SitesBLAST

SitesBLAST – Find functional sites

SitesBLAST

Comparing CA265_RS03130 FitnessBrowser__Pedo557:CA265_RS03130 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1t47A Structure of fe2-hppd bound to ntbc (see paper)
53% identity, 95% coverage: 15:371/376 of query aligns to 1:361/362 of 1t47A

query
sites
1t47A

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binding fe (ii) ion: H172 (= H181), H255 (= H264), E334 (= E344)
binding 2-{hydroxy[2-nitro-4-(trifluoromethyl)phenyl]methylene}cyclohexane-1,3-dione: H172 (= H181), S215 (= S224), P228 (= P237), H255 (= H264), F321 (= F331), E334 (= E344), F344 (= F354), G345 (= G355), N348 (= N358), F349 (= F359), L352 (= L362)

5ec3A Structural insight into the catalyitc mechanism of human 4- hydroxyphenylpyruvate dioxygenase
48% identity, 94% coverage: 25:376/376 of query aligns to 14:373/376 of 5ec3A

query
sites
5ec3A

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binding cobalt (ii) ion: H175 (= H181), H258 (= H264), E341 (= E344)

P32755 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase; 4-hydroxyphenylpyruvic acid oxidase; 4HPPD; HPD; HPPDase; F Alloantigen; F protein; EC 1.13.11.27 from Rattus norvegicus (Rat) (see 2 papers)
47% identity, 94% coverage: 25:376/376 of query aligns to 22:381/393 of P32755

query
sites
P32755

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H183 (= H181) binding Fe cation
H266 (= H264) binding Fe cation
E349 (= E344) binding Fe cation

Sites not aligning to the query:

1 modified: Initiator methionine, Removed
2 modified: N-acetylthreonine

8im2A Crystal structure of human hppd complexed with ntbc (see paper)
48% identity, 93% coverage: 25:375/376 of query aligns to 16:374/374 of 8im2A

query
sites
8im2A

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binding cobalt (ii) ion: H177 (= H181), H260 (= H264), E343 (= E344)
binding 2-{hydroxy[2-nitro-4-(trifluoromethyl)phenyl]methylene}cyclohexane-1,3-dione: P233 (= P237), N235 (= N239), H260 (= H264), F330 (= F331), F341 (= F342), F353 (= F354), N357 (= N358), F358 (= F359), L361 (= L362)

8im3A Crystal structure of human hppd complexed with compound a10 (see paper)
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8im3A

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binding [1,3-diethyl-2,2-bis(oxidanylidene)-2$l^{6},1,3-benzothiadiazol-5-yl]-(1-methyl-5-oxidanyl-pyrazol-4-yl)methanone: H177 (= H181), P233 (= P237), Q245 (= Q249), F330 (= F331), F341 (= F342), E343 (= E344), F353 (= F354), G354 (= G355), N357 (= N358), F358 (= F359), L361 (= L362)
binding cobalt (ii) ion: H177 (= H181), H260 (= H264), E343 (= E344)

8jbwA Crystal structure of zthppd-(+)-usnic acid complex (see paper)
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8jbwA

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binding (9bR)-2,6-diethanoyl-8,9b-dimethyl-3,7,9-tris(oxidanyl)dibenzofuran-1-one: M196 (= M191), I220 (= I215), F224 (≠ Y219), H252 (= H264)
binding cobalt (ii) ion: H186 (= H181), H252 (= H264), Q320 (= Q329), E335 (= E344)

Q02110 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase; 4-hydroxyphenylpyruvic acid oxidase; 4HPPD; HPD; HPPDase; EC 1.13.11.27 from Sus scrofa (Pig) (see paper)
45% identity, 94% coverage: 25:376/376 of query aligns to 22:381/393 of Q02110

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Q02110

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1sqiA Structural basis for inhibitor selectivity revealed by crystal structures of plant and mammalian 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenases (see paper)
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1sqiA

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1sqiB Structural basis for inhibitor selectivity revealed by crystal structures of plant and mammalian 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenases (see paper)
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sites
1sqiB

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binding fe (iii) ion: H177 (= H181), H242 (= H264), E325 (= E344)

7x8iA Crystal structure of athppd-shikonin complex (see paper)
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7x8iA

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binding cobalt (ii) ion: H186 (= H181), H259 (= H264), E345 (= E344)
binding 2-[(1R)-4-methyl-1-oxidanyl-pent-3-enyl]-5,8-bis(oxidanyl)naphthalene-1,4-dione: L216 (= L222), Q244 (= Q249), H259 (= H264), F332 (= F331), F343 (= F342), F363 (vs. gap), F368 (= F359)

7x64A Crystal structure of athppd-y18027 complex (see paper)
35% identity, 91% coverage: 24:367/376 of query aligns to 15:376/380 of 7x64A

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7x64A

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binding 1,5-dimethyl-6-(2-oxidanyl-6-oxidanylidene-cyclohexen-1-yl)carbonyl-3-(phenylmethyl)quinazoline-2,4-dione: H186 (= H181), S218 (= S224), P231 (= P237), R241 (≠ K246), Q244 (= Q249), H259 (= H264), F332 (= F331), F363 (vs. gap), G364 (vs. gap), N367 (= N358), F368 (= F359)
binding cobalt (ii) ion: H186 (= H181), H259 (= H264), E345 (= E344)

7x5sA Crystal structure of athppd-y14157 complex
35% identity, 91% coverage: 24:367/376 of query aligns to 15:376/380 of 7x5sA

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binding 2-methyl-4-(2-nitro-4-piperidin-1-yl-phenyl)carbonyl-5-phenyl-1H-pyrazol-3-one: H186 (= H181), P231 (= P237), H259 (= H264), F332 (= F331), F343 (= F342), F363 (vs. gap), K365 (vs. gap), N367 (= N358), F368 (= F359)
binding cobalt (ii) ion: H186 (= H181), H259 (= H264), E345 (= E344)

7ezqA Complex structure of athppd with inhibitor y15832
35% identity, 91% coverage: 24:367/376 of query aligns to 15:376/382 of 7ezqA

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sites
7ezqA

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