
V
 
V
D
 
Q
I
 
I
P
 
V
L
 
L
A
 
A
D
|
D
P
 
H
H
 
H
F
 
Y
W
 
W
-
 
G
T
 
G
M
 
L
Q
 
R
G
 
D
S
 
T
V
 
Q
R
 
T
V
 
L
A
 
A
Q
 
K
M
 
M
C
 
C
H
 
D
E
 
T
F
 
F
G
 
G
L
 
L
T
 
G
W
 
V
G
 
S
S
 
M
H
|
H
S
|
S
N
|
N
N
 
S
H
 
H
F
 
L
D
 
G
I
 
I
S
 
S
L
 
L
A
 
M
M
 
A
F
 
M
T
 
A
H
 
H
V
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
V
P
 
P
G
 
N
K
 
L
I
 
D
T
 
Y
A
 
A
I
x
C
D
|
D
T
 
T
H
 
H
W
 
Y
I
 
P
W
 
W
Q
 
Q
E
 
E
G
 
P
N
 
D
Q
 
E
R
 
E
L
 
V
T
 
I
K
 
K
-
 
G
E
 
G
P
 
K
F
 
L
E
 
P
I
 
I
K
 
V
G
 
D
G
 
G
M
 
C
V
 
V
Q
 
K
V
 
I
P
 
T
A
 
R
K
 
A
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
L
E
 
E
L
 
L
D
 
D
M
 
H
D
 
D
Q
 
Q
V
 
L
M
 
G
K
 
K
A
 
L
H
 
H
E
 
D
L
 
Q
Y
 
Y
Q
 
L
K
 
T
H
 
C
G
 
G
L
 
I
G
 
R
A
 
Q
R
 
R
D
 
D
D
 
D
A
 
V
M
 
R
G
 
Q
M
 
M
Q
 
Q
Y
 
R
L
 
Y
I
 
K
P
 
P
N
 
D
W
 
W

3va8A Crystal structure of enolase fg03645.1 (target efi-502278) from gibberella zeae ph-1 complexed with magnesium, formate and sulfate
34% identity, 97% coverage: 9:442/446 of query aligns to 12:425/427 of 3va8A

query
sites
3va8A
V
 
I
V
 
I
S
 
K
S
 
E
M
 
I
Q
 
V
V
 
I
I
 
T
P
 
P
V
 
V
A
 
A
G
 
F
H
 
H
D
 
D
S
 
M
M
 
P
L
 
L
M
 
L
N
 
N
L
 
S
S
 
V
G
 
G
A
 
V
H
 
H
A
 
E
P
 
P
F
 
F
F
 
A
T
 
L
R
 
R
N
 
S
I
 
I
V
 
I
-
 
E
V
 
I
I
 
I
K
 
T
D
 
E
N
 
D
S
 
S
G
 
-
H
 
-
T
 
Y
G
 
G
V
 
L
G
 
G
E
 
E
I
 
S
P
 
Y
G
 
G
G
 
D
-
 
S
-
 
A
-
 
H
-
 
L
E
 
D
K
 
R
I
 
L
R
 
Q
K
 
K
T
 
A
L
 
A
E
 
D
D
 
K
A
 
I
I
 
K
P
 
G
L
 
L
V
 
S
V
 
V
G
 
Y
K
 
S
T
 
T
L
 
N
G
 
V
E
 
I
Y
 
Y
K
 
Q
N
 
R
V
 
C
L
 
V
T
 
E
A
 
S
V
 
L
R
 
R
N
 
N
T
 
-
F
 
-
A
 
-
D
 
D
R
 
T
D
 
N
A
 
G
G
 
D
G
 
G
R
 
M
G
 
G
L
 
G
Q
 
M
T
 
V
F
 
V
D
 
T
L
 
A
R
 
S
T
 
V
T
 
A
I
 
D
H
 
K
V
 
V
V
 
F
T
 
S
G
 
P
I
 
F
E
 
E
A
 
V
A
 
A
M
 
C
L
 
L
D
 
D
L
 
L
L
 
Q
G
 
G
Q
 
K
H
 
L
L
 
A
G
 
G
V
 
I
N
 
S
V
 
V
A
 
S
S
 
D
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
-
G
 
G
Q
 
R
Q
 
V
R
 
R
S
 
D
E
 
S
V
 
V
E
 
Q
M
 
Y
L
 
S
G
 
A
Y
 
Y
L
 
L
F
 
F
F
 
Y
V
 
-
G
 
-
N
 
-
R
 
-
K
 
-
A
 
-
T
 
-
P
 
-
L
 
-
P
 
K
Y
 
W
Q
 
G
S
 
G
Q
 
H
P
 
P
D
 
G
D
 
D
K
 
E
C
 
D
D
 
D
W
 
E
Y
 
Y
R
 
-
L
 
-
R
 
-
H
 
-
D
 
G
E
 
P
A
 
A
M
 
L
T
 
D
P
 
P
D
 
E
A
 
G
V
 
V
V
 
V
R
 
K
L
 
Q
A
 
A
E
 
K
A
 
K
A
 
I
Y
 
I
E
 
D
K
 
E
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
N
 
K
D
 
A
F
 
I
K
 
K
L
 
L
K
 
K
G
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
F
A
 
P
G
 
P
E
 
A
E
 
D
E
 
E
A
 
V
E
 
A
S
 
A
I
 
I
V
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
H
K
 
K
R
 
A
F
 
F
P
 
P
Q
 
G
A
 
V
R
 
P
V
 
L
T
 
R
L
 
L
D
|
D
P
 
P
N
 
N
G
 
A
A
 
A
W
 
W
S
 
T
L
 
V
N
 
E
E
 
T
A
 
S
I
 
K
K
 
W
I
 
V
G
 
A
K
 
K
Y
 
E
L
 
L
K
 
E
G
 
G
S
 
I
L
 
V
A
 
E
Y
 
Y
A
 
L
E
|
E
D
 
D
P
 
P
C
 
A
G
 
G
A
 
E
E
 
I
Q
 
E
G
 
G
F
 
-
S
 
-
G
 
-
R
 
-
E
 
-
V
 
-
M
 
M
A
 
A
E
 
A
F
 
V
R
 
A
R
 
K
A
 
E
T
 
A
G
 
S
L
 
M
P
 
P
T
 
L
A
 
A
T
 
T
N
|
N
M
 
M
I
 
A
A
 
V
T
 
V
D
 
A
W
 
F
R
 
D
Q
 
H
M
 
L
G
 
P
H
 
P
T
 
S
L
 
I
S
 
L
L
 
Q
Q
 
D
S
 
A
V
 
V
D
 
Q
I
 
V
P
 
I
L
 
L
A
 
S
D
 
D
P
 
H
H
 
H
F
 
F
W
 
W
-
 
G
T
 
G
M
 
L
Q
 
R
G
 
K
S
 
S
V
 
Q
R
 
T
V
 
L
A
 
A
Q
 
S
M
 
I
C
 
C
H
 
A
E
 
T
F
 
W
G
 
G
L
 
L
T
 
R
W
 
L
G
 
S
S
 
M
H
 
H
S
 
S
N
 
N
N
 
S
H
 
H
F
 
L
D
 
G
I
 
I
S
 
S
L
 
L
A
 
A
M
 
A
F
 
M
T
 
T
H
 
H
V
 
L
A
 
A
A
 
S
A
 
A
A
 
T
P
 
P
G
 
N
K
 
L
I
 
D
T
 
Y
A
 
A
I
 
C
D
 
D
T
 
T
H
 
H
W
 
W
I
 
P
W
 
W
Q
 
K
E
 
R
G
 
R
N
 
D
Q
 
E
R
 
D
L
 
V
T
 
V
K
 
I
E
 
E
-
 
G
P
 
A
F
 
L
E
 
K
I
 
W
K
 
K
G
 
D
G
 
G
M
 
G
V
 
V
Q
 
I
V
 
V
P
 
P
A
 
S
K
 
G
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
E
L
 
L
D
 
D
M
 
R
D
 
E
Q
 
R
V
 
L
M
 
A
K
 
K
A
 
L
H
 
H
E
 
Q
L
 
Q
Y
 
Y
Q
 
V
K
 
D
H
 
C
G
 
G
L
 
L
G
 
K
A
 
K
R
 
R
D
 
D
D
 
D
A
 
T
M
 
T
G
 
Y
M
 
M
Q
 
K
Y
 
R
L
 
F
I
 
K
P
 
P
N
 
E
W
 
-
T
 
-
F
 
F
D
 
S
N
 
E
K
 
K
R
 
I
P
 
P

3vc6A Crystal structure of enolase tbis_1083(target efi-502310) from thermobispora bispora dsm 43833 complexed with magnesium and formate
34% identity, 96% coverage: 9:436/446 of query aligns to 3:414/420 of 3vc6A

query
sites
3vc6A
V
 
L
V
 
I
S
 
R
S
 
E
M
 
V
Q
 
R
V
 
V
I
 
T
P
 
P
V
 
V
A
 
A
G
 
F
H
 
R
D
 
D
S
 
P
M
 
P
L
 
L
M
 
L
N
 
N
L
 
A
S
 
A
G
 
G
A
 
V
H
 
H
A
 
Q
P
 
P
F
 
W
F
 
A
T
 
L
R
 
R
N
 
T
I
 
I
V
 
V
V
 
E
I
 
V
K
 
V
D
 
T
N
 
D
S
 
E
G
 
G
H
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
L
G
 
G
E
 
E
I
 
T
P
 
Y
G
 
G
G
x
D
-
 
L
-
 
A
-
x
H
-
 
L
E
 
E
K
 
Q
I
 
V
R
 
R
K
 
A
T
 
A
L
 
A
E
 
A
D
 
R
A
 
L
I
 
P
P
 
G
L
 
L
V
 
D
V
 
V
G
 
Y
K
 
A
T
 
L
L
 
H
G
 
R
E
 
I
Y
 
Y
K
 
R
N
 
R
V
 
V
L
 
A
T
 
D
A
 
V
V
 
V
R
 
G
N
 
A
T
 
N
F
 
I
A
 
V
D
 
T
R
 
-
D
 
D
A
 
M
G
 
H
G
 
G
R
 
L
G
 
T
L
 
G
Q
 
S
T
 
S
F
 
S
D
 
R
L
 
V
R
 
K
T
 
T
T
 
V
I
 
D
H
 
R
V
 
V
V
 
F
T
 
A
G
 
A
I
 
F
E
 
E
A
 
V
A
 
A
M
 
C
L
 
L
D
 
D
L
 
I
L
 
Q
G
 
G
Q
 
K
H
 
A
L
 
A
G
 
G
V
 
R
N
 
P
V
 
V
A
 
A
S
 
D
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
-
G
 
G
Q
 
K
Q
 
V
R
 
R
S
 
D
E
 
A
V
 
V
E
 
P
M
 
Y
L
 
S
G
 
A
Y
|
Y
L
 
L
F
 
F
F
 
Y
V
 
K
G
 
W
N
 
A
R
 
G
K
 
-
A
 
-
T
 
-
P
 
-
L
 
-
P
 
-
Y
 
H
Q
 
P
S
 
G
Q
 
K
P
 
P
D
 
E
D
 
D
K
 
-
C
 
-
D
 
-
W
 
-
Y
 
-
R
 
-
L
 
-
R
 
R
H
 
F
D
 
G
E
 
P
A
 
A
M
 
L
T
 
D
P
 
P
D
 
D
A
 
G
V
 
I
V
 
V
R
 
A
L
 
Q
A
 
A
E
 
R
A
 
L
A
 
L
Y
 
I
E
 
G
K
 
E
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
N
 
R
D
 
S
F
 
I
K
|
K
L
 
L
K
|
K
G
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
F
A
 
P
G
 
P
E
 
E
E
 
Q
E
 
E
A
 
A
E
 
E
S
 
A
I
 
I
V
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
R
K
 
D
R
 
A
F
 
F
P
 
P
Q
 
G
A
 
L
R
 
P
V
 
L
T
 
R
L
 
L
D
|
D
P
 
P
N
|
N
G
 
A
A
 
A
W
 
W
S
 
T
L
 
V
N
 
E
E
 
T
A
 
S
I
 
I
K
 
R
I
 
V
G
 
G
K
 
R
Y
 
A
L
 
L
K
 
D
G
 
G
S
 
V
L
 
L
A
 
E
Y
 
Y
A
 
L
E
|
E
D
 
D
P
 
P
C
 
T
G
 
-
A
 
-
E
 
-
Q
 
-
G
 
-
F
 
-
S
 
P
G
 
G
R
 
I
E
 
D
V
 
G
M
 
M
A
 
A
E
 
R
F
 
V
R
 
A
R
 
A
A
 
E
T
 
V
G
 
P
L
 
M
P
 
P
T
 
L
A
 
A
T
 
T
N
|
N
M
|
M
I
 
C
A
 
V
T
 
V
D
 
T
W
 
P
R
 
E
Q
 
H
M
 
L
G
 
P
H
 
A
T
 
A
L
 
V
S
 
E
L
 
R
Q
 
R
S
 
P
V
 
I
D
 
G
I
 
V
P
 
L
L
 
L
A
 
I
D
|
D
P
 
H
H
 
H
F
 
Y
W
 
W
T
 
G
-
 
G
M
 
L
Q
 
V
G
 
R
S
 
S
V
 
A
R
 
H
V
 
I
A
 
A
Q
 
T
M
 
L
C
 
C
H
 
A
E
 
T
F
 
F
G
 
G
L
 
I
T
 
E
W
 
L
G
 
S
S
 
M
H
|
H
S
|
S
N
|
N
N
 
S
H
|
H
F
 
L
D
 
G
I
 
I
S
 
S
L
 
L
A
 
A
M
 
A
F
 
M
T
 
T
H
 
H
V
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
T
P
 
P
G
 
A
K
 
I
I
 
T
T
 
H
A
 
A
I
x
C
D
|
D
T
 
T
H
 
H
W
 
T
I
 
P
W
 
W
Q
 
Q
E
 
D
G
 
G
N
 
Q
Q
 
D
R
 
V
L
 
V
T
 
A
K
 
P
E
 
G
P
 
A
F
 
L
E
 
R
I
 
F
K
 
V
G
 
D
G
 
G
M
 
A
V
 
V
Q
 
P
V
 
V
P
 
P
A
 
D
K
 
G
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
E
L
 
L
D
 
D
M
 
R
D
 
D
Q
 
A
V
 
L
M
 
A
K
 
V
A
 
M
H
 
H
E
 
E
L
 
Q
Y
 
Y
Q
 
E
K
 
R
H
 
C
G
 
G
L
 
I
G
 
R
A
 
T
R
 
R
D
 
D
D
 
D
A
 
E
M
 
G
G
 
Y
M
 
M
Q
 
R
Y
 
S
L
 
F
I
 
D
P
 
P
N
 
S
W
 
F
T
 
S

4hpnA Crystal structure of a proposed galactarolactone cycloisomerase from agrobacterium tumefaciens, target efi-500704, with bound ca, ordered loops (see paper)
24% identity, 83% coverage: 40:409/446 of query aligns to 33:372/378 of 4hpnA

query
sites
4hpnA
I
 
L
V
 
V
V
 
E
I
 
I
K
 
E
D
 
C
N
 
D
S
 
D
G
 
G
H
 
T
T
 
V
G
 
G
V
 
W
G
 
G
E
 
E
I
 
C
P
 
L
G
|
G
G
 
P
E
 
A
K
x
R
I
 
P
R
 
N
K
 
A
T
 
A
L
 
V
E
 
V
D
 
Q
A
 
A
I
 
Y
P
 
S
-
 
G
L
 
W
V
 
L
V
 
I
G
 
G
K
 
Q
T
 
D
L
 
P
G
 
R
E
 
Q
Y
 
T
K
 
E
N
 
K
V
 
I
L
 
W
T
 
A
A
 
V
V
 
L
R
 
Y
N
 
N
T
 
A
F
 
L
A
 
-
D
 
-
R
 
R
D
 
D
A
 
Q
G
 
G
G
 
Q
R
 
R
G
 
G
L
 
L
Q
 
-
T
 
-
F
 
-
D
 
-
L
 
-
R
 
-
T
 
-
T
 
S
I
 
L
H
 
T
V
 
A
V
 
L
T
 
S
G
 
G
I
 
I
E
 
D
A
 
I
A
 
A
M
 
L
L
 
W
D
 
D
L
 
I
L
 
K
G
 
G
Q
 
K
H
 
H
L
 
Y
G
 
G
V
 
A
N
 
S
V
 
I
A
 
S
S
 
M
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
-
G
 
G
Q
 
R
Q
 
W
R
 
R
S
 
E
E
 
S
V
 
V
E
 
R
M
 
A
L
 
-
G
 
-
Y
 
-
L
 
-
F
 
Y
F
 
A
V
x
T
G
 
G
N
 
S
R
 
F
K
 
K
A
 
-
T
 
-
P
 
-
L
 
-
P
 
-
Y
 
-
Q
 
-
S
 
-
Q
 
-
P
 
-
D
 
-
D
 
-
K
 
-
C
 
-
D
 
-
W
 
-
Y
 
-
R
 
-
L
 
-
R
 
R
H
 
D
D
 
N
E
 
V
A
 
D
M
 
R
T
 
V
P
 
S
D
 
D
A
 
N
V
 
A
V
 
S
R
 
E
L
 
M
A
 
A
E
 
E
A
 
R
A
 
R
Y
 
A
E
 
E
K
 
-
Y
 
-
G
 
G
F
 
F
N
 
H
D
 
A
F
 
C
K
|
K
L
 
I
K
|
K
G
 
I
G
 
G
V
 
-
L
 
F
A
 
G
G
 
V
E
 
E
E
 
E
E
 
D
A
 
L
E
 
R
S
 
V
I
 
I
V
 
A
A
 
A
L
 
V
A
 
R
K
 
E
R
 
A
F
 
I
-
 
G
P
 
P
Q
 
D
A
 
M
R
 
R
V
 
L
T
 
M
L
 
I
D
|
D
P
 
A
N
|
N
G
 
H
A
 
G
W
 
Y
S
 
T
L
 
V
N
 
T
E
 
E
A
 
A
I
 
I
K
 
T
I
 
L
G
 
G
K
x
D
Y
 
R
L
 
A
K
 
A
G
 
G
-
 
F
S
 
G
L
 
I
A
 
D
Y
 
W
A
 
F
E
|
E
D
 
E
P
 
P
C
 
V
G
 
V
A
 
P
E
 
E
Q
 
Q
G
 
-
F
 
-
S
 
-
G
 
-
R
 
L
E
 
D
V
 
A
M
 
Y
A
 
A
E
 
R
F
 
V
R
 
R
R
 
A
A
x
G
T
 
Q
G
 
P
L
 
I
P
 
P
T
 
V
A
 
A
T
 
G
N
x
G
M
x
E
I
x
T
A
 
W
T
 
H
D
 
G
W
 
R
R
 
Y
Q
 
G
M
 
M
G
 
W
H
 
Q
T
 
A
L
 
L
S
 
S
L
 
A
Q
 
G
S
 
A
V
 
V
D
 
D
I
 
I
P
 
L
L
x
Q
A
 
P
D
|
D
-
 
L
-
 
C
-
 
G
-
 
C
P
 
G
H
 
G
F
 
F
W
 
S
T
 
E
M
 
I
Q
 
Q
G
 
-
S
 
-
V
 
-
R
 
K
V
 
I
A
 
A
Q
 
T
M
 
L
C
 
A
H
 
T
E
 
L
F
 
H
G
 
G
L
 
V
T
 
R
W
 
I
G
 
V
S
 
P
H
|
H
S
x
V
-
x
W
N
 
G
N
 
T
H
 
G
F
 
V
D
 
Q
I
 
I
S
 
A
L
 
A
A
 
A
M
 
L
-
 
Q
F
 
F
T
 
M
H
 
A
V
 
A
A
 
M
A
 
T
A
 
P
A
 
D
P
 
P
G
 
V
K
x
R
I
 
V
T
 
N
A
 
P
I
 
I
D
 
E
-
 
P
-
 
I
-
 
M
-
x
E
-
x
F
-
 
D
-
 
R
T
 
T
H
|
H
W
 
-
I
 
-
W
 
-
Q
 
N
E
 
P
G
 
F
N
 
R
Q
 
Q
R
 
A
L
 
V
T
 
L
K
 
R
E
 
E
P
 
P
F
 
L
E
 
E
I
 
A
K
 
V
G
 
N
G
 
G
M
 
V
V
 
V
Q
 
T
V
 
I
P
 
P
A
 
D
K
 
G
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
I
E
 
E
L
 
I
D
 
N
M
 
R
D
 
D
Q
 
A
V
 
L
M
 
T
K
 
E

Sites not aligning to the query:

3u4fA Crystal structure of a mandelate racemase (muconate lactonizing enzyme family protein) from roseovarius nubinhibens
27% identity, 65% coverage: 113:402/446 of query aligns to 87:356/371 of 3u4fA

query
sites
3u4fA
V
 
M
T
 
A
G
 
G
I
 
V
E
 
D
A
 
T
A
 
A
M
 
I
L
 
W
D
 
D
L
 
L
L
 
R
G
 
G
Q
 
K
H
 
Q
L
 
A
G
 
G
V
 
K
N
 
P
V
 
V
A
 
A
S
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
G
-
 
S
-
 
A
G
 
G
Q
 
T
Q
 
I
R
 
R
S
 
A
E
 
Y
V
 
A
E
x
S
M
 
S
L
 
M
G
 
-
Y
 
-
L
 
-
F
 
-
F
 
-
V
 
-
G
 
-
N
 
K
R
 
R
K
 
D
A
 
I
T
 
T
P
 
P
L
 
-
P
 
-
Y
 
-
Q
 
-
S
 
-
Q
 
-
P
 
-
D
 
-
D
 
-
K
 
-
C
 
-
D
 
-
W
 
-
Y
 
-
R
 
-
L
 
-
R
 
-
H
 
H
D
 
D
E
 
E
A
 
A
M
 
-
T
 
-
P
 
-
D
 
E
A
 
R
V
 
M
V
 
K
R
 
R
L
 
L
A
 
R
E
 
D
A
 
A
A
 
-
Y
 
-
E
 
-
K
 
-
Y
 
H
G
 
G
F
 
F
N
 
D
D
 
A
F
 
F
K
|
K
L
 
V
K
x
R
G
 
A
G
 
G
-
 
A
-
 
E
V
 
V
L
 
G
A
 
R
G
 
G
E
 
R
E
x
D
E
 
E
-
 
W
-
 
P
-
 
G
-
 
R
A
 
T
E
 
E
S
 
E
I
 
I
V
 
V
A
 
P
L
 
T
A
 
M
K
 
R
R
 
R
F
 
E
-
 
M
-
 
G
P
 
D
Q
 
S
A
 
A
R
 
A
V
 
L
T
 
L
L
 
I
D
|
D
P
 
A
N
|
N
G
 
S
A
 
C
W
 
Y
S
 
A
L
 
P
N
 
A
E
 
Q
A
 
A
I
 
I
K
 
E
I
 
L
G
 
G
K
 
K
Y
 
L
L
 
L
K
 
Q
G
 
D
-
 
H
S
 
G
L
 
F
A
 
S
Y
 
H
A
x
F
E
|
E
D
 
E
P
 
P
C
 
C
G
 
P
A
 
Y
E
 
W
Q
 
E
G
 
L
F
 
E
S
 
Q
G
 
T
R
 
K
E
 
E
V
 
V
M
x
S
A
 
E
E
 
A
F
x
L
R
 
D
-
 
I
R
x
D
A
 
V
T
 
T
G
 
G
L
x
G
P
x
E
T
 
Q
A
 
D
T
 
C
N
 
D
M
 
L
I
 
-
A
 
-
T
 
T
D
 
T
W
 
W
R
 
R
Q
 
R
M
 
M
G
 
-
H
 
-
T
 
-
L
 
I
S
 
D
L
 
M
Q
 
R
S
 
A
V
 
V
D
 
D
I
 
V
P
 
-
L
 
-
A
 
V
D
x
Q
P
 
P
H
x
D
F
 
I
W
 
L
T
 
Y
M
 
L
Q
 
G
G
 
G
-
 
I
-
 
C
-
 
R
S
 
T
V
 
L
R
 
R
V
 
V
A
 
A
Q
 
R
M
 
M
C
 
A
H
 
E
E
 
A
F
 
A
G
 
A
L
 
L
T
 
P
W
 
V
G
 
T
S
 
P
H
|
H
S
 
C
N
x
A
N
|
N
H
 
L
F
 
S
D
 
L
I
 
V
S
 
T
L
 
L
A
 
-
M
 
-
F
 
F
T
 
T
-
 
M
H
 
H
V
 
L
A
 
L
A
 
R
A
 
A
A
 
I
P
 
P
-
 
N
-
 
A
G
 
G
K
|
K
I
 
Y
T
 
L
A
x
E
I
 
F
-
 
S
-
x
I
-
 
E
-
x
G
D
 
E
T
 
D
H
 
Y
W
 
Y
I
 
P
W
 
W
Q
 
Q
E
 
D
G
 
G
N
 
-
Q
 
-
R
 
L
L
 
F
T
 
V
K
 
E
E
 
D
P
 
P
F
 
Y
E
 
R
I
 
I
K
 
E
G
 
D
G
 
G
M
 
H
V
 
A
Q
 
R
V
 
V
P
 
T
A
 
E
K
 
A
P
 
P
G
 
G
L
 
W
G
 
G
V
 
V
E
 
E
L
 
I

Sites not aligning to the query:

3dg6A Crystal structure of muconate lactonizing enzyme from mucobacterium smegmatis complexed with muconolactone (see paper)
25% identity, 65% coverage: 116:407/446 of query aligns to 102:360/366 of 3dg6A

query
sites
3dg6A
I
 
I
E
 
D
A
 
M
A
 
A
M
 
M
L
 
W
D
 
D
L
 
A
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
H
 
S
L
 
L
G
 
R
V
 
L
N
 
S
V
 
V
A
 
S
S
 
E
L
 
M
L
 
L
G
 
G
D
 
G
G
 
Y
Q
 
T
Q
 
D
R
 
R
S
 
M
E
 
R
V
 
V
E
 
S
-
 
H
M
|
M
L
 
L
G
 
G
Y
 
F
L
 
-
F
 
-
F
 
-
V
 
-
G
 
-
N
 
-
R
 
-
K
 
-
A
 
-
T
 
-
P
 
-
L
 
-
P
 
-
Y
 
-
Q
 
-
S
 
-
Q
 
-
P
 
-
D
 
D
D
 
D
K
 
-
C
 
-
D
 
-
W
 
-
Y
 
-
R
 
-
L
 
-
R
 
-
H
 
-
D
 
-
E
 
-
A
 
-
M
 
-
T
 
-
P
 
P
D
 
V
A
 
K
V
 
M
V
 
V
R
 
A
L
 
E
A
 
A
E
 
E
A
 
R
A
 
I
Y
 
R
E
 
E
K
 
T
Y
 
Y
G
 
G
F
 
I
N
 
N
D
 
T
F
 
F
K
|
K
L
 
V
K
|
K
G
 
V
G
 
G
V
 
R
L
 
R
A
 
P
G
 
V
E
 
Q
E
 
L
E
 
D
A
 
T
E
 
A
S
 
V
I
 
V
V
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
R
K
 
E
R
 
R
F
 
F
P
 
G
Q
 
D
A
 
A
-
 
I
R
 
E
V
 
L
T
 
Y
L
 
V
D
|
D
P
 
G
N
|
N
G
 
R
A
 
G
W
 
W
S
 
S
L
 
A
N
 
A
E
 
E
A
 
S
I
 
L
K
 
R
I
 
A
G
 
M
K
 
R
Y
 
E
L
 
M
K
 
A
G
 
D
-
 
L
S
 
D
L
 
L
A
 
L
Y
 
F
A
 
A
E
|
E
D
 
E
P
 
L
C
 
C
G
 
P
A
 
A
E
 
D
Q
 
D
G
 
V
F
 
L
S
 
S
G
 
R
R
 
R
E
 
R
V
 
L
M
 
V
A
 
G
E
 
Q
-
 
L
-
 
D
-
 
M
-
 
P
F
 
F
R
 
I
R
 
A
A
x
D
T
x
E
G
x
S
L
 
V
P
 
P
T
 
T
A
 
P
T
 
A
N
 
D
M
 
V
I
 
T
A
 
-
T
 
-
D
 
-
W
 
R
R
 
E
Q
 
V
M
 
L
G
 
G
H
 
G
T
 
-
L
 
-
S
 
S
L
 
A
Q
 
T
S
 
A
V
 
I
D
 
S
I
 
I
P
x
K
L
 
T
A
 
A
D
 
R
P
 
T
H
 
G
F
 
F
W
 
-
T
 
-
M
 
-
Q
 
T
G
 
G
S
 
S
V
 
T
R
 
R
V
 
V
A
 
H
Q
 
H
M
 
L
C
 
A
H
 
E
E
 
G
F
 
L
G
 
G
L
 
L
T
 
D
W
 
M
G
 
-
S
 
-
H
 
V
S
 
M
N
x
G
N
|
N
H
x
Q
F
x
I
D
 
D
I
 
G
S
 
Q
L
 
I
A
 
G
M
 
T
F
 
A
T
 
C
H
 
T
V
 
V
A
 
S
A
 
F
A
 
G
A
 
T
P
 
A
G
 
F
K
 
E
I
 
R
T
 
T
A
 
S
I
 
R
D
 
H
T
 
A
H
x
G
W
x
E
I
x
L
-
 
S
-
 
N
W
 
F
Q
 
L
E
 
D
G
 
M
N
 
S
Q
 
D
R
 
D
L
 
L
T
 
L
K
 
T
E
 
V
P
 
P
F
 
L
E
 
Q
I
 
I
K
 
S
G
 
D
G
 
G
M
 
Q
V
 
L
Q
 
H
V
 
R
P
 
R
A
 
P
K
 
G
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
I
E
 
E
L
 
I
D
 
D
M
 
P
D
 
D
Q
 
K
V
 
L

Sites not aligning to the query:

2gghC The mutant a68c-d72c-nlq of deinococcus radiodurans nacylamino acid racemase (see paper)
24% identity, 74% coverage: 89:417/446 of query aligns to 80:368/370 of 2gghC

query
sites
2gghC
N
 
Q
T
 
T
F
 
F
A
 
A
D
 
N
R
 
P
D
 
E
A
 
A
G
 
V
G
 
S
R
 
D
G
 
A
L
 
L
Q
 
G
T
 
S
F
x
Y
D
 
-
L
 
-
R
 
R
T
 
G
T
 
N
I
 
R
H
 
M
V
 
A
V
 
R
T
 
A
G
 
M
I
 
V
E
 
E
A
 
M
A
 
A
M
 
A
L
 
W
D
 
D
L
 
L
L
 
W
G
 
A
Q
 
R
H
 
T
L
 
L
G
 
G
V
 
V
N
 
P
V
 
L
A
 
G
S
 
T
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
G
G
 
H
Q
 
K
Q
 
E
R
 
Q
S
 
V
E
 
E
V
 
V
E
 
G
M
 
V
-
x
S
L
 
L
G
 
G
Y
 
-
L
 
-
F
 
-
F
 
-
V
 
-
G
 
-
N
 
-
R
 
-
K
 
-
A
 
-
T
 
-
P
 
-
L
 
-
P
 
-
Y
 
-
Q
 
-
S
 
-
Q
 
-
P
 
-
D
 
-
D
 
-
K
 
-
C
 
-
D
 
-
W
 
-
Y
 
-
R
 
-
L
 
I
R
 
Q
H
 
A
D
 
D
E
 
E
A
 
Q
M
 
A
T
 
T
P
 
V
D
 
D
A
 
L
V
 
V
V
 
R
R
 
R
L
 
H
A
 
V
E
 
E
A
 
Q
A
 
G
Y
 
Y
E
 
R
K
 
R
Y
 
I
G
 
-
F
 
-
N
 
-
D
x
K
F
 
L
K
|
K
L
 
I
K
 
K
G
 
P
G
 
G
V
 
W
L
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
-
E
 
-
E
 
D
A
 
V
E
 
Q
S
 
P
I
 
V
V
 
R
A
 
A
L
 
T
A
 
R
K
 
E
R
 
A
F
 
F
P
 
P
Q
 
D
A
 
I
R
|
R
V
 
L
T
|
T
L
 
V
D
|
D
P
 
A
N
|
N
G
 
S
A
 
A
W
 
Y
S
 
T
L
 
L
N
 
A
E
 
D
A
 
A
I
 
G
K
 
R
I
 
L
G
 
R
K
 
Q
Y
 
L
L
 
D
K
 
E
G
 
Y
S
 
D
L
 
L
A
 
T
Y
 
Y
A
 
I
E
|
E
D
 
Q
P
 
P
C
 
L
G
 
A
A
 
W
E
 
D
Q
 
D
G
 
L
F
 
V
S
 
D
G
 
H
R
 
A
E
 
E
V
 
L
M
 
A
A
 
R
E
 
R
F
 
I
R
 
R
R
 
T
A
 
P
T
 
L
G
 
C
L
 
L
P
x
D
T
x
E
A
x
S
T
 
V
N
 
A
M
 
S
I
 
-
A
 
A
T
 
S
D
 
D
W
 
A
R
 
R
Q
 
K
M
 
-
G
 
-
H
 
-
T
 
A
L
 
L
S
 
A
L
 
L
Q
 
G
S
 
A
V
 
G
D
 
G
-
 
V
I
 
I
P
 
N
L
 
L
A
x
K
D
 
V
P
 
A
H
 
R
F
 
V
W
 
G
T
 
G
M
 
H
Q
 
A
G
 
E
S
 
S
V
 
R
R
 
R
V
 
V
A
 
H
Q
 
D
M
 
V
C
 
A
H
 
Q
E
 
S
F
 
F
G
 
G
L
 
A
T
 
P
W
 
V
G
 
W
S
x
C
H
x
G
S
x
G
N
x
M
N
x
L
H
 
E
F
 
S
D
 
G
I
 
I
S
 
G
L
 
R
A
 
A
M
 
H
F
 
N
T
 
I
H
 
H
V
 
L
A
 
S
A
 
T
A
 
L
A
 
S
-
 
N
-
 
F
-
 
R
-
 
L
P
 
P
G
|
G
K
x
D
I
x
T
T
 
S
A
 
S
I
 
A
D
 
S
T
 
R
H
 
Y
W
 
W
I
 
-
W
 
-
Q
 
-
E
 
-
G
 
-
N
 
E
Q
 
R
R
 
D
L
 
L
T
 
I
K
 
Q
E
 
E
P
 
P
F
 
L
E
 
E
I
 
A
K
 
V
G
 
D
G
 
G
M
 
L
V
 
M
Q
 
P
V
 
V
P
 
P
A
 
Q
K
 
G
P
 
P
G
 
G
L
 
T
G
 
G
V
 
V
E
 
T
L
 
L
D
 
D
M
 
R
D
 
E
Q
 
F
V
 
L
M
 
A
K
 
T
A
 
V
H
 
T
E
 
E
L
 
A
Y
 
Q
Q
 
E
K
 
E
H
 
H

Sites not aligning to the query:

3t8qB Crystal structure of mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein from hoeflea phototrophica
26% identity, 49% coverage: 183:402/446 of query aligns to 125:353/369 of 3t8qB

query
sites
3t8qB
M
 
I
T
 
T
P
 
P
-
 
K
D
 
D
A
 
E
V
 
A
V
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
S
E
 
R
A
 
L
A
 
R
Y
 
-
E
 
D
K
 
R
Y
 
F
G
 
G
F
 
F
N
 
D
D
 
A
F
 
F
K
|
K
L
 
F
K
x
R
G
 
I
G
 
G
V
 
A
L
 
E
A
 
C
G
 
G
E
 
R
E
 
G
E
 
Q
A
x
D
E
 
E
S
 
W
I
 
P
V
 
G
A
 
R
L
 
T
A
 
E
K
 
E
R
 
I
F
 
V
P
 
P
Q
 
T
A
 
I
R
 
R
V
 
A
T
 
A
L
 
M
D
 
D
-
 
D
-
 
S
-
 
V
-
 
A
-
 
L
-
 
L
-
 
V
-
x
D
P
 
A
N
|
N
G
 
S
A
 
C
W
 
Y
S
 
G
L
 
P
N
 
E
E
 
Q
A
 
A
I
 
I
K
 
E
I
 
V
G
 
G
K
 
K
Y
 
M
L
 
L
-
 
E
K
 
Q
G
 
N
S
 
G
L
 
I
A
 
S
Y
 
H
A
 
Y
E
|
E
D
 
E
P
 
P
C
 
C
G
 
P
A
 
Y
E
 
W
Q
 
E
G
 
Y
F
 
E
S
 
Q
G
 
T
R
 
Q
E
 
Q
V
 
V
M
 
T
A
 
N
E
 
A
F
 
L
R
 
S
-
 
I
R
 
D
A
 
V
T
 
T
G
 
G
L
x
G
P
x
E
T
 
Q
A
x
D
T
 
C
N
 
E
M
 
L
I
 
-
A
 
-
T
 
Q
D
 
N
W
 
W
R
 
R
Q
 
R
M
 
M
G
 
-
H
 
-
T
 
-
L
 
I
S
 
E
L
 
M
Q
 
K
S
 
A
V
 
V
D
 
D
I
 
I
P
 
V
L
x
Q
A
 
P
D
|
D
-
 
I
P
 
C
H
 
Y
F
 
L
W
 
G
T
 
G
M
 
I
Q
 
T
G
 
R
S
 
T
V
 
L
R
 
R
V
 
V
A
 
A
Q
 
E
M
 
M
C
 
A
H
 
H
E
 
K
F
 
A
G
 
G
L
 
L
T
 
P
W
 
C
G
 
T
S
 
P
H
|
H
S
x
A
N
x
A
N
 
N
H
 
L
F
 
S
D
 
M
I
 
V
S
 
T
L
 
L
A
 
-
M
 
-
F
 
F
T
 
T
-
 
M
H
 
H
V
 
L
A
 
L
A
 
R
A
 
A
A
 
I
P
 
P
-
 
N
-
 
A
G
 
G
K
|
K
I
 
Y
T
 
L
A
x
E
I
 
F
-
 
S
-
 
I
-
 
E
-
 
G
D
 
E
T
 
D
H
 
Y
W
 
Y
I
 
P
W
 
W
Q
 
Q
E
 
-
G
 
-
N
 
D
Q
 
D
R
 
L
L
 
F
T
 
V
K
 
A
E
 
S
P
 
P
F
 
Y
E
 
E
I
 
I
K
 
V
G
 
D
G
 
G
M
 
K
V
 
A
Q
 
T
V
 
V
P
 
T
A
 
D
K
 
L
P
 
P
G
 
G
L
 
W
G
 
G
V
 
V
E
 
E
L
 
V

Sites not aligning to the query:

3tcsB Crystal structure of a putative racemase from roseobacter denitrificans
24% identity, 67% coverage: 113:411/446 of query aligns to 83:361/367 of 3tcsB

query
sites
3tcsB
V
 
M
T
 
A
G
 
G
I
 
V
E
 
D
A
 
T
A
 
A
M
 
I
L
 
W
D
 
D
L
 
L
L
 
R
G
 
G
Q
 
K
H
 
Q
L
 
Q
G
 
G
V
 
K
N
 
P
V
 
V
A
 
A
S
 
E
L
 
V
L
 
L
G
 
G
-
 
G
-
 
T
D
 
P
G
 
G
Q
 
L
Q
 
I
R
 
R
S
 
A
E
 
Y
V
 
A
E
x
S
M
 
S
L
x
M
G
 
-
Y
 
-
L
 
-
F
 
-
F
 
-
V
 
-
G
 
-
N
 
K
R
 
R
K
 
D
A
 
I
T
 
T
P
 
P
L
 
-
P
 
-
Y
 
-
Q
 
-
S
 
-
Q
 
-
P
 
-
D
 
-
D
 
-
K
 
-
C
 
-
D
 
-
W
 
-
Y
 
-
R
 
-
L
 
-
R
 
-
H
 
R
D
 
D
E
 
E
A
 
A
M
 
-
T
 
-
P
 
-
D
 
E
A
 
R
V
 
L
V
 
K
R
 
R
L
 
L
A
 
R
E
 
D
A
 
T
A
 
Q
Y
 
-
E
 
-
K
 
-
Y
 
-
G
 
G
F
 
F
N
 
T
D
 
A
F
 
F
K
|
K
L
 
V
K
x
R
G
 
A
G
 
G
V
 
A
L
 
E
A
 
V
G
 
G
E
 
R
E
 
N
E
 
R
A
x
D
E
 
E
S
 
W
I
 
P
V
 
G
A
 
R
L
 
T
A
 
E
K
 
E
R
 
I
F
 
I
P
 
P
Q
 
T
A
 
M
R
 
R
-
 
R
-
 
E
-
 
L
-
 
G
-
 
D
-
 
D
-
 
V
-
 
D
V
 
L
T
 
L
L
 
I
D
|
D
P
 
A
N
|
N
G
 
S
A
 
C
W
 
Y
S
 
T
L
 
P
N
 
D
E
 
R
A
 
A
I
 
I
K
 
E
I
 
V
G
 
G
K
 
H
Y
 
M
L
 
L
K
 
Q
G
 
D
-
 
H
S
 
G
L
 
F
A
 
C
Y
 
H
A
 
F
E
|
E
D
 
E
P
 
P
C
 
C
G
 
P
A
 
Y
E
 
W
Q
 
E
G
 
L
F
 
A
S
 
Q
G
 
T
R
 
K
E
 
Q
V
 
V
M
x
T
A
 
D
E
 
A
F
x
L
-
 
D
-
 
I
-
x
D
-
 
V
-
 
T
-
 
G
-
x
G
R
x
E
R
 
Q
A
 
D
T
 
C
G
 
D
L
 
L
P
 
P
T
 
T
A
 
-
T
 
-
N
 
-
M
 
-
I
 
-
A
 
-
T
 
-
D
 
-
W
 
W
R
 
Q
Q
 
R
M
 
M
G
 
-
H
 
-
T
 
-
L
 
I
S
 
D
L
 
M
Q
 
R
S
 
A
V
 
V
D
 
D
I
 
I
P
 
-
L
 
-
A
 
V
D
x
Q
P
 
P
H
x
D
F
 
I
W
 
L
T
 
Y
M
 
L
Q
 
G
G
 
G
-
 
I
-
 
C
-
 
R
S
 
T
V
 
L
R
 
R
V
 
V
A
 
V
Q
 
E
M
 
M
C
 
A
H
 
R
E
 
A
F
 
A
G
 
G
L
 
L
T
 
P
W
 
V
G
 
T
S
 
P
H
|
H
S
 
C
N
x
A
N
|
N
H
 
W
F
 
S
D
 
L
I
 
V
S
 
T
L
 
L
A
 
-
M
 
-
F
 
F
T
 
T
-
 
M
H
 
H
V
 
L
A
 
L
A
 
R
A
 
A
A
 
I
P
 
P
-
 
N
-
 
A
G
 
G
K
|
K
I
 
Y
T
 
L
A
x
E
I
 
F
D
 
S
T
x
I
-
 
E
-
x
G
-
 
P
-
 
D
H
 
Y
W
 
Y
I
 
P
W
 
W
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
N
 
-
Q
 
-
R
 
L
L
 
F
T
 
V
K
 
K
E
 
T
P
 
P
F
 
Y
E
 
E
I
 
I
K
 
E
G
 
D
G
 
G
M
 
H
V
 
A
Q
 
R
V
 
V
P
 
T
A
 
D
K
 
A
P
 
P
G
 
G
L
 
W
G
 
G
V
 
V
E
 
E
L
 
I
D
 
S
M
 
P
D
 
E
Q
 
W
V
 
L
M
 
A
K
 
R
A
 
S
H
 
Q

Sites not aligning to the query:

5olcC Crystal structure of the 3,6-anhydro-d-galactonate cycloisomerase from zobellia galactanivorans (see paper)
24% identity, 48% coverage: 196:407/446 of query aligns to 139:345/351 of 5olcC

query
sites
5olcC
Y
 
Y
E
 
K
K
 
S
Y
 
Q
G
 
G
F
 
F
N
 
K
D
 
A
F
 
T
K
|
K
L
 
M
K
|
K
G
 
V
G
 
G
V
 
-
L
 
L
A
 
G
G
 
I
E
 
E
E
 
Q
E
 
D
A
 
L
E
 
K
S
 
Y
I
 
I
V
 
A
A
 
A
L
 
I
A
 
R
K
 
K
R
 
A
F
 
I
-
 
G
P
 
P
Q
 
D
A
 
M
R
 
R
V
 
L
T
 
M
L
 
I
D
|
D
P
 
S
N
|
N
G
 
H
A
 
A
W
 
Y
S
 
C
L
 
Y
N
 
K
E
 
E
A
 
A
I
 
I
K
 
E
I
 
L
G
 
A
-
 
R
K
 
K
Y
 
A
L
 
E
K
 
K
G
 
F
S
 
D
L
 
I
A
 
S
Y
 
W
A
 
F
E
|
E
D
 
E
P
 
P
C
 
V
G
 
S
A
 
P
E
 
E
Q
 
D
G
 
-
F
 
Y
S
 
D
G
 
G
R
 
Y
E
 
K
V
 
-
M
 
-
A
 
-
E
 
R
F
 
L
R
 
R
R
 
Q
A
 
N
T
 
T
G
 
T
L
 
I
P
 
P
T
 
I
A
 
S
T
 
G
N
x
G
M
 
-
I
 
-
A
x
E
T
 
C
D
 
E
W
 
Y
R
 
L
Q
 
K
M
 
Y
G
 
G
H
 
F
T
 
K
L
 
R
S
 
L
L
 
F
Q
 
D
S
 
K
V
 
D
D
 
C
I
 
V
P
 
D
L
 
I
A
 
A
D
 
Q
P
 
P
H
x
D
F
 
I
W
 
C
T
 
A
M
 
A
Q
 
G
G
 
G
S
 
L
V
 
T
-
 
E
-
 
V
-
 
K
R
 
K
V
 
I
A
 
A
Q
 
T
M
 
L
C
 
A
H
 
Q
E
 
T
F
 
Y
G
 
N
L
 
V
-
 
D
-
 
L
-
 
V
-
 
P
-
x
H
T
 
T
W
 
W
G
 
G
S
 
T
H
 
W
S
 
-
N
 
-
N
 
-
H
 
-
F
 
-
D
 
-
I
 
I
S
 
A
L
 
I
A
 
S
M
 
A
F
 
A
T
 
V
H
 
H
V
 
L
A
 
V
A
 
A
A
 
N
A
 
L
P
 
D
G
 
L
K
 
P
I
 
T
T
 
M
A
x
E
I
 
L
D
 
D
T
 
R
H
 
-
W
 
-
I
 
-
W
 
-
Q
 
T
E
|
E
G
 
N
N
 
A
Q
 
L
R
 
R
-
 
D
-
 
E
L
 
V
T
 
T
K
 
L
E
 
H
P
 
K
F
 
I
E
 
K
I
 
L
K
 
E
G
 
N
G
 
G
M
 
H
V
 
L
Q
 
E
V
 
V
P
 
P
A
 
C
K
 
T
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
D
L
 
V
D
 
D
M
 
M
D
 
D
Q
 
K
V
 
L

Query Sequence

>BWI76_RS22825 FitnessBrowser__Koxy:BWI76_RS22825
MSAQFSTPVVSSMQVIPVAGHDSMLMNLSGAHAPFFTRNIVVIKDNSGHTGVGEIPGGEK
IRKTLEDAIPLVVGKTLGEYKNVLTAVRNTFADRDAGGRGLQTFDLRTTIHVVTGIEAAM
LDLLGQHLGVNVASLLGDGQQRSEVEMLGYLFFVGNRKATPLPYQSQPDDKCDWYRLRHD
EAMTPDAVVRLAEAAYEKYGFNDFKLKGGVLAGEEEAESIVALAKRFPQARVTLDPNGAW
SLNEAIKIGKYLKGSLAYAEDPCGAEQGFSGREVMAEFRRATGLPTATNMIATDWRQMGH
TLSLQSVDIPLADPHFWTMQGSVRVAQMCHEFGLTWGSHSNNHFDISLAMFTHVAAAAPG
KITAIDTHWIWQEGNQRLTKEPFEIKGGMVQVPAKPGLGVELDMDQVMKAHELYQKHGLG
ARDDAMGMQYLIPNWTFDNKRPCMVR

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory