SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing BWI76_RS24605 FitnessBrowser__Koxy:BWI76_RS24605 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 10 hits to proteins with known functional sites (download)

P37349 PEP-dependent dihydroxyacetone kinase, phosphoryl donor subunit DhaM; Dihydroxyacetone kinase subunit M; EC 2.7.1.121 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
65% identity, 100% coverage: 1:472/473 of query aligns to 1:470/472 of P37349

query
sites
P37349
M
 
M
V
 
V
N
 
N
L
 
L
V
 
V
I
 
I
V
 
V
S
 
S
H
|
H
S
 
S
A
 
S
R
 
R
L
 
L
G
 
G
E
 
E
G
 
G
V
 
V
G
 
G
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
M
 
M
L
 
L
M
 
M
N
 
S
D
 
D
G
 
S
C
 
C
K
 
K
L
 
I
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
I
D
 
D
D
 
D
P
 
P
A
 
Q
S
 
N
P
 
P
I
 
I
G
 
G
T
 
T
D
 
D
P
 
A
I
 
V
K
 
K
V
 
V
M
 
M
E
 
E
A
 
A
I
 
I
E
 
E
S
 
S
V
 
V
A
 
A
D
 
D
A
 
A
D
 
D
H
 
H
V
 
V
L
 
L
V
 
V
M
 
M
M
 
M
D
 
D
I
 
M
G
 
G
S
 
S
A
 
A
L
 
L
L
 
L
S
 
S
A
 
A
E
 
E
T
 
T
A
 
A
L
 
L
D
 
E
L
 
L
L
 
L
D
 
A
P
 
P
A
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
A
K
 
K
V
 
V
R
 
R
L
 
L
C
 
C
A
 
A
A
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
V
E
 
E
G
 
G
T
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
A
T
 
T
V
 
V
S
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
S
G
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
I
D
 
D
K
 
K
V
 
V
I
 
I
E
 
F
D
 
D
A
 
A
M
 
M
N
 
H
A
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
A
K
 
K
R
 
R
V
 
E
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
L
P
 
P
S
 
S
Q
 
S
P
 
D
Q
 
T
P
 
E
P
 
I
S
 
S
L
 
D
T
 
T
A
 
C
E
 
P
L
 
-
A
 
A
D
 
Y
D
 
D
R
 
E
D
 
E
A
 
A
R
 
R
S
 
S
V
 
L
S
 
A
V
 
V
V
 
V
I
 
I
Q
 
K
N
 
N
P
 
R
N
 
N
G
 
G
L
 
L
H
|
H
V
 
V
R
 
R
P
 
P
A
 
A
S
 
S
K
 
R
L
 
L
V
 
V
A
 
Y
A
 
T
L
 
L
A
 
S
G
 
T
F
 
F
N
 
N
A
 
A
D
 
D
L
 
M
V
 
L
L
 
L
E
 
E
K
 
K
E
 
N
G
 
G
K
 
K
C
 
C
V
 
V
T
 
T
P
 
P
D
 
E
S
 
S
L
 
I
N
 
N
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
L
 
L
L
 
L
Q
 
Q
V
 
V
R
 
R
R
 
Y
N
 
N
D
 
D
T
 
T
L
 
L
R
 
R
L
 
L
L
 
I
A
 
A
R
 
K
G
 
G
P
 
P
D
 
E
A
 
A
D
 
E
A
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
I
A
 
A
F
 
F
Q
 
R
A
 
Q
L
 
L
A
 
A
A
 
E
E
 
D
N
 
N
F
 
F
G
 
G
E
 
E
Q
 
T
T
 
E
E
 
E
-
 
V
A
 
A
T
 
P
P
 
P
A
 
T
L
 
L
Q
 
R
P
 
P
T
 
V
H
 
-
A
 
-
A
 
P
R
 
P
I
 
V
Q
 
S
G
 
G
Q
 
K
V
 
A
V
 
F
L
 
Y
Y
 
Y
P
 
Q
R
 
P
P
 
V
Q
 
L
N
 
C
S
 
T
V
 
V
T
 
Q
R
 
A
E
 
K
K
 
S
S
 
T
A
 
L
A
 
T
I
 
V
G
 
E
Q
 
E
Q
 
E
Q
 
Q
L
 
D
R
 
R
L
 
L
K
 
R
R
 
Q
A
 
A
I
 
I
D
 
D
R
 
F
T
 
T
L
 
L
D
 
L
D
 
D
L
 
L
S
 
M
A
 
T
L
 
L
T
 
T
A
 
A
L
 
K
A
 
A
E
 
E
E
 
A
K
 
S
Y
 
G
S
 
L
A
 
D
D
 
D
I
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
I
F
 
F
S
 
S
G
 
G
H
 
H
H
 
H
T
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
D
D
 
D
P
 
P
D
 
E
L
 
L
Y
 
L
T
 
A
A
 
A
A
 
A
C
 
S
D
 
E
I
 
L
V
 
L
R
 
Q
D
 
H
E
 
E
Q
 
H
C
 
C
S
 
T
A
 
A
E
 
E
W
 
Y
A
 
A
W
 
W
H
 
Q
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
S
 
K
D
 
E
L
 
L
S
 
S
Q
 
Q
Q
 
Q
Y
 
Y
R
 
Q
H
 
Q
L
 
L
D
 
D
D
 
D
A
 
E
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
Y
 
Y
I
 
I
D
 
D
I
 
V
E
 
D
D
 
D
I
 
L
L
 
L
H
 
H
R
 
R
T
 
T
L
 
L
R
 
V
H
 
H
L
 
L
N
 
T
E
 
Q
S
 
T
S
 
K
E
 
E
A
 
E
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
F
 
F
S
 
N
T
 
S
P
 
P
S
 
T
I
 
I
L
 
L
V
 
L
A
 
A
D
 
E
D
 
N
I
 
I
F
 
Y
P
 
P
S
 
S
T
 
T
V
 
V
V
 
L
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
G
 
P
R
 
A
Q
 
V
V
 
V
K
 
K
G
 
G
I
 
I
C
 
C
L
 
L
Q
 
S
E
 
A
S
 
G
S
 
S
E
 
P
H
 
V
A
 
S
H
|
H
G
 
S
A
 
A
I
 
L
I
 
I
A
 
A
R
 
R
Q
 
E
A
 
L
G
 
G
I
 
I
A
 
G
M
 
W
L
 
I
C
 
C
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
G
D
 
E
V
 
K
L
 
L
T
 
Y
T
 
A
L
 
I
Q
 
Q
N
 
P
G
 
E
E
 
E
T
 
T
V
 
L
T
 
T
L
 
L
D
 
D
I
 
V
P
 
K
G
 
T
K
 
Q
R
 
R
V
 
F
I
 
N
R
 
R

P23533 Phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase; Phosphotransferase system, enzyme I; EC 2.7.3.9 from Staphylococcus carnosus (strain TM300) (see paper)
27% identity, 38% coverage: 286:464/473 of query aligns to 43:222/573 of P23533

query
sites
P23533
R
 
K
L
 
F
K
 
N
R
 
G
A
 
A
I
 
L
D
 
N
R
 
K
T
 
S
L
 
K
D
 
V
D
 
E
L
 
L
S
 
T
A
 
K
L
 
I
T
 
R
A
 
N
L
 
N
A
 
A
E
 
E
E
 
K
K
 
Q
Y
 
L
S
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
K
A
 
A
A
 
A
I
 
I
F
 
F
S
 
D
G
 
A
H
 
H
H
 
L
T
 
L
L
 
V
L
 
L
D
 
E
D
 
D
P
 
P
D
 
E
L
 
L
Y
 
I
T
 
Q
A
 
P
A
 
I
C
 
E
D
 
D
I
 
K
V
 
I
R
 
K
D
 
N
E
 
E
Q
 
S
C
 
V
S
 
N
A
 
A
E
 
-
W
 
-
A
 
-
W
 
-
H
 
A
Q
 
Q
V
 
A
L
 
L
S
 
T
D
 
D
L
 
V
S
 
S
Q
 
N
Q
 
Q
-
 
F
-
 
I
-
 
T
-
 
I
Y
 
F
R
 
E
H
 
S
L
 
M
D
 
D
D
 
N
A
 
E
Y
 
Y
L
 
M
Q
 
A
A
 
E
R
 
R
Y
 
A
I
 
A
D
 
D
I
 
I
E
 
R
D
 
D
I
 
V
L
 
S
H
 
K
R
 
R
T
 
V
L
 
L
R
 
A
H
 
H
L
 
I
N
 
L
E
 
G
S
 
V
S
 
E
E
 
L
A
 
P
L
 
N
P
 
P
Q
 
S
F
 
I
S
 
V
T
 
D
P
 
E
S
 
S
-
 
V
I
 
V
L
 
I
V
 
I
A
 
G
D
 
N
D
 
D
I
 
L
F
 
T
P
 
P
S
 
S
T
 
D
V
 
T
V
 
A
Q
 
Q
L
 
L
D
 
N
G
 
K
R
 
E
Q
 
Y
V
 
V
K
 
Q
G
 
G
I
 
F
C
 
V
L
 
T
Q
 
N
E
 
I
S
 
G
S
 
G
E
 
R
H
 
T
A
 
S
H
 
H
G
 
S
A
 
A
I
 
I
I
 
M
A
 
S
R
 
R
Q
 
S
A
 
L
G
 
E
I
 
I
A
 
P
M
 
A
L
 
V
C
 
V
Q
 
G
Q
 
T
R
 
K
D
 
S
V
 
I
L
 
T
T
 
E
T
 
E
L
 
V
Q
 
E
N
 
A
G
 
G
E
 
D
T
 
T
V
 
I
T
 
V
L
 
V
D
 
D

Sites not aligning to the query:

2wqdA Crystal structure of enzyme i of the phosphoenolpyruvate:sugar phosphotransferase system in the dephosphorylated state (see paper)
26% identity, 40% coverage: 275:464/473 of query aligns to 32:222/570 of 2wqdA

query
sites
2wqdA
E
 
E
K
 
K
S
 
V
A
 
T
A
 
D
I
 
V
G
 
E
Q
 
G
Q
 
E
Q
 
V
L
 
A
R
 
K
L
 
F
K
 
N
R
 
S
A
 
A
I
 
I
D
 
E
R
 
A
T
 
S
L
 
K
D
 
V
D
 
E
L
 
L
S
 
T
A
 
K
L
 
I
T
 
R
A
 
N
L
 
N
A
 
A
E
 
E
E
 
V
K
 
Q
Y
 
L
S
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
K
A
 
A
A
 
A
I
 
I
F
 
F
S
 
D
G
 
A
H
 
H
H
 
L
T
 
L
L
 
V
L
 
L
D
 
D
D
 
D
P
 
P
D
 
E
L
 
L
Y
 
I
T
 
Q
A
 
P
A
 
I
C
 
Q
D
 
D
I
 
K
V
 
I
R
 
K
D
 
N
E
 
E
Q
 
N
C
 
A
S
 
N
A
 
A
E
 
A
W
 
T
A
 
A
W
x
L
H
 
T
Q
 
D
V
 
V
L
 
T
S
 
T
D
 
Q
L
 
F
S
 
V
Q
 
T
Q
 
I
Y
 
F
R
 
E
H
 
S
L
 
M
D
 
D
D
 
N
A
 
E
Y
 
Y
L
 
M
Q
 
K
A
 
E
R
 
R
Y
 
A
I
 
A
D
 
D
I
 
I
E
 
R
D
 
D
I
 
V
L
 
S
H
 
K
R
 
R
T
 
V
L
 
L
R
 
S
H
 
H
L
 
I
N
 
L
E
 
G
S
 
V
S
 
E
E
 
L
A
 
P
L
 
N
P
 
P
Q
 
S
F
 
M
S
 
I
T
 
D
P
 
E
S
 
S
-
 
V
I
 
V
L
 
I
V
 
V
A
 
G
D
 
N
D
 
D
I
 
L
F
 
T
P
 
P
S
 
S
T
 
D
V
 
T
V
 
A
Q
 
Q
L
 
L
D
 
N
G
 
K
R
 
E
Q
 
F
V
 
V
K
 
Q
G
 
G
I
 
F
C
 
A
L
 
T
Q
 
N
E
 
I
S
 
G
S
 
G
E
 
R
H
 
T
A
 
S
H
x
A
G
 
S
A
 
A
I
 
I
I
 
M
A
 
S
R
 
R
Q
 
S
A
 
L
G
 
E
I
 
I
A
 
P
M
 
A
L
 
I
C
 
V
Q
 
G
Q
 
T
R
 
K
D
 
S
V
 
I
L
 
T
T
 
Q
T
 
E
L
 
V
Q
 
K
N
 
Q
G
 
G
E
 
D
T
 
M
V
 
I
T
 
I
L
 
V
D
 
D

Sites not aligning to the query:

P08839 Phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase; Phosphotransferase system, enzyme I; EC 2.7.3.9 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
27% identity, 45% coverage: 260:470/473 of query aligns to 14:227/575 of P08839

query
sites
P08839
G
 
G
Q
 
K
V
 
A
V
 
L
L
 
L
Y
 
L
P
 
K
R
 
E
P
 
D
Q
 
E
N
 
I
S
 
V
V
 
I
T
 
D
R
 
R
E
 
K
K
 
K
S
 
I
A
 
S
A
 
A
-
 
D
-
 
Q
I
 
V
G
 
D
Q
 
Q
Q
 
E
Q
 
V
L
 
E
R
 
R
L
 
F
K
 
L
R
 
S
A
 
G
I
 
R
D
 
A
R
 
K
T
 
A
L
 
S
D
 
A
D
 
Q
L
 
L
S
 
E
A
 
T
L
 
I
T
 
K
A
 
T
L
 
K
A
 
A
E
 
G
E
 
E
K
 
T
Y
 
F
S
 
G
A
 
E
D
 
E
I
 
K
A
 
E
A
 
A
I
 
I
F
 
F
S
 
E
G
 
G
H
 
H
H
 
I
T
 
M
L
 
L
L
 
L
D
 
E
D
 
D
P
 
E
D
 
E
L
 
L
Y
 
E
T
 
Q
A
 
E
A
 
I
C
 
I
D
 
A
I
 
L
V
 
I
R
 
K
D
 
D
E
 
K
Q
 
H
C
 
M
S
 
T
A
 
A
E
 
D
W
 
A
A
 
A
W
 
A
H
 
H
Q
 
E
V
 
V
L
 
I
S
 
E
D
 
G
L
 
Q
S
 
A
Q
 
S
Q
 
A
Y
 
L
R
 
E
H
 
E
L
 
L
D
 
D
D
 
D
A
 
E
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
K
A
 
E
R
 
R
Y
 
A
I
 
A
D
 
D
I
 
V
E
 
R
D
 
D
I
 
I
L
 
G
H
 
K
R
 
R
T
 
L
L
 
L
R
 
R
H
 
N
-
 
I
L
 
L
N
 
G
E
 
L
S
 
K
S
 
I
E
 
I
A
 
D
L
 
L
P
 
S
Q
 
A
F
 
I
S
 
Q
T
 
D
P
 
E
S
 
V
I
 
I
L
 
L
V
 
V
A
 
A
D
 
A
D
 
D
I
 
L
F
 
T
P
 
P
S
 
S
T
 
E
V
 
T
V
 
A
Q
 
Q
L
 
L
D
 
N
G
 
L
R
 
K
Q
 
K
V
 
V
K
 
L
G
 
G
I
 
F
C
 
I
L
 
T
Q
 
D
E
 
A
S
 
G
S
 
G
E
 
R
H
 
T
A
 
S
H
|
H
G
 
T
A
 
S
I
 
I
I
 
M
A
 
A
R
 
R
Q
 
S
A
 
L
G
 
E
I
 
L
A
 
P
M
 
A
L
 
I
C
 
V
Q
 
G
Q
 
T
R
 
G
D
 
S
V
 
V
L
 
T
T
 
S
T
 
Q
L
 
V
Q
 
K
N
 
N
G
 
D
E
 
D
T
 
Y
V
 
L
T
 
I
L
 
L
D
 
D
I
 
A
P
 
V
G
 
N
K
 
N
R
 
Q
V
 
V

Sites not aligning to the query:

2hwgA Structure of phosphorylated enzyme i of the phosphoenolpyruvate:sugar phosphotransferase system (see paper)
27% identity, 45% coverage: 260:470/473 of query aligns to 13:226/572 of 2hwgA

query
sites
2hwgA
G
 
G
Q
 
K
V
 
A
V
 
L
L
 
L
Y
 
L
P
 
K
R
 
E
P
 
D
Q
 
E
N
 
I
S
 
V
V
 
I
T
 
D
R
 
R
E
 
K
K
 
K
S
 
I
A
 
S
A
 
A
-
 
D
-
 
Q
I
 
V
G
 
D
Q
 
Q
Q
 
E
Q
 
V
L
 
E
R
 
R
L
 
F
K
 
L
R
 
S
A
 
G
I
 
R
D
 
A
R
 
K
T
 
A
L
 
S
D
 
A
D
 
Q
L
 
L
S
 
E
A
 
T
L
 
I
T
 
K
A
 
T
L
 
K
A
 
A
E
 
G
E
 
E
K
 
T
Y
 
F
S
 
G
A
 
E
D
 
E
I
 
K
A
 
E
A
 
A
I
 
I
F
 
F
S
 
E
G
 
G
H
 
H
H
 
I
T
 
M
L
 
L
L
 
L
D
 
E
D
 
D
P
 
E
D
 
E
L
 
L
Y
 
E
T
 
Q
A
 
E
A
 
I
C
 
I
D
 
A
I
 
L
V
 
I
R
 
K
D
 
D
E
 
K
Q
 
H
C
 
M
S
 
T
A
 
A
E
 
D
W
 
A
A
 
A
W
x
A
H
 
H
Q
 
E
V
 
V
L
 
I
S
 
E
D
 
G
L
 
Q
S
 
A
Q
 
S
Q
 
A
Y
 
L
R
 
E
H
 
E
L
 
L
D
 
D
D
 
D
A
 
E
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
K
A
 
E
R
 
R
Y
 
A
I
 
A
D
 
D
I
 
V
E
 
R
D
 
D
I
 
I
L
 
G
H
 
K
R
 
R
T
 
L
L
 
L
R
 
R
H
 
N
-
 
I
L
 
L
N
 
G
E
 
L
S
 
K
S
 
I
E
 
I
A
 
D
L
 
L
P
 
S
Q
 
A
F
 
I
S
 
Q
T
 
D
P
 
E
S
 
V
I
 
I
L
 
L
V
 
V
A
 
A
D
 
A
D
 
D
I
 
L
F
 
T
P
 
P
S
 
S
T
 
E
V
 
T
V
 
A
Q
 
Q
L
 
L
D
 
N
G
 
L
R
 
K
Q
 
K
V
 
V
K
 
L
G
 
G
I
 
F
C
 
I
L
 
T
Q
 
D
E
 
A
S
 
G
S
 
G
E
 
R
H
 
T
A
 
S
H
|
H
G
 
T
A
 
S
I
 
I
I
 
M
A
 
A
R
 
R
Q
 
S
A
 
L
G
 
E
I
 
L
A
 
P
M
 
A
L
 
I
C
 
V
Q
 
G
Q
 
T
R
 
G
D
 
S
V
 
V
L
 
T
T
 
S
T
 
Q
L
 
V
Q
 
K
N
 
N
G
 
D
E
 
D
T
 
Y
V
 
L
T
 
I
L
 
L
D
 
D
I
 
A
P
 
V
G
 
N
K
 
N
R
 
Q
V
 
V

Sites not aligning to the query:

O69250 Phosphocarrier protein HPr; Histidine-containing protein from Priestia megaterium (Bacillus megaterium) (see 2 papers)
33% identity, 18% coverage: 160:242/473 of query aligns to 5:88/88 of O69250

query
sites
O69250
S
 
T
V
 
F
V
 
T
I
 
V
Q
 
T
N
 
A
P
 
D
N
 
S
G
 
G
L
 
I
H
 
H
V
 
A
R
 
R
P
 
P
A
 
A
S
 
T
K
 
T
L
 
L
V
 
V
A
 
Q
A
 
A
L
 
A
A
 
S
G
 
K
F
 
F
N
 
D
A
 
S
D
 
D
L
 
I
V
 
N
L
 
L
E
 
E
K
 
F
E
 
N
G
 
G
K
 
K
C
 
T
V
 
V
T
 
N
P
 
L
D
 
K
S
|
S
L
 
I
N
 
M
Q
 
G
I
 
V
A
 
M
L
 
S
L
 
L
Q
 
G
V
 
I
R
 
Q
R
 
K
N
 
G
D
 
A
T
 
T
L
 
I
R
 
T
L
 
I
L
 
S
A
 
A
R
 
E
G
 
G
P
 
S
D
 
D
A
 
E
D
 
A
A
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
F
 
L
Q
 
E
-
 
D
A
 
T
L
 
M
A
 
S
A
 
K
E
 
E
N
 
G
F
 
L
G
 
G
E
 
E

Q9F166 Phosphocarrier protein HPr from Bacillus thuringiensis subsp. israelensis (see 2 papers)
35% identity, 17% coverage: 163:242/473 of query aligns to 7:87/87 of Q9F166

query
sites
Q9F166
I
 
V
Q
 
T
N
 
S
P
 
D
N
 
S
G
 
G
L
 
I
H
|
H
V
 
A
R
 
R
P
 
P
A
 
A
S
 
T
K
 
L
L
 
L
V
 
V
A
 
N
A
 
T
L
 
A
A
 
S
G
 
K
F
 
F
N
 
G
A
 
S
D
 
D
L
 
I
V
 
N
L
 
L
E
 
E
K
 
Y
E
 
N
G
 
G
K
 
K
C
 
N
V
 
V
T
 
N
P
 
L
D
 
K
S
|
S
L
 
I
N
 
M
Q
 
G
I
 
V
A
 
M
L
 
S
L
 
L
Q
 
G
V
 
I
R
 
Q
R
 
Q
N
 
N
D
 
A
T
 
E
L
 
I
R
 
K
L
 
I
L
 
T
A
 
A
R
 
N
G
 
G
P
 
D
D
 
D
A
 
A
D
 
A
A
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
F
 
I
-
 
E
Q
 
E
A
 
T
L
 
M
A
 
K
A
 
N
E
 
E
N
 
G
F
 
L
G
 
G
E
 
E

1pohA The 2.0 angstroms resolution structure of escherichia coli histidine- containing phosphocarrier protein hpr: a redetermination (see paper)
32% identity, 16% coverage: 161:238/473 of query aligns to 6:83/85 of 1pohA

query
sites
1pohA
V
 
V
V
 
T
I
 
I
Q
 
T
N
 
A
P
 
P
N
 
N
G
 
G
L
 
L
H
 
H
V
 
T
R
 
R
P
 
P
A
 
A
S
 
A
K
 
Q
L
 
F
V
 
V
A
 
K
A
 
E
L
 
A
A
 
K
G
 
G
F
 
F
N
 
T
A
 
S
D
 
E
L
 
I
V
 
T
L
 
V
E
 
T
K
 
S
E
x
N
G
 
G
K
|
K
C
 
S
V
 
A
T
 
S
P
 
A
D
 
K
S
 
S
L
 
L
N
 
F
Q
 
K
I
 
L
A
 
Q
L
 
T
L
 
L
Q
 
G
V
 
L
R
 
T
R
 
Q
N
 
G
D
 
T
T
 
V
L
 
V
R
 
T
L
 
I
L
 
S
A
 
A
R
 
E
G
 
G
P
 
E
D
 
D
A
 
E
D
 
Q
A
 
K
A
 
A
L
 
V
A
 
E
A
 
H
F
 
L
Q
 
V
A
 
K
L
 
L
A
 
M
A
 
A
E
 
E

1j6tB Complex of enzyme iiamtl and the histidine-containing phosphocarrier protein hpr from escherichia coli nmr, restrained regularized mean structure (see paper)
32% identity, 16% coverage: 161:238/473 of query aligns to 6:83/85 of 1j6tB

query
sites
1j6tB
V
 
V
V
 
T
I
 
I
Q
 
T
N
 
A
P
 
P
N
 
N
G
 
G
L
 
L
H
|
H
V
x
T
R
 
R
P
 
P
A
 
A
S
 
A
K
 
Q
L
 
F
V
 
V
A
 
K
A
 
E
L
 
A
A
 
K
G
 
G
F
 
F
N
 
T
A
 
S
D
 
E
L
 
I
V
 
T
L
 
V
E
 
T
K
 
S
E
 
N
G
 
G
K
 
K
C
 
S
V
 
A
T
 
S
P
 
A
D
 
K
S
 
S
L
 
L
N
 
F
Q
 
K
I
 
L
A
 
Q
L
 
T
L
 
L
Q
 
G
V
 
L
R
 
T
R
 
Q
N
 
G
D
 
T
T
 
V
L
 
V
R
 
T
L
 
I
L
 
S
A
 
A
R
 
E
G
 
G
P
 
E
D
 
D
A
 
E
D
 
Q
A
 
K
A
 
A
L
 
V
A
 
E
A
 
H
F
 
L
Q
 
V
A
 
K
L
 
L
A
 
M
A
 
A
E
 
E

P0AA04 Phosphocarrier protein HPr; Histidine-containing protein from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
32% identity, 16% coverage: 161:238/473 of query aligns to 6:83/85 of P0AA04

query
sites
P0AA04
V
 
V
V
 
T
I
 
I
Q
 
T
N
 
A
P
 
P
N
 
N
G
 
G
L
 
L
H
|
H
V
 
T
R
 
R
P
 
P
A
 
A
S
 
A
K
 
Q
L
 
F
V
 
V
A
 
K
A
 
E
L
 
A
A
 
K
G
 
G
F
 
F
N
 
T
A
 
S
D
 
E
L
 
I
V
 
T
L
 
V
E
 
T
K
 
S
E
 
N
G
 
G
K
 
K
C
 
S
V
 
A
T
 
S
P
 
A
D
 
K
S
 
S
L
 
L
N
 
F
Q
 
K
I
 
L
A
 
Q
L
 
T
L
 
L
Q
 
G
V
 
L
R
 
T
R
 
Q
N
 
G
D
 
T
T
 
V
L
 
V
R
 
T
L
 
I
L
 
S
A
 
A
R
 
E
G
 
G
P
 
E
D
 
D
A
 
E
D
 
Q
A
 
K
A
 
A
L
 
V
A
 
E
A
 
H
F
 
L
Q
 
V
A
 
K
L
 
L
A
 
M
A
 
A
E
 
E

Query Sequence

>BWI76_RS24605 FitnessBrowser__Koxy:BWI76_RS24605
MVNLVIVSHSARLGEGVGELARQMLMNDGCKLAIAAGIDDPASPIGTDPIKVMEAIESVA
DADHVLVMMDIGSALLSAETALDLLDPAIAAKVRLCAAPLVEGTLAATVSAAAGADIDKV
IEDAMNALEAKRVQLGLPSQPQPPSLTAELADDRDARSVSVVIQNPNGLHVRPASKLVAA
LAGFNADLVLEKEGKCVTPDSLNQIALLQVRRNDTLRLLARGPDADAALAAFQALAAENF
GEQTEATPALQPTHAARIQGQVVLYPRPQNSVTREKSAAIGQQQLRLKRAIDRTLDDLSA
LTALAEEKYSADIAAIFSGHHTLLDDPDLYTAACDIVRDEQCSAEWAWHQVLSDLSQQYR
HLDDAYLQARYIDIEDILHRTLRHLNESSEALPQFSTPSILVADDIFPSTVVQLDGRQVK
GICLQESSEHAHGAIIARQAGIAMLCQQRDVLTTLQNGETVTLDIPGKRVIRG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory